Capítulo 5
Transcripción
Transcripción
Una de las funciones de la doble cadena del ADN, represen-
tada en el dogma de la Biología Molecular, es expresar la
información contenida en el material genético. El primer
paso en la expresión génica es la transcripción, que consis-
te en la síntesis de una cadena de ARN complementaria y
antiparalela, a la secuencia de nucleótidos de una de las
cadenas de ADN denominada cadena molde, y por lo tanto,
tiene la secuencia de nucleótidos idéntica a la cadena
opuesta del ADN llamada cadena codificadora, con la pre-
misa de que la timina se sustituye por uracilo en la molécu-
la de ARN (figura 5-1).
La transcripción es el paso previo y necesario para la
generación de proteínas funcionales que definen el metabo-
lismo y la identidad de las células. Las secuencias de ADN
que se copian en cada proceso de transcripción se denomi-
nan genes (figura 5-2). Desde el punto de vista molecular, el
gen es una secuencia lineal de nucleótidos en la molécula de
ADN, que contiene la información necesaria para la síntesis
de un ARN funcional, que puede ser ARNm, ARNt o ARNr.
Los genes se sitúan a lo largo de cada cromosoma en una
posición determinada llamada locus. Se estima que el núme-
ro de genes que se encuentra en la especie humana es de
aproximadamente 23 000; sin embargo, todavía no se tiene
certeza acerca del número exacto. La definición de gen pro-
puesta por Gerstein y colaboradores lo describe como un
conjunto de secuencias que codifican para potenciales pro-
ductos funcionales que se sobreponen entre sí y que pueden
estar localizadas en más de un locus en el ADN.
Estructura del gen
El mecanismo de transcripción en células eucariotas, aun-
que transcurre de manera similar que en procariotas, es un
proceso mucho más complejo; tanto el número de proteí-
44
Zamira Helena Hernández Nazará
nas y enzimas como la diversidad y la estructura de los
genes son considerablemente mayores, por lo que se requie-
re de una regulación más precisa. La mayoría de los genes
en procariotes están organizados en operones, esto es, un
conjunto de genes situados en el mismo fragmento de ADN
que se transcriben como una unidad y que generan varios
productos funcionales que participan en una vía metabólica
común; aunque también pueden existir unidades que codi-
fiquen para un solo producto funcional. Por el contrario, en
los eucariotes, se transcribe generalmente un solo producto
génico (unidades transcripcionales monocistrónicas) con
mayor complejidad en su regulación.
Los genes eucariotes están constituidos por secuencias
regulatorias y codificantes. El inicio del sitio de transcrip-
ción se denomina +1, y la numeración aumenta conforme se
dirige al extremo 3’. Esta dirección se conoce como corriente
abajo, donde se encuentran las secuencias codificantes del
gen. Hacia el extremo 5’, en la dirección opuesta, conocida
como corriente arriba, la numeración se indica como —1, y
es allí donde se encuentra la mayoría de regiones regulato-
rias del gen (figura 5-3).
La región codificadora del gen también contiene regio-
nes que no serán traducidas, denominadas intrones, y que
son retirados por medio del proceso corte y empalme del
ARNm primario o heterogéneo nuclear (ARNhn). Las
regiones que codifican para el producto génico se conocen
como exones. Un solo gen puede sintetizar diferentes pro-
teínas mediante el arreglo de los exones por el proceso de
corte y empalme alternativo. El tránscrito primario o ARN-
hn es el producto inmediato de la transcripción y consiste
en un ARN que contiene las secuencias intrónicas y exóni-
cas, cuyos extremos 5’ y 3’ no han sufrido ninguna modifi-
cación. El producto final, ARN mensajero maduro, ARN
ribosomal (ARNr) y ARN transferencia (ARNt), se produce
cuando sucede una serie de modificaciones en el tránscrito
primario: modificaciones postranscripcionales. En proca-
 CAPÍTULO 5 • Transcripción 45

ADNg +1 Inicio de la transcripción secuencias adyacentes a este promotor mínimo forman

TTAGCTCCCGTTTAAAA parte de él, y pueden modificar la tasa de transcripción del
5´ 3´
Cadena Codificante, también conocida como cadena
gen, pero no son imprescindibles para la unión de la ARN
informativa, con sentido, hebra no molde, “+” y que no es polimerasa.
transcripta El promotor basal es la secuencia mínima requerida
AATCGAGGGCAAATTTT 5´
3´ para la unión de la maquinaria basal de transcripción y para
Cadena Molde, también conocida como cadena transcripta, la ARN pol II (ARN polimerasa II) incluye el Inr y la caja
hebra no informativa, no codificante, “–” y antisentido TATA o el DPE.
A los promotores se les unen proteínas reguladoras
ARNm ADNc conocidas como factores transcripcionales (transcriptional
5´ 3´ factors, TF), cuya función es regular (aumentar o disminuir)
UUAGCUCCCGUUUAAAA 3´ 5´ la tasa de transcripción. Aunque existe mucha diversidad
5´ 3´
ARN con sentido “+”
La copia del ARNm en ADNc puede entre los promotores reconocidos por la ARN polimerasa II
ser una cadena o doble cadena se pueden definir secuencias consensos comunes entre sí.
Figura 5-1. Transcripción: proceso de síntesis de ARN a partir Una secuencia consenso es la región conocida como inicia-
de ADN. La molécula de ARN formada es complementaria y dor (Inr) localizada entre las posiciones –3 y +5. La secuen-
antiparalela a la molécula de ADN 5’ → 3’ a la que se le llama cia consenso denominada caja TATA, debido a su
molde, y de secuencia idéntica a la cadena de ADN 5’ → 3’, composición de ocho pb A-T, se encuentra en la mayoría de
denominada codificante. los promotores y se localiza a –31 a –25 bp hacia el extremo
5’ del punto de inicio. Éste es el único elemento que se loca-
liza en una dirección relativamente fija con respecto al pun-
riotes, el ARN recién sintetizado no sufre modificaciones to de inicio. Los promotores que carecen de caja TATA se
postranscripcionales y se utiliza para la traducción de for- denominan TATA menos. Cuando existe una mutación en
ma inmediata sin sufrir ningún proceso. la caja TATA, el sitio de inicio de la transcripción cambia,
Un tipo de secuencias de ADN regulatorias que no ya que la ARN pol II al ser activada se sitúa en otro sitio
codifican para el producto génico, pero regulan su expre- (figura 5-4). El DPR (downstream promoter element) es un
sión, son los promotores. El promotor mínimo es la región elemento común en los promotores TATA menos, se loca-
regulatoria indispensable para la transcripción del gen. Las liza de +28 a +32.

GEN DE LA INSULINA HUMANA, Localización del Gen

dentro del Genoma Cromosoma: 11; Locus: 11p15.5

Núcleo GEN ENZIMA

GEN PROTEÍNA
GEN POLIPETIDO
GEN UN ARN
GEN PRODUCTO
GÉNICO FUNCIONAL
ADNg

Corriente arriba Corriente abajo

Promotor +1 Inicio de la transcripción Secuencias

5
basal reguladoras 3´
Intrón Exón

Figura 5-2. Gen: región del genoma que contiene la información necesaria para la síntesis de una molécula funcional o un rasgo
particular. La localización de genes en el cromosoma es el locus (singular), loci (plural). La transcripción sucede en la interfase del
ciclo celular y sólo ocurre sobre la conformación de 10 nm de ADNg cuando hay mayor acceso de las enzimas a la eucromatina.
46 PARTE I • Conceptos básicos de biología molecular

Corriente arriba Corriente abajo

ADN

5´ –30 pb +1 inicio de la transcripción 3´

TATA

ARNhn
5´ 3´

ARNm

5´ 3´
CAP 7mG POLIA

Proteína
funcional
Polipéptidos

Secuencias reguladoras

Exones

Intrones

Figura 5-3. Procesamiento del ARN. A través de la transcripción de un gen se produce un ARNhn, que se procesa para dar lugar a
un ARNm. Este ARNm sale del núcleo y en el citoplasma se traduce para dar lugar a proteínas que, a través de diversos procesos
de maduración, darán lugar a proteínas funcionales.

Algunos promotores basales son fuertes, como la mayo-

ría de los ubicados en los genes procariotes y virales; se les
Promotor di
denomina así ya que la maquinaria de transcripción basal se Potenciador stal
–10 kpb Sile
une de forma eficaz y la tasa de transcripción es elevada. nciador
ADNg
Otros son débiles, como la mayoría de los promotores de
genes eucariotes, con un inicio de la transcripción menos –2 Kpb Aisladores
frecuente, por lo que requieren secuencias accesorias con- Promotor
tenidas en promotores proximales, localizadas generalmen- proximal Promotor
–100 pb
te a menos de 200 pb corriente arriba del sitio de inicio de Basal Intron
es/Exones Silenciado
r
la transcripción. Las cajas GC, CAAT y el octámero son +1
ejemplos de estos promotores proximales, reconocidos por
los factores transcripcionales específicos para favorecer la
iniciación. El número y la posición de estos elementos TFIIB TBP TFIID TFIID
varían entre los promotores de los diversos genes. La uni-
dad de transcripción se refiere a la interacción de todas las BRE TATA Inr DPE
secuencias funcionales o estructurales posibles, así como el
complejo proteico formado de enzimas y TF que se requie- –3 –32 –31 –26 –2 +4 +28 +32 pb
ran durante el proceso de la transcripción.
Otras regiones regulatorias que ayudan a los promoto-
res débiles a iniciar la transcripción son los promotores dis- Figura 5-4. Secuencias que regulan la transcripción. Esquema
tales, que generalmente se encuentran a más de 200 pb río del promotor basal y los factores transcripcionales que se unen
arriba (región 5’) del sitio de inicio de la transcripción, aun- a él y los otros elementos involucrados: promotor proximal;
que también se han localizado hacia el extremo 3’ (corrien- promotor distal; silenciadores; potenciadores y aisladores;
elemento de respuesta para el TFIIB (BRE); caja TATA (TATA);
te abajo). Las regiones que controlan la transcripción de un
elemento iniciador (Inr); elemento promotor corriente abajo
gen no necesariamente tienen que estar cerca de la región (DPE); factor transcripcional IIB (TFIIB); factor de unión a la
codificadora. Estas regiones son mucho más complejas y caja TATA (TBP), y factor transcripcional IID (TFIID). Pb: pares
pueden activar o desactivar genes. de bases.
 CAPÍTULO 5 • Transcripción 47

Los potenciadores o secuencias amplificadoras (enhan-
cers) son secuencias cortas que potencian o aumentan la
transcripción del gen de manera cooperativa con otras
secuencias reguladoras y alteran la estructura del ADN, ya
que inducen el superenrollamiento en la zona del promotor
basal y aumentan la unión de TF, lo que implica una aproxi-
mación f ísica entre ambos y una flexibilidad en la molécula
de ADN, y favorece el inicio de la transcripción.
Por otra parte, los silenciadores (silencers) son secuencias
cortas de nucleótidos de dos tipos: los elementos silenciado-
res o los elementos de regulación negativa (negative regula-
tion elements, NRE) y pueden actuar de varias maneras:
1. Modificando la estructura de la cromatina y evitando
que los genes sean activados.
2. Reclutando factores transcripcionales represores y evi-
tando que factores transcripcionales inductores se unan
al ADN.
3. Alterando el proceso de corte y empalme del ARN hete-
rogéneo nuclear y evitando su maduración.
4. Creando señales que bloquean la traducción, e inacti-
vando así la expresión génica.
La acción de un potenciador o un silenciador puede
inhibirse por la presencia de secuencias aisladoras, cuya
función es bloquear la transmisión de la señal de un sitio a
otro en el ADN e impedir el silenciamiento. La mayoría de
los potenciadores o silenciadores actúan sobre el promotor
que se encuentra vecino, sin ser específicos de un determi-
nado gen.
Tipos de ARN polimerasa
La enzima protagonista en este proceso es la ARN pol, que
sintetiza una cadena de ARN en dirección 5’ → 3’ al igual
que la ADN pol. Esta enzima actúa de manera continua
durante toda la unidad de transcripción: primero sobre el
sitio de inicio indicado en el promotor basal, continúa en la
secuencia codificadora y finaliza en una secuencia de termi-
nación. En las células eucariotas los genes nucleares son
transcritos por tres tipos de ARN pol: I, lI y III, que transcri-
ben diferentes tipos de genes en lugares específicos del
núcleo. Cada una reconoce promotores y TF con caracte-
rísticas específicas. Las ARN pol de mitocondrias se aseme-
jan más a la ARN pol bacteriana, dada la menor complejidad
de los genomas de estos organelos (figura 5-5).
La ARN pol I reside en una zona definida del núcleo, el
nucleolo, donde transcribe los genes que codifican para los
ARNr. Esta enzima sintetiza un único tránscrito, el ARNr

Núcleo
GEN ARN
GEN ARN GEN ARN GEN ARN Pequeño
Transferencia Mensajero Ribosomal nuclear

ADN

A ARN
Pequeño
ARNt ARNhn ARNr nuclear

B ARNm
D

Factores
Citoplasma Polimerasa Producto Génicos Localización transcripcionales
C

ARN pol-I ARNr grande: 28S, 18S y 5.8S Nucléolo TFI

ARN pol-II ARN, ARNm, ARNsn Nucleoplasma TFII

ARN pol-III ARN pequeño: 5S, ARNt Nucleoplasma TFIII

Figura 5-5. Enzimas productoras de ARN. La síntesis de todos los tipos de ARN se lleva a cabo en el núcleo por enzimas espe-
cíficas donde la ARN pol I sintetiza el ARNr; la ARN pol II, el ARNm, y la ARN pol III, el ARNt y el ribosomal 5s. Después de su
maduración son transportados al citoplasma para su función.
48 PARTE I • Conceptos básicos de biología molecular
45S, precursor de los ARNr 18S, 28S y 5.8S. La ARN pol III
se encuentra en el nucleoplasma y es la encargada de la sín-
tesis de los ARNt, el ARNr 5S y otros pequeños ARN (small
nuclear, ARNsn).
La ARN pol II también se encuentra en el nucleoplasma
y sintetiza las moléculas de ARNhn, el precursor del ARNm
y algunos ARNsn. Existen tres subunidades comunes para
las tres ARN pol: en primer lugar, una subunidad grande, el
dominio terminal carboxilo (carboxy terminal domain,
CTD), que puede ser altamente fosforilada en los residuos
de serina y treonina, y es muy importante en el inicio de la
transcripción, en el corte y empalme, en la modificación de
los extremos del ARN y en la terminación. Las otras dos
subunidades son las de reconocimiento de la secuencia de
ADN y la del sitio catalítico.
Factores transcripcionales
(generales y específicos)
La producción de ARNhn por la ARN pol II requiere de una
regulación mucho más compleja, donde el número y el tipo
de factores de transcripción involucrados es mayor. Como
se mencionó anteriormente, los TF son proteínas que se
unen al ADN en el promotor, potenciador o silenciador
para el control de la expresión de los genes. Éstos se unen al
ADN reconociendo una secuencia específica, aunque una
misma secuencia puede ser reconocida por más de un TF,
que puede ser activador o represor. Los TF se han clasifica-
do, de acuerdo con su función, en factores transcripciona-
les generales o basales y factores transcripcionales indu-
cibles.
Factores transcripcionales (TF)
generales o basales
Son los requeridos para el inicio de la transcripción en
todos los promotores basales. Se unen a la ARN pol para
formar un complejo que rodea el sitio de inicio, determi-
nando la iniciación. Los TF toman el nombre de la ARN pol
con la que actúan y, junto con ésta, forman el aparato básico
de transcripción. Por lo tanto, los TF que actúan con la
ARN pol I se denominan TF I; los que actúan con la ARN
pol II, TF II, y los que actúan con la ARN pol III, TF III.
Factores transcripcionales inducibles
El conjunto de TF requerido para la expresión de un deter-
minado gen es particular para cada promotor. Los TF indu-
cibles, o TF de tejido específico, interactúan con el ADN de
la misma manera que los TF generales, pero su función es
más bien reguladora y se unen preferentemente a los pro-
motores distales. Se sintetizan o activan bajo un estímulo y
controlan la transcripción en tiempo y espacio. Un gen con
un promotor que contenga secuencias reconocibles sólo
por los TF generales puede transcribirse en cualquier tipo
celular y éstos son los responsables de la expresión de genes
que se expresan constitutivamente. En cambio, los genes
controlados por TF inducibles requieren de la formación de
un complejo mediador estimulado de forma aleatoria.
Proceso de transcripción
La transcripción tiene lugar en el núcleo. En el sitio de ini-
cio de la transcripción, la molécula de ADN se separa de
forma transitoria en dos cadenas sencillas y una se utiliza
como molde para la síntesis de ARN, formando una burbu-
ja (burbuja de transcripción). Conforme la ARN pol avanza
y copia el ADN, el ADN ya copiado se vuelve a unir a su
cadena complementaria y forma nuevamente la doble héli-
ce, liberando el ARN como una cadena sencilla de nucleóti-
dos (sólo los últimos 25 nucleótidos sintetizados forman
complejo con el ADN). La reacción de transcripción se
divide en tres etapas: iniciación, elongación y termina-
ción.
El reconocimiento del promotor basal, o preiniciación,
de la transcripción inicia con la unión de la primera proteí-
na del complejo del TFIID a la caja TATA, conocida como
proteína de unión específica de TATA (TATA binding pro-
tein, TBP). La TBP tiene la capacidad inusual de unirse al
ADN por el surco menor donde lo dobla. Esta unión pro-
voca una deformación en la estructura del ADN sin sepa-
rar las dos cadenas. Es el componente clave en el
posicionamiento de la ARN pol II y delimita la distancia
desde el punto de inicio hasta la caja TATA. En los promo-
tores que carecen de caja TATA, la TBP puede incorporar-
se por asociación a otras proteínas que reconocen el ADN.
El TFIID está formado, además de por la TBP, por 11 TAF
(TBP associated protein). Los TAF son subunidades dife-
rentes y pueden reconocer una variedad de promotores
tanto basales como distales. Estas proteínas desempeñan
un papel fundamental en el nexo entre el aparato basal de
transcripción y los otros factores 5’ y TF reguladores, para
formar el complejo mediador de la unidad transcripcional
(figura 5-6).
El TFIIA controla la capacidad de unión de TBP al ADN
y permite al TFIID reconocer la región que se extien-
de hacia el extremo 5’. El TFIIB es otro factor que se une de
forma adyacente a TBP, específicamente en la secuencia del
promotor basal BRE y proporciona mayor superficie de
reconocimiento para el anclaje de la ARN pol II. El TFIIF es
el medio de unión de la ARN pol II al complejo de trans-
cripción.
La proteína TFIIH tiene actividad helicasa y contacta
con la ARN pol II, lo que le permite su anclaje a ésta. La
burbuja de transcripción se origina mediante un desenro-
llamiento local, que se inicia en el sitio de unión de la ARN
pol II. En el caso de promotores débiles, en este paso tiene
lugar el ensamblaje de todas las proteínas necesarias para
iniciar la síntesis.

A Complejo de preiniciación
TBPTFIID D Iniciación
TATA +1
TFIIB
TFIIA
B
P-P-P
TBPTFIID
TATA +1
TFIIF
ARN pol II
C del promotor en presencia de TFEII y TFHII, además de los
P-P-P
TATA 10 nucleótidos ARN
+1
Figura 5-6. Iniciación de la transcripción. A, en la etapa de
preinicio la proteína de unión a la caja TATA, TBP, interactúa
con el surco menor del ADN, activando el complejo de preini-
cio y curvando la doble hélice. TBP forma parte del TFIID. B,
TFIIA controla la capacidad de unión de TBP al ADN y permite
a TFIID reconocer la región que se extiende hacia el extremo
5’. TFIIB proporciona una mayor superficie de reconocimiento
para el anclaje de la ARN pol II. C, formación del complejo
entre TFIIF y la ARN pol II. La ARN pol queda colocada sobre
el sitio de inicio de la transcripción. Se une TFIIE que recluta
a TFIIH. TFIIH tiene actividad de helicasa y desnaturaliza al
ADN, exponiendo la secuencia nucleotídica a la ARN pol II.
Inicio D, se refiere a la síntesis de los primeros 10 enlaces
nucleotídicos del ARN. El extremo CTD de la ARN pol II es
fosforilado en varias posiciones. La ARN pol II se suelta de
todos los factores de transcripción, y sólo TBP queda unido a
la caja TATA.
1. Inicio. El inicio se refiere a la síntesis de los primeros
enlaces nucleotídicos de ARN. La ARN pol II permanece
en el promotor mientras sintetiza los primeros nueve
enlaces. La fase de inicio puede retrasarse por la ocu-
rrencia de intentos abortivos, en los que la enzima sinte-
tiza pequeños fragmentos (menos de nueve bases) y los
libera, y vuelve a iniciar nuevamente. El inicio termina
cuando la enzima comienza a alargar la cadena y abando-
na el promotor con el complejo de iniciación (figura 5-6).
2. Elongación. La fase de elongación requiere de las pro-
teínas TFIIE y TFIIH, que se unen corriente arriba de la
ARN pol II; ambas se requieren para iniciar su movi-
miento a lo largo del ADN y el abandono del promotor
basal. Una vez unida TFIIE, se pueden unir TFIIH, que
excepcionalmente continúa unido a la ARN pol II y tie-
ne varias actividades: ATPasa, helicasa y cinasa, que
puede fosforilar el dominio CTD de la ARN pol II. La
fosforilación del dominio carboxiterminal (CTD) está
implicado en el abandono del promotor basal y el inicio
de la fase de elongación. En la elongación, la enzima
ARN pol II se mueve a lo largo del ADN y sintetiza la
cadena naciente de ARN. A medida que la enzima avan-
za sobre el ADN, lo desenrolla para exponer un nuevo
CAPÍTULO 5 • Transcripción 49
Elongación
P-TEFb,hSPT5 Terminación
Corrector de errores Corte y Empalme (splicing)
TFIIS TAT-SF1
CPSF
Guanil
transferasa 20 - 40 CstF
+ 7mG 5’ nucleótidos ARN
metilasa
7mG5’ AAUAAAAA
200 nucleótidos
Figura 5-7. Elongación: en esta etapa la ARN pol II se libera
factores de elongación PTEFb y TFIIS, que evitan la termina-
ción prematura. TFIIS (elonguina) participa en la reparación
en caso de que un nucleótido no sea apareado correctamente.
hSPT5 es un factor de procesamiento del extremo 5’. Termi-
nación: implica la formación de la señal de poliadenilación y
terminación AAUAAAAA y la adición de la cola de poli-A en
el tránscrito de ARN, así como la separación del complejo de
transcripción. Los procesos de elongación y terminación son
simultáneos. El factor CPSF es específico de la poliadenilación.
El factor CstF participa en la escisión. El complejo proteico TAT-
SF1 recluta el ayustosoma.
segmento de cadena sencilla de ADN, que fungirá como
molde. Los nucleótidos se añaden de forma covalente al
extremo 3’OH y en la región desenrollada se forma un
híbrido ADN-ARN (figura 5-7)
3. Terminación. La terminación de la transcripción
implica el reconocimiento de una secuencia que contie-
ne una región rica en GC, en una serie de seis o más
adeninas contenidas en el tránscrito de ARN. En la
transcripción del ARN se leería como la señal de polia-
denilación que determina el final de la adición de
nucleótidos a la cadena y la desintegración del complejo
de transcripción. Se presume que este proceso puede
ser mucho más complejo. Cuando se añade el último
nucleótido a la burbuja de transcripción se colapsa al
desaparecer el híbrido ADN-ARN, y se libera la ARN
pol II. Es importante mencionar que existe una super-
posición de eventos, de tal manera que los procesos de
elongación, terminación y maduración del ARNhn son
simultáneos, por lo que cuando termina la transcrip-
ción ya existe un ARNm maduro y listo para transpor-
tarse al citoplasma (figura 5-7).
Procesamiento del ARN
El tránscrito primario, o ARNhn, tiene que procesarse de
diversas formas para su maduración antes de exportarse del
núcleo y participar en el proceso de traducción. El proceso
de maduración incluye la adición de un capuchón de guani-
na modificada en el extremo 5’, la poliadenilación del extre-
mo 3’, el corte y empalme, además del proceso de edición
que sucede sólo en algunos genes (figuras 5-7 y 5-8).
El extremo 5’ se modifica cuando el ARN es apenas un
polímero de 20 a 40 ribonucleótidos, por la adición de una
50 PARTE I • Conceptos básicos de biología molecular

A Modificación del extremo 5’ Corte y empalme (splicing)

OH OH
H H H H
El proceso de corte y empalme (splicing) consiste en la
5’
O B Modificación del extremo 3’ remoción de los intrones (las secuencias intragénicas no
CH2
3’ 7mG 5’ CPSF codificadoras de la región codificadora) y el empalme de los
P P P O CstF
5’ Guanilil exones (bloques de secuencias codificadoras para formar el
transferasa ARNm maduro). Los exones y los intrones pueden empal-
+ 5’ AAUAAA AAAAAAAA3’
2’-O-methyl- marse en más de una forma y generar variantes del ARNm
3’ transferasa
por corte y empalme alternativo. Las regiones en el ARNhn
C Eliminación de intrones 5’ ADN 3’
reconocidas por la maquinaria de corte y empalme son
y empalme de exones
5’ E1 E2 E3 E4 E5 3’
secuencias conservadas de nucleótidos específicas que
ARNsn limitan los exones y los intrones, e indican dónde se realiza-
Exones U1 U2 5’ ARNm 3’
U4 U5 U6
rá el corte y el empalme, sitio de empalme 5’ y 3’ (donante y
Intrones
receptor, respectivamente); una tercera secuencia, conoci-
Figura 5-8. A, adición de la caperuza o casquete en el extre- da como sitio de ramificación, se encuentra en la secuencia
mo 5’. La base modificada 7 metilguanosina (7mG) se añade del intrón. Las enzimas del proceso también conocido
en 2’-OH de la última base del Marne, eliminando un grupo como ayustosoma median dos reacciones de transesterifi-
fosfato con la formación de un enlace entre carbono 5’-5’ de cación sucesivas donde se rompen y se forman dos enlaces
las ribosas. B, modificación del extremo 3’ con la adición de
fosfodiéster nuevos. El ayustosoma está formado por 150
la cola de Poli A en presencia de los factores CPSF y CstF, al
reconocer la secuencia AAUAAA presente en el ARNm. proteínas y 5 ARN nucleares pequeños (ARNsn), conocidos
C, eliminación de intrones y empalme de exones (splicing), como U1, U2, U4, U5 y U6; por lo tanto, es una riboproteí-
con la formación del ayustosoma con ataque nucleofílico y na. Las reacciones se pueden dividir en tres etapas:
transesterificación.
1. Identificación de las secuencias donantes 5’ y sitio de
ramificación por U1 y U2, respectivamente, ayudado
por proteínas accesorias.
2. Formación de un plegamiento del ARN para acercar los
7-metil-guanosina, en tres pasos enzimáticos: la elimina-
tres sitios de corte y empalme, ayudado por U4, U5 y
ción de un grupo fosfato (enzima ARN trifosfatasa); la adición
U6; en este momento, se produce el ataque nucleof ílico
del nucleótido guanina (enzima guanilil transferasa), y por
de la adenina conservada en el sitio de ramificación en
último, su metilación (enzima metil transferasa). Las tres
el enlace fosfodiéster de una guanina conservada del
enzimas son reclutadas por el factor de elongamiento
sitio donante 5’, formando un nuevo enlace fosfodiéster
hSPT5 unido al CTD de la ARN pol II. La 7-metil guanosi-
y una estructura llamada lazo intrónico.
na queda unida a través de un enlace entre carbono 5’-5’ de
3. Liberación de U1. Es remplazado por U6. En la segunda
las ribosas (figura 5-8A).
reacción de transesterificación el sitio donante 5’ libre
La etapa de la terminación de la transcripción y la adi-
se convierte en un nucleófilo que ataca el sitio receptor
ción de la cola de poliadenilación (poli-A) en el extremo 3’
3’. Los exones se empalman y liberan el lazo intrónico.
están íntimamente ligadas. El CTD de la ARN pol II, de
En este momento se libera U4 y entran en contacto U6
igual manera, participa en el reclutamiento de las enzi-
y U2, y la unión de los exones es mediada por U5. El
mas para la poliadenilación que sucede al encontrar secuen-
ayustosoma es constantemente reciclado y reclutado
cias de reconocimiento en el ARN tránscrito primario en
por el CTD de la ARN pol II a través del TAT-SF1 (figu-
tres procesos:
ra 5-8C).
1. Los complejos proteicos, el factor estimulante de la esci-
sión (cleavage stimulation factor, CstF) y el factor espe-
Edición del ARN
cífico de poliadenilación y escisión (cleavage and
polyadenylation specificity factor, CPSF), transferidos La edición es una forma de modificación postranscripcio-
desde CTD al ARNhn, lo escinden. nal del ARNm. En algunos casos genera el cambio de un
2. Adición de alrededor de 200 residuos de adenina en el aminoácido importante por otro o codones de paro de la
extremo 3’ por la enzima poli-A polimerasa. Es impor- traducción y la generación de una proteína truncada. El
tante mencionar que la cola de poli-A sólo se añade a los proceso de edición sólo se presenta en ciertos genes, en
ARN generados por la ARN pol II; es decir, los que pre- algunos tejidos o en algunos tipos celulares. Existen dos
sentan la señal de poliadenilación AAUAAA. mecanismos que median la edición: la desaminación oxida-
3. La ARN pol II continúa añadiendo nucleótidos antes de tiva de una citosina metilada, que se convierte en uridina
colapsar la burbuja de transcripción, por lo que la señal del codón CAA (enzima citidina desaminasa) y genera el
de poliadenilación es clave para el proceso de termina- codón de paro UAA, o el cambio de aminoácido adenina
ción (figura 5-8B). por inosina, que prefiere aparearse con citosina (enzima

adenosina desaminasa de acción sobre ARN, ADAR),
mecanismo propio de los mamíferos, incluido el ser huma-
no. La inserción o deleción de una uridina dirigida por un
ARN guía se ha observado en procariotes, y ha cambiado
los marcos de lectura para la traducción. El ejemplo más
representativo del proceso de edición es en el ARNm de la
apoliproteína B (ApoB). El ARNm sintetizado en el hígado
produce una cadena polipeptídica de 100 aminoácidos, por
lo que se lo conoce como ApoB-100. Este mismo gen en el
intestino, al ser tránscrito, sufre un proceso de edición, en
el que una citosina en la posición 2152 es desaminada y se
convierte en U, cambiando el codón CAA por UAA, un
codón de terminación que provoca la formación de una
Preguntas de repaso
1. ¿Cuál es la definición molecular que describe mejor un gen?
a) Locus específico del ADN que contiene información y
almacenamiento para la descendencia.
b) Secuencia del ADN que contiene la información para
la síntesis de ARN.
c) Secuencia del ADN específica de unión a proteínas
necesarias para la función celular.
2. ¿Qué diferencias existen en la transcripción entre euca-
riotes y procariotes?
a) Mayor complejidad en la regulación, se realiza en el
núcleo, requiere procesamiento del ARN, son genes
monocistrónicos.
b) Se realiza en el citoplasma, son genes policistrónicos,
no requieren procesamiento del ADN.
c) Menor complejidad en la regulación, se realizan en el
citoplasma, traducción y transcripción de manera si-
multánea.
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CAPÍTULO 5 • Transcripción 51
proteína truncada de tan sólo 48 aminoácidos denominada
ApoB-48.
Regulación de la transcripción
Las diferencias fenotípicas que caracterizan a las diferentes
células presentes en organismos multicelulares, a pesar de
tener el mismo genotipo, se deben a la expresión diferencial
de sus genes. El desarrollo y el fenotipo de un organismo
pueden regularse por el producto génico que interactúa con
otros genes o con el ambiente en tiempo y espacio. Existen
diversos mecanismos por los cuales se puede controlar la
expresión de los genes (véase el capítulo 7).
3. Esquematiza (dibuja) la secuencia de eventos de la trans-
cripción.
4. Son funciones del dominio proteico CTD de la ARN pol II:
a) Regulación negativa, formación de la burbuja de
transcripción y síntesis de ribonucleótidos.
b) Enzima metiltransferasa, colapso de burbuja de trans-
cripción y sitio de unión al ADN.
c) Reclutamiento de las enzimas, función de ATPasa y
helicasa.
5. ¿Cuáles son las modificaciones del ARNhn que lo con-
vierten en un ARNm?
a) Superenrollamientos, modificación del extremo 3’ con
una guanina metilada.
b) Poliadenilacion del extremo 3’, corte de los intrones y
empalme de los exones.
c) Formación de estructuras secundarias, corte de los
exones y empalme de los intrones.
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