L'atome

L'atome est la plus petite unité de matière et

est formé d'un noyau (protons et neutrons)
et d'électrons.

C'est un ensemble électriquement neutre dont la

taille est proche 10-10 mètres de vide.

Le noyau est constitué :

 de protons (p), porteurs d'une charge
positive :
 masse ~ 10-27 kg ;
 taille ~ 10-15 m ;
 1 charge positive par proton ;
 de neutrons (n), particules de charge neutre :
 masse ~ 10-27 kg ;
 neutres ;
 n + p = A = nombre de masse.
Le noyau est donc chargé positivement.

Les électrons sont :

 porteurs d'une charge négative ;
 entourent le noyau ;
 masse ~ 9.10-31 kg ;
 dans un atome :
 nombre d'électrons (Z = numéro atomique) ;
 égal au nombre de protons ;
 électriquement neutre ;
 disposition " autour " des atomes ;
 " couches électroniques ", " nuage
électronique " ;
 l'ensemble = cortège électronique ;
 la dernière couche explique les propriétés
chimiques. Elle s'appelle la couche de
valence (ou couche périphérique) d'un
atome, elle est la plus éloignée du noyau. Ce
sont les électrons de la couche de valence,
appelés électrons de valence, qui
interviennent dans les liaisons chimiques.
Atome 1
 Atome 2
Représentation symbolique :

X = symbole chimique = nom

 lié au numéro atomique ;
 lié au nombre d'électrons Z ;
 même nombre de protons ;
 donc neutrons = A – z ;
 même Z Mais, A différents ;
 isotopes ;
  mêmes propriétés chimiques ;

Représentation symbolique de l’atome

Classification périodique :
 par numéros atomiques croissants ;
 par propriétés chimiques.
 Classification périodique des éléments
A la base du concept de mole :
[Mole = quantité de matière (mol.)]
 nombre d'atomes de carbone contenus dans
12 grammes de 12 C ;
 ~ 6.1023 atomes (N, nombre d'Avogadro) ;
Masse molaire d'un élément chimique
 Masse de 6.1023 atomes ;
 en première intention, proche de A ;
 g.mol-1.
 43.3. La molécule
La molécule est une association d'atomes,
qui se fait par mise en commun ou cession
d'électrons.

La molécule
La molécule est plus stable qu'un atome grâce :
 aux liaisons covalentes.
 elle favorise la mise en commun d'une paire
d'électrons.
 le carbone à quatre liaisons, l'oxygène à
deux liaisons, l'hydrogène une liaison etc.
 le nombre de liaisons possibles dépend du
nombre d'électrons disponibles qui se
trouvent sur la couche extérieure du noyau.
 à la ionisation. Un ion est un atome ou un
groupe d' atomes qui a perdu ou gagné un
ou plusieurs électrons
 les anions sont négatifs.
 les cations sont positifs.

Tableau Anions/cations
Par exemple, le magnésium : il a deux électrons
libres sur la couche externe du noyau. Il va
céder les deux électrons du bord, le noyau aura
12 protons (+) et il ne restera que 10 électrons (-
) après la cession donc: (+12) + (-10) = +2 d'ou
Mg ²+

Quelques éléments chimiques constituant le

vivant.
 le carbone (C):
o quatre liaisons chimiques ;
o il construit des molécules du vivant ;
o il peut se lier avec lui-même ou avec la
plupart des autres molécules.
 l'oxygène (O):
o deux liaisons chimiques.
 l'hydrogène (H.) :
o une liaison chimique ;
o c'est l'élément le plus associé au carbone.
 l'azote (N.) :
o trois liaisons chimiques ;
 o c'est un des constituants des protéines et
des acides nucléiques (ADN, ARN etc.).
 le soufre (S.) :
o deux liaisons chimiques ;
o il entre dans la composition d'insuline.
 le phosphore (P.) :
o trois ou cinq liaisons chimiques ;
o il rentre dans la constitution de molécules
énergétiques comme l'ATP.

43.4. Molécule organique /

molécule inorganique
Une molécule organique contient du
carbone, et est produite par un organisme
vivant (végétal ou animal).

Exemple : glucides, protéines, lipides....

Les petites molécules organiques peuvent

ensuite s'associer en des molécules plus
grosses ou se dissocier par l'entremise de deux
réactions (synthèse et dégradation).
Ces réactions sont possibles grâce à l'action des
enzymes qui vont couper ou assembler les
molécules.

Une molécule inorganique ou minérale ne

contient pas d'atomes de carbone : sels
minéraux, oligo-éléments.

Réaction de synthèse d’une molécule

 Réaction de dégradation d’une molécule

44. L'eau : principal

constituant de la matière
vivante
L'eau est composée de 2 atomes
d'hydrogène et d'un atome d'oxygène et a
une structure de triangle isocèle.
Molécule d’eau 1
 Molécule d’eau 2
Elle est " polaire " ou polarisée car :
 O est électronégatif (électrons libres) ;
 H est électropositif ;
 les atomes d' H vont pouvoir établir des
liaisons hydrogène avec des molécules
biologiques également polaires par leur
fonctions :
 alcool –OH ;
 Acide –COOH ;
 Aldéhyde –CHO ;
  Cétone C=O ;
 Amine -NH2.
L'eau est donc un solvant, capable de
dissoudre des substances appelées solutés.

L'oxygène, étant plus électronégatif que

l'hydrogène, attire davantage les électrons vers
lui.

Le nuage électronique est déformé et son centre

ne coïncide plus avec le centre de la molécule.

Déformation du nuage électronique

 L’eau
Les liaisons hydrogène se rompent et se
reforment constamment.

Cristal de sel se dissolvant dans l'eau : des

molécules d'eau entourent chaque ion du soluté
(= hydratation)
 Hydratation de cristaux de sel
Protéine hydrosoluble (ex. : lysozyme). Les
régions ioniques et polaires à la surface d'une
protéine attirent les molécules d'eau
 Protéine hydrosoluble

44.1. L'eau de l'organisme

L'eau est quantitativement le composant le plus
abondant de la matière vivante.

Elle représente 55 à 65 % du poids total de

l'organisme humain et reste variable selon l'âge
et le sexe :
 embryon 97% ;
 nourrisson 70% ;
  adulte 60-65% ;
 sujet âgé 45% ;
Variable selon les tissus :
 muscle 83% ;
 os 22%.
Elle se répartit dans différents compartiments
hydriques :
 le compartiment intra-cellulaire pour environ
40 % (sur 60% du poids corporel total) ;
 le compartiment extra-cellulaire pour environ
20% (sur 60% du poids corporel total)
constituant par lymphe et plasma ;
Chaque compartiment est une solution de
solutés (Na+, K+, Cl-, glucose, urée...) dans de
l'eau pure.

Dans l'eau, il existe de nombreux composés

sous forme ionisée (Na+, K+, Cl-...).

Dans chaque compartiment, la quantité de

solutés (osmoles) est identique, Mais, leur
nature est différente.

Ex : [K+] très élevée dans la cellule, basse dans

le plasma.

Ex : [Na+] basse dans la cellule, élevée dans le

plasma.

Les deux compartiments intra et extra cellulaires

sont séparés par une membrane semi
perméable (parois des cellules, parois des
vaisseaux...).

Cette membrane permet les mouvements

passifs de l'eau d'un compartiment à l'autre :
 moins concentré vers plus concentré ;
 toute variation de concentration d'un soluté
dans un des 2 compartiments entraîne un
mouvement d'eau pour maintenir une
osmolalité identique de part et d'autre.
 Osmose
La membrane cellulaire est semi-perméable :
perméable à l'eau :
 diffusion de l'eau du secteur le moins
concentré vers le plus concentré.
Osmolalité plasmatique = C° de toutes les
particules osmotiquement actives (molécules
responsables des échanges d'eau entre les
secteurs intra et extra-cellulaires).
 Rôles de l'eau de l'organisme :
 hydrate les cellules ;
  participe à l'équilibre thermique du corps
(amortit les chocs thermiques) ;
 permet l'ionisation de nombreux composés ;
 assure la distribution des nutriments ;
 participe aux réactions d'hydrolyse qui se
produisent ;
Par exemple lors de la digestion : ex : maltose
donne 2 glucose.
 assure l'élimination des déchets.

44.2. Le bilan hydrique et sa

régulation
44.2.1. Le bilan hydrique
Il permet d'évaluer avec précision les
apports liquidiens de l'organisme et les
pertes liquidiennes sur 24 heures.

Entrées : ~ 2,5 L/jour :

 boissons : 1,2 L ;
 aliments : 1 L ;
 eau métabolique : 0,3 L.
Sorties : ~ 2,5 L/jour :
 urines : 1,5 L ;
 selles : 0,1 L ;
 sueur : 0,5 L ;
 respiration : 0,4 L.

44.2.2. Régulation du bilan

hydrique
La régulation peut se faire par :

44.2.2.1. La soif
 mécanisme de défense permettant
d'augmenter l'ingestion d'eau en réponse à
un déficit de liquide de l'organisme ;
 facteurs de stimulation :
 volo-recepteurs ;
 baro-recepteurs ;
 osmo-recepteurs ;
 mécanisme tardif !!!
 on a soif quand on a perdu 3% d'eau ;
  on est mort quand on a en a perdu 20%.
Attention aux populations fragiles :
 bébés ;
 patients âgés ;
 patients inconscients...
Intoxication à l'eau
 dilution en excès du plasma : hypotonique ;
 GR turgescents => hémolyse ;
 œdème cérébral => troubles de la
conscience, convulsion => mort (causes :
potomanie, traitement au Lithium)

44.2.2.2. Les hormones

 régulation des sorties d'eau :
 l'hormone antidiurétique augmente la
réabsorption d'eau pure au niveau du rein ;
 l'aldostérone augmente la réabsorption active
de Na+ (et d'eau) au niveau du rein et de
l'intestin ;
 ces mécanismes hormonaux sont activés en
réponse à une hypovolémie, hypotension...