JOURNAL READING

“Clinical Performance Of The Cytoscan Dx Assay In

Diagnosing Developmental Delay/Intellectual Disability”

Oleh
Wahidah Hardyanti
Sukaji
H1A014079

PEMBIMBING
dr. Titi Pambudi Karuniawaty, M.Sc,
Sp.A

DALAM RANGKA MENGIKUTI KEPANITERAAN KLINIK

MADYA BAGIAN ILMU KESEHATAN ANAK
FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS MATARAM
RUMAH SAKIT PROVINSI NTB
2018

KATA PENGANTAR

Puji syukur saya panjatkan kehadirat Allah SWT, karena hanya dengan
rahmat dan hidayah-Nya, saya dapat menyelesaikan journal reading yang berjudul
“Clinical performance of the CytoScan Dx Assay in diagnosing
developmental delay/intellectual disability”. Journal reading ini saya susun
dalam rangka memenuhi tugas dalam proses mengikuti kepaniteraan klinik di
bagian SMF Ilmu Kesehatan Anak Rumah Sakit Umum Propinsi Nusa Tenggara

1
Barat, Fakultas Kedokteran Universitas Mataram. Saya berharap penyusunan
jurnal reading ini dapat berguna dalam meningkatkan pemahaman kita semua
Saya menyadari bahwa jurnal reading ini masih belum sempurna. Oleh
karena itu, saya sangat mengharapkan kritik dan saran yang membangun untuk
perbaikan laporan ini. Semoga Allah selalu memberikan petunjuk-Nya kepada kita
semua di dalam melaksanakan tugas dan menerima segala amal ibadah kita.

Mataram, 23 Agustus 2018

Penyusun

IDENTITAS JURNAL

• Judul : Clinical Performance Of The Cytoscan Dx Assay In

Diagnosing Developmental Delay/Intellectual Disability

2
• Penulis :Rolph Pfundt, PhD,Kat Kwiatkowski, MPH,
Alan Roter, PhD, Anju Shukla, MS, Eric Thorland, PhD,Richard Hockett, MD
Barbara DuPont, PhD, Eric T. Fung, MD, PhD and Alka Chaubey, PhD
• Penerbit : American College of Medical Genetics and Genomics
• Tahun terbit : 2016

ABSTRAK

Tujuan: Prevalensi cacat saat perkembangan di Amerika dilaporkan 13,87% pada

semua ras, etnis, dan sosial ekonomi kelompok. Microarray adalah suatu
modalitas yang telah direkomendasikan sebagai tes tingkat pertama untuk pasien

3
dengan gangguan perkembangan. Penelitian ini melaporkan hasil diagnostik dan
potensi kemampuan tindakan menggunakan kromosom densitas tinggi microarray
(CMA).

Metode: Hasil diagnostik CytoScan Dx Assay pada 960 pasien dinilai dengan
kriteria tindakan Riggs untuk mengevaluasi prediksi utilitas klinis.

Hasil: Delapan puluh enam persen subjek dinilai menggunakan microarray

sebagai bagian dari perawatan pasien rutin historis (RPC). Tingkat temuan
patogen serupa antara RPC (13,3%) dan Cyto- Scan Dx Assay (13,8%). Di antara
138 pasien yang tidak menerima microarray sebagai RPC, hasil diagnostik untuk
CytoScan Dx Assay adalah 23,9% dibandingkan dengan 14,5%, menunjukkan
peningkatan 9,4% saat menggunakan metode resolusi tinggi. Tiga puluh lima
persen pasien dengan temuan abnormal telah memprediksi implikasi manajemen
klinis.

Kesimpulan: Ini adalah studi pertama untuk menilai kinerja klinis dari CytoScan
Dx Assay. Hasil diagnostik pengujian serupa dengan yang ditemukan dalam
penelitian lain dari CMA. Tiga puluh lima persen pasien dengan temuan abnormal
diperkirakan memiliki manajemen klinis implikasi yang dapat meningkatkan
kualitas kesehatan pasien.

PENDAHULUAN

Prevalensi cacat perkembangan adalah 13,87% di semua kelompok ras, etnis,

dan sosial ekonomi, dan 1 di 33 bayi lahir dengan anomali kongenital di Amerika
Serikat. Sering, orang dengan cacat perkembangan ( keterlambatan perkembangan
dan / atau cacat intelektual (DD / ID)) hadir dengan satu atau lebih anomali
kongenital atau dismorfik fitur. Individu yang terkena ini memiliki tantangan
seumur hidup, termasuk kesulitan dengan gerakan fisik, pembelajaran, dan

4
interaksi sosial. Intervensi dini penting untuk menyediakan hasil yang lebih baik
untuk anak-anak ini dengan kebutuhan khusus. Meskipun ini, rata-rata, diagnosis
kecacatan perkembangan pada anak-anak tidak terjadi sampai mereka mencapai
usia 4 tahun atau 2,6 tahun pada anak-anak dengan cacat perkembangan dan cacat
intelektual. Penegakkan diagnosis yang mendasari sejak dini memiliki potensi
untuk mengurangi biaya perawatan kesehatan dan menyediakan dokter dan
keluarga dengan informasi tentang gangguan yang mempengaruhi anak,
prognosis, dan komorbiditas, semuanya memiliki implikasi di luar perawatan
medis.

Secara historis dengan penggunaan teknik sitogenetika tradisional seperti

hibridisasi karyotyping dan fluoresensi in situ (IKAN), hanya sebagian kecil
pasien (6%) berhasil didiagnosis, karena batasan pada resolusi. Namun, dalam
beberapa tahun terakhir, dengan munculnya teknik-teknik baru seperti microarray
kromosom (CMA), hasil memiliki peningkatan 10–18% .Selain itu, baru-baru ini
dilaporkan oleh Shashi bahwa ketika kombinasi alat laboratorium termasuk
microarray digunakan, 46% dari pasien yang dicurigai memiliki penyakit genetik
didiagnosis dan 72% dari diagnosa dilakukan pada kunjungan pertama. Para
penulis juga menunjukkan bahwa diagnosis genetik pada pasien mengarah ke rata-
rata pengurangan biaya di laboratorium genetik (termasuk jumlah kunjungan ke
diagnosis dan biaya dari semua tes genetik yang dilakukan) dibandingkan dengan
yang pasien tidak terdiagnosis. Telah dilaporkan bahwa microarray analisis untuk
mendukung dampak standar perawatan pasien manajemen pasien hingga 70% dari
waktu.

Dalam dua penelitian retrospektif besar yang mewakili sedikit kurang dari
total 75.000 pasien, diperkirakan 35-46% pasien dengan temuan sitogenetik
patogen dan 7% dari semua pasien akan memiliki semacam perubahan dalam
klinis manajemen berdasarkan hasil microarray. Dua penelitian lain dilaporkan
pada kohor retrospektif yang tingkat aktualnya implikasi klinis yang tersedia dan
menemukan bahwa lebih dari 50% dari semua pasien dengan kelainan memiliki
manajemen klinis perubahan berdasarkan hasil microarray. Meskipun microarray

5
sekarang tes tingkat pertama yang umum dalam populasi pasien ini dan didukung
oleh pedoman medis dari American College of Genetika Medis dan Genomik
(ACMG), Internasional Kolaborasi untuk Genomik Klinis (ISCA / ICCG) dan
American Academy of Neurology, penggantian pembayar untuk pengujian tidak
konsisten, menunjukkan perlunya tambahan sistematis studi menilai perubahan
dalam manajemen pasien yang terjadi sebagai hasil pengujian microarray.

Sebuah penelitian kohort menjelaskan dari 960 pasien yang sebelumnya

menjalani tes genetik standar untuk kecurigaan terhadap suatu gangguan genetik
terkait dengan DD / ID, kelainan kongenital, dan / atau dismorfik fitur, kami
menilai hasil diagnostik dari CytoScan Dx Assay dibandingkan dengan laporan
riwayat pasien atau perawatan pasien rutin (RPC). Untuk menentukan bagaimana
hal ini berhubungan untuk implikasi manajemen, kami menilai utilitas klinis
Assay CytoScan Dx dengan menerapkan kriteria Riggs actionability untuk
kelainan kromosom yang diidentifikasi oleh CytoScan Dx Assay. Pada 2013,
Riggs et al. menerbitkan artikel menggambarkan 186 fenotipe yang dapat ditindak
secara klinis, berpotensi didiagnosis melalui CMA, dan itu terkait secara kausal ke
gen spesifik dan / atau kromosom lokus.

6
METODE

Sampel
Sampel dari pasien yang menjalani pengujian kromosom dikumpulkan dari
Juli 2009 hingga Juli 2012 pada tiga laboratorium: Greenwood Genetic Center
(Greenwood, SC), CombiMatrix (San Diego, CA), dan Mayo Clinic (Rochester,
M N). Kriteria inklusi studi diterapkan pada sampel sebagai berikut:

1. Sampel DNA dari pasien pascanatal yang dirujuk analisis kromosom

berdasarkan kecurigaan DD / ID, kongenital anomali, dan / atau ciri
dismorfik
2. Jenis sampel adalah gDNA yang berasal dari darah pasien darah
3. Sampel gDNA diekstrak dari darah utuh dikumpulkan menggunakan
ethylenediaminetetraacetic tabung pengumpul darah asam atau heparin
4. Sampel gDNA konsentrasi> 150 ng / μl melalui pengukuran densitas
optik atau ≥75 ng / μl melalui PicoGreen (Life Technologies, Eugene,
OR) pengukuran dan diencerkan dalam 1 × Molecular Grade TE
Buffer (Affymetrix, Santa Clara, CA) pH 8,0
5. Volume sampel gDNA adalah ≥20 μl
6. Sampel gDNA telah dianalisis menggunakan metode analisis seluruh
genom (microarray dan kariotipe) dan kedua hasil tes dan laporan
diagnostik pasien bisa disediakan. Sampel dikeluarkan jika sampel
gDNA dianalisis menggunakan microarray Affymetrix sebagai bagian
dari RPC untuk menghindari perbandingan diri dari microarray
Affymetrix. Pelajaran ini telah disetujui oleh dewan peninjau
institusional Greenwood Genetic Center, Mayo Clinic, dan Combi
Matrix Diagnostics.

Analisis Genetik
Perawatan pasien rutin (RPC) di institusi ini bervariasi dan terdiri dari satu
atau lebih metode jumlah salinan seperti kariotipe, IKAN, CMA (tidak termasuk
microarray Affymetrix), polimerase reaksi berantai, atau probe yang pada ligasi
multipleks amplifikasi. Setiap cytogeneticist yang memenuhi syarat atau ahli

7
patologi molekuler menghasilkan laboratorium klinis secara keseluruhan
interpretasi untuk setiap sampel dan juga menilai masing-masing daerah nomor
salinan kromosom (CNV) dilaporkan di setiap sampel dan mengklasifikasikannya
sebagai jinak, patogenik, atau varian signifikansi yang tidak diketahui. Sampel itu
kemudian diberikan kepada Affymetrix untuk analisis lebih lanjut. Sampel gDNA
dijalankan di laboratorium Affymetrix di CytoScan Dx Assay, dan hasilnya
diberikan kepada independen cytogeneticist yang menghasilkan laboratorium
klinis secara keseluruhan interpretasi untuk setiap sampel, termasuk sindrom
diagnosis. Para cytogeneticist juga menilai masing-masing CNV sampel dan
mengklasifikasikannya sebagai benign, patogenik, atau VOUS. Para
cytogeneticist diizinkan untuk meminta sampel orang tua, dan setelah disetujui
maka cytogeneticist akan menggunakannya untuk menyelesaikan interpretasinya.

Analisis Data
Menggunakan Human Genome Build 19, CytoScan Dx Assay CNV
koordinat dibandingkan dengan koordinat microarray yang dapat ditindaklanjuti
temuan yang tercantum dalam studi oleh Riggs Ada dua klasifikasi yang cocok.
Pertama, jika wilayah Riggs dicirikan sebagai wilayah kromosom dan tidak
memiliki gen spesifik terlibat, maka regio tersebut harus sepenuhnya masuk
dalam CytoScan Dx Assay CNV. Pada bagian kedua, jika Riggs mencirikan gen
tertentu sebagai wilayah signifikansi, sebuah kecocokan dianggap ketika ada
tumpang tindih dengan CytoScan Dx Assay CNV (yaitu, setiap tumpang tindih
akan mengganggu gen dan berfungsi).Tarif dan statistik deskriptif dilaporkan.

HASIL

8
 Sebanyak 1.171 sampel dikumpulkan dari ketiga sampel tersebut. Seratus
lima puluh enam sampel gagal memenuhi kriteria inklusi 96,8% karena
ketersediaan sampel rendah (sampel gDNA ≤20 µl) atau konsentrasi gDNA
rendah sehingga dikeluarkan dari penelitian. Total 1,015 gDNA yang diturunkan
sampel dikumpulkan dan diserahkan kepada Affymetrix. Empat puluh delapan
sampel-sampel ini gagal masuk kontrol kualitas-DNA vrics sehingga diekslusi.
Oleh karena itu, 967 sampel gDNA memenuhi syarat untuk CytoScan Dx Assay.
Pada sampel pengolahan, dua sampel gagal uji kualitas metrik, satu sampel
sangat tersegmentasi (> 1.000 segmen dan tidak bisa dimuat ke dalam sistem
manajemen data) dan tidak dikirim untuk interpretasi, dan empat dikeluarkan oleh
cytogeneticist sebagai tidak dapat ditafsirkan karena tingginya jumlah CNv
segmeno. Oleh karena itu, set data analisis akhir berisi 960 sampel.
Hasil Diagnostik Dan Tidak Ada Heterozigositas
Hasil diagnostik (dihitung sebagai tingkat penemuan patogenik ) serupa
antara RPC 13,3% dan CytoScan Dx Assay 13,8% dan 23,9% dibandingkan
dengan 14,5% atau pada individu yang tidak menerima microarray sebagai RPC.
Perbedaan ini tidak signifikan secara statistik karena lebar interval kepercayaan
berdasarkan ukuran sampel kecil yang tidak menerima microarray sebagai bagian
dari RPC.
Ketiadaan heterozigositas (AOH) dilaporkan oleh cytogeneticist
menafsirkan CytoScan Dx Assay menghasilkan 91 pasien. AOH daerah
dilaporkan pada berbagai kromosom dan memiliki ukuran mulai dari 5 hingga 649
Mb; ukuran rata-rata adalah 11,7 Mb. Disomi uniparental diidentifikasi yang
memprediksi diagnosis Prader-Willi atau Angelman dalam satu sampel. Namun,
karena Hasil AOH tidak diminta dari RPC, tidak ada perbandingan mungkin.
Namun, memperoleh informasi AOH selain informasi nomor salinan dari platform
yang sama diketahui memaksimalkan hasil diagnostik dari pengujian larik.
Prediksi kegunaan klinis
Dari pasien dengan temuan patogen (terdiri dari 58 CNVs) diidentifikasi
oleh CytoScan Dx Assay sebanyak 35% atau 46/132 dapat diprediksi implikasi
manajemen klinisjnya. Untuk menggambarkan utilitas klinis CytoScan Dx Assay,

9
satu dari pasien adalah seorang anak laki-laki Afrika-Amerika berusia 20 bulan
etnis yang disajikan di klinik untuk evaluasi DD, hipotonia, berat badan rendah,
dan mikrosefali. Tidak ada peri-komplikasi natal, meskipun ia lahir pada 36½
minggu. Pencitraan resonansi magnetik sebelumnya menghasilkan hasil normal.
Sejarah keluarga mengungkapkan bahwa ia memiliki tiga saudara tiri yang lebih
tua, salah satunya memiliki riwayat hiperaktivitas deficit-perhatian gangguan dan
lain yang memiliki riwayat operasi jantung untuk gumam jantung. Pemeriksaan
fisik pada saat evaluasi menunjukkan berat 9,9 kg (persentil kedua), tinggi 80,5
cm (Persentil ke-15), dan lingkar kepala 44,5 cm (kurang dari persentil kedua).
Dia duduk di sekitar usia 12 bulan dan membuat beberapa suara nonspesifik
(mengoceh). Individu ini sangat sosial dan interaktif. Dia tidak memiliki
dysmorphic besar fitur (kecuali jembatan hidung datar), dan kardiovaskular hasil
pemeriksaan tidak dapat dibagikan. Namun, pemeriksaan neurologis
mengungkapkan hipotonia trunkal ringan. RPC pengujian genetik termasuk
karyotyping, studi metilasi untuk sindrom Prader-Willi / Angelman, pengujian
rapuh-X, dan tes distrofi myotonic, semuanya memiliki hasil normal. CytoScan
Dx Assay mengidentifikasi penghapusan 7q11.23, yang mana konsisten dengan
diagnosis klinis Williams-Beuren syndrome (WBS). WBS adalah sindrom
penghapusan gen yang berdekatan pada pasien dengan ID, hiperkalsemia,
hiperkalsiuria, hipotiroidisme, gagal tumbuh pada masa bayi, supravalvar aortic
stenosis, fitur wajah yang khas, iris stellata, suara serak, hernia, prolaps rektum,
dan keterbatasan atau kelemahan sendi.
Beberapa microdeletion / microduplication syndromes adalah
diidentifikasi oleh CytoScan Dx (dan tidak terjawab oleh RPC) dalam penelitian
ini, termasuk (tetapi tidak terbatas pada) 3q29 microduplication, 22q11
microduplication, 16p11.2 microduplication, 16p11.2 mikro- penghapusan,
sindrom KBG, dan sindrom Floating-Harbour. Beberapa dari kasus-kasus ini akan
membutuhkan klinis yang signifikan manajemen pada saat diagnosis, sedangkan
untuk yang lain menemukan-

10
penyebab genetik akan mengakhiri pengembaraan diagnostik. Namun, karena
RPC menganggap kasus ini normal, tidak informasi tindak lanjut lainnya
diberikan oleh masing-masing situs untuk penelitian ini.

DISKUSI
Studi saat ini dilakukan untuk menilai kinerja klinis CytoScan Dx Assay pada
pasien dengan DD, ID, dan / atau anomali kongenital yang dirujuk untuk
pengujian kromosom keseluruhan genom. CytoScan Dx Assay mengidentifikasi
patogen langka CNV pada 13,8% dari pasien ini. Hasil diagnostik ini sebanding
dengan laporan RPC historis sebelumnya, yang sering menggunakan microarray
untuk menilai pasien ini, dan itu juga konsisten dengan literatur yang diterbitkan
tentang hasil diagnostik dalam hal ini populasi pasien
CytoScan Dx Assay memiliki kemampuan untuk identifikasi CNV yang
mungkin terlewatkan oleh teknologi lain seperti itu sebagai karyotyping, IKAN,
dan target atau resolusi yang lebih rendah platform karena cakupan yang tidak
memadai dan / atau resolusi yang lebih rendah. CNV ini dapat mengakhiri
pengembaraan diagnostik untuk pasien dan keluarga, berpotensi mengurangi biaya
perawatan kesehatan dengan menghindari pengujian yang tidak perlu, berikan
informasi tambahan untuk diinformasikan kesehatan reproduksi untuk keluarga
berencana, dan secara substansial mempengaruhi perawatan pasien. Dalam
kelompok ini, CytoScan Dx Assay mengidentifikasi suatu tambahan 20 CNV
dibandingkan dengan hasil RPC, yangbiasanya menggunakan satu atau lebih
metode analisis kromosom 25% dari CNV tambahan ini akan menghasilkan
prediksi klinis untuk perubahan manajemen terapi.
Ada beberapa keterbatasan dalam penelitian kami. Perbandingan hasil
diagnostik RPC dengan yang dari CytoScan Dx Assay dikacaukan oleh fakta
bahwa laboratorium yang menafsirkan hasil RPC historis mungkin memiliki akses
ke pelengkap hasil laboratorium dan data orang tua, sedangkan cytogeneticist
menafsirkan hasil dari CytoScan Dx Assay tidak memiliki akses ke laboratorium
klinis atau informasi dan akses ke tes orang tua sangat terbatas. Keterbatasan lain
adalah bahwa kohort pasien dilaporkan disini belum tentu dievaluasi dengan

11
microarray sebagai uji utama. Banyak CNV yang diketahui dan dapat
ditindaklanjuti lebih besar dan berdasarkan platform resolusi rendah. Selama 3-5
tahun terakhir, platform resolusi tinggi telah mengidentifikasi banyak CNV kecil
yang mendasari gangguan ID / DD dan karenanya dapat mengarah ke peningkatan
hasil diagnostik dan tingkat tindakan untuk beberapa pasien-pasien ini. Akhirnya,
perbandingan dengan kriteria Riggs bersifat prediktif dan bukan merupakan
cerminan dari praktik sebenarnya. Penelitian selanjutnya harus prospektif dan
mengikuti pasien untuk perubahan manajemen klinis yang sebenarnya.

KESIMPULAN
Penelitian ini ini adalah studi pertama untuk menilai kinerja dengan
DD, ID, dan / atau anomali kongenital yang dirujuk untuk pengujian kromosom
keseluruhan genom. CytoScan Dx Assay’s hasil diagnostik mirip dengan yang
dilaporkan sebelumnya studi, dengan 13,8 dan 35% pasien dengan CNV patogen
diidentifikasi oleh CytoScan Dx Assay diprediksi memiliki klinis implikasi
manajemen yang dapat meningkatkan hasil kesehatan.

ANALISIS PICO

a. Problem
Prevalensi cacat perkembangan adalah 13,87% di semua kelompok ras,
etnis, dan sosial ekonomi, dan 1 di 33 bayi lahir dengan anomali
kongenital di Amerika Serikat. Sering, orang dengan cacat perkembangan
( keterlambatan perkembangan dan / atau cacat intelektual (DD / ID))
hadir dengan satu atau lebih anomali kongenital atau dismorfik fitur.
Individu yang terkena ini memiliki tantangan seumur hidup, termasuk
kesulitan dengan gerakan fisik, pembelajaran, dan interaksi sosial.
Intervensi dini penting untuk menyediakan hasil yang lebih baik untuk
anak-anak ini dengan kebutuhan khusus. Penegakkan diagnosis yang
mendasari sejak dini memiliki potensi untuk mengurangi biaya perawatan
kesehatan dan menyediakan dokter dan keluarga dengan informasi tentang
gangguan yang mempengaruhi anak, prognosis, dan komorbiditas,

12
 semuanya memiliki implikasi di luar perawatan medis.Secara historis
dengan penggunaan teknik sitogenetika tradisional seperti hibridisasi
karyotyping dan fluoresensi in situ (IKAN), hanya sebagian kecil pasien
(6%) berhasil didiagnosis, karena batasan pada resolusi. Namun, dalam
beberapa tahun terakhir, dengan munculnya teknik-teknik baru seperti
microarray kromosom (CMA), hasil memiliki peningkatan 10–18%.
b. Intervention
Penelitian ini merupakan peneliatan kohort sehingga tidak ada intervensi
apapun yang dilakukan.
c. Comparison
Sampel darah pada pasien dianalisis dan diperiksa menggunakan dua
metode.
d. Outcome
Didapatkan Hasil diagnostik (dihitung sebagai tingkat penemuan
patogenik ) serupa antara RPC 13,3% dan CytoScan Dx Assay 13,8% dan
23,9% dibandingkan dengan 14,5% atau pada individu yang tidak
menerima microarray sebagai RPC. Perbedaan ini tidak signifikan secara
statistik karena lebar interval kepercayaan berdasarkan ukuran sampel
kecil pada sampel yang menerima microarray sebagai bagian dari RPC.
ANALISIS JURNAL

a. Validity
 Desain
Penelitian ini merupakan penelitian kohort pada Kelompok
Penelitian pasien yang dicurigai mengalami DD dan intekltual
diasability di Amerika Serikat.
 Populasi dan Sampel
Sampel dari pasien yang menjalani pengujian kromosom
dikumpulkan dari Juli 2009 hingga Juli 2012 pada tiga
laboratorium: Greenwood Genetic Center (Greenwood, SC),
CombiMatrix (San Diego, CA), dan Mayo Clinic (Rochester, M
N). Kriteria inklusi studi diterapkan pada sampel sebagai berikut:
Sampel DNA dari pasien pascanatal yang dirujuk analisis
kromosom berdasarkan kecurigaan DD / ID, kongenital anomali,
dan / atau ciri dismorfik, jenis sampel adalah gDNA yang berasal

13
 dari darah pasien darah, sampel gDNA diekstrak dari darah utuh
dikumpulkan menggunakan ethylenediaminetetraacetic tabung
pengumpul darah asam atau heparin, sampel gDNA konsentrasi>
150 ng / μl melalui pengukuran densitas optik atau ≥75 ng / μl
melalui PicoGreen (Life Technologies, Eugene, OR) pengukuran
dan diencerkan dalam 1 × Molecular Grade TE Buffer (Affymetrix,
Santa Clara, CA) pH 8,0, volume sampel gDNA adalah ≥20 μl,
sakit didapatkan dari catatan rumah sakit dan tim medis rawat inap.
 Analisis Data
Menggunakan Human Genome Build 19, CytoScan Dx Assay
CNV koordinat dibandingkan dengan koordinat microarray yang
dapat ditindaklanjuti temuan yang tercantum dalam studi oleh
Riggs Ada dua klasifikasi yang cocok. Pertama, jika wilayah Riggs
dicirikan sebagai wilayah kromosom dan tidak memiliki gen
spesifik terlibat, maka regio tersebut harus sepenuhnya masuk
dalam CytoScan Dx Assay CNV. Pada bagian kedua, jika Riggs
mencirikan gen tertentu sebagai wilayah signifikansi, sebuah
kecocokan dianggap ketika ada tumpang tindih dengan CytoScan
Dx Assay CNV (yaitu, setiap tumpang tindih akan mengganggu
gen dan berfungsi).
b. Importance
Pada penelitian ini diagnosis anak dengan DD dan Intelektual disability
dapat dilakukan sejak dini melalui pmeriksaan genetik. Pemeriksaan
genetik yang dapat dilakukan ialah pemeriksaan kariotip dan pemeriksaan
menggunakan cytoscan (affimetric). Hasil pemeriksaan tersebut dapat
mendiagnosis anak- anak yang dicurigai mengalami DD dan intelektual
disability.
c. Aplicability
Penelitian ini dilakukan di Amerika Serikat yang mana memiliki
karakteristik penduduk dan demografi tidak mirip dengan Indonesia.alat,
bahan dan laboratorium relatif cukup mahal sehingga masih sangat jarang
di Indonesia. Namun, penelitian ini cukup penting dan bermanfaat untuk

14
sehingga keterlambatan perkembangan dapat didiagnosis dini agar
perencanaan terapi lebih cepat dan baik.

15