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Evaluación “in silico” de las moléculas MR5 y Estudio de modelaje molecular de las moléculas
Nacetil MR5 y Nacetil
La tecnología del modelo de simulación “in silico” El modelaje molecular predice la conformación
permite el descubrimiento de nuevos fármacos, favorecida de una molécula, al estar unida a otra, a
mediante la química computacional y biológico, para fin de formar un complejo estable y conociendo
obtener una predicción farmacocinética (vida dicha orientación, puede ser usada para predecir la
media, biodisponibilidad, permeabilidad a la fuerza de la asociación o la afinidad de enlace entre
membrana, volumen de distribución, depuración). dos moléculas. El acoplamiento se realiza con la
Estos comprenden las bases de datos, la relación estructura de una proteína, la cual ha sido
cuantitativa entre la estructura y la actividad determinada por cristalografía de rayos X o por
(QSAR), ofreciendo como ventaja su alta tasa de espectroscopía de resonancia magnética nuclear, que
resultados en el contexto de un costo razonable se encuentra depositada en el Banco de Datos de
complementado con evaluaciones farmacodinámicas Proteínas (Protein Data Bank). El estudio de
y toxicológicas. En este orden, las moléculas MR5 y interacción del MR5 y del Nacetil con el sitio de
Nacetil fueron evaluadas con el programa unión de la colchicina en la tubulina muestra muy
Molinspiration, arrojando que ambas moléculas no buena estabilidad en el bolsillo de interacción,
violan la regla de Lipinski´s, la cual describe las determinada por la energía de enlaces formados por
propiedades moleculares relacionadas a la fármaco- los puentes de hidrógenos con los residuos de
cinética en humanos, tales como la absorción, Cys668, Asn110, Cys668, Leu682, siendo la
distribución, metabolismo y excreción (ADME) (6). molécula de Nacetil la que presenta mejor
Éstas poseen peso molecular menor a 500g/mol, un interacción con todos los residuos con los que
valor de coeficiente de partición LogP menor a 4, interacciona la colchicina, con una energía de enlace
son donadoras y aceptores de protones, indicando de -9,66 Kcal/mol (Fig. 4). Estos resultados nos
una buena biodisponibilidad oral y permeabilidad a permiten predecir que el Nacetil actúa como la
la membrana. colchicina, un inhibidor clásico de la tubulina, y
podría ser éste uno de los posibles mecanismos de
A acción que se inician en las células tumorales de
25 páncreas humano.
20
Dosis MR5 (g/mL)
15
DEteorico 86,58
10
DEExperimental 0,1123
0
0 20 40 60 80 100 120 140 160
Dosis Nacetil (g/mL)
B
25
20
Dosis MR5 (g/mL)
15
DEteorico 86,58
10
Fig. 4. Representación enzima–ligando de la Colchicina,
MR5 y el Nacetil en el sitio activo de la tubulina.
5 Colchicina (amarillo), MR5 (naranja) y Nacetil (verde).
DEExperimental 0,000035237
0 Referencias
0 20 40 60 80 100 120 140 160
Dosis Nacetil (g/mL)
1. Arvelo, F., Sojo, F., Cotte, C. (2016). Cancer
and Metastasic Substrate Ecancermedicalscience,
Fig. 3. Isobologramas de las combinaciones del 4-metil 10:701 DOI: 10.3332/ecancer.2016.701.
piridinil quinolina y el N-acetil strychnosplendine sobre
las células de cáncer de páncreas (PANC-1). A) MR5 +
2. Jemal, A., Siegel, R., Ward, E., Hao, Y., Xu, J.
Nacetil. B) Nacetil + MR5. DEteorica (Dosis efectiva y Thun, M.J. (2009). Cancer statistics, 2009, CA.
teorica), DEexperimental (Dosis efectiva experimental). Cancer Journal for Clinicians, 59(4): 225–249.
31
3. Kouznetsov, V.V., Merchan Arenas, D.R., M.I. y Mosqueda-Melgar, J. (2017). Cytotoxic,
Arvelo, F., Bello Forero, J., Sojo, F. y Muñoz, Antioxidant and Antimicrobial Properties of Red
A. (2010). 4-Hydoxy-3-metoxyphenil substituted Sweet Pepper (Capsicum Annuum L. var.
3-methyl-tetrahydroquinoline derivatives obtained Llanerón) Extracts: In Vitro Study. International
through imino Diels-Alder reactions as potential Journal of Food Studies, 6: 222-223.
antitumoral agents. Letter in Drug Design & 11. Rojas, J.C., Buitrago, A.A., Arvelo, F.A., Sojo,
Discovery, 7: 632-639. F.J. y Suarez, A.I. (2017). Cytotoxic activity of
4. Kouznetsov, V.V., Sojo, F., Rojas-Ruiz, F.A., different polarity fractions obtained from
Merchan-Arenas, D.R. y Arvelo, F. (2016). methanolic extracts of Vismia baccifera and
Synthesis and cytotoxic evaluation of 7-chloro-4- Vismia macrophylla (Hypericaceae) collected in
phenoxyquinolines with formyl, oxime and Venezuela. J. Pharm. Pharmacogn. Res., 5: 320–
thiosemicarbazone scaffolds. 16 August 2016 by 326.
Springer in Med. Chem. Res.; 12. Siegel, R., DeSantis, C., Virgo, K., Stein, K.,
doi:10.1007/s00044-016-1688-6. Mariotto, A., Smith, T., Cooper, D., Gansler,
5. Kouznetsov, V.V., Robles-Castellanos, M.L. T., Lerro, C., Fedewa, S., Lin, C., Leach, C.,
Sojo, F., Rojas-Ruiz, F.A. y Arvelo, F. (2017). Cannady, R.S., Cho, H., Scoppa, S., Hachey,
Diverse C-6 substituted 4-methyl-2-(2-,3-and4- M., Kirch, R., Jemal, A. y Ward, E. (2012).
pyridinyl) quinolines: synthesis, in vitro anticancer Cancer treatment and survivorship statistics, 2012.
evaluation and in silico studies. Med. Chem. Res. CA Cancer J. Clin., 62: 220-241.
2017; DOI 10.1007/s00044-016-1775-8. 13. Siegel, R., Naishadham, D. y Jemal, A. (2013).
6. Lipinski, C.A., Lombardo, F., Dominy, B.W. y Cancer statistics, 2013. CA Cancer J. Clin., 63:
Feeney, P.J. (1997). Experimental and 11-30.
computational approaches to estimate solubility 14. Suárez, A.I, Manceboa, M., Delle Monacheb,
and permeability in drug discovery and F., Tirric, M.M, Sojo, F., Arvelo, F. y Tillett, S.
development settings. Adv. Drug Deliv. Rev., 23: (2016). A new indole-alkaloid and a new phenolic-
3-25. glycoside with cytotoxic activity from Strychnos
7. Mosmann, T.J. (1983). Rapid colorimetric assay fendleri. Natural Product Research. DOI:
for cellular growth and survival: application to 10.1080/14786419.2015.1019351.
proliferation and cytotoxicity assays. J. Immunol. 15. Súarez, A.I., Taddei, A., Sojo, F. y Arvelo, F.
Methods, 65: 55-63. (2014). Diterpenos biactivos de Croton malambo
8. Páez, D., Labonte, M.J. y Lenz, H.J. (2012). Karst. Revista de la Facultad de Farmacia de la
Pancreatic cancer: medical management (novel UCV, 77 (1): 8-15.
chemotherapeutics). Gastroenterol Clin. North 16. Tallarida, R.J. (2012). Revisiting the Isobole and
Am., 41: 189-209. Related Quantitative Methods for Assessing Drug
9. Pan, S., Brentnall, T.A. y Chen, R. (2016). Synergism. J. Pharm. and Experimental
Glycoproteins and glycoproteomics in pancreatic Therapeutics;http://dx.doi.org/10.1124/jpet.112.1
cancer. World J. Gastroenterol., 22(42): 9288- 93474.
9299. 17. Vincent, A., Herman, J., Schulick, R., Hruban,
10. Raybaudi-Massilia, R., Suárez, A.I., Arvelo, F., R.H. y Goggins, M. (2011). Pancreatic cancer.
Zambrano, A., Sojo, F., Calderón-Gabaldón, Lancet, 378: 607-620.
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