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CV- SHAUKAT ALI

 
Associate Professor/Small Grain Pathologist
Room 113D, Seed Technology Building
Plant Science Department
South Dakota State University
2380 Research Park way
Brookings, SD57006
Phone: 605-688-6996
E. Mail: Shaukat.ali@sdstate.edu
 
 
 
 
 
 
EDUCATIONAL QUALIFICATIONS:
Date Institution Degree
     
2001 Plant Pathology Department Ph.D.
  North Dakota State University  
Fargo, ND 58105
1993 South Dakota State University MSc.
Department of Plant Science
  Brookings, SD 57007, USA  
1978 Department of Plant Pathology MSc (Hons)
  University of Agriculture  
Faisalabad, Pakistan
   
Responsibilities:
 

Research Epidemiology, host-parasite interaction, population

genetics of small grains diseases, and disease diagnosis
 
Teaching Horticultural crops diseases, Host-parasite genetics, and
Epidemiology
 
Service Help SDSU cereal breeders and geneticist in breeding for
disease resistance and diagnostic lab in fungal pathogens
identification
 
 
Professional memberships:
1. American Phytopathological Society

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Publications
 
Selected-Refereed Journal Articles and Notes:
 
1. Ali,  S.  and  L.  J.  Francl  2014.  A  differential  medium  for  discriminating  between  
Drechslera  bromi  and  Drechslera  tritici-­‐repentis.  Pak.  J.  Phytopathology    26:207-­‐212  
2. Zhong,  S.  S.  Ali,  Y.  Leng,  R.  Wang,  and  D.  F.  Gravin  2014  Brachypodium  distachyon-­‐
Cochliobolus  sativus  Pathosystem  is  a  New  Model  for  Studying  Plant-­‐fungal  
Interactions  in  Cereal  Crops  (Phytopathology  accepted  and  posted  online  on  25  Nov  
2014)  
3. Ali,  S.,  S.  Abdullah,  P.  Gautam,  E.  Byamukama,  J.  S.  Rohila,  M.  Eldakak,  K.  Gover,  and  J.  
Gonzalez  2013.  Determination  of  Fusarium  graminearum  chemotypes  prevalent  on  
oat,  rye  heads  and  wheat  roots  in  South  Dakota.  National  Fusarium  Head  Blight  Forum  
held  in  Milwaukee,  WI  Proceedings.  Pages  51-­‐54.    
4. Ali,  S.,  M.  Eldakak,  P.  Gautam,  K.  Glover,  J.  S.  Rohila,  J.  Gonzales,  and  W.  Berzonsky  
2012.  Gibberrella  zeae  chemotype  diversity  on  moderately  FHB  resistant  wheat  
genotypes  in  South  Dakota.  National  Fusarium  Head  Blight  Forum  held  in  Orlando,  
Florida  Proceedings.  Pages115-­‐117.    
5. Bilgi,  V.  N.,  C.  A.  Bradly,  F.  M.  Methew,  S.  Ali,  J.  B.  Rasmussen  2011.  Root  rot  of  dry  
edible  bean  caused  by  Fusarium  graminearum.  Online.  Plant  Health  Progress  
doi:10.1094/PHP-­‐2011-­‐0425-­‐01-­‐RS.  
6. Ali,  S.,  Gurung,  S.,  and  Adhikari,  T.  B.  2010.  Identification  and  characterization  of  novel  
isolates  of  Pyrenophora  tritici-­‐repentis  from  Arkansas.  Plant  Dis.  94:229-­‐235.  
7. Gurung,  S.,  J.  M.  Bonman,  S.  Ali,  J.  Patel,  M.  Myrfield,  M.  Mergoum,  P.  K.  Singh,  and  T.  B.  
Adhikari  2009.    New  and  diverse  sources  of  multiple  disease  resistance  in  wheat.  Crop  
Science  49:1655-­‐1666.  
8. Adhikari,  T.  B.,  J.  Bai,  S.  W.  Meinhardt,  S.  Gurunj,  M.  Myrfield,  J.  Patel,  S.  Ali,  N.  C.  
Gudmestad,  and  J.  B.  Rasmussen  2009.  Tsn  1-­‐mediated  host  responses  to  ToxA  from  
Pyrnophora  tritici-­‐repentis.  MPMI  22:1056-­‐1068  
9. Ali,  S.,  P.  K.  Singh,  M.  P.  McMullen,  M.  Mergoum,  and  T.  B.  Adhikari  2008.  Identification  
of  New  Sources  of  Resistance  to  Multiple  Leaf  Spotting  Diseases  in  Wheat  Germplasm.  
Euphytica  159:167-­‐179  
10. Ali,  S.,  and  T.  B.  Adhikari.  2008.  Variation  in  Aggressiveness  of  Stagonospora  nodorum  
isolates  in  North  Dakota.  Journal  of  Phytopathology  156,  140–145.    
11. Burlakoti,  R.  R.,  S.  Ali,  G.  A.  Secor,  S.  M.  Neate,  M.  P.  McMullen,  and  T.  B.  Adhikari  2008.  
Comparative  mycotoxin    profiles  of  Gibberella  zeae  population  from  barley,  wheat,  
potatoes,  and  sugar  beets.  Appl.  And  Environ.  Microbiology  74:6513-­‐6520.  
12. Adhikari,  T.  B.  S.  Ali,  R.  R.  Burlakoti,  P.  K.  Singh,  M.  Mergoum,  and  S.  B.  Goodwin  2008.  
Genetic  Structure  of  Phaeosphaeria  nodorum  Populations  in  the  North-­‐  Central  and  
Midwestern  United  States.  Phytopathology  98:101-­‐107  
13. Mergoum,  M.,  R.  C.  Frohberg,  R.  W.  Stack,  P.  K.  Singh,  S.  Ali,  J.W.  Rasmussen,  T.  L.  
Friesen,  and  T.  B.  Adhikari  2008.    Registration  of  Spring  Wheat  Germplasm  ND  756  
Combining  Resistances  to  Foliar  Diseases  and  Fusarium  Head  Blight.    Journal  of  Plant  
Registrations  2:  61-­‐64  
14. Singh,  P.  K.,  M.  Mergoum,    S.  Ali,  T.  B.  Adhikari,    and  G.  R.  Hughes  2008.  Genetic  
analysis  of  resistance  to  Pyrenophora  tritici-­‐repentis  races  1  and  5  in  tetraploid  and  
hexaploid  wheat.  Phytopathology  98:702-­‐708.  
15. Paul,  P.  A.,  P.  E.  Lipps,  E.  De  Wolf,  G.  Shaner,  G.  Buechley,  T.  Adhikari,  S.  Ali,  J.  Stien,    L.  
Osborne,  and  L.  V.  Madden  2007.  A  Distributed-­‐Lag  Analysis  of  the  Relationship  
Between  Gibberella  zeae  Inoculum  Density  on  Wheat  Spikes  and  Weather  Variables.  
Phytopathology  97:1608-­‐1624.  

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16. Mergoum,  M.,  P.  K.  Singh,  S.  Ali,  E.  M.  Ellias,  J.  A.  Anderson,  K.  D.  Glover,  T.  B.  Adhikari  
2007.  Reaction  of  Elite  Wheat  Genotypes  from  the  Northern  Great  Plains  of  North  
America  to  Septoria  Diseases.  Plant  Disease  91:1310-­‐1315  
17. Mitter,  V.,  L.  J.  Francl,  S.  Ali,  S.  Simfendorfer,  and  S.  Chakraborty  2006.  Ascosporic  and  
conidial  inoculum  of  Gibberrella  zeae  play  different  role  in  Fusarium  head  blight  and  
crown  rot  of  wheat  in  Australia  and  the  USA.  Australasian  Plant  Pathology  35:1-­‐12.  
18. Singh,  P.  K.,  M.  Mergoum,  S.  Ali,  T.  B.  Adhikari,  E.  M.  Elias,  and  G.  R.  Hughes  2006.  
Identification  of  new  sources  of  resistance  to  tan  spot,  Stagonospors  nodorum  blotch,  
and  Septoria  tritici  blotch  of  wheat.  Crop  Science  46:2047-­‐2053  
19. Ali,  S.,  and  L.  J.  Francl  2001.  Recovery  of  Pyrenophora  tritici-­‐repentis  from  barley  and  
reaction  of  12  cultivars  to  five  races  and  two  host-­‐selective  toxins.  Plant  Dis.  85  :580-­‐
584.    
20. Friesen,  T.,  S.  Ali,  K.  K.  Klien,  and  J.  B.  Rasmussen  2005.  Population  Genetic  Analysis  of  
a  Global  Collection  of  Pyrenophora  tritici-­‐repentis  Causal  Agent  of  Tan  Spot  of  Wheat.  
Phtyopathology    95:1144-­‐1150.    
21. Liu,  Z.  H.,  J.  D.  Faris,  S.  W.  Meinhardt,  S.  Ali,  J.  B.  Rasmussen,  and  T.  L.  Friesen  2004.  
Genetic  and  Physical  Mapping  of  a  Gene  Conditioning  Sensitivity  in  Wheat  to  a  
Partially  Purified  Host-­‐Selective  Toxin  Produced  by  Stagonospora  nodorum  
Phytopathology  94:1056-­‐1060.  
22. Martinez,  J.  P.,  S.  A.  Ottum,  S.  Ali,  L.  J.  Francl,  and  M.  Ciuffetti  2001.  Characterization  of  
the  ToxB  Gene  from  Pyrenophora  tritici-­‐repentis.  MPMI  14:675-­‐677.  
23. Hartel,  K.  D.,  W.  A.  Berzonsky,  S.  F.  Kianian,  and  S.  Ali  2004.  Expression  of  a  Triticum  
tugidum  var.  dicoccoides  sources  of  Fusarium  head  blight  resistance  transferred  to  
synthetic  hexaploid  wheat.  Plant  Breeding  123:516-­‐519.  
24. Ali,  S.,  and  L.  J.  Francl  2003.  Population  race  structure  of  Pyrenophora  tritici-­‐repentis  
prevalent  on  wheat  and  non-­‐cereal  grasses.  Plant  Dis.  87:418-­‐422.  
 

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