Prediccion Del Valor de Cria Blup Modelo

06/03/2018
PREDICCIÓN DEL VALOR DE CRÍA

(BLUP – Modelo Animal)
Rufino Paucar Chanca

Laboratorio de Mejoramiento Genético
Escuela Profesional de Zootecnia
Universidad Nacional de Huancavelica
Huancavelica, Perú
Valor de cría
 El valor de cría de un animal candidato a la
selección, constituye la porción del
genotipo que será transmitida, en una
proporción de un medio, a su progenie.
 no es observable, dado que no se tienen
infinitas crías de .
 Es predicho ( ), a partir de datos fenotípicos
propios y/o de individuos emparentados.
 Metodologías:
1. Índice de selección 2
2. BLUP
1
06/03/2018
Introducción
Ancestros
FUENTES DE ai Colaterales
Propia
INFORMACIÓN
Descendientes
Modelos Mixtos – BLUP –

Modelo Animal
o Teoría de M odelos Lineales M ixtos (MM)
Teoría estadística para analizar datos con un modelo que
incluye:
o BLUP
Es el método de predicción empleando teoría de MM, del
mismo modo que en la teoría clásica de regresión y análisis
de varianza se utilizan “mínimos cuadrados”.
o M odelo animal
Es un modelo mixto desarrollado por los mejoradores 4
animales para predecir las variables aleatorias de interés.
2
06/03/2018
Modelos mixtos
Modelos estadísticos que incluyen efectos fijos y variables
aleatorias:
i = efecto fijo
j = animal
Sexo, edad del animal, edad de la madre,

nivel nutricional, etc.
 Efectos fijo s
En el IS: corrección previa (Xi = Pi – µ).
En MM directamente en el modelo.
Valor de cría de cada animal.
 Efectos aleato rio s Se considera que los datos son una
muestra de una población mayor (la
población total serían todos los
individuos que pudieron haber
nacido) .
BLUP
o Metodología de predicción (Henderson, 1949).
o Utilizando teoría estadística de modelos mixtos, permite

simultáneamente:
→ Estimar efectos fijos o factores ambientales sistemáticos
sexo, edad, grupo de contemporáneos, heterosis.
→ Predecir los efectos aleatorios del modelo
valor de cría (individual o materno) para uno o

varios caracteres, desvío de dominancia.
6
3
06/03/2018
Propiedades de BLUP
Las siglas de BLUP hacen referencia a las
propiedades estadísticas que tiene como predictor:
 B (best) es de mínima varianza o de mayor exactitud.
 L (linear) son funciones lineales de los datos.
 U (unbiased) son insesgadas. E(â) E(a)
 P (prediction) predicción del valor de cría verdadero.
BLUP (best linear unbia sed predictor): predictor

lineal insesgado de mínima varianza o máxima
8
exactitud.
Propiedades de BLUP
4
06/03/2018
Propiedades de BLUP
BLUP reduce las diferencias (shrinkage’) entre los da tos
Si la diferencia entre el promedio fenotípico de los hijos

de dos toros es igual a : PA – PB = 20 kg.
El BLUP de la diferencia entre la mitad de los valores de

cría predichos de estos toros (que es lo que heredó la
progenie) será:
BLUP(½aA) BLUP (½aB) < 20 kg.
Dicho número se acercará a 0 cuanto menor sea la h2.
BLUP pondera por el grado de transmisibilidad del carácter

(h2) e indica que cuanto mayor es la h2, mayor es la
probabilidad de que las diferencias entre animales sean de
origen genético aditivo. Rufino Paucar Chanca
Modelo Animal (AM)

o Es un modelo mixto desarrollado por los mejoradores
animales (otros: modelo de padre, modelo de padre y abuelo materno).
Dato(s) = Efectos Fijos + Efectos aleatorios + Error
Sexo, Edad de madre, Grupo Valor de cría para un carácter o

de contemporáneos. varios caracteres.
o Predice el valor de cría total de cada animal.

o Permite calcular los BLUP(a) para todos los animales
del pedigrí, tengan o no datos observados:
 Las relaciones aditivas, resultado del método tabular.
 Correlaciones genéticas y ambientales (modelos multi-carácter).
5
06/03/2018
Modelo Animal
Padres
FUENTES DE ai
INFORMACIÓN Propia
Progenie
Empleando MM:
Ponderaciones para cada

animal según h2 y nº datos
VCP de los
padres, MA Dato individual
ajustado por e. Ajuste por mérito genético del
otro progenitor  impide VCP
ambientales
sesgados
Diferencias Esperadas en la
Progenie (EPD o DEP)
o DEP = ½ Valor de Cría predicho.
o Es la diferencia que se espera observar entre el promedio
la progenie del animal evaluado y el de la población.
o Es un valor relativo entre dos animales.
o Se expresa en unidades del carácter.
o NO permiten predecir el valor absoluto de cada grupo
hijos.
o Una DEP positiva es superior al promedio de los animales
evaluados, una negativa es inferior a dicho promedio.
o EPD´s maternas para caracteres afectados por efectos
maternos.
o Carácter ‘peso al destete total’ o ‘leche y crecimiento’:
6
06/03/2018
EPDS, EBVS Y PTAS

o EPD o DEP es la mitad del Valor de Cría Predicho:
o EBV o VCP es Valor de Cría Predicho:
o PTA (Predicted Transmited Ability). Es la mitad del Valor de Cría

Predicho:
vacas de valor genético promedio

TORO A
TORO B
DEPPF = +15 kg
DEPPF = +5 kg
¿Qué diferencia existirá entre los hijos de ambos toros?

Se espera que los hijos de A tengan un promedio de peso final de 10 kg
(15 – 5) superior al promedio de los hijos de B.
15
Si el promedio de la población es de 380 kg ¿Cuánto pesará un hijo del
toro A? ¿y del toro B?
7
06/03/2018
Evaluación Genética
•Pedigree
•Identificación •Registros duplicados
Chequeo
1. Dato s •Sexo •Grupos de
•Fechas de nacimiento Edición contemporáneos
•Datos fenotípicos
Fijos: grupo genético – GC – Edad - Sexo

2. Análisis Efec to s
Aleato rio s genéticos directos
M odelo Animal
error maternos
•BLUP´s
3. Resultado s •Exactitud
•Cambio posible
•Base / tendencia Rufino Paucar Chanca
Descomposición del valor de

cría en el modelo animal
En resumen, las tres fuentes de información que contribuyen a la
predicción del valor de cría de un individuo, con un modelo
animal son :
 información de los padres,
 información propia,
 información de la progenie.
El valor de cría predicho se puede escribir como:
8
06/03/2018
Modelo Animal
o En el Modelo Animal, la información de las tres fuentes de información
se pondera a través de b1, b2 y b3.
o Las ponderaciones dependen:
 de la cantidad de información (número de registros) que

proporcionan cada una de las tres fuentes de información,
 h2 del carácter.
o A diferencia del IS, las ponderaciones b1, b2 y b3 del Modelo Animal

difieren con cada animal, dependiendo de la cantidad de información
aportada por cada vía.
o Cuando el animal no tiene registros individuales o de la progenie, la
predicción del valor de cría se realiza sobre la base de la información de
los ancestros o pedigrí.
o Los registros individuales proporcionan la mayor cantidad de
información porque son una muestra de todo el valor de cría.
o En el caso de los padres y las madres, cuando el número de hi1jo8s

aumenta, la información del pedigrí se vuelve menos relevante.
Ventajas del modelo animal

o Se considera el apareamiento selectivo.
o Ajusta por las diferencias genéticas entre las distintas

subclases de los efectos fijos (toros de referencia: individuos que
conectan diferentes grupos de contemporáneos).
o Tiene en cuenta la tendencia genética.
o Corrige diferencias entre efectos fijos (año, rodeo)
o Proporciona las mejores (mayor exactitud) predicciones

lineales insesgadas del valor de cría de un animal, pues
utiliza toda la información disponible.
9
06/03/2018
Requerimientos de BLUP-AM
 Se requiere estimar los componentes de varianzas de la

población bajo evaluación.
 Deben existir conexiones entre rodeos, mediante los

individuos o toros de referencia.
 Es importante evitar el aumento de la consanguinidad

fundamentalmente en esquemas de conservación de
recursos genéticos.
Recapitulando: cuestiones a
destacar
 Hemos visto dos metodologías de predicción del valor
de cría de los reproductores.
 BLUP permite obtener para cada animal:
 Predicciones del valor de cría más precisas,
porque incorpora toda la información del pedigrí.
 Con BLUP-AM obtenemos todo el valor de cría
del animal.
 Es la metodología universal usada en todas las
evaluaciones genéticas animales, y su producto final
es publicado en los catálogos de reproductores de las
21
asociaciones de animales.
10
06/03/2018
Evaluación genética
•Pedigree
Chequeo

M odelo Animal
error maternos
•BLUP´s
•Cambio posible
Exactitud o precisión
11
06/03/2018
Evaluación genética
•Pedigree
Chequeo

M odelo Animal
error maternos
•BLUP´s
•Cambio posible
Cambio posible
 Es el error estándar de la predicción o cambio posible de

la DEP.
 Se deben esperar cambios en las DEPs cuando

exactitud no es igual a 1.
 Si se repitiese la evaluación un numero grande de veces,

en el 67% de ellas la DEP se modificaría dentro
“cambio posible”.
12
06/03/2018
Rango del cam bio posible del verdadero valor de cría de

un animal c o n EBV + 10 para c rec imiento a lo s 400 días
90
Nivel de
Exactitud (%) 70
50
30
10
-40 -30 -20 -10 0 10 20 30 40 50 60

EBV 400 Day Growth (kg)
Verdadero valor de cría se encuentra en este rango para un

dado nivel de exactitud
La confianza acerca del cambio posible aumenta con mayor

exactitud y el rango se achica.
Cambio posible (Ejemplo)

Un animal con DEP de 3 kg PN y exactitud 0.50:
•Se posee una confianza del 67% de que el intervalo entre 1.88
kg. y 4.12 kg. incluye la verdadera DEP de ese toro para el
carácter considerado.
•Si se repitiese la evaluación un número grande de veces, en el
67% de ellas la DEP se modificaría dentro del intervalo [1.88,
4.12] es decir, dentro del cambio posible.
13
06/03/2018
Evaluación Hereford -
Argentina
Cambio posible para distintos valores de precisión
P recisión P eso Peso Destete Peso Final Leche L e ch e &

Nacimiento Crecimiento
0 1.9 7.6 13.9 8.5 9.2
0.10 1.8 7.1 12.8 7.8 8.4
0.20 1.7 6.3 11.3 6.9 7.5
0.30 1.4 5.5 10.0 6.0 6.7
0.40 1.2 4.7 8.5 5.2 5.8
0.50 1.1 3.9 7.2 4.4 4.9
0.60 0.9 3.2 5.8 3.6 4.1
0.70 0.7 2.4 4.4 2.7 3.1
0.80 0.4 1.7 3.3 1.9 2.2
0.90 0.2 1.1 1.8 1.1 1.3
1.00 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Evaluación Genética
•Pedigree
Chequeo

M odelo Animal
error maternos
•BLUP´s
•Cambio posible
14
06/03/2018
Base de la evaluación
genética
o Al ser las DEPs valores relativos entre animales, se suele fijar
una base o valor 0, respecto de la cual se expresan todas las
DEPs. Los animales nacidos ese año, tienen una DEP=0.
o Cada DEP se desvía de la DEP promedio del año considerado.
o Es un cambio de escala de las DEP´s:

DEPi – DEPpromedio animales nac. año base
o No afecta el ranking de los animales:
o Decisión política de los criadores:
 Fija: se elige un año y no se modifica en el tiempo.

 Móvil: se actualiza en cada evaluación (ej: promedio de 3 años
previos).
 Flotante: promedio general de todos los animales evaluados.
Tendencia genética y base
15
06/03/2018
EJEMPLO
Supongamos que queremos conocer el valor mejorante para
peso al nacimiento de los siguientes bovinos cárnicos.
Animal Rebaño Peso al Nacimiento (Kg)

1 1 43
2 2 41
3 1 45
4 2 38
5 1 40
6 1 42
7 2 39
8 1 43
MODELO MATEMÁTICO
(ALGEBRAICO)
yij = ri + aj + eij 43 = r1 + a1 + e11
41 = r2 + a2 + e22
Donde:
yij = Peso al nacimiento del animal j
45 = r1 + a3 + e13
que pertenece al rebaño i
38 = r2 + a4 + e24
ri = Efecto del rebaño i, FIJO 40 = r1 + a5 + e15
42 = r1 + a6 + e16
aj = Efecto del animal j, valor
mejorante, ALEATORIO 39 = r2 + a7 + e27
43 = r1 + a8 + e18
eij = Error
16
06/03/2018
EN NOTACIÓN MATRICIAL
Efectos Fijos Efectos Aleatorios

EN NOTACIÓN MATRICIAL
DONDE:
y = Vector de observaciones.
X = Matriz de incidencia (0,1) que relaciona las observaciones con los niveles del
efecto rebaño.
b = Vector de efectos fijos, en nuestro caso rebaño.
Z = Matriz de incidencia (0,1) que relaciona las observaciones fenotípicas con el

valor mejorante de cada animal.
a = Vector de efectos aleatorios, en nuestro caso los valores mejorantes de los

animales.
e = vector de errores: recoge la parte de la variabilidad no explicada por el modelo.
17
06/03/2018
ALGORITMO DE HENDERSON
Predictor (Prediction): Solución para los efectos aleatorios
Lineal (Linear): Combinación lineal de las observaciones
Insesgado (Unbiased): El valor esperado del predictor debe ser igual al valor del
parámetro a predecir
Mínima varianza (Best): La varianza del error de predicción debe ser mínima
ECUACIONES DEL MODELO MIXTO (HENDERSON):
 X'R -1 X X'R -1Z  bˆ   X'R -1y 

 -1   
-1 -1
= -1 
 Z'R X Z'R Z + G     Z'R y 
û
ALGORITMO DE HENDERSON
ECUACIONES DEL MODELO MIXTO (HENDERSON):
 X'R-1 X X'R-1Z  bˆ   X'R-1y 
 -1   
-1 -1
= -1 
 Z'R X Z'R Z + G     Z'R y 
û
u  G 0   A u2 0 
Definición del modelo: var        
e   0 R  0 I e2 
ECUACIONES DEL MODELO MIXTO SIMPLIFICADAS:
 X'X X'Z  bˆ   X'y 

 Z'X Z'Z + A-1    =  Z'y  siendo:
  û     2
p   u2 
 2    p2 1  h2
2 2
  e2  p 2 u  
u u  2
u h2
 p2
18
06/03/2018
MODELO ANIMAL - EMM
MODELO ANIMAL - EMM
19
06/03/2018
MODELO ANIMAL - EMM
20
06/03/2018
FRISÓN
21
06/03/2018
RETINTO
22
06/03/2018
ASSAF
CABALLO HANNOVERIANO
23
06/03/2018
CABALLO TROTADOR ESPAÑOL
rufipc@lamg.pe
www.lamg.pe
24

Prediccion Del Valor de Cria Blup Modelo

Загружено:

Сведения о документе

Исходное описание:

Авторское право

Доступные форматы

Поделиться этим документом

Поделиться или встроить документ

Параметры публикации

Этот документ был вам полезен?

Это неприемлемый материал?

Авторское право:

Доступные форматы

Prediccion Del Valor de Cria Blup Modelo

Загружено:

Авторское право:

Доступные форматы

06/03/2018

PREDICCIÓN DEL VALOR DE CRÍA

Rufino Paucar Chanca

Rufino Paucar Chanca

Modelos Mixtos – BLUP –

Sexo, edad del animal, edad de la madre,

o Utilizando teoría estadística de modelos mixtos, permite

→ Estimar efectos fijos o factores ambientales sistemáticos

sexo, edad, grupo de contemporáneos, heterosis.

→ Predecir los efectos aleatorios del modelo

valor de cría (individual o materno) para uno o

Rufino Paucar Chanca

BLUP (best linear unbia sed predictor): predictor

Rufino Paucar Chanca

Si la diferencia entre el promedio fenotípico de los hijos

El BLUP de la diferencia entre la mitad de los valores de

BLUP(½aA) BLUP (½aB) < 20 kg.

Dicho número se acercará a 0 cuanto menor sea la h2.

BLUP pondera por el grado de transmisibilidad del carácter

Modelo Animal (AM)

Dato(s) = Efectos Fijos + Efectos aleatorios + Error

Sexo, Edad de madre, Grupo Valor de cría para un carácter o

o Predice el valor de cría total de cada animal.

Ponderaciones para cada

Rufino Paucar Chanca

Rufino Paucar Chanca

EPDS, EBVS Y PTAS

o EBV o VCP es Valor de Cría Predicho:

o PTA (Predicted Transmited Ability). Es la mitad del Valor de Cría

Rufino Paucar Chanca

vacas de valor genético promedio

¿Qué diferencia existirá entre los hijos de ambos toros?

Rufino Paucar Chanca

Fijos: grupo genético – GC – Edad - Sexo

Descomposición del valor de

Rufino Paucar Chanca

 de la cantidad de información (número de registros) que

o A diferencia del IS, las ponderaciones b1, b2 y b3 del Modelo Animal

o En el caso de los padres y las madres, cuando el número de hi1jo8s

Ventajas del modelo animal

o Ajusta por las diferencias genéticas entre las distintas

o Tiene en cuenta la tendencia genética.

o Corrige diferencias entre efectos fijos (año, rodeo)

o Proporciona las mejores (mayor exactitud) predicciones

Rufino Paucar Chanca

 Se requiere estimar los componentes de varianzas de la

 Deben existir conexiones entre rodeos, mediante los

 Es importante evitar el aumento de la consanguinidad

Rufino Paucar Chanca

Fijos: grupo genético – GC – Edad - Sexo

Rufino Paucar Chanca

Fijos: grupo genético – GC – Edad - Sexo

 Es el error estándar de la predicción o cambio posible de

 Se deben esperar cambios en las DEPs cuando

 Si se repitiese la evaluación un numero grande de veces,

Rufino Paucar Chanca

Rango del cam bio posible del verdadero valor de cría de

-40 -30 -20 -10 0 10 20 30 40 50 60

Verdadero valor de cría se encuentra en este rango para un

La confianza acerca del cambio posible aumenta con mayor

Rufino Paucar Chanca

Cambio posible (Ejemplo)

Rufino Paucar Chanca