Академический Документы
Профессиональный Документы
Культура Документы
CICLO DE KREBS
Respiración celular
El piruvato de la glicolisis en condiciones anaeróbicas se va a la fermentación. Si estamos
en condiciones aeróbicas entra a la mitocondria y va a la respiración celular. En la
respiración celular las células consumen O2 y producen CO2.
Son reacciones aeróbicas, no pueden ocurrir sin oxígeno. El piruvato de la glicólisis se
termina de oxidar para dar finalmente CO2 y H2O.
Glicolisis + Respiración celular à 30-32 ATP por molécula de glucosa.
*En células eucariontes la respiración celular ocurre en la mitocondria.
Organización de la mitocondria
- Membrana externa → Permeable a iones y moléculas
pequeñas ya que tienen porinas, que son poros que
atraviesan las moléculas libremente del citosol a un
espacio que esta entre la membrana externa e interna.
- Espacio intermembrana → Hay varias enzimas y
metabolitos
- Membrana interna → Impermeable a iones y moléculas
pequeñas. Todo lo que va a entrar hacia el interior de la
mitocondria debe ser por acto de un transportador. Por lo
tanto, encontramos una serie de transportadores, la que
nos interesa es la ADP-ATP translocasa, que entra ADP y
saca ATP. Encontraremos la cadena transportadora de
electrones y la ATP sintasa, por lo que la membrana
genera invaginaciones para tener una mayor superficie de
membrana interna y así hacer eficiente el proceso de
síntesis de ATP.
Dentro de la mitocondria lo que no es membrana interna es la matriz.
- Matriz → Encontramos el complejo piruvato deshidrogenasa que produce Acetil-CoA. Las
enzimas del ciclo de Krebs, enzima de la oxidación de ácidos grasos y aminoácidos, DNA
mitocondrial, ribosomas y tRNA mitocondrial.
Respiración celular
Tiene tres etapas
- La primera etapa consiste en producir Acetil-CoA a partir del
piruvato de la glicólisis (Aunque también se puede a partir de la
oxidación de aminoácidos y ácidos grasos).
- La segunda etapa el Acetil-CoA se oxida en el ciclo de Krebs (aquí
se llega a CO2 y H2O), y en el proceso oxidativo se sacan electrones
que van quedando en transportadores de electrones reducidos
(NADH y FADH2).
- La tercera etapa el NADH y FADH2 entregan los electrones a la
cadena transportadora de electrones donde fluyen hacia el oxígeno
que es el aceptor final generando una gradiente de protones que
permite la síntesis de ATP en la fosforilación oxidativa (ATP sintasa),
generando una gran cantidad de ATP.
Si solo hacemos el proceso en ausencia de oxígeno, se forman 2
ATP por la glicolisis, pero si hacemos el proceso completo
obtenemos 30-32 ATP.
Lipoato
Lo vamos a encontrar unido a enzima 2, es un grupo prostético que se une covalentemente a
una lisina como una cadena lateral de lisina en la enzima 2. Puede estar en su forma oxidada
formando un anillo o estar de una forma reducida. En su forma reducida, en uno de los azufres,
va a recibir el grupo acetilo. Estos procesos son vitales para la mantención de los organismos,
si uno interrumpe estos procesos que vemos ahora de síntesis de ATP, el organismo termina
muriendo por falta de energía. También como son arsénicos, son tóxicos porque secuestran
Lipoamida, que es el precursor del Lipoato (una persona que consume arsénico se queda sin
Lipoato y no va a poder producir Acetil CoA ni ATP de forma normal).
Resumen:
● Enzima 1 forma CO2.
● Enzima 2 forma Acetil CoA.
● Enzima 3 forma NADH.
Este complejo,
piruvato
deshidrogenasa es
prototipo (es igual)
de otros complejos
multienzimáticos
que también tienen
las 3 enzimas:
- usan los mismos
cofactores
- hacen el mismo
mecanismo pero
como parten de
otra cosa no
producen acetil
CoA.
● Se parte con:
- 1 molécula de acetil CoA
- 1 molécula de oxaloacetato
La formación de Acetil CoA no es parte
del ciclo de krebs, sino que es previa.
● Condensan las 2 moléculas y se
obtiene citrato.
● Luego pasa a isocitrato (más
adelante lo veremos en detalle)
● Alfa Cetoglutarato
● Succinil CoA
● Sucinato
● fumarato
● malata
● Se vuelve a oxaloacetato
Por cada molécula de Acetil CoA que se oxida, es decir, por cada vuelta, se producen:
- 2 CO2
- 3 NADH
- 1 FADH2
- 1 GTP (después se convierte en ATP, entonces cuando se cuente el rendimiento de
ATP, se contará como ATP pero lo que se produce inicialmente es GTP)
PREGUNTA:
Si se parte de una molécula de glucosa ¿Cuántas vueltas del ciclo de krebs hay que dar? →
¡2 vueltas! porque se producen 2 piruvato y esos dan 2 Acetil CoA lo que significa dos
vueltas. Entonces, por molécula de Acetil CoA o por vuelta, ese es el rendimiento.
PRIMERA REACCIÓN:
1º reacción es
catalizada por la
citrato sintasa.
DATO: (Las
sintasas son
enzimas distintas de
las sintetasas.
Las sintetasas si
gastan energía, las
sintasas no)
-Citrato sintasa cataliza una reacción de condensación entre el grupo acetilo de Acetil CoA y
una molécula de oxaloacetato.
Citrato se
transforma en
isocitrato
(isomerización):
Dentro del ciclo de Krebs se produce FADH2 e inmediatamente el FADH2 entrega sus
electrones a la cadena transportadora de electrones. esta unido a la cadena transportadora
de electrones como el complejo 2.
Como en algún momento se puede necesitar usar el ciclo de krebs para formar energía y a
la vez sacar intermediarios para la síntesis de otros compuestos, podría haber una situación
en que alguno le empezara a faltar algún intermediario del ciclo de Krebs, entonces existen
las reacciones con la flecha roja que se llaman reacciones anapleróticas.
Reacciones anapleróticas
Son reacciones que producen directamente intermediarios del ciclo de Krebs, se van a
activar estas reacciones cuando falten intermediarios del ciclo de krebs.
Tenemos esas cuatro flechas rojas, no todas las células tienen todas, algunas tienen unas y
otras tienen otras.
La tercera reacción para nosotros no tiene importancia porque solo esta en plantas,
levaduras y bacterias.
- En el ciclo de Krebs citrato sintasa se activa por ADP y se inhibe por NADH, succinil-
CoA, citrato y ATP.
- Isocitrato deshidrogenasa se activa en músculo por Ca2+ y ADP, y se inhibe por
ATP.
- El complejo alfa cetoglutarato deshidrogenasa se activa por Ca2+ y se inhibe por
succinil-CoA que es su producto y NADH.
El citrato, el ATP y el NADH también son inhibidores en la glicolisis, estos tres compuestos
permiten una regulación coordinada del ciclo de Krebs y en la glicolisis, el citrato sobre todo
que inhibe a la citrato sintasa, inhibe a la PFK1 que es el punto más importante en la
regulación. Con esto se logra que las dos vías funcionen coordinadas, si la glicolisi se
inhibe, el ciclo de krebs también se inhibe.
Todas las moléculas de NADH y de FADH2 tiene que entregar sus electrones a la cadena
transportadora de electrones, el transporte de electrones creará un gradiente de protones en
el espacio intermembrana que se va a aprovechar para la síntesis de ATP.
Aquí hay mucho Ubiquinona no tiene porque ser la misma molécula de ubiquinona, el paso
es de I a ubiquinona y de II a ubiquinona en forma independiente, de ubiquinona para acá
esto es común, no hay nunca paso de electrones del complejo I y II. Ambos entregan a
ubiquinona, distintas moléculas de ubiquinona que están ahí presente y de ahí la ubiquinona
hacia oxígeno es una vía común.
Entonces están ordenados todos los componentes de menor a mayor afinidad por los
electrones, eso se refleja en el potencial estándar de reducción, cuantifica la tendencia de
una sustancia a ser reducida u oxidada.
Se ve que partimos con NADH que tiene potencial negativo y de ahí el potencial siempre va
subiendo hasta el aceptor final que es el oxígeno que es el que tiene la mayor tendencia a
aceptar los electrones.
Como esta tabla está ordenada entonces el flujo de electrones es espontáneo que libera
energía.
En los complejos 1, 2, 3 y 4 esa energía se aprovecha para mover al mismo tiempo protones
de la matriz al espacio intermembrana. En paralelo está pasando el transporte de
electrones hacia el oxígeno y en algunos complejos el 1, 2 , 3 y 4 movimiento de protones
de la matriz hacia el espacio intermembrana.
Si partimos de FADH2 del ciclo de krebs se mueven 4 protones del complejo III y 2 protones
en el complejo IV, es decir, 6 protones en total.
Se sabe que se necesita juntar 4 protones en el espacio intermembrana por cada molécula
de ATP que se va a sintetizar, entonces como el NADH me permite juntar mas protones me
permite sintetizar más moléculas de ATP.
10 protones de NADH dividido por 4 por cada molécula de ATP me da un rendimiento de 2,5
ATP por cada molécula de NADH.
6 protones de FADH2 dividido por 4 me da un rendimiento de 1,5 ATP por cada molécula de
FADH2.
Entonces se sintetizan más ATP por los electrones de NADH que por los electrones de
FADH2 porque el transporte de electrones de NADH como parte antes permite juntar más
protones y mientras mas protones junte más ATP puedo sintetizar. Al juntar menos protones
desde FADH2 se obtiene menos ATP desde FADH2.
Estos números 2,5 y 1,5 antiguamente eran 3 y 2, pueden haber escuchado que el
rendimiento de ATP era 36 o 38 eso era con esos números, pero después se midió de
manera más exacta y ahora se llega a un número de 30 o 32.
Si tienen que calcular ATP la profesora dirá “Considere 2,5 o 3” ahí ella va a indicar que es
lo que hay que tomar. Pero lo que se usa ahora son 2,5 y 1,5.
Ubiquinona o Coenzima Q
Lo que hace es tomar electrones y pasar de una forma oxidada a una forma reducida. Es un
lípido es una benzoquinona, tiene una cola hidrofóbica, es liposoluble y entonces está
soluble en la membrana interna. Tiene una larga cadena isoprenoide que se encuentra en la
membrana interna de la mitocondria.
La ubiquinona puede captar un máximo de dos electrones en la forma de dos átomos de
hidrógeno. Pero los puede captar de a uno, no es necesario que los capte los dos altiro.
Entonces capta 1 y queda semireducida, capta el otro y queda la forma totalmente reducida.
Puede recibir entonces un total de dos electrones y después los puede entregar de uno, por
lo tanto los capta de a uno y los puede entregar de uno, eso es importante porque conectan
dadores de 2 electrones con aceptores de 1 electrón.
Citocromos
Son proteínas que tienen como grupos prostéticos el grupo hemo, entonces ese sistema de
anillos
con el fierro al medio.
Hay distintos citocromos que tienen distintas maneras de unir el grupo hemo (hay que saber
la estructura de cada uno)
Citocromo C es una proteína soluble que está asociada a la cara externa de la membrana
interna entonces se va a poder mover entre el complejo 3 y 4 porque no está inserta en la
membrana.
En estos casos el fierro es el que va a aceptar los electrones y ceder los electrones
Hay una variante que proteína de Rieske que tiene los dos fierros, dos azufres inorgánicos,
2 cisteínas y 2 nitrógenos de histidina. Es igual que el anterior pero tiene 2 histidinas.
Por lo que también habrá un complejo de fierro y azufre que corresponde a la proteína de
rieske.
En cada caso el fierro es el que participa en el paso de los electrones, la parte proteica del
aminoácido no tiene grupos adecuados para captar y ceder electrones, por eso se asocian
con los citocromos que tienen fierro.
El NADH formado en la mitocondria,
osea cuando se pasa a piruvato a
acetilCoA o en el ciclo de krebs,
entrega los electrones al complejo 1.
Ese NADH2 se forma dentro del
complejo 2, los electrones entran en
el complejo 2.
El problema está con el NADH de la
glicólisis, este se produce en el
citosol y la membrana interna es
impermeable del NADH y no hay
transportador de este. Por ende en
NADH no puede entrar a la
mitocondria a entregar sus electrones
al complejo 1. para que los electrones del NADH citosólico puedan llegar a la cadena
transportadora de electrones se necesitan sistemas indirectos llamados sistemas de
lanzaderas . En resumen lo que ocurre aquí es que el NADH no puede entrar a la
mitocondria a entregar los electrones a la cadena transportadora de electrones. Para que los
electrones lleguen a esta cadena sin que el NADH entre a la mitocondria, estarán las
lanzaderas.
Hay 2 lanzaderas distintas que están en distinto tipo de célula, dependiendo de la lanzadera
que tenga la célula será ese 30 o 31
Como le entrega los electrones a la ubiquinona solo logrará juntar los protones que mueven
los complejos 3 y 4 que son 6, entonces habrá un rendimiento de 1,5 en el sistema nuevo, 2
ATP por molécula de NADH en el antiguo. Estas células van a llegar a 30 ATP.
Lanzadera del malato-aspartato
Presente en hígado, riñón y corazón. (mitocondrias de células de hígado riñón y corazón)
Hay oxaloacetato en el
citosol, en el citosol hay
una enzima de la
malato deshidrogenasa,
la misma del ciclo de
krebs, y lo que hace es:
Con los electrones del
NADH de la glicólisis
transforma oxaloacetato
en malato, el malato
ahora tiene los
electrones que estaban
en el NADH.
El malato si tiene un
transportador, entonces
el malato con los
electrones del NADH de
la glicólisis entra a la mitocondria.
En la mitocondria la malato deshidrogenasa lo transforma en oxaloacetato y produce NADH.
Este NADH se produjo en la mitocondria con los electrones del NADH de la glicólisis, pero
ahora es como cualquier NDH de la mitocondria y entrega los electrones del complejo 1.
Me da 2,5 o 3 ATP por molécula de NADH. Estas células van a llegar a 32.
La parte de abajo es para volver a sacar oxalacetato al citosol, porque el oxalacetato no
tiene transportador por ende se tiene que transformar en otra cosa que salga al citosol.
En este caso oxalacetato se transforma en aspartato y este sale en el citosol y se convierte
en oxaloacetato.
Nunca entró NADH a la mitocondria, sus electrones llegaron y sirvieron para generar NADH
mitocondrial.