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LABORATORIO BIOQUÍMICA
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OBJETIVOS DE APRENDIZAJE:
Los ácidos nucleicos tienen como principales funciones la transmisión y expresión de la información
genética. A través de estas funciones determinan no solo la estructura, también, regulan todos los
procesos fisiológicos y metabólicos de los seres vivos. Existen dos tipos de ácidos nucleicos,
denominados ácido desoxirribonucleico (ADN) y ácido ribonucleico (ARN), los cuales son polímeros
de nucleótidos, que a su vez se conforman de tres moléculas diferentes (azúcar pentosa, base
nitrogenada y fosfato).
En las células eucarióticas el ADN se encuentra en el núcleo asociado a proteínas denominadas
histonas formando la cromatina (figura 1). También, puede encontrase en organelas como las
mitocondrias y los cloroplastos. En procariotas (Ej: bacterias) el ADN se localiza en el citoplasma ya
que estas carecen de membrana nuclear.
Figura No 1. Niveles de organización del ADN en células eucariotas. Tomado de La química del genoma
en Locos por la biología. Julio 20, 2011. Disponible en la web:
http://locosporlabiologia.wordpress.com/2011/07/20/la-quimica-del-genoma/
El ARN es un tipo de ácido nucleíco de menor tamaño que el ADN. Existen varios tipos de ARN:
mensajero (ARNm), ribosomal (ARNr) y de transferencia (ARNt) con diferentes funciones, todas
asociadas con la expresión de la información contenida en el ADN. El ARN es sintetizado en el
núcleo en el proceso de transcripción, y en la mayoría de los casos, debe ser transportado al
citoplasma para que pueda ejercer sus funciones.
Los ácidos nucleicos de una célula eucariota, pueden ser aislados mediante la ruptura de la
membrana celular y nuclear, para su posterior limpieza y precipitación. Para ello es necesario
someter a las células a un choque osmótico (ej; NaCl 3M), una homogenización mecánica,
digestión enzimática (ej; proteinasa K) y tratamiento con detergentes (ej; SDS) o ácidos (ej;
HCl). Posteriormente, una ronda de centrifugación permite descartar las células intactas,
organelas y restos de membranas, dejando los ácidos nucleicos solubles en el sobrenadante, el
cual es tratado con agentes como fenol, mezclas de cloroformo-alcohol isoamílico o una
solución concentrada de sales (ej: cloruro de sodio 5M) que permiten separar las proteínas, que
se encuentran unidas a los ácidos nucleicos, al desnaturalizarlas. El ADN que era soluble en la
fase acuosa se precipita adicionando etanol frio, lo que permite su aislamiento. Después de ser
secado y disuelto en un buffer apropiado, el ADN puede ser visualizado en un gel de agarosa,
usando SYBR Green, un fluoróforo que se une con gran afinidad al surco menor del DNA
bicatenario, aumentando su fluorescencia unas 1000 veces. Bajo luz ultravioleta estas
moléculas son fluorescentes y por estar unidas al ADN se pueden observar indirectamente las
moléculas de ADN con un color verde, producto de la capacidad de fluorescencia del colorante.
Disfrute la práctica.
2. SEGURIDAD DURANTE LA PRÁCTICA
• Bata de laboratorio
• Guantes de nitrilo
• Gafas de seguridad
Mantener los elementos personales de seguridad identificados y en buen estado. Está prohibido su intercambio con
los demás compañeros de laboratorio.
Tanto por razones de seguridad como por respeto al medio ambiente, es importante disponer los residuos
generados en las prácticas del laboratorio de química en forma adecuada. Por ello el estudiante debe:
1. Emplear los recipientes destinados para eliminar los residuos o desechos de laboratorio, los cuales están
debidamente identificados según el tipo de sustancia a desechar.
2. Verter únicamente los residuos en el recipiente correspondiente para evitar reacciones no controladas y
potencialmente peligrosas. No arrojar por el desagüe los desechos o residuos químicos obtenidos durante el
desarrollo de la práctica. Si tiene alguna inquietud al respecto comuníquela al responsable del laboratorio,
quien le indicará la forma correcta de hacerlo.
3. METODOS
3.1 REACTIVOS:
3.3. EQUIPOS
3.4. PROCEDIMIENTO
2. Tome 2,5 mL de la muestra y deposítela en un tubo Falcon. Adicione 2,5mL de solución SDS
al 10% y agite por inversión.
4. Añada 10mL de etanol al 96% (debe estar a una temperatura de -20ºC). Agite por inversión (muy
suavemente).
5. Anotar observaciones.
1. Retire el peine de un gel de agarosa preparado al 0.8%, el cual ha sido depositado en una
cámara de electroforesis horizontal. Cúbralo con buffer TBE 1X.
2. Corte un pedazo de papel parafilm. Deposite 3 µl de buffer de carga 5X y mézclelos con 5L
de la solución de ADN.
4. Una vez el gel ha sido servido, cierre la cámara, conéctela a la fuente de poder y deje correr
por espacio de 30 minutos a 60 voltios.
5. CUANTIFICACIÓN DE ADN:
3. Una vez calibrado, adicione la dilución de la muestra en una cubeta de cuarzo. Mida y
registre el valor de la D.O. a 260 y 280 nm.
6. RESULTADOS
Electroforesis:
1. Tome una foto del gel en el transiluminador. Señale el carril por el que su muestra corrió.
Determine el peso molecular de la banda y agregue la leyenda de la imagen
2. Con la misma fotografía del gel, compare su muestra con la de otro grupo. Determine si hay
variación en el peso, la intensidad lumínica y grosor entre las dos bandas describiéndolo y haciendo
referencia a la imagen.
Cuantificación de ADN:
1. En una tabla reporte la concentración de ADN y la relación 260/280 e incluya la leyenda
correspondiente.
7. ANÁLISIS
Extracción de ADN:
1. Qué diferencia esperar encontrar en un gel de agarosa al 0.8% frente a uno al 2%?
2. Cuál es la función del buffer TBE 1X sobre la electroforesis?
3. Explique porque es posible observar el ADN con Luz UV cuando se tiñe con SYBR Green o
con Bromuro de etidio. ¿Cuál es el mecanismo de tinción de estos reactivos?
4. Explique en que se basa la separación de moléculas de ADN en geles de agarosa usando
como ejemplo lo que observó en el gel que se realizó en la práctica de laboratorio
5. Cuál es la función del buffer de carga? Qué implicaciones tendría el no combinarlo con la
muestra que se pretende visualizar en el gel? Detalle su respuesta.
Cuantificación de ADN:
8. Bibliografía.
1. Bioquímica de Stryer
2. Bioquímica de Lehninger
3. SAMBROOK J, FRITSCH E, MANIATIS T. Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd
edn. Cold Spring Harbor, NY: Cold S, Spring Harbor Laboratory.1989.
4. Sitios de internet:
− platea.pntic.mec.es/~cmarti3/bio/ADN/adn3/ppal.htm
− www.hospitalameijeiras.sld.cu/.../...
− http://www.hospitalameijeiras.sld.cu/hha/mpm/documentos/BIOLOGIA%20MOLE
CULAR%20Y%20GENETICA/GP/EXTRACCION%20DE%20DNA%20A%20PAR
TIR%20DE%20MUCOSA%20BUCAL.pdf
5. Alberto Checa Rojas. (2017). Método: Gel de electroforesis Agarosa. 2018, Diciembre 5,
Conogasi.org Sitio web: http://conogasi.org/articulos/metodo-gel-de-electroforesis-
agarosa/