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Taller biología para ingenieros primer parcial

Conceptos claves.
Características de los organismos vivos
Importancia de la biología en ingeniería química (aplicaciones)
Enfoque clásico de los productos biotecnológicos en ingeniería química
Diferencias (ventajas y desventajas) de algunos tipos de procesos: Bacterias, levaduras,
cultivos celulares.
Tipos de aminoácidos
Propiedades ácido básicas de los aminoácidos y cambio en la estructura con el pH
Punto isoeléctrico de aminoácidos y proteínas
Enlace peptídico, formación de péptidos
Estructuras de las proteínas (primaria a cuaternaria)
Análisis cualitativo de proteínas y aminoácidos
Qué son enzimas
Actividad de las enzimas en el organismo y aplicaciones en la ingeniería química
Especificidad de las enzimas
Cofactores y coenzimas
Actividad enzimática: cómo se determina y como se aplica
Cinética enzimática y modelos de linealización
Significado de Vmax y Km
Tipos de inhibición y como se pueden encontrar en un gráfico cinético
Bases nitrogenadas y como se unen
Relación ADN y ARN y cómo se genera
Diferencias entre ADN y ARN (estructura)
Transcripción traducción (mecanismos) y síntesis de proteínas.

Ejercicio 1
La hormona peptídica oxitocina induce el parto porque estimula la concentración del
músculo liso uterino. Su secuencia de aminoácidos es la siguiente:
Cys-Tyr-Ile-Gln-Asn-Cys-Pro-Leu-Gly
Escriba una secuencia de ARN mensajero para dicha secuencia.
Escriba la secuencia de las dos cadenas de nucleótidos de ADN que lleva la información
para dicha proteína.

Ejercicio 2
Se aisló una estearasa de un extracto vegetal y se midió su actividad en la hidrólisis del
benzoato de metilo.
500 g del material vegetal se maceraron y se extrajeron con 2 litros de agua, se filtró el
extracto y se cuantificó su contenido de proteína, hallándose 50 mg en el mismo. Para
determinar su actividad se tomaron 10 gramos de benzoato de metilo, se disolvieron en una
mezcla agua/isoporopanol (100 mL) y se añadieron 5 mL del extracto enzimático, se ajustó
el pH al valor deseado y se dejó en agitación y calentamiento el sistema por 1 hora. Pasado
el tiempo se midió el contenido de metanol por cromatografía gaseosa.

Figura 1 reacción de hidrólisis del benzoato de metilo

Determine la actividad específica enzimática en mg de benzoato de metilo por minuto a


los diferentes pH
pH Metanol g/L
3 0,25
5 0,37
7 0,42
9 0,26

Para determinar los parámetros cinéticos se realizaron las mediciones de velocidad a


diferentes concentraciones:
v
S µmol/L nmol/min
3,7 10
13 30
39 63
79 87
230 116
400 122
Se probó además la acetofenona como inhibidor de la estearasa, obteniendo los
siguientes datos:
v
S µmol/L nmol/min
3,7 5
13 20
39 30
79 61
230 102
400 122

Determine las constantes cinéticas KM y Vmax para ambos casos y deduzca el tipo de
inhibición que causa la acetofenona sobre la enzima.

Ejercicio 3
La síntesis de un péptido se da por la secuencia de mRNA 5’GAAGAGAAACUUACU3’,
halle la estructura primaria de dicho péptido.
Si por un error de transcripción se omiten el cuarto, octavo y noveno nucleótido, ¿qué
péptido se sintetizaría?
Halle la carga de cada péptido a pH7 y explique si este error de transcripción puede afectar
la actividad biológica de dicha molécula.

Ejercicio 4

Se tiene una solución con la mezcla de los siguientes péptidos:


1) Ala-Cys-Gly
2)phe-tyr-trp-phe
3)glu-asp-glu-ile

Cómo se encuentran cargados cada una de ellos a los siguientes pH:


a) 3
b) 5
c) 7
d) 9

1) ¿Cuál de los anteriores pH es el más adecuado para separarlos mediante campos


eléctricos?
2) ¿Una vez separados en 3 soluciones cómo podría determinarse cualitativamente
si la separación si fue completa?

Ejercicio 5

Describa los niveles de estructura de una proteína y diga cómo se verían afectados con:
a. Hidrólisis con HCl 6M (rompe enlace peptídico)
b. Calentamiento con mercaptoetanol (rompe puentes de hidrógeno)
.
Ejercicio 6

En una empresa productora de jarabe de fructosa se tiene implementado el siguiente


proceso para su producción a partir de almidón de maíz:

Etapa 1. Hidrólisis del almidón: se usa un complejo enzimático conformado por alfa
amilasas y gluco amilasas. El preparado enzimático tiene una actividad de 3000U/mL,
donde U está definido como la cantidad de enzima que es capaz de hidrolizar 1 g de almidón
soluble en 30 minutos. Esta etapa se lleva a cabo a 85°C y 15 minutos y se utiliza una carga
de 10 U por gramo de almidón, con lo que se garantiza la conversión total del almidón en
glucosa.
Este complejo enzimático tiene un costo de $80000/L

Etapa 2.
Se realiza la reacción de isomerización de glucosa para transformarla en fructosa, se usa
una isomerasa la cual tiene una actividad de 30 GIU/g, donde GIU se define como la
cantidad de enzima que es capaz de producir una milimol de fructosa en una hora a 45°C.
El proceso se lleva a cabo a una carga de 0,05 GIU por milimol de glucosa durante 30
minutos a 45 °C

El costo de esta enzima es de $110000/Kg

Una empresa productora de enzimas le ofrece un nuevo complejo enzimático el cual hace
las reacciones de hidrólisis e isomerización de manera simultánea. Para determinar el
desempeño de este nuevo proceso, se hacen pruebas de laboratorio en la empresa de
acuerdo con el siguiente protocolo:
100 gramos de almidón de maíz se mezclan con 100 gramos de agua, se calientan a
diversas temperaturas y se homogenizan con agitación mecánica, posteriormente se le
añaden 2 gramos de este nuevo complejo enzimático, se deja la reacción durante 30
minutos y se mide el contenido de fructosa por cromatografía líquida, obteniéndose los
siguientes resultados:

Temperatura °C % p/p fructosa


30 16
50 28
70 50
90 32

a. Determine la actividad enzimática (UF) en gramos de fructosa producidos por minuto por
gramo de enzima para cada temperatura.
b. El nuevo complejo enzimático tiene un costo de $30000/kg.
Si el proceso se lleva a cabo a una carga de 0,12 UF por gramo de almidón, ¿es
económicamente viable el cambio por el nuevo proceso?
De no ser viable, determine a partir de qué carga enzimática lo sería.

Ejercicio 7

La anhidrasa carbónica cataliza la hidratación del dióxido de carbono


 
H 2 O  CO 2  HCO3  H
Se tienen los siguientes datos:

1/v (M-1.s) Concentración de sustrato(M)


95000 2
45000 5
29000 10
25000 15

a)Calcule las constantes de Michaelis Menten.

b)Grafique la velocidad de reacción en función de la concentración de sustrato, ubique las


constantes y explique su significado, explique el comportamiento de la gráfica.

c) En presencia de sulfanilamida las constantes de Michaelis Menten para la reacción son


Vmax: 7,57e-5 M/s y Km:20M. Qué tipo de compuesto es la sulfanilamida y cuál es su
mecanismo de acción?

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