Objetivo General:

Analizar el funcionamiento de los organismos a nivel molecular

 COMPOSICIÓN DE LA MATERIA VIVA
• Todos los seres vivos tienen una organización química muy
compleja pero básica semejante en todos a pesar de su diversidad

• La organización química de la materia viva se basa en los mismos

materiales y los mismos principios que rigen el universo de los
seres sin vida

• Las bases para el estudio de los seres vivos comienzan por

comprender la estructura química de la célula, así como, los
principios químicos y físicos que rigen su actividad

Composición química del protoplasma (citoplasma + núcleo)

El protoplasma es un complejo de iones, moléculas y partículas

coloidales, organizados para constituir múltiples sistemas estructurales
y funcionales y determinar las características de un sistema viviente.
 ELEMENTOS BIOGENÉSICOS O BIOELEMENTOS
Los elementos son sustancias que no pueden descomponerse en otras más sencillas mediante
reacciones químicas ordinarias

Los bioelementos son los elementos químicos que forman parte del
protoplasma, se conocen unos 24 elementos esenciales para la
estructuración y funcionamiento normal de la célula.

En un análisis elemental cuantitativo de cualquier ser vivo se encuentra que

sólo 11 elementos químicos constituyen ya el 99% de su composición
elemental.

 Hay 4 elementos C, H, O, N, que por sí solos constituyen más

del 96% del peso del protoplasma.

 También son esenciales tres elementos no metales : S, P,

Cl y cuatro metales : Na, K, Ca, Mg .

 Los restantes elementos, hasta 24 cuya presencia en la materia

viva es esencial, se presentan en concentraciones muy pequeñas,
son los elementos TRAZA y todos son metálicos (Fe, Cu, I, Zn, Co,
Va, Fl, Se, Cr, Si, etc.).
Razones de la abundancia del C (20%), H (9.5%), O (62%) y N (2,5%) en los
seres vivos

- Son fácilmente incorporados desde la biosfera.

- Forman entre ellos enlaces covalentes, compartiendo electrones. El carbono, nitrógeno

y oxígeno, pueden compartir más de un par de electrones, formando enlaces dobles y
triples, lo cual les dota de una gran versatilidad para el enlace químico.

- Son los elementos más ligeros con capacidad de formar enlace covalente, por lo que
dichos enlaces son muy estables.

- Debido a la configuración tetraédrica de los enlaces del carbono, los diferentes tipos de
moléculas orgánicas tienen estructuras tridimensionales diferentes. Esta
conformación espacial es responsable de la actividad biológica.

- Las combinaciones del carbono con otros elementos, como el oxígeno, el hidrógeno, el
nitrógeno, etc. Permiten la aparición de una gran variedad de grupos funcionales que
dan lugar a las diferentes familias de sustancias orgánicas. Estos presentan características
físicas y químicas diferentes, y dan a las moléculas orgánicas propiedades específicas, lo
que aumenta las posibilidades de creación de nuevas moléculas orgánicas por reacción
entre los diferentes grupos.
 Bioelementos primarios o principales: C, H, O, N

Son los elementos más ligeros, con capacidad de formar enlace

covalente, compartiendo electrones por lo que dichos enlaces son muy
estables. Los organismos vivos han seleccionado aquellos
elementos capaces de formar enlaces covalentes más fuertes

 El carbono, nitrógeno y oxígeno, pueden compartir más de

un par de electrones, formando enlaces dobles y triples, lo
cual les dota de una gran versatilidad para el enlace químico.

Hydrogeno Oxygeno Nitrogeno Carbono

(valencia = 1) (valencia = 2) (valencia = 3) (valencia = 4)
 De los 4 elementos el CARBONO juega un papel
preponderante, fundamentalmente debido al papel que
ocupa en el sistema periódico ya que está situado en
medio entre los elementos electropositivos y
electronegativos.

El C es el origen de una gran variedad de

combinaciones moleculares

• Posee propiedades electronegativas bastante

débiles (combinación con el H)
• Posee propiedades electropositivas bastante
fuertes (combinación con el O y el N)

• Posee la propiedad de combinarse consigo

mismo, formando combinaciones complejas e
infinitamente variadas
 CARBONO
Las valencias del carbono se dirigen hacia
los vértices de un tetraedro regular,

 A causa de la configuración tetraédrica de los enlaces del

carbono, los diferentes tipos de moléculas orgánicas tienen
estructuras tridimensionales diferentes y a veces complicadas .
esto explica que:

• Los compuestos orgánicos formen cadenas en zig-zag

• Los átomos de carbono puedan unirse en forma de anillo

 Los enlaces entre los
átomos de carbono Etano Propano
Lineales
(C - C), (C = C) o
triples, permiten que
puedan formarse
cadenas más o menos
largas, lineales,
ramificadas y anillos. Butano 2-methylpropano
(commonly called isobutane)
Ramificadas

Esta conformación 1-Buteno 2-Buteno

espacial es responsable
Dobles enlaces

de la actividad biológica.

Cyclohexano Benzeno

Anillos
 Las combinaciones del carbono con otros elementos como el oxígeno, el hidrógeno,
el nitrógeno, etc., permiten la aparición de una gran variedad de grupos funcionales
que dan lugar a las diferentes familias de sustancias orgánicas .

Grupos funcionales apolares

(insolubles o hidrófobos)

Grupos funcionales polares

(solubles en agua o hidrófilos)
Campbell pag: 64-65
Atendiendo a la concentración en la que éstos se encuentran en los
seres vivos :

Elementos Plásticos: formados por los 11 elementos ya

mencionados y que forman parte de las moléculas metabólicas,
energéticas y estructurales.

Oligoelementos: que se caracterizan por presentarse en una

bajísima concentración y ejercer en general una función catalítica. Sin
embargo, también se incluyen aquí elementos como Fe, Cu, Mg y Co
que se encuentran en unas concentraciones muy superiores a los
restantes. Los oligoelementos generalmente se ponen en evidencia
en las enfermedades carenciales en donde se manifiesta su carácter
indispensable.
 Otros Elementos Plásticos

Se encuentra en dos aminoácidos (cisteína y metionina) , presentes en

Azufre
todas las proteínas. También en algunas sustancias como el Coenzima A
Forma parte de los nucleótidos, compuestos que forman los ácidos
nucléicos. Forman parte de coenzimas y otras moléculas como
Fósforo fosfolípidos, sustancias fundamentales de las membranas celulares.
También forma parte de los fosfatos, sales minerales abundantes en los
seres vivos.
Forma parte de la molécula de clorofila, y en forma iónica actúa como
Magnesio catalizador, junto con las enzimas , en muchas reacciones químicas del
organismo.
Forma parte de los carbonatos de calcio de estructuras esqueléticas. En
Calcio forma iónica interviene en la contracción muscular, coagulación
sanguínea y transmisión del impulso nervioso.
Catión abundante en el medio extracelular; necesario para la conducción
Sodio
nerviosa y la contracción muscular
Catión más abundante en el interior de las células; necesario para la
Potasio
conducción nerviosa y la contracción muscular
Anión más frecuente; necesario para mantener el balance de agua en la
Cloro
sangre y fluido intersticial
 Oligoelementos

Fundamental para la síntesis de clorofila, catalizador en reacciones

químicas y formando parte de citocromos que intervienen en la
Hierro
respiración celular, y en la hemoglobina que interviene en el
transporte de oxígeno.
Interviene en la fotolisis del agua , durante el proceso de fotosíntesis
Manganeso
en las plantas.
Necesario para la síntesis de la tiroxina, hormona que interviene en el
Iodo
metabolismo
Flúor Forma parte del esmalte dentario y de los huesos.
Forma parte de la vitamina B12, necesaria para la síntesis de
Cobalto
hemoglobina .
Proporciona resistencia al tejido conjuntivo, endurece tejidos
Silicio
vegetales como en las gramíneas.
Cromo Interviene junto a la insulina en la regulación de glucosa en sangre.
Zinc Actúa como catalizador en muchas reacciones del organismo.
Actúa sobre neurotransmisores y la permeabilidad celular. En dosis
Litio
adecuada puede prevenir estados de depresiones.
Forma parte de las enzimas vegetales que actúan en la reducción de
Molibdeno
los nitratos por parte de las plantas.
Nitrogeno deficiencia Iodo deficiencia
Proporción de algunos bioelementos en el cuerpo humano comparada con la que tienen en el resto de la Tierra

Litosfera- atmósfera-
Elemento Cuerpo humano (%)
hidrosfera (%)
Oxígeno (O) 50,02 62,81
Carbono (C) 0,18 19,37
Hidrógeno (H) 0,95 9,31
Nitrógeno (N) 0,03 5,14
Calcio (Ca) 3,22 1,38
Fósforo (P) 0,11 0,64
Azufre (S) 0,11 0,63
Sodio (Na) 2,36 0,26
Potasio (K) 2,28 0,22
Cloro (Cl) 0,20 0,18
Magnesio (Mg) 2,08 0,04
Flúor (F) 0,10 0,009
Hierro (Fe) 4,18 0,005
Aluminio (Al) 7,30 0,001
0,0002
Manganeso (Mn) 0,08
Silicio (Si) 25,80 —
 CONCLUSIONES

 La materia viva utiliza únicamente una fracción de los elementos

que tiene a su disposición en la naturaleza.

 La capacidad de la materia viva para concentrar elementos

raros en su interior es notable: El H, C y N juntos, solamente
representan menos del 1% de los átomos que se hallan en la
corteza terrestre, pero forman el 74% de los átomos presentes en
la materia viva.
Posiblemente esto es debido:

• Todos estos elementos forman con facilidad enlaces covalentes

estables
• Tienen una considerable versatilidad para el enlace químico,
pueden reaccionar fácilmente unos con otros mediante enlaces
simples, dobles o triples
 Aunque la composición química del agua es muy simple, sus propiedades físicas
la hacen única entre el resto de sustancias.

 Posee 16 fases cristalinas (el último tipo de hielo se descubrió en 2009), dos o
más vítreas y puede que dos puntos críticos.

 En estado líquido muestra no menos de 73 anomalías, algunas conocidas desde

hace más de 300 años, y participa en la mayoría de procesos biológicos.

 Es la sustancia más abundante en la biosfera, dónde la encontramos

en sus tres estados
 Componente más abundante en los seres vivos, aproximadamente un
70 por ciento de un ser vivo es agua, aunque este porcentaje varía según se
trate de una célula animal o una vegetal, dentro de los diferentes tejidos, en
diferentes formas de vida, etc.

 Hizo posible el origen de los seres vivos hace más de 3600 millones de
años. No hay vida activa sin agua.

 Posee una manifiesta reaccionabilidad y posee unas extraordinarias

propiedades físicas y químicas que van a ser responsables de su
importancia biológica.
• La molécula de agua está formada por dos átomos de
hidrógeno y uno de oxígeno (H2O).

• Cada uno de los átomos de hidrógeno está unido al de

oxígeno por un enlace covalente

• La molécula de agua es neutra, no tiene carga eléctrica,

pues posee igual nº de protones (8+2) que de electrones
(8+2), y sin embargo es una molécula polar
 Agua (H2O)

Modelos Moleculares

Modelo de Modelo de
Modelo espacial orbitales híbridos
esferas y varillas Con un modelo de varillas y
orbitales superpuestos

Par de electrones
no unidos

104.5°

• La disposición tetraédrica de los orbitales sp3 del oxígeno determina un

ángulo entre los enlaces H-O-H aproximadamente de 104'5:,
Por todo esto, en la práctica las moléculas de agua se comportan como dipolos, y se orientan
unas frente a otras, enfrentando las esquinas de distinta carga parcial.

La fuerza de atracción existente entre ellas forma un enlace que se conoce como
Puente de Hidrógeno
• Es un enlace más débil que uno covalente o iónico

• Tiene una vida muy corta

• Todos juntos tienen una fuerza considerable

• gracias a ellos, las moléculas se mantienen unidas y

el agua es líquida a temperaturas a las que otras
moléculas son gaseosas.

El agua en estado líquido esta formada por moléculas que se

desplazan continuamente chocando entre ellas rompiendo o
formando nuevos puentes de hidrógeno

http://www.um.es/~molecula/pdeh.htm
Los puentes de hidrógeno mantienen las moléculas de agua fuertemente
unidas, formando una estructura compacta que la convierte en un líquido
casi incomprensible.

Al no poder comprimirse puede tener la función en algunos animales de

esqueleto hidrostático, como ocurre en algunos gusanos, permite dar
volumen a las células.

También explica la función mecánica amortiguadora que ejerce en

las articulaciones (líquido sinovial)
Los enlaces por puentes de hidrógeno aseguran una cohesión entre las
moléculas que se traduce a 0ºC (punto de congelación del agua) en
la formación de cristales de hielo.
Alrededor de una molécula de agua hay otras 4 moléculas ocupando
cada una el vértice de un tetraedro en el que la primera molécula estaría
en el centro.
Se crea un retículo abierto que es la estructura más estable de un
cristal de hielo
  DENSIDAD
Mientras que la mayoría de las sustancias se hacen más densas al disminuir su
temperatura, el agua tiene una densidad máxima a los 4ºC y comienza a
expandirse conforme disminuye su temperatura, esto se debe:

- A los 4ºC es cuando las moléculas de agua están más próximas y pueden
formar puentes de H simultáneamente con otras 4 moléculas de agua

- Cuando la temperatura desciende por debajo de los 4ºC, las moléculas deben
separarse ligeramente debido a que los puentes de hidrógeno se vuelven más
rígidos y ordenados.

Por tanto, el agua sólida ocupa más volumen que en estado líquido, siendo el
hielo menos denso que el agua líquida, de modo que flota en ella

Consecuencias biológicas:

 Contribuye a la formación de suelo

 La expansión del agua sucede antes del congelamiento, razón por la cual las masas de
agua se congelan de arriba hacia abajo y permiten continuar la vida a los organismos que
habitan en ella cuando el ambiente se enfría notablemente.
 El hielo flota sobre el agua por lo que se encuentra en la superficie de esta
 COHESIVIDAD: Es la responsable de características del agua como la:

 TENSIÓN SUPERFICIAL

La tensión superficial del agua es muy elevada, es el resultado de la

cohesión o atracción mutua entre sus moléculas

 CALOR ESPECÍFICO

Presenta un elevado calor específico (cantidad de energía necesaria para

elevar la temperatura del agua en un grado centígrado), se debe a la
presencia de puentes de hidrógeno entre sus moléculas lo cual favorece el
hecho de que los océanos, los lagos, las plantas y animales terrestres con
alto contenido de agua puedan mantener su temperatura relativamente
constante.
 COHESIVIDAD:

 CALOR DE VAPORIZACIÓN

Como las moléculas de agua se mantienen juntas por puentes de

hidrógeno, el agua tiene elevado calor de vaporización, de tal manera
que para convertir un gramo de agua en un gramo de vapor se
necesitan más de 500 calorías.

Debido a que el agua absorbe calor al cambiar de su estado líquido a

gas, el cuerpo humano disipa el exceso de calor mediante la
evaporación del sudor y las hojas de las plantas se mantienen frescas a
los rayos del sol por la evaporación del agua en su superficie.

La elevada conductividad calorífica del agua hace posible la distribución

uniforme del calor en todo el cuerpo.
 CAPILARIDAD
Esta fuerza está también en relación con los puentes de hidrógeno que se
establecen entre las moléculas de agua y otras moléculas polares y es
responsable, junto con la cohesión del llamado fenómeno de la capilaridad.

Cuando se introduce un
capilar en un recipiente
con agua, ésta asciende
por el capilar como si
trepase agarrándose por
las paredes, hasta
alcanzar un nivel superior
al del recipiente,

A este fenómeno se debe en

parte la ascensión de la savia
bruta desde las raíces hasta las
hojas, a través de los vasos
leñosos.

 IMBIBICIÓN

Es La penetración capilar de las moléculas de agua en sustancias tales como la madera

o la gelatina, que se hinchan como resultado de ello. Las presiones realizadas por
imbibición pueden ser sorprendentemente grandes
  ACCIÓN DISOLVENTE
El agua es el disolvente universal.
Esta propiedad, tal vez es la más importante para la vida
La polaridad de las moléculas de agua es la responsable de su capacidad disolvente
Son las cargas residuales de los enlaces de H rotos las que confieren al agua sus
extraordinarias cualidades disolventes

Se debe a su capacidad para formar puentes de hidrógeno con otras sustancias que pueden
presentar grupos polares o con carga iónica (alcoholes, azúcares con grupos R-OH,
aminoácidos y proteínas con grupos que presentan cargas + y - , lo que da lugar a:

• disoluciones iónicas.
•disoluciones moleculares.

En el caso de las
disoluciones iónicas, los
iones de las sales son
atraídos por los dipolos
del agua, quedando
"atrapados" y
recubiertos de
moléculas de agua en
forma de iones
hidratados o solvatados.

disoluciones iónicas disolución molecular

 La capacidad disolvente es la responsable de dos funciones:

1. El agua es el medio donde ocurren las reacciones del

metabolismo.

2. El agua es el sistemas de transporte de sustancias, aporte

de nutrientes y la eliminación de desechos.

Solubilidad de las biomoléculas:

Son solubles:
• Los iones inorgánicos y orgánicos (grupos ácidos y aminos).
• Las moléculas polares (alcoholes, tioles).

Son insolubles:
• Las moléculas apolares (moléculas con mucho C e H).
Ionización del agua Disociación del agua :

El agua pura en realidad se puede

considerar una mezcla de :
• agua molecular (H2O )
• protones hidratados (H3O + ) e
• iones hidroxido (OH -)

Se dice que esa solución es neutra

Ion Hidronio Ion Hidróxido

(H3O+) (OH–)
Bajo grado de ionización: sólo una molécula de cada 551.000 de agua se encuentra
ionizada:

Esto explica que la concentración de iones H3O+ y de los iones OH- sea muy baja,
concretamente de 10-7 por litro.

Dado los bajos niveles de estos iones, si al agua se le añade un ácido o una base, aunque sea en
poca cantidad, estos niveles varían bruscamente.

En los líquidos biológicos, sin embargo, y pese a estar constituidos por agua en su mayoría, la
adición de ácidos o bases no varía apenas la concentración de iones H3O+ y OH-.

Esto es debido a que los líquidos biológicos contienen sales minerales y moléculas orgánicas
disueltas que pueden ionizarse en mayor o menor grado actuando como disoluciones
amortiguadoras. Este efecto se denomina efecto tampón.
 El pH expresa el grado de acidez o alcalinidad de un líquido
Sorensen definió el pH como el logaritmo negativo (base 10) de la concentración de hidrogeniones.
pH= -log [H+]
Para una solución acuosa neutra [H+] es de 10 -7M pH= -log10-7=-(-7)=7
Según esto: disolución neutra pH = 7
disolución ácida pH < 7
disolución básica pH > 7
La escala de pH comprende el intervalo de las concentraciones de H+ y OH- empleando logaritmos

[H+] > [OH–] [H+] = [OH–] [H+] < [OH–]

Los organismos vivos no soportan variaciones del pH mayores de unas décimas de unidad y
por eso han desarrollado a lo largo de la evolución sistemas de tampón o buffer, que
mantienen el pH constante mediante mecanismos homeostáticos.
 Funciones del agua
Las funciones del agua se relacionan íntimamente con las propiedades
anteriormente descritas. Se podrían resumir en los siguientes puntos:

Soporte o medio donde ocurren las reacciones metabólicas

Amortiguador térmico

Transporte de sustancias

Lubricante, amortiguadora del roce entre órganos

Favorece la circulación y turgencia

Da flexibilidad y elasticidad a los tejidos

Puede intervenir como reactivo en reacciones del metabolismo,

aportando hidrogeniones e hidroxilos al medio.
 Sales minerales
Las sales minerales son compuestos inorgánicos fundamentalmente iónicos.
Los procesos vitales requieren la presencia de ciertas sales bajo la forma de iones como los cloruros, los carbonatos y los
sulfatos.

Las sales minerales se pueden encontrar en los seres vivos de tres formas:

 Precipitadas: Insolubles en agua

Forman estructuras duras, que proporcionan estructura o protección al ser que las posee. También actúan con función
reguladora.

• Silicatos: caparazones de algunos organismos (diatomeas), espículas de algunas esponjas y estructura de sostén en algunos
vegetales (gramíneas).
• Carbonato cálcico: caparazones de algunos protozoos marinos, esqueletos externos de corales, moluscos y artrópodos,
huesos, dientes, etc.
• Fosfato de calcio: esqueleto de vertebrados.

Ionizadas: solubles en agua

Las sales disueltas en agua manifiestan cargas positivas o negativas.
• Los cationes más abundantes en la composición de los seres vivos son Na+, K+, Ca2+, Mg2+, NH4+.
• Los aniones más representativos en la composición de los seres vivos son Cl−, PO43−, CO32− ,HCO3 −.

Las sales disueltas en agua pueden realizar funciones tales como:

Funciones catalíticas
Amortiguar cambios de pH, mediante el efecto tampón.
Controlar la contracción muscular.
Producir gradientes electroquímicos.
Estabilizar dispersiones coloidales.
Intervienen en el equilibrio osmótico.

Asociadas a moléculas:
Dentro de este grupo se encuentran las fosfoproteínas y los fosfolípidos.
Los iones de las sales pueden asociarse a moléculas, realizando funciones que tanto el ion como la molécula no realizarían por
separado.
 Objetivos de aprendizaje

• Nombrar los principales elementos químicos presentes en los seres vivos y

mencionar una función importante de cada uno.

• Distinguir entre enlaces covalentes, iónicos, puentes de hidrógeno,

interacciones de van der Waals,…

• Explicar como los enlaces de hidrógeno entre moléculas de agua adyacentes

dirigen muchas de las propiedades del agua.

• Comparar ácidos y bases y estudiar sus propiedades

• describir las propiedades del carbono

• Identificar los principales grupos funcionales presentes en los compuestos

orgánicos y describir sus propiedades