Comparative Transcriptomics Provides

Insight into Floral Color Polymorphism in a

Pleione limprichtii Orchid Population
Alejandro Ochoa Álvarez
Objetivo
• El objetivo del estudio fue comprender el mecanismo molecular del
polimorfismo del color y la razón principal que causa la intensidad de las
flores rosadas de las P. limprichtii.
Contenido
• Introducción

• Resultados

• Discusión

• Conclusión
Introducción
 • Los cambios de color están
Introducción relacionados con el contenido de
• El ABP implica procesos pigmento de la flor.
multimetabólicos que consisten
• El color de la flor está
principalmente en siete genes
estructurales centrales: CHS, CHI, influenciado por flavonoides,
F3H, F30H, F305 0H, DFR y ANS. especialmente las antocianinas
producidas por la vía de
• El ABP está regulado por tres biosíntesis de antocianinas (ABP)
factores de transcripción : R2R3-
• Las antocianinas derivan
MYB, helix-loop-helix (bHLH)
básico y WD40-repeat (WDR). principalmente de tres
Estos regulan así la síntesis de antocianidinas: pelargonidina
antocianinas. (rojo ladrillo a escarlata),
cianuración (rojo a magenta) y
delfinidina (púrpura a violeta).
Resultados
Major Anthocyanin Compounds in P. limprichtii
RNA-Seq and Annotation of Unigenes
80,525 unigenes were obtained by de novo assembly.
According to the BLASTx results, a total of 33,724 unigenes
were annotated.
• 33,459 could be annotated using the Nr database
• 21,177 using the Swiss-prot database
• 11,067 using the KEGG database
• 19,871 using the KOG database
• Basado en las anotaciones Nr, 6495
unigenes se clasificaron en 53
categorías funcionales,
pertenecientes a tres términos
funcionales:
• función molecular

• componente celular

• proceso biológico

• Los mayores porcentajes en cada uno de los tres términos funcionales fueron
proceso metabólico (3602 unigenes), célula y parte celular (2237 y 2233
unigenes), y actividad de unión y catalítica (2481 y 3409 unigenes),
• Para explorar exhaustivamente las funciones potenciales de los unigenes
anotados, se mapearon 11.067 unigenes en 131 rutas de KEGG, incluidas
las rutas metabólicas, la biosíntesis de metabolitos secundarios, la
biosíntesis de antibióticos y muchas otras rutas metabólicas importantes.
• Entre estas 131 rutas, hay dos rutas relacionadas con la formación de
color, la ruta de biosíntesis de flavonoides (ko00941) a la que se asignaron
36 unigenes, y la ABP (ko00942) a la que se asignó un unigen.
The Expression Patterns of ABP Genes
Las diferencias de color floral fueron
causadas por diferentes patrones de
expresión de genes relacionados con ABP.
Los genes que codifican (FLS, PlFLS), (ANS,
PlANS1, PlANS2) y (UFGT, PlUFGT1,
PlUFGT2) se expresaron a un nivel superior
en flores pigmentadas (rosa-púrpura y rosa).
Otros genes también influyen en la formación
del color, (F3H; PlF3H3) y (DFR, PlDFR3)
Hubo 21 unigenes
fueron regulados al alza en las flores de color
estructurales
rosa púrpura y contribuyen a la formación
relacionados con ABP,
del color rojo.
que codificaron 10
El análisis de la expresión de alto nivel de
enzimas, expresadas
expresión de PlCHS y PlCHI en pétalos
tanto en flores
blancos y un nivel bajo en pétalos
pigmentadas como en
pigmentados, lo que sugiere que los pétalos
flores blancas.
blancos pueden producir una gran cantidad
de naringenina pero eventualmente no
pueden convertirse en antocianina sintasa.
The Relationship between Structure Genes and TFs

A través del análisis de los patrones de expresión de genes relacionados con

ABP y el árbol filogenético de R2R3-MYB, obtuvimos varios genes candidatos
que se correlacionan con la intensidad del color floral. Se creó una red de
coexpresión para identificar las interacciones entre los genes relacionados
con ABP y las proteínas complejas de MBW (MYB, bHLH y WDR)
Conclusión
Agregar un título de diapositiva (2)

• The results show that PlFLS • PlANS and PlUFGT were found to
serves as a crucial gene that determine the color intensity in
contributes to white color pigmented flowers
formation and that PlANS and
PlUFGT are related to the
accumulation of anthocyanin
which is responsible for color
intensity, especially in pigmented
flowers.