La Bioinformática como Nueva Área

de Trabajo en México
Oscar Iván Saucedo Romero

Licenciatura en Informática, Instituto Tecnológico de Durango

Durango, México

osivsaro__79@hotmail.com

La Bioinformática es el conjunto de aplicaciones, II. LA BIOINFORMÁTICA

tecnologías y programas informáticos que ayudan a Y SU SITUACIÓN EN MÉXICO
gestionar, almacenar, organizar, y analizar datos
El desarrollo de la ingeniería genética y las nuevas
biológicos, médicos, conductuales o de salud. Es una
tecnologías de la información durante la última década del
disciplina científica de investigación multidisciplinaria,
siglo XX, condicionaron el surgimiento de una disciplina
la cual puede ser ampliamente definida como la interfaz
que generó vínculos indisolubles entre la Informática y las
entre dos ciencias: la Biología y la Computación. Sin
Ciencias Biológicas: la Bioinformática. (1)
duda, ésta puede convertirse en una importante área de
generación de empleos en nuestro país.

A. Concepto de Bioinformática, Biocomputación, Biología

Computacional e Informática Médica
I. INTRODUCCIÓN
La Bioinformática es una disciplina emergente que
La Bioinformática se define como la aplicación de
utiliza las tecnologías de la información para captar,
las tecnologías de las computadoras a la gestión y análisis de
organizar, analizar y distribuir información biológica con el
datos biológicos. Incluye aquellas herramientas que sirven
propósito de responder preguntas complejas en biología. Su
para adquirir, almacenar, organizar, analizar o visualizar
objetivo final consiste en utilizar esta información para
tales datos.
desarrollar nuevas formas de tratar, curar o prevenir las
Es importante señalar que para desarrollar el miles de enfermedades que afligen a la humanidad. (2)
software que ayuda a solucionar los problemas de estas áreas
Esta disciplina está relacionada principalmente con
de la biología se requiere de diferentes conocimientos que
las siguientes áreas: biología molecular, genómica,
incluyen, además de la informática, las matemáticas
proteómica, ciencias biomédicas, ciencias de la
aplicadas, estadística, ciencias de la computación,
computación, matemáticas, física y estadística.
inteligencia artificial, química y bioquímica, entre otros.
 La Biología Computacional comprende
computación aplicada a la comprensión de las cuestiones
biológicas básicas, a partir de la modelación y simulación -
sistemas de vida artificial, algoritmos genéticos, redes de
neuronas artificiales. (2)
La Biocomputación incluye el desarrollo y
utilización de sistemas computacionales basados en modelos
y materiales biológicos -biochips, biosensores, computación
basada en ADN, entre otros. (2)
La Informática Médica es el campo de las ciencias
de la información que se ocupa del análisis y la
diseminación de datos médicos mediante diferentes
aplicaciones informáticas sobre aspectos del cuidado de la
salud y medicina.
B. Historia de la Bioinformática
Durante la segunda mitad del siglo XX, la
bioquímica mostró un avance acelerado, sobre todo, a partir
del desarrollo de nuevas técnicas como la cromatografía y la
aparición del microscopio electrónico, que abrieron el
camino para el análisis detallado y el descubrimiento de
muchas moléculas y rutas metabólicas de la célula. Con ella,
avanzaron también la biología celular, la biología molecular,
la biotecnología y la genética, entre otras. (3)
Al principio de los años 60, el número creciente de
secuencias de aminoácidos era uno de los factores
principales que contribuyó al desarrollo de la biología
computacional. (2)
En los 70 una perspectiva científica surge con la
idea de que la genética podría estudiarse considerando la
codificación, almacenamiento y el flujo de información entre
las moléculas. También aparecen los primeros signos de una
convergencia entre la biología, bioquímica, ingeniería e
la informática que conduciría después al nacimiento de la
Bioinformática.
Hacia finales de los años 80, comenzó a emplearse
el término bioinformática y se desarrollaron programas que
rápidamente se convirtieron en productos comerciales. Sin
embargo, en esta época, el campo de acción de la
bioinformática estaba relativamente limitado, hasta que lo
impulsó la generación de bases de datos para almacenar y
catalogar la información generada. Otro avance importante y
fundamental fue el desarrollo de la WWW, como un medio
universal para acceder a bases de datos biológicas y
programas bioinformáticos.
La bioinformática dio un giro en su enfoque a
mediados de los años noventa, perfilándose como una área
de investigación gracias al desarrollo de proyectos de
secuenciación, como el del genoma humano y de otros
organismos importantes, en las áreas de la salud y la
industria.
En el año 2003, con la conclusión del proyecto
concertado por la Human Genome Organization nacieron la
Medicina Molecular, y la Genómica, que estudia
sistemáticamente, y a escala global, la estructura y función
de todos los genes de una especie. (2)
C. La Bioinformática en la Actualidad
La industria médica se constituye sobre los
conocimientos, los recursos y las tecnologías generadas del
proyecto del Genoma Humano para lograr una mejor
contribución de la genética a la salud humana. Durante los
últimos años, la genética ha adquirido una significación
especial para el diagnóstico, seguimiento y tratamiento de
las enfermedades. (2)
El crecimiento de los datos biológicos, que han
pasado de 606 secuencias de ADN almacenadas en 1982, a
más de 82 millones hoy en día, fue impulsado por el
desarrollo de la técnica Reacción en Cadena de la
Polimerasa (PCR) en el año de 1986, y ahora por la
aparición de las denominadas nuevas tecnologías de alto
rendimiento en experimentación biológica. (3)
El inmenso volumen de datos que se está
generando, una vez almacenados, requiere también de
nuevos modelos de análisis que permitan hacerlos
comparables en la medida que son obtenidos utilizando un
variado conjunto de técnicas y condiciones experimentales.
En las ciencias de la salud comienza a revelarse su
utilidad de forma paulatina, ya que se ha observado un gran
avance en la caracterización de la variabilidad genética en
seres humanos y en la forma en que esta variabilidad se
vincula con determinados riesgos de enfermedades. (4)
Con el crecimiento explosivo de Internet se está
apreciando una tendencia, que corre en paralelo a la del
comercio electrónico, consistente en la aparición de portales
en Internet para facilitar el acceso de los investigadores a
datos genéticos y a herramientas bioinformáticas. (5)
D. Las Barreras de la Bioinformática
Una de las principales limitaciones de
Bioinformática, es el hecho de que la información que
produce crece a una velocidad muy superior a la que crecen
los recursos necesarios para analizarla. Y no sólo se refiere a
los recursos computacionales,si no también de recursos
humanos. Esto quiere decir que se tiene una escasez de
científicos, investigadores y técnicos interesados en la
utilización y el desarrollo de herramientas computacionales
para el análisis de este tipo de datos.
Aparte, la bioinformática se enfrenta a grandes
problemas para conseguir el reconocimiento académico y
profesional, pues los científicos de la computación
consideran que la informática aplicada es sólo una rama de
un tronco común que soporta todas las teorías y los logros
científicos.
E. El Futuro de la Bioinformática y sus Perspectivas
La comprensión sobre cómo las variantes genéticas
y el medio ambiente regulan el fenotipo de las células,
tejidos y órganos, ocupará la investigación del siglo XXI. (3)
La masiva cantidad de datos que se generarán en un
futuro inmediato por la utilización de las nuevas tecnologías
de secuenciación, conlleva necesariamente al reto de
diseñar procesos que permitan almacenar, actualizar y poner
a disposición de otros investigadores, estos datos de manera
permanente y confiable. (2)
Así mismo, se prevé que se tendrán que
implementar, a través de internet, estrategias de
comunicación con distribuidores de datos cada vez más
eficientes y veloces, para permitir la actualización,
sincronización y consulta permanente de las bases de datos,
que funcionen adecuadamente dentro de las limitaciones de
la Internet, y el enorme volumen de datos que implican las
principales bases de datos biológicos. (2)
la
En el futuro, se asistirá a una revolución basada en
las tecnologías que posibilitará la “medicina a la carta” o
individualizada, en la que el paciente participe en la toma de
decisiones y tenga acceso a un tratamiento de alta calidad,
adaptado a sus características individuales, peculiaridades de
su desarrollo y condiciones del entorno. (2)
Hay quien prevé que, dentro de pocos años, una
persona podrá pedir su perfil genético en un laboratorio,
obtenerlo en un CD-ROM y contrastarlo vía web con
librerías genéticas que podrán informarle acerca de su
predisposición a padecer ciertas enfermedades o de los
fármacos a los que presente mejor tolerancia. (5)
La computación móvil y la comunicación
inalámbrica, la integración de la telefonía e Internet, la
aparición de nuevas interfaces con voz en lenguaje natural,
el establecimiento de una nueva generación de Internet con
una alta calidad de servicio, la simulación de cirugía y
radiación asistida por imágenes, el progreso de la robótica en
la cirugía, el crecimiento de los sistemas diagnósticos
basados en nanotecnología, la ingeniería microelectrónica,
la creación de tarjetas personales inteligentes, y de nuevos
sensores y biochips para obtener información bioquímica o
genética de forma rápida y costoefectiva, entre otros muchos
avances, propondrán un panorama realmente revolucionario
en el entorno clínico del futuro. (2)
F. La Bioinformática en México
Esta disciplina se está desarrollando en nuestro país
de manera discreta, pero se está trabajando. Algunas de las
instituciones que están desarrollando trabajos en esta área
son: (6)
 Centro de Investigación sobre la Fijación del
Nitrógeno (http://www.cifn.unam.mx/), con su
programa de investigación en genómica
computacional y en colaboración con la Red
Europea de Biología Molecular desarrollan el Nodo
Nacional de Bioinformática EMBnet México
(http://embnet.cifn.unam.mx/).
 Instituto de Biotecnología y el Instituto de Química
de la UNAM (http://www.ibt.unam.mx/).
 Departamento de Biotecnología, UAM-Iztapalapa
(http://www.iztapalapa.uam.mx/iztapala.www/divis
ion.cbs/biotecnolo/).
 Unidad Profesional Interdisciplinaria de
Biotecnología (http://www.upibi.ipn.mx/).
 ITESM, con su programa de Verano de
Investigación
(http://w3.mor.itesm.mx/~esucar/veraniegos.html).
 UAEM, con su especialidad en biología molecular
(http://www.fc.uaem.mx).
En septiembre de 2001 se creó el Nodo Nacional de
Bioinformática EMBnet (European Molecular Biology
Network), cuyo principal objetivo era atender las
necesidades del proyecto genómico titulado: “Desarrollo de
la Ciencia Genómica en México: el genoma de Rhizobium
etli como sistema modelo”, impulsado por el Dr. Juan
Ramón de la Fuente. Este proyecto promovió y ofreció
apoyo, tanto educativo como tecnológico, a la comunidad
científica de nuestro país, razón por la que se obtuvo la
membresía a una de las redes de bioinformática de mayor
importancia a nivel internacional: La EMBnet. Asimismo,
derivado de este proyecto se creó la Licenciatura en Ciencias
Genómicas (LCG) de la UNAM y la Sociedad Mexicana de
Ciencias Genómicas (SMCG). (7)
Para el 2007, la Dirección General de Servicios de
Cómputo Académico (DGSCA) de la UNAM promovió
ampliar su gama de servicios y de esta forma ofrecer
aquellos relacionados con la Bioinformática, para lo cual
solicitó apoyo al CCG y al IBt. Con esta iniciativa se
propuso la creación del Nodo Nacional de Bioinformática de
la Universidad Nacional Autónoma de México (NNB-
UNAM), cuyo objetivo principal es, a través de un sitio web,
ofrecer información, herramientas, bases de datos y foros de
discusión, donde la comunidad científica y académica
pudiera intercambiar opiniones y apoyos en áreas
relacionadas con la bioinformática y las ciencias genómicas.
(7)
 III. PRINCIPALES ÁREAS DE INVESTIGACIÓN Y
DESARROLLO
De acuerdo a los resultados de un análisis
bibliométrico hecho a la base de datos Medline, la
principales aplicaciones de la bioinformática fueron: la
gestión de datos en los laboratorios, la automatización de
experimentos, el ensamblaje de secuencias contiguas, la
predicción de dominios funcionales en secuencias génicas, la
alineación de secuencias, las búsquedas en bases de datos de
estructuras, la determinación y predicción de la estructura de
las macromoléculas, la evolución molecular y los árboles
filogenéticos. (1)
A continuación se presentan algunas de las
principales áreas que utilizan la bioinformática como una
importante herramienta en la realización de sus labores.
A. Medicina Molecular, Genómica e Individual
La convergencia entre la medicina y la genómica
está dando lugar a la llamada Medicina Molecular. Ésta
trata de explicar la vida y la enfermedad en el ser humano a
partir de la presencia y la regulación de las funciones
biológicas que realizan de las diferentes entidades
moleculares en los organismos vivos. (2)
La Medicina Genómica es el uso rutinario de
análisis genotípicos para mejorar los cuidados de salud del
individuo.
La Medicina Individual, por su parte, consiste en
la aplicación de la genómica para identificar
predisposición individual de los seres humanos para
desarrollar una enfermedad y para diseñar terapias adaptadas
a los perfiles genéticos de los pacientes y que, por tanto,
podrían prescribirse con garantías de seguridad y eficiencia.
(2)
B. Análisis de Mutaciones en el Cáncer
Se han realizado esfuerzos masivos de
secuenciación para identificar sustituciones individuales de
bases (o puntos de mutación de nucleótidos) todavía
desconocidos en una variedad de genes en el cáncer. Los
bioinformáticos continúan produciendo sistemas
automatizados para gestionar el importante volumen de
datos de secuencias obtenido, y han estado creando nuevos
algoritmos y software para comparar los resultados de
secuenciación con la creciente colección de secuencias del
genoma humano y de los polimorfismos de la línea
germinal. (8)
C. Epidemiología
La epidemiología comprende el estudio de la
distribución de las enfermedades -según persona, tiempo y
lugar- y las determinantes de los eventos y estados de salud
en poblaciones específicas -grupos de personas con
características identificables- y su uso en el control de los
problemas de salud. (2)
D. Biología Evolutiva Computacional
La Biología Evolutiva es el estudio del origen
ancestral de las especies, así como de su cambio a través del
tiempo. La informática ha apoyado a los biólogos evolutivos
en diferentes campos clave.
E. La Minería de Datos
la
La Minería de Datos (Data Mining) es el proceso
automatizado de descubrir información desconocida u
oculta, y de presentarla en una forma que se pueda
comprender, a partir de grandes volúmenes de datos, útil
para toma de decisiones críticas.
F. Modelado de Sistemas Biológicos
La biología de sistemas implica el uso de
simulaciones por ordenador de subsistemas celulares, tanto
para analizar como para visualizar las complejas conexiones
de estos procesos celulares. La vida artificial o la evolución
virtual tratan de entender los procesos evolutivos por medio
de la simulación por ordenador de sencillas formas de vida
artificial. (8)
G. e-Salud
Se habla de e-Salud para referirse a la aplicación de
los principios del comercio electrónico en la prestación de
servicios e información sobre salud. El fin de estas
aproximaciones radica en la necesidad de ofrecer una
respuesta, desde las organizaciones sanitarias, a las
crecientes exigencias de un nuevo tipo de consumidor que
demanda una asistencia sanitaria más personalizada, de
mayor calidad y en la que el paciente forme parte del
proceso de toma de decisiones. (5)
H. Medición de la Biodiversidad
La biodiversidad de un ecosistema puede definirse
como el conjunto genómico completo de todas las especies
presentes en un medio ambiente particular, sea este una
biopelícula en una mina abandonada, una gota de agua de
mar, un puñado de tierra, o la biosfera completa del planeta
Tierra. Se utilizan bases de datos para recoger los nombres
de las especies, así como de sus descripciones,
distribuciones, información genética, estado y tamaños de
las poblaciones, necesidades de su hábitat, y cómo cada
organismo interactúa con otras especies. Así mismo, se usa
software especializado para encontrar, visualizar y analizar
la información; y, lo que es más importante, para
compartirla con otros interesados. (8)
IV. RESULTADOS
La Bioinformática es la aplicación de las
tecnologías de la información y comunicación a la gestión y
análisis de datos biológicos. Esta disciplina nace en la
década de los 50 del siglo pasado, y desde aquel tiempo y
hasta la actualidad ha avanzado notablemente, siendo hoy en
día una herramienta vital para la Biología y todas sus sub
áreas.
En México, apenas se está empezando la
exploración de este nuevo campo, por lo que no se cuenta
con mucha información al respecto. Afortunadamente son
muchas las disciplinas en las que se pueden incorporar los
investigadores y egresados de las áreas de las tecnologías y
la computación, interados en estas áreas.
CONCLUSIONES
Sin duda, la Bioinformática es un área que podría
dar grandes oportunidad de desarrollo a nuestro país, debido
a la gran ayuda que proporciona la ciencia de la Biología y a
todas las disciplinas que se derivan de ellas.
Apenas se está empezando, y de forma discreta,
este gran camino, pero si se le invierte el suficiente apoyo
económico y el esfuerzo de los investigadores, México
podría ser un fuerte desarrollador de herramientas y técnicas
para el análisis de datos biológicos.
BIBLIOGRAFÍA
1. Impacto de la Bioinformática en las ciencias
biomédicas. Perezleo Solórzano, Ligeya, y otros. 4, Agosto
de 2003, Acimed, Vol. 11.
2. Bioinformática: en busca de los secretos moleculares de
la vida. Cañedo Andalia, Rubén y Arencibia Jorge,
Ricardo. 2004, Acimed.
3. Bioinformática: una oportunidad y un desafío. Barreto
Hernández, Emiliano. 1, Julio de 2008, Revista
Colombiana Biotecnología, Vol. 10, págs. 132-138.

4. La Bioinformática como Herramienta para la

Investigación en Salud Humana. Martínez Barnetchet,
Jesús. Edición Especial, Cuernavaca, México : s.n., 2007,
Salud Pública de México, Vol. 49, págs. 64-66.

5. Genoma, bioinformática y comercio electrónico (e-

genética): Impactos en salud. Martín Sánchez, Fernando.
[ed.] Jordi Camí. 18, Enero-Junio de 2000, Quark.

6. Hernández Valdelamar, Eugenio Jacobo.

Bioinformática: una nueva área de oportunidad. 2002.

7. Acerca del Nodo Nacional de Bioinformática. [En línea]

1.0, 2010. [Citado el: 8 de Diciembre de 2010.]
http://www.nnb.unam.mx/acercade.

8. Bioinformática - Wikipedia. [En línea] 2 de Diciembre de

2010. [Citado el: 10 de Diciembre de 2010.]
http://es.wikipedia.org/wiki/Bioinform%C3%A1tica