LES BACILLES A GRAM NEGATIF (1)

ALLAG H.
ANNEE UNIVERSITAIRE 2012/13.

1
ENTEROBACTERIACEAE

 Vaste famille de bactéries (> 30 genres, > 140 espèces)


 • TD de l'homme et des animaux

 • 7 caractères bactériologiques communs :
. BGN
. Oxydase -
. Pousse sur milieux ordinaires
. Aéro-anaérobie facultatif (AAF)
. Réduction des NO 3- en NO2-
. Fermentation du glucose
. Souvent mobiles (ciliature péritriche) sauf Klebsiella, Shigella

2
ESCHERICHIA COLI (1)

 Principaux caractères bactériologiques :

 Entérobactérie mobile indole + lactose + citrate -
 Existence de  sérotypes selon :
 . Ag somatique O et flagellaire H (ex. E. coli O157:H7)
 . Ag capsulaire K (ex. E. coli K1)

 Habitat :
 Hôte normal du TD de l'homme et des animaux (10 7-10 9/g selles)
 Espèce dominante de la flore aérobie (mais 99 % d'anaérobies strictes)
 Retrouvé dans l'environnement (contamination fécale _ colimétrie)

3
ESCHERICHIA COLI (2)
 Pouvoir pathogène :
• Infections extra-intestinales :
. Infections urinaires (cystites, pyélonéphrites)
• Infections extra-intestinales (suite) :
. Infections abdominales : cholécystites, péritonites, appendicites
. Infections génitales : prostatites
. Infections ostéo-articulaires
. Bactériémies (risque de choc endotoxinique) : 50 %
. Méningites néonatales (dues à E. coli K1) et neurochirurgicales
. Infections puerpérales
. Infections de plaies chirurgicales (nosocomiales)

• Infections intestinales : diarrhées infectieuses

 Existence de 6 pathovars selon les facteurs de virulence

4
ESCHERICHIA COLI
 Diagnostic biologique :
 Isolement sur gélose ordinaire ou milieu sélectif (type Drigalski) :
 Utilisation de milieux chromogènes :

 Utilisation de milieux spécifiques pour la recherche de EHEC (SMAC)

 Identification par galerie biochimique (type Api20E)

 Utilisation d'anti-sérums pour typage AgO, H (AgK1)

 Recherche de gènes de virulence par PCR

5
SENSIBILITE AUX ANTIBIOTIQUES
 ATB :
 Naturellement sensible aux ATB :
-lactamines, aminosides, quinolones, cotrimoxazole, fosfomycine
Mais existence de R acquises :
. Production de pénicillinase (type TEM ou SHV)
. Production de -lactamase à spectre étendu (BLSE)

 Traitement :
 Fluoroquinolones, C 3G
 Souvent adapté selon l'antibiogramme

6
SALMONELLA (1)
 Principaux caractères bactériologiques :
 Entérobactérie mobile ONPG - lactose - LDC + souvent H 2S +

 Taxonomie et nomenclature :
 2 espèces : S. enterica et S. bongori (très rare)
 6 sous-espèces de S. enterica : S. enterica subsp. enterica (>99%)
 >2500 sérovars de S. enterica subsp. Enterica

 Identification précise par étude des caractères Ag (Kauffmann-White) :

. AgO somatique (LPS)
. AgH flagellaire (flagelline)
. AgVi de surface (seulement chez S. Typhi, S. Paratyphi et S. Dublin)

7
SALMONELLA (2)

 Habitat et épidémiologie :

 S. Typhi et S. Paratyphi A, B et C strictement humaines

 Parasites du TD de l'homme et des animaux
 Porteurs sains _ contamination du milieu extérieur
 Contamination féco-orale
 Aliments à risque : volaille, charcuterie, coquillages, produits
à base d'œufs (mayonnaise)

 Fièvres typhoïdes et paratyphoïdes = MDO

 Toxi-infections alimentaires collectives (TIAC) = MDO

8
SALMONELLA (3)

 Pouvoir pathogène :

• Formes septicémiques : fièvres typhoïde et paratyphoïdes A, B et C

• Incubation 14 j puis bactériémie avec fièvre, tuphos et troubles digestifs

• Formes digestives : Toxi-infections alimentaires (collectives ou non)

• Incubation 8-10 h puis diarrhée, nausées, vomissements, fièvre
Evolution spontanément favorable en 2-5 j

• Formes extra-digestives : plus rares (+ souvent chez ID, drépanocytaire)

Ex. cholécystite, méningite, ostéomyélite, spondylodiscite, IU

9
SALMONELLA (4)

 Diagnostic bactériologique :
* Direct : à partir d'hémocultures, coprocultures,
aliments
 sur milieu Hektoen
 (SS, DCLS, CHROMagar salmonella)
 ou après enrichissement en milieu Rappaport,
 sélénite ou Müller-Kauffmann

10
. Indirect : Sérologie de Widal et Félix
 pour le diagnostic tardif des salmonelloses majeures par
recherche d'Ac anti-O et anti-H à l'aide de suspensions Ag
TO, TH, AO, AH, BO, BH, CO et CH par dilutions croissantes du
sérum
 Apparition des Ac anti-O vers 8ème j et Ac anti-H vers 10-12
ème j
 NB : Existence de faux + (Y. enterocolitica, paludisme,
typhus, dysglobulinémies) et faux -

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SALMONELLA (5)

Traitement :
 Naturellement sensible aux ATB
 Mais existence de R acquises -antibiogramme
_ Fièvres typhoïdes :
 Ceftriaxone, fluoroquinolones dans PI
 Cotrimoxazole, chloramphénicol dans PVD
 _ GE : à discuter selon

 Prévention :
 Hygiène, contrôle des eaux et du personnel de cuisine
 Vaccination : vaccin actuel Typhim Vi
 • protection de 3 ans contre S. Typhi, S. ParatyphiC et S. Dublin

12
SHIGELLA (1)

 Principaux caractères bactériologiques :

 Entérobactérie immobile à faible activité métabolique
 4 sous-groupes :
 . A : Shigella dysenteriae (10 sérotypes) dont le bacille de
 Shiga (sérotype 1)
 . B : Shigella flexneri (6 sérotypes)
 . C : Shigella boydii (15 sérotypes)
 . D : Shigella sonnei (1 sérotype) le + fréquent en France

 Habitat et épidémiologie :
 Strictement humain (TD)
 Existence de porteurs sains
 Transmission féco-orale

13
SHIGELLA (2)
• Dysenterie bacillaire due à S. dysenteriae sérotype 1 (vérotoxine)
 Ulcerations de la muqueuse intestinale et réaction inflammatoire
• Syndrome dysentérique : glaires muco-sanglantes + douleurs abdominales +
épreintes + ténesmes troubles neuros
• Colites infectieuses chez l'adulte et GE chez l'enfant (TIAC)
• Infections urinaires (rares)

 Diagnostic bactériologique :
 Coproculture _ isolement sur milieux sélectifs idem Salmonella
 Rq : Pas de milieux d'enrichissement
 Identification à l'aide anti-sérums

 Sérodiagnostic sans intérêt

14
SHIGELLA (3)

 Traitement :
 Réhydratation +++
 Naturellement sensible aux ATB
 Existence de R acquises _ antibiogramme

 ATB de choix : fluoroquinolones, ceftriaxone

 Prévention :
 Mesures d'hygiène, eau potable
 Pas de vaccin

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ENTÉROBACTÉRIES OPPORTUNISTES (1)
 Différents groupes :
 - Proteae : avec les 3 genres (TDA + souvent URE +)
 . Proteus : P. mirabilis, P. vulgaris et P. penneri
 . Providencia : P. stuartii, P. rettgeri
 . Morganella : M. morganii
- Klebsiella (gros BGN immobile capsulé VP+) :
 K. pneumoniae et K. oxytoca
- Enterobacter (entérobactérie généralement mobile VP+) :
 E. cloacae et E. aerogenes
- Serratia (entérobactérie mobile VP+) :
 S. marcescens et S. liquefaciens

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ENTÉROBACTÉRIES OPPORTUNISTES (2)

 Tres répandues dans l'environnement (eau, sol, poussière)

 Commensales du TD, des téguments et orifices naturels
 Resp. diverses (notamment nosocomiales chez des patients
fragilisés) :
 infections broncho-pulmonaires, urinaires, post-chirurgicales,
bactériémies
 Souvent R aux ATB _ antibiogramme indispensable

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YERSINIA (1)

 Yersinia pestis :
 Agent de la peste découvert par Yersin à Hong
Kong en 1894
 Petit BGN poussant lentement en 36-48h à 30°C
 Maladie des rongeurs transmise
 à l'homme par la puce du rat (Pulex irritans)

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YERSINIA (2)

_ Peste bubonique : adénite réactionnelle (2-7 j) avec

bactériémie et atteinte pulmonaire (mortalité 70 %)
 Peste pulmonaire : transmission interhumaine par voie
aérienne
 • évolution foudroyante en 2-3 j (mortalité 100 %)
 Diagnostic bactériologique par ponction ganglionnaire, HC,
crachats
 Souvent R aux ATB _ streptomycine, cyclines [MDO]

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YERSINIA (3)

 Yersinia pseudoruberculosis (ou bacille de Malassez et Vignal) :

 Petit BGN URE ++ immobile à 37°C et mobile à 22°C

 Retrouvé dans la nature - Porte d'entrée digestive

 Infection souvent localisée au TD :

 . adénite mésentérique
 . iléite terminale

 Bactériémies rares (cirrhose, diabète), érythème noueux (EN)

 Sensible aux C3G, aminosides, cyclines et fluoroquinolones

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YERSINIA (4)

 Yersinia enterocolitica :
 Petit BGN URE +++ - Culture lente en 2-4 j - Pousse à +4°C
 Contamination par voie orale (porc mal cuit)
 Resp. d'entérocolites aiguës,  pseudo-appendiculaires (enf. 8-12 ans)
 Arthrites réactionnelles, EN (HLA-B27)
 Bactériémies rares (ID, chocs septiques post-transfusionnels)

 Recherche par coproculture :

 Utilisation de milieu sélectif CIN
 (Cefsulodine-Irgasan-Novobiocine) en aérobiose à 30°C pendant 48h
 Sérodiagnostic peu fiable (faux +)

 Sensible aux C 3G, aminosides, cyclines et fluoroquinolones

 Traitement par fluoroquinolones

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PSEUDOMONAS AERUGINOSA ( 1)

 = Bacille pyocyanique

 Principaux caractères bactériologiques :
 BGN aérobie strict, oxydase +, très mobile (flagelle polaire)
 Produit un pigment bleu ou pyocyanine un pigment vert fluorescent ou pyoverdine
 Odeur caractéristique de « seringa »

 Habitat et épidémiologie :
 Répandu dans l'eau , le sol et l'environnement hospitalier (siphons de lavabos, Savons liquides,
humidificateurs, solutions d'antiseptiques)
 Fait partie de la flore de transit de l'homme (TD)

 Existence de  sérotypes selon AgO _ typage lors d'épidémies

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PSEUDOMONAS AERUGINOSA (2)
= BACILLE PYOCYANIQUE

 Pouvoir pathogène :
 Resp. de nombreuses infections opportunistes nosocomiales :
 . Infections locales : oculaires, cutanées (brûlures), urinaires,
 pulmonaires, (ostéo-articulaires, méningées)
 . Bactériémies

 Diagnostic bactériologique :
 Isolement à partir de prél. divers sur milieux ordinaires
 Identification phénotypique aisée

 Traitement :
 Naturellement R à de nombreux ATB
 Nombreux mécanismes de R _ antibiogramme

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AUTRES PSEUDOMONADACEAE

 Famille très hétérogène de bactéries de l'environnement

 Resp. d'infections opportunistes (notamment hospitalières)

 Principales espèces :
 . Pseudomonas fluorescens (proche du pyocyanique mais rare)
 . Burkholderia cepacia (mucoviscidose)
 . Burkholderia mallei (morve = zoonose très rare)
 . Burkholderia pseudomallei (mélioïdose en ASE)
 . Stenotrophomonas maltophilia (infections resp., urinaires)
 . Ralstonia pickettii (infections resp.)

 Traitement souvent délicat car germes naturellement très R aux ATB

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VIBRIO CHOLERAE (1)

 = Vibrion cholérique découvert par Koch en Egytpe en 1884

 Principaux caractères bactériologiques :

 BGN incurvés en virgule, très mobiles (flagelle polaire) OX +
 Aéro-anaérobie facultatifs, GLU +

 2 biovars : sérotype O:1

 . V. cholerae cholerae
 . V. cholerae eltor
 Autres sérotypes = vibrions non-cholériques (VNC) ou non-agglutinables (NAG)
 Existence d'un autre sérotype O:139 resp. de choléra

 Pousse facilement sur gélose ordinaire avec tolérance aux pH et [NaCl] élevés

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VIBRIO CHOLERAE (2)
 Habitat et épidémiologie :
 Homme = réservoir et disséminateur
 Dans selles de malades, convalescents et porteurs sains
 Transmission par l'eau de boisson, les aliments et les mains sales
 Survie > 15 j dans le milieu extérieur
 7ème 8ème pandémie due au biovar eltor depuis 1961
 pandémie due au sérotype O:139 depuis 1992 (Inde)
 Pouvoir pathogène :
 Choléra = toxi-infection intestinale aiguë à début brutal (incubation 1-5 j)
 Dû à la sécrétion de la toxine cholérique
 Diarrhée aqueuse abondante (_ 10-20l/j) _ selles incolores « eau de riz »
 + vomissements mais sans fièvre
 • déshydratation aiguë avec acidose métabolique, CCV et anurie

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VIBRIO CHOLERAE (3)

Diagnostic bactériologique :
 Isolement par coproculture sur milieu sélectif
TCBS (Thiosulfate-Citrate- Bile-Saccharose) _
colonies jaunes
 enrichissement par passages successifs (/4h) en
eau peptonée alcaline
 Agglutination avec sérum anti-O:1 :

27
VIBRIO CHOLERAE (4)

 Traitement :
 Urgence = réhydratation parentérale (solution de Ringer-lactate) et
corrections des troubles hydro-électriques

 ATB secondaire : cyclines, cotrimoxazole, fluoroquinolones, macrolides

pendant 2-3 j

 Prophylaxie :
 Isolement des malades et dépistages des porteurs sains [MDO]
 Mesures d'hygiène générale

 Vaccination à efficacité limitée (60% pendant 6 mois)

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AUTRES VIBRIONS

 Vibrio alginolyticus :
 Isolé de pus divers, otites, conjonctivites, lésions cutanées (eau de mer)

 Vibrio parahaemolyticus :
 Resp. de GE

 Vibrio vulnificus :
 Resp. de septicémies, suppurations de plaies, GE

 Aeromonas hydrophila :
 Proche des vibrio, fréquemment isolé d'eau douce (sol, aliments)
 Resp. de septicémies (ID), suppurations de plaies, GE ou autre (méningite,
 péritonite, endocardite, pneumonie, ostéomyélite, cholécystite, IU)

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LES BACILLES A GRAM NEGATIF (2)
Principaux bacilles à Gram négatif (BGN) d'intérêt médical
• Entérobactéries (famille des Enterobacteriaceae)

• Bactéries aérobies strictes (Pseudomonas et apparentés)

• Vibrions

• Campylobacter et Helicobacter

• Autres BGN aérobies

• Anaérobies strictes
CAMPYLOBACTER
 caractères bactériologiques :
BGN fins, incurvés « en virgule ou S », mobiles (flagelle polaire)
Culture lente sur milieux enrichis en 2-5 j en aérophilie
Oxydase + et Uréase - ( Helicobacter)
 3 espèces principales :
C. jejuni
C. coli
C. fetus

 Habitat et épidémiologie :
Commensaux du TD des animaux (volailles+++)
Contamination alimentaire - Existence de porteurs sains
Survie dans mil. extérieur limitée
CAMPYLOBACTER
 Pouvoir pathogène :
• C. fetus : opportuniste chez l'homme
Resp. de septicémies chez ID (infections sur anévrysmes, méningées,
endocardites)

• C. jejuni / C. coli (5/1) : resp. de GE

Incubation de 1-3 j puis diarrhée (selles avec sang) + doul. Abdominales
diffuses + fièvre ± bactériémie
 Surtout chez enfant, jeune adulte (saison chaude)
 Risque de complications : arthrite réactionnelle, d de Guillain-Barré
(SGB), Syndrome Hémolytique et Urémique (SHU)
 Rq : 30% des SGB précédés d'entérocolite à Campylobacter
CAMPYLOBACTER

 Diagnostic bactériologique :
 Isolement du germe :
. à partir d'hémocultures ou prélèvements endovasculaires
. par coproculture sur milieu sélectif (Karmali, Skirrow, Butzler,)
à 37°C en aérophilie pendant 2-5 j
 Identification :
 Traitement :
 Souvent R aux -lactamines (sauf imipénème), S aux aminosides et aux
fluoroquinolones
 ATB de choix = érythromycine (macrolides) [ATBg nécessaire]
HELICOBACTER PYLORI

 Principaux caractères bactériologiques :

 BGN spiralés, non capsulés, mobiles (flagelles polaires)
 Culture lente sur milieux enrichis au sang ou au sérum en 3-6 j en aérophilie (5%
O 2, 10% CO 2, 85% N 2)
 Oxydase + Uréase +++
 Habitat :
 Niche écologique restreinte : germe inféodé à la muqueuse gastrique
 Découvert en 1983 par Warren et Marshall (Prix Nobel 2005)
 Existence d'espèces voisines vivant dans l'intestin et les canalicules biliaires (ex. H.
hepaticus)
HELICOBACTER PYLORI

 Pouvoir pathogène :
 Infection à H. pylori = la + fréquente au Monde :
. PI :  prévalence avec l'âge (20% à 20 ans, 60% à 60 ans)
. PVD : prévalence à 80-95% dès l'enfance
 Contamination oro-orale ou féco-orale (mode exact ?)
 Eradication spontanée rare !
• Pathologies associées :
• Gastrite (6-8% de sujets symptomatiques)
• Maladie ulcéreuse (UGD)
• Atrophie _ adénocarcinome (cancer gastrique)
• Lymphome (MALT ou Mucosa Associated Lymphoid Tissue)

 NB : Dép. de facteurs de la souche (cytotoxine vacuolisante VacA, protéine CagA) mais aussi du sys. imm. de
l'hôte (production de cytokines pro-inflammatoires)
HELICOBACTER PYLORI

• Méthodes directes invasives : biopsies gastiques (antre, fundus)

- Recherche rapide de l'activité uréasique
- ED : Gram, Ana-path
- Culture : Méthode de référence
- Détection par PCR
• Méthodes indirectes non invasives :
- Test respiratoire à l'urée marquée ( 13C) ou Breath test
- Sérodiagnostic : IgG

• Autres : Recherche d'Ag dans les selles

HELICOBACTER PYLORI

 Traitement
 Tres S aux ATB mais des souches R

 Eradication par trithérapie : 2 ATB + 1 inhibiteur de pompes à protons ou IPP (type

oméprazole MOPRAL)
 ATB : Amoxicilline CLAMOXYL (< 1% R)
 Clarithromycine ZECLAR (10-20% R)
 Métronidazole FLAGYL (30-40% R)
 (cyclines, fluoroquinolones, sels de bismuth)
 Détermination de la sensibilité in vitro (CMI par E-test)
 Détection de la R par PCR possible pour la clarithromycine
ACINETOBACTER
 Principaux caracteres bactériologiques :
 Cocco-BGN aérobie strict, souvent groupés par 2 ("diplobacille")
 Proche des Neisseria et Moraxella
 17 espèces dont :
. A. baumannii +++
. A. calcoaceticus, A. lwoffii, A. haemolyticus, A. junii, A. johnsonii (+ rares)
 Habitat :
 Bactéries de l'environnement (eau, sol) et commensales de la peau
 A. baumannii très répandu dans l'environnement hospitalier (solutions
 antiseptiques, savons liquides, sols, app. médicaux)
ACINETOBACTER

 Pouvoir pathogène :
 Surtout chez les patients hospitalisés (aplasiques, USI) _ épidémies
 10% des infections nosocomiales
 Resp. d'infections diverses : IU, inf. respiratoires, méningites post-
 neurochirurgicales, bactériémies

 Traitement :
 Naturellement R aux ATB et antiseptiques
+ nombreux mécanismes de R acquise
• ATBgramme indispensable
 ATB de choix : Ticarcilline ou Imipénème
+ Aminoside
BRUCELLA

 Principaux caracteres bactériologiques :

 Petit coccobacille à Gram négatif, aérobie strict, immobile
 Culture lente (> 48h) à 37°C sur milieux riches (type Brucella agar) sous
CO2
 Habitat et épidémiologie :
 Zoonose resp. d'avortements chez les animaux (contrôlée en France)
 Brucellose humaine (MDO) rare en France : < 100 cas/an
 3 principales espèces :
. B. melitensis : caprins, ovins
. B. abortus : bovins
. B. suis : porcs, lièvres
BRUCELLA
Pouvoir pathogène : Brucellose ou fièvre de Malte

 2 modes de transmission (pénétration cutanéo-muqueuse ou digestive) : -

contamination par contact direct avec animaux malades (maladie professionnelle :
vétérinaires, éleveurs, employés d'abattoir)
 - ingestion de lait ou fromage frais (vacanciers, citadins)

 Typiquement, 3 phases de la maladie : incubation 21 j

. Aiguë septicémique : fièvre ondulante sudoro-algique + arthromyalgies
. Subaiguë localisée : ostéo-art. (70% vertébrale) [neuro-méningées]
. Chronique : "patraquerie", lésions articulaires, hépatiques
BRUCELLA

 Diagnostic bactériologique :
 Recherche par hémoculture (ponction ganglionnaire, MO, LCR, Liq. articulaire)
 Sérologie :
- Sérodiagnotic de Wright : IgG, IgM (+ si > 1/80)
- Epreuve de l'Ag tamponné (EAT) ou Rose Bengale : IgG (rapide)
- Réaction de fixation au Ct, IFI, ELISA
 Traitement :
Traitement de référence (OMS) :
 Doxycycline + rifampicine, 6 semaines (streptomycine, cotrimoxazole)

 Prévention :
 Surveillance des troupeaux et abattage des animaux infectés
 Pasteurisation du lait
HAEMOPHILUS

 Haemophilus influenzae :
 Petit BGN polymorphe, immobile, aéro-anaérobie facultatif
 ± capsulé _ 6 sérotypes (a-f) : Sérotype b +++
 Culture dép. de 2 facteurs de croissance (gélose au sang cuit ou chocolat) :
. Facteur X ou hémine
. Facteur V ou NAD
 Commensal des muqueuses du nasopharynx et des VAS
 Transmission interhumaine par voie aérienne
HAEMOPHILUS
 Haemophilus influenzae (suite) :
 Infections souvent dues aux souches capsulées :
. Méningite chez l'enfant de 3 mois à 3 ans [HIb]
. Epiglottite (très grave), OMA, sinusite, conjonctivite
. Surinfections broncho-pulmonaires chez BPCO, mucoviscidose
. Autres : bactériémies, ostéomyélites, péritonites, péricardites,
 Isolement par culture
 Détection rapide des Ag solubles dans le LCR

 Naturellement S à l'amoxicilline (15-20% de R acquise)

 Sensible aux C 3G et fluoroquinolones
 Vaccination efficace depuis 1993 _ quasi-disparition des inf. invasives à HIb [Fraction
polysaccharidique de H. influenzae sérotype b (Hibest )]
HAEMOPHILUS

 Autres Haemophilus :

Haemophilus ducreyi : Chancre mou (MST)

 Ulcération génitale douloureuse + adénopathie inguinale
 Dans PVD
 Culture lente et difficile en 2-5 j
 Traitement minute par ciprofloxacine ou ceftriaxone
• H. parainfluenzae :
 Proche et même habitat que H. influenzae
 Parfois resp. d'endocardites ou suppurations diverses
• H. aphrophilus, H. paraphrophilus et H. segnis :
 3 espèces de la cavité buccale (plaque dentaire)
 Resp. d'endocadites et de suppurations diverses (abcès de cerveau)
PASTEURELLA MULTOCIDA

 Principaux caractères bactériologiques :

 Petit BGN aéro-anaérobie facultatif, immobile, ± capsulé
 Culture sur milieux ordinaires
 Glucose + Oxydase +faible , Indole +
 Sensibilité caractéristique au composé vibriostatique O/129

 Habitat :
 Bactérie commensale des VAS et cavité buccale des animaux (chiens,
chats +++)
 Transmission par morsure, griffade, léchage de plaie
PASTEURELLA MULTOCIDA

 Pouvoir pathogène : Pasteurelloses

 Incubation de qq heures puis infl. intense et douloureux au point
d'inoculation +syndrome algo-dystrophique
 Localisations pleuro-pulmonaires les + fréquentes
 Resp. aussi de bactériémies, endocardites, mémningites, péritonites,
ostéomyélites, inf. ORL
 Diagnostic bactériologique et traitement :
 Isolement par culture à partir des lésions
 Traitement classique = amoxicilline ou doxycycline
 ATB actifs : C 3G et fluoroquinolones
FRANCISELLA TULARENSIS

 Principaux caractères bactériologiques :

 Miniscule CBGN à la limite de la visibilité au microscope
 Aérobie strcit, immobile, poussant sur milieux spéciaux (milieu de Francis ou milieu de Mac Coy et Chapin) _
colonies petites, rondes et saillantes (> 48h, 37°C)

 Habitat et épidémiologie :
 Réservoir = animaux sauvages
 (lièvre, lapin de Garenne)

 Traverse la peau saine !

 Contamination par manipulation d'animaux malades (chasseurs +++)
 Transmission interhumaine très rare
 Manipulation au laboratoire dangeureuse (P3)
 Maladie rare (< 50cas/an en France) - Agent de bio-terrorisme
FRANCISELLA TULARENSIS

 Pouvoir pathogène : Tularémie

 Incubation de 4 j puis état pseudo-grippal + papule érythémateuse au point d'inoculation +
ulcération + adénopathie satellite doul. (suppuration)

 Si entrée digestive : amygdalite + adénopathie cervicale

 Si contamination oculaire : conjonctivite + adénopathie prétragienne puis sous-maxillaire

 Diagnostic :
 Recherche par culture ou PCR à partir du pus et Sérodiagnostic
 Traitement :
 Sensible aux aminosides, à la tétracycline et au chloramphénicol
BORDETELLA PERTUSSIS

 =bacille de Bordet-Gengou
 Principaux caractères bactériologiques :
 Petit BGN, immobile, capsulé, Oxydase +
 Culture difficile possible sur milieu de Bordet et Gengou (30% sang frais)
 • colonies lisses et brillantes (en "gouttes de mercure") en 4-6 j à 37°C
 Habitat et épidémiologie :
 Bactérie strictement adaptée à l'homme
 Pas de porteurs sains
 Contamination par voie aérienne (accès de toux), par contact direct
 Maladie très contagieuse
BORDETELLA PERTUSSIS

 Pouvoir pathogène : Coqueluche

 NB : Chez l'enfant non vacciné ou l'adulte anciennement vacciné

 Infection respiratoire aiguë évoluant en 3 phases : incubation 7-10 j

 . Phase catarrhale (2 sem) : toux sèche à prédominance nocturne avec rhinorrhée (contagiosité +++)
 . Phase paroxystique (3-6 sem) : quintes de toux suivies d'une inspiration profonde et bruyante ("chant du coq")
± vomissements, convulsions
 Risque d'encéphalite, asphyxie (nourrisson)
 . Phase de déclin et de convalescence (+ longue) : quintes + asthénie

 Chez l'adulte : symptômes moins évocateurs (toux persistante)

 Immunité efficace et durable

BORDETELLA PERTUSSIS

 Diagnostic bactériologique :
 Ecouvillonage nasopharyngé (IFD rapide possible), aspiration bronchique
 Recherche par culture ou par PCR
 Sérologie possible (formes atypiques)

 Traitement :
 ATB pour prévenir les complications pleuro-pulmonaires et ORL
 ATB actifs : macrolides (érythromycine, azithromycine), cotrimoxazole, aminosides,
 cyclines ou thiamphénicol

 Prévention :
 2 types de vaccins : < 2 mois
- vaccin classique (suspension de bactéries tuées par la chaleur)
- vaccin moderne (dit "acellulaire") mieux toléré
LEGIONELLA PNEUMOPHILA

 Principaux caractères bactériologiques :

 Petit BGN mal coloré par la coloration de Gram
 Mobile, aérobie strict, Oxydase +
 Pousse sur milieux complexes comme le milieu BCYE (Buffer Charcoal Yeast Extract) à 37°C sous 10% de CO
2 _ 2-7 j
 15 sérogroupes dont sérogroupe 1 (~90%)

 Habitat et épidémiologie :
 Bactérie de l'environnement (eau +++)
 Dans réseaux de distribution, lacs, systèmes de conditionnement d'air
 Transmission par voie aérienne _ inhalation eau en aérosols (climatiseurs,
 tours aérofrigérantes, douches, bains agités, humidificateurs d'air, nébulisateurs)

 MDO (1202 cas déclarés en France en 2004)

LEGIONELLA PNEUMOPHILA

 Pouvoir pathogène : Légionelloses

 Bactérie opportuniste _ infections chez sujets fragilisés (> 50 ans,
alcoolisme, Tabagisme, ID)
 Responsable de 2 pathologies principales :
- Maladie des légionnaires = pneumopathie aiguë
 Etat pseudo-grippal
 + toux sèche non productrice
 ± troubles dig., doul. abdos, diarrhée, signes encéphalitiques
 - Fièvre de Pontiac (forme bénigne)
 Pas de contamination interhumaine !
LEGIONELLA PNEUMOPHILA

 Diagnostic bactériologique :
 . Par détection directe (IFD, Ag urinaire, PCR)

 . Par culture sur milieu BCYE ATB (GVPC) sous CO 2 à 35-

37°C, 10j :
 Aspect « marbré » des colonies grises halo rose
 Aspect « en verre brisé » à la loupe +++ :
. Par sérologie (IFI)
 Definition des cas de légionellose : Pneumopathie + 1 signe suivant :

 . Cas confirmé :
 . isolement de Legionella dans 1 prél. clinique
 . titre Ac sérique (x 4) avec 1 2ème
 . présence d'Ag soluble urinaire
 . IFD + sur 1 prél. clinique

 . Cas probable :
 . Titre unique Ac sérique  256

 Rq : PCR pas reconnue comme méthode diagnostique ++

 titre minimum de 128

 . Cas nosocomial certain : hospitalisé durant toute la période d'incubation (10 j)

 . Cas nosocomial probable : hospitalisé entre 2 et 9 j avant la date des 1ers signes
LEGIONELLA PNEUMOPHILA
 Traitement :
 Pas d'antibiogramme en routine
 ATB de choix = érythromycine +++
 ATB aussi actifs : rifampicine, flluoroquinolones

Prévention : 
Surveillance régulière des réseaux d'eau des établissements de santé 
et dans les établissements recevant du public 
AUTRES BGN AÉROBIES

 Streptobacillus moniliformis :
 BGN polymorphe, µaérophile, cultivant sur milieux riches
 Transmis à l'homme par morsure de rat
 Resp. de la streptobacillose :
 incubation 10 j puis fièvre brutale + frissons + céphalées
 ± vomissements, éruption, polyarthrite
 Traitement de choix = Pénicilline G

 Groupe HACEK :
 BGN des VAS de culture délicate resp. d'endocardites "à HC négative"
 [Haemophilus-Actinobacillus actinomycetemcomitans-Cardiobacterium hominis- Eikenella corrodens-Kingella
kingae]

 Calymmatobacterium granulomatis :
 BGN agent de la donovanose (MST tropicale)
BACILLES À GRAM NÉGATIF ANAÉROBIES STRICTES
 = Anaérobies non telluriques ("flore de Veillon")
 02= toxique
 Bactéries non sporulées et non toxinogènes commensales des cavités
 naturelles de l'homme (cavité buccale, TD, vagin)

 Bacteroides du groupe fragilis :

 BGN AnaS tolérant la bile
 3 espèces principales : B. fragilis, B. thetaiotaomicron, B. ovatus
 Resp. d'infections diverses : gynécologiques, abdominales, bactériémies
 Souvent associées à d'autres pathogènes (entérocoques)
 Assez R aux ATB
 Sensibles au métronidazole, aux associations pénicilline + inhibiteur de bêta-
lactamase (AUGMENTIN, TAZOCILLINE), à l'imipénème et au chloramphénicol