Conservation en milieux

agricoles
Emmanuelle Porcher
UMR 7204 Centre d’Ecologie et des Sciences de la
Conservation
Muséum national d’Histoire naturelle, Paris
porcher@mnhn.fr
Agriculture
Processus par lequel les êtres humains aménagent
leurs écosystèmes et contrôlent le cycle biologique
d'espèces domestiquées, dans le but de produire
des aliments et d'autres ressources utiles à leurs
sociétés

By Victor Szalvay - flickr.com, CC BY-SA 2.0,

Le contexte : besoins alimentaires de
la population mondiale
Démographie ~820 millions de sous-nourris
7 milliards d’être humains (<1 milliard en 1990)
~1 milliard de mal-nourris (??)
MAIS:
1.9 milliards en surpoids
Gaspillage alimentaire
 L’agriculture influence une grande partie
de la surface terrestre
>50% des terres en
Europe (40% monde)

Source : CORINE Land cover

 Le contexte : changements globaux
et durabilité de l’agriculture
Scénarios climatiques Place de l’agriculture dans
les émissions de gaz à
effet de serre

IPCC 2014
Le contexte
Interactions fortes entre agriculture et biodiversité

Ressources génétiques
Services écosystémiques
…
Ravageurs
Compétiteurs
…
Biodiversité Agriculture
Destruction des habitats
Fragmentation
Pollutions
…
Nouveaux habitats
Espèces domestiquées
…
Bilan
Agriculture en
interaction forte avec
la nature
Quels impacts sur la
biodiversité ?

Besoin de pratiques
plus durables
Est-il possible de
concilier maintien de la
production alimentaire
et conservation de la
biodiversité ?
Plan
(Brève) histoire de l’agriculture

Impacts de l’agriculture intensive sur la

biodiversité
Echelle de la parcelle
Echelle du paysage

Quelles mesures pour maintenir la production

tout en conservant la biodiversité ?
Land-sharing vs. land sparing
Agro-écologie
Agriculture biologique
Les origines de l’agriculture
-200 000 ans Homme moderne
Populations de
chasseurs-cueilleurs

-14 000 ans Sédentarisation de

certaines populations

-10 000 ans Développement de

l’agriculture

-3 000 ans Augmentation du nombre

d’espèces cultivées

-150 ans Apparition des

semenciers
Mécanisation

-50 ans Biotechnologies

Peintures rupestres du Tassili n'Ajjer
(Algérie, -10000 à -5000 ans)
Domestication
Ensemble des processus liés à l’agriculture,
conduisant à l’acquisition, par une espèce
sauvage, de caractères profitables à l’Homme
Syndromes de domestication
Plantes Animaux
Graines plus grosses Productivité plus élevée
Pas de dispersion Agressivité réduite
Moins de dormance …
…
Centres d’origine des espèces cultivées
Diffusion de l’agriculture, migrations
humaines, dispersion des variétés, adaptation
Jusqu’au début du 20ème siècle:
Variétés locales ou populations de pays
cultivées par les agriculteurs:

Sélectionnées de façon plus ou moins consciente par

l’agriculteur pour des caractères morphologiques
(sélection diversifiante)

Adaptées à l’environnement (climat, parasites, sol,...)

Échanges de graines entre agriculteurs

Résultat de la sélection diversifiante :
grande diversité d’espèces domestiquées

= Biodiversité « agricole »
Une agriculture s’appuyant sur les services
écosystémiques fournis par la biodiversité sauvage
Millenium Ecosystem
Assessment

Bilan mondial de l’état des

écosystèmes
>1300 experts
1er rapport en 2005

Répertorie les services

écosystémiques majeurs
en quatre catégories
De l’ordre de 24 services

14
Les services fournis à l’agriculture
par la biodiversité
Fertilité des sols Contrôle des ravageurs
Exemple : recyclage de la Fonctionnement des chaînes
matière organique par les trophiques
décomposeurs
Australie, 1972 : ~ 1 Mha
dégradés par an, dû à
l’absence de recyclage des C
bouses de bovins et ovins
Importation de scarabées
coprophages venant H
d’Afrique du Sud

P
Contrôle des ravageurs
Deux options pour un
contrôle biologique
Favoriser la présence
naturelle de prédateurs
(contrôle biologique par
conservation)

Introduire
artificiellement des
prédateurs dans les
parcelles
Pollinisation
70% des espèces Déclin des pollinisateurs
cultivées (35% de la (dont abeille domestique)
production) dépendent A terme, pollinisation
manuelle ?
des pollinisateurs pour Vanille, pommiers dans
la production de graines l’Himalaya

17

Klein et al. 2007

L’agriculture est source de destruction
des habitats naturels
Déforestation aux États-unis
Déforestation en France
Croissance de la surface, mais
transition relativement
récente
~75% de la surface après la
dernière glaciation (-6000 ans)
Exemple : forêt de Tronçais
Existe depuis au moins le 13e
siècle
Mais fortement dégradée
pendant la révolution (forges)

Kauppi et al. 2006

Cette déforestation a probablement causé une perte de

biodiversité importante, mais difficile à quantifier
Agriculture et ouverture du paysage
La déforestation et le maintien de prairies par le
pâturage créent des habitats « nouveaux »
Les messicoles, des espèces inféodées au
milieu agricole
Autres espèces spécialistes des milieux
agricoles
Diversité des paysages agricoles
« traditionnels »
Loup, paysages agricoles
traditionnels et conservation
Délibération du Conseil
d’Administration du Parc Stage en
national des Cévennes forêt d’Orient
(18/10/2012)

« (…) demande à l’Etat (…) la

possibilité de réaliser des tirs
en cœur du Parc national des
Cévennes »

Stage des
Causses
Des priorités de conservation différentes
selon les cultures
Europe (France) Amérique du Nord
Parc national des Parc du Yellowstone
Cévennes « Wilderness »
Chasse interdite même
Paysages = résultats de en dehors du Parc
l’action de l’Homme sur
la nature

Chasse d’une espèce

protégée autorisée dans
un espace protégé
 Agriculture moderne et
érosion de la biodiversité
Les impacts de l’agriculture sur la
biodiversité, très dépendants du contexte
Ce que fait l’agriculture :
Perturbations (destruction de biomasse) récolte, labour,
pâturage, pesticides
Enrichissement (apports d’éléments nutritifs) eau, engrais
Dans les écosystèmes « naturels », ces deux facteurs
interagissent pour influencer la biodiversité

Ressources limitées Ressources intermédiaires Ressources abondantes

Diversité des espèces

Taux de perturbation Taux de perturbation Taux de perturbation

Les pratiques agricoles peuvent augmenter ou diminuer la

biodiversité
La révolution verte
Date : 1940-1960
Objectifs
Augmenter la production pour nourrir la population
Changer le mode de vie des agriculteurs
Progrès techniques et génétiques
Augmentation linéaire de la production moyenne

Remaniements à deux échelles

Locale
Paysage

Tilman 1999
Évolution du type de variétés
Variété = ensemble d’individus dont les caractéristiques
sont jugées par les agriculteurs suffisamment semblables
entre elles et dissemblables des autres individus pour qu’ils
soient regroupés en une même catégorie et désignés par
un même nom.

Avant : une variété = une population hétérogène

Après :
Espèces autogames Espèces allogames Espèces clonales

Lignées pures Hybrides Variétés clones

Perte de diversité génétique

Conséquences : perte de la variabilité génétique nécessaire pour

la sélection (naturelle et artificielle)
Progrès technique
Mécanisation Intrants
Engrais
Produits phytosanitaires

Favorisé et exigé par l’utilisation des nouvelles variétés

Homogénéité intervariétale (ex : gène de nanisme du blé)
Homogénéité intravariétale
Variétés performantes dans des conditions « optimales »
Progrès techniques : intrants

Tilman et al. 2001

Des changements dans le rendement
énergétique de l’agriculture
EUE = efficacité de l’utilisation de l’énergie (production végétale)

Une agriculture de plus en plus efficace mais toujours plus

d’énergie consommée Paradoxe de Jevons (effet rebond)
Agriculture plus autosuffisante
Pellegrini & Fernandez 2018 PNAS
Diminution du nombre de personnes
impliquées dans la production
Résultats : remaniements à deux échelles
Échelle locale (parcelle) Échelle du paysage

Intrants chimiques accrus Conversion des prairies en

Engrais terres cultivées
Pesticides
Augmentation de la taille des
Mécanisation poussée parcelles cultivées

Diminution de la diversité Fragmentation et disparition

des cultures des habitats naturels
Monocultures
Suppression des rotations Homogénéisation du paysage
Suppression des cultures
intermédiaires
Homogénéisation du paysage
Conséquences environnementales
Erosion des sols Pollutions aux engrais
Ex : Dust bowl Nitrates et phosphates
américain, années 30 Eutrophisation des
milieux aquatiques
Impact des pratiques agricoles
« modernes » sur la biodiversité
Déclin des espèces d’oiseaux spécialistes
des milieux « cultivés »
Populations d’oiseaux et agriculture
Relation négative entre la croissance des
populations d’oiseaux et le rendement en Europe

Donald et al. 2001

Impact de l’agriculture sur la diversité
végétale : plantes messicoles
Diminution de la banque Changement de composition
de graines en Angleterre des communautés végétales

Prairies
Cultures

Robinson & Sutherland 2002

Différence 1978-1990, UK
Impact de l’agriculture sur les
insectes ?
Pièges malaises dans des 75% de perte de biomasse
espaces protégés au cœur depuis 1990
de zones agricoles (Allemagne)

Hallmann & al 2017

43
 Impact sur les pollinisateurs
Analyse du rendement et de sa stabilité
54 cultures +/- dépendantes des pollinisateurs

Deguines et al. 2014

Impact sur les pollinisateurs
L’intensification agricole ne permet plus d’augmenter le
rendement des cultures très dépendantes des pollinisateurs

Deguines et al. 2014

Pressions sur la biodiversité
HIPPO
Habitat loss
Invasions
Pollutions
Population growth (Human)
Overexploitation
(+Climate change)
Quels mécanismes de l’impact négatif de
l’agriculture sur la biodiversité ?
Remaniement du paysage Intensification dans les
Disparition des habitats parcelles
naturels Labour
Isolement Pesticides
Diversité des cultures Engrais / eau

"1264 Rogator Spraying Corn" by Pl77

Fragmentation /destruction des habitats
Milieux « naturels » = habitats pour les espèces
La présence d’habitats semi-naturels favorise le
maintien de diversité

Tscharntke et al. 2005

Gill et al. 2016

Rôle crucial de l’hétérogénéité du paysage

 Rôle des haies, corridors naturels
Effet du remembrement Impact sur la diversité et
la biomasse de
micromammifères

Royaume-Uni

Robinson & Sutherland 2002 Michel et al. 2006

 Rôle des haies, corridors naturels
Effet du remembrement Impact sur la diversité et
la biomasse de
micromammifères

Royaume-Uni

Robinson & Sutherland 2002 Michel et al. 2006

Impact d’une augmentation en nitrates
sur les communautés végétales
Forte diminution de la richesse spécifique
Prairies expérimentales
I = contrôle
A-H : gradient de fertilisation

Mécanismes
productivité, nb
d’individus et perte
(aléatoire) d’espèces rares
Compétition : Disparition des
plantes fixatrices d’azote et
des espèces à stratégie K
Pesticides et biodiversité
Un exemple historique : DDT et aigle à tête blanche
60es : Reproduction du pygargue à tête blanche menacée par
l’usage massif de DDT

Pygargue à tête blanche

(Haliaeetus leucocephalus)
Pesticides et biodiversité
Un exemple récent : les néonicotinoïdes
Abeilles, France
Soumises à des doses réalistes (sub-létales) d’un pesticide

Henry et al. 2012

Pesticides et biodiversité
Un exemple récent : les néonicotinoïdes
Oiseaux, Pays-Bas

Hallmann et al. 2014

Mécanisation et érosion des sols
Labour et qualité du sol
Érosion
Déstructuration
Libération du carbone stocké dans le sol
Perturbation de la faune
Diversité conv – Div
non-labour

Cortet et al. 2002

Pratiques agricoles : interaction avec le
paysage
Le contexte paysager peut parfois compenser les
effets négatifs des pratiques dans la parcelle
Diversité des plantes

Agri Bio
Conventionnel
Extensif

Intensif

Roschewitz et al. 2005 Rundölf & Smith 2006

 Quelles solutions pour
promouvoir la conservation
de la biodiversité ?
Pourquoi vouloir conserver la
biodiversité dans les espaces agricoles ?
Les territoires agricoles représentent un fort pourcentage
du territoire
En France et en Europe

Valeur intrinsèque Valeur instrumentale

Conserver tout Notion de service
écosystémique
Des effets aussi sur la production
agricoles ?
Exemple : rendements du blé en France

Brisson et al. 2010

Prendre en compte les aspects sociaux,
économiques et politiques

Le Roux & Sabbagh 2008

Changer les surfaces concernées par
l’agriculture ?
Land-sharing vs. land-sparing
Cultiver une petite surface de façon très intensive
Ou cultiver de grandes surface de façon extensive ?

Habitats naturels

ou Agriculture peu intensive

Agriculture intensive

L’optimum dépend de la réponse des espèces à

l’intensification

Green et al. 2005

Land-sharing ou land-sparing
Le choix optimal dépend de la réponse des espèces à
l’intensité de l’agriculture
Taille de population

Taille de population
Intensité de l’agriculture Intensité de l’agriculture

Plusieurs limites de cette approche

Pas de mesure univoque de la biodiversité
Effet d’échelle / Rôle du paysage
Peut-on vraiment maintenir une agriculture « intensive » ?
Ne pas oublier les effets globaux
L’agriculture n’a pas que des effets locaux

Exemple : élevage hors-sol

en Europe
Érosion de la biodiversité
en Amérique du Sud
Déplacement de l’empreinte
écologique
Possible effet pervers des actions de conservation :
Protéger ses espaces
localement peut
conduire à délocaliser
certaines activités * : menaces par les
importations plus
importantes que par
Ex : bilan par pays des les activités
imports et exports de domestiques
produits produisant des
menaces sur les
espèces

Certains pays (dont la

France) menacent plus
d’espèces à l’étranger Lenzen et al. 2012

que sur leur territoire

Une note sur les agro-carburants
Production d’éthanol à Alternative : utilisation de
partir de matériel végétal prairies extensives ?
1ère gén. : cultures vivrières
2nde gén. : cultures non-vivrières
3e gén. : algues

Avantages
Réduction des émissions
de CO2 par rapport aux
énergies fossiles

Inconvénients
Agriculture intensive
Réduction des cultures
vivrières
Pollutions
Emissions initiales de CO2

Tilman et al. 2006

Deux options contrastées pour une
agriculture plus durable
Progrès technologique Intensification écologique
Agriculture de précision Amélioration des processus
Utilisation de drones écologiques favorisant la
OGM production
Diminution du travail Retour de diversité
humain (spécifique, génétique)
Conservation de la
biodiversité
Quels outils pour promouvoir l’« intensification
écologique » de l’agriculture ?
A priori, protection de la biodiversité suppose une
agriculture moins intensive Coût pour la
production

Actions coercitives (réglementation)

Directive Cadre sur l’Eau
Grenelle de l’environnement
Zones protégées…

Actions incitatives
Taxer les externalités négatives
Rémunérer les externalités positives
Outils économiques pour la gestion de la
biodiversité (« verdir la main du marché » ?)
Taxer les externalités Rémunérer les externalités
négatives positives
Taxes pigouviennes Subventions (MAE, EcoPhyto)

Paiements pour services

Taxe carbone
environnementaux

Permis négociables

Labels écologiques

Suppose de bien évaluer

les dommages
environnementaux
68
Quelques exemples de changements de
pratiques
Agriculture biologique Agriculture de conservation Agroforesterie
Pas d’intrants de synthèse Pas de labour

Points communs
Réflexion sur le
fonctionnement écologique
des agroécosystèmes et sur la
place de la biodiversité
S’appuient les savoirs locaux /
traditionnels
Impacts pour la biodiversité
encore peu étudiés (ex.
« permaculture »)
 Publications scientifiques autour de
la permaculture
Pour comparaison : agriculture biologique

800

35
Un exemple de combinaison de taxes et
d’incitations : le plan EcoPhyto 2018
Directive de l’UE (“reduce
risks and impacts of pesticide
use on human health and the
environment”)
2008 : plan avec 4 volets
Diffusion de l’information aux
agriculteurs
Identification de pratiques
plus économes en pesticides
Réseaux de fermes Objectif : diminuer par
expérimentales
Interdiction de certains
deux la consommation
pesticides de pesticides (agricole
Financement (100M€/an) et non-agricole) en 10
en partie par une taxe ans
pigouvienne sur les
pesticides
 Hossard et al. 2017 Science of
the Total Environment

Résultats du plan EcoPhyto 2018

Nombre de substances

Doses totales

Herbicides

Fongicides

Insecticides
Un exemple de subventions : les
mesures agro-environnementales
Dans le cadre de la Politique Agricole Commune
Compensations financières pour
Pratiques agricoles respectueuses de l’environnement
Protection des ressources naturelles (dont eau, biodiversité)
et des paysages
Changement climatique
Réduction des pollutions
Systèmes de culture (dont AB)
Déprise agricole
2.2 milliards € (5%) sur 2002-2003
20 milliards en 2007-2013
Mesures prises dans le cadre de Contrats d’Agriculture
Durable (CAD) 5 ans
Quelques mesures nationales et régionales
La plupart sont territorialisées
Uniquement dans des territoires à enjeux (Natura 2000, DCE,
zones protégées…)
Subventions « perverses »
Subventions à la production et au rendement

Subventions à l’agriculture : de l’ordre de 10 à

100 fois plus importantes que les sommes
allouées à la conservation de la biodiversité
(Europe, USA)
Agriculture intensive

Chalutage
Pêche en eaux profondes

75
Efficacité discutée des mesures agri-
environnementales
avec MAE
avec MAE sans MAE
sans MAE

Kleijn et al. 2001

Causes :
Effets dépendants du paysage
Peu d’études rigoureuses
Peu de rôle des sources scientifiques
dans les critères de choix
Conséquences
Renforcement du coercitif « Surfaces
d’intérêt écologique » Tscharntke et al. 2005
Action incitative (2) Le paiement pour
service environnemental
Bassin versant de Vittel
Aquifère de 6000 ha
Objectif : < 4.5mg nitrates/L
1990 : augmentation de la
concentration en nitrates

Subventions aux agriculteurs

Contrats à long terme
200€ /ha/an pour une
conversion faibles intrants

2004 : toutes les exploitations

participent
92% de la surface protégée

77
Paiements pour service environnemental
par des collectivités publiques
New-York
Cat-skills (1996) : qualité
insuffisante de l’eau
Urbanisation et
intensification de
l’agriculture
Coûts de restauration de
la qualité de l’eau
Usine : 10 milliards €
Restauration écosystème
: 1.5 milliards €
Pékin
2010 : 54% des eaux de
qualité suffisante
Difficulté d’application des
mesures de protection
Mise en place de
paiements pour services
environnementaux dans le
bassin versant de Miyun
Efficacité ?
Action incitative (3) Utilisation de labels :
exemple de l’agriculture biologique
Principe : non-utilisation d’engrais ou
de pesticides de synthèse

Conséquences :
Recyclage des matières organiques
Rotation des cultures
Lutte biologique
Travail mécanique du sol important

Cahier des charges très strict pour

chaque étape de la filière

Contrôles réguliers donnant lieu à

une certification
Agriculture biologique et biodiversité
Nombreuses études disponibles

Nb d’espèces en AB – Nb d’espèces en conv.

Nb Nb avec effet +
Groupe
total sur la richesse

Tous 63 53*

Oiseaux 3 3

Arthropodes 28 21*

Faune du sol 10 7

Plantes 22 22*
Bengtsson et al. 2005

En moyenne, + 50%
d’individus en agriculture
biologique
Gibson et al. 2007
 Effets d’échelle dans la mise en place de
pratiques favorables à la biodiversité
Gains/pertes d’abondance
dus à l’agriculture biologique

Echelle de la Echelle du
parcelle paysage

Schneider et al. 2013

Des effets de la certification plus
mitigés : culture du palmier à huile
Exemple de la Malaisie

Couverture forestière de l’île de Bornéo

Près de Lahad Datu (Malaisie, état de Sabah)

 L’orang utan
(Pongo pygmaeus)

Causes et conséquences

Perte de biodiversité
Cours de l’huile de palme ; 1992-2017

Feux de foret (1997-1998) Quantité d’aérosols émis par les feux

Dégradation rapide des environnements forestiers fragmentés sous l’effet des modifications climatiques
 Carlson et al. 2018 - PNAS

Effets de la certification « durable »

Moins de déforestation (mais peu de forêts au départ)
Autant de feux
Conclusions
L’agriculture intensive (1950-2000) est une des
causes majeures de l’érosion de la biodiversité en
Europe

Des changements de pratiques culturales sont en

cours

Il reste encore à évaluer les effets concrets de

ces changements pour la biodiversité