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Este tema proporciona una visión práctica del campo de la farmacogenómica, incluyendo el
contexto histórico, las diferentes formas en que las diferencias farmacogenómicas pueden
afectar la respuesta a la terapia farmacológica( DROGA), una visión general del etiquetado
aprobado por la Administración de Drogas y Alimentos de los Estados Unidos (FDA) de los
medicamentos para los que se recomienda la realización de pruebas genéticas, y los desafíos
que deben superarse antes de que las pruebas farmacogenéticas de rutina (genotipado) se
integren completamente en la medicina clínica convencional.
TERMINOLOGIA
La siguiente terminología se utiliza para describir los factores que contribuyen al efecto de un
medicamento específico sobre un individuo específico
Cambios epigenéticos - Los cambios epigenéticos son aquellos que afectan a los genes
sin alterar la secuencia genética. Esto puede ocurrir a través de cambios en la metilación de
genes o en la modificación de la histona (metilación, acetilación), cualquiera de los cuales
puede influir en la tasa de transcripción o silenciamiento de la expresión génica. Otros cambios
epigenéticos incluyen las alteraciones en los ARN no codificadores y la longitud de los
telómeros. Estos cambios epigenéticos pueden transmitirse de padres a hijos, pero también
pueden ser el resultado de las influencias ambientales sobre el epigenoma.
CONTEXTO HISTORICO
Las raíces de la farmacogenómica pueden remontarse al siglo VI a.C., cuando se dice que
Pitágoras reconoció que el consumo de habas causaba enfermedades en algunos individuos,
pero no en todos. En la década de 1940, el inmunoquímico William Boyd observó que, a
diferencia de las poblaciones mediterráneas, los británicos nativos casi nunca desarrollaron
anemia hemolítica tras la ingestión de habas; sugirió una diferencia genética como explicación
probable. Ahora se sabe que la anemia hemolítica asociada con la ingestión de habas, que
también puede ocurrir con una variedad de agentes farmacológicos, se debe a la deficiencia de
glucosa-6-fosfato deshidrogenasa ligada al cromosoma X (G6PD). (Véase "Diagnóstico y
tratamiento de la deficiencia de glucosa-6-fosfato deshidrogenasa (G6PD)", sección "Incitación
a medicamentos, productos químicos, alimentos, enfermedades").
En la década de 1950, se observó que los pacientes con una deficiencia hereditaria de
colinesterasa en plasma tenían una respuesta paralítica prolongada al suxametonio.
En 1957, Motulsky sugirió por primera vez que las diferencias interindividuales en la eficacia de
los medicamentos(DROGA), así como en las ADR, eran al menos parcialmente atribuibles a las
diferencias genéticas. El término "farmacogenética" fue acuñado por primera vez por
Frederich Vogel, un genetista alemán, en 1959.
Desde entonces, los avances en la tecnología genética humana y una mayor comprensión de
las bases moleculares del metabolismo-DROGA, transporte y acción de los medicamentos a
nivel de su objetivo (a menudo un receptor) han llevado a la caracterización de docenas de
mutaciones y polimorfismos farmacogenéticos funcionales que influyen en la respuesta a la
terapia farmacológicaDROGA
CYP isoenzimas y metabolismo de drogas - Los citocromos P450s (CYPs) son miembros de una
superfamilia de enzimas oxidativas, que representan el sistema principal para el metabolismo
oxidativo de sustancias terapéuticas. La secuenciación del genoma humano ha revelado 58 CYP
humanos diferentes genes, que codifican varias isoenzimas CYP. La información sobre los
genes humanos CYP P450 es disponible en línea en
http://drnelson.uthsc.edu/cytochromeP450.html
La actividad de las enzimas CYP puede verse afectada por factores genéticos y ambientales.
Una de las influencias ambientales más comunes ocurre a través de las interacciones
medicamentosas(INTERACCION DROGA-DROGA). Un ejemplo común es la inducción o
inhibición de CYP3A4 causada por la administración de un medicamento(DROGA), que a su vez
altera el metabolismo de un segundo medicament (DROGA). Este tema se discute en detalle
por separado. (Ver "Las drogas y el hígado: metabolismo y mecanismos de lesión".)
Más aplicable al campo de la farmacogenómica es el hecho de que la mayoría de los genes CYP
que codifican las enzimas activas en el metabolismo xenobiótico son polimórficos, y los
polimorfismos que afectan al metabolismo de los fármacos(DROGAS) se observan en una parte
significativa de la población. En muchos casos, la frecuencia varía según el origen étnico. Por
ejemplo, la expresión de CYP2D6 está funcionalmente ausente en el 7 por ciento de los
caucásicos y afroamericanos, mientras que la deficiencia es rara entre los asiáticos. Debido a la
importancia de estos genes, un sitio web (http://drnelson.uthsc.edu/cytochromeP450.html)
que se ha creado de forma continua actualizado para polimorfismos CYP recientemente
identificados en https://www.pharmvar.org/
Los polimorfismos en los genes CYP pueden contribuir a la disminución o ausencia del
metabolismo, o al metabolismo excesivo de un compuesto. En general, las variaciones
genotípicas de CYP resultan en tres fenotipos metabólicos: metabolizadores ultrarrápidos,
metabolizadores extensos (normales) y pobres metabolizadores. Las variaciones polimórficas
clínicamente más importantes en los CYP hepáticos se observan en el CYP2C9, Los genes
CYP2C19, CYP2D6 y CYP3A4, que codifican las enzimas responsables de la fase I del
metabolismo de aproximadamente el 60 al 70 por ciento de todos los medicamentos
terapéuticos utilizados en humanos.
Tanto la codeína como la nortriptilina son metabolizadas por la CYP2D6; sin embargo, la
codeína es un promedicamento(profármaco) y sus propiedades analgésicas no se manifiestan
hasta que es metabolizado por CYP2D6, principalmente a la morfina y a la codeína-6-
glucuronida. Por el contrario, la nortriptilina es la fracción activa y su metabolismo da como
resultado la inactivación del medicamento a su metabolito primario
Para las personas con actividad TPMT baja o ausente, puede ser necesario reducir la dosis de
tiopurina hasta en un 90 por ciento, según la experiencia en leucemia linfocítica aguda (LLA)
pediátrica. También se ha demostrado que las pruebas prospectivas del genotipo TPMT para
ajustar la dosis son eficaces para reducir la toxicidad de 6-MP sin comprometer la eficacia.
Se han identificado variantes en una segunda enzima metabolizadora, NUDT15 (fracción X del
motivo 15, NUDIX 15, ligada al difosfato nucleósido)(, nucleoside diphosphate-linked moiety X
motif 15, NUDIX 15).. que influyen fuertemente en la tolerancia a la tiopurina en pacientes con
LLA(ALL) o enfermedad intestinal inflamatoria. El primer SNP identificado relacionado con la
toxicidad de la tiopurina fue una citosina para el cambio de timidina que resultó en una
sustitución de la arginina por cisteína en la posición de aminoácidos 139 (R139C). Los
individuos con esta variante son extremadamente sensibles a 6-MP y toleran sólo el 8 por
ciento de la dosis estándar. Desde entonces, se han identificado varias variantes de alelos con
prevalencias variables entre poblaciones diferentes y grados variables de efectos funcionales.
El fenotipo del metabolizador deficiente NUDT15 se observa a una frecuencia de
aproximadamente uno de cada 50 pacientes de ascendencia asiática oriental, que es más
común que el fenotipo del metabolizador deficiente TPMT en los europeos.
Como resultado de estos temas, las opiniones de los expertos difieren en cuanto a la función
del TPMT y el genotipado de NUDT15 antes de la administración de tiopurinas para el
tratamiento del cáncer y los trastornos inmunológicos o inflamatorios. Algunos expertos
abogan por las pruebas de rutina mientras que otros, citando la baja frecuencia de variantes
homocigóticas de TPMT entre los caucásicos (sólo 1 de cada 300) y el hecho de que la mayoría
de los pacientes que desarrollan mielosupresión mientras toman azatioprina no tienen
mutaciones detectables del gen TPMT, no están de acuerdo con este enfoque. Algunos
médicos, en particular los que tratan la leucemia aguda con 6-MP, sólo realizan el genotipado
TPMT y NUDT15 si hay una mielosupresión inesperadamente severa o prolongada. En ausencia
de un historial familiar de metabolismo deficiente o de una variante conocida que se haya
encontrado incidentalmente en las pruebas genéticas, abogamos por este enfoque. (See "6-
mercaptopurine (6-MP) metabolite monitoring and TPMT testing in patients with inflammatory
bowel disease", section on 'TPMT genotyping' and "Pharmacology and side effects of
azathioprine when used in rheumatic diseases", section on 'Pharmacogenetics and TPMT
testing' and "Chronic immunosuppressive therapy for myasthenia gravis", section on
'Administration of specific drugs' and "Post-remission therapy for Philadelphia chromosome
negative acute lymphoblastic leukemia in adults", section on 'Maintenance therapy'.)
Las pruebas genéticas para detectar variantes de los genes VKORC1 están disponibles para
ayudar a los médicos a evaluar si un paciente puede ser especialmente sensible a la warfarina
y requerir una dosis inicial más baja; también prueban variantes genéticas en CYP2C9 que
influyen en el metabolismo de la warfarina. Sin embargo, el genotipado rutinario de los
pacientes antes de comenzar la warfarina no está ampliamente aceptado (o recomendado en
las pautas del American College of Chest Physicians). Esta posición está apoyada por los
resultados de tres ensayos aleatorios, que encontraron que la dosificación farmacogenética en
comparación con la dosificación guiada clínicamente no tuvo ninguna utilidad o, en el mejor de
los casos, una utilidad marginal para mejorar los resultados clínicos (tiempo dentro de un
rango terapéutico de la proporción internacional normalizada[INR] o sangrado excesivo). (See
"Warfarin and other VKAs: Dosing and adverse effects", section on 'Initial dosing' and "Vitamin
K and the synthesis and function of gamma-carboxyglutamic acid", section on 'Mutations and
polymorphisms of the VKOR complex' and "Warfarin and other VKAs: Dosing and adverse
effects", section on 'Warfarin administration'.)
Efecto sobre las reacciones idiosincrásicas - Una reacción idiosincrásica es una reacción
adversa a un medicamento (ADR) que no se puede anticipar basándose en la diana conocida
del fármaco. Ejemplos en los que una idiosincrasia la reacción a un medicamento varía de
acuerdo a factores genéticos incluyen hipersensibilidad al abacavir y HLAB*5701, reacciones
adversas cutáneas severas al alopurinol y variantes de HLA-B*5801, TCL1A y efectos
secundarios musculoesqueléticos de los inhibidores de la aromatasa, y HLA-A*3101 o B*1502 y
hipersensibilidad a la carbamazepina. Varios ensayos han demostrado la mejoría en la
seguridad de la administración de fármacos con previa inmunogenética para HLA-B*5701, y las
directrices de los grupos de expertos (incluyendo el El Consorcio de Implementación de
Farmacogenética Clínica[CPIC][91]) respalda el uso de abacavir sólo en pacientes que han dado
negativo para HLA-B*5701. (Ver "Hipersensibilidad al abacavir reacción" y `Recursos en línea
para médicos' más abajo.)
Abacavir - Abacavir es un análogo nucleósido con actividad potente contra el VIH; sin
embargo, una proporción de pacientes desarrollan reacciones severas de
hipersensibilidad a este medicamento. La hipersensibilidad al abacavir se asocia con el
transporte del alelo HLA-B*5701 del complejo de histocompatibilidad mayor (MHC)
clase I. Se ha teorizado que el abacavir se metaboliza en un metabolito reactivo al
aldehído, que se somete al procesamiento clásico de MHC clase I. La presentación del
complejo peptídico HLA en una célula presentadora de antígenos al receptor de una
célula T CD8+ específica de abacavir activa la liberación de citocinas inflamatorias,
dando lugar al síndrome clínico de hipersensibilidad aguda.
Alopurinol - Existe una fuerte asociación entre la herencia del alelo HLA-B*5801 y los
eventos adversos cutáneos severos en pacientes tratados con alopurinol,
particularmente en ciertas poblaciones asiáticas, incluyendo pacientes chinos Han y
tailandeses, y en pacientes con enfermedad renal que son de ascendencia coreana.
Preocupaciones similares se aplican a los pacientes con antecedentes familiares de
reacciones adversas cutáneas graves al alopurinol. El cribado es aconsejado por varios
expertos en pacientes de alto riesgo[92]. Este tema y el papel de las pruebas HLA-
B*5801 antes del alopurinol se discuten en detalle en otra parte (See "Pharmacologic
uratelowering therapy and treatment of tophi in patients with gout", section on
'Allopurinol' and "Tumor lysis syndrome: Prevention and treatment", section on
'Prevention'.)
Inhibidores de la aromatasa - Las variantes hereditarias del gen de la leucemia de
células T 1A (TCL1A) se han asociado con el riesgo de efectos secundarios
musculoesqueléticos en mujeres que reciben un inhibidor de la aromatasa (AI) para el
tratamiento del cáncer de mama. Sin embargo, la magnitud del exceso de riesgo es
pequeña, y sólo una pequeña fracción (aproximadamente el 11 por ciento) de los
eventos adversos musculoesqueléticos clínicamente significativos de los IA pueden
atribuirse a esta variante genética en particular. Por lo tanto, no se recomienda
realizar pruebas. (Ver "Terapia endocrina adyuvante para mujeres con cáncer de
mama con receptores hormonales positivos".)
Carbamazepina - Carbamazepina, un anticonvulsivo y estabilizador del estado de
ánimo, puede causar el síndrome de Stevens-Johnson y la necrólisis epidérmica tóxica
relacionada, reacciones idiosincrásicas que pueden reducirse en frecuencia al evitar el
medicamento en pacientes que portan uno de los dos HLA. alelos, B*1502 (en
poblaciones asiáticas) y A*3101 (en europeos). Basándose en estas observaciones, la
FDA de los Estados Unidos también ha sugerido que se realicen pruebas en
poblaciones asiáticas para detectar el alelo B*1502 antes de usar el medicamento
relacionado oxcarbamazepina (tabla 1).
Ivacaftor, un modulador de CFTR disponible por vía oral que es específico para la mutación
G551D, restaura el funcionamiento de la proteína CFTR en pacientes que albergan esta
mutación. En un ensayo clínico que condujo a su aprobación en los Estados Unidos, los sujetos
con FQ y una mutación G551D en al menos uno de sus genes CFTR experimentaron mejorías
en las exacerbaciones pulmonares menos frecuentes de FEV, y mayor aumento de peso con
ivacaftor en comparación con aquellos que recibieron placebo. Todos los individuos con FQ
deben someterse a un genotipado para determinar si son portadores de la mutación G551D.
(See "Cystic fibrosis: Treatment with CFTR modulators", section on 'Introduction'.)
Una lista completa de las recomendaciones de las sociedades profesionales está disponible en
la página web de PharmGKB sitio web (www.pharmgkb.org/guidelines)
Limitaciones del diseño del estudio - Varios problemas en el diseño del estudio han limitado la
traducción de la farmacogenética a la esfera clínica.
Preocupaciones regulatorias y éticas - Desde una perspectiva ética, una preocupación de larga
data ha sido si la identificación de variantes farmacogenéticas (en particular aquellas asociadas
con una respuesta o pronóstico deficiente del tratamiento) en un individuo podría resultar en
la estigmatización (por ejemplo, la denegación del seguro).
Un paso importante en la protección de los derechos de las personas llegó con la aprobación
de la H.R. 493, la Ley de No Discriminación de Información Genética de 2008. Esta ley protege
a los estadounidenses contra la discriminación basada en su información genética en asuntos
relacionados con el seguro médico y el empleo y debería traducirse en una mayor aceptación
de las pruebas farmacogenéticas por parte del público en el futuro.
Falta de análisis de rentabilidad - Entre las circunstancias que favorecen la rentabilidad de una
prueba farmacogenética se incluyen una alta prevalencia de la variante genética de interés en
la población diana, una buena correlación entre el fenotipo y el genotipo, criterios de prueba
diagnósticos satisfactorios, una enfermedad que se asocia con una morbilidad o mortalidad
significativa si no se trata, y una reducción significativa de las reacciones adversas a los
medicamentos resultantes de la prueba.
El primer problema puede ilustrarse mediante pruebas farmacogenéticas para las variantes
CYP2C9 y VKORC1 en pacientes que se inician con el anticoagulante warfarina (véase más
arriba "Warfarina y polimorfismos VKORC1"). Las variantes de VKORC1 representan
aproximadamente el 25 por ciento de la variabilidad fenotípica en la dosificación de warfarina,
mientras que las variantes de CYP2C9 añaden entre el 6 y el 10 por ciento adicional. Los datos
disponibles sugieren que combinar el conocimiento de las variantes genéticas con las
características clínicas puede explicar entre el 55 y el 71 por ciento de la variabilidad de la dosis
de warfarina.
Un documento de trabajo de 2006 del American Enterprise Institute-Brookings Joint Center for
Regulatory Studies (y publicado parcialmente en 2008) estimó que la integración formal de las
pruebas genéticas en la terapia de rutina con warfarina podría permitir a los usuarios
estadounidenses de warfarina evitar 85.000 casos graves de hemorragia y 17.000 accidentes
cerebrovasculares al año, lo que resultaría en un ahorro estimado de 1.100 millones de dólares
anuales, con un rango de entre 100 y 2.000 millones de dólares. Sin embargo, el genotipado
rutinario no es ampliamente aceptado (o recomendado en las directrices del American College
of Chest Physicians), especialmente después de que ensayos aleatorios que compararon la
dosificación inicial guiada por el genotipo con la dosificación inicial estándar no encontraron
diferencias en las tasas de hemorragia o tromboembolismo. (See "Warfarin and other VKAs:
Dosing and adverse effects", section on 'Baseline testing'.)
Falta de pruebas y directrices para la aplicación de las pruebas - En comparación con otras
pruebas clínicas, hay relativamente pocas pruebas farmacogenéticas disponibles para su uso
en la práctica clínica, e incluso cuando se dispone de pruebas, ha habido una lenta adopción de
estas pruebas para informar a la toma de decisiones clínicas en la práctica. Las limitaciones
citadas en el desarrollo e implementación de nuevas pruebas incluyen:
RESUMEN
Este cuadro tiene por objeto ilustrar los conceptos básicos de la función de los ensayos
farmacogenómicos. Para la gestión de pacientes, consulte los temas de UpToDate sobre
condiciones específicas y la información más reciente sobre el producto. Puede encontrar
información adicional sobre farmacogenómica en UpToDate y en el sitio web de la FDA.
ADH: alcohol deshidrogenasa; ALDH: aldehído deshidrogenasa; CYP: citocromo P450; DPD:
dihidropirimidina deshidrogenasa; NQO1: NADPH: quinona oxidoreductasa o DT diaforasa;
COMT: catecol O-metiltransferasa; GST: glutatión S transferasa; HMT: metiltransferasa de
histamina; NAT: Nacetiltransferasa; ST: sulfotransferasas; TPMT: tiopurina metiltransferasa;
UGT: trifosfato de uridina 5' glucuronosiltransferasas.
Ejemplos de ajustes de dosis basados en el PGDx
UM: metabolizador ultrarrápido; RA: acetilador rápido; EM: metabolizador extensivo; IA:
acetilador intermedio; IM: metabolizador intermedio; SA: acetilador lento; PM: metabolizador
pobre; AUC: área bajo la curva.
Inhibidores moderados