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La importancia de las predicciones genéticas

Diego Aqueveque1
1. Universidad Adolfo Ibáñez
Resumen
A través de un análisis experimental a pacientes de lupus eritematoso sistémico (LES) se
comprobará que las predicciones genéticas permiten la planificación, prevención y cuidado
anticipado del individuo dependiendo de los antecedentes genéticos de la persona y del resultado
que arrojen estas probabilidades. Al obtener los diferentes resultados se compararon según el
nomograma de Fagan, el cual se compone de tres columnas de probabilidades: pre-test, razón
de verosimilitud y post-test; siendo esta ultima una prolongación de los demás resultados.
Se concluyó que estos procedimientos son importantes debido a que pueden utilizarse como un
apoyo para diagnósticos generales, confirmando así, la hipótesis propuesta.

Introducción ocasiona el mal con manifestaciones


perceptibles en distintos exámenes físicos.5
Las diversas enfermedades autoinmunes
son condiciones crónicas que abarcan un Con el descubrimiento de la genética y como
extenso espectro de patologías, con se ve afectada con la presencia de ciertas
manifestaciones muy diferentes en el cuerpo enfermedades, es posible analizar mediante
humano. distintas muestras si existe riesgo a futuro de
contraer alguna enfermedad de tipo
Aunque el concepto de salud resulta
autoinmune.
sencillo, se ha intentado definir lo que
realmente significa “estar sano” desde Esto genera un conflicto pues no se tiene
diferentes áreas incluyendo la antropología, certeza si se debe llamar “enfermo” a una
historia y sociología. persona asintomática, sin alteraciones
evidentes en su cuerpo ni en su desempeño
Sin embargo, hay cualidades que dificultan
orgánico y sistémico, equilibrada
la definición exacta y única respecto al
emocionalmente, solamente por el hecho de
término salud, ya que este depende del
encontrar una alteración bioquímica que sólo
contexto en el cual se utiliza.
traduce una probabilidad de riesgo futuro.5
La definición de salud propuesta por la
El análisis genético implica examinar el
Organización Mundial de la Salud es “el
ADN, la base de datos química que contiene
estado de completo bienestar físico, mental
instrucciones para el funcionamiento del
y social y no solamente la ausencia de
cuerpo. Este análisis puede aportar
afecciones o enfermedades, que a su vez
información relevante para el diagnóstico,
son definidas como aquellas alteraciones
tratamiento y prevención de enfermedades.
estructurales o funcionales que afectan
negativamente al estado de bienestar” 3 El conocimiento de las personas sobre algún
tipo de alteración bioquímica que puedan
Por otra parte, desde el comienzo de la
padecer, la cual permita desarrollar alguna
humanidad, el concepto de enfermedad se
enfermedad a futuro, es de suma
ha tratado como aquel que facilita el
importancia debido a que habilita el accionar
debilitamiento humano, es decir, que
de la persona según el tipo de enfermedad, completo la enfermedad, si es igual a uno no
y más aún, saber si la enfermedad puede modifica la probabilidad de enfermedad y si
poseer algún origen del tipo ‘genético’. toma un valor mayor o igual a tres se
incrementa notablemente la probabilidad de
El lupus eritematoso (LES) es una
enfermedad. A su vez, de esta expresión se
enfermedad autoinmune que se caracteriza
derivan dos fórmulas más; LR positivo (en
por episodios periódicos de inflamación y
caso a la presencia del hallazgo) y LR
daño en articulaciones, tendones, entre negativo (en caso de ausencia):
otros. El lupus afecta a todas las personas
de manera diferente y los efectos pueden ir 𝑆𝑒𝑛𝑠𝑖𝑏𝑖𝑙𝑖𝑑𝑎𝑑
𝐿𝑅 (+) =
desde leves a severos, llegando a ser mortal. 1 − 𝐸𝑠𝑝𝑒𝑐𝑖𝑓𝑖𝑑𝑎𝑑
La mayoría de las personas que padecen
lupus son mujeres jóvenes debido a que el
estrógeno parece estar asociado con la 1 − 𝑆𝑒𝑛𝑠𝑖𝑏𝑖𝑙𝑖𝑑𝑎𝑑
𝐿𝑅 (−) =
enfermedad. Los factores que provocan el 𝐸𝑠𝑝𝑒𝑐𝑖𝑓𝑖𝑑𝑎𝑑
LES son tanto genéticos como ambientales, Donde el LR (+) indica la proporción de
donde una combinación de los genes de pacientes con la enfermedad que tienen un
ambos padres, sumada a factores hallazgo, dividido por la proporción de
ambientales desconocidos, produce el rasgo pacientes sin la enfermedad que tienen el
o trastorno. 4 mismo hallazgo. Por otra parte, la expresión
del LR (-) indica la proporción de pacientes
El diagnóstico de la enfermedad es difícil ya
con la enfermedad que no tienen un hallazgo
que cada persona puede tener diferentes
síntomas, es por eso por lo que se debe entre la proporción de pacientes sin la
revisar el historial clínico, es aquí donde las enfermedad que tampoco no tienen el
predicciones genéticas toman mismo hallazgo.1
importancia. Luego de obtener los cálculos de
Mediante un diseño experimental basado en probabilidad se procede a realizar el
las probabilidades y antecedentes genéticos nomograma de Fagan, el cual se compone
se buscará evidenciar la premisa de que las de tres columnas: la primera es la
predicciones genéticas permiten la probabilidad pretest (prevalencia), la
prevención y el cuidado anticipado de segunda es la razón de verosimilitud (LR) y
diferentes enfermedades autoinmunes. la tercera es la probabilidad post test. Con
una regla se traza una línea entre la
probabilidad pretest y la razón de
verosimilitud. La prolongación de esta línea
Materiales y métodos
que corta en la tercera columna es la
Para calcular el poder de predicción de un probabilidad de tener la enfermedad en
anticuerpo de acuerdo con la sensibilidad y función del resultado de la prueba. 2
especificidad, teniendo en cuenta la
prevalencia en la población de origen, es
necesario utilizar la siguiente formula:

𝑃𝑟𝑜𝑏 𝑑𝑒 𝑞𝑢𝑒 𝑙𝑎 𝑝𝑟𝑢𝑒𝑏𝑎 𝑟𝑒𝑠𝑢𝑙𝑡𝑒 𝑒𝑛 𝑠𝑢𝑗𝑒𝑡𝑜 𝑒𝑛𝑓𝑒𝑟𝑚𝑜


𝐿𝑅 =
𝑃𝑟𝑜𝑏 𝑑𝑒 𝑞𝑢𝑒 𝑙𝑎 𝑝𝑟𝑢𝑒𝑏𝑎 𝑟𝑒𝑠𝑢𝑙𝑡𝑒 𝑒𝑛 𝑠𝑢𝑗𝑒𝑡𝑜 𝑠𝑎𝑛𝑜

Donde LR es un cociente de probabilidad, si


es equivalente a cero se descarta por
Es así, como se procederá a estudiar dos Figura 1 – Gráfico paciente 1
casos particulares respecto al Lupus
Eritematoso (LES) debido a que se
encuentran en fase preclínica, es decir, sin
manifestaciones clínicas visibles, con el fin
de determinar si los individuos podrían
generar o no la enfermedad a futuro.
Cabe mencionar que la probabilidad de
ocurrencia del LES es de un caso en mil
alrededor del mundo, es decir, 0,1%.
En el caso n°1, mujer de 46 años, quien
asistió a consulta por una historia de otro tipo
de enfermedades que no cabe mencionar,
posee antecedentes familiares de
importancia, una hermana con enfermedad e Figura 1: El gráfico del paciente n°1 presenta los resultados de
Takayasu y dos tíos maternos, uno con LES análisis presencial de anticuerpos y complementos sanguíneos, de
los cuales se presentan muy bajos niveles de anticuerpos
y otro con Diabetes Mellitus tipo I (DMI). antinucleares (un promedio de 0,26) aunque de igual manera no se
descarta la presencia de LES.
Por otra parte, el caso n°2 es una mujer de
22 años que fue a consulta por artralgias
ocasionales, con antecedentes negativos,
Para la paciente n°1 (y con base en la
sin evidencia de inflamación articular y
prevalencia mundial informada) la
examen físico dentro de los normales.
probabilidad pretest es de 0,1%.
Ambas casos permanecieron sin síntomas
Se utiliza LR positivo ya que la prueba fue
visibles ni presentaron alguna manifestación
positiva en el paciente, el LR positivo de los
clínica sugestiva de LES, los controles se
ANAs es de 4,71 y se calcula en base a la
realizaron periódicamente cada 2 meses. Se
sensibilidad y especificad informadas para la
procederá a analizar distintas muestras en
prueba, esto es, 99% y 79%
base a análisis de ANAs (anticuerpos
respectivamente.
antinucleares) debido a que su resultado
puede indicar la presencia de enfermedades Por lo que reemplazando en la
autoinmunes, como lo es, en este caso, el expresión adecuada nos queda:
LES. 1
LR (+) = 0,99 / 0,21 = 4,71
Resultados
Este resultado, al compararlo con el
Con el fin de demostrar que el análisis nomograma de Fagan (figura 3) se puede
genético es una herramienta útil de notar que se ubica a la derecha la
prevención se procedió a analizar los dos probabilidad pretest de la paciente (0,1%),
casos mencionados respecto al Lupus se traza una línea (continua en la figura) que
Eritematoso (LES), los cuales arrojaron los cruza por 4,71 (porque su LR fue positivo
siguientes resultados: debido a sus ANAs) y en la columna de la
derecha se obtiene la probabilidad post-test.
Para este caso particular, la probabilidad de
tener lupus luego de la obtención de
resultados sube de un 0,1% a un 0,5%.
Luego, si se parte de esta probabilidad y se
vuelve a realizar el cálculo considerando que
el Anti Sm fue positivo (Sensibilidad 24% y Se adjunta el nomograma de Fagan, el cual
especifidad 95%) con un LR (+) = 0,24/0,05 fue usado con el fin de mostrar
= 4,8 y cruzando este en el nomograma de cuantitativamente las predicciones en los
Fagan (línea punteada en la figura 1), la casos clínicos n°1 y n°2, explicando su
nueva probabilidad de tener lupus en la funcionamiento durante el resumen y la
pacientes luego de obtener anti Sm positivo metodología del análisis.
sube a un 2%, por lo que se sigue de
Figura 3: Nomograma de Fagan
acuerdo en continuar con un tratamiento de
observación.
Por otra parte, al realizar los mismos
cálculos para el caso 2, la probabilidad
pretest con ANAs positivos es de 0,5%, la
linfopenia presente (sensibilidad 46%,
especifidad 89% según Tan et al) con LR (+)
de 4,18 eleva la probabilidad post-test de
tener LES a 2,1% y partiendo de esta
probabilidad con el resultado de Anti ADN
positivo (sensibilidad 67% y especifidad 92%
según Tan et al) con un LR (+) de 8,38 la
probabilidad final de tener LES para la
paciente es de 15,2% (línea de guiones de
la figura 3), probabilidad por la cual se toma
la decisión de iniciar un tratamiento.

Figura 2 – Gráfico paciente 2

Figura 3: El nomograma de Fagan presenta tres columnas de


probabilidades, la primera es de pretest/prevalencia (la cual indica la
probabilidad de tener alguna enfermedad, es informada por los
médicos. En la segunda columna encontramos los cocientes de
probabilidad (LR) de los casos presentados y la tercera columna es
la prolongación de la recta obtenida anteriormente, obteniéndose
así, la probabilidad post-test.

Si comparamos las tablas y gráficos de


ambos casos podemos ver diferencias
Figura 2: El gráfico presenta los resultados de análisis presencial de notorias en la cantidad presente en el cuerpo
anticuerpos y complementos sanguíneos, de los cuales, y al igual
que el caso n°1, se presentan muy bajos niveles de anticuerpos
de distintas muestras, esto debido
antinucleares (un promedio de 0,29), por lo que no se descarta la posiblemente a la presencia de variantes
presencia de enfermedad. genéticas o de factores ajenos a la sangre.
Discusión y conclusión
A raíz del experimento propuesto y de los
resultados obtenidos se puede concluir que Bibliografía
no es fácil tomar la decisión de intervenir o
no a un paciente basándose en una 1. Ortega, O., Lopez-Guzmá, S., Rojas-
Villarraga, A. & Anaya, J.-M.
probabilidad del 15% de tener LES (Caso 2),
PREDICCIÓN DE LAS
frente a una probabilidad del 2% (Caso 1) ENFERMEDADES AUTOINMUNES :
luego de haber realizado múltiples pruebas MITO , REALIDAD Y RIESGO. Med
de laboratorio. Estos diagnósticos lo que 16, 56–73 (2008).
permiten es llegar de una aproximación
cuantitativa de la predicción diagnostica, por 2. Aznar-Oroval, E. Mancheño Alvaro,
lo que la decisión de iniciar un tratamiento A. García-Lozano, T. Sánchez-
depende tanto del paciente como del Yepes, y M. Razón de verosimilitud
y nomograma de Fagan : 2
profesional a cargo. A su vez, la sensibilidad
instrumentos básicos para un uso
y especificidad de un test en estos casos, racional de las pruebas del
puede resultar muy alta, pero no es laboratorio clínico Likelihood ratio
suficiente para confiar en su capacidad de and Fagan ’ s nomogram : 2 basic
discriminar sanos de enfermos, pues en la tools for the rational use of clinical
práctica clínica diaria, los grados de laboratory tests Nomograma
severidad de una enfermedad son muy Adecuación. Rev Calid Asist 28,
amplios. 5 390–393 (2013).

Es así como se llega a que los análisis 3. Organizacion Mundial de la Salud.


genéticos desempeñan un rol fundamental Constitution. (1946).
en la determinación del riesgo de contraer 4. Stanford Children’s Health. Lupus
ciertas enfermedades, así como en los Eritematoso Sistémico (Lupus).
análisis para la detección y el tratamiento (2019). Available at:
médico. Las puntuaciones de riesgo http://www.stanfordchildrens.org/en/t
poligénicas son cada vez más precisas y opic/default?id=overview-of-
ayudan a identificar a la gente más propensa craniofacial-anomalies-90-P01830.
a sufrir enfermedades como el cáncer y el 5. Patricio Burdiles, P. Algunos desafíos
Alzheimer, pero no están exentas de dudas bioéticos de la predicción y
sobre su fiabilidad ni sobre su ética. 6 prevención secundaria en oncología.
Rev. Médica Clínica Las Condes 22,
Por lo que, considerando los casos 512–521 (2011).
anteriores, se puede concluir que los análisis
genéticos son un bien porque pueden 6. Regalado, A. Riesgos y beneficios de
permitir la planeación a futuro del individuo, predecir el futuro de las personas
si es que pudiese padecer una enfermedad con su adn. 27 february (2018).
mortal. Finalmente, las predicciones Available at:
genéticas pueden utilizarse de manera https://www.technologyreview.es/s/10
017/riesgos-y-beneficios-de-predecir-
complementaria (y no completa debido a
el-futuro-de-las-personas-con-su-
algunas imprecisiones) con un diagnostico adn.
general.

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