Características fisicoquímicas y microbiológicas

del suelo
Importancia en los procesos de Biorremediación
Descontaminación de suelos y aguas a través de la
biorremediación
Servicio Nacional de Aprendizaje SENA

Julián Esteban Másmela Mendoza

Instructor de Agroecología y medio Ambiente
El suelo NO es una matriz estática, El suelo es un ecosistema en un equilibrio
dinámico: intercambio continuo mediante procesos físicos, químicos, macro y
microbiológicos
Procesos continuos: Ciclos biogeoquímicos de materia y energía -Síntesis y
degradación

“Lo esencial es invisible a los ojos”

Funciones ecológicas del suelo: servicios ecosistémicos

Sumideros de
carbono-ácidos
húmicos-Consumo
de carbono
atmosférico
Soporte físico de
Mantenimiento
las plantas-
de la calidad de
Producción de
aire
biomasa

Protección de los
Almacenamiento de
ecosistemas-
agua y nutrientes—
Filtración y
Diversidad genética-
transformación de
Microbiana-Hábitat
compuestos tóxicos
de la mayoría de
para los
Microorganismos –
ecosistemas
”core community”
acuáticos -
 Aminoácidos, proteínas,
carbohidratos, fosfolípidos;
ácidos húmicos, y fúlvicos
Glucosa

Macronutrientes (N, P, K)
Micronutrientes (S, Mg, Ca, Cl, Fe,
Mn, Br, Se)
para las plantas O2, CO2, N2
Identificar: Deficiencias y toxicidad
Vapor de agua
NO3-, NO2-, NH4+, NH3+, PO-4,
Relación C:N
Arcillas, limos, arenas

Microagregados-grumos-bolitas

Ácidos húmicos-Humus

Actividad metabólica de
los microorganismos

Horizontes:
Cero-Hojarasca
A-Nutrientes-Materia
orgánica-Mineralización
 PERMEABILIDAD
Una característica asociada a la porosidad es la permeabilidad o facilidad que tiene el
suelo para dejarse penetrar por los fluidos. Sobre la permeabilidad influyen tres factores
primordiales del suelo: la textura, la estructura y el contenido en materia orgánica. Se
indica por la velocidad de circulación del agua de gravedad o conductividad hidráulica, y
es tanto más elevada cuanto la porosidad no capilar sea mas grande.
Según el tamaño del agregado se pueden clasificar en Macro
y microagregados
Determinan la disponibilidad, las concentraciones, el estado
atómico (aniones, cationes) y molecular de los nutrientes del
suelo, estados de oxixorreducción y La actividad microbiana del
suelo
 Importante en los procesos de biorremediación: Las
arcillas al ser cargadas negativamente pueden retener
hidrocarburos-No dejarlos solubles para la degradación
microbiana!
 pH del suelo

Óptimo: pH neutros 6-7,5 -La asimilación de nutrientes del

suelo está influenciadas por el pH, ya que determinados
nutrientes se pueden bloquear en determinadas
condiciones
• Propiedades químicas y fertilidad

Los residuos de la actividad orgánica son de naturaleza

ácida-descomposición de materia orgánica.
Procesos de escorrentía
Va a influir en los estados de oxidorreducción de los
nutrientes-minerales inorgánicos y metales pesados
• Factores que influyen en los valores de pH
 ¿Sería bueno tener una buena capacidad de intercambio
catiónico en los suelos durante los procesos de biorremediación
de metales pesados?
 capacidad de intercambio catiónico

El número de cargas negativas del

suelo y se expresa en meq/ 100g de suelo
 CIC (Capacidad de Intercambio catiónico)
Algunas partículas del suelo tienen la posibilidad de adsorber iones en su
superficie que pueden intercambiar con la solución del suelo.

Existe un equilibrio entre la concentración de iones en la solución y los

retenidos por la fase sólida, si bien este equilibrio es muy complejo y
depende de la naturaleza del ion, del tipo de adsorbente y de la reacción de
la solución, principalmente.

Influida por:

• Las arcillas
• Las moléculas húmicas : ácidos húmicos y fúlvicos
• los oxihidróxidos de hierro y aluminio
La determinación de minerales-formas inorgánicas en el suelo es esencial
para identificar las concentraciones de nutrientes disponibles para el
metabolismo de las plantas y los microorganismos que realizaran los procesos de
biorremediación.

Fertilidad del suelo

Elementos:
Nitrógeno-Amoniaco: NH3+, Amonio: NH4+, N2 (g), N2O, Nitritos:
NO2, Nitratos: NO3
Fósforo: Fosfatos: PO4-Rocas fosforicas-Ca3PO4,Fe3PO4, Al2PO4
Disponibilidad en pH neutros 6,5-7,5
Azufre –SO4-, H2S
Calcio, Magnesio, Potasio-En suelos ácidos disminuye la CIC-se
pueden perder
Hierro y Manganeso
En los análisis fisicoquímicos se incluyen las concentraciones de los macro y micronutrientes y sus estados

Estados de oxidorreducción de los nutrientes y su biodisponibilidad para la planta

Relación Carbono: nitrógeno: Fósforo C:N:P es esencial; 100:10:1
Nutrientes limitantes-Nitrógeno y fósforo en algunos casos
Esenciales por su diversidad metabólica
 Biodegradación, mineralización e

microorganismos del suelo

inmovilización de compuestos
orgánicos e inorgánicos –bacterias
heterotrofas
Importancia de los

Descomponedores-”Enganche y
desenganche” de materia y energía-
Continuidad de los ciclos-reacciones
de oxidorreducción

Nadie habla del mantenimiento y la

conservación de la diversidad
microbiana!
 Salud del suelo: Actividad y diversidad microbiana-Grupos
funcionales microbianos.
Grupos funcionales
Microorganismos
microbianos

Bacterias-Arqueas Bacterias fijadoras de nitrógeno

Hongos Bacterias-Hongos solubilizadoras de fósforo

Protozoos-algas Bacterias heterótrofas totales- Mesófilas-

Actinomycetos-Actinobacterias

Microorganismos son los primeros bioindicadores de

cualquier alteración o perturbación del suelo
Bacterias y hongos del suelo cercano
a la raíz-rizósfera
Los grandes amigos de las plantas
¡Muy importantes en la agricultura!
Sin sus funciones ecológicas, su metabolismo y
las interacciones positivas (sinergias,
cooperación, mutualismos) no podrían
sobrevivir las plantas, no habría agricultura….
No estaríamos vivos nosotros tampoco!
 Vista al microscopio de
epifluorescencia de bacterias que
viven cerca a la raíz de la planta
 Ciclo del carbono en los suelos

Desbalance:
Baja Cantidad de
materia orgánica
que ingresa al
suelo

-Reservas de
carbono del suelo-
ácidos húmicos se
agotan

-Pérdida de
diversidad
microbiológica
Ciclo biogeoquímico del Nitrógeno
Algunas funciones de los microorganismos del suelo
 Bacterias y Hongos promotores de crecimiento vegetal
(PGPB-siglas en ingles)

Estimulan el crecimiento vegetal de las plantas:

Longitud-Atura de mi planta, diámetro de las hojas, número
de hojas, número de hojas, número de raíces secundarias,
pelos radiculares, número de frutos.

 Tolerancia a estrés abiótico: Las plantas resisten mejor las

sequias, las heladas, las deficiencias de nutrientes, la
toxicidad-ejemplo-exceso de sodio.

 Tolerancia a estrés biótico: Las plantas pueden

defenderse mejor del ataque de plagas-insectos,
enfermedades por bacterias y hongos-
 Géneros y especies de Bacterias promotoras de
crecimiento vegetal que se encuentran en el suelo y
que se pueden conseguir como biofertilizantes
microbianos
Bacillus subtilis
Bacillus velezensis
Bacillus pumilus
Streptomyces
Pseudomonas fluorescens
Pseudomonas
Rhizhobium
Frankia
Azospirillum brasiliensis
Burkholderia
 Bacterias fijadoras de Nitrógeno

Son bacterias “amigas” de las

plantas

Interacción: Simbiosis-mutualismo
Yo te ayudo-tu me ayudas

Las plantas brindan protección y

nutrientes (glucosa) a la bacteria
Las bacterias brindan el Nitrógeno del
aire en forma de Amoniaco-amonio para
las plantas-Nutriente vegetal en el suelo
 ¿Cómo se llaman estas bacterias que componen el grupo de
Bacterias fijadoras de nitrógeno?

Simbióticas-Nódulos, Vida libre-Viven cerca a la

dentro de la planta raíz
Rhizhobium Azotobacter, Azospirillum,
Rhizobium, Pseudomonas,
Bradhirhizobium
Bacillus, Beijerinckia, Acidovorax
Frankia
+Leguminosas + Pastos
 Bacterias solubilizadoras de fósforo
Bacterias capaces de producir sustancias que dejan disponible el fósforo en forma
de fosfatos para la nutrición de las plantas
Actinomycetos=Actinobacteria
Medios de cultivo con actinobacterias
Las actinobacterias –actinomycetos son las principales defensoras de las plantas
contra patógenos al producir antibióticos-sustancias que matan a los
microorganismos malos
Micorrizas-Hongos micorrízicos
Micorrizas arbusculares vistas al microscopio óptico, creciendo dentro de una raíz. Las flechas indican las
hifas (hilos) del hongo.
Tipos de micorrizas:
-Ectomicorrizas-Crecimiento externo
-Micorrizas de Ericaceaes
-Micorrizas de Orchidaceae,-Orquideas
-Micorrizas arbusculares -Endomicorrizas

Funciones: Mayor absorción de nutrientes-Aumenta el área de

disposición de nutrientes para la planta
Mayor absorción de agua
-solubilización de fósforo
-Competencia de espacio y nutrientes
con posibles patógenos.
-Mejora el estado nutricional de la
Planta-más fuerte
-Sinergia con BSF y BFN
-Producción de auxinas
 ¿Quiénes y cuántos están?
composición y actividad de la comunidad Análisis microbiológicos cultivables. Técnicas de biología
molecular-Librerias genómicas de ADN-Metagenoma del
Cómo puedo medir la diversidad,

microbiana del suelo suelo-Análisis de la fracción microbiana no cultivables

Carbono y nitrógeno microbiano-Fracción orgánica;

y cuánto?
¿Qué pueden hacer?¿Qué hacen
Análisis microbiológicos cultivables de grupos funcionales
microbianos. Ensayos enzimáticos-fosfatasa, nitrogenasa,
celulasas. Ensayos de respiración microbiana-Cálculo de ATP

q-RT PCR-cuantificación de genes específicados implicados

en ciclos-nitrógeno, fósforo
 En resumen….Debo determinar la salud del suelo para reconocer mi punto de
partida en los procesos de biorremediación

Conceptos claves:
Resiliencia y
resistencia del suelo
El suelo….en escala de tiempo humana-en una generación…. debe
ser considerado como un recurso natural no renovable!

El suelo es un recurso natural biogeoquímico dinámico que

soporta todos los componentes que comprenden los
ecosistemas terrestres

Importancia de la conservación del suelo: seguridad

alimentaria, el alivio de la pobreza, la degradación
de tierras y la provisión de servicios ecosistémicos
 Características físicas , químicas y biológicas que pueden perder los suelos por
procesos de degradación y su clasificación como procesos reversibles-irreversibles-
recuperables a alto costo

Proceso de degradación Reversible Irreversible-

recuperable a alto
costo
Encostramiento-Sellado superficial X
Erosión X
Compactación X
Reducción de la capacidad de X
almacenamiento de agua
Pérdida de materia orgánica X
Desbalance de nutrientes X
Acidificación, salinización X
Pérdida de diversidad y actividad X
microbiológica
Contaminación por plaguicidas y metales X
pesados

Scherr, 1999
 El ciclo de materia y flujo de energía en un ecosistema se ve
alterado cuando:
-Eliminamos una de las partes del sistema y esa función no es remplazada-
explotamos una parte: ejemplo: la deforestación-Fotosíntesis; polinizadores-
agroquímicos; Especies clave- Grandes depredadores de la red trófica;
¿Descomponedores?.

-Introducimos Nutrientes aloctonos-externos al sistema; nitratos y fosfatos de los

fertilizantes químicos sintéticos en cultivos agrícolas-escorrentía-eutrofización de
lagos y ríos; materia orgánica en un ecosistema-basuras, residuos sólidos,
vertimiento de aguas residuales;

-Introducimos compuestos orgánicos “artificiales” creados en el laboratorio y

liberamos compuestos inorgánicos en estados de oxidorreducción que circulan
por la red trófica -Ningún descomponedor puede consumirlos; pesticidas-
plaguicidas-compuestos organofosforados, plásticos, derrame de hidrocarburos,
la contaminación por metales pesados-bioacumulación.

Perturbación que con el paso del tiempo no se va a eliminar fácilmente y que

puede persistir y afecta la vida de los seres vivos y la salud de los humanos
 ¿Qué busca la biorremediación?
• La biorremediación busca integrar los contaminantes a los
ciclos biogeoquímicos de elementos de la naturaleza (C, N, P,
S, Fe)

• Utilizar la capacidad metabólica de los microorganismos para

transformar o mineralizar los compuestos orgánicos
contaminantes recalcitrantes o que no fueron producidos de
forma artificial.

• Microorganismos autóctonos del área contaminada

• Comunidades microbianas presentes en las zonas de

biorremediación.