Clase:

Enzimas:
características,
clasificación,
mecanismos
Curso:
Bioquímica 2019 -II
Dr. Iván Best Cuba
Logro
Al término de la sesión, el estudiante explica sobre la funciones
y mecanismos que median las enzimas en los sistemas
biológicos.
 ENZIMAS

Concepto

Las enzimas son catalizadores biológicos,

responsables de la mayoría de las reacciones químicas
que mantienen la homeostasis en los sistemas
biológicos.

Son importantes en la mayoría de procesos

bioquímicos. Catalizan reacciones que degradan
moléculas de nutrientes, conservan y transforman la
energía química y forman macromoléculas biológicas a
partir de precursores.
 ENZIMAS
Generalidades

• La mayoría de reacciones químicas en los organismos

vivos, son realizadas por catalizadores específicos
(Enzimas).

• Intervienen en tanto en reacciones que requieren

energía (endergónicas), como en las que liberan energía
(exergónicas).

• La mayoría de las enzimas son de naturaleza proteica a

excepción de las ribozimas que son moléculas de ácido
ribonucleico (ARN).
 ENZIMAS

Características

• Las enzimas son altamente específicas, cada enzima

cataliza la reacción de un solo tipo de molécula ó un
grupo de moléculas relacionadas.

• Las enzimas aceleran las reacciones químicas.

• Las enzimas son liberadas luego catalizar la conversión

de sustratos a productos.

• Las enzimas son saturables por altas concentraciones de

sustrato.

http://highered.mheducation.com/sites/0072495855/student_view0/chapter2/a
nimation__how_enzymes_work.html
LOCALIZACIÓN

DE LAS

ENZIMAS
 ENZIMAS

Características

• Muchas enzimas requieren cofactores y/o coenzimas,

los cuales contribuyen con su actividad.

• Las enzimas trabajan en un medio acuoso y algunas son

sensibles al cambio de pH y temperatura.

• La actividad de una enzima está dada por su estructura.

• Las enzimas son importantes en el diagnóstico de

ciertas enfermedades.
Términos relacionados con la acción enzimática

Cofactor:
Son moléculas orgánicas ó inorgánicas, cuya presencia es
necesaria para que la enzima sea activa.

a) Iones inorgánicos:
Fe2+, Mg2+, Mn2+, Zn2+ , etc.

b) Complejos orgánicos (Coenzimas):

NAD, FAD (Derivados de Vitaminas hidrosolubles)
Iones inorgánicos
Coenzimas
 Términos relacionados con la acción enzimática

• Apoenzima:
Referido solo a la parte proteica de la enzima.

• Holoenzima:
Es la proteína unido a una coenzima y/o ión metálico.

• Grupo Prostético:
Componente orgánico o ión metálico unido fuertemente
(covalentemente) a la apoenzima. Es frecuente la confusión
entre cofactor y grupo prostético, pero la diferencia radica en
la fuerza de su unión a la enzima.
 Clasificación de las Enzimas

• Muchas enzimas han sido designadas añadiendo el

sufijo –asa al nombre del sustrato.
Ej: ureasa, arginasa, DNA polimerasa.

• Otras enzimas han recibido nombres derivados de sus

descubridores o porque cumplen una función amplia.
Ej: pepsina (Griego: pepsis)
lisozima
tripsina
 Nomenclature Committee of the
International Union of Biochemistry and Molecular
Biology (NC-IUBMB)
http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/

• EC 1 OXIDOREDUCTASE
• EC 1.4 Acting on the CH-NH2 group of donors
• EC 1.4.1 With NAD+ or NADP+ as acceptor

• Examples:
• EC 1.4.1.1 alanine dehydrogenase
EC 1.4.1.2 glutamate dehydrogenase
EC 1.4.1.3 glutamate dehydrogenase [NAD(P)+]
EC 1.4.1.4 glutamate dehydrogenase (NADP+)
EC 1.4.1.5 L-amino-acid dehydrogenase
EC 1.4.1.6 deleted, included in EC 1.4.4.1
EC 1.4.1.7 serine 2-dehydrogenase
EC 1.4.1.8 valine dehydrogenase (NADP+)
EC 1.4.1.9 leucine dehydrogenase
.
Clasificación de las Enzimas

http://us.expasy.org/enzyme/
 1. Oxido-Reductasas
Catalizan reacciones de Oxido reducción, es decir transferencia de
electrones.
 2. Transferasas
Transfieren grupos funcionales de un donante a un aceptor, estos
grupos funcionales pueden ser un carbono, grupos aldehídos o
cetónicos, fosfatos, aminos, glucosilo.
 3. Hidrolasas
• Catalizan reacciones de hidrólisis de enlaces glucosídicos,
enlaces peptídicos y otros enlaces C-N
 4. Liasas
• Enzimas que remueven o agregan grupos funcionales (H2O,
amonio o CO2) con formación o pérdida de dobles enlaces. Ej:
Descarboxilasas, deshidratasas.
 5. Isomerasas
Transferencia de grupos dentro de una molécula para producir formas
isoméricas
 6. Ligasas
• Formación de nuevos enlaces (C-C, C-S, C-O, C-N) con ruptura
de enlaces de alta energía (ATP)
 Cinética Enzimática
Como las enzimas trabajan:

 Las enzimas poseen un medio especifico (bolsillo

hidrofóbico ó sitio activo) donde ocurre la reacción
energéticamente más favorable.

 La mólecula que se une al sitio activo de la enzima se

denomina sustrato.

 Las enzimas actúan disminuyendo la energía de activación

de una reacción química.

 Las enzimas aumentan la velocidad de una reacción

química, no afectando el equilibrio.
 Como las enzimas trabajan

http://highered.mheducation.com/sites/0072495855/student_view0/chapter2/anima
tion__how_enzymes_work.html
Sitio activo ó bolsillo hidrofóbico
Reacción no catalizada

Energía de activación
Reacción catalizada
Reacción catalizada
 Ecuación de Michaelis & Menten

Cinética enzimática:

 La ecuación de Michaelis & Menten describe la cinética de

una reacción catalizada enzimáticamente, describe el
cambio de la velocidad de la reacción con respecto a la
concentración de sustrato, cuando la concentración de
enzima se mantiene constante.
Reacciones de orden cero y
de primer orden
Fase II (velocidad de
orden cero) Saturación
ES

Fase I (velocidad de
primer orden)
 Reacciones de orden cero y
de primer orden

Fase I (reacción de primer orden):

Durante la fase inicial de la reacción la velocidad es lineal
con respecto a la [S]. De manera que la velocidad de la
reacción es directamente proporcional a la [S].
([S] << Km)

Fase II (reacción de orden cero):

Se alcanza una velocidad máxima y cualquier incremento
de la [S] ya no modifica la velocidad. De manera que la
velocidad de reacción es independiente de la [S].
([S] >> Km)
 Ecuación de Michaelis & Menten

Vo= Velocidad inicial.

Vmax= Obtenida a concentraciones saturantes de S.
[S] = Concentración de sustrato.
Km= Concentración de sustrato a la cual la Vo es la mitad de la
Vmax.

Vmax y Km pueden diferir entre diferentes enzimas

 Anhidrase Carbónica V vs. [S]
Vmax1

0.9

0.8

[E] = 1 x 10-6 M
0.7
v
0.6
Vmax = 1 Ms-1
v Ms^-1

0.5 KM = 0.012 M
0.4
kcat = 1 x 106 s-1
0.3

0.2

0.1

0
0 KM 0.02 0.04 0.06 0.08 0.1 0.12 0.14
[S] M
[S]
 Por que determinar el Km?

• El valor numérico de Km, establece un valor aproximado para

el nivel intracelular del sustrato.

• El Km es constante para una enzima. Su valor numérico

proporciona un medio de comparación de las enzimas de los
diferentes organismos, ó de los diferentes tejidos del mismo
organismo, ó del mismo tejido en las diferentes etapas del
desarrollo.
 Por que determinar el Km?

• La cte Km indica la relativa “adecuación” de los diferentes

sustratos con una enzima determinada (afinidad por el
sustrato).

• Todos los ensayos enzimáticos válidos desarrollados en el

laboratorio clínico, están basados sobre conocimiento de
los valores de Km para cada sustrato.
Por que determinar el Km?
• Constante catalítica (Kcat):
Es la capacidad del enzima para llevar a cabo una
transformación enzimática.

Número de recambio: cantidad máxima de moléculas de

sustrato transformadas a producto por unidad de tiempo.

Vmax
Kcat = ------------
[E t]
 Verdadera afinidad de la enzima por el
sustrato

• Eficacia catalítica (Kcat/Km):

Parámetro que establece la eficacia catalítica del enzima.

Donde Kcat/Km es la constante de un proceso que depende de la

concentración de la enzima y sustrato.

Cada vez que un sustrato llega al sitio activo del enzima se

transforma en producto, por lo que la velocidad depende de los
rápido que llega el sustrato al sitio activo.
Valores de Kcat/Km
Plot de las Inversas ó de Lineweaver-
Burk

Ecuación de
MIchaelis-Menten

y = 1/Vo
m = Km/Vmax
y = mx + b b = 1/Vmax
Plot de las Inversas ó de Lineweaver-
Burk