Clase 3: LA ESTRUCTURA DEL ADN.

Temario: La doble hélice. Las reglas de Chargaff. Los estudios de difracción

de rayos X. El modelo de Watson y Crick.

Para comenzar este tema veremos el siguiente vídeo:

https://youtu.be/B4RAE7ZP2Qw

LA ESTRUCTURA DEL ADN

El ADN y ARN son químicamente polímeros constituidos por varios
monómeros. Los monómeros que constituyen el ADN y ARN se llaman
nucleótidos. A su vez, cada nucleótido está constituido por tres partes: una
azúcar pentosa (cinco carbonos), una base nitrogenada, y un grupo fosfato.
El azúcar en el ADN se llama desoxyrribosa, y en el ARN es ribosa. Los dos
azúcares se diferencia por el grupo químico que portan en el carbono 2´: un
átomo de hidrogeno (H) en la desoxyrribosa y un grupo hidroxilo (OH) en la
ribosa. Hay 2 clases de bases nitrogenadas: las purinas, las cuales poseen
estructura de doble anillo, y las pirimidinas que poseen un solo anillo. Las
purinas son la adenina (A) y guanina (G), y hay tres pirimidinas: timina (T),
citocina (C) y uracilo (U). Tanto el ADN como el ARN contienen adenina,
guanina y citosina; mientras que la timina sólo es encontrada en el ADN y el
uracilo en el ARN.

En el ADN y ARN, las bases nitrogenadas están unidas al carbono 1´ de la

pentosa por medio de enlaces covalentes. Las purinas están unidas por medio
del nitrógeno 9, y las pirimidinas por el nitrógeno 1. La combinación de un
azúcar y una base nitrogenada se denomina nucleósido. La adición de un
grupo fosfato al nucleósido constituye un nucleósido fosfato, mejor
conocido como nucleótido. El grupo fosfato (PO4-2) se une al carbono 5´ del
azúcar, tanto en el ADN como en el ARN. Para formar un polinucleótido de
ADN o ARN, los nucleótidos se unen entre sí, por enlaces covalentes, entre
el grupo fosfato de un nucleótido y el carbono 3´ del azúcar de otro
nucleótido. Este enlace fosfato 5´- 3´ se llama enlace fosfodiéster. Los
enlaces fosfodiéster son uniones fuerte, de tal manera que la repetición de
los mismos en el ADN y ARN, formando un esqueleto azúcar-fosfato-
azúcar-fosfato, le confiere estabilidad a la estructura. Los dos extremos
de la cadena difieren entre sí, por la posición del átomo de carbono del
azúcar en el cual está unido el grupo fosfato. En un extremo de la cadena
está unido en posición 5´ y en el otro en 3´. Esta asimetría se denomina
polaridad de la cadena.

La doble hélice
La clase 1 nos sirvió para comprender esta parte de la clase 2, el siguiente
vídeo resume lo visto hasta el momento en la historia del ADN.

https://www.youtube.com/watch?v=nEqdRHPn9pE

En 1953, James D. Watson y Francis Crick publicaron un artículo en la

revista científica Nature, donde propusieron un modelo para la estructura
física y química de la molécula de ADN. Ellos propusieron una estructura
tridimensional compuesta por dos cadenas de nucleótidos, una al lado de la
otra, que denominaron modelo de la doble hélice. Antes del descubrimiento
de Watson y Crick, se sabía que el ADN estaba compuesto por nucléotidos;
sin embargo, no se sabía cómo los nucleótidos formaban la estructura del
ADN. Las dos cadenas de nucleótidos permanecen juntas por medio de
uniones débiles entre las bases nitrogenadas de cada cadena, formando una
estructura parecida a una escalera de caracol. El esqueleto de cada cadena
está formado de unidades alternadas de azúcar desoxyribosa y grupos
fosfatos, los cuales están ligados por enlaces fosfodiéster. Watson y Crick
se basaron en estudios previos para poder generar su modelo. Uno de esos
estudios fue el que condujo Erwin Chargaff sobre la composición de las
bases en el ADN (conocido como las reglas de Chargaff), y el otro sobre
difracción de rayos X realizado por Rosalind Franklin y Maurice Wilkins.
Las reglas de Chargaff

Chargaff hidrolizó el ADN de varios organismos, por medio de tratamiento

químico, y
luego cuantificó las purinas y pirimidinas liberadas. Sus estudios
demostraron, que en
todos los ADNs de doble cadena, el 50 % de las bases fueron purinas y el
50 %
pirimidinas. A su vez, la cantidad de Adenina (A) era igual a la de timina (T),
y la
cantidad de guanina (G) era igual a la de citosina (C). Estas equivalencias se
conocen
como reglas de Chargaff. Al comparar el ADN de doble cadena de
diferentes
organismos, la proporción A/T es 1 y la de G/C es 1, pero la proporción (A +
T)/(G + C)
es variable entre los organismos (el % GC) pero es el mismo en los
diferentes tejidos
del mismo organismo.
Los estudios de difracción de rayos X

Rosalind Franklin y Maurice Wilkins estudiaron fibras de ADN aisladas, por

medio de
la técnica de difracción de rayos X. Un haz de rayos X paralelos es dirigido
a la
molécula de ADN. El haz es difractado (roto) por los átomos en un patrón
que es
característico del peso atómico y el ordenamiento espacial de las moléculas.
Los rayos
X difractados son registrados sobre una placa fotográfica. Analizando las
fotografías, Franklin obtuvo información sobre la estructura atómica de las
moléculas. Ella concluyó que el ADN es una larga y delgada estructura
helicoidal que
tiene dos partes similares, que están paralelas una de la otra, y corren a lo
largo de la
longitud de la molécula. Ella detectó dos regularidades distintivas a lo largo
del eje
de la molécula de 0,34 nm y 3,4 nm .

El modelo de Watson y Crick

Watson y Crick usaron los resultados de Franklin y Wilkins para construir

su modelo tridimensional de la estructura del ADN. Su modelo de doble
hélice tiene las siguientes características que ayudan a comprender su
estructura.