Isomerasas

Las isomerasas son una clase de enzimas involucradas en el re-arreglo

estructural o posicional de isómeros y estereoisómeros de diferentes
moléculas. Están presentes virtualmente en todos los organismos
celulares cumpliendo funciones en diversos contextos.

Las enzimas de esta clase actúan sobre un solo sustrato, a pesar de que
algunas puedan estar asociadas covalentemente con cofactores, iones,
entre otros. La reacción general, por lo tanto, puede verse como sigue:

X-Y → Y-X

Las reacciones catalizadas por estas enzimas implican un

reordenamiento interno de los enlaces, que puede significar cambios en
la posición de grupos funcionales, en la posición de dobles enlaces entre
carbonos, entre otros, sin cambios en la fórmula molecular del sustrato.

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Mecanismo de acción de la Isopentenil Pirofosfato Isomerasa catalizando

la isomerización del isopentenil pirofosfato a dimetilalil pirofosfato
Las isomerasas cumplen diversas funciones en gran variedad de
procesos biológicos, dentro de las cuales cabe incluir las rutas
metabólicas, la división celular, la replicación del ADN, por citar algunas.
Las isomerasas fueron las primeras enzimas empleadas industrialmente
para la producción de jarabes y otros alimentos azucarados, gracias a su
capacidad de interconvertir los isómeros de diferentes tipos de
carbohidratos.

Procesos biológicos en los que participan

Las isomerasas participan en múltiples procesos celulares vitales. Entre
los más destacados están la replicación y empaquetamiento del ADN,
catalizados por las topoisomerasas. Estos eventos son cruciales para la
replicación del ácido nucleico, así como para su condensación antes de la
división celular.

La glucólisis, una de las rutas metabólicas centrales en la célula, incluye

al menos tres enzimas isómeras, a saber: la fosfoglucosa isomerasa, la
triosa-fosfato isomerasa y la fosfoglicerato mutasa.

La conversión de UDP-galactosa en UDP-glucosa en la vía del

catabolismo de la galactosa es conseguida por la acción de una
epimerasa. En humanos esta enzima se conoce como la UDP-glucosa 4-
epimerasa.

El plegamiento de proteínas es un proceso esencial para el

funcionamiento de muchas enzimas en la naturaleza. La enzima
proteína-disulfuro isomerasa asiste el plegamiento de proteínas que
contienen puentes disulfuro al modificar la posición de los mismos en las
moléculas que emplea como sustrato.

Funciones
La función principal de las enzimas pertenecientes a la clase de las
isomerasas puede verse como la de la transformación de un sustrato a
través de un pequeño cambio estructural, con el fin de hacerlo
susceptible a un procesamiento ulterior por enzimas aguas abajo en una
ruta metabólica, por ejemplo.
Un ejemplo de isomerización es el cambio del grupo fosfato en posición
3 al carbono en posición 2 del 3-fosfoglicerato para convertirlo en 2-
fosfoglicerato, catalizado por la enzima fosfoglicerato mutasa en la ruta
glucolítica, con lo cual se genera un compuesto de mayor energía que es
sustrato funcional de la enolasa.

Nomenclatura
La clasificación de las isomerasas sigue las reglas generales de la
clasificación de las enzimas propuestas por la Comisión de Enzimas
(Enzyme Commission) en el año 1961, en la cual cada enzima recibe un
código numérico para su clasificación.

La posición de los números en dicho código indica cada una de las

divisiones o categorías en la clasificación y estos números están
precedidos por las letras “EC”.

Para las isomerasas el primer número representa la clase enzimática, el

segundo denota el tipo de isomerización que realizan, y el tercero el
sustrato sobre el que actúan.

La nomenclatura de la clase de las isomerasas es EC.5. Posee siete

subclases, por lo que se encontrarán enzimas con el código desde EC.5.1
hasta el EC.5.6. Existe una sexta “sub-clase” de isomerasas conocida
como “otras isomerasas”, cuyo código es EC.5.99, ya que incluye
enzimas con diversas funciones isomerasas.

La denotación de las subclases se realiza principalmente de acuerdo con

el tipo de isomerización que estas enzimas realizan. A pesar de ello,
también pueden recibir nombres como racemasas, epimerasas, cis-
trans-isomerasas, isomerasas, tautomerasas, mutasas o ciclo
isomerasas.

Subclases
Existen 7 clases de enzimas dentro de la familia de las isomerasas:

EC.5.1 Racemasas y epimerasas

Catalizan la formación de mezclas racémicas basadas en la posición del

carbono α. Pueden actuar sobre aminoácidos y derivados (EC.5.1.1),
sobre grupos hidroxiácidos y derivados (EC.5.1.2), sobre carbohidratos y
derivados (EC.5.1.3) y otros (EC.5.1.99).

EC.5.2 Cis-trans-Isomerasas

Catalizan la conversión entre las formas isoméricas cis  y trans de

diferentes moléculas.

EC.5.3 Isomerasas intramoleculares

Estas enzimas se encargan de la isomerización de porciones internas en

una misma molécula. Existen algunas que realizan reacciones de
oxidorreducción, donde el donador y aceptor de electrones es la misma
molécula, por lo que no se clasifican como oxidorreductasas.

Pueden actuar inter convirtiendo aldosas y cetosas (EC.5.3.1), sobre

grupos ceto- y enol- (EC.5.3.2), cambiando la posición de dobles enlaces
C-C (EC.5.3.3), de enlaces disulfuro S-S (EC.5.3.4) y otras
“oxidorreductasas” (EC.5.3.99).

EC.5.4 Transferasas (mutasas) intramoleculares

Estas enzimas catalizan los cambios de posición de diversos grupos

dentro de la misma molécula. Se clasifican de acuerdo al tipo de grupo
que “mueven”.

Están las Fosfomutasas (EC.5.4.1), las que transfieren grupos amino

(EC.5.4.2), las que transfieren grupos hidroxilo (EC.5.4.3), y las que
transfieren otros tipos de grupos (EC.5.4.99).
EC.5.5 Liasas intramoleculares

Catalizan la “eliminación” de un grupo que forma parte de una molécula,

pero que no deja de estar unido covalentemente a la misma.

EC.5.6 Isomerasas que alteran la conformación

macromolecular

Pueden actuar alterando la conformación de polipéptidos (EC.5.6.1) o de

ácidos nucleicos (EC.5.6.2).

EC.5.99 Otras isomerasas

Esta subclase reúne enzimas como la Tiocianato isomerasa y la 2-

hidroxicromeno-2-carboxilato isomerasa.