Les principales voies du métabolisme

Cours de Biologie, Enseignant : P. HARDOUIN , 29/07/2018

TABLE DES MATIERES

I.Généralités...................................................................................................................................................4

1.Devenir et utilisation des nutriments dans l'organisme...........................................................................4

a.Devenir des nutriments après le repas.................................................................................................4

b.Devenir des nutriments lors d'une période de jeûne (de courte durée)...............................................5

2.Notions d'énergétique..............................................................................................................................6

a.Qu'est-ce que l'énergie ?......................................................................................................................6

b.Application avec le Glucose :.............................................................................................................7

c.La molécule énergétique :...................................................................................................................7

3.Les coenzymes........................................................................................................................................9

a.Rappel :...............................................................................................................................................9

b.Rôle des coenzymes comme réactifs de transfert de groupe.............................................................10

II.Le métabolisme des glucides....................................................................................................................13

1.La glycogenèse......................................................................................................................................14

2.Glycogénolyse.......................................................................................................................................14

3.La glycolyse..........................................................................................................................................14

a.Devenir des 2 molécules de pyruvate................................................................................................15

b.La chaîne respiratoire........................................................................................................................16

c.Cycle de Krebs..................................................................................................................................18

III.Métabolisme des acides aminés..............................................................................................................20

1.Devenir des protéines alimentaires.......................................................................................................20

2.Catabolisme des acides aminés.............................................................................................................21

a.Désamination oxydative....................................................................................................................21

b.Réaction de transamination...............................................................................................................21

c.Réaction de décarboxylation.............................................................................................................22

d.Couplage désamination-transamination............................................................................................23

1
LES PRINCIPALES VOIES DU MÉTABOLISME

e.Devenir de l'ammoniac......................................................................................................................23

IV.Le métabolisme des lipides.....................................................................................................................25

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I. Généralités
1. Devenir et utilisation des nutriments dans l'organisme
a. Devenir des nutriments après le repas

MUSCLES Autres Tissus TISSUS ADIPEUX

Protéines Glycogène Triglycérides

E
A.A. E Glc
Lipogénèse

Glc
Glc

FOIE tube digestif

Glycogénogénèse
Glycogène Glc Glc Fru-Gal-Glc

Triglycérides Acides gras

(Energie) Lipogénèse

E Acides aminés A.A. Acides aminés

Figure 1 : état post-prandial

Les triglycérides :

 Lieu de stockage : tissu adipeux selon 3 origines

 Une fraction est oxydée dans tous les organes

Les acides aminés (A.A.) :

 Source d'énergie pour le foie

 Peuvent être transformés en acides gras

 Participation aux synthèses protéiques dans toutes les cellules

Le glucose :

3
LES PRINCIPALES VOIES DU MÉTABOLISME

 Source d'énergie principale

 Stockage dans le foie et les muscles

 Transformation en triglycérides et stockage dans le tissu adipeux

b. Devenir des nutriments lors d'une période de jeûne (de courte durée).

MUSCLES Autres Tissus TISSUS ADIPEUX

Protéines Glycogène Triglycérides

E

Glc
A.A.

Lactate Ac. gras Ac. gras Glycérol

+
Pyruvate
E

néoglucogénèse
néoglucogénèse

FOIE système nerveux

néoglucogénèse Glc Glc E

glycogénolyse

Glycogène

Figure 2 : état de jeûne

Problème essentiel : maintenir la glycémie constante car le système nerveux ne peut utiliser que le
glucose comme source d'énergie. Or le glucose n'est plus absorbé au niveau du tube digestif (période de
jeûne). Les sources de glucose sanguin sont au nombre de 4 : Glucose hépatique et les 3 voies de la
néoglucogenèse. Les Triglycérides sont la première source d"énergie utilisée en cas de jeûne. Si la période
de jeûne est de courte durée, les réserves de glycogène suffisent.

Si la période de jeûne est de longue durée, il se produira une protéolyse afin de transformer les acides
aminés en glucose et tous les organes (sauf le cerveau) utiliseront les acides gras comme source d'énergie
afin d'épargner au maximum la glycémie.

4
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2. Notions d'énergétique

SANG
ENZ. DIGESTIFS
Aliments Nutriments CELLULE
[tube digestif]

Nutriments contiennent de l'énergie chimique

potentielle
catalyseur =
déclencheur de la
O2 Enzyme réaction

Nutriments

ENERGIE CHIMIQUE

but de la cellule : effectuer un

travail cellulaire

a. Qu'est-ce que l'énergie ?

C'est la capacité à effectuer un travail. Toutefois, cette énergie existe sous deux formes : énergie cinétique
(énergie de mouvement, eg : la pierre qui tombe) ou énergie potentielle (énergie de position, eg : énergie
contenue dans la pierre).

énergie potentielle
énergie spontanée

énergie cinétique
énergie non spontanée

Les deux énergies sont inter-convertibles soit de façon spontanée (c'est la pierre qui tombe et qui passe de
son niveau énergétique haut à son niveau énergétique bas = réaction exergonique), soit de façon non
spontanée (c'est la pierre qui remonte vers son niveau énergétique haut : il faut pour se faire apporter de
l'énergie à la pierre = réaction endergonique).

Toutefois, pour libérer l'énergie potentielle et transformer celle-ci en énergie cinétique il faut une énergie
d'activation (eg : la clé que l'on tourne dans la voiture démarre le moteur)

énergie d'activation
énergie
potentielle

énergie cinétique

Figure 3 : différentes énergies

5
LES PRINCIPALES VOIES DU MÉTABOLISME

Unités énergétique : kJ (le kilojoule)

Couplage énergétique : Les réactions endergoniques sont couplées à des réactions exergoniques.

A+B C+D Réaction exergonique

Ep= 1000 kJ Ep= 800 kJ
E 200 kJ

E+F G+H Réaction endergonique

Ep= 70 kJ Ep= 240 kJ

E 30 kJ
Chaleur

b. Application avec le Glucose :

oxydation
C6H12O 6 + 6 O 6 OH 2 + 6 CO2
2
sucre réducteur 2815 kJ
E chimique forte Réaction exergonique
E E chimique faible

30,5 kJ
38 OH 2 + ATP 38 ADP + Pi
E chimique forte E chimique faible Réaction endergonique

Pertes : 2815 - (30,5 x 38) = 1656 kJ

T=37°C E thermique chaleur

Quantité d ' énergie utilisable 1159 x 100

= =41,2%
Quantité d ' énergie globale 2815

1656 x 100
rendement des pertes= =58 ,8 %
2815

c. La molécule énergétique :
A = Adénosine (Adénine + Ribose) A = Adénosine
T = Tri D = Di
P = Phosphate P = Phosphates

6
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Adénine

Ribose P P P

NH 2 liaisons à haut potentiel énergétique

on peut y stocker 30,5 kJ
C N
N C
CH H2 O O O
HC C N
N O C O P O P O P OH
HC CH OH OH OH
HC CH
OH OH liaison à faible potentiel énergétique
on peut y stocker 10,5 kJ

Adénosine + Acide phosphorique (Pi) + 10,5 kJ  adénosine mono-phosphate + H2O

AMP + Pi + 30,5 kJ  ADP + H2O

ADP + Pi + 30,5 kJ  ATP + H2O

NH2
C N
N C adénine
CH
HC C N
N H2 O O O
C O P O P O P OH
OH OH OH
O
HC CH
ribose
H C CH
OH OH
adénosine
AMP
ADP
ATP

Figure 4 : adénosine, AMP, ADP, ATP

L'ATP (au niveau cellulaire) ne sert pas vraiment à stocker de l'énergie (dans la cellule on stocke l'énergie
sous forme de glycogène) ; par contre c'est une molécule de transfert énergétique : elle peut transporter
l'énergie là où l'on en a besoin.

On a besoin de sous pour vivre. Le lieu de stockage est la banque (foie) qui stocke sous forme de lingots
d'or (glycogène). Nous, non ne paye pas en lingots mais en petites pièces (ATP). Nous dépensons en
fonction de nos besoins. Nous avons besoin de ressources pour fournir l'argent à la banque (petit-déjeuner,
déjeuner…).

7
LES PRINCIPALES VOIES DU MÉTABOLISME

3. Les coenzymes
Le métabolisme énergétique (eg : réaction d'oxydation cellulaire du glucose :
C6H12O6 + 6 O2  6 CO2 + 6 H2O) ne s'effectue pas en une seule étape mais nécessite l'intervention de
nombreuses réactions enzymatiques. Les principales étant des réactions de déshydrogénation et de
décarboxylation. Les deux réactions se font par le biais d'enzymes décarboxylases et déshydrogénases.
Ces enzymes ne peuvent travailler seules. Il leur faut l'aide de coenzymes.

Qu'est-ce qu'un coenzyme ? C'est quelque chose qui aide l'enzyme à fonctionner.

NAD = Nicotinamide Adénine Dinucléotide

 Nicotinamide : synthétisé par vitamine PP ou tryptophane = acide aminé essentiel

 Adénine : base azotée

 Dinucléotide : 2 riboses

NH2 H O
C N NAD + = NAD sous
N C NH2 forme oxydée
CH H2 O O H2
HC C N
N O C O P O P O C N+
O
HC CH 5 OH OH
1
HC CH
OH OH OH
2 H , 2 e-
+
NAD = transporteur de protons

NH2 O
H H
C
N C N NH2
CH H2 O O H2
+
HC C N H
N O C O P O P O C
O N NADH + H + = NAD sous
HC CH OH OH forme réduite
H C CH
OH OH OH

+
NADP oxydé
NH2 O
+ -
H H 2 H ,2e
C N
N C NH2
CH H2 O O H2 +
H
HC C N
N O C O P O P O C N
O
HC CH OH OH +
NADPH, H réduite
H C CH
OH OH
O
HO P O
OH

a. Rappel :
Equation enzymatique : E+SESE+P

Classes enzymatiques : oxydoréductases, transférases, hydrolases, lyases, isomérases, ligases

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Certains enzymes ne travaillent qu'en présence d'une coenzyme.

Une coenzyme est une molécule organique spécifique thermostable et de faible poids moléculaire.
L'ensemble enzyme & coenzyme constitue l'holoenzyme (apoenzyme + coenzyme). La coenzyme peut
être liée de façon covalente ou non à l'apoenzyme. Si la coenzyme est liée de façon covalente on parlera
de groupe prosthétique (eg : hémoglobine  le fer est le cofacteur, le coenzyme).

Les enzymes nécessitant des coenzymes sont :

 Oxydoréductases

 Transférases

 Isomérases

 Ligases

Les enzymes ne nécessitant pas de coenzymes sont :

 Hydrolases

 Lyases

La coenzyme est souvent envisagée comme cosubstrat de la réaction ou second substrat réactionnel :

NADH + H + NAD +

O OH
H 3C COOH Pyruvate acide lactique H C C COOH
3
enzyme = déshydrogénase H

+ +
2H + NAD + NADH + H

b. Rôle des coenzymes comme réactifs de transfert de groupe.

Eg : déshydrogénation ou transamination.

Equation globale : D-G+A  A-G+D

D -G CoE A -G
G G

D Co-G A

transférase, application : désamination

Coenzymes élémentaires

9
LES PRINCIPALES VOIES DU MÉTABOLISME

élément enzymes
Fe2+ / Fe3+ Cytochromes, peroxydases, catalases
Cu+ / Cu2+ Cytochrome oxydase, tyrosinase
Mg2+ Phosphotransférase
Mn2+ Arginase, enzyme à biotine
Zn2+ Alcool déshydrogénase, anhydrase carbonique
K+ Pyruvate kinase
Na+ Pompe sodium – potassium
Mo3+ / Mo6+ Xanthine oxydase, sulfite oxydase
Se Glutathion peroxydase
Cl- -amylase, enzyme de conversion
Ni2+ Uréase
Ca2+ Phosphorylase kinase

COENZYMES ORGANIQUES
Coenzyme et abréviation Vitamine ou facteur de Principales fonctions
croissance apparente
COENZYMES DES OXYDOREDUCTASES

I- Nicotinamide-adénine-dinucléotide (NAD)
Tryptophane, nicotinamide
Nicotinamide-adénine-dinucléotide-phosphate
(NADP)
Oxydoréduction (déshydrogénase,
II- Flavine-mononuclétide (FMN) oxygénases, transporteurs de la chaîne
Vitamine B2 ou riboflavine respiratoire)
Flavine-adénine-dinucléotide (FAD)
III- Groupement prosthétiques des cytochromes
IV- Coenzymes quinoniques (ubiquinones)
V- Tétrahydrobioptérine Aucun Hydroxylation Phe, Tyr, Trp
COENZYMES DES AUTRES CLASSES

I- Carboxylations, décarboxylations

1. Biotine Biotine -carboxylation

2. Thiamine pyrophosphate (TPP) Vitamine B1 ou thiamine décarboxylation d'acides –cétoniques

3. Acide lipoïque Acide lipoïque décarboxylation oxydative d'acides -

cétoniques

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II- Transferts de radicaux monocarbonés

(sauf carboxyle)

1. Méthylcobalamine Vitamine B12 (cobalamine) Transfert de méthyle

2. S-adénosyl-méthionine Méthionie Transfert de méthyle

3. Tétrahydrofolate (THF) Acide folique Transfert de tous les radicaux

monocarbonés
III- Transfert d'acyle
Coenzyme A (CoA-SH) Acide pantothénique
IV- Nucléotides et dérivés
Adénosine triphosphate (ATP) Transfert d'énergie, P, PP et AMP
Phospho-adénosine-phosphosulfate (PAPS) Transfert de sulfate
Uridine triphosphate (UTP)
UDPGlc, UDPGal Transfert d'oses
Transfert d'énergie, de P
Guanosine triphosphate (GTP)
Transfert d'oses
GCPmannose

Cytidine triphosphate (CTP)

Transfert d'amines (choline, etc…)
CDPcholine
V- Métabolisme des amino-acides
Phosphate de pyridoxal (PAL) Vitamine B6 ou pyridoxine
VI- Isomérisations
Adénosylcobalamine Vitamine B12 (cobalamine)

NH2 O NH

N N H N O
H2 O O
N N H H H
O C O P O P O C C C C C N N H
H2 H
OH OH OH OH OH 2

OH OH ribitol
H3C CH 3

Figure 5 : FAD : Flavine Adénine Dinucléotide

- 2H , 2e -
+ +
FAD oxydé 2H , 2e FMN

FADH 2 réduite FMNH2

Figure 6 : Coenzymes FAD et FMN

11
LES PRINCIPALES VOIES DU MÉTABOLISME

II. Le métabolisme des glucides

DEGRADATION
BIOSYNTHESE GLYCOGENE

GLYCOGENOLYSE GLYCOGENOGENESE

GLUCOSE GLUCOSE 6-PHOSPHATE VOIE DES

PENTOSES
PHOSPHATES
GLYCOLYSE
NEOGLUCOGENESE

PYRUVATE
en anaérobiose en aérobiose

LACTATE ACETYL-CoA

CYCLE
DE
KREBS

+
CHAINE
RESPIRATOIRE

FERMENTATION RESPIRATION

Foie
stockage = glycogénèse
Glucose
alimentaire muscle
énergie = ATP 3 réactions :
cytoplasme cellulaire - Glycolyse (respiration anaérobie)
mitochondries - Cycle de Krebs (respiration aérobie)
"centrale énergétique" - Phosphorylation oxydative
de l'organisme

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1. La glycogenèse

ATP ADP UTP PPi

Glucose sanguin
responsable de la Glc hépathique G6 P G1 P UDP-Glucose
glycémie 0,8-1,2g/L 1 3
myocyte 2
Glycogène
hépatocyte ( C6H10O5 )
ATP n 5

ADP UDP

Glycogène
( C6H 10O5)
UTP ramifié n+1
6

1 : glucokinase (= kinase : ajoute un acide phosphorique)

2 : phosphoglucomutase = mutase

3 : UDP glucophosphorylase

4 : Glycogénosynthase

5 : Enzyme branchante

2. Glycogénolyse
Glycogène
linéaire membrane
(C H O ) 1 hépatocyte
6 10 5
n
2 3
G1 P G6 P Glc Glc sanguin

( C6H10O 5 )
n-1

Seul le Glc est capable de passer la membrane cytoplasmique, G1P ou G6P sont capables de sortir de la
cellule.

1 : Phosphorylase

2 : Phosphoglucomutase

3 : Glucose phosphatase

La glucose phosphatase n'existe que dans le foie. Dans le muscle il y a aussi une réserve.

3. La glycolyse
S'effectue dans toutes les cellules sauf les adipocytes (utilisent les acides gras) et le foie (utilise les acides
aminés).

13
LES PRINCIPALES VOIES DU MÉTABOLISME

sang Cellule foie sang

muscle

glucokinase
ATP ADP ATP ADP ATP ADP
DHAP
Glucose Glc G6 P Glycolyse Glc G6 P F6P F1-6 diP isomérase
G6-phosphatase
isomérase phosphofructokinase
[Glycéraldéhyde-3P]
+
mutase 2 NAD Pi
+
G1 P 2ADP 2ATP 2 NADH, H G3P-déshydrogénase

UTP 2(1-3-diphosphoglycérate)
Glc 2 pyruvate
PPi 2ADP
+ + 3-phosphoglycératekinase
UDP-Glucose 2NAD 2NADH,H 2 ATP
glycogène
glycogène 2(3-phosphoglycérate)
synthase
UTP
2ATP 2ADP
Glycogène
2 pyruvate (PEP)2 (2-phosphoglycérate)2 mutase
énolase
pyruvate kinase

Cet ensemble de réactions s'effectue dans le cytosol.

Glycolyse s'effectuant en milieu ANAEROBIE.

a. Devenir des 2 molécules de pyruvate

deux devenirs différents suivant la situation anaérobie (O2) ou aérobie (O2).

+ +
2 NADH, H 2 NAD

2 pyruvate 2 lactate
lactate déshydrogénase
O OH
H3 C H3C COOH
COOH
H

Figure 7 : Anaérobie : l'opération se fait dans le cytosol

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glycolyse 2 lactate
+ +
2NADH,H 2NAD

2 pyruvate

O mitochondrie

H3C COOH pyruvate

2 NAD + CoASH
pyruvate déshydrogénase
+ CO 2
O 2 NADH, H

H 3C S CoA acétyl-CoA

cycle de Krebs

Figure 8 : Aérobie : le pyruvate entre dans la mitochondrie

b. La chaîne respiratoire
(régénération des co-enzymes réduits)

Les co-enzymes sont dans la matrice mitochondriale. La chaîne respiratoire va permettre de régénérer les
co-enzymes réduits.

1 + 1 1
CoE H O2 NADH,H O2 FADH O2
réduit 2 2 réduit 2 réduit 2 2
oxydé oxydé oxydé

OH2 + OH2 FAD OH2

CoE NAD
oxydé réduit oxydé réduit oxydé réduit
- -
2e e- 2e

ADP+Pi ATP 3 ADP+Pi 3 ATP 2 ADP+Pi 2 ATP

Figure 9 : coenzymes NAD et FAD

Ces réactions d'oxydoréduction s'effectuent au niveau de la membrane interne de la mitochondrie et à

l'aide d'enzymes et de coenzymes à savoir des enzymes de transport de protons (H+) du transporteur réduit
(NAD ou FAD) du O2 et d'autre part des enzymes de couplage énergétique le tout constitue la chaîne
respiratoire.

But de la chaîne respiratoire : faire passer des protons et des électrons d'un potentiel le plus électronégatif
vers un potentiel le plus électropositif.

15
LES PRINCIPALES VOIES DU MÉTABOLISME

Glycolyse chaîne respiratoire

Pyruvate

Pyruvate
C.K.

matrice AcétylCoA

Figure 10 : localisation mitochondriale de la chaîne respiratoire

Les protons libérés dans l'espace inter membranaire par le CoEQ ressortent vers la matrice de la
mitochondrie via un complexe F0/F1.

F0 = canal protéique à protons

F1 = complexe ATP/synthétase

Le transfert des 2 protons au travers de F0 permet de faire fonctionner F1 et donc de fabriquer une
molécule d'ATP

Dans l'espace inter-membranaire, H+ rencontre O2 qui le capte pour former de l'eau.

2 ADP Gycolyse

+
2ATP 2 NADH, H 6 ATP
2 pyruvate

+
2 NADH, H 6 ATP

2 acétylCoA

4 ATP 2 FADH Cycle

2 Krebs +
6 NADH, H 18 ATP

2 ADP

2ATP

Figure 11 : glycolyse et cycle de Krebs

16
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c. Cycle de Krebs
Dans la matrice de la mitochondrie

acétylCoA

CoASH

citrate synthétase

oxaloacétate
+ OH2 citrate
NADH, H OAA

aconitase
NAD + malate
déshydrogénase

malate
isocitrate
+
fumarase CYCLE DE NAD
isocitrate CO2
KREBS déshydrogénase
OH2 +
NADH, H

alpha-cétoglutarate
fumarate
CoASH
NAD +
succinate CO2
FADH2 déshydrogénase
alpha cétoglutarate déshydrogénase
+
NADH, H
FAD OH2
Succinate succinylCoA

succinate thiokinase

ATP ADP+ Pi
CoASH

Figure 12 : cycle de Krebs

17
LES PRINCIPALES VOIES DU MÉTABOLISME

Glucose (C6H12O6)
2 ADP + 2 Pi

2 ATP
2 NAD+
déshydrogénase
+
2 NADH, H membrane membrane
externe interne
2 acides pyruviques
CYTOPLASME

MITOCHONDRIE
2 acides pyruviques
2 NAD+
+
2 NADH, H complexe
déshydrogénase-décarboxylase

2 Coenzyme A
2 acétylcoenzyme A acides aminés

CO 2

décarboxylases

+ CYCLE DE
2x4 NADH, H KREBS
+ 2 CO2
2x4 NAD
2 CO 2
déshydrogénases

2 ATP 2 ADP + 2 Pi

crête

6 O2
ADP + Pi
+ membrane
2H interne
membrane
externe
n NAD+ chaîne respiratoire ATP 6 OH2

ATP synthétase

Bilan pour 1 glucose 38 ATP

Figure 13 : catabolisme des glucides

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III. Métabolisme des acides aminés

1. Devenir des protéines alimentaires
Alimentation  protéines alimentaires (végétales et animales)  acides aminés (par l'action de protéases)

Acides aminés non-indispensables, indispensables (Tryptophane, Valine, Leucine, Isoleucine, Valine,

Thréonine, Méthionine, Phénylalanine), acides aminés pseudo indispensables (Arginine, Histidine).

Protéines tissulaires Protéines alimentaires

Pool d'acides
Glucides
aminés Lipides
T
NH3 T T
Composés azotés
(acides nucléiques)
Acétyl-CoA T

urée Corps cétoniques

Energie T= transamination

Figure 14 : les acides aminés

Le "turn-over" des protéines tissulaires est de 1 à 2%. C'est à dire que 1 à 2% des protéines tissulaires sont
dégradés en acides aminés. 75% des acides aminés obtenus servent à synthétiser d'autres protéines. Le
reste est soit dégradé sous forme de déchets (urée), soit on en fait des glucides ou des corps cétoniques.
Ce qui signifie que la perte nette journalière en protéines est de 30/40g. Pertes en azote de 5 à 7g/jour.

Protéines tissulaires

CATABOLISME ANABOLISME
20 à 35 g d'N/jour 15 à 25g d'N/jour

acides aminés

Pertes
5 à 7g d'N/jour

urine selles

Figure 15 : anabolisme et catabolisme des acides aminés

Il n'y a pas de stockage d'acides aminés.

Bilan de N : équilibre : entrées = sorties

Mais parfois ce bilan peut être positif Entrée > Sortie

(eg : femme enceinte, nourrisson, adolescent)

19
LES PRINCIPALES VOIES DU MÉTABOLISME

Ou bien peut être positif Entrée < Sortie

(eg : personnes atteintes de maladies nutritionnelles ; anorexie, Kwashiorkor)

2. Catabolisme des acides aminés

a. Désamination oxydative

H O
R COOH + OH 2 + coenzyme R COOH + NH 3 + coenzyme-2H
NH 2
acide aminé acide cétonique ammoniac

Figure 16 : désamination oxydative

Eg :

Glutamate
Glutamate déshydrogénase
Glu + OH 2 + NAD + alpha-cétoglutarate + NADH, H +
Ac. glutamique
NH 3
Cycle de Krebs

Figure 17 : exemple de désamination oxydative

b. Réaction de transamination
réaction de transfert de la fonction amine

H O O H
R1 COOH + R2 COOH R1 COOH + R2 COOH
NH 2 NH 2

acide aminé acide aminé acide cétonique acide aminé

Figure 18 : transamination

Eg :

20
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Pyruvate ASP (Aa) OAA

alanine trasamine (Aa) (corps cétonique)
(corps cétonique) Aspartine transamine
transamination transamination

alpha-cétoglutarate Glutamine (Aa) alpha-cétoglutarate Glutamine (Aa)

désamination désamination
oxydative oxydative

NH 3 NH 3

Figure 19 : exemple de transamination

c. Réaction de décarboxylation

H décarboxylase
R NH 2 R C NH 2 + CO 2
H2
COOH
COOH

acide aminé
Figure 20 : décarboxylation

21
LES PRINCIPALES VOIES DU MÉTABOLISME

d. Couplage désamination-transamination

Coenzyme Coenzyme-2H

OH 2 désamination NH 3
oxydative
COOH
H COOH O
C C C COOH
H 2 H2 C C C COOH
NH2 H2 H 2
acide glutamique acide alpha-cétoglutarique

transamination

O H
H3C C COOH
H3C C COOH
acide pyruvique
NH2
alanine

Figure 21 : désamination + transamination

e. Devenir de l'ammoniac
Cycle de l'urée : consomme 4 molécules d'ATP par mole d'urée synthétisée

22
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CO2+NH3
2 ATP

2 ADP+Pi
H2N O
O H2N
P
H2N
urée carbamyl-phosphate

ornithine

Pi
OH2

Cycle de
arginine l'urée citrulline
H
HOOC C C COOH
H
NH2 2
aspartate
ATP

fumarate arginino-
succinate

AMP + P-P

Figure 22 : cycle de l'urée

Cette voie est consommatrice d'ATP : l'organisme doit dépenser de l'énergie pour ce processus de
détoxication.

Bilan énergétique : - 4 ATP / mole d'urée synthétisée.

Cellule
Désamination oxydative
Acides Acides
aminés cétoniques

NH3
Ammoniac

Sang

Ammoniac Foie

CO2

Excrétion sous forme de protéines de Excrétion

desquamation de la peau, de Urée
l'organisme urinaire
O
perte des cheveux, etc... (minime)
H2N C NH2 NH 3
Urée Protéines et acides
aminés du régime
Sang alimentaire Pool des Glucides et
acides aminés NH 3 lipides
Reins Excrétion urinaire
(minime)
Urée

Dérivés des acides aminés contenant de l'azote

(nucléotides, hormones, créatine, etc...)
Urine

Figure 23 : métabolisme des acides aminés

23
LES PRINCIPALES VOIES DU MÉTABOLISME

IV. Le métabolisme des lipides

Glycérol
Triglycérides
3 acides gras

ATP ADP NAD NADH, H

Glycérol Glycérol 3P DHAP
glycérolkinase glycéroldéshydrogénase

glycolyse

Figure 24 : catabolisme des lipides

Acides Gras : entrent dans un cycle de -oxydation au niveau de la matrice mitochondriale

-oxydation des acides gras (matrice mitochondriale), les réactions se font en chaîne et on l'appelle
"hélice de Lynen".

acide gras Cn H3 C C COOH

ATP H2 n
CoA-SH
AMP+PPi acylCoA synthétase O
Acyl-CoA H3 C C S CoA
FAD H2 n-2

acylCoA déshydrogénase
FADH2 O
transdéhydroacyl-CoA H3 C C C C S CoA
H2 n-2 H H
OH2
hélice de transhydratase
H H O
Lynen
L-hydroxyacyl-CoA H3C C S CoA
+ H2 n-2
NAD OH H
NADH+H +
hydroxy-acylCoA déshydrogénase
O O
CétoAcyl-CoA H3C C C S CoA
CoA-SH H2 n-2 H2
O
céto acyl thiolase
H3 C C S CoA
H2 n-2
Acétyl-CoA

Cycle de Krebs

Chaîne respiratoire
(12 ATP)

Figure 25 : béta-oxydation des acides gras

24
 Cours de Biologie, Enseignant : P. HARDOUIN , 29/07/2018

O
H3 C C
H2 n OH
CoA-SH

FAD

FADH2

OH2

NAD +
+
NADH+H

Acétyl-CoA
O
H3 C C
H2 n-2 OH

Acide stéarique (C18)

Stéaryl-CoA(C18)
+
4H
Acétyl-CoA Palmityl-CoA(C16)
CoA-SH +
4H
Acétyl-CoA
Myristyl-CoA(C14)
CoA-SH +
4H
Acétyl-CoA
Lauryl-CoA(C12)
CoA-SH + 8 FAD 8 FADH 2
4H
Acétyl-CoA 8 NAD + 8 NADH+H +
Capryl-CoA(C10)
9 acétyl-CoA CoA-SH +
4H
Acétyl-CoA Caprylyl-CoA(C8)
CoA-SH +
4H
Acétyl-CoA
Caproyl-CoA(C6)
CoA-SH +
4H
Acétyl-CoA Butyryl-CoA(C4)
CoA-SH +
4H
Acétyl-CoA Acétyl-CoA(C2)
CoA-SH

Figure 26 : hélice de Lynen

25
LES PRINCIPALES VOIES DU MÉTABOLISME

Bilan : pour un acide gras en C18 (18/2=9 ; 9-1=8; 8 tours d'hélice)

8 x 12=96 ATP
8 x 5=40 ATP ( NADH et FAD )
1 x 12=12 ATP ( Dernier tour )
−2 ATP (1 ère étape)
TOTAL 146 ATP

Figure 27 : bilan énergétique catabolisme d'un acide gras en C18

pour un C24 : 12-1= 197 ATP

Glc

DHAP Glycérol

Pyruvate

Acides gras Acétyl-CoA A.a.

Cycle de
Krebs

Figure 28 : synthèse d'acides gras à partir de glucides

eg : lorsque l'on mange une religieuse au chocolat et que l'on ne dépense pas ce sucre par un footing, le
glucose ne se dirige pas vers le Cycle de Krebs mais vers les Acides Gras. Il y a conservation d'un peu de
sucre pour fabriquer du glycérol (glycérol + 3 acides gras = triglycéride)

La transformation du glucose en acides gras + glycérol = triglycéride s'appelle la lipogenèse (a lieu dans
le foie et les tissus adipeux).

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