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proteínas y enzimas
EN E S T A U N I D A D
16.1 Fundones
de las proteínas
16.2 Aminoácidos
16.3 Acidez y basicidad
de los aminoácidos
16.4 Formación de péptidos
16.5 Niveles estructurales
de las proteínas
16.6 Enzimas
16.7 Acción enzimàtica
16.8 Factores que afectan
a la actividad enzimàtica
16.9 Cofactores enzimáticos
«Estoy criando este cordero con Lamb Lac, que es un sustituto
sintético de la leche de oveja», nos cuenta Dennis Samuelson,
granjero a tiempo parcial «Una oveja tuvo trillizos y no tenía
suficiente leche para alimentar a todas sus crías, así que no se
estaban desarrollando del modo en que debían. El Lamb Lac está
preparado con leche desnatada y suero en polvo, proteínas de leche,
albúmina de huevo, los aminoácidos metionina y lisina, vitaminas y
minerales».
Los técnicos veterinarios diagnostican y tratan las enfermedades
de los animales, toman muestras de sangre y de tejidos y les
c ® hem istry administran medicamentos y vacunas. Por su parte, los técnicos
* c place
agrónomos estudian la manera de incrementar las cosechas de las
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encontrarás cuestiones adicionales, granjas y su productividad, con el fin de asegurar una fuente
tutoriales interactivos, información estable de alimentos. Buscan formas de aumentar el rendimiento de
profesional, diapositivas en los cultivos, desarrollan técnicas más seguras para controlar las
PowerPoint para repasar el capítulo,
ayuda para resolver las operaciones
malas hierbas y las plagas y diseñan métodos para la conservación
matemáticas y casos prácticos. del suelo y del agua.
a palabra proteína procede del término griego proteios, que significa
«primero». Todas las proteínas humanas son polímeros construidos a
partir de 20 aminoácidos diferentes, y cada una de ellas está formada
553
554 CAPÍTULO 16 AMINOÁCIDOS, PROTEÍNAS Y ENZIMAS
E J E R C IC IO R E S U E L T O 16.1
■ Clasificación de las proteínas según su función
Indica el tipo de proteínas que realizan las siguientes funciones:
a Catalizan las reacciones metabólicas de los lípidos.
b. Transportan el oxígeno por el torrente sanguíneo.
c. Almacenan los aminoácidos de la leche.
SOLUCIÓN
jA H O R A TÚ!
¿Qué tipo de proteínas ayudan a regular el metabolismo?
R O
HjO + I
H3N—C— C—O“
H
Carbono a Ion dipolar (zwiterión)
16.2 AMINOÁCIDOS 555
A u n q u e r e s u l ta m á s c ó m o d o d ib u ja r lo s a m in o á c id o s c o n s u s g r u p o s fu n c io n a le s e n
e s ta d o n e u tro , e n r e a l id a d se e n c u e n tra n io n iz a d o s a l p H d e la m a y o ría d e l o s flu id o s c o r p o -
r a le s . E n c o n d ic io n e s f isio ló g ic a s , e l g ru p o — C O O H p ie rd e u n H + p a r a fo rm a r — C O O " y
e l g r u p o — N H j g a n a u n H + f o rm a n d o — N H g \ A l t e n e r u n e x tre m o c o n c a r g a p o s itiv a y o tr o
c o n c a r g a n e g a tiv a , lo s a m in o á c id o s s o n io n e s d ip o la re s , ta m b ié n lla m a d o s z w k o i o n e s .
E JE R C IC IO R ESU ELTO 16 . 2
F ó rm u la s e stru c tu ra le s d e lo s am in o á c id o s
D ib u ja l a e s tr u c tu ra d e l i ó n d ip o la r y e s c rib e la a b r e v ia tu r a d e l o s s ig u ie n te s a m in o á c i-
d o s:
a . a la n in a (R = — C H J b . se riñ a (R = — C H jO H )
S O LU C IÓ N
a . E l ió n d ip o la r s e d ib u ja u n ie n d o la c a d e n a la te ra l (R ) a l á to m o c e n tra l d e l a m in o á c id o
e n f o r m a d e ió n d ip o la r:
a la n in a (A la )
CH, Grupo R
NH3— CH — COO"
h. s e rin a (Ser)
OH
CH2
NH3— CH — COO"
¡A H O R A TÚ !
C la s ifi c a lo s a m in o á c id o s d e l p ro b le m a a n te rio r c o m o p o la re s o n o p o la re s .
c h 3 ch 3 c h 3
\ / T
c h 2
CH3 c h 3
H c h 3
\ /
CH
fC H 2 c h 3- c h
H H H H H
Glicina (Gly) Alanlna (Ala) \fcllna (\fcl) Leucina (Leu) Isoleucina (De)
6 ,0 * 6,0 6,0 6,0 6,0
)H O nh2
\ /
C
OH ch3 SH ch2
<j¡H2 h c ^o h <pH2 C^H2 CpH2 <j*í 2
NH2
Y í=iNH2
C nh3
ch2 c h 2 NH
H3Ñ—C—COO" H3Ñ—C—COO" c h 2 c h 2
H H ^H 2 (Jh2
Ácido aspártico (Asp) Acido glutámico (Glu)
2,8 sa H sÑ — C -C O O ' h 3ñ — c—
H H H
Hlstldlna (Hls) Lisina (Lys) Arglnlna (Arg)
7,6 9,7
* Punto isoeléctrico
16.3 ACIDEZ Y BASICIDAD DE LOS AMINOÁCIDOS
e n la s p ro te ín a s . C o m p a re m o s lo s is ó m e ro s l - y D -g lic e ra ld e h íd o y lo s is ó m e ro s l - y D-ala-
n in a y l - y D -c iste ín a
CHO CHO
HO H H- OH
C H 2O H C H 2O H
L-Gliceraldehído o-Gliceraldehído
COO" COO"
H 3N — |— H H — |— N H 3
CH3 c h 3
L-Alanina D-Alanina
COO" COO'
H ,N - -H H ------N H 3
C H 2S H c h 2s h
L-Cisteína D-Cisteína
EJE R C IC IO S Y PROBLEM AS
A m inoácidos 169 N om bra lo s am inoácidos representados por las siguientes
abreviaturas:
163 Indica los grup os fu ncionales de todos los a-am ino ácido s. a A la h Val
164 ¿C óm o com pararías la polaridad de las cad enas laterales de la c L ys d Cys
le u d n a y de la serina?
1610 N om bra los am inoácidos representados por las siguientes
165 Dibuja el ión dipolar de los siguientes am inoácidos: abreviaturas:
a alanina h. treonina a T rp hM et
c á d d o glu tám ico <Lfenilalanina c Pro d G ly
166 D ibuja el ión dipolar de lo s sigu ientes am inoácidos: 1611 D ibuja la proyección de Fischer de los siguientes
a lisina h. á d d o aspártico am inoácidos:
c leucina d. tirosina a . L -valina b. D -dsteína
lft7 G a s ifíc a lo s am ino ácidos del problem a 16.5 com o hidrófobo s 1612 D ibuja la proyección de F ischer de los siguientes
(no polares), hidrófilos (polares, neutros), ácidos o básicos. am inoácidos:
168 C las ifíc alos am ino ácidos del problem a 16.6 com o hidrófobos a . l -treonina b. o-valina
(no polares), hidrófilos (polares, neutros), ácidos o básicos.
A n a lic e m o s lo s c a m b io s q u e s e p ro d u c e n e n la s fo rm a s ió n ic a s d e la a la n in a a l p a sa r d e l ió n
d ip o la r (p l = 6 , 0 ) a l ió n p o s itiv o , q u e s e fo rm a e n u n a d is o lu c ió n m á s á c id a , y , fin alm e n te ,
Profi&g/oxeg a l i ó n n e g ativ o , q u e a p a r e c e e n u n a d is o lu c ió n b á sic a .
con (fuím/ca
H30 + I H 30+
ch3
A lanina a p H < 6 Ión dipolar d e la alanina A lanina a p H > 6
(carga= 1+) p H = 6 .0 (caiga= 1 -)
(carga = 0 )
L o s v a lo re s d e p l d e lo s a m i n o á c id o s p o la r e s y d e lo s n o p o la re s s e e n c u e n tr a n e n tre 5,1 y
6 ,0 . L o s v a lo r e s d e p l d e lo s a m in o á c id o s á c id o s s o n m e n o r e s (a lre d e d o r d e 3 ), p o r q u e lo s
g r u p o s c a rb o x ilo d e la s c a d e n a s la te ra le s ta m b ié n a c e p ta n H \ L o s v a lo re s d e p l d e lo s a m i-
Especialista n o á c id o s b á si c o s s o n m a y o r e s (e n tre 7,6 y 10 ,8 ), y a q u e lo s g r u p o s a m in o d e las c a d e n a s
en rehabilitación la te ra le s ta m b ié n c e d e n H +. E n la ta b la 16.2 s e in c lu y e n l o s v a lo re s d e p l d e b a jo d e l n o m b re
«Me interesan los aspectos biom ecánicos d e c a d a a m in o á c id o .
de la rehabilitación, com o por ejem plo los
ejercicios de fortalecim iento para que la
gente pueda volver a realizar su s activida- E JE R C IC IO RESU ELTO 1 6 .3
des cotidianas», nos cuenta M in na Robles, ■ Aminoácidos en medio ácido y básico
es pe cialista e n rehabilitación . «A hora
estoy colocando una prótesis e n la m uñeca D ib u ja l a f ó rm u la e s tr u c tu r a l d e la s e rin a a p H 5 ,7, q u e e s s u p l.
que ay u dará a una paciente a levantar la
mano. E ste ejercicio tam bién co ntribuirá a SOLUCIÓN
que lo s m úsculos y el tejido blando de la
m uñeca se curen. E l conocim iento de los L a s e r in a e s tá e n la fo r m a d e ió n d ip o la r e n e l p l, c o n e l g r u p o á c id o c a rb o x ílic o y e l g r u p o
com puestos quím icos del cuerpo, el m odo a m in o io n iz a d o s.
en q ue in terac d o n a n y cóm o afectan al
cuerpo es im portante para nuestro trabajo.
Por ejem plo, frecuentem ente utilizam os la
técnica co n o d d a com o lib e rad ó n miofa-
d a l, en la que aplicam os presión a una par- N H 3— C H — C — O - lón dipolar de la se riña
te del cuerpo para que aum ente la d rcu la-
d ó n , con lo que s e consigue una m ejor ¡A H O R A TÚ!
m ovilización de los tejidos blandos y se
D ib u ja l a e s tr u c tu ra d e l a s e r in a a u n p H m e n o r q u e s u p l (5,7).
m ejora la am plitud del m ovim iento».
EJER C IC IO S Y PROBLEM AS
Acidez y basiddad de los aminoácidos
C .H 3N — C H — C O C T
1 6 1 3 Dibuja los siguientes am in oá d d os en form a de ión dipolar:
a glicina h d s te ín a c serina d alanina
M
1 6 1 4 D ibuja los siguientes am in oá d d os en fo rm a de ión dipolar: CHj CH S
a fenilalanina h m etionina c le u d n a d valina
16 1 5 D ibuja el ión positiv o (ión de la form a ád d a) de los 1 & 1 8 Las siguientes form as iónicas de la serina, ¿existirán a un pH
am in oá dd os del p roblem a 16.13, a un pH inferior a 1,0. mayor, m enor o igual al pl?
O o O H O
II , II Il I
H3N— CH2— C —O “ + H3N—CH— C — O ' H 3N — C H 2 — |C — N - f C H — C — O - + H 20
c h 3 c h 3
Nomenclatura de péptidos
P a r a n o m b r a r u n p é p tid o , s e c o m ie n z a p o r e l a m in o á c id o N -te rm in a l y d e s p u é s s e n o m b ran
l o s d e m á s a m in o á c id o s s e p a ra d o s p o r g u io n e s , s e g ú n e l o r d e n d e te r m in a d o p o r la se c u e n c ia ,
c o n la te r m in a c ió n il. F in a lm e n te , s e in d ic a e l n o m b re c o m p le to d e l a m in o á c id o C -te rm in a l.
P o r e j e m p lo , u n tr ip é p tid o f o r m a d o p o r a la n in a , g l ic in a y s e r in a s e n o m b ra c o m o a la n f l-
g l i c i - s e r i n a . P o r c o m o d id a d , la s e c u e n c i a d e a m in o á c id o s e n e l p é p tid o s e s u e le in d ic a r
m e d ia n te s u s c o rre s p o n d ie n te s a b re v ia tu r a s o c ó d ig o s d e 3 le tra s .
Gficina Alanina
pep tídico
F I G U R A 1 6 . 1 Formación de un enlace peptídico entre las formas iónicas dipolares de la glicina y de la alanina, para
formar el dipéptido glicil-alanina.
P ¿Entre qué grupos funcionales de la glicina y de la alanina se establece el enlace peptídico?
560 CAPÍTULO 16 AMINOÁCIDOS, PROTEÍNAS Y ENZIMAS
0 0 0
II II I
H 3N — C H — C — N H — C H — C — N H — C H — C — O '
(^H O H (^H 2
c h 3 c h c h 3
ch 3
a ¿ C u á l e s e l a m in o á c id o N - te rm in a l? ¿ C u á l e s e l a m in o á c id o C -te rm in a l ?
b . ¿ C u á l e s la s e rie d e a b re v ia tu r a s d e la s e c u e n c ia d e a m in o á c id o s d e l trip é p tid o ?
S O L U C IÓ N
a L a tre o n in a e s e l a m in o á c id o N -te rm in a l, la fe n il a la n in a e s e l C - te rm in a l.
b . T h r- L e u -P h e .
lA H ORA TÚ!
¿ C u á l e s e l n o m b re c o m p le to d e l trip é p tid o d e l e j e r c ic io r e s u e lto 1 6 .4 ?
EJER C IC IO S Y PROBLEM AS
Formación de péptidos 1&20 Dibuja las fórm ulas estructurales condensadas de los
siguientes péptidos y nóm bralos m ediante las correspondientes
16 19 Dibuja las fórm ulas estru cturales co nden sadas de los
abreviaturas:
siguientes péptidos y nóm bralos m ediante las correspondientes
a m etion il-ád do aspártico
abreviaturas:
h . alanil-triptófano
a alanil-fenilalanina c. m etio nil-glutam il-lisina
h serinil-fenilalanina
d W stidil-g lidl-glutam il-alanina
c. g lid l-a la n il-g lid n a
d valinil-isoleudl-triptó fan o
Estructura primaria
La estructura primaria d e u n a p ro te ín a e s s u s e c u e n c ia p a r tic u la r d e a m in o á c id o s , u n id o s
W EB TU TO RIAL m e d ia n te e n la c e s p e p tíd ic o s . P o r e je m p lo , la h o r m o n a q u e e s tim u la la tir o id e s p a ra q u e
Structure of Proteins g e n e re t ir o x i n a e s u n tr ip é p tid o c o n u n a s e c u e n c ia d e a m in o á c id o s G lu - H is -P r o . A p e s a r d e
Primary and Secondary Structure q u e o tr a s s e c u e n c ia s d e a m in o á c id o s s e rí a n p o s ib le s , c o m o H is -P r o - G lu o P r o - H is - G lu , e sta s
16.5 NIVELES ESTRUCTURALES DE LAS PROTEÍNAS 561
n o p re s e n ta n n in g u n a a c tiv id a d h o rm o n a l. C o m o se v e , la f u n c ió n b io ló g ic a d e lo s p é p tid o s
y d e la s p ro te ín a s d e p e n d e d e s u s e c u e n c ia d e a m in o á c id o s .
o +
V ,N H
c h 2
c h 2 o h c h 2 o h
H 3N - C H - C - N - C H - C — N — N — C H - C - O "
G lu H is P ro
Estructura secundaria
La estructura secundaria de u n a p ro te ín a e s e l tip o d e e s tr u c tu ra q u e s e o r ig in a c u a n d o l o s
a m in o á c id o s q u e la fo rm a n se u n e n e n tr e s í m e d ia n te e n la c e s d e h id r ó g e n o o c o n o t r a c a d e -
n a p o lip e p tíd ic a . L o s 3 tip o s m á s c o m u n e s d e e s tru c tu ra s e c u n d a ri a s o n la hélicealfa, l a hoja
plegada betay la triple hélice.
E n la héfice alia (héficea) se e s ta b le c e n e n la c e s d e h id ró g e n o e n tre lo s g r u p o s N — H y
lo s á to m o s d e o x íg e n o d e lo s g r u p o C = O d e a m in o á c id o s b a st a n te a le ja d o s e n tre s í e n la
c a d e n a (fig. 1 6.3 ). A l fo rm a r s e u n e le v a d o n ú m e ro d e e n la c e s d e h id r ó g e n o a l o la r g o d e
la c a d e n a p o lip e p tíd ic a , e s ta a d q u ie r e u n a e s tr u c tu r a h e li c o id a l, c o m o u n c a b l e d e te lé fo n o
e n r o lla d o e n e s p ira l, o u n m u e lle . L a s c a d e n a s la te ra le s (g ru p o s R ) d e lo s d if e re n te s « - a m i -
n o á c id o s se d is p o n e n h a c ia fu e ra d e la h é lic e .
Opiáceos endógenos ñas que se conocen. L a secu encia de am inoácidos d e las encefalinas
El cuerpo produce de m odo natural analgésicos, com o las encefalinas tam bién se encuentra incluida en la cadena m ás larga de las endorfi-
y las endorfinas, que son unos polipéptidos qu e se unen a ciertos recep - nas.
tores del cerebro aliviando el dolor. Parece que este efecto es el resp on - S e han identificado 4 grupos de endorfinas: las a -e nd orfin as (que
sable de la sensación de placer qu e experim entan algunos atletas, d e la co n tien en 16 am inoácidos), las /3-endorfinas (31), las 7 -endorfinas
ausencia m om entánea de d olor tras u n a lesión grave o de los efectos (17) y las 8 -endorfinas (con 27 am inoácidos). L as endorfinas producen
analgésicos de la acupuntura. su efecto sed ante bloqueando la liberación de la sus ta nc ia P, un poli-
Las encefalinas, pentapéptidos que se e ncu entran en el tálam o y e n péptid o form ado p o r 11 am inoácidos qu e transm ite al cerebro los
la m édula espinal, so n las m oléculas co n actividad op iácea m ás p eque- im pulsos nerviosos relacionados con el dolor.
a-Endorfina-
T yr — G ly — G ly — P h e — M e t— T h r— S e r — G lu — L y s— S e r — G lu — T h r — P ro — L e u — V a l— T hr
Ehcefalina • Leu
G lu — G ly — L y s— L y s — T y r— A la — A s n — L y s— D e— l ie — A la — A s n — L y s — P he
/3-Endorflna
562 CAPÍTULO 16 AMINOÁCIDOS, PROTEÍNAS Y ENZIMAS
Cadena A Cadena B
Enlaces
de la estructura
Carbono
Oxígeno
Nitrógeno
Enlaces de hidrógeno
de la estructura
Cadena lateral R
* Hidrógeno
O tro tip o d e e s tru c tu ra s e c u n d a ria e s l a bofa plegada beta (bofa plegflda (5), e n la q u e
lo s e n la c e s d e h id r ó g e n o q u e se f o r m a n e n tre l a s c a d e n a s p o lip e p tíd ic a s p ro p ic ia n q u e e s ta s
s e m a n te n g a n a l la d o u n a s d e o tra s , c o m o e n u n a h o j a d o b la d a o p le g a d a . P o r e je m p lo , e n la s
F I G U R A 1 6 . 2 Secuencia de fib ra s d e s e d a , la a b u n d a n c ia d e g lic in a , a la n in a y s e rin a — q u e s o n a m in o á c id o s c o n c a d e n a s
aminoácidos de la insulina humana
la te ra le s p e q u e ñ a s — h a ce q u e la s h o ja s p le g a d a s /3 s e e m p a q u e te n d e u n m o d o m u y c o m -
y su estructura primaria.
p a c to , lo q u e le s c o n fie r e f o rt a le z a , fle x ib ilid a d y d u ra b ilid a d (fig. 16.4).
P ¿Qué tipos de enlace conforman
la estructura primaria de las El colágeno e s la p ro te ín a m á s a b u n d a n t e y c o n s titu y e h a s ta u n te rc io d e las p r o te ín a s d e
proteínas? lo s v e rte b ra d o s . S e e n c u e n tra e n e l te jid o c o n e c tiv o , e n lo s v a s o s s a n g u ín e o s , e n la p ie l, lo s
te n d o n e s , lo s lig a m e n to s , la c ó rn e a d e lo s o jo s y e l c a rtíla g o . L a fu e rte e s tr u c tu ra d e l c o lá g e -
n o e s e l re s u lta d o d e l e n tr e la z a d o d e 3 p o lip é p tid o s , q u e fo rm a n u n a hélice triple s im ila r a
u n a tr e n z a (fig. 16 .5). E l c o lá g e n o tie n e u n e le v a d o c o n te n id o e n g lic in a (3 3 % ), p ro lin a (2 2% ),
a la n in a (1 2 % ) y c a n t id a d e s m e n o r e s d e h id ro x ip ro lin a y d e h id ro x ilisin a . L a s f o rm a s h id ro x i
16.5 NIVELES ESTRUCTURALES DE LAS PROTEÍNAS 563
Enlaces de
hidrógeno entre las
cadenas peptídicas
• Carbono
• Oxígeno
• Nitrógeno
• Cadena lateral R
• Hidrógeno
F I G U R A 1 6 . 4 En la estructura secundaria tipo hoja plegada beta (hoja plegada p) se forman enlaces
de hidrógeno entre las cadena peptídicas.
P ¿En qué difieren b s enlaces de hidrógeno que se forman en la hoja plegada /3 y en la hélice a ?
N
3
h 2
LH
— OH
H2
;h 2 ch 2 h 2
Estructura terciaria
La estructura terciaria d e la s p ro te ín a s s e o r ig in a p o r l a s a tra c c io n e s y re p u ls io n e s q u e s e
e s ta b le c e n e n tr e lo s g r u p o s d e l a s c a d e n a s la te ra le s d e lo s a m in o á c id o s . A l p ro d u c irs e in te -
r a c c io n e s e n tr e d ife re n te s z o n a s d e la c a d e n a p o lip e p tíd ic a , a lg u n o s f ra g m e n to s d e l a m is m a
c a d e n a s e re tu e rc e n y s e p lieg a n , d e m o d o q u e la p r o te ín a a d q u ie re u n a e s tru c tu ra tr id im e n -
s io n a l c a r a c te rís tic a (fig . 1 6 .5). L a e s tr u c tu r a te r c ia r ia d e la s p r o t e ín a s s e e s ta b le c e , p u e s, p o r
in te ra c c io n e s e n tr e la s c a d e n a s l a te ra l e s d e lo s a m in o á c id o s d e u n a z o n a d e t e rm in a d a d e
la c a d e n a p o lip e p t íd ic a c o n la s d e l o s a m in o á c id o s d e o tr a s r e g io n e s d e la p ro te ín a . E n l a
ta b la 1 6.3 s e r e c o g e n la s in te ra c c io n e s e s ta b iliz a n te s re s p o n s a b le s d e la e s tru c tu r a t e rc ia r ia .
L L as interacciones hidrófobas s e e s ta b le c e n e n tr e c a d e n a s la te r a le s n o p o la r e s . E n la s
p ro te ín a s , lo s a m in o á c id o s c o n c a d e n a s la te ra le s n o p o la r e s tie n d e n a a le ja r se lo m á x im o
p o s ib le d e l m e d io e x te r n o a c u o s o , p o r lo q u e s e fo rm a u n c e n tro h id r ó f o b o e n e l in te rio r
d e la p ro te ín a .
2. L a s kiteracdones hidrófitas se e s ta b le c e n e n tr e e l m e d io a c u o s o e x te rn o y lo s a m in o á -
c id o s c o n c a d e n a s p o la re s o io n iz a d a s . E n la s p ro te ín a s g lo b u la re s , la c a d e n a p o la r tie n -
d e a c o lo c a r s e e n la s u p e r fi c ie e x te rio r p a r a fo rm a r e n la c e s d e h id r ó g e n o c o n e l a g u a .
a L o s puentes sainos s o n e n la c e s ió n ic o s e n tr e la s c a d e n a s la te r a le s d e lo s a m in o á c i d o s
b á s ic o s y á c id o s , q u e tie n e n c a r g a s p o s it iv a s y n e g a tiv a s r e s p e c tiv a m e n te . P o r e je m p lo ,
c u a n d o la c a d e n a la te ra l d e la lis in a s e io n iz a , a d q u ie r e c a rg a p o s itiv a , m ie n tr a s q u e la
c a d e n a la te ra l d e l á c id o a s p á rtic o a d q u ie r e c a r g a n e g a tiv a a l io n iz a rs e . L a a tra c c ió n e le c -
tr o s tá ti c a e n tr e e sta s c a d e n a s la te ra le s c o n c a r g a o p u e s ta fo rm a u n e n la c e ió n ic o o p u e n -
te s a lin o b a s ta n te fu e rte .
4 Los enlaces dehidrógoio se e sta b le c e n e n tr e e l H d e u n g ru p o la te ra l y e l O o N d e o tro
a m in o á c id o . P o r e je m p lo , e n t re lo s — O H d e 2 s e r in a s s e p u e d e f o rm a r u n e n la c e d e
h id ró g e n o , a l ig u a l q u e e n tr e e l — O H d e u n a s e rin a y e l — N H j d e l a c a d e n a la te ra l d e l a
g lu ta m in a .
5l L o s puentes dhulfiiro ( - S — S —) s o n e n la c e s c o v a le n te s q u e s e f o r m a n e n tre l o s
g ru p o s — SH d e 2 c is te ín a s d e la c a d e n a p o lip e p tíd ic a .
E JE R C IC IO R ESU ELTO 1 6 .5
Interacciones en la estructura terciaria
¿ Q u é t ip o d e a tra c c ió n c a b e e s p e ra r e n tre la s c a d e n a s la te ra le s d e lo s s ig u ie n te s a m in o -
á c id o s ?
a. c is te rn a y c iste rn a
b . á c id o g lu tá m ic o y lis in a
^ © h e m is t r y
* c place S O LU C IÓ N
W EB TU TO RIAL a. C o m o l a c is te rn a c o n tie n e u n a c a d e n a la te ra l c o n u n g ru p o — S H , s e p u e d e f o r m a r u n
Tertiary and Quaternary Structure p u e n te d isu lfu ro .
16.5 NIVELES ESTRUCTURALES DE LAS PROTEÍNAS 565
In teracc io n es OH QH
h idrófita s
con e l agu a
H élice
E n lace de h id róg eno
c=o
Interacció n
h id ró foba
Puente salino
P u en tes
d isulftiro
H oja p leg a da /3
E nlace de h id róg en o
F I G U R A 1 6 . 5 Las interacciones entre las cadenas laterales de b s aminoácidos hacen que las
proteínas se plieguen, generando una estructura tridimensional llamada estructura terciaria.
P ¿Por qué en la estructura terciaria una sección de la proteína se mueve hacia dentro mientras que
otra sección permanece en el exterior?
b. S e p u e d e fo rm a r u n p u e n te s a lin o p o r a tr a c c ió n e n tr e e l — C 0 0 " d e la
c a d e n a la te ra l d e l á c id o g lu tá m ic o y e l — N H , + d e l a c a d e n a la te r a l d e lis in a .
B olsillo p ara el o xígen o ( 0 ^
¡A H O R A TÚ ! A m inoácidos
E n la e s tru c tu ra t e rc ia ria d e u n a p ro te ín a , ¿ d ó n d e c r e e s q u e e n c o n tr a r ía m o s la e n la c ad e n a
v a li n a y l a l e u c in a , e n e l in te rio r o e n e l e x te r io r? ¿ P o r q u é ?
Q u ím ^ c t g a é o Lc/
Los aminoácidos esenciales
De los 20 am inoácidos que participan en la construcción de proteínas,
el cuerpo so lo sintetiza 10. L os 10 am ino ácidos restantes, que se reco-
g en en la tabla 16.4, son los denom in ados aminoácidosesenciales, qu e
d eb en obtenerse de las proteínas ingeridas en la dieta.
T A B L A 1 6 . 4 A m in o á cid o s e se n c iales
A rginina (Arg)* M etionina (M et)
H istidina (H is)' Fenilalanina (Phe)
Is o le u d n a (lie) T reonina (Thr)
L e u d n a (Leu) Triptófano (Trp)
L isina (Lys) X ilina (Val)
*Esenciales para los niños, no para los adultos. T A B L A 1 6 . 5 D eficien cia d e a m in o ácid o s d e a lg uno s
v e g etale s y ce re a le s
Las proteínas completascontienento dos lo s am inoácidos esen cia-
les y se encuen tran en la m ay oría de lo s alim entos de orig en anim al, Alim ento Aminoácido no presente
com o los huevos, la leche, la carne, el pescado o las aves. S in embargo,
Huevos, leche, carne, pescado, Ninguno
la gelatina y las proteínas d e o rig en vegetal, c o m o lo s cereales, las aves
ju d ías o las nueces, son proteínasincompletas, y a que carecen de uno
Trigo, arroz, avena Lisina
o varios am inoácidos esenciales. Po r tanto, las d ietas basadas en ali-
m entos de orig en vegetal deb en incluir u n a varied ad ad ecu ad a de pro- M aíz Lisina, triptófano
teínas, para q u e quien las o bserve obteng a todos los am inoácid os esen- Judías M etionina, triptófano
ciales. Por ejem plo, una dieta a b a se de a rroz y ju d ía s p ro po rcion a
G u isan tes M etionina
tod os los a m inoácidos esenciales, y a que so n 2 fuentes d e proteínas
com plem entarias. E l arroz contiene m etionina y triptófano, de los q ue Alm endras, nueces Lisina, triptófano
c arecen las jud ías, m ientras que estas co n tien en lisina, que no está Soja M etionina
presente en el a rroz (tabla 16.5).
(a) E structura
prim aria
(b ) E structu ra
se cu n daria
(c) E structura
\ terciaria
(d ) E structu ra
cu atern a ria
Q o jm / c c l g & é a c/
Estructura proteica y enfermedad m edidas d e control actuales excluyen el e m p le o del cerebro y de la
de las vacas locas m édula espinal de lo s preparados alim enticios para ganado, co n el fin
d e red ucir la incidencia de la EEB . En el a ñ o 2000 se identificó el
H asta hace poco s e pensaba q ue solam ente los virus y las bacterias eran prim er caso de E E B en España.
cap aces de transm itir enferm edades. S in em bargo, ho y se con oce un
g rup o de enferm edades cuyos agentes infecciosos so n unas proteínas
llam adas priones. L a en cefalo pa tía espo ng ifo rm e b o v ina (E EB ) o
enfermedadde las vacaslocases una enferm edad cereb ral fatal q u e
a fecta al ganado y por la que el cerebro s e llen a de cavidades, adqui-
riendo un aspecto sim ila r al de u n a e sp o n ja E n la form a n o infecciosa
del prión PrF*, el extrem o N -term inal form a una espiral al azar (v. la
estructura a la derecha). L a fo rm a no infeccio sa puede se r in g erid a en
algunos productos cárnicos, pero su estructura se puede alterar, d ando
lugar a lo que se conoce co m o PrP50, o pro teína priónscrapie. E n esta
form a infecciosa, el extrem o de la cad en a peptíd ica s e pliega y adq uie-
re form a de h oja plegada /3, lo que tiene efectos d esastrosos p ara el
cereb ro y la m édula espinal. L as causas p or las que se produ ce este
cam bio estructural so n todavía desconocidas.
L a variante hum ana de la enferm edad s e llam a enferm edad de
C teutzfeldt-Jakob (ECJ). A lrededor de 1955, el Doctor Carleton Gajdu-
se k estudiaba la tribu de lo s Fore e n Papúa N ueva Guinea, donde se
estaban produciendo num erosas m uertes po r consecuencia d e u na enfer-
medad neurològica conocida com o kuru. En aquella época era habitual
entre los F ore com erse a lo s m iem bros de la tribu cuando se m orían.
Debido al largo período de incubación de la enferm edad, se necesitaron
m uchos años para deducir que esa práctica era la responsable de la trans-
m isión del agente infeccioso entre los m iem bros de la tribu.
L a EEB se diagnosticó por prim era vez en G ran B retañ a e n 1986.
L a proteína está presente en el tejido nervioso, pero no en la carne. Las
E JE R C IC IO R ESU ELTO 1 6 .6
■ Identificación de la estructura proteica
I n d ic a s i la s s ig u ie n te s in te r a c c io n e s s o n r e s p o n s a b le s d e l a e s tr u c tu ra p rim a ria , s e c u n d a ria ,
te r c ia r a o c u a te rn a r ia d e l a s p ro te ín a s.
a P u e n te s d is u lf u r o e n tr e d is tin ta s p o rc io n e s d e l a c a d e n a p ro teic a ,
b . L o s e n la c e s p e p tíd ic o s q u e f o rm a n u n a c a d e n a d e a m in o á c id o s .
S O L U C IÓ N
a L o s p u e n te s d isu lfu ro c o n tr ib u y e n a e s ta b iliz a r l a e s tr u c tu ra te r c ia r ia d e la s p ro te ín a s ,
b . L a s e c u e n c ia d e a m in o á c id o s e n u n p o lip é p tid o e s l a e s tru c tu r a p r im a ria .
¡A H O R A TÚ!
¿ Q u é n iv e l e s tru c tu r a l r e p r e s e n ta n la s in te ra c c io n e s e n tr e 2 s u b u n id a d e s d e in s u lin a ?
/we&Cjpa ta entorno
Desnaturalización de
las proteínas de la leche
L lena 5 v a so s c o n lec he . A ñade los
siguientes reactivo s a los vasos 1-4; el
quinto vaso es de re fe ren cia
1. V inagre, gota a gota (rem ueve).
2 . M edia cucharada de adobo para carne.
3L U na cucharada de z um o de piña fresca
(el z um o enla tado ha sido calentado,
así que no sirve).
Calor, 4 U na cucharada de z um o de piña fresca
ácid o s, previam ente hervido.
bases, sa le s
de m e ta le s PREG UN TAS
p esad o s, L ¿C óm o cam bia el aspecto de la leche
a g itación en cada m uestra?
2» ¿Q ué en zim a contiene, se gú n la eti-
q u e ta el adobo para carne?
3L ¿C óm o com pararías el efecto del ju g o
de piña fresca con el hervido? E xplica
por qué se d a es ta diferencia.
4 ¿ P o r qué e n los postres de gelatin a
(una proteína) se utiliza piña en a lm í-
Proteína activa Proteín a de sn atu ra lizad a
bar en lugar de piña fresca?
L a p é rd id a d e la s e s tr u c tu r a s s e c u n d a ria s y te r c ia r ia s s e p r o d u c e c u a n d o c a m b ia n la s
c o n d ic io n e s d e l m e d io , p o r e je m p lo , a l a u m e n ta r la te m p e ra tu ra , o a l h a c e r s e e l p H m u y
á c id o o m u y b á s i c o . S i e l p H se m o d ific a , la s c a d e n a s la te ra le s á c id a s y b á s i c a s p i e r d e n s u s
c a rg a s ió n ic a s , y y a n o p u e d e n f o r m a rs e p u e n te s s a lin o s , l o q u e p r o v o c a u n c a m b io e n la
f o r m a d e la p ro te ín a . L a d e s n a tu ra liz a c ió n ta m b i é n s u c e d e c u a n d o s e a ñ a d e n a l a p ro te ín a
c ie r to s c o m p u e s to s o r g á n ic o s o i o n e s d e m e ta le s p e s a d o s , o b ie n p o r a g ita c ió n m e c á n ic a
(ta b la 1 6 .7 ).
C u a n d o l a s in te r a c c io n e s e n tr e la s c a d e n a s la te ra le s d e s a p a r e c e n , se p u e d e d e s p le g a r u n a
p r o te ín a g lo b u la r, c o n v irtié n d o s e e n a lg o p a r e c id o a u n e s p a g u e ti b la n d o . A d e m á s , a l p e r d e r
s u fo r m a , l a p ro te í n a d e ja d e s e r b io ló g ic a m e n te a c tiv a .
¿¿a /S K /C C L C f g & é o L c /
Anemia drepanocitica m oléculas de h em oglobina defectuosa se apelm acen, form ándose
fibras insolubles de hem oglobina drepanocídca que colapsan los capi-
L a an em ia drepanocitica es u na enferm edad causada p or u n a anorm a- lares, causando in flam adón, dolor y d año orgánico. P or tanto, e n los
lid ad en la form a de una d e las sub un idades de la pro teín a hem oglobi-
tejidos afectados se pueden alcanzar niveles de oxígeno críticam ente
na, provocada por la sustitució n del sex to am inoácid o de la cad en a /3,
bajos.
el á d d o glutám ico, que es polar, p or la v a lin a un a m in o á d d o no Para que la an em ia drepanocítica se m anifieste es necesario heredar
polar. fas 2 genes d e la hem oglobina alterada; en las personas qu e tienen un
C om o la valina tiene u n a cad ena no polar, es atraída por las regio - solo gen para la hem oglobina drepanocítica solo se encuentra u n peque-
nes no polares de las cadenas de la o tra hem o glo bina /3. L os glóbulos
ño núm ero d e gló bulos rojos deform es, lo que, casualm ente, propor-
ro jo s afectados pasan de se r redondeados a tener fo rm a d e m edia luna,
d o n a p ro tecd ón frente a la m a la ria
c o m o una hoz, lo que altera su capacidad para tran spo rtar ad ecuad a-
m ente el oxígeno. L as a tra c d o n e s hidrófobas tam b ién hacen que las
^ A m in o á d d o polar
EJER C IC IO S Y PROBLEM AS
N ive le s estru ctu ra le s d e la s p ro teín as 16L29 ¿Qué tip o de in terac d ó n crees que s e daría entre las cadenas
laterales de lo s siguientes am inoácidos?
l f t Z t ¿Q ué tipo de enlace es respon sable de la estructu ra prim aria de
a cisteína y d s te ín a b. á d d o glutám ico y lisina
las proteínas? c serina y á d d o aspártico A le u d n a y le u d n a
1&22 ¿Cóm o pueden 2 proteínas estar form adas por exactam ente el
16L30 Alrededor de la m itad de los 153 a m in oá d d o s de la
m ism o núm ero y tipo de am inoácidos pero ten er estructuras
m io glo bina tiene cadenas laterales no polares:
prim arias diferentes?
a ¿D ónde crees que encontraríam os estos a m ino á d d o s en la
16L23 ¿Cuáles son las posibles estructu ras prim arias de 2 péptidos estru ctura te rd a ria de una proteína?
form ados por una m olécula de serin a y 2 d e valina? b ¿D ónde en contraríam os las cadenas laterales polares?
1&24 ¿Cuáles son los 3 tipo s d e estructu ra secun daria? c ¿P o r qué la m ioglobina es m ás soluble en agua que la seda o
la lana?
16L25 ¿Qué le sucede a la estru ctu ra prim aria de una proteína al
form arse la estructura secundaria? 1&3I U na porción de una cadena polipeptídica tiene la siguiente
secuencia de am inoáddos:
1 & £ 8 ¿Cóm o se establecen los enlaces entre am inoácidos en la
-L eu-Val-C ys-A sp-
estructura secund aria de una proteína?
a ¿Q u é am inoácidos pueden form ar un puente disulfuro?
16L27 ¿Cuáles son las diferencias respecto al enlace entre la h élice a b. ¿Q ué am ino ádd os so n m ás fáciles de encontrar en el
y la hoja plegada /3? interior de la estructura proteica? ¿P or qué?
1 62 8 ¿Estructuralm ente, en q ué se d ifere n d an la estru ctura de la c ¿Q u é am in o ád do s son m ás fáciles de encontrar en el
hoja plegada /3 y la hélice triple? exterio r de la estructura proteica? ¿P or qué?
16.6 ENZIMAS 571
d ¿C óm o afecta la estructura p rim aria de la p roteína a la 1 & 3 3 Ind ica los cam bios que las siguientes acciones producen en la
estructura terciaria? estructura proteica:
1&32 Indica si las sig uientes afirm aciones hacen referen cia a la a U n huevo se cuece en agua a 100 °C durante 3 m inutos,
estructura primaria, se c u n d a ria terciaria o cuaternaria de una h . Antes de adm inistrar una inyección, s e frota la piel con una
proteína: g asa em papada en alcohol,
a Las cadenas laterales interaccionan para fo rm ar puentes c. El instrum ental quirúrgico se esteriliza en un autoclave a
disulfuro o en laces iónicos, 120 °C.
h Los am inoácido s s e unen fo rm an d o u na cadena d L a herida de una operación quirúrgica cicatriza
polipeptídica m ed iante enlaces peptídicos. m ediante calor (cauterización).
c V arias cad enas polipeptídicas s e m antienen unidas entre sí 16i34 In d íca lo s cam bios que las siguientes acciones producen en la
m ediante enlaces de hidrógeno en tre las cadenas estructura proteica:
adyacentes. a S e aplica á d d o tánico a una q ue m a du ra
d Los enlaces de hidrógeno entre lo s am inoácidos del m ism o h . D urante la e lab o ra d ón de yogur s e calienta la leche a 60 °C.
polipéptido proporcionan a la pro teín a un a fo rm a en espiral, c. Se tratan unas sem illas con H gC l 2 para conservarlas,
e Las cadenas laterales hidrófobas se sitú an en el interior de d S e cocina una ham burguesa a alta tem peratura para destruir
la proteína plegada al buscar un entorn o no polar. las bacterias de E Cotí, que pueden causar enferm edades
£ Las cadenas de colágen o form an una hélice triple, intestinales.
g U na proteína activa tiene 4 su bun id ades terciarias.
F I G U R A 1 6 . 9 La e n z im a a n h id ra s a
Anhidrasa
carbónica c a rb ó n ic a r e d u c e la e n e rg ía d e
a c tiv ac ió n d e la r e a c c ió n e n tr e e l C 0 2
C 0 2 + H 20
y e l H 20 .
P ¿C u ál e s la fu n c ió n d e las e n z im a s
Nomenclatura y clasificación de las enzimas e n lo s p r o c e s o s b io ló g ic o s ?
L o s n o m b r e s d e la s e n z im a s in d ic a n e l c o m p u e s to o la r e a c c ió n q u ím ic a q u e c a ta liz a n , s u s -
-asa. P o r e je m p lo ,
titu y e n d o e l f in a l d e l n o m b re d e l c o m p u e s to o d e la r e a c c ió n p o r e l su fijo
una oxidasa c a ta liz a u n a re a c c ió n d e o x id a c ió n , y u n a deshidrogenasae lim in a á to m o s d e
h id ró g e n o . L a e n z im a s a c a r a s a h id r o liz a la sa c a ro s a , y lo s líp id o s s o n h id ro liz a d o s p o r la s
lipasas. E l n o m b re d e a lg u n a s d e la s p rim e ra s e n z im a s q u e s e d e s c u b rie ro n te rm in a n c o n e l
ina, c o m o la papaína (q u e s e e n c u e n t ra e n la p a p a y a ), la renina (e n l a le c h e ) o la
s u f ij o
pepsinay la tripsina, q u e s o n e n z im a s q u e c a ta liz a n la h id r ó lis is d e l a s p r o te ín a s .
M á s r e c ie n te m e n te , s e h a d e s a rro lla d o u n m é to d o s is te m á tic o p a r a n o m b r a r las e n z im a s .
E l n o m b re y e l g ru p o d e c a d a e n z im a in d ic a n e l tip o d e r e a c c i ó n q u e c ata liz a . S e h a n e s ta -
b le c id o 6 c la s e s p rin c ip a le s d e e n z im a s , q u e s e r e c o g e n e n la ta b la 16 .8 .
572 CAPÍTULO 16 AMINOÁCIDOS, PROTEÍNAS Y ENZIMAS
E JE R C IC IO RESU ELTO
■ Nomenclatura de enzimas
¿ Q u é tip o d e r e a c c ió n q u ím ic a e s c a ta l iz a d a p o r la s s ig u ie n te s e n z im a s ?
a a m in o tra n s fe r a s a
b. la c ta to d e s h id r o g e n a s a
SOLUCI ÓN
a C a ta liz a la t ra n s f e re n c ia d e u n g ru p o a m in o .
b. C a ta liz a la e lim in a c ió n d e h id ró g e n o d e l la c ta to .
¡A H O R A TÚ!
¿ C u á l e s e l n o m b re d e la s e n z im a s q u e c a ta liz a n l a h id ró lis is d e lo s líp id o s ?
E JER C IC IO S Y PROBLEM AS
Enzimas 169B ¿Q ué tipo d e enzim a cataliza las siguientes reacciones?
a hidrólisis de la sacarosa
1 6 3 5 ¿Por qué el cuerpo necesita que las enzim as catalicen su s
b.adición de oxígeno
reacciones quím icas?
c transfo rm ación de la glucosa (Q H ^O g) en fructosa
16 3B ¿Cóm o consiguen las enzim as acelerar las reacciones quím icas
del cuerpo? ¿ tra n s fe re n c ia de un grupo am ino entre 2 m oléculas
16 37 ¿Cuál es el sustrato reactivo de las sig uientes en zim as? 16 40 ¿Qué tip o d e enzim a c ataliza las siguientes reacciones?
a galac tasa a adición de agua a un doble enlace
h lipasa Ik elim inación de átom os de hidrógeno
c aspartasa c ruptura de los enlaces peptídicos de las proteínas
1 6 3 8 ¿Cuál es el sustrato reactivo de las siguientes enzim as? d . elim inación de C 0 2del piruvato
a peptidasa
h celulasa
c lactasa
16.7 ACCIÓN ENZIMÀTICA 573
Sitio activo
E n e l tr a n s c u rs o d e la s re a c c i o n e s q u e c a ta liz a n , la s e n z im a s tie n e n q u e u n ir s e a u n su s tra to S ustrato Productos
d e u n m o d o q u e f a v o re z c a e l p ro c e s o c a ta lític o . P o r lo g e n e ra l, la s e n z i m a s s o n m u c h o
m a y o r e s q u e lo s s u s tra to s . S in e m b a rg o , e n s u e s tr u c tu r a te rc ia r ia h a y u n a r e g ió n lla m a d a
sitio activo, d o n d e l o s s u s tr a to s s e u n e n c o n l a e n z im a y s e p r o d u c e la r e a c c ió n . E l s it io
a c tiv o s u e le s e r u n a c a v id a d o b o ls illo e n e l q u e e n c a ja p e rfe c ta m e n te e l s u s tr a to (fig. 1 6 .10 ).
E n e l sitio a c tiv o , la s c a d e n a s la te ra le s d e lo s a m in o á c id o s s e u n e n a l s u s tra to m e d ia n te
e n la c e s d e h id ró g e n o , p u e n te s ió n ic o s o a tr a c c io n e s h id ró fo b as , y s o lo u n o s p o c o s s u s tra to s
d is tin to s p u e d e n e n c a ja r e n e l sitio a c tiv o , lo q u e h a c e q u e la s e n z im a s s e a n m u y e s p e c íf ic a s
r e s p e c to a l o s s u s tr a to s c o n l o s q u e se u n e n .
Sitio
activo
Reacciones catalizadas enzimáticamente
F I G U R A 1 6 . 1 0 En la enzima
L a d is p o s ic ió n a d e c u a d a d e u n su s tra to e n e l s itio a c tiv o d a lu g a r a la f o rm a c ió n d e l complejo existe una región llamada sitio activo
enzima-sustrato (E S ). L a c o m b in a c ió n d e la e n z im a c o n e l s u s tra to p ro p o r c io n a u n c a m in o que se une al sustrato y cataliza su
a lte rn a tiv o , c o n u n c o n te n id o e n e rg é tic o m e n o r, p a r a q u e s e p r o d u z c a la r e a c c ió n y , a d e m á s , reacción.
la s c a d e n a s la te ra le s d e lo s a m in o á c id o s ta m b ié n p a rtic ip a n e n l a c a tá lisis . U n a v e z q u e la P ¿Por qué las enzimas solo
r e a c c ió n h a te n id o lu g a r, lo s p r o d u c to s s o n rá p id a m e n te lib e ra d o s p o r la e n z im a, d e fo rm a q u e
catalizan las reacciones de ciertos
sustratos?
e s ta p u e d e u n irs e a u n a n u e v a m o lé c u la d e s u stra to . L a re a c c ió n c a ta liz a d a e n tre la e n z im a (E)
y e l su s tra to (S) p a ra fo rm a r e l p ro d u c to (P) s e p u e d e re p re se n ta r d e l s ig u ie n te m o d o :
P asol E + S ES
Paso 2 ES E + P
E + S ES — - E + P
Enzima + sustrato Complejo ES Enzima + producto
c @ h e m is t r y
^ . p la c e
E + S C o m p le jo E S E + Pj + P2
Sitio activ o
S acaro sa
49 ( 1) L as m o lécu las
C o m p lejo
sac arasa-sacaro sa
(a) Modelo llave-cerradura
*
Complejo enzima-sustrato
de sa caros a s e unen Sitio a ctiv o
al sitio a ctiv o de
*
la sa c arasa
^ 0
< 9 L os productos
resultantes, La sa c arasa (b) Modelo de ajuste inducido Complejo enzima-sustrato
la glucosa cataliza
Sitio activ o El su s trato no
y la fructosa, la hid ró lisis
se puede unir
se se p a ra n de la s m oléculas
*
al sitio activo
del sitio a ctiv o y de sa c aro sa
la sacarasa q ue d a
libre p ara c ataliz ar
la hidrólisis de m ás
m oléculas de sa c a ro s a No hay reacción
(c)
F I G U R A 1 6 . 1 1 Cuando la sacarosa se une a F I G U R A 1 6 . 1 2 (a) Según el modelo llave-cerradura,
la sacarasa en el sitio activo, se dispone de modo cuando el sustrato encaja en el sitio activo se forma el
adecuado para que se produzca la hidrólisis. Los complejo enzima-sustrato, (b) En el modelo de ajuste
monosacáridos resultantes se separan del sitio activo inducido, el sitio activo flexible y el sustrato se adaptan
y la enzima queda lista para unirse a otra molécula de mutuamente, y se produce un ajuste óptimo, (c) La enzima no
sacarosa. cataliza la reacción de un sustrato que no encaje o induzca el
P ¿Por qué la reacción de hidrólisis de la sacarosa es ajuste con el sitio activo.
más rápida cuando está catalizada por enzimas que P ¿En qué difieren el modelo de ajuste inducido y el de llave-
cuando la realizamos en el laboratorio? cerradura?
A p e s a r d e q u e e l m o d e lo lla v e - c e rr a d u ra e x p lic a la u n ió n e n tr e m u c h o s s u s tr a to s y e n z i-
m a s d ife re n te s , a lg u n a s e n z im a s tie n e n u n a a c tiv id a d m u c h o m a y o r d e lo q u e c a b r ía e s p e ra r
s e g ú n e s te m o d e lo . E l modelo de ajuste inducido e s ta b le c e q u e c u a n d o se p ro d u c e la in te -
r a c c ió n e n tr e la e n z im a y e l s u s tra to (fig . 1 6 .1 2 b ) e l s itio a c tiv o ta m b ié n se m o d ific a p a ra
a ju s ta rs e m e jo r a la fo r m a d e l s u s tr a to . A l m is m o tie m p o , e l s u s tra to ta m b i é n m o d if ic a su
g e o m e tría , p a r a e n c a ja r m e jo r e n e l s itio a c tiv o . L a c o n s e c u e n c i a e s q u e l a p a rte d e l s u s tra to
q u e v a a re a c c io n a r q u e d a p e rfe c ta m e n te d i s p u e s ta r e s p e c to a l o s g r u p o s d e l s itio a c tiv o q u e
v a n a c a ta liz a r l a r e a c c ió n . U n s u s tr a to d ife re n te n o s e rí a c a p a z d e in d u c ir e sto s c a m b io s y,
p o r lo ta n to , n o s e p ro d u c irí a l a c a tá lis is (fig. 1 6 .1 2 c).
S O L U C IÓ N
E l s it io a c tiv o d e la e n z im a a lo ja e l s u s tr a to y , a d e m á s , c o n tie n e la s c a d e n a s la te ra le s d e lo s
a m in o á c id o s , q u e c a ta liz a n la re a c c ió n .
{A H O R A TÚ!
¿ E n q u é d ifie re n e l m o d e lo lla v e -c e r r a d u ra y e l d e a ju s te in d u c id o e n lo r e fe r e n te a la d e s -
c r ip c ió n d e l s itio a c tiv o d e u n a e n z im a ?
16.7 ACCIÓN ENZIMÀTICA 575
U /fft/C C L g a é u c i
Q
O
m ism a reacción m etabólica, pero en d iferen tes c élulas o tejido s del
cuerpo. G eneralm ente, so n estructu ras cu atern arias co n pequeñas
variaciones e n los am inoácido s de las sub unidades polipeptídicas. Por
ejem plo, hay 5 isoenzim as d e la lactato deshidrogenasa(LDH) qu e
catalizan la transfo rm ació n del lactato en piruvato.
C orazón, riñ ones
OH ILactato
ortatn O
_ deshidrogenasa
C H 3— C H — CO O C H 3— c — C O O ' + 2H
H 4 (L D H ,)
Lactato Piruvato
G ló bu lo s rojos, c orazón,
riñón, c ere b ro
H 3M (L D H 2)
H 2M 2 (L D H 3)
H M 3 (L D H 4)
M 4 (L D H 5)
C a da iso enzim a L D H contiene un a com bin ació n distinta de su bu n ida- T A B L A 1 6 . 9 Iso enzim as d e la la ctato
des polipeptídicas M y H. E n el hígado y en lo s m úsculos, e l lactato se
d eshid ro g en asa y d e la cre a tin a q uin asa
convierte en piruvato p or la acción de una isoenzim a L D H 5, que tiene
4 subunidades M y s e d esig n a M 4. E n el corazón, la m ism a reacció n es Isoenzima Abundante en Subunidades
catalizad a por una iso enzim a L D H ,, que tiene 4 sub unidades H (H J. Lactato deshidrogenasa (LDH)
En las isoenzim as L D H del cerebro, en los glóbu los rojos, en los gló -
bulos blancos o en el riñón se pueden encontrar distintas com bin acio- LDH, Corazón, riñones
nes de las subunidad es M y H. LDH* Glóbulos rojos, corazón, riñones, M Hj
Las diferentes form as de las enzim as perm iten el diag n óstico m édi- cerebro
co del daño sufrido por lo s órganos o tejidos. E n los tejidos sanos, las L D H, Cerebro, pulmones, glóbulos
isoenzim as realizan su m isió n den tro de las células. S in em bargo, blancos
cuando se daña un d eterm inad o órgano, sus células mueren, liberando
ld h 4 Pulmones, m úsculo esquelético M 3H
sus correspondientes isoenzim as en la sangre, po r lo que la id entifica-
ció n en el suero sang u íneo de niveles altos de u n a enzim a específica ld h 5 M úsculo esquelético, hígado m4
a yuda a identificar la enferm edad y su localización. P or ejem plo, una Creatina quinasa
elevación e n e l suero de L D H 5, que es la isoen zim a M x de la lactato
deshidrogenasa, indica d a ño hepático. C u an d o se sufre un infarto de CK, Cerebro, pulm ones BB
m iocardio, o un ataqu e al corazón, y se dañan las células del m úsculo CK* M úsculo cardíaco MB
cardiaco, se puede detectar un nivel elevado de la iso enzim a L D H, (H J Músculo esquelético, glóbulos rojos MM
CK,
en el suero sanguíneo (tabla 16.9).
576 CAPÍTULO 16 AMINOÁCIDOS, PROTEÍNAS Y ENZIMAS
E JE R C IC IO S Y PROBLEM AS
A cció n e nzim à tica h ¿En qué se diferencia el sitio activo del resto de la
estructura de la enzim a?
1&4I R elaciona los térm inos complejoenzima-sustrato, enzimay
sustratocon la afirm ación que corresponda: 1644 a ¿C óm o aum entan las enzim as la velocidad de las reacciones
a . tiene una estru ctu ra terc iaria c ap a z de re co n o c er un qu ím icas?
su strato h U na vez que se han form ado los productos, ¿qué le sucede a
bh com binación de una enzim a con su sustrato la enzim a?
c su estructura encaja en el sitio activo de una enzim a 1645 ¿Qué son las isoenzim as?
1&4S R elaciona los térm inos complejoenzima-sustrato, enzimay 1&48 ¿En q ué difieren las isoenzim as LD H del corazón de las del
sustratocon la afirm ación que corresponda: hígado?
a zona de la enzim a d o nd e tiene lugar la reacción quím ica 16L47 Un paciente acude al servicio de urgencias con un dolor en el
catalizada pecho. ¿Q u é enzim as se deberían analizar en su sangre?
bk sitio activo que se adap ta a la geom etría de un su stra to
1&48 Un paciente alcohólico tiene niveles elevados de LD H y AST,
c. sitio activo con geom etría rígid a
¿qué enferm edad es posible que padezca?
16L43 a E scribe una ecuación q ue represente una re ac ción quím ica
catalizada por una enzim a.
Temperatura
L a s e n z im a s s o n m u y s e n s ib le s a l a te m p e ra tu ra . A b a ja s te m p e ra tu ra s , l a m a y o r ía d e l a s
e n z im a s tie n e n u n a b a ja a c tiv id a d , y a q u e n o h a y su fic ie n te e n e rg ía p a r a q u e la re a c c ió n q u e
c a ta liz a n te n g a lu g a r. A l a u m e n ta r la te m p e r a tu ra , la a c tiv id a d e n z im à tic a s e in c re m e n ta , y a
q u e la s m o lé c u la s d e re a c tiv o s e m u e v e n m á s rá p id a m e n te y la f re c u e n c ia d e c o lis io n e s co n
la s e n z im a s e s m ay o r. L a s m a y o ría d e l a s e n z im a s m u e s tra u n m á x im o d e a c tiv id a d a u n a
temperatura óptima, q u e e s d e 3 7 °C , la te m p e ra tu ra c o r p o ra l (fig . 16 .1 3 ). A te m p e ra tu ra s
s u p e r io re s a 5 0 °C, l a e s tr u c tu r a t e r c ia ria — q u e d e te r m in a l a fo rm a d e la m a y o ría d e la s
p ro te ín a s — s e d e stru y e , c a u s a n d o la p é rd id a d e a c tiv id a d . P o r ta n to , e l in s tr u m e n ta l h o s p i-
ta la r io y d e l a b o ra to rio s e e s t e riliz a e n a u to c la v e s , d o n d e s e c o n s ig u e m e d ia n te e le v a d a s
te m p e r a tu r a s d e s n a tu ra liz a r la s e n z im a s d e lo s m ic ro o r g a n is m o s p e rju d ic i a le s .
16.8 FACTORES QUE AFECTAN A LA ACTIVIDAD ENZIMÀTICA 577
— Máxima
\ actividad
c
o
/ \ enzimàtica
Desnaturalización
MM etÁá (a
\ /
•s \ l
Actividad enzimàtica
L as enzim as d e una m anzana recién c o r-
/Tem peratura tada, d e un aguacate o de un plátano, re ac-
/ óptima v cionan con e l oxígeno del aire, y la s u p e r-
i - / i i \ 1 ll 1.
ficie de la fruta se pone m arrón. Los
10 20 30 40 50 60
antioxidantes, com o la vitam ina C del
Temperatura (°C) z um o del lim ón, evitan la reacción de ox i-
dación. C orta una manzana, un aguacate o
F I G U R A 1 6 . 1 3 Lasenzimas F I G U R A 1 6 . 1 4 Lasenzimas u n plátano e n varios trozos. C oloc a un
alcanzan la máxima actividad a su son más activas a su pH óptimo. trozo en una bolsa, extrae el aire y c ié rra-
temperatura óptima, generalmente A pH mayores o menores, la la. Sum erge otro tro zo en zum o de lim ón
37 °C . A temperaturas más bajas se desnaturalización hace que pierdan su y colócalo en un plato. E spolvorea otro
reduce la velocidad de la reacción, y capacidad catalítica. trozo con una pastilla m achacada de vita-
a temperaturas superiores a 50 °C la P ¿Por qué el pH óptimo de la enzima m ina C. D eja o tro tro zo de fru ta com o
proteína se desnaturaliza y pierde su digestiva pepsina es 2? con tro l. O bserva la sup e rficie de las
capacidad catalítica. m uestras, anotando s us reacciones tanto
P ¿Por qué la temperatura óptima de la
inm ediatam ente com o a l cabo de 6 horas
mayoría de las enzimas es de 37 °C ? o más.
PREG UN TAS
pH
1. ¿Q ué trozos se oxidan m ás (se vuelven
L a s e n z im a s s o n m á s a c tiv a s c u a n d o s e e n c u e n tra n a u n pH óptimo, q u e e s e l p H a l q u e se más oscuros)?
m a n tie n e la e s tr u c tu r a t e rc ia ria d e l a p r o te ín a (fig . 1 6 .1 4 ). V a lo r e s d e p H s u p e r io r e s o in fe - 2. ¿Q ué trozos no se oxidan o lo hacen
r i o r e s a l p H ó p ti m o p ro v o c a n c a m b io s e n la e s tr u c tu r a trid im e n s io n a l d e la e n z im a , q u e m uy poco?
3. ¿C óm o a fe c ta n los tra tam ie nto s con
p ie r d e s u s itio a c tiv o . P o r ta n to , la e n z im a y a n o p u e d e u n irs e a d e c u a d a m e n te a l s u s tr a to y
a ntiox id an tes la o x id ación de c a d a
n o p u e d e d a r s e la re a c c ió n .
trozo?
L a s e n z im a s d e la m a y o ría d e la s c é lu la s tie n e n v a lo r e s d e p H ó p t im o p ró x im o s a 7,4,
a u n q u e la s e n z im a s e s to m a c a le s tie n e n u n p H ó p tim o m á s b a jo , y a q u e h id ro liz a n p r o te ín a s
a l p H á c id o d e l e s tó m a g o . P o r e je m p lo , la p e p sin a , u n a e n z im a d ig e s tiv a d e l e s tó m a g o , tie n e
u n p H ó p tim o d e 2. E l p H e n e l e s tó m a g o , c u a n d o e s tá v a c ío , e s d e 4 o 5, y la p e p s in a m u e s -
tr a e s c a s a o n u la a c tiv id a d d ig e s tiv a e n e s ta s c o n d ic io n e s . S i n e m b a r g o , c u a n d o e l a lim e n to
p e n e tr a e n e l e stó m a g o , s e s e c r e ta HC1, q u e re d u c e e l p H a 2 , y la p e p s i n a se a c tiv a .
S i s e c o rrig e n v a ria c io n e s p e q u e ñ a s e n e l p H , la s e n z im a s p u e d e n r e c u p e ra r n u e v a m e n te
s u e s tr u c tu ra y a c tiv id a d . S in e m b a rg o , d e s v ia c io n e s g r a n d e s y p r o lo n g a d a s d e l p H ó p tim o
d e s tr u y e n d e f in itiv a m e n te la e s tr u c tu ra d e la e n z im a . L a ta b la 1 6 .1 1 r e c o g e lo s v a lo re s d e Actividad máxima
p H ó p tim o s p a ra a lg u n a s e n z im a s .
E JE R C IC IO RESU ELTO 1 6 .9
■ Factores que afectan a la actividad enzimática
I n d ic a e l e f e c to q u e l a s s i g u ie n te s m o d if ic a c io n e s e je r c e n s o b re la v e lo c id a d d e la re a c c ió n
c a ta liz a d a p o r u re a s a q u e s e d e s c r ib e a c o n tin u a c ió n :
H 2N — NH2 + H 20 ^2221 2N H 3 + 2
Urea
a a u m e n to d e la c o n c e n tr a c ió n d e u r e a h . d is m in u c ió n d e la te m p e ra t u ra a 1 0 ° C
S O LU C IÓ N
a E l a u m e n to d e l a c o n c e n tra c ió n d e u re a in c r e m e n ta r á la v e lo c id a d d e la r e a c c ió n h a s ta
q u e to d a s la s m o lé c u la s d e e n z im a s e u n a n a l s u s t ra to (urea).
c © h e m is t r y b. D a d o q u e u n a te m p e ra tu ra d e 10 °C e s tá p o r d e b a jo d e la ó p tim a d e 3 7 °C , la v e lo c id a d
** , place d e la r e a c c ió n d is m in u y e .
W EB TU TO RIAL
Enzyme Inhibition ¡A H O R A TÚ!
S i l a u re a s a tie n e u n p H ó p tim o d e 5, ¿ c u á l e s e l e fe c to d e u n a d is m in u c ió n d e l p H a 3 ?
Inhibición enzimática
H a y m u c h a s m o lé c u la s c a p a c e s d e h a c e r q u e la s e n z i m a s p ie r d a n s u a c tiv id a d c a ta lític a : s o n
lo s lla m a d o s kddbidores. A p e s a r d e q u e e x is te n d if e r e n te s m e c a n is m o s d e a c c ió n , to d o s lo s
in h ib id o re s im p id e n la u n ió n e n tre e l su s tra to y e l s itio a c tiv o . L a in h ib ic ió n p u e d e s e r c o m -
p e titiv a o n o c o m p e titiv a ; e n la i n h ib ic ió n c o m p e tit iv a , e l in h ib id o r c o m p ite c o n e l s u s tra to
p o r e l s itio a c tiv o , m ie n tra s q u e e n la in h ib ic ió n n o c o m p e titiv a e l in h ib id o r a c t ú a e n u n lu g a r
d is tin to d e l s itio a c tiv o .
Los feüribidflrcs competitivas t ie n e n e s tru c tu ra s m u y s im ila re s a la s d e lo s s u s tr a to s q u e
c o m p ite n c o n é l p o r u n i rse c o n e l s itio a c tiv o . E n la m e d id a e n q u e e l in h ib id o r o c u p a e l sitio
a c tiv o , e l s u s tr a to n o p u e d e u n ir s e a l a e n z im a y , p o r lo ta n to , n o s e p ro d u c e la re a c c i ó n
d e s e a d a (fig . 1 6 .1 6 ).
Se favorece
- ES — E + P á aumentar [S]
Complejo
enzima-sustrato
I\ in hib ido r
co m p etitivo
se une co n el
enzima-sustrato
C u a n d o la c o n c e n tra c ió n d e l in h ib id o r e s c o n s id e r a b le , s e p r o d u c e l a p é r d id a d e la a c ti-
sitio activ o, v id a d e n z im á tic a . S in e m b a r g o , s i s e in c r e m e n ta la c o n c e n tra c ió n d e l s u s tra t o , s e d e s p l a z a n
el su stra to no
la s m o lé c u la s d e in h ib id o r y , a m e d id a q u e s e u n e n m á s m o lé c u la s d e s u s tra t o a la e n z im a
puede h a ce rlo
«
(E S ), la a c tiv id a d e n z im á tic a s e re c u p e ra .
L a e s tru c t u r a d e lo s inhibidores no conpetítívos n o se p a r e c e a la d e l s u s tra t o y , p o r
ta n to , n o c o m p i te n c o n é l p o r u n ir s e c o n e l s itio a c tiv o , s in o q u e se u n e n a u n l u g a r d e la
p ro te ín a d istin to . C u a n d o u n in h ib id o r n o c o m p e titiv o s e u n e a u n a e n z im a , s u g e o m e tría s e
F I G U R A 1 6 . 1 6 D ebidoaque d is to r s io n a , y la i n h ib ic ió n s e p ro d u c e p o rq u e e l s u s tra to y a n o e n c a ja e n e l s it io a c ti v o o n o
la estructura de los inhibidores lo h a c e a d e c u a d a m e n te , y s in e l a d e c u a d o a lin e a m ie n to d e l su s tr a to c o n lo s g ru p o s la te ra le s
competitivos es muy similar a la del d e lo s a m in o á c id o s , la c a tá lis is n o t ie n e lu g a r (fig. 16 .1 7 ).
sustrato, compiten con el sustrato
C o m o lo s in h ib id o re s n o c o m p e titiv o s n o c o m p ite n p o r e l s itio a c tiv o , l a a d ic ió n d e m ás
para unirse con el sitio activo.
su s tra to n o re v ie r te e s te tip o d e in h ib ic ió n . A lg u n o s e je m p lo s d e in h ib id o re s no c o m p e titiv o s
P ¿Por qué al incrementarse la
concentración de sustrato se s o n lo s io n e s d e m e ta le s p e s a d o s P b 2+, A g ^ y H g 2+, q u e se u n e n c o n lo s g r u p o s la te ra le s
revierte el efecto de un inhibidor — C O O ~ o — O H d e lo s a m in o á c id o s . L a a c tiv id a d c a ta lític a s e r e c u p e ra c u a n d o lo s in h ib i-
competitivo? d o r e s s e e lim i n a n c o n r e a c tiv o s q u ím ic o s .
16.8 FACTORES QUE AFECTAN A LA ACTIVIDAD ENZIMÀTICA 579
F I G U R A 1 6 . 1 7 Los inhibidores no
competitivos se unen a la enzima en un lugar
distinto del sitio activo, b que deforma la enzima
e impide la unión adecuada entre el sustrato y el
sitio activo.
P Al aumentar la concentración de sustrato,
¿se revierte el efecto de b s inhibidores no
competitivos?
L o s a n ti b ió tic o s p ro d u c id o s p o r l a s b a c te ria s , h o n g o s o le v a d u r a s s o n in h ib id o re s c a p a -
c e s d e d e te n e r e l c re c im ie n to b a cte ria n o . P o r e je m p lo , la p e n ic ilin a in h ib e u n a e n z im a n e c e -
s a ria p a r a la fo r m a c ió n d e la m e m b ra n a c e lu la r d e la s b a c te ria s , p e ro n o l a d e lo s h u m a n o s .
S i l a m e m b r a n a c e lu la r e s tá in c o m p le ta , la s b a c te ria s n o p u e d e n s o b r e v iv ir y la in fe c c ió n se
d e tie n e . S in e m b a rg o , a lg u n a s b a c te ri a s s e h a n h e c h o re s is te n te s a la p e n ic ilin a , y a q u e s e g re -
g a n p e n ic ila s a , u n a e n z im a q u e d e g r a d a la p e n ic ilin a , p o r lo q u e s e h a h e c h o n e c e s a r io d e s a r -
r o lla r d e riv a d o s d e p e n ic ilin a a lo s q u e la s b a c te r ia s a ú n n o s e h a n h e c h o re s iste n te s .
S
NHo NH o
Penicilina
E JE R C IC IO R E SU ELTO 16 . 1 0
Inhibición enzimàtica
D e te r m in a e l tip o d e in h ib ic ió n e n z im à tic a e x is te n te e n l o s s ig u ie n te s c a s o s:
a E l i n h ib id o r tie n e u n a e s tru c t u ra s im ila r a la d e l s u s tra to .
h E l i n h ib id o r s e u n e a l a s u p e rfic ie d e l a e n z im a , a lte ra n d o s u fo rm a d e m o d o q u e n o
p u e d a u n ir s e a l s u s tra to .
S O L U C IÓ N
a in h ib ic ió n c o m p e titiv a b . in h ib ic ió n n o c o m p e titiv a
jA H O R A T Ú !
¿ Q u é t ip o d e in h ib ic ió n e n z im à t ic a s e p u e d e r e v e rtir a ñ a d ie n d o m á s su s tra to a l m e d io ?
580 CAPÍTULO 16 AMINOÁCIDOS, PROTEÍNAS Y ENZIMAS
E JER C IC IO S Y PROBLEM AS
Factores que afectan a la actividad enzimática 1&53 In d ic a si en los siguientes apartados se hace referencia a un
inhibidor enzim àtico com petitivo o no com petitivo:
1(L4D La tripsina, una peptidasa que hidroliza polipéptidos en el
a El inhibidor tiene una estructura sim ilar a la del sustrato,
intestino delgado, tiene un pH óptim o de 8 . ¿C óm o se altera la
h . El efecto del inhibidor no se puede revertir m ediante la
velocidad de la reacción catalizada por trip sin a en las
adición de m ás sustrato.
siguientes condiciones?
c. El inhibidor com pite con el sustrato por el sitio activo.
a dism inuyendo la co ncentración d e polipéptidos d. La estru ctu ra del inhibidor es distinta a la del sustrato,
h cam biando el pH a 3
e L a adición de m ás sustrato revierte la inhibición.
c cuando la reacción s e lle v a a cabo a 75 °C
1(154 El oxalacetato es un inhibidor de la su c d n a to deshidrogenasa:
16L50 La pepsina, una peptidasa del estóm ag o que hidroliza
proteínas, tiene un pH ó ptim o de 2. ¿C óm o se alte ra la COO- COO-
velocidad de la reacción catalizada por pepsina en las
siguientes condiciones? ch2 ch 2
a increm entando la concentración d e proteínas
-O -
ch2
II
o
h cam biando el pH a 5
c cuando la reacción s e lle v a a cabo a 0°C eoo c o a
16L5I En el siguiente gráfico se m uestran las curvas de actividad de Succinato Oxalacetato
la pepsina, la ureasa y la trip sin a E stim a el pH óptim o de cada
una de ellas. a ¿C rees que el oxalacetato se rá un inhibidor com petitivo o
no com petitivo? ¿P or qué?
h . El oxalacetato, ¿se unirá con el s itio activo de la enzim a o
se unirá a otro lugar?
c. ¿Cóm o se podría revertir el efecto del inhibidor?
1 6 5 5 H etanol y el m etanol se oxidan por la enzim a alcohol
deshidrogenasa. En los casos de intoxicación por metanol, se
ad m in istra etanol por vía intravenosa para evitar la form ación
de form aldehído, que tiene efectos tóxicos.
a Com para las estructuras del etanol y del metanol.
h.El etanol, ¿com petiría con el sitio activo de la enzim a o se
uniría a o tro lugar?
c. El etanol, ¿es un inhibidor com petitivo o no com petitivo en
la reacción de oxidación del m etanol?
1 6 5 6 El antibiótico am oxicilina (un tipo de penicilina) se usa en los
1&5B Con la ayuda del gráfico del problem a 16.51, d ete rm in a si en
las siguientes reacciones la velocidad de reacción es ó ptim a o hum anos para el tratam iento de ciertas infecciones
bacterianas.
no:
a tripsina pH 5 b. u re asa pH 5 a ¿L a am oxicilina inhibe las enzim as hum anas?
c pepsina pH 4 d trip sin a pH 8 h . ¿P o r qué este antibiótico destruye las bacterias pero no es
e pepsina, pH 2 perjudicial para los hum anos?
F o r m a s d e e n z i m a s a c t iv a s
P r o t e ín a Enzfcna simple
M o lé c u la
P r o t e ín a -------------------- o r g á n ic a Enrama* cofactor
( c o e n z im a )
16.9 COFACTORES ENZIMÁTICOS 581
Iones metálicos
M u c h a s e n z im a s n e c e s ita n d e la p re se n c ia d e u n ió n m e tá lic o p a ra lle v a r a c a b o s u a c ti v id a d
c a ta lític a . L o s io n e s m e tá li c o s s e s u e l e n u n ir a u n a o m á s d e la s c a d e n a s la te r a le s d e lo s
a m in o á c id o s . L o s io n e s m e t á lic o s q u e in g e r im o s e n n u e s tr a d ie ta c u m p le n d i s tin ta s fu n c io -
n e s c o m o c a ta liz a d o r e s ; p o r e je m p lo , la s o x id a s a s e m p le a n io n e s F e 2+ y C u 2\ q u e p ie rd e n o
g a n a n e le c tr o n e s e n lo s p ro c e s o s d e o x i d a c ió n y re d u c c ió n . O tr o s io n e s m e tá lic o s , c o m o e l
Z n 2+, e s ta b iliz a n la s c a d e n a s la te ra le s d e l o s a m in o á c id o s d u r a n te la s r e a c c io n e s d e h id ró lisis .
E n la ta b la 1 6 .1 2 s e re c o g e n a lg u n o s c o fa c to re s m e tá lic o s n e c e s a r io s p a ra e l f u n c io n a m ie n -
t o d e la s e n z im a s .
E JE R C IC IO RESUELTO 16.11
Cofactores
I n d ic a s i la s s ig u ie n te s e n z im a s s o n a c tiv a s c o m o ta le s o r e q u ie r e n u n c o fa c to r:
a u n p o lip é p tid o q u e n e c e s ita M g 2+ p a r a s u a c c ió n c a ta lític a
b. u n a e n z im a a c ti v a fo rm a d a p o r u n a s o la c a d e n a p o lip e p tíd ic a
c . u n a e n z im a q u e c o n s is te e n u n a e s tru c tu ra c u a te r n a ria u n id a a v ita m in a B fi
S O L U C IÓ N
a L a e n z im a n e c e s ita u n c o fa c to r .
b . U n a e n z im a a c tiv a fo r m a d a p o r u n a s o la c a d e n a p o lip e p tíd ic a e s u n a e n z im a s im p le .
c . L a e n z i m a n e c e s ita u n c o f a c to r.
EJE R C IC IO S Y PROBLEM AS
Cofactores 1 & 5 9 Identifica la vitam ina que se une a las siguientes coenzim as:
a coenzim a A
1R57 Las enzim as descritas en los siguientes apartados, ¿so n activas
be tetrahidrofolato (THF)
com o tales o requieren un cofactor?
c. N A D +
a requiere vitam ina B , (tiamina)
h necesita Zn2* para su actividad catalítica
16L0O Id entifica la vitam ina que se une a las siguientes coenzim as:
c su form a activa consiste en 2 cadenas polipeptídicas a pirofosfato de tiam ina
KFAD
1<158 Las enzim as descritas en lo s sig uientes apartados, ¿son activas
c. fosfato de piridoxilo
com o tales o req uieren un cofactor?
a requiere vitam ina B 2 (riboflavina)
h su form a activa e stá form ada por 155 am in oácid o s
c em plea C u 2* du ran te la catálisis
584 CAPÍTULO 16 AMINOÁCIDOS, PROTEÍNAS Y ENZIMAS
¡DE UN VI STAZO!
16.1 Fundones de las proteínas 16.6 Enzimas
0 objetivo es... clasificar las proteínas según su función El objetivo es... conocer el funcionamiento de las enzimas
en las células. como catalizadores, así como sus nombres.
A lgunas proteínas actúan c om o enzim as, o tras com o horm onas y otras Las en zim as actú an com o catalizadores, reduciendo la energía de activa-
tienen funciones estructurales — de transporte, protección, alm acen aje— ción y acelerand o la velocidad de las reacciones biológicas. El nom bre de
o participan en la contracción m uscular. la m ayoría d e las enzim as term ina en -asae indica el com puesto o el tipo
d e reacción que la enzim a cataliza. L as enzim as se clasifican en función
16.2 Aminoácidos del tipo principal de reacción que catalizan.
B objetivo es... dibujar los aminoácidos en forma de ión
dipolar. 16.7 Acción enzimàtica
Las proteínas están form adas por 20 tip os de am inoácidos. L os am ino á- El objetivo es... conocer el papel de las enzimas
cidos tienen un grupo am ino y u n gru po ácid o carboxílico, unidos a u n en las reacciones biológicas.
átom o d e carbono central (alfa) y una caden a lateral característica (R ). L a E n la estructu ra terciaria d e las proteínas existe una c avidad llam ada sitio
cadena lateral les c onfiere carácter no polar, polar, ácido o básico. Al activo, o bolsillo, que se une con el sustrato. S egún el m odelo llave-
valor del pH fisiológico, la m ayoría de los am inoácidos están en form a de c e rra d u ra el su strato encaja perfectam ente en el sitio activo. El m odelo
iones dipolares, llam ados zwiteriones. d e aju ste inducido establece q u e el sitio activo cam bia de geom etría para
albergar al sustrato de m odo óptim o. En el com plejo enzim a-sustrato, la
16.3 Acidez y basicidad de los aminoácidos catálisis se p roduce cuando las cadenas de los am inoácidos reaccionan
B objetivo es... dibujar la estructura de un aminoácido con el sustrato. L os productos s e liberan de la enzim a y esta queda libre
ionizado a un pH por encima o por debajo del pl. para u nirse con o tra m olécula de sustrato.
Los am inoácidos pueden existir c om o iones d ipo lares llam ados zwiterio-
nes,com o iones positivos (a valores d e pH bajos) y c o m o iones negativos 16.8 Factores que afectan a la actividad enzimàtica
(a valores de pH altos). E n el punto isoeléctrico, los iones dipolares son El objetivo es... conocer el efecto de la temperatura, del pH,
neutros. de la concentración del sustrato y de los inhibidores en la
actividad de las enzimas.
16.4 Formación de péptídos L as en zim as son m ás eficaces a una tem peratura y pH óptim os, general-
B objetivo es... dibujar la estructura de un dipéptido. m ente 37 °C y 7,4 respectivam ente. L a velocidad de una reacción c a ta liz a
Los dipéptidos contienen enlaces de tipo am ida (peptídicos) que se for- d a por enzim as dism inuye c o n la tem peratura y a m edida que el pH se
m an cuando el g ru po ácido carbox ílico d e un am inoácido se une co n el aleja del valo r óptim o. El aum ento de la concentración de sustrato aum enta
grupo am ino de otro aminoácido. Las cad enas largas con m uchos am in oá- la velocidad d e la reacción enzim àtica. C uando la enzim a se satura, la adi-
cidos se llam an proteínas. ción de m ás sustrato no increm enta la velocidad. L os inhibidores reducen
la actividad de las enzim as o las hacen inactivas. Los inhibidores com peti-
16.5 Niveles estructurales de las proteínas tiv os tienen una estructura sim ilar a la del sustrato y com piten con él por
B objetivo es... identificar los niveles estructurales unirse con el sitio activo. S i el sitio activo está ocupado, la enzim a no pue-
de las proteínas. d e catalizar la reacción del sustrato. L os inhibidores no com petitivos se
L a estru ctura prim aria d e una proteína es su secuencia d e am inoácidos.
unen a o tras partes de la e n z im a cam biando la form a tanto de la enzim a
En la estru ctura secundaria, los en laces de hidróg eno que se estab lecen
com o del sitio activo. M ientras que el inhibidor no com petitivo se m anten-
entre las cadenas polipeptídicas gen eran una estru ctu ra característica de
g a unido, el sitio activo no puede unirse con el sustrato.
tip o hélice a, hoja plega da /3 o hélice triple. L a estructu ra terciaria se
estab lece m ediante interacciones entre las cad enas laterales de lo s a m i- 16.9 Cofactores enzimáticos
noácidos, de tipo enlace de hidrógeno, puentes d isu lfu ro y puentes s a li- El objetivo es... conocer b s cofactores que se unen
nos. T am bién existen interacciones que desplazan las cadenas hidrófobas a las enzimas.
al interior de la proteína y las hidrófilas al exterior. E n la estru ctura cu a- Las enzim as sim ples so n biológicam ente activas com o tales, m ientras que
ternaria, 2 o m ás estructuras terciarias, necesarias para la función b ioló - o tras enzim as necesitan la presencia de m oléculas orgánicas pequeñas o
gica de la proteína, se m antienen unidas gracias a los m ism o s tipos de iones m etálicos, llam ados cofactores. Los cofactores pueden se r iones
interacción que estabilizan la estru ctu ra tercia ria m etálicos, c om o C u 2* o F e * \ o m oléculas orgánicas llam adas coenzim as.
L a desn aturalización d e las proteínas tien e lu g ar c u an d o la estructu ra Las vitam inas s o n pequeñas m oléculas orgánicas necesarias para el c re -
se c u n d aria terciaria o cuatern aria es d estruida po r altas tem peraturas, cim iento y p ara u na vida saludable. L as vitam inas se obtienen en peque-
ácidos, bases, ciertos com puestos orgánicos, iones m etálicos o m ediante ñas can tid ad es m ediante la alim entación. L as vitam inas hidrosolubles B y
agitación, lo que produce la pérdida de actividad b io ló g ica C actúan com o coenzim as.
T É R M I N O S C LAV E
Actividad V elocidad a la que una enzim a cataliza la tran sfo rm ación de Aminoácido básico A m inoácido con un g rup o am in o (— N H J e n la
un sustra to en producto. cad en a lateral que s e ioniza com o una base débil.
A m in o á cid o B loque de constru cció n de las proteínas. E stá n form ados Aminoácido no polar A m inoácido c o n una cadena lateral n o polar e
po r un grupo am ino, un grupo á d d o carboxílico y una cad ena lateral insoluble en agua.
cara cterís tica todos unidos al átom o de carbono alfa. Ammoáridas polares A m inoácidos co n cadenas laterales polares y
Aminoácido ácido A m in o ác id o c o n u n g ru p o á cid o c a rb o x ílic o solubles en a g u a
(— C O O H ) e n la c a d e n a latera l q u e se io n iz a c o m o u n á c id o C-tcnninal E xtrem o de una cadena polipeptídica donde se sitú a el am i-
d ébil. noácido con el grupo — CCK> libre.
COMPRENDER LOS CONCEPTOS 585
Coenzima M olécula orgánica, una v itam in a g eneralm ente, q ue actúa Interacciones hidrófobas A tracciones e n tre las cadenas laterales no
com o co facto r de una e n z im a polares en el interior d e una proteína globular.
C a t a d o r Ión m etálico o m olécu la orgánica no proteica n ecesaria para la lsoenzimas Enzim as con diferentes com binaciones de subunidades poli-
función biológica de una en zim a p ep tíd icas que c atalizan la m ism a reacción en distintos tejidos del
Colágeno Es la proteína m ás abun dante en el cuerpo, form ad a por héli- cuerpo.
ces triples con enlaces de hidró geno entre los grup os — O H de la Modáo de ajuste inducido M odelo de acción enzim àtica se gú n el cual
hidrox ip rolin ay d e la h id ro x ilisin a la form a del sustrato y d el sitio activo se m odifican para lograr un
Complejo enzima-»strato (ES) Interm edio de las reacciones cataliza- aju ste óptim o.
das por enzim as consisten te en un a enzim a u nida con el sustrato. Modelo llave-cerradura D escripción de la acción enzim àtica qu e co n -
Desnaturalización Pérdida de las estructuras pro teicas secun d aria y ter- sidera al sus trato com o una especie de llave qu e encaja en la geom e-
c ia ria causada por e l calor, los ácidos, las bases, algunos co m pues- tría específica del sitio activo.
tos orgánicos, m etales pesados y /o agitación. N-terminal Extrem o d e una c adena polipeptídica donde se s itú a e l am i-
Enlace de hidrógeno Atracción entre los grup os polares, c om o — OH, no ácido con el grupo — N H ,+ libre.
— N R , y — COOH , d e las cadenas laterales de los am inoácid os de Héptido C om binación de 2 o m ás am inoácidos unidos entre sí m ediante
una cadena p o lipe p tídica enlaces peptídicos; dipéptido, tripéptido, etc.
Enlacepeptídico Enlace d e tipo am id a q u e une a los am inoácidos en las pH óptimo Valor del pH al que la enzim a es m ás a c tiv a
proteínas. IVotetna T érm ino utilizado para referirse a polipéptidos biológicam ente
Estructura cuaternaria E structura proteica form ada por 2 o m ás subu- activos fo rm ados por m últiples am inoácidos unidos entre s í m edian-
nidades polipeptídicas. te enlaces peptídicos.
Estructura primaria S ecuen cia específica de am inoácidos en una pro- IVotetna fibrosa Proteína insoluble en a g u a consisten en cadenas p o li-
teina. peptídicas con hélices a u hojas plegadas /3 y que form an las fibras
Estructura secundaria Form ación de hélices or, hojas plegadas p o héli- del pelo, la la n a la piel, las uñas o la seda.
ces triples. IVotdna globular Proteínas que adquieren una estructura com pacta
Estructura tfrc ia ii Pleg am iento de la e stru ctu ra se cu n d aria d e una m ediante atracciones entre las cadenas laterales de los aminoácidos.
p roteina de m odo que se form a una estru ctura com pacta estab ilizada IH io ites d is u lf u ro Enlaces cova lentes — S — S — qu e se form an entre
m ediante interacciones entre las cadenas laterales. lo s g rup os — S H de las unidades de ciste ina de una proteina y que
Enzima simple E nzim a activ a en form a p olipeptídica estabilizan la estructura secundaria.
Enzimas Sustancias, generalm en te proteín as globulares, q ue catalizan IHientesalino Atracción entre los grupos laterales ionizados de los a m i-
reacciones biológicas. no ácidos ácidos y básicos en la estructura terciaria de las proteínas.
Hélice a (alfa) Nivel estructural secund ario de las proteínas, e n la que el tan to isoeléctrico (pi) pH al cual un am inoácido e stá en form a de ión
grupo N H de un enlace peptídico se une a un grupo C = 0 m ás ale- dipolar.
ja d o m ediante un enlace de hidrógeno, generan do u na estru ctura en Sitio activo C avidad en una zona de la estructu ra terciaria d e una enzim a
espiral o enrollada. en la que se une el sustrato de la reacción.
Hélice triple E structu ra del colágeno, fo rm ada po r 3 cadenas polipeptí- Sustrato M olécula que reacciona en el sitio activo e n una reacción en zi-
dicas entrelazadas com o una tre n z a m àtic a
Hoja plegada/3 (beta) Nivel estructural secund ario de las proteínas q ue T en^fratura óptima T em peratu ra en la q u e un a enzim a m uestra su
se ge nera por enlaces d e hidró geno e n tre lo s enlaces peptídicos d e m áxim o de actividad.
cadenas polipeptídicas paralelas. Vitaminas M oléculas orgánicas; s o n necesarias para una vida saludable
Inhibidor competitivo M o lécula c o n una e stru ctu ra sim ilar a la del sus- y p ara el crecim iento adecuado y se obtienen en pequeñas cantidades
trato que inhibe la acción en zim àtica al com petir por el sitio activo. a trav és de los alim entos.
Inhibidcr no competitivo Inhibidor que altera la geo m etría de la enzim a Vitaminas hidrasoiubics V itam inas solubles en a g u a No se alm acenan
y del sitio activo, de m od o qu e la en zim a no pued e u nirse co n el e n el cuerpo, s e destruyen fácilm ente por la acción d el calor, la luz
sustrato de m odo adecuado. u ltravioleta o el oxígeno y actúan c om o coenzim as.
Inteacriones hidrófitas A tracciones entre las cadenas laterales polares Vitaminashposainbles V itam inas insolubles en agua. Pueden se r alm a-
en el exterior de una proteína. cenadas en el hígado y en la grasa corporal.
Inhibidores S ustancias que inactiv an u na enzim a interfirien do su cap a- Zwitcrión F orm a dipolar de un am inoácido con 2 zonas de c arga iónica
cidad de reaccionar con un sustrato. o p u e s ta — N H 3+y — COO".
C O M P R E N D E R LOS C O N C E P T O S
16L61 El etilenglicol (H O — C H 2— C H 2— OH) es el com ponente
principal de lo s anticongelantes. E n el cuerpo, s e convierte
prim ero en H O O C — C H O (ácido oxoetanoico) y desp ués en
H O O C — C O O H (ácido oxálico), que es tóxico,
a ¿Qué tipo de enzim as catalizan am bas reacciones del
etilenglicol?
h El tratam iento en los casos de in gestión de etilenglicol con siste
en la inyección in traven o sa de etanol. ¿C óm o con sigue este
tratam iento evitar las concentraciones tóxicas de ácido
oxálico?
lftflg Los adultos que so n intolerantes a la lactosa no pueden hidro lizar
este disacárido abundante en los productos lácteos. C o n el fin de
586 CAPÍTULO 16 AMINOÁCIDOS, PROTEÍNAS Y ENZIMAS
a pH=2 hpH =5 c pH =9
H 3Ñ — C H — C — N H — C H — C — O " k - C H 2- C - 0 - y H 3Ñ - ( C H 2)4
c . — C H 2— SH y H S - C H , —
a ¿Q ué am inoácidos fo rm an el aspartam o?
b. ¿C óm o nom brarías el d ipéptido? CH3
d - C H 2— C H — C H 3 y C H 3 —
1673 Si en una proteína la serin a fuese su stituida por valina, ¿cóm o se reacción se d u p lic a
vería afectada la estructura terciaria? 1 6 8 8 Señala si las siguientes enzim as serían funcionales en las
1 6 74 Si com em os arroz, ¿qué o tra fuente vegetal de proteína debem os condiciones que se indican:
añadir para ingerir to dos los am inoácidos esenciales? a pepsina, una enzim a d ig es tiv a a pH 2
bk una en zim a a 37 °C si procede de una bacteria term òfila y
1 6 75 ¿En qué se diferencian las enzim as de los catalizadores utilizados
tiene una tem peratura óptim a de 100 °C.
en el laboratorio?
1 6 8 9 Las siguientes frases, ¿describen una enzim a sim ple o una
lf tT B ¿Por qué las enzim as so lo funcio nan en condiciones suaves?
en zim a que requiere un cofactor?
1<Í77 La lactasa es una enzim a que hidroliza la lactosa a glucosa y a C ontiene M g2’ en el sitio activo.
g a lacto sa bk T iene actividad catalítica com o estructura terc ia ria
a ¿Cuáles so n lo s reactivos y lo s productos de la reacción? c Su actividad biológica requiere ácido fólico.
h D ibuja un diagram a d e energía para la reacción en p resencia y
16 9 0 Las siguientes frases, ¿describen una enzim a sim ple o una
ausencia de lactasa.
en zim a que requiere un cofactor?
c. ¿C óm o acelera la lactasa la reacció n?
a contiene riboflavina o vitam ina B2
16L78 La mal tasa es una enzim a que hidroliza la m altosa a 2 m oléculas
bk tiene 4 subunidades polipeptídicas
de g lu co s a c su actividad catalítica requiere Fe3*en el sitio activo
a ¿Cuáles so n lo s reactivos y los productos de la reacción?