UNIVERSITE MOULOU-MAAMERI DE TIZI-OUZOU

FACULTE DE MEDECINE
DEPARTEMENT DE PHARMACIE
COURS DE 4ème ANNEE PHARMACIE
MODULE DE MICROBIOLOGIE

LES CORONAVIRIDAE
Dr T.DJERBOUA
Pharmacien maitre assistant en microbiologie
CHEF DE SERVICE DU LABORATOIRE DE BIOLOGIE MEDICALE
HOPITAL BELLOUA-CHU TIZI-OUZOU

Année universitaire : 2016-2017

Email : drtaoufik123@hotmail.fr
 PLAN
• GENERALITES SUR LES CORONAVIRIDAE
• LES CORONAVIRUS : DES VIRUS EMERGEANTS
(cas du SRAS-CoV et du MERS-CoV)
• ASPECTS CLINIQUES
• DIAGNOSTIC VIROLOGIQUE
• PREVENTION ET SURVEILLANCE
 LES CORONAVIRIDAE GENERALITES
Virus peu étudiés jusqu’à l’épidémie
SRAS
Petit virus , enveloppés , a ARN simple
brun , polarité positive, le plus gros
génome des virus a ARN

Regroupe plusieurs genres de virus

pouvant atteindre l’homme et l’animal
(large spectre d’hote : mammifères ,
oiseaux …)

Infection le plus souvent bénignes ,

entériques et respiratoires , possibles
cas sévères.

Potentiel épidémique et de
 LES CORONAVIRIDAE :CLASSIFICATION
 la famille regroupe
plusieurs genres dont le
G\Cornavirus est le plus
interessant actuellement
chez l’homme
G\Coronvirus regroupe
plusieurs espèces capables
d’infecter l’homme E\H-
Cov (la lettre ou le préfixe
indique l’hote)

Capacité de
franchissement de barrière
d’espèce
 LES CORONAVIRIDAE :Structure
 virus pléomorphes, surtout
sphérique , capside a symétrie
hélicoïdale, l’enveloppe est hérissée de
larges spicules lui donnant un aspect
caractéristique en couronne
Le virus compte 4 protéines
structurales:

*S (spike) : attachement et fusion

*M : membrane (assemblage)
*N : protéine de la nucléocapside
E : enveloppe

Le génome code aussi pour des

protéines non-structurals dont le rôle
n’est pas complètement élucidé
 LES CORONAVIRIDAE : cibles cellulaires

2 récepteurs identifiés chez l’homme

* L’amino-peptidase N (APN=CD-13)
*Enzyme de conversion de l’angiotensine II (ACE II)

=) large spectre de cellules hôte

Expression cellulaire du CD13) selon le type de tissus

LES CORONAVIRIDAE :
réplication
Le cycle viral complet dure 3 a 4h

Apres pénétration par fusion des

membranes le génome est
directement traduit en protéines
(phase précoce)

Parmi les protéines traduites on

trouve les réplicases (ARN
polymérase/ARN dépendantes) qui
répliquent l’ ARN+ en ARN-

Les ARN – seront répliqués en

ARN+ qui serviront soit a

*Amplifier la synthèse protéique

*synthèse de nouveaux virions après
assemblage et libération
 Pouvoir pathogène des H-CoV
Les infections a H-CoV sont bénignes le plus souvent ,
d’ordre respiratoire essentiellement , puis d’ordre gastro-
intestinal, l’implication dans les troubles neurologiques n’a
pas été complètement établi

L’infection respiratoire est dominé par le Rhume commun

(2ème agent après le Rhinovirus)

Les symptômes sont surtout dues a la réponse immunitaire

s’expliquent par une atteinte de l’appreil respiratoire
supérieur puis descendant vers les poumons

Les formes sévères sont retrouvés chez le sujet fragilisé

QUESTION : j’ai un rhume ou une
Grippe :’( ?
 CORONAVIRIDAE : DES VIRUS EMERGEANTS
LA PANDEMIE SRAS

• 2002-2003
• 8,098 cas probables, 774 morts
• Pertes economiques>$30B
• Facteurs de propagation accélérée ont aidé a la
pandémisation de l’évenement (voyage autour de la terre
ne prend que 2h)
• Stratégies de controle :

- Surveillance clinique et screening des symptomes

- Isolation des cas potentials
- Quarantaine des cas exposés
- INFECTION BIEN CONTROLEE
CHAINE EPIDEMIOLOGIQUE DE L’INFECTION MERS-CoV
Middle East Respiratory Syndrome

Reservoir : animal ? (Camélidae , Chauves souris … )

Transmission :
non complètement élucidée , probablement par contacte étroite
avec une personne infectée (famille , personnel soignant )
CHAINE EPIDEMIOLOGIQUE DE L’INFECTION MERS-CoV
Middle East Respiratory Syndrome

• Premier cas identifié en Arabie Saoudite en Septembre 2012

• L’épidémie aurait commencé en Jordanie (Avril 2012)
• 1980 confirmés ,693 décés , 27 pays touchés
• Gender: sex ratio de 1.5 prédominance masculine (63%)
• Age médian 52 ans , avec des extremes de moins de 1 ans a 92 ans .
• NOTION DE FACTEUR DE RISQUE OU CO-MORBIDITE (la plupart des
malades )
• plusieurs des malades sont du corps médical exposé.
• Les cas algériens : deux hommes algériens, âgés de 66 et 59 ans,
ayant séjourné en Arabie saoudite pour l’accomplissement de la
Omra, selon la même source. Les deux cas ont été enregistrés à
Tipasa et Tlemcen (2014 , pas de nouveaux chiffre depuis !)
 CLINIQUE DE L’INFECTION MERS-CoV
Middle East Respiratory Syndrome
• DONNES CLINIQUES LIMITES , la plupart des symptomes étant décrits
chez des patients en état critique.
• De l’asymptomatique a la pneumonie aigue severe (DRA , choc septique
et defaillance multiviscerale)
• Peut toucher toutes les catégories d’age.
• Prédominance des formes associés a une tarre sous jacente
• Mortalité de 30%

• A l’admission : les symptomes communs sont fievre,frissons , céphalés ,

myalgies ,toux non productive, dyspnée,
• Plus rarement douleurs de la gorge , coryza, , toux productive nausées ,
vomissements , diarrhées , douleurs abdominales ,étourdissement
• Les présentations atypiques incluent une gastro-entérite précédant une
pneumonie , , ceux ayant necessité une hospitalisation en USI ont
présenté une pneumonie aigue rapidement progressive.
Coronavirus : Diagnostic

1) Indications :
-Diagnostic d’une infection respiratore haute
ou basse de symptomatology compatible (si
forms sévères, épidémique)
- Diagnostic d’une gastro-entérite virale

2) Prélèvements :
Diagnostic direct : secretions respiratoires,
LBA , Selles ,sang (sérologie a but
épidemiologique, pas d’interet diagnostic)

3) Techniques : IFI, RT-PCR, microscopie

électronique (selles+++), culture cellulaire
trés difficile reserve aux laboratoires
spécialisés
 PREVENTION
• Pas de traitement spécifique (corticoides-
Ribavirine Dans les formes sévères ?)
• Bien aérer les locaux
• Port de masque ou de bavette en cas de
symptômes respiratoires
• Hygiène des mains (virus fragile)
• Hygiène des locaux
• Education du personnel et des patients