Année universitaire 2014-2015

UE 1V001 "Organisations cellulaires du Vivant"

EXAMEN ECRIT 1ère PARTIE

samedi 25 octobre 2014

NB. Ce sujet est à l'usage exclusif des étudiant-e-s régulièrement inscrit-e-s à l'UE 1V001
pour cette année universitaire 2018-2019. Tout autre utilisation, en particulier pour la
constitution de polycopiés d'annales, n'est pas autorisée et pourra le cas échéant faire
l'objet de poursuites, au terme de la législation sur le droit à la propriété intellectuelle.
• Toutes les réponses sont à fournir exclusivement sur la feuille-réponse.
• Les réponses doivent être courtes et précises, avec le vocabulaire scientifique adapté.

L’usage de calculatrices et de téléphones portables est formellement interdit.

Durée de l'épreuve : 1 heure 30 Note sur 30

***************
Les trois exercices proposés dans ce sujet sont indépendants.

Exercice I (notation sur 5; durée conseillée : 15 minutes)

Pour chacun des ensembles de 4 termes listés ci-dessous, complétez la feuille-réponse en

entourant l'"intrus" qui ne vous semble pas partager une propriété ou une fonction biologique
commune avec les 3 autres termes. Pour chaque association, décrivez brièvement le point
commun aux 3 termes associés et expliquez le motif d'isolement du 4ème, dans les cases qui
conviennent. L'exemple ci-dessous permet de vous guider.
Exemple : protéine - membrane - glucide - lipide
Point commun : Motif d'isolement :
macromolécules biologiques simples complexe macromoléculaire

• stroma - thylacoïde - matrice – ATP synthase

• glycérol – sphingosine – phosphate – acide gras
• FADH2 - NAD+ - NADP+ - FAD
• fluidité membranaire – cholestérol – protéine – température
• groupe monophylétique – Eucaryotes – organismes photosynthétiques - Métazoaires
NB : toute réponse exacte mais incomplète ("intrus" correct mais point commun ou motif
d'isolement non indiqué) ne rapportera que la moitié des points prévus; si seul l'"intrus" est
indiqué sans justification ou si l'"intrus" est faux, la totalité de la réponse sera considérée
comme fausse.

Exercice II (notation sur 10; durée conseillée : 30 minutes)

La figure en haut de la page 2 ci-dessous représente un organisme X appartenant à l'un des

trois domaines du vivant.
1) Quelles caractéristiques doit posséder cet organisme pour être qualifié de "vivant"?
2) Dans la liste des termes ci-dessous, sélectionnez ceux qui correspondent à chacune à des
légendes numérotées de la figure.

UE 1V001 "Organisations cellulaires du Vivant" – Ecrit 1 (25 octobre 2014) page 1/3
 1
Termes à sélectionner pour les légendes :
✓cytoplasme
2
✓noyau
✓flagelle
✓membrane plasmique
3
✓réticulum endoplasmique
✓ribosomes 4
✓nucléoïde
5
✓spermatozoïde
✓paroi
✓pili 6
✓mitochondrie 7

Afin de situer cet organisme dans le domaine du vivant correspondant, une reconstruction
phylogénétique a été réalisée à l'aide de caractères moléculaires, à savoir les séquences
d'ADN codant les ARN de la petite sous-unité du ribosome. En plus de l'organisme X, un
représentant de chacun des trois domaines du vivant a été sélectionné : Escherichia coli,
Methanococcus vannielli et Homo sapiens. Ce dernier représentant est utilisé comme extra-
groupe. Une partie de l'alignement des séquences étudiées est présentée ci-dessous :

Position dans
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
l'alignement
E. coli C A T C G C G C G G
M. vannielli C T A C G C A T G G
H. sapiens C T A C G C A C G G
Organisme X C A T C G C G T G G

3) Précisez à quel domaine du vivant appartient chacun des trois représentants étudiés.
4) Indiquez quels sont les caractères informatifs par leur numéro de position dans
l'alignement de séquence, en justifiant votre réponse.

L'arbre phylogénétique le plus parcimonieux, construit à partir de cette analyse, est

présenté ci-dessous :

H. sapiens M. vannielli E.coli Organisme X

5) Définissez le principe de parcimonie utilisé pour la construction d'un arbre phylogénétique.

6) A quel domaine du vivant l'organisme X appartient-il? Justifiez votre réponse.

7) Définissez le terme "monophylétique" et illustrer votre réponse en replaçant un exemple

de ce terme sur l'arbre phylogénétique obtenu (à reproduire dans la case réponse)
UE 1V001 "Organisations cellulaires du Vivant" – Ecrit 1 (25 octobre 2014) page 2/3
Exercice III (notation sur 15; durée conseillée : 45 minutes)

Les cellules eucaryotes sont délimitées par une structure appelée membrane plasmique.
Cette structure est composée de deux grands types de macromolécules biologiques.
1) Citez les grands types de lipides constitutifs de la membrane plasmique.
2) Quelle est l'organisation adoptée par les lipides dans la membrane?
3) Justifiez cette organisation.

Dans le but d'étudier plus précisément cette organisation de la membrane plasmique, des
hématies intactes et des "fantômes" d'hématies (obtenus par choc osmotique et restant
ouverts, avec une membrane "trouée") sont isolées et soumises aux différents traitements
suivants :
• digestion enzymatique par une sphingomyélinase
• digestion enzymatique par une phospholipase
• marquage par un réactif fluorescent, le SITS, anion qui se lie spécifiquement au
groupement amine primaire, présent sur la phosphatidyléthanolamine et sur la
phosphatidylsérine
On analyse ensuite la sensibilité des constituants lipidiques de la membrane à chacun des
traitements utilisés. Les résultats obtenus sont présentés dans le tableau ci-dessous :

Sphingomyélinase sur Phospholipase sur Fluorescence SITS sur

Lipides testés
hématies "fantômes" hématies "fantômes" hématies "fantômes"

phosphatidylcholine - - + + - -
phosphatidyléthanolamine - - +/- + +/- +
phosphatidylsérine - - - + - +
phosphatidylinositol - - - + - -
sphingomyéline + + - - - -

+ : sensibilité +/- : sensibilité faible - : insensibilité

4) Pourquoi avoir utilisé des hématies pour ces expériences?

5) Qu'apporte l'utilisation de "fantômes" d'hématies?
6) A partir des résultats du tableau, déduisez la distribution des lipides dans la membrane
plasmique. Justifiez vos réponses.
7) Quel résultat aurait donné un traitement des hématies et des "fantômes" d'hématies avec
une glycosidase, enzyme hydrolisant les sucres, et pourquoi?
8) Quelle propriété fondamentale de la membrane plasmique est ainsi mise en évidence?
9) Quelles sont les autres macromolécules constitutives de la membrane plasmique et leur(s)
localisation(s) possible(s)?
10) En intégrant l'ensemble de vos réponses aux questions précédentes, faîtes un schéma
légendé d'une portion de membrane plasmique.

UE 1V001 "Organisations cellulaires du Vivant" – Ecrit 1 (25 octobre 2014) page 3/3