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INTRODUCTION :
-La microbiologie, étymologiquement « science des microbes »
-Les travaux de Pasteur et Lister ont fait progresser la microbiologie
Les méthodes d'antisepsie : ensemble des méthodes employées pour détruire
momentanément les microbes qui déterminent des infections sur ou dans les êtres vivants.
Les techniques de l'asepsie chirurgicale : l'asepsie, ce sont ensemble des méthodes qui
consistent à empêcher les germes de parvenir jusqu'à nous.
-Protistes : c’est le troisième règne pour classer les micro-organismes regroupent tous les
organismes vivants unicellulaires animaux (Protozoaires) ou végétaux (Protophytes). Les
protistes sont divisés en protistes supérieurs (protistes eucaryotes) et en protistes inférieurs
(protistes procaryotes).
I. CLASSIFICATION DES MICROORGANISMES :
1. Les protistes eucaryotes ou protistes supérieurs
Structure et taille : -des organismes unicellulaires ou multicellulaires.
-Chaque cellule se caractérise par un noyau vrai et des vrai organites
(mitochondries, dictyosomes de l’appareil de Golgi, centriole…).
-délimité par une enveloppe nucléaire
-cellule diploïde (deux jeux de chromosomes)
Les principaux représentants de ce groupe :
-Les champignons microscopiques ou mycètes (levures et moisissures) : non photosynthétiques,
(ils tirent leur énergie de l’oxydation de composés organiques).
-Les algues ou protophytes (à l’exception des algues bleues) : photosynthétiques
-Les protozoaires : se nourrissant de matière organique (donc non photosynthétiques)
Structure du peptidoglycane :
-Le peptidoglycane à son rôle constitue par des glucides aminés ‘’les osamines’’ : N-
acétylglucosamine (NAG) et l’Acide N-acétylmuramique (NAM).
-Chaque peptidoglycane est composé de 2 glycanes (chaînes polysaccharidiques) :
-Chaque glycane est constituée alternativement d’une série des NAG et NAM, ces deux
osamines sont liées entre eux par la Liaisons β -1,4-glycosidiques.
-Les deux glycanes sont liés par les NAM qui possèdent une molécule Tétrapeptide PEP, et
entre ces molécules de PEP il existe des Liaisons ou ponts interpeptidiques.
Coloration de Gram :
Préparation du frottis fixé : - étalement de la culture en couche mince sur la lame
-séchage à l’air libre
-passage de la lame à travers la flamme pour fixer la préparation.
Coloration de Gram : 1- recouvrement du frottis par le violet de gentiane 1min = toutes les B
sont colorées en violet
2-ajout du Lugol et maintien en contact pendant 1min = tous les B restent
colorées en violet
3- décoloration à l’éthanol 20s = les B Gram+ restent violettes, les B
Gram- sont décolorées
4-contre coloration avec la fuschine = les B Gram+ sont colorées en violet
et les B Gram- sont colorées en rose-rouge.
Fonction de la paroi :
- Le lysozyme est une enzyme qui rompt les liaisons β -1,4 des chaines polysaccharidiques du
peptidoglycane. Donc dégrade le peptidoglycane des parois des bactéries Gram + et Gram -. (la
B devient protoplaste)
- Le protoplaste : bactérie ayant perdu sa paroi, donc elle perd sa forme bacillaire et devient
sphériques
- Le sphéroplaste : une partie de la paroi et maintenue
C. Nutrition Bactérienne :
Le microorganisme doit trouver dans son environnement (naturel ou milieu de culture) : Substances
élémentaires constitutives de la cellule (C, O, H, N, S, P) + autres minéraux ; Substances énergétiques
permettant à la cellule de réaliser la synthèse de ses propres constituants, ces deux types de substances
sont les besoins communs à toutes les bactéries. Aussi, il y a des Substances spécifiques constituent les
besoins spécifiques à certaines bactéries appellent ‘’les facteurs de croissance’’.
1. Source d'energie
e- : Minérale e- : Minérale
B .utilisent des molécules
Photolithotrophes Chimiolithotrophes B. utilisent le CO2 (molécule organiques préformées
inorganique) comme unique réduites, comme sources de
ou principale source de carbone sont
e- : Organique e- : Organique carbone (ces molécules provenant
Photoorganotrophes Chimioorganotrophes d'autres organismes).
2- Besoins spécifiques-facteurs de croissance :
C’est un phénomène observé quand on ensemence deux bactéries (l’une est auxotrophe pour un F.C et
l’autre prototrophe est productrice de ce facteur) dans le même milieu de culture, après incubation, la
croissance de la B. auxotrophe n’est observée qu’à proximité de la culture de B. prototrophe. Les
besoins en facteurs de croissance d’une espèce (auxotrophe) sont satisfaits par la présence d’une autre
espèce qui synthétise ces facteurs.
Exemple
Haemophilus sp: bactérie auxotrophe pour le facteur V (NAD)
Staphylococcus: bactérie productrice de NAD
3- Milieux de culture :
Un milieu de culture : est une préparation qui permet la multiplication des Bs. Doit contenir les besoins
élémentaires, énergétiques et spécifiques des µorganismes à faire cultiver.
Milieux semi-solides
Milieu liquide + agar à faible
concentration (3 à 5 g/l)
Milieux enrichis Ex: Gélose nutritive au Milieu de base + substances (sang, sérum…) pour favoriser
sang, Favorise la croissance des bactéries hémolytiques la croissance du microorganisme recherché.
Extrait de viande de
Extrait de Lev
boeuf
Composé de sels
Excellente
minéraux, vitamines
vitamin
hydrosolubles, A.A,
composés
peptides, nucléotides,
carbo
glucides.
D. METABOLISME ENERGETIQUE :
1- Def :
L’énergie se définit comme la capacité d’accomplir un travail ou celle de provoquer des changements
particuliers.
Le métabolisme cellulaire est l’ensemble des réactions chimiques qui ont lieu dans la cellule.
L’énergie libérée durant le transfert des électrons est piégée sous forme d’ATP.
Une oxydation définie par une perte d'e- par un substrat, on écrire : AH2 (réducteur) A+2H++ 2e-
Une réduction définie par une gain d'e- par un substrat, on écrire : (oxydant) ????
Les électrons libres capturent par un oxydant B selon l'équation : AH2 A / B BH2
Il est possible d'identifier plusieurs voies métaboliques selon le trajet suivi par les électrons et la nature
de l'oxydant (accepteur d'électrons) final :
a) La respiration aérobie, transfert des électrons par des cytochromes jusqu’à l’oxygène moléculaire
comme accepteur final.
b) La respiration anaérobie, transfert des électrons par des cytochromes jusqu’à un accepteur final qui
peut être un ion minéral comme le nitrate ou un substrat organique comme le fumarate.
La respiration : l’oxydation complète des substrats organiques en composés minéraux (CO 2 et H2O) elle
fournit une grande quantité d’ATP (36 pour une molécule de glucose)
Un intermédiaire est nécessaire pour coupler les réactions exergoniques aux réactions endergoniques,
riches en énergie et peut être soit dérivés phosphorylés ayant une liaison anhydride (ATP, ADP, GTP,
GDP...) ou une liaison énol (phosphoénolpyruvate), les composés comportant une liaison thio-ester
(acétylCoA). Ils interviennent comme agents de couplage.
L’énergie est donc mise en réserve au sein de liaisons covalentes qui peuvent s’hydrolyser facilement.
Minérale Organic
-N2
-Nitrates NO-
3 -Nitrites -A.A
NO-2 -A.N
-Ammoniac
NH3