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-> 1. Définitions …
DOCUMENT DE TRAVAIL
-> Prise de notes (mercredi 12/10/20 à 8h)
METABOLISME
μεταβολή, du grec métabole
(« changement, transformation »)
A B
A B C D C
A
B
D
A
B C Reproduction ou diffusion totale ou partielle dans tout autre contexte strictement interdite sous peine de poursuites.
Tous droits réservés © l’auteur INTEGRATION METABOLIQUE 1
Pr S. MARY –Intégration métabolique– PASS / L-AS- UE1 Octobre 2020
-> 1. Définitions …
UE1 – ECUE 1.2 PASS / L-AS Octobre 2020 – Pr MARY – Prise de notes
SYMETRIE ET COMPLEMENTARITE
= EQUILIBRE DU MILIEU INTERIEUR
Continu
Simultanés Pas d’épargne
Régulés
Coordonnés
Distincts
Bioénergétique
Pose les bases de l’homéostasie
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INTEGRATION METABOLIQUE 2
Quels acteurs pour un métabolisme intégré ?
UE1 – ECUE 1.2 PASS / L-AS Octobre 2020 – Pr MARY – Prise de notes
ALIMENTS INGERES
Produits de la digestion
= Nutriments cellulaires
(lipides, glucides, protéines..)
CATABOLISME ANABOLISME
(O2) Energie
Intermédiaires métab.
Cofacteurs réduits
ATP
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UE1 – ECUE 1.2 PASS / L-AS Octobre 2020 – Pr MARY – Prise de notes
O2
+ C red
Produits organiques
AUTOTROPHES HETEROTROPHES
PHOTOSYNTHETIQUES C ox
matière organique
CO2
+
H2O
ENERGIE
Mécanique
Chimique
( AB) Électrique 13
Calorifique
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BESOINS EN ENERGIE ?
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-> 2. Stratégies du métabolisme
2.1 Gestion de l’énergie … BIOENERGETIQUE UE1 – ECUE 1.2 PASS / L-AS Octobre 2020 – Pr MARY – Prise de notes
Cellule vivante
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43,1 kJ/mol
ADP + Pi + H+ ATP + H2O
Etape 1
Etape 2
Acétyl CoA
Etape 3
Cycle de
l’acide
citrique
Chaîne e-
respiratoire,
Phosphorylation
oxydative
ATP
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-> 2. Stratégies du métabolisme
2.1 Produire de l’énergie … sous forme d’ATP ! UE1 – ECUE 1.2 PASS / L-AS Octobre 2020 – Pr MARY – Prise de notes
Incorporation
f(structure)
β−oxydation
Urée
Cycle de
l’urée
Cycle de
l’acide
citrique
Pr S. MARY –Intégration métabolique– PASS / L-AS- UE1 Octobre 2020 Central au métabolisme énergétique
Reaction de transition
NAD+ NADH
pyruvate
PDH (pyruvate déshydrogénase)
acétyl CoA
Krebs
O2 ADP ATP ANT ATP
succinate O 2 H 2O H+
NADH
V
I II III IV
H+ H+
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NADPH
Glycolyse
Production
coEnzymes réduits !!
β-OXYDATION
Cycle de Krebs
(cycle de l’acide citrique)
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NADPH
Voie pentoses
phosphates
NADPH, H+
NADH ; FADH2
(énergie libérée lors de la formation du gradient de protons)
CONCLUSIONS IMPORTANTES
Origine de l’ATP?? Question pivot
(voir aussi cours ECUE 2.1 S.MARY)
S. S.
Pr MARY – UE
MARY 1 INTEGRATION
–Intégration DU METABOLISME
métabolique– PASS / L-AS- UE1 Octobre 2020
2 . Les stratégies du métabolisme 2. Stratégie(s) du métabolisme
2 . 3 Produire les briques de l’édifice métabolique 3 . Les outils de régulation du flux
métabolique
Molécules simples AcétylCoA
Grands principes
de régulation des voies
Molécules complexes Cholestérol Échos entre les voies 3.1 Régulation enzymatique
Alanine
lactate Glycerol Acétyl-CoA
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HMG Co A réductase
HMGCoA Mévalonate
51
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INTEGRATION METABOLIQUE 13
3.1 Régulation enzymatique du flux métabolique
UE1 – ECUE 1.2 PASS / L-AS Octobre 2020 – Pr MARY – Prise de notes
Un contrôle coordonné repose sur….
Grands principes
de régulation des voies 3.1 Régulation enzymatique
3.2 Régulation par l’état énergétique de la cellule
ADP
ATP
Vitesse relative
du métabolisme
énergétique
charge
0,25 0,5 0,75 Équilibre 1 énergétique
énergétique
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3. Les outils de régulation du flux métabolique
un exemple intégré : la pyruvate kinase UE1 – ECUE 1.2 PASS / L-AS Octobre 2020 – Pr MARY – Prise de notes
GLYCOLYSE
NEOGLUCOGENESE
•Lactate
•Acides aminés
glucoformateurs
(alanine)
Pr S. MARY –Intégration métabolique– PASS / L-AS- UE1 Octobre 2020 (Berg, Tymoczko &Stryer, Biochimie, VI édition)
3 . Les outils de régulation du flux
métabolique
Grands principes
de régulation des voies 3.1 Régulation enzymatique
3.2 Régulation par l’état énergétique de la cellule
3.3 Régulation par la compartimentation cellulaire
-
Béta-oxydation
Σ AGL malonylCoA
regule
carnitine palmitoyl transferase JP CRISTOL
Néoglucogenèse
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UE1 – ECUE 1.2 PASS / L-AS Octobre 2020 – Pr MARY – Prise de notes
4. Dispositifs intrinsèques au
fonctionnement des voies métaboliques
Carrefours
L’exemple du lactate
(monnaie d’échange)
acétylCoA
pyruvate
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Glc-6-P
Pyruvate L/P
AcétylCoA
Le cerveau
Étudiant en septembre/octobre
•substrat énergétique préférentiel ?
5 . Profil(s) métabolique(s) d’organe Glucose [1mM] cerveau (GLUT3) (KM )
(corps cétoniques)
•Pas de réserves
ultradépendant du Glucose
•Consommation (120g/j)
Réserves +++
Réserves ±
Production lactate,
alanine
(néoglucogenèse hépatique)
Exercice
(§ 6.2)
musculaire
Pathologie
(§ 6.3)
cancéreuse
85
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Fonctionnement du
système de régulation de
la glycémie
POST PRANDIALE
Glucose
Glycogenogenèse
Glycogène
+ +
Glucagon α
β Insuline
β
+ Lipogenèse
rapport I/G
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INTEGRATION METABOLIQUE 22
6 . Exemples d’adaptations métaboliques
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Fonctionnement du
système de régulation de
la glycémie
« En phase POST
PRANDIALE tardive »
Glucose
Glycogène
Glycogénolyse
Lipolyse
rapport Ins/G
α
β β
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LE JEUNE (1/2)
Fonctionnement du
système de régulation de
la glycémie
« En période de jeûne»
Diabète de
type 1 ?
+ protéolyse
Lipolyse
rapport I/G AGL, CC
Glucagon α
β β
L’insulinothérapie - 1922
[plasmatiques]
[plasmatiques]
Corps cétoniques
AGL
(§ 6.1) Repas
(régulation glycémie)
Exercice
(§ 6.2)
musculaire
ATP en stock
P-créatine : 4-5 sec (15 mmoles/kg)
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6 . Exemples d’adaptations métaboliques
Coopération intertissulaire : le cycle de Cori adrénaline UE1 – ECUE 1.2 PASS / L-AS Octobre 2020 – Pr MARY – Prise de notes
GLYCOGENOLYSE
NEOGLUCOGENESE GLYCOLYSE
1 glucose
2 lactate + 2 ATP
2 lactate + 6 ATP
1 glucose
Exercice
(§ 6.2)
musculaire
Exercice musculaire
bref et intense
- +
OXYDATION GLYCOLYSE
DES LIPIDES ET GLYCOGENOLYSE
+ - (1000m)
Endurance
Coopération inter-tissulaire : FOIE-MUSCLE-TISSU ADIPEUX
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INTEGRATION METABOLIQUE 26
Exercice
(§ 6.2)
musculaire
« CROSS OVER CONCEPT » UE1 – ECUE 1.2 PASS / L-AS Octobre 2020 – Pr MARY – Prise de notes
la balance de l’utilisation des substrats
lipides
60 100
Glucides (%)
Lipides (%)
50 90
40 80
30 70
20 60
10 glucides 50
repos 20 40 60 80 100
Intensité de l’exercice (% de VO2max)
(D’après Brooks et Mercier, 1994)
Pathologies
(§ 6.3)
cancéreuses
lactate
2 ADP + 2 Pi 2 ATP
Glucose Glycolyse
2 NAD+ 2 NADH
+2 H+
2 pyruvates
Mais pour certains tissus la glycolyse
seule permet d’obtenir de l’énergie
2 molécules de lactate
Pathologies
(§ 6.3)
cancéreuses
Acétaldéhyde
NAD+
NADH,H+
Acétate AcétylcoA
Crise énergétique
La beta-oxydation ↓ (Stéatose ↑)
Nombreuses réactions
couplées et interconnectées
PAES
S. MARY – UE 1
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IDEE CLES ET CONCEPTS A RETENIR IDEE CLES ET CONCEPTS A RETENIR
Glycolyse
Pyruvate ATP
Acétyl CoA
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IDEE CLES ET CONCEPTS A RETENIR POUR INFORMATION
KREBS Recyclage
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UE1 – ECUE 1.2 PASS / L-AS Octobre 2020 – Pr MARY – Prise de notes
….
NUCLEOTIDES ET ACIDES
NUCLEIQUES Cours n°2 ECUE 2.1
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