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COENZYMES ET VITAMINES
Chapitre 3
Pr C. ZINSOU
OBJECTIFS
De l’enseignant :
• Donner les structures et caractéristiques fonctionnelles des coenzymes usuels rencontrés dans
le métabolisme et qui déterminent souvent le type de réactions
• Indiquer pour chaque sous-classe d’enzymes les coenzymes impliqués, leur structure et leur
mécanisme d’action
• Introduire la notion de séquence de réactions catalysées par des enzymes dont l’ordre
d’intervention est déterminé par les coenzymes impliqués. Illustration fournée par l’oxydation du
pyruvate par la pyruvate déshydrogénase.
De l’étudiant :
PLAN
OBJECTIFS
1 - INTRODUCTION - PROPRIETES
2 - LES COENZYMES D'OXYDOREDUCTION
2.1 - COENZYMES NICOTINIQUES OU PYRIDINIQUES
2.1.1 – PROPRIETES ET STRUCTURE
2.1.4 – MECANISME DE FORMATION DU COMPLEXE ENZYMATIQUE ET DE LA CATALYSE
2.2 - LES COENZYMES FLAVINIQUES
2.2.1 – PROPRIETES ET STRUCTURE
2.2.2 – MECANISME D’ACTION
2.2.3 – PRINCIPALES FLAVOPROTEINES MEMBRANAIRES
2.3 - LES COENZYMES QUINONIQUES : UBIQUINONE ET PLASTOQUINON²E
2.4 - LES METALLOPORPHYRINES : CYTOCHROMES ET PEROXYDASES
2.4.1 - CYTOCHROMES
2.4.2 – CATALASES ET PEROXYDASES
2.4.3 - OXYGENASES
2.5 - PROTEINES FER-SOUFRE
3 - LES COENZYMES DE TRANSPORT DES RADICAUX MONOCARBONES
3.1 - COENZYME DE TRANSPORT DE CO2
3.1.1 – BIOTINE OU VITAMINE H
3.1.2 – VITAMINE K (pour mémoire)
3.2 - COENZYMES DE TRANSPORT DE RADICAUX AUTRES QUE CO2
3.2.1 - S-ADENOSYL METHIONINE
3.2.2 - ACIDES FOLIQUES (LES FOLATES)
4 - COENZYMES DE TRANSPORT DE RADICAUX A DEUX OU PLUSIEURS CARBONES
4.1 - THIAMINE PYROPHOSPHATE (TPP)
4.3 - LE COENZYME A ou HSCoA
4.3.1 – ACTIVATION DE L’ACETATE ET DES ACIDES GRAS
4.3.2 – REACTIONS DE CARBOXYLATION
4.4 – ILLUSTRATION DE NOTION DE SEQUENCE DE REACTIONS ET DE COMPLEXE MULTI-
ENZYMATIQUE
5 - COENZYME DES AMINOTRANSFERASES : LE PYRIDOXAL PHOSPHATE
_
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1 - INTRODUCTION - PROPRIETES
Certaines enzymes fonctionnent avec des coenzymes ou cofacteurs. Les
coenzymes ou cofacteurs sont des métabolites non protéique, de faible masse moléculaire
comparée à la masse moléculaire des enzymes.
- Ils ont une structure simple.
- Ils agissent à faible concentration et doivent, comme les enzymes, être régénérés
à la fin d’une réaction ou d’une séquence de réactions
- Ils sont libres ou associés à l’enzyme.
- ils sont thermostables.
D’autres enzymes comportent dans leur structure le coenzyme. Ce dernier est lié à
l’apoenzyme par une liaison covalente. Le coenzyme est alors appelé groupement
prosthétique de l’enzyme et a un rôle activateur.
C’est sous la forme d’holoenzyme que l’enzyme acquiert une spécificité pour son
substrat. Cette spécificité peut être :
- étroite : l’enzyme n’agit que sur un substrat : la glucokinase ne phosphoryle que le
glucose
- lâche : l’enzyme intervient sur un groupe de substrats ayant une communauté de
structure : l’hexokinase phosphoryle tous les hexoses.
Les coenzymes sont introduits dans l'organisme des mammifères par l'alimentation
sous forme de vitamines ou de facteurs de croissance qui sont des composés
indispensables au métabolisme, agissant à dose faible, et non synthétisés par l'organisme.
Exemple :
Malate + NAD+ ←→ oxaloacétate + NAD+
Malate + NADP+ → Pyruvate + CO2 + NADPH,H+
Nicotinamide
H H
H
CONH2
CONH2
N+
N+
O
- O
O P O CH2 -
O + H-H O P O CH2
H H
- H-H H
O
H
+ H+
H H NH2
OH OH H H NH2
OH OH
O N
N O N
N
N N N N
-
O P O CH2 -
O P O CH2
O O
O O
H H
H H
H H
OH OH H H
OH OH
NAD+ NADH,H+
H H
H
CONH2
CONH2
N+
N+
O
-
O P O CH2 O
O -
+ H-H O P O CH2
H H
- H-H H
O
H
+ H+
H H NH2
OH OH H H NH2
OH OH
O N
N O N
N
N N N N
-
O P O CH2 -
O O
O P O CH2
H H
O O
H H
H H
OH O H H
OH O
O P O-
O P O-
O-
O-
NADP+ NADPH,H+
Figure 1 – Structure des deux coenzymes nicotiniques dérivés du nicotinamide (Vit PP). Le
couple NAD+/NADH,H+ est un accepteur ou donneur dans les réaction d’oxydoréduction du
catabolisme. Le couple NADP+/NADPH,H+ intervient par sa forme réduite comme donneur
d’électrons dans les réactions de biogenèse.
- Sous forme oxydée ces coenzymes n’ont qu’une seule bande d'absorption à 260
nm, due au noyau adénine
O O O H
N CH3
N CH3 N CH3
HN HN HN
CH3 O CH3 O CH3
O
N N N N N N
H
O O
- -
O P O O P O
Riboflavine (Vit B2)
O- O-
FMN FMNH2
O O H
N CH3 N CH3
HN HN
O CH3 O CH3
N N N
H
N
+ H2
CH2 - H2 CH4
(CHOH)3
NH2 (CHOH)3
NH2
CH2
N CH2
N N
O N
- N
OP O N O
- N
- O O CH2
OP O N
OP
O O - O
H H OP O CH2 O
O
H H H H
OH OH H H
OH OH
FAD FADH2
Figure 2 – Structure des deux coenzymes flaviniques dérivés de la riboflavine (Vit B2). Le
couple FMN/FMNH2 ne se rencontre que dans le transport des électrons de la chaîne
respiratoire. Le couple FAD/FADH2 est donneur ou accepteur d’électrons dans les réactions
de catabolisme.
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2.2.2 – MECANISME D’ACTION
Le noyau isoalloxazine comporte 2 doubles liaisons conjuguées capables de fixer
réversiblement deux atomes d'hydrogène. La forme oxydée présente une bande
d'absorption à 450 nm alors que la forme réduite n’en présente pas. Ces
déshydrogénases peuvent recevoir des hydrogènes des coenzymes nicotiniques. On
distingue les flavoprotéines membranaires, non auto-oxydables, à structure complexe, et
les flavoprotéines auto-oxydables cytoplasmiques qui peuvent transférer l'hydrogène
directement à l'oxygène avec formation de peroxydes d’hydrogène. Pour le transport des
électrons et des protons elles ont besoin parfois des ions comme le fer et le molybdène.
Les principales flavoprotéines impliquées dans le métabolisme énergétique de la cellule
figurent dans le tableau ci-dessous.
Les quinones possèdent deux fonctions quinones qui, par réduction, sont transformées en
dihydroquinone par acceptation de 2 électrons et de 2 protons libérés par le substrat. (Voir
figure 3).
O OH
H3CO CH3 + H2 H3CO CH3
- H2
CH3 CH3
H3CO (CH2 C C CH2) 10 H H3CO (CH2 C C CH2)10 H
H H
O OH
Coenzyme Q10 oxydé Coenzyme Q10 réduit
2.4.1 - CYTOCHROMES
Ce sont des chromoprotéines présentes dans toutes les cellules, dans la membrane
interne des mitochondries, dans la membrane thylakoide des chloroplastes, et dans le
cytoplasme. Le groupement prosthétique ferroprotoporphyrinique est le même (Voir figure
4). Seules les apoenzymes qui leur sont solidement accrochées par liaisons covalentes
sont différentes (avec des masses moléculaires allant de 13 000 à 250 000) et leur
confèrent des potentiels redox différents. Ils ont un rôle de transport séquentiel des
électrons grâce au changement de valence du fer. Dans les mitochondries des cellules
animales et végétales et dans les chloroplastes on a isolé et identifié un grand nombre de
cytochromes fonctionnant tous sur le même principe. C’est le fer du groupement
prosthétique qui transporte les électrons par passage réversible du fer ferrique en fer
ferreux (figure 9) :
Lors du transport des électrons l’ordre d’intervention des cytochromes est déterminé par
leur potentiel redox.
CH3 CH=CH2
Hème des cytochromes
N
H3 C CH3
N Fe N
HOOCCH2 CH2 CH=CH2
N
Figure 4 – Structure de l’hème des cytochromes. Les cytochromes sont présents dans
toutes les cellules. Ils sont impliqués dans le transport des électrons de la chaîne
respiratoire et de la photosynthèse par changement de valence du fer.
* Les peroxydases oxydent certains substrats à partir d'un peroxyde comme l'eau
oxygénée.
2.4.3 - OXYGENASES
Ces métalloprotéines catalysent l'incorporation d'un atome (monooxygénases) ou d'une
molécule d'oxygène (dioxygénases) sur un substrat. Certaines sont des cuproprotéines et
ferroprotéines (fer non hématinique). Un exemple est donné par la tyrosine oxygénase et
la dopamine ß-hydroxylase qui participe à la formation de la noradrénaline dans la
médullo-surrénale.
S Cys
S Fe
cys S
Fe S
Fe S
S Fe
S S Cys
cys
Elle sert aussi de transporteur à l’Acétyl-CoA carboxylase, une autre enzyme capitale
dans la synthèse des acides gras.
O Biotine
C
H H
N N
H H
H 2C CH CH 2-CH 2-CH2-CH2-COOH
Exemple
Ethanolamine + 3 S-adénosylméthionine → Choline + 3 S-adénosylhomocystéine
NH2
NH2
N
N N
N
CH3
O N
N N
S CH3
O O O
CH2 +
CH2-O-P-O-P-O-P-OH + O
CH2 S + PPi + Pi
O CH2 CH2
OH OH OH
CH NH2 CH2
COOH OH OH CH NH2
OH OH
COOH
ATP Méthionine S-Adénosy lméthionine
Figure 7 – Réaction de formation et structure de la S-Adénosylméthionine
Acide folique
OH
N
N CH2 NH C NH CH CH2 CH2 COOH
O COOH
N N
NH2
C
CH 2 CH2 O PH OH
+
CH2 N
N S O
C
H
HO P OH
N
H3C NH2
O
Thiamine pyrophosphate
R1 R1
R1
+
N CH3 N+
N+ CH3 R CH3
+ CO
R R
HOC C R2 C R2
HC R2 COOH HOC
COOH S H S
S CO2
L'acide lipoïque est un acide gras à 8 atomes de carbone qui a un pont disulfure
entre les carbones 6 et 8 (figure 10). Il est solidement lié à son apoenzyme. L’holoenzyme
formée prend alors le nom de lipoamide..
Acide lipoïque
S S
- l'adénosine 5'-diphosphate
- de l’acide pantothénique, qui est le facteur vitaminique (non synthétisé par les
animaux)
- et de la mercaptoéthylamine.
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La fixation du radical sur la fonction thiol produit la formation d'un thioester à haut
potentiel énergétique R-CO∼SCoA. Les réactions d’activation dans lesquelles intervient le
Coenzyme A sont décrites ci-dessous.
CH2
Coenzyme A N N
O
(HSCoA)
HO P O N
N
O
(1) HO P O CH2
O O
CH
OH OH
R
CO SH SH
O
SH S
+ HSCoA
(E 2)
R CH
+
H 2C CH R3
(2) SCoA
H2C CH R3 C
H2
C
H2
Acyl-CoA Dihydrolipoate
Acyllipoate
Les cellules animales forment des acyl∼CoA (réaction d’activation) suivant le même
mécanisme et la réaction est catalysée par l'acyl∼CoA synthétase.
Ø interviennent, dans un ordre bien fixé, 5 coenzymes : TPP, lipoate, HSCoA, FAD et
NAD+. Ces coenzymes sont indispensables au fonctionnement de la séquence de
réaction. L’ordre d’intervention des coenzymes détermine celui des enzymes de la
séquence (schéma de la figure 12).
H
O
O C
Pyridoxal phosphate
(PLP) HO P O H 2C OH
OH
N CH3
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