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NÚCLEO DE ANZOÁTEGUI
ESCUELA DE MEDICINA
DEPARTAMENTO DE CIENCIAS FISIOLÓGICAS
ASIGNATURA: BIOQUÍMICA
CÓDIGO: 153-2016
SÍNTESIS DE ATP
Objetivos Específicos:
Conocer
UNIDAD II: y diferenciar los distintos métodos experimentales utilizados para el
estudio bioquímico de las relaciones estructurales y funcionales de los tejidos y las
QUÍMICA DE LOS AMINOÁCIDOS Y LAS PROTEÍNAS
células.
Capacitar para la elaboración de un protocolo experimental para el estudio de las
TEMApropiedades
1: EL AGUA.
estructurales y/oPROPIEDADES FÍSICAS
funcionales de células, Y QUÍMICAS
organelos y biomoléculas.
Objetivos Específicos:
Conocer, analizar y aplicar los conceptos de hidrofobicidad, puentes de
hidrógeno, interacciones bipolares (dipolo-dipolo, dipolo-dipolo inducido,
dipolo inducido-dipolo inducido), constante dieléctrica.
Conocer, analizar y aplicar los conceptos de polaridad, ionización y
escala de pH.
Conocer, analizar y aplicar los conceptos de pH, de pK, ácido, base y
solución tampón.
Objetivos Específicos:
Reconocer las funciones químicas amino y carboxilo, como las responsables
del comportamiento anfótero de todos los aminoácidos en soluciones
acuosas.
Conocer y aplicar la clasificación de los aminoácidos en función de sus grupos
funcionales.
Reconocer los distintos grados de hidrofobicidad de los aminoácidos
Conocer y aplicar las distintas nomenclaturas para la designación de los
aminoácidos.
Analizar correctamente las curvas de titulación de los aminoácidos en función
de su comportamiento en solución acuosa.
Definir y aplicar el concepto de punto isoeléctrico.
Determinar el estado de ionización de un aminoácido mediante el cálculo de su
carga neta, en una solución acuosa y relacionarlo con su capacidad de
expresar alguna actividad biológica.
Diferenciar los aminoácidos codificables de los no-codificables
Objetivos Específicos:
Conocer los distintos métodos de separación de los aminoácidos y las
proteínas y su importancia en el diagnóstico de algunas enfermedades.
Relacionar las propiedades fisicoquímicas de una proteína y su composición
de aminoácidos con su comportamiento electroforético, cromatográfico y
con la introducción de cambios en la fuerza iónica, el pH y otros.
Objetivos Específicos:
Comprender la relación estructura-función en una proteína.
Relacionar la estructura tridimensional de una proteína, con distintas
interacciones de importancia funcional.
Conocer y analizar las distintas funciones de la hemoglobina y relacionarlas
con su estructura.
Comprender la importancia del efecto cooperativo, en la capacidad
transportadora de oxígeno de la hemoglobina.
Analizar la función de la hemoglobina como molécula transportadora de
oxígeno y dióxido de carbono.
Explicar la importancia funcional de los restos E7 y F6 en la hemoglobina y
la mioglobina.
Conocer, analizar y explicar el papel bifosfoglicerato en la afinidad de la
hemoglobina por el oxígeno.
Conocer, analizar y explicar el efecto Bohr en función de sus bases
moleculares.
Integrar a través de un esquema, todas las funciones de la hemoglobina.
Objetivos Específicos:
Conocer y aplicar los conceptos de energía y sistemas termodinámicos.
Conocer, analizar y aplicar las definiciones de los diferentes tipos de
sistemas termodinámicos.
Analizar la célula como un sistema termodinámico estacionario.
Definir las Funciones de Estado.
Conocer qué es una propiedad extensiva y definir el estado de equilibrio.
Definir y aplicar el concepto de energía interna de un sistema.
Conocer y aplicar el primer principio de la termodinamia en los sistemas
biológicos.
Definir y aplicar los conceptos de calor, trabajo, entalpía y entropía.
Conocer y aplicar los conceptos de reacciones endotérmicas y exotérmicas.
Definir y aplicar el segundo principio de la termodinamia.
Diferenciar reacciones espontáneas, irreversibles y reversibles.
Objetivos Específicos:
Definir y comprender el concepto de energía libre de un sistema.
Conocer y entender la función de la energía libre de Gibbs, como una relación
entre la primera y la segunda ley de la termodinamia.
Relacionar la energía libre de Gibbs con los conceptos de H y pH.
Conocer y aplicar los conceptos de reacciones endergónicas y exergónicas.
Analizar las actuaciones en las cuales una reacción química posee una energía
libre mayor, menor, o igual a cero y relacionarla con la direccionalidad del
proceso.
Conocer y aplicar las propiedades aditivas de la energía libre y calcular el ▲G de
la hidrólisis del ATP.
Objetivos Específicos:
Explicar el concepto de enlace de alta energía, y conocer los compuestos
ricos en energía.
Explicar el concepto de potencial de transferencia.
Explicar por qué el ATP es el intermediario energético fundamental en los
procesos biológicos.
Explicar las bases moleculares que premiten la formación de enlaces de alta
energía con especial énfasis en la molécula de ATP y los enlaces éster
fosfato.
Explicar la procedencia de energía para los procesos metabólicos en el
organismo humano.
Explicar la importancia de los procesos de transferencia energética en el
control y regulación del flujo, en las distintas rutas del metabolismo celular.
Objetivos Específicos:
Conocer los distintos procesos de transferencia electrónica que ocurren en
los seres vivos y comprender su importancia como procesos transferidores de
energía.
Definir, analizar y aplicar los conceptos de agente reductor, agente oxidante,
par redox y reacción redox.
Definir, analizar y aplicar los conceptos de potencial redox y potencial redox
estándar.
Aplicar la relación entre potencial redox y energía libre estándar.
Mencionar enzimas y coenzimas que participan en las reacciones redox.
Determinar la direccionalidad de la transferencia energética de una reacción
redox.
Las enzimas como catalizadores biológicos. Los componentes de una enzima, conceptos de
apoenzimas, holoenzimas, grupo prostético, coenzima, cofactor, sitio de unión, sitio
catalítico, centro activo, especificidad. Los componentes de un sistema enzimático, la
enzima, el sustrato y los productos. Clasificación y nomenclatura de las enzimas.
Ejemplos de algunas enzimas asociadas al funcionamiento de los sistemas y rutas
metabólicas en el ser humano. Conceptos de isoenzimas y zimógenos.
Objetivos Específicos:
Reconocer el carácter proteico de las enzimas.
Reconocer la función de las enzimas en el cuerpo humano.
Analizar y explicar las diferencias entre catalizador químico y biológico.
Definir y aplicar los conceptos de grupo prostético, apoenzima, holoenzima,
cofactor, coenzima, centro activo, sitio de unión, sitio catalítico, sustrato y
especificidad.
Conocer y aplicar la clasificación de las enzimas y su nomenclatura.
Objetivos Específicos:
Comprender la importancia de la formación del complejo enzima-sustrato en
la catálisis enzimática.
Analizar y explicar la disminución de la energía de activación en una reacción
catalizada por una enzima.
Explicar por qué las enzimas se comportan como trampas entrópicas.
Conocer y explicar la importancia de los distintos eventos moleculares
responsables de las actividades catalíticas de las enzimas.
Reconocer la importancia de los aminoácidos serina, histidina y cisterna en la
catálisis enzimática.
Reconocer la importancia de los metales de transición en la catálisis
enzimática.
Definir las serin-proteinasas y metal-proteinasas.
Reconocer algunos marcadores de afinidad y sus aplicaciones biológicas.
Objetivos específicos:
Justificar la importancia del estudio y conocimiento de la Biología Molecular
y sus metodologías para el avance de la medicina actual.
Presentar en forma global y secuencial los temas a tratar en el área de
Biología Molecular. Reconocer la importancia del estudio de cada uno de
ellos.
Objetivos Específicos:
Reconocer los elementos químicos básicos constituyentes de la estructura
de los nucleótidos.
Reconocer las diferencias entre la estructura de las bases nitrogenadas A,
T, C, G y U.
Comprender las bases químicas del tautomerismo ceto-enol e imino-amino
y su importancia en la mutagénesis.
Resaltar la diferencia entre los nucleótidos, los nucleósidos y los
desoxinucleótidos.
Identificar en la estructura del nucleótido los sitios de unión entre el resto de
la base nitrogenada, el azúcar pentosa y el grupo fosfato.
Objetivos Específicos:
Reconocer la procedencia de los distintos átomos de carbono y de nitrógeno
en la ruta de síntesis de novo de las purinas.
Reconocer la importancia de la participación del compuesto fosforribosil
pirofosfato en las rutas metabólicas de síntesis de los nucleótidos.
Definir los niveles de control y sistemas de regulación enzimática que
funcionan en relación con esta ruta metabólica.
Comprender la importancia del funcionamiento integral de los mecanismos de
regulación, para la obtención de cantidades equimolares de los dos tipos de
nucleótidos de purinas, como constituyentes básicos de la estructura de los
ácidos nucleicos.
Destacar el papel de las coenzimas NAD y tetrahidrofolato en el proceso.
Reconocer la importancia de las rutas de recuperación de bases purínicas
libres en el hombre.
Objetivos Específicos:
Relacionar el proceso de producción de los nucleótidos difosfato con la
síntesis de sus formas desoxi correspondientes.
Visualizar la importancia de la síntesis equitativa de las formas
ribonucleótidos trifosfato y de desoxirribonucleótidos trifosfato para la síntesis
de ARN y del ADN
Entender la importancia del proceso de regulación de la síntesis de
desoxirribonucleótidos, a partir del proceso modulador ejercido por los
compuestos ATP y dTTP.
Conocer la existencia y el mecanismo de acción de las drogas
antineoplásicas que interfieren con la síntesis de desoxirribonucleótidos.
Objetivos Específicos:
Objetivos Específicos:
Comparar el grado de complejidad organizativa del ADN entre células
procarióticas, eucarióticas y los virus.
Relacionar los cambios en el grado de condensación de la cromatina con los
procesos de replicación y la transcripción del ADN.
Establecer la relación entre las distintas formas organizativas del ADN y las
características de las funciones de replicación de los organismos.
Objetivos Específicos:
Reconocimiento de la replicación de l ADN, como un requisito previo a la
división celular.
Entender cómo el modelo de replicación semiconservativa garantiza la
fidelidad del proceso de replicación del material genético.
Reconocimiento de la replicación como un proceso que garantiza la
Bioquímica (IV Semestre) Pá gina 21
perpetuación de la especie.
Describir la secuencia de pasos involucrados en el proceso bioquímico de la
replicación del ADN.
Comprender la importancia de la capacidad autocorrectora del proceso para
la disminución de la tasa mutacional en las especies.
Objetivos Específicos:
Reconocer al proceso de la transcripción del ADN, como el mecanismo
mediante el cual ocurre la expresión de la información genética en los
organismos.
Diferenciar la función de cada uno de los ARN productos de la transcripción,
en el proceso de síntesis de las proteínas.
Comprender la importancia del proceso de maduración de los ARN, como un
mecanismo que permite la regulación de la expresión genética a distintos
niveles, particularmente en le caso de los organismos eucarióticos.
Relacionar el proceso de corte y empalme en le ARN de eucariotes y la
aparición de isoproteínas en las células de nuestro organismo. Relación de
este fenómeno con la especialización celular.
Reconocer el mecanismo de acción de las ribonucleoproteínas nucleares
pequeñas, en el proceso de corte y empalme del ARN.
Relacionar la presencia de algunas enfermedades autoinmunes, con el
malfuncionamiento o ausencia de complejos de ribonucleoproteínas
Objetivos Específicos:
Objetivos Específicos:
Objetivos Específicos:
Objetivos Específicos:
Definir y clasificar a los carbohidratos de acuerdo a la estructura molecular.
Comprender las bases químicas de la hidrofilicidad de los carbohidratos.
Comprender la importancia de los carbohidratos, como principal fuente de
combustible celular y como constituyentes de otras macromoléculas y
organelos celulares.
Relacionar la isomería óptica con la presencia de uno o varios carbonos
asimétricos en la estructura de los carbohidratos.
Comprender la importancia del fenómeno de la isomería, con relación a la
diversidad estructural que este confiere a la familia de los monosacáridos.
Objetivos Específicos:
Conocer la importancia de la actividad conjunta de los sistemas de
transporte de glucosa en la célula epitelial, para la absorción normal de los
monosacáridos durante el período absortivo.
Establecer la diferencia entre los mecanismos de acción de los sistemas de
transporte facilitado pasivo y activo, en relación a su dependencia de
energía metabólica.
Identificar los transportadores de glucosa, como una familia de proteínas
integrales de la membrana plasmática, cuya presencia depende de la
expresión genética particular en cada tejido del organismo.
Objetivos Específicos:
Objetivos Específicos:
Identificar a la glucosa como unidad básica del metabolismo intracelular de
los carbohidratos.
Capacitar para la elaboración de un esquema integral de la relación de todas
las rutas metabólicas que involucra a los carbohidratos.
TEMA 6: LA GLUCÓLISIS.
La glicólisis, definición como ruta metabólica universal, para la obtención de
energía, aspectos históricos. Las reacciones de fosforilación al nivel de sustrato,
para la síntesis de ATP. La generación de otras rutas metabólicas. Análisis de los
aspectos más resaltantes de cada una de las reacciones enzimáticas de la ruta.
Objetivo particular de cada reacción y su relación con las reacciones precedente y
posterior. Consideración de los valores de ▲G o paticulares y generales, para el
análisis de la ocurrencia de las reacciones en condiciones fisiológicas. Las
enzimas hexoquinasa, fosfofructoquinasa y piruvatoquinasa, como puntos de
control central para la regulación integral de la velocidad de la ruta. Los
moduladores positivos y negativos y los índices energéticos, como elementos del
sistema de control de la actividad de esta enzima. Importancia fisiológica de la
glicólisis, bajo distintas condiciones normales y patológicas.
Objetivos Específicos:
Explicar la importancia biológica de las rutas pentosas fosfato, como única
fuente generadora de poder reductor, bajo la forma de NADPH y de ribosa-
fosfato para las reacciones de síntesis de macromoléculas.
Mencionar la ubicación subcelular y tisular de la vía de las pentosas
fosfato.
Explicar el sistema de regulación de la ruta, a través del efecto alostérico
de los moduladores sobre la actividad de la enzima glucosa-6-fosfato
deshidrogenasa.
Objetivos Específicos:
Comprender la importancia del proceso de almacenamiento de glucógeno,
como el mecanismo de reserva energética de corta duración en el organismo
humano.
Diferenciar la ruta de síntesis y la ruta de degradación, como dos eventos
independientes que ocurren en el mismo compartimiento intracelular, pero
que responden a señales de regulación particulares.
Diferenciar la función del glucógeno hepático y la función del glucógeno
muscular, a través de su conexión con otras rutas del metabolismo de los
carbohidratos.
Reconocer la “irreversibilidad” de la reacción de degradación del glucógeno, a
consecuencia de la relación de las concentraciones intracelulares de los
metabolitos glucosa-6-fosfato y Pj.
Reconocer la relación entre las alteraciones genéticas de las enzimas del
metabolismo del glucógeno y síntomas clínicos como la hepatomegalia,
hipoglicemia y cetoacidosis metabólica.
TEMA 9: LA GLUCONEOGÉNESIS.
Definición, objetivos e importancia biológica. El hígado como órgano principal
para el funcionamiento de esta ruta metabólica. Diferenciación conceptual de las
rutas gluconeogénica y glucolítica. Análisis comparativo de las reacciones entre
ambas. Los sustratos gluconeogénicos, procedencia del lactato, el glicerol y los
aminoácidos gluconeogénicos. Definición y funcionamiento del ciclo de Cori y el
ciclo de la alanina. Condiciones metabólicas que favorecen la ruta
Objetivos Específicos:
Reconocer la importancia de los lípidos como moléculas estructurales y de
reserva energética, en los distintos tejidos animales.
Reconocer el sistema de clasificación de los lípidos, de acuerdo a sus
características estructurales.
Reconocer la estructura de los triglicéridos, como constituyentes principales
de las reservas de energía de largo plazo en el organismo humano.
Definir la función de los fosfolípidos y del colesterol, en las membranas
biológicas animales.
Reconocer la importancia de las lipoproteínas, como vehículo de transporte
de los lípidos en el torrente sanguíneo.
Objetivos Específicos:
Objetivos Específicos:
Describir el paso de los componentes de las micelas mixtas al interior de los
enterocitos.
Describir el proceso de reesterificación que ocurre en la mucosa intestinal.
Esquematizar la formación de los quilomicrones en la célula intestinal.
Describir el paso de los quilomicrones hacia el torrente sanguíneo.
Describir el proceso de absorción de los ácidos grasos de cadena mediana
y cadena corta.
Objetivos Específicos:
Objetivos Específicos:
Reconocer la función de los ácidos grasos como molécula de reserva
energética de mediano y largo plazo, a través del proceso de almacenamiento
y oxidación metabólica.
Realizar un esquema integrador de las rutas metabólicas del anabolismo y el
catabolismo de los lípidos dentro de las células y entre tejidos periféricos.
Conocer el mecanismo de regulación del metabolismo de los ácidos grasos, a
través de moléculas de carbohidratos y de las enzimas sensibles a hormonas.
Objetivos Específicos:
Describir los principales combustibles celulares.
Describir en forma general la producción de acetil-Coa a partir de los
diferentes combustibles celulares.
Explicar la importancia del intermediario acetil-Coa en el proceso de
regulación de la obtención de energía metabólica, a partir de la oxidación de
las moléculas combustibles.
Objetivos Específicos:
Explicar el papel catalizador del ácido oxaloacético en el funcionamiento del
ciclo de Krebs.
Describir la producción del CO2 y poder reductor, como los productos
principales del ciclo de Krebs.
Bioquímica (IV Semestre) Pá gina 34
Explicar los puntos centrales de regulación enzimática del ciclo de Krebs.
Explicar la conexión funcional entre el ciclo de Krebs y la cadena de
transporte electrónico.
Describir el proceso de óxido-reducción asociado al funcionamiento de la
cadena de transporte electrónico.
Describir el proceso de síntesis de ATP, en función de la asociación física
entre el proceso de óxido-reducción y la fosforilación del ADP.
Objetivos Específicos:
Calcular el rendimiento energético del ATP a partir de la oxidación de la
glucosa como combustible.
Calcular el rendimiento energético del ATP a partir de la ß-Oxidación del
palmitato en la mitocondria.
Comparar el rendimiento de ATP proveniente de la oxidación de diferentes
combustibles.
Explicar la importancia de síntesis de ATP a partir de diferentes
combustibles, en distintas condiciones fisiológicas y patológicas.
Objetivos Específicos:
Explicar la importancia de los aminoácidos en la dieta.
Explicar el concepto de aminoácidos esenciales y no esenciales.
Explicar el concepto de balance nitrogenado.
Objetivos Específicos:
Explicar la existencia de diferentes sistemas de transporte para los
aminoácidos.
Conocer la existencia de distintos tipos de transportadores de aminoácidos.
Explicar el mecanismo simport utilizado por las células para el transporte de
aminoácidos.
Explicar el ciclo de glutamilo como un sistema de transporte de
aminoácidos.
Objetivos Específicos:
Entender la importancia nutricional de las vitaminas.
Conocer sus requerimientos vitamínicos del organismo humano.
Objetivos Específicos:
Objetivos Específicos:
Objetivos Específicos:
Conocer y explicar la existencia de una proteína receptora de fotones.
Conocer y explicar las interacciones moleculares y su relación funcional
entre el 11-cis-retinal y la oxina en la molécula de rodoxina.
Conocer, analizar y explicar los eventos moleculares que se desencadenan
Objetivos Específicos:
Conocer la estructura de la vitamina D y sus compuestos relacionados.
Explicar la importancia de los procesos fotoquímicos en la biosíntesis del
colecalciferol.
Explicar las funciones de las proteínas enlazadoras de la vitamina D.
Explicar la importancia del riñón y la placenta en la función de la vitamina D.
Explicar las diferencias bioquímicas entre el raquitismo tipo uno y tipo dos.
Conocer la estructura de la vitamina K.
Conocer las fuentes de la vitamina K para el organismo humano.
Explicar las bases bioquímicas de la acción biológica de la vitamina K.
Explicar el ciclo metabólico de la vitamina K.
Explicar los efectos de la 4-hidroxicoumarina, el salicilato, la
sulfoquinoxalina y la warfarina en el metabolismo de la vitamina K.
Explicar el efecto de la cefalosporina de la 2 y 3 generación que contienen
N-metil trotertazol, (NMTT) en el metabolismo de la vitamina K.
METODOLOGÍA DE LA ENSEÑANZA