Моделирование биологических процессов

(на примере моделирования динамики популяций)

Моделирование есть процесс конструирования модели реальной системы и
постановки экспериментов на этой модели с целью либо понять поведение системы,
либо оценить (в рамках ограничений, накладываемых некоторым критерием или
совокупностью критериев) различные стратегии, обеспечивающие функционирование
данной системы. Иначе говоря, модель – представление группы объектов или идей в
некоторой форме, отличной от их реального воплощения.
Основополагающим принципом моделирования является структурно-
функциональное соответствие модели и исследуемого объекта. Реальному объекту
может соответствовать много моделей, структура которых определяется прежде всего
задачей исследования, т. е. в конечном счете субъективно.
Модель – формальное описание основных элементов естественнонаучной
проблемы в физических и математических терминах. Иными словами, модель может
быть точной копией объекта (из другого материала, в другом масштабе), или
отображать некоторые характерные свойства объекта в абстрактной, т.е.
математической форме. Модель – используемый для предсказания и сравнения
инструмент, позволяющий логическим путем спрогнозировать последствия
альтернативных действий и достаточно уверенно сказать, какому из них отдать
предпочтение.
Моделирование как процесс не ново. Формирование понятия моделирования и
разработка моделей играли жизненно важную роль в духовной деятельности человека
с тех пор, как оно стало стремиться к пониманию и изменению окружающей среды.
Люди всегда использовали концепцию модели, пытаясь с ее помощью представить и
выразить абстрактные идеи и реальные объекты (от наскальной живописи до
составления систем сложных математических уравнений).
Модель может принимать различные формы, но одна из наиболее полезных и
определенно наиболее употребительных форм – это математическая, выражающая
посредством системы уравнений существенные черты изучаемых реальных систем
или явлений.
Сама математическая модель является абстрактной системой, которая состоит из
абстрактных элементов, причем вводится представление об абстрактном
функционировании и абстрактном взаимодействии этих элементов.
Выбор конкретной математической модели указывает на то, какие исходные
данные следует получить из экспериментов для того, чтобы соответствующая модель
правильно описывала определенный круг явлений.

Задание – проведите физическое моделирование ритмической самоорганизации

численности популяций (модель создана и описана Дж.Т. Томпсоном).
Для моделирования понадобятся шахматная доска, у которой в раскрытом
состоянии нет просвета между 4-й и 5-й горизонталями, а также два набора плоских
дискообразных фишек разного цвета, диаметр который не превышает трети стороны
клетки доски (можно использовать монеты, картонные кружки, пуговицы).
Выберите одно из начальных соотношений «жертв» и «хищников»:
а) 20 : 10; б) 25 : 5; в) 15 : 15.
Правила моделирования:
 1) в заданном исходном соотношении «хищники» и «жертвы» тщательно
перемешиваются и равномерно распределяются по ареалу обитания (игровому полю);
2) положения фишек, относящимся к двум или четырем соседним клеткам доски,
корректируются перемещением фишки в одну, превалирующую клетку;
3) «хищники», попавшие на черные клетки, если там нет «жертв», «вымирают»
из-за отсутствия пищи (т.е. снимаются с доски);
4) «жертвы», попавшие на белые клетки, если там нет «хищников»,
«размножаются» (т.е. удваиваются по числу);
5) «хищники», попавшие на одну клетку с «жертвами», «поедают» последних и
«размножаются» (т.е. фишки «жертв» снимаются с доски, а фишки «хищников»
удваиваются на занятых ими полях);
6) после выполнения всех правил игровой цикл повторяется с использованием
оставшихся на доске фишек.
Выполните не менее 30 игровых циклов, каждый раз фиксируя в тетради
результат очередного цикла.
Проведите аналогичное моделирование с другими соотношениями начальных
численностей «жертв» и «хищников».
Зарисуйте графики динамики ритмов популяции, реализованных в вашей модели,
отметив на оси абцисс – игровые циклы, а на оси ординат – «численности» «жертв» и
«хищников».
Ответьте на следующие вопросы:
1. Какой ритм – хищников или жертв – является опережающим?
2. Являются ли колебания численности популяций гармоническими (т.е.
синусоидальными по форме)?
3. Зависит ли период ритма популяций от исходного соотношения их
численностей?

Требования к выполнению данного задания:

В отчете должно быть название работы, описание материалов, которые были
использованы для моделирования, представлены графики, отражающие результаты
моделирования, с подробными подписями осей, указания на исходное соотношение
численностей «жертв» и «хищников», полные ответы на вопросы, для понимания
которых не нужно перечитывать текст вопроса.