18.05.

2020

ВИРУСЫ
ВИРУСОЛОГИЯ

1892 – Д.И. Ивановский

ВИРУС ТАБАЧНОЙ МОЗАЙКИ
у растений

1898 – М.Бейеринк
ВИРУС ЯЩУРА
у крупного рогатого скота

1901 – У.Рид
ВИРУС ЖЕЛТОЙ ЛИХОРАДКИ
у человека

1901 •Уолтер Рид с коллегами - обнаружено первое вирусное заболевание человека

- жёлтая лихорадка
1907 •вирус натуральной оспы
1909 •вирус полиомиелита
1911 •вирус саркомы Рауса
1912 •вирус герпеса
1926 •вирус везикулярного стоматита
1931 •вирус гриппа свиней и вирус западного энцефаломиелита лошадей
1933 •вирус гриппа человека и вирус восточного энцефаломиелита лошадей
1934 •вирус японского энцефалита и вирус паротита
1936 •вирус рака молочных желез мышей
1937 •вирус клещевого энцефалита
1945 •вирус крымской геморрагической лихорадки
1948 •вирусы Коксаки
1951 •вирусы лейкоза мышей и вирусы ЕСНО
1953 •аденовирусы и вирус папилломы человека
1954 •вирус краснухи и вирус кори
1956 •вирусы парагриппа, вирус цитомегалии и респираторно-синцитиальный вирус
1957 •вирус полиомы
1959 •вирус аргентинской геморрагической лихорадки,
1960 •риновирусы

1
 18.05.2020

1917 – Феликс д’Эрель

БАКТЕРИОФАГ
- вирус бактерий

2008 - «ВИРОФАГИ» - вирусы вирусов

Mimivirus-dependent virus Sputnik, ранее Sputnik
virophage — субвирусный агент, который способен
заражать клетки (амёб) исключительно в
присутствии вируса-хозяина - мимивируса.

Бар - 200 нм

Хозяин - амеба Acanthamoeba polyphaga

Вирус-хозяин - мимивирус
Bernard La Scola et al. The virophage as a unique parasite
of the giant mimivirus // Nature. 2008. V. 455. P. 100–104.

Mavirus

Внутри гигантского вируса CroV

жгутивого Cafeteria roenbergensis

Fischer MG, & Suttle CA (2011) A Virophage at the

Origin of Large DNA Transposons // Science (New
York, N.Y.) PMID: 21385722

Phycodnaviridae
OLV (Organic Lake Virophage)

паразитирует на вирусах
водоросли Phycodnaviridae

Yau, S. et al. (2011) Virophage control of antarctic algal host–virus

dynamics // PNAS USA. V. 108, N. 15 doi: 10.1073/pnas.1018221108

Что может стать объектом поражения вирусом?

Прока-
риоты: Клетки
Клетки Другие
бактерии животных Грибы
растений вирусы
(бактерио- и человека
фаги)
и археи

Степень изученности

2
 18.05.2020

Морфология и строение вирусов

Вирусы существуют в 2-х основных формах:

Внеклеточная форма Внутриклеточная форма

Вирион, вирусная частица, репродуцирующийся вирус
покоящаяся форма вегетативный вирус,
комплекс «вирус-клетка»
• Метаболически не активна
Использует синтетический и
(нет катаболизма,
энергетический аппарат клетки
нет анаболизма),
для репродукции новых вирусных
• Не размножается
частиц
• Неклеточная форма жизни

Только ассоциируясь с клеткой, вирус приобретает

свойства живой системы!

Размеры вирусов
Средний размер вирусов: 20–300 нм 500нм (мимивирусы)

20нм (пикорнавирусы)

Сравнительные размеры вирусов

Электронная
микроскопия

«Мегавирус чилийский»
Megavirus chilensis (MGVC)

открыт в апреле 2010 года в образце воды,

взятом неподалёку от научной станции Лас
Круцес (провинция Сан-Антонио, Чили).

• диаметр капсида 440 -700 нм

(крупнейший из известных вирусов)
• геном содержит 1 259 197 п. н.

• ДНК-содержащий вирус,
• поражает амёб
• родственен мимивирусу (APMV) Его размеры в 10 раз превышают средний размер
вируса, а диаметр составляет 0,7 мкм
Megavirus chilensis можно разглядеть в обычный
световой микроскоп, в то время, как другие
вирусы — только в электронный.

D. Arslan, M. Legendre, V. Seltzer, C. Abergel, J.-M. Claverie (2011-10-10). Distant Mimivirus

relative with a larger genome highlights the fundamental features of Megaviridae // PNAS.

3
 18.05.2020

Строение вирусов (вирионов)

• Капсид
Покровы
• Оболочка (не у всех)
Вирусная частица
(вирион) • НК (ДНК или РНК)
Центральная часть • Матриксные белки (не у всех)
• Ферменты (не у всех)

Капсид - белковая оболочка Капсомеры состоят из одной

Капсид состоит из одинаковых капсомеров (у ВТМ) или нес-ких
Нуклеокапсид - капсид + НК белковых субъединиц

«в оболочке», «с
«раздетые», «голые»
суперкапсидом»

Строение вируса герпеса

Шипы (гликопротеины)
Матрикс

Кор

2ц ДНК

Капсид
Суперкапсид

Строение вирусов (вирионов): симметрия в вирионах

1) спиральная

Вирус табачной мозаики (ВТМ)

2нм
Длина – 300 нм
Диаметр – 18 нм
300нм

Внутр. Диаметр – 2 нм
2130 капсомеров (7х2х2,3 нм),
Шаг спирали – 2,3нм,
18нм
16,33 белковых субъединиц

4
 18.05.2020

Строение вирусов (вирионов): симметрия в вирионах

2) кубическая
Примеры:
• аденовирусы
• вирус простого герпеса
• реовирусы
ВПЧ
Ø  55 nm. Вирус содержит 72 капсомера,
Икосаэдр – 20-тигранник по 5 субъединиц в каждом. Итого, 360
белковых субъединиц.
Мимивирус
• Ø 400 нм
• Геном 1,185 Mbp, 2ц ДНК
• 1260 генов (вместо 100 обычных)

3) комбинированная

Примеры:
• Некоторые бактериофаги

Морфология вирусов (вирионов)

1) палочковидные ВТМ

2) Нитевидные

3) Сферические

Пикорнавирус (раздетый)

Герпесвирус
(оболочечный)

4) Кубовидные

5) Булавовидные
Бактериофаги, актинофаги Бактериофаг E. coli T4
Ø головки - 85 nm

Морфология вирусов (вирионов)

Вирус гриппа 6) Сложные вирусы

Ø 80 nm
Вирус ВИЧ
(1) РНК-геном вируса, (2) нуклеокапсид, (3) капсид, (4)
белковый матрикс, подстилающий (5) липидную
мембрану, (6) gp120 — гликопротеин, с помощью
которого происходит связывание вируса с клеточной
мембраной, (7) gp41 — трансмембранный гликопротеин.
(8-11) - белки, входящие в состав вириона и
необходимые вирусу на ранних стадиях инфекции: (8) —
интеграза, (9) — обратная транскриптаза, (10) — Vif, Vpr,
Nef и p7, (11) — протеаза.

5
 18.05.2020

Химический состав вирусов

1935 г. - У.М. Стенли
выделил ВТМ в кристаллическом виде
1946 г. - Нобелевская премия по химии (совместно с
Д.Самнером и Д.Нортропом) «за приготовление
в чистом виде ферментов и белков вирусов»

Простые вирусы Сложные вирусы

НК + белок капсида
+
НК + белок капсида липопротеидная
мембрана, углеводы,
ферменты

Эксперименты Френкель-Конрата
(50-е гг. XX века)
Разделение белковой и нуклеотидной
составляющей вируса

Вирусные геномы
ДНК-геномные РНК-геномные
1ц ДНК 2ц ДНК 1ц РНК 2ц РНК
φX174 Вирусы герпеса, оспы, MS2, Полиовирусы φ6
Chicken anemia virus Лямбда (E. coli), Т4 Вирусы гриппа, бе- Реовирусы
шенства, ретровирусы,
SARS-CoV-2
• Маленький размер (max 1,18 Mb - у Мимивируса, 1.26 Mb - у Чилийского мегавируса)
• Только один тип НК – РНК или ДНК (см. Табл.)
• 1- или 2-цепочечная НК
• Кольцевая форма или, чаще, линейная
• М.б. фрагментированный геном (моновирусы и ковирусы или мультивирусы)

Вирусные геномы: 1 ц РНК

6
 18.05.2020

Особенности вирусных нуклеиновых кислот

• Необычные (аномальные) азотистые основания в ДНК у фагов:
5-оксиметилцитозин – вместо цитозина;
5-оксиметилурацил – вместо тимина.
Метилирование стабилизирует ДНК, упридает устойчивость к нуклеазам.

• Дополнительный углеводный компонент в ДНК у некоторых фагов:

глюкоза в виде моно- или дисахарида. Она присоединена с помощью гликозидной
связи к 5-оксиметильной группе оксиметилцитозина.

• Кольцевая 2ц. ДНК образует вторичные витки – суперспирализация ДНК. При этом
увеличивается устойчивость к экзонуклеазам.

• Линейная 2ц. ДНК может иметь «липкие концы»

Вирусные белки
1) Детерминированные геномом вируса 2) Имеющие клеточное происхождение
• капсидные • участвующие в репликации вируса
• матриксные архитектурные • суперкапсидные (липопротеины)
• коровые
• ферменты
– нейраминидаза (миксовирусы)
– лизоцим и аденозинтрифосфатаза
(фаги)
– ферменты репликации вирусных НК
(онкогенные вирусы, вирус
осповакцины)
– РНК-зависимая ДНК-полимераза
(ревертаза) (ретровирусы)
• суперкапсидные

Функции вирусных белков:

1) защитная
2) придают стабильность НК
3) облегчают проникновение НК в клетки
4) определяют антигенные свойства вирусов
5) ферментативная активность

Вирусные белки имеют более высокую устойчивость к

химических и физическим факторам по сравнению с
клеточными белками

•свинец
•0,5%-ный раствор фенола
•эфир
•рН 1,6-10,0
•50%-ный Полио-
сернокислый миелит
аммоний •ацетон

•таннин •уксуснокислый свинец

7
 18.05.2020

Углеводы - гликопротеины (gp) и гликолипиды - вирусов

 Функция прикрепительного белка - обеспечивают связывание
вириона с клеточным рецептором;
 Обеспечивают слияние мембран;
 Антигенные свойства вирусов;
 Функция транслоказ в мембране гранулярного ЭПР,
обеспечивает транспорт вирусных компонентов в его просвет

Липиды и липопротеины вирусов

 Образуют суперкапсид (липопротеидная оболочка вирусов)
 Чаще всего – белок + миристиновая (С14) кислота
 Имеют клеточное происхождение
 Характерны для сложноорганизованных вирусов:
 Вирус энцефалита лошадей – 54% липидов
 Вирус гриппа – 18-37%
 Бактериофаги, вирусы растений – немного липидов.
 Стабилизируют структуру ВЧ
 Обеспечивают слияние мембран

Строение бактериофагов
МОРФОТИПЫ БАКТЕРИОФАГОВ

Строение колифага Т4

Икосаэдрическая головка
(Ø 650Å, длина 950Å)
• 2ц ДНК
• Белки-капсомеры
• Фермент транскриптаза в неакт.
состоянии

Отросток (хвост)
• Воротничок
• Наружный чехол (или оболочка)
• Внутренний стержень с канальцем
• Базальная пластинка
• Шипы
• Нити
• Ферменты:
• Лизоцим
• АТФаза

8
 18.05.2020

International Committee on Taxonomy

of Viruses (ICTV)
Международный комитет
по таксономии вирусов

Систематика,
классификация и
таксономия
вирусов

Классификация вирусов по Балтимору (1971)

(Baltimore classification)
в зависимости от типа геномной НК и способа её репликации

Дэвид Балтимор
1938 г.р., амери-
канский биохимик,
молекулярный биолог и
вирусолог, лауреат
Нобелевской премии – 1975 г.

Класс I: вирусы, содержащие 2ц ДНК

Класс II: вирусы, содержащие 1ц ДНК
Класс III: вирусы, в которых РНК способна к репликации (редупликации)
Класс IV: вирусы, содержащие 1ц (+)РНК
Класс V: вирусы, содержащие 1ц (−)РНК
Класс VI: вирусы, содержащие 1ц (+)РНК, реплицирующиеся через стадию ДНК
Класс VII: вирусы, содержащие 2ц ДНК, реплицирующиеся через стадию 1ц РНК

Систематика вирусов

Иерархия таксонов в вирусологии

Отряд (-virales)
Семейство (-viridae)
Подсемейство (-virinae)
Род (-virus)
Вид (-virus)

9
 18.05.2020

International Committee on Taxonomy of Viruses Database (ICTVdB)

Вид вируса - низший таксон в систематике вирусов,

политетический класс вирусов, который составляет
воспроизводящийся ряд поколений и занимает определенную
экологическую нишу (7-ой отчет ICTV).

Политетическими называют таксоны, члены которых делят ряд общих

признаков, но при этом не обязательно каждый представитель таксона должен
иметь все признаки, свойственные данному таксону.
Универсальные таксоны характеризуются признаками, которые присущи всем их
членам.

International Committee on Taxonomy of Viruses Database

Virus Taxonomy: 2019 Release
Ratification March 2020 (MSL #35)
4 realms, 9 kingdoms, 16 phyla, 2 subphyla, 36 classes, 55 orders, 8 suborders,
168 families, 103 subfamilies, 1421 genera, 68 subgenera, 6590 species

Происхождение вирусов

1) Вирусы – примитивные доклеточные формы жизни

2) Вирусы – крайняя степень паразитизма
3) Вирусы возникли из клеточных компонентов

10
 18.05.2020

Культивирование вирусов

Культивирование вирусов
осуществляют:
• в организме восприимчивых
животных,
• в клетках куриных эмбрионов,
• клетках культур тканей.

Вирус (от лат. virus — яд) —

не имеющая клеточного строения
автономная генетическая структура,
представленная ДНК или РНК в комплексе с
белком, способная функционировать и
репродуцироваться (размножаться) только в
восприимчивых к ней живых клетках
прокариотов (бактерий и архей) и
эукариотов (грибов, растений и животных),
а также в некоторых вирусных частицах,
используя для образования своего
потомства генетический и белок-
синтезирующий аппарат хозяина
(облигатный внутриклеточный
паразитизм на генетическом уровне) ,
обладающая наследственностью
(способностью передавать потомкам
основные свойства), генетической
изменчивостью, способностью к адаптации к
определенному хозяину, способностью
вызывать инфекционный процесс и т.д.

Характерные свойства вирусов

1) Содержат только один тип НК: ДНК или РНК;
2) Не имеют собственной белоксинтезирующей системы;
3) Облигатные внутриклеточные паразиты. Паразитизм на
генетическом уровне;
4) Не способны размножаться вне клетки-хозяина.
дизъюнктивный (разобщенный) способ размножения
(репродукции);
5) Не являются самостоятельными организмами;
6) Развитие вируса приводит к гибели клетки-хозяина;
7) Вне клетки вирусы существуют в виде вириона (вирусной
частицы);
8) Вирион состоит из НК и белковой оболочки – капсида;
9) Хозяевами вирусов могут быть бактерии, археи, животные,
растения, грибы.

11