613 – 635
УДК 577.352.5
ФЛУОРЕСЦЕНТНАЯ КОРРЕЛЯЦИОННАЯ
СПЕКТРОСКОПИЯ В БИОЛОГИИ,
ХИМИИ И МЕДИЦИНЕ
Обзор
© 2011 г. И.В. Перевощикова1,2, Е.А. Котова1, Ю.Н. Антоненко1*
1
НИИ физикохимической биологии им. А.Н. Белозерского
МГУ им. М.В. Ломоносова, 119991 Москва; факс: (495)9393181,
электронная почта: antonen@genebee.msu.ru
2
Department of Biomedical Sciences, University of Veterinary Medicine,
Vienna, Austria
Поступила в редакцию 15.10.10
После доработки 24.11.10
Описаны метод флуоресцентной корреляционной спектроскопии (ФКС) и его приложения. ФКС исполь!
зуется для исследования процессов, связанных с изменением подвижности молекул и комплексов, и позво!
ляет изучать такие процессы, как агрегация частиц, связывание флуоресцирующих молекул с надмолеку!
лярными комплексами, липидными везикулами и так далее, причем диапазон размеров изучаемых объек!
тов очень широк – от молекул красителей до наночастиц, размер которых достигает сотен нанометров. Рас!
смотренные приложения ФКС охватывают разные области изучения – от простых химических систем
(раствор–мицелла) до тонких процессов регуляции на уровне живых клеток. Показана простота и доступ!
ность как методических основ, так и теоретической базы ФКС. Наиболее полно отражены приложения,
связанные с искусственными и природными мембранами. В отличие от родственного метода динамическо!
го светорассеяния метод ФКС в настоящее время мало известен в России, несмотря на то что он активно
используется зарубежом. Цель работы – дать толчок развитию ФКС в России и помочь этому методу занять
более заметное место в современной российской науке.
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: флуктуации флуоресценции, корреляционная спектроскопия, диффузия, агрегация,
связывание, наночастицы, биополимеры, везикулы, лиганды, рецепторы, конформационные изменения,
сворачивание белков и нуклеиновых кислот.
613
614 ПЕРЕВОЩИКОВА и др.
получить информацию о двух важных парамет! зии и концентрации частиц. Именно этим мате!
рах: времени диффузии частиц (τd), которое матическим преобразованием и обусловлено
прямо пропорционально их размеру, и числе название метода. Первоначально он был разра!
частиц в конфокальном объеме (N). Традицион! ботан для изучения кинетики химических реак!
но ФКС используется для исследования процес! ций. В 1972 г. Магде с соавт. [28] показали при!
сов, связанных с изменением подвижности мо! годность нового метода для исследования хими!
лекул и комплексов, а именно: агрегации час! ческой реакции связывания бромида этидия
тиц, взаимодействия флуоресцирующих моле! (EtBr) с двунитевой молекулой ДНК:
кул с надмолекулярными комплексами, липид!
ными везикулами и так далее, причем диапазон
размеров изучаемых объектов очень широк – от .
молекул красителей до наночастиц размером,
составляющим сотни нанометров. EtBr – Это маленькая флуоресцирующая мо!
Метод ФКС активно применяется в зару! лекула, которая может встраиваться между ос!
бежных лабораториях, но по не очень ясным нованиями ДНК, что сопровождается увеличе!
причинам мало известен в настоящее время в нием ее квантового выхода флуоресценции в 20
России, несмотря на то что во второй половине раз.
1970!х гг. на территории СССР в Институте хи! Первоначально установка включала в себя
мической и биологической физики АН ЭССР в аргоновый лазер с длиной волны 514,5 нм. Флуо!
Таллине была создана установка ФКС мирового ресценция собиралась параболическим зерка!
уровня [1, 2], с помощью которой в дальнейшем лом, проходила через раствор К2Cr2O7 для отде!
были получены принципиально новые результа! ления от возбуждающего света, после чего соби!
ты [3–7]. На фоне обширной иностранной лите! ралась на фотоэлектронный умножитель. Ана!
ратуры по ФКС, включающей в себя наряду с логовый сигнал флуоресценции затем анализи!
экспериментальными и теоретическими статья! ровался 100!канальным коррелятором. Типич!
ми большое число обзоров [8–21], имеется лишь ные концентрации препаратов составляли 5 мкМ
считанное число современных публикаций на EtBr и 5 нМ ДНК массой 20 кДа из тимуса те!
русском языке [22–27], причем одна из этих ра! ленка.
бот полностью выполнена в английской лабора! Размеры области наблюдения составляли
тории [24]. Метод ФКС по своей сути очень 5 мкм в поперечном и 150 мкм в продольном
близок к методу фотонной корреляционной направлениях. Таким образом, в поле зрения на!
спектроскопии (его еще называют методом ди! ходилось 104 молекул. Обработка сигнала флук!
намического светорассеяния), который очень туаций флуоресценции коррелятором давала ав!
широко используется в России для измерения токорреляционную функцию с временами диф!
размеров наночастиц в суспензии. фузии 10–100 мс. В описанной системе флук!
Цель настоящего обзора – восполнить не! туации флуоресценции возникали в результате
достаток информации о методе ФКС в России. двух процессов: свободной диффузии флуорес!
Авторы, собравшие у себя в лаборатории прибор цирующих молекул в объеме наблюдения и вза!
ФКС, на собственном опыте убедились в эффек! имодействия флуоресцирующих молекул с
тивности и плодотворности данного подхода. ДНК, приводящего к разгоранию флуоресцен!
ции. Анализ автокорреляционных функций, по!
лученных для различных концентраций EtBr,
ИСТОРИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ позволил оценить константы связывания и рас!
РАЗВИТИЯ МЕТОДА пада комплексов, которые составили 1,5 · 107
М–1 · с–1 и 27 с–1 соответственно [28].
ФКС – Экспериментальный метод, осно! Последующие теоретические и эксперимен!
ванный на статистической обработке флуктуа! тальные разработки метода [29–31] обеспечивали
ций флуоресценции в условиях регистрации ма! использование ФКС для определения констант
лого числа молекул красителя. В противополож! химических реакций, концентрации частиц, аг!
ность другим методикам, регистрирующим регации молекул, вращательного и поступатель!
флуоресцентный сигнал, в методе ФКС наибо! ного движения в двух! и трехмерном простран!
лее информативен не сам сигнал интенсивности ствах [5, 6, 29–36]. Значительным успехом стало
флуоресценции, а его отклонение от среднего применение метода для изучения диффузии ли!
значения, т.е. флуктуации флуоресценции. По! пидов в мембранах [35, 37, 38]. Был определен
следующее автокоррелирование временнóго сиг! коэффициент диффузии D = 9,9 · 10–8 см2/с флуо!
нала интенсивности флуоресценции позволяет ресцентной молекулы йодида 3,3'!диоктадеци!
получить информацию о коэффициенте диффу! линдокарбоцианина (DiI) в искусственной би!
а б в
КД КД КД
Л Л Л
СЗ СЗ СЗ
Т+ Т+ Т0 Т+
Т0 Объект Объект Т0 Объект
Т– Т– Т–
Рис. 3. Принцип конфокальной фильтрации сигнала. Луч лазера (непрерывная линия) с помощью селективного зеркала
(СЗ) направляется в объектив микроскопа и фокусируется в точку Т0 в глубине исследуемого объекта. Флуоресценция, из!
лучаемая из этой точки (штриховая линия), собирается объективом и фокусируется линзой Л в сопряженной фокальной
плоскости объектива, проходя через отверстие в конфокальной диафрагме (КД) к фотоэлектронному умножителю (ФЭУ)
(а). Флуоресценция, излучаемая из точек Т+ (б) и Т– (в), дефокусирована на КД и к ФЭУ не проникает. Тем самым обес!
печивается подавление флуоресценции, испускаемой из точек образца, расположенных выше и ниже фокуса объектива
где N – число флуоресцирующих молекул в кон! ления зависит от точности определения коэф!
фокальном объеме, с – молярная концентрация фициента диффузии в воде общепринятого
вещества, NА – число Авогадро. флуоресцентного маркера родамина 6G, значения
Преимуществом данного подхода является которого в литературе различаются от 250 до
то, что он не зависит от оптических характерис! 426 мкм2/с при 22° [39, 52–54].
тик прибора и, следовательно, не требует допу!
щений о функции распределения света в конфо!
кальном объеме. Однако этот метод трудоемок и
требователен к фотофизическим свойствам об!
разцов. Традиционно используемые красители,
такие как родамин 6G и сульфородамин В, не
могут быть использованы для калибровки при!
бора таким методом в связи с их быстрой и зна!
чительной адсорбцией на поверхность стекла.
Второй метод основан на предположении,
Z0
что распределение вероятности регистрации
частицы в конфокальном объеме можно ап!
проксимировать функцией Гаусса в трехмерном
пространстве. Тогда аппроксимация экспери! r0
ментальной автокорреляционной кривой (см.
ниже) позволит определить время диффузии
флуоресцирующих молекул τd. Зная коэффици!
ент диффузии вещества, размер эффективного
объема можно вычислить по формуле
где k = z0/r0.
Основным достоинством этого метода явля! Рис. 4. Форма и параметры конфокального объема (темная
ется быстрота калибровки. Но точность опреде! область)
4 4 4
5 5
z, мкм
z, мкм
3
y, мкм
2 6 6
1 7 7
1 2 3 4 3 4 5 6 4 5 6 7
х, мкм у, мкм
Рис. 5. Измерение размеров конфокального объема путем сканирования интенсивности флуоресценции неподвижных
сфер. Серые контуры соответствуют 90, 50 и 13,5% максимальной интенсивности флуоресценции. На краях рисунка по!
казаны экспериментально полученные границы конфокального объема в соответствующих плоскостях (модифицирован!
ный рисунок из работы [51])
Пуассона:
0,04
, (8)
0,02
где λ – среднее число частиц за время наблюде!
ния. В силу принятого выше условия однород!
0,00 ной вероятности обнаружения частицы внутри
10–5 10–3 10–1 101 выделенного объема PCH должна также соответ!
τ, с ствовать в данном случае распределению Пуас!
сона. Однако неравномерное распределение ве!
роятности обнаружения частицы, а также слу!
Рис. 6. Принцип автокорреляционной обработки сигнала чайная траектория движения частицы в конфо!
флуктуаций флуоресценции. а – Типичная зависимость кальном объеме вносят искажения в гистограм!
интенсивности флуоресценции родамина 6G (R6G) от вре! му распределения интенсивности, что приводит
мени при возбуждении 532 нм. б – Показана часть данных
из панели а в другом временнóм масштабе. Нижняя запись к заметным отклонениям от распределения Пу!
–
сдвинута относительно верхней на время τ. F – средний ассона.
уровень сигнала. Для нахождения значения автокорреля! В случае двухфотонного возбуждения, когда
ционной функции при данном значении τ необходимо распределение вероятности обнаружения части!
суммировать произведения величин сигналов, показанных
на этих двух строчках. в – Результирующая автокорреляци! цы хорошо описывается функцией Гаусса, выве!
онная функция флуктуаций флуоресценции R6G (точки) и дены математические алгоритмы нахождения
ее аппроксимация по уравнению (6) (кривая) функции для аппроксимации эксперименталь!
1,2
0,8
Автокорреляция G(τ)
τ2
τ1
0,4
0,0
10–7 10–5 10–3 10–1
τ, с
мицелл в конфокальном объеме Np,lim, и далее ной формы составил (5,8 ± 0,65) · 10–11 м2/с, что
вычисляли концентрацию мицелл в растворе по из расчета глобулярной структуры белка соответ!
формуле ствует радиусу 4,3 ± 0,5 нм. После завершения
процесса агрегации время диффузии было на
, (13) 2–3 порядка больше, чем в начале эксперимен!
та. Определение размеров таких комплексов из
данных автокорреляционной функции затруд!
где Vf – конфокальный объем. Эксперименталь! нено, так как флуктуации флуоресценции боль!
но определенное значение N = 168 ± 4 оказалось шой амплитуды вносят существенный вклад в
постоянным в широком диапазоне концентра! форму автокорреляционной функции. Авторы
ций липополисахарида (0,7–150 мкМ). отмечают, что метод ФКС имеет большую
Более прямым способом регистрации агре! чувствительность, поэтому для измерений с ис!
гации биополимеров является измерение увели! пользованием этого метода требуются гораздо
чения времени диффузии τd в условиях, когда более низкие концентрации белков, чем для
флуоресцентная метка ковалентно связана с аналогичных измерений методом светорассея!
данным полимером. Таким способом изучали ния.
агрегацию белка β!амилоида в растворе [63–65] Метод анализа автокорреляционных функ!
и агрегацию белка α!синуклеина in vitro [66]. Аг! ций и измерения коэффициентов диффузии
регация α!синуклеина играет ключевую роль в совместно с методом измерения анизотропии
болезни Паркинсона, причем мутантные белки, флуоресценции применили также для изучения
обнаруживаемые у больных, обладают большей взаимодействия с молекулами ДНК таких бел!
склонностью к агрегации, чем дикий тип [67]. ков, как активатор транскрипции NtrС [68] и
Авторы показали, что под действием белков се! 7!аминоактиномицин Д [23]. К достоинствам
мейства иммунофилинов агрегация α!синукле! данного подхода помимо высокой чувствитель!
ина, меченного красителем Bodipy, существенно ности относится возможность проводить изме!
ускоряется, что приводит к увеличению време! рения в широком диапазоне значений рН, кон!
ни диффузии (τd) меченого α!синуклеина. Из! центраций солей и температуры. Показано, что
меренный коэффициент диффузии мономер! константы диссоциации NtrС существенно за!
где N = (CA + CB)V – общее число молекул А и В ласти рН >8 процесс протонирования поверхно!
в объеме наблюдения, K = kAB /KBA = CB /CA – стного красителя включает в себя взаимодей!
константа равновесия химической реакции, ствие протона со всей поверхностью мембраны
τR = (kAB + kBA)–1 – время релаксации химичес! (т.е. мембрана работает как антенна, собираю!
кой реакции. щая протоны), тогда как при более низких зна!
Уравнение (20) содержит два компонента, чениях рН протонирование красителя происхо!
один из которых аналогичен приведенному в дит без участия мембраны, т.е. так же, как и в
уравнении (6), описывающему автокорреляци! растворе.
онную функцию для трехмерной диффузии, а Была измерена кинетика образования комп!
другой соответствует вкладу химической реак! лексов ионов калия с флуоресцентно!меченным
ции. Для временнóго промежутка τ << τR,τd амп! К+!индикатором TAC!К+ методом ФКС [105].
литуда автокорреляционной функции обратно При образовании комплекса индикатора с ио!
пропорциональна числу флуоресцирующих мо! нами калия происходил переход из нефлуорес!
лекул А (G(τ→0) = 1/NA, NA = CAVконф). Если ско! цирующего состояния свободного индикатора
рость химической реакции больше времени во флуоресцирующее состояние индикатора,
диффузии (τR << τd), то для временных ` проме! связанного с ионами калия:
жутков, бóльших τR, автокорреляционная функ!
ция определяется преимущественно диффузией
(уравнение (6)), причем в этом случае G(τ→0) = ,
= 1/N, т.е. амплитуда автокорреляционной
функции зависит от общего числа молекул, что где kа – константа образования комплекса и kd –
связано с быстрыми переходами между состоя! константа распада комплекса. Анализ автокор!
ниями А и В. реляционных функций при разных концентра!
Переход молекулы из флуоресцирующего циях ионов калия в растворе позволил опреде!
состояния в нефлуоресцирующее может быть лить константы ассоциации и диссоциации
связан с протонированием–депротонировани! комплекса (0,0020 ± 0,0003 мМ–1 · мс–1 и 0,12 ±
ем молекулы, как в случае зеленого флуоресци! ± 0,02 мс–1 соответственно).
рующего белка (GFP) [102]. Анализ автокорре! Методом ФКС была изучена кинетика взаи!
ляционных функций GFP при разных значени! модействия пиронина Y и пиронина B с β!цик!
ях рН показал, что время перехода составляет лодекстрином [106]. При добавлении циклодек!
300 мкс при рН 7 и уменьшается до 45 мкс при стрина происходил сдвиг автокорреляционной
рН 5; при этом 80% молекул переходят в нефлуо! функции в область больших времен (от 250 до
ресцирующее состояние. При щелочных значе! 400 мкс) и появилась быстрая компонента G(τ) в
ниях рН зарегистрировано время перехода 340 диапазоне 0,1–1 мкс. Показано, что связывание
мкс, не связанное с протонированием–депрото! обоих красителей было быстрым и лимитирова!
нированием. Авторы предполагают, что мерцание лось диффузией. Основной вклад в различие их
флуоресценции белка при рН 8–11 связано с равновесных констант связывания вносило раз!
внутримолекулярным переносом протона или из! личие в скоростях диссоциации комплексов.
менением конформационного состояния белка. Были измерены также коэффициенты диффу!
В работе [103] была рассмотрена более прос! зии свободных красителей и их комплексов с
тая система – переходы между флуоресцирую! циклодекстринами.
щим и нефлуоресцирующим состояниями кра! С помощью метода ФКС можно следить за
сителя флуоресцеина в водном растворе. В част! образованием водородных связей, приводящим
ности, характерное время перехода из депрото! к сворачиванию биополимеров. Например,
нированной двухзарядной флуоресцирующей ФКС использовали для изучения кинетики об!
формы в однопротонированную анионную сла! разования петли короткоцепочечной молекулы
бофлуоресцирующую форму при рН 9,4 состав! ДНК [107]. К одному концу молекулы ДНК ко!
ляло 5,4 мкс. В последующей работе этой же ла! валентно присоединялся флуоресцентный кра!
боратории метод ФКС применили для изучения ситель (родамин 6G), а к другому – тушитель
латеральной подвижности протонов на поверх! флуоресценции родамина DABCYL. Таким об!
ности липидной мембраны, а также процесса разом, флуоресценция была яркой в разверну!
отрыва–присоединения протонов к липидной том состоянии ДНК и существенно затушенной
поверхности [104]. Для этого использовали два при образовании шпильки. Формула (20) была
флуоресцентно!меченных липида на основе преобразована для двумерного движения и ис!
фосфатидилэтаноламина: один представлял со! пользована для вычисления кинетических пара!
бой конъюгат с флуоресцеином, а другой – с метров химической реакции образования вто!
орегоновым зеленым. Было показано, что в об! ричной структуры ДНК:
ческом поле. Теоретически в стандартном мето! го колхицина с тубулином [124, 125]. Если в
де ФКС для надежной дискриминации двух растворе присутствуют только молекулы флуо!
флуоресцирующих веществ необходимо иметь ресцирующего лиганда, запись сигнала флуо!
не менее чем восьмикратное различие в их мо! ресценции в зависимости от времени представ!
лекулярной массе М (в силу того что D ~M–1/3), ляет собой прямую с небольшими отклонения!
тогда как электрофоретическая подвижность ми от среднего значения. При добавлении к это!
пропорциональна отношению заряда к массе, му раствору частиц, способных связать несколь!
т.е. более чувствительна к изменению массы мо! ко молекул флуоресцирующего лиганда, в запи!
лекулы [119]. Однако измерения подвижности в си интенсивности флуоресценции появляются
электрическом поле серии молекул ДНК прак! пики с высокой амплитудой, характерной для
тически показали отсутствие зависимости под! образования комплексов. Поскольку частицы,
вижности от длины, тогда как коэффициент связавшие разное число флуоресцирующих мо!
диффузии, измеренный методом ФКС, заметно лекул, различаются по яркости, авторы предла!
менялся в зависимости от длины молекул в со! гают анализировать не число образовавшихся
ответствии с моделью жесткого цилиндра [120]. комплексов, т.е. пиков, а суммарную площадь
Одно из практически значимых применений под пиками на графике зависимости интенсив!
ФКС в билогических исследованиях – изучение ности флуоресценции от времени. Контрольные
скорости потока крови в сосудах. Наличие ав! измерения показали линейную зависимость
тофлуоресцирующих компонентов крови, таких этого параметра от числа частиц, на которых
как эритроциты, позволяет проводить исследо! сорбировался флуоресцирующий лиганд [124].
вания без дополнительной модификации био! Такой анализ применяется при определении
молекул или введения маркеров. Совместно с константы связывания лиганда [124].
лазерной сканирующей микроскопией метод Аналогичный подход использовали для ана!
ФКС применили для определения скорости лиза связывания катионного полимера поли[(2!
кровотока в сосудах мозга эмбриона рыбки D. диметиламино)этилметакрилата] (pDMAEMA)
rerio [122]. Для визуализации сосудов в данном с флуоресцентно!меченным олигонуклеотидом
эксперименте во всех эндотелиальных клетках (Rh!ON) [126]. Как известно, комплексы ДНК с
кровеносных сосудов экспреcсировали GFP. катионными полимерами более эффективно
После фиксации эмбриона был выбран одиноч! осуществляют трансфекцию по сравнению со
ный сосуд, в котором проводились дальнейшие свободной ДНК. Состав комплексов pDMAEMA–
измерения скорости потока методом ФКС. По! Rh!ON исследован как функция соотношения
лученное значение скорости (1,67 мм/с) хорошо зарядов катионов и анионов ϕ(+/–). Авторы по!
согласовывалось со значениями скоростей для казали, что в комплексах катионного полимера
сосудов сердца D. rerio [123]. с олигонуклеотидом, имеющих ϕ < 1, происхо!
Анализ пиков флуоресценции в суспензии яр; дит тушение флуоресценции в связи с высокой
ких частиц. Обработка сигнала флуоресценции в концентрацией олигонуклеотида на одной це!
виде автокорреляционной функции не всегда почке полимера. Дальнейшее увеличение кон!
является оптимальным вариантом анализа сис! центрации полимера приводит к увеличению
темы методом ФКС. Так, в случае смеси частиц, числа пиков высокой амплитуды, что связано с
существенно различающихся по яркости, G(τ) распределением молекул олигонуклеотида меж!
будет практически полностью определяться ду цепочками полимера в концентрации, не
вкладом ярких частиц. Кроме того, в суспензии достаточной для самотушения. При достижении
частиц большого размера (липосомы, выделен! определенного соотношения зарядов, когда
ные митохондрии и т.д.) при их низкой концен! каждой цепочке полимера будет соответство!
трации воспроизводимое измерение G(τ) связа! вать одна молекула олигонуклеотида, дальней!
но с накоплением сигнала на протяжении дли! шее увеличение концентрации полимера не
тельного времени (вплоть до нескольких часов), приведет к увеличению числа пиков, что и на!
что затрудняет решение этой задачи. Поэтому блюдалось авторами при ϕ = 15 [126]. Этим ме!
при работе с такого рода системами предложили тодом исследовали также связывание других ка!
использовать другой вариант анализа – подсчет тионных полимеров [127].
числа и амплитуды пиков флуоресценции в из! Подобный вариант метода ФКС, включаю!
начальной временнóй записи сигнала. Такой щий в себя анализ пиков сигнала флуоресцен!
подход очень характерен для анализа электро! ции, применяли и для исследования вытекания
физиологических данных и имеет развитый ма! флуоресцентного красителя из замкнутых ли!
тематический аппарат. пидных везикул (липосом) под действием раз!
В частности, анализ пиков применили для личных факторов [128–132]. Ван ден Богаарт с
изучения связывания флуоресцентно!меченно! соавт. [129, 133] предложили модифицирован!
ный вариант анализа пиков, который включал в нально неактивный белок. На основе соотноше!
себя регистрацию сигнала двух флуоресцентных ния белок–липид рассчитали, что в одной липо!
маркеров, различающихся по спектральным соме присутствует ~10 молекул белка, образую!
свойствам. Свой вариант анализа авторы назва! щих каналы. Тогда эффективность встраивания
ли двухцветовым анализом пиков флуоресцен! составляет <10%.
ции (dual color fluorescence burst analysis Применение данного подхода может быть
(DCFBA)). Один гидрофильный маркер находил! очень эффективным и в случае изучения ли!
ся внутри липосом, тогда как второй был липо! ганд!рецепторных систем. Для этого необходи!
фильным и находился в липидном бислое. Если мо приготовить липосомы с встроенным в них
воздействие не приводило к формированию пор флуоресцентно!меченным рецепторным бел!
в мембране и целостность липосом сохранялась, ком, и лиганд при этом тоже должен иметь
сигналы интенсивности флуоресценции двух флуоресцентую метку, спектрально отличную от
маркеров совпадали по времени и продолжи! метки рецептора. При этом необходимо, чтобы
тельности, так как оба маркера двигались сов! сродство лиганда к рецептору было достаточно
местно в каждой липосоме. В случае если к ли! высоким и исключающим фоновый сигнал
посомам добавляли каналообразующий агент и флуоресценции свободного лиганда в растворе.
образовывались поры, размер которых был Данный подход применили для вычисления
больше размера молекул гидрофильного марке! константы связывания флуоресцентно!мечен!
ра, последний выходил из липосом и сигналы ного белка SecA с флуоресцентно!меченным
флуоресценции больше не совпадали (рис. 8). белком канала SecYEG секреторной системы
Анализ пиков позволил определить концен! E. coli. Путем изменения концентрации немече!
трацию молекул!маркеров внутри липосом, ко! ного лиганда (SecA) была получена константа
торая рассчитывалась по следующей формуле связывания Кass = 4 нМ [129, 134].
для каждого пика: Выше уже обсуждалась возможность приме!
нения проточного капилляра для анализа пиков
сигнала флуоресценции. Альтернативой этому
является использование принудительного пере!
, (26) мешивания раствора суспензии частиц. В нашей
лаборатории анализ пиков сигнала флуоресцен!
ции применили для анализа связывания потен!
циалзависимых красителей с выделенными ми!
тохондриями [26, 135]. Так как размеры митохон!
где Iliposome, Isize!marker – флуоресцентный сигнал дрий существенно больше размеров липосом, в
липосом и молекул внутренних маркеров соот! этом случае анализ G(τ) затруднен или даже не!
ветственно, причем значение Iliposome больше не! возможен в силу лабильности препарата выде!
которого значения Ioffset на временнóм проме! ленных митохондрий. Было показано, что ана!
жутке t1–t2; возведение в степень 3/2 в знамена! лиз пиков существенно улучшается в случае пе!
теле связано с тем, что флуоресцентная метка ремешивания суспензии митохондрий. На рис. 9
находится на поверхности липосом, тогда как приведены примеры записей флуоресценции
молекулы!маркеры находятся в растворе внутри тетраметилродамина этилового эфира (TMRE) в
липосом. суспензии митохондрий без перемешивания
Данный подход применили при изучении (левая сторона) и в условиях перемешивания
механочувствительного канала MscL [133]. Этот (правая сторона). На средней записи, сделанной
белок был встроен в липосомы, окрашенные ли! в условиях энергизации митохондрий, пики
пофильной меткой DiO и нагруженные флуо! флуоресценции TMRE проявляются наиболее
ресцентно!меченными молекулами!маркерами отчетливо. При деэнергизации происходит па!
различного размера. Показано, что для соедине! дение мембранного потенциала митохондрий,
ний размерами 2–3 нм (белки молекулярной приводящее к выходу катионного красителя во
массой до 7 кДа) концентрация молекул!марке! внешнюю среду (нижние записи на рис. 9). Дан!
ров внутри липосом уменьшалась по мере от! ный подход может быть применен для анализа
крывания канала MscL. Результаты исследований связывания с митохондриями не только гидро!
отдельных липосом методом DCFBA использо! фобных соединений, но и таких сравнительно
вали для оценки степени встраивания белка гидрофильных веществ, как флуоресцентно!ме!
MscL в липосомы. Показано, что только 50% ченный ATP [136], а также различных заряжен!
всего количества липосом теряет свое содержи! ных фталоцианинов [85].
мое при активации канала. Это значит, что при! Следует отметить, что перемешивание сус!
мерно половина липосом несет в себе функцио! пензии частиц для увеличения числа регистри!
60 а
40
20
120 б
80
40
60 а
40
20
120 б
80
40
60 а
40
20
120 б
80
40
0
0,0 0,1 0,2 0,3
Время, с
руемых событий может быть заменено на пере! наночастиц [139], а также изучения динамики
мещение конфокального объема внутри ячейки. белков и лиганд!рецепторного взаимодействия
Этого можно добиться либо путем синхронизо! в живых клетках [19].
ванного движения лазерного луча и положения
конфокальной диафрагмы (как это осуществля! Рассмотренные приложения метода ФКС
ется в конфокальном микроскопе), либо путем охватывают самые разные области исследова!
перемещения столика микроскопа. Такой вари! ний – от простых химических систем (раст!
ант ФКС был реализован еще на заре возникно! вор–мицелла) до тонких процессов регуляции
вения самого метода [137] и успешно применял! на уровне живых клеток. Наиболее полно в об!
ся для изучения олигомеризации белков в раст! зоре отражены приложения, касающиеся искус!
воре [138], регистрации траектории движения ственных и природных мембран. Это связано со
а б
2 2 Неэнергизованное 3 Энергизованное
состояние состояние
100 кГц
+ сукцинат
3
+ митохондрии + ДНФ
ротенон
4 1
•
СH3СH2COO
1
20 с • •
(СH3)2N O N(СH3)2
4 Деэнергизованное
ТМRE состояние
1 МГц
2
50 мс
Рис. 9. а – Зависимость интенсивности флуоресценции от времени для суспензии митохондрий, окрашенных TMRE
(0,3 мкМ) в отсутствие перемешивания. 1 – Контрольная запись в растворе TMRE, 2 – неэнергизованное состояние ми!
тохондрий в присутствии ротенона, 3 – энергизованное состояние после добавления сукцината, 4 – деэнергизованное
состояние после добавления ДНФ. б – Схематическое представление цепи событий взаимодействия красителя TMRE с
отдельной митохондрией в различных энергетических состояниях. в – Зависимость интенсивности флуоресценции от
времени для суспензии митохондрий, окрашенных TMRE (0,03 мкМ) в условиях перемешивания. 1 – Митохондрии и ро!
тенон, 2 – добавка сукцината, 3 – добавка ДНФ
сферой первичных научных интересов авторов зии, яркости частиц, степени их агрегации, кон!
обзора. Однако мы старались описать наиболее центрации комплексов и, наконец, кинетике
характерные примеры и из других приложений. межмолекулекулярного и внутримолекулярного
Наша главная задача – показать на данных при! взаимодействия [12].
мерах широкие возможности данного метода, Если настоящий обзор вызвал интерес у чи!
чтобы читатели могли оценить его примени! тателя в плане конкретного применения данно!
мость для изучения конкретных систем. го подхода, то возникает вопрос о практической
Отличительное свойство метода ФКС – вы! реализации измерения ФКС. Иными словами,
сокая чувствительность. Это позволяет работать насколько сложно сделать такой прибор у себя в
при концентрациях флуоресцентного маркера лаборатории? Опыт авторов показал, что задача
~1 нМ в объемах измерения от 10 до 1000 мкл, изготовления такого прибора достаточно реаль!
т.е. типичное измерение требует ~10–13 моля ве! на при наличии соответствующих блоков. Среди
щества. В то же время ФКС вряд ли можно при! них главными являются флуоресцентный мик!
равнивать к прямым методам измерения флуо! роскоп, лазер, ФЭУ (или высокочувствитель!
ресценции отдельных молекул, поскольку по ный светодиод) и коррелятор. Лазер, ФЭУ и
своей сути за типичное время измерений (1 мин) коррелятор являются стандартными компонен!
анализируется статистика для большого ансамб! тами достаточно распространенной установки
ля молекул (характерное значение ~103 моле! по измерению динамического светорассеяния.
кул), что позволяет проводить усреднение как Кроме того, в отличие от газовых лазеров совре!
свойств самого используемого маркера (яркос! менные твердотельные лазеры (особенно зеле!
ти, подвижности и т.д.), так и параметров его ный) уже достаточно распространены и характе!
взаимодействия с другими компонентами сис! ризуются большим временем безотказной не!
темы. Следовательно, данным методом не могут прерывной работы. Наладка установки ФКС
быть напрямую решены такие задачи (типичные при наличии вышеописанных блоков подробно
для регистрации одиночных молекул), как описана в литературе [11, 13]. Собственный
изучение «мерцания» (blinking) флуоресцен! опыт авторов обзора показал, что даже в отсут!
ции, идентификация множественных интерме! ствие навыков работы с оптическими прибора!
диатов реакций, в том числе различных конфор! ми наладка самодельного прибора ФКС занима!
мационных состояний на прямом и обратном ет всего несколько дней. Следует отметить так!
путях реакции [140–144]. Таким образом, метод же, что компании, выпускающие конфокальные
ФКС стоит на полпути исследования интеграль! микроскопы, наладили выпуск приставок, поз!
ных свойств вещества в целом и индивидуаль! воляющих проводить измерения ФКС. Авторы
ных свойств отдельных молекул со всеми выте! будут считать свою задачу выполненной, если
кающими из этого преимуществами и недостат! прочтение данного обзора убедит читателей в
ками. необходимости практического поиска возмож!
Чувствительность метода ФКС можно оха! ностей конструирования прибора ФКС (или его
рактеризовать на примере сравнительного из! приобретения) и его применения в своей экспе!
учения взаимодействия меченых олигонуклео! риментальной работе. Метод ФКС, безусловно,
тидов с ДНК. Показано, что чувствительность должен занять более заметное место в современ!
ФКС примерно соответствует чувствительности ной российской науке.
измерений взаимодействия по радиоактивной
метке, однако ФКС не требует работы с радио!
активностью и не требует физического разделе! Авторы выражают благодарность проф.
ния компонентов. Для применения метода ФКС Д.Б. Зорову (НИИ физико!химической биоло!
достаточно существенно меньшего количества гии им. А.Н. Белозерского МГУ им. М.В. Ломо!
вещества по сравнению с используемым при из! носова) за плодотворное обсуждение обзора и
мерениях методами кругового дихроизма или проф. Петре Швилле (Технический университет
калориметрии. Кроме того, ФКС дает дополни! Дрездена) за предоставление макетов некоторых
тельную информацию о коэффициентах диффу! рисунков.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
1. Каск П., Кяндлер Т. (1978) Изв. АН ЭССР, 27, 73–78. 35. Koppel, D.E., Axelrod, D., Schlessinger, J., Elson, E.L.,
2. Каск П., Кяндлер Т., Сирк А., Кару Т., Липпмаа Э. and Webb, W.W. (1976) Biophys. J., 16, 1315–1329.
(1979) Изв. АН ЭССР, 28, 221–226. 36. Aragon, S.R., and Pecora, R. (1976) J. Chem. Phys., 64,
3. Кяндлер Т., Каск П., Пиксарв П., Сирк А., Липпмаа 1791–1803.
Э. (1982) Изв. АН ЭССР, 31, 314–319. 37. Webb, W.W. (1976) Q. Rev. Biophys., 9, 49–68.
4. Кяндлер Т.Э. (1985) Флуоресцентная корреляционная 38. Fahey, P.F., Koppel, D.E., Barak, L.S., Wolf, D.E., Elson,
спектроскопия в исследовании динамики химических E.L., and Webb, W.W. (1977) Science, 195, 305–306.
систем. Дис. канд. физ.!мат. наук, Тартуский государ! 39. Rigler, R., Mets, U., Widengren, J., and Kask, P. (1993)
ственный университет, Тарту. Eur. Biophys. J., 22, 169–175.
5. Kask, P., Piksarv, P., Mets, U., Pooga, M., and Lippmaa, 40. Rigler, R., Pramanik, A., Jonasson, P., Kratz, G., Jansson,
E. (1987) Eur. Biophys. J., 14, 257–261. O.T., Nygren, P., Stahl, S., Ekberg, K., Johansson, B.,
6. Kask, P., Piksarv, P., Pooga, M., Mets, U., and Lippmaa, Uhlen, S., Uhlen, M., Jornvall, H., and Wahren, J. (1999)
E. (1989) Biophys. J., 55, 213–220. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 96, 13318–13323.
7. Kask, P. (1987) Stud. Biophys., 118, 7–24. 41. Denk, W., Strickler, J.H., and Webb, W.W. (1990) Science,
8. Fluorescence Сorrelation Spectroscopy: Theory and Applica 248, 73–76.
tions (Rigler, R., and Elson, E., eds), 2001, Springer, N.Y. 42. Schwille, P., Haupts, U., Maiti, S., and Webb, W.W. (1999)
9. Eigen, M., and Rigler, R. (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. Biophys. J., 77, 2251–2265.
USA, 91, 5740–5747. 43. Koppel, D. E. (1974) Phys. Rev. A, 10, 1938–1945.
10. Schwille, P. (2001) Cell. Biochem. Biophys., 34, 383–408. 44. Kask, P., Gunther, R., and Axhausen, P. (1997) Eur.
11. Krichevsky, O., and Bonnet, G. (2002) Rep. Prog. Phys., Biophys. J., 25, 163–169.
65, 251–297. 45. Qian, H. (1990) Biophys. Chem., 38, 49–57.
12. Hess, S.T., Huang, S., Heikal, A.A., and Webb, W.W. 46. Meseth, U., Wohland, T., Rigler, R., and Vogel, H. (1999)
(2002) Biochemistry, 41, 697–705. Biophys. J., 76, 1619–1631.
13. Sengupta, P., Balaji, J., and Maiti, S. (2002) Methods, 27, 47. Kask, P., Palo, K., Ullmann, D., and Gall, K. (1999) Proc.
374–387. Natl. Acad. Sci. USA, 96, 13756–13761.
14. Enderlein, J., Gregor, I., Patra, D., and Fitter, J. (2004) 48. Chen, Y., Muller, J.D., So, P.T., and Gratton, E. (1999)
Curr. Pharm. Biotechnol., 5, 155–161. Biophys. J., 77, 553–567.
15. Gosch, M., and Rigler, R. (2005) Adv. Drug Deliv. Rev., 57, 49. Chen, Y., Muller, J.D., Tetin, S.Y., Tyner, J.D., and
169–190. Gratton, E. (2000) Biophys. J., 79, 1074–1084.
16. Briddon, S.J., and Hill, S.J. (2007) Trends Pharmacol. Sci., 50. Enderlein, J., Gregor, I., Patra, D., Dertinger, T., and
28, 637–645. Kaupp, U.B. (2005) Chemphyschem., 6, 2324–2336.
17. Kim, S.A., Heinze, K.G., and Schwille, P. (2007) Nat. 51. Ruettinger, S., Buschmann, V., Kramer, B., Erdmann, R.,
Methods, 4, 963–973. Macdonald, R., and Koberling, F. (2007) Proc. SPIE,
18. Machan, R., and Hof, M. (2010) Biochim. Biophys. Acta, 6630, 66300D.
1798, 1377–1391. 52. Sachl, R., Mikhalyov, I., Hof, M., and Johansson, L.B.
19. Petrasek, Z., Ries, J., and Schwille, P. (2010) Methods (2009) Phys. Chem. Chem. Phys., 11, 4335–4343.
Enzymol., 472, 317–343. 53. Petrasek, Z., and Schwille, P. (2008) Biophys. J., 94,
20. Garcia!Saez, A.J., and Schwille, P. (2010) Biochim. 1437–1448.
Biophys. Acta, 1798, 766–776. 54. Gendron, P.O., Avaltroni, F., and Wilkinson, K.J. (2008) J.
21. Serdyuk, I.N., Zaccai, N.R., and Zaccai, J. (2007) in Fluoresc., 18, 1093–1101.
Methods in Molecular Biophysics: Structure, Dynamics, 55. Gosch, M., Blom, H., Holm, J., Heino, T., and Rigler, R.
Function, Cambridge University Press, Cambridge. (2000) Anal. Chem., 72, 3260–3265.
22. Сухарев В.И., Векшин Н.Л. (2000) Биоорган. химия, 26, 56. Muller, J.D., Chen, Y., and Gratton, E. (2000) Biophys. J.,
723–727. 78, 474–486.
23. Ковалев А.Е., Яковенко А.А., Векшин Н.Л. (2004) Био 57. Qian, H., and Elson, E.L. (1990) Biophys. J., 57, 375–380.
физика, 49, 1030–1037. 58. Eid, J.S., Muller, J.D., and Gratton, E. (2000) Rev. Sci.
24. Татаркова С.А., Ллойд К., Хайра С.К., Берк Д. (2003) Instrum., 71, 361–368.
Квант. электроника, 33, 357–362. 59. Chen, Y., Muller, J.D., Ruan, Q., and Gratton, E. (2002)
25. Векшин Н.Л. (2006) Флуоресцентная спектроскопия Biophys. J., 82, 133–144.
биополимеров, Фотон!век, Пущино. 60. Chen, Y., Wei, L.N., and Muller, J.D. (2003) Proc. Natl.
26. Перевощикова И.В., Сорочкина А.И., Зоров Д.Б., Ан! Acad. Sci. USA, 100, 15492–15497.
тоненко Ю.Н. (2009) Биохимия, 74, 814–824. 61. Egea, P.F., Rochel, N., Birck, C., Vachette, P., Timmins,
27. Страховская М.Г., Антоненко Ю.Н., Пашковская P.A., and Moras, D. (2001) J. Mol. Biol., 307, 557–576.
А.А., Котова Е.А., Киреев В., Жуховицкий В.Г., Кузне! 62. Yu, L., Tan, M., Ho, B., Ding, J.L., and Wohland, T.
цова Н.А., Южакова О.А., Негримовский В.М., Рубин (2006) Anal. Chim. Acta, 556, 216–225.
А.Б. (2009) Биохимия, 74, 1603–1614. 63. Tjernberg, L.O., Pramanik, A., Bjorling, S., Thyberg, P.,
28. Magde, D., Elson, E.L., and Webb, W.W. (1972) Phys. Rev. Thyberg, J., Nordstedt, C., Berndt, K.D., Terenius, L.,
Lett., 29, 705–708. and Rigler, R. (1999) Chem. Biol., 6, 53–62.
29. Elson, E.L., and Magde, D. (1974) Biopolymers, 13, 1–27. 64. Sengupta, P., Garai, K., Sahoo, B., Shi, Y., Callaway, D.J.,
30. Magde, D., Elson, E.L., and Webb, W.W. (1974) and Maiti, S. (2003) Biochemistry, 42, 10506–10513.
Biopolymers, 13, 29–61. 65. Garai, K., Sureka, R., and Maiti, S. (2007) Biophys. J., 92,
31. Magde, D., Webb, W.W., and Elson, E.L. (1978) L55–L57.
Biopolymers, 17, 361–376. 66. Gerard, M., Debyser, Z., Desender, L., Kahle, P.J., Baert,
32. Ehrenberg, M., and Rigler, R. (1974) Chem. Phys., 4, 390–401. J., Baekelandt, V., and Engelborghs, Y. (2006) FASEB J.,
33. Ehrenberg, M., and Rigler, R. (1976) Q. Rev. Biophys., 9, 20, 524–526.
69–81. 67. Conway, K.A., Harper, J.D., and Lansbury, P.T. (1998) Nat.
34. Aragon, S.R., and Pecora, R. (1975) Biopolymers, 14, 119–138. Med., 4, 1318–1320.
68. Sevenich, F.W., Langowski, J., Weiss, V., and Rippe, K. 100. Walter, N.G., Schwille, P., and Eigen, M. (1996) Proc.
(1998) Nucl. Acids Res., 26, 1373–1381. Natl. Acad. Sci. USA, 93, 12805–12810.
69. Lagerkvist, A.C., Foldes!Papp, Z., Persson, M.A., and 101. Schwille, P., Meyer!Almes, F.J., and Rigler, R. (1997)
Rigler, R. (2001) Protein Sci., 10, 1522–1528. Biophys. J., 72, 1878–1886.
70. Tetin, S.Y., Swift, K.M., and Matayoshi, E.D. (2002) Anal. 102. Haupts, U., Maiti, S., Schwille, P., and Webb, W.W.
Biochem., 307, 84–91. (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 95, 13573–13578.
71. Varriale, A., Staiano, M., Iozzino, L., Severino, L., 103. Persson, G., Thyberg, P., and Widengren, J. (2008)
Anastasio, A., Cortesi, M.L., and D’Auria, S. (2009) Biophys. J., 94, 977–985.
Protein Pept. Lett., 16, 1425–1428. 104. Sanden, T., Salomonsson, L., Brzezinski, P., and Widengren,
72. Kinjo, M., and Rigler, R. (1995) Nucl. Acids Res., 23, J. (2010) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 107, 4129–4134.
1795–1799. 105. Magzoub, M., Padmawar, P., Dix, J.A., and Verkman,
73. Schwille, P., Oehlenschlager, F., and Walter, N.G. (1996) A.S. (2006) J. Phys. Chem. B, 110, 21216–21221.
Biochemistry, 35, 10182–10193. 106. Al Soufi, W., Reija, B., Novo, M., Felekyan, S.,
74. Rusu, L., Gambhir, A., McLaughlin, S., and Radler, J. Kuhnemuth, R., and Seidel, C.A. (2005) J. Am. Chem.
(2004) Biophys. J., 87, 1044–1053. Soc., 127, 8775–8784.
75. Yu, L., Ding, J.L., Ho, B., and Wohland, T. (2005) 107. Bonnet, G., Krichevsky, O., and Libchaber, A. (1998)
Biochim. Biophys. Acta, 1716, 29–39. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 95, 8602–8606.
76. Posokhov, Y.O., Rodnin, M.V., Lu, L., and Ladokhin, A.S. 108. Kim, H.D., Nienhaus, G.U., Ha, T., Orr, J. W., Williamson,
(2008) Biochemistry, 47, 5078–5087. J.R., and Chu, S. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 99,
77. Antonenko, Y.N., Perevoshchikova, I.V., Davydova, L.I., 4284–4289.
Agapov, I.A., and Bogush, V.G. (2010) Biochim. Biophys. 109. Shusterman, R., Gavrinyov, T., and Krichevsky, O. (2008)
Acta, 1798, 1172–1178. Phys. Rev. Lett., 100, 98–102.
78. Clamme, J.P., Azoulay, J., and Mely, Y. (2003) Biophys. J., 110. Chattopadhyay, K., Saffarian, S., Elson, E.L., and Frieden,
84, 1960–1968. C. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 99, 14171–14176.
79. Pramanik, A., Thyberg, P., and Rigler, R. (2000) Chem. 111. Neuweiler, H., Johnson, C.M., and Fersht, A.R. (2009)
Phys. Lipids, 104, 35–47. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 106, 18569–18574.
80. Takakuwa, Y., Pack, C.G., An, X.L., Manno, S., Ito, E., 112. Dittrich, P.S., and Schwille, P. (2002) Anal. Chem., 74,
and Kinjo, M. (1999) Biophys. Chem., 82, 149–155. 4472–4479.
81. Rhoades, E., Ramlall, T.F., Webb, W.W., and Eliezer, D. 113. Kuricheti, K.K., Buschmann, V., and Weston, K.D.
(2006) Biophys. J., 90, 4692–4700. (2004) Appl. Spectrosc., 58, 1180–1186.
82. Красновский А.А. (2004) Биофизика, 49, 305–321. 114. Brister, P.C., Kuricheti, K.K., Buschmann, V., and
83. Valenzeno, D.P. (1987) Photochem. Photobiol., 46, 147–160. Weston, K.D. (2005) Lab. Chip., 5, 785–791.
84. Pashkovskaya, A.A., Maizlish, V.E., Shaposhnikov, G.P., 115. Edel, J.B., and de Mello, A.J. (2003) Anal. Sci., 19,
Kotova, E.A., and Antonenko, Y.N. (2008) Biochim. 1065–1069.
Biophys. Acta, 1778, 541–548. 116. Okagbare, P.I., and Soper, S.A. (2009) Analyst., 134,
85. Пашковская A.A., Перевощикова И.В., Майзлиш 97–106.
В.Е., Шапошников Г.П., Котова E.A., Антоненко 117. Park, H.Y., Qiu, X., Rhoades, E., Korlach, J., Kwok,
Ю.Н. (2009) Биохимия, 74, 1252–1259. L.W., Zipfel, W.R., Webb, W.W., and Pollack, L. (2006)
86. Allen, N.W., and Thompson, N.L. (2006) Cytometry A, 69, Anal. Chem., 78, 4465–4473.
524–532. 118. Van Orden, A., and Keller, R.A. (1998) Anal. Chem., 70,
87. van den Bogaart, G., Hermans, N., Krasnikov, V., de Vries, 4463–4471.
A.H., and Poolman, B. (2007) Biophys. J., 92, 1598–1605. 119. LeCaptain, D.J., and Van Orden, A. (2002) Anal. Chem.,
88. Ramadurai, S., Holt, A., Krasnikov, V., van den Bogaart, 74, 1171–1176.
G., Killian, J.A., and Poolman, B. (2009) J. Am. Chem. 120. Bayer, J., and Radler, J.O. (2006) Electrophoresis, 27,
Soc., 131, 12650–12656. 3952–3963.
89. Schwille, P., Korlach, J., and Webb, W.W. (1999) 121. Fogarty, K., and Van Orden, A. (2009) Methods, 47,
Cytometry, 36, 176–182. 151–158.
90. Korlach, J., Schwille, P., Webb, W.W., and Feigenson, 122. Pan, X., Yu, H., Shi, X., Korzh, V., and Wohland, T.
G.W. (1999) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 96, 8461–8466. (2007) J. Biomed. Opt., 12, 14–34.
91. Wawrezinieck, L., Rigneault, H., Marguet, D., and Lenne, 123. Malone, M.H., Sciaky, N., Stalheim, L., Hahn, K.M.,
P.F. (2005) Biophys. J., 89, 4029–4042. Linney, E., and Johnson, G.L. (2007) BMC Biotechnol., 7,
92. Humpolickova, J., Gielen, E., Benda, A., Fagulova, V., 40.
Vercammen, J., Vandeven, M., Hof, M., Ameloot, M., and 124. Van Craenenbroeck, E., Matthys, G., Beirlant, J., and
Engelborghs, Y. (2006) Biophys. J., 91, L23–L25. Engelborghs, Y. (1999) J. Fluoresc., 9, 325–331.
93. Wenger, J., Conchonaud, F., Dintinger, J., Wawrezinieck, 125. Van Craenenbroeck, E., and Engelborghs, Y. (2000) J.
L., Ebbesen, T.W., Rigneault, H., Marguet, D., and Lenne, Mol. Recognit., 13, 93–100.
P.F. (2007) Biophys. J., 92, 913–919. 126. Van Rompaey, E., Sanders, N., De Smedt, S.C.,
94. Chiantia, S., Ries, J., and Schwille, P. (2009) Biochim. Demeester, J., Van Craenenbroeck, E., and Engelborghs,
Biophys. Acta, 1788, 225–233. Y. (2000) Macromolecules, 33, 8280–8288.
95. Przybylo, M., Sykora, J., Humpolickova, J., Benda, A., 127. Van Rompaey, E., Engelborghs, Y., Sanders, N., De
Zan, A., and Hof, M. (2006) Langmuir, 22, 9096–9099. Smedt, S.C., and Demeester, J. (2001) Pharm. Res., 18,
96. Machan, R., and Hof, M. (2010) Int. J. Mol. Sci., 11, 928–936.
427–457. 128. van den Bogaart, G., Mika, J.T., Krasnikov, V., and
97. Politz, J.C., Browne, E.S., Wolf, D.E., and Pederson, T. Poolman, B. (2007) Biophys. J., 93, 154–163.
(1998) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 95, 6043–6048. 129. van den Bogaart, G., Kusters, I., Velasquez, J., Mika, J.T.,
98. Ries, J., Yu, S.R., Burkhardt, M., Brand, M., and Krasnikov, V., Driessen, A.J., and Poolman, B. (2008)
Schwille, P. (2009) Nat. Methods, 6, 643–645. Methods, 46, 123–130.
99. Oehlenschlager, F., Schwille, P., and Eigen, M. (1996) 130. van den Bogaart, G., Guzman, J.V., Mika, J.T., and
Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 93, 12811–12816. Poolman, B. (2008) J. Biol. Chem., 283, 33854–33857.
131. Pashkovskaya, A., Kotova, E., Zorlu, Y., Dumoulin, F., 137. Meyer, T., and Schindler, H. (1988) Biophys. J., 54,
Ahsen, V., Agapov, I., and Antonenko, Y. (2010) 983–993.
Langmuir, 26, 5726–5733. 138. Berland, K.M., So, P.T., Chen, Y., Mantulin, W.W., and
132. Smith, P.B., Dendramis, K.A., and Chiu, D.T. (2010) Gratton, E. (1996) Biophys. J., 71, 410–420.
Langmuir, 26, 10218–10222. 139. Levi, V., Ruan, Q., Kis!Petikova, K., and Gratton, E.
133. van den Bogaart, G., Krasnikov, V., and Poolman, B. (2003) Biochem. Soc. Trans., 31, 997–1000.
(2007) Biophys. J., 92, 1233–1240. 140. Lu, H.P. (2005) Acc. Chem. Res., 38, 557–565.
134. Kusters, I., van den Bogaart, G., de Wit, J., Krasnikov, V., 141. Novoderezhkin, V.I., Rutkauskas, D., and van Grondelle,
Poolman, B., and Driessen, A. (2010) Methods Mol. Biol., R. (2006) Biophys. J., 90, 2890–2902.
619, 131–143. 142. Osad’ko, I.S. (2006) Phys.Usp., 49, 19–51.
135. Perevoshchikova, I.V., Zorov, D.B., and Antonenko, Y.N. 143. Mukhopadhyay, S., and Deniz, A.A. (2007) J. Fluoresc.,
(2008) Biochim. Biophys. Acta, 1778, 2182–2190. 17, 775–783.
136. Perevoshchikova, I.V., Zorov, S.D., Kotova, E.A., Zorov, 144. Hilario, J., and Kowalczykowski, S.C. (2010) Curr. Opin.
D.B., and Antonenko, Y.N. (2010) FEBS Lett., 584, Chem. Biol., 14, 15–22.
2397–2402.
FLUORESCENCE CORRELATION
SPECTROSCOPY IN BIOLOGY, CHEMISTRY,
AND MEDICINE
I. V. Perevoshchikova1,2, E. A. Kotova1,
Y. N. Antonenko1*
1
A. N. Belozersky Institute of PhysicoChemical Biology,
M. V. Lomonosov Moscow State University, Moscow 119991,
Russia; fax: (495)9393181, Email: antonen@genebee.msu.ru
2
Department of Biomedical Sciences, University of
Veterinary Medicine, Vienna, Austria
Received October 15, 2010
Revision received November 24, 2010
The review describes the method of fluorescence correlation spectroscopy (FCS) and its applications. This experi!
mental approach is based on recording fluorescence fluctuations arising from the Brownian motion of fluorescent par!
ticles in a small confocal detection volume. Being responsive to changes in mobility of fluorescent particles, FCS is
used to study a variety of processes associated with alteration of particle size, e.g., binding of ligands to membrane
vesicles or supercomplexes, aggregation of macromolecules, etc. The size of fluorescent particles detectable by FCS
ranges from a few angstroms (dimensions of single dye molecules) to hundreds of nanometers (dimensions of
nanoparticles). Applications of FCS comprise diverse processes beginning from solution/micelles interconversion up
to sophisticated regulations in living cells. The present review concentrates preferentially on FCS use in studying arti!
ficial and natural membranes. In contrast to a closely related method of dynamic light scattering, at present FCS is
poorly known in Russia, though widely employed in foreign laboratories. The goal of this review is to promote
development of FCS in Russia so that this technique could occupy the position it deserves in modern Russian science.
Key words: fluorescence fluctuations, correlation spectroscopy, diffusion, aggregation, binding, nanoparticles,
biopolymer, vesicle, ligand, receptor, conformational change, nucleic acid and protein folding