Вы находитесь на странице: 1из 400

Л.

Страйер
Second Edition

BIOCHEMISTRY

Lubert Stryer
Stanford University

W.H.Freeman and Company


San Francisco
Л.Страйер В 3-х томах

Перевод с английского канд. биол. наук М.Д.Гроздовой


и канд. биол. наук А.М.Колчинского

Под редакцией академика С.Е.Северина

том

Москва «Мир»
1985
ББК 28.072
С 83
УДК 577.1

Страйер Л.
С 83 Биохимия: В 3-х т. Т.3 Пер. с англ.- М.: Мир, 1985,-
400 с., ил.

В книге ученого из США на самом современном научном уровне рассмотрены ос-


новные проблемы биохимии и молекулярной биологии.
Третий том посвящен хранению, передаче и реализации генетической информации,
а также молекулярным основам ряда физиологических процессов (иммунной защите, дей-
ствию гормонов, транспорту веществ в клетке, работе биологических мембран).
Предназначена для биохимиков, молекулярных биологов, физиологов, химиков, меди-
ков, для студентов, аспирантов и преподавателей биологических, химических и медицин-
ских специальностей.

2001040000-372 ББК 28.072


С св. пл. подп. изд., 1985 57.04
041(01)-85

Редакция литературы по биологии

1975, 1981 by Lubert Stryer


перевод на русский язык, «Мир»,
1985
Информация
Хранение, передача и экспрессия
Часть генетической информации

Модель пары дезоксирибону-


клеотидных мономеров двой-
ной спирали ДНК. В этой паре
аденин связан водородной
связью с тимином.
ГЛАВА 24 группой соседнего сахара фосфодиэфирной
связью. Вариабельной в ДНК является по-
ДНК: генетическая роль, следовательность оснований. ДНК содер-
жит четыре типа оснований: два пури-
структура и репликация новых основания - аденин (А) и гуанин (G);
два пиримидиновых основания - тимин (Т)
Дезоксирибонуклеиновая кислота (ДНК) - и цитозин (С). Строение цепи ДНК показа-
молекула наследственности. ДНК - очень но на рис. 24.2.

Аденин Гуанин Тимин Цитозин


(А) (G) (Т) (С)

длинная нитевидная молекула, состоящая Строение ДНК можно изобразить и бо-


из большого числа рибонуклеотидов. Пу- лее кратким путем. В этом случае для обо-
риновые и пиримидиновые основания ДНК значения четырех основных нуклеотидов
несут генетическую информацию, тогда используются следующие символы:
как сахарные и фосфатные группы вы-
полняют структурную роль. В настоящей
главе обсуждаются структура, генетическая
роль и репликация ДНК, причем основ-
ное внимание уделяется ДНК прокариот,
так как эти организмы устроены про-
ще и подчиняются общим для всех ор-
ганизмов законам. Хромосомы эукариоти- Вертикальные линии в приведенных сим-
ческих клеток рассматриваются в гл. 29. волах соответствуют остаткам сахара,
буквы A, G, С и Т - основаниям. Диаго-
нальная линия с символом (на схеме,
приведенной ниже), обозначает фосфоди-
24.1. Ковалентная структура эфирную связь. Эта диагональная линия
и номенклатура ДНК соединяет конец одной вертикальной ли-
Остов ДНК имеет одинаковое строение на нии с серединой другой. Точки соедине-
всем протяжении молекулы. Он состоит из ния соответственно означают 5'-ОН- и
остатков дезоксирибозы, связанных фосфо- 3'-ОН-группы. В приведенном ниже приме-
диэфирными мостиками. 3'-гидроксильная ре символ указывает, что дезоксиаде-
группа остатка сахара одного дезоксирибо- нилат связан с дезоксицитидином фосфо-
нуклеотида соединена с 5'-гидроксильной диэфирным мостиком. 3'-ОН-группа дезок-
сиаденилата присоединена к 5'-ОН-группе
Часть IV. дезоксицитидина через фосфорильную груп-
6 Информация пу:
бактерий. Они вызывают пневмонию у че-
ловека и других чувствительных млекопи-
тающих. Мутанты, лишенные полисаха-
ридной оболочки, не патогенны. Бактерии
дикого типа обозначают буквой S (от англ.
Предположим теперь, что с дезоксицити- smooth - гладкий), так как они образуют
дином этого динуклеотида связан дезокси- гладкие колонии, а мутантные бактерии, не
гуанилат. Соответствующий тринуклеотид имеющие капсулы,- буквой R (от англ.
можно представить следующим образом: rough - шероховатый), так как они обра-
зуют шероховатые колонии. У одной
группы R-мутантов отсутствует фермент
дегидрогеназа, превращающий UDP-глю-
козу в UDP-глюкуронат. Фермент необхо-
дим для синтеза капсульного полисахари-
да, который у этих пневмококков состоит
Сокращенное обозначение этого трину- из чередующейся последовательности
клеотида - pApCpG или ACG. остатков глюкозы и глюкуроната:

Глюкуронат Глюкоза Глюкуронат Глюкоза

Цепь ДНК характеризуется поляр- В 1928 г. Фред Гриффит (Fred Griffith)


ностью. Один конец цепи несет 5'-ОН- обнаружил, что непатогенный R-мутант
группу, а другой - 3'-ОН-группу, которая не можно трансформировать в патогенную
связана с другим нуклеотидом. Согласно S-форму следующим путем. Он инъециро-
принятым сокращениям, символ ACG оз- вал мышам смесь живых бактерий R-
начает, что свободная 5'-ОН-группа при- формы и убитых нагреванием пневмокок-
надлежит дезоксиаденозину, а свободная ков S. Поразительное открытие Гриффита
3'-ОН-группа - дезоксигуанозину. Итак, по- состояло в том, что эта смесь вызывала
следовательность оснований пишется в на- гибель мышей, хотя ни живые R-пневмо-
правлении 5'—>3'. Напомним, что амино- кокки, ни убитые нагреванием S-пневмо-
кислотная последовательность белка пи- кокки мышей не убивали. Кровь погибших
шется в направлении от N-концевой ами- мышей содержала живые S-пневмококки.
нокислоты к С-концевой аминокислоте. Следовательно, убитые нагреванием S-
Следует отметить, что ACG и GCA - раз- пневмококки каким-то образом трансфор-
ные соединения, точно так же, как Glu-Phe- мировали живые R-пневмококки в живые
Ala отличается от Ala-Phe-Glu. S-пневмококки. Это изменение было ста-
бильным: трансформированные пневмо-
кокки давали патогенное потомство
24.2. Трансформация пневмококков S-формы. Затем было установлено, что та-
с помощью ДНК показала, что гены кая трансформация R—>S может происхо-
состоят из ДНК дить in vitro. Некоторые клетки в растущей
Бактерии пневмококки сыграли важную культуре R-формы трансформировались
роль в открытии генетической функции в S-форму при добавлении бесклеточного
ДНК. экстракта убитых нагреванием пневмокок-
Пневмококки обычно окружены слизи- ков S. Это открытие заложило основу для
стой блестящей полисахаридной капсулой.
Этот наружный слой имеет существенное 24. ДНК: генетическая роль,
значение для проявления патогенности структура и репликация 7
чала результат был близок к расчетному
для ДНК; 2) оптические, электрофоретиче-
ские свойства, поведение при ультрацен-
трифугировании и диффузия очищенного
материала соответствовали свойствам
ДНК; 3) при экстрагировании белков или
липидов не происходило потери трансфор-
мирующей активности; 4) трипсин и химо-
трипсин не влияли на трансформирующую
активность; 5) рибонуклеаза (которая, как
известно, гидролизует рибонуклеиновую
кислоту) не влияла на трансформирующее
начало; 6) при добавлении дезоксирибону-
клеазы трансформирующая активность, на-
оборот, терялась.
Эта работа - памятная веха в истории
биохимии. До 1944 г. считалось, что гене-
тическую информацию несут хромосомные
белки, а ДНК играет вторичную роль. Та-
кая преобладающая точка зрения была ре-
шительно опровергнута открытием строго
доказанного факта, что очищенная ДНК
обладает генетической специфичностью.
В 1943 г. Эйвери (Avery) живым языком
описал это исследование и его последствия

Рис. 24.1. Схема структуры ДНК. Саха-


рофосфатный остов показан
черным цветом, а пуриновые
и пиримидиновые основания
разноцветные. (Kornberg A.,
The synthesis of DNA; Scientific
American, Inc., 1968.)

изучения химической природы трансфор-


мирующего начала.
Исследователи стали фракционировать
бесклеточный экстракт убитых нагрева-
нием пневмококков S и определять транс-
формирующую активность его компонен-
тов (рис. 24.3). В 1944 г. Освальд Эйвери,
Колин Мак-Леод и Маклин Мак-Карти
(Oswald Avery, Colin MacLeod, Maclyn
McCarty) опубликовали результаты своей
работы. Оказалось, что «нуклеиновая кис-
лота дезоксирибозного типа - основное дей-
ствующее начало трансформирующего эк-
стракта пневмококка типа III.» Экспери-
ментальные доказательства этого заключе-
ния состояли в следующем: 1) при эле-
ментном химическом анализе очищенного,
высокоактивного трансформирующего на-

Часть IV. Рис. 24.2. Строение одной цепи ДНК.


8 Информация Показана часть цепи.
зяином и, возможно, ферментативно про-
делывает небольшое отверстие в наружной
мембране (рис. 24.5). Затем нуклеиновая
кислота из головки вируса перетекает
внутрь клетки». Чтобы проверить это
предположение Альфред Херши и Марта
Чейз (Alfred Hershey, Martha Chase) поста-
вили следующий опыт. Фаговую ДНК по-
метили радиоактивным изотопом 32Р,
а белковую оболочку - изотопом 35S. Эти
метки весьма специфичны, так как ДНК не
содержит серы, а в белковой оболочке нет
фосфора. Культуру Е. coli заразили поме-
ченным фагом, который за непродолжи-
тельное время инкубации прикреплялся
к бактерии. Суспензию обрабатывали в те-
чение нескольких минут в гомогенизаторе
Уоринга при 10000 об/мин. В этих усло-
виях зараженные фагом клетки подверга-
лись воздействию значительных сил сдви-
га, которые разрушали связи между виру-
сами и бактериями. Затем суспензию цен-
трифугировали, чтобы осадить бактерии на
дно пробирки. Полученный осадок содер-
жал зараженные бактерии, а надосадочная
фракция - более мелкие частицы. Исследуя
содержание 32Р и 35S в осадке и надоса-
дочной фракции, определяли локализацию
фаговой ДНК и белка оболочки. В ре-
зультате были получены следующие
Рис. 24.3. Трансформация непатогенного данные.
пневмококка R (мелкие коло- 1. Большая часть фаговой ДНК обнару-
живалась в бактериях.
нии) и возникновение патоген-
2. Большая часть фагового белка обна-
ного пневмококка S (крупные
блестящие колонии) под дей- руживалась в надосадочной фракции.
ствием ДНК из убитых нагре- 3. Обработка в гомогенизаторе почти не
ванием пневмококков S. влияет на способность зараженных бакте-
[Avery О. Т., MacLeod С. М., рий продуцировать вирусное потомство.
McCarty M., J. Exp. Med., 79, Дополнительные эксперименты показа-
158 (1944).] ли, что менее 1% 35S было перенесено из
родительских фаговых частиц фаговому
потомству; 30% родительской 32Р-метки,
наоборот, обнаруживалось в потомстве.
в письме, направленном брату в другой Эти простые, убедительные эксперименты
университет (рис. 24.4). показали, что фаг Т2 можно физически
Новое подтверждение генетической ро- разделить на генетическую и негенетиче-
ли ДНК было получено при изучении од- скую части... Серусодержащий белок по-
ного вируса (бактериофага), заражающего коящихся фаговых частиц содержится
Е. coli. Бактериофаг Т2 состоит из сердце- только в защитной оболочке, которая
вины (ДНК), заключенной в белковую обо-
обеспечивает прикрепление фаговой ча-
лочку. В 1951 г. Роджер Херриот (Roger
стицы к бактериальной клетке и функцио-
Herriott) предположил, что «вирус, очевид- нирует в качестве приспособления для вве-
но, действует, как крошечный шприц для
дения фаговой ДНК в клетку. Этот белок,
подкожных инъекций, наполненный транс- возможно, не несет никакой функции, необ-
формирующим началом; вирус как тако-
вой никогда не проникает в клетку; только 24. ДНК: генетическая роль,
отросток вступает в контакт с клеткой-хо- структура и репликация 9
В течение последних двух лет, вначале с Мак-Леодом, а в настоящее время с д-ром Мак-Кар-
ти, я пытаюсь выяснить, какова химическая природа того вещества в бактериальных экстрак-
тах, которое вызывает это специфическое изменение. В неочищенном экстракте бактерий типа
III полно капсульных полисахаридов, углевода С (соматического), нуклеопротеинов, свободных ну-
клеиновых кислот дрожжевого и тимусного типа, липидов и других клеточных компонентов. По-
пробуй найти в таких сложных смесях активное начало! Попробуй выделить и химически иден-
тифицировать именно то вещество, которое само, придя в соприкосновение с R-клетками типа II,
заставляет их вырабатывать капсульный полисахарид типа III и приобрести все аристократиче-
ские особенности того самого типа клеток, из которых был приготовлен экстракт! Вот это ра-
бота, полная проблем и неожиданных затруднений. Но, ВОЗМОЖНО, мы наконец достигли
своего.
...Если окажется, что мы правы - а это, разумеется, очень весомое «если»,- тогда можно счи-
тать, что нам известна и химическая природа индуцирующего начала, и химическая структура
вещества, которое в результате образуется. Первое - это тимусная нуклеиновая кислота, вто-
рое - полисахарид типа III. Оба они впоследствии воспроизводятся в дочерних клетках, и через бес-
численное множество переносов без повторного добавления индуцирующего агента можно выде-
лить то же самое активное и специфичное трансформирующее начало в количестве, значительно
превышающем то, которое было использовано в самом начале для индуцирования реакции. Это
напоминает вирус. Возможно, это - ген. Но механизм явления меня сейчас не интересует. Всему
свое время, и первым шагом должно быть выяснение химической природы трансформирующего
начала. Остальные вопросы пусть решает кто-нибудь еще. Конечно, с каждым шагом работа
обрастает трудностями. Она затрагивает биохимию нуклеиновых кислот тимусного типа, ко-
торые, как известно, составляют основную часть хромосом, но которые до сих пор считали
сходными независимо от их происхождения. Она затрагивает генетику, энзимологию, клеточный
метаболизм и синтез углеводов. Но сегодня, только располагая множеством надежно обосно-
ванных данных, можно убедить кого бы то ни было в том, что натриевая соль дезоксирибозной
нуклеиновой кислоты, свободная от белка, могла бы обладать специфической биологической ак-
тивностью. Именно такие данные мы и пытаемся теперь получить. Тут хватает всяких весе-
леньких неожиданностей, чтобы пойти на дно, но разумнее справиться с ними самому, прежде
чем кто-нибудь другой попытается это сделать.

Рис. 24.4. Из письма Освальда Эйвери клетках с диплоидным набором хромосом.


брату Рою, написанного в мае Гаплоидные клетки имеют вполовину мень-
1943 г. (Из статьи Hotchkiss ше ДНК.
R. D. In: Phage and the Origin of
Molecular Biology, J. Cairns, 24.3. Гены некоторых вирусов состоят
S. Stent, eds., Cold Spring из РНК
Harbor Laboratory, 1966, pp. Гены всех прокариотических и эукариоти-
185-186.) ческих организмов построены из ДНК,
гены вирусов - из ДНК или из РНК. Вирус
табачной мозаики, заражающий листья

ходимой для роста фаговых частиц внутри


клетки. ДНК же выполняет какую-то функ-
цию в размножении фага. Представленные
эксперименты не позволяют сделать более
далеко идущие выводы относительно хи-
мической природы наблюдаемых явлений».
Осторожный тон этого вывода не дол-
жен умалять его значения. Вскоре генети-
ческая роль ДНК стала общепризнанной.
Эксперименты Херши и Чейз убедительно
подтвердили факты, открытые восемью го-
дами раньше Эйвери, Мак-Леодом и Мак-
Карти на другой системе. Дополнительные
доказательства были получены при иссле-
довании содержания ДНК в отдельных Рис. 24.5. Схема бактериофага Т2, вводя-
клетках. Они показали, что для данного щего свою ДНК в бактериаль-
вида содержание ДНК одинаково во всех ную клетку. (Wood W.B.,
Edgar R.S., Building a Bacterial
Часть IV. Virus, Scientific American. Inc.,
10 Информация 1967.)
растений табака,- один из наиболее изу- Межплоскостное расстояние 3,4 А
ченных РНК-содержащих вирусов. Он
образован одной молекулой РНК, окру-
женной белковой оболочкой из 2130 одина-
ковых субъединиц (обсуждение структуры
и сборки вирусов см. в гл. 30). Обработав
вирус фенолом, можно отделить белок от
РНК. Изолированная вирусная РНК инфек-
ционна, тогда как изолированный белок ли-
шен инфекционности. Использование син-
тетических гибридных вирусных частиц
еще раз показало, что генетическая специ-
фичность вируса заключается только в его
РНК. Существует множество штаммов ви-
руса табачной мозаики. Был получен син-
тетический гибридный вирус из РНК
штамма 1 и белка штамма 2. Другой такой
вирус был приготовлен из РНК штамма
2 и белка штамма 1. После заражения
клетки гибридным вирусом вирусное по- Рис. 24.6. Фотография дифракции рент-
томство всегда состояло из РНК и белка, геновских лучей на влажной ни-
соответствующих специфичности РНК ги- ти ДНК (В-форма). Крест в се-
бридного вируса, использованного для зара- редине картины характерен для
жения. спиральной структуры. Интен-
сивные меридианальные ре-
флексы возникают в результа-
24.4. Двойная спираль ДНК Уотсона-Крика те дифракции на стопке пар
В 1953 г. Джеймс Уотсон и Френсис Крик оснований, расположенных на
(James Watson, Francis Crick) установили расстоянии 3,4 А друг от друга.
трехмерную структуру ДНК и сразу же (Печатается с любезного разре-
предложили возможный механизм ее ре- шения д-ра Maurice Wilkins.)
пликации. Это блестящее достижение
стоит в ряду важнейших событий в исто-
рии биологии, так как оно открыло путь между соседними основаниями вдоль оси
к пониманию функции гена на молекуляр- спирали 3,4 А, они повернуты относитель-
ном уровне. Уотсон и Крик проанализиро- но друг друга на 36°. Таким образом, на
вали картины дифракции рентгеновских один виток спирали каждой из цепей при-
лучей на нити ДНК (рис. 24.6), полученные ходится 10 нуклеотидов, что соответствует
Розалиндой Франклин и Морисом Уилкин- 34 А.
сом (Rosalind Franklin, Maurice Wilkins), 4. Две цепи удерживаются вместе водо-
и предложили структурную модель, кото- родными связями между парами основа-
рая в основных своих чертах оказалась ний. Аденин всегда спаривается с тимином,
верной. Характерные особенности этой мо- гуанин - с цитозином (рис. 24.9 и 24.10).
дели сводятся к следующему. 5. На последовательность оснований
1. Две спиральные полинуклеотидные в полинуклеотидной цепи не накладывает-
цепи закручены вокруг общей оси. Цепи ся никаких ограничений. Определенная по-
направлены в противоположные стороны следовательность оснований несет кон-
(рис. 24.7). кретную генетическую информацию.
2. Пуриновые и пиримидиновые основа- Важнейшее свойство двойной спирали -
ния расположены внутри спирали, а остат- специфичность спаривания оснований. Ис-
ки фосфата и дезоксирибозы - снаружи ходя из стерических ограничений и способ-
(рис. 24.8). Плоскости оснований перпенди- ности к образованию водородных связей,
кулярны оси спирали. Плоскости остатков Уотсон и Крик постулировали, что аденин
сахара расположены почти под прямым
углом к основаниям. 24. ДНК: генетическая роль,
3. Диаметр спирали 20 А. Расстояние структура и репликация 11
Формы ДНК -
А-форма ДНК: двухспиральная ДНК, содержащая примерно 11 остатков на
один оборот спирали. В этой правозакрученной спирали плоскости пар осно-
ваний повернуты примерно на 20° относительно перпендикуляра к оси спира-
ли. Образуется при дегидратации В-формы ДНК.
В-форма ДНК: классическая уотсон-криковская двойная спираль, содержащая
примерно 10 остатков на один оборот спирали. В этой правозакрученной спи-
рали плоскости пар оснований перпендикулярны оси спирали.
Z-форма ДНК: левозакрученная двухспиральная форма ДНК, содержащая
около 12 остатков на один оборот. Эта структура предложена Александром
Ричем (Alexander Rich) и его сотрудниками на основе изучения кристалличе-
ской структуры d(CG)3.

должен спариваться с тимином, а гуа- лены периодическим строением спираль-


нин - с цитозином. Стерические ограниче- ной структуры сахарофосфатного остова
ния на расположение основания обуслов- обеих полинуклеотидных цепей. Глико-
зидные связи, которыми присоединяется
к остову пара оснований, отстоят друг от
друга на расстояние 10,85 А (рис. 24.11).
Пара пиримидин—пурин прекрасно
укладывается в это пространство. В то же
время для двух пуринов этого расстояния
недостаточно. Для двух пиримидинов мес-
та более чем достаточно, но они оказались
бы слишком далеко друг от друга, чтобы
образовать водородные связи. Следова-

Рис. 24.8. Схема одной из цепей двойной


спирали ДНК (вид по оси спи-
рали). Основания - в данном
Рис. 24.7. Схема модели двухспиральной случае только пиримидины -
ДНК. Вся структура повто- расположены внутри, а сахаро-
ряется через 34 А, что соответ- фосфатный остов - снаружи.
ствует 10 остаткам в каждой Отчетливо видно, что структу-
цепи. ра имеет ось симметрии деся-
того порядка. Основания обо-
Часть IV. значены зеленым цветом, саха-
12 Информация ра - красным.
Рис. 24.9. Модель пары оснований аде-
нин—тимин.

Рис. 24.10. Модель пары основании гуа-


нин—цитозин.

Рис. 24.11. Наложение АТ-пары основа-


ний (обозначена желтым цве-
том) на GС-пару (обозначена
синим цветом). Обратите вни-
мание, что положения глико-
зидных связей и С'-1 атома де-
зоксирибозы (обозначен зе-
леным) в двух типах пар 24. ДНК: генетическая роль,
оснований почти одинаковы. структура и репликация 13
Рис. 24.12. Модель двухспиральной моле- тате проведенных ранее исследований ну-
кулы ДНК. Показаны три пары клеотидного состава ДНК разных видов.
оснований. Обратите внима- В 1950 гг. Эрвин Чаргафф (Erwin Chargaff)
ние, что две цепи ориентиро- обнаружил, что соотношение аденина с ти-
ваны в противоположном на- мином и гуанина с цитозином у всех иссле-
правлении. дованных видов было близко к 1. Значение
этого факта оставалось неясным, пока не
тельно, одно из оснований в паре в двой- была предложена модель Уотсона-Крика
ной спирали ДНК всегда должно быть пу- (рис. 24.12 и 24.13). Только тогда стало по-
рином, а другое - пиримидином. Кроме нятным, что эта закономерность отражает
того, на спаривание оснований наклады- важнейшее свойство структуры и функции
вают ограничения правила образования ДНК - специфичность спаривания основа-
водородных связей. Атомы водорода в пу- ний.
риновых и пиримидиновых основаниях за- 24.5. Комплементарные цепи служат
нимают вполне определенные положения. матрицами друг для д р у г а
Аденин не может спариваться с цитозином, при репликации ДНК
так как тогда на месте одной связи оказа- Модель двухспиральной молекулы ДНК
лось бы два атома водорода, а на месте позволила сразу же предложить механизм
другой - ни одного. Точно так же гуанин не репликации ДНК. Уотсон и Крик опубли-
может связываться с тимином. Аденин, на- ковали свою гипотезу через месяц после
оборот, образует с тимином две водо- того, как представили модель структуры
родные связи, а гуанин - три водородные ДНК в виде прекрасной статьи, отличав-
связи с цитозином (рис. 24.9 и 24.10). шейся простотой и ясностью.
Ориентация этих водородных связей и рас- «Если задан определенный порядок ос-
стояние между ними оптимальны для нований в одной из цепей, можно напи-
сильного взаимодействия между основа- сать точную последовательность основа-
ниями. ний в другой цепи, поскольку спаривание
Эта схема спаривания оснований получи- специфично. Таким образом, каждая из
ла убедительное подтверждение в резуль- цепей комплементарна другой цепи,
и именно это свойство подсказывает, ка-
Часть IV. ким образом может удваиваться молеку-
14 Информация ла дезоксирибонуклеиновой кислоты.
Прежние дискуссии о самоудвоении
всегда опирались на представление о не-
кой матрице или каком-то шаблоне.
Предполагалось, что матрица копирует
непосредственно самое себя, или должна
образовывать «негатив», который в свою
очередь действует в качестве матрицы
и образует исходный «позитив». Ни
в одном случае не было предложено де-
тального объяснения, как это могло бы
происходить на уровне атомов и моле-
кул.
В нашей модели дезоксирибонуклеино-
вой кислоты имеется, по существу, пара
матриц, причем каждая из них компле-
ментарна другой. Мы полагаем, что
перед удвоением водородные связи раз-
рываются и две цепи раскручиваются
и расходятся. Затем каждая цепь исполь-
зуется в качестве матрицы для образова-
ния на ней новой комплементарной цепи,
так что в конце концов у нас будет две
пары цепей, тогда как раньше была
только одна. Более того, при таком спо-
собе репликация последовательность пар
оснований будет в точности удвоена».

24.6. Репликация ДНК полуконсервативна Рис. 24.13. Пространственная модель


Уотсон и Крик предположили, что одна из двойной спирали ДНК. Отчет-
цепей каждой дочерней молекулы ДНК ливо видны большая бороздка
синтезируется заново, а другая происходит (показана красным цветом)
от родительской молекулы ДНК. Такое и малая бороздка (показана си-
распределение атомов родительской моле- ним цветом). Обратите внима-
кулы называют полуконсервативным. ние, что часть каждого основа-
Метью Меселсон и Франклин Сталь ния доступна для взаимодей-
(Matthew Meselson, Franklin Stahl) постави- ствия с другими молекулами.
ли принципиально важный эксперимент (Печатается с любезного разре-
для проверки этой гипотезы. Родитель- шения д-ра Sung-Hou Kim.)
скую ДНК пометили тяжелым изотопом
15
азота N, чтобы сделать ее более тяже-
лой, чем обычная ДНК. Для этого выра- ностью, близкой к плотности ДНК
щивали Е. coli в течение многих поколений ( ~ 1 , 7 г/см3). Этот раствор центрифуги-
в среде, содержавшей в качестве единствен- руют почти до равновесного состояния.
ного источника азота 15NH4Cl. Затем бак- Под действием противодействующих про-
терии быстро переносили в среду, содер- цессов седиментации и диффузии в центри-
жавшую 14 N-стабильный изотоп азота. фужной ячейке возникает градиент концен-
Этот эксперимент должен был показать, трации хлористого цезия. В результате
как распределяются изотопы 14N и I 5 N создается устойчивый градиент плотности
в молекулах ДНК в ходе последующих от 1,66 до 1,76 г/см3. Под действием цен-
циклов репликации. тробежной силы молекулы ДНК переходят
Распределение 14N и 15 N в потомстве в ту область градиента, в которой плот-
изучали с помощью только что разрабо- ность раствора равна их собственной пла-
танного метода равновесной седиментации вучей плотности. Высокомолекулярная
в градиенте плотности. Небольшое коли-
чество ДНК растворяют в концентриро- 24. ДНК: генетическая роль,
ванном растворе хлористого цезия с плот- структура и репликация 15
Рис. 24.14. Разделение 14N- и 15N-ДНК тов вывод, «что азот молекул ДНК рас-
при центрифугировании в гра- пределяется поровну между двумя физиче-
диенте плотности. А - фото- ски раздельными структурами, что после
графия центрифужной ячейки удвоения каждая дочерняя молекула полу-
в ультрафиолетовом свете; чает одну из этих структур и что эти
Б - денситометрическая кривая структуры сохраняются интактными
поглощения, полученная при в течение многих удвоений». Полученные
сканировании фотографии, результаты прекрасно согласовывались
приведенной на рис. А. с моделью репликации ДНК Уотсона—
[Meselson M., Stahl F. W., Proc. Крика (рис. 24.16).
Nat. Acad. Sci., 44, 671 (1958).]
24.7. Некоторые вирусы содержат
на определенных стадиях жизненного цикла
ДНК образует четко выраженную полосу, одноцепочечную ДНК
обнаруживаемую по поглощению ультра- ДНК не всегда двухцепочечная молекула.
фиолетового света. Молекулы 14N-ДНК и Роберт Синсхеймер (Robert Sinsheimer) об-
15
N-ДНК хорошо разделяются в таком наружил, что ДНК фага φ Х 1 7 4 , небольшо-
градиенте, поскольку их плотность разли- го вируса, заражающего Е. coli,- одноцепо-
чается примерно на 1% (рис. 24.14). чечная молекула. Несколько эксперимен-
ДНК выделяли из бактерий через раз- тальных фактов привели его к этому
личные промежутки времени после перено- неожиданному выводу. Во-первых, соотно-
са со среды, содержащей 15N, на 14N. Ана- шение оснований в ДНК фага φХ174 не
лиз этих образцов центрифугированием удовлетворяет правилу [А] = [Т] и [G] =
в градиенте плотности показал, что после = [С]. Во-вторых, вязкость раствора ДНК
одного цикла репликации ДНК дает одну фага φХ174 значительно меньше вязкости
полосу (рис. 24.15). Плотность этой полосы раствора ДНК Е. coli той же концентра-
была равна в точности среднеарифметиче- ции. Гидродинамические свойства ДНК
скому значению между плотностью 14N- и фага φХ174 соответствуют полимеру
15
N-ДНК. Отсутствие 15N-ДНК свиде- в конформации случайного клубка. В отли-
тельствовало о том, что целостность ро- чие от этого ДНК в форме двойной спира-
дительской ДНК в ходе репликации нару- ли ведет себя гидродинамически как очень
шается. Отсутствие 14N-ДНК показывало, жесткая палочка. В-третьих, аминогруппы
что часть атомов всех дочерних молекул оснований ДНК фага φХ174 легко реаги-
ДНК происходила от родительской ДНК. руют с формальдегидом, тогда как основа-
Соотношение 14N и 15 N в дочерних моле- ния в двойной спирали ДНК почти недо-
кулах должно составлять 1:1, так как плот- ступны для этого реактива.
ность гибридных молекул ДНК была сред- Обнаружение этой одноцепочечной ДНК
ней между 14N- и 15N-ДНК. породило сомнения в универсальности
После двух циклов репликации ДНК схемы полуконсервативной репликации,
распределялась поровну в двух полосах. предложенной Уотсоном и Криком. Одна-
Одна из них - гибридная ДНК, ко вскоре было показано, что ДНК фага
другая - 14N-ДНК. Меселсон и Сталь φХ174 находится в одноцепочечном со-
сделали из этих убедительных эксперимен- стоянии только на протяжении части жиз-
ненного цикла вируса. Синсхеймер обнару-
Часть IV. жил, что зараженные клетки Е. coli содер-
16 Информация жат двухцепочечную форму ДНК фага
Рис. 24.15. Доказательство полуконсерва-
тивной репликации в клетках Е.
coli с помощью центрифугиро-
вания в градиенте плотности.
Положение полосы ДНК зави-
сит от содержания 14N и 15N.
После 1,0 генерации все моле-
кулы ДНК представляют со-
бой гибриды, содержащие рав-
ное количество 14N и l 5 N.
Родительская ДНК ( 1 5 N) после
1,0 генерации не обнаруживает- Рис. 24.16. Схема полуконсервативной ре-
ся. [Meselson M., Stahl F.W., пликации. Родительская ДНК
Proc. Nat. Acad. Sci., 44, 671 изображена зеленым, а ново-
синтезированная - красным.
(1958).]
[Meselson M., Stahl F.W., Proc.
Nat. Acad. Sci, 44, 671 (1958).]

φ Х 1 7 4 . Эта двухцепочечная ДНК назы-


вается репликативной формой, так как она
служит матрицей для синтеза ДНК вирус-
ного потомства. Вирусы, содержащие 24. ДНК: генетическая роль,
одноцепочечную РНК, также реплици- структура и репликация 17
ческих структур, а диаметр 20 А находится
на уровне атомных размеров. Бруно Зимм
(Bruno Zimm) показал, что самая большая
хромосома у Drosophila melanogaster содер-
жит единую молекулу ДНК, состоящую из
6,2•107 пар оснований. Контурная длина
этой молекулы 2,1 см. Столь асимме-
тричные молекулы ДНК весьма чувстви-
тельны к разрыву под действием сил сдви-
га. Они легко разрываются на фрагменты,
масса которых в 1000 раз меньше, чем мас-
са исходной молекулы, если при манипуля-
циях с ней не принимаются особые меры
предосторожности.
Изображения молекул ДНК многих бак-
терий и вирусов были непосредственно по-
лучены с помощью электронного микро-
скопа (рис. 24.18). Размеры некоторых та-
ких молекул ДНК приведены в табл. 24.1
Следует отметить, что даже самые ма-
ленькие молекулы ДНК имеют весьма вы-
тянутую форму. Например, ДНК вируса
Рис. 24.17. Электронная микрофотогра- полиомы содержит 5100 пар оснований
фия частиц вируса φХ174. (Пе- и имеет контурную длину 1,7 мкм (17000
чатается с любезного разреше- А). Напомним, что диаметр молекулы ге-
ния д-ра Robley Williams.) моглобина составляет 65 А, а длина колла-
гена, одного из самых длинных бел-
ков,- 3000 А. Это сравнение подчеркивает
огромную длину и выраженную асимме-
руются через промежуточную двухцепочеч- трию молекул ДНК.
ную репликативную форму. Механизмы
этих процессов подробнее рассматривают-
ся в гл. 30. Здесь же важно лишь подчерк-
нуть, что эти исследования подтвердили
всеобщность схемы репликации Уотсона—
Крика. Двухцепочечная ДНК (или
РНК) - репликативная форма всех из-
вестных генов.
24.8. Молекулы ДНК очень длинные
Прежде чем перейти к механизму реплика-
ции ДНК, представляющему собой
сложный ферментативный процесс, рассмо-
трим некоторые свойства ДНК. Порази-
тельная особенность молекул ДНК, встре-
чающихся в природе,- их необычайная дли-
на. Хромосома Е. coli представляет собой
единую молекулу двухспиральной ДНК, со-
держащей 4 млн. пар оснований. Масса
этой молекулы ДНК 2,6•106 кДа. Она
имеет крайне асимметричную форму: ее
контурная длина 14•106 А, а диаметр 20 А.
Контурная длина (1,4 мм) этой молекулы Рис. 24.18. Электронная микрофотогра-
ДНК соответствует размерам макроскопи- фия молекулы ДНК бактерио-
фага λ (форма RFII). (Печатает-
Часть IV. ся с любезного разрешения
18 Информация д-ра Thomas Broker.)
Для измерения длин молекул нуклеиновых кислот применяется единица
длины, равная 1000 пар нуклеотидов в случае двухцепочечных молекул ну-
клеиновых кислот (т.п.н., или kb - от англ. kilobase) или 1000 нуклеотидов
в случае одноцепочечных молекул (т.н., или kb). 1 kb двухцепочечной ДНК
имеет контурную длину 0,34 мкм и массу примерно 660 кДа.

24.9. Двойная спираль может быть обратимо


расплавлена
Две цепи ДНК-спирали могут легко ра-
зойтись, если разрушить водородные свя-
зи, соединяющие спаренные основания.
Этого можно достичь, либо нагревая рас-
твор ДНК, либо добавляя в раствор кисло-
ту или щелочь для ионизации оснований.
Раскручивание двойной спирали называет-
ся плавлением, так как происходит мгно-
венно при строго определенной температу-
ре. Температура плавления (Тпл) - это та
температура, при которой разрушается по-
ловина спиральной структуры. Резкость
этого перехода показывает, что двойная
спираль ДНК - структура высококоопера-
тивная. Плавление ДНК легко регистриро-
вать, измеряя ее поглощение при 260 нм.
Нарушение межплоскостных взаимодей-
ствий пар оснований приводит к увеличе- Рис. 24.19. При плавлении двойной спира-
нию поглощения - эффект, называемый ги- ли, когда она переходит в одно-
перхромизмом (рис. 24.19). цепочечную форму, поглоще-
Температура плавления молекулы ДНК ние раствора ДНК при 260 нм
существенно зависит от ее нуклеотидного возрастает.
состава. Молекулы ДНК, богатые GС-па-
рами оснований, имеют более высокие зна-
чения Тпл, чем молекулы, богатые АТ-па-
рами оснований (рис. 24.20). В общем Тпл
Таблица 24.1. Размеры некоторых молекул ДНК
(Kornberg A., DNA replication, W. H. Freeman and Co.,
1980, p. 20)

Организм Число пар Контурная


оснований, длина, мкм
kb

Вирусы
Полиома или SV-40 5,1 1,7 Рис. 24.20. Кривые плавления различных
Фаг λ 48,6 17 ДНК. На графике отложено от-
Фаг Т2 166 56 носительное поглощение при
Вирус коровьей оспы 190 65 260 нм в зависимости от темпе-
Бактерии ратуры (поглощение при 25°С
Микоплазма 760 260 принято за 1). Тпл равна 69°С
E.coli 4000 1 360 для ДНК Е. coli (50% GС-пар)
Эукариоты
и 76°С для ДНК. P. aeruginosa
(68% GС-пар).
Дрожжи 13500 4600
Дрозофила 165000 56000
Человек 2900000 990000 24. ДНК: генетическая роль,
структура и репликация 19
24.10. Некоторые молекулы ДНК имеют
кольцевую форму
Методом электронной микроскопии было
показано, что интактные молекулы ДНК
из многих источников замкнуты в кольцо
(рис. 24.18). Открытие того факта, что Е.
coli имеет кольцевую хромосому, не было
неожиданностью. Оно было предсказано
на основе генетических исследований, пока-
завших, что карта генетического сцепления
этой бактерии является кольцевой. Термин
«кольцевая» означает лишь, что цепь ДНК
непрерывна, и отнюдь не относится к ее
геометрической форме. In vivo молекулы
ДНК всегда имеют весьма компактную
Рис. 24.21. Электронная микрофотогра- форму. В связи с этим следует отметить,
фия молекулы ДНК, частично что хромосома Е. coli примерно в 1000 раз
расплетенной под действи- длиннее, чем клетка бактерии.
ем щелочи. Одноцепочечные Не все молекулы ДНК имеют кольце-
участки имеют вид петель, ко- вую форму. Например, ДНК бактериофага
торые окрашены менее интен- Т7 является линейной. Молекулы ДНК не-
сивно, чем двухцепочечные которых вирусов, таких, как бактериофаг λ,
участки. Эти расплетенные претерпевают взаимопревращения линейной
участки ДНК богаты АТ-пара- и кольцевой форм. В вирусной частице при-
ми оснований. Один из них по- сутствует линейная форма, а в клетке-хо-
мечен стрелкой. [Inman R. В., зяине - кольцевая (разд. 30.16).
Schnos M., J. Mol. Biol., 49, 93
(1970).] 24.11. Кольцевые двухспиральные
молекулы ДНК могут находиться
в суперспирализованном
состоянии
ДНК многих видов повышается линейно При превращении линейной двухцепочеч-
от 77 до 100°С с увеличением содержания ной ДНК в замкнутую кольцевую молеку-
GС-пар от 20 до 78%. GC-пары стабильнее лу она приобретает новое свойство. Дже-
АТ-пар, так как в них основания удержи- ром Виноград (Jerome Vinograd) установил,
ваются вместе тремя водородными связя- что ось двойной спирали ДНК может сама
ми, а не двумя. Следовательно, АТ-богатые быть закручена в суперспираль. Эта супер-
области ДНК должны плавиться первыми спираль может быть закручена в правую
(рис. 24.21). Как мы увидим ниже, in vivo или в левую сторону (рис. 24.22). Термины
двойная спираль расплетается под дей- «суперспирализованная», «сверхскручен-
ствием специальных белков. Некоторые из
них вызывают раскручивание ДНК, гидро-
лизуя АТР (разд. 24.21).
Разделенные комплементарные цепи
ДНК спонтанно реассоциируют с образо-
ванием двойной спирали, если температура
становится ниже Тпл. Этот процесс ренату-
рации иногда называют отжигом. Ско-
рость реассоциации зависит от концентра-
ции комплементарных последовательно-
стей (разд. 29.10). Легкость, с которой
плавятся и реассоциируют двойные спира-
ли, имеет критическое значение для выпол-
нения ДНК ее биологических функций.
Рис. 24.22. Схематическое изображение
Часть IV. релаксированной (А) и супер-
20 Информация спирализованной (Б) ДНК.
ная», «суперспиральная», «суперскручен-
ная» и «сверхспиральная» - синонимы.
Кольцевую ДНК, совершенно лишенную
суперспиральных витков, называют релак-
сированной. Для того чтобы превратить ре-
лаксированную ДНК в суперспирализован-
ную, необходимо затратить определенную
энергию. Например, энергия, затрачивае-
мая на образование 15 суперспиральных
витков в одной молекуле ДНК вируса
SV-40 (ее контурная длина 1,7 мкм), соста-
вляет около 100 ккал/моль. Энергия напря-
жения суперспирализованной ДНК (энер-
гия суперспирализации) примерно пропор-
циональна квадрату числа суперспи-
ральных витков.
Суперспирализация, по-видимому, вы-
полняет две биологические функции. Во-
первых, суперспирализованная ДНК имеет
более компактную форму, чем релаксиро-
ванная ДНК такой же длины (рис. 24.23).
Суперспирализация может играть опреде-
ленную роль в упаковке ДНК. Во-вторых,
Суперспирализация может влиять на сте-
пень расплетания двойной спирали и, сле-
довательно, на ее взаимодействия с други-
ми молекулами. Точнее, отрицательная Рис. 24.23. Электронные микрофотогра-
суперспирализация может приводить к рас- фии митохондриальной ДНК:
кручиванию двойной спирали. Интересно от- А - релаксированная кольцевая
метить, что почти все кольцевые молекулы форма; Б - суперспирализован-
ДНК, встречающиеся в природе, отрица- ная кольцевая форма. (Печа-
тельно суперспирализованы. тается с любезного разрешения
Важная характеристика замкнутой коль- д-ра David Clayton.)
цевой ДНК - ее порядок зацепления L (от
англ. linking). Число L указывает, сколько
раз одна цепь пересекает другую цепь, если
их спроецировать на плоскость. Число
L должно быть целым. Кручение Т (от 24.12. Открытие ДНК-полимеразы
англ. twisting) и величина суперспирализа- Перейдем теперь к молекулярному меха-
ции W (от англ. writhe) связаны между со- низму репликации ДНК. Артур Корнберг
бой уравнением (Arthur Kornberg) и его коллеги в 1955 г.
начали поиск фермента, синтезирующего
L = W + Т, ДНК. Вскоре этот поиск увенчался успе-
хом, главным образом потому, что при
т.е. находятся в обратной зависимости. планировании экспериментов были при-
Порядок зацепления - топологическая ха- няты три правильных решения, т.е. был
рактеристика; она может изменяться, лишь сделан правильный выбор между несколь-
когда в одну или в обе цепи кольцевой кими возможностями.
ДНК вносятся разрывы. Действительно, 1. Что представляют собой активиро-
были выделены ферменты, которые ката- ванные предшественники ДНК? Корнберг
литически изменяют величину L. Катали- и его коллеги сделали правильное предпо-
тическую активность таких топоизомераз ложение, что активированные промежу-
легко выявить с помощью гель-электрофо- точные продукты синтеза ДНК - дезоксири-
реза, так как суперспирализованная ДНК бонуклеозид-5'-трифосфаты. В основе это-
более компактна и поэтому имеет боль-
шую подвижность, чем релаксированная 24. ДНК: генетическая роль,
ДНК (рис. 24.24). структура и репликация 21
тивности в осадке, полученном после обра-
ботки инкубационной смеси кислотой. В ос-
нове этого метода лежит тот факт, что
ДНК осаждается кислотами, например
трихлоруксусной кислотой, а нуклеотиды-
предшественники остаются в растворе.
3. Какие клетки следует выбрать для ис-
следования? После того как первона-
чальные эксперименты с экстрактами жи-
вотных клеток дали отрицательные резуль-
таты, выбор пал на бактерии Е. coli,
поскольку деление этих клеток происходит
всего лишь за 20 мин (время генерации), и,
следовательно, их можно выращивать
в больших количествах. Как и предполага-
лось, эта бактерия исключительно богата
ферментами, участвующими в синтезе
ДНК.
Экстракт Е. coli инкубировали с радиоак-
Рис. 24.24. Фотографии гелей, на которых тивным дезокситимидин-5'-трифосфатом.
видна релаксация суперспира- Радиоактивность этого 14
С-меченного
лизованной ДНК вируса SV-40. предшественника составляла 1•106 имп./
Дорожка А - суперспирализо- мин. Радиоактивность осадка, полученного
ванная ДНК с большим чис- добавлением к инкубационной смеси кис-
лом отрицательных витков. лоты, составляла всего 50 имп./мин. Было
При инкубации ДНК с топои- синтезировано лишь несколько пикомолей
зомеразой в течение 5 мин (Б) ДНК, но этим было положено начало.
и 30 мин (В) образуется ряд по- Корнберг писал: «Хотя количество нуклео-
лос с более низкой степенью су- тида, включившегося в состав нуклеиновой
перспирализации. [Keller W., кислоты, было ничтожным, оно было су-
Proc. Nat. Acad. Sci., 72, 2553 щественно выше уровня фона. Мы попро-
(1975).] бовали забить клин в эту узенькую щелку.

го предположения лежали два соображе-


ния. Во-первых, пути биосинтеза пуринов
и пиримидинов приводят к образованию
нуклеозид-5'-фосфатов (а не нуклеозид-3'-
фосфатов). Во-вторых, активированным
промежуточным продуктом синтеза пиро-
фосфатной связи в таких коферментах, как
NAD + , FAD и СоА, является АТР.
2. Что может служить критерием синте-
за Д Н К ? Предполагалось, что абсолютное
количество ДНК, синтезированной в пер-
воначальных экспериментах, должно быть
весьма невелико, главным образом из-за
обилия нуклеаз. Поэтому нужен был ка-
кой-то чувствительный тест. Был разрабо-
тан такой тест с использованием радиоак- Рис. 24.25. Электронная микрофотогра-
тивных нуклеотидов-предшественников. фия молекул ДНК-полиме-
Включение этих предшественников в ДНК разы (сферические структуры),
обнаруживали путем измерения радиоак- связанных с молекулой ДНК
(тонкая нить). (Печатается
Часть IV. с любезного разрешения д-ра
22 Информация Jack Griffith.)
Рис. 24.26. Реакция элонгации цепи, ката- зоксирибонуклеотиды к 3'-гидроксильному
лизируемая ДНК-полимера- концу предсуществующей цепи ДНК (или
зой. РНК). Другими словами, необходима за-
травочная цепь, или затравка, со свобод-
Молотком нам служила очистка фермен- ной 3'-гидроксильной группой.
та - метод, отработанный при изучении 3. Необходима матричная ДНК. Матри-
спиртового брожения». цей может служить как одно- так и двухце-
Этот новый фермент был назван ДНК- почечная ДНК. Двухцепочечная ДНК слу-
полимеразой (рис. 24.25). Теперь его назы- жит эффективной матрицей лишь в том
вают ДНК-полимеразои I, так как с тех случае, если ее сахарофосфатный остов
пор были выделены другие ДНК-полиме- разорван в одном или нескольких местах.
разы. После десяти лет напряженной ра- Реакция элонгации (удлинения) цепи, ка-
боты в лаборатории Корнберга ДНК-по- тализируемая ДНК-полимеразой, происхо-
лимераза I была очищена до гомогенного дит путем нуклеофильной атаки 3'-ОН-кон-
состояния и детально охарактеризована. цом матрицы ближайшего к рибозе атома
Насколько велики были масштабы проде- фосфора очередного дезоксирибонуклеозид-
ланной работы, говорит тот факт, что для трифосфата. В результате образуется фос-
получения 500 мг чистого фермента необ- фодиэфирный мостик и одновременно выс-
ходимо было взять 100 кг клеток E.coli. вобождается пирофосфат (рис. 24.26). По-
ДНК-полимераза I - это единая полипеп- следующий гидролиз пирофосфата обеспе-
тидная цепь с массой 109 кДа. Она катали- чивает дальнейшую полимеризацию. Такое
зирует последовательное присоединение де- смещение общего состояния равновесия
зоксирибонуклеиновых звеньев к цепи ДНК: было бы невозможно, если бы активиро-
ванными промежуточными продуктами
(ДНК)n остатков
+ служили нуклеозиддифосфаты. Именно
+ dNTP (ДНК)n+1 + РРi в этом мы усматриваем убедительную
причину преобладания нуклеозидтрифос-
Для синтеза цепи ДНК ДНК-полимеразе фатов по сравнению с дифосфатами в каче-
I необходимы следующие компоненты: стве активированных предшественников
1. В среде должны присутствовать все в биосинтетических реакциях. Элонгация
четыре дезоксирибонуклеозид-5'-трифосфа- цепи ДНК происходит в направлении 5'—>
та: dATP, dGTP, dTTP и dCTP. В дальней- —>3' (рис. 24.27). За секунду одна молекула
шем мы будем обозначать эти дезоксири- ДНК-полимеразы I присоединяет пример-
бонуклеозидтрифосфаты общим символом но 10 нуклеотидов. Полимеризация процес-
dNTP. Кроме того, необходимы ионы
Мg2+. 24. ДНК: генетическая роль,
2. ДНК-полимераза I присоединяет де- структура и репликация 23
Рис. 24.27. ДНК-полимеразы катализи- и С), поскольку он образует подходящую
руют рост цепей ДНК в напра- пару оснований с цитозином.
влении 5'—>3'. 3. Нуклеотидный состав новосинтезиро-
ванной ДНК зависит от характера ма-
трицы, а не от относительного количества
сивна, т. е. фермент присоединяет много ну- четырех нуклеотидов-предшественников.
клеотидов, оставаясь связанным с одной Образующаяся ДНК имеет тот же нуклео-
матрицей. тидный состав, что и двухспиральная ма-
тричная ДНК. Из этого следует, что под
24.13. ДНК-полимераза получает действием ДНК-полимеразы реплицируют-
инструкции от матрицы ся обе цепи матричной ДНК.
ДНК-лолимераза катализирует образова- 4. Наиболее убедительным доводом слу-
ние фосфодиэфирной связи только в том жат данные о том, что ДНК фага φХ174,
случае, если основание очередного нуклео- реплицированная in vitro ДНК-полимера-
тида комплементарно соответствующему зой I, полностью инфекционна. Следова-
основанию матричной цепи. Если же осно- тельно, частота, с которой этот фермент
вание очередного нуклеотида не образует делает ошибки, очень низка.
уотсон-криковской пары с соответствую-
щим основанием матричной цепи, вероят- 24.14. ДНК-полимераза I исправляет
ность образования ковалентной связи ошибки в ДНК
очень низка. Следовательно, ДНК-полиме- ДНК-полимераза обладает еще одним ви-
раза - фермент, направляемый матрицей. дом ферментативной активности: в опреде-
Она была открыта первой из ферментов ленных условиях она способна расщеплять
такого типа. цепи ДНК. ДНК-полимераза постепенно
Ряд экспериментов доказывает, что ДНК- гидролизует цепь ДНК с 3'-гидроксильно-
полимераза получает инструкции от ма- го конца. При этом отщепляются монону-
трицы. клеотиды. Таким образом, ДНК-полимера-
1. Первым доводом в пользу этого утвер- за I является также 3'—>5'-экзонуклеазой
ждения послужил тот факт, что значи- (рис. 24.28). Удаляемый нуклеотид должен
тельный синтез ДНК идет только в при- иметь свободный 3'-ОН-конец и не должен
сутствии всех четырех дезоксирибонуклео- находиться в составе двойной спирали.
зидтрифосфатов и матричной Д Н К , Является ли такая экзонуклеазная актив-
2. ДНК-полимераза может включать ность фермента нежелательным побочным
в ДНК некоторые аналоги оснований. На- эффектом, или она каким-то образом уча-
пример, урацил или 5-бромурацил может ствует в биологическом действии ДНК-по-
замещать тимин. Гипоксантин может заме- лимеразы? Эксперименты с использова-
щать гуанин. Способность аналогов заме- нием химически синтезированных полину-
щать основания высоко специфична. Со- клеотидов с некомплементарным остатком
гласно правилу замещения, тот или иной на конце затравки показали, что 3'—>
аналог может включаться лишь при усло- —>5'-экзонуклеазная активность выпол-
вии, что он способен образовать уотсон- няет в процессе полимеризации функцию ре-
криковскую пару с основанием, комплемен- дактирования. Рассмотрим полимер, пока-
тарным замещаемому основанию. Так, ги- занный на рис. 24.28, в котором последова-
поксантин может замещать G (но не А, Т тельность остатков dT образует двойную
спираль с более длинным полимером dA.
Часть IV. На 3'-конце этой poly(dT)-последователь-
24 Информация ности имеется один остаток dC, который
не образует водородных связей, так как он
не комплементарен dA. При добавлении
ДНК-полимеразы и dTTP этот некомпле-
ментарный остаток dC отщепляется рань-
ше, чем начинается присоединение остат-
ков dT. Эксперименты с использованием
множества различных синтетических поли-
меров показали, что ДНК-полимераза
I всегда удаляет некомплементарные
остатки на конце затравки, прежде чем
продолжать полимеризацию. Если на конце
находится комплементарное основание и
в среде присутствуют активированные
предшественники, гидролиза практически
не происходит. Полимеризация предотвра-
щает гидролиз с 3'-конца.
По всей вероятности, репликация ДНК
идет с высокой точностью, так как спарива-
ние оснований проверяется дважды. В тех
случаях, когда пара оснований не вмещает-
ся в двойной спирали, полимеризация обы- Рис. 24.28. 3'—>5'-экзонуклеазная актив-
чно не идет. Однако, если на этом этапе ность ДНК-полимеразы I.
все-таки произойдет ошибка, она может
быть исправлена раньше, чем будет при-
соединен следующий нуклеотид. Таким
образом, ДНК-полимераза I проверяет ре-
зультат каждого проведенного акта поли-
меризации, прежде чем перейти к следую-
щему.
Кроме того, ДНК-полимераза I может
гидролизовать ДНК, начиная с 5'-конца це-
пи. Эта 5'—>3'-нуклеазная активность
(рис. 24.29) существенно отличается от об-
суждавшейся выше 3'—>5'-экзонуклеазной
активности. Во-первых, расщепляемая
связь должна находиться в двухспираль-
ном участке. Во-вторых, может происхо-
дить расщепление как концевой фосфодиэ-
фирной связи, так и связи, расположенной
на расстоянии нескольких нуклеотидов от
5'-конца (который может иметь свободную
или фосфорилированную гидроксильную
группу). В-третьих, 5'—>3'-нуклеазная ак-
тивность увеличивается, если одновремен-
но идет синтез ДНК. В-четвертых, ак- Рис. 24.29. 5'—>3'-нуклеазная активность
тивный участок 5'—>3'-нуклеазной актив- ДНК-полимеразы I.
ности четко отделен от активных участков
полимеризации и 3'—>5'-гидролиза. ДНК-
полимеразу I можно расщепить протеоли-
тическими ферментами на фрагмент с мас- различных фермента в одной полипептид-
сой 36 кДа, содержащий всю 5'—> ной цепи. 5'—>3'-нуклеаза дополняет 3'—>
—>3'-нуклеазную активность, и фрагмент —>5'-экзонуклеазную активность, исправляя
с массой 75 кДа, содержащий всю полиме- ошибки другого рода. Например, 5'—>
разную и всю 3'—>5'-экзонуклеазную ак- —>3'-нуклеаза участвует в вырезании пири-
тивности. Таким образом, ДНК-полимера-
24. ДНК: генетическая роль,
за I содержит по меньшей мере два
структура и репликация 25
Рис. 24.30. ДНК-лигаза катализирует со- фосфатной группы на 5'-конце другой. Об-
единение двух цепей ДНК, вхо- разование фосфодиэфирной связи между
дящих в состав одной двухспи- этими группами - эндергоническая реакция.
ральной молекулы. Следовательно, для реакции соединения це-
пей требуется источник энергии. У Е. coli
и других бактерий эту роль выполняет
N A D + , тогда как в клетках животных и за-
раженных бактериофагом клетках данная
реакция осуществляется за счет энергии
АТР.
Заслуживает внимания и еще один ас-
пект работы ДНК-лигазы: ДНК-лигаза не
может соединить две молекулы одноцепо-
чечной ДНК. Цепи ДНК, соединяемые
ДНК-лигазой, должны быть частью двух-
цепочечной молекулы ДНК. Исследования
модельных систем дают основание думать,
что ДНК-лигаза образует фосфодиэфир-
Рис. 24.31. Ковалентный промежуточный ную связь только в том случае, если вбли-
комплекс фермент—AMP. зи от места разрыва имеется хотя бы не-
сколько пар оснований. В действительно-
сти ДНК-лигаза заделывает одноцепо-
мидиновых димеров, образующихся при чечные разрывы в остове двухспиральной
облучении ДНК ультрафиолетом (разд. ДНК. Этот процесс необходим для нор-
24.24). Более того, 5'—>3'-нуклеазная ак- мального синтеза ДНК, для репарации по-
тивность играет ключевую роль в самой врежденной ДНК и для сращивания
репликации ДНК (разд. 24.19). (сплайсинга) цепей ДНК при генетической
рекомбинации.
24.15. ДНК-лигаза соединяет Рассмотрим механизм этой реакции,
фрагменты ДНК установленный Робертом Леманом (Robert
ДНК-полимераза I может присоединять Lehman). ATP или NAD + вступают в реак-
дезоксирибонуклеотиды к затравочной це- цию с ДНК-лигазой и образуют ковалент-
пи, но она не способна катализировать со- ный комплекс фермент-AMP, в котором
единение двух цепей ДНК или замыкание AMP связан с ε-аминогруппой лизинового
одной цепи ДНК. Обнаружение кольцевой остатка фермента фосфоамидной связью
ДНК указывало, что такой фермент дол- (рис. 24.31). Остаток AMP активирует фос-
жен существовать. В 1967 г. в нескольких фатную группу на 5'-конце ДНК. Послед-
лабораториях одновременно была открыта няя стадия - нуклеофильная атака активи-
ДНК-лигаза - фермент, катализирующий рованного атома фосфора 3'-ОН-группой.
образование фосфодиэфирной связи между В результате образуется фосфодиэфирная
двумя цепями ДНК (рис. 24.30). Фермент связь и освобождается AMP. Движущая
этот активен при наличии свободной сила этой последовательности реакций - ги-
ОН-группы на 3'-конце одной цепи ДНК и дролиз пирофосфата, отщепляющегося при
образовании комплекса фермент—адени-
Часть IV. лат. Таким образом, на образование фосфо-
26 Информация диэфирной связи в остове ДНК расходуют-
Рис. 24.32. Механизм реакции, катализи- теза ДНК нужна какая-то другая полимера-
руемой ДНК-лигазой. за, отличная от ДНК-полимеразы I.
Низкий фон активности полимеразы I
у мутанта polA 1 облегчил поиск новых
ся две богатые энергией фосфатные связи. ДНК-полимераз. Вскоре в нескольких лабо-
если источником энергии служит АТР. раториях были выделены и охарактеризо-
ваны два таких фермента. ДНК-полимеразы
24.16. Открытие ДНК-полимераз II и III II и III подобны полимеразе I в следующих
Мы видели, что ДНК-полимераза I может отношениях:
синтезировать и репарировать ДНК in vitro.
Выполняет ли она эти функции in vivo? Во- 1. Они катализируют направляемый ма-
прос вполне правомерный, так как фермент трицей синтез ДНК из предшественников
не всегда способен осуществлять in vivo ту дезоксирибонуклеозидтрифосфатов.
реакцию, которую он катализирует in vitro. 2. Для проявления их активности необхо-
Условия, существующие в клетке, могут от- дима затравка со свободной 3'-ОН-группой,
личаться от условий, используемых при по- 3. Синтез идет в направлении 5'—>3'.
становке опытов in vitro, и, кроме того, 4. Они обладают 3'—>5'-экзонуклеазной
в клетке могут присутствовать другие фер- активностью. ДНК-полимераза III (но не II)
менты. Действительно, в клетке E.coli является также 5'—>3'-нуклеазой.
имеются по меньшей мере две другие ДНК- Эти полимеразы различаются по характе-
полимеразы, названные полимеразами II ру предпочитаемых ими матриц. Для поли-
и III, которые были обнаружены примерно мераз II и III оптимальными матрицами
через 15 лет после открытия ДНК-полиме- служат двухцепочечные ДНК, имеющие ко-
разы I. Чем же объясняется такое запазды- роткие одноцепочечные пробелы. Полиме-
вание? Дело в том, что активность ДНК-по- раза I, наоборот, предпочитает протя-
лимераз II и III маскировалась высокой женные одноцепочечные участки, сосед-
активностью полимеразы I. ствующие с двухспиральными участками.
Ситуация изменилась в 1969 г., когда Пау- Максимальные скорости катализа in vitro
ла Де Лусия и Джон Кэрнс (Paula DeLucia, для этих ферментов также различаются: по-
John Cairns) выделили мутантную форму лимераза I присоединяет 10 нуклеотидов
E.coli, в экстракте которого обнаруживалось в секунду, а полимераза II - 0,5 и полимераза
от 0,5 до 1% нормальной полимеразной ак- III - 150 нуклеотидов в секунду. В физиоло-
тивности ДНК-полимеразы I по сравнению гически активном состоянии ДНК-полиме-
с обычными клетками. Этот мутант (обо- раза III ассоциирована с некоторыми други-
значенный polA 1) размножался с такой же ми белками. Этот мультисубъединичный
скоростью, как и родительский штамм. комплекс называют голоферментом ДНК-
Кроме того, многие фаги размножались полимеразы III.
в клетках polA 1 так же хорошо, как и в ро- Какова роль этих полимераз in vivo?
дительских клетках. Однако этот мутант го- Вскоре мы расскажем о том, что мультифер-
раздо быстрее погибал под действием уль- ментный комплекс, содержащий ДНК-поли-
трафиолетового облучения. К тому же меразу III, синтезирует большую часть но-
мутант polA 1 был более чувствителен к ле- вообразующейся ДНК, а ДНК-полимераза
тальному действию химического мутагена I удаляет затравку и заполняет пробелы.
метилметансульфоната. Де Лусия и Кэрнс Роль ДНК-полимеразы II пока не устано-
сделали вывод, что репликация ДНК в клет- влена. Проведенные в последнее время био-
ках полученного ими мутанта polA 1 идет
нормально, но репарация ДНК существенно 24. ДНК: генетическая роль,
нарушена. Они предположили, что для син- структура и репликация 27
Рис. 24.33. Положение структурных генов
трех ДНК-полимераз Е. coli.
Ген ДНК-полимеразы I распо-
ложен в локусе polA, ген ДНК-
полимеразы II - в локусе polB
и ген ДНК-полимеразы III - в
локусе dnaE.

химические и генетические исследования по-


казали, что, кроме ДНК-полимераз I и II
и ДНК-лигазы, для репликации ДНК в клет-
ке E.coli необходимо более 10 белков. Пре-
жде чем рассмотреть взаимодействие этих
белков с ДНК, познакомимся в общих чер-
тах с репликацией на уровне целой хромо-
сомы.

24.17. Расплетание родительской ДНК


и синтез новой ДНК происходят
в репликационной вилке
Изображения ДНК во время репликации
были получены с помощью радиоавтогра-
фии и электронной микроскопии. При ра-
диоавтографии изображение образуется
в результате распада подходящего изотопа,
например трития. Испускаемые электроны
взаимодействуют с гранулами серебра фо-
тографической эмульсии. После проявления
пленки возникают черные точки. Метод ра-
диоавтографии имеет довольно низкую раз- Рис. 24.34. Радиоавтограф реплицирую-
решающую способность - порядка несколь- щейся ДНК Е. coli. (Печатается
ких сотен ангстрем. Однако у этого метода с любезного разрешения д-ра
есть определенное преимущество: он позво- John Gairns.)
ляет видеть лишь те молекулы, которые со-
держат метку. Для того чтобы сделать ДНК
видимой при радиоавтографии, в нее вклю- На радиоавтографах и электронных ми-
чают тимин или тимидин, меченный три- крофотографиях видно, что реплицирую-
тием. щаяся ДНК E.coli имеет форму замкнутого
кольца с внутренней петлей (рис. 24.34). Мо-
Часть IV. лекулы такой формы называют тета-струк-
28 Информация турами, так как они напоминают греческую
букву θ (рис. 24.35). Тета-структуры показы-
вают, что молекулы ДНК сохраняют во вре-
мя репликации кольцевую форму. Разреше-
ние этого метода недостаточно велико,
чтобы различить свободные концы. Однако
очевидно, что длинных нитей одноцепочеч-
ной ДНК в молекуле нет. Таким образом,
эти изображения позволяют отвергнуть ме-
ханизм репликации, согласно которому це-
пи родительской ДНК сначала полностью Рис. 24.35. Схематическое изображение
раскручиваются, и только затем исполь- кольцевой хромосомы Е. coli во
зуются в качестве матриц при синтезе новой время репликации. Синими
ДНК. Напротив, синтез новой ДНК сопря- линиями в этой тета-структуре
жен с одновременным раскручиванием роди- показана родительская ДНК,
тельской ДНК. Участок, где происходит красными - новообразованная
одновременное расплетание и синтез, назы- ДНК.
вается репликационной вилкой.

24.18. Репликация ДНК начинается в строго


определенном месте и продолжается
последовательно в обоих направлениях
Начинается ли репликация ДНК E.coli
в произвольном месте хромосомы, или же
в хромосоме имеется определенный участок
инициации? Репликация ДНК - строго регу-
лируемый процесс, поэтому a priori кажет-
ся гораздо более вероятным, что она на-
чинается в определенном месте. Действи-
тельно, как показали работы по определе-
нию относительного числа различных генов
в условиях быстрого синтеза ДНК, реплика-
ция в клетках E.coli начинается в одном
определенном месте хромосомы. Рассмо-
трим два гена - а и b. Предположим, что ген
а расположен вблизи от точки начала репли-
кации, а ген b - вблизи от конца. Тогда ген
а будет реплицироваться намного раньше,
чем ген b. В быстро растущей культуре на
один ген b будет приходиться примерно два
гена а. Если же, наоборот, репликация ДНК
начинается в случайной точке, количество
генов а и b будет одинаковым. Относитель-
ное число генов было определено с по-
мощью метода гибридизации, который рас-
сматривается ниже (разд. 25.5). Результаты Рис. 24.36. Относительные количества
этих экспериментов ясно показали, что от- различных генов в условиях
носительное число генов действительно за- быстрого синтеза ДНК у Е. coli
висит от их положения на карте (рис. 24.36). в зависимости от их положения
Эти данные позволили сделать следующие на генетической карте.
выводы.
1. Репликация начинается в строго опре-
деленном уникальном участке - вблизи гена
ilv, локализованного на 74' на стандартной
генетической карте E.coli.
2. Репликация идет одновременно в обо- 24. ДНК: генетическая роль,
их направлениях с примерно одинаковой структура и репликация 29
скоростью. Другими словами, существуют
две репликационные вилки: одна движется по
часовой стрелке, другая - против часовой
стрелки.
3. Две репликационные вилки встречают-
ся вблизи маркера trp (25' на генетической
карте) - в точке, почти диаметрально проти-
воположной началу репликации.
Еще одно доказательство двунаправлен-
ности репликации ДНК у E.coli было полу- Рис. 24.37. Предполагаемые результаты
чено методом радиоавтографии. Для этого радиоавтографии в случае
вначале репликацию проводили в среде, со- одно- и двунаправленной ре-
державшей тимин, меченный тритием до пликации, если бактерий пере-
умеренной удельной радиоактивности. Че- носят со среды, содержащей ти-
рез несколько минут инкубации бактерии мин с умеренной радиоактив-
перенесли в среду, содержавшую высокоме- ностью, на среду с высокора-
ченный тритием радиоактивный тимин. диоактивным тимином.
Пробы с двумя различными уровнями ра-
диоактивности использовались для того,
чтобы получить на радиоавтографах два ти-
па цепочек зерен серебра: цепочки с низкой
плотностью зерен, соответствующие ДНК,
синтезированной вначале, и цепочки с высо-
кой плотностью, соответствующие ДНК,
синтезированной позже. Если бы реплика-
ция шла в одном направлении, были бы
видны цепочки с высокой плотностью зерен Рис. 24.38. Радиоавтограф ДНК Е. coli во
на одном конце и низкой плотностью на время репликации (условия
другом. Если же репликация идет в двух на- опыта указаны в подписи
правлениях, середина каждого отпечатка к рис. 24.37). Наблюдаемое
ДНК должна была бы иметь низкую плот- распределение зерен серебра
ность зерна, а концы - высокую (рис. 24.37). показывает, что репликация
Радиоавтографы дали наглядный ответ идет в двух направлениях.
(рис. 24.38). Цепочки зерен серебра (отпечат- [Prescott D. M., Kuempel P.L.,
ки ДНК) во всех случаях имели более высо- Proc. Nat. Acad. Sci, 69, 2842
кую плотность зерен на обоих концах, чем (1972).]
посередине, указывая тем самым, что репли-
кация хромосомы E.coli идет в двух напра-
влениях.

24.19. Одна цепь ДНК синтезируется


прерывисто
Вернемся к взаимодействию молекул при
репликации. В области репликационной
вилки обе цепи родительской ДНК служат
матрицами для синтеза новой ДНК. Напом-
ним, что цепи родительской ДНК антипа-
раллельны. Следовательно, общее направле-
ние синтеза ДНК должно быть 5'—>3' для Рис. 24.39. При низком разрешении кажу-
одной из дочерних цепей и 3'—>5' для другой щееся направление репликации
(рис. 24.39). Однако все известные ДНК-по- ДНК будет 5'—>3' для одной
лимеразы синтезируют ДНК в направлении дочерней цепи и 3'—>5' для
5'—>3', а не 3'—>5'. Как же тогда происходит другой. На самом деле обе цепи
синтезируются в направлении
Часть IV. 5'—>3', как показано на
30 Информация рис. 24.40.
кажущийся (при низкой разрешающей спо-
собности метода) рост одной из дочерних
цепей в направлении 3'—>5'?
Проблема была решена Рейдзи Оказаки
(Reiji Okazaki), который обнаружил, что зна-
чительная часть новосинтезированной
ДНК существует в виде коротких фрагмен-
тов. Такие фрагменты длиной около 1000
нуклеотидов (они называются фрагментами
Оказаки) существуют в течение непродол-
жительного времени в непосредственной
близости от репликационной вилки. По ме-
ре прохождения репликации эти фрагменты
соединяются друг с другом ковалентно под Рис. 24.40. Схематическое изображение
действием ДНК-лигазы и образуют одну из репликационной вилки. Обе це-
дочерних цепей (рис. 24.40). Другая новая пи ДНК синтезируются в на-
цепь синтезируется непрерывно или почти правлении 5'—>3'. Ведущая
непрерывно. Та цепь, которая образуется из цепь синтезируется непрерыв-
фрагментов Оказаки, называется отстаю- но, а отстающая - в виде корот-
щей цепью, а та, что синтезируется без раз- ких фрагментов (фрагменты
рывов или почти без разрывов,- ведущей Оказаки).
цепью. И фрагменты Оказаки, и ведущая
цепь синтезируются в направлении 5'—>3'.
Прерывистая сборка отстающей цепи позво-
ляет путем полимеризации в направлении
5'—>3' на атомном уровне получать общий
рост цепи в направлении 3'—>5'.

24.20. Затравкой синтеза ДНК служит


РНК
Как начинается синтез ДНК? Напомним,
что всем ДНК-полимеразам для иницииро-
вания синтеза ДНК необходима затравка со
свободной 3'-ОН-группой. Что служит за-
травкой при синтезе ведущей цепи и фраг-
ментов Оказаки? Важным толчком к реше-
нию этого вопроса послужило наблюдение,
что для инициации синтеза ДНК необходим
синтез РНК. На основе этого открытия бы-
ло высказано предположение, что РНК, оче-
видно, служит затравкой в синтезе ДНК, так
как уже было известно, что РНК-полиме-
разы способны начинать синтез цепей de
novo. Затем было показано, что новообра- Рис. 24.41. Инициация синтеза ДНК.
зующаяся ДНК ковалентно связана с ко- А - праймаза синтезирует ко-
ротким фрагментом РНК, который и слу- роткую комплементарную
жит затравкой. Итак, РНК-затравка цепь РНК; Б - эта РНК служит
в синтезе ДНК. затравкой для синтеза новой
По всей вероятности, репликация ДНК ДНК; В - РНК, входящая в со-
в клетке E.coli происходит, как показано на став новообразованной цепи,
рис. 24.41. гидролизуется, при этом обра-
1. Особая РНК-полимераза (ее называют зуется брешь, которая впослед-
праймаза) синтезирует короткую цепь РНК ствии заполняется.
(примерно 10 нуклеотидов), комплементар-
ную одной из цепей ДНК-матрицы. В отли- 24. ДНК: генетическая роль,
чие от ДНК-полимеразы праймаза не ну- структура и репликация 31
Рис. 24.42. Электронная микрофотогра- на для синтеза ДНК на одноцепочечной ма-
фия хромосомы Е. coli, прикре- трице, заполняет эти бреши.
пленной к двум фрагментам Последние исследования показали, что
клеточной мембраны. На ри- действию праймазы предшествует образо-
сунке изображена одна интакт- вание предзатравочного промежуточного
ная суперспирализованная мо- комплекса, состоящего как минимум из пяти
лекула ДНК. [Delius H., белков. Один из них - белок dnaB - может
Worcel A., J. Mol. Biol., 82, 108 передвигаться вдоль ДНК, используя энер-
(1974).] гию гидролиза АТР. Белок dnaB может слу-
жить сигналом для активации праймазы.
Специфичность инициации очередного ци-
кла репликации может обеспечиваться бел-
ждается в затравке для синтеза полинуклео- ками, доставляющими белок dnaB точно
тида. в область гена ilv, где находится точка нача-
2. 3'-гидроксильная группа концевого ри- ла репликации хромосомы E.coli. Время на-
бонуклеотида этой цепи РНК служит за- чала репликации ДНК имеет критическое
травкой для синтеза ДНК под действием го- значение, поскольку оно должно быть
лофермента ДНК-полимеразы III. Большая скоординировано с делением клетки. И дей-
часть новообразованной ДНК синтезирует- ствительно, бактериальная хромосома ассо-
ся этим мультисубъединичным комплексом. циирована с впячиванием клеточной мем-
3. РНК-компонент этого РНК-ДНК-ги- браны (рис. 24.42).
брида гидролизуется под действием ДНК-
полимеразы I. 24.21. Энергия гидролиза АТР используется
4. После удаления РНК из новообразо- для расплетания родительской ДНК
ванных цепей между фрагментами ДНК в области репликационной вилки
остаются довольно обширные бреши. ДНК- под действием белка rep
полимераза I, которая хорошо приспособле- В 1953 г. Уотсон и Крик отмечали, что «рас-
крутить спираль - задача труднопреодоли-
Часть IV. мая». Исследования, проведенные в послед-
32 Информация нее время, показали, что в клетке E.coli
вают также белками, дестабилизирующими
спираль (белки ДС), или плавящими белка-
ми.
24.22. ДНК-гираза вводит отрицательные
супервитки в родительскую ДНК, чтобы
облегчить ее расплетание
При расплетании ковалентно замкнутой
кольцевой молекулы ДНК возникают топо-
логические проблемы, так как расплетание
двойной спирали вызывает образование по-
ложительных супервитков в замкнутой мо-
лекуле. В области репликационной вилки
родительская ДНК вращается со скоростью
100 об/с - более чем в 100 раз быстрее, чем
обычная долгоиграющая пластинка. Чтобы
процесс расплетания продолжался, необхо-
димо снять эти положительные супервитки,
образовавшиеся в результате вращения.
Другими словами, необходимо наличие ка-
кого-то молекулярного шарнира. Недавно
Мартин Геллерт (Martin Gellert) установил,
что эту функцию выполняет ДНК-гираза.
Эта топоизомераза удаляет положи-
тельные супервитки, внося одноцепочечные
разрывы и затем заделывая фосфодиэфирные
связи в остове ДНК. АТР не требуется для
такой термодинамически выгодной релакса-
ции третичной структуры ДНК. Более того,
ДНК-гираза может активно вводить отри-
цательные супервитки в ковалентно замкну-
тую кольцевую ДНК за счет энергии гидро-
лиза АТР (рис. 24.43). Эти отрицательные
супервитки способствуют расхождению це-
пей родительской ДНК в области реплика-
Рис. 24.43. Каталитические активности ционной вилки 1 .
ДНК-гиразы.

24.23. Сложность аппарата репликации,


по-видимому, необходима для обеспечения
в области репликационной вилки происхо- очень высокой надежности
дит активное расплетание родительской Существующие представления о молекуляр-
двойной спирали под действием фермента — ном механизме репликации ДНК у E.coli
белка rep. Поскольку энергия для расплета-
ния родительской ДНК высвобождается 1
В этой главе автор называет ДНК-гиразой
при гидролизе АТР, белок гер называют хе- два совершенно различных фермента. Один из
ликазой. На разделение каждой пары осно- них - ДНК-гираза, способная вводить в ДНК
ваний затрачиваются примерно две моле- термодинамически невыгодные отрицательные
супервитки за счет энергии гидролиза АТР; дру-
кулы АТР. Затем каждая из разделенных гой - независимая от АТР ДНК-топоизомераза,
цепей родительской ДНК взаимодействует приводящая кольцевую молекулу ДНК в тер-
с несколькими молекулами белка, связываю- модинамически равновесное (релаксированное)
щегося с одноцепочечной ДНК (ОЦ-связы- состояние. Это два совершенно различных бел-
ка: у них различные ингибиторы, потребности
вающий белок). Роль ОЦ-связывающего в ионных условиях среды, механизм действия.
белка - стабилизировать одноцепочечные В репликации в качестве молекулярного шарни-
участки ДНК, образовавшиеся под дей- ра участвует ДНК-гираза.- Прим. перев.
ствием хеликазы, чтобы расплетенная
область могла функционировать в качестве 24. ДНК: генетическая роль,
матрицы. ОЦ-связывающие белки назы- структура к репликация 33
Рис. 24.44. Схематическое изображение предыдущую пару оснований. Частота оши-
ферментативных процессов бок для них на несколько порядков вели-
в области репликационной вил- чины выше, чем для ДНК-полимераз. Было
ки Е. coli. Фрагменты, отме- найдено остроумное решение этой про-
ченные синим цветом, катали- блемы: начинать синтез ДНК с полинуклео-
зируют инициацию, элонгацию тида, синтезируемого с низкой надеж-
и сшивание (с помощью ДНК- ностью, но отмечать его «временный»
лигазы) цепей ДНК. (Коrn- характер, включив в его состав рибонуклео-
berg A., DNA replication,
W.H. Freeman and Co., 1980.) Таблица 24.2. Белки репликации Е. coli

Белок Функция Масса, Число


представлены на рис. 24.44 и в табл. 24.2.
кДа моле-
Поражает сложность взаимодействий мно- кул в
жества белков, участвующих в этом процес- клетке
се. Генетический анализ показывает, что
в репликации ДНК непосредственно уча- dna В Дает возможность ~250 20
ствует не менее 15 белков. Почему механизм праймазе иницииро-
репликации ДНК столь сложен? В частно- вать синтез РНК
сти, почему синтез ДНК начинается с РНК- Праймаза Синтезирует РНК-за- 60 100
затравки, которая затем удаляется? Если бы травки
ДНК-полимеразы могли начинать синтез rер Расплетает двойную 65 50
цепей de novo, в РНК-затравке не было бы спираль
надобности. Однако такая способность бы- ДНК-связы- Стабилизирует одно- 74 300
ла бы несовместима с чрезвычайно высокой вающий цепочечные участки
точностью ДНК-полимераз. Напомним, что ДНК-гираза Вводит суперспираль- 400
ДНК-полимеразы, прежде чем образовать ные витки
новую фосфодиэфирную связь, проверяют Голофермент Синтезирует ДНК 20
>300
правильность предшествующей пары осно- ДНК-полиме-
ваний. Эта функция редактирования суще- разы III
ственно снижает частоту ошибок. РНК-по-
ДНК-полиме- Удаляет затравку и 109 300
лимеразы, напротив, могут начинать синтез раза I заполняет бреши
цепей de novo, так как они не проверяют
ДНК-лигаза Соединяет концы 74 300
Часть IV. ДНК

34 Информация
тиды. Затем ДНК-полимераза I вырезает
эти короткие последовательности РНК-за-
травок и замещает их последовательностью
ДНК, синтезированной с высокой надеж-
ностью. Создается впечатление, что многие
детали, усложняющие механизм реплика-
ции ДНК, предназначены для обеспечения
чрезвычайно высокой точности. Генетиче-
ский анализ показывает, что частота оши-
9 10
бок составляет одну на 10 -10 считанных
пар оснований.
Рис. 24.45. Модель димера урацила, обра-
24.24. Повреждения ДНК постоянно зованного под действием уль-
репарируются трафиолетового облучения.
Поскольку множество химических и физиче- Тиминовый димер имеет при-
ских агентов вызывает в ДНК повреждения, мерно такую же структуру.
во всех клетках имеются специальные меха-
низмы для исправления этих повреждений.
Основания в ДНК могут изменяться и те- ждения и вносит одноцепочечный разрыв
ряться, фосфодиэфирные связи остова мо- вблизи от димера, обычно с 5'-стороны.
гут разрываться, а две цепи могут попереч- Участок, содержащий димер, выпячивается
но сшиваться друг с другом. Эти поврежде- из двойной спирали, что позволяет ДНК-по-
ния образуются под действием ионизирую- лимеразе I (или другой подобной полимера-
щей радиации, ультрафиолетового облуче- зе) провести репарационный синтез в напра-
ния и различных химических веществ. влении 5'—>3'. Затравкой при этом служит
Многие повреждения в ДНК поддаются ис- 3'-конец разорванной цепи, а матрицей - ин-
правлению, так как генетическая информа- тактная комплементарная цепь. Затем
ция записана в обеих цепях двойной спира- область, где расположен пиримидиновый
ли. Благодаря этому информацию, утрачен- димер, вырезается под действием 5'—>
ную одной из цепей, можно извлечь из —>3'-нуклеазной активности ДНК-полиме-
другой цепи. разы. Наконец, новосинтезированная цепь
Один из наиболее хорошо изученных ме- и остаток той же цепи ДНК соединяются
ханизмов репарации - вырезание пиримиди- ДНК-лигазой. Другой путь репарации-фо-
нового димера (рис. 24.45), который обра- тохимическое расщепление пиримидиново-
зуется при действии на ДНК ультрафиоле- го димера. Почти все клетки содержат фо-
тового света. Соседние пиримидиновые тореактивирующий фермент, который уз-
остатки в одной цепи ДНК могут в этих ус- нает димер и расщепляет его на исходные
ловиях образовать ковалентную сшивку. основания, используя энергию поглощенно-
Такой пиримидиновый димер не уклады- го синего света.
вается в двойную спираль, так что реплика-
ция и экспрессия генов оказываются блоки-
24.25. Рак кожи при золотистой ксеродерме
рованными до тех пор, пока повреждение не обусловлен нарушением нормальной
будет удалено.
репарации ДНК
В осуществлении этого процесса важную
Золотистая ксеродерма (Xeroderma
роль играют четыре ферментативные актив-
pigmentosum) - редкое заболевание кожи
ности (рис. 24.46). Первая из них - УФ-специ-
у людей. Оно наследуется как аутосомный
фичная эндонуклеаза - находит место повре- рецессивный признак. У гомозиготных
больных кожа крайне чувствительна к сол-
нечному и ультрафиолетовому свету. Серь-
езные поражения кожи наблюдаются уже
в детстве, а с возрастом они принимают все
более тяжелый характер. Кожа становится
сухой, и дерма в значительной степени атро-

24. ДНК: генетическая роль,


структура и репликация 35
Ксеродерма -
от греч. слов, означающих «сухая кожа». Этот термин был впервые использован
F. Hebra и М. Kaposi в 1874 г. для описания «пергаментной кожи» и аномаль-
ной пигментации, наблюдавшихся у одного из больных.

фируется. Появляются кератозы, веки по- Дезаминирование цитозина является потен-


крываются рубцами, поражается роговица. циально мутагенным, так как образующий-
Обычно во многих местах возникает рак ко- ся урацил спаривается с аденином, и, следо-
жи. Многие больные погибают, не достиг- вательно, одна из дочерних цепей будет
нув 30 лет, от метастазов этих злокаче- содержать AU-пару оснований вместо ис-
ственных опухолей кожи. ходной GC-пары:
В ДНК человека, как и у E.coli, под дей-
ствием ультрафиолетового света образуют-
ся пиримидиновые димеры. Более того, ме-
ханизмы репарации у человека и у E.coli,
по-видимому, сходны. Изучение фибробла-
стов кожи больных золотистой ксеродер-
мой показало, что одна из форм этой болез-
ни сопровождается биохимическим наруше-
нием. В нормальных фибробластах поло-
вина пиримидиновых димеров, образовав- Эта мутация исправляется под действием
шихся под действием ультрафиолетового репарационной системы, узнающей чуже-
облучения, вырезается менее чем за сутки. родный урацил в молекуле ДНК
В фибробластах же, полученных от больных (рис. 24.47). Прежде всего урацил-
золотистой ксеродермой, за тот же проме- ДНК—гликозидаза гидролизует гликозид-
жуток времени вырезания димеров почти не ную связь остатка урацила с дезоксирибо-
наблюдается. Какой этап репарации нару- зой. На этом этапе остов ДНК остается
шен? Ответ был получен путем определения интактным, но одно основание отсутствует.
молекулярной массы цепей ДНК из фибро- Затем специфическая эндонуклеаза узнает
бластов, облученных ультрафиолетовым этот дефект и расщепляет остов рядом с от-
светом. В нормальных клетках в течение не- сутствующим основанием. ДНК-полимера-
скольких часов после облучения происходит за I вырезает оставшийся дезоксирибозо-
заметное снижение молекулярной массы фосфат и вставляет цитозин, комплемен-
одноцепочечной ДНК. Это снижение моле- тарный гуанину в неповрежденной цепи.
кулярной массы обусловлено первой реак- Наконец, репарированная цепь заделывает-
цией процесса репарации, а именно расще- ся ДНК-лигазой.
плением цепи ДНК рядом с пиримиди- В течение многих лет оставалось загад-
новым димером. После УФ-облучения кле- кой, почему в ДНК присутствует тимин, а не
ток золотистой ксеродермы, наоборот, сни- урацил, ведь оба основания спариваются
жения молекулярной массы не происходит. с аденином. Единственное различие между
Следовательно, это кожное заболевание, ними - метильная группа тимина на месте
возможно, вызвано инактивацией эндону- атома водорода при С-5 в урациле. Почему
клеазы, которая гидролизует остов ДНК ря- это метилированное основание использует-
дом с пиримидиновым димером. Тяжелые ся в ДНК, но не в РНК? Напомним, что на
клинические последствия этого фермента- метилирование дезоксиуридилата с образо-
тивного нарушения свидетельствуют об ис- ванием дезокситимидилата расходуется
ключительной важности процессов репара- много энергии (разд. 22.16). Открытие срав-
ции ДНК. нительно недавно активной системы, репа-
рируюшей дезаминирование цитозина, слу-
24.26. ДНК содержит тимин вместо урацила, жит убедительным ответом на эту загадку.
что делает возможной репарацию Урацил-ДНК—гликозидаза не удаляет
дезаминированного цитозина тимина из ДНК. Таким образом, метильная
Цитозин в ДНК спонтанно дезаминируется группа тимина служит меткой, позволяю-
с измеримой скоростью, образуя урацил. щей отличать его от дезаминированного ци-
тозина. Если бы этой метки не было, ура-
Часть IV. цил, стоящий на правильном месте, было бы
36 Информация невозможно отличить от урацила, образо-
24.27. Рестриктирующие эндонуклеазы
совершили переворот в анализе ДНК
Ферменты рестрикции - эндонуклеазы, спо-
собные узнавать определенные последова-
тельности оснований в двухспиральной
ДНК и расщеплять обе цепи. Эти исключи-
тельно тонкие скальпели - великолепный
подарок природы биохимикам. Существо-
вание ферментов рестрикции позволило
проводить эксперименты, о которых нельзя
было даже и мечтать всего лишь несколько
лет назад. Они представляют собой незаме-
нимые инструменты для исследования

Рис. 24.46. Репарация участка ДНК, со-


держащего тиминовый димер,
в результате последовательно-
го действия специфической эн-
донуклеазы, ДНК-полимеразы
и ДНК-лигазы. Тиминовый ди-
мер показан синим цветом,
а новосинтезированный уча-
сток ДНК - красным. [На-
nawalt P.C, Endeavor, 31, 83
(1972).]

вавшегося в результате дезаминирования.


Дефект остался бы незамеченным, и в одной
из дочерних молекул ДНК неизбежно про-
изошло бы мутационное замещение одной
GC-пары на AU-пapy. Система репарации,
которая выискивает урацилы и оставляет
тимины, подавляет такие мутации. По всей
вероятности, тимин используется в ДНК
вместо урацила для увеличения надежности Рис. 24.47. Остатки уранила в ДНК выре-
генетической информации. В противопо- заются и замещаются цитози-
ложность этому РНК не репарируется, и ном - исходным основанием.
в ней используется урацил, так как он пред-
ставляет собой менее дорогой строи- 24. ДНК: генетическая роль,
тельный блок. структура и репликация 37
Палиндром (перевертыш) -
слово, предложение или стих, которые читаются одинаково слева направо
и справа налево.
Примеры:
Радар
То не ясли ломал, а молился енот.
А роза упала на лапу Азора.
Нажал кабан на баклажан.
Roma tibi subito motibus ibit amor.
Происходит от греческого слова palindromos - бегу назад.
структуры хромосомы, определения после- В каждой цепи эта эндонуклеаза рвет фос-
довательности нуклеотидов в очень фодиэфирную связь между G и С, дисталь-
длинных молекулах ДНК, выделения генов ную по отношению к оси симметрии. К на-
и получения новых молекул ДНК для кло- стоящему времени очищено и охарактеризо-
нирования. Разработку всех этих методов вано более 80 ферментов рестрикции. Их
начали Вернер Арбер, Гамилтон Смит и Дэ- названия состоят из сокращенного до трех
ниел Натанс (Werner Arber, Hamilton Smith, букв названия микроорганизма (например,
Daniel Nathans). Есо от E.coli, Hin от Haemophilus influenzae,
Рестриктирующие эндонуклеазы обнару- Нае от H.aeguptins), обозначения штамма
живаются у самых различных прокариот. и римской цифры. Специфичность неко-
Биологическая роль этих ферментов со- торых ферментов показана на рис. 24.48.
стоит в том, чтобы расщеплять чужеродные Обратите внимание, что производимые в
молекулы ДНК. Собственная клеточная двух цепях разрывы могут быть распо-
ДНК при этом не расщепляется, так как ложены либо со сдвигом относительно
участки, узнаваемые своими ферментами друг друга, либо строго против друг
рестрикции, у нее метилированы. Взаимос- друга.
вязь между ресткрикцией и модификацией Ферменты рестрикции используются для
рассматривается в гл. 30 (разд. 30.9). Важ- расщепления молекул ДНК на опреде-
ное значение имеет тот факт, что многие ленные фрагменты, которые более удобны
ферменты рестрикции узнают специфиче- для анализа и манипулирования, чем ис-
ские последовательности ДНК длиной от ходная молекула. Например, EcoRI расще-
четырех до шести пар оснований и гидроли- пляет кольцевую двухцепочечную ДНК ви-
зуют фосфодиэфирные связи в обеих цепях руса SV-40 длиной 5,1 kb только в одном
в этой области. Удивительная особенность месте, Нра - в четырех местах и Hind - в 11
таких участков расщепления - их симметрия местах. Кусок ДНК, образованный одним
относительно оси вращения второго поряд- ферментом рестрикции, можно специфиче-
ка. Другими словами, узнаваемая последо- ски расщепить на более мелкие фрагменты
вательность пар оснований представляет со- с помощью другого фермента. Используя
бой палиндром. несколько ферментов рестрикции, можно
Расщепляемые участки расположены сим- картировать хромосомы (разд. 31.8). Более
метрично относительно оси второго поряд- того, набор фрагментов, полученных с по-
ка. Например, фермент рестрикции из мощью ферментов рестрикции, может слу-
Streptomyces achromogenes узнает последова- жить своего рода «отпечатком пальца»
тельность для соответствующей молекулы ДНК. Не-
большие различия между сходными моле-
кулами ДНК можно легко выявить с по-
мощью электрофоретического разделения
их рестрикционных фрагментов. Для каж-
дого данного геля электрофоретическая
подвижность фрагмента ДНК обратно
пропорциональна логарифму числа пар ос-
нований (до определенного предела длины
фрагментов). Для разделения фрагментов
Часть IV.
ДНК длиной до 1000 пар оснований ис-
38 Информация
пользуют полиакриламидный гель, а для
24.28. Последовательность нуклеотидов
в ДНК можно быстро определить
с помощью специфического химического
расщепления
Появление надежных методов определения
последовательности нуклеотидов в моле-
кулы ДНК облегчило также изучение
структуры ДНК и ее связи с экспрессией
гена. Метод химического расщепления, раз-
работанный Алланом Максамом и Уолте-
ром Гилбертом (Allan Maxam, Walter
Gilbert), основан на использовании ДНК,
меченной 32 Р по одному из концов одной
из цепей. Для введения 32 Р в 5'-гидро-
ксильный конец обычно используют поли-
нуклеотидкиназу. Меченую ДНК расщеп-
ляют предпочтительно по одному из четы-
рех нуклеотидов. Условия реакции подби-
рают таким образом, чтобы на каждую
цепь приходился в среднем один разрыв.

Рис. 24.48. Специфичность некоторых эн-


донуклеаз рестрикции. После-
довательности пар оснований,
узнаваемые этими фермента-
ми, имеют ось симметрии вто-
рого порядка. Две цепи ДНК
в этой области симметричны
относительно оси, обозначен-
ной зеленым овалом. (Одна
цепь сдвинута относительно
другой на 180°.) Места расще-
пления показаны красными
стрелками. Сокращенные на-
звания каждого фермента ре-
стрикции приведены справа от
последовательности, которую
он узнает.

разделения более длинных молекул более Рис. 24.49. Электрофоретическое разделе-


пористый агарозный гель. Если ДНК со- ние фрагментов, образующих-
держит радиоактивную метку, полосы ся при расщеплении ДНК
можно выявить методом радиоавтографии. SV-40 тремя различными фер-
В другом случае гель можно покрасить ментами рестрикции. Эти
бромистым этидием, который при связыва- фрагменты флуоресцируют
нии с двухспиральной ДНК флуоресцирует благодаря тому, что гель окра-
ярким оранжевым светом. При использо- шен бромистым этидием. (Пе-
вании этого способа можно легко увидеть чатается с любезного разреше-
полосу, содержащую 50 нг ДНК ния д-ра Jeffrey Sklar.)
(рис. 24.49). Помимо чувствительности,
важное достоинство таких гелей - их высо- 24. ДНК: генетическая роль,
кая разрешающая способность. структура и репликация 39
Частичное расщепление по каждому осно- В результате основание отделяется от со-
ванию дает набор радиоактивных фраг- ответствующего остатка сахара. Затем
32
ментов, начинающихся Р-меткой и кон- смесь нагревают в щелочи, что вызывает
чающихся одним из положений этого расщепление сахарофосфатного остова
основания. Например, если исследуемая ДНК и удаление остатка сахара. В резуль-
ДНК имеет последовательность тате образуются фрагменты, несущие на
конце метку. Эти фрагменты разделяют
в полиакриламидном геле и на радиоавто-
32
5'- P-GCTACGTA-3' графе получают картину полосы различ-
ной интенсивности. Темные полосы со-
ответствуют фрагментам, образовавшимся
при расщеплении по гуанину, так как гуа-
то в результате специфического расщепле-
нин метилируется гораздо быстрее, чем
ния с 5'-стороны каждого из четырех осно-
аденин. В то же время гликозидная связь
ваний получатся следующие радиоак-
в метилированном аденозине менее ста-
тивные фрагменты:
бильна, чем в метилированном гуанозине.
Поэтому при обработке разбавленной кис-
лотой после метилирования происходит
предпочтительное выщепление аденина
(получается дорожка А + G). Сравнение до-
рожки А + G с параллельной дорожкой
G на том же геле показывает, происходит
ли расщепление по А или по G (рис. 24.52).
Расщепление по цитозину и тимину прово-
дят гидразином. Остов затем расщепляют
Затем эти фрагменты разделяют методом
электрофореза в полиакриламидном геле,
который дает возможность разделять мо-
лекулы ДНК, различающиеся по длине
всего лишь на один нуклеотид. Следую-
щий этап - радиоавтография этого геля.
Как показано на рис. 24.50, самая нижняя
полоса расположена на дорожке, соответ-
ствующей расщеплению по С, следую-
щая - на дорожке Т, затем еще одна - на
дорожке А. Следовательно, последователь-
ность первых трех нуклеотидов имеет вид
5'-СТА-3'. Если прочитать все семь полос
снизу вверх, получится последовательность
5'-CTACGTA-3'. Итак, радиоавтограф геля,
полученного после четырех различных реак-
ций химического расщепления, дает набор
полос, по которым можно непосредственно
прочитать нужную последовательность.
Как достигается специфическое расще- Рис. 24.50. Схематическое изображение
пление ДНК? Для этого используют со- геля, на котором показаны ра-
единения, которые способны модифициро- диоактивные фрагменты, обра-
вать основание и затем отщеплять его от зовавшиеся при специфиче-
остатка сахара (рис. 24.51). Пурины моди- ском расщеплении последова-
фицируют диметилсульфатом, метилирую- тельности 5'-32P-GCTACGTA-
щим гуанин по N-7 и аденин по N-3. Рас- 3' по каждому из четырех осно-
щепление гликозидной связи метилирован- ваний (дорожки A, G, С и Т).
ного пурина легко достигается нагрева- Слева указано число нуклеоти-
нием при нейтральном значении рН. дов (n) в каждом фрагменте.
Последовательность основа-
Часть IV. ний читается непосредственно
40 Информация с геля снизу вверх.
24.29. Полная последовательность
оснований ДНК фага φХ174 была
определена с помощью метода
ферментативной репликации
Другой метод определения последователь-
ности оснований в ДНК основан на обра-
зовании меченых фрагментов с помощью
контролируемого прерывания фермента-
тивной репликации in vitro. Этот метод
разработали Фред Сэнгер (Fred Sanger)
и его сотрудники. Для считывания опреде-
ленной последовательности с одноцепочеч-
ной ДНК используют ДНК-полимеразу

Рис. 24.51. Стратегия метода определения


последовательности нуклеоти-
дов в ДНК с помощью химиче-
ского расщепления.

пиперидином, который вытесняет продукты


реакции с гидразином и катализирует
элиминацию фосфатов. В результате рас-
щепления по цитозинам и тиминам полу-
чают серию полос примерно равной интен-
сивности (дорожка С + Т). Эти пирими-
дины различают, проводя гидразинолиз
в присутствии 2 М NaCl, подавляющим
реакцию с тимином (дорожка С). Теперь по-
следовательность ДНК можно прочитать
по радиоавтографу геля, сопоставляя до- Рис. 24.52. На радиоавтографе геля видны
рожки G, A + G, С + Т и С (рис. 24.52). меченые фрагменты, образо-
Самый короткий фрагмент имеет самую вавшиеся при химическом рас-
высокую электрофоретическую подвиж- щеплении. 5'-конец этой ДНК
ность, так что 5'-концу соответствует низ был помечен 32Р. Самый ко-
геля. Если использовать несколько различ- роткий нуклеотид расположен
ных гелей для разделений всех меченых у основания геля. С геля можно
фрагментов, можно легко определить та- прочитать последовательность
ким образом последовательности длиной 5'-CTTTTTTGGGCTTAGC-3'.
более 150 пар оснований.
24. ДНК: генетическая роль,
структура и репликация 41
Заключение
ДНК - молекула наследственности у всех
прокариотических и эукариотических орга-
низмов. У вирусов роль генетического ма-
териала выполняет либо ДНК, либо РНК.
Любая клеточная ДНК представляет собой
две очень длинные спиральные полину-
клеотидные цепи, закрученные вокруг об-
щей оси. Две цепи двойной спирали ориен-
тированы в противоположном направле-
I 1 ) . В качестве затравки для синтеза ис- нии (антипараллельны). Сахарофосфатный
пользуется комплементарный фрагмент, остов каждой цепи лежит снаружи двойной
который можно получить из набора про- спирали, а пуриновые и пиримидиновые
дуктов рестрикции, соответствующей двух- основания - внутри. Две цепи удерживают-
цепочечной ДНК. Кроме четырех радиоак- ся вместе водородными связями между па-
тивных дезоксирибонуклеозидтрифосфатов, рами оснований. Аденин (А) всегда спари-
инкубационная смесь содержит 2',3'-диде- вается с тимином (Т), а гуанин (G) - c
зоксианалог одного из них. Включение это- цитозином (С). Таким образом, цепи двой-
го аналога блокирует дальнейший рост це- ной спирали взаимно комплементарны. Ге-
пи, так как он не содержит концевой нетическая информация закодирована в по-
3'-гидроксильной группы, необходимой для следовательности оснований вдоль цепи.
образования следующей фосфодиэфирной Большинство молекул ДНК имеет кольце-
связи. Так образуются фрагменты, несу-
щие на 3'-конце дидезоксианалог (рис. 24.53).
Затем четыре набора фрагментов, образо-
ванных терминированием цепей, разделяют
гель-электрофорезом и прочитывают по-
следовательность оснований синтезирован-
ной ДНК по радиоавтографу геля. Исполь-
зуя менее 1 пмоль очищенной ДНК, мож-
но определить последовательности 200 ну-
клеотидов.
С помощью метода контролируемой ре-
пликации in vitro Сэнгер определил пол-
ную последовательность 5375 оснований
в ДНК фага φХ174. Расшифровка последо-
вательности ДНК целого генома - крупное
достижение молекулярной биологии. Она
позволила сделать ряд важных выводов,
которые мы рассмотрим в гл. 26
(разд. 26.11). Интересно отметить, что Сэн-
гер определил полную последовательность
оснований целого генома через четверть Рис. 24.53. Стратегия метода определения
века после того, как он расшифровал ами- последовательности нуклеоти-
нокислотную последовательность белка2. дов в ДНК путем терминиро-
1
Поэтому данный метод в отечественной ли- вания цепи. Фрагменты обра-
тературе называют методом полимеразного ко- зуются в результате добав-
пирования.- Прим. перев. ления 2',3'-дидезоксианалога
2
Следует отметить, что в промежутке между одного из dNTP в каждую из
этими открытиями Ф. Сэнгер разработал ориги- четырех пробирок, в которых
нальный метод определения последовательно- происходит полимеризация.
сти оснований в РНК, который имел огромные
преимущества перед другими известными в то Например, при добавлении ди-
время методами.- Прим. перев. дезоксианалога dATP обра-
зуются фрагменты, оканчи-
Часть IV. вающиеся на А (показано
42 Информация красным цветом).
вую форму. Ось двойной спирали кольце- лиза АТР. Расплетанию способствует так-
вой ДНК может сама закручиваться же ДНК-гираза, которая играет роль моле-
и образовывать суперспираль. Суперспира- кулярного шарнира и вводит отрица-
лизованная ДНК имеет более компактную тельные супервитки в родительскую ДНК.
форму, чем релаксированная ДНК. Одна цепь ДНК (ведущая) синтезируется
При репликации ДНК две цепи двойной непрерывно, тогда как другая (отстающая)
спирали расплетаются и расходятся по ме- синтезируется в виде фрагментов длиной
ре того, как синтезируются новые цепи. 1 kb. Поскольку образование отстающей
Каждая родительская цепь служит матри- цепи происходит путем сборки из от-
цей для образования новой комплементар- дельных фрагментов, полимеризация в на-
ной цепи. Таким образом, репликация правлении 5'—>3' на атомном уровне при-
ДНК полуконсервативна - каждая дочерняя водит к общему росту этой цепи
молекула получает одну цепь родитель- в направлении 3'—>5'. Синтезу новой ДНК
ской молекулы ДНК. Репликация предшествует синтез РНК, которая исполь-
ДНК - сложный процесс, в осуществлении зуется затем в качестве затравки. Впослед-
которого участвует много белков, в том ствии РНК, входящая в состав новообра-
числе ДНК-полимеразы трех типов зованной РНК-ДНК-цепи, гидролизуется
и ДНК-лигаза. Активированные предше- и замещается ДНК. Затем ДНК-лигаза со-
ственники синтеза ДНК - четыре дезокси- единяет новообразованные фрагменты
рибонуклеозид-5'-трифосфаты. Новая цепь ДНК, которые спарены с одной и той же
синтезируется в направлении 5'—>3'. Этот матричной цепью. В этой реакции уча-
синтез осуществляется путем нуклеофиль- ствует в качестве источника энергии
ной атаки внутреннего атома фосфора оче- NAD + .
редного дезоксинуклеозидтрифосфата Повреждения в ДНК, вызванные ионизи-
3'-гидроксильным концом цепи затравки. рующей радиацией, ультрафиолетовым
Самое важное состоит в том, что ДНК-по- светом и различными химическими соеди-
лимераза катализирует образование фос- нениями, постоянно репарируются. Напри-
фодиэфирной связи только в том случае, мер, пиримидиновые димеры, индуциро-
если основание очередного нуклеотида ванные ультрафиолетовым светом, выре-
комплементарно основанию матричной це- заются специфической эндонуклеазой. Ура-
пи. Другими словами, ДНК-полимеразы — цил, который образуется при спонтанном
ферменты, направляемые матрицами. дезаминировании цитозина в ДНК, уда-
ДНК-полимеразы I, II и III обладают так- ляется гликозидазой, которая дифференци-
же 3'—>5'-экзонуклеазной активностью, ко- рует урацил и тимин.
торая увеличивает надежность репликации Ферменты рестрикции узнают специфиче-
путем удаления некомплементарных остат- ские последовательности, обладающие
ков. ДНК-полимеразам I и III присуща, симметрией второго порядка, и гидроли-
кроме того, 5'—>3'-нуклеазная активность, зуют одну фосфодиэфирную связь в каж-
играющая важную роль в механизмах ре- дой цепи ДНК в этой области. Эти эндону-
пликации и репарации ДНК. клеазы можно использовать для расщепле-
Репликация ДНК в клетках E.coli на- ния молекул ДНК на специфические фраг-
чинается в строго определенном месте (в менты, удобные для дальнейшего изучения.
точке начала репликации) и идет в обоих Разработка методов, позволяющих быстро
направлениях. В области репликационной определять последовательность нуклеоти-
вилки (там, где из двух цепей ДНК полу- дов в ДНК на основе специфического рас-
чаются четыре) обе цепи родительской щепления и электрофоретического разделе-
ДНК используются в качестве матриц для ния продуктов, революционизировала изу-
синтеза новой ДНК. Белок rep расплетает чение структуры ДНК.
родительскую ДНК за счет энергии гидро-

24. ДНК: генетическая роль,


структура и репликация 43
РЕКОМЕНДУЕМАЯ Molecular structure of nucleic acid. Bird R.E., Lourarn J., Martuscelli J.,
ЛИТЕРАТУРА A structure for deoxyribose nucleic acid, Caro L., 1972. Origin and sequence of
Nature, 171, 737-738. chromosome replication in E. coli,
С чего начать Watson J.D., Crick F.H.C., 1953. J, Mol. Biol, 70, 549-566.
Kornberg A., 1979. Aspects of DNA Genetic implications of the structure of Ogawa T., Okazaki Т., 1980. Discontinu-
replication, Cold Spring Harbor Symp., deoxyribonucleic acid, Nature, 171, ous DNA replication, Ann. Rev. Bio-
Quant Biol., 43, 1-9. 964-967. chem., 49, 421-458.
Alberts В., Sternglanz R., 1977. Recent Kornberg A., 1960. Biological synthesis
excitement in the DNA replication of deoxyribonucleic acid, Science, 131, Структура ДНК
problem, Nature, 269, 655-661. 1503-1508. Cantor С.R., Schimmel P.R., 1980.
Fiddes J.G., 1977. The nucleotide Meselson M., Stahl F.W., 1958. The Biophysical Chemistry, Freeman.
sequence of a viral DNA, Sci. Amer., replication of DNA in Escherichia coli, [Имеется перевод: Кантор Ч., Шим-
237(6), 54-67. Proc. Nat. Acad. Sci., 44, 671-682. мел Р. Биофизическая химия. В 3-х
Hamilton H.О., 1979. Nucleotide Taylor J.H. (ed.), 1965. Selected Papers т. - М.: Мир, 1984.] (Гл. 3 и 6 в томе
sequense specificity of restriction endo- on Molecular Genetics, Academic Press. 1 и гл. 22-24 в томе 3 содержат пре-
nucleases, Science, 205, 455-622. (В этой книге содержатся классичес- восходный обзор, посвященный кон-
Nathans D., 1979. Restriction endo- кие статьи, упоминавшиеся в данной формации нуклеиновых кислот.)
nucleases, simian virus 40, and the new главе.)
genetics, Science, 206, 903-909. Суперспиральная ДНК
Bauer W.R., Crick F.H.C., White J.H., Определение последовательности ос- Bauer W.R., 1978. Structure and
1980. Supercoiled DNA, Sci. Amer., нований в ДНК reactions of closed duplex DNA, Ann.
243(1), 118-133. (Ясно и четко Sanger F., Nicklen S., Coulson A.R., Rev. Biophys. Bioeng., 7, 287-313.
рассмотрена топология суперспи- 1977. DNA sequencing with chain- Crick F.H.C., 1976. Linking numbers
ральных ДНК.) terminating inhibitors, Proc. Nat. Acad. and nucleosomes, Proc. Nat. Acad. Sci.,
Sci., 74, 5463-5467. 73, 2639-2643. (Доступное введение
Книги Maxam A.M., Gilbert W., 1977. A new в проблему порядка зацепления, на-
Kornberg A., 1980. DNA Replication, method for sequencing DNA, Proc. Nat. пряжения и угла закручивания супер-
Freeman. (Выдающаяся монография, Acad. Sci., 74, 560-564. спиральной ДНК.)
читается с большим интересом.) Mizuuchi K., O'Dea M.H., Gellert M.,
Cold Spring Harbor Laboratory, 1979. Белки, участвующие в репликации 1978. DNA gyrase: subunit structure
Replication and Recombination, Cold ДНК and ATPase activity of the purified
Spring Harbor Symposia of Wickner S.H., 1978. DNA replication enzyme, Proc. Nat. Acad. Sci., 75,
Quantitative Biology, vol. 43. (Наибо- proteins of Escherichia coli, Ann. Rev. 5960-5963.
лее информативный сборник статей Biochem., 47, 1163-1191. Cozzarelli N.R., 1980. DNA gyrase and
по репликации, репарации и рекомби- Lehman I . R . , 1974. DNA ligase: struc- the supercoiling of DNA, Science, 207,
нации ДНК.) ture, mechanism, and function, Science, 953-960.
Bloomfield V.A., Crothers D.M., 186, 790-797.
Тinосо I., Jr., 1974. Physical Chemistry McHenry C., Kornberg A., 1977. DNA Репарация ДНК
of Nucleic Acids, Harper and Row. polymerase III holoenzyme of Hanawalt P.C., Cooper P.K.,
Davidson J.N., 1977. The Biochemistry Escherichia coli: purification and Ganesan A.K., Smith C.A., 1979. DNA
of the Nucleic Acids, Academic Press. resolution into subunits, J. Biol. Chem., repair in bacteria and mammalian cells,
Ts'o P.O.P., 1974. Basic Principles in 252, 6478-6484. Ann. Rev. Biochem., 48, 783-836.
Nucleic Acid Chemistry, vol. 1 and 2, Rowen L., Kornberg A., 1978. Primase, Lindahl Т., Ljungquist S., Siegert W.,
Academic Press. the dna G protein of Escherichia coli: an Nyberg B., Sperens В., 1977. DNA N-
enzyme which starts DNA chains, J. Biol. glycosidases. Properties of uracil-DNA
Возникновение основополагающих Chem., 253, 758-764. glycosidase from Escherichia coli, J. Biol.
концепций Kornberg A., Scott J.F., Bertsch L.L., Chem., 252, 3286-3294.
Avery О.Т., MacLeod С.M., 1978. ATP utilization by rep protein in Cleaver J.E., 1978. Xeroderma
McCarty M., 1944. Studies on the the catalytic separation of DNA strands pigmentosum. In: Stanbury J.B.,
chemical nature of the substance induci- at a replicating fork, J. Biol. Chem., 253, Wyngaarden J. В., Fredrickson D. S.
ng transformation of pneumococcal 3298-3304. (eds.), The Metabolic Basis of Inherited
types. Induction of transformation by Cozzarelli N.R., 1977. The mecha- Disease (4 th ed.), pp. 1072-1095,
a deoxyribonucleic acid fraction isolated nism of action of inhibitors of McGraw-Hill.
from Pneumococcus Type III, J. Exp. DNA synthesis, Ann. Rev. Biochem., 46,
Med., 79, 137-158. 641-668. Воспоминания и исторические очерки
Hershey A.D., Chase M., 1952. Indepen- Cairns J., Stent G.S., Watson J. D. (eds.),
dent functions of viral protein and 1966. Phage and the Origins of
nucleic acid in growth of bacteriophage,
Место начала репликации ДНК и на- Molecular Biology, Cold Spring Harbor
J. Gen. Physiol., 36, 39-56. правление репликации Laboratory. (Увлекательный сборник
Watson J.D., Crick F.H.C., 1953. Prescott D.M., Kuempel P. L., 1972. воспоминаний некоторых основопо-
Bidirectional replication of the ложников молекулярной биологии.)
Часть IV. chromosome in E. coli, Proc. Nat. Acad. Watson J.D., 1968. The Double Helix,
44 Информация Sci., 69, 2842-2845. Atheneum. (Живой рассказ об откры-
тии структуры ДНК и ее биологичес- Helix, University of Washington Press. of the Genetic Substance, MIT Press.
ких функциях, в котором проступает Portugal F.H., Cohen J.S., 1977. Judson H., 1979. The Eighth Day of
яркая личность автора.) [Имеется A Century of DNA: A History of the Creation, Simon and Schuster.
перевод: Уотсон Д. Двойная спи- Discovery of the Structure and Function
раль. - М.: Мир, 1969.]
Olby R., 1974. The Path to the Double

3. ДНК одного делеционного му-


Вопросы и задачи танта бактериофага λ имеет
1. Напишите комплементарные контурную длину 15 мкм вместо 17 мкм.
последовательности (в стан- Сколько пар оснований недостает у этого
дартной записи в направлении 5'—>3') для мутанта?
следующих последовательностей: 4. Какой результат получили бы
а) GATCAA, Меселсон и Сталь, если бы ре-
б) TCGAAC, пликация ДНК была консервативной? Ука-
в) ACGCGT, жите предполагаемое распределение моле-
г) ТАССАТ. кул ДНК после 1-й и 2-й генераций
2. Одна из цепей двухспиральной в случае консервативной репликации (т.е.
ДНК имеет следующий нуклео- когда родительская двойная спираль не
тидный состав (относительное молярное расходится).
содержание): [А] = 0,30, [G] = 0,24. 5. Зависит ли от видовой принад-
а) Что можно сказать о содержании [Т] лежности способность из-
и [С] в той же цепи? вестных ДНК-лигаз использовать для сое-
б) Что можно сказать о содержании [А], динения ДНК-цепей NAD + или АТР?
[G], [Т] и [С] в комплементарной цепи? Предположим, что обнаружена новая
ДНК-лигаза, нуждающаяся в каком-то
другом источнике энергии. Предположите
приемлемую с энергетической точки зре-
ния замену NAD + или АТР в этой реак-
ции.
6. ДНК-лигаза из Е. coli релакси-
рует суперспирализованную
кольцевую ДНК в присутствии AMP. В от-
сутствие АТР эта активность не проявляет-
ся. Каков механизм этой реакции и почему
он зависит от AMP?
7. На рис. 24.54 приведена схема
радиоавтографа геля с четырь-
мя дорожками фрагментов ДНК, образо-
вавшихся при химическом расщеплении.
32
ДНК содержала Р-метку на 5'-конце.
Какова последовательность этой ДНК?
Рис. 24.54. Схематическое изображение
радиоавтографа геля. Видны Дополнительные вопросы см.: Wood W. В.,
радиоактивные фрагменты, Wilson J. H., Benbow R. M., Hood L. Е.
образующиеся при специфиче- Biochemistry: A Problems Aproach,
ском расщеплении олигону- Benjamin, 1974, chs. 16, 17.
клеотидов.
ГЛАВА 25 шивается реактивом Фёльгена. Касперсон
обнаружил, что почти вся ДНК содержит-
Информационная ся в ядре, тогда как РНК находится боль-
шей частью в цитоплазме. К такому же
РНК и транскрипция выводу пришел Жан Браше (Jean Brachet),
который разделял клетки на ядерную и ци-
В этой главе мы рассмотрим выражение топлазматическую фракции и определял
в фенотипе (экспрессию) генетической ин- в них содержание ДНК и РНК. Более того,
формации, содержащейся в ДНК. Функция он обнаружил, что РНК в цитоплазматиче-
генов - кодирование синтезируемых в клет- ской фракции находится в составе малень-
ке белков. Однако сама ДНК не исполь- ких частиц и ассоциирована с белком. Бы-
зуется в качестве непосредственной ма- ло показано, что эти частицы, состоящие
трицы для синтеза белка. Роль таких из РНК и белка, служат местом синтеза
матриц выполняют молекулы РНК (рибо- белка. Теперь их называют рибосомы.
нуклеиновой кислоты). В норме поток гене-
тической информации в клетке идет в сле- 25.1. Структура РНК
дующем направлении: РНК, подобно ДНК, представляет собой
длинную неразветвленную молекулу, со-
стоящую из нуклеотидов, соединенных
фосфодиэфирными связями 3'—>5'. Число
нуклеотидов в молекуле РНК колеблется
В настоящей главе мы увидим, что неко- от всего лишь 75 до многих тысяч. Кова-
торые молекулы РНК играют роль проме- лентная структура РНК отличается от
жуточных переносчиков информации в син- ДНК в двух отношениях. Как указывает
тезе белка, тогда как другие молекулы само название, сахарный остаток
РНК являются частью аппарата белкового в РНК - рибоза, а не дезоксирибоза. Рибоза
синтеза. Затем мы рассмотрим синтез содержит 2'-гидроксильную группу, кото-
РНК, протекающий в соответствии с по- рой нет в дезоксирибозе. Другое различие
следовательностью ДНК-матрицы. Это - состоит в том, что одним из четырех осно-
процесс транскрипции, за которым следует ваний в РНК является урацил (U) - вместо
трансляция. При трансляции РНК-ма- тимина, содержащегося в ДНК. Как и ти-
трицы направляют синтез белков. Более мин, урацил может образовывать пару ос-
подробно этот вопрос рассматривается нований с аденином. Но в молекуле ураци-
в гл. 27. ла нет метильной группы, имеющейся
Участие РНК в синтезе белка казалось в молекуле тимина.
вероятным уже в 1940 г., за несколько лет
до того, как было показано, что ДНК - ма-
териал наследственности. Торбьёрн Кас-
персон (Torbjorn Caspersson) изучал рас-
пределение РНК и ДНК в отдельных
эукариотических клетках с помощью свето-
вой микроскопии. Он исходил из того фак-
та, что и РНК, и ДНК сильно поглощают
ультрафиолетовый свет с длиной волны
260 нм, но только ДНК интенсивно окра-

Часть IV.
46 Информация
Таблица 25.1. Молекулы РНК у Е. coli

Тип РНК Отно- Коэф- Масса, кДа


ситель- фици- Число
ное со- ент нукле-
держа- седи- отидов
ние, % мента-
ции,
S

Рибосомная 80 23 1,2•103 3700


(рРНК) 16 0,55•1 03 1700
5 3,6•101 120
Транспортная 15 4 2,5•101 75
(тРНК)
Информаци- 5 Гетерогенна
онная (мРНК)

Молекулы РНК имеют одноцепочечное


строение, за исключением РНК некоторых
вирусов. Поэтому нуклеотидный состав
РНК не подчиняется правилу комплемен-
тарности. Действительно, в большинстве
молекул РНК содержание аденина отли-
чается от содержания урацила, а содержа-
ние гуанина отличается от содержания ци-
тозина. Но молекулы РНК все-таки содер- Рис. 25.1. Структура части цепи РНК.
жат участки с двухцепочечной структурой,
которые образуют петли в виде шпилек
(рис. 25.2). В этих участках А спаривается 25.2. Клетки содержат три типа РНК:
с U, a G спаривается с С. Кроме того, рибосомную, транспортную и инфор-
G может образовывать пару оснований мационную
с U, но она менее прочна, чем GС-пара Клетки содержат три типа РНК
(разд. 27.6). Спаривание оснований (табл. 25.1). Информационная РНК (ее на-
в шпильках РНК часто несовершенно. Не- зывают также матричная РНК, отсюда
которые основания, расположенные мРНК) служит матрицей для синтеза бел-
в шпильке друг против друга, не компле- ка. Каждому работающему гену (или груп-
ментарны, и одно или несколько основа- пе генов) соответствует своя молекула
ний в одной из цепей могут выпетливаться мРНК. Следовательно, мРНК - крайне ге-
(выступать) из участка двойной спирали, терогенный класс молекул, у Е. coli сред-
чтобы облегчить спаривание других осно- няя длина молекулы мРНК составляет
ваний. Доля двухспиральных участков примерно 1,2 kb. Транспортная РНК
в различных РНК варьирует в широких (тРНК) переносит аминокислоты в активи-
пределах - в наиболее типичном случае до рованной форме к рибосомам, где они сое-
50% диняются пептидной связью в определен-

Рис. 25.2. РНК может складываться сама


на себя и образовывать двухс- 25. Информационная РНК
пиральные структуры. и транскрипция 47
Единица Сведберга (S) -
коэффициенты седиментации биологических макромолекул выражаются
в единицах Сведберга (сокращенно S); 1S = 10 - 1 3 с. (Сведберг - шведский
ученый, изобретатель ультрацентрифуги.)

ной последовательности, которую задает нии индуктора синтез данных ферментов


РНК-матрица. Для каждой из 20 амино- прекращался также быстро. Эти экспери-
кислот имеется по крайней мере одна раз- ментальные данные были несовместимы
новидность тРНК, Транспортная РНК со- с существованием стабильных матриц для
стоит примерно из 75 нуклеотидов (масса синтеза указанных ферментов. Отсюда Жа-
25 кДа). Это самые маленькие молекулы коб и Моно сделали вывод, что время
РНК. Рибосомная РНК (рРНК) - основной жизни посредника должно быть очень ко-
компонент рибосом, но пока ее роль в син- ротким. Затем они предположили, что он
тезе белка точно не установлена. В клетке должен обладать следующими свойствами.
Е. coli имеется три разновидности рРНК, 1. Посредник должен быть полинуклео-
называемые 23S-, 16S- и 5S-PHK соответ- тидом.
ственно их поведению при седиментации. 2.. Нуклеотидный состав предшественни-
В каждой рибосоме содержится по одной ка должен соответствовать нуклеотидному
молекуле каждой из этих трех разновидно- составу ДНК, которая его кодирует.
стей РНК. Из трех указанных типов РНК 3. Посредник должен быть весьма гете-
(мРНК, тРНК, рРНК) количественно пре- рогенным по размеру, так как гены (или
обладает рРНК. Затем идет тРНК, и мень- группы генов) различаются по длине. Жа-
ше всего в клетке содержится информа- коб и Моно высказали правильное предпо-
ционной РНК, на долю которой приходит- ложение, что три нуклеотида кодируют
ся всего лишь 5% всей РНК. одну аминокислоту, и вычислили, что
масса посредника должна быть не менее
25.3. Формулирование концепции 500 кДа.
информационной РНК 4. Посредник должен быть временно ас-
Концепция мРНК была сформулирована социирован с рибосомами - местом синтеза
Франсуа Жакобом и Жаком Моно белка.
(Francois Jacob, Jacues Monod) в классиче- 5. Посредник должен синтезироваться
ской статье, опубликованной в 1961 г. По- и распадаться очень быстро. Отсюда сле-
скольку в эукариотических клетках белки дует, что аналоги оснований, например
синтезируются в цитоплазме, а не в ядре, 5-фторурацил, должны включаться в по-
было очевидно, что должен существовать средник в течение нескольких минут.
какой-то химический посредник, коди- Для Жакоба и Моно было очевидно, что
руемый генами. Жакоб и Моно назвали известные в то время фракции РНК не
его структурным посредником. Какова удовлетворяют этим критериям. Рибосом-
природа этого промежуточного продукта? ная РНК, которую принято было считать
Важную роль в решении этого вопроса сы- матрицей для синтеза белков, была слиш-
грало проведенное ими исследование регу- ком гомогенна по размеру. Кроме того, ее
ляции синтеза белка у Е. coli (гл. 28). Неко- нуклеотидный состав был сходен у видов,
торые ферменты Е. coli, например фер- сильно различавшихся по нуклеотидному
менты, участвующие в поглощении и ис- составу ДНК. Более того, эта РНК была
пользовании лактозы, индуцибельны. Это стабильной, и 5-фторурацил включался
означает, что количество этих ферментов в нее очень медленно. Транспортная РНК
увеличивается более чем в 1000 раз в при- тоже не подходила на роль посредника по
сутствии индуктора (например, изопропил- тем же причинам. К тому же она слишком
тиогалактозида). Особенно показательна мала. Однако в литературе высказывалось
была кинетика индукции. Добавление ин- предположение о существовании третьего
дуктора уже через несколько минут вызы- типа РНК, который, по-видимому, удовле-
вало максимальный синтез ферментов, ка- творял всем критериям посредника.
тализирующих обмен лактозы. При удале- В клетках Е. coli, зараженных бактериофа-
гом Т2 (рис. 25.3), была обнаружена ранее
Часть IV. неизвестная фракция РНК подходящего
48 Информация размера с очень коротким временем жиз-
ни. Самое интересное, что нуклеотидный Как же происходит при заражении пере-
состав этой фракции РНК был близок ключение синтеза с одних белков на дру-
к составу вирусной ДНК, а не ДНК Е. coli. гие? Одна возможность состояла в том,
что фаговая ДНК программирует образо-
вание новых рибосом. Согласно этому
25.4. Экспериментальные данные предположению, гены определяют синтез
о существовании информационной специализированных рибосом, а каждая
РНК-посредника в синтезе белка рибосома может синтезировать белок
Правомочность гипотезы о короткоживу- только одного вида. Альтернативное пред-
щей РНК-посреднике, играющей роль положение, выдвинутое Жакобом и Моно,
переносчика информации при синтезе бел- состояло в том, что рибосомы - неспециа-
ка, была проверена вскоре после того, как лизированные структуры, которые полу-
гипотеза была сформулирована. Сидней чают генетическую информацию от гена
Бреннер, Франсуа Жакоб и Мэтью Месел- в виде нестабильной информационной
сон (Sydney Brenner, Francois Jacob, РНК (посредника). Эксперименты Бренне-
Matthew Meselson) провели эксперименты ра, Жакоба и Меселсона были спланиро-
на E. coli, зараженной бактериофагом Т2. ваны таким образом, чтобы можно было
Почти все белки, синтезирующиеся после выяснить, происходит ли после заражения
заражения, детерминируются генами фага. синтез новых рибосом или же новообразо-
Синтез этих белков не сопровождается уве- ванная РНК присоединяется к предсуще-
личением общего количества РНК. Однако ствовавшим рибосомам.
вскоре после заражения появляется минор- Бактерии выращивали в среде, содержав-
15 13
ная фракция РНК с коротким временем шей тяжелые изотопы ( N и С), заража-
жизни. Как уже говорилось выше, нуклео- ли фагом и немедленно переносили в сре-
тидный состав минорной фракции РНК ду, содержащую легкие изотопы (14N и
12
сходен с составом фаговой ДНК. Эта си- С). Рибосомы, синтезированные до
стема представлялась оптимальной для и после заражения, можно было разделить
проверки гипотезы посредника, поскольку центрифугированием в градиенте плотно-
в ней происходило быстрое переключение сти, так как их плотности различались
природы синтезируемого белка. Еще одно («тяжелые» и «легкие» соответственно;
преимущество состояло в том, что в зара- рис. 25.4). Новая РНК была помечена ра-
женных клетках не происходило синтеза диоактивными изотопами с помощью 32Р-
рРНК и тРНК. и 14С-урацила, а новый белок был помечен
изотопом 35S. В результате этих экспери-
ментов было установлено следующее.
1. Синтеза рибосом после заражения не
происходит, о чем свидетельствует отсут-
ствие «легких» рибосом.
2. РНК синтезируется после заражения.
Большая часть радиоактивно меченной
РНК обнаруживается в «тяжелом» рибо-
сомном пике. Итак, большая часть ново-
синтезированной РНК ассоциирована
с предсуществующими рибосомами. Допол-
нительные эксперименты показали, что во
время роста фага происходит быстрый
распад и ресинтез этой новой РНК.
3. Радиоактивный изотоп 35S временно
появлялся в «тяжелом» рибосомном пике,
из чего следует, что синтез новых белков
происходит на предсуществующих рибосо-
мах.
Рис. 25.3. Электронная микрофотогра- Эти эксперименты позволили сделать
фия клетки E. coli, зараженной
вирусами Т2. (Печатается с лю-
безного разрешения д-ра Lee 25. Информационная РНК
Simon.) и транскрипция 49
ной ДНК выше температуры плавления
она переходит в одноцепочечную форму.
При медленном охлаждении раствора эти
цепи реассоциируют и образуют двухспи-
ральную структуру, обладающую биологи-
ческой активностью. Мармур и Доти обна-
ружили также, что двухспиральные моле-
кулы образуются только в том случае,
если цепи ДНК происходят из организмов
одного вида или близкородственных ви-
дов. Это наблюдение подсказало Спигел-
ману, что в смеси одноцепочечной ДНК
и РНК должны образовываться гибриды
ДНК-РНК, если их последовательности
Рис. 25.4. Центрифугирование рибосом оснований комплементарны (рис. 25.5).
и РНК контрольных бактерий Схема эксперимента была следующей:
и бактерий, зараженных фагом 1. РНК, синтезированную после зараже-
Т2, в градиенте плотности. Ме- ния Е. coli фагом Т2 (Т2-мРНК), метили
ченная 32Р РНК, синтезирован- изотопом 32Р. В другом эксперименте
ная после заражения, попадает ДНК фага Т2 (Т2-ДНК) пометили изото-
3
в полосу рибосом, образо- пом Н.
ванных до заражения («тя- 2. Смесь Т2-мРНК и Т2-ДНК нагревали
желые» рибосомы). После за- до 100°С. В результате двухспиральная
ражения синтеза рибосом не ДНК расплавлялась и переходила в одно-
происходит. цепочечную форму. Этот раствор, содержа-
щий одноцепочечные РНК и ДНК, медлен-
но охлаждали до комнатной температуры.
3. Охлажденную смесь анализировали
следующий вывод: рибосомы - неспециали- методом центрифугирования в градиенте
зированные структуры, синтезирующие плотности. Образцы центрифугировали не-
в каждый данный момент тот белок, ко- сколько дней в бакет-роторе. Затем пласти-
торый закодирован в информационной РНК,
находящейся в данный момент в рибосо-
мах. Исследования незараженных бакте-
риальных клеток также показали, что ин-
формационная РНК служит звеном, пере-
носящим информацию от гена к белку.
Вскоре представление об информационной
РНК стало одним из основополагающих
в молекулярной биологии.

25.5. Опыты по гибридизации показали,


что информационная РНК комплементарна
кодирующей ее ДНК-матрице
В 1961 г. Сол Спигелман (Sol Spigelman)
разработал новый метод, названный гибри-
дизацией. Он должен был дать ответ на
следующий вопрос: комплементарна ли
последовательность оснований РНК, син-
тезированной после заражения фагом Т2,
последовательности оснований ДНК фага
Т2? Из работы Джулиуса Мармура и Пола
Доти (Julius Marmur, Paul Doty) было из-
вестно, что при нагревании двухспираль- Рис. 25.5. Если РНК и ДНК имеют ком-
плементарные последователь-
Часть IV. ности, может образоваться ги-
50 Информация брид РНК—ДНК.
ковые пробирки с образцами протыкали
снизу и собирали фракции по каплям для
дальнейшего анализа.
В результате были обнаружены три по-
лосы (рис. 25.6). Полоса с наибольшей
плотностью соответствовала одноцепочеч-
ной РНК. Вторая полоса соответствовала
двухспиральной ДНК. Третья располага-
лась вблизи от полосы ДНК и состояла из
двухцепочечных гибридных молекул
ДНК—РНК. Итак, Т2-мРНК образовыва-
ла гибрид с Т2-ДНК. В отличие от этого
Т2-РНК не гибридизовалась с ДНК мно-
гих бактерий и неродственных вирусов, да-
же если их нуклеотидный состав был подо-
Рис. 25.6. РНК, образовавшаяся после
бен Т2-ДНК. Последующие эксперименты заражения E. coli фагом Т2,
показали, что фракция мРНК из незара- комплементарна вирусной
женных клеток гибридизуется с ДНК
ДНК. В этих экспериментах по
именно того организма, из которого она
гибридизации РНК метили
была выделена, но не с ДНК нерод- 32
Р, а ДНК фага Т2 - 3Н. Рас-
ственных организмов. Эти убедительные пределение радиоактивности
эксперименты продемонстрировали, что
в градиенте плотности хлори-
последовательность оснований мРНК ком-
стого цезия показывает, что
плементарна последовательности ДНК-ма- большая часть РНК, синтези-
трицы. К тому же был разработан рованной после заражения, по-
мощный метод, с помощью которого мож-
падает в одну полосу с ДНК
но было исследовать поток генетической фага Т2. (Spiegelman S., Hybrid
информации в клетках и выяснять, сходны
nucleic acids, Sci. Amer., 1964.)
ли две молекулы нуклеиновой кислоты.

25.6. Рибосомные РНК и транспортные


РНК также синтезируются на
ДНК-матрице
Метод гибридизации был использован за-
тем, чтобы выяснить, синтезируются ли
рРНК и тРНК также на ДНК-матрицах.
Образование гибридов РНК—ДНК выяв-
ляли с помощью фильтров, а не центрифу-
гированием в градиенте плотности, так как
этот метод проще, чувствительнее и тре-
бует меньше времени. Одноцепочечные
РНК проходят через нитроцеллюлозный
фильтр, а двухспиральные ДНК и гибриды
РНК—ДНК задерживаются на фильтре.
РНК Е. coli пометили изотопом 32 Р и сме-
шали с немеченой ДНК Е. coli. Эту смесь
нагревали, медленно охлаждали и затем
отфильтровывали через нитроцеллюлозу.
Радиоактивность, задержанную на филь- Рис. 25.7. Электронная микрофотогра-
тре, просчитывали. Результаты экспери- фия РНК-полимеразы E. coli.
ментов не вызывали сомнений: гибриды (Печатается с любезного разре-
РНК—ДНК образовывались со всеми шения д-ра Robley Williams
рРНК (5S, 16S и 23S) и тРНК. Отсюда сле- и д-ра Michael Chemberlin.)
довало, что в геноме Е. coli имеются после-
довательности, комплементарные этим мо- 25. Информационная РНК
лекулам РНК. и транскрипция 51
Рис. 25.8. Механизм реакции элонгации Синтез РНК во многих отношениях
цепи, катализируемой РНК-по- подобен синтезу ДНК (рис. 25.8). Во-
лимеразой. первых, как будет вскоре показано более
подробно, синтез идет в направлении 5'—>
25.7. Все клеточные РНК синтезирует —>3'. Во-вторых, по-видимому, механизм
РНК-полимеразa элонгации сходен. Происходит нуклео-
Концепция мРНК стимулировала поиски фильная атака внутреннего фосфата оче-
фермента, который синтезирует РНК в со- редного нуклеозидтрифосфата 3'-ОН-груп-
ответствии с последовательностью ДНК- пой на конце растущей цепи. В-третьих,
матрицы. Стратегия эксперимента была движущая сила синтеза - гидролиз пиро-
такой же, как и при поиске ДНК-полиме- фосфата.
разы I. В 1960г. Джерард Хёрвиц и Сэ- Однако по некоторым важным особен-
мюэл Вейсс (Jerard Hurwitz, Samuel Weiss) ностям синтез РНК отличается от синтеза
независимо открыли такой фермент. Они ДНК. Во-первых, РНК-полимеразе не нуж-
назвали его РНК-полимеразой. Ферменту на затравка. Во-вторых, ДНК-матрица при
из клеток Е. соli (рис. 25.7) нужны были синтезе РНК полностью сохраняется, тог-
для синтеза РНК следующие компоненты. да как при синтезе ДНК она сохраняется
1. Матрица. Предпочтительная матри- лишь наполовину. В-третьих, РНК-полиме-
ца - двухцепочечная ДНК. Одноцепочечная раза, насколько известно, не обладает ни-
ДНК также может служить матрицей. Ни какими нуклеазными активностями.
РНК (как одноцепочечная, так и двухцепо- Все три типа клеточной РНК Е.
чечная), ни гибриды РНК—ДНК не могут coli - мРНК, тРНК и рРНК - синтезируют-
служить эффективными матрицами. ся одной РНК-полимеразой в соответствии
2. Активированные предшественники. Не- с инструкциями, заданными ДНК-матри-
обходимы все четыре рибонуклеозидтри- цей. В клетках млекопитающих имеет ме-
фосфата - ATР, GTP, UTP и СТР. сто разделение труда между несколькими
3. Двухвалентные ионы металлов. Фер- видами РНК-полимераз. Кроме того, необ-
мент активен в присутствии Mg 2+ или ходимо отметить, что некоторые вирусы
Mn 2 + . In vivo эту потребность фермента кодируют РНК-синтезирующие ферменты,
2+
удовлетворяет Mg . совершенно отличные от ферментов клет-
РНК-полимераза катализирует инициа- ки-хозяина. Таковы, например, РНК-поли-
цию и элонгацию цепей РНК. Фермент ка- мераза, кодируемая ДНК-содержащим фа-
тализирует следующую реакцию: гом Т7, и РНК-репликаза, кодируемая
(РНК)n остатков + Рибонуклеозидтрифос- РНК-содержащим фагом Qβ. Репликаза
фат (РНК)n + 1 остаток + PP i . фага Qβ является РНК-зависимой РНК-
полимеразой, так как она синтезирует
Часть IV. РНК не по ДНК-матрице, а по РНК
52 Информация (гл. 30). Клеточные же ферменты, синтези-
5'-GCGGCGACGCGCAGUUAAUCCCACAGCCGCCAGUUCCGCUGGCGGCAUUUU-3' мРНК
3'-CGCCGCTGCGCGTCAATTAGGGTGTCGGCGGTCAAGGCGACCGCCGTAAAA-5'
ДНК
5'-GCGGCGACGCGCAGTTAATCCCACAGCCGCCAGTTCCGCTGGCGGCATTTT-3'

Рис. 25.9. Последовательность основа- комплементарна матричной ДНК. Наибо-


ний мРНК комплементарна лее убедительный довод в пользу надежно-
последовательности матрич- сти копирования ДНК при транскрипции
ной ДНК. Показана часть по- получен при изучении последовательности
следовательности триптофано- оснований; оказалось, что последователь-
вого оперона. ность мРНК в точности комплементарна
последовательности матричной ДНК
(рис. 25.9).
рующие РНК, наоборот, представляют со-
бой ДНК-зависимые РНК-полимеразы. 25.9. Обычно в данном участке генома
транскрибируется только одна цепь ДНК
25.8. РНК-полимераза получает инструкции Транскрибируются ли обе цепи двухспи-
от ДНК-матрицы ральной матричной ДНК, или только од-
Подобно ДНК-полимеразам, описанным на? А priori кажется маловероятным, что
в предыдущей главе, РНК-полимераза ис- в одном и том же участке ДНК обе цепи
пользует информацию, содержащуюся кодируют функциональные белки. Один из
в ДНК-матрице. Первым доводом в поль- первых ответов на этот вопрос был полу-
зу этого утверждения послужили данные чен при использовании метода гибридиза-
о том, что нуклеотидный состав новосин- ции в опытах с Е. coli, зараженной фагом
тезированной РНК комплементарен соста- φХ174. Частицы фага φХ174 содержат
ву матричной цепи ДНК. Если в качестве одноцепочечную ДНК, которую называют
матрицы использовать синтетический по-
лидезоксирибонуклеотид poly(dT), содержа-
щий только остатки тимидиловой кислоты,
то в синтезируемую полирибонуклеотид-
ную цепь включается только один рибону-
клеозидтрифосфат - АТР. Продукт реак-
ции - полирибоаденилат [сокращенное обо-
значение poly(rA)]. Если в качестве ма-
трицы для РНК-полимеразы используется
сополимер с чередующимися основаниями
poly(dA-dT), то включаются UTP и АТР,
а в качестве продукта реакции образуется
poly(rA-rU). Нуклеотидный состав РНК,
синтезированной с использованием в каче-
стве матрицы одноцепочечной ДНК фага
φХ174, также свидетельствует о наличии
комплементарности между РНК-продук-
том и ДНК-матрицей (табл. 25.2). Экспери-
менты по гибридизации показывают, что
РНК, синтезированная РНК-полимеразой,

Таблица 25.2. Нуклеотидный состав РНК, синтезиро-


ванной на вирусной ДНК в качестве матрицы Рис. 25.10. Как показывает этот гибриди-
ДНК-матрица (плюс-цепь фага РНК-продукт
зационный эксперимент, толь-
φХ174) ко одна цепь РФ-ДНК фага
φХ174 используется в качестве
А 0.25 0,25 U матрицы при транскрипции.
Т 0,33 0,32 А
G 0,24 0,23 С
С 0,18 0,20 G 25. Информационная РНК
и транскрипция 53
Рис. 25.11. Электронная микрофотогра- φХ174 служит in vivo матрицей для тран-
фия, на которой виден процесс скрипции.
транскрипции. [Miller О. L., Точно так же только одна цепь таких ви-
Hamkalo В. A., Visualization of русов, как Т7, SP8 и α, транскрибируется in
RNA synthesis on chromosomes, vivo. В случае таких вирусов, как фаги Т4
Int. Rev. Cytol., 33, 1 (1972).] или λ, ситуация сложнее. В одних участках
генома матрицей служит одна цепь, в дру-
гих - другая. Такая же транскрипция с пере-
плюс-цепью. После того как плюс-цепь меной матрицы в различных группах генов
проникает в бактерию, синтезируется ком- происходит и в клетках Е. coli.
плементарная минус-цепь, и в результате
образуется кольцевая двухцепочечная мо- 25.10. РНК-полимераза Е. coli состоит из
лекула ДНК, называемая репликативной субъединиц
формой (РФ). Эта РФ-ДНК направляет РНК-полимераза Е. coli - очень большой
синтез мРНК, которая в свою очередь де- и сложный фермент. Масса целого фермен-
терминирует фаговые белки. Вскоре после та равна примерно 500 кДа. РНК-полиме-
заряжения E. coli фагом φХ174 в среду до- раза состоит из отдельных субъединиц
бавляли 32Р-фосфат; так получили ра- (табл. 25.3); это можно доказать, вызвав
диоактивную фаговую РНК. Ее выделили. диссоциацию фермента в концентрирован-
Кроме того, РФ-ДНК разделили на соста- ном растворе мочевины. Субъединичный
вляющие плюс- и минус-цепи, что нетруд- состав целого фермента, называемого го-
но сделать, поскольку они различаются по лоферментом,- α2ββ'σ. Как это видно из
нуклеотидному составу и, следовательно,
по плавучей плотности. Затем осуществили
Таблица 25.3. Субъединицы РНК-полимеразы E.coli
гибридизацию, с тем чтобы выяснить, ком-
плементарна ли новосинтезированная
мРНК плюс-цепи, или минус-цепи, или же Обозначение Число Масса, кДа .
обеим цепям. Был получен однозначный субъединицы субъединиц
результат: только минус-цепь РФ-ДНК
образовывала гибрид с меченой мРНК. α 2 40
Итак, только одна цепь РФ-ДНК фага β 1 155
β' 1 165
Часть IV. σ 1 95
54 Информация
рибонуклеазой, и определить в этих фраг-
ментах последовательность нуклеотидов.
Другой подход сводится к тому, чтобы ис-
следовать ряд мутантов с повышенной или
пониженной интенсивностью транскрипции
определенных генов. В результате таких
исследований было установлено, что про-
моторные участки состоят примерно из со-
рока пар оснований, что соответствует
фрагменту ДНК длиной примерно 140 А.
Как показал анализ различных промото-
ров Е. coli и фагов, функцию сигнала узна-
вания в основном выполняет последова-
тельность семи пар оснований, середина
которой находится на расстоянии пример-
но 10 нуклеотидов перед точкой, с которой
начинается кодирование мРНК (рис. 25.13).
Второй участок узнавания расположен на
Рис. 25.12. Электронная микрофотогра- расстоянии около 35 нуклеотидов перед
точкой начала мРНК; он также участвует
фия РНК-полимеразы-голо-
в первоначальном связывании РНК-поли-
фермента, связанного со мно-
меразы.
гими промоторными участка-
ми фрагмента ДНК фага Т7.
25.12. σ-Субъединица обеспечивает
[Williams R.C., Ргос. Nat. Acad.
узнавание промоторных участков РНК-
Sci., 74, 2313 (1977).]
полимеразой
Кор-фермент (α2ββ') РНК-полимеразы не
может начинать транскрипцию в промо-
последующего текста, после того как ини- торных участках. Для специфической ини-
циация синтеза РНК произошла, σ-субъе- циации необходим голофермент α2ββ'σ
диница отделяется от фермента. РНК-по-
Роль сигма-субъединицы была открыта
лимераза без σ-субъединицы называется
следующим образом. Если РНК-полимера-
минимальным ферментом или кор-фермен-
зу очищали хроматографией на колонке
том (α2ββ'). Каталитический участок РНК-
с фосфоцеллюлозой, то она была практи-
полимеразы находится в кор-ферменте.
Установлено, что β'-субъединица участвует
в связывании с ДНК-матрицей, а β-субъе-
диница - в связывании субстратов - рибону-
клеозидтрифосфатов. σ-Субъединица голо-
фермента участвует в выборе участка
инициации транскрипции.
Синтез РНК РНК-полимеразой Е. coli
происходит в три этапа, называемых
1) инициация, 2) элонгация и 3) термина-
ция. С этими процессами мы познакомим-
ся несколько ниже. Рис. 25.13. Промоторные последователь-
ности лактозного (А), галактоз-
25.11. Транскрипция инициируется на промо- ного (Б) и триптофанового (В)
торных участках матричной ДНК оперонов E.coli, фагов λ (Г)
Транскрипция начинается в определенных и φХ174 (Д) и вируса SV-40 (Е).
участках матричной ДНК, называемых Предполагаемая область го-
промоторами. Как РНК-полимераза нахо- мологии, так называемая по-
дит эти участки? Один из подходов к ре- следовательность Прибнова
шению этой проблемы состоит в том, (Pribnow), показана зеленым.
чтобы выделить те фрагменты, которые
голофермент РНК-полимеразы защищает 25. Информационная РНК
от расщепления панкреатической дезокси- и транскрипция 55
обе цепи фаговых ДНК-матриц, тогда как
голофермент транскрибирует асимметрич-
но одну цепь, как он это делает in vivo.
Сигма-субъединица обеспечивает специ-
4
фическую инициацию, снижая в 10 раз
сродство РНК-полимеразы к ДНК, не
содержащей промоторов. Кроме того, сиг-
ма-субъединица активирует узнавание про-
моторных последовательностей РНК-поли-
меразой. Наконец, сигма-субъединица уча-
Рис. 25.14. Разделение РНК-полимеразы ствует в раскрывании двойной спирали
на σ-субъединицу и кор-фер- ДНК, так чтобы одна из цепей могла слу-
мент (минимальный фермент; жить матрицей. При связывании голофер-
α2ββ') на колонке с фосфоцел- мента РНК-полимеразы расплетается при-
люлозой. мерно один виток спирали ДНК. Так
происходит подготовка фермента к обра-
зованию первой фосфодиэфирной связи но-
чески лишена активности при использова-
вой цепи РНК.
нии в качестве матрицы ДНК фага Т4, но После того как начинается синтез новой
сохраняла активность в опытах с ДНК из
цепи РНК, сигма-субъединица отделяется
тимуса теленка. Наряду с этим та же РНК-
от голофермента. Кор-фермент продол-
полимераза, очищенная центрифугирова- жает транскрибировать матрицу ДНК. Та-
нием в градиенте концентрации глицерола,
ким образом, функция голофермента —
была, напротив, весьма активна на обеих
поиск промотора и инициация, а функция
матрицах. Из этого наблюдения можно
кор-фермента - элонгация. Отделившаяся
было сделать вывод, что в препарате РНК-
сигма-субъединица присоединяется к дру-
полимеразы, очищенной на фосфоцеллю-
гой молекуле кор-полимеразы, чтобы уча-
лозе, не хватает какого-то фактора. Так оно
ствовать в инициации нового цикла тран-
и было (рис. 25.14). Активность фермента,
скрипции.
очищенного на фосфоцеллюлозе, значи- Инициация новых цепей РНК регули-
тельно увеличивается при добавлении дру- руется многими способами. Некоторые
гой фракции, элюирующейся с колонки. промоторные последовательности обеспе-
Этот стимулирующий фактор сам по себе чивают высокую эффективность инициа-
не обладает каталитической активностью. ции, другие менее эффективны. Кроме то-
Он был назван сигма (σ)-фактором. После- го, эффективность инициации регулируется
дующие эксперименты показали, что фер-
белками, которые связываются с самим
мент, очищенный на фосфоцеллюлозе,
промоторным участком или рядом с ним.
лишен σ-субъединицы, тогда как фермент,
Репрессоры блокируют транскрипцию,
очищенный в глицероле, содержит ее. Та-
препятствуя связыванию РНК-полимеразы,
ким образом, препарат, проявлявший мак-
а факторы положительной регуляции спо-
симальную активность при использовании собствуют инициации, облегчая связывание
в качестве матрицы ДНК фага Т4, предста- РНК-полимеразы. Эти важные регуля-
влял собой голофермент α2ββ'σ а кор-фер-
торные механизмы мы рассмотрим под-
мент α2ββ' был не в состоянии транскриби- робнее в гл. 28.
ровать эту ДНК. Добавление σ-субъеди-
ницы к кор-ферменту приводило к рекон-
струкции вполне активного голофермента. 25.13. Цепи РНК начинаются с pppG или
Кор-фермент обладал способностью тран- рррА
скрибировать ДНК тимуса теленка, так Большинство новосинтезированных цепей
как эта матрица содержит много одноце- РНК содержат своего рода ярлычок, ко-
почечных разрывов. РНК, синтезированная торый показывает, с чего начался их син-
кор-полимеразой in vitro, не соответствует тез. Новые цепи РНК имеют строго опре-
транскриптам, образующимся in vivo. деленную структуру 5'-конца: молекула
В частности, кор-фермент транскрибирует начинается либо с рррА, либо с pppG. В от-
личие от синтеза ДНК затравка в этом
Часть IV. случае не нужна. Цепи РНК могут обра-
56 Информация зовываться de novo.
в инкубационную смесь. Таким образом,
32
Р включается в молекулу РНК в начале
синтеза, а не в конце. Следовательно, рост
цепи РНК идет в направлении 5 ' — > 3 ' , как
при синтезе ДНК.
Кор РНК-полимеразы движется вдоль
цепи матричной ДНК в направлении 3'—>
—>5', так как матричная цепь антипарал-
Этот ярлычок на 5'-конце был открыт
лельна новосинтезированной цепи ДНК.
двумя способами. Было обнаружено, что
Одна и та же молекула РНК-полимеразы
цепи РНК включают 32Р, если инкуба-
синтезирует весь транскрипт - иными сло-
ционная смесь содержит меченный по
вами, транскрипция процессивна. По мере
γ-атому 32Р-АТР. Очевидно, что включен-
того как расплетается очередной участок
ная метка должна быть локализована на
ДНК, транскрибированный участок восста-
конце, так как только α-атом фосфора ну-
навливает свою двухспиральную конфор-
клеозидтрифосфата может участвовать
в образовании внутренних фосфодиэ- мацию. Максимальная скорость элонгации
составляет примерно 50 нуклеотидов
фирных мостиков РНК. Кроме того, при
щелочном гидролизе новосинтезированной в секунду.
Необходимо подчеркнуть, что РНК-по-
РНК образуются продукты трех типов: ну-
клеозиды, нуклеозид-2'-монофосфаты (или лимераза не обладает нуклеазной актив-
нуклеозид-3'-монофосфаты) и нуклеозид-
тетрафосфаты (рис. 25.15). Если в ка-
честве субстрата использовали γ-32Р-АТР,
образовывался аденозин-3'-фосфат-5'-три-
фосфат. γ-Атом фосфора этого нуклео-
зидтетрафосфата содержал метку. Анало-
гичный результат был получен с γ-32P-GTP.
Однако, если взять γ-меченный СТР или
UTP, радиоактивность не включается.
Следовательно, новообразованная цепь
РНК имеет трифосфатную группу на
5'-конце и свободную ОН-группу на 3'-конце.

25.14. Цепи РНК синтезируются


в направлении 5'—>3'
В каком направлении синтезируется РНК?
В направлении 5'—>3' или 3'—>5'? Два
противоположных механизма роста цепи
проиллюстрированы на рис. 25.16. При ро-
сте в направлении 5'—>3' трифосфатный
конец образуется в начале роста цепи,
а при росте 3'—>5' трифосфатный конец
появляется с последним включенным
остатком. Кинетика включения радиоак-
тивности в РНК, синтезированную из
γ-32P-GTP (или АТР), указывает, какая из
этих возможностей имеет место. Если в ка-
честве субстрата использовать γ-32P-GTP,
то отношение включения 32 Р к общему
включению нуклеотидов в продукт дости-
гает максимума очень быстро после сме- Рис. 25.15. Продукты щелочного гидроли-
шивания компонентов, а затем постепенно за цепи РНК, меченной с по-
снижается во времени. При этом общая ра- мощью γ-32Р-АТР.
диоактивность уже помеченной РНК не
снижается при последующем добавлении 25. Информационная РНК
большого избытка нерадиоактивного GTP и транскрипция 57
Рис. 25.16. Предполагаемое положение той области (рис. 25.17). Следовательно,
32
Р-метки в случае роста в на- РНК-транскрипт этой области самоком-
правлении 5'—>3' и 3'—>5'. На- плементарен, а это значит, что он способен
блюдаемое в действительности к спариванию оснований, приводящему
положение метки показывает, к образованию структуры шпильки
что РНК синтезируется в на- (рис. 25.18). Кроме того, новообразованные
правлении 5'—>3'. цепи РНК кончаются несколькими остат-
ками U, которые кодируются серией осно-
ваний А в АТ-богатой области ДНК-ма-
трицы. Одна или несколько подобных
ностью. В отличие от ДНК-полимеразы структурных особенностей заставляют
РНК-полимераза не проверяет правильно- РНК-полимеразу задержаться, сделать
сти новообразованной полинуклеотидной паузу, когда она сталкивается с таким сиг-
цепи. В связи с этим надежность тран- налом. В некоторых участках терминации
скрипции значительно ниже, чем надеж- новообразованные цепи РНК высвобо-
ность репликации. Частота ошибок при ждаются без участия дополнительных бел-
синтезе РНК составляет примерно одну ков. В других местах для терминации цепи
ошибку на 10 4 —10 5 нуклеотидов, что в 105 необходимо участие белка ρ (ро).
раз выше, чем при синтезе ДНК. Гораздо
более низкую надежность синтеза РНК
клетка обходит тем, что с одного гена син- 25.16. Белок ρ участвует в терминировании
тезируется много копий РНК-транскрип- транскрипции
тов. Тот факт, что терминирование транскрип-
ции в некоторых участках происходит
25.15. Матричная ДНК содержит стоп-сиг- с участием белка ρ, подтверждается сле-
налы для транскрипции дующими данными: молекулы РНК, син-
Терминирование транскрипции регулирует- тезированные in vitro в присутствии белка
ся так же тонко, как и инициирование. ρ, короче молекул, полученных в его отсут-
В матричной ДНК имеются стоп-сигналы, ствие. Например, РНК, синтезированная на
которые были расшифрованы путем срав- ДНК фага fd в присутствии белка ρ, имеет
нения различных последовательностей ос- коэффициент седиментации 10S, тогда как
нований в этих участках. Все они имеют РНК, синтезированная в отсутствие бел-
одну общую особенность: вслед за GC-бо- ка ρ,- 23S. Дополнительные сведения о дей-
гатой областью перед участком термина- ствии белка ρ были получены при добавле-
ции располагается АТ-богатая последова- нии этого фактора терминации в инкуба-
тельность. Отличительная особенность ционную смесь через различные промежут-
терминирующих последовательностей — ки времени после начала синтеза РНК.
симметрия второго порядка этой GC-бога- Если белок ρ добавляли через несколько
секунд, через 2 и 10 мин после инициации,
Часть IV. получали РНК с коэффициентами седимен-
58 Информация тации 13, 17 и 23S соответственно. Этот ре-
терминации, не требующий белка ρ (дает
23S-PHK). Следовательно, специфическая
терминация может происходить и в отсут-
ствие белка ρ. Однако белок ρ выявляет
дополнительные сигналы терминации, ко-
торые сама по себе РНК-полимераза узна-
вать не может.
Каким образом белок ρ вызывает терми-
нацию синтеза РНК по достижении опре-
деленных сигналов терминации? Одна из
возможностей состоит в том, что этот бе-
лок-тетрамер с массой 200 кДа - садится
на РНК и движется по направлению к мо-
лекуле РНК-полимеразы, останавливая ее
на участке терминации. Согласно этой мо-
дели, белок ρ вытесняет РНК-полимеразу
с 3'-конца РНК, что приводит к высвобож-
дению РНК-транскрипта. Интересно отме-
тить, что при терминировании транскрип-
ции белок ρ гидролизует АТР.
Как можно было предвидеть, термини-
рование транскрипции некоторых генов
контролируется. В ходе дальнейшего изло-
жения мы увидим, что бактериофаг λ син-
тезирует белки-антитерминаторы, обеспе-
чивающие возможность транскрипции
и экспрессии некоторых генов (разд. 28.11),
У Е. coli действует система регуляции с ис-
пользованием специализированных терми-
нирующих сигналов, называемых атте-
нюаторами, для обеспечения пищевых по-
требностей клетки (разд. 28.9).

Рис. 25.17. Последовательность ДНК,


соответствующая 3'-концу
trp-мРНК E.coli. Последова-
тельности оснований, пока-
занные желтым цветом, обла-
Рис. 25.18. Последовательность основа-
дают симметрией второго по-
рядка относительно оси, обо- ний 3'-конца мРНК, транскри-
значенной зеленым цветом. бированной с триптофанового
оперона E.coli. Возможно обра-
зование стабильной структуры
зультат свидетельствует о том, что матри- шпильки.
ца содержит но крайней мере три участка
терминации, чувствительных к белку ρ (они 25. Информационная РНК
дают 10S-, 13S- и 17S-PHK), и один участок и транскрипция 59
Рис. 25.19. Влияние фактора ρ на размер Второй тип процессинга - присоединение
транскрибируемых РНК. нуклеотидов к концам некоторых РНК.
Например, последовательность ССА при-
соединяется к 3'-концам молекул тРНК.
25.17. Многие молекулы РНК которые еще не обладают этой конце-
после транскрипции расщепляются вой последовательностью. У эукариот к
и химически модифицируются 3'-концу большинства молекул мРНК
Образование функционально активных мо- присоединяется длинная последователь-
лекул РНК (процессинг) продолжается пос- ность poly(A), а метилированный нуклео-
ле завершения транскрипции. У прокариот тид G (так называемый «колпачок», или
молекулы транспортных и рибосомных «кеп») - к 5'-концу (разд. 29.22).
РНК образуются путем расщепления и хи-
Модификации оснований и рибозных
мической модификации определенных ново- остатков представляют собой третий тип
синтезированных цепей РНК. Например, процессинга. У эукариот одна 2'-гидрок-
у E.coli три вида молекул рибосомных
сильная группа примерно на сто рибозных
РНК и одна молекула транспортной РНК остатков в рРНК ферментативно метили-
вырезаются из первичного РНК-тран- руется за счет S-аденозилметионина.
скрипта, который, кроме того, содержит У бактерий в рРНК метилируются не
спейсерные (разграничивающие) участки остатки рибозы, а основания. Особенно ин-
(рис. 25.20). Другие транскрипты содержат тересны необычные основания, которые
по несколько различных видов тРНК или встречаются во всех молекулах тРНК
несколько копий одной и той же тРНК. (разд. 27.3). Они образуются путем фер-
Нуклеазы, которые расщепляют и укорачи-
вают эти предшественники рРНК и тPHK,
действуют с высокой точностью. Напри-
мер, рибонуклеаза Р образует правильные
5'-концы всех молекул тРНК в клетке Е.
coli. Рибонуклеаза III вырезает предше-
ственники 5S-, 16S- и 23S-pPHK из первич-
ного транскрипта, расщепляя опреде-
ленные связи в двухспиральных шпи-
лечных областях. Молекулы мРНК у про-
кариот, наоборот, практически не претер-
певают модификации. Более того, многие
из них транслируются еще до того, как за-
канчивается их транскрипция. В то же вре-
мя некоторые вирусные мРНК (например, ментативной модификации обычных рибо-
мРНК фага Т7) расщепляются рибонуклеа- нуклеотидов, входящих в состав предше-
зой III раньше, чем начинается трансляция. ственника тРНК. Например, псевдоуриди-
лат и риботимидилат образуются путем
Часть IV. модификации уридиловых остатков после
60 Информация транскрипции.
транскрипцию совершенно различным пу-
тем. Рифамицин, образуемый бактериями
Streptomyces, и его полусинтетическое про-
изводное рифампицин специфически инги-
бируют инициацию синтеза РНК. Эти ан-
тибиотики не предотвращают связывания
РНК-полимеразы с ДНК-матрицей. Ри-
фампицин препятствует образованию пер-
вой фосфодиэфирной связи в цепи РНК.
При этом антибиотик практически не
влияет на элонгацию цепи. Столь высокая
избирательность ингибирующего действия
делает рифампицин ценным инструментом
в молекулярно-биологических исследова-
ниях. Например, его можно использовать
для подавления инициации новых цепей
РНК, не затрагивая транскрипции тех це-
пей, синтез которых уже начался. Ми-
шенью для рифампицина, видимо, служит
У эукариот все транскрипты подвер- β-субъединица РНК-полимеразы. Были вы-
гаются интенсивному процессингу. делены мутанты Е. coli, устойчивые к ри-
Расщепление и модификация предшествен- фампицину (так называемые rif-r-му-
танты). В некоторых из них электрофоре-
ников рРНК и тРНК напоминают соответ-
ствующие процессы у прокариот. Удиви- тическая подвижность β-субъединицы из-
тельное отличие состоит в том, что мРНК менена.
Механизм действия актиномицина D (со-
эукариот образуется путем расщепления
большого транскрипта и последующего сра-
щивания (сплайсинга) получающихся при
этом фрагментов. Это явление мы рассмо-
трим в одной из следующих глав
(разд. 29.21). У эукариот транскрипция
и трансляция происходят в различных ком-
партментах клетки. По всей вероятности,
процессинг РНК играет ключевую роль
в регуляции транспорта мРНК, рРНК
и тРНК из ядра в цитозолъ.

25.18. Антибиотики - ингибиторы транскрип-


ции: рифамицин и актиномицин
Антибиотики - очень интересные молекулы,
так как многие из них представляют собой держащего полипептиды антибиотика, про-
весьма специфические ингибиторы биоло- дуцируемого микроорганизмом Streptomy-
гических процессов. Актиномицин и рифа- ces) совершенно отличен от механизма дей-
мицин - два антибиотика, ингибирующих ствия рифампицина. Актиномицин D проч-
но связывается с двухспиральной ДНК и
за счет этого подавляет ее активность
в качестве матрицы для синтеза РНК.
Он состоит из двух идентичных цикли-
ческих пептидов, соединенных феноксазо-
новой системой колец (рис. 25.22). Состав
Рис. 25.20. При расщеплении этого пер- этих циклических пептидов необычен: они
вичного транскрипта обра- содержат саркозин, метилвалин и D-валин.
зуются молекулы 5S, 16S и 23S Кроме того, в их молекуле имеется эфир-
рРНК и одна молекула тРНК.
Спейсерные участки закра- 25. Информационная РНК
шены желтым цветом. и транскрипция 61
ра образования новых РНК как в прока-
риотических, так и в эукариотических клет-
ках.
Недавно структура кристаллического
комплекса одной молекулы актиномицина
с двумя молекулами дезоксигуанозина бы-
ла изучена на уровне атомного разрешения
(рис. 25.23). В этом комплексе феноксазо-
новое кольцо актиномицина зажато между
двумя гуаниновыми кольцами. Один из
циклических пептидов расположен над фе-
ноксазоновым кольцом, другой - под ним.
Каждый из этих пептидов образует
сильные водородные связи с 2-аминогруп-
пой гуанинового остатка. Между антибио-
тиком и нуклеозидами осуществляется
много энергетически выгодных вандер-
ваальсовых взаимодействий. Важная осо-
бенность этого комплекса состоит в том,
что он почти симметричен. Ось симметрии
второго порядка проходит вдоль линии,
Рис. 25.21. Пространственная модель соединяющей средние атомы О и N фенок-
структуры актиномицина D. сазонового кольца. Конформация всего
Феноксазоновое кольцо обо- комплекса показывает, что актиномицин
значено красным цветом, ци- узнает в ДНК последовательность основа-
клические пептиды - желтым. ний GpC. Обратите внимание, что если
(По рисунку, любезно пред- в одной цепи ДНК имеется последователь-
оставленному д-ром Henry ность 5'GpC3', то в комплементарной цепи
Sobell.) последовательность будет 3'CpG5'. По-ви-
димому, актиномицин интеркалирует
ная связь между гидроксильной группой в ДНК между двумя GC-парами основа-
треонина и карбоксильной группой метил- ний и взаимодействует с остатками G в ос-
валина. новном таким же образом, как и в ком-
Актиномицин D прочно связывается плексе с динуклеотидом. Согласно этой
с двухспиральной ДНК, но не с одноцепо- модели, циклические пептидные остатки
чечными ДНК или РНК, двухспиральной локализованы в малой бороздке спирали
РНК или РНК-ДНК-гибридами. Кроме ДНК. Главная особенность этой модели
того, связывание актиномицина с ДНК за- состоит в том, что симметрия молекулы
метно усиливается с увеличением содержа- актиномицина соответствует симметрии
ния остатков гуанина. Спектроскопические определенной последовательности в ДНК1.
и гидродинамические исследования ком-
плексов актиномицина D с ДНК свиде- 25.19. Разработаны совершенные методы
тельствуют о том, что феноксазоновое определения последовательности
кольцо актиномицина проникает в ДНК нуклеотидов в РНК
между двумя соседними парами основа- Высокая разрешающая способность мето-
ний. Такой способ связывания называется да гель-электрофореза дает возможность
интеркаляцией (рис. 25.23). При низких быстро определять последовательности ну-
концентрациях актиномицин D ингибирует клеотидов как в молекулах РНК, так и
транскрипцию, не оказывая сколько-нибудь
существенного влияния на репликацию 1
Изложенная точка зрения на структуру ком-
ДНК. На синтез белка непосредственно ак- плекса актиномицина D с ДНК не является об-
тиномицин также не влияет. Благодаря щепризнанной. Существует и другая гипотеза,
этому актиномицин D широко использо- согласно которой актиномицин не интеркали-
вался в качестве специфического ингибито- рует в ДНК, а связывается в малой бороздке,
причем структура комплекса актиномицина D
с динуклеотидом GpC не отражает структуры
Часть IV, его комплексов с протяженными молекулами
62 Информация ДНК. - Прим. перев.
Рис. 25.22. Структура актиномицина D. тарной ДНК. Но как получить комплемен-
в молекулах ДНК. Для этого 3'- или 5'-ко- тарные фрагменты ДНК? Один из мето-
нец цепи РНК метят радиоактивной груп- дов состоит в следующем. С помощью
пой. Затем меченую цепь частично расще- рестрикционных эндонуклеаз фрагменти-
пляют по одному из четырех оснований, руют большие молекулы ДНК. Затем ме-
тодом гибридизации идентифицируют ре-
чтобы получить набор фрагментов. Специ-
фическое (или избирательное) расщепление стрикционные фрагменты, содержащие по-
можно провести с помощью ферментов, следовательность, комплементарную ис-
специфичных к определенному основанию следуемой РНК. В другом случае компле-
ментарную ДНК синтезируют фермента-
эндонуклеаз (табл. 25.4). Например, рибо-
нуклеаза Т1 гидролизует РНК с 3'-стороны тивно по РНК-матрице с помощью обрат-
ной транскриптазы из опухолеродных ви-
остатков G. Кроме того, РНК можно спе-
русов (разд. 30.19). Именно так была рас-
цифически расщепить с помощью химиче- шифрована полная последовательность 576
ской модификации одного из четырех осно- нуклеотидов мРНК, колирующей β-цепь
ваний. Затем остов расщепляют в месте,
гемоглобина человека.
где расположено модифицированное осно-
вание. После этого четыре набора фраг-
ментов разделяют гель-электрофорезом Заключение
и последовательность оснований РНК чи- Поток генетической информации в нор-
тают непосредственно с радиоавтографа мальных клетках происходит в направле-
(рис. 25.24), как и в случае ДНК нии: ДНК —> РНК —> белок. Синтез РНК
(разд. 24.28). Эти подходы позволяют лег- по ДНК-матрице называется транскрип-
ко определять в молекулах РНК последо- цией, а синтез белка по РНК-матрице -
вательность 100-200 нуклеотидов. трансляцией. Существует три типа моле-
Другая стратегия сводится к тому,
чтобы определять последовательность ну- 25. Информационная РНК
клеотидов не в самой РНК, а в комплемен- и транскрипция 63
Таблица 25.4. Ферменты, используемые при определении последовательности нуклеотндов в РНК 1)

Фермент Тип активности Субстрат Продукты

Рибонухлеаза T1 Эндо- и экзонуклеаза


Панкреатическая рибонукле- Эндо- и экзонуклеаза
аза
Рибонуклеаза U2 Эндо- и экзонуклеаэа

Рибонуклеаза I Эндо- и экзонуклеаза


(из P. polycephalum) N = A, G, U, но не С
Щелочная фосфатаза (из Е. соli) Фосфатаза

Фосфодиэстepaзa из селезен- Экзонуклеаза


ки крупного рогатого скота

Фосфодиэстераза змеиного Экзонуклеаза


яда
Полинуклеотидкиназа Киназа

1)
В эту таблицу необходимо внести еще один фермент - РНК-лигазу. С его помощью осуществляется
включение метки в 3'-концы РНК: —XpY + pCp —> XpYpCp (pCp содержит 32Р-метку).- Прим. перев.

Рис. 25.23. Предполагаемая структура ся с малой бороздкой спирали


комплекса актиномицина D ДНК. Между актиномицином
с ДНК. Феноксазоновое коль- D и соседними гуанинами воз-
цо актиномицина (показано никает несколько водородных
красным цветом) интеркали- связей. Ось симметрии субъе-
рует между двумя GС-парами диниц актиномицина D совпа-
ДНК (показаны синим цветом). дает с осью симметрии сахаро-
Циклические пептиды актино- фосфатного остова и последо-
мицина D (желтые) связывают- вательности оснований ДНК.
(По рисунку, любезно пред-
Часть IV. оставленному д-ром Henry
64 Информация Sobell.)
чаются среди мРНК; они могут содержать
более 5000 нуклеотидов. Последователь-
ность нуклеотидов в длинных цепях РНК
можно определить, расщепляя их и разде-
ляя фрагменты гель-электрофорезом.
Все клеточные РНК синтезирует РНК-
полимераза в соответствии с последова-
тельностью ДНК-матрицы. Активиро-
ванными промежуточными продуктами
служат рибонуклеозидтрифосфаты. Синтез
РНК, как и синтез ДНК, происходит в на-
правлении 5'—>3'. РНК-полимераза отли-
чается от ДНК-полимеразы тем, что не
нуждается в затравке и не обладает нук-
леазными активностями. Еще одно отли-
чие состоит в том, что ДНК-матрица при
синтезе РНК полностью сохраняется, тог-
да как при синтезе ДНК она сохраняется
наполовину. РНК-полимераза Е. coli имеет
субъединичную структуру α2ββ'σ и массу,
достигающую 500 кДа. Кор-фермент имеет
состав α2ββ'. Сигма-субъединица увеличи-
вает скорость и специфичность транскрип-
ции, так как она обеспечивает узнавание
РНК-полимеразой сигналов начала тран-
скрипции в матричной ДНК. Связывание
РНК-полимеразы с такими промоторными
участками вызывает локальное расплета-
ние матрицы, что создает условия для
образования первой фосфодиэфирной свя-
зи. Цепи РНК начинаются с pppG или
рррА. После инициации синтеза новой це-
пи сигма-субъединица отделяется от голо-
Рис. 25.24. Радиоавтограф фрагмента фермента. Терминация транскрипции так
5S-PHK дрожжей. 3'-конец по- же тонко регулируется, как и инициация.
мечен радиоактивной меткой. Матричная ДНК содержит стоп-сигналы
Четыре дорожки соответ- транскрипции. Некоторые из этих сигналов
ствуют расщеплению по остат- узнает белок ρ. Некоторые специфические
кам G, А, С и U. На геле можно ингибиторы могут блокировать транскрип-
прочитать последовательность цию. Например, антибиотик рифампицин
5'-CGAAACUCAGGUGCUG- ингибирует инициацию синтеза РНК, а ак-
CAAUC-3'. [Peattie D. А., Ргос. тиномицин D блокирует элонгацию РНК.
Nat. Acad. Sci., 76, 1762 (1979).] Многие молекулы РНК подвергаются по-
сле транскрипции расщеплению и химиче-
ской модификации (например, метили-
руются). У прокариот молекулы тРНК
и рРНК подвергаются интенсивному про-
кул РНК: информационная РНК (мРНК), цессингу, а молекулы мРНК почти не пре-
транспортная РНК (тРНК) и рибосомная
терпевают модификаций. У эукариот все
РНК (рРНК). Все эти РНК одноцепо-
транскрипты сильно модифицируются.
чечные. Транспортная РНК и рибосомная
РНК содержат протяженные двухспи-
ральные участки, которые образуются при
складывании цепи в шпильки. Самыми ма-
ленькими молекулами РНК являются
тРНК; они содержат около 75 нуклеоти- 25. Информационная РНК
дов. Самые длинные молекулы РНК встре- и транскрипция 65
РЕКОМЕНДУЕМАЯ Инициирование транскрипции Wu A.M., Platt T., 1978. Transcription
ЛИТЕРАТУРА Hayashi M., Hayashi M.N., termination: nucleotide sequence at 3'
С чего начать Spiegelman S., 1963. Restriction of in end of tryptophan operon in
Miller О. 1973. The visualization of vivo genetic transcription to one of the Escherichia coli, Proc. Nat. Acad. Sci.,
genes in action, Sci. Amer, 228(3), complementary strands of DNA, Proc. 75, 5442-5446.
34-42. Nat. Acad Sci., 50, 664-672.
Spiegelman S., 1964. Hydrid nucleic Taylor K., Hradecna Z., Szybalski W., Антибиотики - ингибиторы синтеза
acids, Sci. Amer., 210(5), 48-56. 1967. Asymmetric distribution of the РНК
Chamberlin M.J., 1976. RNA transcribing regions on the com- Goldberg J.H., Friedman P.A., 1971.
polymerase: an overview. In: Losick R. plementary strands of coliphage Antibiotics and nucleic acids, Ann.
and Chamberlin M. (eds.), RNA λ DNA, Proc. Nat. Acad. Sci., Rev. Biochem., 40, 775-810.
Polymerase, pp. 17-67, Cold Spring 57, 1618-1625. Sobell H.M., 1974. How actinomycin
Harbor Laboratory. Burgess R.R., Travers A.A., Dunn J.J., binds to DNA. Sci. Amer., 231(2),
Открытие информационной РНК Bautz E.K.F., 1969. Factor stimulating 82-91.
Jacob F., Monod J., 1961. Genetic transcription by RNA polymerase,
regulatory mechanisms in the synthesis Nature, 221, 43-46. (Открытие сигма- Процессинг РНК
of proteins, J.Mol.Biol., 3, 318-356. фактора.) Perry R.P., 1976. Processing of RNA,
Brenner S., Jacob F., Meselson M., Gilbert W., 1976. Starting and stopping Ann. Rev. Biochem., 45, 605-630.
1961. An unstable intermediate sequences for the RNA polymerase. In: Steitz J.A., Young R.A., 1978.
carrying information from genes to Losick R. and Chamberlin M. (eds.), Complementary sequences 1700
ribosomes for protein synthesis, RNA Polymerase, pp. 193-205, Cold nucleotides apart from a ribonuclease
Nature, 190, 576-581. Spring Harbor Laboratory. III cleavage site in Escherichia coli
Hall B.D., Spiegelman S., 1961. Reznikoff W.S., Abelson J . N . , 1978. ribosomal precursor RNA, Proc. Nat.
Sequence complementarity of T2-DNA The lac promoter. In: Miller J. H. and Acad. Sci., 75, 3593-3597.
and T2-specific RNA, Proc. Nat. Acad. Reznikoff W. S. (eds.), The Operon, Altman S., 1978. Biosynthesis of tRNA.
Sci., 47, 137-146. pp. 221-243, Cold Spring Harbor In: Atlman S. (ed.), Transfer RNA,
РНК-полимераза Laboratory. (Сопоставляются 29 про- pp. 48-77, MIT Press.
Losick R., Chamberlin M. (eds.), 1976. моторных последовательностей.)
RNA Polymerase, Cold Spring Harbor Определение последовательности ос-
Laboratory. (Книга содержит ряд Терминирование транскрипции нований в РНК
превосходных статей.) Adhya S., Gottesman M., 1978. Control Peattie D.A., 1979. Direct chemical
Chamberlin M.J., 1974. The selectivity of transcription termination, Ann. Rev. method for sequencing RNA, Proc.
of transcription, Ann. Rev. Biochem., Biochem., 47, 967-996. Nat. Acad. Sci., 76, 1760-1764.
43, 721-776. Das A., Merril C., Adhya S., 1978. Simoncsits A., Brownlee G.G.,
Travers A., 1976. RNA polymerase Interaction of RNA polymerase and Brown R.S., Rubin J.R., Guilley H.,
specificity and the control of growth, rho in transcription termination: 1977. New rapid gel sequencing meth-
Nature, 263, 641-646. coupled ATPase, Proc. Nat. Acad. Sci., od for RNA, Nature, 269, 833-836.
75, 4828-4832.

Вопросы и задачи 4. Каким образом кордицепин


(3'-дезоксиаденозин) блокирует
1. Сравните ДНК-полимеразу I синтез РНК?
и РНК-полимеразу Е. coli по 5. Какие продукты должны полу-
каждому из следующих свойств. читься при частичном гидроли-
а) Субъединичная структура. зе олигорибонуклеотида
б) Активированные предшественники. 5'-pGCAGUACUGUC-3'
в) Направление элонгации цепи. следующими ферментами:
г) Нуклеазные активности. а) панкреатической рибонуклеазой,
д) Сохранение матрицы. б) рибонуклеазой Т1,
е) Потребность в затравке. в) рибонуклеазой U2,
ж) Энергетика реакции элонгации. г) рибонуклеазой I из Physarum!
2. Напишите последовательность 6. Исчерпывающий гидролиз оли-
молекулы мРНК, синтезиро- горибонуклеотида панкреатиче-
ванной на матричной цепи ДНК со сле- ской рибонуклеазой дает следующие про-
дующей последовательностью: дукты: Ср 2Up, AGCp и GAAUp. Гидролиз
того же олигонуклеотида рибонуклеазой
5'-ATCGTACCGTTA-3'. T1 дает AAUp, UAGp и CCUGp. Какова
его последовательность?
3. РНК легко гидролизируется Дополнительные вопросы см.: Wood W. В.,
щелочью, а ДНК нет. Почему? Wilson J.H., Benbow R.M., Hood L.E.
Biochemistry: A Problem Approach, ens. 16,
17 Benjamin, 1974, chs. 16,17.
ГЛАВА 26 Все подобные попытки закончились не-
удачей. Физико-химические соображения
Генетический код и также не дают никаких оснований счи-
тать это предположение правдопо-
зависимость между добным.»
генами и белками Крик отметил, что РНК не имеет вы-
пуклых гидрофобных поверхностей, позво-
В главе 25 была описана роль информа- ляющих отличить валин от лейцина и изо-
ционной РНК в качестве посредника ме- лейцина, и не содержит соответствующим
жду геном и его полипептидным продук- образом расположенных заряженных
том. В настоящей главе мы рассмотрим групп, чтобы различать положительно
дальнейший поток информации от гена и отрицательно заряженные боковые цепи
к белку. В центре внимания находится ге- аминокислот. Затем Крик предлагает прин-
нетический код, связывающий последова- ципиально иной механизм для узнавания
тельность оснований ДНК (или соответ- мРНК:
ствующего транскрипта) с последователь- «РНК - это прежде всего последователь-
ностью аминокислот в белке. Код универ- ность участков, способных образовывать
сален для всех организмов. Он восхищает водородные связи. Поэтому независимо
своей простотой. Три основания, соста- от того, что именно связывается с мат-
вляющие кодон, детерминируют одну ами- рицей специфичным образом, связыва-
нокислоту. Кодоны считываются последо- ние, очевидно, происходит путем образо-
вательно молекулами транспортных РНК вания водородных связей. Следователь-
(тРНК), играющих при синтезе белка роль но, естественно предположить, что ами-
адаптеров. Полная расшифровка генети- нокислоты переносятся к матрице адап-
ческого кода в 60-х годах - одно из вы- торными молекулами и что именно
дающихся достижений современной био- адаптор соответствует РНК. В простей-
логии. шем случае потребуется 20 адаптеров,
по одному на каждую аминокислоту».
26.1. Транспортная РНК - адапторная Эта новаторская гипотеза вскоре стала
молекула в синтезе белка доказанным фактом. Роль адаптера в бел-
Мы уже видели, что мРНК служит матри- ковом синтезе играет тРНК. Структура
цей для синтеза белка. Каким образом она этих замечательных адапторных молекул
осуществляет соединение аминокислот и реакции, в которых они участвуют, рас-
в правильном порядке? В 1958 г. Фрэнсис сматриваются подробно в следующей гла-
Крик (Francis Crick) писал: ве. Здесь же достаточно отметить, что
«Одно из первых предположений, до- в тРНК имеются место прикрепления ами-
вольно наивных, состояло в том, что нокислот и участок узнавания матрицы
РНК будет принимать конфигурацию, (рис. 26.1 и 26.2). Молекула тРНК перено-
способную образовать двадцать раз- сит определенную аминокислоту в активи-
личных «полостей», по одной для боко- рованной форме к месту синтеза белка.
вой цепи каждой из двадцати аминокис- Карбоксильная группа аминокислоты свя-
лот. Если бы это было так, можно было зана эфирной связью с 3'-гидроксильной
бы попробовать проиграть эту задачу
в обратном направлении, т.е. найти не-
обходимую конфигурацию РНК, пы- 26. Генетический код.
таясь воссоздать форму этих полостей. Зависимость гены-белки 67
или 2'-гидроксильной) группой рибозного
остатка, расположенного на 3'-конце цепи
тРНК. Во время синтеза белка связанная
аминокислота может перемешаться с 2'- на
3'-гидроксильную группу и обратно. При-
соединение аминокислоты к тРНК с обра-
зованием аминоацил-тРНК катализируется
особым ферментом, называемым аминоа-
цил-тРНК—синтетазой (или активирую-
щим ферментом). Эта реакция этерифика-
ции идет за счет энергии АТР. Для каждой
из 20 аминокислот имеется по крайней ме-
ре одна специфическая синтетаза. Участок
узнавания матрицы в тРНК представляет
собой последовательность из трех основа- Рис. 26.1. Присоединение аминокислоты
ний, называемую антикодоном (рис. 26.2). (показана красным цветом)
Антикодон тРНК узнает кодон, т. е. ком- к молекуле тРНК. Аминокис-
плементарную последовательность из трех лота связана эфирной связью
оснований в мРНК. с 3'-гидроксильной группой
концевого аденозина РНК.
Молекула тРНК, несущая ко-
26.2. Аминокислоты кодируются группами
валентно привязанную амино-
из трех оснований, начиная со строго
кислоту, называется аминоа-
определенной точки
цил-тРНК или «нагруженная»
Генетический код связывает последова-
тРНК, а тРНК без аминокис-
тельность оснований в ДНК (или в со-
лоты - «ненагруженная».
ответствующих транскриптах) и последова-
тельность аминокислот в белках. К 1961 г.
благодаря экспериментам Фрэнсиса Крика,
Сиднея Бреннера (Francis Crick, Sydney
Brenner) и других исследователей были
установлены следующие свойства генетиче-
ского кода.
1. Чему равно кодирующее отношение?
Поскольку в ДНК имеется четыре вида ос-
нований, то при кодировании одной ами-
нокислоты одним основанием могло бы
кодироваться всего лишь четыре амино-
кислоты. При кодировании одной амино-
кислоты двумя основаниями кодировалось
бы 16 аминокислот (4•4=16), а при коди-
ровании тремя основаниями - 64 аминокис-
лоты (4•4•4 = 64). Белки состоят из двад-
цати аминокислот основного набора. Из
этого несложного подсчета было очевидно,
что для кодирования одной аминокислоты,
видимо, необходимы три или более осно-
ваний. Генетические эксперименты показа-
ли, что на самом деле одну аминокислоту
кодирует группа из трех оснований. Эта
группа оснований называется кодоном.
2. Является ли код перекрывающимся?
В случае непрерывающегося триплетного Рис. 26.2. Схематическое изображение
кода каждая группа из трех оснований ко- аминоацил-тРНК. Показаны
участок прикрепления амино-
Часть IV. кислоты и антикодон (участок
68 Информация узнавания матрицы).
дирует только одну аминокислоту, тогда Первые две аминокислоты в этой полипеп-
как в случае полностью перекрывающегося тидной цепи будут нормальными, но
триплетного кода АБВ кодирует первую остальная последовательность оснований
аминокислоту, БВГ-вторую, ВГД-третью будет прочитана неправильно, так как в ре-
и т.д. зультате делеции Ж произошел сдвиг рамки
Эту дилемму удалось решить путем считывания. Теперь предположим, что
определения последовательности амино- между Е и Ж добавилось основание Ш:
кислот в мутантах. Предположим, что ос-
нование В мутировало в В'. Если код не
перекрывается, изменится только одна
аминокислота. При полностью перекры-
вающемся коде мутация В в В' приведет
к изменению аминокислот 1, 2 и 3. Изуче-
ние последовательности аминокислот бел-
ка оболочки мутантов вируса табачной мо- Эта вставочная мутация также нарушает
заики показало, что у этих мутантов рамку считывания, начиная с кодона ами-
измененной обычно оказывалась только нокислоты 3. В действительности генетиче-
одна аминокислота. Напомним также, что ские исследования вставочных и деле-
как уже говорилось при обсуждении ано- ционных мутантов позволили выяснить
мальных гемоглобинов в гл. 5, и в этом многие свойства генетического кода,
случае у большинства мутантов происхо- 4. Как уже было сказано выше, суще-
дило изменение только одной аминокис- ствует 64 возможных триплета оснований
лоты. Отсюда был сделан вывод, что гене- и 20 аминокислот. Соответствует ли ка-
тический код не перекрывается: ждой из 20 аминокислот только один три-
плет, или некоторые аминокислоты коди-
руются более чем одним триплетом? Гене-
тические исследования показали, что боль-
шинство из 64 триплетов кодируют амино-
кислоты. В последующих биохимических
3. Как происходит правильное считыва- исследованиях было установлено, что 61
ние группы из трех оснований? A priori од- триплет из 64 кодирует определенные ами-
на из возможностей состоит в том, что нокислоты. Таким образом, для большин-
одно из четырех оснований (оно обозначе- ства аминокислот имеется более одного
но Q) служит «запятой» между группами кодового слова. Другими словами, генетиче-
по три основания: ский код вырожден.
. . . QAБBQГДEQЖЗИQКЛMQ. . .
26.3. Расшифровка генетического кода:
синтетические РНК могут служить
Оказалось, что это не так. Последователь- информационными РНК
ность оснований читается последователь- Каково соотношение между 64 видами ко-
но, начиная со строго определенной точки: довых слов и 20 аминокислотами? В прин-
ципе на этот вопрос можно получить пря-
мой ответ, если сравнить последователь-
ность аминокислот в каком-либо белке
с соответствующей последовательностью
оснований его гена или мРНК. Однако
в 1961 г. этот подход был совершенно не-
Запятых в коде нет. Предположим, что
доступен, так как о последовательностях
в результате мутации произошла делеция
оснований в генах и молекулах мРНК ни-
основания Ж:
чего не было известно. Тогда казалось, что
проблема генетического кода не может
быть решена в близком будущем, но вне-
запно ситуация изменилась. Маршалл Ни-

26. Генетический код.


Зависимость гены-белки 69
ренберг (Marshall Nirenberg) обнаружил, Ниренберга была бесклеточная система
что добавление полиуридилата [ p o l y ( U ) ] синтеза белка, зависящая от добавления
в бесклеточную систему синтеза белка при- мРНК.
водит к синтезу полифенилаланина. Оче- Другим важнейшим компонентом в этом
видно, poly(U) выполнил функцию инфор- эксперименте был синтетический полири-
мационной РНК. Первое кодовое слово бонуклеотид poly(U). Poly(U) синтезирова-
было расшифровано: UUU кодирует фени- ли с помощью полинуклеотид-фосфори-
лаланин Этот замечательный эксперимент лазы - фермента, открытого в 1955 г. Ма-
указал путь к полной расшифровке генети- рианной Грюнберг-Манаго и Северо Очоа
ческого кода. (Marianne Grunberg-Manago, Severo Ochoa).
Обсудим более подробно этот эпо- Этот фермент катализирует синтез полири-
хальный эксперимент. В качестве двух ос- бонуклеотидов из рибонуклеозиддифосфа-
новных компонентов были использованы тов:
бесклеточная система, активно синтезиро-
(РНК) n + Рибонуклеозиддифосфат
вавшая белок, и синтетический полирибо-
(РНК) n + 1 + Pi.
нуклеотид, сыгравший роль информацион-
ной РНК. Бесклеточная система синтеза Полинуклеотид-фосфорилаза и РНК-поли-
белка была получена из Е. coli следующим мераза катализируют совершенно раз-
образом. Бактериальные клетки осторожно личные реакции. В приведенной реакции
разрушали, перемалывая с тонко измель- активированными предшественниками слу-
ченным порошком окиси алюминия, чтобы жат рибонуклеозиддифосфаты, а не три-
получить клеточный сок. Затем обрывки фосфаты. Продукт реакции - ортофосфат,
клеточной стенки и клеточной мембраны а не пирофосфат. Следовательно, равнове-
удаляли центрифугированием. В результа- сие в реакции не может быть сдвинуто
те получали экстракт, содержащий ДНК, вправо в результате гидролиза пирофосфа-
мРНК, тРНК, рибосомы, ферменты и дру- та. В самом деле, in vivo равновесие сдви-
гие клеточные компоненты. При добавле- нуто в сторону распада РНК, а не ее син-
нии ATP, GTP и аминокислот в этой бес- теза. Принципиальное отличие состоит
клеточной системе синтезировался белок. в том, что полинуклеотид-фосфорилаза не
По крайней мере одна из добавленных использует матрицы. Состав РНК, синте-
аминокислот была радиоактивной, что да- зированной этим ферментом, определяется
вало возможность обнаружить ее включе- соотношением рибонуклеотидов в инкуба-
ние в белок. Эту смесь инкубировали при ционной смеси, а последовательность близ-
37°С примерно в течение 1 ч. Затем доба- ка к случайной. Благодаря этому полину-
вляли трихлоруксусную кислоту, чтобы клеотид-фосфорилаза оказалась ценней-
остановить реакцию и осадить белки. При шим инструментом в экспериментах по
этом свободные аминокислоты оставались расшифровке генетического кода. Напри-
в надосадочной фракции. Осадок промыва- мер, poly(U) синтезировали, инкубируя
ли и просчитывали его радиоактивность, в присутствии фермента раствор высокой
определяя таким образом сколько меченой
аминокислоты включилось в новосинтези-
рованный белок. Важная особенность этой
системы состоит в том, что синтез белка
можно остановить добавлением дезоксири-
бонуклеазы, разрушающей матрицы для
синтеза новых мРНК. Поскольку та
мРНК, которая уже имелась в смеси ко
времени добавления дезоксирибонуклеазы,
лабильна, синтез белка можно прекратить
в течение нескольких минут. Затем Нирен-
берг обнаружил, что синтез белка возобно-
вляется при добавлении неочищенной Рис. 26.3. Синтез белка в бесклеточной
фракции мРНК. Таким образом, в руках системе останавливается через
несколько минут после доба-
вления дезоксирибонуклеазы
Часть IV. и возобновляется при добавле-
70 Информация нии мРНК.
концентрации UDP. Сополимеры двух ри- Таблица 26.1. Ожидаемая встречаемость триплетов
бонуклеотидов, например U и А, со слу- в случайном сополимере U (0,76) и G (0,24)
чайной последовательностью готовили,
также инкубируя UDP и АТР с этим Триплет Вероятность Относи-
ферментом. тельная
Различные синтетические рибонуклео- встречае-
тиды вводили в бесклеточную систему син- мость, %
теза белка и измеряли включение меченно-
го 14С L-фенилаланина. Результаты оказа-
лись поразительными: UUU 0,76•0,76•0,76=0,439 100
UUG 0,75•0,24•0,24 = 0,139 31,6
UGU 0,76•0,24•0,76 = 0,139 31,6
GUU 0,24•0,76•0,76 = 0,139 31,6
Добавленный 14
С, имп./мин UGG 0,76•0,24•0,24 = 0,0438 10,0
полинуклеотид GUG 0,24•0,76•0,24 = 0,0438 10,0
GGU 0,24•0,24•0,76 = 0,0438 10,0
GGG 0,24•0,24•0,24 = 0,0138 3,1
Контроль 44
Poly(A) 50 различных триплетов: UUU, UUG, UGU,
Poly(С) 38
Poly(U) GUU, UGG, GUG, GGU и GGG. Относи-
39800
тельную частоту этих триплетов можно
легко вычислить, исходя из молярного со-
Тот же эксперимент был проделан отношения U и G в сополимере. Оно со-
с различными 14С-аминокислотами в ка- ставляло 0,76:0,24 (табл. 26.1). Относи-
ждой инкубационной смеси. Оказалось, что тельное включение различных аминокис-
poly(А) вызывает синтез полилизина, лот в присутствии этой матрицы приведе-
a poly(С) - синтез полипролина. Так было но в табл. 26.2. В наибольшей степени
расшифровано три кодовых слова: включался, как и можно было предпола-
гать, фенилаланин, так как триплет UUU
встречался чаще всего. Затем шли валин,
лейцин и цистеин. Уровень их включения
Кодовое слово Аминокислота составлял чуть больше трети от включения
фенилаланина, что соответствует вычис-
ленной частоте встречаемости триплетов,
UUU Фенилаланин содержащих два U и одно G. Включение
ААА Лизин других аминокислот было очень низким.
ССС Пролин Отсюда был сделан вывод, что валин, лей-
цин и цистеин кодируются кодонами, содер-

Кодовое слово GGG невозможно было Таблица 26.2. Включение аминокислот в присутствии
расшифровать таким же образом, потому случайного сополимера U (0,76) и G (0,24)
что poly (G) не работает в качестве ма-
трицы. Возможно, это объясняется тем,
что он образует трехцепочечную спираль- Аминокислота Относитель- Состав соот-
ную структуру. Полирибонуклеотиды, ное включе- ветствующего
образующие протяженные участки с упоря- ние, % кодона
доченной структурой, не эффективны в ка-
честве матриц для синтеза белка.
Фенилаланин 100 UUU
Валин 37 2U, 1G
26.4. Состав кодонов многих аминокислот Лейцин 36 2U, 1G
был определен с помощью сополимеров Цистеин 35 2U, 1G
в качестве матриц Триптофан 14 1U, 2G
Для дальнейшего изучения генетического Глицин 12 1U, 2G
кода были использованы в качестве ма-
триц полирибонуклеотиды, состоящие из
оснований двух типов. Например, слу- 26. Генетический код.
чайный сополимер U и G содержит восемь Зависимость гены-белки 71
жащими 2U и 1G, а триптофан и глицин С помощью методов органической хи-
кодируются кодонами, которые содержат мии и биохимии были синтезированы все
1U и 2G. 64 тринулеотида. Для каждого тринуклео-
Эксперименты того же типа проводили тида было проверено связывание молекул
и с другими случайными сополимерами, тРНК, соответствующих всем 20 амино-
а именно с UA, UC, АС и AG, а также кислотам. Например, было показано, что
с UGC, AGC, UAC и UAG. Таким образом pUpUpG стимулирует связывание только
в лабораториях Ниренберга и Очоа был лейциновой тРНК, pUpGpU - только ци-
определен состав кодонов, соответствую- стеиновой тРНК, a pGpUpU - связывание
щих каждой из 20 аминокислот. только валиновой тРНК. Отсюда был сде-
лан вывод, что кодоны UUG, UGU
и GUU соответствуют лейцину, цистеину
26.5. Тринуклеотиды способствуют
и валину соответственно. С несколькими
связыванию определенных молекул тРНК
кодонами не было получено избирательно-
с рибосомами
го связывания какой-либо тРНК, тогда как
При использовании смешанных сополиме-
с несколькими другими связывалось более
ров в качестве матриц удалось установить
одной тРНК. Для большинства кодонов
состав кодонов, соответствующих опреде-
были получены вполне четкие результаты.
ленным аминокислотам, но не их последо-
В общем этот простой и элегантный под-
вательность (кроме UUU, ААА и ССС).
ход позволил расшифровать около 50 ко-
Как уже говорилось, валин кодируется
донов.
триплетом из 2U и 1G. Какой же это три-
плет: UUG, UGU или GUU? Ответ на
этот вопрос был получен с помощью двух 26.6. Еще один инструмент расшифровки
совершенно различных экспериментальных кода - сополимеры с определенной
подходов: во-первых, с использованием последовательностью
синтетических полирибонуклеотидов с упо- Примерно в то же время Гобинду Коране
рядоченной последовательностью и, во- (Gobind Khorana) удалось синтезировать
вторых, с помощью зависимого от кодона полирибонуклеотиды с определенной по-
специфического связывания молекул тРНК вторяющейся последовательностью. Соче-
с рибосомами. тая методы органической химии и фермен-
В 1964 г. Ниренберг установил, что три- тативные методы, он синтезировал ряд
нуклеотиды способствуют связыванию сополимеров с повторяющейся последова-
определенных молекул тРНК с рибосомами тельностью из двух, трех и четырех осно-
в отсутствие синтеза белка. Например, до- ваний. Рассмотрим, к примеру, стратегию
бавление pUpUpU вызывает связывание синтеза poly(GUA). Этот упорядоченный
фенилаланиновой тРНК, а рАрАрА значи- сополимер имеет последовательность
тельно увеличивает связывание лизиновой
GUAGUAGUAGUAGUAGUAGUAGUA...
тРНК, как и рСрСрС - связывание проли-
новой тРНК. Динуклеотиды не стимули-
руют связывания тРНК с рибосомами. Эти Прежде всего Корана синтезировал с по-
работы показали, что тринуклеотид (как мощью методов органической химии два
и триплет в мРНК) специфически связы- комплементарных дезоксирибонуклеотида
вается с определенной молекулой тРНК, по девять нуклеотидов длиной: d(TAC)3 и
для которой он является кодовым словом. d(GTA) 3 . Затем эти два олигонуклеотида
Был разработан простой и быстрый тест были использованы в качестве матрицы
на связывание: связанные с рибосомами для синтеза длинных цепей ДНК из четы-
молекулы тРНК задерживаются на нитро- рех дезоксинуклеозидтрифосфатов под дей-
целлюлозном фильтре, а несвязанные мо- ствием ДНК-полимеразы I. Ни один оли-
лекулы тРНК проходят через фильтр. Для гонуклеотид в отдельности не был эффек-
того чтобы определить, какие именно мо- тивной матрицей. Если же присутствовали
лекулы тРНК садятся на фильтр, исполь- оба олигонуклеотида, то d(TAC)3 служил
зовали молекулы тРНК, несущие опреде- матрицей для синтеза poly(dGTA), a
ленную аминокислоту, меченную 14С. d(GTA) 3 - для синтеза poly(dTAC). Эти
длинные комплементарные ДНК обра-
зовывали двухспиральные молекулы. Сле-
72 дующим шагом было получение длинных
содержит кодоны двух видов - АБА и БАБ.
Поэтому полипептидный продукт должен
представлять собой чередующуюся после-
довательность из двух аминокислот (сокра-
щенно обозначенных ак1 и ак 2 ):

Стоит ли на N-конце полипептидного про-


дукта aк1 или ак2, зависит от того, на-
чинается ли рамка считывания с А или с Б.
Если в качестве матрицы использовали
poly(UG), то синтезировался полипептид
из чередующихся валина (Val) и цистеина
(Суs):
UGU|GUG|UGU|GUG|UGU|GUG
Рис. 26.4. Цепь этой двухспиральной ма-
тричной ДНК, которая должна Этот результат однозначно доказывал три-
транскрибироваться, опреде- плетность кода и показывал, что один из
ляется набором рибонуклео- триплетов - UGU или GUG - кодирует ци-
зидтрифосфатов в инкубацион- стеин, а другой - валин. В сочетании
ной смеси. с данными по связыванию тРНК было
очевидно, что UGU кодирует цистеин,
a GUG - валин. В присутствии некоторых
полирибонуклеотидных цепей с последова- чередующихся сополимеров из двух осно-
тельностью, соответствующей poly (dTAC) ваний происходил синтез следующих поли-
и poly(dGTA). Для этого дуплекс пептидов:
poly(dTAC): poly(dGTA) использовали
в качестве матрицы для РНК-полимеразы.
Цепь ДНК для транскрипции можно вы- Матрица Продукт Смысл кодонов
брать, добавляя три подходящих рибону-
клеозидтрифосфата. Если в инкубацион-
ную смесь добавить GTP, UTP и АТР, го Poly(UC) Poly(Ser-Leu)
на матричной цепи poly(dTAC) синтези-
руется полирибонуклеотидный продукт
Poly(AG) Poly(Arg-Gln)
poly(GUA). Другая цепь не транскриби-
руется, так как не хватает одного из необ-
ходимых субстратов - СТР. Если же доба- Poly(AC) Poly(Thr-His)
вить СТР, UTP и АТР, то на другой
матричной цепи синтезируется poly(UAC).
Итак, органический синтез и вслед за ним
матричный синтез с помощью ДНК-поли- Рассмотрим теперь матрицу, состоящую
меразы и РНК-полимеразы позволили син- из повторяющейся последовательности
тезировать два длинных полирибонуклеоти- трех оснований, поли(АБВ). Если рамка
да со строго определенной повторяющейся считывания начинается с А, образующийся
последовательностью оснований (рис. 26.4). полипептид должен содержать аминокис-
Эти регулярные сополимеры были ис- лоту только одного вида, кодируемую три-
пользованы в качестве матриц в бесклеточ- плетом АБВ:
ной системе синтеза белка. Рассмотрим не-
которые результаты такого эксперимента.
Сополимер, состоящий из чередующейся
последовательности двух оснований - А
и Б:
АБА | БАБ | АБА | БАБ | АБА |. . .
26. Генетический код.
Зависимость гены-белки 73
Если рамка считывания начинается с Б, липептидов. Причина этого явления станет
синтезирующийся полипептид должен со- ясна чуть ниже.
держать другую аминокислоту, кодируе- Корана синтезировал также ряд сополи-
мую триплетом БВА: меров, состоящих из повторяющегося те-
трануклеотида, например poly(UAUC). На
этой матрице шел синтез полипептида
с повторяющейся последовательностью
Tyr-Leu-Ser-Ile независимо от рамки
считывания:

Если же рамка считывания начинается с В, UAU|CUA|UCU|AUC|UAU|CUA|UCU|AUC


должен образовываться полипептид треть- Туr—Leu—Ser—Ilе—Туr—Leu—Ser—Ilе
его типа, содержащий аминокислоту, коди-
руемую триплетом ВАБ: Отсюда можно было сделать вывод
о смысле четырех кодонов.
Совершенно иной результат был полу-
чен при использовании в качестве матрицы
poly(GUAA). Единственными продуктами
были ди- и трипептиды. Почему не было
более длинных цепей? Объясняется это
тем, что один из триплетов, встречающих-
ся в этом сополимере, а именно UAA, ко-
Таким образом, предполагаемые про- дирует не аминокислоту, а терминацию
дукты - три различных гомополипептида. синтеза белка:
Действительно, именно такой результат
получался в случае большинства матриц, GUA | AGU | AAG | UAA | GUA|A. . .
состоящий из повторяющейся последова- Val—Ser —Lys— Стоп
тельности трех нуклеотидов. Например, на
poly(UUC) синтезировались полифенилала- На матрице poly(AUAG) также получались
нин, полисерин и полилейцин. Этот резуль- только ди- и трипептиды, так как UAG-
тат в сочетании с результатами других экс- второй сигнал терминации цепи:
периментов показывал, что UUC кодирует AUA|GAU|AGA|UAG|AUA|G. . .
фенилаланин, UCU-серин и CUU-лейцин.
Полипептиды, которые синтезировались на Ile — Asp—Arg—Стоп
других матрицах этого типа, приведены
в табл. 26.3. Обратите внимание, что Посмотрим теперь снова на табл. 26.3. На
в присутствии poly(GUA) и poly(GAU) матрице poly(GUA) синтезировались два,
происходил синтез двух, а не трех гомопо- а не три гомополипептида по той причине,
что третья рамка считывания соответ-
Таблица 26.3. Гомополнпептнды, синтезирующиеся на ствует последовательности
матрицах, которые состоят нз повторяющихся последова-
тельностей тринуклеотидов G | UAG | UAG | U A G - - -
Стоп — Стоп — Стоп
Матрица Синтезирующиеся полипептиды
т. е. представляет собой повторяющуюся
последовательность сигнала терминации.
Poly(UUC) Phe; Ser; Leu Как же обстоит дело с poly(GAU)? На
Poly(AAG) Lys; Glu; Arg этой матрице синтезировались только два
Poly(UUG) Cys; Leu; Val гомополипептида, потому что третья рам-
PoIy(CCA) Gln; Thr; Asn
ка считывания соответствует еще одному
Poly(GUA) Val; Ser
Poly(UAC) Tyr; Thr; Leu
сигналу терминации - UGA:
Poly(AUС) Ile; Ser; His
Poly(GAU) Met; Asp GA | UGA | UGA | UGA | U. . .
Стоп — Стоп — Стоп
Часть IV.
74 Информация
Таблица 26.4. Генетический код1)

Первое Третье
положение Второе положение положение
(5'-конец) (3'-конец)

U С A G
Phe Ser Туr Cys U
Phe Ser Туr Cys С
U Leu Ser Стоп Стоп А
Leu Ser Стоп Trp G
Leu Pro His Arg U
Leu Pro His Arg С
С Leu Pro Gln Arg А
Leu Pro Gln Arg G
lle Thr Asn Ser U
Me Thr Asn Ser С
А Me Thr Lys Arg А
Met Thr Lys Arg G
Val Ala Asp Gly U
Val Ala Asp Gly С
G Val Ala Glu Gly А
Val Ala Glu Gly G
1)
Зная положение оснований в кодоне, можно найти соответствующую
аминокислоту. Например, кодон 5'-AUG-3' в мРНК детерминирует
метионин, тогда как CAU детерминирует гистидин. Кодоны UAA, UAG
и UGA - сигналы терминации (стоп-кодоны). AUG является частью сиг-
нала инициации помимо того, что он кодирует внутренние остатки ме-
тионина.

В действительности оказалось, что только 26.7. Основные свойства генетического кода


три кодона не кодируют никакой аминокис- Были расшифрованы все 64 кодона
лоты: UAG, UAA и UGA. (табл. 26.4). 61 триплет соответствует опре-
Синтез полинуклеотидов с определенной деленным аминокислотам, а три кодируют
последовательностью в лаборатории Ко- терминацию. Поскольку существует 20 ами-
раны был выдающимся достижением. Ис- нокислот и 61 триплет для их кодирования,
пользование этих полимеров в качестве ма- очевидно, что код в высокой степени выро-
триц для синтеза белка в сочетании жден. Иными словами, многие аминокис-
с работами Ниренберга по связыванию лоты детерминируются более чем одним
тРНК с рибосомами в присутствии трину- триплетом. Только триптофан и метионин
клеотидов привели к полной расшифровке кодируются всего одним триплетом.
генетического кода к 1966 г. Еще за шесть Остальные 18 аминокислот кодируются
лет до этого такое событие казалось несбы- двумя и более триплетами. Так, в частности,
точной мечтой. Благодаря разработке со- лейцин, аргинин и серин кодируются
вершенных методов синтеза в лаборатории шестью кодонами каждый. В нормальных
Кораны стало возможным и еще одно до- физиологических условиях код однозначен:
стижение: полный синтез молекулы ДНК, каждый кодон обозначает только одну
соответствующей последовательности мо- аминокислоту.
лекулы транспортной РНК.
26. Генетический код.
Зависимость гены-белки 75
Кодоны, соответствующие одной амино- 26.8. Сигналы инициации и терминации
кислоте, называют синонимами. Например. синтеза белка
CAU и САС - синонимы для гистидина. Как мы уже упоминали, UAA, UAG и UGA
Обратите внимание, что синонимы не раз- (стоп-кодоны) обозначают терминацию це-
бросаны случайным образом по таблице ге- пи. Эти кодоны считываются не молекулами
нетического кода (табл. 26.4). Аминокисло- тРНК, а особыми белками - факторами
та, кодируемая двумя или более синонима- терминации. Сигнал начала (инициации)
ми, занимает одну клетку в таблице (за синтеза белка более сложен. Полипеп-
исключением тех случаев, когда для данной тидные цепи у бактерий начинаются с моди-
аминокислоты существует более четырех фицированной аминокислоты формилме-
синонимов). Аминокислоты, располо- тионина (fMet).
женные в одной клетке, кодируются кодона-
ми, у которых два первых основания одина-
ковые, а третье различается, например
GUU, GUC, GUA и GUG. Большинство си-
нонимов различается только последним ос-
нованием триплета. Рассмотрение кода по-
казывает, что XYC и X Y U всегда кодируют
одну и ту же аминокислоту, a X Y G и X Y A
чаще (но не всегда) кодируют одну и ту же
аминокислоту. Структурные основы такой
эквивалентности кодонов станут понятны
после обсуждения природы антикодонов
в молекулах тРНК (разд. 27.6).
Каков биологический смысл сильной вы- Существует особая тРНК, которая пере-
рожденности генетического кода? Один из носит fMet. Эта fMet-тРНК узнает кодон
возможных ответов состоит в том, что выро- AUG (или реже GUG). Однако AUG являет-
жденность сводит к минимуму пагубное ся также кодоном для метионина, располо-
действие мутаций. Если бы код не был вы- женного внутри полипептида, а GUG-ко-
рожден, 20 кодонов кодировали бы амино- дон внутреннего валина. Это значит, что
кислоты, а 44 вызывали бы терминацию сигнал для первой аминокислоты полипеп-
цепи. тидной цепи должен быть сложнее, чем для
Таким образом, вероятность превраще- всех последующих аминокислот. AUG (или
ния кодона в сигнал терминации была бы GUG) представляет собой часть сигнала
гораздо выше в случае невырожденного ко- инициации. Существует другой сигнал, пред-
да, чем в существующем коде. Важно учесть, шествующий AUG (или GUG), который
что мутации, приводящие к образованию определяет, будет ли кодон считан как сиг-
сигнала терминации цепи, обычно приводят нал инициации цепи или как кодон для вну-
к синтезу неактивных белков, тогда как за- треннего остатка метионина (или валина).
мещение одной аминокислоты другой обыч- Механизмы инициации и терминации синте-
но относительно безвредно. Кроме того, вы- за белка мы рассмотрим в следующей главе
рожденность кода может иметь определен- (разд. 27.13).
ное значение постольку, поскольку она
26.9. Генетический код универсален
позволяет нуклеотидному составу ДНК ме-
няться в широких пределах, не влияя на ами- Как мы уже сказали, генетический код был
нокислотную последовательность белков, ко- расшифрован в результате исследований по-
дируемых этой ДНК, ([G] + ведения тринуклеотидов и синтетических
матричных РНК в бесклеточных системах,
+ [С])-содержание бактериальных ДНК ко-
леблется от 30% до более 70%. Молекулы полученных из бактерий. Возникают два во-
ДНК с сильно различающимся содержа- проса. Одинаков ли генетический код in vivo
нием [G] + [С] могут кодировать одни и те и in vitro? Одинаков ли генетический код
же белки благодаря систематическому ис- у всех организмов? Убедительный ответ на
пользованию различных синонимов. эти вопросы был получен при анализе мута-
ций у вирусов, бактерий и высших организ-
мов. Известно множество аминокислотных
Часть IV. замен, возникающих в результате мутаций
76 Информация в генах гемоглобина человека, белка обо-
лочки вируса табачной мозаики (ВТМ) ций на генетической карте был таким же,
и α-цепи триптофан-синтазы E.coli. Почти как порядок соответствующих замен в по-
все эти аминокислотные замены объясняют- следовательности аминокислот полипептид-
ся заменами всего лишь одного основания ного продукта (рис. 26.5). Другими словами,
(табл. 26.5). Это - надежная проверка пра- ген, кодирующий α-цепь, и его полипеп-
вильности всего генетического кода и его тидный продукт коллинеарны.
универсальности.
Почему код не изменился за миллионы 26.11. Некоторые последовательности
лет эволюции? Обсудим действие мутации, вирусных ДНК кодируют более одного белка
изменяющей считывание мРНК. Такая му- Открытие того факта, что ДНК фага φХ174
тация изменит последовательность амино- кодирует больше белков, чем позволяет
кислот в большинстве, если не во всех бел- имеющееся в ней количество нуклеотидов,
ках, синтезируемых в клетках мутантного было совершенно загадочным. Как этот ви-
организма. Многие их этих изменений, бе- рус может кодировать более 2000 аминокис-
зусловно, окажутся губительными, и, следо- лотных остатков, если он содержит всего
вательно, должно существовать сильное да- лишь 5375 нуклеотидов? Ответ был получен
вление отбора против таких мутаций. из полной последовательности оснований
(разд. 24.29), когда обнаружилось, что
в ДНК фага φХ174 некоторые гены перекры-
26.10. Последовательность оснований гена ваются. Определенные участки соответству-
и последовательность аминокислот ющих транскриптов транслируются в раз-
соответствующего полипептида коллинеарны
личных рамках считывания, что приводит к
Обратимся теперь к взаимоотношениям ме- образованию белков с различными последо-
жду генами и белками. Как показала работа вательностями аминокислот (рис. 26.6).
Сеймура Бензера (Seymour Benzer) по гене- Например, одни и те же 300 нуклеотидов
тическому картированию высокого разре- кодируют белок гена Е и большую часть
шения, гены - неразветвленные структуры. белка гена D. Еще более поразительный
Этот важный результат согласовывался
Таблица 26.5. Мутации в гемоглобине человека, трипто-
с установленным фактом, что ДНК предста-
фан-синтазе E.coli и белке оболочки вируса табачной мо-
вляет собой линейную последовательность заики (ВТМ)
пар оснований. Полипептидные цепи также
имеют неразветвленную структуру. Поэто-
му в начале 60-х годов возник следующий Белок Замена Предполагае-
вопрос: существует ли линейное соответ- аминокислоты мое изменение
ствие между геном и его полипептидным кодона
продуктом?
Подход Чарлза Янофски (Charles 1)
Гемоглобин Glu—>Val
Yanofsky) к этой проблеме состоял в исполь-
GAA—>GUA
зовании мутантов E.coli, у которых обра- Гемоглобин Glu—>Lys1)
зуется измененная молекула фермента. Бы- GAA —>AAA
ло выделено много мутантов по α-цепи Гемоглобин Glu —>Gly GAA —>GGA
триптофан-синтазы и определена локализа- Триптофан-синтаза Gly —>Arg GGA —>AGA
ция мутаций на генетической карте α-цепи Триптофан-синтаза Gly—>Glu GGA —>GAA
с помощью рекомбинационных эксперимен- Триптофан-синтаза Glu —>Ala GAA —>GCA
тов с трансдуцирующим фагом. Некоторые Белок оболочки Leu —>Phe CUU—>UUU
из этих мутаций были локализованы близко ВТМ
Белок оболочки Glu —>Gly GAA —>GGA
друг к другу на генетической карте, тогда
ВТМ
как другие были сильно удалены в пределах Белок оболочки Pro —>Ser CCC —>UCC
одного гена. Следующей важной задачей ВТМ
было определить положение аминокислот-
ной замены для каждого из этих десяти му- 1)
Замена Glu—>Val и Glu—>Lys происходит в положе-
тантов. Прежде всего была определена по- нии 6 в β-цепи гемоглобинов S и С человека соответ-
следовательность 168 аминокислот α-цепи ственно.
дикого типа. Затем с помощью метода «от-
печатков пальцев» были установлены место
и природа аминокислотной замены в ка- 26. Генетический код.
ждом случае. Порядок расположения мута- Зависимость гены-белки 77
Рис. 26.5. Коллинеарность гена и амино- 26.12. Гены эукариот представляют собой
кислотной последовательно- мозаику из транслируемых и нетрансли-
сти α-цепи триптофан-синтазы. руемых последовательностей ДНК
Положение мутаций в ДНК У бактерий полипептидные цепи кодируют-
(желтая линия) было определе- ся непрерывной последовательностью три-
но методами генетического плетных кодонов. В течение многих лет счи-
картирования. Аминокис- талось, что гены высших организмов также
лотные замены в последова- непрерывны. Эта точка зрения была неожи-
тельности аминокислот (синяя данно опровергнута в 1977 г., когда в не-
линия) расположены в том же скольких лабораториях было открыто, что
порядке, что и соответствую- некоторые гены имеют прерывистое строе-
щие мутации. (Yanofsky С., ние. Например, ген β-цепи гемоглобина пре-
Gene Structure and Protein рывается в области, кодирующей аминокис-
Structure, Sci. Amer., 1967.) лотную последовательность, длинной неко-
дирующей вставочной последовательностью
из 550 пар оснований и короткой последова-
пример представляет родственный бакте- тельностью из 120 пар оснований. Таким
риофаг G4, в ДНК которого некоторые ко- образом, ген β-глобина разделен на три ко-
роткие участки кодируют три различных дирующие последовательности:

белка. Эти вирусы используют перекрываю-


щиеся гены, чтобы ввести больше информа- Эта удивительная структура была открыта
ции в маленькие молекулы ДНК. Однако за с помощью электронно-микроскопических
эту генетическую экономию приходится исследований гибридов между β-глобино-
платить: на последовательности аминокис- вой мРНК и фаргментом ДНК мыши, со-
лот, кодируемые перекрывающимися гена- держащим ген β-глобина (рис. 26.7). Двухце-
ми, накладываются строгие ограничения. почечная ДНК частично денатурируется,
Поэтому перекрывающиеся гены, по-види- что позволяет мРНК гибридизоваться
мому, широко используются лишь в тех слу- с комплементарной цепью ДНК. Затем
чаях, когда количество ДНК строго лимити- одноцепочечный участок ДНК образует
ровано, как в случае вирусов с белковой петлю и на электронных микрофотографиях
оболочкой строго определенных размеров. выглядит как тонкая линия в отличие от
двухцепочечной ДНК или ДНК-РНК-ги-
Часть IV. бридных участков, которые выглядят значи-
78 Информация тельно толще. Если бы ген β-глобина был
зацию таких вставочных последовательно-
стей.
На каком этапе экспрессии гена удаляют-
ся вставочные последовательности? Ново-
синтезированные РНК, выделенные из ядра,
значительно длиннее молекул мРНК, ко-
торые из них получаются. В частности, пер-
вичный транскрипт гена β-глобина содер-
жит две нетранслируемые области. Эти
вставочные последовательности в первич-
ном 15S-транскрипте вырезаются, а коди-
рующие последовательности одновременно
соединяются под действием фермента
сплайсинга. Этот фермент обладает высо-
кой точностью. Так, образуется зрелая
9S-мРНК (рис. 26.9). Кодирующие последо-
вательности прерывистых («разорванных»)
генов называются экзонами, а вставочные
последовательности - интронами (от англ.
слов expressed regions - экспрессирующиеся
участки и intervening sequence - прерываю-
щая последовательность).
Еще один прерывистый эукариотический
ген - ген овальбумина куриного яйца, ко-
торый состоит из восьми экзонов, разде-
ленных семью длинными интронами
(рис. 26.10). Еще более удивителен ген ко-
нальбумина: он содержит не менее 17 экзо-
нов. Общее свойство экспрессии этих ге-
нов - то, что их экзоны располагаются
в мРНК и в ДНК в одной и той же последо-
вательности. Таким образом, прерывистые
гены, подобно непрерывным генам, колли-
Рис. 26.6. Перекрывающиеся гены
неарны своим полипептидным продуктам.
в ДНК фага φХ174. Рядом с
Все картированные до настоящего време-
последовательностью основа- ни гены птиц и млекопитающих, кроме генов
ний показаны две последова- гистонов (разд. 29.13), содержат интроны.
тельности аминокислот, детер- Почему практически все гены высших эука-
минируемые различными рам- риот содержат вставочные последователь-
ками считывания. ности? Один из возможных ответов состоит
в том, что прерывистые гены отражают про-
непрерывен, была бы видна одна петля. Од- цесс эволюции. Экзоны могут соответство-
нако на электронных микрофотографиях та- вать крупным структурным или функцио-
ких гибридов (рис. 26.8) отчетливо видны нальным элементам (доменам), которые
три петли. Это показывает, что ген преры- соединились и образовали белки с новыми
вается по крайней мере одним участком свойствами. Другая возможность состоит
ДНК, которого нет в соответствующей в том, что вырезание вставочных последова-
мРНК. Дополнительные данные о вста- тельностей регулирует поток мРНК из ядра
вочных последовательностях были полу-
в цитозоль. В соответствии с этой гипотезой
чены при картировании рестрикционных сплайсинг (сращивание) первичного тран-
фрагментов гена β-глобина и продукта скрипта играет ключевую роль: он опреде-
обратной транскрипции мРНК. Большие ляет, какие белки синтезирует клетка. От-
различия между этими картами показали, крытие прерывистых генов у высших орга-
что геномная ДНК содержит нетрансли- низмов ввело нас в увлекательную область
руемые последовательности между коди-
рующими последовательностями. Рестрик- 26. Генетический код.
ционные карты позволили уточнить локали- Зависимость гены-белки 79
Рис. 26.7. Выявление вставочных после- за один цикл репликации. Для E.coli
довательностей с помощью и Drosophila melanogaster эти величины со-
электронной микроскопии. ставляют 4•10 - 1 0 и 7•10-1 соответствен-
Молекула мРНК (красная ли- но.
ния) гибридизуется с геномной Существует два типа одиночных замен
ДНК, содержащей соответ- пары оснований. Транзиция - замещение
ствующий ген. А - если ген не- одного пурина другим пурином или одного
прерывен, видна одна петля пиримидина другим пиримидином. Транс-
одноцепочечной ДНК (показа- версией, наоборот, называется замещение
но синим цветом); Б - если ген
содержит вставочную последо-
вательность, видны две петли
одноцепочечной ДНК (показа-
но синим цветом) и одна петля
двухцепочечной ДНК (синий
и желтый цвет).

познания, которая, по-видимому, имеет


большое значение для понимания роста
и дифференцировки клеток.

26.13. Мутации возникают в результате


изменений последовательности оснований
ДНК Рис. 26.8. Электронная микрофотогра-
Существуют мутации нескольких типов: фия гибрида β-глобиновой
1) замена одной пары оснований (или не- мРНК и фрагмента геномной
скольких пар) другой парой; 2) делеция ДНК, содержащего ген β-гло-
одной или более пар оснований; 3) вставка бина. Толстые петли двухспи-
(включение, инсерция) одной или более пар ральной ДНК - вставочные по-
оснований (рис. 26.11). Наиболее распро- следовательности в ДНК, ко-
страненный тип мутаций - замена одной торых нет в мРНК (как на
пары оснований другой парой. Частота спон- рис. 26.7, Б). Верхняя стрелка
танных мутаций у бактериофага Т4 была указывает на большую вста-
оценена в 1,7•10 -8 на одну пару оснований вочную последовательность,
нижняя стрелка - на малень-
Часть IV. кую. (Печатается с любезного
80 Информация разрешения д-ра Philip Leder.)
завывать необычные пары оснований, от-
личные от А-Т и G-C. Например, тауто-
мерная иминоформа аденина может спари-
ваться с цитозином (рис. 26.12). В следую-
щем цикле репликации этот аденин, воз-
можно, снова перейдет в свое обычное
таутомерное состояние и будет спариваться
с тимином, тогда как цитозин будет спари-
ваться с гуанином. В результате одна из до-
черних молекул ДНК будет содержать пару
G-C вместо пары А-Т (рис. 26.13).
Кроме того, мутации могут вызывать де-
фектные ДНК-полимеразы. Существует му-
тант E.coli, у которого частота мутаций
в 1000 раз выше, чем в норме, возможно, из-
за измененной полимеразы. Отличительная
особенность мутаций этих клеток состоит
в том, что почти все они являются трансвер-
сиями А-Т—>G-C.

Рис. 26.9. Транскрипция гена β-глобина 26.14. Некоторые химические мутагены


и удаление вставочных после- весьма специфичны
довательностей из первичного В ДНК можно включить аналоги основа-
РНК-транскрипта. Образова- ний, например 5-бромурацил и 2-аминопу-
ние «колпачка» и присоедине- рин. Они вызывают транзиции, нарушая
ние poly(A) обсуждаются правила спаривания оснований в процессе
в разд. 29.22. их собственного включения в состав ДНК
или в следующем цикле репликации
(рис. 26.14). Аналог тимина 5-бромурацил
пурина пиримидином или пиримидина пу- в норме спаривается с аденином. Однако
рином: доля енольного таутомера в 5-бромурациле
выше, чем в тимине, возможно, из-за высо-
кой электроотрицательности атома брома
по сравнению с метильной группой при С-5.
Енольная форма 5-бромурацила спаривает-
ся с гуанином, и это вызывает транзиции
А-Т—>G-C. 2-аминопурин в норме спари-
вается с тимином. В отличие от аденина
Механизм спонтанного возникновения обычный таутомер 2-аминопурина может
транзиций был предложен Уотсоном и Кри- образовать одну водородную связь с цито-
ком в их классической работе о двойной зином. Поэтому 2-аминопурин способен вы-
спирали ДНК. Они отметили, что неко- зывать транзиции А-Т—>G-C.
торые атомы водорода каждого из четырех В основе действия других мутагенов ле-
оснований могут менять свое положение. жат химические модификации оснований
Такие таутомерные формы, которые возни- ДНК. Например, азотистая кислота реаги-
кают с низкой вероятностью, могут обра- рует с основаниями, имеющими аминогруп-

Рис. 26.10. Структура гена овальбумина


куриного яйца. Интроны (неко-
дирующие участки) показаны
желтым цветом, а экзоны - си- 26. Генетический код.
ним. Зависимость гены-белки 81
На примере типогралских ошибок пу. При этом происходит окислительное де-
Замена заминирование аденина до гипоксантина,
На примере типожграфских ошибок цитозина до урацила, гуанина до ксантина.
Вставка Образующийся при этом гипоксантин спа-
ривается с цитозином, а не с тимином, ура-
На примере тпографских ошибок цил спаривается с аденином, а не с гуани-
Делеция ном. Ксантин, как и гуанин, спаривается
с цитозином. Поэтому азотистая кислота
На примере типограф-савдкмьыэм вызывает транзиции А-Т—>G-C. Гидро-
Нонсенс ксиламин (NН2ОН) - высокоспецифичный
мутаген. Он реагирует почти исключитель-
Рис. 26.11. На примере типографских но с цитозином и дает производное, которое
ошибок можно проиллюстри- спаривается с аденином, а не с гуанином.
ровать различные типы мута- Гидроксиламин вызывает транзицию толь-
ций. ко в одном направлении: G-С—>А-Т.
Другой тип мутаций вызывают плоские
ароматические молекулы, например акри-
дины. Эти соединения интеркалируют
в ДНК, т.е. проскальзывают между сосед-
ними парами оснований в двойной спирали
ДНК (разд. 25.18). Интеркаляторы, видимо,
стабилизируют спаривание оснований со
сдвигом в повторяющихся последователь-
ностях, таких, например, как CGCGCGCG.
В результате они вызывают включения или
делеции одной или более пар оснований. Дей-
ствие таких мутаций заключается в измене-
нии рамки считывания, если только общее
число делетированных или включившихся
Рис. 26.12. Редкая таутомерная форма оснований не кратно трем. Именно анализ
аденина спаривается с цитози- таких мутантов позволил доказать триплет-
ном вместо тимина. Этот тау- ность генетического кода.
томер образуется при сдвиге 26.15. Многие мутагенные канцерогены
протона 6-аминогруппы к ато- можно выявить по их мутагенному действию
му N-1. на бактерии
Многие опухоли у человека возникают в ре-
зультате воздействия токсичных химиче-
ских веществ. Поскольку эти химические
канцерогены обычно мутагенны, можно ду-
мать, что повреждение ДНК лежит в основе
и канцерогенеза, и мутагенеза. Эти соедине-
ния важно идентифицировать и оценить их
потенциальную биологическую активность,
чтобы свести к минимуму то воздействие,
которое они оказывают на человека. Брюс
Эймс (Bruce Ames) разработал простой
и чувствительный тест для выявления хими-
ческих мутагенов. На чашку Петри поме-
Рис. 26.13. Спаривание редкой таутомер- щают тонкий слой агара, содержащий
ной формы аденина (А*) с цито- около 109 клеток специально сконструиро-
зином (С) привоцит к появле- ванного тест-штамма Salmonella. Эти бакте-
нию пары G—С в следующем рии не способны расти в отсутствие гисти-
поколении. дина, поскольку они несут мутацию в одном
из генов биосинтеза этой аминокислоты.
Часть IV. Добавление мутагена в центр чашки инду-
82 Информация цирует появление множества новых мута-
нов - добавление гомогената печени млеко-
питающих. Напомним, что некоторые по-
тенциальные канцерогены превращаются
в активную форму под действием фермента-
тивных систем печени или других тканей
млекопитающих (разд. 20.21). В бактериях
эти ферменты отсутствуют, в связи с чем на
чашку наносят несколько миллиграммов го-
могената печени, чтобы активировать по-
добные мутагены. Например, соединение

Рис. 26.14. Аналог тимина 5-бромурацил


иногда спаривается с гуанином
вместо аденина. Присутствие
атома брома при С-5 увеличи-
вает долю редкого таутомера,
образующегося при сдвиге
протона от N-3 к атому кисло-
рода при С-4.

ций. Небольшая часть этих мутаций приво-


дит к реверсии исходной мутации (возврат
к дикому типу), так что клетки приобретают
способность синтезировать гистидин. Эти
ревертанты размножаются в отсутствие эк-
зогенного гистидина и появляются в виде
отдельных колоний на чашке после инкуба-
ции чашки в течение двух дней при 37°С
(рис. 26.15). Например, 0,5 мкг 2-аминоан-
трацена дают 11.000 колоний ревертантов
по сравнению всего лишь с 30 спонтанными
ревертантами в отсутствие этого мутагена. Рис. 26.15. Тест на мутагены с использова-
Можно легко поставить опыт с различными нием сальмонеллы. А. На чаш-
9
концентрациями исследуемого соединения, ку Петри посеяно примерно 10
чтобы получить кривую доза-ответ. Обыч- бактерий, неспособных синте-
но эта зависимость имеет линейный харак- зировать гистидин. Б. На чаш-
тер; отсюда следует, что пороговой концен- ку помещен кружок фильтро-
трации в процессах мутагенеза нет. вальной бумаги, пропитанный
Некоторые тест-линии чувствительны мутагеном. В результате воз-
к заменам пар оснований, тогда как другие никает множество ревертан-
можно использовать для выявления делеций тов, способных синтезировать
или вставок пар оснований (сдвигов рамки). гистидин. Эти ревертанты
Чувствительность этих штаммов, скон- видны в виде ореола колоний
струированных специально для оценки му- вокруг белого кружочка. Не-
тагенов, увеличена генетически: они лишены большое число колоний на
системы эксцизионной репарации. Кроме чашке А - спонтанные ревер-
того, у них нет липополисахаридной обо- танты. [Ames B.N., McCann J.,
лочки, которая обычно окружает клетки Yamasaki E., Mutation Res., 31,
Salmonella. Отсутствие этого барьера облег- 347 (1975).]
чает проникновение в клетку потен-
циальных мутагенов. Еще одна важная осо- 26. Генетический код.
бенность этой системы выявления мутаге- Зависимость гены-белки 83
с реакционноспособной боковой цепью Генетический код един у всех живых орга-
(дающее ему возможность образовать кова- низмов. Он был расшифрован в результате
лентную связь с ДНК) и с ароматической экспериментов трех типов. Во-первых, син-
группой (которое позволяет ему интеркали- тетические полирибонуклеотиды (полу-
ровать) обладает значительно большей му- ченные с помощью полинуклеотид-фосфо-
тагенностью, чем такое же соединение, со- рилазы) были использованы в качестве
стоящее из одной ароматической группы. мРНК в бесклеточных системах синтеза
В настоящее время тест с использованием белка, после того как было открыто, что
Salmonella широко используется для оценки poly(U) кодирует фенилаланин. Во-вторых,
опасности мутагенного и канцерогенного тринуклеотид (подобный кодону в мРНК)
действия множества разнообразных хими- специфически связывается с определенной
ческих соединений. Эта быстрая и недорогая тРНК, для которой он является кодовым
бактериологическая проба на мутагенность словом. Были синтезированы все 64 трину-
дополняет эпидемиологические обследова- клеотида и проверена их способность сти-
ния и пробы на животных, которые всегда мулировать связывание определенных
оказываются более трудоемкими, мед- тРНК с рибосомами. В-третьих, в качестве
ленными и дорогими. Тест на мутагенность мРНК были использованы синтетические
с использованием Salmonella - ответвление полирибонуклеотиды с известной последо-
исследований взаимосвязи гена и белка вательностью. Например, на матрице
у бактерий. Это - удивительный пример то- poly(UAUC) синтезировался poly(Tyr-
го, как фундаментальные исследования Leu-Ser-Ile).
в области молекулярной биологии могут не- Многие гены высших эукариот имеют
посредственно внести важный вклад в здра- «разорванное» строение. Кодирующие по-
воохранение. следовательности (экзоны) в таких генах
разделены вставочными последовательно-
стями (интронами), которые удаляются
в ходе превращения первичного транскрип-
Заключение
та в мРНК. Например, ген β-глобина млеко-
Последовательность оснований гена колли-
питающих содержит два интрона. Преры-
неарна аминокислотной последовательно-
вистые гены, как и непрерывные гены,
сти полипептидного продукта. Генетиче-
коллинеарны своим полипептидным про-
ский код - это взаимосвязь между последо- дуктам.
вательностью оснований в ДНК (или со-
Мутации обусловлены изменениями в по-
ответствующего РНК-транскрипта) и по- следовательности оснований ДНК. Ос-
следовательностью аминокислот в белках. новные типы мутаций - замены, делеции
Аминокислоты кодируются группами по
и включения. Самый распространенный тип
три основания (они называются кодонами),
мутаций - замена одной пары оснований на
начиная с фиксированной точки. 61 кодон из
другую. Замена одного пурина другим или
64 кодирует определенную аминокислоту,
одного пиримидина другим пиримидином
а остальные три кодона (UAA, UAG и UGA)
называется транзицией. Трансверсия - заме-
служат сигналами терминации. Таким обра-
щение пурина пиримидином и наоборот.
зом, для большинства аминокислот имеется
Мутации могут возникать вследствие спон-
более одного кодового слова. Другими сло-
танной таутомеризации оснований или под
вами, код вырожден. Кодоны, определяю- действием аналогов оснований (например,
щие одну и ту же аминокислоту, называют-
5-бромурацила) или других химических му-
ся синонимами. В большинстве случаев
тагенов (например, азотистой кислоты). По-
синонимы различаются только последним тенциальную канцерогенную активность
основанием триплета. Некоторые последо-
многих веществ можно выявить по их мута-
вательности вирусных ДНК кодируют бо-
генному действию на бактерии.
лее одного белка, так как их транскрипты
транслируются в различных рамках считы-
вания.

Часть IV.
84 Информация
РЕКОМЕНДУЕМАЯ Medicine (1963-1970), pp. 341-369, rabbit β-globin gene contains a large
ЛИТЕРАТУРА American Elsevier (1973). insert in the coding sequence, Cell, 12,
Nirenberg M., 1968. The genetic code. 1097-1108.
С чего начать In: Nobel Lectures: Physiology or Breathnack R., Mandel J.L., Cham-
Yanofsky С., 1967. Gene structure and Medicine (1963-1970), pp. 372-395, bon P., 1977. Ovalbumin gene is split in
protein structure, Sci. Amer, 216(5), American Elsevier (1973). chicken DNA, Nature, 270, 314-319.
80-94. (Статья содержит данные, сви- Garen A., 1968. Sense and nonsense in Cochet M., Gannon F., Hen R.,
детельствующие о коллинеарности the genetic code, Science, 160, 149-159. Maroteaux L., Perrin F., Chambon P.,
гена и пептида.) Woese C.K., 1967. The Genetic Code, 1979. Organisation and sequence
Nirenberg M.W., 1963. The genetic Harper and Row. studies of the 17-piece chicken
code II. Sci. Amer., 208(3), 80-94. (Опи- Cold Spring Harbor Laboratory, 1966. conalbumin gene, Nature, 282, 567-574.
сано использование синтетических The Genetic Code (Cold Spring Harbor Tilghman S.M., Tiemeier D.C., Seid-
полирибонуклеотидов для расши- Symposia on Quantitative Biology, man J.G., Peterlin B.M., Sullivan M.,
фровки кода.) vol. 31). (Сборник выдающихся ста- Maijel J.V., Leder P., 1978. Intervening
Crick F.Н.С., 1966. The genetic code тей, в которых установлены ос- sequence of DNA identified in the struc-
III, Sci. Amer., 215(4), 55-62. (В статье новные свойства кода.) tural portion of a mouse β-globin gene,
рассматриваются представления Proc. Nat. Acad. Sci., 75, 725-729.
о генетическом коде в тот момент, Перекрывающиеся гены
когда он был почти полностью рас- Barrell B.C., Air G.M., Hutchin- Мутагенез
шифрован.) son С.A., III, 1976. Overlapping genes Hayes W., 1968. The Genetics of
Kourilsky P., Chambon Р., 1978. The in bacteriophage φX174, Nature, 264, Bacteria and Their Viruses (2nd ed.),
ovalbumin gene: an amazing gene in 34-40. Wiley. (В гл. 13 четко и кратко опи-
eight pieces, Trends Biochem. Sci., 3, сана природа мутаций.)
244-247. Коллинеарность гена и белка Drake J. W., Baltz R.H., 1976. The
Yanofsky С., Carlton В.С., Guest J . R . , biochemistry of mutagenesis, Ann. Rev.
Гипотеза адаптера (роль тРНК) Helinski D.R., Henning U., 1964. On the Biochem., 45, 11-38.
Crick F.H.C., 1958. On protein colinearity of gene structure and protein Drake J.W., 1970. The Molecular Basis
synthesis, Symp. Soc. Exp. Biol, 12, structure, Proc. Nat. Acad. Sci., 51, of Mutation, Holden-Day.
138-163. (Блистательное предвидение 266-272.
механизма белкового синтеза. Изло- Sarabhai X.S., Stretton O.W., Bren- Выявление канцерогенов
жена гипотеза адаптера.) ner S., Bolle A., 1964. Colinearity of Ames B.N., 1979. Identifying envi-
gene with polypeptide chain, Nature, ronmental chemicals causing mutations
Генетический код 201, 13-17. and cancer, Science, 204, 587-593.
Crick F.Н.С., Barnett L., Brenner S., Devoret R., 1979. Bacterial tests for
Watts-Tobin R.J., 1961. General nature Разорванные гены н вставочные по- potential carcinogens. Sci. Amer,
of the genetic code for proteins, Nature, следовательности 241(2), 40-49.
192, 1227-1232. Crick F., 1979. Split genes and RNA McCann J., Spingarn N.E., Kobori J.,
Khorana H.G., 1968. Nucleic acid splicing in evolution of eukaryotic cells, Ames B.N., 1975. Detection of
synthesis in the study of the genetic Science, 202, 1257-1260. carcinogens as mutagens: bacterial
code. In: Nobel Lectures: Physiology or Jeffreys A.J., Flavell R.A., 1977. The tester strains with R factor plasmids,
Proc. Nat. Acad. Sci., 72, 979-983.

Вопросы и задачи ной РНК тем же мутагеном привела к по-


явлению в том же положении фенилала-
1. Какую последовательность нина:
аминокислот кодирует следую-
щая последовательность оснований моле-
кулы мРНК? Считайте, что рамка считыва-
ния начинается с 5'-конца: 5'-UUGCCU- а) Каковы предполагаемые кодоны для
AGUGAUUGGAUG-3'. этих четырех аминокислот?
2. Какова последовательность по- б) Что применялось в качестве мутагена:
липептида, который образуется 5-бромурацил, азотистая кислота или акри-
при добавлении poly(UUAC) в бесклеточ- диновый краситель?
ную систему синтеза белка? 4. Специалист по химии белка ска-
3. Одноцепочечную РНК вируса зал молекулярному генетику,
табачной мозаики обработали что он нашел новый мутантный гемогло-
химическим мутагеном. Были получены му- бин, в котором аспартат замещает лизин.
танты, у которых в определенном положе-
нии вместо пролина располагается серин 26. Генетический код.
или лейцин. Повторная обработка мутант- Зависимость гены-белки 85
Молекулярный генетик удивился и отпра- а) Могла ли эта мутация возникнуть путем
вил своего приятеля еще повозиться замены одной пары оснований в ДНК фага
в лаборатории. Т4? Если нет, то как мог возникнуть такой
а) Почему молекулярный генетик выразил мутант?
сомнения в возможности такой аминокис- б) Какова последовательность оснований
лотной замены? мРНК, кодирующей пять аминокислот
б) Какая аминокислотная замена показа- в белке дикого типа, отличающихся от той
лась бы молекулярному генетику более же последовательности у мутанта?
приемлемой? 6. РНК-транскрипт одного участ-
5. Ниже приведены последова- ка ДНК фага G4 содержит по-
тельности аминокислот в фраг- следовательность 5'-AAAUGAGGA-3'. Этот
менте лизоцима бактериофага Т4 дикого ти- фрагмент кодирует три различных белка.
па и мутанта: Каковы их последовательности?

Дополнительные вопросы см.: Wood W.В.,


Wilson J. H., Benbow R. M., Hood L. Е,
Biochemistry: A Problems Approach,
Benjamin, 1974, ch. 19.
Инициация приводит к связыванию инициа-
ГЛАВА 27 торной тРНК с сигналом начала транскрип-
Синтез белка ции в мНРК. Инициаторная тРНК занимает
Р-участок рибосомы (от англ. peptidyl - пеп-
тидильный) - один из двух участков связы-
Из предыдущей главы нам известно, что по- вания тРНК. Элонгация начинается со
следовательность аминокислот в белках связывания аминоацил-тРНК с другим
определяется последовательностью кодо- участком связывания тРНК на рибосоме,
нов в мРНК, считываемых молекулами называемым А-участком (от англ.
тРНК. Обратимся теперь к механизму син- aminoacyl - аминоацильный). Затем обра-
теза белка. Этот процесс называется транс- зуется пептидная связь между аминогруп-
ляцией (от англ. translation - перевод), так пой второй аминоацил-тРНК и карбоксиль-
как информация, записанная на четырехбук- ной группой fMet, связанного с инициатор-
венном языке нуклеиновых кислот, перево- ной тРНК. Теперь образовавшаяся в резуль-
дится на язык белков, состоящий из 20 букв. тате дипептидил-тРНК перемещается из
Как и следовало ожидать, трансляция - про- А-участка в Р-участок, в то время как осво-
цесс более сложный, чем репликация или бодившаяся молекула тРНК покидает рибо-
транскрипция ДНК, которые происходят сому. Связывание аминоацил-тРНК, пере-
с использованием одного и того же языка мещение пептидил-тРНК из А-участка
спаривания оснований. Трансляция осу- в Р-участок и одновременное перемещение
ществляется в результате согласованного рибосомы к следующему кодону мРНК тре-
взаимодействия более чем сотни видов ма- буют гидролиза GТР. Затем новая амино-
кромолекул. Помимо рибосом, необходимы ацил-тРНК связывается со свободным А-
молекулы тРНК, активирующих фермен- участком и начинается новый цикл реакции
тов, растворимых факторов и мРНК. элонгации, подобный уже описанному.
Прежде чем перейти к подробному описа- Терминация происходит тогда, когда стоп-
нию синтеза белка, рассмотрим процесс кодон (сигнал терминации) в молекуле
в общих чертах. Белок синтезируется в на- тРНК считывается фактором освобождения
правлении от аминоконца к карбоксильно- белка. Это приводит к отделению завершен-
му концу путем последовательного присое- ной полипептидной цепи от рибосомы. В на-
динения аминокислот к карбоксильному стоящей главе мы будем говорить главным
концу растущей пептидной цепи. Амино- образом о синтезе белка в клетках E.coli, где
ацил-тРНК, в которых карбоксильная груп- этот процесс лучше всего изучен. Некоторые
па аминокислоты присоединена к 3'-концу различия между синтезом белка у прока-
тРНК, играют в этом процессе роль активи- риот и эукариот будут рассмотрены
рованных предшественников. Присоедине- в разд. 29.25.
ние аминокислоты к соответствующей
тРНК катализирует аминоацил- 27.1. Аминокислоты активируются
тРНК—синтетаза. Эта реакция активации, и присоединяются к транспортным РНК
будучи аналогична активации жирных кис- под действием специфических синтетаз
лот, также запускается энергией гидролиза Образование пептидной связи между ами-
АТР. Для каждой аминокислоты имеется по ногруппой одной аминокислоты и СООН-
крайней мере один вид тРНК и специфиче- группой другой аминокислоты термодина-
ский активирующий фермент. Синтез белка
осуществляется в три стадии, называемые
инициацией, элонгацией и терминацией. 27. Синтез белка 87
мически невыгодно. Этот термодинамиче-
ский барьер преодолевается путем актива-
ции СООН-группы аминокислот-предше-
ственников. Активированными промежу-
точными продуктами синтеза белка слу-
жат эфиры аминокислот, в которых карбок-
сильная группа аминокислоты связана с 2'-
или 3'-гидроксильной группой рибозного
остатка на 3'-конце тРНК. Аминоацильная
группа может быстро перемещаться из
2'-положения в 3'-положение и обратно.
Этот активированный промежуточный про-
дукт называется аминоацил-тРНК
(рис. 27.1).
Присоединение аминокислоты к тРНК Рис. 27.1. В аминоацил-тРНК аминокис-
имеет значение не только потому, что при лота связана эфирной связью
этом активируется ее карбоксильная группа с 2'- или 3'-гидроксильной груп-
и она может образовать пептидную связь, пой концевого аденозина.
но и потому, что аминокислоты сами по се-
бе не способны узнавать кодоны в мРНК. цильная группа на 2'- или 3'-гидроксильную
Аминокислоты переносятся к рибосомам группу рибозного остатка на 3'-конце тРНК,
специфическими тРНК, которые и узнают зависит от того, о какой аминокислоте и ка-
кодоны в мРНК. Таким образом, эти тРНК кой аминоацил-тРНК—синтетазе идет
выполняют роль адапторных молекул. речь. Активированная аминокислота может
В 1957 г. Пол Замечник и Малон Хогланд очень быстро перемещаться из 2'- в 3'-поло-
(Paul Zamecnik, Mahlon Hoagland) установи- жение и обратно.
ли, что активация аминокислот и их после- Аминоацил-АМР + тРНК
дующее присоединение к тРНК катализи- Аминоацил-тРНК + AMP.
руются специфическими аминоацил-
тРНК—синтетазами, которые также на- Суммарная реакция этапов активации
зывают активирующими ферментами. и переноса описывается следующим уравне-
В реакциях, катализируемых некоторыми нием:
синтетазами, первая стадия состоит в обра- Аминокислота + АТР + тРНК
зовании аминоациладенилата из аминокис- Аминоацил-тРНК + AMP + РР i .
лоты и АТР. Это активированное соедине-
ние представляет собой смешанный анги- ΔG' для этой реакции близко к нулю, так
дрид, в котором карбоксильная группа как свободная энергия гидролиза эфирной
аминокислоты присоединена к фосфатной связи аминоацил-тРНК соответствует сво-
группе AMP. Другие синтетазы катализи- бодной энергии гидролиза концевой фосфо-
руют реакцию АТР, аминокислоты и тРНК
без промежуточного образования доступно-
го для обнаружения аминоациладенилата.

Следующий этап - перенос аминоациль-


рильной группы АТР. Что же в таком случае
ной группы аминоацил-АМР на молекулу
запускает синтез аминоацил-тРНК? Как
тРНК с образованием аминоацил-тРНК-
и можно было ожидать, реакция запускается
активированного промежуточного продук-
гидролизом пирофосфата. Суммарная реак-
та в синтезе белка. Переносится ли аминоа- ция этих превращений высокоэкзергонична:
Часть IV. Аминокислота + АТР + тРНК + Н 2 О
88 Информация Аминоацил-тРНК + AMP + 2Р i .
Таким образом, на синтез аминоацил-
тРНК затрачиваются две богатые энергией
фосфатные связи. Одна из них расходуется
на образование эфирной связи аминоацил-
тРНК, другая сдвигает равновесие реакции
в сторону образования продукта.
Стадии активации и переноса определен-
ной аминокислоты катализируются одной
и той же аминоацил-тРНК—синтетазой.
В действительности аминоацил-АМР не дис-
социирует из комплекса с синтетазой. Он
прочно связывается с активным центром
фермента нековалентными взаимодействия-
ми. В норме аминоацил-АМР, образующий-
ся в качестве промежуточного продукта син-
теза аминоацил-тРНК, существует в течение
непродолжительного времени, но он вполне
стабилен и может быть легко выделен, если
в реакционной смеси нет тРНК.
Мы уже встречались с ациладенилатным
промежуточным продуктом при активации
Рис. 27.2. Пространственные модели
жирных кислот (разд. 17.6). Интересно от-
валина и изолейцина. Синте-
метить, что Пол Берг (Paul Berg) первым от-
тазы, активные в отношении
крыл этот промежуточный продукт в реак-
этих аминокислот, высоко спе-
ции активации жирных кислот, и он же
цифичны.
позже выяснил, что этот продукт образуется
также при активации аминокислот. Основ-
ное различие между этими реакциями со-
27.2. Надежность синтеза белка
стоит в том, что в первом случае роль акцеп-
определяется высокой специфичностью
тора ацильных групп играет СоА, а во
аминоацил-тРНК-синтетаз
втором - тРНК. Энергетика этих биосинте-
Правильная трансляция генетических ма-
тических реакций очень сходна: обе они ста-
триц обеспечивается высокой специфич-
новятся необратимыми благодаря гидроли-
ностью аминоацил-тРНК—синтетаз. Эти
зу неорганического пирофосфата.
ферменты весьма избирательны в отноше-
Для каждой аминокислоты имеется по
нии активируемых аминокислот и соответ-
крайней мере одна аминоацил-тРНК—син-
ствующей тРНК-акцептора. Как будет ука-
тетаза. Эти ферменты различаются по раз-
зано несколько ниже, молекулы тРНК,
меру, субъединичной структуре и аминокис-
акцептирующие различные аминокислоты,
лотному составу (табл. 27.1).
имеют различные последовательности ос-
Таблица 27.1. Свойства некоторых аминоацнл- нований, благодаря чему синтетазы легко
тРНК-сннтетаз узнают их. Гораздо более сложная задача
для этих ферментов - различать сходные
аминокислоты. Например, единственное
Источник Специфич- Масса, Субъеди- различие между изолейцином и валином со-
ность к ами- кДа ничная стоит в том, что изолейцин содержит лиш-
нокислоте структура
нюю метиленовую группу (рис. 27.2). До-
полнительная энергия связывания, которую
вносит эта лишняя группа —СН2—, благо-
E.coli Гистидин 85 α2
E.coli Изолейцин 114 Одна цепь
приятствует тому, что активация изолей-
E.coli Лизин 104 цина происходит примерно в 200 раз чаще,
α2
E.coli Глицин 227 α2β2
чем активация валина. Концентрация ва-
Дрожжи Лизин 138 α2 лина in vivo примерно в 5 раз выше концен-
Дрожжи Фенилалакин 270 α2β2 трации изолейцина, так что валин должен
Поджелудоч- Триптофан 108 α2
ная железа бы-
ка
27. Синтез белка 89
был бы неправильно включаться вместо
изолейцина в одном случае из 40. Однако
наблюдаемая частота ошибок in vivo соста-
вляет всего одну на 3000. Это указывает, что
должна существовать еще какая-то стадия
коррекции ошибок для увеличения надежно-
сти. Действительно, синтетаза исправляет
собственные ошибки. Валин, активиро-
ванный по ошибке, не переносится на тРНК,
специфичную к изолейцину. Вместо этого
тРНК способствует гидролизу валин-АМР
и таким образом предупреждает его непра-
вильное включение в белки. Кроме того, эта
гидролитическая реакция освобождает син-
тетазу для активации и переноса изолей-
цина правильной аминокислоты. Каким
образом синтетаза избегает гидролиза
изолейцин-АМР - правильного промежу- Рис. 27.3. Исправление ошибок с по-
точного продукта? Скорее всего, гидроли- мощью гидролиза ошибочного
тический участок достаточно велик, чтобы продукта.
там поместился валин-АМР, но слишком
мал для связывания изолейцин-АМР.
Многие другие аминоацил-тРНК—син-
тетазы также содержат, помимо участков
синтеза, гидролитические участки. Возмож-
но, эти участки действуют как двойные
фильтры, обеспечивающие высокую надеж-
ность. Участок синтеза отбрасывает амино-
кислоты, превышающие по размеру нужную
аминокислоту, а гидролитический участок
разрушает те активированные промежу-
точные продукты, которые меньше по раз-
меру, чем требуется. Очевидно, высокая на-
дежность синтеза белка в первую очередь
зависит от механизма коррекции с помощью
гидролитической активности, которой обла-
дают многие аминоацил-тРНК—синте-
тазы.
27.3. Молекулы транспортных РНК имеют
общий план строения
В 1965 г, Роберт Холли (Robert Holley) после
семи лет упорных поисков впервые опреде-
лил последовательность оснований одной
из транспортных РНК. При исследовании
дрожжевой аланиновой тРНК была получе-
на первая полная последовательность ну- Рис. 27.4. Последовательность основа-
клеиновой кислоты. Эта работа стала источ- ний дрожжевой аланиновой
ником новых идей, касающихся биологиче- тРНК. Модифицированные ну-
ской активности молекулы тРНК. В процес- клеозиды (отмечены зеленым)
се расшифровки последовательности Холли сокращенно обозначаются сле-
разработал общие методы для определения дующим образом: инозин - I,
последовательности нуклеотидов в нуклеи- метилинозин - mI, дигидро-
новых кислотах. Последовательность дрож- уридин - UH 2 , риботимидин -
Т, псевдоуридин - ψ, метилгу-
Часть IV. анозин - mG и диметилгуано-
90 Информация зин - m2G.
жевой аланиновой тРНК показана на тилированные производные A, U, С и G, ко-
рис. 27.4. Молекула представляет собой од- торые образуются путем ферментативной
ну цепь из 76 рибонуклеотидов. 5'-конец модификации тРНК-предшественника
фосфорилирован (pG), а 3'-конец имеет сво- (разд. 25.17). Роль этих необычных основа-
бодную 3'-гидроксильную группу. Харак- ний неизвестна. Вполне возможно, что мети-
терная особенность этой молекулы - высо- лирование препятствует спариванию неко-
кое содержание оснований, отличных от А, торых оснований и делает их таким образом
U, G и С. В ней содержится девять необы- доступными для других взаимодействий.
чных нуклеотидов: инозин, псевдоуридин, Кроме того, метилирование изменяет ги-
дигидроуридин, риботимидин и метилиро- дрофобность некоторых участков тРНК,
ванные производные гуанозина и инозина. что может иметь важное значение для их
Участок прикрепления аминокислоты пред- взаимодействия с синтетазами и рибо-
ставляет собой 3'-гидроксильную группу сомными белками.
остатка аденозина на 3'-конце молекулы. 3. 5'-конец тРНК фосфорилирован. На
Последовательность IGC в середине моле- 5'-конце обычно расположен остаток pG.
кулы - антикодон. Он комплементарен 4. На 3'-конце всех тРНК находится по-
GCC - одному из кодонов аланина. следовательность ССА. Активированная
аминогруппа прикрепляется к 3'-гидрок-
сильной группе концевого аденозина.
5. Примерно половина нуклеотидов
тРНК спарена и образует участки двойной
спирали (рис. 27.5). Не спарены пять групп
оснований: 3'-концевая область ССА (акцеп-
Вскоре были определены последователь- торная ветвь); ТψC-петля, которая получи-
ности нескольких других молекул тРНК. ла свое название по последовательности ри-
К настоящему времени уже известны после- ботимидин - псевдоурацил - цитозин;
довательности более 70 тРНК. Самое уди- добавочная петля, число остатков которой
вительное, что все эти последовательности различно в разных тРНК; дигидроуридило-
можно изобразить в форме клеверного ли- вая петля, которая содержит несколько
ста, в котором около половины нуклеоти- остатков дигидроуридина; антикодоновая
дов образует пары оснований. Следователь- петля.
но, молекулы тРНК обладают многими 6. Антикодоновая петля состоит из семи
общими структурными особенностями. оснований, расположенных в следующей
В этом факте нет ничего неожиданного, так последовательности:

как все молекулы тРНК должны взаимодей- 27.4. Транспортная РНК имеет L-образную
ствовать примерно одинаковым образом форму
с рибосомами и мРНК. Говоря конкретно, К настоящему времени трехмерная структу-
все молекулы тРНК должны укладываться ра молекулы тРНК установлена на атом-
в А- и Р-участки рибосомы и должны взаи- ном уровне благодаря рентгеновским кри-
модействовать с ферментом, катализирую- сталлографическим исследованиям, осу-
щим образование пептидной связи. ществленным в лабораториях Александра
Все молекулы транспортных РНК обла- Рича и Арона Клуга (Alexander Rich, Aaron
дают следующими общими свойствами. Klug). В результате проведенного ими неза-
1. Все они представляют собой одну цепь висимого рентгенографического изучения
длиной от 73 до 93 рибонуклеотидов (масса фенилаланиновой тРНК получено множе-
около 25 кДа). ство новых данных о структуре молекулы
2. Они содержат много необычных осно- тРНК.
ваний, как правило, от 7 до 15 на молекулу.
Многие из этих необычных оснований пред-
ставляют собой метилированные или диме- 27. Синтез белка 91
Рис. 27.5. Общая схема строения моле- действует с некоторыми основаниями и да-
кул тРНК. же с другим участком самого остова. Во
многих подобных взаимодействиях 2'-ОН-
группа остатков рибозы выступает в каче-
1. Молекула имеет L-образную форму стве донора или акцептора при образовании
(рис. 27.6 и 27.7). водородных связей. Кроме того, значитель-
2. В молекуле имеется два участка двой- ная часть оснований упакована в стопки
ной спирали. Каждая из этих спиралей содер- (межплоскостные взаимодействия). Эти ги-
жит примерно десять пар оснований, что со- дрофобные взаимодействия между соседни-
ответствует одному витку спирали. Спи- ми ароматическими кольцами играют ос-
ральные участки расположены перпендику- новную роль в молекулярной архитектуре.
лярно друг другу, что и придает молекуле 4. ССА-конец - участок прикрепления
L-образную форму. Схема спаривания осно- аминокислоты - расположен на одном из
ваний, постулированная в модели клеверно- концов L. Другой конец L представляет со-
го листа, построенной по результатам опре- бой антикодоновую петлю. Таким образом,
деления последовательности, оказалась пра- аминокислота, связанная в аминоацил-
вильной. тРНК, удалена от антикодона (на расстоя-
3. Большинство оснований вне спи- ние примерно 80 А). Дигидроуридиловая
ральных участков образует необычные во- петля и ТψC-петля образуют угол буквы L.
дородные связи. Эти третичные взаимодей- 5. ССА-конец и прилегающая к нему спи-
ствия возникают между основаниями, ко- ральная область не очень сильно взаимо-
торые обычно не комплементарны друг действуют с остальной молекулой. Эта
другу (например, G—G, А—А и А—С). Бо- часть молекулы может изменять конформа-
лее того, рибозофосфатный остов взаимо- цию при активации аминокислоты и при
синтезе белка на рибосоме.
Часть IV. Определение трехмерной структуры
92 Информация тРНК - важный шаг в изучении процесса
трансляции на молекулярном уровне. Еще
совсем недавно решение этого вопроса каза-
лось делом далекого будущего. Теперь идеи
и усилия исследователей в данной области
обращаются к еще более сложным задачам,
таким, как изучение трехмерной структуры
комплексов аминоацил-тРНК—синтетазы
с тРНК и даже тРНК, связанной с мРНК
и рибосомными белками.

27.5. В узнавании кодона участвует


антикодон, а не активированная присоединенный остаток цистеина превра-
тили в аланин, обработав Cys-тРНК C y s ни-
аминокислота
Мы уже упоминали, что антикодон келем Ренея. В результате атом серы отде-
лился от активированного остатка цисте-
тРНК - участок, узнающий кодон мРНК,
ина; связь цистеина с тРНК при этом не
и что узнавание происходит путем спарива-
затрагивалась.
ния оснований. Играет ли какую-нибудь
роль в этом процессе аминокислота, присое- Так была получена гибридная аминоацил-
тРНК, в которой аланин ковалентно при-
диненная к тРНК? Ответ на этот вопрос
соединен к тРНК, специфичной к цистеину.
был получен следующим путем. Вначале ци-
стеин присоединили к соответствующей
тРНК (она обозначается тРНК С у s ). Затем

Рис. 27.7. Схематическое изображение


трехмерной структуры дрож-
Рис. 27.6. Фотография скелетной модели жевой фенилаланиновой
дрожжевой фенилаланиновой тРНК. (По рисунку, любезно
тРНК, основанная на карте предоставленному д-ром Sung-
электронной плотности с раз- Hou Kim.)
решением 3 А. (Печатается
с любезного разрешения д-ра
Sung-Hou Kim.) 27. Синтез белка 93
Какой кодон узнаёт эта гибридная Так, X и X' должны быть либо А и U (или
тРНК - аланина или цистеина? Ответ был U и А), либо G и С (или С и G). Из этой мо-
получен при использовании этой гибридной дели следует, что каждый антикодон может
тРНК в бесклеточной системе синтеза бел- узнавать только один кодон. Однако факты,
ка. Матрицей служил случайный сополимер, которыми мы располагаем, противоречат
построенный из U и G в соотношении 5 : 1 ; этому. Некоторые выделенные в чистом виде
в норме он вызывает включение цистеина молекулы тРНК могут узнавать более
(UGU), но не аланина (GCX). Но когда в ин- одного кодона. Например, дрожжевая алани-
кубационную смесь добавили Ala-тРНК Cys , новая тРНК, изученная Холли, связывается
произошло включение аланина в полипеп- с тремя кодонами: GCU, GCC и GCA.
тид. Другими словами, аланин включался Только первые два основания этих кодонов
так, как если бы к тРНК, специфичной к ци- одинаковы, третье различается. Может
стеину, был присоединен цистеин. Был сде- быть, узнавание третьего основания кодона
лан вывод, что узнавание кодона не зависит иногда менее избирательно, чем узнавание
от аминокислоты, прикрепленной к двух других? Общая картина вырожденно-
тРНК. сти генетического кода показывает, что дело
Такой же результат был получен в тех может обстоять именно так. XYU и XYC
случаях, когда роль матрицы выполняла всегда кодируют одну и ту же аминокисло-
гемоглобиновая мРНК. В качестве гиб- ту, a X Y A и XYG обычно имеют одинаковый
ридной аминоацил-тРНК использовали смысл. Исходя из этих данных, Крик пред-
14
С-аланил-тРНКCys. Единственный ра- положил, что на спаривание третьего осно-
диоактивный триптический пептид (т. е. пеп- вания должны накладываться менее строгие
тид, содержащий 14С-аланин) соответство- стерические ограничения, чем на спаривание
вал пептиду, который в норме содержит двух других. Были построены модели раз-
цистеин, а не аланин. С другой стороны, ни личных вариантов спаривания оснований,
в одном пептиде, который в норме содержит чтобы определить, какие из них сходны со
аланин, а не цистеин, не было обнаружено стандартными А — U - и G—С-парами в от-
метки. Этот эксперимент, равно как и пре- ношении расстояния и угла между глико-
дыдущий, убедительно доказал, что амино- зидными связями. В это исследование был
кислота в аминоацил-тРНК не играет ника- включен инозин, так как он встречается в не-
кой роли в выборе кодона. которых антикодонах. Если предположить,
что в спаривании третьего основания кодо-
27.6. Молекула транспортной РНК на допустима некоторая стерическая свобо-
может узнавать более одного кодона да («качание», или неоднозначное соответ-
благодаря «качаниям» ствие), то комбинации, приведенные
По каким правилам происходит узнавание в табл. 27.2, кажутся вполне возможными.
кодона антикодоном в тРНК? Проще всего В настоящее время правомочность гипо-
предположить, что каждое из оснований ко- тезы «качаний» доказана. Антикодоны
дона образует уотсон-криковскую пару ос- тРНК с известной последовательностью
нований с комплементарным основанием связываются с теми кодонами, которые
антикодона. Тогда кодон и антикодон дол- предсказывает эта теория. Например, анти-
жны полностью соответствовать друг другу кодоном дрожжевой аланиновой тРНК
с учетом антипараллельности (на схеме
штрих обозначает комплементарное осно-
вание): Таблица 27.2. Допустимые типы спаривания третьего ос-
нования кодона в соответствии с гипотезой «качаний»

Первое основание Третье основание


антикодона кодона

C G
А U
U А или G
G U или С
Часть IV. I U, С или А
94 Информация
является IGC. Эта тРНК узнает кодоны основание в антикодоне. Эти спонтанные
GCU, GCC и GCA: события противоположны по своей сути хи-
мической модификации in vitro аминокис-
лоты, прикрепленной к тРНК. Любопытна
история открытия таких мутантных тРНК.
В течение многих лет генетики знали, что
повреждающее действие некоторых мута-
ций может быть подавлено другой мута-

Итак, I спаривается с U, С и А, как и пред-


сказывает теория.
Фенилаланиновая тРНК, имеющая анти-
кодон GAA, узнает кодоны UUU и UUC, но
не UUA и UUG:

Таким образом, G спаривается с U или с С


в третьем положении кодона, как и пред-
сказывает гипотеза качаний.
Можно сделать два обобщения, касаю-
щихся кодон-антикодонового взаимодей-
ствия.
1. Первые два основания кодона спари-
ваются обычным образом. Узнавание про-
исходит точно. Следовательно, кодоны, ко-
торые различаются по одному из первых
двух оснований, должны узнаваться раз-
личными тРНК. Например, и UUA, и CUA
кодируют лейцин, но считываются раз-
личными тРНК.
2. Первое основание антикодона опреде-
ляет, считывает ли данная молекула тРНК
один, два или три типа кодонов: С и А уз-
нают по одному кодону, U и G - по два ко-
дона, I - три кодона. Итак, одна из причин
вырожденности генетического кода заклю-
чается в неточности, или неоднозначности,
спаривания («качании») третьего основания
кодона. Именно в этом мы усматриваем ос-
новную причину распространенности не-
обычного нуклеозида инозина в антикодо-
нах. Инозин увеличивает число кодонов,
которые способна считывать данная мо-
лекула тРНК (рис. 27.8). Рис. 27.8. Благодаря «качаниям» инозин
может давать пары оснований
27.7. Мутантные молекулы транспортных с цитозином, аденином и ура-
РНК могут подавлять другие мутации цилом.
Новый этап в изучении процесса узнавания
кодона начался в связи с исследованиями
мутантных тРНК, в которых изменено одно 27. Синтез белка 95
Рис. 27.9. Супрессия мутации, приво- различных генах. Один из этих супрессоров
дящей к терминации цепи, вто- считывает UAG как кодон тирозина,
рой мутацией в молекуле
тРНК.

цией. Предположим, какой-то фермент стал


неактивным из-за превращения кодона
GCU (аланин) в кодон GAU (аспартат). Му-
тации какого рода могли бы восстановить
активность этого фермента? что может привести к синтезу активного
1. Обратная мутация того же основания белка вместо неполной полипептидной цепи
А—>С даст исходное кодовое слово. (рис. 27.9). Почему же эта мутантная РНК
2. Другая мутация A—>U даст валин вставляет тирозин в ответ на кодон UAG?
(GUU), который, возможно, полностью или В норме тирозиновая тРНК узнает кодоны
частично восстановит активность фермента. UAC и UAU. Эта мутантная тРНК идентич-
3. Мутация в другом месте того же гена на нормальной тирозиновой тРНК, за ис-
может обратить действие первой мутации. ключением одной замены основания в анти-
Такой измененный белок будет отличаться кодоне: GUA—>CUA. Мутация G—>С пер-
от белка дикого типа двумя аминокислота- вого основания антикодона меняет специ-
ми. фичность узнавания. Как предсказывает
4. Мутация в другом гене может преодо- теория «качаний», измененный антикодон
леть повреждающее действие первой мута- может узнавать только UAG.
ции. Это явление называется межгенной Супрессорная тРНК этого типа будет за-
супрессией. креплена отбором скорее всего в том случае,
В течение долгого времени механизм дей- если мутировавшая тРНК не была необхо-
ствия межгенных супрессоров оставался за- димой. Иными словами, должна существо-
гадкой. Теперь мы знаем из генетических вать другая разновидность тРНК, которая
и биохимических исследований, что боль- узнает те же кодоны, что и мутировавшая
шинство таких супрессоров действует, из- тРНК. Действительно, у E.coli имеются две
меняя считывание мРНК. Рассмотрим различные тРНК, которые в норме узнают
к примеру мутацию, которая приводит к по- кодоны UAC и UAU. Изменяется та тРНК,
явлению терминирующего кодона UAG которая присутствует в небольшом количе-
(т. е. стоп-кодона, или сигнала терминации). стве. Функция этой минорной разновидно-
Результатом мутации будет образование сти тирозиновой тРНК в норме неясна.
неполных полипептидных цепей. Такие му- В связи с существованием такой супрессор-
тации называются нонсенс-мутациями (от ной мутации возникает еще один вопрос. Ес-
англ. nonsense - бессмысленный), так как не- ли мутантный кодон в UAG считывается
полные полипептиды обычно неактивны. как тирозин, а не как сигнал терминации,
Действие нонсенс-мутации UAG может что происходит при нормальной термина-
быть подавлено мутациями в нескольких ции цепей? Как ни странно, большинство
полипептидных цепей в клетках супрессор-
Часть IV. ного мутанта терминируется нормально,
96 Информация возможно, по той причине, что сигнал тер-
супрессия не обладает стопроцентной эф-
фективностью.
Были обнаружены и другие виды му-
тантных тРНК. Миссенс-супрессоры изме-
няют считывание мРНК, так что в ответ на
некоторые кодоны вставляется измененная
аминокислота (например, глицин вместо ар-
гинина). Особенно интересны супрессоры
сдвига рамки. Одна из таких тРНК содержит
лишнее основание в антикодоновой петле.
Благодаря этому она считывает в качестве
кодона четыре основания вместо трех. На-
пример, UUUC считывается как кодон фе-
нилаланина вместо UUU. Такая измененная
тРНК может супрессировать вставку лиш-
него основания.

27.8. Рибосомы - органеллы,


в которых происходит синтез белка,-
состоят из большой и малой субчастиц
Перейдем теперь к механизму синтеза бел-
ка. Этот сложный процесс происходит в ри-
босомах, которые можно рассматривать как
органеллы синтеза белка, подобно тому как
митохондрии считают органеллами окисли-
тельного фосфорилирования. Рибосома -
весьма специализированная и сложная
структура. Ее диаметр - примерно 200 А.
Лучше всего изучены рибосомы E.coli. Мас-
са этой рибосомы составляет 2500 кДа,
а коэффициент седиментации 70S. Ее можно
диссоциировать на большую (50S) и малую
(30S) субчастицы. Далее эти субчастицы
можно диссоциировать на составляющие их
белки и РНК. 30S-субчастица содержит 21
белок и одну молекулу 16S-PHK. 50S-субча-
стица содержит примерно 34 белка и 2 моле-
кулы РНК (23S и 5S). Рибосома E.coli при-
мерно на две трети состоит из РНК и на
одну треть - из белка.
Рибосомы цитоплазмы эукариотических
клеток несколько крупнее бактериальных
рибосом. Интактная эукариотическая рибо-
сома имеет коэффициент седиментации 80S.
Подобно бактериальной рибосоме, она дис-
Рис. 27.10. Электронные микрофотогра- социирует на большую (60S) и малую (40S)
фии 70S-рибосом (А), 50S-суб- субчастицы. Малая субчастица содержит
частиц (Б) и 30S-субчастиц (В). одну молекулу 18S-PHK, а большая субча-
(Печатается с любезного разре- стица - три молекулы РНК (28S, 7S1) и 5S).
шения д-ра James Lake.) Рибосомы митохондрий и хлоропластов от-
личаются от цитоплазматических рибосом
минации представляет собой нечто боль- 1
Эту рРНК по сложившейся традиции чаще
шее, чем просто кодон UAG. Действитель- обозначают 5,8S-PHK.- Прим. перев.
но, известно, что некоторые кодирующие
последовательности заканчиваются двумя
различными стоп-кодонами. Кроме того, 27. Синтез белка 97
1. 16S-PHK необходима для ее сборки
и функционирования. Эта потребность весь-
ма специфична, так как 16S-PHK из дрож-
жей не может заменить 16S-PHK из E.coli.
Роль молекул рибосомной РНК остается
областью пристального интереса со сто-
роны исследователей.
2. В опытах по реконструкции каждый
раз из системы исключали один из белков,
чтобы выяснить, может ли интактная
30S-субчастица образоваться из остальных
20 белков и 16S-PHK. Оказалось, что по
крайней мере шесть белков необходимо для
сборки 30S-частицы.
3. Для сборки функционально активной
Рис. 27.11. Рибосомы можно диссоцииро- 30S-частицы необходимо большинство вхо-
вать примерно на 55 белков дящих в нее белков. Итак, 30S-субчастица
и три молекулы РНК. представляет собой кооперативную целост-
ную в функциональном отношении структу-
ру.
эукариот. Они больше похожи на 70S-ча- 27.10 Белки синтезируются в направлении
стицы, а не на 80S. Между синтезом белка от аминоконца к карбоксильному концу
в митохондриях, хлоропластах и бактериях Одним из первых вопросов, касающихся ме-
имеется много общего. ханизма синтеза белка, был вопрос о том,
синтезируются ли белки в направлении от
27.9. Рибосомы можно реконструировать из аминоконца к карбоксильному концу или
составляющих их молекул белков и РНК
наоборот. Четкий ответ на этот вопрос дали
Рибосомную 30S-субчастицу можно рекон- опыты Говарда Динциса (Howard Dintzis)
струировать из смеси 16S-PHK и 21 белка, с импульсной меткой. Ретикулоциты, актив-
входящего в ее состав. Сборку этих компо-
нентов с образованием функционально ак-
тивной 30S-субчастицы впервые осуществил
Масаясу Номура (Masayasu Nomura)
в 1968 г. Через несколько лет была рекон-
струирована 50S-субчастица. Эти экспери-
менты имели важное значение в двух отно-
шениях. Во-первых, они продемонстрирова-
ли, что вся информация, необходимая для
сборки этой органеллы, содержится в струк-
туре ее компонентов. Для сборки не нужны
никакие внерибосомные факторы. Таким
образом, образование рибосом in vitro пред-
ставляет собой процесс самосборки. Во-
вторых, реконструкцию можно использо-
вать для того, чтобы выяснить, необходим
ли тот или иной компонент для сборки ри-
босомы или собственно для ее функциони-
рования. Например, таким образом был вы-
явлен компонент рибосомы, отвечающий за
ее чувствительность к антибиотику стрепто- Рис. 27.12. Разделение белков рибосом-
мицину (разд. 27.20). Из работ по рекон- ной 50S-субчастицы с по-
струкции 30S-субчастицы были сделаны сле- мощью двумерного электро-
дующие выводы. фореза в полиакриламидном
геле. (Печатается с любезного
Часть IV. разрешения д-ра Charles
98 Информации Cantor.)
27.11. Информационная РНК транслируется
в направлении 5'—>3'
Направление считывания мРНК определя-
ли с помощью синтетического полинуклео-
тида

использованного в качестве матрицы в бес-


клеточной системе синтеза белка. ААА ко-
дирует лизин, а ААС-аспарагин. Полипеп-
тидный продукт имел структуру

Поскольку аспарагин был расположен на


карбоксильном конце, кодон ААС был счи-
тан последним. Следовательно, трансляция
идет в направлении 5'—>3'. Напомним, что
мРНК также синтезируется в направлении
5'—>3' (разд. 25.14). Это означает, что мРНК
может транслироваться уже в то время, ког-
Рис. 27.13. Электрофоретическое разделе- да она еще синтезируется. Действительно,
ние в полиакриламидном геле
белков нативной рибосомной
30S-субчастицы (слева) и рекон-
струированной 30S-субча-
стицы (справа). В реконструи-
рованной субчастице присут-
ствуют все те же белки, что и
в нативной. (Печатается с лю-
безного разрешения д-ра
Masayasu Nomura.)

но синтезирующие гемоглобин, инкубиро-


вали в присутствии 3 Н-лейцина в течение
коротких промежутков времени, недоста-
точных для синтеза полных цепей. Синтези-
рованный в этих условиях гемоглобин раз-
деляли на α- и β-цепи и обрабатывали
трипсином. Затем определяли удельную ра- 3
диоактивность полученных пептидов, т.е. Рис. 27.14. Распределение Н-лейцина
отношение их радиоактивности к общему в α-цепи гемоглобина, синтези-
содержанию лейцина. В пептидах, располо- рованного после инкубации ре-
женных в нативном белке вблизи карбок- тикулоцитов в течение корот-
сильного конца, было больше радиоактив- кого времени в присутствии
ности, чем в пептидах вблизи аминоконца. метки. Более высокая радиоак-
Наблюдалось постепенное возрастание ра- тивность С-конца по сравне-
диоактивности от аминоконца к карбоксиль- нию с N-концом указывает, что
ному концу (рис. 27.14). Сильнее всего был С-конец синтезируется послед-
помечен карбоксильный конец, так как он ним.
синтезировался последним. Следовательно,
направление роста цепей — от аминоконца
к карбоксильному концу. 27. Синтез белка 99
у E.coli 5'-конец мРНК взаимодействует
с рибосомами вскоре после того, как он син-
тезируется (рис. 27.15). Таким образом,
трансляция тесно сопряжена с транскрип-
цией.

27.12. Одну молекулу мРНК одновременно


транслирует несколько рибосом
Одну молекулу мРНК могут одновременно
транслировать несколько рибосом. Это су-
щественно увеличивает эффективность ис-
пользования мРНК. Группа рибосом, свя-
занных с одной молекулой мРНК, назы-
вается полирибосомой или полисомой. Рибо-
сомы, входящие в состав этой структуры,
работают независимо, и каждая из них син-
тезирует полную полипептидную цепь. При
максимальной плотности рибосом на
мРНК одна рибосома приходится на 80 ну-
клеотидов. Полирибосомы, синтезирующие
гемоглобин (цепь гемоглобина содержит
145 аминокислот, а мРНК - соответственно
500 нуклеотидов), обычно состоят из пяти
рибосом. Рибосомы, расположенные ближе Рис. 27.15. Транскрипция участка ДНК
всего к 5'-концу мРНК, несут самые корот- E.coli и трансляция новообра-
кие полипептидные цепи, а те, что ближе зующейся мРНК. Транскриби-
к 3'-концу,- почти полные цепи. После осво- руется лишь часть хромосомы.
бождения полипептидного продукта рибо- [Miller О. L, Hamkalo В. А.,
сомы диссоциируют на 30S- и 50S-субча- Thomas С. A., Jr., Visualization
стицы. of Bacterial Genes in Action,
Science, 169, 392 (1970).]
27.13. Синтез белка в бактериях
инициируется формилметиониновой тРНК
Как начинается синтез белка? A priori про-
стейшая возможность состоит в том, что Ключом к изучению механизма инициа-
транслируется вся мРНК, и никакие особые ции цепи стало открытие того факта, что
сигналы начала синтеза не нужны. Однако примерно половина N-концевых аминокис-
эксперименты показали, что трансляция не лот белков E.coli - метионин, хотя в других
начинается непосредственно на 5'-конце положениях полипептидной цепи эта амино-
мРНК. На самом деле первый трансли- кислота встречается редко. Кроме того, N-
руемый кодон почти всегда расположен на конец новообразованных белков обычно
расстоянии не менее чем 25 нуклеотидов от модифицирован, из чего следует, что в ини-
5'-конца. К тому же многие молекулы циации, очевидно, участвует какое-то про-
мРНК у прокариот полицистронны, т.е. ко- изводное метионина. Действительно, синтез
дируют две или более полипептидные цепи. белка у бактерий начинается с формилме-
Например, одна молекула мРНК длиной тионина (fMet). Существует особая тРНК,
около 7000 нуклеотидов кодирует пять фер- которая переносит формилметионин к ри-
ментов пути биосинтеза триптофана у E.coli. босоме для инициации синтеза белка. Эта
Каждый из этих пяти ферментов имеет инициаторная тРНК (сокращенно обозна-
собственные сигналы начала и конца транс- чается mPHKf) отличается от той тРНК, ко-
ляции в мРНК. На деле все изученные моле- торая вводит метионин во внутренние поло-
кулы бактериальных мРНК содержат сиг- жения (сокращенно тРНК m ). Буква f указы-
налы начала и конца каждой кодируемой вает, что метионин, присоединенный
ими полипептидной цепи. к инициаторной тРНК, может быть форми-
лирован, тогда как метионин, присоеди-
Часть IV. ненный к тРНК m ,- нет.
100 Информация Метионин присоединяет к этим двум раз-
Рис. 27.16. Схематическое изображение
организации полирибосомы
(полисомы). Рибосомы дви-
жутся вдоль мРНК в направле-
нии 5'—>3'. Рибосомы рабо-
тают независимо друг от друга.

новидностям тРНК одна и та же аминоа-


цил-тРНК—синтетаза. Затем специальный
фермент формилирует аминогруппу ме-
тионина, присоединенного к тPHK f . Донор
активированной формильной группы в этой 27.14. Сигналом инициации служит кодон
реакции N 10 -формилтетрагидрофолят. AUG (или GUG), которому предшествует
несколько оснований, способных спариваться
с 16S-PHK
Какие структурные особенности мРНК по-
зволяют системе синтеза белка различать
кодоны AUG? Первым шагом на пути к ре-
шению этого вопроса было выделение ини-
циаторных участков ряда мРНК. Для этого
комплексы мРНК с рибосомами, образо-
вавшиеся в условиях, допускающих инициа-
цию, но не элонгацию, расщепляли панкреа-
тической рибонуклеазой. Во всех случаях от
расщепления была защищена последова-
тельность длиной около 30 нуклеотидов.
Как и предполагалось, каждый из этих ини-
циирующих участков содержал кодон AUG
или GUG (рис. 27.18).
Кроме того, каждый участок инициации
содержит богатую пуринами последова-
тельность, центр которой находится на рас-
стоянии примерно 10 нуклеотидов в 5'-сто-
рону от инициирующего кодона. Роль этого
богатого пуринами участка стала ясна, ког-
да была расшифрована последовательность
16S-PHK. 3'-конец этой рибосомной РНК
содержит последовательность из несколь-
ких оснований, комплементарную богатому
пурином участку в областях инициации

Рис. 27.17. Образование формилметио-


нил-тРНК f . 27. Синтез белка 101
Рис. 27.18. Последовательности участков комплекса без мРНК, a IF-1 и IF-2 способ-
инициации синтеза белка неко- ствуют связыванию инициаторной тРНК
торых бактериальных и ви- с комплексом мРНК и 30S-субчастицы.
русных РНК. Затем 50S-cyбчастица присоединяется
к инициаторному 30S-комплексу, образуя
инициаторный 70S-комплекс. На этом этапе
мРНК. Из продуктов ферментативного рас-
происходит гидролиз связанного GTP. 70S-
щепления инициирующего комплекса уда-
инициаторный комплекс (рис. 27.20) готов
лось выделить комплекс 3'-концевого фраг-
к стадии элонгации белкового синтеза. Мо-
мента 16S-мРНК и области инициации лекула fMet-тPHK f занимает Р-участок (пеп-
мРНК (рис. 27.19). Последовательности бо-
тидильный участок) рибосомы. Второй уча-
лее чем 70 изученных участков инициации
сток на рибосоме для связывания молекулы
показывают, что число пар оснований, ко-
тРНК-А-участок (аминоацильный) - еще
торые мРНК образует с 16S-PHK, колеблет-
пуст. Существование раздельных участков
ся от 3 до 9. Интересно, что изменение силы
Р и А было показано при изучении пуроми-
этого взаимодействия дает возможность ре-
цина - антибиотика, о котором говорится
гулировать эффективность инициации.
ниже (разд. 27.21). Сейчас важно отметить,
Итак, место начала синтеза белка опреде- что fMet-тPHK f располагается таким обра-
ляется взаимодействиями двух типов: спа-
зом, что антикодон спаривается с иниции-
риванием оснований мРНК с 3'-концом
рующим кодоном AUG (или GUG) в мРНК.
16S-pPHK и с формилметиониновой инициа-
Таким образом, рамка считывания устана-
торной тРНК.
вливается специфическим взаимодействием
рибосомы и fMet-тPHK f с мРНК. Напом-
27.15. В результате образования
инициирующего 70S-комплекса формил-
ним, что в этом взаимодействии участвует
метиониновая тРНК связывается
богатый пурином участок, расположенный
со стороны 5'-конца от инициирующего ко-
с Р-участком
Синтез белка начинается с ассоциации дона. Он спаривается с 3'-концом 16S-PHK,
мРНК, рибосомной 30S-субчастицы и фор- входящей в состав 30S-субчастицы. Выясне-
милметиониновой тРНК. Они образуют ние этого сложного способа, которым до-
30S-комплекс инициации (рис. 27.20). Для стигается правильная ориентация инициа-
торной тРНК, породило любопытную про-
образования этого комплекса необходимы
GTP и три белковых фактора, называющих- блему. Каким же образом в опытах по
ся IF-1, IF-2 и IF-3. Один из этих факторов расшифровке генетического кода
(разд. 26.3) могли транслироваться poly(U)
инициации - IF-3 - участвует в связывании
мРНК с 30S-субчастицей. Кроме того, IF-3 и другие синтетические полипептиды без
препятствует ассоциации 50S- и 30S-субча- сигналов начала трансляции? Ответ заклю-
стиц с образованием непродуктивного 70S- чается в том, что, к счастью, в этих экспери-
ментах происходила неспецифическая
трансляция благодаря тому, что концентра-
Часть IV. ция Mg 2 + в реакционной смеси была выше,
102 Информация чем это имеет место in vivo.
Рис. 27.19. Спаривание богатого пурином 27.17. После образования пептидной связи
участка (показано синим цве- происходит транслокация
том) в области инициации Теперь у нас имеется комплекс, в котором
мРНК и 3'-концевого участка аминоацил-тРНК занимает А-участок,
16S-pPHK (красный цвет). Ко-
дон AUG (зеленый цвет) опре-
деляет начало полипептидной
цепи. Показанная на рисунке
мРНК кодирует А-белок фага
R17.

27.16. Фактор элонгации Тu доставляет


аминоацил-тРНК в А-участок рибосомы
Цикл элонгации белкового синтеза вклю-
чает три этапа: 1) связывание аминоацил-
тРНК (узнавание кодона); 2) образование
пептидной связи; 3) транслокация. Цикл
начинается с введения аминоацил-тРНК
в пустой А-участок рибосомы. Выбор опре-
деленной разновидности тРНК зависит от
того, какой кодон мРНК находится
в А-участке. Комплементарная аминоацил-
тРНК доставляется в А-участок белком,
который называется фактором элонгации
EF-Tu. Когда аминоацил-тРНК занимает
правильное положение на рибосоме, проис-
ходит гидролиз GTP, связанного с EF-Tu.
GDP остается прочно связанным с EF-Tu
до тех пор, пока он не вытесняется другим
фактором элонгации, а именно EF-Ts.
Образовавшийся комплекс Тu с Ts распа-
дается при связывании GTP с Тu; новый
комплекс Tu-GTP готов для следующего
раунда элонгации. Эта ассоциация и диссо-
циация белков (рис. 27.21) ускоряется
и приобретает характер повторяющегося
цикла за счет энергии гидролиза GTP.
Важно отметить, что EF-Tu не взаимо-
действует с fMet-mPHK f . Поэтому ини- Рис. 27.20. Стадия инициации синтеза бел-
циаторная тРНК не попадает в А-участок. ка: образование 30S-комплекса
В то же время Меt-тРНКm связывается инициации и затем 70S-ком-
с EF-Tu, подобно всем другим аминоацил- плекса инициации.
тРНК. Этим и объясняется тот факт, что
внутренние кодоны AUG не считываются
инициаторной тРНК. 27. Синтез белка 103
Рис. 27.21. Цикл реакций с участием фак- действовать каталитически. Транслока-
тора элонгации Тu. ция - еще один пример направленного дви-
жения, энергию для которого обеспечивает
а fMet-тРНК занимает Р-участок. Все гото- гидролиз нуклеозидтрифосфата. После
во к образованию пептидной связи транслокации А-участок освобождается
(рис. 27.22). Эту реакцию катализирует пеп- и подготавливается к связыванию аминоа-
тидилтрансфераза - фермент, представляю- цил-тРНК, чтобы начать новый цикл элон-
щий собой составную часть 50S-субча- гации (рис. 27.23).
стицы. Активированный формилметиони-
новый остаток fMet-TPHK f (расположенной 27.18. Синтез белка терминируется
в Р-участке) переносится на аминогруппу факторами освобождения
аминоацил-тРНК (в А-участок), образуя Если А-участок рибосомы занят кодонами
дипетидил-тРНК. UAA, UGA или UAG, то связывания ами-
После образования пептидной связи не- ноацил-тРНК обычно не происходит. Нор-
нагруженная тРНК занимает Р-участок, мальные клетки не содержат тРНК с анти-
а дипептидил-тРНК занимает А-участок. кодонами, комплементарными сигналам
Следующий этап цикла элонгации - транс- термииации. Их узнают белковые факторы
локация. Происходят три перемещения: не- освобождения. Один из этих факторов ос-
нагруженная тРНК покидает Р-участок, вобождения - RF-1 - узнает кодоны UAA
пептидил-тРНК переходит из А-участка или UAG. Второй фактор освобождения —
в Р-участок и мРНК продвигается на три RF-2 - узнает UAA или UGA. Таким обра-
нуклеотида. В результате следующий ко- зом, белки способны узнавать тринуклео-
дон занимает нужное положение для тидные последовательности с высокой спе-
считывания очередной мРНК. Для транс- цифичностью.
локации необходим третий фактор элонга- Связывание одного из факторов освобо-
ции - EF-G (называемый также транслока- ждения с терминирующим кодоном
зой). Во время транслокации происходит в А-участке каким-то образом активирует
гидролиз GTP, связанного с EF-G. Гидро- пептидилтрансферазу, и она гидролизует
лиз GTP обусловливает отделение EF-G связь между полипептидом и тРНК в Р-
от рибосомы. Следовательно, GTP может участке. Фактор освобождения изменяет
специфичность пептидилтрансферазы та-
Часть IV. ким образом, что акцептором активиро-
104 Информация ванного пептидильного остатка становится
лазой. Под действием аминопептидазы мо-
жет произойти отщепление одного или
нескольких N-концевых остатков. И у про-
кариот, и у эукариот концевой метионин
иногда отщепляется в то время, когда син-
тез остальной полипептидной цепи еще
продолжается.
2. При окислении двух цистеиновых
остатков могут образоваться дисульфидные
связи.
3. Боковые цепи некоторых аминокислот
могут быть специфически модифициро-
ваны. Например, некоторые остатки про-
лина и лизина в коллагене гидроксили-
руются. Гликопротеины образуются путем
присоединения сахаров к боковым цепям
аспарагина, серина и треонина. Некоторые
белки фосфорилируются. К ферментам ко-
валентно присоединяются простетические
группы, например липоевая кислота.
4. Полипептидные цепи могут подвер-
гаться специфическому расщеплению, на-
пример при превращении проколлагена
в коллаген и проинсулина в инсулин.
Трансляция мРНК вируса полиомы дает
очень длинную полипептидную цепь, кото-
рая гидролизуется с образованием не-
скольких белков.
27.20. Стрептомицин ингибирует инициацию
и вызывает неправильное считывание
информационной РНК
Мы уже видели, что антибиотики - чрезвы-
чайно важный инструмент в биохимиче-
ских исследованиях, так как действие мно-
гих антибиотиков весьма специфично. На-
пример, рифампицин - мощный ингибитор
инициации синтеза РНК (разд. 25.18). Из-
вестно много антибиотиков, ингибирую-
щих синтез белка (табл. 27.3). В случае
Рис. 27.22. Образование пептидной связи. некоторых из них установлен и меха-
низм действия. Стрептомицин - сильно ос-
новной трисахарид - препятствует связыва-
Н 2 О, а не аминогруппа. Затем полипептид- нию формилметионил-тРНК с рибосомами
ная цепь покидает рибосому. 70S-рибосома и нарушает таким образом правильную
диссоциирует на 30S- и 50S-субчастицы инициацию белкового синтеза. Кроме того,
и приготавливается к синтезу новой белко- стрептомицин вызывает неправильное
вой молекулы. считывание мРНК. Если в качестве матри-
цы используется poly(U), то наряду с вклю-
27.19. Многие белки модифицируются чением фенилаланина (UUU) происходит
после трансляции включение изолейцина (AUU). Место дей-
Многие полипептиды, образующиеся при ствия стрептомицина в рибосоме было
трансляции мРНК,- еще не окончательные определено в результате опытов по рекон-
продукты. Они могут быть впоследствии струкции компонентов рибосом из чув-
модифицированы различными способами.
1. Формильная группа на N-конце бакте-
риальных белков гидролизуется деформи- 27. Синтез белка 105
Рис. 27.23. Стадия элонгации синтеза бел-
ка: связывание аминоацил-
тРНК, образование пептидной
связи и транслокация.

ствительных и устойчивых к стрептомици-


ну бактерий. Такие штаммы бактерий
различаются мутацией в единственном
гене. Чем же различаются эти рибосомы?
Поскольку рибосомы можно диссоцииро-
вать и реконструировать in vitro, предста-
влялась возможность выяснить, где распо-
ложен детерминант чувствительности
к стрептомицину - в 50S- или 30S-субчасти-
це. Гибридные рибосомы из 50S-субчастиц
устойчивых бактерий и 30S-субчастиц чув-
ствительных бактерий оказались чувстви-
тельными к стрептомицину, а рибосомы, по-
лученные из субчастиц в обратной комбина-
ции, устойчивы к нему. Этот эксперимент
показал, что детерминант чувствительно-
сти к стрептомицину локализован в 30S-суб-

Часть IV.
106 Информация
Таблица 27.3. Антибиотики - ингибиторы синтеза белка

Антибиотик Действие

Стрептомицин Ингибирует инициацию и вызы-


вает неправильное считывание
мРНК (у прокариот)
Тетрациклин Связывается с 30S-субчастицей
и ингибирует связывание аминоа-
цил-тРНК (у прокариот)
Хлорамфеникол Ингибирует пептидилтрансфе-
разную активность 50S-субча-
стицы рибосом (у прокариот)
Циклогексимид Ингибирует пептидилтрансфе-
разную активность 60S-субча-
стины рибосом (у эукариот)
Эритромицин Связывается с 50S-субчастицей
и ингибирует транслокацию (у Рис. 27.24. Структура пуромицина напо-
прокариот) минает аминоацилированный
Пуромицин Вызывает преждевременную
конец аминоацил-тРНК.
терминацию цепи, действуя в ка-
честве аналога аминоацил-тРНК
(у прокариот и эукариот)
с рибосомы. Пуромицин был использован
для изучения функционального состояния
рибосом. Концепция существования А-
частице. Следующий эксперимент проде- и Р-участков возникла в результате опытов
монстрировал, что чувствительность с использованием пуромицина для выясне-
к стрептомицину определяется каким-то ния локализации пептидил-тРНК. Когда
белком 30S-субчастицы, а не молекулой пептидил-тРНК находится в А-участке (до
16S-PHK. Наконец, после ряда сложных транслокации), она не может вступать в ре-
экспериментов оказалось, что чувствитель- акцию с пуромицином.
ность к стрептомицину детерминируется
только одним белком, входящим в состав 27.22. Некоторые короткие пептиды
30S-субчастицы S12. синтезируются без участия рибосом
Теперь мы перейдем к другому механизму
27.21. Пуромицин вызывает преждевремен- образования пептидной связи в биологиче-
ную терминацию цепи, так как имитирует ских системах. Рассмотрим в качестве при-
амииоацилированную транспортную РНК мера биосинтез грамицидина S - цикличе-
Антибиотик пуромицин ингибирует синтез ского пептидного антибиотика, состоящего
белка, поскольку он освобождает ново- из двух идентичных пентапептидов, соеди-
образованные полипептидные цепи еше до ненных «голова к хвосту» (рис. 27.25). Этот
того, как завершается их синтез. Пуроми- антибиотик продуцируют некоторые
цин-аналог концевого участка аминоацил- штаммы спорообразующей бактерии
тРНК аминоациладенозина (рис. 27.24). Он Bacillus brevis.
связывается с А-участком рибосомы и пре- Биосинтез грамицидина S происходит
пятствует связыванию аминоацил-тРНК. в отсутствие рибосом или мРНК. Для него
Кроме того, пуромицин содержит α-амино- необходим гораздо более простой синтети-
группу. Эта аминогруппа, подобно амино- ческий аппарат, состоящий всего лишь из
группе аминоацил-тРНК, образует пептид- двух ферментов - EI и ЕII. Фермент ЕII
ную связь с карбоксильной группой расту- (масса 100 кДа) активирует фенилаланин,
щей пептидной цепи в результате реакции, остальные четыре аминокислоты пентапеп-
катализируемой пептидилтрансферазой. тидного фрагмента активируются EI (масса
Образующийся продукт представляет со- 180 кДа). Кроме того, оба фермента уча-
бой пептид с ковалентно присоединенным
остатком пуромицина на карбоксильном
конце. Затем пептидилпуромицин сходит 27. Синтез белка 107
переносится на иминогруппу L-пролиново-
го остатка, присоединенного к EI, с обра-
зованием дипептида. В последующих ре-
акциях участвует только E I . Активирован-
ная карбонильная группа остатка пролина
в составе дипептида реагирует с амино-
группой валинового остатка, прикреплен-
ного к тому же ферменту, и дает трипеп-
тид. Этот процесс повторяется с участием
орнитина и затем лейцина, образуя в ре-
зультате пентапептид, связанный с фермен-
том. С возникновением каждой новой пеп-
тидной связи растущий пептид переносится
на новую сульфгидрильную группу. Нако-

Рис. 27.25. Последовательность амино-


кислот в грамицидине S, цикли-
ческом пептиде, состоящем из
двух одинаковых пентапеп-
тидных групп.

ствуют в образовании пептидной связи.


В этой системе аминокислоты активи-
руются путем образования тиоэфиров, свя-
занных с ферментами. Вместо 3'-концевой
гидроксильной группы тРНК активиро-
ванные аминокислоты присоединяются
к сульфгидрильной группе EI и EII:

Если инкубировать L-пролин, L-валин,


L-орнитин и L-лейцин с EI в присутствии
АТР, они образуют тиоэфирные связи
с определенными сульфгидрильными груп-
пами ЕI. Точно так же D-фенилаланин
в присутствии АТР образует тиоэфирную
связь с ЕII. нец, активированные пентапептиды, при-
Синтез пептида в этой системе иниции- соединенные к двум различным молекулам
руется взаимодействием EI и ЕII. Остаток EI, реагируют друг с другом с образова-
D-фенилаланина, присоединенный к ЕII, нием циклического грамицидина S.

Часть IV.
108 Информация
Следует отметить две особенности этого на специфическая тРНК. Все транспортные
биосинтетического пути. РНК, обладающие различной специфич-
1. Аминокислотная последовательность ностью, характеризуются общим планом
грамицидина S определяется простран- строения. Это - одиночные цепи РНК дли-
ственной организацией и специфичностью ной примерно 80 нуклеотидов, содержащие
ферментов EI и ЕII. На каждую пептидную некоторые модифицированные (например.
связь приходится по меньшей мере одна метилированные) производные обычных
субъединица белка. Выходит, что этот спо- оснований. Последовательности оснований
соб синтеза уступает по экономичности всех известных тРНК могут быть напи-
рибосомному механизму. Поэтому пеп- саны в виде клеверного листа, в котором
тиды, содержащие более чем примерно 15 примерно половина нуклеотидов спарена.
остатков, не синтезируются с помощью Кристаллографические исследования с по-
этого механизма. мощью рентгеновских лучей показали, что
2. Синтез грамицидина S напоминает молекула тРНК имеет L-образную форму.
синтез жирных кислот в том отношении, На одном конце L-образной структуры на-
что активированными промежуточными ходится 3'-концевая ССА-последователь-
продуктами в обоих процессах служат ность, являющаяся местом присоединения
тиоэфиры. Кроме того, EI содержит кова- аминокислоты, на другом конце, на рас-
лентно связанный остаток фосфопантете- стоянии около 80А,- антикодон. Информа-
ина. Возможно, этот тиол переносит расту- ционная РНК узнает антикодон тРНК,
щую пептидную цепь с одного участка ЕI а не присоединенную к тРНК аминокисло-
на следующий. Фриц Липман (Fritz ту. Кодон мРНК образует пары оснований
Lipmann) предположил, что синтез полипеп- с антикодоном тРНК. Некоторые тРНК
тидных антибиотиков, возможно, предста- узнают более одного кодона благодаря то-
вляет собой как бы атавизм, напоминаю- му, что спаривание третьего основания ко-
щий о примитивном механизме синтеза дона менее избирательно, чем спаривание
белка, который использовался на заре эво- двух других (гипотеза «качаний», неодноз-
люции. Синтез рибосомных белков мог начного соответствия; wobble-hypothesis).
возникнуть в результате эволюции синтеза Синтез белка происходит на рибосомах,
жирных кислот. образованных из больших и малых субъе-
диниц. В каждом из них примерно две тре-
Заключение ти массы приходится на долю РНК и одна
Синтез белка (трансляция) зависит от треть-на белок. 70S-рибосома E.coli (мас-
координированного взаимодействия более са 2500 кДа) состоит из 30S- и 50S-субча-
чем 100 макромолекул, к которым, помимо стиц.
рибосом, относятся мРНК, тРНК, активи- Синтез белка происходит в три этапа,
рующие ферменты и белковые факторы. называемых соответственно инициацией,
Синтез белка начинается с активации ами- элонгацией и терминацией. Информацион-
нокислот аминоацил-тРНК-синтетазами ная РНК, формилметионил-тРНКf и 30S-
(активирующими ферментами) за счет субчастица рибосомы соединяются, образуя
энергии АТР. Синтетазы соединяют кар- 30S-комплекс инициации. Сигналом начала
боксильную группу аминокислоты с 2'- или трансляции служит кодон AUG (или
3'-гидроксильной группой остатка аденози- GUG), которому предшествует богатая пу-
на на 3'-конце тРНК. Для каждой амино- рином последовательность, способная спа-
кислоты имеется по меньшей мере один
активирующий фермент. Кроме того, для
каждой аминокислоты имеется хотя бы од- 27. Синтез белка 109
риваться с 16S-pPHK. Затем 50S-субчасти- и UAG, что приводит к гидролизу связи
ца рибосомы присоединяется к этому ком- между полипептидом и тРНК. При обра-
плексу, что приводит к образованию 70S- зовании 70S-комплекса инициации, при
комплекса инициации, готового к следую- связывании аминоацил-тРНК с рибосомой
щему этапу. Цикл элонгации включает и на стадии транслокации происходит ги-
связывание аминоацил-тРНК (узнавание дролиз GTP. Различные стадии синтеза
кодона), образование пептидной связи белка избирательно ингибируются токси-
и транслокацию. Рост цепи происходит нами и антибиотиками. Пептидные анти-
в направлении от N-конца к С-концу. биотики и другие короткие полипептиды
Терминацию синтеза белка осуществляют синтезируются без рибосом, причем меха-
факторы освобождения, которые узнают низм их образования напоминает синтез
терминирующие кодоны UAA, UGA жирных кислот.

РЕКОМЕНДУЕМАЯ Транспортная РНК to nonsense triplets and ribosome bindi-


Schimmel P., Soil D., Abelson J. (eds.) ng sites, Proc. Nat. Acad. Sci., 71,
ЛИТЕРАТУРА
1979. Transfer RNA. Cold Spring 1342-1346.
С чего начать Harbor Laboratory. (В части I рассмо- Steitz J.A., Jakes K., 1975. How
трены структура, свойства и узнава- ribosomes select initiator regions in
Miller О.L., Jr., 1973. The visualization ние, а в части II - биосинтез и генетика mRN A: base pair formation between the
of genes in action, Sci. Amer., 228(3), тРНК. Авторитетный и содержа- 3'-terminus of 16S rRNA and the mRNA
34-42. тельный труд.) during initiation of protein synthesis in
Rich A., Kim S.H., 1978. The three- Kim S.-H., 1978. Three-dimensional Escherichia coli, Proc. Nat. Acad. Sci., 72,
dimensional structure of transfer RNA, structure of transfer RNA and its 4734-4738.
Sci. Amer., 238(1), 52-62. functional implications, Advan. Enzy- Gupta S.L, Waterson J., Sopori M.,
Clark B.F.C., Marcher K.A., 1968. mol, 46, 279-315. Weissman S.M., Lengyel P., 1971., Mo-
How proteins start, Sci. Amer., 218(1), Jack A., Ladner J.E., Klug A., 1976. vement of the ribosome along the
36-42. Crystallographic refinement of yeast messenger ribonucleic acid during
phenylalanine transfer RNA ot 2,5 A protein synthesis, Biochemistry, 10,
Книги, посвященные синтезу белка resolution, J. Mol. Biol., 108, 619-649. 4410-4421.
Weissbach H., Pestka S. (eds.), 1977. Sussman J.L., Kim S.-H., 1976. Three- Kaziro Y., 1978. The role of GTP in
Molecular Mechanisms of Protein dimensional structure of a transfer RNA polypeptide chain elongation, Biochim.
Biosynthesis, Academic Press. (Содер- in two crystal forms, Science, 192, Biophys. Acta, 505, 95-127.
жит статьи о синтетазах, структуре 853-858.
и функции рибосом, инициации, элон- Надежность трансляции
гации, транслокации, терминации Амноацил-тРНК синтетазы Fersht A., Dingwall C., 1979. Evidence
и антибиотиках-ингибиторах белко- Schimmel P.R., Soil D., 1979. Amino for the double-sieve editing mechanism
вого синтеза.) acyl-tRNA synthetases: general features in protein biosynthesis, Biochemistry,
and recognition of transfer RNAs, Ann. 18, 2627-2631.
Cold Spring Harbor Laboratory, 1969. Rev. Biochem., 48, 601-648.
Антибиотики и токсины
Mechanisms of Protein Biosynthesis
Pestka S., 1971. Inhibitors of ribosome
(Cold Spring Harbor Symposium on Инициация, элонгация и терминация
function, Ann. Rev. Microbiol., 25,
Quantitative Biology, vol. 34). Dintzis H.М., 1961. Assembly of
487-562.
the peptide chains of hemoglo-
Jimenez A., 1976. Inhibitors of trans-
Рибосомы bin, Proc. Nat. Acad. Sci., 47, 247-
lation, Trends Biochem. Sci., 1, 28-29.
Nomura M., Tissieres A., Lengyel P. 261. (Важные эксперименты по
(eds.) 1975. Ribosomes, Cold Spring импульсной метке, показавшие, что Tai P.-C., Wallace B.J., Davis B.D.,
Harbor Laboratory. (Содержит вели- белки синтезируются в направлении 1978. Streptomycin causes misreading of
natural messenger by interacting with
колепные статьи о структуре, функ- от аминоконца к карбоксильному
ribosomes after initiation, Proc. Nat.
ции и сборке рибосом.) концу.)
Brimacombe К., Staffer G., Witt- Steitz J.A., 1979. Genetic signals and Acad. Sci., 75, 275-279.
тапп H.G., 1978. Ribosome structure, nucleotide sequences in messenger RNA. Нерибосомный синтез пептидов
Ann. Rev. Biochem., 47, 217-249. In: Goldberger R.F. (ed.), Biological Lipmann F., 1971. Attempts to map
Wittman H.G., 1977. Structure and Regulation and Development, vol. I, a process evolution of peptide
function of Escherichia coli ribosomes, pp. 349-399, Plenum. biosynthesis, Science, 17 , 875-884.
Fed. Proc., 36, 2025-2080. Shine J., Dalgarno L., 1974. The Perlman D., Bondanszky M., 1971. Bio-
Nomura M., 1973. Assembly of bacterial 3'-terminal sequence of Escherichia coli synthesis of peptide antibiotics, Ann.
ribosomes, Science, 179, 864-873. 16S ribosomal R N A : complementarity Rev. Biochem., 40, 449-464.
Lipmann F., 1973. Nonribosomal poly-
Часть IV. peptide synthesis on polyenzyme
110 Информация templates, Ace. Chem. Res., 6, 361-367.
Вопросы и задачи активирующая группа отщепляется от при-
соединяющегося к растущей цепи мономе-
1. Образование Ile-тРНК происхо- ра. Укажите, по какому из механизмов, 1-му
дит через связанный с фермен- или 2-му, протекают следующие реакции
том промежуточный продукт Ilе-АМР. Бу- биосинтеза.
дет ли, по вашему мнению, образовываться а) Синтез гликогена.
32 32
Р-меченный АТР из РР i , если инкубиро- б) Синтез жирных кислот.
вать каждый из следующих наборов компо- в) С5 —> С10 —> С 15 при синтезе
нентов в присутствии специфического акти- холестерола.
вирующего фермента? г) Синтез ДНК.
32
а) АТР и PPi. д) Синтез РНК.
б) тРНК, АТР и РР i .
32
е) Синтез белка.
в) Изолейцин, АТР и 3 2 Р Р i . 5. Мутации, в результате которых
2. Из бактерий, выращенных на возникают терминирующие ко-
«тяжелой» (содержащей 13С и доны, называются нонсенс-мутациями. Эти
15
N) и на «легкой» ( 1 2 С и l4 N) среде, получи- мутации могут быть супрессированы изме-
ли рибосомы. Эти 70S-рибосомы добавили ненными тРНК. Например, мутантная РНК
в систему с активным синтезом белка in считывает кодон UGA как триптофановый
vitro. Через несколько часов из смеси ото- кодон. Какое наиболее вероятное замеще-
брали пробу и проанализировали ее центри- ние основания произошло в этой мутантной
фугированием в градиенте плотности. тРНК?
Сколько полос 70S-рибосом вы ожидаете 6. Придумайте реактив для кова-
увидеть в градиенте плотности? лентного мечения по сродству
3. Сколько богатых энергией фос- участков связывания тРНК в рибосоме. Как
фатных связей затрачивается на бы вы синтезировали такой реактив?
синтез белка из 200 остатков, если исходить 7. мРНК-транскрипт одного гена
из готовых аминокислот? фага Т7 содержит следующую
4. Существует два основных меха- последовательность оснований:
низма элонгации биологических
молекул (рис. 27.26). 1-й механизм основан

Предскажите, к какому результату приведет


мутация отмеченного стрелкой G при его
замене на А.
8. Что общего между коррекцией
ошибок при синтезе белка
и ДНК?
Рис. 27.26. Два механизма элонгации. Дополнительные вопросы см.: Wood W. В.,
на отщеплении активирующей группы (по- Wilson J.H., Benbow R.M., Hood L. E.,
меченной на рисунке крестиком) от расту- Biochemistry: A Problems Approach,
щей цепи. При синтезе по 2-му механизму Benjamin, 1974, ch. 18.
ГЛАВА 28 Главный фермент в метаболизме этого са-
хара - β-галактозидаза, гидролизующая
Регуляция выражения лактозу на галактозу и глюкозу (рис. 28.1).
При выращивании на лактозе клетка Е. coli
гена в фенотипе содержит несколько тысяч молекул β-галак-
Мы уже видели, что активность многих бел- тозидазы. Если же выращивать Е. coli на
ков регулируется с помощью различных ме- других источниках углерода, например на
ханизмов, например протеолитической ак- глюкозе или глицероле, то число молекул
тивации, аллостерических взаимодействий β-галактозидазы на клетку не достигает де-
и ковалентной модификации. В этой главе сяти. Лактоза индуцирует значительное уве-
рассматривается регуляция скорости синте- личение количества β-галактозидазы в клет-
за белка, которая также играет принци- ке Е. coli, причем она вызывает синтез новых
пиально важную роль в обшей картине ме- молекул фермента, а не активирует профер-
таболизма клетки. У бактерий активность мент (рис. 28.2). Следовательно, β-галакто-
гена регулируется в основном на уровне зидаза - индуцибельный фермент. Одновре-
транскрипции, а не трансляции. Мы сосредо- менно и согласованно с β-галактозидазой
точим внимание на лактозном и триптофа- синтезируются еще два белка - галактозид-

новом оперонах Е. coli и на регуляторных пермеаза и тиогалактозид-трансацетилаза.


аспектах цикла развития бактериофага λ, Пермеаза необходима для переноса лак-
так как молекулярные механизмы регуля- тозы через бактериальную клеточную мем-
ции в этих системах хорошо изучены. Более брану, трансацетилаза же не имеет суще-
того, именно интенсивное исследование ственного значения для метаболизма лак-
этих систем позволило сформулировать не- тозы. Физиологическая роль трансацети-
которые общие принципы регуляции выра- лазы пока не установлена, in vitro она ката-
жения гена в фенотипе (экспрессии гена) лизирует перенос ацетильной группы аце-
у прокариот и вирусов. Экспрессия гена у эу- тил-СоА на гидроксильную группу при С-6
кариот регулируется иначе, как это станет тиогалактозида.
очевидно из следующей главы. Физиологическим индуктором β-галакто-
зидазы является аллолактоза, которая обра-
28.1. β-Галактозидаза - зуется из лактозы в результате реакции
индуцибельный фермент трансгликозилирования. Синтез аллолак-
Е. coli может использовать лактозу в каче- тозы катализируется теми несколькими мо-
стве единственного источника углерода. лекулами β-галактозидазы, которые имеют-
ся в клетке еще до индукции. Изучение
Часть IV. природы индукторов показало, что неко-
112 Информация торые β-галактозиды служат индукторами,
от какого-то общего элемента, отличного
от генов, кодирующих их последовательно-
сти. Ген этого общего регуляторного эле-
мента был обозначен i. Индуцибельные бак-
терии дикого типа имеют генотип
+ + + +
i z y a , а конститутивные мутанты по
-- + + +
лактозным генам - генотип i z y a .
Каким образом осуществляется влияние
гена i на скорость синтеза белков, коди-
руемых генами z, у и а? Проще всего было
предположить, что ген i кодирует синтез не-
коего компонента цитоплазмы, названного
репрессором, которого либо совсем нет в
i---клетках, либо он там неактивен. Эта идея
была проверена в ряде изящных генетиче-
ских экспериментов с частично диплоидны-
ми бактериями, имевшими два набора генов
лактозной области. Один набор содержался
в бактериальной хромосоме, а второй - в по-
Рис. 28.1. β-Галактозидаза гидролизует ловом факторе F', введенном в клетку при
лактозу. конъюгации. Например, был получен ди-
плоид i + z - - / F i - - z + . У этого диплоида гены
i + z - - находятся в хромосоме, а гены i - - z + - в
не являясь при этом субстратами β-галакто- эписоме. Является ли этот диплоид индуци-
зидазы, тогда как другие соединения ведут бельным или конститутивным в отношении
себя как субстраты, не будучи при этом ин- β-галактозидазы? Другими словами, может
дукторами. Например, изопропилтиогалак- ли ген i+ бактериальной хромосомы подав-
тозид (ИПТГ) неметаболизируемый индук- лять экспрессию гена z+, расположенного
тор (его также называют холостым индук- в эписоме? Эксперимент дал совершенно
тором).

28.2. Открытие регуляторного гена


Ключом к изучению механизма индукции
β-галактозидазы стало открытие того фак-
та, что под действием всех исследованных
индукторов количество пермеазы и транса-
цетилазы возрастало прямо пропорцио-
нально количеству β-галактозидазы. Даль-
нейший прогресс был достигнут при изуче-
нии мутантов. Оно показало, что β-галакто-
зидаза, пермеаза и трансацетилаза коди-
руются тремя генами - z, у и а соответствен-
но - которые расположены друг за другом.
Были получены мутанты, утратившие спо-
собность к синтезу одного из этих белков.
Например, генотип z - - y + a + обозначает, что
у данного мутанта нет β-галактозидазы, но Рис. 28.2. Увеличение количества β-га-
имеются в нормальном количестве пермеа- лактозидазы идет параллельно
за и трансацетилаза. Наибольший интерес увеличению числа клеток в рас-
представляет класс мутантов, у которого тущей культуре E.coli. Наклон
мутацией затронуты все три белка. Такие этого графика указывает, что
конститутивные мутанты синтезируют без β-галактозидаза составляет
всякого индуктора большие количества 6,6% всего синтезируемого бел-
β-галактозидазы, пермеазы и трансацети- ка.
лазы. Франсуа Жакоб и Жак Моно (Francois
Jacob, Jacques Monod) пришли к выводу, что 28. Регуляция выражения
скорость синтеза этих трех белков зависит гена в фенотипе 113
Рис. 28.3. Карта лактозного оперона
и его регуляторного гена.
В карте масштаб не соблюден:
участки р и о в действительно-
сти гораздо меньше, чем коди-
рующие участки генов.

Рис. 28.4. Схема лактозного оперона 28.3. Оперон - единица координированной


в репрессированном (А) и инду- генетической экспрессии
цированном (Б) состояниях. На основе только что описанных экспери-
ментов Жакоб и Моно постулировали мо-
дель оперона, объясняющую регуляцию бел-
кового синтеза. Генетические элементы этой
четкий результат: диплоид индуцибелен, а не модели - регуляторный ген, операторный
конститутивен. Такой же результат был по- ген и набор структурных генов (рис. 28.3).
-- + + --
лучен и в отношении диплоида i z / F i z . Регуляторный ген продуцирует репрессор,
Следовательно, ген i кодирует способный который может взаимодействовать с опера-
к диффузии репрессор. торным геном. В дальнейшем выяснилось,
что репрессор представляет собой белок.
Часть IV. Операторный ген расположен рядом по со-
114 Информация седству со структурными генами, которые
он контролирует. Связывание репрессора способность связываться с ИПТГ. Уолтер
с операторным геном препятствует тран- Гилберт и Бенно Мюллер-Хилл (Walter
скрипции структурных генов. Операторный Gilbert, Benno Muller-Hill) установили, что
ген в совокупности со структурными гена- lас-репрессор - белок, который связывается
ми, рядом с которыми он расположен, назы- с ДНК, содержащей lас-оперон, но не связы-
вается опероном. В случае лактозного оперо- вается ни с одной другой ДНК. Как и пред-
на ген i - регуляторный ген, ген о - ген-опе- полагалось, ИПТГ подавляет связывание
ратор, а гены z, у и а - структурные гены. lас-репрессора с lас-операторной ДНК.
Кроме того, существует еще промоторный Клетка Е. coli дикого типа содержит всего
участок (обозначаемый символом р) для около десяти молекул lас-репрессора. При
связывания РНК-полимеразы. Этот участок очистке репрессора возникли трудности,
инициирования транскрипции расположен связанные с тем, что он составляет всего
перед операторным геном. Индуктор, на- 0,001% общего содержания белка. Однако
пример изопропилтиогалактозид (ИПТГ), существуют isq-мутанты, имеющие, по-види-
связывается с репрессором и тем самым на- мому, более эффективный промотор гена i.
рушает его взаимодействие с операторным У этих мутантов образуется гораздо боль-
геном. Теперь гены z, у и а могут транскри- ше lас-репрессора. Количество lас-репрессо-
бироваться. При этом образуется одна ра увеличивается еще сильнее, если исполь-
длинная молекула РНК, кодирующая все зовать трансдуцирующие фаги, несущие
три белка (рис. 28.4). Молекулу мРНК, ко- область lас. Зараженные таким фагом клет-
дирующую более одного белка, называют ки Е. coli содержат около 20 000 молекул ре-
полицистронным (или полигенным) тран- прессора (примерно 2% всего белка). Это
скриптом. прекрасный исходный материал для выделе-
ния lас-репрессора.
28.4. lас-Репрессор - тетрамерный белок Репрессор - тетрамер из идентичных
При выделении репрессора лактозного опе- субъединиц с массой 37 кДа, каждая из ко-
рона (lас-репрессор) была использована его торых имеет один участок связывания с ин-
дуктором. Константа диссоциации ИПТГ
составляет примерно 10 - 6 М. Репрессор
очень прочно и быстро связывается с опера-
тором. Константа диссоциации комплекса
репрессор-оператор составляет примерно
10 - 1 3 М. Такое высокое сродство обуслов-
лено тем, что в клетке Е. coli дикого типа со-
держится всего несколько молекул реп-
рессора. Константа скорости ассоциации
9 -1 -1
поразительно высока - 7•10 м •с . Из
этого следует, что репрессор находит опера-
торный участок, диффундируя вдоль моле-
кулы ДНК (одномерный поиск), а не ищет
его, находясь в водной среде (трехмерный
1
поиск) .

28.5. Последовательность оснований в


lас-операторе симметрична
Наличие чистого lас-репрессора сделало
возможным выделение lас-оператора
1
Недавно проведенные исследования показали,
что ситуация намного сложнее: поиск оператора
репрессором включает оба указанных механиз-
Рис. 28.5. Электронная микрофотогра- ма и в очень большой степени зависит от ион-
фия lас-репрессора, связанного ного состава среды.- Прим. перев.
с ДНК, содержащей lас-опера-
тор. (Печатается с любезного 28. Регуляция выражения
разрешения д-ра Jack Griffith.) гена в фенотипе 115
налам терминирования транскрипции
(разд. 28.8) и к связыванию пептидного
антибиотика актиномицина D с ДНК
1
(разд. 25.18) .

28.6. Циклический AMP стимулирует


транскрипцию многих индуцибельных
катаболических оперонов
Давно уже известно, что в клетках Е. coli,
растущих на глюкозе, активность катаболи-
ческих ферментов, таких, как β-галактозида-
за, галактокиназа, арабинозо-изомераза
и триптофаназа, находится на очень низком
уровне. Очевидно, было бы совершенно из-
лишним синтезировать эти ферменты в ус-
ловиях изобилия глюкозы 2 . Молекулярный
механизм такого ингибирующего действия
глюкозы, получивший название катаболит-
Рис. 28.6. lас-Репрессор защищает lас- ная репрессия, был расшифрован. Ключом
оператор от расщепления пан- к выяснению этого вопроса явились данные
креатической дезоксирибону- о том, что глюкоза понижает концентрацию
клеазой. циклического AMP в клетках Е. coli. Затем
обнаружилось, что экзогенный циклический
AMP снимает состояние репрессии, обусло-
и определение его последовательности ос- вленное присутствием глюкозы. Последую-
нований. Гилберт и его сотрудники, воздей- щие биохимические и генетические исследо-
ствовав ультразвуком на ДНК фага, содер- вания показали, что циклический AMP
жащего lас-область, получили фрагменты стимулирует инициирование транскрипции
длиной примерно 1000 пар оснований. многих индуцибельных оперонов.
К смеси фрагментов добавили lас-рспрессор Циклический AMP, синтезированный
и затем профильтровали раствор через ни- в отсутствие глюкозы, связывается с БАК
троцеллюлозную мембрану. Фрагменты (белковый активатор катаболизма) - бел-
ДНК, не связанные с lас-репрессором, про- ком, представляющим собой димер из
шли через фильтр, а комплексы ДНК-ре- субъединиц массой 22 кДа. Комплекс БАК
прессор прочно связались с ним. Связанную с циклическим AMP стимулирует тран-
ДНК сняли с фильтра с помощью ИПТГ. скрипцию, связываясь вблизи от многих
Эти элюированные фрагменты ДНК обра- промоторных участков; БАК без AMP та-
ботали панкреатической дезоксирибону- кой способностью не обладает. Опытами по
клеазой в присутствии репрессора. Идея расщеплению дезоксирибонуклеазой было
этого этапа эксперимента состояла в том, установлено, что в случае lас-оперона БАК
что операторный участок, связанный в ком- связывается рядом с участком связывания
плексе с репрессором, должен быть защи- РНК-полимеразы. Точнее, БАК защищает
щен от расщепления дезоксирибонуклеазой от расщепления нуклеотиды от —87 до
(рис. 28.6). Затем установили последова- —49, а РНК-полимераза - нуклеотиды от
тельность оснований этих операторных
фрагментов, определив последовательность 1
При детальном изучении механизма воздей-
транскрибированной с этих фрагментов ствия laс-репрессора с оператором оказалось,
РНК. Последовательность оснований этого что вазимодействию не свойственна такая сим-
участка оказалась очень интересной: 28 пар метрия, так что пока остается не совсем ясным,
почему последовательности laс-оператора (и
оснований расположены симметрично отно- многих других операторов) обладают элемента-
сительно оси второго порядка (рис. 28.7). ми симметрии,- П р и м . перев.
Симметрия репрессора, по-видимому, со- 2
Далеко не очевидно, почему клетки E.coli, как
ответствует симметрии оператора. Этот и многие другие клетки, предпочитают именно
принцип узнавания приложим также к сиг- глюкозу всем остальным источникам углерода
и энергии и используют ее до тех пор, пока ее
содержание не будет исчерпано даже в присут-
Часть IV. ствии значительного избытка других сахаров.—
116 Информация Прим. перев.
Рис. 28.7. Нуклеотидная последователь- с промотором (araI) и оператором (araО)
ность lac-оператора. Симме- образуют арабинозный оперон (рис. 28.9).
тричные участки закрашены Этот оперон регулируется геном (araС), рас-
одинаковым цветом. положенным рядом с операторным участ-

—48 до +5 (рис. 28.8). При этой системе


нумерации первый транскрибируемый ну-
клеотид обозначается +1. Последователь-
ность оснований ДНК, узнаваемая БАК,
обладает симметрией второго порядка, с ко-
торой мы постоянно сталкиваемся при рас-
смотрении взаимодействий белков с ДНК.
Каким образом БАК стимулирует инициа-
цию синтеза лактозной мРНК в 50 раз? По- ком. Подобно лактозному оперону, араби-
следовательное расположение неперекры- нозный оперон может быть активирован
вающихся участков связывания БАК комплексом БАК с циклическим AMP. Ара-
и РНК-полимеразы дает основание думать,
что связывание БАК с ДНК порождает
новые участки взаимодействия РНК-поли-
меразы с ДНК. Лактозный репрессор, на-
против, связывается с нуклеотидами от —3
до +21, которые в значительной степени
перекрываются с участком РНК-полиме-
разы (нуклеотиды от —48 до +5). Таким
образом, репрессор препятствует инициа-
ции, блокируя связывание РНК-полимеразы.
По всей вероятности, комплекс циклический
AMP-БАК действует таким же образом
и на другие индуцибельные опероны. Итак,
индуцибелъные опероны контролируются
с помощью комплементарных механизмов,
которые используют в качестве сигнальных
молекул циклический AMP и специфические
индукторы.

28.7. Различные формы одного и того же бел-


ка активируют и ингибируют
транскрипцию арабинозного оперона
Бактерии могут использовать арабинозу
в качестве источника энергии, превра-
щая ее в ксилулозо-5-фосфат - промежуточ- Рис. 28.8. На схеме показаны БАК
ный продукт пентозофосфатного пути и РНК-полимераза, сидящие
(разд. 15.4). Превращение арабинозы в кси- на ДНК-матрице. Положение
лулозо-5-фосфат происходит в результате этих белков было определено
последовательного действия арабинозо- с помощью расщепления ну-
изомеразы, рибулокиназы и рибулозо-5- клеазой.
фосфат-эпимеразы - ферментов, кодируе-
мых генами araА, araВ и araD соответ- 28. Регуляция выражения
ственно. Эти структурные гены вместе гена в фенотипе 117
вместе с комплексом БАК-сАМР связы-
вается с промоторным участком, что дает
возможность РНК-полимеразе начать тран-
скрипцию. Таким образом, один и тот же
регуляторный белок служит положи-
тельным и отрицательным регулятором.
Рис. 28.9. Карта арабинозного оперона 28.8. Транскрипция триптофанового оперона
и его регуляторного гена. регулируется и аттенюатором, и оператором
Еще один регуляторный элемент был от-
крыт Чарльзом Янофски (Charles Yanofsky)
бинозный оперон был первым, в отношении и его коллегами при изучении триптофано-
которого было установлено наличие и поло- вого оперона E. coli. Транскрибируемая
жительной, и отрицательной регуляций. с этого оперона мРНК длиной 7kb кодирует
Продукт гена аrаС - белок, который суще- пять ферментов, превращающих хоризмат
ствует в двух функционально различных со- в триптофан (разд. 21.9). Эти пять белков
стояниях Р1 и Р 2 . В отсутствие арабинозы синтезируются при трансляции полици-
этот белок действует как репрессор (Р1). стронной trp-мРНК последовательно, коор-
Форма P1 связывается с оператором, что динированно и в эквимолярных количе-
препятствует транскрипции оперона. Араби- ствах. Трансляция начинается раньше, чем
ноза снимает Р1 с оператора и смещает кон- заканчивается транскрипция. trp-мРНК син-
формационное равновесие в сторону Р2 (ак- тезируется примерно за 4 мин и затем бы-
тивирующей формы). Затем форма Р2 стро разрушается. Короткое время жизни

Рис. 28.10. Схема trp-оперона. Показаны trp-мРНК, составляющее всего около 3 мин,
контрольные участки - промо- позволяет бактериям быстро реагировать
тор (р), оператор (о) и аттенюа- на изменяющуюся потребность в триптофа-
тор (а), а также гены, кодирую- не. Е. coli может менять скорость образова-
щие лидерную последователь- ния ферментов биосинтеза триптофана бо-
ность (L), и ферменты пути лее чем в 700 раз.
биосинтеза триптофана (E, D, Как осуществляется эта регуляция?
С, В и А). Первый уровень регуляции достигается пу-
тем взаимодействия специфического репрес-
сора с trp-операторным участком ДНК. trp-
репрессор - белок с массой 58 кДа, коди-
руемый геном trpR, удаленным от trp-оперо-
на на довольно большое расстояние. Ком-
плекс этого репрессора и триптофана прочно
связывается с оператором, тогда как сам по
себе репрессор с ним не связывается. Други-
Рис. 28.11. Последовательность основа- ми словами, триптофан является корепрессо-
ний trp-оператора. Ось симме- ром. Мишень, на которую действует ком-
трии второго порядка обозна- плекс триптофана с репрессором,- участок
чена зеленым. Пара оснований, ДНК, обладающий симметрией второго по-
отмеченная +1,- начало тран- рядка (рис. 28.11); и в этом случае симме-
скрибируемой части оперона. трия играет важную роль во взаимодей-
ствии белка с ДНК. Этот операторный
Часть IV. участок перекрывается с промоторным
118 Информация участком инициирования транскрипции. Та-
Рис. 28.12. Последовательность основа- ром и геном первого фермента пути
ний аттенюаторного участка биосинтеза триптофана. Этот участок
trp. Связанные симметрией терминации, регулируемый физиологиче-
второго порядка пары основа- скими условиями, подобен участкам тер-
ний GC-богатой области пока- минации в конце других оперонов
заны синим цветом; такие же (разд. 25.15); он содержит GC-богатую по-
пары AT-богатой области по- следовательность и следом за ней АТ-бо-
казаны желтым цветом. гатый участок. Каждый из этих участков ат-
тенюатора обладает симметрией второго
порядка (рис. 28.12). Кроме того, термини-
ким образом, связывание trp-penpeccopa рованный лидерный транскрипт заканчи-
с оператором препятствует связыванию вается несколькими U подряд.
РНК-полимеразы с trp-промотором, и гены Аттенюаторный участок дополняет опе-
trp не транскрибируются. ратор в регуляции транскрипции trp-генов.
В течение некоторого времени считалось, При изобилии триптофана инициация тран-
что ингибирование конечным продуктом ка- скрипции блокируется в результате связыва-
талитической активности первого фермен- ния комплекса триптофан-репрессор с опе-
тативного комплекса в пути биосинтеза ратором. По мере снижения концентрации
триптофана (разд. 21.11) и система ингиби- триптофана в клетке репрессия снижается
рования транскрипции с участием репрессо- и начинается транскрипция. Однако неко-
ра и оператора - основные регуляторные си- торые молекулы РНК-полимеразы поки-
стемы биосинтеза триптофана. Эта точка дают матрицу, дойдя до аттенюатора, тогда
зрения была неожиданно опровергнута, ког- как другие продолжают синтезировать пол-
да было обнаружено, что у некоторых му- ную trp-матрицу. По мере исчерпания трип-
тантов с делециями между оператором и ге- тофана увеличивается доля молекул РНК-
ном первого фермента (trpE) в опероне полимеразы, проходящих через аттенюа-
происходит повышенное образование торный участок.
trp-мРНК. К тому же анализ 5'-концевой по-
следовательности trp-мРНК показал, что 28.9. Аттенюация опосредуется трансляцией
там имеется лидерная последовательность лидерной мРНК
длиной 162 нуклеотида, расположенная Каким образом аттенюаторный участок trp-
перед инициирующим кодоном trpE. Затем оперона улавливает концентрацию трипто-
оказалось, что делеции, повышающие со- фана в клетке? В решении этого вопроса
держание trp-мРНК, картируются в этой ли- особенно важную роль сыграли данные
дерной области, примерно в 30-60 нуклеоти- о том, что часть лидерной мРНК трансли-
дах от начала гена trpE. Следующее руется. Весьма существенно, что в 14-член-
поразительное наблюдение состояло в том, ном лидерном полипептиде (рис. 28.13)
что при высокой концентрации триптофана имеются остатки триптофана в положениях
образовывался транскрипт, содержащий 10 и 11. Когда триптофан находится в избы-
всего 130 нуклеотидов лидерной последова- тке, синтезируется полный лидерный пеп-
тельности ; при нехватке же триптофана син- тид. Но если триптофана не хватает, рибо-
тезировалась trp-мРНК длиной 7000 ну- сома задерживается на двух располо-
клеотидов, включающая полную лидерную женных тандемом кодонах UGG, поскольку
последовательность. Отсюда Янофски сде- в этом случае оказывается недостаточным
лал вывод, что транскрипция trp-оперона содержание триптофанил-тРНК. Застряв-
должна регулироваться участком контро-
лируемой терминации, называемым атте- 28. Регуляция выражения
нюатором. Он локализован между операто- гена в фенотипе 119
Рис. 28.13. Последовательность амино- чены, чтобы улавливать концентрации фе-
кислот в лидерном пептиде trp нилаланина и гистидина. Если соответ-
и последовательность основа- ствующих аминоацилированных тРНК не
ний в соответствующей лидер- хватает, трансляция лидера останавливает-
ной мРНК. ся. Как уже обсуждалось выше на примере
trp-оперона, считается, что застрявшая ри-
босома таким образом изменяет конформа-
шая рибосома каким-то образом меняет цию мРНК, что у нее происходит спарива-
структуру мРНК, так что РНК-полимераза ние оснований. Это дает возможность
транскрибирует оперон за пределами атте- РНК-полимеразе проскакивать аттенюа-
нюаторного участка. Ключевой аспект это- торный участок 1 . Присутствие семи после-
го регуляторного механизма состоит в том, довательно расположенных кодонов ги-
что трансляция и транскрипция тесно сопря- стидина в лидерной мРНК гистидинового
жены между собой. Рибосомы, транслирую- оперона существенно увеличивает чувстви-
щие лидерную trp-мРНК, следуют непос- тельность этого детектора. Действительно,
редственно за молекулой РНК-полимеразы, падение концентрации гистидил-тРНК на
транскрибирующей ДНК-матрицу. Иссле- 15% вызывает троекратное увеличение чис-
дования, проведенные в последние годы, по- ла молекул мРНК, транскрибируемых с это-
казали, что застрявшая рибосома изменяет го оперона.
вторичную структуру мРНК: конформация,
при которой основания спариваются, благо- 28.11. Репрессоры и активаторы
приятствуя тем самым терминированию детерминируют развитие умеренных фагов
транскрипции, изменяется таким образом, Обратимся теперь к роли репрессоров и ак-
что РНК-полимераза проскакивает атте- тиваторов транскрипции в регуляции жиз-
нюатор (рис. 28.14). Мы начинаем пони- ненного цикла бактериофага лямбда (λ). Зре-
мать, что молекулы нуклеиновых кислот, лая вирусная частица состоит из линейной
как и белковые молекулы, могут принимать двухспиральной молекулы ДНК (48 kb), упа-
различные конформации и что изменения кованной в белковую оболочку. Существует
конформации регулируются и имеют дале- два пути развития вируса: он может разру-
ко идущие физиологические последствия. шить клетку-хозяина или он может стать ее
компонентом (отсюда и название - уме-
28.10. Аттенюаторный участок ренный). При литическом пути развития
гистидинового оперона содержит семь происходит полное выражение (экспрессия)
гистидиновых кодонов подряд фаговых генов, что приводит к лизису бакте-
В настоящее время известны еще два оперо- рии и образованию примерно 100 вирусных
на биосинтеза аминокислот у E. coli, содер- частиц потомства. В другом случае развитие
жащих аттенюаторные участки. Фенилала- фага λ может пойти по пути лизогенизации
ниновый оперон и гистидиновый оперон, клетки, когда его ДНК становится кова-
подобно триптофановому оперону, содер- лентно связанной с ДНК клетки-хозяина
жат регулируемые участки терминации в строго определенном месте (сайт-специфи-
перед первым геном, кодирующим фермент. ческая интеграция). Этот процесс рекомби-
И в этих случаях лидерная область перед нации, в котором участвует кольцевая моле-
участком терминации транслируется. Уди- кула ДНК фага λ, мы обсудим ниже
вительна последовательность аминокислот (разд. 30.16). Когда ДНК фага интегрирует
в лидерном пептиде фенилаланинового опе- с ДНК клетки-хозяина, большинство фа-
рона: 7 из 15 остатков - фенилаланины говых функций выключается. Фаговая ДНК
(рис. 28.15). Еще поразительнее лидерный в таком состоянии называется профагом,
пептид гистидинового оперона: он содер- а клетка-хозяин, содержащая профаг - лизо-
жит семь остатков гистидина подряд. Оче- генной бактерией. Профаг реплицируется
1
видно, что эти лидерные мРНК предназна- Автор противоречит собственному утвержде-
нию, что застрявшая рибосома разворачивает
Часть IV. мРНК (см. предыдущий разд.); рибосома дей-
ствительно способствует именно разворачива-
120 Информация нию мРНК.- Прим. перев.
Рис. 28.14. Схематическое изображение ские функции молчат, но не теряются
аттенюации trp-оперона E.coli. (рис. 28.17). Многие агенты, нарушающие
Когда триптофан имеется в нормальную репликацию ДНК в клетке-хо-
избытке (А), лидерный учас- зяине, индуцируют профаг, и он переходит
ток (обозначен цифрой 1) на путь литического развития.
trp-мРНК полностью трансли- Вначале рассмотрим выражение генов фа-
руется. Участок 2 взаимодей- га λ при литическом пути. Цель разви-
ствует с рибосомой, что позво- тия - образование многочисленного потом-
ляет основаниям участков 5 и ства - достигается путем последовательной
4 спариваться. Эта спаренная транскрипции вирусных генов. Вначале обра-
область каким-то образом сиг- зуются белки, необходимые для репликации
нализирует РНК-полимеразе и рекомбинации ДНК, затем белки головки
о том, что следует закончить и отростка вирусной частицы и белки, необ-
транскрипцию. Если же трип- ходимые для лизиса клетки-хозяина.
тофана не хватает (Б), участки Чрезвычайно важное значение имеет стро-
3 и 4 не взаимодействуют, так гая очередность этих событий; преждевре-
как рибосома застревает на менное разрушение клетки-хозяина для ви-
trp-кодонах участка 1. Участок руса, конечно, невыгодно. Выражение генов
2 взаимодействует с участком при литическом развитии происходит в три
3 вместо того, чтобы входить стадии: предраннюю, раннюю и позднюю
в рибосому, и в результате (рис. 28.18). На предранней стадии начинает-
участки 3 и 4 не могут спари- ся синтез РНК с двух промоторов - PL и PR.
ваться. Вследствие этого тран- Один из образующихся при этом тран-
скрипция продолжается. скриптов служит матрицей для синтеза бел-
[Oxender D. L., Zurawski G., ка N, которому принадлежит важнейшая
Yanofsky C., Proc. Nat. Acad. регуляторная роль. В отсутствие белка
Sci., 76, 5524 (1979).] N предранние транскрипты заканчиваются
на одном из двух участков терминации. Бе-
лок N препятствует терминированию тран-
скрипции в этих участках и обеспечивает та-
в лизогенной бактерии как часть клеточной
хромосомы обычно на протяжении многих 28. Регуляция выражения
поколений. В лизогенном состоянии литиче- гена в фенотипе 121
Рис. 28.15. Последовательность амино- ствует транскрипции ранних генов в левую
кислот в лидерном пептиде сторону. В частности, не синтезируется бе-
и последовательность основа- лок N, и поэтому литический путь оказы-
ний соответствующего участка вается закрытым. Связываясь с OR, λ-ре-
мРНК фенилаланинового (А) прессор препятствует выражению генов cro
и гистидинового (Б) оперонов. и Q в правую сторону. Таким образом, ког-
да λ-репрессор связан с OL и OR, весь геном
фага молчит, кроме гена сI, кодирующего
ким образом дальнейшее выражение генов λ-репрессор. Как будет указано чуть ниже,
фага λ. Белок N включает раннюю стадию. λ-репрессор сам контролирует работу гена
В это время синтезируются белки, необхо- сI, регулируя таким путем собственную кон-
димые для репликации ДНК фага центрацию. Инактивация λ-репрессора
и рекомбинации. Кроме того, на ранней ста- обеспечивает возможность транскрипции
дии транскрибируется ген Q. Белок Q - еще генов, участвующих в литическом процессе.
один важный регуляторный элемент выра- Профаг исключается из хромосомы клетки-
жения генов фага λ. Он необходим для пере- хозяина, и литические функции экспресси-
хода в позднюю стадию. На поздней стадии руются.
транскрибируются гены, необходимые для
образования головки и отростка фага и для 28.12. Два оператора фага лямбда содержат
лизиса клетки-хозяина. Белок Q, подобно ряд участков связывания репрессора
белку N, подавляет терминацию транскрип- λ-Репрессор был выделен и подробно изу-
ции. Короче говоря, последовательная регу- чен Марком Пташне (Mark Ptashne). Моно-
ляция литического развития осуществляет-
ся двумя белками - положительными регуля-
торами, кодируемыми генами N и Q. Их
действие заключается в том, что они позво-
ляют РНК-полимеразе продолжать тран-
скрипцию, проскочив несколько участков
терминации.
В лизогенном цикле различают три ста-
дии: установление лизогенного состояния,
его поддержание и выход из лизогенного со-
стояния. Для установления состояния про-
фага необходимо, чтобы вирусная ДНК ин-
тегрировалась с ДНК клетки-хозяина
и литические функции вируса были инакти-
вированы. Эти процессы протекают очень
сложно, и до конца они не изучены. Поддер-
жание состояния профага, наоборот, срав-
нительно несложный процесс. А. Дейл Кей-
зер (A. Dale Kaiser) показал, что из всех
генов профага экспрессируется только ген
сI. Этот ген кодирует λ-репрессор, который
связывается с двумя операторными участка-
ми OL и OR (рис. 28.19). Связывание λ-ре-
прессора с OL непосредственно препят- Рис. 28.16. Электронная микрофотогра-
фия фагов λ. (Печатается с лю-
Часть IV. безного разрешения д-ра
122 Информация A. Dale Kaiser.)
Рис. 28.17. Генетическая карта фага λ. По- операторные участки обладают частичной
казаны лишь некоторые гены. симметрией второго порядка.
После проникновения в бакте- Самые сильные места связывания репрес-
риальную клетку линейная сора в операторах OL и OR расположены
двухцепочечная ДНК перехо- ближе всего к началу первого структурного
дит в кольцевую форму. гена оперона. Промоторный участок гена
N расположен в пределах OL а промотор
гена cro - внутри OR. Как и в лактозном, и
мере массой 26 кДа находится в равновесии в арабинозном оперонах, связывание ре-
с олигомерами. С ДНК связываются имен- прессора с этими операторами препятствует
но олигомеры. Два операторных связыванию РНК-полимеразы с соответ-
участка - ОL и ОR - узнаются одним и тем же ствующим промотором, и, следовательно,
репрессором. Ген сI, кодирующий этот ре- транскрипция не начинается. Связывание
прессор, расположен между ОL и OR λ-репрессора с двумя участками в OL и OR
(рис. 28.19). Каждый их этих операторов со- более эффективно блокирует промотор, чем
держит три участка связывания λ-репрессо- связывание только с одним участком.
ра. Расщепление с помощью нуклеаз пока-
зало, что участки связывания представляют 28.13. λ-Репрессор регулирует
собой последовательность из 17 пар основа- собственный синтез
ний и отделены друг от друга АТ-богатыми Число молекул λ-репрессора в лизогенных
участками длиной от 3 до 7 пар оснований. клетках Е. coli строго регулируется. Сниже-
Последовательности оснований всех этих ние количества репрессора (даже кратковре-
участков связывания λ-репрессора сходны, менное) переводит клетку на литический
но не идентичны. Узнаваемая последова- путь. С другой стороны, избыток репрессо-
тельность - 5'-TATCACCGC-3' или что-ни- ра затруднит выход фага, если условия его
будь в этом роде. Как и lас-оператор, эти существования в бактерии станут неблаго-

Рис. 28.18. Три стадии транскрипции при приятными. Как регулируется концентрация
литическом цикле развития фа- λ-репрессора? Проведенные сравнительно
га λ. Белок N образуется на недавно исследования показали, что это ре-
предранней стадии и активи- прессор регулирует собственный синтез.
рует раннюю стадию. Тогда Для этого λ-репрессор связывается с OR3
в свою очередь синтезируется операторным участком, локализованным
белок Q, который активирует
позднюю стадию. [Echols H., 28. Регуляция выражения
The Bacteria, 8, 502 (1979).] гена в фенотипе 123
Рис. 28.19. Схематическое изображение при низкой концентрации λ-репрессора и по-
операторных участков OL и OR давляется при высокой концентрации того
и прилегающих генов. Самое же белка. Другими словами, выражение ге-
высокое сродство к λ-репрессо- на сI - саморегулирующаяся система.
ру имеют ОL1 и ОR1. сI - ген-ре- Описанная регуляция по принципу обрат-
прессор. Левый транскрипт на- ной связи стремится поддерживать концен-
чинается с гена N, правый - с трацию репрессора на таком уровне, чтобы
гена crо. остальной геном фага не экспрессировался.
Как же тогда фаг может выйти из состояния
лизогении? Литический цикл запускается
ближе всего к гену cI, и выключает тран- при снижении числа молекул λ-репрессора;
скрипцию этого гена (рис. 28.20). Связывание содержание λ-репрессора должно умень-
репрессора с О R 1 , напротив, усиливает тран- шаться до такого уровня, которого доста-
скрипцию гена cI. Напомним, что сродство точно только для транскрипции гена crо.
λ-репрессора к ОR1 выше, чем к OR3. Таким Новообразованный белок cro связывается с
образом, транскрипция гена cI усиливается ОR3 и подавляет транскрипцию гена cI.

Рис. 28.20. Саморегуляция концентрации Самое главное, что OR3 имеет более высо-
λ-репрессора. А - когда репрес- кое сродство к белку cro, чем OR1. Таким
сора мало, он связывается с образом, небольшое количество белка cro
O R 1 и стимулирует транскрип- подавляет синтез λ-репрессора, не выключая
цию гена сI. Б - по мере увели- синтеза самого белка cro. Вследствие этого
чения концентрации λ-репрес- λ-репрессор уже не может руководить хо-
сора он связывается с ОR3 дом событий. С этого момента необратимо
и ингибирует дальнейшую запускается цепь реакций, ведущих к лизису.
транскрипцию гена cI. Таким образом, тонкое взаимодействие все-
го нескольких белков и операторных участ-
Часть IV. ков определяет путь развития фага. Было
124 Информация бы интересно выяснить, имеют ли неко-
торые регуляторные системы, такие, как Кроме того, некоторые опероны биосин-
множественные операторные участки с раз- теза аминокислот, в том числе trp-оперон,
личным сродством к белкам, более общее находятся под контролем аттенюаторов.
значение в регуляции развития прокариоти- Если конечный продукт биосинтеза - амино-
ческих клеток. кислота - имеется в изобилии, транскрипция
в аттенюаторном участке прекращается.
Для аттенюации необходима трансляция
Заключение лидерной мРНК. Регуляция широкого спек-
Клетки регулируют количество синтези- тра генов осуществляется циклическим
руемых белков различными способами. У E. AMP, который связывается с особым бел-
coli выражение генов регулируется в первую ком (БАК). Этот комплекс взаимодействует
очередь на уровне транскрипции, а не транс- с промоторными участками нескольких ин-
ляции. Многие гены организованы в опе- дуцибельных оперонов и стимулирует ини-
роны - координированные единицы генети- циирование транскрипции. Концентрация
ческой экспрессии. Оперон состоит из циклического AMP повышается только при
регуляторных участков (оператора и промо- недостатке глюкозы. Таким образом, глю-
тора) и нескольких структурных генов. Вне коза косвенно подавляет синтез различных
оперона имеется регуляторный ген, коди- ферментов катаболизма.
рующий белок, который взаимодействует Бактериофаг λ может размножаться
с операторным участком. Последователь- и разрушать клетки-хозяева (литический
ность оснований лактозного оператора сим- путь); в другом случае его ДНК может инте-
метрична. Вообще симметрия играет основ- грировать с хромосомой клетки-хозяина
ную роль в узнавании определенных участ- (лизогенный путь). При литическом разви-
ков в ДНК белками. lac-Оперон индуци- тии происходит последовательная тран-
руется β-галактозидами, например аллолак- скрипция трех групп генов. На предранней
тозой и изопропилтиогалактозидом. Связы- стадии образуется белок N, активирующий
вание индуктора с lac-репрессором приво- транскрипцию ранних генов. При этом
дит к его вытеснению с оператора. Теперь в свою очередь синтезируется белок Q - ак-
РНК-полимераза может пройти через опе- тиватор поздней стадии транскрипции. Ли-
ратор и транскрибировать lас-оперон. Трип- зогенное состояние поддерживается λ-ре-
тофановый оперон репрессируется трипто- прессором, который кодируется геном cI.
фаном, который связывается со специфиче- Репрессор связывается с операторами OR и
ским репрессором и дает ему таким OL и препятствует транскрипции предран-
образом возможность связаться с операто- них генов. Присутствие многочисленных
ром. В результате транскрипция генов, ко- участков связывания в этих операторах по-
дирующих ферменты биосинтеза триптофа- зволяет λ-репрессорам регулировать соб-
на, выключается. ственный синтез.

РЕКОМЕНДУЕМАЯ Лактозный оперон Reznikoff W., 1975. Genetic regulation:


ЛИТЕРАТУРА Miller J.H., Reznikoff W.S., 1978. The the lac control region, Science, 187,
Operon, Cold Spring Harbor 27-35.
С чего начать Laboratory. (Превосходный сборник
Jacob F., Monod J., 1961. Genetic статей, касающихся регуляторных Арабинозный оперон
regulatory mechanisms in the synthesis механизмов Е. coli и фага λ. Детально Wilcox G., Meuris P., Bass P., Englesbe-
of proteins, J. Moi. Biol., 3, 318-356. (B рассмотрены лактозный, триптофа- rg E., 1974. Regulation of the arabinose
этой блистательной статье была новый, арабинозный, гистидиновый operon in vitro, J. Biol. Chem., 249,
предложена модель оперона и сфор- и галактозный опероны.) 2946-2952.
мулировано представление об ин- Gilbert W., Muller-Hill В., 1966. Hirsh J., Schleif R., 1976. Electron
формационной РНК.) Isolation of the lac represser, Proc. Nat. microscopy of gene regulation: the
Ptashne M., Gilbert W., 1970. Genetic Acad. Sci., 56, 1891-1898. L-arabinose operon, Proc. Nat. Acad.
repressers, Sci. Amer, 222(6), 36-44. Dickson R., Abelson J., Barnes W., Sci., 73, 1518-1522.
Maniatis Т., Ptashne M., 1976. A DNA
operator-repress or system, Sci. Amer., 28. Регуляция выражения
234(1), 64-76. гена в фенотипе 125
Триптофановый и Proc. Nat. Acad. Sci., 75, 4281-4285. function of a represser in bacteriophage
гистидиновый опероны Stephens J. C., Artz S. W., Ames B. N., lambda, Science, 194, 156-161.
Platt Т., 1978. Regulation of gene 1975. Guanosine 5'-diphosphate 3'-di- Johnson A., Meyer B.J., Ptashne M.,
expression in the tryptophan operon of phosphate (ppGpp): positive effector for 1978. Mechanism of action of the crо
Esherichia coli. In: Miller J. H. and histidine operon transcription and protein of bacteriophage λ, Proc. Nat
Reznikoff W. S.(eds.), The Operon, general signal for amino acid deficiency, Acad. Sci., 75, 1783-1787.
pp. 213-302, Cold Spring Harbor Proc. Nat. Acad. Sci., 72, 4389-4393. Ptashne M., Jeffrey A., Johnson A.D.,
Laboratory. (Четко изложены пред- Maurer R., Meyer B.J., Pabo C.O.,
ставления о trp-опероне.) Циклический AMP и катаболитная Roberts T.M., Sauer R.T, 1980. How
Oxender D.L., Zurawski G., репрессия the λ represser and crо work, Cell, 19,
Yanofsky C., 1979. Attenuation in the Pastan L, Adhya S., 1976. Cyclic 1-11.
Escherichia coli tryptophan operon: the adenosine 3',5'-monophosphate in Hershey A.D. (ed.), 1971. The
role of RNA secondary structure Escherichia coli, Bacteriol. Rev., 40, Bacteriophage Lambda, Cold Spring
involving the Trp codon region, Proc. 527-551. Harbor Laboratory. [Имеется пере-
Nat. Acad. Sci., 76, 5524-5528. Zubay G., Schwartz D., Beckwaith J., вод: Фаг лямбда.- М.: Мир, 1975.]
Bertrand K., Korn L., Lee F,r Platt Т., 1970. Mechanism of activation of (Содержит множество сведений о фа-
Squires C.L., Squires C., Yanofsky C., catabolite-sensitive genes: a positive ге λ.)
1975. New features of the regulation of control system, Proc. Nat. Acad. Sci., 66, Reichardt L., Kaiser A.D., 1971.
the tryptophan operon, Science, 189, 104-110. Control of λ represser synthesis, Proc.
22-26. (Рассказ об истории открытия Nat. Acad. Sci., 68, 2185-2189.
аттенюации транскрипции.) Регуляция транскрипции фага λ
Barnes W.M., 1978. DNA sequence Ptashne M., Backman К., Нитауип
from the histidine operon control М.Z., Jeffrey A., Maurer R., Meyer В.,
region: seven histidine codons in a row, Sauer R. Т., 1976. Autoregulation and

Вопросы и задачи других источников углерода. Концентра-


ция циклического AMP в клетках мутанта
1. К какому результату приведут нормальна. Какая мутация могла бы при-
следующие мутации? вести к такому результату?
а) Делеция регуляторного гена lас-оперона. 5. Клетка Е. coli, несущая профаг
б) Делеция регуляторного гена trp-оперона. λ, иммунна к литическому ин-
в) Делеция регуляторного гена аrа-оперо- фицированию этим фагом. Почему?
на. 6. Транскрипция сI может быть
г) Делеция гена сI фага λ. инициирована с промотора
д) Делеция гена N фага λ. pRE, предназначенного для установления
2. Суперрепрессированные му- лизогении, или pRM, предназначенного для
S
танты по lас-оперону (i ) ведут ее поддержания. Транскрипты с pRM на-
себя как неиндуцибельные мутанты. Ген iS чинаются с 5'-концевого кодона AUG λ-pe-
+
доминирует над геном i в частичных ди- прессора, а в транскрипте pRE этому кодо-
плоидах. Каким может быть молеку- ну инициации предшествует последова-
лярный механизм этой мутации? тельность, комплементарная 3'-концевой
3. Имеется мутант Е. coli, синте- последовательности 16S-pPHK. Для ини-
зирующий большие количества циации на участке pRE необходимы белки,
β-галактозидазы независимо от того, при- кодируемые фагом, которые не экспресси-
сутствует ли в среде индуктор. Частичные руются в лизогенном состоянии.
диплоиды, образованные из этого мутанта а) Какой транскрипт будет транслировать-
и F i + o + z - - , также синтезируют много β-га- ся с большей эффективностью?
лактозидазы независимо от присутствия б) Каково возможное физиологическое зна-
индуктора. Какая мутация могла бы при- чение этого различия?
вести к такому результату?
4. Из культуры дикого типа выде- Дополнительные вопросы см.: Hood L.E.,
лен мутант, неспособный расти Wilson J. H, Wood W. В., Molecular Biology
на галактозе, лактозе, арабинозе и ряде of Eucaryotic Cells, Benjamin, 1975, ch. 1.
ГЛАВА 29 что у эукариот выражение (экспрессия) ге-
нов осуществляется значительно более
Эукариотические сложным путем, чем у прокариот. Иссле-
дования в этой области быстро развивают-
хромосомы и выражение ся, поскольку мы научились выделять
генов у эукариот и клонировать гены эукариот, определять
в них последовательность нуклеотидов
Эукариотическая клетка содержит гораздо
и осуществлять их выражение в хорошо
больше генетической информации, чем
изученных системах. По всему чувствуется,
прокариотическая. Например, в клетке че-
что мы находимся на пороге раскрытия
ловека в 1000 раз больше ДНК, чем
одной из важнейших проблем биологии —
в клетке Е. coli, и примерно в 100000 раз
механизма клеточной дифференцировки.
больше, чем в одном вирионе фага λ. Это
изобилие ДНК наделяет эукариот больши-
ми потенциальными возможностями, ко-
торых нет у прокариот. Другое отличие со-
стоит в том, что ДНК высших организмов
ассоциирована с основными белками - ги-
стонами, а хромосомы низших организмов
таких белков не содержат. Предназначение
этих основных белков - упаковывать ДНК,
с тем чтобы при контурной длине, равной
многим сантиметрам, она могла бы поме-
ститься в объеме диаметром несколько ми-
крометров. Характерная морфология эука-
риотических хромосом, которую легко на-
блюдать в световом микроскопе, показы-
вает, что они организованы значительно
сложнее, чем геномы прокариотических
клеток. К тому же форма эукариотических
хромосом резко меняется в ходе клеточно-
го цикла. Еще одна важная особенность,
которая собственно и отличает эукариот
от прокариот, состоит в том, что эукарио-
тические хромосомы окружены ядерной
мембраной. Этой мембраны у прокариот
нет, равно как нет и других внутренних
мембран. Благодаря наличию мембраны
транскрипция и трансляция у эукариот
разделены во времени и в пространстве, Рис. 29.1. Фазово-контрастная микрофо-
тогда как у прокариот они тесно сопря- тография хромосомы типа
жены. В ядрах высших организмов пер- ламповой щетки из ооцита.
вичные транскрипты подвергаются значи- (Печатается с любезного разре-
тельной модификации, расщепляются и их шения д-ра Joseph Gall.)
фрагменты соединяются. Лишь небольшая
часть синтезированных в ядре РНК выхо- 29. Хромосомы и выражение
дят в цитозоль в виде мРНК. Очевидно, генов у эукариот 127
Рис. 29.2. Радиоавтограф молекулы gaster - 43•106 кДа. Превосходное совпаде-
ДНК Drosophila melanogaster. ние результатов наблюдалось также в слу-
Контурная длина этой ДНК чае мутанта с транслокацией, затрагиваю-
равна 1,2 см. [Kavenoff R., щей самую большую хромосому. В этой
Klotz L. С., Zimm В. Н., Cold хромосоме содержится дополнительный ку-
Spring Harbor Symp. Quant. сок ДНК, благодаря которому содержа-
Biol., 38, 4 (1974).] ние ДНК в ней достигает 59•106 кДа. Из-
меренное количество ДНК в этой моле-
куле составило 58•106 кДа. Радиоавтогра-
фы ДНК D. melanogaster (рис. 29.2) под-
29.1. Эукариотическая хромосома содержит тверждают существование очень длинных
одну молекулу двухспиральной ДНК молекул ДНК. Эти исследования показа-
Можно ли утверждать, что хромосома со- ли, что хромосома дрозофилы содержит
держит одну длинную молекулу ДНК? одну непрерывную молекулу ДНК. Кроме
В течение многих лет на этот вопрос было того, эта молекула ДНК линейная и не-
трудно ответить, так как очень длинные разветвленная.
молекулы ДНК невероятно чувствительны
к разрыву под действием сил сдвига. Бру-
но Зимм (Bruno Zimm) решил эту пробле- 29.2. Эукариотическая ДНК прочно связана
му с помощью метода вязкостной эласто- с основными белками - гистонами
метрии, позволяющего измерять длину ДНК эукариотических хромосом находит-
самых крупных молекул ДНК в смеси. Мо- ся не в свободном виде, а прочно связана
лекулы ДНК растягивают в потоке жидко- с группой небольших основных белков, на-
сти, и затем им дают свернуться в нор- зываемых гистонами. На долю гистонов
мальное состояние. Время, за которое приходится около половины массы эука-
свертывается половина молекул, зависит риотических хромосом; вторую половину
от их молекулярной массы. Клетки пло- составляет ДНК. Этот нуклеопротеиновый
довых мушек лизировали в камере для из- материал хромосомы называется хромати-
мерений, чтобы избежать разрывов ДНК ном. Если обработать хроматин солью или
при переносе образцов. Нуклеазы инакти- разбавленной кислотой, гистоны и ДНК
вировали, инкубируя образцы в присут- можно диссоциировать. Образовавшуюся
ствии детергента при 65°С. Кроме того, смесь можно затем разделить с помощью
для гидролиза связанных с ДНК белков ионообменной хроматографии. Гистоны
добавляли проназу. подразделяются на пять типов, обозна-
Масса самых крупных молекул ДНК чаемых соответственно H1, H2A, Н2В, Н3
в полученной смеси составляла 41•106 кДа. и Н4. Они имеют массу от 11 до 21 кДа
Эта величина хорошо согласуется с из- (табл. 29.1). Удивительная особенность ги-
вестным содержанием ДНК в самой стонов - высокое содержание положительно
большой хромосоме Drosophila melano- заряженных боковых цепей: примерно
каждый четвертый остаток - лизин или ар-
Часть IV. гинин.
128 Информация Благодаря посттрансляционным моди-
фикациям определенных боковых цепей
каждый гистон существует в нескольких
формах. Например, лизин-16 гистона Н4
может быть ацетилирован. Кроме того, ги-
стоны могут быть метилированы, ADP-ри-
бозилированы и фосфорилированы. Изме-
нения заряда, способности к образованию
водородных связей и формы молекул ги-
стонов в результате таких ковалентных
модификаций могут играть важную роль
в регуляции доступности ДНК для репли-
кации и транскрипции.
Рис. 29.3. Последовательность амино-
29.3. Последовательности аминокислот кислот в гистонах Н4 из тимуса
в гистонах Н3 и Н4 почти одинаковы теленка. Несколько остатков
у всех животных и растений модифицированы. α-Амино-
Эмиль Смит и Робер Де-Ланж (Emil группа ацетилирована, равно
Smith, Robert DeLange) показали, что по- как и ε-аминогруппа Lys-16. ε-
следовательности аминокислот в гистоне Аминогруппа Lys-20 метили-
Н4 из проростков гороха и из тимуса те- рована или диметилирована.
ленка различаются только по двум поло- Гистон Н4 из проростков горо-
жениям из 102. Замены эти очень незначи- ха имеет такую же последова-
тельны: валин - вместо изолейцина и ли- тельность аминокислот, за ис-
зин - вместо аргинина. Таким образом, по- ключением положений 60
следовательность аминокислот гистона Н4 (изолейцин) и 77 (аргинин).
сохранилась почти без изменений на протя-
жении 1,2•10 9 лет, прошедших со времени
разделения всего живого на царства расте-
ний и животных. Гистон Н3 также мало сле того, как дивергируют две эволю-
изменился на протяжении этого колоссаль- ционные линии. Эта величина для гистонов
ного периода эволюции. Последовательно- Н3 и Н4 составляет 3•108 и 6•108 лет со-
сти аминокислот в гистоне Н3 из пророст- ответственно и значительно выше, чем для
ков гороха и из тимуса теленка различают- других исследованных до настоящего
ся по четырем положениям. Интересно времени белков, Например, для цитохрома
сравнить скорость изменения последова- с единичный эволюционный период соста-
тельности этих гистонов в ходе эволюции вляет 2•107 лет, для гемоглобина - 6•106
6
со скоростью изменения других белков. лет, для фибринопептидов - 1•10 лет. За-
Обычно для этого используется величина мечательная консервативность структуры
единичного эволюционного периода. Она гистонов Н3 и Н4 свидетельствует о том,
равна времени, за которое последователь- что они выполняют какую-то чрезвычайно
ность аминокислот изменяется на 1% по- важную функцию, возникшую на заре эво-
люции эукариот и сохранившуюся с тех
пор почти без изменений.
Таблица 29.1. Гистоны

29.4. Нуклеосомы - повторяющиеся


Тип Отноше- Число Мас- Локализа- субъединицы хроматина
ние аминокис- са, кДа ция Как происходит взаимодействие гистонов
[Lys]/ лотных с ДНК и образование нити хроматина?
[Arg] остатков Основываясь на данных, полученных раз-
личными методами, Роджер Корнберг
(Roger Kornberg) высказал в 1974 г. пред-
Н1 20,0 215 21,0 Линкер положение, что хроматин состоит из по-
Н2А 1,25 129 14.5 Сердцеви-
вторяющихся субъединиц, каждая из ко-
на
Н2В 2.5 125 13,8 торых включает 200 пар оснований ДНК
Н3 0,72 135 15,3
Н4 0,79 102 11,3 29. Хромосомы и выражение
генов у эукариот 129
Целый ряд экспериментальных данных
свидетельствует в пользу этой модели
структуры хроматина.
1. Электронная микроскопия. На элек-
тронных микрофотографиях хроматина
видны группы расположенных друг за дру-
гом бусин диаметром 100 А, соединенных
тонкой нитью (рис. 29.4). Степень растяже-
ния хроматиновой нити зависит от способа
подготовки образцов для микроскопии.
Некоторые методы дают электронные ми-
крофотографии с более компактным рас-
положением 100-ангстремных бусин. Сле-
довательно, электронная микроскопия пря-
мо подтверждает, что хроматин - цепочка
почти сферических частиц, между которы-
ми расположены гибкие участки.
2. Дифракция рентгеновских лучей
и нейтронов. При рентгеновской дифракции
на нитях хроматина также виден повтор
длиной 100 А. Нейтронная дифракция по-
казывает, что ДНК расположена снаружи
нуклеосомы.
3. Нуклеазный гидролиз. Свободную
ДНК в растворе можно расщепить по лю-
бой из ее фосфодиэфирных связей с по-
мощью панкреатической дезоксирибону-
клеазы I (ДНКазы I) или микрококковой
нуклеазы. ДНК в хроматине, за исключе-
нием нескольких участков, наоборот, защи-
щена от гидролитического действия ну-
клеазы. Характер расщепления хроматина
поражает своей простотой: на электрофо-
реграмме видна лесенка четко выраженных
полос (рис. 29.5). В этих фрагментах содер-
Рис. 29.4. Электронная микрофотогра- жатся фрагменты ДНК, кратные основно-
фия хроматина. Частицы, похо- му повтору длиной примерно 200 пар ос-
жие на бусины, имеют диаметр нований. Электронные микрофотографии
около 100 А. (Печатается с лю- показывают, что число сферических частиц
безного разрешения д-ра Ada во фрагменте хроматина равно числу
Olins и д-ра Donald Olins.) 200-парных повторов (рис. 29.6). Например,
фрагмент, содержащий ДНК длиной 600
и по 2 молекулы гистонов Н2А, Н2В, Н3 пар оснований, состоит из трех 100-анг-
и Н4. Теперь эти повторяющиеся единицы стремных частиц. Следовательно, бусина,
называют нуклеосомами. Большая часть видимая на электронной микрофотогра-
ДНК намотана на гистоновую сердцевину фии, соответствует нуклеосоме, получае-
(гистоновый кор). Остальная ДНК, так на- мой при нуклеазном гидролизе.
зываемый линкер, или межнуклеосомная 4. Реконструкция. Если добавить ги-
ДНК, соединяет соседние нуклеосомы стоны к ДНК аденовируса или обезьяньего
и обеспечивает гибкость хроматиновой ни- вируса SV-40, можно получить in vitro xpo-
ти. Таким образом, хроматиновая нить матиноподобную нить. Количество ДНК,
представляет собой гибкую цепочку нуклео- связанной с нуклеосомой в таких системах
сом, напоминающую бусины на нитке. реконструкции, составляет около 200 пар ос-
нований. Кроме того, для образования ну-
Часть IV. клеосомы необходимо эквимолярное коли-
130 Информация чество гистонов Н2А, Н2В, Н3 и Н4. Если
какого-либо гистона в смеси для рекон-
струкции оказывается недостаточно, обра-
зования характерных бусин не происхо-
дит. Однако гистон H1 для реконструкции
не нужен; этот факт перекликается с тем, что
гистон H1 присутствует не во всех нуклеосо-
мах эукариотических клеток. Исследования
дифракции рентгеновских лучей также по-
казывают, что для получения картины, ха-
рактерной для хроматина, необходимо до-
бавить гистоны Н2А, Н2В, Н3 и Н4.

29.5. Минимальная нуклеосома


(«ядро» нуклеосомы) состоит из ДНК
длиной 140 пар оснований, намотанной
на октамер гистонов
Содержание ДНК в нуклеосомах различных
организмов и типов клеток колеблется от
160 до 240 пар оснований (табл. 29.2). Что
лежит в основе этих различий? И в этом слу-
чае использование нуклеаз оказалось весьма

Рис. 29.5. Гель-электрофорез фрагмен- Рис. 29.6. Электронные микрофотогра-


тов ДНК хроматина, полу- фии мономеров (А), димеров
ченных с помощью ограничен- (Б), тримеров (В) и тетрамеров
ного гидролиза микрококко- (Г) нуклеосом, полученных, как
вой нуклеазой. На дорожку описано в подписи к рис. 29.5.
А была нанесена нефракциони- [Finch J. Т., Noll M, Kornberg
рованная смесь. При центрифу- R.D., Ргос. Nat. Acad. Sci., 72,
гировании в градиенте концен- 3321 (1975).]
трации сахарозы были полу-
чены фракции мономеров (Б),
димеров (В), тримеров (Г) и те-
трамеров (Д). [Finch J. Т.,
Noll M., Kornberg R. D., Ргос. 29. Хромосомы и выражение
Nat. Acad. Sci., 72, 3321 (1975).] генов у эукариот 131
информативным. Нуклеосомы можно
в свою очередь гидролизовать микрококко-
вой нуклеазой; при этом получаются ча-
стицы минимальной нуклеосомы (нуклео-
сомного «ядра»), содержащие 140 пар
оснований, независимо от исходного содер-
жания ДНК в расчете на одну нуклеосому.
Эта минимальная нуклеосома, по всей ве-
роятности, практически одинакова у всех эу-
кариот. Она состоит из фрагмента ДНК
длиной 140 пар оснований, связанного с окта-
мером гистонов (по два гистона Н2А, Н2В,
Н3 и Н4).
Минимальные нуклеосомы были полу-
чены в кристаллическом виде и в настоящее
время исследуются с помощью электронной
микроскопии (рис. 29.7) и дифракции рент-
геновских лучей. Кристаллизация этих ча- Рис. 29.7. Электронная микрофотогра-
стиц показывает, что нуклеосомы хрома- фия кристалла минимальных
тина весьма гомогенны. Арон Клуг и Джон нуклеосом. Центры соседних
Финч (Aaron Klug, John Finch) установили, нуклеосом в этом гексагональ-
что минимальная нуклеосома (нуклеосом- ном слое находятся на расстоя-
ное «ядро») представляет собой уплощен- нии 100 А друг от друга.
ную частицу размером 110 х 100 x 55 А [Finch J. Т. et al, Nature, 269, 31
и состоит из двух слоев. Фрагмент ДНК (1977).]

Таблица 29.2. Содержание ДНК в нуклеосомах


Рис. 29.8. Схематическое изображение
нуклеосомы. Двойная спираль
ДНК (красная полоса) намота- Тип клеток Число пар основа-
на на октамер гистонов (по две ний
молекулы Н2А, Н2В, Н3 и Н4;
изображены голубым). Гистон
H1 (желтый цвет) связывается Дрожжи 165
с наружной стороной этой ми- Клетки HeLa 183
нимальной нуклеосомы и Костный мозг крысы 196
192
Печень крысы
с линкерной ДНК. (Kornberg
Почки крысы 196
A., DNA Replication. Freeman Яйцевод курицы
and. Co., 1980.) Эритроциты курицы 207
Гаструла морского ежа 218
Часть IV. Сперма морского ежа 241
132 Информация
длиной 140 пар оснований намотан снаружи
на сердцевину и образует 1 3 / 4 оборота лево-
закрученной суперспирали с шагом пример-
но 28 А (рис. 29.8).
Как уже упоминалось, гистон H1 не всег-
да присутствует в нуклеосоме. Последова-
тельность аминокислот в гистоне H1 наибо-
лее вариабельна из всех пяти гистонов.
К тому же гистон H1 отличается от других
гистонов пo стехиометрии: на нуклеосому
приходится одна молекула гистона H1. Кро-
ме того, гистон H1 легко отделяется от ну-
клеосом, что указывает на его перифериче-
скую локализацию, т.е. он не является
частью гистоновой сердцевины. Нуклео-
сомы теряют гистон H1, когда ДНК в их со-
ставе укорачивается со 160 до 140 пар осно-
ваний. Таким образом, гистон H1 почти
наверняка расположен вне нуклеосомы, бли-
же к линкерной ДНК. Гистон H1 может слу-
жить мостиком между различными нуклео-
сомами и способствовать таким образом
повышению компактности хроматина.
Рис. 29.9. Предполагаемая соленоидная
модель хроматина. На один
29.6. Нуклеосома - первый уровень оборот спирали приходится
конденсации ДНК шесть нуклеосом (показаны си-
Накручивание ДНК на нуклеосомную серд- ним цветом). Двойная спираль
цевину обеспечивает конденсацию ДНК, так ДНК (красная) намотана на ка-
как уменьшает ее линейные размеры. Уча- ждую нуклеосому. [Finch J.T.,
сток ДНК длиной 200 пар оснований имеет Klug A., Proc. Nat. Acad. Sci., 73,
в растворе длину 680 А. В нуклеосоме это 1900 (1976).]
количество ДНК укладывается в частицу
диаметром 100 А. Таким образом, плот-
ность упаковки (степень конденсации) ну- с плотностью упаковки около 40 (рис. 29.9).
клеосомы составляет примерно 7. Сравнима Складывание таких соленоидов в петли мо-
ли эта величина со степенью конденсации жет дать дополнительную конденсацию. По
ДНК в хромосоме? Метафазные хромо- всей вероятности, в стабилизации струк-
сомы человека, которые находятся в сильно туры хромосомы высших порядков уча-
конденсированном состоянии, содержат ствуют различные негистоновые белки. На-
5,3•109 пар оснований, что соответствует пример, в лишенных гистонов метафазных
контурной длине ДНК 180 см. Эта ДНК хромосомах выявляется центральный бел-
упакована в 46 цилиндрических структур, ковый остов, окруженный множеством
общая длина которых составляет 200 мкм. очень длинных петель ДНК (рис. 29.10). По-
Таким образом, плотность упаковки ДНК видимому, эти петли ДНК закреплены на
в метафазных хромосомах равна приблизи- остове. Такая организация может иметь
4
тельно 10 . В интерфазных ядрах, где хрома- важное значение для передвижения хромо-
тин находится в более дисперсном состоя- сом в митозе и мейозе.
нии, плотность упаковки для ДНК соста-
вляет примерно 102-103. Очевидно, нуклео- 29.7. Репликация эукариотической ДНК
сома представляет собой лишь первый начинается во многих местах и идет
уровень конденсации ДНК. в двух направлениях
Каков следующий уровень организации Подобно другим молекулам ДНК, эукарио-
ДНК? Одна из возможностей состоит тическая ДНК реплицируется полуконсерва-
в том, что сами нуклеосомы укладываются
в спираль. Например, предложена соленоид- 29. Хромосомы и выражение
ная модель хроматина диаметром 360 А генов у эукариот 133
Рис. 29.10. Электронная микрофотогра- ма дрозофилы содержит ДНК длиной
фия ДНК, с которой удалены 2,1 см, или 62000 kb. Репликационная вилка
гистоны. ДНК прикрепляется ДНК дрозофилы движется со скоростью 2,6
к центральному белковому kb/мин (сравните со скоростью движения
остову. Гистоны удалили из вилки у Е. coli 16 kb/мин). Если бы в самой
метафазных хромосом клеток большой хромосоме дрозофилы существо-
HeLa, обработав их полианио- вала только одна точка начала репликации,
нами. (Печатается с любезного то ее удвоение заняло бы более 16 сут. На
разрешения д-ра Ulrich самом деле время репликации составляет
Laemmli.) менее 3 мин. Это достигается коопера-
тивным действием более чем 6000 реплика-
ционных вилок на одну молекулу ДНК. Мо-
тивно. Кроме того, реплицированная ДНК лекула ДНК из ядра дрозофилы, находяще-
полуконсервативно распределяется между гося на стадии дробления, представляет
сестринскими хроматидами метафазных собой набор следующих один за другим
хромосом (рис. 29.11). Методом электрон- участков репликации, или «глаз»
ной микроскопии было показано, что репли- (рис. 29.12). Активирование каждой точки
кация эукариотической ДНК начинается во инициации порождает две расходящиеся ре-
многих точках и идет в двух направлениях. пликационные вилки. Расширяющиеся
Использование многих точек инициации не- в обоих направлениях «глаза» сливаются
обходимо для быстрой репликации, так как и образуют две дочерние молекулы ДНК
эукариотические ДНК имеют огромную (рис. 29.13). «Глаз» внутри другого «глаза»
длину. Например, самая длинная хромосо- никогда не наблюдался. Из этого следует
что начало репликации не может снова реак-
Часть IV. тивироваться, пока не закончится реплика-
134 Информация
Рис. 29.11. Флуоресцентная микрофото-
графия метафазных хромосом
мужчины. ДНК в клетках
дважды реплицировалась
в среде, содержащей аналог ти-
мидина 5-бромдезоксиуридин
(BrdU). Хромосомы сначала
окрасили хинакрином (А),
отмыли и снова окрасили бис-
бензимидазольным красите-
лем Хехст 33258 (Б). BrdU ту-
шит флуоресценцию второго
красителя, поэтому сестрин-
ские хроматиды, содержащие
ДНК, в которой только одна
полинуклеотидная цепь заме-
щена BrdU, флуоресцирует яр-
че, чем ДНК с BrdU в обеих це-
пях. (Печатается с любезного
разрешения д-ра Sammuel
Latt.)

ция всей молекулы ДНК.


В эукариотических клетках имеются
ДНК-полимеразы трех типов (табл. 29.3).
α-Полимераза играет основную роль в ре-
пликации хромосомы, а β-фермент уча-
ствует в репарации ДНК. Когда покоящиеся
клетки начинают быстро делиться, количе- Рис. 29.12. Электронная микрофотогра-
ство α-полимеразы возрастает более чем фия реплицирующейся хромо-
в 10 раз. γ-Полимераза отвечает за реплика- сомной ДНК из дробящегося
цию митохондриальной ДНК. Как и прока- ядра эмбриона дрозофилы.
риотические ДНК-полимеразы, эти фер- «Глаза» - только что реплици-
менты используют в качестве активиро- рованные участки. (Печатается
ванных предшественников дезокси- с любезного разрешения д-ра
рибонуклеозидтрифосфаты и осуществляют David Hogness.)
элонгацию затравки по матрице в направле-
нии 5'—>3'. Но в отличие от прокариот эука- 29. Хромосомы и выражение
риотические ДНК-полимеразы не обладают генов у эукариот 135
Рис. 29.13. Схематическое изображение 29.8. Новые гистоны образуют
репликации эукариотической новые нуклеосомы на отстающей
хромосомы. Родительская дочерней цепи ДНК
ДНК показана синим цве- В репликационных вилках синтез ДНК идет
том, новообразованная ДНК- в направлении 5'—>3' по одной дочерней це-
красным. пи и в направлении 3'—>5' по другой. Как
и при репликации прокариотической ДНК
(разд. 24.19), это происходит следующим
нуклеазной активностью. Скорее всего образом: одна цепь, ведущая, синтезируется
функцию исправления ошибок выполняют непрерывно, а другая, отстающая,- преры-
нуклеазы, ассоциированные с этими поли- висто. Как распределяются старые и новые
меразами в мультиферментных комплексах. гистоны? Чтобы решить этот вопрос, синтез
ДНК проводили в присутствии ингибитора
белкового синтеза циклогексимида. В этих
условиях синтез ДНК прекращается в тече-
ние примерно 15 мин. При действии
ДНКазы I половина новообразованной
ДНК полностью распадается, а другая по-
ловина расщепляется на фрагменты длиной
200 пар оснований. Этот эксперимент, а так-
же данные, полученные с помощью метки
тяжелыми изотопами, показали, что роди-
тельские гистоны ассоциированы только
с одной из двухспиральных дочерних ДНК,
тогда как другая остается голой из-за отсут-

Рис. 29.14. Фазы клеточного цикла эука- Таблица 29.3. Эукариотические ДНК-полимеразы
риотической клетки: митоз
(М); фаза покоя 1, перед синте- Тип Локализация Основная Масса,
зом ДНК (G l ); период синтеза функция кДа
ДНК (S); фаза покоя 2, после Ядро Репликация 140
α
синтеза ДНК (G2). Продолжи- ядерной ДНК
тельность фаз зависит от типа Репарация 40
клеток и условий культивиро- β » ядерной ДНК
вания. Митоз - обычно самая
Митохондрии Репликация 150
короткая фаза. γ митохондриаль-
ной ДНК
Часть IV.
136 Информация
ваются на отстающей цепи по той причине,
что до соединения фрагментов Оказаки она
содержит одноцепочечные участки.

29.9. Митохондрии и хлоропласты содержат


собственную ДНК
Не вся наследственная информация эука-
риотических клеток содержится в ядерной
хромосомной ДНК. В результате генетиче-
ских исследований дрожжей был открыт ми-
тохондриальный геном, отличный от ядер-
ного генома. В 1949 г. Борис Эфрусси (Boris
Ephrussi) обнаружил, что некоторые му-
танты пекарских дрожжей не способны
к окислительному фосфорилированию. Эти
дефектные по дыханию мутанты медленно
растут за счет брожения. Они называются
Рис. 29.15. Асимметричная репликацион- petites (что по-французски означает «ма-
ная вилка, возникшая в резуль- ленькие»), так как образуют очень малень-
тате синтеза ДНК в присут- кие колонии. Генетический анализ привел
ствии циклогексимида, блоки- к неожиданному открытию, что мутации
рующего образование новых petites сегрегируют независимо от ядра; это
гистонов. Одна из дочерних навело на мысль о том, что митохондрии
молекул ДНК покрыта бусина- обладают собственным геномом. И дей-
ми, другая остается голой. Это ствительно, через несколько лет в митохон-
показывает, что родительские дриях была обнаружена ДНК. Более того,
гистоны связаны только митохондриальная ДНК из штамма petite
с одной из дочерних молекул. отличалась по плавучей плотности от мито-
[Riley D., Weintraub H., Proc. хондриальной ДНК дрожжей дикого типа;
Nat. Acad. Sci., 76, 331 (1979).] из этого следовало, что у мутанта изменена
значительная часть митохондриального ге-
нома. Вслед за этим было показано, что хло-
ропласты фотосинтезирующих эукариот то-
ствия новых гистонов. Эта интерпретация же содержат ДНК и что она реплицируется,
находит прямое подтверждение на элек- транскрибируется и транслируется.
тронных микрофотографиях, где видно, что Митохондриальная ДНК животных кле-
в области репликационной вилки одна из ток - кольцевая двухцепочечная молекула
дочерних нитей покрыта бусинами, а дру- с контурной длиной около 5 мкм, что со-
гая - нет (рис. 29.15). Иными словами, роди- ответствует 15 kb. Дрожжевая митохон-
тельские гистоны распределяются во время дриальная ДНК обычно примерно в 5 раз
репликации консервативно1. Такое поведе- длиннее, а хлоропластная - в 10 раз длиннее.
ние гистонов показывает, что гистоны не от- Молекулы ДНК в митохондриях и хлоро-
деляются от ДНК во время репликации. пластах не связаны с гистонами. Они отно-
Старые гистоны остаются на двухцепочеч- сительно невелики, сравнимы по величине
ной ДНК, содержащей ведущую цепь, тогда с вирусными геномами. Лучше всего изучен
как новые гистоны садятся на ДНК, содер- митохондриальный геном дрожжей, коди-
жащую отстающую цепь. Причина этого рующий примерно десять белков, две моле-
различия между дочерними молекулами кулы рибосомной РНК и около 26 видов
ДНК заключается, очевидно, в том, что ги- транспортной РНК. Молекулы, кодируемые
стоны гораздо прочнее связываются с двух- митохондриальной ДНК и синтезируемые
цепочечной ДНК, чем с одноцепочечной. внутри этой органеллы, составляют всего
Старые гистоны, по-видимому, не удержи- около 5% митохондриального белка. Таким
1 образом, большая часть белков митохон-
Недавно этот вывод подвергался серьезной
критике в связи с тем, что по некоторым дрии кодируется ядерным геномом. Однако
данным циклогексимид нарушает нормальное
распределение гистонов во время репликации.— 29. Хромосомы и выражение
Прим. перев. генов у эукариот 137
генетический вклад митохондриальной браны митохондрий кодируются митохон-
ДНК необходим. Например, три из семи дриальным геномом. Существование от-
субъединиц цитохромоксидазы и три из де- дельных геномов влечет за собой ряд
сяти субъединиц АТРазы внутренней мем- вопросов. Каким образом репликация мито-
хондриальной ДНК координируется
с удвоением хромосом и делением клетки?
Как белки, синтезированные в цитозоле,
проникают в митохондрии и взаимодей-
ствуют с продуктами митохондриальных
генов? Но самое загадочное состоит в сле-
дующем: зачем митохондриям нужны со-
бственные геномы, если 95% их белков коди-
руются ядерным геномом? Ответов на эти
интригующие вопросы пока нет.

29.10. Эукариотическая ДНК содержит


много повторяющихся последовательностей
оснований
Рой Бриттен (Roy Britten) и его сотрудники
исследовали кинетику реассоциации ДНК,
денатурированной нагреванием, и обнару-
жили, что эукариотическая ДНК в отличие
от прокариотической ДНК содержит
много повторяющихся последовательно-
стей оснований. В этих экспериментах
ДНК дробили на короткие фрагменты
и затем денатурировали нагреванием рас-
твора выше температуры плавления ДНК
(Тпл). Затем полученный раствор одноцепо-
чечной ДНК охлаждали до температуры
примерно на 25°С ниже Тпл, оптимальной
для реассоциации комплементарных цепей
Рис. 29.16. Электронно-микроскопиче- с образованием двухспиральной ДНК. Ки-
ское изображение молекулы нетику реассоциации можно регистриро-
вать самыми различными способами.
митохондриальной ДНК, со-
Один из методов состоит в измерении по-
держащей два генома, соеди-
ненных «голова к хвосту» глощения раствора при 260 нм (разд. 24.9).
При этой длине волны коэффициент погло-
с образованием кольца. Репли-
щения двухцепочечной ДНК примерно на
кация этой молекулы ДНК
40% ниже, чем соответствующая величина
только что началась. Стрелка-
для одноцепочечной ДНК; это явление на-
ми показаны две петли, распо-
зывается гипохромизмом. В основе другого
ложенные на противопо-
ложных сторонах кольца. Эти экспериментального подхода лежит тот
факт, что двухцепочечная ДНК связывает-
петли с вытесненной цепью
ся колонками с гидроксиапатитом (фосфа-
(D-петли, от англ. displa-
том кальция), а одноцепочечная проскаки-
cement - вытеснение) содержат
вает. В этом методе привлекает то, что он
новосинтезированную ДНК.
позволяет фракционировать большие коли-
Более тонкая линия в каждой
чества ДНК на основе скорости ее реассо-
петле - вытесненный одноцепо-
циации после тепловой денатурации.
чечный участок родительской
Наблюдаемая кинетика реассоциации
ДНК. (Печатается с любезного
ДНК Е. coli или фага Т4 соответствует
разрешения д-ра David
ожидаемой кинетике бимолекулярной реак-
Clayton.)
ции
Часть IV.
138 Информация
Рис. 29.17. Кривые зависимости f от C0t мощью этой кривой. C 0 t 0 , 5 - значение C0t,
(«кривые C0t») отображают ки- при котором происходит реассоциация по-
нетику реассоциации несколь- ловины ДНК (f= 0,5). Для ДНК Е. coli зна-
ких денатурированных нагре- чение C 0 t 0 , 5 составляет примерно 9 М•с,
ванием ДНК. По оси ординат для фага Т4 C 0 t 0 , 5 = 0,3 М•с. Эти числа
отложена доля одноцепо- показывают, что ДНК Е. coli реассоции-
чечных молекул, по оси рует примерно в 30 раз медленнее, чем
абсцисс - C0t. Быстрая реассо- ДНК фага Т4. Объясняется это тем, что
циация сателлитной ДНК мы- ДНК Е. coli длиннее и число разных видов
ши показывает, что она содер- фрагментов, которые содержатся в препа-
жит огромное количество рате ДНК, разрушенной силами сдвига,
повторяющихся последова- больше, чем в препарате ДНК Т4. Итак,
тельностей. [Britten R. J., Koh- концентрация комплементарных фрагмен-
ne D. E., Science, 161, 530 тов в растворе фрагментированной ДНК
(1968).] Е. coli ниже, чем в растворе ДНК фага Т4
(содержащем такое же количество нуклео-
тидов), и, следовательно, скорость реассо-
где S и S' - комплементарные одноцепо- циации ниже. Исследование ряда прока-
чечные молекулы, D - реассоциировавшая риотических ДНК показало, что величина
двойная спираль и k - константа скорости C 0 t 0,5 прямо пропорциональна размеру ге-
ассоциации. В такой реакции доля одноце- нома.
почечных молекул f снижается со временем Когда с помощью этого метода стали
в соответствии с уравнением исследовать ДНК мыши, получили неожи-
данный результат. Геномы млекопитаю-
щих примерно на три порядка величины
больше, чем геном Е. coli, и предполага-
лось, что будет получена величина C 0 t 0 , 5
где С0 - исходная концентрация ДНК (вы- порядка
4
10 М•с. Раствор ДНК
раженная в молях нуклеотидов в 1 л), -4
с концентрацией 10 М и с такой величи-
а t - время в секундах. Для определенной ной C0t0,5 должен реассоциировать напо-
ДНК и заданных экспериментальных усло- ловину за 108 с (примерно 3 года). К уди-
вий (т. е. ионной силы, температуры, разме- влению исследователей, они обнаружили,
ра фрагментов ДНК) f зависит только от что 10% ДНК мыши реассоциирует напо-
C0t - произведения концентрации ДНК на ловину за несколько секунд. Эта фракция
время. Кинетику реассоциации удобно гра- ДНК мыши реассоциирует быстрее, чем
фически изображать, откладывая зависи- даже самые маленькие вирусные ДНК, и,
мость f от десятичного логарифма C0t. Та- следовательно, содержит много повторяю-
кая кривая C0t имеет сигмоидную форму щихся последовательностей. Анализ кри-
(рис. 29.17). Характеристикой того или
иного препарата ДНК служит величина 29. Хромосомы и выражение
C 0 t 0 , 5 , которую легко определить с по- генов у эукариот 139
вой зависимости f от C0t показал, что эта
фракция мышиной ДНК содержит порядка
миллиона копий повторяющейся последова-
тельности длиной около 300 пар оснований.
Примерно 20% мышиной ДНК ренатури-
рует с промежуточной скоростью. Этот
факт, согласно интерпретации авторов,
указывал, что данная фракция содержит
3 4
10 —10 копий определенных последова-
тельностей. Остальные 70% мышиной
ДНК ренатурировали очень медленно. Ве-
личина C 0 t 0,5 для этой фракции показыва-
ла, что она состоит из уникальных или по-
чти уникальных последовательностей осно-
ваний.
Все изученные до настоящего времени Рис. 29.18. На этой кривой седиментации
эукариотические геномы, кроме, возможно, видны три отчетливых пика са-
дрожжей, содержат повторяющиеся по- теллитной ДНК (ρ = 1,692,
следовательности ДНК, тогда как прока- 1,688 и 1,671). Показан резуль-
риоты ее не содержат. Например, челове- тат равновесного центрифуги-
ческая ДНК на 30% состоит из последова- рования ДНК D. virilis в ней-
тельностей, повторяющихся по меньшей тральном градиенте CsCl.
мере 20 раз. Относительное содержание [Gall J. G., Cohen E. H., Ather-
высокоповторяющейся, умеренно повто- ton D. D., Cold Spring Harbor
ряющейся и уникальной ДНК различно Symp. Quant. Biol., 38, 417
у разных видов. (1974).]
29.11. Высокоповторяющаяся ДНК и обрабатывали щелочью для денатурации
(сателлитная ДНК) локализована ДНК. Затем этот препарат инкубировали
в центромерах с меченной тритием РНК, транскрибиро-
Многие высокоповторяющиеся ДНК мож- ванной in vitro очищенной сателлитной
но выделить методом центрифугирования ДНК в качестве матрицы. Гибриды ра-
в градиенте плотности, так как их плавучая диоактивной РНК с участками хромосомы,
плотность отличается от плотности основ- содержащими сателлитную ДНК, вы-
ной ДНК. Например, ДНК Drosophila virilis являли с помощью радиоавтографии
дает главный пик и три сателлитных пика (рис. 29.19). Был получен очень четкий ре-
с меньшей плотностью (рис. 29.18). Эти са- зультат: сателлитная ДНК мыши встре-
теллитные пики содержат исключительно чается только в области центромер. Лока-
повторяющуюся ДНК. Каждая из них лизация этих последовательностей и отсут-
представляет собой повторяющуюся по- ствие в клетке комплементарных им РНК
следовательность гептануклеотидов: объясняются, по-видимому, тем, что са-

Роль высокоповторяющейся ДНК не- теллитные последовательности участвуют


известна. Но хромосомная локализация в перемещениях хромосом во время мито-
этой фракции была определена с помощью за и мейоза.
метода гибридизации in situ, разработанно-
го Джозефом Голлом и Мэри Лу Пардью 29.12. Гены, кодирующие рибосомные РНК,
(Joseph Gall, Mary Lou Pardue). Клетки им- расположены один за другим тандемно
мобилизовали под тонким слоем агара и повторяются несколько сот раз
Гены, кодирующие молекулы рибосомных
Часть IV. РНК, отличаются двумя особенностями.
140 Информация Во-первых, они повторяются тандемно
са Бернстила, Доналда Брауна, Оскара
Миллера (Max Birnstiel, Donald Brown,
Oscar Miller) и их сотрудников. Гены, коди-
рующие четыре рибосомные PHK - 18S-,
5,8S-, 28S- и 5S-рРНК,- были выделены
в чистом виде из ДНК африканских шпор-
цевых лягушек Xenopus laevis и Xenopus
mulleri. Выбор пал на шпорцевых лягушек
по той причине, что их ооциты содержат
особенно много этих генов.
Гены 18S-, 5,8S- и 28S-pPHK собраны
вместе (образуют кластеры) и тандемно
повторяются. Гибридизация in situ показа-
ла, что эти гены расположены в ядрышках.
Повторяющаяся единица состоит из гена,
кодирующего 40S-предшественник РНК
и спейсер (рис. 29.21). 40S-предшественник
(8kb) модифицируется и расщепляется, да-
Рис. 29.19. Радиоавтограф мышиных кле-
вая зрелые 18S-, 5,8S- и 28S-рРНК
ток, на котором видна локали-
зация сателлитной ДНК. (Пе-
чатается с любезного разреше-
ния д-ра Joseph Gall.)

Рис. 29.20. Микрофотография ядра, выде-


ленного из ооцита ксенопуса.
Ядро окрашено, чтобы были
видны сотни ядрышек, обра-
зующихся при амплификации
генов рибосомной РНК.
[Brown D. D., Dawid I. В., Sci-
ence, 160, 272 (1968).]
Рис. 29.21. Организация генов 40S-пред-
шественника 18S- 5,8S-
один за другим. Почти у всех эукариот и 28S-рРНК у ксенопуса. Тан-
имеется более 100 копий этих генов. Во-вто- демно повторяющиеся гены
рых, большинство генов рРНК расположе- разделены нетранскриби-
но в особых участках хромосом, ассоцииро- руемыми участками (спейсера-
ванных с ядрышками. В клетках мутантов, ми). Длина повторяющегося
лишенных ядрышек, синтезируется очень элемента 13 kb.
мало рРНК; поэтому они нежизнеспо-
собны. Об этих генах многое известно, 29. Хромосомы и выражение
главным образом благодаря работам Мак- генов у эукариот 141
Рис. 29.22. На этой электронной микрофо- и дают примерно 2•106 копий. Количество
тографии ядрышковой ДНК генов, кодирующих рРНК, достигает 75%
ясно видна тандемная укладка всей ДНК ооцита. Амплифицированная
генов 18S-, 5,8S- и 28S-pPHK. ДНК представляет собой внехромосомные
Толстая осевая нить - ДНК. кольца, прикрепленные к множеству новых
Тонкие нити, отходящие в сто- ядрышек. Такая избирательная амплифика-
роны,- новообразованные мо- ция гена позволяет ооцитам накопить 1012
лекулы РНК со связанными рибосом, необходимых для очень быстрого
белками. Острый конец каждой синтеза белка во время дробления. Если
«елочки», образованной синте- бы амплификации гена не было, образова-
зирующимися молекулами ние 1012 рибосом заняло бы несколько
РНК, соответствует точке ини- веков!
циации транскрипции. Голые Ген, кодирующий самую маленькую мо-
участки между острыми конца- лекулу рибосом - 5S-pPHK, также тандем-
ми «елочек» - нетранскриби- но повторяется. И соматические клетки,
руемые спейсеры. [Miller О. L., и ооциты содержат около 24000 копий
Jr., Beatty В. R., J. Cell Physiol., этого гена, кодирующего молекулу РНК
74 (suppl. 1), 225 (1969).] длиной 120 нуклеотидов. Эти гены со-
браны в группы (в кластеры) и распола-
гаются на концах большинства хромосом
лягушки. И в этом случае между генами
(разд. 29.21). Спейсер (нетранслируемый данной рРНК имеется область нетранскри-
участок) не транскрибируется (рис. 29.22). бируемого спейсера (рис. 29.23). На самом
Соматические клетки лягушек содержат деле спейсер в несколько раз длиннее
примерно 500 копий этой повторяющейся самого гена. Любопытно, что он содержит
единицы, и все они расположены друг за нетранскрибируемый псевдоген, последова-
другом. В процессе оогенеза происходит тельность оснований которого сходна с са-
удивительная избирательная амплифика- мим геном. Роль спейсера в этом и в дру-
ция (увеличение количества) этих генов. гих эукариотических генах остается загад-
Они реплицируются несколько тысяч раз кой.

Часть IV.
142 Информация
29.13. Гены гистонов собраны вместе
и повторяются тандемно много раз
Как организованы гены, кодирующие бел-
ки? Одними из первых были выделены
и охарактеризованы гены гистонов благо-
даря изобилию гистоновой мРНК в бы-
стро делящихся эмбрионах морского ежа.
Эти морские беспозвоночные развиваются
от стадии зиготы до стадии бластулы, со-
держащей 1000 клеток, за 10 ч. Поэтому
для сборки нового хроматина необходимо
синтезировать большое количество гисто-
нов. Действительно, в период раннего эм-
бриогенеза гистоны составляют более чет-
верти всего синтезированного белка. Ги- Рис. 29.24. Световая микрофотография
стоновая мРНК содержится в еще боль- эмбриона морского ежа на ста-
шем количестве - на ее долю приходится дии четырех клеток. (Печатает-
около 70% всех информационных РНК, ся с любезного разрешения
синтезируемых на этой стадии, поэтому ее д-ра Annamma Spudich.)
сравнительно легко выделить. После выде-
ления гистоновой мРНК была исследована
кинетика ее гибридизации с ДНК морского мостъ. Число копий гистоновых генов
ежа для определения числа копий гисто- у различных видов морского ежа колеблет-
новых генов. Скорость гибридизации была ся от 300 до 1000. У других организмов по-
в несколько сот раз выше, чем она должна вторяемость ниже (табл. 29.4). Число ко-
быть в случае уникальных последовательно- пий гистоновых генов у того или иного
стей: это показывало, что для гистоновых организма, по-видимому, коррелирует
генов характерна очень высокая повторяе- с потребностью в быстром синтезе гисто-
новых мРНК.
Как организованы в геноме многократно
повторяющиеся гены гистонов? Для полу-
чения фракции ДНК, обогащенной генами
гистонов, использовали тот факт, что эти
гены содержат больше пар G—С (55%),
чем большая часть ДНК морского ежа
(42%), и, следовательно, имеют более высо-
кую плавучую плотность. При расщепле-

Таблица 29.4. Повторяемость гистоновых генов1

Вид Число копий

Морской еж 300-1000
Плодовая мушка (Drosophila
melanogaster) 110
Шпорцевая лягушка (Xenopus laevis) 20-50
Мышь 10-20
Рис. 29.23. Организация генов 5S-pPHK Курица 10
Xenopus laevis. Эти тандемно Человек 30-40
повторяющиеся гены также 1
разделены нетранскриби- У дрожжей Saccharomyces cerevisiae имеется только два
гистоновых гена на гаплоидный геном.- П р и м . перев.
руемыми спейсерами. Повто-
ряющийся элемент имеет дли-
ну примерно 750 пар основа- 29. Хромосомы и выражение
ний. генов у эукариот 143
Рис. 29.25. Карта сгруппированных в кла- стоновой мРНК. Но причина, по которой
стеры гистоновых генов мор- повторы собраны тандемно вместе, не
ского ежа (Strongylocentrotus очень ясна. Соседство генов, кодирующих
purpuratus) и плодовой мушки пять гистонов, может быть, играет важную
(Drosophila melanogaster). Коди- роль в координации их синтеза, чтобы ги-
рующие участки закрашены си- стоны Н2А, Н2В, Н3 и Н4 образовывались
ним цветом, спейсеры (нетран- в эквимолярном количестве, а гистон
скрибируемые участ- H1 - в половинном.
ки) - желтым. Стрелки показы-
вают направление тран-
скрипции. 29.14. Многие белки, синтезирующиеся
в больших количествах, кодируются
нии такой обогащенной ДНК одной из ре- уникальными генами
стриктирующих эндонуклеаз получались Мы уже видели, что гены рибосомных
фрагменты длиной 7kb, которые гибриди- РНК и гистонов повторяются много раз.
зовались с гистоновой мРНК. Затем эти Представлены ли гены, кодирующие боль-
фрагменты клонировали в клетках Е. coli шое количество продукта, большим чис-
и исследовали с помощью ферментов ре- лом копий? Для ответа на этот вопрос До-
стрикции и электронной микроскопии. Ре- налд Браун (Donald Brown) выделил ген
зультаты исследований показали, что гены, фиброина шелка шелковичного червя
кодирующие пять основных гистонов, Bombyx mori. Выбор пал на эту систему по-
сгруппированы вместе в составе основного тому, что мРНК, кодирующая фиброин
повторяющегося элемента длиной 7 kb шелка, имеет характерные структурные
(рис. 29.25). В этом повторяющемся эле- особенности. Она служит матрицей для по-
менте пять кодирующих участков чере- вторяющихся последовательностей амино-
дуются с пятью спейсерами. Кодирующие кислот, богатых глицином. Кроме того, ги-
последовательности не прерываются вста- гантские клетки только одного типа синте-
вочными последовательностями в отличие зируют огромные количества фиброина
от других эукариотических генов, опи- шелка на определенной стадии развития.
санных выше (разд. 26.12). Группа из пяти Для очистки РНК использовали ее боль-
гистоновых, генов повторяется тандемно шой размер (9,1 kb) и высокое содержание
много раз. Повторы очень сходны друг G по сравнению с рРНК и молекулами
с другом, но не идентичны. Это согласует- других РНК. Ген фиброина шелка также
ся с тем, что гистоны H1, H2A и Н2В пред- был частично очищен благодаря его не-
ставляют собой группы очень сходных обычно высокой плавучей плотности. Гиб-
белков, а не совершенно однородные поли- ридизация очищенной фиброиновой мРНК
пептиды. В различных тканях и на разных с ДНК показала, что в гаплоидном геноме
стадиях развития экспрессируются раз- имеется только один ген фиброина шелка.
личные гистоновые гены. Этот результат имел чрезвычайно важ-
Какова функциональная роль такой ор- ное значение для изучения экспрессии ге-
ганизации генов? Их повторяемость, не- нов и дифференцировки у эукариот. Он по-
сомненно, имеет важное значение для бы- казал, что большие количества одного
строго синтеза большого количества ги- определенного белка могут быть синтези-
рованы, даже если в геноме имеется толь-
Часть IV. ко одна копия кодирующего его гена.
144 Информация Единственный ген фиброина шелка служит
29.15. Большинство уникальных генов
перемежается повторяющимися
последовательностями
Примерно 70% ДНК самых разнообразных
эукариот представляет собой уникальные
последовательности. Как расположены эти
уникальные гены относительно повторяю-
щихся последовательностей? Анализ эука-
риотических хромосом различными мето-
дами показал, что уникальные последова-
тельности обычно чередуются с умеренно
повторяющимися последовательностями,
длина которых в типичном случае состав-
ляет 300 пар оснований. Существует не-
сколько тысяч различных умеренно повто-
Рис. 29.26. Шелковичный червь (Фотогра- ряющихся последовательностей. Они пов-
торяются в геноме несколько сот раз и
фия любезно представлена
в совокупности составляют 20% ДНК.
д-ром Karen Spraque.)
Функция рассеянных, умеренно повторяю-
щихся последовательностей ДНК неизвест-
на. Возможно, они служат участками
матрицей для синтеза примерно 104 моле- связывания специфических регуляторных
кул мРНК, сохраняющихся в течение не- макромолекул, которые могут контролиро-
скольких дней. Каждая молекула мРНК вать транскрипцию соседних уникальных
служит матрицей для синтеза порядка 105 структурных генов.
молекул белка. Таким образом, одного гена
хватает для синтеза порядка 109 молекул 29.16 Почти все гены высших эукариот,
белка в течение четырех дней. Создается кодирующие белки, имеют разорванное
впечатление, что повторяющиеся гены ри- строение
босомных РНК и гистонов скорее предста- Существование у эукариот повторяющихся
вляют собой исключение, чем правило. генов и их чередование с уникальными ге-
Единственный ген фиброина шелка гораздо нами не имеют никаких аналогий у прока-
типичнее для генов, кодирующих белки, да- риот. Еще одно удивительное отличие в ор-
же белки, синтезирующиеся в больших ко- ганизации генома - присутствие у высших
личествах. Например, ретикулоциты содер- эукариот вставочных последовательностей
жат одну или несколько копий генов, практически во всех генах, кодирующих
кодирующих субъединицы гемоглобина белки. Как уже обсуждалось (разд. 26.12),
(разд. 29.26). Подобно этому, большие ко- эти вставочные последовательности (ин-
личества овальбумина - основного компо- троны) транскрибируются вместе с коди-
нента яичного белка - синтезируются в яй- рующими последовательностями (экзона-
цеводе пасущихся кур, клетки которого ми), а затем удаляются в процессе образо-
содержат только одну копию овальбуми- вания зрелой мРНК. Число интронов
нового гена на гаплоидный геном. Однако в изученных до сих пор разорванных генах
не следует упускать из виду и возможность колеблется от 2 до 17 (табл. 29.5
избирательной амплификации гена как и рис. 29.27)1. Некоторые интроны имеют
способ увеличения синтеза того или иного большую длину. Например, ген β-глобина
белка в клетках определенного типа. Неко- мыши содержит интрон длиной 550 пар ос-
торые опухолевые клетки в культуре при- нований, т.е. он длиннее, чем его экзоны.
обретают устойчивость к аналогам фолие- Два фрагмента иммуноглобулинового гена
вой кислоты путем синтеза 200-кратного разделены еще более длинным интро-
количества дигидрофолят-редуктазы по ном - длиной 1250 пар оснований. В неко-
сравнению с нормальными чувствительны-
ми клетками. Такое количество фермента 1
Ген миозина содержит свыше 50 интронов! —
возникает вследствие избирательной ампли- Прим. перев.
фикации гена дигидрофолят-редуктазы.
Очевидно, эукариотический геном предста- 29. Хромосомы и выражение
вляет собой весьма динамичную систему. генов у эукариот 145
фрагментов старых? Участвуют ли ин-
троны в регуляции выражения генов? Яс-
Рис. 29.27. Карта гена кональбумина. но, что появилась новая важная область
Вставочные последовательно- исследований. Быстро накапливаются
сти (интроны), которые тран- данные, касающиеся существенного вопро-
скрибируются, но не входят са - вырезания вставочных последователь-
в состав зрелой мРНК, пока- ностей из первичного транскрипта. Вскоре
заны желтым цветом. мы рассмотрим эти данные.

торых генах общая длина интронов превы- 29.17. РНК в эукариотических клетках
шает длину экзонов. Так, ген овальбумина синтезируется тремя различными
РНК-полимеразами
содержит около 7700 пар оснований, а его
мРНК имеет длину всего 1859 нуклеоти- Перейдем теперь к транскрипции. В эука-
риотических клетках существует три вида
дов. Как правило, вставочные последова-
РНК-полимераз, синтезирующих РНК.
тельности разорванных генов длиннее, чем
Они различаются по специфичности к мат-
экспрессирующиеся последовательности.
рице, локализации и чувствительности
Интересно отметить, что эволюционные
к ингибиторам. Полимераза типа I локали-
изменения в последовательностях интро-
зована в ядрышках, где она транскриби-
нов происходят быстрее, чем в экзонах.
рует тандемные повторы, кодирующие ри-
Последовательности оснований меньшего
босомные 18S-, 5,8S- и 28S-PHK. Другие
и н т р о н а генов β-глобина мыши и кролика
молекулы РНК - 5S-pPHK и все
совершенно различны. Однако по длине
тРНК - синтезируются другой РНК-поли-
они близки, а их положение в гене иден-
меразой типа III, которая находится не
тично. Еще более существенно, что после-
в ядрышке, а в нуклеоплазме. Большие мо-
довательности на стыке интронов и экзо-
лекулы РНК-предшественники, из которых
нов, по которым происходит сплайсинг
образуются мРНК, синтезируются РНК-
(сращивание), консервативны.
полимеразой II, также содержащейся в ну-
Были обнаружены и разорванные гены,
клеоплазме. У прокариот же все виды кле-
кодирующие РНК. Например, один из ге-
точной РНК синтезируются одной и той
нов транспортных РНК дрожжей содержит
же РНК-полимеразой. Общее свойство эу-
интрон длиной 14 пар оснований рядом
кариотических РНК-полимераз заключает-
с антикодоновой петлей зрелой тРНК. Ми-
ся в том, что в их состав входят две боль-
тохондриальный ген, кодирующий рибо-
шие и несколько маленьких субъединиц.
сомную РНК, также имеет разорванное
строение. В то же время многие рРНК
29.18. Грибной яд α-аманитин -
и тРНК непрерывны. Гены гистонов мор-
мощный ингибитор РНК-полнмеразы II
ского ежа и плодовой мушки, по-видимо-
Каждый год во всем мире более 100 чело-
му, также не содержат вставочных после-
век погибает от отравления ядовитыми
довательностей. До настоящего времени
грибами, в частности Amanitia phalloides,
такие «разорванные» структурные гены
(бледной поганкой). Один из токсинов этих
были обнаружены только у птиц и млеко-
питающих. Интересно выяснить, много ли Таблица 29.5. Некоторые эукариотические гены, имею-
разорванных генов у низших эукариот 1 . щие разорванное строение
Открытие разорванных генов было пол-
ной неожиданностью и повлекло за собой
возникновение ряда увлекательных проб- Ген Число Ген Число
интро- интро-
лем. Может быть, интроны отражают
нов нов
образование в эволюции новых белков из
1
В настоящее время вырисовывается следую-
щая тенденция: чем выше эволюционное поло- Овальбумин 7 β-Глобин 2
жение организма, тем, как правило, больше ин- Овомукоид 6 δ-Глобин 2
тронов содержат его гены и тем они длиннее.— Кональбумии 17 L-цепъ имму-
Прим. перев. ноглобулина 2
α-Глобин 2 Н-цепь имму-
Часть IV. ноглобулина 4
146 Информация
грибов - α-аманитин - циклический пептид, ждой политенной хромосоме имеется ряд
содержащий несколько необычных амино- характерных полос (диски, или хромо-
кислот. α-Аманитин очень прочно связы- меры), видимых под световым микроско-
вается с РНК-полимеразой II (К = 10-8 М) пом. При развитии личинки в куколку не-
и блокирует таким образом синтез пред- которые диски временно увеличиваются
шественников мРНК. Полимераза III инги- (образуют пуфы), так как ДНК в этой
бируется при более высоких концентрациях области переходит из конденсированного
α-аманитина (10-6 М), а полимераза I не состояния в разрыхленное (рис. 29.29).
чувствительна к этому токсину. α-Амани- Пуфы соответствуют транскрипционно ак-
тин блокирует стадию элонгации в синтезе тивным участкам. Был обнаружен порази-
РНК. тельный факт: пуфы могут быть индуциро-

29.19. Специфические гены могут


активироваться для транскрипции
Выражение генов у эукариот, как и у про-
кариот, регулируется в значительной степе-
ни на уровне транскрипции. Одно из наи-
более надежных доказательств было полу-
чено при исследовании хромосом разви-
вающихся насекомых. Гигантские поли-
тенные хромосомы из слюнных желез
Drosophila содержат более тысячи молекул
ДНК, не разошедшихся при репликации
и лежащих бок о бок друг с другом. В ка-

Таблица 29.6. Эукариотическне РНК-полимеразы

Тип Локализация Клеточные Вирусные


транскрипты транскрипты

I Ядрышко 18S-, 5,8S- и Не обнаруже- Рис. 29.28. Ядовитый гриб Amanita phallo-
28S-рРНК ны ides, содержащий α-аманитин.
II Нуклеоплазма Предшествен- Предшествен- (Lincoff G., Mitchell D. H., Toxic
ники мРНК и ники мРНК and Hallucinogenic Mushroom
гяРНК Poisoning, Van Nostrand Reinh-
III Нуклеоплазма тРНК и 5S Малые РНК
old, 1977, p. 30.)
рРНК
29. Хромосомы и выражение
генов у эукариот 147
сгруппированы в единый кластер и этот
кластер генов повторяется тандемно много
раз. В ядрышках эта группа из трех генов
транскрибируется РНК-полимеразой I
и дает 45S-PHK (рис. 29.30). Предшествен-
ник длиной 13 kb подвергается фермента-
тивной модификации и расщеплению
и дает зрелые 18S-, 5,8S- и 28S-pPHK
(рис. 29.31). Примерно 100 нуклеотидов ме-
тилируется, и почти все - по 2'-гидроксиль-
ной группе рибозных остатков. Высокоспе-
цифические участки метилирования сохра-
няются в рРНК таких эволюционно дале-
ких эукариот, как дрожжи и плодовая
мушка. Кроме того, более 100 остатков
уридина изомеризуются в остатки псевдоу-
ридина. Во время созревания происходит
ассоциация множества рибосомных белков
с этими РНК и их предшественниками.
Возможно, именно взаимодействие РНК
с рибосомными белками делает опреде-
ленные участки чувствительными к дей-
Рис. 29.29. Образование пуфа в политен- ствию нуклеаз.
ной хромосоме на определен-
ной стадии развития. Стрелкой
29.21. Информационные РНК избирательно
показан наиболее крупный пуф
образуются из больших ядерных
в хромосоме дрозофилы. (Пе- предшественников РНК
чатается с любезного разреше- (гетерогенной ядерной РНК, гяРНК)
ния д-ра Joseph Gall.) Образование рибосомных РНК у эукариот
сходно с ее образованием у прокариот
(разд. 25.17). В то же время между эука-
ваны в выделенных слюнных железах in риотическими и прокариотическими мРНК
vitro экдизоном - стероидным гормоном на- имеются существенные различия.
секомых. Происходит увеличение и затем 1. Первичные транскрипты у эукариот не
конденсация специфических дисков в опре- используются непосредственно в качестве
деленной временной последовательности, мРНК. Прежде чем они переходят из ядра
и одновременно происходят изменения в цитозоль, они подвергаются процессингу.
в популяции синтезируемых мРНК. Трансляция и транскрипция у эукариот
разобщены во времени и в пространстве,
29.20. Три вида рибосомных РНК тогда как у прокариот они тесно сопря-
образуются в результате процессинга жены.
одного первичного транскрипта 2. Первичные транскрипты у эукариот
Молекулы РНК, синтезируемые тремя имеют в длину от 2 до 20 kb, в связи с чем
РНК-полимеразами, называются первичны- их называют гетерогенной ядерной РНК
ми транскриптами. Эти новообразованные (гяРНК). Обычно эти первичные тран-
РНК в очень большой степени модифици- скрипты в несколько раз длиннее, чем
руются в ядре, прежде чем они переходят мРНК, которые из них получаются. Обра-
в цитозоль в виде зрелых молекул рРНК, зование эукариотических мРНК сопряжено
тРНК и мРНК. Образование рибосомных со сплайсингом и расщеплением. До сих
РНК из первичного транскрипта было изу- пор неизвестно, выполняет ли гяРНК еще
чено детально, лучше, чем процессинг ка- какую-нибудь роль, кроме того, что она
ких-либо других видов РНК. Выше уже об- служит предшественником мРНК.
суждалось, что гены 18S-, 5,8S- и 28S-pPHK 3. Эукариотические мРНК содержат на
5'-конце «колпачки» (кэпы), которые пред-
Часть IV. ставляют собой модифицированные нуклео-
148 Информация тиды. Кроме того, большинство мРНК не-
Рис. 29.30. Если расправить молекулу 45S- сет на 3 -коние длинную poly(А)-последова-
предшественника рибосомной тельность.
РНК из клеток HeLa и исследо- 4. Эукариотические мРНК моноци-
вать ее с помощью электронно- стронны, т.е. они являются матрицами для
го микроскопа, видна весьма синтеза только одной полипептидной цепи.
характерная картина шпилек Многие прокариотические мРНК, наобо-
и петель. Благодаря этому рот, полицистронны (например, мРНК лак-
можно картировать располо- тозного оперона - матрица для синтеза трех
жение молекул 28S- и 18S-PHK, полипептидных цепей).
образующихся из этого пред- 5. Популяция молекул мРНК эукариоти-
шественника. А - электронная ческой клетки зависит не только от скорости
микрофотография 45S-пред- транскрипции определенных генов; в эука-
шественника. Б - схематиче- риотических клетках имеется и еще один
ское изображение молекулы, уровень принятия решений; должен ли тот
изображенной на рис. А. или иной первичный транскрипт подверг-
[Wellauer P. К., Dawid I. В., нуться деградации или процессингу с обра-
Proc. Nat. Acad. Sci., 70, 2828 зованием зрелой мРНК и последующим
(1973).] транспортом ее в цитозоль1.

29.22. На 5'-конце мРНК находятся


«колпачки», а на 3'-конце, как правило,
poly(А)-последовательности
5'-конец всех известных эукариотических
мРНК (но не тРНК или рРНК) модифици-
рован особым образом. К мРНК присоеди-
нен 7-метилгуанилат необычной пирофос-
фатной связью 5'—5' (рис. 29.32). Эта
характерная структура называется «колпач-
ком». Она присоединяется к первичному
транскрипту. 5'-трифосфатный конец ново-
образованной цепи гидролизуется до дифос-
фата, и на него переносится остаток гуани-
лата GTP. Затем N-7 этого концевого
гуанина метилируется S-аденозилметиони-
]
Следует указать еще одно важное отличие
прокариотических мРНК от эукариотических —
время жизни. У прокариот оно составляет не
более нескольких минут, а у эукариот - десятки
Рис. 29.31. Образование рибосомной минут или часы, а в исключительных случаях
РНК млекопитающих из пер- недели и месяцы.- Прим. перев.
вичного транскрипта. Спей-
серные участки показаны 29. Хромосомы и выражение
желтым. генов у эукариот 149
в эукариотических системах синтеза белка.
Кроме того, большинство эукариотиче-
ских мРНК имеет на 3'-конце poly(А)-после-
довательности. Роlу(А)-полимераза присое-
диняет 150-200 нуклеотидов к первичному
транскрипту, на 3'-конце которого располо-
жен динуклеотид GC, а на расстоянии при-
мерно 20 нуклеотидов от него - последова-
тельность A A U A A . Исследования раз-
личных мРНК, введенных в яйца Xenopus,
показали, что роlу(А)-фрагмент увеличи-
вает стабильность мРНК, но при этом не
имеет никакого значения для трансляции.
Кроме того, отсутствие poly(А) на конце ги-
стоновых мРНК показывает, что он не обя-
зательно должен присутствовать в мРНК
для ее транспорта из ядра в цитозоль.

29.23. Ферменты сплайсинга с высокой


точностью удаляют интроны из первичных
транскриптов разорванных генов
При сплайсинге (расщепление с последую-
щим сращиванием) мРНК происходит раз-
рыв двух фосфодиэфирных связей и обра-
зование одной новой. Эндонуклеазная
и лигазная активности, вероятно, содержат-
ся в одном ферментном комплексе, и после-
довательные реакции сплайсинга согласо-
ваны между собой. В настоящее время
многие лаборатории пытаются выделить
ферменты сплайсинга. Очевидно, их дей-
ствие должно обладать высокой точностью.
Ошибка в точке сплайсинга на один нуклео-
тид приведет к сдвигу рамки считывания
Рис. 29.32. Структура «колпачков», распо-
в сторону 3'-конца от этого места, что даст
ложенных на 5'-конце эукарио-
тических мРНК. Все «колпач- совершенно иную последовательность ами-
ки» содержат 7-метилгуанилат нокислот. Как ферменты сплайсинга узнают
(изображен синим цветом), свои мишени? В настоящее время известен
присоединенный пирофосфат- ряд нуклеотидных последовательностей
в месте стыка экзонов и интронов, кодирую-
ной связью к 5'-концу. В «кол-
щих РНК-транскрипты (табл. 29.7). В этих
пачке» 0 ни одна рибоза не ме-
последовательностях есть общий мотив: ин-
тилирована, в «колпачке»
трон начинается с GU и кончается AG. Сле-
1 метилирована одна рибоза,
дует отметить, что один и тот же сигнал
в «колпачке» 2 - две.
сплайсинга встречается у кур, кроликов, мы-
шей и в ДНК вируса SV-40, который зара-
ном и образуется так называемый «колпа- жает клетки обезьян и человека 1 .
чок» 0. Соседние остатки рибозы могут 1
быть метилированы, при этом образуется В последнее время получен ряд данных, свиде-
«.колпачок» 1 или «колпачок» 2 (рис. 29.32). тельствующих об участии т.н. низкомолеку-
лярных ядерных РНК в сплайсинге, а также
Эти «колпачки» способствуют стабилиза- в созревании 3'-концов РНК. Эта фракция РНК
ции мРНК, защищая их 5'-концы от фосфа- исследуется уже давно. Она весьма консерватив-
таз и нуклеаз. Кроме того, «колпачки» по- на и содержит последовательности, комплемен-
вышают эффективность трансляции мРНК тарные участкам экзонов, прилежащим к интро-
нам. Низкомолекулярные ядерные РНК, по-ви-
димому, обеспечивают узнавание участков
Часть IV. сплайсинга соответствующими ферментами. -
150 Информация Прим. перев.
Таблица 29.7. Последовательности оснований транскриптов, содержащих интроны, вблизи участков сплайсинга

Участок гена Экзон Интрон Экзон

Овальбумин, интрон 2
Овальбумин, интрон 3
β-Глобин, интрон 1
β-Глобин, интрон 2
Иммуноглобулин λ 1 , интрон 1
Ранний Т-антиген вируса SV-40

В молекулах транспортной РНК точки нов. Выделение мРНК начинается с получе-


сплайсинга окружены совершенно другими ния клеточного экстракта, из которого
последовательностями. Из этого, очевидно, удаляют белки и ДНК. Затем большую
следует, что существует по крайней мере два часть мРНК отделяют oт других видов
фермента сплайсинга: один для образова- РНК, используя наличие в них poly(А)-фраг-
ния мРНК, другой - тРНК. Процесс сплай- ментов. Эти мРНК прочно связываются
синга тРНК, по-видимому, очень сходен с колонками, содержащими ковалентно при-
у эволюционно далеких видов. Клониро- вязанные полинуклеотиды poly(U)
ванные гены одной из дрожжевых тРНК и poly(Т). После элюции с такой аффинной
вводили в ооциты Xenopus с помощью ми- колонки мРНК ее можно фракционировать
кроинъекции для того, чтобы выяснить, мо- по размеру молекул методом гель-электро-
жет ли ген одноклеточного эукариота тран- фореза или седиментации. Другой способ
скрибироваться, а его продукт - процессиро- выделения индивидуальной мРНК - иммуно-
ваться в клетке амфибии. Самое порази- преципитация. Например, если добавить
тельное, что в клетке Xenopus происходят в белоксинтезирующий экстракт антитела,
транскрипция дрожжевого гена и пра- специфичные к овальбумину, это переведет
вильный процессинг его продукта, несмотря в осадок полисомы, содержащие овальбу-
на то что гены этой тРНК у двух видов со- миновую мРНК. Для того чтобы проверить
вершенно различны. В частности, 14-нуклео- препарат мРНК, его добавляют в бескле-
тидная вставочная последовательность пра- точную систему синтеза белка, которая ра-
вильно удаляется (рис. 29.33). Итак, специ- ботает только в присутствии экзогенной
фичность ферментов сплайсинга сохрани- РНК. Для этого часто используются эк-
лась на протяжении огромного периода стракты проростков пшеницы.
эволюции. Наличие очищенных индивидуальных
мРНК открывает возможности для ряда ин-
тересных экспериментов. Во-первых, с по-
29.24. В настоящее время известны мощью метода гибридизации соответ-
последовательности оснований многих ствующей мРНК (или комплементарной ей
информационных РНК ДНК-копии) с хромосомной ДНК можно
Многие эукариотические мРНК были выде- определить число определенных генов в ге-
лены в очищенном виде. У некоторых из них номе. Во-вторых, можно идентифицировать
была определена последовательность осно- фрагменты ДНК, содержащие данный ген,
ваний. Выделение какой-либо мРНК на- гибридизуя их с мРНК. Затем эти фраг-
чинается с выбора клеток, в которых она со- менты можно клонировать (разд. 31.11),
держится в большом количестве. Например, чтобы получить сам ген и прилегающие
ретикулоциты богаты глобиновой мРНК, к нему участки хромосомы в большом коли-
яйцеводы кур - мРНК овальбумина, плаз-
матические клетки - мРНК иммуноглобули- 29. Хромосомы и выражение
нов, эмбрионы морского ежа - мРНК гисто- генов у эукариот 151
Рис. 29.33. Процессинг предшественни- це (рис. 29.34). 1158 нуклеотидов, кодирую-
ка дрожжевой тирозиновой щих белок, обрамлены с обеих сторон не-
тРНК. Происходит удаление транслируемыми последовательностями.
14-нуклеотидной вставочной С 5'-стороны она короче, чем с 3'-стороны.
последовательности (показано Нетранслируемый 5'-концевой участок дли-
желтым цветом), и ряд основа- ной 64 нуклеотида содержит «колпачок»,
ний модифицируется. Продукт инициирующий кодон AUG, взаимодей-
длиной 92 нуклеотида полу- ствует с белоксинтезирующим аппаратом
чается из первичного тран- и участвует в инициации синтеза белка.
скрипта длиной 108 нуклеоти- Весьма многозначителен тот факт, что этот
дов путем отщепления 5'-кон- участок содержит последовательность, ком-
цевой лидерной последова- плементарную 3'-концу 18S-pPHK. Напом-
тельности и присоединения ним, что у прокариот инициирующая после-
ССА к 3'-концу. довательность в мРНК спаривается
с 3'-концом 16S-pPHK (разд. 27.14). Роль
очень длинной нетранслируемой последова-
тельности, расположенной с 3'-стороны, не-
честве. В-третьих, с помощью электронной известна. Для этого участка длиной 637 ну-
микроскопии можно выявить вставочные клеотидов характерно обилие коротких
последовательности в этом гене (разд. повторяющихся последовательностей.
26.12). В-четвертых, можно определить по- Фрагменту poly(А) в овальбуминовой
следовательность нуклеотидов мРНК, мРНК, как и в других мРНК, предшествует
чтобы идентифицировать регуляторные сиг- GC, а примерно за 20 нуклеотидов до
налы. этого - AAUAAA.
Недавно была определена последователь-
ность овальбуминовой мРНК. Эта мРНК
содержит 1859 нуклеотидов на участке от 29.25. Эукариотическая рибосома (80S)
«колпачка» на 5'-конце до p o l y ( A ) на 3'-кон- состоит из малой (40S) и большой (60S)
субчастиц
Часть IV. Аппарат синтеза белка у эукариот аналоги-
152 Информация чен соответствующему аппарату у прока-
риот, но составляющие его белки и РНК от-
личаются от прокариотических и, кроме
того, они содержатся в большем количестве.
Цитоплазматические рибосомы эукариоти-
ческих клеток несколько крупнее, чем рибо-
сомы бактерий. Эукариотические рибосомы
(рис. 29.35) имеют коэффициент седимента-
ции 80S, а не 70S. Подобно бактериальным
рибосомам, они диссоциируют на большую
(60S) и малую (40S) субчастицы. 40S-субча-
стица содержит молекулу 18S-PHK и при-
мерно 30 белков. Остальные три рибо-
сомные PHK - 5S, 5,8S и 28S - локализованы
в 60S-субчастице, в которую входит также
примерно 45 белков.
Стадии трансляции - инициация, элонга-
ция и терминация - в основном сходны у эу-
кариот и прокариот. Однако в некоторых
частностях механизмы реакции различают-
ся. Так, эукариоты используют для инициа-
ции особую тРНК (она называется
mPHKiMet ), но она у них не формилируется.
Эукариоты и прокариоты различаются так-
же по чувствительности к некоторым инги-
биторам трансляции. Циклогексимид инги-
бирует элонгацию только у эукариот, тогда
Рис. 29.34. Схема организации овальбу- как эритромицин блокирует эту же стадию
миновой мРНК курицы. только у прокариот. Любопытно отметить,
что рибосомы митохондрий и хлоропластов
имеют больше общего с бактериальными ри-
босомами, чем с рибосомами окружающего
их цитозоля. Кроме того, в митохондриях
и хлоропластах используется формилиро-
ванная инициаторная тРНК, а их рибосомы
чувствительны к большинству ингибиторов,
избирательно блокирующих трансляцию
у прокариот.

Рис. 29.36. Структура циклогексимида -


ингибитора стадии элонгации
Рис. 29.35. Электронная микрофотогра- синтеза белка у эукариот, но не
фия эукариотических 80S рибо- у прокариот.
сом. (Печатается с любезного
разрешения д-ра Miloslav 29. Хромосомы и выражение
Boublik.) генов у эукариот 153
29.26. Талассемия - генетически обуслов- гаплоидный геном приходится два тесно
ленное нарушение синтеза сцепленных α-гена глобина. Эти гены у всех
гемоглобина людей, за исключением редких мутантов,
Изучение гемоглобина внесло большой по-видимому, идентичны. Другие гены
вклад в наши представления о структуре глобина сгруппированы в кластеры в другой
и функции белка (гл. 4 и 5). Точно так же ис- хромосоме в следующем порядке:
следования, посвященные генам гемогло- Gγ-Aγ-δ-β (рис. 29.37). Интересно было
бина и их выражению, оказались важным бы выяснить, почему эти функционально
источником данных о функционировании родственные гены расположены рядом друг
эукариотических генов. В процессе внутри- с другом в одной хромосоме. Вполне воз-
утробного развития происходит замена эм- можно, что для переключения экспрессии
бриональных гемоглобинов гемоглобином с γ-генов на δ- и β-гены в ходе развития не-
плода (HbF, α2γ2), а затем гемоглобином обходимо, чтобы они соседствовали. Не ис-
взрослого типа (НbА, α2β2). Кроме того, во ключено также, что сцепление этих генов от-
взрослом организме образуется небольшое ражает историю их эволюции. По всей
количество гемоглобина НbА 2 , субъединич- вероятности, γ-, δ- и β-гены имеют общего
ная структура которого α 2 δ 2 . Напомним, предка, который подвергся тандемным ду-
что HbF имеет более высокое сродство пликациям и затем дивергировал.
к кислороду, чем НbА, так как он менее Талассемии - группа наследственных ане-
прочно связывает бисфосфоглицерат (разд. мий, при которых скорость синтеза одной из
4.7). Это повышенное сродство к кислороду цепей гемоглобина понижена. Название бо-
благоприятствует его переносу из кровенос- лезни «талассемия» происходит от греческо-
ной системы матери в кровеносную систему го слова, обозначающего «море», так как
плода. В действительности HbF предста- болезнь широко распространена у выходцев
вляет собой смесь двух разновидностей, од- из Средиземноморья. Большая и малая та-
на из которых содержит в положении 136 лассемии наблюдаются у гомозиготных
γ-цепи глицин, а другая - аланин. Эти разно- и гетерозиготных больных соответственно.
видности обозначаются Gγ и Aγ соответ- Буквенное обозначение α или β указывает,
ственно. какая цепь синтезируется с пониженной ско-
Все гены гемоглобина картированы. На ростью. В настоящее время в результате
изучения глобиновой мРНК и клонирован-
ной глобиновой ДНК начинает проясняться
причина этих заболеваний. Установлены
молекулярные механизмы некоторых видов
талассемий.
1. Делеция гена. При некоторых видах
α-талассемий делетированы один или оба
α-глобиновых гена.
2. Нестабильность мРНК. В гемоглобине
Constant Spring α-цепь содержит 172 остатка
вместо 141 из-за мутации, приводящей к за-
мене стоп-кодона UAA в кодон глутамина
САА. Трансляция участка, который в норме
не является кодирующим, каким-то обра-
зом делает мутантную мРНК чувствитель-
ной к действию нуклеаз.
3. Нарушение инициации цепей. При неко-
торых видах β-талассемии инициирование
трансляции происходит слишком медленно,
что, возможно, объясняется дефектом
в 5'-нетранслируемой области.
Рис. 29.37. Карта генов γ-, δ- и β-глобина 4. Преждевременная терминация цепи.
человека. Один из видов β-талассемии возникает в ре-
зультате замены одного основания в кодоне
Часть IV. лизина AAG, приводящей к образованию
154 Информация стоп-кодона UAG в 17-м положении.
Рис. 29.38. Каскад фосфорилирования, нию инициации синтеза белка. Каким же
инактивирующий фактор ини- образом гем регулирует активность этой
циации eIF-2. киназы? Действие это опосредуется еще
одной киназой (рис. 29.38). Киназа eIF-2,
модифицирующая фактор инициации, сама
существует в двух формах - неактивной де-
5. Пониженное образование мРНК. При фосфорилированной и активной фосфори-
многих видах β-талассемии, как оказалось, лированной. Фосфорилирование киназы
ген β-глобина имеется, но β-глобиновой eIF-2 катализируется зависимой от цикличе-
мРНК образуется очень мало. В настоящее ского AMP киназой, состоящей из двух ти-
время причина этого явления интенсивно пов субъединиц - двух регуляторных (R)
изучается. Не исключена возможность, что и двух каталитических (С). Неактивный ком-
при некоторых видах β-талассемии не про- плекс R 2 C диссоциирует под действием ци-
исходит правильного вырезания вставочных клического AMP на две каталитически ак-
последовательностей1. тивные С-субъединицы и две R-субъеди-
ницы. Гем блокирует процесс диссоциации.
29.27. Трансляция регулируется каскадом и как следствие этого активации двух киназ
протеинкиназ, инактивирующим один из фак- регуляторной системы не происходит. В ре-
торов инициации зультате фактор eIF-2 не фосфорилируется
В экстрактах ретикулоцитов происходит и сохраняет свою активность в инициации
с высокой скоростью синтез субъединиц ге- белкового синтеза. Этот каскад протеинки-
моглобина до тех пор, пока не иссякает гем. наз напоминает регуляцию метаболизма
В отсутствие гема синтез белка останавли- гликогена (разд. 16.15). Эти процессы имеют
вается из-за быстрого образования фермен- еще и то общее, что в обоих случаях регуля-
тативного ингибитора белкового синтеза. торное действие этих киназ обращается спе-
Этим ингибитором является протеинкиназа. цифическими фосфатазами.
Мишенью для киназы служит eIF-2 - фактор
инициации, связывающий GTP и доста- 29.28. Дифтерийный токсин блокирует
вляющий Met-тРНКf к 40S-субчастице синтез белка у эукариот, ингибируя
рибосомы2. Инактивация eIF-2 в результате транслокацию
фосфорилирования приводит к блокирова- До появления эффективной иммунизации
1
В случае так называемой β+-талассемии это дифтерия была основной причиной детской
оказалось именно так, причем единственное от- смертности. Летальное действие этой болез-
личие мутантного гена от гена дикого типа-за- ни обусловлено главным образом токсином
мена одного-единственного нуклеотида в интро- Corynebacterium diphteriae - бактерии, разви-
не.
2
- Прим. перев. вающейся в верхних дыхательных путях.
Каскадный механизм регуляции, описанный
автором и предложенный в лаборатории Очоа, Структурный ген токсина локализован в ли-
оказался ошибочным. Хотя сАМР-зависимая зогенизирующем фаге, который содержат
протеинкиназа фосфорилирует многие белки. некоторые штаммы С. diphteriae. Несколько
она не затрагивает eIF-2 и никак не влияет на
активность протеинкиназы в физиологических
условиях. [Hunt Т., Phil. Trans. R. Soc. Lond., 29. Хромосомы и выражение
В 302. 127-134 (1983).] - Прим. перев. генов у эукариот 155
микрограммов этого токсина с массой 61 29.29. Рибосомы, связанные с эндоплаз-
кДа обычно представляют собой летальную матическим ретикулумом, синтезируют
дозу для неиммунизированного человека, секреторные и мембранные
так как этой дозы достаточно для ингибиро- белки
вания синтеза белка. Дифтерийный токсин В эукариотических клетках некоторые рибо-
блокирует стадию элонгации синтеза белка сомы свободно плавают в цитозоле, тогда
у эукариот, инактивируя фактор элонгации, как другие связаны с обширной системой
необходимый для транслокации. Этот фак- мембран - эндоплазматическим ретикулу-
тор, называемый фактором элонгации мом (ЭР). Участки ЭР, связанные с рибосо-
2 (EF-2) или транслоказой, выполняет у эу- мами, называются шероховатым ЭР, так
кариот роль, аналогичную EF-G у бактерий. как на электронных микрофотографиях он
Транслоказа необходима для GTP-зависи- покрыт бугорками (рис. 29.39), в отличие от
мого перемещения пептидил-тРНК из гладкого ЭР, не содержащего рибосом.
А-участка в Р-участок и одновременного Клетки, секретирующие большое количе-
перемещения информационной РНК сразу ство белка, например ацинарные клетки
после образования пептидной связи. Осо- поджелудочной железы, имеют сильно раз-
бенно интересен механизм инактивации витый шероховатый ЭР. В общем все из-
транслоказы дифтерийным токсином. Ток- вестные секреторные белки синтезируются
син катализирует ковалентную модифика- связанными с ЭР рибосомами. Кроме того,
цию транслоказы. При этом NAD + служит рибосомы, связанные с этой мембранной си-
донором остатка аденозиндифосфатрибозы стемой, синтезируют многие белки клеточ-
ной мембраны и таких органелл, как лизо-
сомы.
Связанные с мембранами рибосомы в оо-
цитах ящериц, впавших в зимнюю спячку,
образуют кристаллические слои (рис. 29.40).
Эти упорядоченные слои изучаются в на-
стоящее время методами реконструкции
трехмерного изображения. На карте низко-
го разрешения видно, что и большая (60S),
и малая (40S) субчастицы лежат вблизи по-
верхности мембраны. На большой субча-
(ADPR); в результате реакции высвобо-
ждается никотинамид.
Молекула дифтерийного токсина состоит
из двух частей. Ее можно расщепить на два
фрагмента - с массой 21 кДа (фрагмент А)
и 40 кДа (фрагмент В). Домен В связывается
с поверхностью чувствительных клеток,
а домен А катализирует ADP-рибозилирова-
ние транслоказы. Точнее, домен В связы-
вается с ганглиозидом GM1 плазматической
мембраны, что позволяет каталитическому
домену проникнуть в клетку. При этом свя-
занный токсин расщепляется, так что фраг-
мент В остается на поверхности клетки,
а гидрофильный фрагмент А переносится
в цитозоль. Интересно отметить, что мно-
гие другие токсины, например холерный
токсин (разд. 35.7), также состоят из домена,
предназначенного для связывания с поверх-
ностью клетки, и каталитического домена,
который инактивирует какой-либо важный Рис. 29.39. Электронная микрофотогра-
компонент клетки. фия шероховатого эндоплаз-
матического ретикулума. (Пе-
Часть IV. чатается с любезного разреше-
156 Информация ния д-ра George Palade.)
стице имеется выступ, вдающийся в мем-
брану (рис. 29.41). Шероховатый ЭР (в
отличие от гладкого ЭР) содержит два
трансмембранных белка, называемых рибо-
форинами, которые специфически взаимо-
действуют с большой рибосомной субчасти-
цей.
В связи с синтезом и дальнейшей судьбой
белков, образованных на рибосомах ЭР,
возникают три основных вопроса.
1. Существует ли два класса рибосом -
свободные рибосомы цитозоля и связанные
с мембранами рибосомы - или все рибосомы
по сути одинаковы? Если существует только
один класс рибосом, чем определяется,
остается ли данная рибосома свободной или
связывается с шероховатым ЭР?
2. Каким образом новообразованная поли-
Рис. 29.40. Электронная микрофотогра- пептидная цепь, выходящая из связанной
фия кристаллических слоев, с мембраной рибосомы, преодолевает барьер
связанных с мембранами рибо- проницаемости шероховатого ЭР? Напри-
сом в ооцитах ящериц, впав- мер, такие секреторные белки, как профер-
ших в зимнюю спячку. (Печа- менты поджелудочного сока (разд. 8.1),
тается с любезного разрешения вскоре после синтеза обнаруживаются в по-
д-ра Nigel Unwin.) лости ЭР.
3. Чем определяется судьба белка, синте-
зированного на связанной с мембраной рибо-
соме? Некоторые из этих белков экспорти-
руются из клетки, тогда как другие предназ-
начены для органелл внутри клетки. Кроме
того, белки синтезированные шероховатым
ЭР, обнаруживаются в качестве составной
части плазматической и внутриклеточных
мембран.

29.30. Сигнальные последовательности


позволяют секреторным белкам проходить
через мембрану эндоплазматического
ретикулума
Исследования белоксинтезирующей актив-
ности рибосом в бесклеточных системах да-
ли ответ на первый вопрос. Выделяли сво-
бодные рибосомы из цитозоля и добавляли
их к препарату мембран шероховатого ЭР,
с которых были удалены рибосомы. Эта ре-
конструированная система в присутствии
соответствующих мРНК и других раство-
Рис. 29.41. Связанная с мембраной рибо- римых факторов активно синтезировала се-
сома. Это изображение низко- креторные белки. Точно так же рибосомы,
го разрешения получено мето- полученные из препарата шероховатого ЭР,
дом реконструкции на основе проявляли нормальную активность при син-
анализа ряда электронных тезе белков, которые остаются в цитозоле.
микрофотографий упорядо- Кроме того, никаких структурных различий
ченных рибосом, сделанных между свободными рибосомами и рибосо-
под различными углами. (По
схеме, любезно предоставлен- 29. Хромосомы и выражение
ной д-ром Nigel Unwin.) генов у эукариот 157
Рис. 29.42. Гипотеза сигнальной последо- шла подтверждение в работах Сезара Мил-
вательности, образующейся стайна и Джорджа Браунли (Cesar Milstein,
при биосинтезе секреторных George Brownlee), показавших, что иммуно-
и мембранных белков. Соглас- глобулиновая цепь, синтезированная in vitro
но этой гипотезе, N-концевая свободными рибосомами, содержит N-кон-
последовательность новообра- цевую последовательность из 20 остатков,
зованной полипептидной цепи которой нет в зрелом белке, синтезирован-
(показана красным) привязы- ном in vivo. Затем Блобел обнаружил, что
вает рибосому к мембране ЭР. все основные секреторные белки поджелу-
Затем сигнальная последова- дочной железы, синтезированные in vitro на
тельность удаляется пептида- свободных рибосомах, содержат на N-конце
зой, расположенной на вну- дополнительные фрагменты длиной около
тренней стороне ЭР. (Blobel G. двадцати аминокислот. В настоящее время
In: International Cell Biology, сигнальные последовательности многих се-
Brinkley B. R., Porter K. R., eds., креторных белков расшифрованы. Они
Rockefeller Univ. Press, N. Y., имеют длину от 15 до 30 остатков и содер-
1977, p. 318.) жат много неполярных аминокислот
(рис. 29.43).
Гидрофобные сигнальные последователь-
ности, видимо, принимают конформации,
мами, полученными из шероховатого ЭР, не
которые узнаются белками мембраны ЭР,
обнаруживалось. Следовательно, связанные образующими каналы. По всей вероятно-
с мембранами рибосомы и свободные рибо-
сомы, по сути, одинаковы. Остается ли дан-
ная рибосома свободной или прикрепляется
к шероховатому ЭР, определяется только
природой белка, который она синтезирует.
Какая же особенность синтезирующегося
белка определяет, плавает ли ассоциирован-
ная с ним рибосома свободно в цитозоле
или связывается с мембраной ЭР? В 1970 г.
Дэвид Сабатини и Гюнтер Блобел (David
Sabatini, Gunter Blobel) постулировали, что
сигналом прикрепления служит последова-
тельность аминокислотных остатков, при-
легающая к N-концу новообразующейся по- Рис. 29.43. Сигнальные последовательно-
липептидной цепи. Вскоре эта гипотеза сиг- сти двух секреторных белков.
нальной последовательности (рис. 29.42) на- Гидрофобные остатки отме-
чены желтым. Место расще-
Часть IV. пления указано красной чер-
158 Информация той.
Сокращения, принятые для обозначения сахаров:
Fuc - фукоза
Gal - галактоза
Glc - глюкоза
GlcNAc - N-ацетилглюкозамин
Маn - манноза
NAN - N-ацетилнейраминидат (сиаловая кислота)

сти, новообразующиеся полипептидные цепи степени предопределять судьбу гликопроте-


активно протягиваются через канал в ЭР по ина. Обычно гликопротеин содержит одну
мере синтеза. Затем особая пептидаза отше- или несколько олигосахаридных групп, при-
пляет сигнальные последовательности на соединенных к аспарагиновым боковым це-
внутренней стороне ЭР (см. рис. 29.42). Но- пям N-гликозидными связями. Реже сахара
вообразующиеся цепи, которые должны прикрепляются к сериновым или треони-
стать составной частью мембраны, по-види- новым боковым цепям О-гликозидными
мому, содержат специальные последова- связями. Непосредственно с остатками ас-
тельности, блокирующие перенос полипеп- парагина всегда связан N-ацетилглюкоза-
тида через мембрану ЭР до тех пор, пока мин, тогда как к серину и треонину присое-
синтез не доходит до С-конца. В случае же диняется N-ацетилгалактозамин.
секреторных белков, наоборот, через мем- В гликопротеинах встречаются самые
брану ЭР транспортируется вся полипеп- разнообразные олигосахариды (рис. 29.44).
тидная цепь. Однако в основе этого разнообразия лежит
Главная особенность механизма сиг- общий план строения: углеводные остатки,
нальных последовательностей состоит
в том, что перенос полипептида через мем-
брану ЭР сопряжен с трансляцией. Однако
некоторые белки могут пересекать мембра-
ну уже после того, как их синтез завершен.
Например, белки митохондрий и хлоропла-
стов в большинстве своем кодируются
ядерными генами и синтезируются па сво-
бодных рибосомах. Эти белки выходят в ци-
тозоль и затем проходят через мембрану
органеллы. Очевидно, транспорт этих бел-
ков происходит посттрансляционно, а не во
время трансляции. Интересно отметить, что
эти митохондриальные и хлоропластные
белки, подобно секреторным белкам, содер-
жат N-концевые последовательности, ко-
торые удаляются вскоре после их проникно-
вения через мембрану.

29.31. Присоединение сахарных остатков


«ядра» к гликопротеинам происходит
в эндоплазматическом ретикулуме
при участии донора долихола
Почти ко всем белкам, синтезированным
рибосомами, связанными с ЭР, присоеди-
няются ковалентно связанные углеводные
остатки. Растворимые белки, синтези-
руемые свободными рибосомами в цитозо-
ле, наоборот, почти никогда не связаны
с углеводами. Как уже упоминалось (разд.
10.12), остатки сахара, очевидно, ориенти-
руют гликопротеины в мембранах. Кроме 29. Хромосомы и выражение
того, углеводные группы могут в какой-то генов у эукариот 159
присоединенные к остаткам аспарагина (че- внутренней стороне мембраны ЭР. Перенос-
рез атом азота), имеют общее внутреннее чиком служит долихолфосфат - липид
олигосахаридное «ядро». Этот повторяю- с очень длинной цепью, содержащий около
щийся мотив отражает способ биосинтеза двадцати изопреновых (С5) остатков.
олигосахаридной части гликопротеинов: об- Концевая фосфатная группа этого весьма
щий олигосахаридный блок (рис. 29.45) пере- гидрофобного переносчика - место при-
носится с активирующего липидного перено- крепления активированного олигосахарида.
счика на растущую полипептидную цепь на

Рис. 29.44. Структура олигосахаридного К долихолфосфату присоединяется оли-


остатка, связанного с аспараги- госахаридный блок, состоящий из двух
ном в человеческом иммуно- остатков N-ацетилглюкозамина, девяти
глобулине (А) и в тиреоглобу- манноз и трех глюкоз. Его образование идет
лине свиньи (Б). путем последовательного присоединения
моносахаридов (рис. 29.46).

Рис. 29.45. Структура активированного Активированные доноры сахаров в этих ре-


олигосахаридного «ядра» (по- акциях - производные UDP, GDP и долихо-
казано синим цветом). Перено- ла. Ряд специфических трансфераз катализи-
счик (показан желтым цве- рует синтез активированного олигосахарид-
том) - долихолфосфат (Дх). ного «ядра». Затем оно переносится цели-
ком на определенный остаток аспарагина
Часть IV. растущей полипептидной цепи. Активиро-
160 Информация ванный олигосахарид и специфическая
трансфераза расположены на внутренней
стороне ЭР. Об этом свидетельствует тот
факт, что белки в цитозоле не гликозилиро-
ваны. Олигосахарид может быть присоеди-
нен только к такому аспарагину, который
входит в последовательность Asn-X-Ser или
Asn-X-Thr. В большинстве случаев два из
трех остатков глюкозы присоединенного
олигосахарида быстро удаляются, когда
гликопротеин еще связан с ЭР.
При переносе олигосахарида на белок вы-
свобождается долихолпирофосфат, ко-
торый под действием фосфатазы снова пре-
вращается в долихолфосфат. Это превраще-
ние блокируется антибиотиком бацитраци-
ном (разд. 32.6). Еще один интересный
антибиотик-ингибитор - туникамицин, ги-
дрофобный аналог UDP-N-ацетилглюко-
замина. Туникамицин блокирует первый
этап образования олигосахаридного
«ядра» - присоединение N-ацетилглюкоза-
мина к долихолфосфату.

29.32. Модификация и сортировка


гликопротеинов происходит в аппарате
Гольджи
Белки, находящиеся во внутреннем про-
странстве ЭР и в его мембране, переносятся
в аппарат Гольджи - стопку уплощенных
мембранных мешков (рис. 29.47). В этой ор-
ганелле олигосахаридное «ядро» гликопро-
теинов удаляется и к ним присоединяются
новые сахара. Кроме того, аппарат Гольджи
сортирует и упаковывает гликопротеины
для транспортировки в другие участки клет-
ки. Гликопротеины доставляются из ЭР Рис. 29.46. Активированное олигосаха-
к выпуклой поверхности аппарата Гольджи ридное ядро синтезируется пу-
в пузырьках диаметром 500 А, окруженных тем последовательного при-
оболочкой, покрытой чем-то вроде щетинок соединения отдельных остат-
(рис. 29.48). Эта оболочка представляет со- ков сахаров. Затем весь блок
бой многогранную решетчатую структуру, переносится на боковую цепь
состоящую из субъединиц клатрина массой определенного остатка аспа-
180 кДа (рис. 29.49). Эти так называемые рагина новообразованного
окаймленные пузырьки отпочковываются от белка во внутреннем простран-
ЭР и затем сливаются с аппаратом Гольд- стве ЭР.
жи. Кроме того, они переносят мембранные
белки от вогнутой поверхности аппарата
Гольджи в лизосомы, к плазматической окаймленного пузырька и аппарата Гольд-
мембране и в другие участки клетки. К тому жи соответствует внутренней стороне мем-
же окаймленные пузырьки переносят белки браны ЭР. Когда окаймленные пузырьки
и липиды от плазматической мембраны сливаются с плазматической мембраной, их
к внутренним мембранам. Таким образом, внутренняя поверхность становится наруж-
клатрин играет ключевую роль в переносе ной поверхностью плазматической мем-
фрагментов мембраны в пределах клетки. браны. Следовательно, внутренние поверх-
Важно отметить, что во время этих процес-
сов переноса асимметрия мембран сохра- 29. Хромосомы и выражение
няется. Внутренняя поверхность мембраны генов у эукариот 161
Рис. 29.47. Электронная микрофотогра-
фия (вверху) и схематическое
изображение (внизу) аппарата
Гольджи. В этой органелле Рис. 29.48. Электронная микрофотогра-
происходит модификация, фия окаймленных пузырьков
сортировка и упаковка глико- (вверху). Схема окаймленного
протеинов. (Электронная ми- пузырька. (Печатается с любез-
крофотография печатается ного разрешения д-ра Barbara
с любезного разрешения д-ра Pearse.)
Lynne Mercer.)

ности мембраны ЭР и других органелл


соответствуют наружной поверхности плаз-
матической мембраны (рис. 29.50). По этой
причине углеводные группы гликопротеи-
нов плазматической мембраны всегда рас-
положены на ее наружной поверхности
(разд. 10.12).
В аппарате Гольджи происходит пере-
стройка олигосахаридных групп гликопро-
теинов. Единственная оставшаяся глюкоза
и несколько оставшихся манноз олигосаха-
ридного «ядра» удаляются. На этом форми-
рование углеводных остатков некоторых
гликопротеинов заканчивается. Более Рис. 29.49. Изображение реконструиро-
сложные олигосахариды других гликопро- ванного окаймленного пузырь-
теинов образуются путем последовательно- ка. Оно получено наложением
го присоединения сахаров к остаткам многих электронных микрофо-
тографий. [Woodwart M, Р.,
Часть IV. Roth Т. F., J. Supramol. Struc-
162 Информация ture, 11, 240 (1979).]
Рис. 29.50. Асимметрия клеточных мем- го, чтобы запасаться в лизосомах, они экс-
бран. Внутренние поверхности портируются из клетки. Другими словами.
ЭР и других органелл соответ- при болезни I-клеток целый ряд ферментов
ствуют наружной поверхности локализуется в неправильном месте. Эти
плазматической мембраны. ферменты не содержат маннозо-6-фосфата,
который обычно с ними связан. Следова-
тельно, маннозо-6-фосфат, по всей вероят-
ности, представляет собой маркер, напра-
«ядра». Например, в качестве активиро- вляющий в норме многие гидролитические
ванных доноров при синтезе концевого три- ферменты из аппарата Гольджи в лизосомы.
сахаридного остатка, обнаруженного в не- Интересно выяснить, участвуют ли угле-
которых гликопротеинах, выступают UDP- водные остатки других гликопротеинов
N-ацетилглюкозамин, UDP-галактоза в регуляции внутриклеточных передвиже-
и СМР-нейраминидат (рис. 29.51). Этот по- ний.
следний этап биосинтеза, протекающий
в аппарате Гольджи, получил название Заключение
окончательного гликозилирования - в отли- Эукариотическая хромосома содержит одну
чие от гликозилирования олигосахаридного молекулу двухспиральной ДНК, которая по
«ядра», которое происходит в ЭР. крайней мере в 100 раз длиннее, чем моле-
Как происходит сортировка гликопротеи- кулы ДНК в клетках прокариот. ДНК проч-
нов в аппарате Гольджи? Каким путем они но связана с основными белками, которые
доставляются в места назначения? Ответа называются гистонами. Хроматиновая нить
на эти интригующие вопросы пока нет, но представляет собой гибкую цепь нуклеосом.
ключом к пониманию проблемы может по- «Ядро» этого повторяющегося элемента
служить болезнь I-клеток (ее также назы- (минимальная нуклеосома, кор) содержит
вают муколипидозом II). Это нарушение фрагмент ДНК длиной 140 пар оснований,
функции лизосом наследуется как ауто- накрученный на октамер гистонов, в состав
сомный рецессивный признак и характери- которого входят по две молекулы гистонов
зуется сильной задержкой психомоторного Н2А, Н2В, Н3 и Н4. Минимальные нуклео-
развития и деформацией скелета. Лизосомы сомы соединены между собой линкерной
в соединительных тканях больных содержат ДНК, длина которой обычно составляет 60
крупные включения (название болезни про- пар оснований, связанной с одной молеку-
исходит от англ. inclusion - включение) непе- лой гистона H1. Благодаря нуклеосомам
реваренных гликозаминогликанов и глико- ДНК может укорачиваться в семь раз.
липидов. Наличие этих включений обусло- Это - первый уровень конденсации ДНК.
влено отсутствием в лизосомах больных по Эукариотическая ДНК реплицируется полу-
меньшей мере восьми ферментов, необхо- консервативным путем и наполовину не-
димых для их расщепления. В то же время прерывно (т.е. получает по одной из роди-
огромные количества этих ферментов обна- тельских цепей), причем репликация на-
руживаются в моче и крови больных. Следо-
вательно, синтез активных ферментов при 29. Хромосомы и выражение
болезни I-клеток происходит, но вместо то- генов у эукариот 163
с большим числом повторов (сателлитная
ДНК) обычно расположена вблизи от цен-
тромер. Некоторые сателлитные ДНК пред-
ставляют собой гептануклеотидную после-
4
довательность, повторенную более 10 раз.
Другая фракция ДНК с умеренным числом
повторов. В геноме многих эукариот гены
рибосомных РНК и гистонов присутствуют
в количестве десятков или сотен копий.
Большая часть ДНК с умеренным числом
повторов играет, по-видимому, какую-то
регуляторную роль. Третья фракция - уни-
кальная ДНК. Она состоит из последова-
тельностей, которые встречаются в га-
плоидном геноме только один или несколь-
ко раз. Многие из таких белков, как
фиброин шелка, гемоглобин и овальбумин,
кодируются уникальными генами. Эти гены
дают большие количества стабильной
мРНК. Уникальные последовательности
обычно перемежаются с умеренно повто-
ряющимися последовательностями. Кроме
того, для высших эукариот характерно на-
личие вставочных последовательностей во
многих генах, кодирующих белки.
РНК в эукариотических клетках синтези-
руется тремя типами РНК-полимераз. Пер-
вичные транскрипты претерпевают суще-
ственные изменения, прежде чем они перей-
дут из ядра в цитозоль в виде зрелых
молекул рРНК, тРНК и мРНК. Информа-
ционные РНК получаются из гораздо более
длинных первичных транскриптов (гяРНК)
путем расщепления и воссоединения фраг-
Рис. 29.51. Завершающая стадия синтеза ментов. Эукариотическая информационная
содержащего нейраминидат РНК имеет на 5'-конце «колпачок» и на
углеводного остатка гликопро- 3'-конце обычно длинную роlу(А)-последо-
теина (трансферрина человека). вательность. Единственный транслируемый
Эта реакция происходит в ап- участок мРНК обрамлен некодирующими
парате Гольджи. последовательностями, иногда очень
длинными. Набор мРНК в эукариотической
клетке зависит от избирательного процес-
синга первичных транскриптов, а также от
чинается в нескольких тысячах мест. Боль- скорости транскрипции различных генов.
шое число точек инициации обусловлено Регуляция на уровне трансляции, по-види-
огромной длиной эукариотической ДНК по мому, играет менее важную роль при детер-
сравнению с прокариотической. минировании набора белков, синтези-
Кинетика реассоциации денатурирован- руемых каждой данной клеткой. 80S-рибо-
ной нагреванием ДНК показывает, что эука- сома эукариот состоит из 60S- и 40S-субча-
риотическая ДНК в отличие от прокариоти- стиц. Как и у прокариот, у эукариот имеется
ческой содержит много повторяющихся особая инициаторная тРНК, но она не фор-
последовательностей оснований. ДНК милирована. Инициация у эукариот регули-
руется каскадом протеинкиназ, инактиви-
рующих один из факторов инициации
(eIF-2). Митохондрии и хлоропласты содер-
Часть IV.
жат собственную ДНК, которая не связана
164 Информация
с гистонами. Синтез белка в этих органел-
лах напоминает синтез белка у бактерий.
Секреторные и мембранные белки синте-
зируются рибосомами, связанными с эндо-
плазматическим ретикулумом. Многие из
этих белков содержат сильно гидрофобную
N-концевую последовательность, которая
служит сигналом для прикрепления рибо-
сомы к мембране ЭР. Затем синтезирую-
щаяся полипептидная цепь активно протя-
гивается через мембрану ЭР, а сигнальная
последовательность отщепляется на вну-
тренней стороне. Почти ко всем белкам,
синтезированным на связанных с мембрана-
ми полисомах, ковалентно присоединяется
один или несколько углеводных остатков.
В ЭР происходит перенос универсального
олигосахаридного блока с активированного
донора долихола на специфическую аспара-
гиновую боковую цепь. Гликопротеины
переносятся из ЭР в аппарат Гольджи
в окаймленных пузырьках. Эти пузырьки, Рис. 29.52. Электронная микрофотогра-
покрытые клатрином, участвуют во многих фия окаймленных пузырьков,
процессах обмена между мембранными лежащих на плазматической
структурами. В аппарате Гольджи происхо- мембране клетки. (Печатается
дит укорачивание и окончательное гликози- с любезного разрешения д-ра
лирование олигосахаридных остатков. Кро- John Heuser.)
ме того, здесь гликопротеины сортируются
и отправляются по назначению. Угле-
водные остатки, по-видимому, играют важ-
ную роль в этом процессе сортировки.

РЕКОМЕНДУЕМАЯ McGhee J.D., Felsenfeld G., 1980. Drosophila chromosomes: structure of


ЛИТЕРАТУРА Nucleosome structure, Ann. Rev. replication forks and evidence for
Biochem., 49, 1115-1155. bidirectionality, Proc. Nat. Acad. Sci.,
С чего начать Kornberg R.D., 1977. Structure of 71, 135-139.
Crick F., 1979. Split genes and RNA chromatin, Ann. Rev. Biochem., 46,
splicing, Science, 204, 264-271. Организация генома
931-954.
DeRobertis E.M., Gurdon J.B., 1979. Britten R., Kohn D., 1968. Repeated
Kornberg R.D., 1974. Chromatin struc-
Gene transplantation and the analysis segments of DNA, Sci. Amer., 222(4),
ture: a repeating unit of histones and
of development, Sci. Amer., 241(6), 24-31.
DNA, Science, 184, 868-871.
74-82. Davidson E.H., Britten R.J., 1979.
Sperling R., Wachtel E.J. The histones,
Beerman W., Clever U., 1974. Regulation of gene expression: possible
Advan. Protein Chem., in press.
Chromosomal puffs, Sci. Amer., 210(4), role of repetitive sequences, Science,
50-58. 204, 1052-1059.
Репликация ДНК Long E.O., Dawid I.B., 1980. Repeated
Palade G., 1975. Intracellular aspects of
the process of protein synthesis. Science, Kornberg A., 1980. DNA Replication, genes in eucaryotes, Ann. Rev. Bio-
Freeman. (В гл. 6 идет речь об эука- chem., 49, 727-766.
189, 347-358. (Доступная и весьма ин-
формативная Нобелевская лекция.) риотической ДНК-полимеразе и о ре- Schimke R.Т., Kaufman R.J., Alt F.W.,
пликации у эукариот.) Kellems R.F., 1978. Gene amplification
Rothman J.E., Lodish H.F., 1979. The
DePamphilis M.L., Wassarman P.M., and drug resistance in cultured murine
assembly of cell membranes, Sci. Amer.,
1980. Replication of eucaryotic cells, Science, 202, 1051-1055.
240(1), 48-63. (Превосходное обсу-
ждение проблемы асимметрии мем- chromosomes: a close-up of the Kedes L.H., 1979. Histone genes and
replication fork, Ann. Rev. Biochem., 49, histone messengers, Ann. Rev. Bio-
бран.)
627-666. chem., 48, 837-870.
Хроматин Kriegstein H.J., Hogness D.S., 1974. Tzagoloff A., Macino G., Sebald W.,
The mechanism of DNA replication in 1979. Mitochondrial genes and
Cold Spring harbor Symposia, 1978.
Chromatin, Cold Spring Harbor
Symposia on Quantitative Biology, 29. Хромосомы и выражение
vol. 42. генов у эукариот 165
translation products, Ann. Rev. Bio- Revel M., Groner Y., 1978. Post- hypothesis and beyond, Symp. Soc. Exp.
chem., 48, 419-441. transcriptional and translational Biol., 33, 9-36.
controls of gene expression in Unwin P. N. Т., 1977. Three-
Разорванные гены, транскрипция eukaryotes, Ann. Rev. Biochem., 47, dimensional model of membrane-bound
н процессннг РНК 1079-1126. ribosomes obtained by electron
Darnell J.E., Jr., 1979. Transcription Parrenheimer A.M., Jr., 1977. Diph- microscopy, Nature, 269, 118-122.
units for mRNA production in theria toxin, Ann. Rev. Biochem., 46, Rothman J . E . , Lodish H.F., 1977.
eukaryotic cells and their DNA viruses, 69-94. Synchronised transmembrane insertion
Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol., 22, and glycosylation of a nascent
327-353. Гены гемоглобина и талассемия membrane protein. Nature 269,
Abelson J., 1979. RNA processing and Weatherall D.J., Clegg J.B., 1979. 775-780.
the intervening sequence problem, Ann, Recent developments in the molecular Waechter С.J., Lennartz W.J., 1976.
Rev. Biochem., 48, 1035-1069. genetics of human hemoglobin, Cell, 12, The role of polyprenol-linked sugars in
Royal A., Garapin A., Cami В., 467-479, glycoprotein synthesis, Ann, Rev.
Perrin F., Mandel J.L., LeMeur M., Leder A., Miller H.I., Hamer D.H., Biochem., 45, 95-112.
Bregegegre F., Gannon F., LePen- Seidman J.G., Norman B., Sullivan M., Kornfeld R., Kornfeld S., 1976.
nec J.P., Chambon P., Kourilsky P., Leder P., 1978. Comparison of cloned Comparative aspects of glycoprotein
1979, The ovalbumin gene region: mouse α- and β-globin genes: structure, Ann, Rev, Biochem., 45,
common features in the organisation of conservation of intervening sequence 217-237.
three genes expressed in chicken oviduct locations and extragenic homology, Robbins P.W., Hubbard S.C., Turco
under hormonal control, Nature, 279, Proc. Nat, Acad. Sci., 75, 6187-6191. S.J., Winh D . F . , 1977. Proposal for
438-445. Weatherall D.J., 1978. The a common oligosaccharide intermediate
DeRobertis E.M., Olson M.V., 1979. thalassemias. In: Stanbury J.В., in the synthesis of membrane
Transcription and processing of cloned Wyngaarden J.B. and Fredrickson D.S. glycoproteins, Cell, 12, 893-900,
yeast tyrosine tRNA genes (eds.), The Metabolic Basis of Inherited Pearse B.M.F., 1980, Coated vesicles,
microinjected into frog oocytes, Nature, Disease (4th ed.), pp. 1508-1523, Trends Biochem, Sci., 5, 131-134,
278, 137 143. McGraw-Hill (Краткий обзор о структуре и функ-
Shatkin A.J., 1976. Capping of ции клатрина.)
cucaryotic mRNAs, Cell, 9, 645 653. Синтез мембранных белков и секрети- Rothman J.E., Fine R.E., 1980. Coated
руемые белки vesicles transport newly synthesized
Трансляция Blobel G., Walter P., Chang G.N., membrane glycoproteins from
Wool I.G., 1979, Structure and function Goldman B.M., Erickson A . H . , Lin- endoplasmic reticulum to plasma
of eukaryotic ribosomes, Ann. Rev, gappa V.R., 1979. Translocation of membrane in two successive stages,
Biochem., 48, 719-754. proteins across membranes; the signal Proc. Nat. Acad, Sci., 77, 780-784
ГЛАВА 30 весьма привлекательной моделью. Во-
вторых, вирусы - источник представлений
Вирусы об эволюционных процессах и молекулярных
аспектах взаимоотношений хозяин-пара-
Вирусы представляют собой инфекционные
нуклеиновые кислоты, упакованные в за- зит. В третьих, некоторые вирусы вызывают
у экспериментальных животных рак. Ин-
щитную оболочку. Это - наиболее эффек-
тенсивно изучается и возможная роль виру-
тивные из внутриклеточных паразитов.
сов в раковых заболеваниях человека.
В отличие от клеток вирусы не способны вы-
рабатывать энергию с помощью метаболи- 30.1 Оболочка мелких вирусов состоит из
ческих реакций или синтезировать белки. множества идентичных белковых субъединиц
Они отличаются от клеток и тем, что содер- Общее число аминокислот в оболочке виру-
жат только ДНК или только РНК, но никог- са всегда превосходит число нуклеотидов
да не содержат и то и другое одновременно. в его геноме. Например, белковая оболочка
Одни вирусы содержат одноцепочечную ну-
клеиновую кислоту, другие - двухцепочеч-
ную. По сложности строения вирусы широ- Таблица 30.1. Типы вирусов (Davis В.D., Eisen H.N.,
ко варьируют - от фага Qβ - PHK-содержа- Ginsberg H.S., Wood W.B., Jr., Microbiology, Harper and
Row., 1973)
щего фага, имеющего всего 4 гена,- до
вируса оспы, геном которого насчитывает
Нуклеиновая Представитель При-
примерно 250 генов. Готовый внеклеточный кислота мерное
продукт размножения вируса называется ви- число
рионом (или вирусной частицей). Нуклеино- генов
вая кислота, входящая в состав вариона,
одета белковым капсидом, защищающим ее Одноцепочечная Фаг φХ174 5
днк
от ферментативного расщепления и механи-
ческих повреждений. Именно капсид обеспе- Двухцепочечная Вирус полиомы 6
чивает внедрение нуклеиновой кислоты днк
в клетки чувствительной клетки-хозяина. Аденовирус 2 30
У некоторых более сложно устроенных ви- Фаг Т4 150
русов животных капсид окружен оболочкой, Вирус коровьей ос- 240
содержащей липид и гликопротеин. пы
Мы уже видели, что изучение вирусов ока- Однопепочечная Фаг Qβ 3
зало глубокое воздействие на развитие мо- РНК Вирус саркомы Рау- 4
лекулярной биологии. В качестве примера са
можно привести открытие информационной Вирус табачной мо- 6
РНК. Неослабевающий интерес исследова- заики
Вирус полиомиели- 8
телей к вирусам объясняется несколькими
та
причинами. Во-первых, размножение виру-
Вирус гриппа 12
са - модель развития клетки, так как оно со-
провождается последовательным выраже- Двухцепочечная Реовирус 22
РНК
нием генов и сборкой макромолекул
в весьма упорядоченные структуры. Отно-
сительно небольшое число вирусных генов,
высокая скорость репликации и легкость ге-
нетического анализа также делают вирусы 30. Вирусы 167
видов. Например, оболочка ВТМ состоит из
2130 идентичных субъединиц (каждая дли-
ной 158 остатков).
Число способов построения вирусной
оболочки из идентичных субъединиц весьма
ограниченно. Стабильность достигается пу-
тем образования максимального числа свя-
зей и использования одинаковых контактов
между субъединицами. Образующаяся
структура должна быть симметричной. На-
иболее вероятны два способа укладки бел-
ковой оболочки: цилиндрическая оболочка,
обладающая спиральной симметрией, и сфе-
рическая оболочка, обладающая икосаэдри-
ческой симметрией (рис. 30.3). По существу,
все мелкие вирусы представляют собой па-
лочки или сферические частицы (или сочета-
ние этих двух форм). Правила, определяю-
щие структуру сферических вирусов, сфор-
мулировали Дональд Каспар и Арон Круг
(Donald Caspar, Aaron Klug). Толчком для
вдохновения им послужили архитектурные
проекты Бакминстера Фуллера (Buckminster
Fuller).

30.2. Самосборка вируса табачной мозаики


(ВТМ)
Самый простой и лучше всего изученный
Рис. 30.1. Электронная микрофотогра-
процесс сборки вируса - сборка ВТМ. Этот
фия вирионов Т4 в зараженных
клетках. (Печатается с любез-
ного разрешения д-ра Jonathan
King, д-ра Yoshiko Kikuchi
и д-ра Elaine Lenk.)

одной частицы вируса табачной мозаики


(ВТМ; рис. 30.2) содержит около 340000
аминокислотных остатков, а его РНК - все-
го 6400 нуклеотидов. В 1957 г. Френсис Крик
и Джеймс Уотсон (Francis Crick, James
Watson) обратили внимание на то, что бел-
ковая оболочка вируса не может состоять из
одной большой молекулы или набора мно-
жества различных мелких белков, так как
количество вирусной нуклеиновой кислоты
слишком мало, чтобы кодировать такое
огромное число аминокислотных остатков.
С другой стороны, белковую оболочку нель-
зя уменьшить в размере, так как она должна
закрывать всю нуклеиновую кислоту. Ви-
русы решают эту задачу генетической бед-
ности, образуя оболочку из большого числа Рис. 30.2. Электронная микрофотогра-
белковых субъединиц одного или нескольких фия частицы вируса табачной
мозаики (ВТМ). (Печатается
Часть IV. с любезного разрешения д-ра
168 Информация Robley Williams.)
спирали, и таким образом стабилизируется,
к гибкой молекуле РНК должно присоеди-
ниться примерно 17 субъединиц оболочки.
Эта проблема может быть решена присое-
динением к РНК сразу целого комплекса из
многих субъединиц. Действительно, белок
оболочки легко образует двухслойный диск
из 34 субъединиц. Каждый слой диска пред-
ставляет собой кольцо из 17 субъединиц;
примерно столько субъединиц (16 1 / 3 ) при-
ходится на один оборот спирали ВТМ. Клуг
и его сотрудники исследовали трехмерную
структуру диска (рис. 30.5) и показали, что
Рис. 30.3. Модель икосаэдра. он представляет собой главный промежу-
точный продукт при сборке ВТМ. Важней-
шее свойство диска состоит в том, что его
палочковидный вирус имеет длину 3000 А,
субъединицы скользят относительно друг
диаметр 180 А (рис. 30.4) и массу примерно
друга и образуют спираль их двух оборотов,
40000 кДа. 2130 идентичных субъединиц так называемую «запорную шайбу»
белка оболочки плотно упакованы в спи-
(рис. 30.6).
раль вокруг одноцепочечной РНК, содержа-
Диск гораздо быстрее взаимодействует
щей 6390 нуклеотидов. РНК глубоко погру-
с РНК ВТМ, чем с чужеродной ДНК. Следо-
жена в белок, что делает ее неуязвимой для
вательно, РНК ВТМ, по-видимому, содер-
рибонуклеаз. Каждая белковая субъединица
жит последовательность оснований, кото-
взаимодействует с тремя нуклеотидами. От-
рую специфически узнает диск и которая
делившись от белкового капсида, РНК весь-
ма лабильна, тогда как интактный ВТМ со-
храняет инфекционность десятилетиями.
Субъединицы ВТМ не связаны между со-
бой ковалентно. Можно вызвать диссоциа-
цию ВТМ на белок и РНК с помощью, на-
пример, концентрированной уксусной кис-
лоты. В 1955 г. Хайнц Френкель-Конрат
и Робли Уильяме (Heinz Fraenkel-Conrat,
Robley Williams) показали, что в соответ-
ствующих условиях диссоциированные субъе-
диницы оболочки и РНК ВТМ спонтанно ре-
ассоциируют и образуют вирусные частицы,
неотличимые от исходного ВТМ по струк-
туре и инфекционности. Это был первый
пример самосборки активной биологиче-
ской структуры. Процесс самосборки - это
такой процесс, при котором в подходящих
условиях среды происходит спонтанная ас-
социация компонентов и образуется специ-
фическая структура.

30.3. При сборке вирусной частицы ВТМ


белковые диски присоединяются Рис. 30.4. Модель части ВТМ, на которой
к петле РНК показана спиральная укладка
A priori простейший механизм сборки ВТМ белковых субъединиц вокруг
заключался бы в ступенчатом присоедине- одноцепочечной молекулы
нии отдельных белковых субъединиц РНК. [Klug A., Caspar D. L. D.,
к РНК. Трудность, однако, состоит в этом Advan. Virus Res., 7, 274 (1960).]
случае в том, что скорость нуклеации будет
чрезвычайно мала. Прежде чем комплекс за-
мкнется сам на себя, образовав один оборот 30. Вирусы 169
Рис. 30.5. Карта электронной плотности субьединиц оболочки вируса - одна субъе-
белкового диска ВТМ. Показан диница на три нуклеотида. Следовательно,
слой толщиной 6 А. (Печатает- по всей вероятности, петля связывается
ся с любезного разрешения с первым диском, и с этого начинается сбор-
д-ра Aaron Klug.) ка вирусной частицы.
Неожиданно оказалось, что петля инициа-
ции расположена далеко от обоих концов
инициирует сборку. Эта область инициации РНК. Точка начала сборки расположена на
была выделена следующим образом. расстоянии 5300 нуклеотидов от 5'-конца
К РНК ВТМ добавляли несколько дисков, и примерно 1000 нуклеотидов от 3'-конца
чтобы покрыть область инициации, и затем РНК. Другой неожиданностью было то, что
расщепляли остальную РНК нуклеазой. За- оба конца РНК выходят с одной и той же
щищенный фрагмент содержит примерно 65 стороны растущей частицы ВТМ (рис. 30.8).
нуклеотидов, которые прочно и специфично Длина 3'-конца на протяжении процесса
связываются с дисками. Последователь- сборки остается более или менее постоян-
ность оснований в этой области инициации
дает все основания думать, что этот фраг-
мент РНК образует структуру шпильки со
стеблем, состоящим из спаренных основа-
ний, и петлей (рис. 30.7). Самое интересное.
что петля содержит в каждом третьем поло-
жении G. Такое расположение оснований
в триплетах соответствует стехиометрии Рис. 30.6. Схема превращения белкового
диска ВТМ в спиральную фор-
Часть IV. му «запорной шайбы». [Klug
170 Информация A., Fed. Ргос., 31, 40 (1972).]
ной, а 5'-конец по мере удлинения вирусной
частицы становится короче.
Наиболее вероятная модель образования
частиц проиллюстрирована на рис. 30.9.
Сборка начинается с проникновения петли
инициации в центральное отверстие двух-
слойного белкового диска. Петля связы-
вается с первым оборотом диска, и приле-
гающий стебель, состоящий из спаренных
оснований, раскрывается. Это взаимодей-
ствие переводит диск в форму спиральной
запорной шайбы, и диск захватывает РНК.
Так начинается построение спирали вируса.
Затем к новообразованной петле РНК, тор-
чащей из центрального отверстия, присое-
диняется еще один диск. Благодаря прота-
скиванию 5'-конца через центральное отвер-
стие растущей вирусной частицы при доба-
влении каждого следующего диска обра-
зуется новая петля. Наконец, происходит
одевание 3'-конца каким-то пока непо-
нятным способом.
Помимо того что двухслойный диск обес-
печивает быструю нуклеацию, он суще-
ственно увеличивает специфичность образо-
вания оболочки. Диск может связываться со Рис. 30.7. Участок РНК ВТМ, обеспечи-
многими нуклеотидами, тогда как одна вающий инициирование сбор-
субъединица - только с тремя. Следователь- ки вирусной частицы ВТМ.
но, диск обладает гораздо более высокой из-
бирательностью по отношению к РНК
ВТМ по сравнению с мРНК клетки-хозяина,
чем одна субъединица. Еще одно важное
свойство дисков состоит в том, что в физио-
логических условиях они не образуют спи-
ралей без РНК. В этом отношении важней-
шую роль играют две карбоксильные
группы в каждой субъединице. При ней-
тральном значении рН в спиральной форме
ионизированы обе карбоксильные группы,
а в диске - только одна. Электростатическое
отталкивание между близко расположенны-
ми карбоксилат-ионами в спиральной фор-
ме благоприятствует образованию диска.
Связывание РНК со спиральной формой со-
провождается достаточным изменением
свободной энергии, чтобы преодолеть элек-
тростатическое отталкивание карбокси- Рис. 30.8. Электронная микрофотогра-
латных ионов. Итак, карбоксилат- фия частично реконструиро-
ионы - негативный регулятор, препятствую- ванных частиц ВТМ. Видны
щий образованию спирали без РНК. два хвоста РНК, отходящие от
каждого растущего вириона.
30.4. Заражение фагом Т4 полностью [Lebeurier G., Nicholaeff A.,
перестраивает синтез макромолекул Richards К. Е., Ргос. Nat. Acad.
в клетке E.coli Sci. USA, 74, 150 (1977).]
Бактериофаг Т4 - гораздо более сложный
вирус, чем ВТМ. Его двухспиральная ДНК
содержит примерно 165 генов по сравнению 30. Вирусы 171
Рис. 30.9. Схема сборки ВТМ. А- чехол подтягивает головку фага к базальной
область инициации в РНК пластинке и нитям отростка, и в результате
образует петлю и проходит центральный стержень проникает через кле-
в центральное отверстие белко- точную стенку, но не через мембрану клет-
вого диска. Б - диск переходит ки. Затем обнаженная фаговая ДНК прони-
в спиральную форму «запор- кает через клеточную мембрану. По истече-
ной шайбы». В - к тому концу нии несколько минут все реакции синтеза
РНК, где расположена петля, клеточных Д Н К , РНК и белка останавли-
присоединяются новые диски. ваются и начинается синтез вирусных ма-
Г - одна из концов РНК все кромолекул. Другими словами, заразивший
время протаскивается через клетку вирус овладевает синтетическими
центральное отверстие и взаи- механизмами бактериальной клетки и заме-
модействует с новыми диска- щает ее гены своими.
ми. Д - схематическое изобра- В ДНК фага Т4 имеется три группы генов,
жение молекулы РНК в частич- которые транскрибируются на различных
но собранном вирусе. Напра- стадиях заражения: предранние, ранние и по-
вление движения РНК, обозна-
чено стрелкой. (Butler P. J.G.,
Klug A., Sci.Amer., 1978.)

с 6 генами ВТМ. Однако структура, размно-


жение и процесс сборки фага Т4 изучены до-
вольно хорошо, так как он подвергался ин-
тенсивному генетическому и биохимическо-
му анализу. Вирион Т4 состоит из головки.
отростка и шести нитей (фибрилл) отрост-
ка (рис. 30.10). Его молекула ДНК плотно
упакована внутри икосаэдрической белко-
вой оболочки и образует головку вируса.
Отросток состоит из двух соосных трубок,
соединенных с головкой короткой шейкой.
В отростке сократительный чехол окружает
центральный стержень, через который ДНК
вводится в бактерию-хозяина. Отросток не-
сет на конце базальную пластинку с шестью
короткими зубцами, от которой отходит
шесть длинных тонких нитей. Рис. 30.10. Электронная микрофотогра-
Концы нитей отростка связываются фия фага Т4. (Williams R. С., Fi-
с определенными участками на клетке E.coli. sher Н. W., An electron
В результате АТР-зависимого сокращения micrographic atlas of viruses,
С. С. Thomas, Springfield,
Часть IV. Illinois, 1974. Печатается с лю-
172 Информация безного разрешения издателя.)
Таблица 30.2. Гены фага Т4 [Wood W.B., Revel H.R., 5-гидроксиметилцитидилат. Третий фер-
Bacteriol. Rev., 40, 860 (1976)] мент превращает 5-гидроксиметилцитиди-
лат в трифосфат, который служит субстра-
Тип Число том для ДНК-полимераз. Наконец, че-
твертый фермент гликозилирует некоторые
из содержащихся в ДНК остатки гидрокси-
Метаболические, необходимые 22 метилцитозина.
Метаболические, необходимыми не являют- Синтез поздних белков сопряжен с репли-
ся 60 кацией ДНК фага Т4. На этом этапе обра-
Сборка частицы, структурные белки 40 зуются белки капсида и лизоцим. Когда
Сборка частицы, другие белки 13 сборка вирионов потомства завершена, ли-
Общее число идентифицированных генов 135 зоцим гидролизует клеточную стенку бакте-
рии и разрушает ее. Примерно через 20 мин
после заражения возникает около двухсот
здние. Предранние и ранние гены транскри-
новых вирусных частиц.
бируются и транслируются до того, как син-
тезируется ДНК фага Т4. Некоторые белки,
30.5. В упорядоченной сборке фага Т4
кодируемые этими генами, обеспечивают
участвуют вспомогательные белки и
выключение синтеза клеточных макромоле-
протеазы
кул. Вскоре после заражения ДНК клетки-
Сборка фага Т4 - гораздо более сложный
хозяина распадается под действием дезокси-
процесс, чем сборка ВТМ, так как капсид
рибонуклеазы, кодируемой одним из ранних
фага Т4 значительно сложнее по своей
генов фага Т4. ДНК самого фага Т4 не
структурной организации и содержит при-
гидролизуется под действием этого фермен-
мерно 40 различных белков. Еще тринад-
та, поскольку в ней нет кластеров (сгруп-
пированных остатков) цитозина. В ДНК цать дополнительных белков (по сравнению
с ВТМ) участвуют в сборке фага Т4, но не
фага Т4 вместо цитозина находится гидро-
входят в состав капсида. Механизм сборки
ксиметилцитозин (ГМЦ). К тому же остат-
этого вируса был исследован с помощью со-
ки ГМЦ в ДНК Т4 глюкозилированы.
четания генетических, биохимических
Эти производные цитозина включаются
и электронно-микроскопических методов.
в ДНК бактериофага Т4 благодаря дей-
Работы Вильяма Вуда и Роберта Эдгара
ствию нескольких фагоспепифических фер-
(William Wood, Robert Edgar), посвященные
ментов, синтезирующихся на ранней стадии
мутантам фага Т4, дефектным по способно-
заражения. Один из них гидролизует dCTP
сти к сборке, позволили установить следую-
с образованием dCMP, чтобы воспрепят-
щее.
ствовать включению dCTP в ДНК фага Т4.
1. Существует три основных пути пре-
Затем второй фермент вводит в dCMP ги-
вращений, которые приводят к образованию
дроксиметильную группу, и образуется
вupуca. В результате этих превращений неза-
висимо формируются головка, отросток
и нити отростка (рис. 30.11). Если блокиро-
вать образование одного из перечисленных
компонентов, это не повлияет на синтез
двух других.
2. Каждая из этих последовательностей
превращений идет в строго определенном
порядке. Все белки капсида синтезируются
одновременно во второй половине цикла за-
ражения. Таким образом, строгой последо-
вательности сборки головки, отростка и ни-
тей отростка способствуют структурные
особенности самих промежуточных продук-
тов. Ни один из этих процессов ассоциации не
может идти с заметной скоростью, пока не
закончится предыдущий. Возможно, часть

30. Вирусы 173


и протеазы. Например, для образования
центральной «втулки» базальной пластинки
отростка нужны три белка, которые не вхо-
дят в состав собранного отростка. Эти вспо-
могательные белки служат временными ша-
блонами для ассоциации компонентов
«втулки». Протеазы играют важную роль
в сборке головки. Основной белок головки
с массой 45 кДа, который называется gp23*
(gp - от англ. gene product - продукт гена),
образуется из предшественника gp23 с мас-
сой 55 кДа. Расщепление происходит в тот
момент, когда головка частично собрана;
это свидетельствует о том, что оно запу-
скает механизм втягивания ДНК в головку.
Известны еще три белка головки, которые
расщепляются в процессе сборки. Таким
образом, фаг Т4 образуется путем само-
сборки и сборки с участием вспомога-
тельных (морфопоэтических) белков и фер-
ментов.

30.6. В репликации фага T4 участвует


конкатемерный промежуточный продукт
При репликации линейных молекул ДНК,
в частности ДНК фага Т4, возникает особая
проблема. 5'-концы новообразованной до-
черней ДНК застроены не до конца, так как
РНК-затравка была удалена, но не была за-
Рис. 30.11. Морфогенез фага Т4. Числа мещена ДНК (рис. 30.12). Напомним, что
возле стрелок обозначают ДНК-полимераза не способна синтезиро-
гены, продукты которых необ- вать цепи ДНК de novo в направлении 3'—>5'
ходимы для соответствующих (разд. 24.19). При репликации кольцевых
этапов сборки. (Wood W.В., молекул ДНК такой проблемы не возни-
Genetic mechanisms of кает, так как 3'-конец новой цепи служит за-
development, Ruddle F. H., ed., травкой для завершения синтеза дочерней
Academic Press, 1973, p. 29.) цепи. Как же решают эту проблему фаг Т4
и другие вирусы, геном которых предста-
вляет собой линейную ДНК? Важным ука-
энергии связывания на каждом этапе ис- занием на то, как решается эта проблема,
пользуется для снижения энергии активации послужило открытие, что эти линейные мо-
следующего процесса ассоциации и таким лекулы обладают концевой избыточностью,
образом увеличивает его скорость. т.е. последовательность оснований левого
3. Головка и отросток должны быть конца ДНК в точности повторяется на пра-
полностью собраны, прежде чем они соеди- вом конце:
няются друг с другом. Затем готовые нити
отростка присоединяются к базальной пла-
стинке. И в этом случае строгая последова-
тельность событий обеспечивает выход
только готовых вирусных частиц. К тому же при репликации этих молекул
Образование вирионов фага Т4 идет не ДНК образуются длинные конкатемеры,
только путем самосборки. Важную роль на Эти открытия позволили предложить меха-
некоторых этапах этого процесса играют низм заполнения 5'-концов дочерних цепей.
вспомогательные ( морфопоэтические ) белки Поскольку одноцепочечные концы ново-
образованных двухцепочечных молекул
Часть IV. взаимно комплементарны, они быстро реас-
174 Информация социируют (рис. 30.13). Эта комплементар-
30.7. ДНК фага Т4 вводится
в преобразованную головку
Как образуется молекула ДНК, соответ-
ствующая одному фаговому геному, и как
она упаковывается в головку? Эта проблема
невероятно сложна: ДНК имеет контурную
длину 56 мкм и при этом должна уместить-
ся в головку, длина которой по большей оси
0,1 мкм. К тому же объем ДНК
(1,8•10-4 мкм3) ненамного меньше объема
головки (2,5•10-4 мкм3). A priori имеются
две возможности: ДНК может входить
в предобразованную головку или головка
Рис. 30.12. 5'-концы новосинтезиро- может собираться вокруг «ядра» конденси-
ванных линейных молекул рованной ДНК. Выделение пустых головок
ДНК застроены не до конца. фага, способных упаковать ДНК, прямо до-
Родительские цепи ДНК пока-
казывает, что ДНК фага Т4 вводится в пред-
заны красным цветом, а дочер- образованные головки (рис. 30.14). В то вре-
ние - синим. мя как ДНК входит в головку и свертывает-
ся в структуру, напоминающую моток
пряжи, происходит расщепление нескольких
белков головки. Одновременно происходит
разбухание головки. Наконец, когда в голов-
ку входит фрагмент ДНК, соответствую-
щий длине одного генома, конкатемерная

Рис. 30.13. Конкатемерный промежу-


точный продукт репликации
линейных двухцепочечных мо-
лекул ДНК. Двухцепочечные
молекулы ДНК с неза-
строенными концами ассоции-
руют друг с другом благодаря
спариванию комплементарных
одноцепочечных концов (АВ
с ab). Затем одноцепочечные
пробелы застраиваются.

ность - следствие концевой избыточности


последовательности оснований. В конкате-
мерной цепочке, состоящей из повторяю- Рис. 30.14. Схема упаковки ДНК при
щихся звеньев - двухспиральных молекул сборке головки фага Т4.
фаговой ДНК, 3'-конец одной молекулы
служит затравкой для заполнения 5'-конца
другой. 30. Вирусы 175
словами, не более 60 идентичных субъеди-
ниц могут быть упакованы в сферическую
оболочку с соблюдением абсолютной сим-
метрии. Но ВККТ и ряд других сферических
вирусов содержат 180 идентичных субъеди-
ниц. Биологическое преимущество построе-
ния оболочки из 180 вместо 60 субъединиц
такого же размера состоит в том, что в бо-
лее крупный вирион можно упаковать боль-
ше нуклеиновой кислоты. Это достигается
не нарушением симметрии, а некоторым ее
ослаблением (рис. 30.16, Б). Рентгенострук-
турный анализ структуры ВККТ высокого
разрешения, проведенный Стивеном Харри-
соном (Stephen Harrison), показал, что хими-
чески идентичные субъединицы его оболоч-
ки можно отнести к трем группам (А, В и С),
каждая из которых состоит из 60 белков,
подчиняющихся строгой икосаэдрической
симметрии. В то же время молекулы из раз-
ных групп расположены по отношению друг
Рис. 30.15. Электронная микрофотогра-
к другу несколько по-разному; поэтому их
фия вируса кустистой карлико-
вости томата. (Печатается называют квазиэквивалентными.
с любезного разрешения д-ра Как объяснить квазиэквивалентность
Robley Williams.) с физической точки зрения? Рентгенострук-
турный анализ показал, что каждая субъеди-
ница состоит из S-домена, образующего
часть поверхности оболочки; Р-домена, вы-
ДНК расщепляется. Нуклеаза действует не ступающего наружу; N-концевого участка,
путем узнавания какой-либо определенной направленного внутрь. Р- и S-домены всех
последовательности, а расщепляет ДНК субъединиц имеют примерно одинаковое
именно в тот момент, когда головка напол- строение. В то же время угол между Р- и S-
нена. Этим и объясняется тот факт, что доменами в субъединицах группы С сильно
концы молекул ДНК Т4 обладают концевой отличается от угла в субъединицах А и В. Р-
избыточностью, ДНК упаковывается таким и S-домены соединены шарниром, обеспечи-
образом, что она может быть очень быстро вающим поворот на угол до 20°. Еще одно
введена в бактерию при следующем цикле отличие состоит в том, что N-концевая
заражения. Чем обеспечивается такая пора- часть в субъединицах группы С упорядоче-
зительная подвижность, остается загадкой. на, а в субъединицах А и В находится в бес-
порядочной конформации. Благодаря такой
30.8. Гибкость белка оболочки ВККТ гибкости структурной организации субъеди-
позволяет ему образовывать ницы, принадлежащей к различным группам,
икосаэдрический капсид могут взаимодействовать друг с другом по-
Вирус кустистостой карликовости томатов чти идентичным образом, что необходимо
(ВККТ) - сферический вирус, иллюстрирую- для самосборки. С другой стороны, РНК
щий другой принцип организации вируса внутри частицы, по-видимому, не находится
(рис. 30.15). ВККТ содержит одну молекулу в какой-нибудь определенной конформации.
РНК длиной 4800 нуклеотидов, окруженную Гибкие N-концевые участки субъединиц
оболочкой из 180 идентичных белковых оболочки проникают внутрь и взаимодей-
субъединиц массой 41 кДа. Как уложены ствуют с РНК.
эти субъединицы оболочки? Максимально
возможная симметрия изотермической обо- 30.9. Бактериальные рестрикционные
лочки достигается в случае икосаэдра эндонуклеазы расщепляют чужеродные
и имеет порядок 60 (рис. 30.16, А). Другими молекулы ДНК
Мы уже видели, что фаг Т4 обладает фер-
Часть IV. ментативной системой для избирательного
176 Информация расщепления ДНК клетки-хозяина. Подоб-
Рис. 30.16. Икосаэдрическая поверхност- и другие молекулы ДНК, содержащиеся
ная решетка, демонстрирую- в клетках-хозяевах, метилированы по опре-
щая упаковку 60 совершенно деленным участкам. Те же участки узнает
одинаковых субъединиц (А) и рестриктирующая эндонуклеаза, которая
и 180 квазиэквивалентных расщепляет только неметилированные по-
субъединиц (Б). Обратите вни- следовательности. Таким образом, метили-
мание, что все контакты типа рование определенного основания в последо-
«хвост к хвосту» на рис. А вательности-мишени (участке узнавания)
образуются кольцевыми груп- препятствует гидролизу ферментом ре-
пами по пять субъединиц, а на стрикции (рис. 30.17). Момент, в который
рис. Б некоторые такие кон- происходит модификация, имеет принци-
такты образуются группами по пиально важное значение: бактериальная
пять, а другие — по шесть ДНК не подвергается расщеплению, потому
субъединиц. [Harrison S.C., что она метилируется раньше. Только что
Trends Biochem. Sci., 3,4 (1978).] реплицированная бактериальная хромосо-
ма, метилированная только по одной - ро-
дительской - цепи, устойчива к действию
фермента рестрикции. Такая наполовину
но этому, у бактерий имеются ферменты, модифицированная ДНК становится по-
называемые рестриктирующими эндону- лностью метилированной до начала сле-
клеазами, которые расщепляют чужеродные дующего цикла репликации.
молекулы ДНК. Эти ферменты были откры- У бактерий обнаружено два типа систем
ты в результате наблюдения, что фаги, вы- рестрикция-модификация. В системах типа
ращенные на одном штамме бактерий (на- I активность метилазы и нукдеазы ассоции-
пример, E.coli В), плохо растут на другом рована с крупным комплексом, состоящим
штамме (E.coli К) и наоборот. Такое явле- из нескольких субъединиц. Например, такие
ние, когда фаг плохо растет на штамме, от- комплексы у E.coli К и В состоят из поли-
личном от того, на котором он был выра- пептидных цепей трех типов. α-Цепь обла-
щен, было названо рестрикцией. Однако дает эндонуклеазной активностью, β-цепь -
-5
небольшая часть фага (примерно 1 0 ) из- метилазной активностью, а γ-цепь несет
бегает рестрикции и в дальнейшем хорошо участок узнавания ДНК. Ферменты типа
растет на новом хозяине. При этом фаги I нуждаются в S-аденозилметионине и
теряют способность расти на старом хо- в АТР для проявления как нуклеазной, так
зяине. и метилазной активности. Ферменты типа
Все эти данные показали, что специфиче- I расщепляют не модифицированную ДНК
ская модификация в клетках-хозяевах защи- в случайном месте на расстоянии 1900 пар
щает фаг от рестрикции. Затем Вернер Ар- оснований или более в 5'-сторону от участка
бер (Werner Arber) продемонстрировал, что
специфическая модификация клеткой-хозяи-
ном на самом деле воздействует на фаговую
ДНК и что рестрикция обусловлена дегра-
дацией ДНК фага. ДНК клетки-хозяина 30. Вирусы 177
Рис. 30.17. Метилирование участков узна- 30.10. Стратегия репликации
вания (последовательностей- РНК-содержащих вирусов
мишеней) защищает их от рас- Репликация РНК-содержащих вирусов
щепления рестриктирующей представляет собой особую проблему, так
эндонуклеазой. как в незараженных клетках-хозяевах нет
ферментов для синтеза РНК по РНК-ма-
трице. Следовательно, РНК-содержащие
узнавания1 и одновременно гидролизуют вирусы должны нести генетическую инфор-
АТР. В системах типа II, наоборот, мети- мацию для синтеза РНК-зависимой РНК-
лазы и нуклеазы разделены. S-аденозилме- полимеразы (которую называют также
тионин служит донором метальной группы РНК-репликазой или РНК-синтетазой) или
в реакции модификации, но не участвует для РНК-зависимой ДНК-полимеразы (на-
в расщеплении ДНК. Еще одно отличие со- зываемой также обратной транскриптазой).
стоит в том, что нуклеазы и метилазы типа РНК-содержащие вирусы удобно классифи-
II не нуждаются в АТР. Самое удивитель- цировать в зависимости от РНК, содержа-
ное, что места расщепления нуклеазами ти- щейся в вирионе, и мРНК. По определению
па II весьма специфичны. Как уже обсужда- мРНК представляет собой ( + ) Р Н К , а ком-
лось в одной из предыдущих глав
(разд. 24.27), многие из этих ферментов уз-
нают определенную последовательность из
4-6 пар оснований и гидролизуют в каждой
цепи единственную строго определенную
фосфодиэфирную связь в этой области. От-
личительная особенность этих участков рас-
щепления состоит в том, что они симме-
тричны относительно оси вращения второго
порядка (рис. 30.18). Ферменты рестрик-
ции - незаменимый инструмент в исследова-
нии структуры ДНК (разд. 24.27) и создании
новых молекул ДНК (разд. 31.9).
1
Арбер изучал систему рестрикции—модифи-
кации типа I на содержащем одноцепопечную
ДНК фаге fd, поэтому он мог указать положе- Рис. 30.18. Специфичность рестриктирую-
ние участка расщепления относительно участка
узнавания так, как это сделано в тексте.- Прим. щей эндонуклеазы Hind III из
перев. Hemophilus influenza и соответ-
ствующей метилазы. Зеленым
Часть IV. цветом показана ось симме-
178 Информация трии второго порядка.
Пикорнавирусы -
группа мелких (pica) РНК-содержащих (рна - от айгл. RNA) вирусов. Одна одно-
цепочечная молекула (+)РНК окружена икосаэдрической белковой оболочкой
диаметром 270 А. К пикорнавирусам относятся вирус полиомиелита, ринови-
рус (вызывающий обычную простуду) и вирус ящура крупного рогатого скота.

Рис. 30.19. Способы экспрессии генов в цитоплазму клетки-хозяина, эта молекула


РНК-содержащих вирусов. РНК вириона используется в качестве ма-
[Baltimore D., Bacteriol. Rev., трицы для синтеза белка. Она транслирует-
35, 326 (1971).] ся рибосомами клетки-хозяина с образова-
нием белков капсида и особой РНК-полиме-
разы, работающей по РНК-матрице (РНК-
репликазы). Затем РНК-репликаза синтези-
плементарная ей цепь - (—)РНК. Известны рует (—)цепи на матрице (+)РНК вириона
четыре пути репликации и транскрипции (рис. 30.21). (—)РНК в свою очередь служит
РНК-содержащих вирусов (рис. 30.19). Ви- матрицей для синтеза множества (+)цепей,
русы 1-го класса (например, вирус полио- которые участвуют в синтезе белка или упа-
миелита) - вирусы, содержащие положи- ковываются в капсиды и дают новые ви-
тельную цепь РНК. Они синтезируют рионы.
(—)РНК, которая используется в качестве
матрицы для образования (+)мРНК. Ви-
русы 2-го класса (например, вирусы бешен-
ства) содержат отрицательную цепь РНК,
у них (—)РНК вириона служит матрицей
для синтеза (+)мРНК. Вирусы 3-го класса
(например, реовирусы) содержат двухцепо-
чечную РНК; (±)РНК вириона направляет
асимметрический синтез (+)мРНК. Наибо-
лее необычны вирусы 4-го класса - ретрови-
русы (например, вирус саркомы Рауса).
У них выражение генетической информации,
содержащейся в (+)РНК вириона, опосре-
довано образованием ДНК, которая служит
матрицей для синтеза (+)РНК. Таким
образом, поток генетической информации
ретровирусов направлен от РНК к ДНК
и затем обратно к РНК.
Рис. 30.20. Электронная микрофотогра-
30.11. Белки вируса полиомиелита фия частиц вируса полиомие-
образуются путем множественного лита. (Печатается с любезного
расщепления гигантского предшественника разрешения д-ра John Finch.)
Вирус полиомиелита состоит из одноцепо-
чечной (+)РНК длиной 7,5 kb, заключен-
ной в икосаэдрический капсид. Проникнув 30. Вирусы 179
Рис. 30.21. Репликация РНК вируса по- тические мРНК, наоборот, сплошь и рядом
лиомиелита. полицистронны (например, мРНК лактоз-
ного оперона). Таким образом, вирус полио-
миелита использует расщепление полипро-
Поразительная особенность выражения теина, чтобы преодолеть ограничения, на-
генов вируса полиомиелита состоит в том, кладываемые особенностями животной
что (+)РНК вириона служит матрицей для клетки-хозяина.
синтеза непрерывной полипептидной цепи,
содержащей более 2000 аминокислотных 30.12. С геномной РНК вируса
остатков. Дэвид Балтимор (David Baltimore) везикулярною стоматита транскрибируется
показал, что этот гигантский полипептид пять моноцистронных мРНК
расщепляется протеазами клетки-хозяина Вирус везикулярного стоматита вызываю-
на семь белков: четыре белка оболочки, одну щий легкое заболевание крупного рогатого
РНК-репликазу и два белка, функция ко- скота, и вирус бешенства - примеры второго
торых пока еще неизвестна (рис. 30.22). Но- способа выражения генов. Их вирионы со-
вообразованная полипептидная цепь расще- держат одноцепочечную молекулу ( — ) Р Н К ,
пляется на три куска, которые затем которая не может служить матрицей.
подвергаются дальнейшему расщеплению. Поэтому первый этап ее экспрессии - синтез
В частности, два белка оболочки образуют- (+)РНК. Поскольку в незараженных клет-
ся из предшественника на завершающей ках нет РНК-репликазы, вирусы должны со-
стадии сборки вириона. держать этот фермент в составе вириона
Почему вирус полиомиелита синтезирует и вводить его при заражении в клетку. Дей-
свои белки таким на первый взгляд ствительно, два из пяти белков вириона
сложным путем? По-видимому, у него нет ВВС осуществляют репликацию РНК. Для
выбора. Напомним, что в эукариотических проявления инфекционности вируса необхо-
клетках молекула мРНК по непопятной по- димы белок L массой 200 кДа (от англ.
ка причине может при трансляции дать large - большой) и белок NS массой 45 кДа
только одну полипептидную цепь. Прокарио- (от англ. nonstructural - неструктурный),
присутствующие в небольших количествах.
Часть IV. Геномная РНК находится в комплексе
180 Информация с большим числом молекул белка нуклео-
Рабдовирусы -
вирусы, имеющие форму пули. К ним относятся вирусы везикулярного стома-
тита и бешенства. Название происходит от греческого слова rhabdo, что озна-
чает «палочка».

Рис. 30.22. Синтез белков вируса полио- ми. Проникнув в клетку-хозяина, вирион
миелита путем множественно- теряет наружную икосаэдрическую оболоч-
го расщепления гигантского ку, состоящую из трех видов белков. Удале-
полипептидного предшествен- ние этой оболочки активирует РНК-поли-
ника. меразу, содержащуюся в сердцевине вирио-
на. Эта РНК-зависимая полимераза по-
лностью транскрибирует 10 молекул
капсида N массой 50 кДа - основного белка (+)РНК, так что образующиеся (+)мРНК
вириона. ВВС заключен в липидную дву- имеют такую же длину, как фрагменты ге-
слойную мембрану, которую он захваты-
вает из плазматической мембраны в процес-
се отпочковывания от клетки (рис. 30.23).
Белок G (от англ. glycoprotein - гликопро-
теин) массой 65 кДа, кодируемый вирусом,
образует шипы, выступающие из этой мем-
браны. Белок матрикса М массой 29 кДа
располагается между оболочкой и нуклео-
капсидом. Эти пять белков ВВС образуются
при трансляции пяти (+)мРНК, а не пу-
тем расщепления одного полипротеина. Та
же самая РНК-репликаза синтезирует
и длинную (+)РНК, содержащую всю гене-
тическую информацию вируса. Эта полная
(+)РНК в свою очередь служит матрицей
для синтеза (—)РНК, которая упаковывает-
ся и дает новые вирионы. Рис. 30.23. Электронная микрофотогра-
фия вируса везикулярного сто-
30.13. Геном реовируса состоит из десяти матита. (Williams R. С., Fisher
различных молекул двухцепочечной РНК Н. W., Electron Micrographic
Реовирус, содержащий двухцепочечную Atlas of Viruses, С. С. Thomas,
РНК, поражает клетки млекопитающих 1974. Печатается с любезного
и представляет третий тип вирусных генети- разрешения издателя.)
ческих систем. Сердцевина вириона содер-
жит десять различных двухцепочечных мо-
лекул ( ± ) Р Н К , ассоциированных с белка- 30. Вирусы 181
Реовирус -
вирус, содержащий двухцепочечную РНК, выделен из дыхательных путей и же-
лудочно-кишечного тракта людей и других млекопитающих; насколько извест-
но, он не вызывает заболевания. Приставка рео составлена из первых букв ан-
глийских слов respiratory enteric orphan, что означает энтеро-респираторный
вирус-сирота (сирота, поскольку бродит «не пристроенный» ни к какой
болезни).

нома. (±)РНК матрица транскрибируется


асимметрично и консервативно, т.е. обра-
зуются только (+)РНК, а исходные
(±)РНК разрушаются. В сердцевине вирио-
на к 5'-концам этих мРНК присоединяются
«колпачки» под действием ферментов. За-
тем эти концы выходят через каналы в серд-
цевине (рис. 30.25). Следовательно, сердце-
вина - высокоорганизованная система син-
теза мРНК. Каждая из этих десяти мРНК
дает при трансляции один белок. Затем
весь набор десяти (+)РНК соединяется
с некоторыми вирусными белками и об-
Рис. 30.24. Электронная микрофотогра- разует предшественник сердцевины («пре-
фия реовируса. (Williams R. С., кор»), в котором синтезируется десять
Fisher H. W., An electron (—)цепей.
micrographic atlac of viruses, Для чего геном реовируса разделен на
С. С. Thomas, 1974. Печатается фрагменты? Как уже было указано выше,
с любезного разрешения изда- вирусы животных не могут иметь полици-
теля.) стронных мРНК. Вирус полиомиелита ре-
шает эту проблему путем расщепления ги-
гантского белка-предшественника, а вирус
везикулярного стоматита транскрибирует
РНК вириона в виде коротких мРНК, ка-
ждая из которых соответствует одному бел-
ку. Стратегия реовируса состоит в том,
чтобы иметь отдельную «хромосому» для
каждого синтезируемого белка.
Четвертый путь выражения генетической
информации РНК-содержащих вирусов -
использование ДНК-посредника, интегри-
рующей с геном клетки-хозяина. Это более
сложная генетическая система, которую ис-
пользуют ретровирусы (РНК-содержащие
опухолеродные вирусы). Мы обсудим ее ни-
же в этой главе (разд. 30.19).

30.14. Мелкие РНК-содержащие фаги


содержат перекрывающиеся гены
Рис. 30.25. Синтез мРНК в сердцевине ре- Такие РНК-содержащие фаги, как R17 (MS2,
овируса. Молекулы мРНК вы- F2) и Qβ, относятся к простейшим вирусам.
глядят нитями, отходящими от Они имеют форму правильного многогран-
темных телец-сердцевин. ника и диаметр около 200 А. Капсид этих
[Bartlett N. М., Gillies S. G., близкородственных фагов содержит 180 мо-
Bullivant S., Bellamy A. R., лекул белка оболочки массой 14 кДа и одну
J. Virol., 14, 324 (1974).] молекулу белка А (созревания) массой
38 кДа. Кроме того, одноцепочечная
Часть IV. (+)РНК кодирует одну из субъединиц ре-
182 Информация пликазы. До сих пор считалось, что эти мел-
кие РНК-содержащие вирусы содержат
только три гена. Однако обнаружение му-
танта фага, образующего нормальные ви-
рионы, но не способного при этом лизиро-
вать клетку-хозяина, повлекло за собой
поиск еще одного кодируемого вирусом
белка. Действительно, у РНК-содержаших
фагов имеется четвертый ген, кодирующий
белок, необходимый для лизиса бактерии-
хозяина. Ген этого белка лизиса перекры-
вается с генами белка оболочки и субъеди-
ницы репликазы (рис. 30.26). Эти мелкие
РНК-содержащие фаги, подобно маленько-
му ДНК-содержащему фагу φX174
(разд. 26.11), используют перекрывающиеся
гены для того, чтобы вместить больше ин-
формации в свои маленькие геномы. Молеку-
ла ( + ) Р Н К вириона служит матрицей и для
синтеза четырех белков, и для синтеза
(—)РНК. Затем (—)РНК используется в ка-
честве матрицы для образования множества
копий (+)РНК. Таким образом, по генети- Рис. 30.26. Перекрывающиеся гены в РНК
ческой системе эти фаги напоминают вирус вирусов R17 и Qβ. Одна рамка
полиомиелита. считывания показана желтым
Репликаза, синтезирующая (+)- и (—)це- цветом, другая - синим.
пи фаговой РНК,- очень интересный фер-
мент. Он проявляет высокую специфич-
ность к гомологичной фаговой РНК. Поэто-
му молекулы РНК клетки-хозяина не конку- периода инфекции,- основной продукт
рируют с фаговой РНК при репликации. трансляции. Одна из причин этого состоит
Qβ-репликаза состоит из четырех субъеди- в том. что рибосомы гораздо прочнее связы-
ниц, из которых только одна кодируется фа- ваются с участком инициации соответ-
говой РНК. Три другие субъединицы репли- ствующего цистрона, чем с другими участ-
казы - белки клетки-хозяина, которые фаг ками инициации в (+)РНК. Кроме того,
приспособил для собственных нужд. Два из белок оболочки подавляет трансляцию гена
них - факторы элонгации синтеза белка репликазы, блокируя его участок инициа-
EF-Tu и EF-Ts, а третий - один из компонен- ции. Таким образом, белок оболочки - спе-
тов 30S-субчастицы рибосомы. Так фаг Qβ цифический релрессор трансляции. Белок
создает весьма специфичный фермент мак- А транслируется только с незаконченных
симально экономичным способом. молекул (+)РНК, так как в полных молеку-
Регуляторные механизмы обеспечивают лах РНК его участок инициации блокирован
правильную временную последовательность в результате спаривания оснований. Вторич-
трансляции и репликации. ( + ) Р Н К служит ная структура полной молекулы РНК по-
одновременно матрицей для синтеза белка зволяет транслировать лишь небольшое ко-
и для синтеза (—)РНК. Было бы нежела- личество белка А.
тельно, чтобы оба процесса происходили
одновременно на одной и той же ( + ) Р Н К , 30.15. Дарвиновская эволюция фаговой РНК
поскольку рибосомы, движущиеся в на- вне клетки
правлении 5'—>3', сталкивались бы с репли- Очистка РНК фага Qβ и Qβ-репликазы от
казой, движущейся в направлении 3'—>5'. примесей нуклеаз позволила Солу Спигел-
Этого не происходит, так как Qβ-репликаза ману (Sol Spigelman) изучать эволюционные
сильно ингибирует связывание рибосом с события вне живой клетки. Один из вопро-
(+)РНК до тех пор, пока не синтезируется сов был сформулирован следующим обра-
достаточное число молекул ( — ) Р Н К . зом: что произойдет с молекулами РНК, ес-
Четыре фаговых белка синтезируются
в различных количествах. Белок оболочки,
который синтезируется на протяжении всего 30. Вирусы 183
ли единственное предъявляемое к ним требо-
вание - это как можно быстрее размно-
жаться? Молекулы РНК и репликазы фага
Qβ и рибонуклеозидтрифосфаты инкубиро-
вали в течение 20 мин. Такое время инкуба-
ции способствует отбору мутантных моле-
кул РНК, которые быстро реплицируются.
Образец этой инкубационной смеси перено-
сили и разводили в свежей порции стандарт-
ной реакционной смеси, содержащей Qβ-ре-
пликазу и рибонуклеозидтрифосфаты. Про-
водили 75 переносов и затем анализировали
образовавшиеся РНК. Продолжительность
инкубации постепенно снижали, так как мо-
лекулы РНК на протяжении эксперимента
реплицировались все быстрее. Самым удиви-
тельным было то, что после 75 переносов
(«поколений») длина молекул РНК соста-
вляла всего 12% длины исходной РНК фага
Qβ. Нуклеотиды, ненужные для репликации,
были утрачены, так как укороченные моле-
кулы реплицировались быстрее. Основное
ограничение, которое накладывали условия
этого эксперимента,- сохранение в му-
тантных молекулах инициирующей после-
довательности, которую узнает Qβ-репли-
каза.

30.16. Лизогенные фаги могут включать


свою ДНК в состав ДНК клетки-хозяина
У некоторых бактериофагов существует два
возможных пути, по которым может пойти
их дальнейшее развитие после заражения Рис. 30.27. Электронная микрофотогра-
клетки-хозяина: они могут размножаться фия фага λ. (Печатается с лю-
и лизировать зараженную клетку (литиче- безного разрешения д-ра
ский путь развития) или же их ДНК может A. Dale Kaiser.)
включиться в ДНК зараженной клетки, не
проявляя способности к размножению и ли-
зису (лизогенный путь развития). Вирусы, ми концами, так как они взаимно компле-
которые не всегда убивают клетку-хозяина, ментарны и могут спариваться друг с дру-
называются умеренными. Лучше всего из гом. На самом деле они соединяются сразу
умеренных вирусов изучен фаг после заражения. В результате 5'-фосфат ка-
λ (рис. 30.27); мы уже говорили о нем рань- ждой цепи оказывается рядом со своим
ше в связи с регуляцией транскрипции собственным 3'-гидроксильным концом.
(разд. 28.11). Напомним, что репрессор фага ДНК-лигаза клетки-хозяина заделывает
λ связывается с двумя группами опера- разрывы, и в результате образуется кольце-
торных участков OL и OR и что он регули- вая молекула ДНК фага λ (рис. 30.28).
рует свой собственный синтез. Репликация этой кольцевой молекулы
ДНК вириона λ - линейная двухцепочеч- ДНК фага λ происходит путем взаимодей-
ная молекула длиной 48 kb. 5'-конец каждой ствия белков, кодируемых фагом λ, с репли-
ее цепи представляет собой одноцепочеч- кационными механизмами клетки-хозяина.
ную последовательность из 12 нуклеотидов. В другом случае кольцевая ДНК фага λ мо-
Эти последовательности называются липки- жет включиться в бактериальную хромосо-
му с помощью одного акта реципрокной ре-
Часть IV. комбинации между специфическими участ-
184 Информация ками ДНК фага λ и E.coli длиной по 15 пар
оснований. Сайт (участок) прикрепления фа-
га λ в ДНК E.coli обозначается attλ и распо-
лагается между генами галактозного и био-
тинового оперонов galE и biоА. Последова-
тельность оснований attλ можно символи-
чески обозначать В-В' (от англ.
bacterial - бактериальный). Специфический
сайт прикрепления в фаге λ называется att
и локализован рядом с генами int (от англ.
integrate - интегрировать) и xis (от англ.
excise - вырезать). Последовательность ос-
нований att обозначается Р-Р' (от англ.
phage - фаг). Белок int узнает последователь-
ность Р-Р' в фаговой ДНК и последователь-
ность В-В' в ДНК E.coli. Затем происходит
взаимный перенос: Р соединяется с В', а В - с
P'. Эта схема (рис. 30.29 и 30.30) была перво-
начально предложена Алланом Кэмпбел-
лом (Allan Campbell) на основании генетиче-
ских данных.
Теперь ДНК фага λ составляет часть мо-
лекулы ДНК E.coli. Эта форма называется
профагом, а клетка E.coli, содержащая про-
фаг,- лизогенной бактерией. Профаг стаби-
лен в отсутствие белка xis. Транскрипция ге-
на xis блокируется репрессором фага
λ (разд. 28.11). Когда репрессия снимается.
белки xis и int совместно катализируют раз-
рыв последовательностей В—Р' и Р—В',
и снова происходит взаимный перенос
(рис. 30.30): Р соединяется с Р', а В с В'; при
этом снова получаются кольцевая молекула
ДНК фага λ и нелизогенная хромосома
E.coli. Главная особенность этой системы
рекомбинации заключается в том. что белок
int сам по себе не может узнавать две новые
последовательности на концах профага
(В-Р' и Р-В'), поэтому они устойчивы. Та-
Рис. 30.28. Превращение линейной ДНК ким образом, внедрение фага происходит
фага λ в кольцевую форму. в присутствии одного белка int, тогда как
вырезание профага - только в присутствии
обоих белков - int и xis.

Рис. 30.30. Интеграция и исключение


ДНК фага λ. Это неполная схе-
ма, так как некоторые факторы,
участвующие в этих процессах,
пока не идентифицированы.
Рис. 30.29. Схема реципрокной рекомби-
нации ДНК фага λ и ДНК Е.
coli. 30. Вирусы 185
30.17. Ретровирусы и некоторые ДНК-
содержащие вирусы могут вызывать рак
у чувствительных клеток-хозяев
В 1911 г. Пейтон Раус (Peyton Rous) приго-
товил бесклеточный фильтрат из опухоли
соединительной ткани, которая спонтанно
возникла у курицы и ввел его нормальным
цыплятам. Как ни странно, у реципиентов
развились высокозлокачественные опухоли
такого же типа, которые называются сарко-
мами. Кроме того, Раус обнаружил, что опу-
холеродный фактор фильтрата, известный
в настоящее время под названием вируса
саркомы Рауса (RSV) или вируса саркомы
птиц (ASV) (рис. 30.31), можно размножить
путем последовательного пассирования
в курах. Вирус саркомы птиц относится
к группе РНК-содержащих опухолеродных
вирусов (онкогенных РНК-содержащих ви-
русов). Эти вирусы содержат в составе вири-
нов (+)РНК и размножаются с использова- Рис. 30.32. Электронная микрофотогра-
нием двухспиральной ДНК-посредника. По- фия ДНК-содержащего опухо-
этому их называют ретровирусы. Ретрови- леродного вируса SV-40. (Печа-
тается с любезного разрешения
д-ра Jack Griffith.)

русы - единственные РНК-содержащие ви-


русы, способные вызывать рак. Кроме того,
злокачественные опухоли может вызывать
ряд ДНК-содержащих вирусов. Обезьяний
вирус 40 (SV-40) и вирус полиомы принадле-
жат к группе паповавирусов (рис. 30.32); из
всех онкогенных ДНК-содержащих вирусов
они изучаются наиболее интенсивно.
Особый интерес к этим РНК- и ДНК-содер-
жащим вирусам привлекает то, что они со-
держат всего четыре-пять генов. В индукции
рака участвует всего один или два вирусных
гена, и потому исследователи питают на-
дежду выяснить механизм их действия.
Для изучения рака на молекулярном
уровне были разработаны системы тка-
невых культур. При проникновении онко-
Рис. 30.31. Электронная микрофотогра- генного вируса в подходящие животные
фия вируса саркомы птиц (ви- клетки они становятся постоянно трансфор-
руса саркомы Рауса), относя- мированными, т.е. похожими на раковые.
щегося к ретровирусам. Силь- Трансформированные клетки отличаются
ноокрашивающиеся вирионы от нормальных особенностями своего роста
расположены вблизи поверх- и характером клеточных поверхностей
ности зараженной клетки цы- (табл. 30.3). Самое разительное изменение
пленка. (Печатается с любезно- состоит в том, что трансформированные
го разрешения д-ра Samuel клетки растут непрерывно и хаотически не-
Dales.) зависимо от соседних клеток. Кроме того,
трансформированные клетки содержат ви-
Часть IV. русоспецифическую ДНК, интегрированную
186 Информация с геномом клетки-хозяина. Этим объясняет-
Таблица 30.3. Изменения свойств клеток при трансфор- цевую двухспиральную ДНК. В некоторых
мации ДНК- или РНК-содержащими опухолероднымн ви- клетках (они называются пермиссивными
русами (Tooze J., ed.. The molecular biology of tumour клетками-хозяевами) развитие этих вирусов
viruses. Cold Spring Harbor Laboratory, 1973, p. 351)
идет по пути литического цикла, что приво-
дит к образованию множества новых вирио-
нов (рис. 30.33).
Характер роста
При продуктивной инфекции эти вирусы
При введении чувствительным животным образуют
убивают клетки. В клетках других типов (не-
опухоли
Растут до гораздо более высокой плотности пермиссивных клеток-хозяев) некоторые
Рост становится не ориентированным в пространстве стадии экспрессии вирусного генома по не-
и клетки отделяются от поверхности, на которой понятным причинам блокируются. Никако-
растут го вирусного потомства в них не образуется.
В среду выделяются активаторы протеаз, что повы- но небольшая часть клеток - порядка од-
шает инвазивность клеток ной на 105 - трансформируется в резуль-
Снижается потребность в факторах роста сыворотки тате интеграции вирусной ДНК с геномом
Свойства поверхности клетки-хозяина.
Появляются новые вирусоспецифические антигены К настоящему времени расшифрована
Один из белков наружной поверхности клеток - фи- полная последовательность 5243 пар осно-
бронектин - исчезает ваний ДНК вируса SV-40, а многие аспекты
Падает содержание ганглиозидов его репликации и транскрипции интенсивно
На поверхности клетки появляются антигены плода исследуются. Половина ДНК транскриби-
Скорость транспорта питательных веществ увеличи- руется на ранней стадии инфекции, другая
вается
половина ДНК - на поздней стадии, одно-
Способность к агглютинации под действием расти-
тельных лектинов увеличивается
временно с синтезом вирусной ДНК
(рис. 30.34).
Признаки присутствия опухолеродного вируса Точка начала репликации находится в той
Имеются последовательности вирусной ДНК же области, что и начало транскрипции ран-
Имеются вирусоспецифические мРНК ней и поздней областей. Ранняя область
Выявляются вирусоспецифические антигены
транскрибируется в направлении против ча-
совой стрелки и кодирует Т-антиген (белок
ся тот факт, что трансформация является А), необходимый для инициирования репли-
наследуемым изменением фенотипа. Куль- кации ДНК. Другой, иммунологически от-
туры, полученные из трансформированных личный белок - малый t-антиген - также ко-
колоний, навсегда сохраняют аномальные дируется ранней областью. При синтезе
свойства трансформированных клеток. Кро- мРНК для Т-антигена происходит выре-
ме того, некоторые трансформированные зание вставочной последовательности из
клетки, полученные из культуры ткани, при первичного транскрипта.
введении в достаточном количестве в подхо- Таким образом, вирус SV-40 использует
дящего хозяина образуют раковую опухоль. аппарат сплайсинга клеточного ядра. Заслу-
живает внимания также последовательность
30.18. Вирусы SV-40 и полиомы могут оснований в точке начала репликации. Здесь
вызывать продуктивную инфекцию имеются две последовательности длиной по
или трансформацию клеток-хозяев 13 пар оснований, симметричных относи-
Вирусы SV-40 и полиомы содержат внутри тельно оси второго порядка, а рядом нахо-
икосаэдрической оболочки маленькую коль- дится АТ-богатая область:

30. Вирусы 187


Паповавирусы -
группа ДНК-содержащих вирусов. Название составлено по названиям трех
представителей группы: вирусов папилломы, полиомы и вакуолизирующего ви-
руса (SV-40).

Рис. 30.33. Электронная микрофотогра- эффективностью. Еще один пример генети-


фия фрагмента ядерной мем- ческой экономии - то, что SV-40 не синтези-
браны клетки, зараженной ви- рует собственных белков для упаковки
русом SV-40. Видны ядерные ДНК. Новосинтезированная ДНК свя-
поры и множество вирионов. зывается с гистонами клетки-хозяина
(Печатается с любезного разре- (рис. 30.35). Затем этот сверхспирализован-
шения д-ра Jack Griffith.) ный комплекс упаковывается в капсид с по-
мощью белков VP1, VP2 и VP3. В конце кон-
цов вирионы потомства высвобождаются
С этим участком связывается Т-антиген.
Транскрипция поздней области происхо-
Таблица 30.4. Белки, кодируемые вирусом SV-40
дит по направлению часовой стрелки от на-
чала репликации (рис. 30.34) и приводит
к синтезу трех белков капсида: VP1, VP2 Белок Масса, мРНК Роль
и VP3. И в этом случае происходит удаление кДа
вставочных последовательностей из первич-
ного транскрипта. Три мРНК, по-видимо-
му, образуются в результате различных ре- Т-антиген
акций сплайсинга. N-концевая последова- (белок А) 94 Ранняя Необходим для
тельность аминокислот VP3 перекрывает инициации, репли-
кации ДНК и для
70% С-концевой последовательности VP2.
трансформации
Кроме того, перекрывающийся участок из
22 нуклеотидов читается в одной рамке t-Антиген 21 Ранняя Неизвестна
считывания при синтезе VP2 и VP3 и в дру- VP1 40 Поздняя Основной белок
капсида
гой рамке при синтезе VP1. Так, ограничен-
ное количество генетической информации VP2 39 Поздняя Минорный белок
у вируса SV-40 используется с максимальной капсида
VP3 27 Поздняя Минорный белок
Часть IV. капсида
188 Информация
при лизисе клетки-хозяина, которая в ре-
зультате гибнет.
В непермиссивных клетках происходит
экспрессия ранней области генома SV-40,
поздняя же область не реплицируется и не
транскрибируется. Небольшая часть этих
клеток трансформируется в результате ин-
теграции генома SV-40 с клеточной ДНК.
В отличие от интеграции ДНК фага λ в ме-
ханизме интеграции ДНК SV-40, по-види-
мому, не участвуют специфические участки
ни вирусной, ни клеточной ДНК. Для транс-
формации, а также, по всей вероятности, для
поддержания трансформированного состоя-
ния необходимы оба вирусных антигена (Т
и t). Введение таких трансформированных Рис. 30.34. Генетическая карта ДНК виру-
клеток чувствительным животным приво- са SV-40, содержащая 5243
дит к быстрому образованию опухолей. Ос- пары оснований. Ранняя
новная цель ведущихся в настоящее время область (транскрибируется
исследований вируса SV-40 состоит в том, в направлении против часовой
чтобы выяснить, как экспрессия ранней стрелки) показана желтым цве-
области интегрированной формы этого ви- том, поздняя область (тран-
руса делает клетку раковой. скрибируется по часовой стрел-
ке) - синим, место начала ре-
пликации (ori) - красным.
30.19. Ретровирусы содержат обратную
транскриптазу, которая синтезирует
двухспиральную ДНК, используя
в качестве матрицы ( + ) Р Н К
Еще один класс опухолеродных вирусов -
ретровирусы - содержит (+)РНК-геном в
икосаэдрическом «футляре». Это сфериче-
ское нуклеопротеиновое «ядро» окружено
оболочкой, состоящей из кодируемых виру-
сом молекул гликопротеина в двуслойной
липидной оболочке, происходящей из плаз-
матической мембраны клетки-хозяина.
Обычно диаметр ретровирусов составляет
1000 А (см. рис. 30.31).
В 1964 г. Говард Темин (Howard Temin)
наблюдал, что заражение такими РНК-со-
держащими опухолеродными вирусами, как
вирус саркомы птиц, блокируется ингибито-
рами синтеза ДНК. Ингибиторы, например
аметоптерин, 5-фтордезоксиуридин и цито-
зинарабинозид, эффективны в течение
первых двадцати часов после введения виру-
сов. В результате этого открытия было
Рис. 30.35. Электронная микрофотогра-
высказано предположение, что для роста
фия формирующихся частиц
РНК-содержащих опухолеродных вирусов
необходим синтез ДНК. К тому же образо- опухолеродного вируса SV-40,
вание частиц вирусного потомства подав- ассоциированных с клеточной
ляется актиномицином D. Известно, что хромосомой. (Печатается с лю-
этот антибиотик ингибирует синтез РНК по безного разрешения д-ра Jack
ДНК-матрице (разд. 25.18). Так зародилось Griffith.)
предположение о том. что для размножения
РНК-содержащих опухолеродных вирусов 30. Вирусы 189
содержавшаяся в вирусной частице, синтези-
рует (—)цепь ДНК. Тот же фермент расще-
пляет цепь геномной РНК в составе гибрида
РНК—ДНК. Теперь обратная транскрипта-
за синтезирует (+)цепь ДНК, используя
в качестве матрицы (—)цепь. Таким обра-
зом, обратная транскриптаза осущест-
вляет три последовательные реакции: РНК-
зависимый синтез ДНК, гидролиз РНК
и ДНК-зависимый синтез ДНК (рис. 30.36).
Подобно другим ДНК-полимеразам,
обратная транскриптаза синтезирует ДНК
в направлении 5'—>3' и неспособна к инициа-
ции цепей de novo. Откуда же берется за-
травка для синтеза вирусной ДНК? Процесс
Рис. 30.36. Синтез ДНК по РНК-матрице инициации весьма экономичен: ( + ) Р Н К ви-
обратной транскриптазой. За- русного генома содержит нековалентно свя-
травка не показана. занную транспортную РНК (в вирусе сар-
комы птиц это - триптофановая тРНК),
которая была захвачена в клетке-хозяине во
необходима транскрипция ДНК. Эти неожи- время предыдущего цикла заражения.
данные данные привели Темина к мысли, 3'-ОН-группа этой тРНК, основания кото-
что ДНК-содержащий провирус служит рой спарены с геномной РНК, действует
промежуточным продуктом в репликации в качестве затравки синтеза ДНК. Как про-
и в онкогенном действии этих вирусов: исходит репликация полной цепи (+)РНК?

Выдвинутая Темином гипотеза, что генети- Напомним, что при репликации любой ли-
ческая информация может переходить от нейной ДНК возникает особая проблема за-
РНК к ДНК, была вначале холодно встрече- полнения 5'-концов (разд. 30.6). Ретрови-
на большинством исследователей. Она тре- русы нашли очень остроумный выход из
бовала существования неизвестного тогда этого положения. Их геномы состоят не из
еще фермента, способного синтезировать одной, а из двух молекул (+)РНК
ДНК по РНК-матрице (РНК-зависимой (рис. 30.37). Эти молекулы связаны друг
ДНК-полимеразы). В 1970 г. Темин и Балти- с другом водородными связями вблизи
мор (Temin, Baltimore) независимо открыли 5'-концов. К тому же (+)РНК содержит од-
такой фермент, который называется обрат- ну и ту же последовательность у 5'- и
ной транскриптазой, в вирионах некоторых у 3'-конца. Эта концевая избыточность, по-
РНК-зависимых опухолеродных вирусов. видимому, необходима для процесса репли-
Все вирусы этой группы, исследованные кации, как и в случае фага Т4 (разд. 30.6).
в дальнейшем, содержали обратную тран-
скриптазу, поэтому их и называют ретрови- 30.20. Ретровирусная ДНК
русами (от англ. reverse transcriptase - обрат- транскрибируется только в том случае, если
ная транскриптаза). она интегрирована с геном клетки-хозяина
Жизненный цикл обычного ретровируса Двухспиральная вирусная ДНК переходит
начинается со связывания вирионов со спе- в кольцевую форму и проникает в ядро.
цифическими рецепторами на поверхности Транскрипция ретровирусной ДНК проис-
клетки-хозяина и проникновения в клетку. ходит только после того, как она интегри-
В цитозоле вирусная (+)РНК скидывает рует с ДНК клетки-хозяина. Таким образом,
оболочку. Затем обратная транскриптаза, в жизненном цикле ретровирусов интегра-
ция — этап обязательный. В жизненном ци-
Часть IV. кле онкогенных ДНК-содержащих вирусов,
190 Информация напротив, интеграция и продуктивная ин-
фекция - альтернативные пути. Еще одно от-
личие заключается в том, что частота ин-
теграции ретровирусной ДНК очень высока,
как и следовало ожидать исходя из ее клю-
чевой роли в продуктивной инфекции.
Геном вируса саркомы птиц длиной 10 kb
содержит четыре гена (рис. 30.38). Три из
них - gag, pol и env - необходимы для продук-
тивной инфекции. Ген gag кодирует поли-
протеин массой 76 кДа, который расще-
пляется на четыре белка, образующих
сердцевину вируса. Ген pol кодирует обрат-
ную транскриптазу, состоящую из α- и β-
субъединиц. α-Субъединица массой 65 кДа
представляет собой фрагмент (массой
90 кДа) протеолиза β-цепи. Ген env кодирует
гликопротеин оболочки вируса, необхо-
димый для прикрепления вируса к поверх-
ности клетки-хозяина. Четвертый ген - src
(от англ. sarcomа - саркома) - не нужен для
размножения вируса, но необходим для
трансформации, как будет показано чуть
ниже.
Различные вирусные мРНК, видимо,
образуются в результате сплайсинга из пер-
вичного транскрипта длиной 10 kb. Затем
они транспортируются в цитозоль и здесь
транслируются. Геномная РНК и вирусные
белки перемещаются к плазматической
мембране и включаются в нее. Затем часть
измененной мембраны отпочковывается
и образует новые вирусные частицы. Таким
Рис. 30.37. Схематическое изображение образом, продуктивная ретровирусная ин-
генома вируса саркомы птиц. фекция в отличие от инфекции онкогенными
Две идентичные молекулы ( + ) ДНК-содержащими вирусами не является
РНК связаны между собой не- литической. Ретровирусы обычно не уби-
ковалентно. На 5'-концах нахо- вают клеток-хозяев. Ретровирусная ДНК
дятся «колпачки», а на 3'-кон- остается в геноме зараженной клетки и про-
цах - poly(А)-последовательно- должает экспрессироваться. Кроме того, ин-
сти. Молекула тРНК, которая тегрированная вирусная ДНК реплицирует-
служит затравкой, присоедине- ся вместе с клеточной ДНК, поэтому
на посредством спаривания ос- дочерние клетки наследуют вирусный геном.
нований к каждой молекуле
РНК. 30.21. Киназа, кодируемая геном src вируса
саркомы птиц, участвует в трансформации
Изучение некоторых температурочувстви-
тельных мутантов принесло новые данные
о механизме трансформации под действием
вируса саркомы птиц. При высокой темпе-
ратуре эти мутанты нормально размно-
жаются, но не трансформируют клеток-хо-
Рис. 30.38. Генетическая карта вируса сар- зяев, а при низкой температуре оба процесса
комы птиц. Геном имеет длину протекают нормально. Кроме того, фибро-
10 kb. Буквой Т обозначены
концевые повторяющиеся по-
следовательности. 30. Вирусы 191
Для этого должен экспрессироваться ген
rsc.
Что же представляет собой продукт гена
src? Исследования, проведенные в последнее
время, показали, что этот белок массой
60 кДа - киназа, фосфорилирующая белки.
Проводится изучение мишени этой киназы,
что позволит выяснить механизм трансфор-
мации. Поразительно, что один небольшой
белок может полностью изменить характер
роста клетки и сделать ее раковой.

30.22. Двухцепочечная РНК подавляет


синтез белка в клетках, обработанных
интерфероном
Устойчивость животных клеток ко многим
вирусам заметно увеличивается под дей-
ствием интерферонов - группы небольших
белков, которые синтезируются и секрети-
руются клетками позвоночных, инфициро-
ванными вирусом. Двухцепочечные моле-
кулы РНК оказывают некоторое стимули-
рующее действие на образование интерфе-
Рис. 30.39. Электронная микрофотогра- рона. Интерфероны связываются с плазма-
фия частиц вируса миелобла- тической мембраной других клеток организ-
стоза птиц. Введение этого опу- ма и стимулируют их способность сопроти-
холеродного РНК-содержа- вляться вирусной инфекции. Клетки при-
щего вируса новорожденным обретают устойчивость к широкому спектру
цыплятам вызывает в течение вирусов. Иммунность, которую обеспечи-
3 недель злокачественную лей- вают антитела, наоборот, весьма специфич-
кемию. (Печатается с любезно- на. Интерфероны обладают очень высокой
го разрешения д-ра Ursula активностью: всего 10-1 М достаточно
Heine, Национальный институт для проявления выраженного противови-
раковых исследований.) русного действия.
Интерферон повышает противовирусную
устойчивость клеток путем увеличения син-
теза трех ферментов: олигонуклеотид-син-
бласты, трансформированные этими мутан- тетазы, эндонуклеазы и киназы. До тех пор
тами при низкой температуре, при повыше- пока сенсибилизированная клетка не зара-
нии температуры возвращаются к нормаль- жается вирусом или не подвергается воздей-
ному фенотипу. Сдвиг от трансформирован- ствию двухцепочечной РНК, эти три фер-
ного состояния к нормальному оказывается мента бездействуют. Активация этих фер-
полностью обратимым. Анализ этих мутан- ментов блокирует синтез белков двумя
тов показал, что в процессе трансформации различными путями (рис. 30.40). Протеин-
участвует только один вирусный белок - киназа фосфорилирует один из факторов
продукт гена src. Ген src получил свое на- инициации синтеза белка и тем самым инак-
звание потому, что способен направлять син- тивирует его. Напомним, что тот же фактор
тез какого-то белка, вызывающего саркому. инициации служит мишенью регуляторного
Важно подчеркнуть, что в таких мутантных каскада в ретикулоцитах (разд. 29.27). Дру-
клетках при высокой температуре вирусная гой важный результат воздействия двухспи-
ДНК остается интегрированной с кле- ральной РНК на сенсибилизированные ин-
точным геном. Следовательно, интеграция терфероном клетки - стимулирование дегра-
сама по себе не приводит к трансформации. дации мРНК. Эндонуклеаза активируется
олигоаденилатом, который называется 2,5А.
Часть IV. Двухцепочечная РНК стимулирует синтета-
192 Информация зу, образующую этот стимулятор эндону-
Рис. 30.40. Двухцепочечная РНК стимули- большого числа белковых субъединиц одно-
рует расщепление мРНК (А) го или нескольких видов, так как вирусы со-
и ингибирует инициацию син- держат крайне ограниченное количество ге-
теза белка в клетках, обрабо- нетической информации. Два основных
танных интерфероном (Б). способа укладки - цилиндрическая оболоч-
[Farrell P.J., Sen G.C, Dubois ка, обладающая спиральной симметрией,
M. F., Ratner L., Slattery E., и сферическая оболочка, обладающая ико-
Lengyel P., Proc. Nat. Acad.Sci. саэдрической симметрией. Частица вируса
USA, 75, 5896 (1978).] (вирион) табачной мозаики состоит из 2130
идентичных субъединиц, уложенных спи-
ралью вокруг одноцепочечной молекулы
РНК; она образуется в результате само-
сборки, которая осуществляется путем при-
соединения белковых дисков к петле РНК.
Вирус кустистой карликовости томатов
образует икосаэдрическую оболочку, так
как домены, из которых состоит его белок
оболочки, связаны друг с другом подвижно.
Сборка фага Т4 - гораздо более сложный
процесс, в котором участвует примерно 50
белков. Три основных пути сборки ведут
клеазы. Было бы крайне интересно выяс-
к независимому образованию головки, от-
нить, играют ли эти регуляторные пути
ростка и нитей отростка. Формирование фа-
какую-либо роль в незараженной клетке, по-
га Т4 идет в строго определенном порядке,
мимо того что они защищают ее от вирусов.
в нем участвуют процессы самосборки
и сборки с участием ферментов. Кроме того,
Заключение важную роль в сборке фага Т4 играют вспо-
Вирусы представляют собой плотно упако- могательные (морфопоэтические) белки.
ванную инфекционную нуклеиновую кисло- Незараженные клетки не могут синтези-
ту, окруженную защитной оболочкой. Они ровать РНК по РНК-матрице. Следователь-
содержат ДНК или РНК, которые могут но, общее свойство РНК-содержащих виру-
быть одно- или двухцепочечными. Простей-
шие вирусы имеют всего 3 гена, а наиболее
сложные - около 250 генов. Вирусные обо-
лочки в большинстве случаев состоят из 30. Вирусы 193
сов (кроме РНК-содержащих опухоле- свои клетки-хозяева, либо их ДНК интегри-
родных вирусов) - это кодирование РНК-за- рует с ДНК клетки-хозяина. Ретровирусы
висимой РНК-полимеразы. РНК, содержа- могут размножаться только путем интегра-
щаяся в вирионах некоторых вирусов ции с клеточной ДНК. Эти вирусы содержат
(например, фага Qβ), служит при заражении обратную транскриптазу, катализирующую
информационной РНК. У других вирусов синтез двухспиральной ДНК с использова-
(например, у реовирусов) геномная РНК нием в качестве матрицы геномной РНК.
должна сразу после заражения транскриби- Продуктивная инфекция ретровирусами
роваться. Транскрипция осуществляется в отличие от онкогенных ДНК-содержащих
ферментом, который имеется в вирионе. вирусов не является литической. Клетки,
РНК-содержащие вирусы используют раз- в геноме которых содержится ДНК вируса
личные способы синтеза белка. Белки виру- SV-40, полиомы или ретровируса, имеют
са полиомиелита образуются путем расщеп- аномальные поверхности и характеризуют-
ления гигантского предшественника. Реови- ся нарушениями роста. При введении чув-
рус содержит отдельную «хромосому» для ствительным животным они образуют опу-
каждого синтезируемого им белка, а вирус холи. Эти вирусы - удобная модель для
везикулярного стоматита транскрибирует изучения молекулярных основ рака, так как
несколько моноцистронных РНК с одной они имеют всего около пяти генов. Удалось
геномной РНК. показать, что трансформацию вызывает
Не все вирусы разрушают свои клетки-хо- киназа, которую кодирует ген src вируса
зяева. Умеренный фаг λ может принимать саркомы птиц.
форму дремлющего профага, когда его Устойчивость клеток животных ко мно-
ДНК интегрирована с бактериальной хро- гим - вирусам заметно увеличивается под
мосомой путем реципрокной рекомбина- действием интерферона - белка, который
ции. Этот профаг сохраняет способность синтезируют и выделяют клетки, зара-
к размножению и лизису, которую он про- женные вирусом. Интерферон увеличивает
являет, когда происходит его исключение из образование трех ферментов, блокирующих
клеточной ДНК. Подобно этому, ДНК-со- синтез белка путем ингибирования фактора
держащие опухолеродные вирусы SV-40 инициации и стимулирования деградации
и полиомы либо размножаются и лизируют мРНК.

Биологические исследования представляют собой, в частности, упражнения по


эстетике природы. Занимаясь биологией, мы получаем удовольствие главным
образом оттого, что снова и снова осознаем, насколько экономичны, изящны
и целесообразны те механизмы, которые случайно возникли в ходе эволюции
и были закреплены отбором. Вирусолог может чувствовать себя одним из
самых счастливых биологов, так как он может изучить избранный им объект до
подробностей строения его отдельных молекул. Вирусолог наблюдает, как ви-
рус - этот полнейший паразит - использует для своего существования наиболее
общие принципы биологии клетки...
David Baltimore, Нобелевская лекция, 1976 г.

РЕКОМЕНДУЕМАЯ a physician's guide, New Engl. J. Med., Книги


ЛИТЕРАТУРА 303, 675-682. Luria S.E., Darnell J.E., Jr.
Campbell A.M., 1976. How viruses Baltimore D., Campbell A., 1978.
С чего начать insert their DNA into the DNA of the General Virology (3rd ed.), Wiley.
Butler P.J.G., King A., 1978. The host cell, Sci. Amer, 235(6), 102-113. [Имеется перевод: Лурия С, Дар-
assembly of a virus, Sci. Amer., 239(5), Temin H.M., 1972. RNA-directed DNA нелл Дж., Балтимор Д., Кэмпбелл Э.
62-69. (Сборка вируса табачной мо- synthesis, Sci. Amer., 226(1), 24-33. Общая вирусология.- М.: Мир, 1981.]
заики.) Nathans D., 1979. Restriction endo- (Доступное и увлекательное введение
Bishop J.M., 1980. The molecular nucleases, simian virus 40, and the new в вирусологию.)
biology of RNA tumor viruses: genetics, Science, 206, 903-909. Тooze J. (ed.), 1980, The Molecular
Biology of Tumour Viruses (2nd ed.),
Часть IV. Cold Spring Harbor Laboratory.
194 Информация Williams R.С., Fisher H.W., 1974. An
Electron Micrographic Atlas of Airuses, Сборка вирусов Внеклеточная эволюция РНК фага Qβ
Thomas. (Сожержит превосходные Lebeurier G., Nicolaieff A., Ric- Mills D.R., Peterson R.L., Spiegel-
электронные микрофотографии hards К.E., 1977. Inside-out model for man S., 1967. An extracellular
и очень увлекательные объяснения self-assembly of tobacco mosaic virus, Darwinian experiment with
к ним.) Proc. Nat. Acad. Sci., 74, 149-153. a selfduplicating nucleic acid molecule,
Butler P.J.G., Finch J. Т., Zimmern D., Proc. Nat. Acad. Sci., 58, 217-224.
Строение вирусов 1977. Configuration of tobacco mosaic
Bloomer А.С., Champness J.N., virus RNA during virus assembly, Лизогення
Bricogne G., Staden R., Klug A., 1978. Nature, 265, 217-219. Lwoff A., 1966. The prophage and I. In:
Protein disk of tobacco mosaic virus at Wood W.В., 1978. Bacteriophage T4 Cairns J., Stent G. S. and Watson J. D.
2,8 A resolution showing the assembly and the morphogenesis of (eds.), Phage and the Origins of
interactions within and between subcellular structures, Harvey Lectures, Molecular Biology, pp. 88-99, Cold
subunits, Nature, 276, 362-368. 73, 203-223. Spring Harbor Laboratory. (Захваты-
Stubbs G., Warren S., Holmes K., 1977. Casjens S., King J., 1975. Virus вающий рассказ об открытии основ
Structure of RNA and RNA binding site assembly, Ann. Rev. Biochem., 44, лизогении.)
in tobacco mosaic virus from 4-A map 555-611.
calculated from X-ray fibre diagrams, Опухолеродные вирусы
Nature, 267, 216-221. Рестрикция и модификация Baltimore D., 1976. Viruses,
Harrison S.C., Olson A.J., Schutt C.E., Smith D.H., 1979. Nucleotide sequence polymerases, and cancer, Science, 192,
Winkler F.K., Bricogne G., 1978. specificity of restriction endonucleases, 632-636.
Tomato bushy stunt virus at 2,9 A Science, 205, 455-462. Timin H., 1976. The DNA provirus
resolution, Nature, 276, 368-373. Arber W., 1979. Promotion and hypothesis: the establishment and
Harrison S.C., 1978. Structure of simple limitation of genetic exchange, Science, implications of RNA-directed DNA
viruses: specificity and flexibility in 205, 361-365. synthesis, Science, 192, 1075-1080.
protein assemblies, Trends Biochem. Dulbecco R., 1976. From the molecular
Sci., 3-6. Интерферон biology of oncogenic DNA viruses to
Crick F.H.C, Watson J.D., 1957. Virus Friedman R.М., 1977. Antiviral activity cancer, Science, 192, 437-440.
structure: general principles. In: of interferon, Bacteriol. Rev., 41. Bishop J.M., 1978. Retroviruses, Ann.
Wolstenholme G. E. W. (ed.), Ciba Fou- 543-567. Rev. Biochem., 47, 35-88.
ndation Symposium on the Nature of Farrell P.J., Sen G.C., Dubois M.F., Reddy V.В., Thimmappaya В., Dhar R.,
Viruses, pp. 5-13. Ratner L., Slattery E., Lengyel P., 1978. Subramanian K.N., Zain B.S., Plan J.,
Caspar D.L.D., Klug A., 1962. Physical Interferon action: two distinct pathways Ghosh P.K., Celma M.L., Weiss-
principles in the construction of regular for inhibition of protein synthesis by man S. M., 1978. The genome of simian
viruses, Cold Spring Harbor Symp. double-stranded RNA, Proc. Nat. Acad. virus 40, Science, 200, 494-502.
Quant Biol., 27, 1-24. (В этой класси- Sci., 75, 5893-5897.
ческой статье рассматривается тео- Burke D.C., 1977. The status of
рия строения сферических вирусов.) interferon, Sci. Amer., 236(4), 42-50.
ГЛАВА 31 могут реплицироваться и экспрессироваться
в подходящих клетках-хозяевах. Кроме то-
Перестройки генов: го, мы обсудим важность клонирования ге-
нов и возможность его практического при-
рекомбинация, менения. Исследования рекомбинации
транспозиция и и транспозиции и разработка методов кло-
нирования идут исключительно быстрым
клонирование темпом. В результате этих работ возникают
новые плодотворные методы изучения гено-
Тема настоящей главы - перестройка генов мов, которые позволяют глубже проник-
путем перемещения крупных участков ДНК. нуть в механизмы их эволюции и выраже-
Прежде всего мы обсудим процесс генетиче- ния.
ской рекомбинации, при котором новая мо- 31.1 В основе генетической рекомбинации
лекула ДНК возникает путем разрыва и вос- лежат разрыв и воссоединение цепей ДНК
соединения цепей ДНК. Вероятность гене- При генетической рекомбинации возникает
тической рекомбинации существенно увели- молекула ДНК, последовательность кото-
чивается при наличии обширных участков рой происходит частично от одной роди-
гомологии между взаимодействующими тельской молекулы, а частично от другой.
молекулами ДНК. Были выделены проме- Исследования клеток Е. coli, зараженных
жуточные продукты рекомбинации, а срав- смесью фагов Т4, меченных 32Р и бром-
нительно недавно был охарактеризован дезоксиурацилом, позволили получить
и фермент, катализирующий взаимный об- представление о молекулярной природе ре-
мен цепей ДНК. Затем мы обсудим транс- комбинантных молекул. Плавучая плот-
позицию - перемещение гена из одной хро- ность ДНК, меченной бромурацилом, зна-
мосомы в другую или с одного места на чительно выше, чем плотность ДНК, мечен-
другое в пределах одной хромосомы. В от- ной 32Р, так что родительские молекулы
личие от общей рекомбинации для транспо- можно отделить друг от друга и от реком-
зиции не нужны протяженные участки гомо- бинантных молекул центрифугированием в
логии. У прокариот присутствие так назы- градиенте плотности хлористого цезия
ваемых последовательностей-вставок, или (CsCl). Результаты опытов по центрифуги-
IS-элементов (от англ. insertion sequences), рованию показали, что после заражения
сообщает подвижность неродственным смесью фагов рекомбинантные молекулы
фрагментам ДНК, обеспечивая их соедине- 32
содержат и Р, и бромурацил. Структура
ние. Рекомбинация и транспозиция сыграли гибридных молекул зависела от того, про-
важную роль в эволюции, так как они приво- исходил ли во время их образования синтез
дили к возникновению новых геномов. В кон- ДНК. В отсутствие синтеза ДНК 32Р-ДНК
це настоящей главы мы рассмотрим кон- в составе рекомбинантных молекул не была
струирование новых комбинаций генов ковалентно соединена с меченной бромура-
в пробирке и их выражение в клетках-хозяе- цилом ДНК. При нагревании выше темпе-
вах. Гены можно ковалентно соединить ратуры плавления двухспиральных молекул
с ДНК плазмид и вирусов с помощью ре- гибрид диссоциировал на легкий и тяжелый
стриктирующих эндонуклеаз и ДНК-ли- компоненты. Фрагменты родительских мо-
газы. Такие рекомбинатные молекулы ДНК лекул в этом гибриде удерживаются вместе
в результате спаривания оснований; поэто-
Часть IV. му этот промежуточный продукт называет-
196 Информация ся составным (рис. 31.3). Если же синтез
Рис. 31.1. Перенос генетической инфор- пиль из донорной клетки в ак-
мации от одной клетки Е. coli цепторную. (Печатается с лю-
к другой. На этой электронной безного разрешения д-ра
микрофотографии видны две Charles Brinton и д-ра Judith
клетки Е. coli, соединенные при Carnahan.)
помощи пиля во время конью-
гации. ДНК переносится через
31. Перестройки генов 197
ДНК происходил, одноценочечные пробелы
в составном промежуточном продукте за-
полнялись ДНК-полимеразой I и концы со-
единялись ДНК-лигазой. Образовавшуюся
рекомбинатную молекулу уже нельзя было
разделить на легкий и тяжелый компо-
ненты, так как куски ДНК были ковалентно
соединены. Эти эксперименты показали,
что одноцепочечные участки ДНК являют-
ся промежуточными продуктами генетиче-
ской рекомбинации и что в этом процессе
участвуют ферменты.

31.2. При генетической рекомбинации


происходит спаривание гомологичных
цепей ДНК с образованием двухцепо-
чечного промежуточного продукта
Изображение промежуточных продуктов ге-
нетической рекомбинации было получено
методом электронной микроскопии. В этих
исследованиях была использована ДНК
плазмид Е. coli. Как мы вскоре увидим (разд.

Рис. 31.2. Электронная микрофотогра-


фия кольцевой молекулы ДНК,
содержащей гены устойчиво-
сти к нескольким антибиоти-
кам. Такие плазмиды (факторы
R - от англ. resistance - устойчи-
вость) сообщают клеткам
устойчивость к различным ве-
ществам, которая может пере-
даваться другим клеткам. (Пе-
чатается с любезного разреше-
ния д-ра Stanley Cohen.)

Рис. 31.4. Электронная микрофотогра-


фия молекул ДНК в процессе
Рис. 31.3. Составной промежуточный рекомбинации: А - промежу-
продукт рекомбинации ДНК точный продукт в форме вось-
фага Т4 в зараженных бакте- мерки, состоящий из двух мо-
32
риях. Меченная Р ДНК пока- лекул Д Н К ; Б - при расщепле-
зана красным цветом, а ДНК, нии этого промежуточного
меченная бромурацилом,- си- продукта рестриктирующей
ним. эндонуклеазой образуется х-
форма. [Potter H., Dressier D.,
Часть IV. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 76,
198 Информация 1089 (1976).]
Рис. 31.5. Предполагаемая схема расще- длины. С другой стороны, если два плаз-
пления двух молекул ДНК, со- мидных кольца ковалентно соединены
единенных в негомологичных в области участка гомологии, должна быть
(А) и в гомологичных (Б) участ- видна структура с четырьмя ветвями в фор-
ках. Наблюдаемая симметрия ме греческой буквы χ. В действительности
χ-форм (как на рис. 31.4, Б) по- почти все восьмерки превращаются в χ-
казывает, что молекулы ДНК форму (рис. 31.4, Б). Это служит надежным
в форме восьмерок соединены подтверждением, что восьмерки представля-
в гомологичных участках. ют собой промежуточные продукты репли-
кации. В пользу этого вывода говорит и то,
что у некоторых мутантов Е. coli, дефект-
31.4), эти небольшие кольцевые двухцепо- ных по рекомбинации, восьмерки не обра-
чечные ДНК автономно реплицируются зуются.
в бактериальной клетке. В присутствии Какова структура области перекрестка
хлорамфеникола число плазмид в одной двух геномов в восьмерках? Точка контакта
бактерии увеличивается примерно с 20 до (пересечения) χ-форм всегда делит всю
1000. Этот антибиотик - ингибитор синтеза структуру на две пары плеч равной длины.
белка - подавляет репликацию бактериаль- Это означает, что геномы соединяются
ной хромосомы, но не ингибирует реплика- в области гомологии (рис. 31.5). Если бы
ции плазмид. Итак, бактериальная клетка плазмиды соединялись в области негомоло-
оказывается наполненной молекулами плаз- гичных последовательностей, то длины всех
мид, способными к рекомбинации. Элек- четырех плеч распределялись бы случайным
тронная микроскопия плазмид, выделенных образом. Кроме того, точка контакта распо-
из этих клеток, показывает, что примерно лагается примерно с равной вероятностью
четверть из них представляют собой ди- вдоль всей плазмиды; отсюда следует, что
меры в форме восьмерок (рис. 31.4, А). За- спаривание может происходить во многих
тем эти димеры расщепили рестриктирую- положениях. Способ соединения нитей
щей эндонуклеазой EcoRI. разрезающей в области перекреста был исследован с по-
мономер плазмиды в строго определенном мощью его избирательной денатурации. На
месте. Если бы димеры были взаимозаце- электронных микрофотографиях видно, что
пленными друг с другом мономерами или четыре двухцепочечные молекулы в местах
кольцами двухкратной длины, то под дей- соединения двух геномов отходят от кольца,
ствием рестриктирующей эндонуклеазы
образовались бы палочки одинаковой 31. Перестройки генов 199
Рис. 31.6. А - электронная микрофото- гую. Эти куски, содержащие несколько со-
графия χ-формы; Б - схема мо- тен нуклеотидов, подвергаются дальнейше-
лекулы, изображенной на фо- му расщеплению ферментом recВС, обла-
тографии. Участок гомологии дающим активностью экзонуклеазы. Рас-
(богатый АТ-парами основа- плетающая и нуклеазная активности этого
ний) был избирательно денату- ферментного комплекса зависят от гидро-
рирован формамидом, чтобы лиза АТР. Скорее всего роль белка recВС
было видно соединение цепей в рекомбинации сводится к образованию
в области перекреста. [Pot- одноцепочечной ДНК, способной внедриться
ter Н., Dressier D., Cold Spring в двухцепочечную молекулу ДНК.
Harbor Symp. Quant. Biol., 43, Как одноцепочечная ДНК находит гомо-
973 (1979).] логичную последовательность в двухцепо-
чечной молекуле, спаривается с компле-
ментарной цепью и вытесняет вторую цепь?
Недавно было показано, что эту реакцию ка-
состоящего из одиночных нитей (рис. 31.6). тализирует белок recА с массой 40 кДа, ко-
Затем этот промежуточный продукт может торый гидролизует АТР и использует выде-
быть расщеплен и лигирован, так что обра- ляющуюся энергию. Продукт этой реакции
зуются две пары различных рекомби- состоит из двухцепочечного участка и вы-
нантных молекул (рис. 31.7). тесненной одноцепочечной петли и имеет
форму буквы D; он называется D-петлей
(рис. 31.8). Образованию D-петли способ-
31.3. Белок г е c А катализирует ствует белок, который специфически связы-
АТР-зависимый обмен цепей ДНК вается с одноцепочечной ДНК. Этот белок
при генетической рекомбинации играет также важную роль в репликации
Процесс, который мы обсуждали до сих пор, ДНК (разд. 24.21); он стабилизирует одноце-
называется общей генетической рекомбина- почечную ДНК, образовавшуюся под дей-
цией, поскольку обмены могут происходить ствием нуклеазы recВС, и стимулирует вне-
между любыми парами гомологичных по- дрение этой цепи в гомологичную двухспи-
следовательностей в родительских молеку- ральную молекулу, катализируемую белком
лах ДНК. У Е. coli общая рекомбинация за- rесА.
висит от генов rec. В клетках rec-- бакте-
риальная ДНК не может рекомбинировать
с экзогенными молекулами ДНК. Были 31.4. Бактерии содержат плазмиды и другие
идентифицированы три гена rec: recА, recВ подвижные генетические элементы
и recС. Белки recВ (масса 140 кДа) и recС Общая генетическая рекомбинация приво-
(128 кДа) - две субъединицы одной ну- дит к возникновению новых комбинаций
клеазы, которая расплетает двухспираль- специфических аллелей, но не изменяет рас-
ную ДНК и расщепляет на куски сначала положения локусов. Другими словами, при
одну из расплетенных цепей, а затем дру- гомологичной рекомбинации ABCDE
с A'B'C'D'E' легко получится ABC'D'E', но не
Часть IV. может получиться ABXYZCDE или ABE.
200 Информация Такие крупные генетические перестройки
Рис. 31.7. Модель генетической реком- происходят при участии подвижных генети-
бинации, предложенная Роби- ческих элементов (табл. 31.1). Важный класс
ном Холидеем (Robin Holliday). подвижных генетических элементов - плаз-
Одна из родительских двухце- миды. Это кольцевые двухцепочечные моле-
почечных молекул изображена кулы ДНК (рис. 31.9), размер которых коле-
синим цветом, а другая блется от двух до нескольких сотен тысяч
красным. Более темная нить пар оснований (kb). Плазмиды содержат
в каждом дуплексе - (+)цепь. гены, ответственные за инактивирование ан-
Буквами X, Y и Z обозначены тибиотиков, метаболизм природных соеди-
три гена; х, у и z - их аллели. В нений и образование токсинов. В сущности,
и Г - ковалентное соединение плазмиды представляют собой дополни-
родительских молекул ДНК. тельные хромосомы. Они отличаются от
Е - иное представление ком- бактериальной хромосомы тем, что без них
плекса молекул, изображенно- в определенных условиях клетка может
го на рис. Д. Обратите внима- обойтись. Кроме того, плазмиды обладают
ние, что эта структура на рис. Е способностью реплицироваться независимо
может быть разрезана по гори- от клеточной хромосомы. Клетка Е. coli
зонтальной или по вертикаль- обычно содержит около 20 копий мелких
ной оси. Воссоединение нитей хромосом и 1-2 большие.
на рис. Ж и З дает два раз-
личных набора рекомбинантов 31.5. Фактор F позволяет бактериям
(И и К). Участки, содержащие передавать гены реципиентам путем
по одной цепи каждого из ро- конъюгации
дительских дуплексов, отме- Некоторые плазмиды обусловливают пере-
чены звездочками. [Potter H., нос бактериями генетического материала
Dressier D., Cold Spring Harbor
Symp. Quant. Biol., 43, 973
(1979).] 31. Перестройки генов 201
Таблица 31.1. Мобильные генетические элементы

Тип Раз- Свойства


мер,
kb

Плазмиды
Фактор F (фактор 93 Сообщает клетке
фертильности, фак- мужской фенотип,
тор плодовитости) переносится при
конъюгации
Факторы F' >100 Переносят, помимо
генов фактора F, ге-
ны Е. coli
Факторы R (факто- 4-117 Содержат гены устой-
ры устойчивости) чивости к различ-
ным веществам:
кроме того, некото-
рые из н и х с о д е р -
жат гены, обеспечи-
вающие конъюга-
цию
Факторы колицино- 6-141 Переносят гены, про-
генности дуцирующие коли-
цин (токсин); неко-
торые содержат,
кроме того, гены,
обеспечиваюшие
конъюгацию
Лизогенизирующие фа-
кторы
Лямбда 48 Небольшая часть фа-
гов переносит гены
Е. coli (gal или bio)
наряду с вирусными
Рис. 31.8. Спаривание одноцепочечной генами
молекулы ДНК (показана Мю 38 Все фаги мю несут
красным цветом) с комплемен- короткий участок
тарной цепью (желтым) ду- генома Е. coli
плекса, катализируемое бел- Послeдовательности- От 0,8 Гены, обрамленные
ком rec A. В результате обра- вставки до 1,4 парой IS-элементов,
зуется структура, называемая (IS-элементы) могут переноситься
D-петлей. с места на место
внутри клетки

в другие бактерии путем образования непос-


редственных межклеточных контактов.
Этот процесс, названный конъюгацией, от- вает между собой мужскую и женскую клет-
крыли в 1946 г. Джошуа Ледерберг ки (рис. 31.1). Затем он сокращается, что
и Эдвард Татум (Joshua Lederberg, Edward позволяет клеткам вступить в непосред-
Tatum). При конъюгации клеток Е. coli один ственный контакт для передачи ДНК
партнер (мужского пола) служит донором (рис. 31.10). Бактерия мужского пола содер-
генетического материала, другой (женского жит плазмиду, называемую фактором F (от
пола) - реципиентом. Бактерии мужского англ. fertility - плодовитость), которая несет
пола имеют на поверхности особые отрост- гены, детерминирующие образование по-
ки, получившие название половых пилей, ловых пилей и других компонентов, уча-
а женские клетки несут рецепторные участ- ствующих в конъюгации. При конъюгации
ки, которые связывают пили. Пиль связы- одна цепь плазмиды фактора F разрывается
в одном месте, и происходит расплетание
Часть IV. двухцепочечной молекулы (рис. 31.11). 5'-ко-
202 Информация нец разорванной цепи входит в реципиент-
ную клетку, и на ней синтезируется компле- ные гены. Конъюгация клетки F' с клеткой
--
ментарная цепь. При этом образуется F приводит к переносу этих хромосомных
замкнутая кольцевая двухцепочечная моле- генов из донора в реципиентную клетку,
кула. Присутствие плазмиды фактора F которая в результате становится диплоид-
--
в реципиентной клетке (первоначально F ) ной по этим генам.
+
превращает ее в мужскую клетку (F ). Му-
жская клетка может спонтанно терять свой
фактор и ревертировать таким образом к ге-
--
нотипу F .
Плазмида фактор F может интегриро-
вать с бактериальной хромосомой. Интегра-
ция происходит путем кроссинговера с од-
ним из множества мест в бактериальной
хромосоме. Частота интеграции составляет
примерно 10-5 в расчете на одну генерацию.
Бактерии, несущие фактор F в своих хромо-
сомах, называются клетками Hfr (от англ.
high frequency of recombination - высокая ча-
стота рекомбинации). Клетки Hfr, как
и клетки F+ , участвуют в конъюгации в ка-
честве доноров (рис. 31.12). Различие между
ними состоит в том, что клетка Hfr пере-
дает всю бактериальную хромосому (вклю-
чая интегрированный фактор F), тогда как
клетка F+ передает реципиенту только фак-
тор F. При скрещивании Hfr x F-- вся хро-
мосома переносится примерно за 90 мин. Рис. 31.9. Электронная микрофотогра-
Порядок входа передаваемых генов в реци- фия небольшой плазмиды фак-
пиентную клетку зависит от места, в кото- тора R. (Печатается с любезно-
ром произошла интеграция фактора F и от го разрешения д-ра Jack
его полярности. Поэтому порядок генов Griffith.)
в хромосоме донора можно легко устано-
вить, прерывая конъюгацию в различные
моменты времени и определяя, какие мар-
керы успели перейти. Передаваемая хромо-
сома донора может рекомбинировать с хро-
мосомой реципиента. Частота рекомбина-
ции выше всего для генов, которые вошли
в реципиентную клетку первыми, так как
они находятся там дольше всего. Таким
образом, можно строить генетические
карты, определяя время входа и частоту ре-
комбинации маркеров, передаваемых доно-
ром.
При исключении фактора F из хромо-
сомы Hfr-клетки она переходит в состояние
F+. Этот процесс, обратный интеграции
фактора F, также происходит с частотой
примерно 10-5 за одну генерацию. В не-
большой части ревертантов кроссинговер Рис. 31.10. Электронная микрофотогра-
происходит в сайте, отличном от сайта ин- фия двух клеток Е. coli во время
теграции. В результате образуется плазми- конъюгации. (Печатается с лю-
да, содержащая, помимо генов фактора F, базного разрешения д-ра
хромосомные гены (рис. 31.13). Такая плаз- Lucien Саrо.)
мида называется фактором F'; штрих обоз-
начает, что в ней присутствуют хромосом-
31. Перестройки генов 203
Рис. 31.11. Предполагаемый механизм Таким образом, у бактерий имеется меха-
переноса нити фактора R при низм для переноса целых хромосом или не-
конъюгации. В суперспирали- скольких генов из одной клетки в другую.
зованную молекулу фактора Фактор F можно рассматривать как особый
R в клетке F+-донора вносится переносчик (вектор), возникший специально
одноцепочечный разрыв, и по- для обмена генетическим материалом. Ин-
сле этого он расплетается, тересно отметить, что лизогенизирующие
Перенос одной цепи фактора фаги также могут участвовать в обмене ге-
R в клетку F -- -реципиента со- нов клетки-хозяина. Например, ДНК фага
пряжен с репликацией этой це- λ может интегрировать между генами gal
пи донора. Затем в реципиент- и bio хромосомы Е. coli (разд. 30.16). Исклю-
ной клетке синтезируется ком- чение профага из хромосомы обычно проис-
плементарная цепь. [War- ходит точно, но не всегда. Примерно
ren G.J., Twigg A.J., Sher- в одном вирионе на 105 ДНК фага λ содер-
ratt D. J., Nature, 274, 260 жит оперон gal или ген bio. При заражении
(1978).] такими фагами, называемыми λgal и λbio,
эти гены вводятся в клетку Е. coli вместе
с генами фага λ. Другой родственный фаг,
который называется φ80, интегрирует вбли-
зи оперона trp и может переносить гены trp

Рис. 31.12. Схема образования Hfr-клеток


путем интеграции фактора F
с хромосомой Е. coli. Рис. 31.13. Аномальное исключение фак-
тора F приводит к образова-
Часть IV. нию плазмиды F', содержащей
204 Информация часть хромосомы Е. coli.
из одной зараженной клетки в другую. Бак-
териофаг μ интегрирует почти в любом ме-
сте хромосомы Е. coli и при исключении
всегда захватывает кусок бактериальной
хромосомы. Эти трансдуцирующие фаги,
подобно фактору F, представляют собой
подвижные генетические элементы, ко-
торые обеспечивают взаимообмен бакте-
риальных генов. Не исключено, что транс-
дукция ускоряет эволюцию бактерий.

31.6. Плазмиды факторы R придают Рис. 31.14. Схематическое изображение


бактериям устойчивость к антибиотикам фактора R. Гены RTF (ответ-
Поразительным примером необычно бы- ственные за конъюгацию и ре-
строй эволюции бактерий может служить пликацию) показаны зеленым
эпидемия бактериальной дизентерии, проте- цветом, а гены r (ответственные
кавшая в 1955 г. Один из штаммов Shigella за устойчивость к различным
dysenteriae приобрел устойчивость одновре- лекарственным веществам) —
менно к хлорамфениколу, стрептомицину, красным. IS-элементы пока-
сульфаниламидам и тетрациклину. Такого заны желтым цветом.
рода множественная устойчивость к лекар-
ственным препаратам в настоящее время
широко распространена среди многих пато-
генных микроорганизмов. Гены, придаю-
щие устойчивость к многим антибиотикам,
соединены вместе в плазмидных факторах
R (от англ. resistance - устойчивость), назы-
ваемых также факторами устойчивости.
Наиболее крупные из этих плазмид наряду
с несколькими генами r содержат также фак-
тор переноса устойчивости (resistance
transfer factor - RTF) (рис. 31.14). Участок
RTF позволяет плазмиде переноситься
в другие бактерии с помощью конъюгации.
В действительности гены участка RTF весь-
ма сходны с аналогичными генами факто-
ров F. Гены r кодируют ферменты, инакти-
вирующие определенные лекарственные ве-
щества. Факторы R, имеющие участок RTF,
могут переноситься между различными ви-
дами бактерий при совместном культивиро-
вании. Следовательно, множественная
устойчивость к антибиотикам может быть
трансмиссивной.
Маленькие плазмиды факторы R лишены
области RTF и обычно придают клетке
устойчивость только к одному антибиотику.
Например, плазмида R pSC101 длиной 8,2
kb несет ген устойчивости к тетрациклину,
но она не может быть перенесена путем
конъюгации. Однако этот ген r может при- Рис. 31.15. Инфекционный фактор R обра-
соединиться к другой плазмиде, несущей зуется, когда ген r присоеди-
иной ген устойчивости к какому-либо веще- няется к плазмиде RTF.
ству (рис. 31.15). Если эти гены r интегри-
руют с плазмидой, содержащей область
RTF, возникает трансмиссивная R-плазми- 31. Перестройки генов 205
Рис. 31.16. Перенос гена (показано крас- последовательностями реципиентной ДНК
ным цветом), граничащего с и концевыми последовательностями транс-
обеих сторон с IS-элементами позона нет никакой гомологии. Кроме того,
(желтый цвет). При транспози- гены rec E. coli не участвуют в процессе ин-
ции реципиентный участок (си- теграции транспозона, что в корне отличает
ний цвет) удваивается. Один его от общей генетической рекомбинации.
конец транспозона предста- Концы транспозона, возможно, служат IS-
вляет собой обращенный по- элементами, направляя действие нуклеаз
втор другого конца. и других белков, участвующих в интеграции.
Самое главное заключается в том, что
транспозон не обязательно гомологичен ре-
да. Следовательно, плазмиды, являющиеся ципиентной ДНК, так как специфичность
сложными факторами R, образуются из интеграции определяется в первую очередь
весьма подвижных элементов, обусловли- ДНК-белковыми взаимодействиями, а не
вающих, устойчивость к отдельным химиче- спариванием оснований.
ским соединениям. Такие генетические эле- Самые маленькие подвижные генетиче-
менты, способные к переносу, теперь назы- ские элементы - это последовательности-
вают транспозонами. вставки (IS-элементы), которые имеют дли-
ну около 1 kb. В отличие от транспозонов
31.7. IS-элементы могут присоединяться IS-элементы не несут никаких генов. Однако
к неродственным генам они оказывают существенное влияние на
Что лежит в основе высокой подвижности выражение соседних генов. IS-элементы
транспозонов? Электронно-микроскопиче- обычно блокируют транскрипцию ди-
ские исследования и определение последова- стальных генов транскрипционной единицы.
тельности нуклеотидов в ДНК показали, Кроме того, они могут выступать в качестве
что последовательность, расположенная на новых промоторов. К тому же IS-элементы
одном конце транспозона, повторяется на способствуют таким хромосомным пере-
другом конце. Например, концы Tn3-транс- стройкам, как делеции и инверсии. В хромо-
позона, кодирующего устойчивость к ампи- соме E. coli было обнаружено несколько ко-
циллину,- представляют собой обращенные пий четырех различных IS-элементов (IS1,
повторы длиной 38 пар оснований. После- IS2, IS3 и IS4). К тому же концевые последо-
довательности нуклеотидов в ДНК реце- вательности некоторых транспозонов иден-
пиенте, граничащие с обеих сторон с транс- тичны одному из этих IS-элементов. По всей
позоном, являются прямым повтором по- вероятности, транспозон образуется в том
следовательности 5-9 пар оснований, при- случае, когда какой-либо ген оказывается
сутствовавшей до вставки транспозона окруженным парой IS-элементов.
(рис. 31.16). Между этими обрамляющими Мы уже видели, что плазмиды и фаги мо-
гут обмениваться блоками генов с бакте-
Часть IV. риальными хромосомами. Кроме того,
206 Информация плазмиды и фаги способны рекомбиниро-
Рис. 31.17. Синтез и клонирование ре- лась возможность создать в лабораторных
комбинантных молекул ДНК. условиях новые комбинации неродственных
генов. Затем эти новые геномы можно вве-
сти в подходящие клетки и размножить во
вать друг с другом. Было показано, что ге- много раз с помощью механизмов синтеза
нетический элемент, отвечающий за устой- ДНК клетки-хозяина. Некоторые из таких
чивость к тетрациклину, перемещается из введенных в клетки генов могут также тран-
плазмиды фактора R в фаг, размножающий- скрибироваться и транслироваться в новом
ся в клетках Salmonella, а оттуда в хромосо- окружении. Основные этапы клонирования
му Salmonella, затем в фаг λ и из фага λ в trp- ДНК сводятся к следующему (рис. 31.17).
оперон E. coli и обратно в фаг λ. Это 1. Создание рекомбинантной молекулы.
замечательное путешествие показывает, на- Интересующий исследователя фрагмент
сколько подвижны гены прокариот. Было ДНК ковалентно присоединяется к ДНК
бы интересно выяснить, обладают ли гены вектора. Основное свойство вектора со-
эукариот столь же высокой подвижностью. стоит в том, что он может автономно репли-
цироваться в подходящем хозяине. Напри-
31.8. В лаборатории можно сконструировать мер, плазмиды и фаг λ наиболее удобные
новые геномы и клонировать их векторы для клонирования генов в клетках
в клетках-хозяевах Е. coli. Как будет описано ниже, молекулы
Разработанная в последние годы техноло-
гия рекомбинантных ДНК - важнейшее до-
стижение молекулярной биологии. Появи- 31. Перестройки генов 207
Химерная ДНК -
рекомбинантная молекула ДНК, содержащая неродственные гены. От слова хи-
мера - мифологическое существо с головой льва, телом козла и хвостом змеи.
«...Коей порода была от богов, не от смертных: Лев головою, задом дракон
и коза серединой, Страшно дыхала она пожирающим пламенем бурным».
Гомер, «Илиада», пер. Н. Гнедича, гл. VI, стих 180.

ДНК можно соединить путем лигирования ной ДНК, не имеющий существенного зна-
(т.е. воздействием лигазы) фрагментов чения для репликации.
с липкими одноцепочечными концами или 3. Отбор. Следующий этап состоит в том,
же с тупыми концами. чтобы определить, какие клетки несут ре-
2. Введение в клетку-хозяина. Большин- комбинантную молекулу ДНК, содержа-
ство бактериальных и эукариотических кле- щую нужный ген. Такие клоны можно ото-
ток поглощает голые молекулы ДНК из брать по признаку присутствия вектора или
среды. Эффективность поглощения низка самого встроенного гена. Например, неко-
(примерно 1 на 106 молекул ДНК), но в спе- торые плазмидные векторы сообщают клет-
циально подобранных экспериментальных ке устойчивость к какому-либо антибиоти-
условиях можно трансформировать значи- ку. Другой подход состоит в том, чтобы
тельную часть клеток. Существует и другой определить, какие клетки связывают РНК,
метод: клетки заражают реконструиро- комплементарную нужному гену, или синте-
ванными вирионами, содержащими реком- зируют кодируемый им белок. Клоны, со-
бинантные молекулы ДНК. В таком синте- держащие рекомбинантную ДНК, ста-
тическом вирусном геноме интересующий бильны, по крайней мере в течение несколь-
исследователя ген замещает участок вирус- ких сотен поколений.
Клонирование рекомбинантной ДНК уже
внесло большой вклад в наши представле-
ния о структуре хромосомы и выражении ге-
на. Многие встроенные гены удалось раз-
множить путем клонирования, что дало
большие количества ДНК для определения
последовательности оснований и электрон-
но-микроскопических исследований. Кроме
того, с помощью этих клонов были синтези-
рованы в больших количествах белки, ко-
торые в обычных условиях образуются
в ничтожных количествах. Методы
рекомбинантных ДНК используются также
для изучения сложных геномов и регуляции
их выражения.

31.9. Ферменты рестрикции и ДНК-лигаза -


необходимые инструменты для получения
рекомбинантных молекул ДНК
Молекулы ДНК можно легко соединять in
vitro с помощью рестриктирующих эндону-
клеаз (разд. 24.27), ДНК-лигаз (разд. 24.15)
и других высокоспецифических ферментов,
Рис. 31.18. Электронная микрофотогра- действующих на ДНК. В эксперименте по
фия pSC101 - плазмидного век- получению рекомбинантной ДНК вектор
тора, использованного для подготавливают к соединению с клони-
клонирования ДНК. (Печа- руемым фрагментом путем расщепления
тается с любезного разрешения в одном определенном месте с помощью ре-
д-ра Stanley Cohen.) стрикционной эндонуклеазы. Например, не-
большую плазмиду pSC101 можно расще-
Часть IV. пить в одном месте ферментом рестрикции
208 Информация EcoR1. Если с помощью этого фермента две
Рис. 31.19. Соединение молекул ДНК к тетрациклину. Затем используют другой
с помощью метода липких кон- метод отбора для выявления клонов, содер-
цов. Одна из родительских мо- жащих плазмиду со встроенной ДНК.
лекул ДНК (показано зеленым Второй метод соединения двух нерод-
цветом) несет гены Р и Q, разде- ственных молекул ДНК основан на присое-
ленные участком рестрикции, динении poly(dА)-фрагментов к обоим
а другая (красный цвет) несет 3'-концам одной молекулы и poly(dТ)-фраг-
гены X и У. Одна из реком- ментов к обоим 3'-концам другой молекулы
бинантных молекул несет гены (рис. 31.20). Эти гомополимерные последо-
Р и У, а другая - Q и X. вательности синтезируются терминальной

Рис. 31.20. Соединение молекул ДНК с по- дезоксинуклеотидил-трансферазой (терми-


мощью наращивания poly (dA)- нальной трансферазой) - ферментом, при-
и poly(dT)-концов (коннек- соединяющим нуклеотиды к 3'-гидроксиль-
торным методом). ной группе цепи ДНК. Эта трансфераза
в отличие от ДНК-полимеразы не зависит
от матрицы, поэтому с ее помощью можно
цепи ДНК расщепить наискосок, то обра- присоединить последовательности из ну-
зуются комплементарные одноцепочечные клеотидов только одного тина (обычно дли-
концы (липкие концы). Предположим те- ной 100 остатков). Ро1у(dА)-концы одной мо-
перь, что фрагмент ДНК, который необхо- лекулы ДНК отжигают с poly(dT)-конца-
димо ввести в эту плазмиду, образован пу- ми другой. Длины этих концевых последова-
тем расщепления большой молекулы ДНК тельностей могут несколько колебаться,
эндонуклеазой EcoR1. Тогда одноцепо- поэтому, прежде чем соединить цепи ДНК-
чечные концы этого фрагмента будут ком- лигазой, бреши заполняют с помощью
плементарны концам расщепленной плаз- ДНК-полимеразы I. Точно так же можно ис-
миды. Теперь фрагмент ДНК и плазмиду пользовать для соединения различных мо-
можно подвергнуть отжигу и соединить лекул ДНК и концевые poly(dG)- и poly(dC)-
ДНК-лигазой (рис. 31.19). Затем бактерии последовательности.
инкубируют в присутствии этой смеси моле- Третий подход к соединению молекул
кул ДНК. Небольшую часть бактерий, несу-
щих плазмиду, отбирают, исходя из того
что pSC101 сообщает клеткам устойчивость 31. Перестройки генов 209
Рис. 31.21. Образование липких концов устойчивости к тетрациклину и ампицилли-
путем присоединения и расще- ну (сходный с пенициллином антибиотик).
пления химически синтезиро- Эту плазмиду пять различных рестриктаз
ванного линкера. расщепляют в каком-то одном определен-
ном месте каждая (рис. 31.22). Введение
ДНК в участок рестрикции EcoR1 не затра-
гивает генов устойчивости к антибиотикам.
ДНК сочетает преимущества метода липких В то же время введение ДНК в участки ре-
концов с универсальным характером стрикции HindIII, SalI или BamHI приводит
(dA—dТ)-метода (коннекторного). К концам к инактивации гена устойчивости к тетраци-
фрагмента ДНК или вектора ковалентно клину; это явление называется инактива-
присоединяют химически синтезированный цией вставкой (инсерционной инактива-
линкер, т.е. связующую цепь (длиной от ше- цией). Клетки, содержащие pBR322 со
сти до десяти пар оснований), чувстви- вставленной ДНК, устойчивы к ампицилли-
тельный к расщеплению каким-либо фер- ну, но чувствительны к тетрациклину; по-
ментом рестрикции. 5'-концы десятинуклео- этому их легко отобрать. Клетки, которые
тидного линкера и молекулы ДНК фосфо- не смогли воспринять ДНК вектора, чув-
рилируют полинуклеотидкиназой и соеди- ствительны к обоим антибиотикам, а клет-
няют лигазой фага Т4, которая может ки, содержащие pBR322 без вставки ДНК,
образовывать ковалентную связь между мо- к обоим антибиотикам устойчивы.
лекулами ДНК с тупыми концами. Если Другая группа векторов создана на осно-
обработать эти концевые участки соответ- ве плазмиды ColE1, кодирующей колицин
ствующим ферментом рестрикции, обра- Е - белковый токсин, убивающий некоторые
зуются липкие концы (рис. 31.21). Таким штаммы Е. coli. Преимущество использова-
образом, почти у любой молекулы ДНК ния этих колициногенных плазмид в качестве
можно вызвать образование липких концов,
соответствующих специфичности данного
фермента рестрикции.

31.10. Плазмиды и фаг лямбда -


наиболее подходящие векторы
для клонирования ДНК в бактериях
Для увеличения эффективности проникнове-
ния рекомбинантных ДНК в клетку и облег-
чения отбора содержащих такие молекулы
бактерий создаются новые векторы. Напри-
мер, плазмида pBR322 содержит гены
Рис. 31.22. Генетическая карта плазмиды
Часть IV. pBR322, несущей два гена
210 Информация устойчивости к антибиотикам.
для упаковки в головку фага λ. Длина ДНК,
которая может быть легко упакована в го-
ловку, достигает 75-105% длины генома ди-
кого типа. Однако достаточно длинный
фрагмент ДНК (скажем, длиной 10 kb),
вставленный между двумя концами ДНК
фага λ, позволяет такой рекомбинантной
молекуле ДНК (93% генома) быть упако-
ванной в головке (инкапсидироваться). По-
чти все инфекционные частицы λ, образо-
ванные таким способом, будут содержать
вставленный кусок чужеродной ДНК. Еще
одно преимущество использования этих ви-
рионов в качестве векторов состоит в том,
что они проникают в бактерии с гораздо бо-
лее высокой эффективностью, чем плаз-
миды. К настоящему времени разработаны
методы упаковки молекул ДНК in vitro
с образованием инфекционных вирионов λ.
Рис. 31.23. Электронная микрофотогра- Для использования в качестве векторов бы-
фия плазмид ColE1. (Печатает- ли сконструированы самые разнообразные
ся с любезного разрешения мутанты фага λ. Некоторые из них могут
д-ра Jack Griffith.) служить векторами для вставок фрагментов
ДНК, достигающих 40 kb.

векторов состоит в том , что их репликация 31.11. Из суммарной геномной ДНК,


не находится под строгим контролем. расщепленной рестриктирующими
В клетке, содержащей ColE1, обычно имеет- эндонуклеазами, можно выделить
ся 25 копий плазмиды. Обработка клеток с помощью клонирования определенные
хлорамфениколом блокирует синтез белка эукариотические гены
и репликацию клеточной хромосомы. Одна- Как уже говорилось в предыдущей главе, ис-
ко репликация ColE1 в этих условиях про- следование эукариотических геномов пред-
должается. В результате в клетках, обрабо- ставляет огромные трудности. Ген длиной
танных хлорамфениколом, может накапли- 1 kb составляет 2,5•10-4 генома Е. coli и все-
ваться 1000 копий ColE1, так что количество го лишь 3,4•10-7 генома млекопитающих.
этой плазмиды достигает примерно поло- Методы рекомбинантных ДНК позволяют
вины всей клеточной ДНК 1 . в настоящее время вводить эукариотический
Фаг λ - другой удобный вектор. Большие ген в Е. coli, что сильно упрощает задачу.
участки его ДНК, имеющей в длину 48 kb, Эксперимент начинается с частичного рас-
не являются необходимыми для литической щепления ДНК эукариотического генома,
инфекции или интеграции и могут быть за- чтобы получить случайные фрагменты со
мещены чужеродной ДНК. Были сконструи- средней длиной примерно 20 kb (рис. 31.25).
рованы мутантные фаги λ, предназначенные К концам этих фрагментов присоединяют
для клонирования ДНК. Один из этих му- синтетические линкеры, образуют липкие
тантов, который называется λgt = λ, содер- концы и затем присоединяют к какому-ни-
жит два участка расщепления EcoR1 вместо будь вектору, например к ДНК фага λ. При
пяти, имеющихся в фаге дикого типа упаковке ДНК в вирионы in vitro происхо-
(рис. 31.24). После расщепления цен- дит отбор рекомбинантных молекул ДНК,
тральный участок молекулы ДНК этого фа- содержащих большие вставки. Затем этими
га λ можно удалить. Два оставшихся куска рекомбинантными фагами заражают клетки
ДНК составляют вместе 72% длины всего Е. coli. Получается лизат, содержащий фраг-
генома. Это количество ДНК недостаточно менты эукариотической ДНК, заключенной
в фаги и размноженной примерно в мил-
1
Плазмида pBR322 создана на основе ColE1, лион раз. Этот лизат представляет собой би-
поэтому она обладает способностью точно так
же накапливаться в клетках в присутствии хлор-
амфеникола.- Прим. перев. 31. Перестройки генов 211
Рис. 31.24. В качестве вектора для клони- 31.12. Эукариотические гены могут
рования может быть использо- транскрибироваться в бактериальных
ван мутант фага λ. В ходе реак- клетках
ции упаковки фага происходит Рекомбинантные молекулы ДНК, содержа-
отбор молекул ДНК, содержа- щие бактериальные гены, часто экспресси-
щих вставку. руются в клетках Е. coli. Например, клони-
рование триптофанового оперона Е. coli
блиотеку клонированной эукариотической в составе плазмидного вектора ColE1 при-
ДНК. водит к образованию больших количеств
Затем в такой библиотеке можно прове- пяти биосинтетических ферментов, закоди-
сти отбор для идентификации фаговых кло- рованных в этом опероне. Количество этих
нов, содержащих нужный эукариотический ферментов примерно в 20 раз выше, чем
ген. Вычисление показывает, что лишь один в обычной клетке Е. coli, так как рекомби-
из 180000 клонов будет содержать уни- нантная плазмида представлена многими
кальный эукариотический ген. Поэтому не- копиями. ДНК дрожжей, простого эукарио-
обходима очень быстрая и эффективная тического организма, также может экспрес-
процедура отбора. Она основана на гибри- сироваться в бактериях. В одном исследова-
дизации. Присутствие определенной после- нии в качестве клетки-хозяина использовали
довательности ДНК в одной бляшке фага мутант Е. coli, нуждающийся в гистидине,
λ можно выявить с помощью радиоактивной так как он не содержал имидазолглицерол-
молекулы комплементарной ДНК или РНК фосфат-дегидрогеназы. При заражении это-
в качестве гибридизационной пробы. Связы- го мутанта фагом λ, содержащим фрагмент
вание этой пробы можно обнаружить мето- дрожжевой ДНК, появилось несколько бак-
дом радиоавтографии. Таким образом, мож- териальных клонов, которые уже не нужда-
но проверить 1 млн. клонов за один день. лись в экзогенном гистидине. Вставленный
Итак, клон, соответствующий определенно- кусок дрожжевой ДНК нес недостающий
му эукариотическому гену, можно легко ген, который экспрессировался с помощью
идентифицировать и выделить при условии, механизмов транскрипции и трансляции
что имеется транскрибированная с него бактериальной клетки.
РНК в более или менее чистом виде. Могут ли гены млекопитающих экспрес-
сироваться в бактериях? Для ответа на этот
Часть IV. вопрос в клетки Е. coli ввели ген инсулина
212 Информация крысы (рис. 31.26). Отправной точкой этого
кДНК -
комплементарная ДНК, синтезированная обратной транскриптазой на РНК-
матрице.

исследования послужила инсулинома - опу- дазы, локализованном в плазмидном векто-


холь поджелудочной железы, выделяющая ре. При трансформации E.coli начался син-
большое количество инсулина. Эта опухоль тез гибридного белка, в котором сомато-
богата мРНК препроинсулина, предше- статин был присоединен к β-галактозида-
ственника активного гормона (разд. 35.9). зе. Пептидную связь между этими двумя
С помощью обратной транскрипции этой компонентами расщепляли in vitro с по-
мРНК была получена двухцепочечная ком- мощью бромциана (разд. 2.7). Для этого
плементарная ДНК (кДНК), а затем ее встроенный ген содержал кодон метиони-
включили в плазмидный вектор. Почему
именно кДНК, а не геномную ДНК ввели
в Е. соli? Как мы уже говорили, многие эука-
риотические гены содержат вставочные по-
следовательности, которые вырезаются из
первичных транскриптов (разд. 29.16). По-
скольку бактерии, по всей вероятности, не
способны удалять эти последовательности,
представляется желательным трансформи-
ровать их участком ДНК, комплемен-
тарным зрелой мРНК. Действительно, ока-
залось, что несколько бактериальных кло-
нов, трансформированных инсулиновой
кДНК, синтезируют небольшое количество
предшественника инсулина (около 100 ко-
пий на клетку). Недавно был получен еще
один важный результат: последователь-
ность ДНК, кодирующая овальбумин кури-
ного яйца, экспрессируется в клетках Е. coli.
Около 1,5% белка, синтезированного в та-
ких трансформированных бактериях, пред-
ставляет собой полные молекулы овальбум-
ина (масса 43 кДа). Очевидно, гены эукарио-
тических белков могут экспрессироваться
в бактериях.

31.13. Химически синтезированный ген


пептидного гормона соматостатина
экспрессируется в клетках Е. coli
Последние достижения в химическом синте-
зе заданных последовательностей ДНК рас-
ширили масштаб и возможности метода ре-
комбинантных ДНК. Можно синтезировать
de novo гены с практически любой нуклео-
тидной последовательностью и вставить их
в вектор для введения в Е. coli. Прекрасным
примером такого подхода служит синтез ге-
на соматостатина - 14-членного пептида
(рис. 31.27), который обнаруживается в эк- Рис. 31.25. Стратегия клонирования опре-
страктах гипоталамуса. Соматостатин по- деленного эукариотического
давляет секрецию гормона роста, инсулина гена, начиная с расщепления
и глюкагона. Молекулу ДНК, кодирующую суммарной геномной ДНК.
этот пептид, синтезировали путем соедине-
ния восьми олигонуклеотидных блоков.
Этот ген соединили с геном β-галактози- 31. Перестройки генов 213
на перед первым кодоном соматостатина. ностей во многих эукариотических генах.
С-конец соматостатина был свободен, так Появилась возможность быстро картиро-
как после кодона последнего остатка пеп- вать сложные хромосомы и разделять их на
тида были расположены два стоп-кодона отдельные элементы, которые поддаются
(рис. 31.27). На долю химерного белка при- различным манипуляциям. Темпы исследо-
ходилась значительная часть клеточного ваний постоянно нарастают. Кроме того,
белка (около 3%). Более того, полученный клонирование генов становится важным
таким способом соматостатин обладал био- способом получения определенных белков
логической активностью. Следовательно, в больших количествах. Например, с по-
клонированием химически синтезированного мощью рекомбинантных молекул можно
гена можно получать функционально ак- увеличить в 500 раз количество ДНК-ли-
тивный полипептид. газы, образующейся в клетках Е. coli. На-
иболее многообещающим представляется
31.14. Перспективы клонирования генов синтез пептидов и белков эукариот транс-
Метод рекомбинантных ДНК открыл формированными бактериями. В недалеком
новые горизонты в молекулярной биологии. будущем такие гормоны, как инсулин, и та-
Увеличение числа генов путем клонирова- кие противовирусные агенты, как интерфе-
ния в бактериях дает неограниченные коли- рон, будут продуцироваться бактериями 1 .
чества ДНК для электронно-микроскопиче- В фармакологии начинается новая эра, ко-
ского анализа и определения последова- торая, по-видимому, окажет глубокое воз-
тельности нуклеотидов. Исследуются специ- действие на медицину. Исследуются также
фические участки ДНК, отвечающие за возможности клонирования генов для уве-
подвижность генов, репликацию ДНК личения сельскохозяйственного производ-
и транскрипцию. Возникают совершенно ства. Эукариотические гены вводят в на-
новые направления; примером может слу- стоящее время не только в бактерии, но и
жить открытие вставочных последователь- в эукариотические клетки. Например, вирус
SV-40 был использован в качестве вектора
для переноса гена глобина кролика в клет-
ки почек обезьяны. Такие зараженные клет-
ки синтезировали значительные количества
β-глобина кролика. Этот эксперимен-
тальный подход является многообещаю-
щим методом расшифровки регуляторных
механизмов экспрессии эукариотических ге-
нов.
Заключение
При генетической рекомбинации новая мо-
лекула ДНК образуется путем разрыва
и воссоединения цепей ДНК. Взаимообмен

Рис. 31.26. Синтез предшественника ин- может произойти между любой парой гомо-
сулина - проинсулина в транс- логичных последовательностей родитель-
формированных клетках Е. coli. ских молекул ДНК, и потому этот процес
называется общей генетической рекомбина-
цией. У Е. coli общая рекомбинация осу-
Часть IV. 1
В А н г л и и и США уже продается инсулин, син-
214 Информация тезированный клетками бактерий.- Прим. перев.
Рис. 31.27. Синтез пептидного гормона чивость к антибиотикам. Более крупные из
соматостатина клетками Е.со- этих плазмид содержат фактор переноса
li, трансформированными хи- устойчивости (RTF), обусловливающий
мически синтезированным ге- переход плазмиды в другую бактерию при
ном. коньюгации. Некоторые гены, обеспечиваю-
щие устойчивость к антибиотикам, могут
ществляется под действием генов rec. Белок быть сцеплены с областью RTF. Поэтому
recВС - нуклеаза; она образует одноцепо- множественная устойчивость к лекар-
чечную ДНК, которая может внедряться ственным средствам может быть трансмис-
в двухцепочечную молекулу ДНК. Эта реак- сивной. Транспозоны обладают высокой
ция связывания одноцепочечной молекулы подвижностью, так как они обрамлены IS-
катализируется белком recА, который одно- элементами. Эти концевые последователь-
временно гидролизует АТР. ности направляют действие белков, уча-
В генетических перестройках негомоло- ствующих в их интеграции с ДНК. Транспо-
гичных локусов участвуют подвижные гене- зон не обязательно гомологичен реципиент-
тические элементы, называемые транспозо- ной ДНК.
нами (элементы, способные к переносу - В лаборатории можно создать новые со-
транспозиции). Плазмиды (небольшие коль- четания неродственных генов и клонировать
цевые двухцепочечные ДНК) - важный класс их в клетках-хозяевах. Прежде всего синте-
подвижных генетических элементов. Эти до- зируется рекомбинантная молекула ДНК
полнительные хромосомы несут гены, отве- путем соединения какого-либо фрагмента
чающие за инактивацию антибиотиков, мета- ДНК с ДНК вектора, который может авто-
болизм природных соединений и образова- номно реплицироваться в подходящем хо-
ние токсинов. Плазмиды могут реплициро- зяине. Наиболее подходящие векторы - фаг
ваться автономно или интегрировать лямбда, вирус SV-40 и плазмиды. Ферменты
с хромосомой клетки-хозяина. Фактор рестрикции и ДНК-лигаза - основные ин-
F (фактор плодовитости) - плазмида, сооб- струменты для получения новых молекул
щающая бактериям способность передавать ДНК. Липкие концы, гомополимерные кон-
гены другим бактериям путем коньюгации. цевые фрагменты и химически синтезиро-
Для коньюгации необходим непосред- ванные линкеры - три способа соединения
ственный физический контакт между донор-
ной (F + ) и реципиентной (F - - ) клетками.
Плазмиды факторы R обеспечивают устой- 31. Перестройки генов 215
молекул ДНК. Рекомбинантные молекулы coli определенные эукариотические гены.
ДНК можно ввести в клетки-хозяева, зара- Многие эукариотические гены могут тран-
жая их реконструированным вирусом или скрибироваться и транслироваться в бакте-
инкубируя их в присутствии голых молекул риальных клетках. Клонирование генов —
ДНК. Последний этап заключается в отборе мощный метод исследования организации
клеток, несущих нужную молекулу реком- и выражения сложных генов. Кроме того,
бинантной ДНК, с использованием какого- технология рекомбинантных ДНК - весьма
либо отличительного свойства введенного многообещающий метод для синтеза боль-
гена (например, устойчивости к антибиоти- ших количеств генов и белков, имеющихся
ку). Имея рестриктазный гидролизат геном- в обычных клетках в ничтожных количе-
ной ДНК, можно клонировать в клетках Е. ствах.

РЕКОМЕНДУЕМАЯ duplex DNA for homologous pairing, construction of bacteriophage л carrying


ЛИТЕРАТУРА Nature, 281, 191-195. segments of the Escherichia coli
Radding C.M., 1978. Genetic recom- chromosome: selection of hybrids
С чего начать bination: strand transfer and mismatch containing the gene for DNA ligase,
Gilbert W., Villa-Komaroff L., 1980. Us- repair, Ann. Rev. Biochem., 47, 847-880. Proc. Nat. Acad. Sci., 72, 3416-3420.
eful proteins from recombinant bacteria, Подвижные генетические элементы Collins J., Hohn B., 1978. Cosmids:
Sci. Amer., 242(4), 74-94. Calos M.P., Miller J.H., 1980. Trans- a type of plasmid gene-cloning vector
Cohen S.N., Shapiro J.A., 1980. posable elements, Cell, 20, 579-595. that is pack adeable in vitro in
Transposable genetic elements, Sci. Cohen S.N., 1976. Transposable genetic bacteriophage heads, Proc. Nat. Acad.
Amer., 242(2), 40-49. elements and plasmid evolution, Nature, Sci, 75, 4242-4246.
Abelson J., Butz E. (eds.), 1980. 263, 731-738. Maniatis Т., Hardison R.C., Lacy E.,
Recombinant DNA, Science, 209, Kleckner N.. 1977. Translocatable ele- Lauer J., O'Connell C., Quon D.,
1317-1438. (Этот весьма содержа- ments in procaryotes, Cell, 11, 11-23. Sim G.K., Efstratiadis A., 1978. The
тельный выпуск журнала Science со- Hicks J., Strathern J.N., Klar A.J.S., isolation of structural genes from
держит много прекрасных статей, по- 1979. Transposable mating type genes in libraries of eucaryotic DNA, Cell, 15,
священных структуре и изменениям Saccharomyces cerevisiae, Nature, 282, 687-701.
генов эукариот и экспрессии клониро- 478-483.
Экспрессия клонированных генов
ванных генов.) Gill R.E., Heffron F.. Falkow S., 1979. Villa-Komaroff L, Efstratiadis A.,
Clowes R.С., 1973. The molecule of Identification of the protein encoded by
Broome S., Lomedico P., Tizard R.,
infectious drug resistance, Sci. Amer., the transposable element Tn3 which is
Naber S.P., Chick W.L., Gilbert W.,
228(4), 18-27. required for its transposition, Nature, 1978. A bacterial clone synthesizing
Cohen S.N., 1975. The manipulation of 282, 797-801.
proinsulin, Proc. Nat. Acad. Sci., 75,
genes, Sci, Amer., 233(1), 24-33. (Эта Chou J., Lemaux P.G.,Casadaban M.J.,
3727-3731.
и некоторые другие статьи, посвя- Cohen S.N.. 1979. Transposition protein
Burrell C.J., Mackory P., Greena-
щенные той же проблеме, помещены of Tn3: identification and characte-
way P.J., Hofschneider P.H., Murray
в книге Freifelder D. (ed.), Recombinant risation of an essential represser-con-
K., 1979. Expression in Escherichia coli
DNA, Freeman, 1978.) trolled gene product, Nature, 282, of hepatitis В virus DNA sequences
Stanier R.Y., Adelberg E.A., Ingra- 801-806.
cloned in plasmid pBR322, Nature, 279,
ham J.L., 1976. The Microbial World Bukhari A.I., Shapiro J.A., Adhya S.L.
43-47.
(4 th ed.), Prentice-Hall. (Особенно (eds.), 1977. DNA Insertion Elements
Mulligan R.C., Howard B.H., Berg P.,
удачна гл. 15, посвященная рекомби- and Episomes, Cold Spring Harbor
1979. Synthesis of rabbit β-globin in cul-
нации, конъюгации и трансдукции.) Laboratory.
Broda P., 1979. Plasmids, Freeman. tured monkey kidney cells following
[Брода П. Плазмиды.- М.: Мир, infection with a SV40 β-globin re-
Генетическая рекомбинация
combinant genome, Nature, 277,
Stahl F.W., 1979. Genetic Recom- 1982.]
108-114.
bination, Freeman. Конструирование и клонирование
Potter H., Dressler D., 1978. In vitro рекомбинантных генов Химический синтез генов
system from Escherichia coli that Setlow J.K., Hollaender A. (eds.), 1979. Khorana H.G., 1979. Total synthesis of
catalyzes generalized genetic recom- Genetic Engineering: Principles and a gene, Science, 203, 614-625.
bination, Proc. Nat. Acad. Sci., 75, Methods, Plenum. Itakura K., Hirose Т., Crea R.,
3698-3702. Scott W.A., Werner R., 1977. Molecular Riggs A.D., Heyneker H.L, Bolivar F.,
McEntee K., Weinstock G.M., Leh- Cloning of Recombinant DNA, Boyer H.W., 1977. Expression in
man I.R., 1979. Initiation of general Academic Press. Escherichia coli of a chemically
recombination catalyzed in vitro by the Helinski D.R., 1978. Plasmids as vehicles synthesized gene for the hormone
recA protein of E. coli, Proc. Nat. Acad. for gene cloning: impact on basic and somatostatin, Science, 198, 1056-1063.
Sci., 76, 2615-2619. applied research, Trends Biochem. Sci., Crea R., Kraszewski A., Hirose Т.,
Cunningham R.P., Shibata Т., Gas- 3, 10-14. Itakura K., 1978. Chemical synthesis of
Gupta С., Radding C.M., 1979. Single Cameron J.R., Panesenko S.M., Leh- genes for human insulin, Proc. Nat.
strands induce recA protein to unwind man I.R., Davis R.W., 1975. In vivo Acad. Sci., 75, 5765-5769.
Молекулярная
физиология
Взаимосвязь между информацией,
конформацией и метаболизмом в
Часть физиологических условиях

Микрофотография палочек
сетчатки, полученная с по-
мощью сканирующего микро-
скопа. Для возбуждения палоч-
ки достаточно одного фотона.
(Печатается с любезного разре-
шения д-ра Deric Bownds.)
ГЛАВА 32 ной клеточной стенкой толщиной, как пра-
вило, 250 А, состоящей из пептидогликана
Оболочки и тейхоевой кислоты. У грам-отрица-
тельных бактерий клеточная оболочка
бактериальных клеток устроена более сложно: плазматическая
Бактериальные клетки в отличие от жи- мембрана окружена клеточной стенкой тол-
вотных клеток окружены клеточной стен- щиной 30 А, состоящей из пептидогликана;
кой, которая придает им определенную фор- далее располагается наружная мембрана
му и служит механической опорой. Одна толщиной 80 А, представляющая собой мо-
клеточная мембрана не способна выдержать заику белков, липидов и липополисахари-
то высокое осмотическое давление, которое дов.
создается в бактериальной клетке вслед-
ствие большой концентрации метаболитов
и которое может достигать 20 атм. Бакте-
риальные клетки, лишенные клеточных сте-
нок, в обычной среде лизируются.
Стенки бактериальных клеток предста-
вляют значительный интерес для медицины.
Дело в том, что именно клеточные стенки
и связанные с ними вещества определяют
вирулентность бактерий. Так, введением
экспериментальным животным выделенных
бактериальных клеточных стенок удается
воспроизвести симптомы многих ми-
кробных заболеваний. На клеточных стен-
ках находятся специфические антигены бак-
терий. Введением животному экстракта
клеточных стенок некоторых бактерий мож-
но выработать у него иммунитет к этим бак-
териям. Наконец, при подавлении синтеза
клеточных стенок бактерии погибают.
Именно на этом основан механизм действия
пенициллина и некоторых других антибиоти-
ков.
Уже более полувека бактерии классифи-
цируют на грам-положительные и грам-
отрицательные в зависимости от их реакции
на окраску по Граму. Основа этого эмпири-
чески найденного различия стала теперь по-
нятной. Указанные классы бактерий разли-
чаются по типу клеточной оболочки
(рис. 32.2). Плазматическая мембрана грам- Рис. 32.1. Электронная микрофотогра-
положителъных бактерий окружена массив- фия выделенной клеточной
стенки Bacillus licheniformis.
Часть V. (Печатается с любезного разре-
218 Молекулярная физиология шения д-ра Nathan Sharon.)
Рис. 32.2. Схематическое изображение в его состав остаток D-глутамина образует
клеточных оболочек грам-по- пептидную связь с γ-карбоксильной груп-
ложительных (А) и грам-отри- пой своей же боковой цепи.
цательных (Б) бактерий. В интактном протеогликане NAG и NAM
чередуются последовательно, образуя ли-
нейную полисахаридную цепь. Пентаглици-
32.1. Клеточная стенка - это огромная новый пептид соединяет остатки NAM,
мешковидная макромолекула принадлежащие разным полисахаридным
Рассмотрим структуру и биосинтез клеточ-
ной стенки Staphylococcus aureus - грам-по-
ложительной бактерии, вызывающей
гнойные процессы в таких тканях, как кожа,
кости и легкие. Макромолекула, образую-
щая клеточную стенку этой бактерии, назы-
вается пептидогликаном, поскольку она со-
стоит из пептидных и углеводных единиц.
В пептидогликане линейные полисахаридные
цепи поперечно сшиты короткими пептида-
ми. Благодаря обилию поперечных сшивок
возникает одна огромная мешковидная ма-
кромолекула. В выделенном состоянии кле-
точные стенки сохраняют свою исходную
форму (т.е. форму той бактерии, которую
они окружали).
В состав пептидогликана входят три по-
вторяющиеся единицы (рис. 32.3): 1) диса-
харид N-ацетилглюкозамина (NAG) и N-
ацетилмурамовой кислоты (NAM), соеди-
ненных β-1,4-гликозидной связью; 2) тет-
рапептид из L-аланина, D-глутамина, L-ли-
зина, и D-аланина; 3) пентаглициновый пеп- Рис. 32.3. Основное структурное звено
тидный мостик. Тетрапептид представляет пептидогликана из Staphylo-
собой совершенно необычное соединение coccus aureus.
в двух отношениях: в нем содержатся
D-аминокислоты, никогда не встречающие- 32. Оболочки бактериальных
ся в белках, и, кроме того, входящий клеток 219
цепям. Аминогруппа пептида (Gly)5 обра- единение способен совершать челночные
зует пептидную вязь с карбоксильной груп- движения через мембрану.
пой D-аланина, тогда как карбоксильная 3. К NAM-пептидной единице, связанной
группа (Сlу)5 дает пептидную связь с ε-ами- с липидным переносчиком, присоединяются
ногруппой боковой цепи L-лизина. NAG и пентаглициновый мостик.
4. Образовавшееся дисахарид-пептидное
32.2. Стадии синтеза пептидогликана звено переносится от липидного переносчика
Синтез пептидогликана происходит в пять на растущую полисахаридную цень.
стадий. 5. Отдельные полисахаридные цепи попе-
1. На остатке NAM, присоединенном речно связываются пентаглициновыми мо-
к уридиндифосфату, выстраивается пептид- стиками в ходе реакции транспептидации.
ное звено.
2. Образовавшееся NAM-пептидное звено 32.3. Синтез UDP-углевод-пептидного
переносится на липид-переносчик. Значение звена
этой стадии для синтеза клеточной стенки Биосинтез пептидогликанов начинается с
состоит в следующем. Конечный полимери- образования активированных сахаров. Ури-
зованный продукт расположен вне клетки (с диндифосфат-N-ацетилглюкозамин (UDP-
наружной стороны клеточного барьера про- NAG) синтезируется из N-ацетилглюкоз-
ницаемости), тогда как его предшественник амин-1-фосфата и UTP в реакции, проте-
синтезируется внутри клетки. UDP, будучи кающей за счет гидролиза пирофосфатной
соединением полярным, не проникает связи (рис. 32.5). Уридиндифосфат-N-аце-
сквозь клеточную мембрану. Липидный же тилмурамовая кислота (UDP-NAM) обра-
переносчик как совершенно неполярное со- зуется из UDP-NAG и фосфоенолпирувата
(рис. 32.6).
Рост пептидной цепи начинается с образо-
вания пептидной связи между аминогруп-
пой L-аланина и карбоксильной группой
остатка N-ацетилмурамовой кислоты
в UDP-NAM. Далее последовательно при-
соединяются D-глутамат, L-ЛИЗИН и дипеп-
тид D-аланил-D-аланин (рис. 32.7). D-амино-
кислоты образуются из соответствующих
L-изомеров под действием рацемаз, содер-
жащих в качестве простетической группы
пиридоксальфосфат. Образование каждой
из этих пептидных связей протекает за счет
энергии АТР. Подчеркнем, что синтез в дан-
ном случае осуществляется не по обычному
механизму синтеза белков на рибосомах,
а специальными ферментами. Следователь-
но, информация относительно последова-
тельности аминокислот определяется толь-
ко специфичностью ферментов, а не нуклео-
тидной последовательностью информа-
Рис. 32.4. Схематическое изображение ционной РНК. Пептид такого рода не мог
пептидогликана. Сахара пока- бы быть синтезирован обычным путем на
заны желтым цветом, тетра- рибосомах, поскольку он включает D-ами-
нокислоты и γ-пептидную связь.
пептиды - красным, пентагли-
циновые мостики синим. Бла-
годаря обилию перекрестных 32.4. Перенос углевод-пептидного звена
сшивок клеточная стенка пред- на липидный переносчик
ставляет собой одну огромную На следующем этапе происходит перенос
мешковидную макромолекулу. активированного углевод-пептидного звена
от UDP на липидный переносчик (рис. 32.8).
Часть V. Последний представляет собой длиннонепо-
220 Молекулярная физиология чечный спирт, содержащий 11 изопреновых
Рис. 32.5. Синтез UDP-NAG.

Рис. 32.6. Синтез UDP-NAM. 32.5. Синтез дисахарид-пептидного звена,


прикрепленного к липидному переносчику
Следующий этап - присоединение NAG
единиц и потому высокогидрофобный в от- к остатку NAM в углевод-пептидном звене,
личие от UDP. По-видимому, именно бла- прикрепленном к липидному переносчику.
годаря гидробофному характеру этого Донор активированного углевода UDP-
С 55 -липида новообразованное углевод-пеп- NAG вступает в реакцию с С-4 остатка NAM
тидное звено преодолевает барьер прони- и между этими сахарами образуется β-1,4-
цаемости, которым служит клеточная мем- гликозидная связь (рис. 32.9). Далее в ходе
брана. АТР-зависимой реакции NH4+ амидирует

Вспомним, что другой высокогидро- свободную α-карбоксильную группу D-глу-


фобный переносчик - долихолфосфат - уча- таминовой кислоты в пептиде. Вслед за этим
ствует в синтезе олигосахаридов, соста- на ε-аминогруппе остатка лизина в пептиде
вляющих сердцевину (олигосахаридного выстраивается пентаглициновый мостик.
«ядра») гликопротеинов у эукариот
(разд. 29.31). 32. Оболочки бактериальных
клеток 221
Рис. 32.7. Синтез пентапептида на
UDP-NAM.

Рис. 32.8. Структура липидного перено-


счика, участвующего в биосин-
тезе клеточных стенок.

Рис. 32.9. Синтез дисахарид-пептидного ция протекает таким ооразом. Атом углеро-
звена на липидном переносчи- да С-1 остатка NAM находится в активиро-
ке. ванном состоянии, поскольку он связан
с липидным переносчиком пирофосфатной
связью. Поэтому он вступает в реакцию
Этот пентапептид синтезируется путем по- с С-4 концевого остатка NAG растущей по-
следовательного присоединения глициновых лисахаридной цепи, образуя в итоге β-1,4-
остатков, доставляемых глицил-тРНК. Это гликозидную связь (рис. 32.10).
единственный случай, когда тРНК служит Липидный переносчик высвобождается
донором аминокислот в ходе внерибосом- в форме пирофосфата и далее гидролизует-
ного синтеза пептида. На этом завершается ся до монофосфата специфической фосфата-
образование основной структурной еди- зой. Этот этап дефосфорилирования пред-
ницы клеточной стенки. ставляет собой, по существу, регенерирова-
ние переносчика, способного акцептировать
32.6. Перенос дисахарид-пептидного звена углевод-пептидное звено от UDP. Известен
на растущую полисахаридную цепь пептидный антибиотик бацитрацин, ингиби-
Дисахарид-пептидное звено переносится ли- рующий биосинтез клеточных стенок путем
пидным переносчиком на нередуцирующий торможения этого этапа:
конец растущей полисахаридной цепи. Реак-

Часть V.
222 Молекулярная физиология
Рис. 32.10. Перенос дисахарид-пептидно- церола (или другого углевода, например ри-
го звена на растущую полиса- битола), соединенных фосфодиэфирными
харидную цепь. мостиками (рис. 32.12). Свободные гидрок-
сильные группы этерифицируются с алани-
ном или сахарами, в частности с глюкозой.
32.7. Поперечные мостики между Тейхоевая кислота присоединяется к скелету
полисахаридными цепями образуются пептидогликана - последовательности
в реакции транспептидирования остатков NAG-NAM - фосфодиэфирной
В результате реакции транспептидирования связью. Удлинение цепей тейхоевой кис-
между полисахаридными цепями образуют- лоты происходит путем переноса глицерол-
ся поперечные сшивки, что приводит к фор- фосфата от CDP-глицерола на свободную
мированию одной огромной молекулы, на- концевую ОН-группу цепи. Остатки глю-
поминающей по виду мешок. В ходе козы присоединяются к гидроксильным
транспептидирования концевая аминогруппа группам скелета тейхоевой кислоты в ходе
одного пентаглицинового мостика атакует реакции с UDP-глюкозой.
пептидную связь между остатками
D-Ala-D-Ala другой пептидной единицы
(рис. 32.11). При этом образуется пептидная
связь между глицином и одним из остатков
D-аланина, а второй остаток D-аланина выс-
вобождается. Фермент, катализирующий
эту реакцию,- гликопептид-транспептидаза.
Обратите внимание, что синтез этой попе-
речной связи не требует расхода АТР: реак-
ция идет за счет свободной энергии, уже со-
держащейся в связи D-Аlа-D-Аlа. Формиро-
вание пептидной связи таким необычным
способом определяется, очевидно, тем, что
реакция протекает вне клетки, т.е. в остсут-
ствие АТР. Вспомните, что путем трансами-
нирования без использования АТР обра- Рис. 32.11. Аминогруппа пентаглициново-
зуются пептидные связи при поперечной го мостика атакует пептидную
сшивке нитей фибрина (разд. 8.21). связь между двумя остатками
D-Ala; в результате форми-
32.8. У грам-положительных бактерий руется поперечная связь (сшив-
пептидогликан покрыт тейхоевой кислотой ка).
Поверхность грам-положительных бакте-
рий состоит из тейхоевой кислоты, которая 32. Оболочки бактериальных
представляет собой полимер остатков гли- клеток 223
стить активный антибиотик, по его словам,
оказалось, что «пенициллин легко разру-
шается, и, несмотря на все усилия, мы потер-
пели неудачу. Мы были бактериологи, а не
химики, и наши относительно простые при-
емы не принесли успеха».
Прошло 10 лет, прежде чем к пеницилли-
ну вернулись снова. Патолог Хоуард Флори
(Howard Florey) и биохимик Эрнст Чейн
(Ernst Chain) провели ряд глубоких исследо-
ваний, итогом которых явилось выделение,
химическая характеристика и клиническое
использование этого антибиотика. Пени-
циллин состоит из тиазолидинового кольца,
сочлененного с β-лактамным кольцом,
в одном из положений которого находится
тот или иной заместитель (R), присоеди-
ненный с помощью пептидной связи. В бен-
зилпенициллине, например, R является бен-
зильной группой (рис. 32.13 и 32.14). Эта
Рис. 32.12. Строение тейхоевой кислоты. структура может подвергаться различным
трансформациям, что служит причиной ла-
32.9. Пенициллин вызывает гибель бильности пенициллина, с которой впервые
растущих бактерий, ингибируя синтез столкнулся Флеминг. Особенно неустойчи-
клеточных стенок во β-лактамное кольцо. Как будет показано
Пенициллин был открыт в 1928 г. Алексан- ниже, это свойство имеет прямое отношение
дером Флемингом (Alexcander Fleming) до- к антибиотической активности пеницил-
вольно случайно. лина.
При работе с различными штаммами стафи- В 1957 г. Джошуа Ледерберг (Joshua
лококка часть чашек с культурами откладыва- Lederberg) показал, что бактерии, в обычных
ли в лабораторную коллекцию и время от условиях чувствительные к пенициллину,
времени просматривали. Поскольку, когда могут расти в присутствии этого антибиоти-
чашки просматривали, их приходилось откры-
вать, в чашки неизбежно попадали из воздуха ка, если используется гипертоническая сре-
различные микроорганизмы. Обратили внима- да. Выращенные таким образом микроорга-
ние на то, что вокруг большой колонии пророс- низмы, так называемые протопласты, ли-
шей плесени колонии стафилококка стали про-
зрачными и явно подвергались лизису.
Плесень пересеяли и далее стали проводить
предварительное изучение того бактериологи-
ческого вещества, которое, очевидно, синтези-
ровалось плесенью и диффундировало в окру-
жающую среду. Оказалось, что бульон,
в котором на протяжении 1-2 недель при ком-
натной температуре культивировали плесень,
приобретал выраженные ннгибирующие, бак-
терицидные и бактериолитические свойства
в отношении многих распространенных пато-
генных бактерий.
Далее было обнаружено, что экстракт из
плесени Pinicillium при введении животным
не оказывал заметного токсического дей- Рис. 32.13. Высокореакционноспособный
ствия. Это послужило стимулом для даль- участок пенициллина - пептид-
нейших исследований. Однако, когда Фле- ная связь β-лактамного кольца.
минг попытался сконцентрировать и очи- В положении R могут стоять
различные заместители (вариа-
Часть V. бельная группа); в бензилпени-
224 Молекулярная физиология циллине R - бензильная группа.
шены клеточных стенок и потому при имеет напряженную конформацию, вслед-
переносе в обычную среду подвергаются ли- ствие чего пептидная связь в нем становится
зису. Отсюда был сделан вывод, что пени- высокореакционноспособной. В сущности,
циллин препятствует синтезу клеточных сте- пенициллин имеет, по-видимому, структуру
нок бактерий. В 1965 г. Джеймс Парк переходного состояния нормального суб-
и Джек Стромингер (James Park, Jack страта этого фермента. Другими словами.
Strominger) независимо друг от друга при- пенициллин - аналог переходного состояния.
шли к выводу, что пенициллин блокирует Любопытно сравнить пенициллин с дру-
последний этап биосинтеза, а именно обра- гими необратимыми ингибиторами фермен-
зование поперечных сшивок. тов. Стабильный, неактивный пеницилли-
ноил-ферментный комплекс совершенно
32.10. Пенициллин блокирует синтез аналогичен фосфорил-ферментному ком-
клеточных стенок путем ингибирования плексу, образующемуся при взаимодействии
реакции транспептидирования органических фторфосфатов с ацетилхолин-
Пенициллин ингибирует транспептидазу, эстеразой или сериновыми протеиназами.
поперечно сшивающую цепи протеоглика- Однако специфичность пенициллина намно-
на: го выше, чем у фторфосфатных ингибито-

При нормальном течении реакции транс- ров. Мишень действия пенициллина очень
пептидаза образует в качестве промежуточ- строго задана его структурным сходством
ного продукта ацильное производное с остат- с концевым участком D-Аlа-D-Аlа новообра-
ком D-аланина в предпоследнем положении зующейся цепи пептидогликана. След-
пептида (рис. 32.15). Этот промежуточный ствием этой исключительной специфичнос-
продукт взаимодействует далее с амино- ти является низкая токсичность пеницилли-
группой концевого глицина другого пепти- на, столь ценная при клиническом использо-
да. Как показали недавно проведенные ис- вании. В организме человека нет ни одного
следования, пенициллин ингибирует транс- фермента, распознающего D-Ala-D-Ala, а по-
пептидазу путем образования ковалентной тому пенициллин не может помешать рабо-
связи с остатком серина в активном центре те наших ферментов.
фермента (рис. 32.16). Комплекс пеницилли-
ноил-фермент не подвергается деацилирова- 32.11. Некоторые бактерии резистентны
нию. В результате ингибирование транспеп- к пенициллину, так как синтезируют
тидазы пенициллином оказывается необра- разрушающий его фермент
тимым. Ряд бактерий синтезирует пенициллиназу -
Почему пенициллин является столь эф- фермент, способный расщеплять амидную
фективным ингибитором транспептидазы? связь в β-лактамном кольце пенициллина
С помощью молекулярных моделей было с образованием пенициллоиновой кислоты,
выявлено, что пенициллин сходен с одним из лишенной антибиотической активности:

субстратов фермента, а именно с ацил-D-


Ala-D-Ala (рис. 32.17). Кроме того, четырех- 32. Оболочки бактериальных
членное β-лактамное кольцо пенициллина клеток 225
мам, клеточная стенка которых образована
пептидогликаном. Судя по тому, что утрата
гена пенициллиназы не вызывает поврежде-
ния клетки в отсутствие антибиотика, у фер-
мента, видимо, нет иной функции, кроме
инактивации пенициллина. К тому же
имеется хорошая корреляция между сте-
пенью устойчивости к действию пеницил-
лина и общей пенициллиназной актив-
ностью.

32.12. Грам-отрицательные бактерии


окружены наружной мембраной,
богатой липополисахаридами
Как уже упоминалось, клеточная оболочка
грам-отрицательных бактерий устроена бо-
Рис. 32.14. Модель бензилпенициллина. лее сложно, чем клеточная оболочка грам-
положительных бактерий. У грам-отрица-
тельных микроорганизмов (например,
Был выделен целый ряд близких по струк- Escherichia coli или Salmonella typhimurium)
туре пенициллиназ, имеющих массу около слой пептидогликана окружен наружной
30 кДа и высокое число оборотов (порядка мембраной, содержащей фосфолипиды, бел-
103 с - 1 ) . Активность фермента в значитель- ки и липополисахариды. Эта наружная мем-
ной мере зависит от природы R-группы, брана, подобно плазматической, имеет
присоединенной к β-лактамному кольцу пе- структуру бислоя. Итак, грам-отрица-
нициллина. Поэтому полусинтетические пе- тельные бактерии имеют две мембраны,
нициллины с R-группами, защищающими а грам-положительные - одну. Особенность
их от действия пенициллиназы, представ- грам-отрицательных бактерий состоит так-
ляют большую ценность для клинических же в наличии водной прослойки между плаз-
целей. матической мембраной и пептидогли-
Ген, кодирующий пенициллиназу, локали- кановым слоем. В этом периплазматичес-
зован в различных плазмидах (разд. 31.6). ком пространстве содержится много бел-
Эти внехромосомные генетические эле- ков, участвующих в связывании и транспор-
менты у некоторых видов бактерий спо- те сахаров и других питательных веществ
собны быстро появляться и исчезать. В ряде (разд. 37.20).
бактериальных штаммов пенициллиназа Липополисахариды (ЛПС) наружной мем-
является индуцируемым ферментом. По-ви- браны представляют собой крайне необыч-
димому, пенициллиназа возникла в ходе эво- ные соединения, молекулы которых состоят
люции как механизм детоксикации, посколь- из трех частей: липида А, олигосахаридов
ку она свойственна только микроорганиз- сердцевины («ядра») и О-боковой цепи

Рис. 32.15. В ходе реакции транспептиди-


рования в качестве промежу-
точного продукта образуется
ацил—фермент.

Часть V.
226 Молекулярная физиология
Рис. 32.16. Образование пенициллином
ферментного комплекса, обла-
дающего неограниченной ста-
бильностью.

Рис. 32.18. Молекула липополисахарида


состоит из трех частей: липи-
Рис. 32.17. Конформация пенициллина да А, олигосахаридного «ядра»
в области высокореакционно- и О-боковой цепи. Здесь пока-
способной пептидной связи (А) зана последовательность саха-
сходна с предполагаемой кон- ров, характерная для Salmonella
формацией структуры R-D- typhimurium. Сокращения:
Ala-D-Ala (Б) в переходном Abe - абеквоза; EtN - этанол-
состоянии при протекании амин; Gal-галактоза; Glc-
реакции транспептидирования. глюкоза; GlcN - глюкоза-
[Lee В., J.Mol.Biol., 61, 464 мин; GlcNAc - N-ацетил-
(1971).] глюкозамин; Hep - гептуле-
за; KDO - 2-кето-3-дезокси-
октонат; Man - манноза;
(рис. 32.18). Липид А - это гидрофобная Rha - L-рамноза.
часть большой (10 кДа) амфипатической
молекулы. Он включает шесть цепей насы- область олигосахаридного «ядра». Здесь де-
щенных жирных кислот, присоединенных сять углеводных единиц вынесено кнаружи
к двум остаткам глюкозамина. Эти от липида А; еще более наружно распола-
ацильные цепи составляют примерно поло- гается О-боковая цепь, состоящая из боль-
вину наружного слоя наружной мембраны. шого числа повторяющихся тетрасаха-
Внутренний слой вместо цепей жирных кис-
лот содержит фосфолипиды (рис. 32.19). Да- 32. Оболочки бактериальных
лее в молекуле липополисахарида идет клеток 227
хариды сердцевины и О-боковая цепь
высоко гидрофильны. Ряд сахаров в липо-
полисахариде фосфорилирован, и потому
молекула полисахарида в целом имеет от-
рицательный заряд.
Липополисахариды синтезируются в плаз-
матической мембране и затем транспорти-
руются в наружную мембрану. Сначала син-
тезируется липид А, а затем путем последо-
вательного присоединения сахаров (донора-
ми активированных сахаров служат соеди-
нения типа UDP-глюкозы или UDP-галак-
Рис. 32.19. Молекулы липополисахаридов тозы) образуется полисахаридное «ядро».
локализованы в наружном О-боковая цепь собирается иным путем.
слое, тогда как фосфолипиды - Ее повторяющееся тетрасахаридное зве-
во внутреннем слое наружной но синтезируется на том же самом
мембраны. С55-изопреноидном липидном переносчике,
который участвует в синтезе пептидоглика-
на (разд. 32.4). Растущая цепь таких единиц
удлиняется путем переноса олигосахарида
с одной молекулы переносчика на тетраса-
харидное звено, связанное с другой молеку-
лой переносчика (рис. 32.21). Аналогичный
способ удлинения имеет место при синтезе
жирных кислот (разд. 17.18) и белков
(разд. 27.16). Наконец, О-боковая цепь при-
соединяется к концу олигосахаридного
«ядра». По-видимому, повторяющийся те-
трасахарид О-боковой цепи образуется во
внутреннем слое плазматической мем-
браны, затем переносится в наружный слой
и там присоединяется к растущей цепи. Пол-
ностью сформированная молекула липопо-
лисахарида транспортируется из плазмати-
ческой мембраны в наружную, по-видимо-
му, в тех участках, в которых эти структуры
соприкасаются.

32.13. Благодаря разнообразию


О-боковых цепей грам-отрицательные
Рис. 32.20. Формулы ряда редких сахаров, бактерии противостоят защитным силам
входящих в состав липополиса- организма-хозяина
харидов. Липополисахариды содержат в высшей
степени необычные сахара и своеобразные
ридных единиц. В этих двух областях химические связи. Что дает такая вычур-
содержится несколько крайне редких в при-
роде углеводов, а именно 8-углеродный са-
хар 2-кето-3-дезоксиоктонат (КДО, KDO),
7-углеродный сахар гептоза, а также 6-угле-
родные сахара L-рамноза и абеквоза, в мо-
лекуле которых в положении С-6 стоит
—СН3 вместо —СН2ОН (рис. 32.20). В от-
личие от ацильной части липида А олигоса-

Часть V. Рис. 32.21. Способ удлинения О-боковых


228 Молекулярная физиология цепей.
тив О-боковых цепей. Следовательно, ви-
доизменяя О-боковые цепи, микроорганизмы
на один шаг опережают систему иммуноло-
гической защиты организма-хозяина.
Источником генетической информации,
необходимой для изменения О-боковых це-
пей, может служить включение умеренного
фага в грам-отрицательные бактерии. На-
пример, фаг Р22 обеспечивает бактериаль-
ную клетку геном фермента, добавляющего
глюкозу к повторяющемуся тетрасахарид-
ному звену в О-боковых цепях (рис. 32.22).
Такое изменение называют фаговой конвер-
сией. Приведенный пример демонстрирует
удивительное взаимодействие между бакте-
Рис. 32.22. Изменение структуры О-бо- риальными и вирусными генами и те пре-
ковых цепей бактерии Sal- имущества в эволюции, которые возникают
monella при заражении уме- в результате такого симбиоза.
ренным фагом Р22.
32.14. Порин образует в наружной мембране
каналы для небольших полярных молекул
ность? Ключ к решению этого вопроса был В наружной мембране бактериальной клет-
получен при изучении мутантов, дефектных ки содержится большое количество (~10 5 )
по синтезу липополисахаридов. Липид А молекул порина - трансмембранного белка
и прилегающие к нему КДО олигосахарид- массой 37 кДа. Тримеры порина форми-
ного «ядра», по-видимому, абсолютно необ- руют каналы, по которым небольшие по-
ходимы для выживания. Цепи насыщенных лярные молекулы быстро диффундируют,
жирных кислот вносят определенный вклад проходя сквозь мембрану (рис. 32.23). По-
в барьерную функцию наружной мембраны, скольку диаметр канала 10 А, он пропу-
благодаря которой периплазматические скает молекулы массой, не превышающей
белки не выходят наружу, а наиболее ядо- 600 Да. Гидрофобные молекулы независимо
витые вещества не проникают в клетку. Так, от своего размера плохо проходят по кана-
пенициллин довольно плохо проходит лу; из этого следует, что пориновый канал
сквозь клеточную мембрану грам-отрица- наполнен водой и выстлан полярными груп-
тельных бактерий. Кроме того, липид пами. Следовательно, канал приспособлен
А придает наружной мембране жесткость. для пропускания небольших полярных ме-
В отличие от липида А и олигосахаридного таболитов типа моносахара. Что касается
«ядра» О-боковые цепи не являются жиз- полярных соединений с большей молеку-
ненно важными. Например, любимый мно- лярной массой, то для некоторых из них су-
гими биохимиками штамм К12 Е. coli вооб- ществуют специфические системы транс-
ще лишен О-боковых цепей. Все же порта через наружную мембрану; примером
в естественных условиях грам-отрица- может служить система транспорта маль-
тельные бактерии почти всегда имеют О-бо- тозы. Диффузия мальтозы (дисахарида)
ковые цепи. Полисахаридная наружная обо- и мальтотриозы по пориновому каналу идет
лочка придает поверхности бактериальных очень медленно; для их переноса через мем-
клеток высокую степень гидрофильности, брану существует специальная система
что повышает их устойчивость к фагоцитозу транспорта. Известны также специфические
клетками хозяина. О-боковые цепи полиса- системы транспорта витамина В 12 и хелатов
харидов крайне разнообразны; показанная железа. Некоторые фаги проникают в бакте-
на рис. 32.18 структура - это только одна из риальные клетки путем связывания со спе-
многих известных. Грам-отрицательные цифическими переносчиками. Так, фаг λ ис-
бактерии способны быстро мутировать, из- пользует рецептор мальтозы.
меняя таким путем состав своих О-боковых Среди белков наружной мембраны коли-
цепей. В результате популяция клеток хозя- чественно преобладает (~ 7•105 молекул на
ина, встретившись с новой для себя поверх-
ностной структурой, не имеет на первых по- 32. Оболочки бактериальных
рах достаточного количества антител про- клеток 229
Рис. 32.23. А. Электронная микрофото-
графия Е. coli. Видно располо-
жение негативно окрашенных
пориновых каналов. Б. Изобра-
жение пориновых каналов, по-
лученное после обработки
и фильтрации (обесцвечивания
фона) микрофотографии, при-
веденной на рис. А. В. Разъ-
ясняющая схема: показана
проекция каналов порина
при низком разрешении. [Ste-
ven А, С., Heggeler В. Ten, Mu-
ller R., Kistler J., Rosenbusch J.
P., J. Cell Biol., 72, 292 (1977).]

клетку) небольшой липопротеин, содержа- плазматическом пространстве, наружной


щий всего лишь 58 остатков аминокислот. мембране или внеклеточной среде. Каким
Этот белок характеризуется высокой сте- образом новосинтезированная молекула по-
пенью α-спирализованности; к его N-конце- падает в нужное место, выбирая из пяти воз-
вому цистеину ковалентно присоединены можных направлений правильное? Для вы-
три жирные кислоты. Примерно 1/3 моле- яснения этого вопроса очень важное значе-
кул липопротеина через ε-аминогруппы ние имеет следующий факт: как оказалось,
своего С-концевого лизина связана липопротеин наружной мембраны синтези-
с СООН-группами расположенного над руется в виде пролипопротеина, содержаще-
ним пептидогликана. Таким образом, рас- го на N-конце 20 дополнительных остатков
сматриваемый липопротеин прикрепляет на-
ружную мембрану к подлежащему пептидо-
гликанному слою и тем самым способствует
механической устойчивости клеточной обо-
лочки.

32.15. Новообразованные белки


наружной мембраны содержат отщепляемую
сигнальную последовательность
Белки, синтезируемые грам-отрицательны- Рис. 32.24. Последовательность амино-
ми бактериями, могут локализоваться в ци- кислот N-концевой части про-
гозоле, плазматической мембране, пери- липопротеина. Эта сигнальная
последовательность содержит
Часть V. много гидрофобных остатков
230 Молекулярная физиология (показаны желтым цветом).
Рис. 32.25. У прокариот синтез белков он участвует в поглощении мальтозы клет-
клеточной оболочки происхо- кой. Обычно этот белок локализован в пери-
дит на рибосомах, прикре- плазматическом пространстве. Однако при
пленных к плазматической мутации, затрагивающей N-конец его пред-
мембране. Сигнальная после- шественника, локализация белка (в его зре-
довательность (показана лой форме) меняется: замещение гидрофоб-
красным цветом) новообразо- ной аминокислоты в сигнальной последова-
ванного полипептида напра- тельности на заряженный остаток приводит
вляет рибосомы к плазматиче- к накоплению связывающего мальтозу бел-
ской мембране, а также обеспе- ка в цитозоле. Таким образом, следствием
чивает перенос белка через нее. замены всего лишь одного аминокислотного
остатка оказалось изменение локализации
белка: вместо периплазматического про-
аминокислот (рис. 32.24). Аналогичным странства - цитозоль. Рассмотрим обрат-
образом и другие белки, предназначенные ную ситуацию: может ли белок цитозоля
для плазматической мембраны или еще бо- ошибочно попасть в наружную мембрану?
лее наружно расположенных участков, несут Часть гена, ответственного за синтез N-кон-
сигнальные последовательности, отличаю- цевой части белка-переносчика мальтозы
щие их от тех белков, которые остаются (белок наружной мембраны, являющийся
в цитозоле. Рибосомы, синтезирующие бел- также рецептором фага λ), соединили с ге-
ки, предназначенные для выхода из цитозо- ном β-галактозидазы. Кодируемый полу-
ля, соединяются с плазматической мембра- ченным геном белок-химера накапливался
ной посредством именно этих крайне гидро- не в цитозоле, как это свойственно β-галак-
фобных N-концевых последовательностей. тозидазе, а в наружной мембране. Этот
Таким образом, начальные этапы процесса опыт показывает, что N-концевая последова-
секреции у прокариот и эукариот очень тельность новосинтезированной полипеп-
сходны (разд. 29.30). Однако есть и разли- тидной цепи - это своего рода форма записи
чие: у прокариот рибосомы, синтезирующие адреса белков клеточной оболочки. Совер-
белки клеточной оболочки, прикрепляются шенно очевидно, что клетки прокариот, как
к плазматической мембране (рис. 32.25), и эукариот, способны транспортировать
тогда как у эукариот рибосомы с аналогич- белки в соответствующие участки. Молеку-
ной функцией связываются с эндоплазмати- лярные основы этого процесса сортировки
ческим ретикулумом (разд. 29.29). Как и белков - важная область современных ис-
у эукариот, пептидазы прокариот отще- следований.
пляют сигнальные последовательности но-
восинтезированных белков, как только эти
белки минуют барьер мембраны. Заключение
Гипотеза сигнальных последовательно- Бактериальные клетки окружены клеточны-
стей подтверждается данными, полученны- ми стенками, которые защищают их от ос-
ми при изучении бактериальных мутантов;
проиллюстрируем это на примере белка, 32. Оболочки бактериальных
связывающего мальтозу: его масса 38 кДа, клеток 231
мотического лизиса. Клеточная стенка Грам-отрицательные бактерии в отличие
грам-положительных бактерий имеет обыч- от грам-положительных имеют наружную
но толщину 250 А и состоит из пептидогли- мембрану, расположенную над слоем пеп-
кана и тейхоевой кислоты; клеточная по- тидогликана. Кроме того, между плазмати-
верхность грам-отрицательных бактерий ческой мембраной грам-отрицательных
имеет более сложное строение. Клеточная бактериальных клеток и слоем пептидогли-
стенка - это одна огромная макромолекула, кана имеется периплазматическое простран-
имеющая форму мешка. Пептидогликан из ство. Наружная мембрана состоит из крайне
S. aureus содержит 3 повторяющихся звена; своеобразных липополисахаридов. Эти ам-
NAG-NAM, тетрапептид из D- и L-остатков фипатические соединения содержат заяко-
и пентаглициновую цепь. Пентаглициновые ренный в наружном слое наружной мем-
звенья поперечно связывают отдельные по- браны липид А, а также еще более наружно
лисахаридные цепи. В биосинтезе пептидо- расположенные олигосахарид и О-боковые
гликанов используются активированные са- цепи.
хара в форме UDP-NAG и UDP-NAM. О-боковые цепи, в состав которых входят
Биосинтез протекает в пять этапов: 1) на необычные сахара, образуются путем поли-
остатке NAM, присоединенном к UDP, на- меризации тетрасахаридных звеньев на ли-
ращивается пептидное звено; 2) NAM-пеп- пидном переносчике. Разнообразие струк-
тид переносится на липидный переносчик; туры О-боковых цепей позволяет грам-
3) к NAM-пептидной единице присоеди- отрицательным бактериям обойти иммуно-
няются NAG и пентаглициновый мостик; логическую защиту организма-хозяина. По
4) NAG-NAM-пептидное звено переносится содержащим воду каналам в наружной мем-
от липидного переносчика на растущую по- бране происходит диффузия небольших по-
лисахаридную цепь; 5) аминогруппа пента- лярных (но не гидрофобных) молекул; эти
глицинового мостика на одной полисаха- каналы образованы трансмембранно распо-
ридной цепи атакует концевую D-Ala-D-Ala- ложенным белком порином. Молекулы
пептидную связь в тетрапептиде, принадле- большей величины, например мальтоза или
жащем другой цепи, и таким образом витамин В 1 2 , проходят сквозь мембрану
образуется поперечная сшивка между поли- благодаря наличию специфических систем
сахаридными цепями. их транспорта. К числу основных белковых
Пенициллин убивает бактерии, подавляя компонентов наружной мембраны относит-
синтез клеточных стенок. Пенициллин по- ся небольшой липопротеин, посредством
хож по структуре на ацил-D-Ala-D-Ala и со- которого мембрана прикрепляется к подле-
держит высокореакционноспособную пеп- жащему слою пептидогликана. Белки кле-
тидную связь. Он необратимо ингибирует точной оболочки синтезируются на рибосо-
гликопептид-транспептидазу и тем самым мах, присоединенных к плазматической
блокирует образование поперечных сшивок мембране. Предшественники этих белков
в пептидогликане. Некоторые бактерии ре- содержат N-концевые сигнальные последо-
зистентны к действию пенициллина благо- вательности, которые отщепляются после
даря наличию пенициллиназы, гидролизую- переноса белка-предшественника через мем-
щей и тем самым инактивирующей пени- брану.
циллин.
РЕКОМЕНДУЕМАЯ Sharon N., 1969. The bacterial cell wall, грам-отрицательных микроорганиз-
ЛИТЕРАТУРА Sci. Amer., 220(5), 92-98. мов имеют непосредственное отно-
шение к теме данной главы.]
С чего начать Оболочки бактериальных клеток Nikaido H., 1979. Permeability of the
Nikaido H., Nakae Т., 1979. The outer Leive L. (ed.), 1973. Bacterial outer membrane of bacteria, Angew.
membrane of gram-negative bacteria, Membranes and Walls, Marcel Dekker. Chem. (Int.Ed.), 18, 337-350.
Advan. Microbiol. Physiol., 14, 163-250. [Прекрасный сборник критических Hussey H., Baddiley J., 1976.
DiRienzo J.M., Nakamura K., Inouye обзоров. Статьи Гюйсена и Шокмана Biosynthesis of bacterial cell walls. In:
M., 1978. The outer membrane proteins (Ghuysen, Shockman) по биосинтезу Martonosi A. (ed), The Enzymes of
of gram-negative bacteria: biosynthesis, пептидогликана и Накайдо (Nikaido) Biological Membranes, vol. 2, pp.
assembly, and functions, Ann. Rev. по биосинтезу клеточных оболочек 227-326, Plenum.
Biochem., 47, 481-532. Osborn M.J., 1971. The role of
membranes in the synthesis of
Часть V. macromolecules. In: Rothfield L . L .
232 Молекулярная физиология (ed.), Structure and Function of
Biological Membranes, pp. 343-400, D-alanine carboxypeptidases, Proc. Nat. V., Zabin I., Beckwith J., Hofnung M.,
Academic Press. Acad. Sci., 76, 2730-2734. 1980. Mutations which alter the function
Steven A.C., ten Heggeler B., Muller R., Stone K.J., Strominger J.L., 1971. of the signal sequence of the maltose
Kistler J., Rosenbusch J.P., 1977. Mechanism of action of bacitracin: binding protein of Escherichia coli,
Ultrastructure of a periodic protein layer complexation with metal ion and Nature, 285, 78-81.
in the outer membrane of Escherichia C 55 -isoprenyl pyrophosphate, Proc. Emr S., Hedgpeth J., Clement J.-M.,
coli, J. Cell Biol., 72, 292-301. Nat. Acad. Sci., 68, 3223-3227. Silhavy T.J., Hofnung M., 1980.
Boyd D.B.. 1977. Transition state struc- Sequence analysis of mutations that
Пенициллин и бацитрацин tures of a dipeptide related to the mode prevent export of λ receptor, an
Fleming A., 1929. On the antibacterial of action of b-lactam antibiotics, Proc. Escherichia coli outer membrane
action of cultures of a penicillinium, with Nat. Acad. Sci., 74, 5239-5243. protein, Nature, 285, 82-91.
special reference to their use in the Bassford P., Beckwith J., 1979.
isolation of B. influenzae, Brit. J. Exp. Сигнальные последовательности и ло- Escherichia coli mutants accumulating
Pathol., 10, 226-236. кализация белков the precursor of a secreted protein in the
Chain E., 1971. Thirty years of penicillin Chang C.N., Model P., Blobel G., 1979. cytoplasm, Nature, 277, 538-541.
therapy, Proc. Roy. Soc. London (B), Membrane biogenesis: cotranslational Emr S.D., Schwartz M., Silhary T.J.,
179, 293-319. integration of the bacteriophage f1 coat 1978. Mutations altering the cellular
Strominger J.L., Blumberg P.M., protein into an Escherichia coli localization of the phage λ receptor, an
Suginaka H., Umbreit J., Wickus G.G., membrane fraction, Proc. Nat. Acad. Escherichia coli outer membrane
1971. How penicillin kills bacteria: Sci., 75, 4891-4895. protein, Proc. Nat. Acad. Sci., 75,
progress and problems, Proc. Roy. Soc. Inouye S., Wang S., Sekizawa J., Halej- 5802-5806.
London (B), 179, 369-383. oua S., Inouye M., 1977. Amino acid Lin J.J.C., Kanazawa H., Ozols J.,
Yocum R.R., Waxman D.J., Rasmussen sequence for the peptide extension on the Wu H.C., 1978. An Escherichia coli
J.R., Strominger J.L., 1979. prolipoprotein of the Escherichia coli mutant with an amino acid alteration
Mechanisms of penicillin action: outer membrane, Proc. Nat. Acad. Sci., within the signal sequence of outer
penicillin and substrate bind covalently 74, 1004-1008. membrane prolipoprotein, Proc. Nat.
to the same active serine in two bacterial Bedouelle H., Bassford P.J., Fowler A. Acad. Sci., 75, 4891-4895.
ГЛАВА 33 сродством к стимулировавшему его синтез
чужеродному веществу. Антиген (или имму-
Иммуноглобулины ноген) - чужеродная макромолекула, спо-
собная вызвать образование антител. Эф-
фективными антигенами обычно служат
К началу этого столетия были выявлены белки, полисахариды и нуклеиновые кис-
многие важнейшие свойства иммунного от- лоты. Антитела проявляют специфичность
вета. Однако представление о защитных ме- в отношении определенного участка моле-
ханизмах возникло гораздо раньше, о чем кулы антигена; этот участок называют ан-
свидетельствуют записи Фукидида о чуме, тигенной детерминантой.
поразившей Афины в 430 до н.э.: Чужеродные молекулы малого размера
«Пусть другие рассуждают о ее проис- не вызывают образования антител. Однако
хождении и причинах, вызвавших ее по- если они присоединены к макромолекулам,
явление, если только для такого страшно- то может иметь место синтез специфических
го бедствия могут быть найдены доста- антител. В этом случае макромолекула вы-
точные причины... что до меня, я просто полняет функцию носителя присоединенной
опишу ее природу и объясню, по каким химической группы, называемой гаптенной
симптомам ее можно распознать, если детерминантой. Сама по себе чужеродная
она когда-нибудь разразится снова. Тем молекула малого размера называется гап-
лучше я смогу это сделать, что болел сам теном.
и видел, как развивалась болезнь у дру-
гих...
Именно у тех, кто выздоровел после
этой болезни, больные и умирающие вы-
зывали особенное сочувствие. Пережив-
шие болезнь знали по своему опыту, что
это такое, и не боялись более за себя, ибо
один и тот же человек никогда не заболе-
вал вторично или по крайней мере не уми-
рал при этом. И таких людей не только
поздравляли другие, но и сами они в радо-
сти преисполнялись тщетной надеждой,
что отныне они спасены от какой-бы то
ни было болезни».
Называя надежду на спасение тщетной,
Фукидид явно имел в виду специфичность
защиты, свойственную иммунной системе.

33.1. Основные определения


Антитела (или иммуноглобулины) - это бел-
ки, синтезируемые в организме животного
в ответ на присутствие чужеродного веще- Рис. 33.1. Электронная микрофотогра-
ства. Антитело обладает специфическим фия кристалла молекул антите-
ла. [Labaw L. W., Davies D. R.,
Часть V. J. Ultrastruct. Res., 40, 349
234 Молекулярная физиология (1972).]
Рис. 33.2. Электронная микрофотогра-
фия В-лимфоцита. (Печатается
с любезного разрешения
L. Mercer.) Рис. 33.3. Электронная микрофотогра-
фия плазматической клетки.
Виден очень хорошо развитый
Молекулы антител секретируются плаз- шероховатый эндоплазматиче-
матическими клетками, образовавшимися ский ретикулум. (Печатается
из В-лимфоцитов (рис. 33.2). Другой класс с любезного разрешения
лимфоцитов, а именно Т-лимфоциты, обус- L. Mercer.)
ловливает клеточный иммунный ответ, ко-
торый дополняет гуморальный ответ, выра-
жающийся в появлении растворимых анти-
тел. В этой главе мы рассмотрим только
гуморальный ответ, поскольку его молеку-
лярные основы изучены значительно лучше.
Однако нужно подчеркнуть, что молекулы
антител - всего лишь один из компонентов
большой, согласованно функционирующей
системы молекул и клеток, распознающих
и удаляющих чужеродные вещества.

33.2. Синтез специфических антител


в ответ на антиген
Животные способны синтезировать специ-
фические антитела против практически лю-
бой химической группы. Особенно эффек-
тивно стимулирует образование антител
динитрофенол (ДНФ), и потому его широко
используют в качестве гаптенной детер-
минанты. Антитела против ДНФ получают
следующим образом.

1. ДНФ-группы присоединяют ковалент-


но к белку-носителю, например к альбумину Рис. 33.4. Динитрофенильное производ-
сыворотки быка (БСА), используя взаимо- ное бычьего сывороточного
действие фтординитробензола с боковыми альбумина (ДНФ-БСА) - эф-
цепями лизина или других нуклеофильных фективного антигена.
остатков белка (рис. 33.4).
2. ДНФ-БСА вводят кролику в качестве
иммуногена (антигена). Спустя несколько 33. Иммуноглобулины 235
соким сродством к ДНФ. Следовательно, их
можно выделить методом аффинной хрома-
тографии. Для этого готовят колонку, со-
держащую динитрофенильные группы, ко-
валентно связанные с нерастворимым угле-
водным носителем. На колонку наносят
антисыворотку и затем промывают бу-
ферным раствором. Большая часть белков
антисыворотки проходит сквозь колонку,
поскольку их сродство как к ДНФ-группам,
так и к углеводному носителю ничтожно
мало или вовсе отсутствует. В то же время
антитела против ДНФ прочно связываются
Рис. 33.5. Кинетика появления иммуно- на колонке. Далее эти антитела снимают
глобулинов М и G (IgM и IgG) с колонки. Для этого на колонку наносят
в сыворотке после иммуниза- ДНФ в высокой концентрации: доба-
ции. вленный ДНФ связывается с антителами,
вытесняя их из связи с динитрофенильными
группами нерастворимого углеводного но-
дней содержание антител против ДНФ-аль-
сителя. Растворимый комплекс, состоящий
бумина начинает возрастать (рис. 33.5). Эти
из ДНФ и антител против ДНФ, выходит
первыми появляющиеся антитела принадле-
с колонки. Далее ДНФ удаляют путем диа-
жат к классу иммуноглобулинов М (IgM)
лиза или ионно-обменной хроматографии,
массой около 1000 кДа.
и в результате остается препарат очи-
3. Спустя примерно 10 дней после введе-
щенных антител.
ния антигена количество иммуноглобулина
М начинает уменьшаться, но одновременно 33.3. Участки антител, связывающие
растет содержание антител другого класса, антиген, подобны активным центрам
а именно иммуноглобулинов G (IgG) массой ферментов
около 150 кДа. Участки связывания антигена в молекулах
4. Спустя примерно 3 недели после введе- антител во многих отношениях сходны с ак-
ния антигена содержание анти-ДНФ-анти- тивными центрами ферментов.
тел класса иммуноглобулинов G достигает 1. Константы связывания для гаптенов
плато. Введение в этот период новой порции были определены методами равновесного
ДНФ-БСА вызывает дальнейшее увеличе- диализа и спектроскопии. Например, при-
ние содержания антител против ДНФ в сы- соединение окрашенного гаптена типа дини-
воротке кролика. трофенильного производного тушит флуо-
5. Собирают кровь иммунизированного ресценцию остатков триптофана в белке-ан-
кролика и получают сыворотку (называе- тителе. Степень тушения служит мерой
мую антисывороткой, поскольку она полу- насыщения участков связывания в молекуле
чена после иммунизации). Содержание анти- белка. Для большинства гаптенов кон-
тел против ДНФ в этой сыворотке может станты связывания лежат в пределах от
достигать 1 мг антител в расчете на 1 мл 10-4 до 1 0 - 1 0 М. Следовательно, стандарт-
сыворотки. ДНФ исключительно эффекти- ная свободная энергия связывания соста-
вен как агент, стимулирующий образование вляет от —6 до — 1 5 ккал/моль, т. е. лежит
больших количеств специфических антител. в границах, характерных для фермент-суб-
Почти все эти антитела принадлежат к клас- стратных и фермент-коферментных ком-
су иммуноглобулинов G - основному классу плексов. Кроме того, комплексы гаптен-ан-
иммуноглобулинов сыворотки. титело образуются под действием тех же
6. Следующий этап - отделение антител сил, что и фермент-субстратные ком-
против ДНФ от антител с другой специфич- плексы. Сочетание слабых нековалентных
ностью и от прочих сывороточных белков. связей типа электростатических, водо-
Антитела против ДНФ отличаются от родных и вандерваальсовых обеспечивает
остальных белков антисыворотки очень вы- прочное и специфическое связывание.
2. Проверяли способность антител к дек-
Часть V. страну (полисахариду, состоящему из остат-
236 Молекулярная физиология ков глюкозы) связывать олигомеры. Обна-
ружили, что полное связывающее сродство лее при электрофорезе препарата антител
проявляется в отношении олигомера, со- против ДНФ или других специфических ан-
стоящего из шести остатков глюкозы. Здесь тител выявляется множество полос белка.
напрашивается сравнение с лизоцимом, Ферменты же при электрофорезе дают одну
у которого в щели активного центра разме- полосу или небольшое число отдельных по-
щается тоже шесть углеводных остатков. Из лос (например, изоферменты лактат-деги-
этого сопоставления следует, что длина дрогеназы).
связывающего участка в молекулах антител Гетерогенность антител с данной специ-
против декстрана составляет 25 А. фичностью определяется самой природой
3. На основе спектроскопических свойств иммунного ответа. В чем причина гетеро-
ряда гаптенов можно получить информа- генности? Оказалось, что антитела, проду-
цию о степени полярности участков связы- цируемые одной клеткой, гомогенны. Одна-
вания в молекулах антител. Так, некоторые ко различные клетки образуют разные по
нафталины, находясь в высокополярном структуре антитела. Антитела против ДНФ
окружении (например, в воде), дают слабую синтезируются большим количеством раз-
желтую флуоресценцию, а в выраженно не- личных клеток, что и обусловливает их
полярном окружении (например, в гекса- гетерогенность.
не) - интенсивно голубую. Если такой на-
фталиновый гаптен присоединяется к специ- 33.5. При ферментативном расщеплении
фическому антителу, то появляется интен- иммуноглобулина G образуются активные
сивно голубая флуоресценция, что указы- фрагменты
вает на изгнание воды из участка связыва- Иммуноглобулин G имеет массу 150 кДа.
ния. Как правило, участки связывания При изучении такого большого белка целе-
представляют собой неполярные ниши в мо- сообразно предварительно расщепить его
лекуле антитела; это увеличивает прочность на активные фрагменты. В 1959 г. Родни
связывания антигена по причинам, которые Портер (Rodney Porter) показал, что при
уже обсуждались применительно к фермент- ограниченном протеолизе папаином имму-
субстратному взаимодействию (разд. 6.8).
4. Гаптен довольно точно соответствует
связывающему участку по структуре. Специ-
фичность связывания, безусловно, очень вы-
сока, но не абсолютна. Гаптен прочно удер-
живается в участке связывания, имея, таким
образом, малую свободу вращения. Кон-
станта скорости связывания для многих гап-
тенов составляет около 108 М-1•с-1.
Столь высокая константа свидетельствует
о том, что скорость процесса контролирует-
ся скоростью диффузии. Связывание гапте-
на не сопровождается, по-видимому, суще-
ственными структурными перестройками.
33.4. Препараты антител с определенной
специфичностью обычно гетерогенны Рис. 33.6. Флуоресценция ε-дансилли-
Антитела имеют существенное отличие от зина отчетливо меняется при
ферментов: большинство нормальных анти- связывании этого гаптена со
тел с определенной специфичностью, напри- специфическими антителами.
мер антитела против ДНФ, неоднородны по Сдвиг максимума флуоресцен-
молекулярному составу. Анализ связывания ции в сторону более коротких
динитрофенильных гаптенов с препаратом волн и увеличение интенсивно-
анти-ДНФ-антител выявил целый набор ве- сти флуоресценции свидетель-
личин сродства. Некоторые молекулы анти- ствуют о том, что связывание
тел связывают ДНФ с К = 10-6 М, тогда гаптена происходит в неполяр-
как другие - с К = 10 - 1 0 М. В отличие от ном участке.
этого ферменты, как правило, характери-
зуются только одной константой связыва-
ния данного субстрата или кофермента. Да- 33. Иммуноглобулины 237
лекулы в целом. Однако, будучи однова-
лентным (т.е. имея один участок связыва-
ния), Fab не дает осадка с антигеном; этим
Fab отличается от интактной молекулы
иммуноглобулина G, содержащей два иден-
тичных участка связывания антигена. Им-
муноглобулин G может дать осадок с анти-
Рис. 33.7. Протеолитическое расщепле- геном, содержащим не одну, а несколько
ние иммуноглобулина G (IgG). антигенных детерминант. При этом форми-
руется структура в виде протяженной ре-
шетки, где каждая молекула антитела обра-
зует перекрестные связи с двумя и более
антигенами и наоборот (рис. 33.8). Осадок
достигает наибольшего размера, если анти-
тело и антиген присутствуют в эквива-
лентных количествах.
Третий фрагмент (также 50 кДа), обозна-
чаемый F c , не способен к связыванию анти-
гена, но обладает другими биологически
важными функциями. В отличие от Fab этот
фрагмент способен проникать через плацен-
тарную мембрану. Следовательно, способ-
ность иммуноглобулина G проходить
сквозь плаценту и попадать в систему кро-
вообращения плода определяется наличием
на Fc специфического участка, обеспечиваю-
щего перенос через плаценту. На Fc имеется
также участок связывания комплемента.
Связывание антитела с антигенной детерми-
нантой на поверхности чужеродной клетки
часто ведет к лизису последней. Такой ре-
зультат взаимодействия антитела с антиге-
ном опосредован группой белков, носящих
общее название комплемент. Присоедине-
ние одного из этих белков к комплексу анти-
ген—антитело и запускает последователь-
Рис. 33.8. Схематическое изображение ность реакций, приводящих к лизису чуже-
решетки, формирующейся при родной клетки. В обозначении фрагмента Fc
образовании перекрестных свя- индекс «с» (от англ. cristallizable - кристалли-
зей между IgG (показано синим зуемый) указывает на способность этого
цветом) и антигеном (показано фрагмента кристаллизоваться, Обнаруже-
желтым цветом). ние этого свойства послужило первым ука-
занием на гомогенность F c ; что касается
фрагментов F a b , то они гетерогенны и обы-
ноглобулин G расщепляется на три ак- чно не кристаллизуются.
тивных фрагмента массой по 50 кДа. Два 33.6. Иммуноглобулин G состоит
фрагмента связывают антиген. Их обозна- из L- и Н-цепей
чили Fab (ab - от англ. antigen binding - свя- Следующий важный шаг в развитии имму-
зывающий антиген, F - от англ. fra- нологии был сделан также в 1959 г., когда
gment - фрагмент), каждый из Fab содержит Джералду Эделману (Gerald Edelman) уда-
по одному участку связывания гаптена или лось показать, что иммуноглобулин G со-
антигена, причем по связывающему срод- стоит из полипептидных цепей двух видов.
ству этот участок не отличается от всей мо- Белок обрабатывали следующим образом:
дисульфидные мостики в молекуле восста-
Часть V. навливали меркаптоэтанолом; далее разру-
238 Молекулярная физиология шали нековалентные связи 6 М раствором
мочевины. При хроматографическом анали- 4
возрастает в 10 раз по сравнению со связы-
зе смеси было обнаружено, что иммуногло- ванием в одном участке. Не исключено, что
булин состоит из полипептидных цепей мас- подвижность шарнирного типа играет так-
сой 25 и 50 кДа, обозначенных соответ- же определенную роль и в передаче инфор-
ственно как легкие (L) и тяжелые (Н) цепи. мации от Fab-единиц на F с -единицу.
Впоследствии Портер подобрал более
мягкие условия обработки, позволившие ре-
конструировать иммуноглобулин G из двух
Н- и двух L-пепей. На основе этих исследо-
ваний он предложил модель (рис. 33.9)
субъединичной структуры иммуноглобу-
лина G, в соответствии с которой каждая
L-цепь соединена с Н-цепью дисульфидной
связью. Н-цепи, кроме того, связаны между
собой по крайней мере одной дисульфидной
связью. В целом субъединичная структура
иммуноглобулина G L 2 H 2 .
Далее удалось определить, какие участки
предложенной структуры соответствуют
фрагментам, образующимся при расщепле-
нии папаином. Папаин отщепляет Н-цепи со
стороны С-конца от дисульфидного мости-
Рис. 33.9. Субъединичная структура
ка, соединяющего L- и Н-цепи. В итоге Fab
IgG — L 2 H 2 . F ab -фрагменты,
состоит из целой L-цепи и аминоконцевой
высвобождающиеся при рас-
половины Н-цепи, тогда как Fc состоит из
щеплении папаином, показаны
С-концевых половин обеих Н-цепей, Часть синим цветом, Fc-фрагмент -
Н-цепи, содержащаяся в F a b , обозначается красным.
Fd.

33.7. Иммуноглобулин G - гибкая


Y-образная молекула
Электронно-микроскопические исследова-
ния, проведенные Робином Валентайном
и Майклом Грином (Robin Valentine,
Michael Green), показали, что иммуноглобу-
лин G имеет форму буквы Y и что гаптен
присоединяется на концах Fab-единиц.
Fс-единица и две Fab-единицы в интактном
антителе соединены между собой своего ро-
да шарниром, благодаря чему угол между
Fab-единицами может меняться быстро и
в большом диапазоне величин (рис. 33.10).
Этот вид подвижности (гибкости) шарнир-
ного типа усиливает комплексообразование
между антигеном и антителом, так как спо-
собствует лучшему связыванию полива-
лентных антигенов. В самом деле, таким пу-
тем расстояние между антиген-связываю-
щими участками на концах Fab-единиц мо- Рис. 33.10. Иммуноглобулин G имеет
жет быть приведено в соответствие Y-образную форму. Наличие
с расстоянием между специфическими в молекуле шарнирного соеди-
детерминантами на антигене (например, на нения обусловливает подвиж-
вирусе, имеющем много повторяющихся ность отдельных участков.
субъединиц). Как правило, если связывание
поливалентного антигена происходит в двух
участках связывания антигена, то сродство 33. Иммуноглобулины 239
33.8. Антитела образуются под действием клеазы послужил стимулом для постановки
отбора или инструкции? аналогичных опытов с антителами
Специфичность ферментов вырабатывалась (рис. 33.11). Были взяты Fab-фрагменты ан-
на протяжении миллионов лет эволюции. тител против ДНФ; использование фраг-
Специфические антитела появляются в кро- ментов относительно небольшого размера,
ви животного всего лишь через несколько а не целых антител значительно упрощает
недель после воздействия чужеродной де- эксперимент. Fab-фрагмент обрабатывали
терминанты. Каким же образом обеспечи- высокоэффективным денатурирующим
вается образование специфических антител агентом - 7М солянокислым гуанидином.
в столь короткое время? Денатурированный таким образом
1. В 1940 г. Лайнус Полинг (Linus Pauling) Fab-фрагмент терял сродство к гаптену
предложил так называемую инструктивную (ДНФ). Данные гидродинамического и оп-
теорию, согласно которой антиген дей- тического анализа свидетельствовали о том,
ствует как матрица, определяющая конфор- что конформация денатурированного Fab
мацию новообразованной полипептидной це- была близка к случайному клубку. Далее
пи антитела. При этом предполагалось, что гуанидин-HCl удаляли путем диализа; при
молекулы антител с данной последователь- этом денатурированный Fab восстанавливал
ностью аминокислот обладают потенциаль- исходную пространственную структуру
ной способностью к образованию антиген- в отсутствие гаптена ДНФ. Самым пора-
связывающих участков самой разнообраз- зительным было то, что ренатурированный
ной специфичности; возникновение же опре- Fab обладал высоким сродством к динитро-
деленной специфичности зависит от при- фенольным гаптенам. Поскольку ренатура-
роды антигена, присутствующего во время ция происходила в отсутствие гаптена, не
свертывания полипептидной цепи. Согласно оставалось сомнений, что специфичность
инструктивной теории, специфическое анти- участка связывания антигена определяется
тело не может образоваться в отсутствие со- только последовательностью аминокислот
ответствующего антигена. белка-антитела. Результат этого экспери-
2. Селекционная теория (теория отбора), мента свидетельствовал в пользу отбора
которую в 50-х годах выдвинули Макфер- и противоречил основному предсказанию
лейн Вернет и Нильс Ерне (Macfarlane инструктивной теории. Более того, было об-
Burnet, Niels Jerne), постулирует, что анти- наружено, что клетки, продуцирующие анти-
ген регулирует только количество синтези- тела, способны синтезировать их в большом
руемых специфических антител. Согласно количестве в отсутствие антигена. Это
этой теории, антиген-связывающие участки окончательно подтвердило основной тезис
специфических антител полностью детер- селекционной теории: антиген влияет на ко-
минированы еще до встречи с антигеном. личество продуцируемых специфических ан-
33.9. Конец инструктивной теории тител, но не на их аминокислотную последо-
Инструктивная теория предсказывала, что вательность или трехмерную структуру.
если молекула антитела будет развернута 33.10. Иммуноглобулины миеломы
(денатурирована), а затем вновь свернется и гибридомы гомогенны
(ренатурируется), то ее специфичность будет Как же могут синтезироваться специфиче-
утрачена. Этому предсказанию противоре- ские антитела до появления антигенов? Ге-
чили экспериментальные данные по ренату- терогенность антител и трудности анализа
рации рибонуклеазы, полученные в лабора- смеси их молекул на протяжении многих лет
тории Христиана Анфинсена (Christian служили препятствием к изучению этой про-
Anfinsen). Вспомним, что денатурированная блемы. Выйти из этого положения удалось
рибонуклеаза спонтанно восстанавливает путем использования такого объекта иссле-
исходную трехмерную структуру, специфич- дования, как множественная миелома - зло-
ность и каталитическую активность после качественное перерождение клеток, проду-
удаления денатурирующего агента цирующих антитела. При этом виде рака
(разд. 2.12). Для ренатурации присутствие происходит перерождение одного лимфоци-
субстрата не требуется. Этот принципиаль- та или плазматической клетки, что ведет
но важный факт относительно рибону- к неконтролируемому клеточному делению.
Следовательно, в этом случае образуется
Часть V. большое число клеток одного типа. Они со-
240 Молекулярная физиология ставляют клон, т.е. происходят от одной
структурой и во всех отношениях соответ-
ствуют норме, но каждый из них предста-
вляет собой гомогенный образец одного из
многочисленных антител, присутствующих
в данном организме. Миеломы развиваются
у мышей. Эти опухоли можно транспланти-
ровать другим мышам; после пересадки от
одной мыши другой опухоль пролифери-
рует. Более того, в таких продуцирующих
антитела опухолях из поколения в поколе-
ние синтезируется одно и то же антитело.
Именно это обстоятельство привело к тому,
что основные достижения молекулярной
иммунологии связаны с изучением гомо-
генных миеломных иммуноглобулинов.
Сезар Милстайн и Джордж Кёлер
(Cesar Milstein, Georges Kohler) обнаружили,
что можно получить в большом количестве
антитела практически любой заданной спе-
цифичности посредством слияния клетки,
продуцирующей антитело, с клеткой мие-
ломы. Для этого мышь иммунизируют
определенным антигеном и спустя несколь-
ко недель удаляют у нее селезенку. Далее бе-
рут смесь иммунокомпетентных клеток
этой селезенки и in vitro вызывают их слия-
ние с клетками миеломы. Затем выделяют
гибридные клетки путем культивирования
смеси всех клеток в среде, поддерживающей
рост только гибридных (но не исходных)
клеток. В некоторых из полученных ги-
бридных клеток сохраняются неопластиче-
ские свойства миеломных клеток, и при
этом они синтезируют антитела заданной
специфичности. Такие клетки гибридомы как
в первом, так и во всех последующих поко-
лениях устойчиво продуцируют большие
количества гомогенных антител со специ-
фичностью, детерминированной исходной
клеткой селезенки. К настоящему времени
Рис. 33.11. Fab-Фрагмент анти-ДНФ-анти- таким путем получено много различных мо-
тел восстанавливает способ- ноклональных антител, которые исполь-
ность к связыванию ДНФ по- зуются в аналитических целях как высоко-
сле денатурации (развертыва- специфические реагенты. Например, моно-
ния структуры) и последующей клональные антитела против определенного
ренатурации (восстановления лекарственного средства или гормона по-
исходной структуры) в отсут- зволяют определить его содержание в жид-
ствие антигена. Этот опыт по- костях тела даже при крайне низкой концен-
казывает, что специфичность трации.
определяется природой после-
33.11. Каждая L- и Н-цепь состоит
довательности аминокислот.
из вариабельного и константного участков
При множественной миеломе в моче
клетки и имеют одни и те же свойства. Такие больных, как правило, появляются большие
опухоли секретируют большие количества
какого-то одного иммуноглобулина. Имму-
ноглобулины миеломы обладают нормальной 33. Иммуноглобулины 241
количества аномальных белков. На эти бел-
ки обратил внимание еще в 1847 г. Генри
Бенс-Джонс (Henry Bence-Jones) в связи с их
необычными свойствами: они выпадают
в осадок при нагревании до 50°С и вновь
растворяются при кипячении. Оказалось,
что белок Бенс-Джонса - это димер L-цепей
иммуноглобулина, продуцируемого миело-
мой больного; этот белок послужил
удобным исходным материалом для анали-
за последовательности аминокислот в L-це-
пях.
В 1965 г. было проведено первое полное
определение последовательностей амино-
кислот в миеломных L-цепях, содержащих
214 аминокислотных остатков. Эти исследо-
вания показали, что у разных больных белки
Бенс-Джонса различаются по последова-
тельности аминокислот. Самое удивитель-
ное состояло в том, что различия касались
только N-концевой половины полипеп-
тидных цепей. Каждый из исследованных
Рис. 33.12. Легкая цепь иммуноглобулина белков Бенс-Джонса характеризовался уни-
состоит из вариабельной и кон- кальной последовательностью аминокислот
стантной областей. в положениях от 1 до 108, но начиная с поло-
жения 109, последовательность ряда белков
Бенс-Джонса была идентичной. Следова-
тельно, L-цenu состоят из вариабельного
участка (остатки 1-108) и константного
(постоянного) участка (остатки 109-214).
Такое явление не имело прецедента в белко-
вой химии.
Не все L-цепи имеют один и тот же кон-
стантный участок. Существует два типа
L-цепей, обозначаемых соответственно кап-
па (χ) и лямбда (λ), которые во многом
сходны между собой. Так, оба типа L-цепей
состоят из 214 остатков, содержат вариа-
бельную N-концевую и константную С-кон-
цевую половины. Каждая из половин χ- и λ-
цепей образует петлю из-за наличия внутри-
цепочечной дисульфидной связи. С-кон-
цевым остатком цепей обоих типов является
цистеин, который участвует в образовании
дисульфидного мостика с Н-цепью. Нако-
нец, χ- и λ-цепи содержат идентичные ами-
нокислотные остатки в 40% положений, т. е.
проявляют примерно такую же степень го-
мологии, как α- и β-цепи гемоглобина
человека.
Константные участки всех χ-цепей иден-
Рис. 33.13. Тяжелая цепь IgG также со- тичны, за исключением положения 191, где
стоит из вариабельной и кон- может стоять либо лейцин, либо валин. Это
стантной областей. аллотипическое различие наследуется по
классическому правилу Менделя. λ-Цепи
Часть V.
также вариабельны по положению 191, где
242 Молекулярная физиология
может стоять лизин или аргинин.
Н-цепи содержат 446 аминокислотных
остатков. Сравнение последовательностей
Н-цепей иммуноглобулинов, продуци-
руемых разными миеломами, выявило, что
и в этом случае вариабельными оказывают-
ся первые 108 остатков (от N-конца). Следо-
вательно, тяжелые цепи, подобно легким,
состоят из вариабельной (V) и константной
(С) области. Вариабельные области Н- и L-
цепей но размеру одинаковы, а констант-
ные - различны: в Н-цепях этот участок в
3 раза длиннее, чем в L-цепях (рис. 33.13).

33.12. Участок связывания антигена


образован гипервариабельными
фрагментами L- и Н-цепей
Как уже упоминалось выше, в состав анти-
ген-связывающего фрагмента F ab пол-
ностью входит L-цепь и частично - Н-цепь.
Каков относительный вклад каждой из этих
цепей в связывающую активность? Первые
сведения в этом отношении были получены Рис. 33.14. Гипервариабельные участки
легких (А) и тяжелых (Б) цепей.
при сравнении последовательностей амино-
Степень вариабельности в по-
кислот в большом числе миеломных белков.
Обнаружилось, что вариабельные области следовательности аминокис-
L- и Н-цепей вовсе не равномерно вариа- лот отложена как функция по-
бельны, а именно три участка L-цепи и четы- ложения аминокислоты.
ре Н-цепи проявляют значительно большую (Capra J. D., Edmundson А. В.,
изменчивость, чем другие части вариа- The antibody combining site,
бельных областей (рис. 33.14). В 1970 г. Эл- Scientific American, Inc., 1976.)
вин Кабат (Elwin Kabat) предположил, что
эти гипервариабельные участки образуют
лизованными в гипервариабельных участ-
область, связывающую антиген, и что имен-
но от природы составляющих их аминокис- ках этих цепей. Следовательно, участки
лот зависит специфичность антитела. связывания антигена формируются гиперва-
Для проверки этой гипотезы были прове- риабельными остатками аминокислот как
дены опыты с использованием аффинной L-цепей, так и Н-цепей. При последующем
метки. Гаптены, содержащие реакционно- рентгеноструктурном анализе были полу-
способные группы, синтезируются просто. чены более прямые данные в пользу этого
Реакционноспособный гаптен специфически положения; мы их обсудим ниже.
связывается с антиген-связывающим участ-
ком антитела и далее образует ковалентную 33.13. Вариабельная и константная области
выполняют разные функции
связь с ближайшим подходящим остатком
в молекуле данного белка. Например, анти- N-концевые части легких и тяжелых цепей
тела против ДНФ можно пометить по анти- содержат вариабельные области, ответ-
ген-связывающему участку гаптеном нитро- ственные за связывание антигена. Различия-
фенилдиазонием: ми в последовательности аминокислот
обусловлено формирование участков,
связывания антигена, различающихся по
специфичности. Остальная часть каждой из
цепей - константная; она осуществляет та-
кие эффекторные функции, как связывание
Диазониевая группа высокореакционно- комплемента и перенос антител через пла-
способна и образует диазосоединения центарную мембрану. Одни и те же эффек-
с остатками тирозина, гистидина и лизина. торные функции свойственны антителам
Модифицированные таким образом антите-
ла содержат метку и в L-цепях и в Н-цепях.
При этом меченые остатки оказались лока- 33. Иммуноглобулины 243
Рис. 33.15. Структура IgG. Показано рас- конец, константная область легкой цепи
положение дисульфидных мо- (С L ) гомологична трем доменам констант-
стиков и участки г о м о л о - ной области тяжелой цепи.
гичных последовательностей. Эта очевидная гомология последователь-
(Edelman G. M., The structure ностей аминокислот свидетельствует о том,
and function of antibodies, что молекулы иммуноглобулинов свернуты
Scientific American, Inc., 15,70.) с образованием компактных доменов,
каждый из которых содержит область, го-
самой разной специфичности. Таким обра- мологичную по крайней мере одному актив-
зом, антитела состоят из участка с уни- ному участку, выполняющему определен-
кальной последовательностью аминокислот, ную функцию, свойственную молекуле им-
определяющей специфичность связывания муноглобулина в целом (рис. 33.16). Пред-
антигена, и из участка с постоянной после- ставляется вероятным, что домены сходны
довательностью, осуществляющего общие по четвертичной структуре, поскольку
эффекторные функции. Поразительная осо- сходны их последовательности аминокис-
бенность структуры иммуноглобулинов со- лот. Данные рентгеноструктурного анализа
стоит в том, что вариабельный и кон- подтвердили гипотезу доменов. Роберто
стантный области в легких и тяжелых цепях Поляк (Roberto Poljak) раскрыл простран-
имеют четкую границу раздела. ственную структуру при разрешении 2,0 А
фрагмента F ab' (практически идентичного
33.14. Молекулы антител уложены фрагменту F ab ) человеческого иммуногло-
с образованием компактных доменов, булина. Фрагмент F a b ' состоит из четырех
имеющих гомологичные последовательности расположенных в виде тетраэдра глобу-
Последовательность аминокислот в моле- лярных субъединиц - VL, VH, CL и
куле иммуноглобулина полностью раскрыл СH1 - поразительно сходных по простран-
в 1968 г. Джералд Эделман (Gerald ственной структуре (рис. 33.17). Общая
Edelman). Самая интересная особенность структурная особенность четырех доменов
этой последовательности состоит в перио- состоит в наличии двух широких антипарал-
дичности расположения внутрицепочечных лельных β-складок (рис. 33.18). Между ними
дисульфидных связей и в легких, и в тя- располагаются плотно упакованные бо-
желых цепях (рис. 33.15). Кроме того, имеет- ковые цепи многих гидрофобных остатков.
ся сходство в последовательности амино- Указанный повторяющийся элемент струк-
кислот разных частей молекулы иммуно- туры назван иммуноглобулиновой складкой.
глобулина. Так, вариабельная область лег- Трехмерную структуру интактного имму-
кой цепи (VL) гомологична вариабельной ноглобулина G раскрыл Дэвид Дэвис (David
области тяжелой цепи ( V H ) ; константная Davies). Анализ карты электронной плотно-
область тяжелой цепи (С H ) состоит из трех сти с разрешением 6 А показал, что молеку-
равных частей (СH1 СH2 и С H 3), обладаю- ла IgG имеет Т-образную форму
щих сходными последовательностями; на- (рис. 33.19). Домены в фрагменте F c , также
как и в фрагменте Fab, имеют характерную
Часть V. иммуноглобулиновую складку. Углеводный
244 Молекулярная физиология компонент, ковалентно связанный с остат-
Рис. 33.16. Схема, иллюстрирующая гипо- булинах и их фрагментах показало, что по-
тезу доменов. липептидные цепи между доменами обла-
дают значительной гибкостью.

33.15. Рентгеноструктурный анализ


ком аспарагина в СH2-домене, расположен связывающих участков антител показал,
между доменами СH1 и СH2 (рис. 33.19) как происходит связывание некоторых
и составляет значительную часть области гаптенов
контакта между единицами Fab и F c . Срав- Рентгеноструктурный анализ комплексов
нение взаимной ориентации прилегающих гаптенов с фрагментами Fab позволил опре-
друг к другу доменов в разных иммуногло- делить природу антиген-связывающих

Рис. 33.17. Структура Fab'-фрагмента; по- участков антител и структурную основу их


казаны только α-углеродные специфичности. Подтвердилось предсказа-
атомы. L-цепи изображены си- ние, сделанное на основании сопоставления
ним цветом, Н-цепи - красным. последовательностей аминокислот, а также
[Poljak R. L., Amzel L. M, Avey опытов с аффинной меткой, что антиген-
Н. P., Chen B.L., Phizacker-
ley R. P., Saul F., Proc. Nat.
Acad. Sci., 70, 3306 (1973).] 33. Иммуноглобулины 245
Таблица 33.1. Свойства иммуноглобулинов разных классов 1 .

Класс Концен- Масса,


трация в кДа Коэффициент Легкая Тяжелая Субъединичный
сыворотке, седиментации, цепь цепь состав
мг/мл S

IgG 12 150 7 χ или λ γ χ2γ2 или λ2γ2


IgA 3 180-500 7, 10, 13 То же α (χ2α2)n или (λ2α2)n
IgM 1 950 18-20 » μ (χ2μ2)5 или (λ2μ2)5
IgD 0,1 175 7 » δ χ2δ2 или λ2δ2
IgE 0,001 200 8 » ε χ2ε2 или λ2ε2

1
n = 1,2 или 3. IgM и олигомеры IgA содержат также цепь J, которая соединяет между собой молекулы иммуно-
глобулина. Секретируемый IgA имеет дополнительный секреторный компонент.

связывающий участок антитела сформиро- тогда как легкие цепи одни и те же: либо λ,
ван остатками гипервариабельных областей либо χ. Тяжелые цепи иммуноглобулина
как L-цenu, так и Н-цепи. Это хорошо видно G называются γ-цепями, а тяжелые цепи им-
на примере связывания производного ви- муноглобулинов А, М, D и Е - соответствен-
тамина К1 (рис. 33.20). Аналогично проис- но α-, μ-, δ- и ε-цепями. Различие тяжелых
ходит связывание фосфорилхолина в поло- цепей обусловливает и различие биологиче-
сти, выстланной остатками, принадлежащи- ских свойств у пяти классов иммуноглобу-
ми пяти гипервариабельным сегментам: линов. Как уже упоминалось выше, иммуно-
двум L-цепи и трем Н-цепи (рис. 33.21). глобулин М (IgM) - это класс антител,
Этот гаптен наиболее прочно связывается которые первыми появляются в сыворотке
с остатками Н-цепи. Его положительно за-
ряженная триметиламмониевая группа ухо-
дит в глубь клинообразной полости, где
электростатически взаимодействует с двумя
отрицательно заряженными боковыми це-
пями глутамата. Отрицательно заряженная
фосфатная группа фосфорилхолина связы-
вается с положительно заряженной гуаниди-
ниевой группой аргининового остатка
в устье щели. Кроме того, фосфатная группа
образует водородные связи с гидроксилом
тирозинового остатка и с аминогруппой бо-
ковой цепи аргинина. Многочисленные ван-
дерваальсовы взаимодействия, в том числе
с боковой цепью триптофана (рис. 33.21),
также вносят свой вклад в стабильность это-
го комплекса.

33.16. Разные классы иммуноглобулинов


различаются по биологической активности
До сих пор мы рассматривали иммуногло-
булин G. Однако существует 5 классов им- Рис. 33.18. Два слоя антипараллельных
муноглобулинов (табл. 33.1), и все они со- β-складок (показаны зеленым
стоят из тяжелых и легких цепей. Кон- и желтым цветом) составляют
стантные области тяжелых цепей у иммуно- основной структурный мотив
глобулинов разных классов неодинаковы, доменов в иммуноглобулинах.
(Capra J. D.. Edmundson А. В.,
Часть V. The antibody combining site,
246 Молекулярная физиология Scientific American, Inc., 1976.)
Рис. 33.19. Схематическое изображение пей показана розовым цветом,
трехмерной структуры моле- другая голубым. Углеводная
кулы IgG. Каждый аминокис- цепь присоединена к домену
лотный остаток изображен СН2 (показана желтым цве-
в виде шарика. Одна из Н-це- том). [Silverton E. W., Na-
пей показана красным цветом, via М.А., Davies D. R., Proc.
другая синим. Одна из L-це- Nat. Acad. Sci.. 74, 5142 (1977).]
33.17. Молекулы антител возникли
в результате дупликации и последующей
дивергенции генов
Структурная гомология доменов иммуно-
глобулинов указывает на характер их проис-
хождения в эволюции. Выше уже рассматри-
вался вопрос о том, что сходство последова-
тельностей аминокислот в молекулах химо-
трипсина, трипсина, эластазы и тромбина
свидетельствует о происхождении этих
ферментов от общего предшественника
(разд. 8.11). Аналогичным образом вну-
тренняя гомология в молекуле иммуногло-
булина свидетельствует о появлении анти-
тел в процессе дупликации генов и их
последующей дивергенции (видоизменения).
Ген-предшественник кодировал, вероятно,
примитивную молекулу антитела, состоя-
щую примерно из 108 аминокислотных
остатков. Далее, по всей вероятности, про-
исходила дупликация гена-предшественни-
ка; в результате дивергенции образовав-
Рис. 33.20. Способ связывания производ- шихся новых генов возникли разные типы
ного витамина К 1 (показано вариабельных и константных областей. Ал-
желтым цветом) в участке лен Эдмундсон (Allen Edmundson) высказал
связывания антигена. Остатки предположение, что димер L-цепи выполнял
аминокислот гипервариабель- функцию примитивного антитела
ного участка Н-цепи изобра- (рис. 33.22).
жены розовым цветом, а остат-
ки, принадлежащие L-цепи,—
синим. [Amzel I. M., Poljak R.,
Saul F., Varga J., Richards F.,
Proc. Nat. Acad. Sci., 71, 1427
(1974).]

после введения антигена, тогда как иммуно-


глобулин G (IgG) - основной класс антител
сыворотки. На протяжении многих лет IgG
называли γ-глобулином, исходя из его элек-
трофоретических характеристик и раствори-
мости. Иммуноглобулин А (IgA) - это основ-
ной классе антител, секретируемых с раз-
личного рода продуктами внешней секреции
(слезная жидкость, слизь бронхиального
и кишечного эпителия). Таким образом, IgA
служит первой линией зашиты против бак-
териальных и вирусных антигенов. Какова
функция иммуноглобулинов D (IgD) и
Е (IgE), пока не известно. Установлено, од- Рис. 33.21. Способ связывания фосфорил-
нако, что иммуноглобулин Е опосредует ал- холина (показан синим цветом)
лергические реакции и тем самым оказывает с антителом в участке, связы-
вредное действие. вающем антиген. [Padlan E.A.,
Davies D. R., Rudikoff S., Pot-
Часть V. ter M., Immunochemistry, 13,
248 Молекулярная физиология 945 (1976).]
стантными областями в L- и Н-цепях дало
основание думать, что гены иммуноглобу-
линов, так же как и кодируемые ими поли-
пептиды, имеют необычную архитектуру.
Ранее уже упоминалось, что константные
области χ-цепей идентичны по всем положе-
ниям, кроме 191, где можег стоять либо лей-
цин, либо валин. Как показал анализ родос-
ловной, указанные два варианта (аллотипа)
наследуются в соответствии с классическим
правилом Менделя, а это служит веским до-
водом в пользу того, что константная
область χ-цепей кодируется только одним
геном. Что касается вариабельных обла-
стей, то по данным генетического анализа
они кодируются множеством генов.
В 1965 г. Уильям Дрейер и Клод Беннетт
(William Dreyer, Claude Bennett) выдвинули
предположение, что в половых клетках мно-
жественные гены V пространственно отде-
лены от одиночного гена С. Согласно этой
гипотезе, в процессе дифференцировки клет-
ки, продуцирующей антитело, один из генов
V соединяется с геном С. Позднее стало из-
вестно, что действительно возможно сращи-
вание ДНК (сплайсинг), аналогичное тому,
Рис. 33.22. Вероятные этапы эволюции которое имеет место, например, при вклю-
примитивных антител. Ген, ко- чении ДНК фага в геном.
дирующий одну полипептид- Окончательная проверка этой гипотезы
ную цепь (А) из 108 аминокис- транслокации сможет быть произведена
лотных остатков, удваивается только после того, как будет выделена чи-
и дает два идентичных домена стая мРНК иммуноглобулина и будут раз-
(Б), соединенных короткой ли- работаны методы анализа сложных гено-
нейной полипептидной цепью. мов млекопитающих. Особенно интересно
В результате дивергентной в этом отношении использование рестрик-
эволюции образовавшихся при таз, расщепляющих большие хромосомы на
удвоении генов аминокис- специфические фрагменты ДНК, которые
лотный состав двух доменов нетрудно далее подвергнуть анализу. Рас-
становится различным и возни- пределение генов V и С в этих фрагментах
кают (В) вариабельная (V) ДНК можно определить путем гибридиза-
и константная (С) области, ции их с фрагментами мРНК, специфичны-
перевернутые одна по отноше- ми в отношении либо вариабельной, либо
нию к другой. При соединении константной области. В 1976 г. Сусуму То-
этих молекул формируется (Г) негава (Susumu Tonegawa), используя этот
примитивный Fab-фрагмент, подход, определил, что в ДНК половых кле-
обладающий участком связы- ток гены V и С расположены далеко друг от
вания антигена. (Capra J. D., друга, а в клетках, продуцирующих антите-
Edmundson А. В., The antibody ла, они тесно связаны. Следовательно, в ходе
combining site, Scientific дифференцировки лимфоцитов происходит
American, Inc., 1976.) перемещение генов иммуноглобулина
(рис. 33.23).
33.18. Вариабельные и константные области
кодируются разными, но соединившимися
генами
Как организованы и как функционируют
гены иммуноглобулина? Обнаружение чет-
кого различия между вариабельными и кон- 33. Иммуноглобулины 249
4
очень большое число (>10 ) генов, коди-
рующих вариабельные области антител. Ка-
ждой уникальной последовательности ва-
риабельных областей соответствует участок
ДНК в клетках зародышевого пути. Таким
образом, эта гипотеза предполагает, что
разнообразие возникло на протяжении эво-
люции в результате случайных мутаций
и отбора.
2. Гипотеза соматических рекомбинаций.
Согласно этой гипотезе, существует только
Рис. 33.23. При дифференцировке клеток, небольшое число (порядка 100) генов, коди-
продуцирующих антитела, ген рующих вариабельные области антител.
V транслоцируется, соединяясь Эти гены, сходные между собой, но не иден-
с геном С. тичные, на протяжении жизни индивидуума
претерпевают многократные рекомбинации
в клетках, продуцирующих антитела. Пред-
33.19. Как возникает разнообразие полагается, что кроссинговер идет внутри-
специфичности антител? хромосомно. Расчеты показали, что реком-
Организм животного обладает способ- бинация 10 генов может привести к появле-
ностью к синтезу больших количеств специ- нию 106 разных последовательностей ами-
фических антител спустя несколько недель нокислот.
после введения практически любой чуже- 3. Гипотеза соматических гипермутаций.
родной детерминанты. Число различных ви- Согласно этой модели, разнообразие возни-
дов антител, которые могут синтезировать- кает в результате точковых мутаций одно-
ся в организме животного, огромно - ве- го-единственного гена вариабельной обла-
роятно, оно превышает миллион. Как мы сти данного подкласса. Однако только
уже видели, структурной основой специфич- необычайно высокая частота мутаций мо-
ности антител служат последовательности гла бы создать на протяжении жизни инди-
аминокислот в вариабельных областях лег- видуума все разнообразие специфичности
ких и тяжелых цепей. Это подводит нас антител. Было высказано предположение,
к ключевому вопросу: каким образом возни- что в клетках, продуцирующих антитела
кают различные последовательности амино- (или в соответствующих клетках-предше-
кислот вариабельных областей? Можно ственниках), увеличение скорости мутаций
сформулировать в связи с этим и более кон- обеспечивается механизмом репарации
кретные вопросы. ДНК, действие которого в данном случае
1. Когда возникает разнообразие? На направлено на производство ошибок.
протяжении жизни животного (соматически)
или на протяжении эволюции (генетически)? 33.20. Вариабельные участки L- и Н-цепей
2. Как возникает разнообразие? В резуль- кодируются несколькими сотнями генов
тате случайных мутаций в ходе эволюции, Революция в методах изучения ДНК, про-
путем соматической рекомбинации или пу- изошедшая в последние годы, сделала во-
тем соматической гипермутации? прос о происхождении разнообразия анти-
Обилие данных относительно последова- тел доступным для экспериментального
тельностей аминокислот миеломных имму- анализа. Особенно ценными в данном слу-
ноглобулинов позволило иммунологам раз- чае оказались методы клонирования генов
работать несколько гипотез относительно и быстрого определения последовательно-
того, как возникло разнообразие антител. сти протяженных участков ДНК. Благодаря
Были предложены три возможных механиз- использованию этих методов за короткий
ма. срок была получена информация, необходи-
1. Гипотеза клеток зародышевых линий. мая для ответа на два узловых вопроса:
Согласно этой модели, разнообразие свой- сколько генов вариабельных областей со-
ственно уже клеткам зародышевых линий (и держится в клетках зародышевого пути?
эмбриональным клеткам), содержащим Меняется ли последовательность оснований
в процессе дифференцировки клеток, проду-
Часть V. цирующих антитела?
250 Молекулярная физиология Ответ на первый вопрос сводится к тому,
что существует несколько сотен генов ва-
риабельных областей х-легких ( V χ ) и тя-
желых цепей ( V H ) . 300 генов Vχ и 300 генов
V H , соединяясь в различных комбинациях
(300 х 300), способны были бы кодировать Рис. 33.25. Расположение тандемом
4
9•10 вариантов молекул антител, разли- группы генов J, кодирующих
чающихся по специфичности. Этот рас- часть последнего гипервариа-
4
четный максимум (9•10 ) намного ниже бельного участка вариабель-
реального числа антител различной специ- ной области; гены J локализо-
фичности, синтезирующихся в организме ваны вблизи гена С.
животного; считается, что число таких анти-
6
тел значительно превышает 10 . Расхожде-
ние между расчетом и реальной величиной ностей оснований клонированных генов, ко-
еще выше в отношении легких цепей λ, ко- дирующих иммуноглобулины в эмбрио-
торые, как было показано, кодируются ме- нальных и миеломных клетках. Эти исклю-
нее, чем 10 генами Vλ. В целом число генов чительно продуктивные исследования были
вариабельных областей в клетках зародыше- проведены Тонегавой, Филиппом Ледером
вого пути оказалось слишком малым, чтобы и Лероем Худом (Tonegawa, Philip Leder.
полностью обеспечить все разнообразие ан- Leroy Hood). Прежде всего, совершенно не-
тител. Очевидно, в ходе дифференцировки ожиданно выяснилось, чем в эмбриональных
лимфоцитов на протяжении жизни живот- клетках гены V кодируют вариабельные обла-
ного появляются какие-то дополнительные сти L- и Н-цепей вовсе не целиком. Ген V эм-
факторы, повышающие степень разнообра- бриональных клеток (и клеток зародышево-
зия. го пути) заканчивается кодом для аминокис-
лотного остатка 95, а не 108, который
33.21. Открытие генов J (соединяющих) -
составляет конец вариабельной области
дополнительного источника разнообразия
полипептидной цепи иммуноглобулина
антител (рис. 33.24). Где же находится ДНК, которая
Следующий шаг в изучении механизма, кодирует последние 13 остатков вариабель-
обеспечивающего разнообразие антител, ной области? В эмбриональных клетках
был сделан при определении последователь- этот отрезок ДНК локализован в неожидан-
ном месте: вблизи гена С. Указанный отре-
зок ДНК назвали геном J (от англ. join - сое-
динять), потому что в дифференцированных
клетках он соединяет гены V и С. В сущно-
сти, в эмбриональных клетках вблизи гена
С локализована целая группа располо-
женных тандемом генов J (рис. 33.25). При
дифференцировке клеток, продуцирующих
антитела, происходит транслокация гена V
в участок, расположенный рядом с геном С;
эта транслокация осуществляется путем
внутрихромосомной рекомбинации. При
этом ген V сращивается (сплайсинг) с геном
J и формируется общий ген, полностью ко-
дирующий вариабельный участок. Каждый
из указанных генов содержит короткую па-
линдромную (разд. 24.27) последователь-
ность, расположенную рядом с участком ре-
комбинации. Эти палиндромы служат, ве-
роятно, элементами узнавания в процессе
Рис. 33.24. Ген V, выделенный из эмбрио- рекомбинации.
нальных клеток, укорочен. Он Гены J вносят большой вклад в разно-
не кодирует последние 13 ами- образие антител, так как они кодируют
нокислотных остатков вариа-
бельной (V) области полипеп-
тидной цепи. 33. Иммуноглобулины 251
ние генов V и J, вносит дополнительный
вклад в разнообразие антител в организме.
Похоже, что иммунная система получает
удовольствие от мелких погрешностей!
В каждом данном лимфоците экспресси-
рован только один из двух аллельных генов.
Следовательно, все участки, связывающие
антиген, продуцируемые отдельной клет-
кой, одинаковы. Обнаружена структурная
основа такого избирательного выражения
гена (называемого аллельным исключением).
Как показал анализ фрагментов, полу-
ченных после рестрикции, неполный ген V
правильно соединяется с геном J только
в одной из двух гомологичных хромосом;
экспрессируется же только правильно ре-
комбинированный ген иммуноглобулина.
33.23. мРНК для L- и Н-цепей образуются
путем сращивания (сплайсинга) первичных
продуктов транскрипции
Рис. 33.26. Неточность места соединения мРНК легких χ-цепей содержит около 1250
генов V и J служит еще одним оснований (рис. 33.27). Как и в других
источником разнообразия ан- мРНК эукариот, в ней содержатся poly(A)-
тител. последовательность, присоединенная к
часть последнего гипервариабельного 3'-концу, и нетранслируемые последователь-
участка L- и Н-целей. При формировании ности на 3'- и 5'-концах. Лидерная последова-
полного гена Vχ любой из нескольких сотен тельность вблизи 5'-конца мРНК χ-цепи
генов V может присоединиться к любому из кодирует гидрофобную N-концевую
пяти генов J. Например, в результате ком- область синтезируемой χ-цепи. Образую-
бинации 300 неполных генов V с пятью ге- щаяся сигнальная последовательность
нами J может образоваться 1500 вариантов (рис. 33.28) направляет рибосому к эндо-
полного (непрерывного) гена V. Следова- плазматическому ретикулуму и определяет
тельно, соматическая рекомбинация этих способность новосинтезированной полипеп-
генных сегментов усиливает разнообразие, тидной цепи иммуноглобулина проходить
заложенное уже в клетках зародышевого через мембрану ЭР в просвет его трубочек
пути. (разд. 29.30). Далее на внутренней стороне
мембраны ЭР происходит отщепление сиг-
33.22. Соединение генов V и J нальной последовательности под действием
в различных рамках также способствует пептидазы. Вариабельная и константная
разнообразию антител области легкой цепи кодируются смежной
Второе удивительное открытие состояло областью мРНК, которая следует непосред-
в том, что набор из пяти генов J обеспечи- ственно за лидерной последовательностью.
вал синтез не пяти, а большего числа после- Первичный продукт транскрипции, из ко-
довательностей аминокислот для соответ- торого образуется эта мРНК, содержит две
ствующих областей легкой цепи. Анализ вставочные последовательности (рис. 33.29).
последовательностей аминокислот и осно- Одна из них отделяет лидерную последова-
ваний показал, что рекомбинация генов V тельность от начала мРНК, кодирующей
и J происходит не абсолютно точно. Как вариабельную область, а вторая расположе-
оказалось, рекомбинация этих генов может на между дистальным концом последова-
иметь место по тому или иному из основа- тельности, комплементарным гену J, и нача-
ний вблизи кодона, детерминирующего лом последовательности, комплементарной
остаток 95 (рис. 33.26). Следовательно, раз- гену С (т.е. кодирующей константный уча-
личие рамок, в которых происходит сращива- сток). При превращении первичного продукта
в мРНК (процессинг) происходит удаление
Часть V. этих вставочных последовательностей. Лю-
252 Молекулярная физиология бопытно, что ген J несет информацию для
Рис. 33.27. Структура мРНК, кодирую- собными создавать в ходе эволюции новые
щей L-цепь. белки путем объединения участков ДНК, ко-
дирующих разные домены.

33.24. Разные классы антител образуются


в результате перескока генов VH
Как уже упоминалось, существует пять
классов иммуноглобулинов. Клетки, проду-
цирующие антитела, сначала продуцируют
IgM, а затем IgG, IgA, IgD или IgE той же
самой специфичности. При этом переключе-
нии от IgM на другой класс иммуноглобу-
Рис. 33.28. Сигнальная последователь- линов легкая цепь остается неизменной. Бо-
ность новосинтезированной лее того, неизменной остается и вариабель-
L-цепи. Желтым цветом отме- ная область тяжелой цепи. Меняется
чены гидрофобные остатки. только константная область тяжелой це-
пи, и потому этот этап дифференцировки
клетки, продуцирующей антитела, назы-
сплайсинга (сращивания) двух типов: вают С H -переключением (рис. 33.31).
одно - на уровне ДНК (слияние генов V и J) В эмбриональных клетках мыши гены, ко-
и другую - на уровне РНК (соединение J- дирующие константные области μ-, γ- и α-
и С-участков). тяжелых цепей (и обозначаемых соответ-
Какова структура гена, кодирующего тя- ственно Сμ, Сγ и Cα), расположены в ряд,
желую цепь? Вспомним, что Н-цепь состоит один за другим (рис. 33.32). Как оказалось,
из четырех доменов: VH, С H 1, СH2 и CH3. существует четыре гена константных участ-
Недавно было осуществлено клонирование ков γ-цепей, что полностью соответствует
фрагмента ДНК, определяющего констант- данным генетического анализа, выявившего
ную область тяжелой цепи IgG. Электрон- четыре подкласса IgG. Рядом с геном Сμ ло-
но-микроскопические исследования показа- кализуется набор расположенных тандемно
ли, что С H 1, СH2 и СH3 кодируются генов J, кодирующих последний гиперва-
разными участками ДНК (рис. 33.30). Еще риабельный участок вариабельной области.
один участок ДНК кодирует шарнирное со- Полный ген тяжелой цепи IgM образутся
единение между СH1 и С H 2. В целом до- путем транслокации гена VH к гену JH
менная структура иммуноглобулинов (рис. 33.33). В результате этой транслокации
(разд. 33.14) является отражением архи- гены VH, JH и Cμ соединяются в функцио-
тектуры соответствующих генов. Благода- нально единый ген. Вставочные последова-
ря сплайсингу организмы оказались спо- тельности между лидерным отрезком и на-

Рис. 33.29. Первичный транскрипт - пред-


шественник мРНК L-цепи. 33. Иммуноглобулины 253
Рис. 33.30. Три домена константной (С) Как показал анализ продуктов рестрик-
области тяжелой цепи и шар- тазного расщепления ДНК из эмбрио-
нирный участок кодируются нальных и миеломных клеток, СH-пере-
разными участками гена. ключение происходит на уровне ДНК,
а не РНК. Так, при переключении от
IgМ к IgA ген V H J H , расположенный рядом
чалом гена вариабельной области, между с геном Сμ, перемещается в участок, распо-
концом гена JH и началом гена Сμ, а также ложенный рядом с геном Cα (рис. 33.34).
в пределах гена Сμ выстригаются в ходе пре- При этой рекомбинации гены между Сμ и Cα
вращения первичного траскрипта в мРНК образуют петлю и выстригаются. Не исклю-
для μ-цепи. чено, что участки ДНК, претерпевающие ре-
комбинацию, несут палиндромную последо-
вательность. Именно транслокация всего
гена VHJH лежит в основе того факта, что
IgA, продуцируемый определенной клеткой,
идентичен по антигенной специфичности
IgM, синтезированному той же клеткой на
более ранней стадии развития. Каким обра-
зом клетка выбирает для транслокации
один из нескольких генов СH, остается не-
известным. Биологическое значение
СH-переключения состоит в том, что весь
домен, ответственный за узнавание (вариа-
бельный домен), перемещается от первона-
чальной константной области (Сμ) к дру-
гим константным областям, кодирующим
полипептидные цепи с иными эффекторными
функциями.

33.25. Разнообразие антител обусловлено


соматической рекомбинацией многих генов
клеток зародышевого пути
и соматической мутацией
Подытожим теперь те механизмы, которые
обеспечивают разнообразие антител. Клет-
Рис. 33.31. Синтез различных классов им- ки зародышевого пути содержат довольно
муноглобулинов. В результате большой набор генов вариабельных обла-
того, что ген VH-области снача- стей. Легкая цепь х кодируется несколькими
ла соединяется с геном сотнями (скажем, 300) генов V и пятью гена-
Сμ-области, а затем с каким-ли- ми J. Существует по крайней мере три рам-
бо другим из генов С-области, ки, в которых происходит соединение генов
формируются Н-цепи разных V и J. Отсюда следует, что общее число пол-
классов иммуноглобулинов. ных генов Vχ, образующихся при всех воз-
можных сочетаниях генов V и J, составляет
Часть V. 300•5•3 = 4500. Подобным же путем может
254 Молекулярная физиология возникнуть аналогичное число вариантов
Рис. 33.32. Гены константных областей μ-, Основные положения этой ныне общепри-
γ- и α-цепей расположены в ряд, нятой теории следующие.
один за другим. Положение ге- 1. Клетка, продуцирующая антитела, со-
нов Cδ и Cε еще не установлено. держит ДНК с уникальной последователь-
ностью оснований, определяющей последо-
тяжелых цепей. Соединение 4500 L-цепей вательность аминокислот, характерную для
с 4500 Н-цепями дает 4500•4500 = 2•107 раз- синтезируемых ею цепей иммуноглобулина.
личных по антигенной специфичности анти- Специфичность антитела целиком опреде-
тел. Это число достаточно велико, чтобы ляется последовательностью аминокислот.
обеспечить то большое разнообразие анти- 2. Каждая отдельная клетка продуцирует
тел, которое образуется в организме живот- антитела только одной специфичности. Сле-
ного. довательно, способность к синтезу опреде-
Как упоминалось выше, генов Vλ гораздо ленного антитела заложена в клетке еще до
меньше, чем генов Vχ. Так, у мышей имеет- контакта с антигеном.
ся, по-видимому, только 2 гена Vλ. Однако 3. Начинающая созревать клетка проду-
соответствующих этому гену последова- цирует небольшие количества антител
тельностей аминокислот обнаружено на- одной специфичности. Часть из них прикре-
много больше. Представляется вероятным, пляется к поверхности клетки. Если такая
что разнообразие легких цепей λ возникает незрелая клетка встречается с антигеном,
в результате соматических мутаций. В це- против которого оказались направлены ее
лом, как мы видим, природа использует антитела, то она погибает. Вследствие этого
каждый из трех обсуждавшихся выше животное обычно не производит антител
(разд. 33.19) источников разнообразия - против собственных макромолекул, т. е. оно
большой набор генов клеток зародышевого обладает толерантностью к своему. Дей-
пути, соматические рекомбинации и сомати- ствительно, клетки, продуцирующие антите-
ческие мутации: в итоге возникает тот бо- ла против собственных антигенов, элимини-
гатейший набор антител, который необхо- руются на протяжении эмбрионального
дим для защиты организма от вторжения развития. На зрелые клетки в отличие от не-
чужеродных веществ. зрелых встреча с антигеном действует сти-
мулирующим образом: усиливается синтез
33.26. Клонально-селекционная теория антител и запускается клеточное деление.
образования антител Потомки одной клетки составляют клон,
В 50-х годах Нилс Ерне, Макферлейн Бёр- обладающий всеми генетическими особен-
нет, Дэвид Тэлмедж и Джошуа Ледерберг ностями исходной клетки. Следовательно,
(Niels Jerne, Macfarlane Burnet, David деление клетки, инициированное контактом
Talmage, Joshua Lederberg) разработали кло- с антигеном, приводит к появлению клона
нально-селекционную теорию, дающую клеток, синтезирующих антитела той же
обобщенное описание иммунного ответа. специфичности.

Рис. 33.33. В результате соединения генов


VH и JH образуется ген, коди-
рующий μ-цепь. 33. Иммуноглобулины 255
а именно те, которые синтезируют антитела
против ДНФ и несут молекулы таких анти-
тел на своей поверхности. Не задержавшие-
ся на колонке лимфоциты таких антител
против ДНФ не вырабатывают.
Как происходит стимуляция лимфоцитов
под действием специфических антител?
В отсутствие антигена молекулы антител на
поверхности лимфоцита распределены слу-
чайным образом. Добавление антигена
оказывает поразительный эффект: располо-
женные на поверхности лимфоцита антите-
ла вместе с присоединенными антигенами
собираются вместе на одном конце клетки.
образуя так называемый «колпачок» («кэп»).
По завершении перераспределения моле-
кулы антител оказываются внутри клетки.
Образование «колпачка» идет с потребле-
нием энергии и при участии сократительных
элементов клетки. Итак, формирование на
поверхности клетки решетки из комплексов
антиген—антитело ведет к образованию
«колпачка», а это стимулирует клеточное
деление. Антиген должен быть полива-
Рис. 33.34. Структурная основа С H -пере-
лентным (т. е. содержать более одной специ-
ключения. В результате вну- фической детерминанты) для того, чтобы
трихромосомной рекомбина-
создать перекрестные связи между молеку-
ции ген VHJH, находивший-
лами антител на поверхности лимфоцита.
ся возле гена Сμ, оказывается
Вопрос о зависимости митотической актив-
рядом с геном Cα.
ности клеточного ядра от этих событий,

4. Клон проявляет тенденцию к сохране-


нию и после исчезновения антигена. В слу-
чае нового появления того же антигена про-
исходит стимуляция этих клеток, что
и обусловливает иммунологическую память.

33.27. На поверхности клеток, продуцирую-


щих антитела, имеются рецепторы
антигенов
Молекулы специфических антител располо-
жены на поверхности продуцирующих их
клеток. Клетками-предшественниками
являются лимфоциты. В обычных условиях
они делятся медленно. Однако в результате Рис. 33.35. Полученное в сканирующем
стимуляции антигеном лимфоцит превра- электронном микроскопе изо-
щается в плазматическую клетку, очень ак- бражение бараньих эритроци-
тивно синтезирующую и продуцирующую тов, связавшихся с челове-
антитела. Если популяцию лимфоцитов ческим Т-лимфоцитом (в цен-
пропустить через колонку, содержащую ко- тре). Поверхность этого лим-
валентно присоединенные динитрофе- фоцита имеет рецепторы, спе-
нильные (ДНФ) группы, то на колонке свя- цифичные в отношении компо-
жется только очень небольшая часть клеток, нентов бараньих эритроцитов.
(Печатается с любезного разре-
Часть V. шения д-ра J. Thornthwaite,
256 Молекулярная физиология д-ра R. Life и д-ра М. Сауег.)
Рис. 33.36. Полученное методом радиоав- новая тема в биологии. В самом деле, в этом
тографии изображение имму- суть теории Дарвина. Любопытно отме-
ноглобулинов, образовавших тить, что инструктивные теории предше-
«колпачок» на поверхности ствуют селекционным теориям: теория Ла-
В-лимфоцита. Темные включе- марка предшествовала теории Дарвина,
ния - меченные 125 I антитела инструктивная теория в иммунологии была
против иммуноглобулинов, до- сформулирована раньше, чем клонально-се-
бавленные к В-лимфоцитам из лекционная теория.
селезенки мыши. А - при 4°С Ерне высказал предположение, что меха-
молекулы иммуноглобулинов низмы отбора могут играть роль в функцио-
равномерно распределяются нировании нервной системы, например в ме-
на поверхности клетки; Б - пос- ханизмах памяти. По существу, инструктив-
ле инкубации при 37°С метка ная и селекционная теории обучения были
концентрируется в виде «кол- сформулированы очень давно. Локк (Lock)
пачка» на одном полюсе клетки считал, что мозг человека подобен чистому
и затем попадает внутрь по- листу бумаги, на котором опыт выписывает
средством эндоцитоза. (Печа- почти бесконечные узоры. Сократ, напро-
тается с любезного разрешения тив, утверждал, что «все обучение - это на-
д-ра Е. Unanue.) поминание о том, что уже существует в моз-
гу». Будем надеяться, что эта глава вам
кажется чем-то давно знакомым!
разыгрывающихся на поверхности клетки,
составляет интересную и важную область Заключение
исследований. Антитело - это белок, который синтезирует-
ся в организме животного в ответ на про-
33.28. Биологическое значение клональной никновение чужеродного макромолекуляр-
селекции ного соединения (называемого антигеном
Сущность теории селекции клонов в форму- или иммуногеном) и который обладает вы-
лировке Бёрнета состоит в следующем: соким сродством к нему. Небольшие чуже-
Ни один участок связывания антигена родные молекулы (гаптены) вызывают
не адаптирован в эволюционном смысле образование специфических антител только
в какой-либо определенной антигенной в том случае, если такие гаптены присоеди-
детерминанте. Структура участка, связы- нены к макромолекулам. Синтез антител
вающего антиген, существует как таковая, определяется действием отбора, а не ин-
и если она оказывается подходящей в том струкции. Антиген связывается на поверхно-
смысле, что сродство к данной антиген- сти тех лимфоцитов, которые исходно син-
ной детерминанте превышает какой-то тезируют антитела, специфичные к данному
определенный уровень, то инициируется антигену. Присоединение антигена к рецеп-
иммунологически значимая реакция.
Отбор предсуществующих вариантов,
возникающих случайным образом,- это не 33. Иммуноглобулины 257
тору на поверхности клетки запускает про- го антиген-связывающий (вариабельный)
цесс клеточного деления и синтез больших домен.
количеств специфического антитела. Анти- Вариабельная и константная области ко-
тела против специфической детерминанты дируются разными генами, соединяющими-
обычно гетерогенны, поскольку они проду- ся в процессе дифференцировки клеток.
цируются разными клетками. Антитела, вы- Имеется несколько сотен генов вариа-
рабатываемые одной клеткой или одним бельных участков L- и Н-цепей. Полный ген
клоном клеток, гомогенны. В сыворотке вариабельного участка легкой цепи обра-
имеется пять классов антител, причем ос- зуется путем рекомбинации неполного гена
новной класс - это иммуноглобулины D. V и одного из нескольких генов J, кодирую-
После введения антигена первыми появ- щих последний гипервариабельный участок.
ляются в сыворотке антитела, принадлежа- Расположенная тандемно группа генов J ло-
щие к классу иммуноглобулинов М. Имму- кализована рядом с геном С. Первичный
ноглобулины А - это класс антител, сек- продукт транскрипции содержит вста-
ретируемых с продуктами внешней секре- вочные последовательности. Эти вста-
ции. Роль иммуноглобулинов D и Е пока вочные последовательности удаляются, и
еще не установлена. в результате образуется мРНК, кодирую-
Антитела состоят из легких (L) и тяжелых щая вариабельные и константные области
(Н) цепей. Иммуноглобулин G, имеющий иммуноглобулина, а также N-концевую ги-
субъединичную структуру L 2 H 2 , содержит дрофобную сигнальную последователь-
два участка связывания антигена. При фер- ность, которая в последующем отщепляется
ментативном расщеплении иммуноглобу- от новосинтезированной полипептидной це-
лина G образуются два Fab-фрагмента, ко- пи. Синтез тяжелой μ-цепи IgM кодируется
торые связывают антиген, но не дают с ним полным геном, также образовавшимся в ре-
осадка, а также один Fс-фрагмент, обладаю- зультате сращивания генов V и J. Тяжелые
щий функцией эффектора (в частности, цепи иммуноглобулинов других классов (в
связывает комплемент). Сравнение последо- частности IgG) синтезируются после транс-
вательностей аминокислот в миеломных локации полного гена VH к другому гену С
иммуноглобулинах показало, что L- и Н-це- (С γ ). Этот перескок генов называется
пи состоят из вариабельной (V) области (N- СH-переключением. Разнообразие легких х-
концевая последовательность, обычно из цепей, а также тяжелых цепей обусловлено
108 остатков) и константной (С) области. соматической рекомбинацией довольно
Участки связывания антигена сформиро- большого числа гаметных генов (т.е. генов
ваны из остатков аминокислот, принадле- клеток зародышевого пути) вариабельных
жащих гипервариабельным участкам вариа- областей и участков соединения. Степень
бельных областей как L-, так и Н-цепей. разнообразия возрастает также в результате
Молекулы антител свертываются в ком- соединения генов в различных рамках. Раз-
пактные домены, содержащие примерно по нообразие легких цепей обусловлено, по-ви-
108 аминокислотных остатков в виде гомо- димому, соматическими мутациями. Соче-
логичных последовательностей. Полагают, тание нескольких тысяч видов L-цепей
что домены константной области, выпол- с таким же количеством видов Н-цепей
няющие эффекторные функции, возникли обеспечивает то огромное число различных
в процессе эволюции путем удвоения и по- антител, которое синтезируется в организме
следующего расхождения гена, кодирующе- животного.

РЕКОМЕНДУЕМАЯ antibodies, Sci. Amer., 243(4), 66-74. Книги


ЛИТЕРАТУРА Porter R.R., 1973. Structural studies of Hood L.E., Weissman I.L., Wood
immunoglobulins, Science, 180, W.B., 1978. Immunology, Benjamin.
С чего начать 713-716. (Ясное, легко читаемое изложение ос-
Capra J.D., Edmundson А.В., 1977. The Edelman G.M., 1973. Antibody struc- нов иммунологии.)
antibody combining site, Sci. Amer., ture and molecular immunology, Kabat E.A., 1976. Structural Concepts
236(1), 50-59. Science, 180, 830-840. in Immunology and Immunochemistry,
Milstein C., 1980. Monoclonal (2nd ed.), Holt, Rinehart, and Winston.
(Прекрасное описание структуры им-
Часть V. муноглобулинов и ее связи со специ-
258 Молекулярная физиология фичностью связывания антигенов.)
Mishell B.B., Shiigi S.M. (eds.), 1980. separate DNA segments, Nature, 277, two recombinational events, Nature,
Selected Methods in Cellular Immuno- 627-633. 283, 733-739.
logy, Freeman. (Очень хорошее руко-
водство по экспериментальным ме- Механизмы, создающие разнообразие Эффекторные функции иммуноглобу-
тодам в иммунологии.) антител линов
Seidman J.G., Leder A., Nau M, Porter R.R., Reid K.B.M., 1978. The
Структура иммуноглобулинов Norman B., Leder P., 1978. Antibody biochemistry of complement, Nature,
Amzel L.M., Poljak R.J., 1979. Three- diversity, Science, 202, 11-17. 275, 699-704.
dimensional structure of immunogl- Sakano H., Huppi K., Heinrich G., Metzger H., 1978. The IgE-mast cell
obulins, Ann. Rev. Biochem., 48, Tonegawa S., 1979. Sequences at the system as a paradigm for the study of
961-967. somatic recombination sites of immun- antibody mechanisms, Immunol. Rev.,
Silverton E.W., Navia M.A., Davi- oglobulin light-chain genes, Nature, 41, 186-199.
es D.R., 1977. Three-dimensional struc- 280, 288-294.
ture of an intact human immunogl- Seidman J.G., Max E.E., Leder P., Селекция клонов и клеточная иммуно-
obulin, Proc. Nat. Acad. Sci., 74, 1979. A χ-immunoglobulins gene is логия
5140-5144. formed by site-specific recombination Burnet F.M., 1959. The Clonal
Valentine R.C, Green N.M., 1967. without further somatic mutation, Selection Theory of Acquired
Electron microscopy of an antibody- Nature, 280, 370-375. Immunity, Cambridge University Press.
hapten complex, J. Mol. Biol., 27, Schilling J., Clevinger В., Davie J.M., Jerne N.K., 1967. Antibodies and
615-617. Hood L., 1980. Amino acid sequence of learning: selection versus instruction.
homogeneous antibodies to dextran and In: Quarton G.C, Melnechuk T. and
Архитектура генов DNA rearrangements in heavy chain Schmitt F.O. (eds.), The Neurosciences:
Tonegawa S., Maxam A.M., Tizard R., V-region gene segments, Nature, 283, A Study Program, Rockefeller
Bernard O., Gilbert W., 1978. Sequence 35-40. University Press.
of a mouse germ-line gene for a variable Kataoka Т., Kawakami Т., Takahashi- Cunningham B.A., 1977. The structure
region of an immunoglobulin light N., Honjo Т., 1980. Rearrangement of and function of histocompatability
chain, Proc. Nat. Acad. Sci., 75, immunoglobulin γ1-chain gene and antigens, Sci. Amer., 237(4), 96-107.
1485-1489. mechanism for heavy-chain class switch, Raff M.C., 1976. Cell-surface immunol-
Sakano H., Rogers J.H., Huppi K., Proc. Nat. Acad. Sci, 77, 919-923. ogy, Sci. Amer., 234(5), 30-39.
Brack C., Traunecker A., Maki R., Davis M.M., Calame K., Early P.W., Jerne N.K., 1973. The immune system,
Wall R., Tonegawa S., 1979. Domains Livant D.L., Joho R., Weissman I.L., Sci. Amer., 229(1), 52-60.
and the hinge region of an immunogl- Hood L., 1980. An immunoglobulin
obulin heavy chain are encoded in heavy-chain gene is formed by at least
ток, окруженных электровозбудимой мем-
ГЛАВА 34 браной - сарколеммой. Мышечная клетка
содержит большое число параллельных
Мышечное сокращение миофибрилл диаметром около 1 мкм каж-
и подвижность клеток дая. Миофибриллы погружены во внутри-
клеточную жидкость, называемую сарко-
Каким образом энергия химических связей плазмой. В саркоплазме имеются гликоген,
трансформируется в координированное АТР, фосфокреатин и гликолитические фер-
движение? Это один из самых острых воп- менты. В активно функционирующих мыш-
росов современной молекулярной биоло- цах обнаруживается также много митохон-
гии. Направленное движение имеет место дрий, регулярно расположенных вдоль мио-
при расхождении хромосом в процессе кле- фибрилл.
точного деления, при внедрении ДНК бакте-
риофага в бактериальную клетку, при бие-
нии ресничек и жгутиков, при активном
транспорте молекул, при перемещении РНК
в ходе белкового синтеза и - в наиболее оче-
видной форме - при мышечном сокращении.
В данной главе мы будем рассматривать
главным образом структурную основу про-
цесса сокращения поперечнополосатых
мышц позвоночных, поскольку этот процесс
изучен наиболее полно. Сократительная си-
стема поперечнополосатой мышцы состоит
из перекрывающихся белковых нитей, ко-
торые скользят относительно друг друга.
Сокращение происходит за счет энергии,
высвобождающейся при гидролизе АТР.
В поперечнополосатой мышце оно зависит
2+
от концентрации Са , которая в свою оче-
редь регулируется саркоплазматическим ре-
тикулумом - специализированной системой
мембран, накапливающей Са2+ в состоянии
покоя и высвобождающей его при воздей-
ствии на мышечное волокно нервного им-
пульса.

34.1. Мышца состоит из взаимодействующих


друг с другом толстых и тонких
белковых нитей Рис. 34.1. Волокно скелетной мышцы
Произвольные мышцы позвоночных в све- в фазово-контрастном свето-
товом микроскопе выглядят поперечно ис- вом микроскопе. Диаметр во-
черченными (рис. 34.1). Они состоят из кле- локна около 50 мкм. А-диски —
темные, I-диски - светлые. (Пе-
Часть V. чатается с любезного разреше-
260 Молекулярная физиология ния д-ра Hugh Huxley.)
Электронная микрофотография продоль-
ного среза миофибрилл выявляет множе-
ство деталей структуры (рис. 34.2 и 34.3).
Функциональной единицей является сарко-
мер, который повторяется каждые 2,3 мкм
(23 000 А) по длинной оси фибриллы. Регу-
лярно чередуются темная полоса - А-диск
и светлая полоса - I-диск. Середина А-диска,
называемая зоной Н, отличается меньшей
электронной плотностью. По центру зоны
Н проходит темная М-линия. I-диск пересе-
кается узкой Z-пластинкой высокой элек-
тронной плотности.
О молекулярном устройстве саркомера
в толщину можно судить по электронным
микрофотографиям поперечного среза че-
рез миофибриллу. На них видны два типа
взаимодействующих друг с другом белковых
нитей (миофиламентов). Диаметр толстых
нитей равен примерно 150 А, а диаметр
тонких - около 70 А. Толстые нити содер-
жат главным образом миозин, тонкие - ак-
тин, тропомиозин и тропонин. В Z-пластин-
ке имеется α-актинин, а в М-линиях - М-бе- Рис. 34.2. Электронная микрофотогра-
лок. фия продольного среза волок-
I-диск состоит только из тонких нитей, на скелетной мышцы. (Печа-
тогда как в зоне Н А-диска присутствуют тается с любезного разрешения
только толстые нити. В других частях А-ди- д-ра Hugh Huxley.)
ска присутствуют нити обоих типов. На по-
перечном срезе четко видно гексагональное
устройство миофибриллы, при котором шечного сокращения, получившую название
каждая тонкая нить соседствует с тремя модель скользящих нитей. Основные черты
толстыми, а каждая толстая нить окружена этой модели (рис. 34.6), выдвинутой
шестью тонкими (рис. 34.3). Взаимодей- Эндрью Хаксли и Р. Нидергерке (Andrew
ствие толстых и тонких нитей осуществляет- Huxley, R. Niedergerke), а также Хью Хаксли
ся с помощью поперечных мостиков, ко- и Джейн Хенсон (Hugh Huxley, Jean Hanson),
торые представляют собой домены молекул заключаются в следующем.
миозина. Поперечные мостики, с регу- 1. Длина как толстых, так и тонких нитей
лярными интервалами выступающие на в ходе мышечного сокращения не меняется.
толстых нитях, перекрывают промежуток 2. В то же время длина саркомера при со-
шириной 130 А между поверхностью кращении уменьшается вследствие того, что
толстых и тонких нитей (рис. 34.4 и 34.5). По нити двух типов перекрываются в большей
существу, именно взаимодействие миози- степени, а именно в ходе сокращения
новых поперечных мостиков с единицами толстые и тонкие нити скользят относи-
актина в тонких нитях генерирует силу тельно друг друга.
сокращения. 3. Сила сокращения генерируется в ре-
зультате активного движения нитей одного
34.2. При мышечном сокращении происходит типа вдоль прилегающих нитей другого
скольжение толстых и тонких нитей типа.
относительно друг друга В пользу этой модели свидетельствуют
Когда мышца сокращается, степень ее уко- данные, полученные при измерении длины
рочения может достигнуть 1/3 первоначаль- А- и I-дисков, а также зоны Н в растянутой,
ной длины. С чем это связано? В 50-х годах покоящейся и сократившейся мышце
две группы исследователей независимо друг (рис. 34.6). А-диск характеризуется постоян-
от друга постулировали, исходя из данных
дифракции рентгеновских лучей, световой 34. Мышечное сокращение
и электронной микроскопии, модель мы- и подвижность клеток 261
Рис. 34.3. Электронограмма продольно-
го среза миофибриллы скелет-
ной мышцы. Под микрофото-
графией приведено схематиче-
ское изображение соответ-
ствующих поперечных срезов.
(Печатается с любезного разре-
шения д-ра Hugh Huxley.)

ной длиной, т. е. размер толстых нитей при


сокращении не меняется. Расстояние между
Z-пластинкой и началом ближайшей к ней
зоны Н также постоянно; следовательно,
и размер тонких нитей не меняется при со-
кращении. Однако зона Н и I-диск при со-
кращении становятся уже, поскольку в со-
кратившемся волокне толстые и тонкие
нити перекрываются в большей мере, чем
в покоящейся мышце.

34.3. Миозин образует толстые нити;


он гидролизует АТР и связывает актин
Миозин обладает тремя биологически
важными функциями. Во-первых, при фи-
зиологических значениях ионной силы и рН Рис. 34.4. Вид поперечных мостиков ме-
молекулы миозина в растворе спонтанно жду толстыми и тонкими нитя-
образуют волокна. По существу, толстые ми под электронным микро-
скопом. (Печатается с любез-
Часть V. ного разрешения д-ра John
262 Молекулярная физиология Heuser.)
Рис. 34.5. Схематическое изображение нити миофибрилл состоят в основном из
структуры поперечнополоса- молекул миозина. Во-вторых, миозин - это
той мышцы, показывающее фермент. В 1939г. В. А. Энгельгардт
взаимное перекрывание и М. Н. Любимова обнаружили, что миозин
толстых и тонких нитей, и со- обладает АТР-азной активностью:
ответствующая электронная АТР + Н2О ADP + Pi + Н
+

микрофотография сверхтонко-
го продольного среза. (Печа- Эта реакция является непосредственным
тается с любезного разрешения источником свободной энергии, необходи-
д-ра Hugh Huxley.) мой для мышечного сокращения. В-третьих,

Рис. 34.6. Модель скользящих нитей. миозин связывает полимеризованную фор-


(Huxley Н. Е., The mechanism of му актина - основного компонента тонких
muscular contraction, Scientific нитей. Именно это взаимодействие играет
American, Inc., 1965.) ключевую роль в генерировании силы, обес-
печивающей смещение толстых и тонких ни-
тей относительно друг друга.
Молекула миозина очень большая
(500 кДа). Она состоит из двух идентичных
основных цепей (по 200 кДа) и четырех лег-
ких цепей (примерно по 20 кДа). На элек-
тронных микрофотографиях видно, что
миозин состоит из глобулярной, образую-
щей две головки части, присоединенной
к очень длинному стержню (рис. 34.7 и 34.8).
Стержень представляет собой двухцепочеч-
Рис. 34.7. Электронная микрофотогра- ную α-спирализованную суперспираль.
фия молекулы миозина. (Печа-
тается с любезного разрешения 34. Мышечное сокращение
д-ра Susan Lowey.) и подвижность клеток 263
Рис. 34.8. Схематическое изображение но не способен к образованию волокон.
молекулы миозина. ТММ состоит из вытянутой стержневидной
части и глобулярной (в виде двух головок)
области (рис. 34.9). При дальнейшем фер-
34.4. Миозин можно расщепить ментативном расщеплении ТММ распа-
на активные фрагменты дается на два глобулярных субфрагмента
Если миозин подвергнуть ферментативному (обозначаемых S1) и один фибриллярный
расщеплению, то образуются фрагменты, субфрагмент (S2). Каждый S1-фрагмент
сохраняющие некоторые функции интакт- имеет участок с АТР-азной активностью
ной молекулы. Выше на примере иммуно- и участок связывания актина. Кроме того,
глобулинов (разд. 33.5) уже было показано, к S1-фрагменту присоединены легкие цепи
насколько плодотворен такой эксперимен- миозина. Легкие цепи способны модулиро-
тальный подход при изучении макромоле- вать АТР-азную активность миозина. Так,
кул. На самом же деле этот подход был раз- например, в гладких мышцах ими опосредо-
работан для миозина раньше, чем для вано регулирующее действие Са 2+ на сокра-
иммуноглобулинов. В 1953 г. Эндрью Сент- щение.
Дьёрдьи (Andrew Szent Gyorgyi) показал, что
при обработке трипсином миозин расщеп-
ляется на два фрагмента, названные им лег-
ким меромиозином и тяжелым меромиози-
ном (рис. 34.9).
Легкий меромиозин (ЛММ), подобно
миозину, образует нити. Однако он не обла-
дает АТР-азной активностью и не связывает
актина. На электронных микрофотографиях
видно, что ЛММ имеет форму стержня; уд-
линенность структуры обусловливает высо-
кую вязкость растворов ЛММ. Данные
определения оптического вращения показа-
ли, что 90% молекулы ЛММ имеет структу-
ру α-спирали. Это подтверждалось и при
анализе дифракции рентгеновских лучей;
волокна ЛММ дают сильный рефлекс при
5,1 А, характерный для α-спирализованных
суперспиралей. В целом, как было уста-
новлено, ЛММ представляет собой двухце-
почечный α-спирализованный стержень дли-
ной 850 А.
Тяжелый меромиозин (ТММ) обладает
совершенно иными свойствами. ТММ ката-
лизирует гидролиз АТР и связывает актин,
Рис. 34.9. Ферментативное расщепление
Часть V. миозина. На схеме не показаны
264 Молекулярная физиология 4 легкие цепи.
этих белков актомиозин. Формирование
этого комплекса сопровождается большим
увеличением вязкости раствора. В 40-х го-
дах Альберт Сент-Дьёрдьи показал, что воз-
растание вязкости обращается добавлением
АТР. Так было выявлено, что АТР вызывает
диссоциацию актомиозина на актин и мио-
зин. Сент-Дьёрдьи получил также нити ак-
томиозина, молекулы которого были ориен-
тированы определенным образом током
жидкости. Когда эти нити поместили в рас-
+ 2+
твор, содержащий АТР, К и Mg , полу-
чился поразительный результат: актомио-
зиновые нити сократились. В тех же усло-
виях нити, образованные из одного миози-
на, не сокращались. Эти замечательные
опыты дали основание думать, что мышеч-
Рис. 34.10. Электронная микрофотогра- ное сокращение возникает в результате
фия нити из очищенного F-ак- взаимодействия миозина, актина и АТР.
тина. (Печатается с любезного
разрешения д-ра James 34.6. Актин повышает АТР-азную
Spudich.) активность миозина
АТР-азная активность миозина значительно
34.5. Актин образует нити, которые возрастает в присутствии стехиометриче-
соединяются с миозином ских количеств F-актина. Так, число оборо-
Актин - основной компонент тонких нитей. тов увеличивается в 200 раз: от 0,05 до
В растворах с низкой ионной силой актин 10 с-1. Собственно гидролиз АТР чистым
существует в виде мономера массой 42 кДа, миозином идет очень быстро, но продукты
обозначаемого как G-актин (G от англ. реакции-ADP и Рi - высвобождаются мед-
globular - глобулярный). При повышении ленно. Актин увеличивает число оборотов
ионной силы до физиологического уровня миозина, присоединяясь к комплексу
G-актин полимеризуется в F-актин - фи- миозин—ADP—P i и ускоряя высвобожде-
бриллярную форму, очень похожую на тон- ние ADP и Рi (рис. 34.12). После акта гидро-
кие нити. На электронных микрофотогра- лиза актомиозин связывается с АТР, что

Рис. 34.11. Схематическое изображение приводит к его диссоциации на актин и мио-


F-актина, состоящего из спи- зин. В результате вновь образуется ком-
рально расположенных моно- плекс миозин—АТР, входящий в новый ка-
меров актина. (По схеме, лю- талитический цикл. Эти реакции идут
безно предоставленной д-ром с участием Mg 2 + . Важнейшая особенность
James Spudich.) рассматриваемого цикла, который был
предложен Эдвином Тейлором (Edwin
фиях волокна F-актина выглядят как две Taylor) на основе изучения быстрой кинети-
нити бус, закрученные одна вокруг другой ки процесса, состоит в том, что актин обла-
(рис. 34.10). Рентгеноструктурный анализ дает высоким сродством к миозину и ком-
показал, что F-актин представляет собой плексу миозин—ADP—P i , но низким срод-
спираль из мономеров актина. Диаметр спи- ством к комплексу миозин—АТР. Вслед-
рали - около 70 А. Структура состоит из по- ствие этого актин то присоединяется
вторяющихся участков длиной 360 А по оси к миозину, то высвобождается из комплекса
спирали (рис. 34.11).
При добавлении раствора актина 34. Мышечное сокращение
к раствору миозина образуется комплекс и подвижность клеток 265
миофиламентов, отделенных от мышцы,
а также искусственных волокон, образо-
ванных из очищенного миозина, Хью Хакс-
ли показал, как расположены молекулы
миозина в толстых нитях. Выделенная из
мышечного волокна толстая нить имеет
диаметр 160 А и длину примерно 1,5 мкм
(15 000 А). Вдоль нити периодически по спи-
рали выступают поперечные мостики,
и только в середине остается свободная от
мостиков область протяженностью 1500 А
(рис. 34.13).
Аналогичную структуру имеют и искус-
ственные толстые нити, образующиеся при
снижении ионной силы раствора миозина.
Рис. 34.12. Гидролиз ATP приводит к цик- Длина наиболее короткой искусственной
лическому образованию и рас- нити составляет около 3000 А, а располо-
паду комплекса актина и мио- женная в середине свободная от мостиков
зина. зона - 1500 А. Поскольку такая же протя-
женность свободной зоны свойственна и бо-
с ним - в зависимости от гидролиза ATР. лее длинным искусственным нитям, очевид-
Как будет показано ниже, это АТР-зависи- но, что рост толстых нитей происходит
мое изменение во взаимодействии миозина путем добавления молекул параллельно
и актина лежит в основе генерирования к уже собранному ряду. Молекулы миозина,
силы при мышечном сокращении. расположенные по одну сторону от свобод-
ной от мостиков зоны, ориентированы
34.7. Толстые и тонкие нити в одном направлении, тогда как молекулы по
мышечного волокна определенным образом другую сторону ориентированы в противопо-
ориентированы ложном направлении. Следовательно,
Циклический процесс образования и диссо- толстые нити по самой своей природе
циации комплекса миозина и актина создает биполярны.
координированное движение потому, что ЛММ, подобно миозину, агрегирует
эти белки входят в состав высокоорганизо- в растворах с низкой ионной силой, образуя
ванной системы. Путем изучения интактных нити с периодической структурой, где длина

Рис. 34.13. Электронная микрофотогра- повторяющегося участка составляет по оси


фия реконструированной тол- 430 А, т. е. столько же, сколько составляет
стой нити. расстояние между поперечными мостиками
По обе стороны от свободной в интактной толстой нити. Однако нити из
зоны видны выступающие по- ЛММ гладкие, без выступающих мостиков.
перечные мостики. (Печатается Это показывает, что поперечные мостики
с любезного разрешения д-ра образуются в ТММ-части миозина, тогда
Hugh Huxley.) как ЛММ-единицы миозина образуют ске-
лет толстых нитей.
Часть V. Тонкие нити также имеют определенное
266 Молекулярная физиология направление. Если миозин (или ТММ, или
присуща направленность, одинаковая на обо-
их тяжах, составляющих тонкую нить.
В некоторых препаратах тонких нитей, по-
лученных из гомогенизированных мышц,
часть нитей сохраняет связь с Z-пластинкой.
При декорировании таких препаратов тя-
желым меромиозином стрелки на всех ни-
тях оказались направлены в сторону от
Z-пластинки. Отсюда следует, что все тон-
кие нити по одну сторону от Z-пластинки
ориентированы в одном направлении, тогда
как нити, расположенные по другую сторо-
ну,- в противоположном.

34.8. Полярность толстых и тонких нитей


в середине саркомера меняется
на противоположную
Полярность структуры толстых и тонких
нитей играет решающую роль в координи-
рованном движении. Благодаря тому что
участки взаимодействия на нитях актина
и миозина ориентированы одинаково по
отношению друг к другу, в ходе скольже-
ния нитей происходит сложение сил, разви-
вающихся в каждом участке взаимодейст-
вия. Кроме того, посередине между двумя
Z-пластинками направление нитей меняет-
ся на противоположное (рис. 34.15). В итоге
две тонкие нити при взаимодействии с од-
ной толстой скользят навстречу друг другу,
что приводит к уменьшению расстояния
между Z-пластинками (рис. 34.16).

34.9. «Рабочим ходом» является поворот


связанной с актином S1-головки миозина
Генерирование силы сокращения связано
с циклическим образованием и диссоциа-
цией комплекса между S1-головкой миозина
и актином. Циклически повторяющиеся
Рис. 34.14. Электронная микрофотогра- процессы присоединения, подтягивания
фия нити F-актина, декориро-
ванной S1-головками ТММ.
Все стрелки ориентированы
в одну сторону. (Печатается
с любезного разрешения д-ра
James Spudich.)

S1) добавить к тонким нитям или F-актину,


то формируется структура, которая под
электронным микроскопом выглядит как
ряд последовательно расположенных стре- Рис. 34.15. Перемена полярности толстых
лок (рис. 34.14). Такие структуры получили и тонких нитей посередине ме-
образное название декорированные нити. По жду двумя Z-пластинками.
всей длине декорированных нитей стрелки
на обоих тяжах направлены в одну сторону. 34. Мышечное сокращение
Таким образом, тонким нитям изначально и подвижность клеток 267
Рис. 34.16. Схема взаимодействия толс- ловка S1 совершает поворот, принимая на-
тых и тонких нитей при сокра- клонное положение по отношению к тонкой
щении скелетной мышцы. (По нити (рис. 34.17, В). Таким образом, «рабо-
схеме, любезно предоставлен- чий ход» обеспечивается высвобождением
ной д-ром James Spudich.) прочно связанных ADP и Pi. На следующем
этапе происходит отделение головки S1 от
и отсоединения сопровождают даже оди- тонкой нити вследствие связывания АТР
ночное сокращение. Механизм генерирова- (рис. 34.17, Г). Далее отсоединенная от акти-
ния силы сокращения изучается в настоящее на головка S1 вновь становится около тон-
время методами биохимии, электронной кой нити перпендикулярно ей. Завершаю-
микроскопии, дифракции рентгеновских лу- щий этап цикла - гидролиз АТР головкой
чей. Полученные данные показывают, что S1, не связанной с актином.
в покоящейся мышце головки S1 не связаны В молекуле миозина имеется два типа
с тонкими нитями (рис. 34.17, А). В этом фи- шарнирных соединений, благодаря ко-
зиологическом состоянии головки S1 распо- торым головка S1 обратимо присоединяет-
лагаются вокруг толстой нити по спирали. ся к актину или отсоединяется от него, а так-
При стимуляции мышцы S1-головки ото- же, находясь в связанном с актином
двигаются от толстых нитей и прикре- состоянии, меняет свое направление. Шар-
пляются к актиновым единицам на тонких нир одного типа локализован между каждой
нитях (рис. 34.17, Б). На следующем этапе из головок S1 и стержнем S2, а шарнир вто-
головки S1 меняют свое направление так, рого типа - между S2 и ЛММ-единицей
что их длинная ось образует угол примерно миозина (рис. 34.18). Шарниры предста-
45° с осью тонких нитей (рис. 34.17, В). вляют собой гибкие участки полипептидной
Этот постулированный поворот головок цепи, легко расщепляемые гидролитически-
миозина является, по-видимому, рабочим хо- ми ферментами. Собственно сам факт фер-
дом мышечного сокращения. Через S2-еди- ментативного расшепления миозина на
ницу миозина поворот S1-домена передает- фрагменты ЛММ, S1 и S2 указывает на то,
ся на толстую нить. В итоге толстая нить что миозин образован из доменов, соеди-
продвигается относительно тонкой пример- ненных между собой шарнирными участка-
но на 75 А. Завершающий этап процес- ми. Функция домена S2 состоит в передаче
са - отсоединение S1-головки от тонких ни- напряжения от связанной с тонкой нитью
тей (рис. 34.17, Г). головки S1 на домен ЛММ, составляющий
Сопоставим эти предполагаемые струк- часть толстой нити. Благодаря шарнирному
турные переходы, обеспечивающие возник- участку между S1 и S2 головка S1 может по-
новение силы сокращения, с промежуточны- разному взаимодействовать с актином в за-
ми этапами гидролиза АТР. В состоянии висимости от того, имеются ли на ней про-
покоя миозин содержит прочно связанные чно связанные ADP и Рi или нет. Другой
ADP и Рi (рис. 34.17, А). При стимуляции шарнирный участок, соединяющий S2
мышечного волокна головка S1 присоеди- и ЛММ, допускает довольно большие изме-
няется к тонкой нити в перпендикулярном нения в положении S1 относительно тол-
ей направлении (рис. 34.17, Б). Далее ADP и стой нити и тем самым обеспечивает точ-
Рi, связанные с S1, высвобождаются, а го- ность взаимодействия S1 с актином. В итоге
напряжение может генерироваться на боль-
Часть V. шом протяжении латеральных поверхно-
268 Молекулярная физиология стей толстых и тонких нитей. В целом сег-
ментарная подвижность (гибкость) шар-
нирного типа играет критическую роль
в мышечном сокращении, так же как и в ме-
ханизме действия антител (разд. 33.7).

34.10. Тропонин и тропомиозин опосредуют


регуляторное действие ионов кальция
на мышечное сокращение
Физиологическим регулятором мышечного
2+
сокращения служит Са . Сетсуро Эбаши
2+
(Setsuro Ebashi) открыл, что влияние Са
на взаимодействие актина и миозина опос-
редовано тропомиозином и тропониновым
комплексом, которые локализованы в тон-
ких нитях и составляют около трети их
массы. Тропомиозин представляет собой
двухцепочечный α-спирализованный тяж.
Этот очень сильно вытянутый белок массой
70 кДа располагается почти параллельно
длинной оси тонкой нити (рис. 34.19). Тро-
понин - комплекс трех полипептидных це-
пей: ТнС (18 кДа), ТнI (24 кДа) и ТнТ (37
кДа). ТнС связывает ионы кальция, ТнI
связывается с актином, а ТнТ - с тропомио-
зином. Тропониновые комплексы располо-
жены на тонких нитях на расстоянии 385 А
друг от друга, причем этот интервал задает-
ся длиной тропомиозина. Тропониновый
комплекс, связанный с одной молекулой Рис. 34.17. Предполагаемый механизм ге-
тропомиозина, регулирует активность при- нерирования силы при взаимо-
мерно 7 мономеров актина. действии S1-головок нитей
В отсутствие Са 2+ тропонин и тропомио- миозина с нитями актина. По-
зин ингибируют взаимодействие актина ворот головки S1, связанной
и миозина. При этом тропомиозин стериче- с актином, вызывает движение
ски блокирует участки связывания S1 на ак- толстых нитей относительно
тине. Нервный импульс, как будет показано тонких (на схеме - переход от
ниже, запускает высвобождение Са2+ из Б к В).
саркоплазматического ретикулума.
Высвобожденный Са 2+ связывается с ТнС-
компонентом тропонина, что вызывает кон-
формационные сдвиги, передающиеся на
тропомиозин и затем на актин. В частности,
тропомиозин передвигается к центру длин-
ной впадины, идущей спирально вдоль тон-
кой нити. Это разрешает взаимодействие
S1-головок миозина с актиновыми единица-
ми тонких нитей. Возникает сила сокраще-
ния и одновременно гидролизуется АТР; да- Рис. 34.18. Два типа шарнирных соедине-
лее происходит удаление Са 2+ , и тропомио- ний в миозине - один между S1
зин вновь блокирует доступ актина и S2, второй между S2
к S1-головкам миозина. Таким образом, и ЛММ - позволяют изменять
Са2+ регулирует мышечное сокращение по положение головки S1 по отно-
аллостерическому механизму со следующей шению к актину во время «ра-
последовательностью передачи информации: бочего хода».
Са2 + —> Тропонин —> Тропомиозин —> 34. Мышечное сокращение
—> Актин —> Миозин. и подвижность клеток 269
34.11. Поток ионов Са 2 + регулируется
саркоплазматическим ретикулумом
Нервный импульс, достигший концевой
пластинки, т.е. области нервно-мышечного
контакта, вызывает деполяризацию наруж-
ной мембраны мышечного волокна. По Т-
трубочкам (Т от англ. transverse
orientation - поперечная ориентация) депо-
ляризация наружной мембраны распростра-
няется внутрь мышечного волокна. Т-тру-
бочки тесно соприкасаются с сетью тончай-
ших каналов, называемой саркоплазматиче-
ским ретикулумом и служащей хранилищем
Са 2 + (рис. 34.20).
В состоянии покоя система активного
транспорта Са2+ накапливает его в сарко-
плазматическом ретикулуме (разд. 36.9).
Кальциевый насос, приводимый в действие
АТР, снижает концентрацию Са 2+ в цито-
плазме покоящихся мышц до уровня ниже
10-6 М, а в саркоплазматическом ретикулу-
ме повышает ее более чем до 10-3 М. Вто-
рой белок, названный кальсеквестрином,
связывает Са 2+ внутри ретикулума. Каль-
секвестрин, характеризующийся высокой
кислотностью и массой 44 кДа, содержит
более 40 участков связывания Са 2+ . Деполя-
ризация мембран Т-трубочек вызывает вы-
брос Са2+ из цистерн саркоплазматического
ретикулума. Высвобожденный Са 2 + связы-
вается с ТнС-компонентом тропонинового
комплекса и стимулирует мышечное сокра-
щение, как это было описано выше.

34.12. Фосфокреатин - форма запасания ~P


То количество АТР, которое имеется в мы-
шце, может поддержать сократительную ак-
тивность всего лишь на протяжении доли Рис. 34.19. Предполагаемая структура
секунды. Однако в мышцах позвоночных тонкой нити в состоянии покоя.
богатые энергией фосфатные связи запа- Двойная спираль тропомио-
саются в виде фосфокреатина (креатинфос- зина (показано красным цве-
фата). Это соединение характеризуется бо- том) блокирует участки актина
лее высоким потенциалом переноса высо- (синий цвет), в которых при со-
коэнергетических фосфатных групп, чем кращении происходит связыва-
АТР (разд. 11.6). Креатинкиназа катализи- ние S1-головок миозина. При-
рует перенос фосфорильной группы от фос- соединение Са 2+ к ТнС-компо-
фокреатина на ADP с образованием АТР: ненту тропонинового комплек-
Фосфокрсатин + ADP АТР + са (показано желтым цветом)
вызывает смещение спирали
+ Креатин. тропомиозина, при этом от-
Некоторые беспозвоночные для накопле- крываются участки связывания
ния высокоэнергетических фосфорильных головок S1 на актине, и в
групп используют фосфоаргинин. Фосфо- итоге происходит сокращение.
(Cohen С., Protein switch of
Часть V. muscle contraction, Scientific
270 Молекулярная физиология American, Inc., 1975.)
Рис. 34.20. Схематическое изображение этих процессов в генерирование АТР зави-
саркоплазматического ретику- сит от типа мышц. Так, в красных мышцах,
лума. [Peachey L. D., J. Cell цвет которых обусловлен высоким содержа-
Biol., 25, 222 (1965).] нием миоглобина и цитохромов дыхатель-
ной цепи, уровень аэробного обмена намно-
го выше, чем в белых мышцах.
креатин и фосфоаргинин называют фосфа-
генами. 34.13. Актин и миозин служат
сократительными элементами почти во всех
эукариотических клетках
Давно уже установлено, что многие немы-
шечные клетки способны передвигаться
и менять свою форму. Миграция клеток
в процессе развития эмбриона, передвиже-
ние макрофагов к поврежденным тканям,
ретракция сгустка тромбоцитами, биение
микроворсинок кишечного эпителия - все
это примеры, иллюстрирующие универсаль-
ность клеточной подвижности. Некоторые
аспекты подвижности клеток можно иссле-
довать на культурах ткани. Так, культиви-
В работающей мышце запас фосфо- руемые клетки различных типов имеют пло-
креатина быстро истощается, а следо- ские складчатые выросты, так называемые
вательно, снижается и содержание АТР. При ламеллиподии, форма которых медленно ме-
этом возрастает концентрация ADP и Pi, няется. Они напоминают легкие складки
а также - под действием аденилаткиназы платья на ветерке, и потому их называют
(миокиназы) - содержание AMP: также складчатыми краями или активными
краями (рис. 34.21). Складчатые края высту-
2ADP АТР + AMP. пают наружу на несколько микрометров, и
Понижение энергетического заряда при- с их помощью клетка может прикрепляться
водит к стимуляции гликолиза, цикла три-
карбоновых кислот и окислительного фос-
форилирования (разд. 14.13) в работающей 34. Мышечное сокращение
мышце. Относительный вклад каждого из и подвижность клеток 271
Рис. 34.21. Слизистый плесневой гриб тересное, что актин плесневого гриба взаи-
Dictyostelium discoideum в скани- модействовал с S1-головками миозина ске-
рующем электронном микро- летных мышц позвоночных, причем возни-
скопе. Этот организм может кали декорированные нити, подобные тем,
существовать либо в виде сво- которые образуются из актина и миозина
бодных клеток, либо как часть позвоночных. Оказалось, что плесневой ак-
организованной колонии. На тин отличается от актина мышц кролика
поверхности Dictyostelium хо- только по 17 из 375 аминокислотных остат-
рошо видны активные края ков. Следовательно, актин - это высококон-
и филоподии, богатые акти- сервативный, древний белок эукариот. Ана-
ном. (Печатается с любезного логично актину из рассматриваемого плес-
разрешения д-ра James невого гриба, а также из многих других
Spudich.) эукариотических клеток был выделен и мио-
зин. Однако свойства миозинов из разных
источников варьировали в большей степени,
к поверхности. Если прикрепившаяся клетка чем свойства актинов, выделенных из тех
втягивает складки на одном конце и вытяги- же источников. Например, миозины из мно-
вает на другом, то при этом она постепенно гих немышечных клеток не способны к бы-
перемещается. строму формированию таких толстых ни-
Каковы молекулярные основы движения тей, какие образуются из миозина ске-
клеток? Первые сведения по этому вопросу летных мышц. Немышечные миозины обра-
были получены Ариелем Лёви (Ariel Loewy) зуют короткие биполярные нити.
при изучении слизистого плесневого гриба
Physarum polycephalum. Этот слизевик обра- 34.14. Распределение микрофиламентов
зует плазмодий и содержит перетекающие в клетке выявляется методом
массы цитоплазмы. Полученные при высо- иммунофлуоресцентной микроскопии
кой ионной силе экстракты гриба были Как правило, клетки эукариот богаты акти-
сходны по свойствам с актомиозином попе- ном, содержание которого составляет обыч-
речнополосатых мышц. Так, добавление но 10% общего количества белка. По суще-
АТР вызывало быстрое падение вязкости, ству, актин - количественно превалирующий
которая затем вновь медленно возрастала белок во многих типах клеток. Содержание
по мере гидролиза АТР. Спустя несколько миозина в немышечных клетках обычно в 10
лет Садаси Гатано и Фумио Осава (Sadashi раз ниже, чем актина. Следовательно, коли-
Hatano, Fumio Osawa) обнаружили в грибе чественное отношение актина к миозину
высокое содержание актина, очень сходного в немышечных клетках выше, чем в мыш-
с мышечным. Он образовывал тонкие нити цах.
и взаимодействовал с миозином. Самое ин- Часть актина в немышечных клетках по-
лимеризуется с образованием микрофила-
Часть V. ментов (рис. 34.22), напоминающих тонкие
272 Молекулярная физиология нити мышечного волокна. Микрофила-
Рис. 34.22. Электронная микрофотогра-
фия, демонстрирующая боль-
шое количество микрофила-
ментов в цитоскелете фибро-
бластов эмбриона цыпленка.
(Печатается с любезного разре-
шения д-ра Susan Brown.)

менты диаметром 70А выявляются на элек-


тронных микрофотографиях почти всех
клеток эукариот. Декорирование микрофи-
ламентов головками S1 приводит к возник-
новению характерной структуры регулярно
расположенных стрелок; из этого следует,
что микрофиламенты состоят из актина
и могут взаимодействовать с миозином
(рис. 34.23).
Распределение микрофиламентов в клет-
ке выявляется с помощью иммунофлуорес-
центной микроскопии. Метод состоит в том, Рис. 34.23. Электронная микрофотогра-
что получают специфические к актину анти- фия F-актина из Dictyostelium,
тела, ковалентно связывают их с флуорес- декорированного S1-головка-
центной меткой, например с флуоресцеи- ми миозина также из
ном, и добавляют к культивируемым клет- Dictyostelium. Видно, что обра-
кам. В результате проявляется сеть микро- зуются такие же «наконечники
филаментов, видимая под флуоресцентным стрел», как и в случае декориро-
микроскопом (рис. 34.24). Некоторые пучки вания F-актина скелетных
флуоресцирующих нитей тянутся через всю мышц S1-головками мышечно-
клетку. В покоящейся клетке, прикреплен- го миозина. (Печатается с лю-
ной к твердому субстрату, многие акти- безного разрешения д-ра James
новые нити идут параллельно длинной оси Spudich.)
клетки. В складчатых краях, напротив, флуо-
ресценция имеет диффузный характер, что 34. Мышечное сокращение
связано с наличием мономеров актина или и подвижность клеток 273
Рис. 34.24. Иммунофлуоресцентная ми- 34.15. Прикрепленные к мембране
крофотография прикреплен- нити актина опосредуют сокращение
ной к поверхности покоящейся микроворсинок кишечника
культивируемой клетки. Клет- Микроворсинки эпителиальных клеток ки-
ка окрашена флуоресцирую- шечника (рис. 34.27) - это одна из наиболее
щими антителами против акти- изученных немышечных сократительных си-
на. Видны длинные пучки ми- стем. Микроворсинки представляют собой
крофиламентов. (С любезного выпячивания цитоплазмы на апикальной
разрешения Elias Lazarides.)

коротких нитей актина (рис. 34.25). Мето-


дом иммунофлуоресцентной микроскопии
было также исследовано внутриклеточное
распределение других сократительных бел-
ков. В микрофиламентах был обнаружен
тропомиозин (рис. 34.26), тогда как тропо-
нина в них, по-видимому, нет. Ионы кальция
играют важную роль в регуляции не только
мышечной, но и немышечной подвижности,
хотя в целом эти два процесса регулируются
по-разному. Относительно внутриклеточно-
го распределения миозина известно очень
мало. В немышечных клетках обнаружен
также α-актинин, который в мышцах связы-
вает актин с Z-пластинками миофибрилл.
Этот белок присутствует в наибольшем ко-
личестве в складчатых краях и других участ-
ках клетки, где происходит быстрое форми-
рование и распад нитей актина. Возможно,
что α-актинин создает мостики между нитя- Рис. 34.25. Более диффузное распределе-
ми актина в цитоскелете и другими образо- ние нитей актина в движущейся
ваниями, связанными с подвижностью. клетке, особенно в ее активных
краях. (Печатается с любезного
Часть V. разрешения д-ра Elias Laza-
274 Молекулярная физиология rides.)
ности? Путем декорирования актиновых ни-
тей микроворсинок S1-головками миозина
было выявлено, что все нити имеют одина-
ковую полярность (рис. 34.28). Образовав-
шиеся стрелки оказались направленными
к основанию микроворсинок (подобно тому
как на декорированных тонких нитях мы-
шечных волокон стрелки направлены в сто-
рону Z-пластинок). Другими словами, по-
лярность актиновых нитей такова, что
микроворсинки при сокращении втягивают-
ся в клетку. Было также обнаружено, что
в терминальной сети имеются толстые нити,
содержащие миозин. По всей вероятности,
биполярные миозиновые нити терминаль-
ной сети взаимодействуют с нитями актина
прилежащих ворсинок (рис. 34.28). Соглас-
но этой гипотезе, нити актина скользят от-

Рис. 34.26. В клетках, окрашенных флуо-


ресцирующими антителами
против актина, видны похожие
на геодезические вышки купо-
лообразные структуры. (Печа-
тается с любезного разрешения
д-ра Elias Lazarides.)

поверхности эпителиальных клеток кишеч-


ника, и в своей массе они образуют так на-
зываемую щеточную каемку, видимую
в световом микроскопе. Каждая из микро-
ворсинок содержит пучок актиновых нитей,
которые на выступающем конце прикре-
пляются к плазматической мембране. Кро-
ме того, во многих точках вдоль микровор-
синки актиновые нити связаны с плазмати-
ческой мембраной тонкими нитевидными
соединениями. Остов актиновых филамен-
тов проникает под поверхность клетки, до-
стигая так называемой терминальной сети.
Плазматическую мембрану изолированных
щеточных каемок можно удалить, обрабо- Рис. 34.27. Электронная микрофотогра-
тав их детергентом; остальная часть струк- фия щеточной каемки кишеч-
туры при этом сохраняется интактной. Был ного эпителия. Микроворсинки
обнаружен поразительный факт: лишенная содержат нити актина.
мембраны щеточная каемка сокращается [Mooseker M. S., Tilney L. G.,
при добавлении АТР и Са2+ и актиновые J. Cell Biol., 67, 725 (1975).]
нити быстро погружаются в терминальную
сеть. 34. Мышечне сокращение
Какова структурная основа этой подвиж- и подвижность клеток 275
носительно нитей миозина, так что в целом РНК-полимеразы (разд. 29.18). Подобно ци-
движение направлено к центру клетки. тохалазину, фаллоидин блокирует те формы
В итоге микроворсинки укорачиваются, что подвижности, в которых участвуют микро-
способствует всасыванию питательных ве- филаменты. Фаллоидин присоединяется
ществ клеткой. к единицам актина в микрофиламентах
и тем самым препятствует его деполяриза-
34.16. Цитохалазин и фаллоидин тормозят ции. Таким образом, фаллоидин как бы за-
подвижность, сопряженную с процессами пирает микрофиламенты.
сборки и дезагрегации нитей актина
Цитохалазин В (алкалоид из грибов) при до- 34.17. Микротрубочки участвуют
бавлении к эукариотическим клеткам изме- в различных видах клеточной подвижности
няет их форму и подавляет многие формы и частично формируют цитоскелет
подвижности. Так, этот алкалоид ингиби- До сих пор мы рассматривали роль микро-
рует образование складчатых краев у фи- филаментов в различных видах клеточной
бробластов, отрастание аксонов от ган- подвижности. Обратимся теперь к другому
глиев, ретракцию кровяного сгустка тром- классу волокнистых элементов, а именно
боцитами, деление оплодотворенной яйце- к микротрубочкам, которые имеются прак-
клетки морского ежа. Судя по данным тически во всех эукариотических клетках
и участвуют как в поддержании архитек-
туры клетки, так и в сократительной актив-
ности (рис. 34.29). Микротрубочки
представляют собой полые цилиндрические
структуры, образованные из двух сходных
(массой по 55 кДа) типов субъединиц - α-
и β-тубулина. Наружный диаметр микро-
трубочек составляет около 240 А, и этим они
четко отличаются от микрофиламентов
(диаметром 70 А) и от промежуточных фи-
ламентов (структур диаметром 100 А, вы-
полняющих роль связывающих элементов).
Жесткая стенка микротрубочек образована
из спирально уложенных, чередующихся

электронной микроскопии, цитохалазин


оказывает влияние на микрофиламенты, так
как они исчезают в клетках, обработанных
этим алкалоидом. Оказалось, что цитохала-
зин препятствует сборке актиновых нитей,
специфически взаимодействуя с одним из
концов нити. Этот ингибиторный эффект
цитохалазина свидетельствует о динамич-
ности структуры микрофиламентов.
Значение постоянно идущих процессов
сборки и дезагрегации микрофиламентов
для клеточного движения было выявлено
также при изучении механизма действия
фаллоидина. Этот токсический агент присут- Рис. 34.28. Предполагаемое расположе-
ствует в ядовитом грибе Amanita phalloides, ние миозина и актина в ми-
содержащем также α-аманитин - ингибитор кроворсинках щеточной каем-
ки кишок. [Mooseker M. S., Til-
Часть V. ney L.G., J. CellBiol., 67, 725
276 Молекулярная физиология (1975).]
Рис. 34.29. Иммунофлуоресцентная ми- щественное значение для расхождения хро-
крофотография, демонстри- мосом. Колхицин ингибирует также направ-
рующая распределение микро- ленное движение разного рода частиц
трубочек в фибробласте. (Печа- в клетках, что лежит в основе торможения
тается с любезного разрешения процессов их секреции. На протяжении не-
д-ра Klaus Weber.) скольких веков колхицин используют для
лечения острых приступов подагры.

α- и β-тубулиновых субъединиц (рис. 34.30). 34.18. Биение ресничек и движение жгутиков


Повторяющейся единицей структуры обусловлено скольжением микротрубочек,
является αβ-димер, и в целом структура индуцированным динеином
образована из 13 протофиламентов, идущих Микротрубочки являются основными ком-
параллельно длинной оси микротрубочки. понентами ресничек и жгутиков у эукариот.
Сборка и дезагрегация микротрубочек Эти органеллы имеются во многих клетках.
происходят с противоположных концов. Ал- Подвижные реснички, подобно веслам, вы-
калоид из осенних крокусов колхицин бло- зывают ток жидкости параллельно поверх-
кирует сборку и тем самым тормозит кле- ности клетки. Так, координированное дви-
точные процессы, протекающие с участием жение ресничек, выстилающих дыхательные
микротрубочек. Например, колхицин оста- пути, способствует удалению чужеродных
навливает клеточное деление на стадии ме- частиц. Жгутики необходимы для продви-
тафазы, так как микротрубочки имеют су- жения свободных клеток, таких, как спермии
или простейшие. Как показали электронно-
микроскопические исследования, структура
ресничек и жгутиков практически у всех эу-
кариот в основе своей одинакова. Это пучок
волокон, называемый аксонемой, который
окружен мембраной, составляющей продол-
жение плазматической мембраны. Волокна
в аксонеме - это микротрубочки. По перифе-

34. Мышечное сокращение


и подвижность клеток 277
рии расположены девять двойных микро-
трубочек, в центре - две одинарные микро-
трубочки (рис. 34.31). Такой часто встре-
чающийся структурный мотив известен как
расположение 9 + 2. Диаметр двух цен-
тральных микротрубочек равен 240 А. Каж-
дая из девяти периферических пар на попе-
речном срезе имеет вид цифры 8 и размер
370 х 250 А (рис. 34.32). Одна из микротру-
бочек в паре - субфибрилла А - меньше по
размеру и присоединяется к центральной
капсуле реснички с помощью радиального
мостика. От каждой субфибриллы А отхо-
дят две ручки. В отдельной ресничке все руч-
ки направлены в одну сторону. Обработка
ресничек детергентом и далее раствором со-
лей высокой концентрации приводит к уда-
лению наружной мембраны и солюбилиза-
ции АТРазы, называемой динеином.
В результате этой обработки располо-
женные на периферии волокна сохраняют
свою цилиндрическую попарную организа-
Рис. 34.30. Спиральное расположение ту- цию, но утрачивают ручки. При добавлении
булиновых субъединиц в ми- динеина в соответствующей ионной среде
кротрубочке. А - схематиче- ручки восстанавливаются. Следовательно,
ское изображение поперечного состоящие из динеина ручки субфибриллы
среза; видно, что микротрубоч- А обладают АТРазной активностью.
ка образована 13 протофила- Каким образом расщепление АТР динеи-
ментами. Б - поверхностная ре- ном вызывает движение ресничек и жгути-
шетка из α- и β-субъединиц. ков? Как показали Питер Сатир и Ян Гиб-
[Snyder J. A., McIntosh J. R., бонс (Peter Satir, Jan Gibbons), перифериче-
Ann. Rev. Biochem., 45, 706 ские двойные микротрубочки аксонемы
(1976).] скользят относительно друг друга и тем
самым вызывают изгиб реснички. Само
скольжение обусловлено образованием ди-
неиновых поперечных мостиков. По-видимо-
му, динеиновые ручки одной пары микро-
трубочек по мере гидролиза АТР продви-
гаются вдоль прилегающей пары совершен-
но аналогично тому, как в скелетной мышце
миозиновые поперечные мостики движутся
вдоль актиновой нити. В интактной реснич-
ке радиальные мостики противодействуют
скольжению, и благодаря им происходит не
сокращение реснички, а локальный изгиб.
При обследовании группы больных хро-
ническими легочными заболеваниями были
Рис. 34.31. Электронная микрофотогра- обнаружены аксонемы, лишенные динеина.
фия поперечного среза аксо- В этом случае, как показал Бьёрн Афзелиус
немы жгутика. Девять на- (Bjorn Afzelius), реснички эпителия дыха-
ружных двойных микротрубо- тельных путей оказались неподвижными.
чек окружают две одинарные. Более того, мужчины с этим генетическим
(Печатается с любезного разре- дефектом были стерильны вследствие непо-
шения д-ра Joel Rosenbaum.) движности их сперматозоидов. В другом,
недавно обнаруженном случае неподвиж-
Часть V. ность ресничек и жгутиков оказалась обус-
278 Молекулярная физиология ловленной дефектом радиальных мостиков.
Рис. 34.32. Схематическое изображение редине между двумя Z-пластинками это
структуры аксонемы. направление меняется на противоположное.
Циклическое образование и диссоциация
комплексов между миозиновыми попе-
Эти клинические наблюдения подтвер- речными мостиками, выступающими из
ждают существующие представления о ме- толстых нитей, и единицами актина тонких
ханизме движения рассматриваемых орга- нитей происходят за счет энергии АТР;
нелл.

Заключение
Поперечнополосатая мышца позвоночных
состоит из белковых нитей двух типов, ко-
торые взаимодействуют друг с другом.
Толстые нити содержат миозин, а тон-
кие - актин, тропомиозин и тропонин. Ги-
дролиз АТР актомиозином вызывает сколь-
жение указанных нитей относительно друг
друга. Миозин представляет собой очень
большой по массе белок (500 кДа), состоя-
щий из двух основных цепей и четырех лег-
ких цепей. Конформация основных цепей Рис. 34.33. Динеиновые ручки располо-
такова, что они содержат две глобулярные жены вдоль микротрубочек
области (головки S1) и присоединенный с правильной периодичностью.
к ним длинный α-спирализованный стер- Электронные микрофотогра-
жень. Головки S1 и часть стержня образуют фии интактной аксонемы (А)
поперечные мостики, которые взаимодей- и микротрубочки, реконструи-
ствуют с актином, генерируя силу сокраще- рованной из тубулина и дине-
ния. Остальная часть молекулы миозина ина (Б). [Haimo L. Т.,
создает скелет толстой нити. Актин - основ- Telzer В. R., Rosenbaum J. L.,
ной компонент тонких нитей - представляет Ргос Nat. Acad. Sci., 76, 5760
собой глобулярный белок (42 кДа), который (1979).]
полимеризуется с образованием нитей диа-
метром 70 А. Толстые и тонкие нити опреде- 34. Мышечное сокращение
ленным образом направлены, причем посе- и подвижность клеток 279
Рис. 34.34. Внутренняя поверхность плаз- белки, о чем свидетельствует тот факт, что
матической мембраны фибро- они содержатся уже в слизистых грибах.
бласта под электронным ми- В сущности, эти белки участвуют в сократи-
кроскопом. Ясно видны нити тельной активности практически всех эука-
актина (декорированные S1-го- риотических клеток. Особенно распростра-
ловками миозина) и окай- нен актин, образующий микрофиламенты
мленные ямки на мембране. диаметром около 70 А. Микрофиламенты
(Печатается с любезного разре- участвуют в разных видах клеточной под-
шения д-ра John Heuser.) вижности, например в миграции клеток
в ходе развития, ретракции кровяного сгуст-
образование комплексов ведет к уменьше- ка тромбоцитами, передвижении макрофа-
нию расстояния между Z-пластинками. «Ра- гов к поврежденным тканям. Сокращение
бочим ходом» является поворот S1-головки ворсинок щеточной каемки кишечного эпи-
миозина, находящейся в комплексе с акти- телия опосредовано взаимодействием нитей
ном. В генерировании силы сокращения актина с биполярными нитями миозина; по-
важную роль играют шарнирные соедине- следние в эпителиальных клетках кишечни-
ния между доменами миозина. Мышечное ка меньше по размеру и содержатся в мень-
2+
сокращение регулируется Са , причем эф- шем относительном количестве по сравне-
2+
фект Са опосредован тропонином и тро- нию с мышцами. Цитохалазин и фаллоидин
помиозином. При низкой концентрации тормозят те виды клеточной подвижности,
Са2+ эти белки ингибируют взаимодействие которые связаны с агрегацией и диссоциа-
актина и миозина. Нервный импульс запу- цией нитей актина. Цитохалазин ингибирует
скает высвобождение Са2+ из саркоплазма- сборку, а фаллоидин - распад микрофила-
тического ретикулума. Далее ионы кальция ментов.
связываются с тропонином, что инициирует В клетках эукариот имеются микротру-
серию конформационных сдвигов, разре- бочки, которые поддерживают архитектуру
шающих в итоге взаимодействие актина клетки, а также участвуют в сократительной
и миозина. активности. Микротрубочки представляют
Актин и миозин - эволюционно древние собой полые фибриллы диаметром 240 А;
они построены из тубулина. Реснички и жгу-
Часть V. тики клеток эукариот содержат девять
280 Молекулярная физиология двойных микротрубочек, окружающих две
одинарные. Между внешними парами ми- гиб реснички или жгутика; этот механизм
кротрубочек имеются поперечные мостики лежит в основе биения ресничек и движения
из динеина - белка, обладающего АТРазной жгутиков. Ингибитором подвижности,
активностью. Индуцированное динеином опосредованной микротрубочками, служит
скольжение прилегающих пар микротрубо- колхицин, который блокирует их полимери-
чек относительно друг друга вызывает из- зацию.

РЕКОМЕНДУЕМАЯ Мышечное сокращение Tilney L.G., 1979. Actin, motility, and


ЛИТЕРАТУРА Huxley H.E., 1971. The structural membranes. In: Cone R.A. and
basis of muscle contraction, Proc. Roy. Dowling J.E. (eds.), Membrane
С чего начать Soc. London (B), 178, 131-149. Transduction Mechanisms,
Huxley H.Е., 1965. The mechanism of Haxley A.F., 1975. The origin of force pp. 163-186, Raven Press.
muscular comtraction, Sci. Amer., in skeletal muscle, Ciba Found. Symp., Lin S., Lin D.C., Flanagan M.D., 1978.
213(6), 18-27. 31, 271-290. Specificity of the effects of cytochalasin
Cohen C., 1975. The protein switch of Harrington W.F., 1979. Contractile В on transport and motile processes,
muscle contraction, Sci. Amer., 233(5), proteins of muscle. In: Neurath H. and Proc. Nat. Acad. Sci., 75, 329-333.
36-45. Hill R. L. (eds.), The Proteins (3rd ed.), Brown S.S., Spudich J.A., 1979. Cyto-
Murray J.M., Weber A., 1974. The vol. 4, pp. 245-409, Academic Press. chalasin inhibits the rate of elongation
cooperative action of muscle proteins, Adelstein R.S., Eisenberg E., 1980. Re- of actin filament fragments, J. Cell
Sci. Amer., 230(2), 59-69. gulation and kinetics of the Biol., 83, 657-662.
Lazarides E., Revel J.P., 1979. The actin-myosin-ATP interaction, Ann.
molecular basis of cell movement, Sci. Rev. Biochem., 49, 921-956. Микротрубочки
Amer., 240(5), 100-113. Hill T.L, 1977. Free Energy Kirschner M.W., 1978. Microtubules:
Satir P., 1974. How cilia move, Sci. Transduction in Biology, Academic assembly and nucleation, Int. Rev.
Amer., 231(4), 44-52. Press. (В гл. 5 дано ясное описание Cytol., 54, 1-71.
Dustin P., 1980. Microtubules, Sci. термодинамики мышечного сокра- Margolis R.L, Wilson L., 1978.
Amer., 243(2), 66-76. щения.) Opposite end assembly and
Huxley H.E., Farugi A.R., Bordas J., disassembly of microtubules at
Книги Koch M.H.J., Milch J.R., 1980. The steadystate in vitro, Cell, 13,1-8.
Cold Spring Harbor Laboratory, 1972. use of synchrotron radiation in Amos L.A., Baker T.S., 1979. The
The Mechanism of Muscle Con- time-resolved x-ray diffraction studies three-dimensional structure of tubulin
traction, Cold Spring Harbor of myosin layer-line reflections during protofilaments, Nature, 279, 607-612.
Symposia on Quantitative Biology, muscle contraction, Nature, 284, Summers K.E., Gibbons I.R., 1971.
vol. 37. (Выдающийся сборник ста- 140-143. ATP-induced sliding of tubules in
тей, посвященных структуре мы- Adelstein R.S. (ed.), 1980. Symposium trypsin-treated flagella of seaurchin
шечных белков, механизму возник- on phosphorylation of muscle sperm, Proc. Nat. Sci., 68, 3092-3096.
новения силы сокращения, системам contractile proteins, Fed. Proc., 39, (Описаны остроумные опыты, пока-
регуляции, саркоплазматическому 1544-1573. McCubbin W.D., Kay C. завшие, что волнообразное движе-
ретикулуму, миогенезу, а также со- M., 1980. Calciuminduced ние обычного жгутика возникает как
кратительным белкам немышечных conformational changes in the результат индуцированного АТР
тканей.) troponin-tropomyosin complexes of взаимодействия между прилегающи-
Goldman R., Pollard Т., Rosenbaum J. skeletal and cardiac muscle and their ми парными трубочками.)
(eds.), 1976. Cell Motility, Cold Spring roles in the regulation of Haimo L.Т., Telzer В.R., Rosenbaum
Harbor Laboratory. (Содержит много contraction-relaxation, Ace. Chem. J.L., 1979. Dynein binds to and
прекрасных статей, посвященных Res., 13, 185-192. crossbridges cytoplasmic microtubules,
микрофиламентам и микротрубоч- Proc. Nat. Acad. Sci., 76, 5759-5763.
кам и их роли в клеточной подвиж- Роль актина и миозина в клеточной Sturgess J.M., Chao J., Wong J.,
ности.) подвижности Aspin N., Turner J.A.P., 1979. Cilia
Inoue S., Stephens R.E. (eds.), 1975. Коrn E.D., 1978. Biochemistry of with defective radial spokes: a cause of
Molecules and Cell Movement, Raven actomyosin-dependent cell motility (a human respiratory disease, New Engl.
Press. review), Proc. Nat. Acad. Sci., 75, J. Med., 300, 53-56.
Hatano S., Ishikawa H., Sato H. (eds.), 588-599.
1979. Cell Motility: Molekulas and Clarke M., Spudich J.A., 1977. Non- Промежуточные нити
Organization, University Park Press. muscle contractile proteins: the role of Lazarides E., 1980, Intermediate fi-
Sugi H., Pollack G.H. (eds.), 1979. action and myosin in cell motility and laments as mechanical integrators of
Cross-bridge Mechanism in Muscle shape determination, Ann. Rev. cellular space, Nature, 283, 249-256.
Contraction, University Park Press. Biochem., 46, 797-822.
ГЛАВА 35 35.1. Открытие циклического АМР -
посредника в действии многих гормонов
Действие гормонов Важнейшее достижение в изучении меха-
низма действия гормонов связано с име-
Гормоны - это химические посредники, нем Эрла Сазерленда (Earl Sutherland).
координирующие активность различных Первоначальная цель его работ, начатых
клеток многоклеточного организма. Тер- в 50-х годах, состояла в том, чтобы выяс-
мин «гормон» был впервые использован нить механизм действия адреналина
в 1904 г. Уильямом Бэйлиссом и Эрнстом и глюкагона на распад гликогена и образо-
Старлингом (William Bayliss, Ernest вание глюкозы в печени. Сазерленд избрал
Starling) при описании действия секре- эту систему, во-первых, потому, что ука-
тина - вещества, секретируемого двенадца- занные гормоны оказывают очень значи-
типерстной кишкой и стимулирующего вы- тельное и воспроизводимое действие на
деление сока поджелудочной железы. Из распад гликогена. Во-вторых, этот эффект
этой работы вытекала очень плодотворная развивается в течение нескольких минут. В-
концепция, а именно, что 1) гормоны - это третьих, срезы печени нетрудно получить
молекулы, синтезируемые специфическими в большом количестве. В-четвертых, био-
тканями (железами); 2) гормоны секрети- химия распада гликогена уже была доста-
руются непосредственно в кровь, которая точно хорошо изучена (гл. 16). Фактически
и доставляет их к месту действия; 3) гор- Сазерленд начал свои исследования меха-
моны специфическим образом меняют ак- низма действия адреналина и глюкагона
тивность определенных чувствительных тка- в лаборатории Карла и Герти Кори (Carl
ней (органов-мишеней или клеток-мишеней). Cori, Gerty Cori).
По своей химической природе гормоны На начальном этапе работы он стремил-
очень разнообразны. Некоторые, например ся выявить ту ферментативную реакцию
адреналин и тироксин, представляют собой в процессе превращения гликогена в глю-
небольшие молекулы, производные амино- козу, которую усиливали эти гормоны.
кислот. Другие, в частности окситоцин, ин- Для этого срезы печени инкубировали
сулин и тиреотропин (тиреотропный гор- в присутствии 3 2 P i и определяли, в какие
мон),- полипептиды или белки. Третья груп- промежуточные соединения включалась
па гормонов - стероиды, производные холе- метка. Оказалось, что ферментом, лимити-
стерола. В настоящее время выяснен моле- рующим скорость процесса расщепления
кулярный механизм действия ряда гормо- гликогена, была фосфорилаза, а не фосфо-
нов. Установлено, что гормоны оказывают глюкомутаза или глюкозо-6-фосфатаза.
специфическое действие тремя путями: Более того, адреналин и глюкагон увели-
1) воздействуя на скорость синтеза фер- чивали активность фосфорилазы. Однако
ментов и других белков; 2) изменяя ско- механизм активации был неясен. Далее
рость ферментативного катализа; 3) изме- Сазерленд обнаружил фермент, катализи-
няя проницаемость клеточных мембран. ровавший инактивацию активной фосфори-
Любопытно отметить, что ни один гормон лазы. Этот инактивирующий фермент ока-
не является ферментом или коферментом. зался фосфатазой; напрашивалось предпо-
Напротив, действие гормонов сводится ложение, что активация фосфорилазы обус-
к регуляции уже существующих процессов. ловлена ее фосфорилированием. Действи-
тельно, при инкубации срезов печени с 3 2 Р i
Часть V. обнаружилось, что скорость включения
282 Молекулярная физиология
Рис. 35.1. Электронная микрофотогра- ваний и было установлено, что фосфорила-
фия соматотропной клетки ги- за активируется при фосфорилировании
пофиза. Гормон роста (сомато- и инактивируется при дефосфорилировании.
тропин) накапливается в элек- Это был первый пример регуляции
тронноплотных гранулах, чет- активности фермента с помощью механиз-
ко видных на микрофотогра- ма ковалентной модификации.
фии. (С любезного разрешения Далее приступили к анализу активации
Lynne Mercer.) фосфорилазы гормонами в препарате раз-
рушенных клеток печени. Поразительным
образом добавление адреналина и глюка-
метки в фосфорилазу возрастала в присут- гона приводило, как и в опытах со срезами
ствии адреналина и глюкагона, причем это
возрастание было прямо пропорционально
действию гормонов на распад гликогена.
Таким образом, в результате этих исследо- 35. Действие гормонов 283
Рис. 35.2. Примеры трех химически раз- тивации фосфорилазы. Другими словами,
личных классов гормонов: гормональный ответ удалось разделить на
А - адреналин, производное два этапа: взаимодействие гормона с мем-
аминокислоты; Б - глюкагон, бранной фракцией, приводящее к образова-
полипептид; В - кортизол, сте- нию термостабильного фактора, и дей-
роид. ствие этого фактора на надосадочную
фракцию, выражающееся в активации фос-
форилазы. Следующая задача состояла
в том, чтобы идентифицировать термоста-
бильный фактор, полученный в очень
печени, к активации фосфорилазы. Обнару- малом количестве. По данным химическо-
жение того факта, что гормональный эф- го анализа это был аденинрибонуклеотид,
фект проявляется и в бесклеточном гомо- но с необычными свойствами. Сазерленд
генате, явилось новой вехой в развитии описал его в письме Леону Хеппелю (Leon
биохимии. Дело в том, что ранее не удава- Heppel), к которому обратился в надежде
лось наблюдать специфического действия на помощь в изучении структуры этого ве-
гормонов в бесклеточных системах, и мно- щества. В это же время Хеппель получил
гие биологи полагали, что гормоны спо- письмо от Дэвида Липкина (David Lipkin)
собны воздействовать только на интакт- с описанием нового нуклеотида, получен-
ную клетку-мишень. Любопытно вспом- ного путем обработки АТР гидрооксидом
нить, как за полвека до этого Бухнеры бария. Хеппель пришел к выводу, что Лип-
(Buchner) опровергли совершенно анало- кин и Сазерленд изучают одно и то же ве-
гичные воззрения, доказав, что процесс щество, и помог им связаться друг с дру-
брожения может идти и в бесклеточном эк- гом. Действительно, оба ученых исследова-
стракте дрожжей. Однако в отличие от ли одно и то же соединение, оказавшееся
гликолитических ферментов не все компо- аденозин-3',5'-монофосфатом, или, как его
ненты системы, обеспечивающей ответ на обычно называют теперь, циклическим
адреналин и глюкагон, оказались раство-
римыми. Так, после центрифугирования го-
могената клеток печени ответная реакция
на добавление гормонов исчезала. Следо-
вательно, какая-то существенная часть сис-
темы гормонального ответа была локали-
зована во фракции мембран. Действитель-
но, гормональный ответ можно было
восстановить, добавив к надосадочной
жидкости фракцию субклеточных частиц.
Роль субклеточных частиц была выявле-
на следующим образом. При инкубации
этой фракции с адреналином и глюкаго-
ном образовывался некий термостабиль-
ный фактор. Добавление этого фактора
к надосадочной фракции приводило к ак- AMP (cAMP). Эта случайная встреча двух
ученых принесла еще одну пользу: сразу
Часть V. возникла возможность получения больших
284 Молекулярная физиология количеств сАМР для биохимических иссле-
Это высокоэкзергоническая реакция с ΔG°'
около — 1 2 ккал/моль. В отсутствие фосфо-
диэстеразы сАМР - очень стабильное соеди-
нение.

35.3. сАМР служит вторым посредником


при действии многих гормонов
Работа Сазерленда привела к созданию кон-
цепции о роли сАМР как второго посредника
в механизме действия некоторых гормонов.
Первым посредником является сам гормон.
Сущность этой концепции заключается
в следующем.
1. Плазматические мембраны клеток со-
держат рецепторы гормонов.
2. Взаимодействие гормона с его специ-
фическим рецептором на плазматической
мембране ведет к стимуляции аденилатци-
клазы, также связанной с плазматической
мембраной.
3. В результате активации аденилатци-
клазы в клетке увеличивается содержание
сАМР.
4. Действие сАМР проявляется внутри
клетки и состоит в изменении скорости
одного или более процессов.
Важная особенность этой гипотезы вто-
рого посредника состоит в том, что она не
предполагает проникновения гормона в клет-
ку. Действие самого гормона ограничивает-
ся клеточной мембраной. Биологический
эффект гормона опосредован действием
Рис. 35.3. Ферментативный синтез и рас- сАМР внутри клетки; непосредственного
пад сАМР. действия сам гормон не оказывает. Обосно-
ванность этой концепции была проверена
дований. Более того, в результате лабора- с использованием целого ряда эксперимен-
торного синтеза сАМР из АТР и гидроок- тальных критериев, а именно:
сида, бария появилась возможность выдви- 1. Аденилатциклазу клетки должны сти-
нуть предположение о вероятном пути мулировать те гормоны, которые дей-
биосинтеза этого соединения. ствуют на эту клетку как на мишень. Гор-
моны, не вызывающие специфического био-
35.2. Циклический AMP синтезируется логического ответа данной клетки, не
аденилатциклазой и расщепляется должны повышать в ней активности этого
фосфодиэстеразой фермента.
сАМР образуется из АТР под действием 2. Концентрация сАМР в клетках-мише-
мембранного фермента аденилатциклазы: нях должна изменяться пропорционально
биологическому ответу этих клеток на гор-
мональную стимуляцию, т.е. она должна
проявлять временную и количественную за-
Эта реакция в небольшой степени эндерго- висимость от концентрации гормона.
нична; ее ΔG°' составляет около 1,6 ккал/ 3. Ингибиторы фосфодиэстеразы, напри-
моль. Источником энергии для синтеза мер теофиллин или кофеин, должны дей-
сАМР служит последующий гидролиз пиро-
ствовать синергично с теми гормонами, эф-
фосфата. Специфическая фосфодиэстераза
разрушает сАМР путем гидролиза до A M P :

35. Действие гормонов 285


Таблица 35.1. Гормоны, действие которых опосредовано
сАМР

Кальцитонин Липотропин
Хорионический гонадо-
тропин Меланоцитстимулирую-
щий гормон
Кортикотропин Норадреналии
Адреналин Паратгормон
фект которых опосредован сАМР как Фолликулостимулирую-
вторым посредником. щий гормон Тиреотропный гормон
4. Добавление сАМР или родственного Глюкагон Вазопрессин
ему соединения к клеткам-мишеням должно Лютеинизирующий гор-
имитировать биологическое действие гор- мон
мона. (На практике сАМР в таких опытах не
используется, так как он плохо проникает
35.4. Сопряжение рецепторов гормонов
в клетки; однако менее полярные про-
с аденилатциклазой осуществляется
изводные сАМР, в частности дибутирил-
белком, связывающим гуаниннуклеотиды
сАМР, проникают в клетки и оказывают
Каким образом связывание гормона типа
свое действие.)
адреналина или глюкагона со специфиче-
Проведенные опыты показали, что цикли-
ским рецептором приводит к активации мо-
ческий AMP является вторым посредником
лекулы аденилатциклазы? Участки связыва-
при действии не только адреналина и глюка-
ния этих гормонов локализованы на наруж-
гона, но и многих других гормонов
ной поверхности плазматической мем-
(табл. 35.1). сАМР оказывает влияние на ис-
ключительно большое число клеточных браны, тогда как каталитические участки
аденилатциклазы обращены к цитозолю.
процессов. Так, под действием этого соеди-
нения увеличивается распад накопленных В сущности, участки связывания гормона
запасов топливных веществ, повышается и каталитические участки принадлежат
выделение соляной кислоты слизистой же- разным белкам, которые можно разделить
лудка, происходит дисперсия пигментных при центрифугировании плазматической
гранул меланина, уменьшается агрегация мембраны в растворе детергента (рис. 35.4).
Аденилатциклаза (185 кДа) и рецептор адре-
тромбоцитов.
налина (75 кДа) представляют собой боль-
шие интегральные белки мембраны. Рецеп-
тор адреналина называют также β-адренер-
гическим рецептором, поскольку он связы-
вает целый ряд фармакологически активных
соединений.
Связывание гормона со специфическим
рецептором оказывает активирующее дей-
ствие на аденилатциклазу не прямо, а опос-
редованно - через третий белок, называе-
1
мый G-белком (от англ. guanyl, посколь-
ку этот белок связывает гуаниннуклеотиды).
Этот регуляторный белок (42 кДа) суще-
Рис. 35.4. Разделение аденилатциклазы ствует в двух формах. Комплекс G-белка
и β-адренергического рецепто- с GTP активирует аденилатциклазу, тогда
ра центрифугированием солю- как комплекс G-белка с GDP такого дей-
билизированной (в растворе ствия не оказывает. G-белок превращается
детергента) плазматической из неактивной GDP-формы в активную
мембраны в градиенте плотно- GTP-форму в результате обмена связанного
сти сахарозы. [Haga Т., Haga GDP на GTP. Этот GTP—GDP-обмен ка-
К., Gilman A.G., J. Biol. Chem., тализируется гормон-рецепторным ком-
252, 5776 (1977).] плексом, но не свободным рецептором. Та-
Часть V. 1
В отечественной литературе чаще использует-
286 Молекулярная физиология ся обозначение N-белок.- Прим. перев.
ким образом, путь передачи информации
идет от рецептора гормона на G-белок и да-
лее на аденилатциклазу (рис. 35.5).
Как происходит выключение аденилатци-
клазы? G-белок обладает еще одним свой-
ством, благодаря которому он может пере-
давать информацию от рецепторов гормона
на аденилатциклазу. Дело в том, что свя-
занный с G-белком GTP медленно гидроли-
зуется до ADP. Другими словами, G-белок
является GТРазой. Следовательно, этот ре-
гуляторный белок содержит встроенное
в него устройство для инактивации аденил-
атциклазы. Доля G-белка, находящегося
в комплексе с GTP, а соответственно и сте-
пень активации аденилатциклазы зависят от Рис. 35.5. Путь передачи информации
отношения скорости обмена GDP на GTP при активации аденилатци-
к скорости гидролиза GTP. Скорость GTP- клазы, вызванной связыванием
GDP-обмена значительно возрастает при гормона со специфическим ре-
связывании G-белка с комплексом гор- цептором. G-белок играет ре-
мон—рецептор. Следовательно, при низком шающую роль как в активации,
содержании гормона почти весь G-белок на- так и в инактивации аденилат-
ходится в GDP-форме и соответственно по- циклазы.
чти вся аденилатциклаза неактивна. В неко-
торых клетках активация аденилатциклазы
зависит также от концентрации Са 2 + . Для
до сих пор клетки содержат протеинкиназы,
активации аденилатциклазы в этих клетках
необходим не только G-белок в GTP-форме, которые активируются под действием
но и комплекс Са 2+ с кальмодулином (белок сАМР в концентрации порядка 10-8 М. Эти
киназы модулируют активность различных
массой 17 кДа). Таким образом, в настоящее
время начал проясняться вопрос о том, ка- белков путем их фосфорилирования.
Интересен механизм активации протеин-
кие регуляторные циклы определяют актив-
киназы мышц циклическим AMP. Этот фер-
ность аденилатциклазы.
мент состоит из субъединиц двух типов: ре-
гуляторной (R) субъединицы (49 кДа),
35.5. Циклический AMP активирует связывающей сАМР, и каталитической (С)
протеинкиназы субъединицы (38 кДа). В отсутствие сАМР
Каким образом сАМР воздействует на регуляторная и каталитическая субъеди-
столь большое число различных клеточных ницы образуют комплекс R 2 C 2 , лишенный
процессов? Есть ли в этих воздействиях что- ферментативной активности. Присоедине-
либо общее? Действительно, такая общ- ние сАМР к каждой из регуляторных субъе-
ность имеется, и обнаружена она была диниц приводит к диссоциации комплекса
опять-таки при изучении регуляции обмена R 2 C 2 на одну R2-субъединицу и две С-субъе-
гликогена - участка метаболизма, где «ро- диницы. Свободные каталитические субъе-
дился» сАМР. Эдвин Кребс и Донал Уолш диницы обладают ферментативной актив-
(Edwin Krebs, Donal Walsh) установили, что ностью. Следовательно, присоединение
сAMP активирует протеинкиназу в ске- сAMP к регуляторной субъединице снимает
летных мышцах. Протеинкиназа фосфори- ингибирование каталитической субъединицы.
лирует как гликоген-синтазу (переводя ее сАМР при этом функционирует как алло-
в неактивное состояние), так и киназу фос- стерический эффектор. Своей субъединич-
форилазы (переводя ее в активное состоя- ной структурой (наличием отдельных регу-
ние). Таким путем сАМР стимулирует рас- ляторных и каталитических субъединиц)
пад гликогена и ингибирует его синтез протеинкиназа напоминает аспартат-транс-
в мышцах (разд. 16.15). Аналогичный меха- карбамоилазу (разд. 22.14).
низм действует в печени. По существу, все
известные эффекты сАМР обусловлены ак-
тивацией протеинкиназ. Все исследованные 35. Действие гормонов 287
тился во второго посредника? Представ-
ляется, что здесь сыграли роль три фактора.
1. сАМР образуется из повсеместно при-
сутствующего АТР в ходе несложной
реакции, протекающей за счет энергии по-
следующего гидролиза пирофосфата.
2. Будучи производным вещества, зани-
мающего центральное положение в метабо-
лических превращениях, сам сАМР стоит
в стороне от основных путей метаболизма.
сАМР используется только как интегратор
обмена веществ и не является ни предше-
ственником в процессах биосинтеза, ни про-
межуточным продуктом в энергетическом
обмене. Вследствие этого концентрация
сАМР может регулироваться однозначно.
Более того, сАМР стабилен, если не подвер-
гается действию специфической фосфоди-
эстеразы.
3. сАМР обладает достаточным количе-
ством функциональных групп, которые
обеспечивают прочное и специфическое
связывание с рецепторными белками (на-
Рис. 35.6. сАМР активирует протеин- пример, с регуляторной субъединицей про-
киназу, вызывая диссоциацию теинкиназы мышц) и развитие соответ-
комплекса регуляторных и ка- ствующих аллостерических эффектов.
талитических субъединиц фер- Важно отметить, что использование сАМР
мента. как второго посредника приводит к значи-
тельному усилению гормонального сигнала.
Так, многие гормоны в крови присутствуют
35.6. Циклический AMP - эволюционно
в концентрациях порядка 1 0 - 1 0 М. В стиму-
древний сигнал голодания лированных клетках-мишенях концентра-
Как было описано выше (разд. 28.6), сАМР ция сАМР намного выше, так как каждая ак-
оказывает регуляторное действие на клетки тивированная молекула аденилатциклазы
бактерий, у которых он стимулирует тран- синтезирует много молекул сАМР. Фосфо-
скрипцию определенных генов. Очевидно, рилирование множества молекул белка мо-
что сАМР как вещество-регулятор имеет лекулой протеинкиназы, активированной
длинную эволюционную историю. У бакте- сАМР, представляет собой еще один этап
рий сАМР служит сигналом голодания. По- усиления гормонального сигнала. Каскад
явление сАМР свидетельствует об отстут-
ствии глюкозы и ведет к синтезу ферментов,
необходимых для использования других ис-
точников энергии. В некоторых клетках мле-
копитающих, таких, как клетки печени
и мышц, сАМР сохраняет свою древнюю
функцию сигнала голодания, но при этом
действие сАМР направлено на стимуляцию
протеинкиназы, а не на усиление транскрип-
ции определенных генов. Еще одно важное
различие состоит в том, что у высших орга-
низмов сАМР стал вторым посредником,
участвуя во внутриклеточных, а не внекле-
точных коммуникативных связях.
Почему в ходе эволюции сАМР превра-

Часть V. Рис. 35.7. Пространственная модель


288 Молекулярная физиология сАМР.
ферментативных реакций, регулирующих
обмен гликогена, служит примером того,
как малые стимулы могут вызвать значи-
тельные изменения метаболизма клетки.
35.7. Холерный токсин стимулирует
аденилаткиназу, ингибируя GTP-азную
активность G-белка
Непосредственное участие сАМР в патоло-
гических процессах было четко установлено
при холере. Возбудителем этого потен-
циально смертельного заболевания являет-
ся Vibrio cholerae - грам-отрицательная бак-
терия с одним жгутиком, с помощью
которого она движется. Основное клиниче-
ское проявление холеры - сильнейший понос
(диарея). В течение нескольких часов орга-
низм может потерять несколько литров
жидкости, и если потерю жидкости не воз-
местить, то развивается шок и наступает
смерть. Диарея обусловлена не прямым дей-
ствием бактерии, а бактериальным токси- Рис. 35.8. Холерный токсин катализи-
ном. Холерный токсин (называемый также рует ADP-рибозилирование
холерагеном) повышает активность адени- G-белка - регулятора активно-
латциклазы в слизистой тонких кишок, ко- сти аденилатциклазы.
торая в свою очередь повышает содержание
сАМР в клетках, причем до исключительно
высокого уровня. Последнее стимулирует ак- Этот аналог, подобно GTP, активирует G-
тивный транспорт ионов в кишечном эпите- белок, но не способен превращаться в GDP.
лии, вследствие чего резко возрастает выход Связывание гуанилилимидодифосфата с не-
Na+ и воды в полость кишечника. модифицированным G-белком так же акти-
Холерный токсин - белок массой 87 кДа; вирует аденилатциклазу, как связывание
он состоит из A1 и А 2 -пептидов, соеди- GTP G-белком, утратившим GТРазную ак-
ненных дисульфидным мостиком, и пяти В-
пептидов. Токсин проникает в клетку путем
взаимодействия с ганглиозидом GM1 (разд.
20.7) на ее поверхности. Этот богатый угле-
водами сфинголипид узнают В-цепи ток-
сина. Попав в клетку, А 1 -субъединица (23
кДа) ковалентно модифицирует G-белок, ре-
гулирующий активность аденилатциклазы.
В частности, А1-субъединица токсина ката-
лизирует перенос ADP-рибозы от NAD на
боковую цепь аргинина G-белка (рис. 35.8).
Это ADP-рибозилирование блокирует
GTP-азную активность G-белка. Другими
словами, модифицированный G-белок ли-
шается встроенного в него устройства для
инактивации аденилатциклазы (см. тивность. Действие холерного токсина еще
рис. 35.5). По существу, G-белок оказывает- раз доказывает значение GТРазной актив-
ся стабилизированным в GTP-форме, а аде- ности G-белка. Вспомним, что вредоносное
нилатциклаза - в непрерывно активирован- действие дифтерийного токсина также обус-
ном состоянии, несмотря на отсутствие ловлено ADP-рибозилированием белка
гормона. Аналогичный эффект можно полу- с GТРазной активностью (разд. 29.28).
чить in vitro путем добавления к немодифи-
цированному G-белку гуанилилимидоди-
фосфата - негидролизуемого аналога GTP. 35. Действие гормонов 289
35.8. Инсулин стимулирует анаболические
процессы и ингибирует катаболические
процессы
Обратимся теперь к инсулину - полипептид-
ному гормону, играющему ключевую роль
в интеграции процессов использования то-
пливных веществ, что уже обсуждалось вы-
ше (разд. 23.6). Общая характеристика функ-
ции инсулина состоит в том, что в мышцах
печени и жировой ткани он усиливает анабо-
лические и ингибирует катаболические про-
цессы. В частности, инсулин повышает ско-
рость синтеза гликогена, жирных кислот,
белков, а также стимулирует гликолиз. Важ- Рис. 35.10. Изучение белка с высокой ра-
ное значение имеет такой аспект действия диоактивностью, выявляемой
гормона, как стимуляция проникновения после импульсного введения
глюкозы, ряда других сахаров, а также ами- метки в аденому островковой
нокислот в клетки мышц и жировой ткани. ткани поджелудочной железы,
Способствуя входу глюкозы в указанные привело к открытию проинсу-
клетки, гормон снижает ее содержание лина (непрерывной линией по-
в крови (так называемый гипогликемический казана радиоактивность, пре-
эффект). Инсулин ингибирует такие катабо- рывистой - оптическая плот-
лические процессы, как распад гликогена ность при 280 нм).
и нейтрального жира. Он тормозит также
гликонеогенез путем снижения уровня фер-
ментативной активности пируват-карбокси- и В-цепи из 30 остатков; цепи инсулина ко-
лазы и фруктозо-1,6-бисфосфатазы. Дей- валентно связаны между собой двумя ди-
ствие инсулина во многом противоположно сульфидными мостиками (рис. 35.9). Анало-
действию адреналина и глюкагона. По су- гичное строение имеют инсулины других
ществу, адреналин и глюкагон служат сигна- видов животных, в том числе человека. Как
лами недостаточности глюкозы, тогда как синтезируется этот двухцепочечный белок?
инсулин - сигнал избытка глюкозы. A priori можно предположить, что А- и В-це-
пи синтезируются по отдельности, затем
35.9. Препроинсулин и проинсулин - они специфически связываются в результате
предшественники активного гормона нековалентных взаимодействий и далее
Как показал Фредерик Сангер (Frederik между ними формируются правильно рас-
Sanger), бычий инсулин состоит из двух це- положенные дисульфидные мостики. Такое
пей: А-цепи из 21 аминокислотного остатка предположение было проверено экспери-
ментально; для этого определяли, можно ли
из восстановленных А- и В-цепей получить
in vitro активный гормон с правильным рас-
положением дисульфидных мостиков. Сти-
мулом для этого исследования послужили
данные Анфинсена (Anfinsen), посвященные
рибонуклеазе - одноцепочечному белку, спо-
собному к полной ренатурации после хими-
ческого восстановления и развертывания
структуры (разд. 2.12). Однако в случае ин-
сулина был получен совершенно иной ре-
зультат: менее 4% образованных in vitro мо-
лекул содержали правильные дисульфидные
пары. Такой же низкий выход ренатуриро-
Рис. 35.9. Полипептидные цепи и дисуль- ванного белка имел место и в случае с химо-
фидные мостики в инсулине. трипсином - трехцепочечным ферментом,
имеющем две межцепочечные дисуль-
Часть V. фидные связи (разд. 8.2). С другой стороны,
290 Молекулярная физиология химотринсиноген - одноцепочечный пред-
Рис. 35.11. Последовательность амино- Проинсулин представляет собой единую
кислот в проинсулине свиньи; полипептидную цепь, в которой есть после-
А-цепь инсулина показана довательность примерно из 30 аминоки-
красным цветом, В-цепь - си- слот, отсутствующая в инсулине (рис. 35.11).
ним, связующий пептид (С-пеп- Это связующий пептид (С-пептид от англ.
тид) - желтым. [Chance R.E., connecting - связующий); он расположен ме-
Ellis R.M., Bromer W.W.. жду карбоксильным концом В-цепи и ами-
Science, 161, 165 (1968).] ноконцом А-цепи будущего инсулина. Как
и предполагалось, проинсулин обладает спо-
собностью к формированию правильно распо-
шественник химотрипсина - восстанавливал ложенных дисульфидных связей после обра-
свою структуру в значительно большей ме- ботки восстанавливающими агентами
ре. Различие в поведении химотрипсина и последующего повторного окисления.
и химотрипсиногена наводило на мысль Недавно проведенные исследования био-
о том, что и инсулин не восстанавливал синтеза инсулина выявили, что проинсу-
структуры должным образом из-за частич- лин - это еще не исходная форма синтезиро-
ного отсутствия необходимой для этого ин- ванного гормона. Новообразованная поли-
формации. Возник вопрос, не является ли пептидная цепь, попадающая в просвет
инсулин, подобно химотрипсину, про- шероховатого эндоплазматичсского ретику-
изводным одной полипептидной цепи? лума, представляет собой так называемый
Решающую роль в изучении этой про- препроинсулин, который содержит N-конце-
блемы сыграла работа Доналда Стайнера вую последовательность из 16 остатков, от-
(Donald Steiner), проведенная на аденоме сутствующую в проинсулине. По-видимому,
островковой ткани поджелудочной железы. этот N-концевой гидрофобный участок слу-
Эта редко встречающаяся опухоль человека жит сигнальной последовательностью, на-
продуцирует большие количества инсулина. правляющей новообразованную цепь в эн-
Стайнер инкубировал срезы опухоли с ме- доплазматический ретикулум (разд. 29.30).
ченным тритием лейцином и далее прово- Превращение препроинсулина в проинсулин
дил анализ. Таким путем был обнаружен происходит в просвете трубочек эндоплаз-
новый включавший большое количество матического ретикулума вскоре после про-
метки белок (рис. 35.10). Последующие ис- хождения препроинсулина через мембрану.
следования показали, что этот белок, на-
званный проинсулином, служит предше-
ственником инсулина. 35. Действие гормонов 291
Далее образовавшийся проинсулин транс-
портируется в аппарат Гольджи, где на-
чинается протеолиз соединительного пепти-
да. Формирование инсулина из проинсулина
(неактивного гормона) продолжается в се-
креторных гранулах. В проинсулинах жи-
вотных разных видов С-пептиды имеют об-
щие структурные особенности. Так, во
всех изученных к настоящему времени про-
инсулинах связующий пептид содержит
Arg-Arg на N-конце и Lys-Arg на С-конце.
Гидролиз полипептидной цепи по этим по-
ложительно заряженным остаткам осущест-
вляется протеолитическим ферментом, сход-
ным с трипсином. Секреция инсулина, на-
копленного в созревших секреторных грану-
лах, осуществляется при слиянии мембран
гранул с плазматической мембраной клетки.

35.10. Трехмерная структура инсулина


В лаборатории Дороти Ходжкин (Dorothy
Hodgkin) было проведено рентгенострук-
турное исследование инсулина свиньи и рас-
крыта его трехмерная пространственная
структура при разрешении 1,9 А. Эта работа
была завершена почти через 36 лет после то-
го, как Ходжкин получила первые рентгено-
граммы кристалла белка (пепсина), будучи
студенткой-дипломницей в лаборатории
Джона Бернала (John Bernal). За прошедшие
годы Ходжкин расшифровала структуры та-

Рис. 35.13. Электрононграмма содержа-


щих инсулин секреторных гра-
Рис. 35.12. Ферментативное превращение нул в β-клетках поджелудочной
препроинсулина в проинсулин железы. Инсулин образует
и далее в инсулин. в гранулах мелкие кристаллы,
что обусловлено его высокой
концентрацией в этих структу-
Часть V. рах. (Печатается с любезного
292 Молекулярная физиология разрешения д-ра Arthur Like.)
ких биологически важных веществ, как холе-
стерол, пенициллин и витамин В 1 2 . Инсулин
оказался компактным трехмерным образо-
ванием (рис. 35.14), из которого «торчат»
только N- и С-концы В-цепи. Между этими
двумя вытянутыми ветвями В-цепи распо-
лагается А-цепь. Структура имеет неполяр-
ную сердцевину, образованную обращенны-
ми внутрь алифатическими боковыми цепя-
ми остатков аминокислот, принадлежащих
А- и В-цепям. Помимо дисульфидных мо-
стиков, инсулин стабилизирован нескольки-
ми солевыми связями, а также водородны-
ми связями между определенными группа-
ми А- и В-цепей. Конформация проинсулина
еще не исследована, но, судя по данным
спектроскопии, она очень сходна с конфор-
мацией инсулина. Об этом же свидетель-
ствует способность проинсулина кристалли-
зоваться вместе с инсулином. Рис. 35.14. Схематическое изображение
35.11. Рецепторы инсулина локализованы
структуры инсулина; показаны
в плазматической мембране
только α-углеродные атомы.
клеток-мишеней
Красным обозначена А-цепь.
Инсулин прочно связывается со специфиче- синим - В-цепь.
скими рецепторами на плазматической
мембране клеток-мишеней. Это выявляется лином; рецепторы инсулина прочно связы-
в опытах с использованием радиоактивно- вались с колонкой, тогда как остальные
го инсулина, содержащего ковалентно свя- компоненты смеси проходили сквозь ко-
занный 125I. Константа диссоциации инсу- лонку. Далее рецепторы инсулина элюиро-
лин-рецепторного комплекса составляет вали подкисленным раствором мочевины,
около 10 - 1 0 М. Необходимость в столь который вызывал денатурацию рецепторов
прочном связывании объясняется низкой и их отделение от связанного с агарозой
концентрацией инсулина в крови (порядка инсулина. По счастью, очищенные рецеп-
10 - 1 0 М). Константа скорости образования торы удавалось затем ренатурировать пу-
комплекса очень велика (около тем удаления мочевины и повышения рН
107 М-1•с-1) и приближается к величине, раствора. Используя этот метод, Педро
характеризующей реакции, скорость ко- Кватрсказас (Pedro Cuatrecasas) очистил
торых регулируется только скоростью рецепторы инсулина в 250000 раз. Субъе-
диффузии. Клетка жировой ткани содер- диница рецептора, связывающего инсулин,
жит всего лишь 1•10 4 рецепторов инсули- представляет собой гликопротеин массой
на, что соответствует плотности один ре- 135 кДа (рис. 35.15).
цептор на квадратный микрометр плазма- На долю рецепторов инсулина прихо-
тической мембраны. Иными словами, один дится всего лишь 4•10-3% общего количе-
б
рецептор инсулина приходится на 1•10 ства мембранных белков в гомогенате
фосфолипидов мембраны. печени. Следовательно, чтобы получить
Параметры связывания инсулина с со- в чистом виде 1 мг белка-рецептора, необ-
любилизированным рецептором и с рецеп- ходимо подвергнуть обработке количество
тором в интактной плазматической мем- гомогената, эквивалентное 500 г белка,
бране одинаковы. Солюбилизированные а для этого нужно взять печень от 200
рецепторы были очищены методом аффин- крыс. Этот расчет показывает, что выделе-
ной хроматографии, т. е. методом, осно- ние рецепторов в количестве, достаточном
ванным на использовании специфических для определения последовательности ами-
связывающих свойств рецептора. Для нокислот, рентгеноструктурного анализа
очистки препарат солюбилизированных
мембран пропускали через колонку ага-
розы с ковалентно присоединенным инсу- 35. Действие гормонов 293
Диабет -
название указывает на повышенное мочеиспускание. Аретей, каппадокийский
врач второго столетия н.э., писал: «Эпитет «диабет» относится к состоянию,
похожему на прохождение воды по сифону». Он с тонкой наблюдатель-
ностью охарактеризовал диабет как «растворение плоти и конечностей и пре-
вращение их в мочу».

Сахарный -
(по латыни mellitus, т.е. «подслащенный медом») указывает на присутствие
сахара в моче больных диабетом.
и опытов по реконструированию, предста- и глюкозы через мембрану. К числу бы-
вляет собой трудоемкую, но все же выпол- стро развивающихся эффектов инсулина
нимую задачу. относится также фосфорилирование белка,
По всей вероятности, взаимодействие принадлежащего рибосомной 40S-субча-
инсулина с рецепторами на плазматиче- стице. Все эти эффекты гормона не свя-
ской мембране запускает многие быстро заны с изменением содержания сАМР. Ка-
развивающиеся эффекты инсулина, напри- кие вещества опосредуют действие инсули-
мер активацию транспорта аминокислот на в клетке, пока еще не установлено.

35.12. Недостаточность инсулина вызывает


диабет
Сахарный диабет - это сложное заболева-
ние, которым страдают несколько сот мил-
лионов людей. Диабет характеризуется по-
вышенным уровнем глюкозы в крови и
в моче. Выделение глюкозы с мочой насту-
пает в условиях, когда содержание глю-
козы в крови превышает способность по-
чечных канальцев к реабсорбции. Вместе
с глюкозой выделяется много воды, так
что нелеченый больной в острой стадии за-
болевания испытывает голод и жажду. По-
теря глюкозы приводит к израсходованию
запасов углеводов, а затем и к расщепле-
нию жиров и белков. В результате мобили-
зации жиров образуется большое количе-
ство ацетил-СоА. Если ацетил-СоА не
может полностью использоваться в цикле
трикарбоновых кислот из-за недостаточно-
го количества оксалоацетата, то образуют-
ся кетоновые тела (ацетоацетат, ацетон
и гидроксимасляная кислота). Вспомним,
что в организме животных синтеза окса-
лоацетата из ацетил-СоА не происходит;
Рис. 35.15. Гель-электрофорез экстракта у животных оксалоацетат образуется из
плазматических мембран кле- глюкозы и некоторых аминокислот
ток печени (А) и очищенного ре- (разд. 23.4). Выделение кетоновых тел на-
цептора инсулина (Б). Электро- рушает кислотно-щелочное равновесие
форез проводился в денатури- и усиливает обезвоживание организма.
рующих условиях. [Jacobs S., В итоге в острой стадии диабета у нелече-
Hazum E., Schechter Y., ного больного может развиваться кома
Cuatrecasas P., Proc. Nat. Acad. и наступить смерть.
Sci., 76, 4919 (1979).] Сахарный диабет обусловлен недоста-
точностью инсулина. Причины же недоста-
Часть V. точности инсулина в большинстве случаев
294 Молекулярная физиология неизвестны. Диабет удается воспроизвести
у экспериментальных животных путем хи- в этом случае имеет место дефект рецепто-
рургического удаления значительной части ров инсулина в плазматических мембранах.
поджелудочной железы либо путем хими- 4. Нарушение сопряжения рецепторов
ческого разрушения β-клеток. Эти проду- инсулина. Бывают случаи, когда у больных
цирующие инсулин клетки избирательно секретируется нормальный инсулин, клет-
разрушаются при введении аллоксана. ки-мишени содержат обычное число рецеп-
Диабет можно также вызвать введением торов инсулина и параметры связывания
антител против инсулина. Еще одно дока- гормона рецептором также соответствуют
норме. По-видимому, у этих больных нару-
шения локализованы внутри клетки. Воз-
можно, в частности, что отсутствует сопря-
жение между инсулин-рецепторным ком-
плексом и следующим компонентом
в цепи передачи гормонального сигнала.
35.13. Эндорфины - пептиды мозга,
действующие подобно опиатам
На протяжении веков опиаты, в частности
морфин, использовались как болеутоляю-
зательство той важной роли, которую щие средства. В 1680 г. Томас Сиденхем
играет инсулиновая недостаточность в раз- (Thomas Sydenham) писал: «Среди всех ле-
витии диабета, состоит в том, что введение карств, которые всевышний даровал чело-
инсулина быстро снимает острые симп- веку, дабы облегчить его страдания, нет
томы диабета. более универсального и более действенно-
Почему у больного диабетом количество го, чем опий». Но почему в мозгу позво-
инсулина оказывается ниже потребностей ночных содержатся рецепторы к алкалои-
в нем тканей? В настоящее время устано- дам из семян мака? Нейрофармакологи
влено, что в основе клинического состоя- предположили, что опиатные рецепторы
ния, называемого сахарным диабетом, мо- предназначены не для взаимодействия
жет лежать множество различных моле- с растительными алкалоидами, а для во-
кулярных дефектов. Рассмотрим неко- сприятия эндогенных регуляторов ощуще-
торые из причин диабета. ния боли. Согласно этой точке зрения,
1. Нарушение превращения проинсулина морфин оказывает фармакологический эф-
в инсулин. В результате мутаций, затраги- фект только потому, что он имитирует ве-
вающих остатки аминокислот в участке со- щества, существующие в организме живот-
единения А-цепи (или В-цепи) с С-пепти- ного. Вопрос этот был окончательно раз-
дом в проинсулине, может нарушиться его решен в 1975 г., когда Джон Хьюз (John
превращение в инсулин. У таких больных Hughes) выделил из мозга свиньи два пеп-
в плазме крови обнаруживается высокий тида с опиатоподобной активностью. Эти
уровень содержания проинсулина (не обла- сходные между собой пентапептиды, на-
дающего гормональной активностью). званные метионин-энкефалином и лейцин-
2. Нарушение молекулярной структуры энкефалином, присутствуют в большом ко-
инсулина. Еще один тип мутаций приводит личестве в некоторых нервных окончаниях.
к замене аминокислотного остатка в кри- По-видимому, они участвуют в интеграции
тически важном участке молекулы инсу- сенсорной информации, имеющей отноше-
лина. Так, если произошла замена фенил- ние к боли.
аланина на лейцин вблизи карбоксильного Спустя год Роджер Гилемин (Roger
конца В-цепи, то гормональная активность Guillemin) выделил из промежуточной
такого инсулина оказывается сниженной доли гипофиза более длинные пептиды —
в 10 раз. Любопытно, что этот участок мо- эндорфины. Эндорфины обладают почти
лекулы инсулина сохраняется неизменным такой же способностью снимать ощущение
в эволюции, начиная с примитивных мик- боли, как морфин (при той же концентра-
син и до человека. ции). Введение эндорфинов в желудочки
3. Дефект рецепторов инсулина. У неко- мозга лабораторным животным оказывает
торых больных секретируется нормальный
инсулин, но нарушается его связывание
с клетками-мишенями. Следовательно, 35. Действие гормонов 295
с зарождением новой и многообещающей
области нейробиологии и нейропсихиа-
трии.

35.14. При расщеплении проопиокортина


образуется несколько пептидных гормонов
Хотя β-эндорфин был открыт недавно, од-
нако последовательность аминокислот
в нем оказалась знакомой. В самом деле,
β-эндорфин имеет такую же последова-
тельность, как С-концевая область β-липо-
тропина - гормона, который Чо Ли (Chou
Li) выделил из гипофиза. In vivo β-эндор-
фин образуется путем протеолитического
расщепления β-липотропина, накопленного
в секреторных гранулах. В последующем
был обнаружен еще более крупный белок,
включающий последовательности β-липо-
тропина и кортикотропина. Этот прогор-
мон (массой 29 кДа) был назван про-опио-
кортином, так как он служит предшествен-
Рис. 35.16. Последовательности амино- ником опиатного гормона и кортикотропи-
кислот метионин-энкефалина на (рис. 35.18). Кортикотропин (назы-
(А), лейцин-энкефалина (Б) ваемый также адренокортикотропным гор-
и β-эндорфина (В). Синим цве- моном или АКТГ) способствует разраста-
том показана общая для них те- нию коры надпочечников и стимулирует
трапептидная последователь- синтез целого набора стероидных гормо-
ность. нов в этой ткани. Из про-опиокортина
образуется два меланоцитстимулирующих
гормона (МСГ). Один из них - α-МСГ -
примечательное действие. Так, β-эндорфин является фрагментом кортикотропина,
на несколько часов индуцирует глубокую а второй - β-МСГ - формируется из β-липо-
анальгезию всего тела, причем в этот пе- тропина (рис. 35.18). Не исключено, что N-
риод понижается температура тела. Более концевая половина про-опиокортина слу-
того, у животных возникает ступор, и они жит источником и других гормонов. Из
лежат распластавшись. Спустя несколько изложенного ясно, что пептидные гормоны
часов действие эндорфинов исчезает, и жи- образуются из про-опиокортина, как из рога
вотные вновь ведут себя нормально. Выяс- изобилия. Этот прогормон состоит из
нился также удивительный факт, что дей- четырех гомологичных областей, которые,
ствие эндорфинов исчезает через несколько
секунд после введения налоксона
(рис. 35.17), известного антагониста
морфина. Судя по поведенческим реак-
циям, индуцированным эндорфинами, эти
пептиды в нормальных условиях уча-
ствуют в регуляции эмоциональных отве-
тов. Многие методы, необходимые для
проверки этой гипотезы, уже разработаны.
Так, для определения крайне малых коли-
честв пептидов, например эндорфинов, ис-
пользуется радиоиммунологический анализ,
который сочетает чувствительность ра-
диоизотопных методов со специфичностью
иммунной реакции. Здесь мы сталкиваемся
Рис. 35.17. Структура морфина - опиата
Часть V. (А) и налоксона - антагониста
296 Молекулярная физиология морфина (Б).
Рис. 35.18. Про-опиокортин - биосинтети- Подробно исследован механизм дей-
ческий предшественник не- ствия ПГ-Е1 на расщепление жиров в жи-
скольких пептидных гормонов. ровой ткани. Такие гормоны, как адрена-
лин, глюкагон, кортикотропин и тиреотро-
пин, стимулируют липолиз в клетках.
видимо, возникли путем последовательных ПГ-Е, в концентрации 10-8 М является
удвоений гена. сильным ингибитором их липолитического
Участки соединения между будущими эффекта. Непосредственное отношение
активными гормонами в про-опиокортине к этому имеет тот факт, что ПГ-Е1 предот-
содержат пары основных остатков
(Lys-Arg, Arg-Arg или Lys-Lys). Следует
подчеркнуть, что границы С-пептида
в проинсулине (см. рис. 35.11) и в пропа-
ратгормоне также представлены парами
основных остатков. Видимо, именно пары
основных остатков в различных прогормо-
нах служат теми отметинами, которые
указывают, в каких участках должно про-
изойти последующее расщепление.

35.15. Простагландины - модуляторы


действия гормонов
Обратимся теперь к простагландинам -
группе жирных кислот, оказывающих
влияние на разнообразнейшие физиологи-
ческие процессы. Эти соединения были от-
крыты в 30-х годах, но внимание привле-
кли только недавно, главным образом
благодаря работам Суне Бергстрома (Sune
Bergstrom). Простагландины - это 20-угле-
родные жирные кислоты, содержащие
5-углеродное кольцо. Основные классы про-
стагландинов обозначаются как ПГ-А,
ПГ-В, ПГ-Е и ПГ-F, причем внизу допол-
нительно ставится цифра, указывающая на
число углерод-углеродных двойных связей
в углеводородной цепи (вне кольца). Про-
стагландины, по-видимому, не являются
гормонами, но модулируют действие гор-
монов. Обычно они изменяют активность
тех клеток, в которых синтезировались. Ха- Рис. 35.19. Структура ряда простагланди-
рактер действия простагландинов зависит нов.
от типа клетки, и этим они отличаются от
гормонов с их однозначно определенным
эффектом. 35. Действие гормонов 297
крецию прогестерона - гормона, необходи-
мого для имплантации в матке оплодотво-
ренной яйцеклетки.

35.16. Простагландины образуются


из ненасыщенных жирных кислот
Простагландины синтезируются в мембра-
нах из С 20 -жирных кислот, содержащих не
менее трех двойных связей. В организм
млекопитающих эти ненасыщенные
жирные кислоты поступают с пищей
(разд. 17.23). Предшественники простаглан-
динов высвобождаются из фосфолипидов
мембран под действием фосфолипаз. Био-
синтез ПГ-E 1 , например, начинается
с цис-Δ 8 ,Δ 1 1 ,Δ 1 4 -эйкозотриеноата. Обра-
зование циклопентанового кольца и вклю-
чение трех атомов кислорода осущест-
вляются простагландин-синтазой (называе-
мой также простагландин-циклооксигена-
зой). Как и предполагалось a priori, источ-
ником всех трех атомов кислорода служит
молекулярный кислород (рис. 35.20). Гем-
содержащий фермент диоксигеназа, ката-
лизирующий эти реакции, связан с гладким
эндоплазматическим ретикулумом.
Рис. 35.20. Синтез ПГ-Е1 из цис-Δ8, Δ11, Как показал Джон Вейн (John Vane), аспи-
Δ14-эйкозотриеноата. рин тормозит биосинтез простагландинов
путем инактивирования простагландин-син-
таз. Причина угнетения активности этого
вращает увеличение концентрации сАМР, фермента аспирином (ацетилсалицилатом)
которое индуцируют эти гормоны. Однако заключается в том, что он ацетилирует кон-
ПГ-Е 1 не тормозит липолиза, вызванного цевую аминогруппу одной из субъединиц
добавлением дибутирил-сАМР. Следова- простагландин-синтазы (рис. 35.21). Про-
тельно, ПГ-Е1 ингибирует аденилатциклазу стагландины усиливают воспалительные
клеток жировой ткани. В других клетках процессы, тогда как аспирин подавляет их.
влияние простагландинов на содержание По-видимому, такое фармакологическое
сАМР может быть противоположным. действие аспирина обусловлено тем, что он
Молекулярные основы многих эффектов ингибирует биосинтез простагландинов.
простагландинов еще не изучены. Физио-
логическое действие простагландинов вы- 35.17. Стероидные гормоны активируют
ражается в том, что они усиливают воспа- специфические гены
лительные процессы, регулируют приток Первичный эффект стероидных гормонов,
крови к определенному органу, контроли- в частности эстрадиола, прогестерона и кор-
руют транспорт ионов через некоторые тизона, состоит в воздействии на выражение
мембраны, модулируют синаптическую генов, а не непосредственно на активность
передачу. Простагландины представляют фементов или процессы транспорта. В отли-
большой интерес для клиники. Так, пред- чие от адреналина эти стероидные гормоны
полагается, что они играют роль при ро- оказывают свое действие, только проникнув
дах. Вливание ПГ-Е2 вызывает роды через в клетку-мишень. Кроме того, местом их
несколько часов. Простагландины в прин- первичного действия служит не плазматиче-
ципе могут быть использованы как контра- ская мембрана, а клеточное ядро. Для пол-
цептивы; показано, что ПГ-F2α снижает се- ного проявления биологического эффекта
стероидных гормонов требуются часы, а не
Часть V. минуты, поскольку он зависит от синтеза
298 Молекулярная физиология новых белков. Актиномицин D тормозит
тате связывания рецептора с эстрадиолом
сродство рецептора к ДНК значительно по-
вышается. Кроме того, у рецептора, связав-
шего зстрадиол, появляется вторая субъеди-
ница. Последнее находит отражение в увели-
чении коэффициента седиментации с 4S до
5S. Остается неизвестным, чем определяется
специфичность участков ДНК, связываю-
щих эстрадиольный рецептор: последова-
тельностью ли оснований или белками хро-
мосом. Взаимодействие гормон-рецептор-
ного комплекса с ДНК высокоспецифично.
Кроме того, строго специфична и активация
рецептора путем связывания гормона. К ре-
цептору эстрадиола может присоединиться
эстрон, но этот комплекс не взаимодей-
ствует с ДНК. Неспособность эстрон-рецеп-
торного комплекса к связыванию с ДНК
вполне согласуется с тем, что эстрон не сти-
мулирует увеличения матки.
По-видимому, описанный механизм раз-
вития гормонального эффекта характерен
не только для эстрадиола, но и в целом для
всех стероидных гормонов. Так, в опытах
Рис. 35.21. Инактивация простагладин- с культурой ткани гепатомы было показано,
синтазы аспирином. что глюкокортикоидный стероидный гор-
мон дексаметазон тоже связывается со спе-
цифическим цитоплазматическим рецепто-
действие указанных стероидов, из чего сле- ром; рецептор, связавший гормон, претер-
дует, что оно связано с синтезом новой певает конформационные изменения и за-
мРНК. тем мигрирует в клеточное ядро, где
17β-эстрадиол стимулирует увеличение образует комплекс со специфическими
матки. Первый этап этого воздействия со-
стоит в том, что гормон связывается со спе-
цифическим рецептором в цитоплазме кле-
ток матки. Связывание характеризуется
высокой прочностью (К 10-9 M). Образо-
вавшийся гормон-рецепторный комплекс
мигрирует далее в клеточное ядро. В резуль-

Рис. 35.22. Пространственные модели


17β-эстрадиола (А) и тестосте-
рона (Б).

35. Действие гормонов 299


Рис. 35.23. Фактор роста нервов (ФРН) ин- и дифференцировка этих клеток. Чувстви-
дуцирует отрастание аксонов тельным тестом на присутствие фактора ро-
от культивируемых нервных ста нервов служит отрастание аксонов от
клеток. А -без ФРН; Б - в при- культивируемых ганглиев (рис. 35.23). Био-
сутствии ФРН. (Печатается с логически активная молекула ФРН состоит
любезного разрешения Bruce из двух идентичных полипептидных цепей
Yankner, Christiana Richter- массой по 13 кДа. Этот димер (называемый
Landsberg и д-ра Erick Shooter.) β-субъединицей) накапливается в месте
своего синтеза - поджелудочной железе - в
виде комплекса, имеющего субъединичную
структуру α2γ2β и массу 130 кДа. γ-Субъеди-
участками в ДНК. Число участков ДНК, ница является протеолитическим фермен-
связывающих этот рецептор, определено том, а α-субъединица - ингибитором этой
равным 1 на 106 пар оснований. Полученное протеиназы. ФРН синтезируется в виде со-
число согласуется с данными о том, что дек- стоящего из α- и β-субъединиц прогормона,
саметазон влияет на транскрипцию лишь который в последующем расщепляется γ-
небольшого числа генов. Каков механизм протеиназой. По последовательности ами-
этой высокой избирательности в регуляции нокислот ФРН напоминает инсулин. Сле-
транскрипции со стороны стероидных гор- дует отметить, что инсулин не только
монов, остается интригующей загадкой. сильно активирует анаболические процессы
в мышцах, печени и жировой ткани, но
35.18. Белковые факторы роста типа ФРН и оказывает стимулирующий эффект на
и ЭФР стимулируют пролиферацию рост большинства клеток. Можно предпо-
клеток-мишеней ложить, что гены ФРН и инсулина произош-
Как регулируется рост эукариотических кле- ли от общего предшественника.
ток? Проведенное в последние годы выделе- Был выделен и изучен также эпидер-
ние белковых факторов роста, способных малъный фактор роста (ЭФР). Это полипеп-
специфическим образом стимулировать тид массой 6 кДа (рис. 35.24), способный
клетки-мишени, внесло существенный вклад стимулировать рост эпидермальных и эпи-
в решение этого интересного и важного во- телиальных клеток. ЭФР прочно связывает-
проса. Рита Леви-Монтальчини (Rita ся на плазматической мембране клеток-
Levi-Montalcini) открыла, что фактор роста мишеней. Константа диссоциации комплек-
нервов (ФРН) играет решающую роль в раз- са ЭФР—рецептор составляет около
витии симпатических нейронов и опреде- 10 - 1 0 М. Спустя несколько минут после
ленных сенсорных нейронов у позвоночных. связывания ЭФР на мембране кластеры
Под влиянием ФРН начинается деление ЭФР-рецепторных комплексов попадают
внутрь клетки путем эндоцитоза. Участками
Часть V. эндоцитоза являются так называемые окай-
300 Молекулярная физиология мленные ямки (вдавления мембраны), со-
держащие клатрин (разд. 29.32). Далее
пузырьки с ЭФР сливаются с лизосомами.
Аналогичным образом попадают внутрь
клеток и ФРН-рецепторные комплексы
(рис. 35.25). Остается неизвестным, насколь-
ко необходим собственно процесс проник-
новения этих комплексов в клетку для пере-
дачи стимулирующего сигнала клеточному
ядру.

,
Заключение
Гормоны - это группа химически разно-
родных соединений, которые интегрируют
активность различных клеток в многокле-
точном организме. Решающую роль в дей-
ствии многих гормонов (например, адре-
налина или глюкагона) играет сАМР,
который служит вторым посредником вну-
три клетки-мишени. Гормоны, действие ко-
торых опосредовано сАМР, связываются со
специфическими рецепторами на плазмати-
ческой мембране клетки-мишени и активи-
руют аденилатциклазу. Последняя предста-
вляет собой связанный с мембраной фер-
мент, катализирующий синтез сАМР и АТР. Рис. 35.24. Последовательность амино-
Сопряжение между рецепторами гормонов кислот в эпидермальном фак-
и аденилатциклазой осуществляет белок, торе роста (ЭФР). [Savage С. R.,
связывающий гуаниннуклеотиды (G-белок). Hash J.H., Cohen S., J. Biol.
Активация аденилатциклазы приводит Chem., 248, 7669 (1973).]
к увеличению содержания сАМР в клетке.
Образовавшийся сАМР активирует в свою
очередь протеинкиназу, которая фосфори-
лирует один или несколько белков. Так, фос-
форилирование гликоген-синтазы и киназы
фосфорилазы в мышцах и печени ведет к ин-
гибированию синтеза и активации распада
гликогена. Этот каскад реакций многократ-
но усиливает первоначальный гормо-
нальный стимул. сАМР появился на ранних
этапах эволюции, первоначально как сигнал
голодания. Холерный токсин катализирует
ADP-рибозилирование G-белка, что приво-
дит к стойкой активации аденилатциклазы
в клетках кишечного эпителия. В результате
при холере происходит массивный выход
Na+ и воды в полость кишечника.
Инсулин активирует анаболические про-
цессы (синтез гликогена, жирных кислот
и белков) и тормозит катаболизм (в частно-
сти распад гликогена и жиров). Инсулин Рис. 35.25. Проникновение в клетку ком-
оказывает сильнейшее воздействие на про- плекса ФРН-рецептор. (По ри-
цессы мембранного транспорта; в частно- сунку, любезно предоставлен-
сти, он стимулирует вход глюкозы и амино- ному д-ром Erick Shooter.)
кислот в клетки мышечной и жировой
ткани. Биосинтетическими предшественни-
ками активного гормона служат препроин- 35. Действие гормонов 301
сулин и проинсулин, состоящие из одной по- ланоцитстимулирующего гормонов (α-
липептидной цепи. Препроинсулин содер- и β-МСГ). Участки соединения между буду-
жит сигнальную последовательность, кото- щими гормонами в про-опиокортине, как
рая отщепляется в просвете трубочек шеро- и в проинсулине, содержат пары основных
ховатого эндоплазматического ретикулума. аминокислотных остатков. Небольшие по
Далее из проинсулина образуется инсулин; молекулярной массе белки служат также
это происходит путем протеолитического гормонами роста, что видно на примере
отщепления пептида, соединяющего А- фактора роста нервов или эпидермального
и В-цепи будущего активного гормона. Ука- фактора роста. Эти белки стимулируют де-
занное превращение прогормона в гормон ление и дифференцировку клеток-мишеней,
протекает в аппарате Гольджи и в секре- Время проявления их действия - часы и дни.
торных гранулах. Инсулин распознается Аналогично и эффект стероидных гормонов
специфическими рецепторами, локализо- (например, эстрадиола, прогестерона и кор-
ванными в плазматической мембране кле- тизона) развертывается на протяжении не-
ток-мишеней. Недостаточность инсулина по скольких часов или дней. Действие стерои-
сравнению с потребностью в нем клеток ле- дов направлено главным образом на регу-
жит в основе сахарного диабета. Это забо- ляцию выражения генов. Показано, что
левание, возникающее в силу многих раз- эстрадиол проникает в клетку-мишень
личных причин, характеризуется повы- и связывается со специфическим рецепто-
шенным содержанием глюкозы в крови ром в цитозоле. К образовавшемуся ком-
и моче. У небольшой части больных диабе- плексу присоединяется вторая субъединица
том обнаружены такие явления, как наруше- белка, после чего весь комплекс попадает
ние превращения проинсулина в инсулин, в ядро, где происходит его связывание со
изменение молекулярной структуры инсу- специфическими участками ДНК. Проста-
лина, а также дефект инсулиновых рецепто- гландины, которые синтезируются из полие-
ров клеточных мембран. новых С20-жирных кислот, модулируют
Эндорфины и энкефалины - это пептиды действие различных гормонов, но сами не
мозга, оказывающие такой же эффект, как являются гормонами. Аспирин подавляет
опиаты, в частности морфин. β-Эндорфин синтез простагландинов путем ковалентной
образуется из про-опиокортина - прогормо- модификации фермента, катализирующего
на, являющегося источником и других био- включение атомов кислорода в ходе биосин-
логически активных пептидов: кортико- теза простагландинов.
тропина (АКТГ), β-липотропина и ме-

РЕКОМЕНДУЕМАЯ Molecular basis for hormone action. In: Rodbell M., 1980. The role of hormone
ЛИТЕРАТУРА Bondy P. K. and Rosenberg L. E. (eds.), receptors and GTP-regulatory proteins
Metabolic Control and Disease, in membrane transduction, Nature, 284,
С чего начать pp. 104-160, Saunders. 17-22.
Bradshaw R.A., Frazier W.A., 1977.
Pastan I., 1972. Cyclic AMP, Sci. Amer., Helmreich E.J.M., Zenner H.Р.,
227(2), 97-105. Hormone receptors as regulators of Pfeuffer T., Cori C.F., 1976. Signal
hormone action, Curr. Top. Cell Regul.,
Rubenstein E., 1980. Diseases caused by transfer from hormone receptor to ade-
impaired communication among cells, 12, 1-35. nylate cyclase, Curr. Top. Cell
Sci. Amer., 242(3), 102-121. Kahn C.R., 1976, Membrane receptors Regul., 10, 41-87.
Sutherland E.W., 1972. Studies on the for hormones and neurotransmitters, J. Greengard P., 1978. Phosphorylated
mechanism of hormone action, Science, Cell Biol., 70, 261-286. proteins as physiological effectors,
177, 401-408. Goldstein J.L., Anderson R.G.W., Science, 199, 146-152.
Synder S.H., 1977. Opiate receptors and
Brown M.S., 1979. Coated pits, coated Means A.R., Dedham J.R., 1980.
internal opiates, Sci. Amer., 236(3), vesicles, and receptor-mediated Calmodulin: an intracellular calcium
44-56. endocytosis, Nature, 279, 679-685. receptor, Nature, 285, 73-77.
Guillemin R., 1978. Peptides in the
brain: the new endocrinology of the Холерный токсин
neuron, Science, 202, 390-402. cAMP и аденилатциклaзa Moss J., Vaughan M., 1979. Activation
Ross E.M., Oilman A.G., 1980. Bio- of adenylate cyclase by choleragen, Ann.
chemical properties of hormone-sen- Rev. Biochem., 48, 581-600.
Рецепторы гормонов sitive adenylate cyclase, Ann. Rev. Hirschorn N., Greenough W.B., III,
Baxter J.D., MacLeod К.M., 1980. Biochem., 49, 533-564. 1971. Cholera, Sci. Amer, 225(2), 15-21.

Часть V. Инсулин и диабет


302 Молекулярная физиология Czech M.P., 1977. Molecular basis of
insulin action, Ann. Rev. Biochem., 46, Synder S.H., 1977. Opiate receptors in vitamin D metabolism and action, New
359-384. the brain, New Engl. J. Med., 296, Engl. J. Med., 297, 974-984, 1041-1049.
Steiner D.F., 1977. Insulin today, 266-271.
Diabetes, 26, 322-340. Простагландины
Renold A.E., Mintz D.H., Muller W.A., Факторы роста Samuelsson B., Granstrom E., Green K.,
Cahill G.F., Jr., 1978. Diabetes mellitus. Haigler H.T., Cohen S., 1979. Hamberg M., Hammarstrom S., 1975.
In: Stanbury J.B., Wyngaarden J.B. Epidermal growth factor: interactions Prostaglandins, Ann. Rev. Biochem., 44,
and Fredrickson D.S. (eds.), The with cellular receptors. Trends Biochem. 669-695.
Metabolic Basis of Inherited Disease Sci, 4, 132-134. Roth G.J., Siok C.J., 1978. Acetylation
(4th ed.), McGraw-Hill. Greene L.A., Shooter E.M., 1980. The of the NH 2 -terminal serine of prostagla-
Tager H., Given В., Baldwin D., nerve growth factor: biochemistry, ndin synthetase by aspirin, J. Biol.
Mako M., Markese J., Rubenstein A., synthesis, and mechanism of action, Chem., 253, 3782-3784.
Olefsky J., Kobayashi M., Kol- Ann. Rev. Neurosci., 3, 353-402. Vane J.R., 1971. Inhibition of
terman O., Poucher R., 1979. A struc- Levi-Montalcini R., Calissano P., 1979. prostaglandin synthesis as a mechanism
turally abnormal insulin causing human The nerve-growth factor, Sci. Amer., of action for aspirin-like drugs, Nat.
diabetes, Nature, 281, 122-125. 240(6), 68-77. New Biol., 231, 232-235.

Эндорфины и опиаты Стероидные гормоны и витамин D Радиоиммунологический метод опре-


Guillemin R., 1977. Endorphins: brain Yamamoto К.R., Alberts В.М., 1976. деления гормонов
peptides that act like opiates, New Engl. Steroid receptors: elements for Yalow R.S., 1978. Radioimmunoassay:
J. Med., 296, 226-228. modulation of eukaryotic transcription, a probe for the fine structure of biologic
Nakanishi S., Inoue A., Kita T., Ann. Rev, Biochem., 45, 721-746. systems, Science, 200, 1236-1246.
Nakamura M., Chang А.С.Y., Cohen DeLuca H.F., 1974. Vitamin D: the
S.N., Numa S., 1979. Nucleotide vitamin and the hormone, Fed. Proc., Общее представление о проблеме
sequence of cloned cDNA for bovine 33, 2211-2219. Hood L.E., Wilson J.H., Wood W.В.,
corticotropin-b-lipotropin precursor, Haussler M.R., McCain T.A., 1977. 1975. Molecular Biology of Eucaryotic
Nature, 278, 423-427. Basic and clinical concepts related to Cells, ch. 6, Benjamin.
ГЛАВА 36 36.1. Различие между пассивным и активным
транспортом
Мембранный транспорт Является ли процесс транспорта активным
или пассивным, зависит от изменения сво-
бодной энергии транспортируемых компо-
Биологические мембраны представляют со- нентов. Рассмотрим случай, когда транс-
бой высокоизбирательные барьеры прони- портируется незаряженное растворенное ве-
цаемости. Поток молекул и ионов между щество (рис. 36.2). Свободная энергия его
клеткой и окружающей средой строго регу- переноса из отсека 1, где оно находится
лируется специфическими системами транс- в концентрации с1, в отсек 2, где его концен-
порта. Транспортные процессы выполняют трация равна с2, составляет
несколько важных функций.
1. Регулируют объем клетки и поддержи-
вают внутриклеточное значение рН
и ионный состав в узких пределах колебаний,
что создает благоприятные условия для
Для заряженного компонента следует
проявления активности ферментов.
учитывать также электрический потенциал
2. Экстрагируют из среды и концентри-
мембраны. Сумма концентрационной
руют субстраты энергетического и пласти-
и электрической составляющих дает элек-
ческого обмена (топливо и строительные
трохимический потенциал. Изменение сво-
блоки), а также выведение токсических ве-
бодной энергии в этом случае составит
ществ.
3. Создают ионные градиенты, что необ-
ходимо для поддержания возбудимости не-
рвов и мышц. где Z - электрический заряд транспортируе-
В настоящее время начинают выясняться мого компонента, ΔV - мембранная раз-
молекулярные механизмы, лежащие в осно- ность потенциалов в вольтах и F - число Фа-
-1 -1
ве многих процессов транспорта. В этой гла- радея (23,062 ккал • В • м о л ь ) .
ве мы рассмотрим ряд транспортных си- Если ΔG положительно, то процесс транс-
стем, обеспечивающих перенос ионов, саха- порта должен быть активным; если же ΔG
ров и аминокислот через биологические отрицательно, то транспорт может осущест-
мембраны бактериальных и животных кле- вляться пассивно. Активный транспорт
ток. Мы обсудим также продуцируемые ми- требует сопряжения с притоком свободной
кроорганизмами транспортные антибиоти- энергии, тогда как пассивный транспорт мо-
ки, поскольку именно анализ их структуры жет идти спонтанно. Рассмотрим для при-
позволил выяснить, каким образом системы мера транспорт незаряженного вещества из
-1
транспорта различают такие ионы, как, на- с1 = 10-3 мМ в с2 = 10 мМ: ΔG =
-1 -3
пример, Na+ и К + . Последняя часть этой = 2,3RТlg(10 /10 ) = 2,3•1,98•298•2 =
главы содержит описание каналов, соеди- = + 2,7 ккал/моль. При 25°С (298 К) ΔG =
няющих содержимое прилежащих друг = + 2,7 ккал/моль, что указывает на ак-
к другу клеток. Эти протоки (рис. 36.1) тивный транспорт, нуждающийся в притоке
играют важную роль в межклеточной ком- свободной энергии. Такой транспортный
муникации. процесс может протекать за счет, например,
гидролиза АТР, энергия которого соста-
Часть V. вляет —7,3 ккал/моль в стандартных усло-
304 Молекулярная физиология виях.
Рис. 36.1. Электронная микрофотогра- 36.2. Открытие системы активного
фия негативно окрашенных транспорта ионов натрия и калия
межклеточных соединений, вы- Большинство животных клеток имеет высо-
деленных из клеток печени. По кую концентрацию К+ и низкую концентра-
таким каналам диаметром 15 А цию Na+ по сравнению с окружающей клет-
ионы и небольшие молекулы ку средой. Градиенты этих ионов создаются
могут перетекать из одной специфической транспортной системой, на-
клетки в другую. [Hertzberg E. зываемой (Na + + К+)-насосом, поскольку
L, Gilula N. В., J. Biol. Chem., движение этих ионов взаимосвязано. Ак-
254, 2143 (1979).] тивный транспорт Na+ и К+ имеет огром-

36. Мембранный транспорт 305


щую Mg 2+ среду. Этот фермент был назван
(Na + + K+)-АТРазой:

Скоу предположил, что (Na + +


+
+ К )-АТРаза является интегральной
частью (Na + + К + )-насоса и расщепление
АТР обеспечивает энергией активный транс-
порт Na+ и К + . С тех пор был получен
целый ряд доказательств того, что (Na + +
+ К+)-ATРаза - действительно составная
часть ( N a + + К+)-насоса.
1. (Na + + К + )-АТРаза обнаруживается
во всех случаях, когда происходит активный
транспорт Na + и К + . Уровень фермента-
тивной активности коррелирует с количе-
ством транспортируемых ионов. Так, не-
рвным клеткам свойственна высокая актив-
ность и (Na + + K + )-АТРазы, и (Na+ +
+ К+)-насоса, тогда как в эритроцитах
оба этих показателя находятся на низком
уровне.
Рис. 36.2. Изменение свободной энергии 2. И (Na + + К + )-АТРаза, и насос про-
переноса незаряженного рас- чно связаны с плазматической мембраной.
творенного вещества из отсека 3. (Na + + К + )-АТРаза и насос одинако-
с концентрацией с1 в отсек во ориентированы в плазматической мем-
с концентрацией с2 (А) и одно- бране.
валентных ионов через мем- 4. Изменения концентраций Na + и К+
брану на сторону, имеющую оказывают одинаковое действие на АТРаз-
одноименный с ионом заряд ную активность и скорость транспорта этих
(Б). Обратите внимание, что ионов.
мембранный потенциал 59 мВ 5. Кардиотонические стероиды являются
требует для транспорта одно- специфическими ингибиторами и (Na + +
валентного иона при 25°С тако- + К + )-АТРазы, и (Na + + К + )-насоса.
го же изменения свободной Концентрация ингибитора, оказывающая
энергии, как и градиент концен-
трации, равный 10.

ное физиологическое значение. В самом де-


ле, в организме животного на этот процесс
затрачивается более трети АТР, расходуе-
мой в состоянии покоя. Градиенты концен-
трации Na+ и К+ регулируют объем клетки,
обеспечивают электрическую возбудимость
нервных и мышечных клеток и служат дви-
жущей силой для активного транспорта
Сахаров и аминокислот (разд. 36.10).
В 1957 г. Йенс Скоу (Jens Skou) открыл Рис. 36.3. (Na + +К + )-АТРаза [компо-
фермент, гидролизующий АТР только при нент (Na+ + К+)-насоса] ги-
+ +
условии добавления Na и К в содержа- дролизует АТР только в том
случае, если в среде, содержа-
2+
Часть V. щей Mg , одновременно при-
306 Молекулярная физиология сутствуют Na + и К + .
4. Ванадат-ионы ингибируют насос
и АТРазу только при условии, что они нахо-
дятся внутри клетки.

36.4. АТР транзиторно фосфорилирует


натрий-калиевый насос
Каким образом АТР обеспечивает ак-
тивный транспорт Na+ и К + ? Ключом к ре-
шению этого вопроса оказалось наблю-
дение, что в присутствии Na+ и Mg2+
АТР фосфорилирует (Na+ + К+)-АТРазу.
Участком фосфорилирования служит боко-
вая цепь специфического остатка аспартата.
Далее в присутствии К+ происходит гидро-
лиз фосфорилированного промежуточного
Рис. 36.4. (Na+ + К+)-насос строго
продукта (Е—Р). Для реакции фосфорили-
ориентирован в плазматиче-
ской мембране.

полумаксимальный эффект, для обоих про-


цессов одинакова.
6. При обращении работы насоса в опре-
деленной ионной среде происходит синтез
АТР из ADP и Рi;.

36.3. И фермент, и насос ориентированы


в мембране
Исследование (Na+ + К + )-насоса в тенях
эритроцитов позволило установить, как рования не требуется К+, а для реакции де-
ориентированы (Na+ + К + )-АТРаза и фосфорилирования не требуются ни Na+, ни
+ +
(Na + К )-насос. В гипотонической соле- Mg2+:
вой среде эритроцит набухает, и в его мем-
бране появляются дырки. Из него выходит
гемоглобин и остается светлая мембрана
(тень). Содержимое набухшего эритроцита
можно уравновесить с наружной средой. Ес-
ли наружный раствор сделать изотоничным.
то мембрана вновь становится барьером Na+-зависимое фосфорилирование и К + -
проницаемости. Следовательно, молеку- зависимое дефосфорилирование - не един-
лярный и ионный состав среды внутри теней ственные реакции, имеющие критическое
можно отрегулировать путем запечатыва- значение. В процессе функционирования
ния их в соответствующей среде. Исследова- насос принимает по крайней мере две
ния процессов транспорта и ферментатив- разные конформации, обозначаемые как Е1
ной активности в тенях эритроцитов показа- и Е 2 . Всего же в транспорте Na+ и К+ и со-
ло, что (Na+ + K+)-насос ориентирован пряженном с ним гидролизе АТР участвует
следующим образом (рис. 36.4). не менее четырех конформационных форм
1. Для активации АТРазы и переноса че- фермента: E1, Е1—Р, Е 2 —Р и Е2 (рис. 36.5).
рез мембрану ионы Na+ должны быть вну- При гидролизе одной молекулы А ТР происхо-
три, а ионы К+ - снаружи. дит перенос трех ионов Nа+ и двух ионов
2. Только находящийся внутри клетки К+. Следовательно, работа насоса генери-
АТР служит эффективным субстратом рует электрический ток через мембрану.
АТРазы и используется для работы насоса. Другими словами, (Na+ + K+)-АТРазный
3. Кардиотонические стероиды ингиби-
руют насос и АТРазу только в том случае,
если они находятся вне клетки (снаружи). 36. Мембранный транспорт 307
происходит в условиях резко увеличенных
ионных градиентов. Это достигается инку-
бацией эритроцитов в среде с очень высокой
(по сравнению с нормой) концентрацией
+ +
Na и очень низкой концентрацией К .

36.6. Натрий-калиевый насос - олигомерный


трансмембранный белок
+ +
(Na + K )-АТРаза представляет собой
тетрамер α2β2 массой 270 кДа. Большая
α-субъединица (95 кДа) содержит участок,
осуществляющий гидролиз АТР, и участок
связывания кардиотонических стероидных
ингибиторов. Меньшая β-субъединица
(40 кДа) содержит углеводные группы. Ме-
Рис. 36.5. Циклическое изменение кон- жду двумя α-субъединицами или между α-
формации (Nа+ + К + )-АТРазы и β-субъединицами (но не между двумя
в ходе катализа. β-субъединицами) легко образуются попе-
речные мостики. Исходя из этого факта,
можно было предположить, что α-субъеди-
ницы контактируют друг с другом, тогда
как β-субъединицы пространственно разде-
лены. Как уже упоминалось, гидролиз АТР
насос электрогенен. Максимальное число протекает на той стороне мембраны, кото-
оборотов АТРазы составляет около 100 с-1. рая обращена к цитозолю, а участок связы-
Ионы ванадата (V 5 + ) в наномолярных вания стероидных ингибиторов находится
концентрациях ингибируют (Na+ + К + )- на наружной стороне мембраны. Следова-
АТРазу. Этот пятивалентный ион фик- тельно, каждая α-субъединица пронизывает
сирует белок в форме Е2 . Ванадат является мембрану насквозь (рис. 36.7). Углеводные
аналогом переходного состояния, образую- цепи β-субъединиц расположены на наруж-
щегося при гидролитическом отщеплении ной стороне плазматической мембраны, как
фосфорильной группы, так как он способен это вообще свойственно мембранным гли-
принять бипирамидальную структуру, по- копротеинам (разд. 10.12).
добную той. какую дает фосфат (рис. 36.6). Любопытно отметить, что рассматри-
ваемый ферментный комплекс обладает од-
36.5. Транспорт ионов и гидролиз АТР ним участком связывания стероидных инги-
тесно сопряжены биторов, одним участком фосфорилирова-
Важная характеристика насоса состоит ния и тремя участками связывания Na + . Как
в том, что в отсутствие транспорта Na+ и
К+ не происходит гидролиза АТР. Другими
словами, система так сопряжена, что энер-
гия АТР не растрачивается впустую. Про-
чное сопряжение - общая особенность био-
логических систем, опосредующих превра-
щение энергии. Вспомним, что и в митохон-
дриях условием нормального потока элек-
тронов в дыхательной цепи служит одновре-
менное генерирование АТР (разд. 14.13).
Другой пример сформулированного прин-
ципа - обязательное сопряжение гидролиза
АТР и мышечного сокращения. Рис. 36.6. Строение ванадат-иона (V 5 + ).
Действие (Na + + K + )-насоса можно Лиганды вокруг этого иона
обратить так, чтобы он приводил к синтезу располагаются в виде двойной
АТР. Суммарный синтез АТР из ADP и Р i пирамиды, т.е. так же, как во-
круг атома фосфора при гидро-
Часть V. литическом отщеплении фос-
308 Молекулярная физиология форильной группы.
лость должна быть открыта со стороны,
обращенной внутрь, а при другой - со сто-
роны, обращенной наружу.
3. Указанные конформации должны
иметь разное сродство к транспортируемым
компонентам.
Рассмотрим эту модель применительно
к транспорту Na+ и К+ (рис. 36.8). Две кон-
формации белка - это формы Е1 и Е2,
уже описанные ранее. Постулировано, что
1) связывающая ионы полость на Е1 обра-
щена внутрь клетки, а на Е2 - наружу и 2) Е1
обладает высоким сродством к Na+, а Е2 - к
К + . Модель исходит также из двух ус-
Рис. 36.7. Схематическое изображение тановленных фактов, а именно 1) Na+ за-
субъединичной структуры пускает фосфорилирование, а К+ - дефос-
и расположения в мембране форилирование, 2) фосфорилирование ста-
(Na+ + К+)-насоса. билизирует форму Е2, а дефосфорилиро-
вание - форму Е1. На рис. 36.8 E1 и Е2
изображены совершенно разными по кон-
же получается, что тетрамер с субъединич- формации. Нужно, однако, подчеркнуть,
что структурные различия между этими дву-
ной структурой α2β2 содержит нечетное
мя формами вовсе необязательно должны
число связывающих участков? Одна из воз-
быть большими. Сдвига нескольких атомов
можностей состоит в том, что участки
на расстояние 2 А может оказаться доста-
связывания расположены между субъедини-
точно, чтобы изменить ориентацию полости
цами, в месте их контактов. Вспомним, что
и сродство к Na+ или К + . Существует мно-
α2β2-тетрамер гемоглобина содержит един-
жество прецедентов, позволяющих считать,
ственный участок связывания бисфосфогли-
что фосфорилирование способно вызвать
церата, находящийся в полости, располо-
изменения такого масштаба. Вспомним
женной в центре молекулы (разд. 4.14).
влияние фосфорилирования на свойства
Однако существует и иная возможность,
гликоген-фосфорилазы и гликоген-синтазы
а именно такое взаимодействие двух αβ-по-
или на изменение сродства гемоглобина
ловин фермента, при котором связывание
к кислороду при нековалентном связывании
в одном из двух участков препятствует
бисфосфоглицерата.
связыванию в другом. В самом деле, целый
ряд олигомерных ферментов проявляет та-
кую половинную реакционноспособность. 36.8. Кардиотонические стероиды -
специфические ингибиторы (Na+ +
36.7. Модель механизма действия + К+)-АТРазы и (Na+ + К+)-насоса
натрий-калиевого насоса Некоторые стероиды растительного проис-
Почему фосфорилирование и дефосфорили- хождения являются мощными ингибитора-
рование АТРазы приводят к переносу Na+ и ми (Na+ + К+)-АТРазы и насоса. Полу-
К+ через мембрану? Структура этого насо- максимальное ингибирование обоих про-
са еще не настолько изучена, чтобы можно цессов наблюдается при концентрации ин-
было детально описать механизм его дей- гибитора порядка 10-8 М. Представители
ствия. Все же полезно рассмотреть простую этого класса ингибиторов, в частности диги-
модель работы насоса, предложенную Оле- токсигенин и уабаин, называются кардиото-
гом Ярдецким (Oleg Jardetzky). Согласно ническими стероидами в связи с их выра-
этой модели, структура белка, функциони- женным действием на сердечную деятель-
рующего в качестве насоса, должна отве- ность (рис. 36.9). Активность кардиотониче-
чать трем условиям. ских стероидов определяется наличием в их
1. В белке должна быть полость такой ве- структуре 5- или 6-членного ненасыщенного
личины, чтобы в ней умещались небольшая лактонного кольца с β-конфигурацией при
молекула или ион.
2. Белок должен существовать в двух кон-
формациях, причем при одной из них по- 36. Мембранный транспорт 309
Рис. 36.8. Схематическое изображение ваны на наружной стороне мембраны.
предполагаемого механизма Таким образом, подавление дефосфорили-
действия (Na + + К + )-насоса. рования этими стероидами пространствен-
На верхней половине рисун- но так же асимметрично, как и активация де-
ка последовательность реак- фосфорилирования ионами калия.
ций, направленных на выведе- Кардиотонические стероиды, например
ние трех ионов Na + ; ниже — дигиталис, имеют огромное значение в ме-
последовательность реакций, дицине. Дигиталис повышает силу сокраще-
обеспечивающих вход двух ио- ния сердечной мышцы и потому служит ос-
нов К + . Формы Е1 (желтый новным средством лечения острой сердеч-
цвет) и Е2 (синий цвет) на рисун- ной, недостаточности. Ингибирование диги-
ке сильно различаются по кон- талисом (Na + + К + )-насоса приводит
формации. На самом деле кон- к повышению содержания Na + в клетках
формационные различия могут сердечной мышцы. Это сопровождается уве-
быть очень небольшими. личением внутриклеточной концентрации
Са 2+ , что в свою очередь повышает сокра-
тительную активность миокарда. Любопыт-
С-17. Существенное значение имеют также
но отметить, что дигиталис (алкалоид на-
гидроксильная группа при С-14 и цис-кон-
перстянки) успешно использовался задол-
фигурация сочленения колец С и D. В моле-
го до открытия (Na+ + К + )-АТРазы. В
куле уабаина и ряда других кардиотониче-
1785 г. врач и ботаник Уильям Уитеринг
ских стероидов при С-3 находится остаток
(William Withering) опубликовал «Описание
сахара, однако этот сахар не имеет значения
наперстянки и некоторые способы ее приме-
для ингибирования АТРазы.
нения в медицине», где рассказывает, каким
образом он впервые узнал об использова-
нии дигиталиса для лечения острой сердеч-
ной недостаточности.
«В 1775 г. меня спросили, каково мое
мнение о домашнем способе лечения во-
дянки. При этом сообщили, что этот спо-
Как уже упоминалось, кардиотонические соб был известен одной старухе в Шроп-
стероиды ингибируют реакцию дефосфори- шире и она долго держала его в секрете.
лирования (Na + + К + )-АТРазы. Ингиби- Старуха иногда вылечивала больных, ко-
рование присходит только в том случае, ес- торым не могли помочь врачи... Ее сна-
ли кардиотонические стероиды локализо- добье состояло из 20 или более различных
трав, однако разбирающемуся в этом
Часть V. предмете нетрудно было заметить, что ак-
310 Молекулярная физиология тивным началом могла быть только на-
перстянка... Наперстянка влияет на бие-
ние сердца в большей степени, чем
какое-либо из других лекарств, и это дей-
ствие можно с успехом использовать для
исцеления больного».

36.9. Транспорт кальция осуществляется


другой АТРазой
Ионы кальция играют важную роль в регу-
ляции мышечного сокращения (разд. 34.10),
а также во многих других физиологических
процессах. В скелетной мышце содержится
сложная сеть связанных с мембраной трубо-
чек и везикул. Эта мембранная система, на-
зываемая саркоплазматическим ретикулу-
мом, регулирует концентрацию Са2+
в среде, окружающей сократительные мы-
шечные волокна. В состоянии покоя Са 2+
насасывается в саркоплазматический рети-
кулум, так что непосредственно вокруг мио-
фибрил концентрация Са2+ бывает очень

Рис. 36.10. Наперстянка. (Krochmal A.,


Krochmal С., A Guide to the
Medicinal Plants of the United
States, Quadrangle Books, 1973,
p. 243.)

низкой. Возбуждение мембраны саркоплаз-


матического ретикулума под влиянием не-
рвного импульса ведет к мгновенному выс-
вобождению больших количеств Са 2+ , и это
запускает мышечное сокращение. Другими
словами, Са2+ служит промежуточным
звеном между нервным импульсом и сокра-
щением мышечного волокна.
Транспорт Са 2+ через мембрану сарко-
плазматического ретикулума происходит за
счет энергии АТР. В саркоплазматическом
ретикулуме имеется АТРаза, которую акти-
вирует Са 2+ . Эта Са 2+ -АТРаза является со-
2+
ставной частью Са -насоса подобно тому,
как (Na + К )-АТРаза - часть (Na+ +
+ +

+ К+)-насоса. Са2+-АТРаза также подвер-


гается фосфорилированию в ходе гидролиза
АТР:

Рис. 36.9. Кардиотонические стероиды,


например дигитоксигенин и уа-
баин, ингибируют (Na+ +
+ К+)-насос. 36. Мембранный транспорт 311
2+
рименте Са -АТРазу выделяли из мем-
бран саркоплазматического ретикулума по-
сле их солюбилизации детергентом хола-
том. Очищенный солюбилизированный
фермент добавляли к фосфолипидам из со-
евых бобов. После удаления детергента пу-
тем диализа образовывались мембранные
везикулы. Эти реконструированные вези-
2+
кулы с высокой скоростью накапливали Са
2+
в присутствии АТР и Мg .

36.10. Поток Na + обеспечивает энергией


активный транспорт сахаров и аминокислот
Рис. 36.11. Мембранные везикулы, обра- в животных клетках
зованные из очищенной Многие транспортные процессы не зависят
Са 2+ -АТРазы. Глобулярные непосредственно от гидролиза АТР, а со-
частицы на поверхности мем- пряжены с потоком ионов по электрохими-
браны - участки молекулы ческому градиенту. Так, во многих жи-
АТРазы, пронизывающей мем- вотных клетках насасывание глюкозы обес-
брану. [Stewart P. S., Мас- печивается одновременным входом Na + .
Lennan D. H., J. Bioi.Chem., 249, При этом ионы натрия и глюкоза связы-
987 (1974).] ваются со специфическим транспортным
белком и проникают в клетку одновремен-
но. Согласованный перенос двух компонен-
тов называют котранспортом; при симпор-
Цикл конформационных изменений, обус- те имеет место перенос обоих компонентов
ловленных фосфорилированием и дефосфо- в одном направлении, а при антипорте - в
рилированием, обеспечивает перенос двух
ионов Са2+ при расщеплении одной моле-
кулы АТР. Благодаря очень высокому срод-
ству этой АТРазы к Са 2 + (К 10-7 М) фер-
мент эффективно транспортирует Са 2+ из
цитозоля (где [Са2+] < 10-5 М) в сарко-
плазматический рстикулум (где [Са 2 + ]
10-2 М).
Плотность молекул Са2+-насоса в мем-
бране саркоплазматического ретикулума
очень велика, а именно около 20 000 в расче-
те на 1 мкм 2 . В сущности, Са 2+ -АТРаза со-
ставляет более 80% общего количества ин-
тегральных белков мембраны и занимает
треть ее поверхности. Большая субъединица
(100 кДа) Са-насоса пронизывет мембрану
и содержит участок фосфорилирования; как
и в (Na+ + K+)-насосе, таким участком
является специфическая боковая цепь, пред-
ставленная остатком аспартата. Еще одна
общая черта обоих насосов - это наличие
гликопротеина: в Са 2+ -насосе гликопро-
теин массой 55 кДа связан с большой
субъединицей. Рис. 36.12. Источником энергии для ак-
Из очищенной Са 2 + -АТРазы и фосфоли- тивного транспорта глюкозы
пидов удалось реконструировать функцио- служит градиент концентрации
нально активный Са2+-насос. В этом экспе- Na + . Эта система симпорта
свойственна плазматическим
Часть V. мембранам клеток кишечника
312 Молекулярная физиология и почек.
противоположных направлениях. Ионы на-
трия, которые входят в клетку вместе с мо-
лекулами глюкозы посредством симпорта,
выводятся из клетки (Na+ + К+)-АТРазой
(рис. 36.12). Количество транспортируемой
глюкозы и скорость ее транспорта зависят
от трансмембранного градиента концентра-
+
ции Na .
Зависящий от Na+ симпорт широко ис-
пользуется в животных клетках для нако-
пления аминокислот. В некоторых клетках,
например в микроворсинках щеточной
каемки кишечника (рис. 36.13), посредством
симпорта осуществляется активный транс-
порт сахаров. Кроме того, в тонком кишеч-
нике существует специализированный
Na+-зависимый симпорт, обеспечивающий
перенос ионов Cl- против градиента кон-
центрации. Во многих клетках ионы натрия
служат также движущей силой в процес-
сах антипорта, направленных на выведение
ионов кальция. Таким образом, градиент
концентрации ионов натрия, создаваемый Рис. 36.13. Электронная микрофотогра-
(Na+ + K+)-АТРазой, обеспечивает энер- фия поперечного среза микро-
ворсинок кишечника. Наличие
гией большинство симпортов и антипортов
микроворсинок во много раз
в животных клетках.
увеличивает площадь поверх-
36.11. Поток протонов служит движущей ности, через которую происхо-
силой во многих процессах транспорта дит транспорт питательных ве-
у бактерий ществ. (Печатается с любезно-
Симпорты и антипорты - эволюционно го разрешения д-ра G. Pallade.)
очень древние механизмы молекулярного
транспорта. Так, движущей силой многих
транспортных систем у бактерий служит по- чем целая бактерия. В везикулах есть систе-
ток протонов через плазматическую мем- ма окислительного фосфорилирования и
брану. Наиболее изученная бактериальная другие связанные с мембраной белки, но от-
система симпорта - перенос лактозы у E.coli сутствуют цитоплазматические компоненты
(рис. 36.14). У этой обитательницы нижних интактной клетки. Сами по себе везикулы не
отделов кишечника млекопитающих выра- накапливают лактозы, но если добавить
ботался высокоэффективный механизм кон- субстрат окисления, обеспечивающий поток
центрирования лактозы. Насос для этого обладающих высоким потенциалом элек-
дисахарида, выделенный Юджином Кенне- тронов по дыхательной цепи, то накопление
ди (Eugene Kennedy), представляет собой лактозы имеет место. Этот же эффект мож-
одиночную полипептидную цепь массой но получить и иным способом, а именно со-
30 кДа и называется пермеазой для лактозы зданием градиента рН с помощью образуе-
(или М-белком). Это интегральный мем- мой вне клеток кислоты. Создание мем-
бранный белок, который кодируется геном бранного потенциала градиентом концен-
у, входящим в lac-оперон (разд. 28.3). В ин- трации К+ также приводит к насасыванию
дуцированных клетках на его долю прихо- лактозы. Все эти данные показывают, что
дится около 4% белков мембраны. активный транспорт лактозы обеспечивает-
Раскрытию механиза функционирования ся протонодвижущей силой в плазматиче-
лактозного насоса способствовало изучение ской мембране. Транспорт молекул лактозы
мутантов по гену у, а также исследования сопряжен с движением протона в клетку.
везикул (пузырьков), полученных из бакте- При физиологических условиях протонный
риальных мембран. Везикулы очень удобны
для изучения процессов транспорта, по-
скольку они значительно проще устроены, 36. Мембранный транспорт 313
Рис. 36.14. Пермеаза для лактозы транс- нию к фосфорилированным сахарам, и по-
портирует β-галактозиды. в тому они накапливаются внутри бакте-
частности лактозу (А) и изо- риальной клетки.
пропилтиогалактозид (Б). Тио- Наиболее хорошо изучен процесс транс-
галактозиды оказались очень локации групп, осуществляемый фосфо-
удобными для изучения этой трансферазной системой ( Ф Т С ) которую
системы, так как они транс- открыл Сол Роузман (Saul Roseman). Осо-
портируются пермеазой для бенность этой системы состоит в том, что
лактозы, но не подвергают- донором фосфорильной группы служит фос-
ся гидролизу β-галактозида- фоенолпируват, а не АТР или какой-либо
зой. иной нуклеозидтрифосфат. Суммарная ре-
акция, катализируемая фосфотрансфераз-
градиент, необходимый для этого активно- ной системой, следующая:
го транспорта, возникает за счет потока Сахарвне клетки
+
электронов от донора, обладающего высо-
ким потенциалом (например, NADH), по + Фосфоенолпируват
дыхательной цепи. Симпорт протонов и лак-
тозы иллюстрирует обобщающую концеп- —> Фосфорилированный сахар в клетке +
цию Питера Митчелла (Peter Mitchell)
о «преобразовании энергии посредством + Пируват.
протонного градиента» (разд. 14.18).

36,12. Активный транспорт ряда сахаров


сопряжен с их фосфорилированием
Симпорт - не единственный тип насосов,
осуществляющих транспорт сахаров. У не-
которых бактерий накопление углеводов
происходит путем сопряжения их входа
в клетку с фосфорилированием. Например,
у многих бактерий поступающая в клетки
глюкоза превращается в глюкозо-6-фосфат.
Особенность транспорта этого типа, назы-
ваемого транслокацией группы, состоит
в том, что в ходе транспорта происходит
модификация растворенного вещества. Кле-
точная мембрана непроницаема по отноше-
Таблица 36.1. Углеводы, транспортируемые фосфо-
трансферазной системой Е. coli

Глюкоза Маннитол
Фруктоза Сорбитол Рис. 36.15. Протонный градиент служит
Манноза Галактитол источником энергии для транс-
N-ацетилглюкозамин Лактоза порта ряда сахаров и амино-
кислот в бактериальные клет-
ки. Протонный градиент гене-
Часть V. рируется током электронов
314 Молекулярная физиология в дыхательной цепи.
В этой транслокации участвуют 4 белка:
HPr, фермент I, фермент II и фермент III.
Фермент II, будучи интегральным белком
мембраны, образует трансмембранный ка-
нал и катализирует фосфорилирование саха-
ра. При этом фосфорильная группа фосфое-
нолпирувата переносится на сахар не прямо,
а сначала на фермент I и после на специфи-
ческий остаток гистидина небольшого
термостабильного белка HPr (рис. 36.16).
Образующийся в качестве промежуточного
соединения фосфогистидин имеет высокий
потенциал переноса фосфатной группы.
промежуточный по величине между со-
ответствующими значениями для АТР
и фосфоенолпирувата. Далее происходит
перенос фосфорильной группы от фосфори-
лированного HPr на фермент III - перифе-
рический мембранный белок, который уже
взаимодействует с собственно каналом, т. е.
ферментом II:

Конечный этап - перенос фосфорильной


группы от фермента III на транспорти- Рис. 36.16. Поток фосфорильных групп от
руемый сахар (рис. 36.17). Из указанных фосфоенолпирувата на сахар,
четырех очищенных белков удалось рекон- транспортируемый через мем-
струировать функционально активный фер- брану фосфотрансферазной си-
ментный комплекс. стемой.
Некоторые белки, входящие в состав фос-
фотрансферазной системы, обладают специ-
фичностью, другие - нет. Так, HPr и фер- случае фосфорильная группа переносится
мент I, которые являются растворимыми непосредственно от HPr на углевод.
белками цитозоля, участвуют в транспорте Чем объяснить, что фосфотрансферазная
всех сахаров, переносимых этой системой. система устроена значительно сложнее дру-
С другой стороны, ферменты II и III про- гих переносчиков, например пермеазы для
являют специфичность в отношении опреде- лактозы? Представляется вероятным, что
ленных сахаров. Например, в транспорте фосфотрансферазная система не только осу-
глюкозы, лактозы и фруктозы участвуют ществляет транспорт сахаров, но и выпол-
разные ферменты II и III. Такой же резуль- няет регуляторные функции. Избыточное
тат был получен и при генетических иссле- поступление какого-то одного углевода под
дованиях. У мутантов, дефектных по HPr действием фосфотрансферазной системы
или ферменту I, не происходит транспорта сильно подавляет активный транспорт саха-
большого числа разных сахаров, тогда как ров другими переносчиками. Это ингибиро-
мутанты, дефектные по синтезу ферментов вание опосредуется, по-видимому, измене-
II и III, не способны транспортировать нием содержания сАМР, а именно повыше-
только какой-либо определенный сахар.
Фермент III не участвует в транслокации
гекситолов, в частности галактитола; в этом 36. Мембранный транспорт 315
ние концентрации сахара, накопленного
фосфотрансферазной системой, ведет к сни-
жению выработки сАМР (рис. 36.18). В ре-
зультате прекращается транскрипция ряда
индуцируемых оперонов. Вспомним, что
экспрессия таких индуцируемых оперонов,
как lac и gal, значительно возрастает при
связывании комплекса сАМР с белком БАК
в соответствующих участках промотора
(разд. 28.6). Следовательно, фосфотрансфе-
разная система регулирует использование
источников углерода.
36.13. Транспортные антибиотики повышают
ионную проницаемость мембран
Ряд микроорганизмов синтезирует низко-
молекулярные соединения, в присутствии
которых мембраны становятся прони-
цаемыми для определенных ионов. Эти не-
большие молекулы, называемые транс-
портными антибиотиками, оказались
ценным инструментом для эксперимен-
тальных исследований, в частности для
изучения механизма связывания ионов. На-
пример, валиномицин препятствует окисли-
тельному фосфорилированию в митохон-
дриях путем повышения их проницаемости
для К + : в присутствии валиномицина мито-
хондрии используют энергию, генерируе-
Рис. 36.17. Предполагаемый механизм мую при транспорте электронов, не на син-
транслокации групп, осущест- тез АТР, а на накопление К + . Валиномицин
вляемой фосфотрансферазной имеет циклическую структуру, образован-
системой. ную из повторяющейся три раза последова-
тельности четырех разных остатков (А, Б,
В и Г) (рис. 36.19). Эти остатки четырех ти-
пов соединены чередующимися эфирными
и пептидными связями.
Еше один хорошо изученный транспорт-
ный антибиотик - грамицидин А (рис. 36.20).
Это полипептид с открытой цепью, сос-
тоящий из 15 аминокислотных остатков.
Примечательна структура грамицидина А:
в нем чередуются D- и L-аминокисло-
ты. Кроме того, N- и С-концы поли-
пептида модифицированы. Как будет пока-
зано несколько ниже, транспорт ионов
грамицидином А и валиномицином осу-
ществляется совершенно по-разному.
Механизм переноса ионов этими анти-
биотиками удобно исследовать на таких хо-
Рис. 36.18. Транспортируемый фосфо- рошо охарактеризованных модельных си-
трансферазной системой сахар стемах, как двуслойные липидные пузырьки
α-метилглюкозид ингибирует (разд. 10.6) и плоские двуслойные мем-
образование сАМР. браны (разд. 10.6). В опытах используют
пузырьки, содержащие радиоактивный ион,
Часть V. например 4 2 К + ; их получают путем обра-
316 Молекулярная физиология ботки мембран ультразвуком в присутствии
36.14. Транспортные антибиотики
функционируют либо как подвижные
переносчики, либо как каналообразователи
Существует два совершенно разных меха-
низма действия транспортных антибиоти-
ков на проницаемость мембран для ионов
(рис. 36.21). Некоторые антибиотики (на-
пример, грамицидин А) формируют канал,
пронизывающий мембрану. Ионы входят
в такой канал на одной стороне мембраны,
диффундируют по нему и выходят на дру-
гой стороне мембраны. Стимуляция транс-
порта ионов по этому механизму не сопря-
жена с движением самого антибиотика-ка-
налообразователя. Антибиотики другой
Рис. 36.19. Валиномицин имеет периоди- группы (например, валиномицин) функцио-
ческую циклическую структу- нируют как переносчики ионов через углево-
ру, состоящую из остатков дородную область мембраны. Активность
L-лактата (А), L-валина (Б), этих транспортных антибиотиков сопряже-
D-гидроксиизовалерианата (В) на с их собственной диффузией.
и D-валина (Г). В эксперименте подвижные переносчики
и каналообразователи можно различить сле-
дующим образом. Измеряют температур-
этого иона и последующего удаления 4 2 К + , ную зависимость ионной проводимости ис-
не попавшего внутрь пузырьков, методом кусственной липидной двуслойной мем-
гель-фильтрации. Далее сравнивают ско-
рость выхода радиоактивного иона из пузы-
рьков в присутствии и в отсутствие антибио-
тика. Другой способ получения информации
относительно ионной проницаемости дву-
слойных мембран состоит в измерении та-
ких электрических параметров, как сопроти-
вление мембраны и мембранный потенциал.
Например, сопротивление двуслойной мем-
браны по отношению к К + в присутствии
10-7 М валиномицина или 10-9 М грами-
цидина падает более чем в 10000 раз при
градиенте концентраций КСl на мембране
0,02 М.

Рис. 36.21. Схематическое изображение


различий между транспортны-
ми антибиотиками-канало-
образователями и подвижны-
ми переносчиками. Все из-
вестные транспортные белки
принадлежат к категории кана-
лообразователей.

Рис. 36.20. Структура грамицидина А. 36. Мембранный транспорт 317


Как уже обсуждалось выше (разд. 10.14),
перемещение интегральных мембранных
белков с одной поверхности мембраны на
другую (поперечная диффузия) идет крайне
медленно либо вовсе отсутствует. Следова-
тельно, они не могут служить подвижными
переносчиками.

36.15. Антибиотики-переносчики имеют


форму скорлупы ореха и связывают ионы
в своей центральной полости
По данным рентгеноструктурного анализа
и спектроскопических исследований, анти-
Рис. 36.22. Влияние температуры на про- биотики - подвижные переносчики ионов -
водимость липидных дву- характеризуются определенной общностью
слойных мембран, одна из ко- структуры. Все исследованные к настояще-
торых содержит транспортный му времени переносчики по форме напо-
антибиотик-каналообразова- минают скорлупу ореха. Единственный
тель, другая - транспортный связываемый ион металла образует коор-
антибиотик, являющийся под- динационные связи с несколькими атомами
вижным переносчиком. кислорода, окружающими центральную по-
лость. Число таких атомов кислорода
(связывающих ион металла) обычно равно
браны, содержащей транспортный антибио- 6 или 8. Периферическая часть структуры
тик. При этом берут температурный интер- подвижного переносчика состоит из углево-
вал, включающий температуру фазового дородных групп (рис. 36.23).
перехода липида; в этом интервале углево- Функция центрально расположенных ато-
дородная середина мембраны переходит от мов кислорода, окруженных углеводо-
практически затвердевшего состояния до родным наружным слоем, вполне очевидна.
совершенно жидкого. Каналообразователь, В самом деле, в водной среде ион металла,
опосредуя транспорт ионов через мембрану, например К+, связывает через кислород не-
сам по себе не диффундирует. Следователь- сколько молекул воды. Антибиотик-перено-
но, застывание углеводородного слоя не счик конкурирует с молекулой воды за
окажет существенного влияния на его спо- связывание иона, образуя с ним хелатное со-
собность транспортировать ионы. Иная си- единение через несколько соответствующим
туация складывается с подвижным перено- образом расположенных атомов кислорода
счиком ионов, который для проявления в центральной полости. Благодаря углево-
активности должен диффундировать сквозь дородной периферической части переносчи-
углеводородный слой мембраны: его эффек-
тивность при затвердении углеводородного
слоя должна значительно уменьшиться.
Данные экспериментов с валиномицином
и грамицидином А действительно выяв-
ляют различие между двумя рассматри-
ваемыми механизмами (рис. 36.22). Прони-
цаемость содержащей валииомицин дву-
слойной мембраны возрастает при ее
разжижении более чем в 1000 раз. В то же
время на транспортную активность грами-
цидина А переход мембраны в жидкое со-
стояние почти не оказывает влияния.
Важно подчеркнуть, что все известные
в настоящее время природные системы Рис. 36.23. Схематическое изображение
транспорта представляют собой каналы. хелатирования К + атомами
кислорода в транспортном
Часть V. антибиотике - подвижном пе-
318 Молекулярная физиология реносчике.
Рис. 36.24. Модели валиномицина (А) 36.16. Валиномицин связывает К+ в 1000 раз
и его комплекса с К+ (Б). При прочнее, чем Na+
связывании К+ происходит из- Каким образом соединения, транспорти-
менение конформации анти- рующие ионы, различают такие сходные
биотика. [Изображено в со- ионы, как Na+ и К + ? Валиномицин связы-
ответствии с атомными вает К+ в 1000 раз прочнее, чем Na+, т.е. из-
координатами, любезно пред- бирательность этого переносчика выше, чем
оставленными д-ром W. Duax у (Na+ + К + )-АТРазы. Рассмотрим основу
(для валиномицина) и д-ром столь высокой избирательности. Как пока-
L. Steinrauf (для комплекса зали спектроскопические исследования,
валиномицин—К+).] комплексы валиномицина с Na+ и К+ очень
сходны по структуре. В частности, в обоих
ка его комплекс с ионом растворим в липи- комплексах одинаковы длины координа-
дах мембран. По существу, каталитическое ционных связей между катионом в центре
действие рассматриваемых антибиотиков молекулы и атомами кислорода. Почему же
на транспорт ионов через мембраны и со- тогда К+ связывается намного прочнее, чем
стоит в том, что они переводят ионы в рас- Na + ? Причина этой избирательности в том,
творимую в липидах форму. что К+ слабее, чем Na+, притягивает воду.
На рис. 36.24 показаны структуры вали- Свободная энергия образования гидратной
номицина и его комплекса с К + . Ион К+ оболочки для Na+ на 17 ккал/моль ниже,
координирован с шестью атомами кислоро- чем для К+ (табл. 36.2). Следовательно, ва-
да, описывающими октаэдр вокруг цен- линомицин связывает К+ прочнее потому,
тральной полости молекулы. Эти атомы что отделение воды от К+ требует менъ-
кислорода принадлежат карбонильным
группам шести остатков валина в антибио- Таблица 36.2. Свойства щелочных катионов
тике. Метильные и изопропильные боковые
Ион Порядковый Радиус иона, Свободная
цепи формируют углеводородную наруж- номер А энергия
ную часть молекулы валиномицина. элемента гидрата-
Интересна также структура комплекса с ции,
К+ другого переносящего ионы антибиоти- ккал/моль
ка, а именно нонактина (рис. 36.25). В этом
комплексе К+ связан с восемью атомами Li+ 3 0,60 -98
Na+ 11 0,95 -72
кислорода в центре молекулы. Четыре ато-
К+ 19 1,33 -55
ма кислорода из восьми принадлежат кар- Rb + 37 1,48 -51
боксильным группам, а остальные четы- Cs + 55 1,69 -47
ре - эфирным связям.

36. Мембранный транспорт 319


Рис. 36.25. Вид с двух сторон модели ком- К + представляет собой ступенчатый про-
плекса нонактина с К+. цесс, в ходе которого молекулы воды ги-
дратной оболочки иона последовательно
вытесняются кислородными атомами анти-
биотика. Новые связи формируются по мере
шей затраты энергии, чем отделение Na+. разрыва старых, и потому активационный
Пока еще не проводилось исследования барьер для связывания иона оказывается
атомарной структуры какого-либо ион- низким. Аналогичным образом и энергия
транспортирующего соединения, предпоч- активации противоположного процес-
тительно связывающего Na + , однако мож- са - высвобождения иона - также низка.
но представить себе, каким должна быть В итоге валиномицин присоединяет и выс-
ключевая особенность такой структуры. По- вобождает К + множество раз на протяже-
видимому, в ней должно отражаться ис- нии секунды. Важная роль гибкости струк-
пользование того факта, что Na + имеет туры в этом случае так же очевидна, как
меньший ионный радиус (r = 0,95 А), чем и при действии ферментов.
К+ (r = 1,33 А), благодаря чему отрицатель-
но заряженные атомы кислорода могут 36.17. Можно выявить поток ионов
в большей степени приблизиться к Na + , чем через единичный канал в мембране
к К + ; таким путем может быть преодолен Проводимость планарной двуслойной мем-
более высокий энергетический барьер деги- браны, содержащей небольшое количество
дратирования Na + но сравнению с К+. Сле- грамицидина А, не является постоянной.
довательно, можно предсказать, что участ- Как показал Денис Хейдон (Denis Haydon),
ки специфического связывания Na+ должны проводимость этой мембраны для Na + из-
обладать высокой плотностью отрицатель- меняется во времени ступенчато (рис. 36.26).
ного заряда и такой геометрией, которая Эти ступени проведения иона определяются
позволяла бы Na+ плотно входить в них. В спонтанным открыванием и закрыванием
отличие от этого участки специфического образованных грамицидином А каналов.
связывания К+ должны, по-видимому, обла- Единичный канал остается открытым в те-
дать отрицательным зарядом меньшей чение примерно секунды. По такому каналу
плотности и их геометрия должна меньше легко проходят одновалентные катионы, но
подходить для образования очень коротких не анионы или двухвалентные катионы. Ока-
связей между катионом и координирующи- залось, что по одному каналу в течение се-
ми группами. кунды мажет, пройти более 107 ионов. Такая
Примечательна также гибкость молекулы скорость транспорта только на один поря-
валиномицина (рис. 36.24). Хелатирование док величины ниже скорости диффузии в чи-
стой воде. В отличие от этого максимальная
Часть V. скорость транспорта, осуществляемого под-
320 Молекулярная физиология вижным переносчиком, составляет менее
Рис. 36.26. Ступенчатое изменение прово-
димости липидной двуслойной
мембраны, содержащей не-
сколько молекул грамицидина
А. Минимальное увеличение
проводимости обусловлено по-
явлением одного открытого
канала. (Печатается с любезно-
го разрешения д-ра О. Ander-
sen.)

103 ионов в 1 с, так как повороты и переме-


щение подвижного переносчика в мембране
занимают не менее 1 мс.
Методами спектроскопии и дифракции
рентгеновских лучей было показано, что
трансмембранный канал образуется из двух
молекул грамицидина А (рис. 36.27). Внутри
мембраны обладающий свойством провод-
ника спирализованный димер находится
в равновесии с непроводящими мономера-
ми. По существу, ступенчатое изменение
проводимости на рис. 36.26 соответствует Рис. 36.27. Схематическое изображение
процессу образования и диссоциации диме- канала из грамицидина А. Ка-
ров. Димер формирует обводненный канал нал образуется путем связыва-
диаметром 4 А, окруженный полярными ния N-формильных концов
группами пептидов. Гидрофобные боковые двух полипептидов. Каждая
цепи располагаются на периферии канала цепь скручивается в β-спираль,
и контактируют с углеводородными цепями похожую на свернутый в рулон
фосфолипидов мембраны. Окружающие во- β-складчатый слой. Изобра-
дную пору карбоксильные группы в канале женная модель была предложе-
образуют кратковременные координа- на Деном Ури (Dan Urry).
ционные связи с катионом в момент его [Weinstein S., Wallace В. А.,
прохождения по каналу. Как показал рент- Blout E. R., Morrow J. S.,
геноструктурный анализ, связавший ка- Veatch W., Proc. Nat. Acad. Sci.,
тионы канал становится короче и шире; это 76, 4230 (1979).]
еще раз подчеркивает динамическую приро-
ду молекул, обладающих транспортной
функцией. 36. Мембранный транспорт 321
Рис. 36.28. Электронная микрофотогра- также межклеточным каналом, поскольку
фия изолированных листков он служит протоком между внутренним со-
межклеточных щелевых соеди- держимым многих смежных клеток. Ще-
нений. Цилиндрические кон- левые соединения, открытые Жан-Полем
нексоны образуют гексаго- Ревелем и Морисом Карновским (Jean-Paul,
нальную решетку с ребром Revel, Morris Karnovsky), располагаются
ячейки 85 А. Диаметр интенсив- скопом (кластерами) в определенных участ-
но окрашенной полости в цен- ках плазматических мембран прилежащих
тре - около 20 А. (Печатается друг к другу клеток. На электронных микро-
с любезного разрешения д-ра фотографиях листков щелевых соединений
N. Unwin и д-ра G. Zampighi.) (рис. 36.28) можно видеть, что каждое со-
единение образовано шестью субъединица-
ми, окружающими пору диаметром
36.18. Через щелевые соединения ионы 15-20 А. На тангенциальном срезе
и небольшие молекулы перетекают (рис. 36.29) видно, что эти гексамеры про-
из клетки в клетку низывают промежуток (щель) между сопри-
Большие водные каналы, через которые касающимися клетками (отсюда и назва-
происходит пассивный транспорт, свой- ние - щелевое соединение). Для определения
ственны многим биологическим мембранам внутреннего размера щелевых соединений
прокариот и эукариот. Так, в наружной мем- производили микроинъекцию ряда флуорес-
бране грам-отрицательных бактерий цирующих веществ в одни клетки и затем
имеются каналы, образованные порином — наблюдали, как распространяется флуорес-
трансмембранным белком массой 37 кДа ценция по соседним клеткам. По данным
(разд. 32.14). По этим каналам диаметром Вернера Лёвенштейна (Werner Loewenstein),
10 А легко проникают в периплазматиче- все полярные вещества массой до 1 кДа лег-
ское пространство полярные молекулы мас- ко проходят по межклеточным каналам.
сой, не превышающей примерно 600 Да. Да- Другими словами, по щелевым соединениям
лее эти молекулы транспортируются из одной клетки в другую могут поступать
в цитозоль посредством симпорта, трансло- неорганические ионы и большинство метабо-
кации групп или иных пермеаз. Подобным литов (сахара, аминокислоты, нуклеотиды).
же образом в наружных мембранах мито- Что касается белков, нуклеиновых кислот
хондрий и хлоропластов имеются большие и полисахаридов, то из-за своих больших
водные каналы, образованные из анало- размеров они не проходят по этим каналам.
гичных порину молекул. Щелевые соединения играют важную роль
Наиболее хорошо изученным типом во- в межклеточной коммуникации. В ряде воз-
дного канала у эукариот является щелевое будимых тканей, например в сердечной мы-
соединение (щелевой контакт), называемое шце, клетки объединены в единую систему
быстрым потоком ионов через эти соедине-
Часть V. ния; таким путем достигается быстрый
322 Молекулярная физиология и синхронный ответ на стимуляцию. Через
Рис. 36.29. Электронная микрофотогра- ступает во внеклеточное пространство
фия тангенциального среза ще- и соединяется с коннексоном прилежащей
левых соединений между при- клетки. Длинная ось каждой из субъединиц
лежащими клеточными мем- коннексона имеет наклон по отношению
бранами. [Hertzberg E. L., Gi- к поперечной оси мембраны. Путем сколь-
lula N. В., J. Biol. Chem., 254. жения субъединиц относительно друг друга
2143 (1979).] происходит уменьшение их наклона к попе-
речной оси мембраны, и канал при этом за-
щелевые контакты происходит также пита- крывается (рис. 36.31). Самые большие кон-
ние клеток, удаленных от кровеносных сосу- формационные изменения имеют место
дов, например в костях или хрусталике гла- в середине канала, где субъединицы двух
за. Представляется вероятным, что рассма- стыкующихся коннексонов скользят относи-
триваемые каналы коммуникации имеют тельно друг друга на расстояние примерно
важное значение в регуляции процессов раз- 11 А, что соответствует повороту на 28o.
вития и дифференцировки. Анализ высокой степени разрешения позво-
Проницаемость щелевых контактов регу- лит в дальнейшем выявить, каким образом
лируется ионами кальция. Повышение вну- Са2+ индуцирует скольжение и поворот.
триклеточного содержания Са2+ приводит
к тому, что щелевой контакт в той или
иной мере закрывается. Межклеточные ка-
налы полностью открыты при концентра-
ции Са2+ ниже 10-7 М и полностью закры-
2+
ваются при концентрации Са , превышаю-
-5
щей 5•10 М. Увеличение содержания
Са2+ в указанном диапазоне приводит
к сужению просвета межклеточных каналов,
причем в первую очередь снижается прони-
цаемость для более крупных молекул.
Структурная основа таких изменений про-
света каналов была выявлена при анализе
реконструированных трехмерных изображе-
ний полей щелевых контактов, взятых
в двух различающихся по четвертичной
структуре состояниях. Эти структурные ис-
следования показали, что щелевой контакт
состоит из двух смыкающихся цилиндриче-
ских единиц, названных коннексонами. Рис. 36.30. Схематическое изображение
Каждый коннексон образован шестью щелевого контакта.
субъединицами, имеет длину 75 А и на-
сквозь пронизывает плазматическую мем-
брану. Сегмент коннексока длиной 20 А вы- 36. Мембранный транспорт 323
ния, осуществляется иной АТРазной систе-
мой, локализованной в мембране сарко-
плазматического ретикулума. Однако и
в этом случае процесс транспорта сопряжен
с фосфорилированием остатка аспартата.
2+
Обе системы транспорта - как Са , так и
+ +
(Na + К ) - удалось реконструировать из
соответствующих очищенных АТРаз и фос-
фолипидов.
Для ряда транспортных систем непосред-
ственным источником энергии служит не ги-
Рис. 36.31. Модель регуляции ионами
дролиз АТР, а градиент концентрации ио-
Са2+ степени закрывания ще-
нов. Так, активный транспорт глюкозы
левого соединения. (По рисун-
и аминокислот в ряде животных клеток со-
ку, любезно предоставленному
пряжен с одновременным входом Na + ; та-
д-ром N. Unwin и д-ром
кой процесс называется котранспортом.
G. Zampighi.)
Одновременный вход Na+ и глюкозы обес-
печивается специфическим симпортом.
(Na+ + К + )-насос создает тот градиент кон-
Заключение
центрации ионов Na + , который необходим
Транспорт молекул и ионов через биологи-
для сопряженного входа Na + и глюкозы.
ческие мембраны осуществляется транс-
У бактерий, как правило, непосредственным
мембранно ориентированными белками, ко-
источником энергии для симпортов и анти-
торые формируют каналы. Транспорт
портов служит градиент концентрации Н + ,
является пассивным, если ΔG для транспор-
а не Na + . Например, активный транспорт
тируемого компонента отрицательно; в слу-
лактозы, осуществляемый пермеазой для
чае активного транспорта величина ΔG по-
лактозы, сопряжен с входом протона в бак-
ложительна. Изменения свободной энергии
териальную клетку. Этот транспортный
зависят от соотношения концентраций
процесс протекает за счет протонодвижу-
транспортируемого компонента по двум
щей силы, генерируемой переносом элек-
сторонам мембраны и от мембранного по- тронов по дыхательной цепи. Бактериям
тенциала, если мембрана заряжена. Ак- свойствен и иной тип транспорта, а именно
тивный транспорт требует вклада свобод- так называемая транслокация групп; в этом
ной энергии. Наиболее распространенная
случае происходит модификация растворен-
система транспорта в животных ного вещества в процессе переноса. Так,
клетках - (Na+ + K+)-насос, который выво-
фосфотрансферазная система, переносящая
дит из клетки три иона Na+ и насасывает
сахара, фосфорилирует их (например, глю-
в клетку два иона К+ за счет энергии гидро-
козу в глюкозо-6-фосфат) по мере поступле-
лиза одной молекулы АТР. В присутствии
ния в клетку. Донором фосфорильной
Na+ ATP фосфорилирует аспартатную бо-
группы в этом процессе служит фосфоенол-
ковую цепь в α-субъединице этого фермен-
пируват. Фосфорилирование опосредовано
тативного комплекса с субъединичным
тремя разными ферментами и небольшим
составом α2β2. Образовавшееся фосфори-
белком (HPr) - переносчиком фосфорильной
лированное промежуточное соединение ги- группы.
дролизуется в присутствии К + . Эту послед-
Клетки прокариот и эукариот содержат
нюю реакцию подавляют кардиотонические
также наполненные водой каналы, по ко-
стероиды (например, дигиталис), являющие-
торым ионы и небольшие полярные моле-
ся высокоспецифичными ингибиторами
кулы могут пассивно диффундировать
(Na+ + К+)-насоса. В результате цикла кон-
сквозь мембраны. Например, в наружных
формационных изменений, обусловленных
мембранах грам-отрицательных бактерий
фосфорилированием и дефосфорилирова-
имеются пориновые каналы диаметром
нием, происходит перенос ионов Na+ и К + .
около 10 А. Между соприкасающимися
Транспорт ионов кальция, играющих важ-
клетками высших организмов во многих
ную роль в регуляции мышечного сокраще-
случаях имеются щелевые соединения. По
этим каналам диаметром 20 А ионы и боль-
Часть V. шинство метаболитов (например, моносаха-
324 Молекулярная физиология риды, аминокислоты и нуклеотиды) могут
перетекать из одной клетки в другую. Ще- цидин А). Молекула антибиотика подвижно-
левые соединения закрываются под дей- го переносчика, имеющая форму скорлупы
2+
ствием Са . Эти протоки между соприка- ореха, связывает в центральной полости
сающимися клетками играют важную роль один ион металла. Благодаря углеводород-
в межклеточной коммуникации. ной периферической части весь комплекс
Транспортные антибиотики повышают способен проходить сквозь внутренний
проницаемость мембран для определенных углеводородный слой мембраны. Кана-
ионов, функционируя в качестве подвижных лообразующие антибиотики формируют
переносчиков (например, валиномицин) ли- пронизывающие мембрану водные по-
бо каналообразователей (например, грами- ры.

РЕКОМЕНДУЕМАЯ Cantley L.C., Jr., Resh M.D., Guidot- Saier M.H., Jr., 1977. Bacterial phos-
ЛИТЕРАТУРА ti G., 1978. Vanadate inhibits the red phoenolpyruvate sugar phosphotran-
cell (Na + , K + )-ATPase from the sferase systems: structural, functional,
С чего начать cytoplasmic side, Nature, 272, 552-554. and evolutionary interrelationships,
Hobbs A.S., Alberts R.W., 1980. The Akera Т., 1977. Membrane adenosi- Bacteriol. Rev, 41, 856-871.
structure of proteins involved in active netriphosphatase: a digitalis receptor? Simoni R.D., Postma P.W., 1975. The
membrane transport, Ann. Rev. Biop- Science, 198, 569-574. (Обзор данных, energetics of bacterial active transport,
hys. Bioeng., 9, 259-291. показывающих, что (Na + + Ann. Rev. Biochem., 44, 523-554.
Wilson D.В., 1978. Cellular transport + К + )-АТРаза является мишенью
mechanisms, Ann. Rev. Biochem., 47, фармакологического действия диги- Каналы между клетками
933-965. талиса.) Loewenstein W.R., Kanno Y.,
Harold F.M., 1978. Vectorial meta- Jardetzky О., 1966. Simple allosteric Socolar S.J., 1978. The cell-to-cell chan-
bolism. In: Ornston L.N. and So- model for membrane pumps, Nature, nel, Fed. Proc., 37, 2645-2650.
katch J.R. (eds.), The Bacteria, vol. 6, 211, 969. Unwin P.N.T., Zampighi G., 1980.
pp. 463-521, Academic Press. Structure of the junction between
Saier M.H., Jr., 1979. The role of the Транспорт ионов кальция communicating cells, Nature, 283,
cell surface in regulating the internal DeMeis L., Vianna A.L., 1979. Energy 545-549.
environment. In: Sokatch J.R. Orn- interconversion by the Ca2+-dependent Hertzberg E.L., Gilula N.B., 1979.
ston L.N. (eds.), The Bacteria, vol. 7, pp. ATPase of the sarcoplasmic reticulum, Isolation and characterization of gap
167-227, Academic Press. Ann. Rev. Biochem., 48, 275-292. junctions from rat liver, J. Biol. Chem,
Estes J.W., White P.D., 1965. William MacLennan D.H., Campbell K.P., 1979. 254, 2138-2147.
Withering and the purple foxglove, Sci. Structure, function, and biosynthesis of Staehelin L.A., Hull B.E., 1978. Junc-
Amer., 212(6), 110-117. (Любопытное sarcoplasmic reticulum proteins, Trends tions between living cells, Sci. Amer,
описание истории открытия и ис- Biochem. Sci., 4, 148-151. 238(5), 140-152.
пользования дигиталиса.) Tada M., Yamamoto Т., Tonomura Y., Транспортные антибиотики
1978. Molecular mechanism of active Urban В.W., Hladky S.B., Haydon
Книги calcium transport by sarcoplasmic D.A., 1978. The kinetics of ion
Andreoli Т.E., Hoffman J.F., Fane- reticulum, Physiol. Rev., 58, 1-79. movements in the gramicidin channel,
stil D.D. (eds.), 1978. Physiology of Racker E., 1972. Reconstitution of Fed. Proc., 37, 2628-2632.
Membrane Disorders, Plenum. (Содер- a calcium pump with phospholipids and Ovchinnikov Y.A., 1979. Physico-che-
жит прекрасные статьи, касающиеся a purified Ca 2+ -adenosine triphos- mical basis of ion transport through
многих аспектов мембранного транс- phatase from sarcoplasmic reticulum, J. biological membranes: ionophores and
порта.) Biol. Chem., 247, 8198-8200. ion channels, Eur. J. Biochem., 94,
Rosen В.P. (ed.), 1978. Bacterial Wasserman R.H., Fullmer C.S., Tay- 321-336.
Transport, Dekker. lor A.N., 1978. The vitamin D-depen- Lauger P., 1972. Carrier-mediated ion
dent calcium binding proteins. In: transport, Science, 178, 24-30.
Транспорт ионов Na + и К+ Lawson D. E. M. (ed.), Vitamin D, Krasne S., Eisenman G., Szabo G., 1971.
Skou J.C., Norby J.G., (eds.), 1979. Na, Academic Press. Freezing and melting of lipid bilayers
K-ATPase: Structure and Kinetics, Kretsinger R.H., 1976. Calcium-binding and the mode of action of nonactin,
Academic Press, proteins, Ann. Rev. Biochem., 45, valinomycin, and gramicidin, Science,
Fishman M.C., 1979. Endogenous 239-266. 174, 412-415.
digitalis-like activity in mammalian Koeppe R.E., Berg J.M., Hodg-
brain, Proc. Nat. Acad. Sci., 76, Система транспорта у бактерий son K.O., Stryer L., 1979. Gramicidin
4661-4663. Kaback H.R., Ramos S., Robert- A crystals contain two cation bind-
Sweadner K.J., Goldin S.M., 1980. son D.E., Stroobant P., Tokuda H., ing sites per channel, Nature, 279,
Active transport of sodium and 1977. Energetics and molecular biology 723-725.
potassium ions: mechanism, function, of active transport in bacterial mem-
and regulation, New Engl. J. Med., 302, brane vesicles, J. Supramol. Struc., 7,
777-783. 443-461.
как рецепторы ацетилхолина обеспечивают
ГЛАВА 37 проведение нервного импульса в опреде-
ленных синапсах. Затем перейдем к палоч-
Возбудимые мембраны и кам сетчатки глаза - исключительно чув-
сенсорные системы ствительному детектору света. При этом мы
познакомимся с ролью фоторецепторного
Мембраны многих клеток способны возбу- белка родопсина в преобразовании света
ждаться под действием специфических хи- в нервный сигнал. Последняя тема данной
мических или физических стимулов. Ответы главы - хемотаксис, т. е. движение клеток по
мембраны аксона нервной клетки на элек- направлению к веществам-аттрактантам
трический стимул, синапса на выделение ме- и от веществ-репеллентов. В последние годы
диатора, палочек сетчатки на свет, под- получено много новых сведений относи-
вижных клеток на молекулы аттрактан- тельно сопряжения хеморецепторов с двига-
тов - все это реакции, опосредованные воз- тельным аппаратом у бактерий.
будимыми комплексами, присутствующими
в мембранах. Эти и другие процессы, опо- 37.1. Потенциалы действия опосредованы
средованные возбудимыми комплексами, кратковременными изменениями
имеют следующие общие особенности. проницаемости для Na+ и К+
Нервные импульсы представляют собой
1. Стимул воспринимается высокоспеци- электрические сигналы, создаваемые током
фичным белком-рецептором, который ионов через плазматическую мембрану ней-
является интегральным компонентом возбу- ронов. В нейроне, как и в большинстве кле-
димой мембраны. ток, К+ содержится в высокой концентра-
2. Специфический стимул вызывает изме- ции, a Na + - в низкой. Градиенты концен-
нение конформации рецептора, что в свою трации этих ионов генерируются (Na+ +
очередь приводит к изменению проницае-
мости мембраны или активности связанно-
го с мембраной фермента. При этом во мно-
гих случаях происходит многократное уси-
ление ответа на специфические стимулы.
3. Как конформационный сдвиг, так
и возникающие в результате функцио-
нальные изменения рецептора обратимы.
Существуют специальные механизмы, воз-
вращающие рецептор в состояние покоя
и восстанавливающие его возбудимость.
В этой главе мы рассмотрим четыре типа
возбудимых комплексов, начав с натриевого
канала в мембранах аксонов нервных кле-
ток; этот зависимый от потенциала канал
участвует в возникновении потенциала дей-
ствия в нервах. Далее мы обратимся к хими-
чески регулируемому каналу и рассмотрим, Рис. 37.1. Электронная микрофотогра-
фия синапса. (Печатается с лю-
Часть V. безного разрешения д-ра
326 Молекулярная физиология U. Jack McMahan.)
+ К+)-насосом (разд. 36.2). В состоянии
покоя проницаемость мембраны нервной
клетки для К+ гораздо выше, чем проницае-
мость для Na+, и поэтому мембранный по-
тенциал определяется главным образом от-
ношением внутриклеточной концентрации
К+ к внеклеточной (рис. 37.2, А). В нестиму-
лированных аксонах мембранный потен-
циал составляет -60 мВ; это близко к
величине -75 мВ (равновесный К+-потен-
циал), которая соответствует проницае-
мости мембраны для одних только ионов
К + . Нервный импульс, или потенциал дей-
ствия, возникает при деполяризации мем-
браны, выходящей за пределы выше порого-
вого уровня (а именно с —60 до —40 мВ).
За несколько миллисекунд мембранный по-
тенциал становится положительным и до-
стигает примерно +30 мВ, после чего
вновь делается отрицательным. Эта усилен-
ная в несколько раз деполяризация распро-
страняется по нерву, достигая нервного Рис. 37.2. Потенциал действия возникает
окончания. В раскрытии природы потенциа- в результате деполяризации
ла действия важную роль сыграло изучение мембраны аксона нервной
гигантского аксона кальмара. Поскольку клетки. Показано изменение во
в этот необычайно крупный аксон (диаме- времени мембранного потен-
тром около миллиметра) нетрудно ввести циала (А) и проводимости ио-
электроды, он стал излюбленным объектом нов натрия и калия (Б).
исследователей.
Каков механизм возникновения потен-
циала действия? Ален Ходжкин и Эндрью
Хаксли (Alan Hodgkin, Andrew Huxley) про- движущая сила, за счет которой происходил
вели остроумные исследования, показав- вход Na + . Na+-каналы спонтанно закры-
шие, что потенциал действия возникает в ре- ваются, и к этому времени начинают откры-
зультате сильных кратковременных измене- ваться К+-каналы (рис. 37.2, Б). В результа-
ний проницаемости мембраны аксона для те ионы калия входят в клетку, и мем-
ионов Na+ и К+ (рис. 37.2, Б). Сначала ме- бранный потенциал вновь становится отри-
няется проницаемость мембраны для Na + . цательным. Примерно через две миллисе-
Деполяризация мембраны выше порогово- кунды мембранный потенциал становится
+
го уровня приводит к открытию равным —75 мВ, т. е. равновесному К -по-
Na+-каналов. В силу существования высо- тенциалу. Уровень покоя —60 мВ вос-
кого трансмембранного электрохимическо- станавливается еще через несколько милли-
+
го градиента концентрации Na
+
ионы секунд, когда проводимость К снижается
натрия начинают входить в клетку. Вход до величины, характеризующей нестимули-
Na+ усиливает деполяризацию мембраны рованное состояние. Необходимо подчерк-
и способствует тому, что открывается еще нуть, что во время потенциала действия че-
большее число Na + -каналов. Эта положи- рез плазматическую мембрану проходит
+
тельная обратная связь между деполяриза- очень малое количество ионов Na и
цией и входом Na + приводит к очень бы- К+ - примерно одна миллионная часть от
стрым и очень большим по величине содержания этих ионов в нервной клетке.
изменениям мембранного потенциала: от Другими словами, при одном нервном им-
—60 до +30 мВ за одну миллисекунду. пульсе расходуется лишь ничтожно малая
+ +
Вход прекращается при достижении при- часть (Na -K )-градиента. Из этого яв-
мерно +30 мВ, так как это значение со- ствует, насколько эффективен потенциал
ответствует равновесному Na+-потенциалу.
Другими словами, по достижении этого по- 37. Возбудимые мембраны
тенциала исчезает та термодинамическая и сенсорные системы 327
Рис. 37.3. Избирательность натриевого сильной группы гидроксиламина не обра-
канала в отношении ионов ча- зует водородной связи с кислородным
стично определяется стериче- атомом канала. В результате метиламин не
скими факторами. Ионы Na + и проходит по каналу. Обнаружен еше один
Li+ вместе с присоединенной важный факт: проводимость Na + -канала
к ним молекулой воды, так же в отношении всех проникающих катионов
как гидроксиламин и гидразин, значительно уменьшается при снижении рН.
соответствуют размерам кана- По существу, относительная проницаемость
ла. В отличие от этого К+ соответствует кривой титрования кислоты
с присоединенной молекулой с рK 5,2, что указывает на присутствие отри-
воды оказывается слишком цательно заряженного карбоксилат-иона
большим для канала. в активной форме канала. Таким образом,
(Keynes R. D., Ion-channels in избирательность Nа + -канала в отношении
the nerve-cell membrane, Na+ обусловлена наличием отрицательно
Scientific American, Inc., 1979.) заряженного участка с малым радиусом.
Ион К + , будучи крупнее, чем Na + , практи-
чески не может пройти через эту область
(рис. 37.3).
действия как средство сигнализации на
большие расстояния.
37.2. Тетродотоксин и сакситоксин
Na + -канал проводит Na + в 11 раз лучше,
блокируют натриевые каналы в мембранах
чем К + . Как достигается такая избиратель-
аксонов нервных клеток
ность? Окончательный ответ на этот вопрос
Тетродотоксин - сильнодействующий яд
будет получен только после анализа струк-
рыбы иглобрюха - блокирует проведение
туры канала при высоком разрешении. Од-
нервных импульсов вдоль аксона и в возбу-
нако электрофизиологические исследования
димых мембранах нервных волокон, что вы-
относительной проницаемости канала для
зывает паралич дыхания. Летальная доза
различных щелочных катионов и органиче-
для мыши составляет около 0,01 мкг. В свя-
ских катионов все же дают определенный
ключ к решению данного вопроса. Зависи-
мость проницаемости от размера иона
Таблица 37.1. Относительная проницаемость натриевого
(табл. 37.1) указывает на то, что канал узок:
и калиевого каналов в мембранах аксонов
через него не проходят ионы, диаметр ко-
торых превышает 5 А. Однако проводи-
+
мость определяется не только размерами. Ион Na + - K -
Так, метиламин (H3CNH3+) имеет почти та- канал канал
кие же размеры, как гидразин (H 2 NNH 3 + ) Li+ 0,93 <0,01
и гидроксиламин (HONH3+), но при этом не- Na + 1,00 <0,01
сравненно хуже проходит через канал. При- К
+
0,09 1,00
чина, по всей вероятности, кроется в том, Rb + <0,01 0,91
что метильная группа метиламина в отли- Cs+
+
<0,01 <0,08
чие от аминогруппы гидразина или гидрок- NH4 0,16 0,13
+
HONH3 0,94 <0,03
H 2 NNH 3 + 0,59 <0,03
Часть V.
H 3 CNH 3 + <0,01 <0,02
328 Молекулярная физиология
Рис. 37.4. Блокаторы Na + -канала. н и я меченого тетродотоксина с высокой
удельной радиоактивностью определяли
плотность Nа + -каналов в различных возбу-
зи с высокой специфичностью действия те- димых мембранах. Немиелинизированные
тродотоксин с успехом используется при нервные волокна, которые лишены изоля-
экспериментальных исследованиях. Он ционного слоя миелина, обычно характери-
зуются низкой плотностью Na+-ка-
2
налов - порядка 20 на 1 мкм . В мембранах
таких аксонов Na + -каналы отделены друг
от друга расстоянием 2000 А. Что касается
миелинизированных нервных волокон, то
в специфических участках, называемых пере-
хватами Ранвье, плотность Na+-каналов, на-
против, достигает очень высоких значе-
ний - порядка 104 на 1 мкм2. Перехваты
Ранвье, расположенные на аксоне с интерва-
лом 2 мм,- это единственные участки, в ко-
торых мембрана аксона миелинизированно-
Иглобрюх, считающийся в Япо- го нерва соприкасается с внеклеточной
нии деликатесом. жидкостью. Участки мембраны между пере-
хватами Ранвье содержат очень мало кана-
лов и не участвуют в проведении. Потен-
очень прочно (К 10-9 М) связывается с циал действия перескакивает от перехвата
Na + -каналом и блокирует поток ионов на- к перехвату, вследствие чего импульс прово-
трия, не влияя при этом на К + -канал. Та- дится быстрее и эффективнее, чем в немие-
ким же действием обладает и сакситоксин, линизированном волокне. Наличие 104 ка-
2
вырабатываемый одним из морских дино- налов на 1 мкм в перехвате Ранвье озна-
флагеллят. Моллюски, питающиеся дино- чает, что значительная часть поверхности
флагеллятами, в особенности съедобные мембраны в этой области занята
+
двустворчатые моллюски и мидии, тоже Nа -каналами.
становятся ядовитыми. Так, одна мелкая Специфичность связывания тетродоток-
мидия может содержать сакситоксин в дозе, сина с Na + -каналами была использована
достаточной чтобы убить 50 человек! Об- также при их выделении и очистке. Для это-
щая структурная особенность тетродотокс- го интегральные мембранные белки возбу-
ина и сакситоксина - наличие гуанидиновой димых мембран солюбилизировали с по-
группы (рис. 37.4). Эта положительно заря- мощью детергента, после чего разделяли на
женная группа токсина взаимодействует ионообмсннике. Связывание тетродоток-
+
с отрицательно заряженным карбоксилат- сина с солюбилизированным Na -каналом
ионом в устье канала на внеклеточной сто- позволило количественно определять канал
роне мембраны. В сущности, эти токсины в процессе очистки. Выделенный таким пу-
являются конкурентными ингибиторами тем Na + -канал оказался белком массой
Na + . 230 кДа, состоящим из субъединиц раз-
Тетродотоксин и сакситоксины в силу личных типов. Сложность устройства
своей специфичности и высокого сродства к
+
Na -каналу оказались ценнейшими сред- 37. Возбудимые мембраны
ствами анализа. Так, измерением связыва- и сенсорные системы 329
зываемых синапсами (рис. 37.6). Нервные
импульсы передаются через большинство
синапсов с помощью химических нейроме-
диаторов - небольших легко диффундирую-
щих веществ, например ацетилхолина или
норадреналина. Ацетилхолин служит также
медиатором в двигательных концевых пла-
стинках (нервно-мышечных соединениях),
являющихся участками контактов между
нервом и поперечнополосатой мышцей.
Пресинаптическая мембрана холинергиче-
ского синапса (т. е. синапса, в котором в каче-
стве нейромедиатора используется ацетил-
холин) отделена от постсинаптической мем-
браны так называемой синаптической
щелью шириной около 500 А. Окончание
пресинаптического аксона наполнено синап-
тическими пузырьками (везикулами), содер-
жащими ацетилхолин. Пришедший к синап-
су нервный импульс вызывает высвобожде-
Рис. 37.5. Электронная микрофотогра- ние ацетилхолина в синаптическую шель.
фия миелинизированного аксо- Далее молекулы ацетилхолина диффунди-
на из спинного мозга. Миели- руют через щель и достигают постси-
новая оболочка аксона («оберт- наптической мембраны, где связываются со
ка», образованная многочис- специфическими рецепторными молекула-
ленными слоями мембран) вы- ми. Это приводит к деполяризации постси-
полняет роль изолятора. Ско- наптической мембраны, и далее волна депо-
рость проведения в миелинизи- ляризации распространяется вдоль электри-
рованных нервах намного вы- чески возбудимой мембраны второй нерв-
ше, чем в лишенных миелино- ной клетки. Ацетилхолин гидролизуется
вой оболочки нервах того же ацетилхолинэстеразой, и постсинаптическая
диаметра. (Печатается с любез- мембрана поляризуется вновь.
ного разрешения д-ра Cedric Ацетилхолин синтезируется вблизи пре-
Raine.) синаптического окончания аксона путем
переноса ацетильной группы от ацетил-СоА
Na + -канала частично обусловлена, видимо,
тем, что он является не только высокоизби-
рательной порой в мембране, но и содержит
структуру, воспринимающую напряжение
(сенсор напряжения). Заряженные группы
этой структуры реагируют на изменение
мембранного потенциала во время потен-
циала действия и передают информацию на
ту часть канала, которая составляет пору
в мембране. Действительно, до начала пото-
ка натрия через мембрану выявляется поток
через канал (так называемый воротный ток),
обусловленный движением заряженных
групп в белке.

37.3. Ацетилхолин является нейро-


медиатором
Взаимодействие между нервными клетками
осуществляется в местах их соединения, на-

Часть V. Рис. 37.6. Схематическое изображение


330 Молекулярная физиология холинергического синапса.
на холин. Фермент, катализирующий эту ре- трохимического градиента концентрации
акцию,- холин-ацетилтрансфераза (холин- Na+ по сравнению с К + .
ацетилаза). Далее часть образовавшегося Две молекулы ацетилхолина связываются
ацетилхолина попадает в синаптические с молекулой рецептора, вызывая при этом
пузырьки, а часть остается в цитозоле. такие изменения конформации, которые от-
В одном холинергическом синаптическом крывают канал. Схематически кинетику
пузырьке (обычно 400 А диаметром) содер- процесса, согласующуюся с эксперимен-
жится около 10000 молекул ацетилхолина. тальными данными, можно описать уравне-
нием

где А - молекула ацетилхолина, R - закры-


тый канал, R* - открытый канал. За полупе-
риод жизни открытого канала, равный всего
лишь 1 мс, по нему проходит примерно 104
ионов. Продолжительное воздействие аце-
тилхолина на рецептор приводит к его де-
сенсибилизации: канал закрывается и реак-
ция на ацетилхолин исчезает на длительный
промежуток времени.

37.5. Ацетилхолин высвобождается


квантами
Изучению синаптической функции значи- Проведенное Бернардом Катцем (Bernard
тельно способствовало выделение синапто- Katz) изучение передачи нервного импульса
сом из гомогената нервной ткани. Синапто-
сомы представляют собой пресинаптиче-
ские окончания, образующие в процессе
выделения замкнутые структуры. Они пред-
ставляют собой мешочки из пресинаптиче-
ской мембраны, содержащей митохондрии,
цитозоль и синаптические пузырьки.
37.4. Ацетилхолин открывает
в постсинаптической мембране каналы
для катионов
Потенциал покоя постсинаптической мем-
браны или мембраны двигательной конце-
вой пластинки составляет примерно —
—75 мВ. При взаимодействии ацетилхо-
лина со специфическими рецепторами про-
исходит резкое изменение проницаемости
этих мембран (рис. 37.7). В течение 0,1 мс
значительно возрастает проводимость как
Na+, так и К+, и возникает сильный ток
+ +
Na внутрь клетки и более слабый ток К
+
из клетки. Ток Na в клетку приводит к де-
поляризации постсинаптической мембраны
и инициирует возникновение потенциала
действия в соседнем (постсинаптическом)
нейроне или мышечном волокне. Ацетилхо- Рис. 37.7. Ацетилхолин деполяризует
лин раскрывает катионные каналы только постсинаптическую мембрану
+ +
одного типа, характеризующиеся почти оди- путем увеличения Na и К
наковой проницаемостью для Na+ и К+. Ес- проводимости.
ли поток Na + при действии ацетилхолина
оказывается большим, чем поток К + , то это 37. Возбудимые мембраны
обусловлено лишь большей крутизной элек- и сенсорные системы 331
что способствует слиянию на короткий срок
мембраны синаптических пузырьков с пре-
синаптической мембраной.

37.6. При добавлении ацетилхолина


реконструированные мембранные пузырьки
становятся проницаемыми для катионов
В последние годы сделаны большие успехи
в очистке ацетилхолиновых рецепторов
и реконструировании функционально ак-
тивных мембранных пузырьков. Наиболее
подходящий исходный материал для таких
исследований - электрический орган элек-
трической рыбы, например Torpedo (элек-
трический скат), который очень богат холи-
нергическими постсинаптическими мембра-
Рис. 37.8. Генерирование напряжения
нами. Электрический орган образован из
в электрической пластинке
колонок клеток, называемых электрически-
электрического угря.
ми пластинками. Одна сторона клеток (ин-
нервируемая поверхность) снабжена нерв-
ными окончаниями и электрически возбуди-
в участках нервно-мышечного соединения ма. Другая сторона (неиннервируемая по-
показало, что ацетилхолин высвобождается верхность) образует многочисленные склад-
из пресинаптической мембраны порциями
по 104 молекул. Доказательство квантового
высвобождения ацетилхолина было получе-
но при анализе мембранного потенциала
двигательных концевых пластинок, ко-
торым свойственна спонтанная электриче-
ская активность даже в отсутствие стимуля-
ции нерва. Деполяризующие импульсы
с амплитудой 0,5 мВ и длительность около
20 мс возникают залпами. Это так назы-
ваемые миниатюрные потенциалы концевых
пластинок; они возникают случайно с ве-
роятностью, сохраняющейся постоянной на
протяжении длительного времени. Миниа-
тюрный потенциал концевой пластинки вы-
зывается спонтанным высвобождением оди-
ночного синаптического пузырька. Полная
деполяризация концевой пластинки, созда-
ваемая потенциалом действия, обусловлена
синхронным высвобождением примерно 100 Electrophorus electricus, амери-
«квантов» («пакетов») ацетилхолина за бо- канский электрический угорь.
лее короткое время чем 1 мс. Число
высвобождающихся квантов ацетилхолина
зависит от потенциала действия пресинап- ки и электрически невозбудима. Разность
тической мембраны. Другими словами, выс- потенциалов, возникающая при стимуляции
вобождение ацетилхолина представляет со- электрических пластинок, обусловлена
бой электрически регулируемую форму се- асимметрией ответа двух поверхностей.
креции. Высвобождение ацетилхолина зави- У такой электрической рыбы, как Electropho-
сит от присутствия Са2+ во внеклеточной rus, мембранный потенциал иннервируемой
жидкости. При деполяризации пресинапти- поверхности при возбуждении сдвигается с
ческой мембраны происходит вход Са2+, —90 до +60 мВ, тогда как на неиннерви-
руемой поверхности сохраняется —90 мВ.
Часть V. Следовательно, в пик потенциала действия
332 Молекулярная физиология разность потенциалов между наружными
стинках или на иннервируемой поверхности
электрических пластинок электрического
органа. Нейротоксины представляют собой
небольшие основные белки (7 кДа). Их мож-
но пометить радиоактивным изотопом
с высокой удельной радиоактивностью. Для
этого их либо иодируют иодом-125, либо
превращают в шиффово основание с пири-
доксальфосфатом с последующим восста-
новлением образованного продукта
3
М-боргидридом. Меченый кобратоксин
прочно связывается с ацетилхолиновым ре-
цептором (константа диссоциации - порядка
10-9 М) и, что особенно важно, практически
не связывается с другими макромолекулами
постсинаптической мембраны. Таким обра-
зом, рецептор ацетилхолина можно специ-
фически пометить радиоактивным атомом.
Путем обработки фрагментов мембраны
неионным детергентом (таким, как про-
Рис. 37.9. Трехмерная структура нейро-
изводное полиоксиэтилена твин-80) удалось
токсина, блокирующего рецеп- солюбилизировать рецепторы ацетилхо-
тор ацетилхолина. Этот нейро- лина электрического органа. Полученный
токсин вырабатывается у мор-
раствор фракционировали методами гель-
ских змей. (Печатается с любез- фильтрации и ионообменной хроматогра-
ного разрешения д-ра фии. Последним этапом очистки была аф-
Demetrius Tsernoglou и д-ра финная хроматография на колонке, содер-
Gregory Petsko.) жащей ковалентно связанный кобратоксин.
В итоге был получен рецептор, очищенный
в 10000 раз. Ацетилхолиновый рецептор
поверхностями двух сторон составляет представляет собой комплекс массой
150 мВ (рис. 37.8). Электрические пластинки 270 кДа, состоящий из четырех типов субъе-
электрического органа соединены парал- диниц. Субъединица 40 кДа метится по
лельно, и, следовательно, их разность потен- сродству радиоактивными соединениями,
циалов складывается. Орган, состоящий из содержащими группу триметиламмония,
5000 рядов электрических пластинок, может, что указывает на наличие в ней участка
таким образом, генерировать разряд связывания ацетилхолина. Удалось полу-
в 750 В. Интересно отметить, что электриче- чить мембранные пузырьки, содержащие
ские пластинки электрического угря эволю- очищенные рецепторы ацетилхолина; для
ционно возникли из мышечных клеток. При этого к раствору рецепторов добавляли
этом они сохранили электрически возбуди- фосфолипиды и затем удаляли диализом де-
мую наружную мембрану мышцы, но утра- тергент. Показано, что радиоактивные ионы
тили аппарат сокращения. Электрический 22 +
натрия ( Na ), включенные в процессе ре-
орган Electrophorus - великолепный источ- конструирования пузырьков в их внутреннее
ник Na + -каналов. водное пространство, высвобождаются при
Еще один экзотический биологический добавлении ацетилхолина или его аналогов,
материал оказался бесценным источником например карбамоилхолина (рис. 37.10).
ацетилхолиновых рецепторов. Для того, Высвобождение ионов натрия блокируют
чтобы идентифицировать рецептор в смеси бунгаротоксин и обычные антагонисты аце-
макромолекул, его необходимо специфиче- тилхолина; следовательно, оно опосредова-
ски пометить. Для этого используют нейро- но специфическим взаимодействием ацетил-
токсины змей, в частности α-бунгароток- холина со связанным с мембраной рецепто-
син из яда одной змеи с о. Тайвань ром.
и кобратоксин (из яда кобры). Указанные
нейротоксины блокируют нейромышечное
проведение, связываясь с рецепторами аце- 37. Возбудимые мембраны
тилхолина на двигательных концевых пла- и сенсорные системы 333
37.7. Ацетилхолин быстро гидролизуется, вать тысячу импульсов в секунду только по-
и концевая пластинка реполяризуется тому, что постсинаптическая мембрана
Для восстановления возбудимости пост- восстанавливает свою поляризованность за
синаптической мембраны необходимо вы- доли миллисекунды.
ключение деполяризующего сигнала. Эту По механизму действия ацетилхолинэсте-
функцию выполняет ацетилхолинэстераза, раза сходна с химотрипсином. Ацетилхолин
открытая Дэвидом Нахманзоном (David взаимодействует со специфическим остат-
Nachmansohn) в 1938 г. Фермент гидроли- ком серина в активном центре ацетилхолин-
зует ацетилхолин до ацетата и холина. В ре- эстеразы с образованием в качестве проме-
зультате проницаемость постсинаптической жуточного продукта ковалентно связанного
мембраны возвращается к исходному уров- ацетил—фермента, а холин высвобождает-
ню и мембрана реполяризуется. Ацетилхо- ся. Ацетил—фермент далее вступает во
линэстераза локализована в синаптической взаимодействие с молекулой воды, что при-
щели, где она связана с сетью из коллагена водит к образованию ацетата и регенериро-
и гликозамингликанов, поступающих из ванного свободного фермента (рис. 37.12).
постсинаптической клетки. Масса фермента
260 кДа, субъединичная структура - α2β2. 37.8. Ингибиторы ацетилхолинэстеразы
Ацетилхолинэстеразу можно легко отде- используются как лекарственные средства
лить от ацетилхолиновых рецепторов. Фер- и как яды
мент характеризуется поразительно высо- Терапевтические и токсические свойства ин-
ким числом оборотов, а именно 25000 с-1. гибиторов ацетилхолинэстеразы нашли ши-
Это означает, что одна молекула ацетилхо- рокое практическое применение. Алкалоид
лина расщепляется за 40 мкс. Такое высокое из калабарских бобов физостигмин (назы-
число оборотов фермента имеет очень важ- ваемый также эзерин) когда-то использовал-
ное значение для быстрого восстановления ся при испытании ядом в судилище над кол-
поляризованного состояния постсинаптиче- дунами и ведьмами. Физостигмин и род-
ской мембраны. Синапсы способны переда- ственные ему ингибиторы, например не-
остигмин, являются карбамоильными эфира-
ми (рис. 37.13). Они ингибируют ацетилхо-

линэстеразу путем образования ковалентно-


Рис. 37.10. Ацетилхолин вызывает высво- го промежуточного соединения, которое
бождение Na + из реконструи- очень медленно гидролизуется. Неостигмин
рованных мембранных связывается с ацетилхолинэстеразой таким
пузырьков, содержащих аце- образом, что его положительно заряженная
тилхолиновый рецептор. По триметиламмониевая группа встает
оси ординат отложено содер- в анионном участке фермента, а карба-
жание 2 2 Na + в синаптических моильная группа оказывается рядом с реак-
пузырьках. ционноспособным остатком серина в участ-
ке этерификации. Далее происходит карба-
Часть V. моилирование фермента и высвобождается
334 Молекулярная физиология образующийся спирт. Последующий гидро-
Рис. 37.11. Электронная микрофотогра- Путем использования радиоактивного
фия ацетилхолиновых рецепто- ДИФФ в качестве метки было определено
ров в постсинаптической мем- число молекул ацетилхолинэстеразы в кон-
бране.(Печатается с любезного цевой пластинке нерва в диафрагмальной
разрешения д-ра John Heuser мышце мыши. Плотность фермента соста-
и д-ра Steven Salpeter.) вила 12000 м к м - 2 , что почти равно числу
рецепторов ацетилхолина, определенному
с помощью радиоактивных нейротоксинов.
Таким образом, постсинаптическая мем-
лиз карбамоильного производного фермента
в отличие от гидролиза ацетил—фермента брана очень богата и ацетилхолинэстеразой,
происходит с очень низкой скоростью. В ито- и ацетилхолиновыми рецепторами. При
ге активный центр ацетилхолинэстеразы передаче нервных импульсов, поступающих
с малой частотой, используется только не-
оказывается прочно заблокированным. Не-
остигмин используется для лечения глау- большая доля общего числа молекул фер-
комы - болезни глаз, характеризующейся мента. Однако проведение при высокой ча-
повышенным внутриглазным давлением. стоте импульсации требует участие множе-
ства молекул ацетилхолинэстеразы.
Механизм терапевтического эффекта сос-
тоит в том, что неостигмин ингибирует аце-
тилхолинэстеразу и тем самым усиливает
действие ацетилхолина.
Еще более мощные ингибиторы ацетил-
холинэстеразы - органические фторфос-
фаты, в частности диизопропилфторфосфат
(ДИФФ). Эти соединения реагируют с аце-
тилхолинэстеразой, образуя высокоста-
бильные ковалентные фосфорил-фермент-
ные комплексы (рис. 37.14). Как и при
взаимодействии с сериновыми протеиназа-
ми, фосфорильная группа ДИФФ связы-
вается с серином в активном центре фер-
мента.
Множество различных органических
фторфосфатов было синтезировано для ис-
пользования в качестве инсектицидов в сель-
ском хозяйстве, а также в качестве отра-
вляющих веществ - нервно-паралитических
ядов в химической войне (рис. 37.15). Эти со- Рис. 37.12. Механизм каталитического
единения могут вызвать смерть путем оста- действия ацетилхолинэсте-
новки дыхания. Наиболее токсичны из разы.
них - табун и зарин. Паратион - инсектицид,
нашедший широкое применение в сельском 37. Возбудимые мембраны
хозяйстве. и сенсорные системы 335
Рис. 37.13. Физостигмин и неостигмин ин- 37.9. Разработка антидота для лечения
гибируют ацетилхолинэстера- отравлений органическими фосфатами
зу путем карбамоилирования Ацетилхолинэстеразу, ингибированную ор-
серина в активном центре фер- ганическими фторфосфатами типа ДИФФ,
мента. можно реактивировать производными ги-
дроксиламина (NH2OH). При разработке
антидота исходили из обнаруженного Ирви-
ном Уилсоном (Irvin Wilson) факта, что ги-
дроксиламин высвобождает фосфорильную
группу, присоединенную к сериновому
остатку ингибированного фермента, и тем
самым реактивирует его (рис. 37.16). Задача
состояла в том, чтобы приспособить эту ре-
акцию для клинического использования.
Однако гидроксиламин нельзя использо-
вать in vivo, поскольку в тех высоких кон-
центрациях, которые необходимы для реак-
тивации ацетилхолинэстеразы, ингибиро-
ванной ДИФФ, он токсичен. Выбранный
Уилсоном подход состоял в том, чтобы най-
ти соединение, обладающее реакционной
способностью гидроксиламина, но со специ-
Рис. 37.14. Ингибированная диизопро- фичностью и очень высоким сродством
пилфторфосфатом ацетилхо- к ацетилхолинэстеразе. Относительно фер-
линэстераза. мента было известно, что на нем есть
анионный участок для связывания положи-
тельно заряженного остатка холина в аце-
тилхолине, и потому представлялось целе-
сообразным синтезировать производное ги-
дроксиламина, содержащее четвертичную
аммониевую группу. Возникал, однако, во-
прос, где должен стоять заместитель: при
атоме кислорода или азота гидроксила-
мина? Было обнаружено, что О-метилги-

дроксиламин лишен способности реактиви-


ровать фермент, тогда как N-метилгидрок-
Рис. 37.15. Структурные формулы не- силамин обладал такой активностью. Ги-
скольких органических фосфа- дроксильная группа реактиватора не может
тов - ингибиторов ацетилхоли- быть замещена, поскольку именно анионная
нэстеразы. форма соединения атакует атом фосфора
в ингибированном ферменте.
Часть V. Следующий и основной этап состоял
336 Молекулярная физиология в том, чтобы поместить четвертичную ам-
мониевую группу на необходимом растоя- ственно воздействующие на ацетилхоли-
нии от нуклеофильного атома кислорода. новый рецептор. К ним относится кураре,
Более того, требовалось, чтобы по своей который на протяжении столетий использо-
ориентации эти группы были комплемен- вали южноамериканские индейцы. Вскоре
тарны анионному участку и атому фосфора после возвращения Колумба из Америки
в ингибированном ферменте. д'Ангера в своем сочинении «De Orbo novo»
отмечал, что «местные жители отравляли
стрелы соком смертельно-ядовитой травы».
Одним из активных компонентов кураре
является d-тубокурарин (рис. 37.17). Тубоку-
рарин ингибирует деполяризацию концевых
пластинок, конкурируя с ацетилхолином за
связывание с рецептором. Аналогичным пу-
тем действуют α-бунгаротоксин и кобраток-
В качестве реактиваторов были испробо- син. В отличие от этого вещества типа дека-
ваны многочисленные соединения, содержа-
щие четвертичную аммониевую группу и ги-
дроксиламинную функцию. Наиболее эф-

метония соединяются с рецептором ацетил-


холина, вызывая устойчивую деполяризацию
концевой пластинки.
В хирургии в качестве препарата, вызы-
вающего расслабление мышц, используется
аналог ацетилхолина - сукцинилхолин.

фективным среди них оказался 2-пири-


динальдоксимметиодид (ПАМ). Это соедине-
ние обладает устойчивой геометрией благо-
даря двойной связи в оксиме, которая спо-
собствует удержанию атома кислорода
в плоскости кольца.
ПАМ реактивирует ингибированную
ДИФФ ацетилхолинэстеразу в принципе по
тому же механизму, что и гидроксиламин.
-6
Однако по эффективности 10 М ПАМ со-
ответствует 1 М гидроксиламина. Такое по-
вышение эффективности в 1000000 раз по-
зволяет использовать ПАМ для лечения
отравлений органическими фосфатами.
Удивительная эффективность ПАМ обусло-
влена оптимальным расположением четвер-
тичной аммониевой группы по отношению
к нуклеофильному атому кислорода. Разра-
ботка этого препарата явилась вехой в раз-
витии рационального подхода к синтезу ле-
карственных препаратов. Рис. 37.16. Реактивация гидроксилами-
ном ацетилхолинэстеразы, ин-
гибированной диизопропил-
37.10. Ингибиторы ацетилхолинового фторфосфатом.
рецептора
Блокаторами нервно-мышечного проведе- 37. Возбудимые мембраны
ния служат также соединения, непосред- и сенсорные системы 337
Рис. 37.17. Формула и модель d-тубоку- и быстрая утомляемость. Объясняется это
рарина. тем, что в результате иммунизации у них
вырабатываются антитела, реагирующие
с ацетилхолиновыми рецепторами их соб-
Сукцинилхолин крайне медленно гидро- ственных нервно-мышечных соединений.
лизуется ацетилхолинэстеразой в пост- В итоге число функционально активных аце-
синаптической мембране. Вследствие этого тилхолиновых рецепторов уменьшается, что
он вызывает устойчивую деполяризацию приводит к ухудшению нейромышечной
концевой пластинки. В то же время сукци- передачи. Развивающееся у этих кроликов
нилхолин гидролизуется под действием ме- состояние очень напоминает тяжелую бо-
нее специфических холинэстераз в плазме лезнь человека - миастению (myasthenia
и в печени; эти ферменты назвали плаз- gravis), и, действительно, в сыворотке
менными ацетилхолинэстеразами или больных миастенией содержатся антитела,
псевдохолинэстеразами для того, чтобы от- направленные против собственных рецепто-
личить их от ацетилхолинэстеразы пост- ров ацетилхолина. Другими словами,
синаптической мембраны. Сукцинилхолин myasthenia gravis является аутоиммунным
удобен тем, что при его использовании не- заболеванием, т. е. таким заболеванием, при
рвно-мышечное проведение восстанавли- котором организм оказывается мишенью
вается вскоре после того, как перестают вво- действия собственной иммунной системы.
дить этот препарат. Однако в отдельных
случаях мышечное расслабление и паралич 37.11. К числу нейромедиаторов относятся
дыхательных мышц сохраняются на протя- также катехоламины и γ-аминомасляная
жении многих часов. Дело в том, что в таких кислота (ГАМК)
случаях гидролиз сукцинилхолина у боль- Помимо ацетилхолина, известны и другие
ных идет крайне медленно из-за сильно нейромедиаторы. Вещество считается ней-
сниженного сродства плазменной холин- ромедиатором, если оно удовлетворяет сле-
эстеразы к сукцинилхолину. Повышенная дующим критериям. Во-первых, ми-
чувствительность к сукцинилхолину [так же кроинъекции предполагаемого нейромедиа-
как и памахину (разд. 15.11)] - пример гене- тора в синаптическую щель должны вызы-
тически детермированной лекарственной вать такой же ответ, как возбуждение
идиосинкразии. пресинаптического нерва. Во-вторых, это ве-
Если кроликов иммунизировать очи- щество должно в больших количествах при-
щенными ацетилхолиновыми рецепторами, сутствовать в пресинаптических нервных
то спустя несколько недель после иммуниза- окончаниях. В этом отношении наиболее ве-
ции у них наблюдается мышечная слабость сомым критерием служит выделение синап-
тических пузырьков, содержащих это веще-
Часть V. ство. В-третьих, постулированный медиатор
338 Молекулярная физиология должен высвобождаться из пресинаптиче-
ского нерва в нужное время и в количестве,
достаточном для воздействия на постсинап-
тический нерв.
Этим критериям удовлетворяет ряд кате-
холаминов. Так, норадреналин является ме-
диатором в гладкомышечных соединениях,
которые иннервируются симпатическими
нервами (в отличие от парасимпатических
соединений, в которых нейромедиатором
служит ацетилхолин). Катехоламины адре-
налин и дофамин - два других катехолами-
новых нейромедиатора. Указанные катехол-
амины синтезируются из тирозина в оконча-
ниях симпатических нервов и в надпочечни-
ках (рис. 37.18). Первый этап синтеза (реак-
ция, лимитирующая скорость всего процес-
са) - гидроксилирование тирозина с образо-
ванием 3,4-дигидроксифенилаланина (ДО-
ФА). Данная реакция катализируется тиро-
зин-гидроксилазой - ферментом, аналогич-
ным фенилаланин-гидроксилазе. Активато-
ром молекулярного кислорода при этом
служит тетрагидробиоптерин - кофактор
фермента. Второй этап синтеза - декар-
боксилирование ДОФА, катализируемое
ДОФА-декарбоксилазой (ферментом, со-
держащим пиридоксальфосфат) с образова-
нием 3,4-дигидроксифенилэтиламина (до-
фамина). Далее дофамин гидроксилируется
в норадреналин в присутствии медьсодержа-
щей гидроксилазы. Наконец, из норадрена-
лина в результате метилирования образует-
ся адреналин; фермент, осуществляющий
эту реакцию,- трансметилаза, использую-
щая в качестве донора метильных групп
S-аденозилметионин.
Инактивация катехоламиновых нейроме-
диаторов осуществляется путем метилиро-
вания 3-ОН-группы катехолового кольца.
Реакцию катализирует катехол-О-метил-
трансфераза, использующая S-аденозилме- Рис. 37.18. Путь биосинтеза катехолами-
тионин в качестве донора метильной новых нейромедиаторов.
группы. Другой путь инактивации этих ней-
ромедиаторов - удаление аминогруппы
в ходе окисления моноаминоксидазой лизируемой глутамат-декарбоксилазой
(рис. 37.19). (рис. 37.20). Нетрудно предугадать, что про-
Среди производных аминокислот выя- стетической группой этой декарбоксилазы
влен еще один нейромедиатор. Это γ-амино- служит пиридоксальфосфат. γ-Аминобути-
бутират, называемый также γ-аминомасля- рат инактивируется путем трансаминирова-
ной кислотой (ГАМК). ГАМК увеличивает ния с образованием полуальдегида янтар-
проницаемость постсинаптических мембран ной кислоты, который далее окисляется
для К+ и тем самым отдаляет мембранный в сукцинат.
потенциал от порогового уровня, при кото-
ром возникает потенциал действия; таким
образом, ГАМК - это тормозный нейроме-
диатор. ГАМК образуется при декарбок- 37. Возбудимые мембраны
силировании глутамата в реакции, ката- и сенсорные системы 339
Рис. 37.19. Инактивация норадреналина. в свою очередь взаимодействуют с другими
нервными клетками в сетчатке. Электриче-
ские сигналы, генерированные фоторецеп-
37.12. Для возбуждения палочки сетчатки торными клетками, преобразуются, прохо-
глаза достаточно одного фотона дя по сложной сети нервных клеток
Рассмотрим теперь возбудимые рецепторы, в сетчатке, и затем передаются в мозг по во-
активируемые светом. У человека имеются локнам зрительного нерва. Таким образом,
два типа фоторецепторных клеток, назы- сетчатка выполняет две функции, а именно
ваемых палочками и колбочками в соответ- трансформирует свет в нервные импульсы
ствии с их формой. Колбочки функциони- и интегрирует зрительную информацию.
руют на ярком свету и ответственны за В 1938 г. Зелиг Хехт (Selig Hecht) открыл,
цветовое зрение, тогда как палочки воспри- что для возбуждения палочки (клетки) сет-
нимают слабый свет, но не различают цвета. чатки человека достаточно одного фотона.
В сетчатке глаза человека содержится 3 млн. Рассмотрим молекулярную основу исклю-
колбочек и 1 млрд. палочек. Эти фоторецеп- чительно высокой чувствительности этих
торные клетки преобразуют энергию света клеток. Палочки представляют собой тон-
в движение атомов, а далее и в нервный им- кие удлиненные структуры диаметром обы-
пульс. Палочки и колбочки образуют чно 1 мкм и длиной 40 мкм. Основные
синапсы с биполярными клетками, которые функции этой клетки четко разделены про-
странственно (рис. 37.22). Наружный сег-
мент палочки специализирован для фоторе-
цепции. В нем содержится примерно 1000
дисков, сложенных стопкой (рис. 37.23). Ди-
ски представляют собой закрытые упло-
щенные мешочки толщиной около 160 А.
Эти мембранные структуры насыщены фо-
торецепторными молекулами. Мембраны
дисков и плазматическая мембрана наруж-
ного сегмента не соприкасаются. Тонкая ре-
сничка соединяет наружный сегмент с вну-
тренним сегментом, богатым митохон-
дриями и рибосомами. Во внутреннем
сегменте с очень высокой скоростью выра-
батывается АТР и идет активный синтез
белков. Диски наружного сегмента имеют
срок жизни всего лишь 10 дней и постоянно
обновляются. Внутренний сегмент соприка-
сается с ядром, расположенным рядом
с синаптическим тельцем. Синаптическое
тельце, в котором содержится много синап-
тических пузырьков, образует синапс с би-
полярными клетками.

37.13. Родопсин - фоторецепторный белок


Рис. 37.20. Синтез и инактивация γ-амино- палочек
бутирата. Для стимуляции фоторецепторных клеток
необходимо поглощение света. Поглощение
Часть V. фотона света должно вызвать структурные
340 Молекулярная физиология изменения светопоглошающей группировки
Рис. 37.21. Микрофотография клеток па- N-конец расположен в водной фазе внутри
лочек сетчатки, полученная диска, а С-конец - на другой стороне мем-
в сканирующем электронном браны диска, в цитозоле. N-концевая
микроскопе. (Печатается с лю- область родопсина содержит две олигосаха-
безного разрешения д-ра Deric ридные единицы, ковалентно присоеди-
Bownds.) ненные к аспарагиновой боковой цепи.

(хромофора). Фоточувствительным веще-


ством палочек является родопсин, состоя-
щий из белка опсина и простетической
группы, представленной 11-цис-ретиналем
(рис. 37.24). Родопсин представляет собой
трансмембранный белок массой 38 кДа. Его

Рис. 37.23. Наружный сегмент палочки


сетчатки под электронным ми-
кроскопом. Видны уложенные
стопкой диски. (Allen J. M., ed.,
Molecular organization and
biological function, Harper and
Row, 1967.)

Рис. 37.22. Схематическое изображение 37. Возбудимые мембраны


палочки сетчатки. и сенсорные системы 341
скам. Дело в том, что родопсин, как и другие
мембранные белки эукариот, синтезируется
на рибосомах, прикрепленных к эндоплаз-
матическому ретикулуму. Новосинтезиро-
ванный родопсин попадает в аппарат
Гольджи и лишь после этого достигает
плазматической мембраны. Новые диски
образуются в основании внутреннего сег-
мента путем инвагинации плазматической
мембраны, и именно поэтому углеводные
единицы родопсина оказываются локализо-
ванными внутри диска, хотя первоначально,
входя в состав плазматической мембраны,
они обращены во внеклеточное простран-
ство (рис. 37.25).
Опсин, подобно другим белкам, ли-
шенным простетических групп, не погло-
щает видимого света. Цвет родопсина и его
чувствительность к свету определяются
присутствием 11-цис-ретиналя, являющего-
ся высокоэффективным хромофором. Бла-
годаря 11-цис-ретиналю родопсин обладает
широкой полосой поглощения в видимой
области спектра с максимумом при 500 нм,
Рис. 37.24. Структура 11-цис-ретиналя, по-
что прекрасно соответствует солнечному из-
лностью-транс-ретиналя и по-
лучению. Примечательна также интенсив-
лностью-транс-ретинола (ви-
ность поглощения видимого света родопси-
тамина А).
ном. Коэффициент экстинкции родопсина
при 500 нм очень высок, а именно
Этим сахарам, по-видимому, принадлежит 4•104 см-1•М-1 (рис. 37.26). Суммарная
важная роль в направленном передвижении сила поглощения видимого света родопси-
родопсина из внутреннего сегмента к ди- ном приближается к максимальным значе-
ниям для органических соединений. Высо-
кие хромофорные качества 11-цис-ретиналя
обусловлены тем, что он является полиеном.
Чередование в нем шести одинарных
и двойных (ненасыщенных) связей создает
длинную ненасыщенную систему для пере-
носа электрона.
11-цис-ретиналь присоединен к родопсину
через шиффово основание, которое образует-
ся при связывании альдегидной группы

Рис. 37.25. Образование дисков путем ин-


вагинации плазматической
мембраны. Стрелками показа-
на полярность молекул ро-
допсина.

Часть V. Рис. 37.26. Спектр поглощения родоп-


342 Молекулярная физиология сина.
Рис. 37.27. Первичный акт при возбужде- ретиналь-изомеразы двойная связь между
нии светом - это изомеризация С-11 и С-12 изомеризуется из транс-формы
11-цис-изомера шиффова осно- в цис-форму. Недостаточность витамина
вания, образуемого ретиналем. А приводит к ночной («куриной») слепоте
в полностью-транс-форму. и в конечном итоге к повреждению на-
Двойная связь между С-11 ружных сегментов палочек.
и С-12 показана зеленым цве-
том. 37.14. Свет вызывает изомеризацию
11-цис-ретиналя
11-цис-ретиналя с ε-аминогруппой специфи- Первичный акт в процессе зрительного воз-
ческого остатка лизина в опсине. Спек- буждения известен. Как показал Джордж
тральные свойства родопсина свидетель- Уолд (George Wald), свет вызывает изомери-
ствуют о том, что шиффово основание нахо- зацию 11-цис-ретиналъной группы родопсина
дится в протонированной форме. в полностью-транс-ретиналь. В результате

изомеризации сильно меняется геометрия


Предшественником 11-цис-ретиналя слу- ретиналя (рис. 37.27). Образованное ретина-
жит полностью-транс-ретинол (витамин А), лем шиффово основание передвигается по
который в организме млекопитающих не отношению к области кольца хромафора
может синтезироваться de novo. Пол- примерно на 5 А. В сущности, поглощенный
ностью-транс-ретинол (рис. 37.24) превра- фотон преобразуется в движение атомов.
щается в 11-цис-ретиналь в два этапа. Сна- Значительная изомеризация ретиналя
чала происходит окисление спиртовой происходит практически в первые несколько
группы в альдегидную в присутствии рети-
нол-дегидрогеназы и NADP + в качестве ак- 37. Возбудимые мембраны
цептора электронов. Затем под действием и сенсорные системы 343
реакций фотолиза родопсина гидролиз
шиффова основания протекает настолько
медленно, что не играет никакой роли в ге-
нерировании нервного импульса.

37.15. Свет вызывает гиперполяризацию


плазматической мембраны наружного
сегмента палочек
Изомеризация ретиналя из цис- в транс-
форму и последующие конформационные
изменения родопсина - это первичные акты
процесса зрительного возбуждения. Сле-
дующий важный этап, необходимый для ге-
нерирования нервного импульса, был вы-
явлен при электрофизиологических исследо-
ваниях интактной сетчатки. Квант света
вызывает кратковременную гиперполяриза-
цию плазматической мембраны наружных
сегментов (рис. 37.29). Кинетика процесса
Рис. 37.28. Промежуточные этапы фото- гиперполяризации зависит от интенсивно-
лиза родопсина. Приведены сти светового пучка и уровня устойчивого
длины волн, соответствующие фонового освещения. Время реакции на еди-
максимумам поглощения ка- ничный фотон составляет около секунды,
ждого из соединений, а также а на интенсивный падающий свет - несколь-
постоянная времени каждого ко миллисекунд. В палочках не возникает
из превращений. потенциала действия. Их реакция на свет
может быть различной силы. Величина сиг-
нала, идущего от наружного сегмента
пикосекунд после поглощения фотона, о чем
к синапсу, зависит от числа поглощенных
можно судить по появлению новой полосы фотонов. Если взять обладающие полной
поглощения после сильного импульсного чувствительностью адаптированные к тем-
освещения лазером. Образующийся при ноте палочки, то полумаксимальный уро-
этом промежуточный продукт фотолиза, на- вень гиперполяризации наблюдается при
зываемый батородопсином (или прелюмиро- поглощении всего лишь 30 фотонов на-
допсином), содержит напряженную пол- ружным сегментом палочки, содержащим
ностью-транс-форму хромофора. Далее 40•106 молекул родопсина (рис. 37.30). По-
и ретиналь, и белок продолжает изменять глощение единичного фотона адаптирован-
свою конформацию, что приводит к образо-
ной к темноте палочкой вызывает гиперпо-
ванию ряда промежуточных продуктов, раз-
ляризацию порядка 1 мВ, что улавливается
личающихся по спектральным свойствам синапсом и передается на другие нейроны
(рис. 37.28). При переходе от метародопсина сетчатки. Исключительная чувствитель-
I к метародопсину II, длящемуся около мил-
лисекунды, происходит депротонирование
шиффова основания. Лишенное протона
шиффово основание в метародопсине II ги-
дролизуется в течение примерно одной ми-
нуты с образованием опсина и полностью-
транс-ретиналя; последний путем диффузии
отделяется от опсина, поскольку не соответ-
ствует участку связывания 11-цис-изомера.
Полностью-транс-ретиналь в темноте изо-
меризуется снова в 11-цис-ретиналь, ко-
торый связывается с опсином, и таким пу-
тем регенерируется родопсин. В отличие от
Рис. 37.29. Под действием света происхо-
Часть V. дит гиперполяризация палочек
344 Молекулярная физиология сетчатки.
ность - не единственное выдающееся свой-
ство палочек. Их вторая поразительная осо-
бенность состоит в том, что реакция
световоспринимающего аппарата фотоде-
тектора на импульсное освещение зависит
от уровня фоновой освещенности. Для воз-
буждения палочек, освещенных постоянным
светом, требуется значительно больше фо-
тонов, чем для палочек, находящихся в тем-
ноте (рис. 37.30). Благодаря этому свойству,
называемому адаптацией, палочки сетчатки
способны функционировать при уровнях
фоновой освещенности, различающихся на
много порядков величины.
Каков ионный механизм индуцированной
светом гиперполяризации? Плазматическая
мембрана наружного сегмента палочки Рис. 37.30. Чувствительность палочек сет-
в темноте высоко проницаема для Na+. Это чатки к импульсному освеще-
обстоятельство наряду с наличием высоко- нию зависит от фонового уров-
го трансмембранного градиента концентра- ня освещенности.
ций Na+ приводит к тому, что в темноте
ионы натрия быстро входят внутрь наруж-
ного сегмента. Этот градиент поддержи- сина, не соприкасаются с плазматической
вается (Na+ + К+)-АТРазой, локализован- мембраной палочек и не сопряжены с ней
ной в плазматической мембране внутренне- электрически. Более того, молекула родоп-
го сегмента. Таким образом, в темноте сина, поглотившая фотон, может быть уда-
ионы натрия входят в наружный сегмент, лена от натриевого канала плазматической
диффундируют далее во внутренний сег- мембраны на несколько тысяч ангстрем. Все
мент и затем выводятся с помощью насоса, это исключает возможность прямого взаи-
работающего за счет энергии АТР. Свет ка- модействия между дисками и плазматиче-
ким-то образом блокирует Na+-каналы ской мембраной. Практически не может
в плазматической мембране наружного сег- быть сомнений в том, что сигнал от фотоли-
мента. В результате ток Na+, направленный зированного родопсина (Рд*) в мембранах
внутрь клетки, снижается и мембрана с вну- дисков передается на плазматическую мем-
тренней стороны становится более элек- брану с помощью диффундирующих медиа-
троотрицательной. Другими словами, мем- торов. При этом для обеспечения той высо-
бранный потенциал палочек при освещении кой степени усиления, которая реально
сдвигается в сторону равновесного наблюдается, фотолиз одной молекулы ро-
К+-потенциала. Далее индуцированная све- допсина должен сопровождаться образова-
том гиперполяризация вблизи освещенных нием (или распадом) большого числа моле-
дисков пассивно передается по плазматиче- кул медиатора.
ской мембране на синаптическое тельце. Природа медиатора не установлена еще
окончательно; проведенные исследования
37.16. Медиаторы передают сигнал позволили выдвинуть на эту роль двух до-
от фотолизированного родопсина статочно вероятных кандидатов: ионы Са2+
на плазматическую мембрану (рис. 37.31) и циклический GMP (рис. 37.32).
Изменение проницаемости плазматической В пользу Са2+ как медиатора свидетель-
мембраны для Na+ и последующая гипер- ствуют следующие экспериментальные
поляризация - это многократно усиленные данные.
реакции наружного сегмента на свет. 1. Натриевые каналы в плазматической
В самом деле, поглощение всего лишь одно- мембране закрываются при повышении со-
го фотона адаптированной к темноте палоч- держания Са2+ в цитозоле и открываются
кой блокирует ток более чем миллиона ио- при его понижении.
нов натрия. Как возникает усиление такого 2. При введении в цитозоль хелатирую-
масштаба? Прежде всего следует обратить
внимание на то, что мембраны дисков, со- 37. Возбудимые мембраны
держащие основную массу молекул родоп- и сенсорные системы 345
2. Содержание cGMP регулируется све-
том. В частности, под действием света про-
исходит активация фосфодиэстеразы, ги-
дролизующей cGMP, что будет описано
несколько ниже.
3. Фотолиз одной молекулы родопсина
5
ведет к быстрому гидролизу 10 молекул
cGMP.

37.17. Свет снижает содержание


циклического GMP путем активации
фосфодиэстеразы
Как показывают приведенные эксперимен-
тальные данные, возбудимость палочек за-
висит и от Са 2+ , и от cGMP. Взаимодей-
ствие этих агентов может играть решаю-
щую роль в зрительном возбуждении. Что
касается молекулярного механизма индуци-
рованного светом высвобождения Са2+

Рис. 37.31. Схематическое изображение


гипотезы о роли ионов кальция
как медиаторов при зритель-
ном возбуждении.

щих агентов, специфически связывающих


Са 2+ , чувствительность палочек к свету
уменьшается. Такая десенсибилизация
указывает на то, что фотолиз одной моле-
кулы родопсина ведет к высвобождению
в цитозоль нескольких сотен ионов Са 2+ .
3. После импульсного воздействия све-
том из наружных сегментов палочек выво-
дится много Са 2+ .

Однако, судя по результатам других экс-


периментов, медиатором может быть
cGMP. Решающее значение для этого за-
ключения имеют следующие данные.

1. Натриевые каналы плазматической


мембраны открываются при повышении со-
держания cGMP в цитозоле и закрываются
при снижении содержания этого нуклеоти- Рис. 37.32. Схематическое изображение
да. гипотезы о роли cGMP как
медиатора при зрительном
Часть V. возбуждении. Рд* - фотолизи-
346 Молекулярная физиология рованный родопсин.
в цитозоль, то в этом вопросе еще много не-
ясного. Что же касается регуляции светом
содержания cGMP в наружных сегментах
палочек, то в изучении этого вопроса в по-
следние годы был достигнут значительный
прогресс. На гуанилат-циклазу - фермент,
катализирующий синтез cGMP,- свет, по-
видимому, не оказывает существенного
влияния:

Зато на фосфодиэстеразу, гидролизующую


cGMP, свет оказывает поразительное по си- Рис. 37.33. Молекулярная модель цикли-
ле действие: ческого GMP.

В результате освещения активность фосфо-


диэстеразы возрастает в несколько сотен
раз. Стимуляция этого фермента фотолизи-
рованным родопсином опосредована регу-
ляторным белком, называемым трансдуци-
ном. В темноте трансдуцин содержит про-
чно связанную молекулу GDP. При освеще-
нии фотолизированный родопсин образует
комплекс с GDP-трансдуцином и катализи-
рует обмен GDP на GTP (рис. 37.34). Возни-
кающий комплекс GTP-трансдуцин активи-
рует фосфодиэстеразу. Крайне важное зна- Рис. 37.34. Фотолизированный родопсин
чение имеет то обстоятельство, что всего (Рд*) катализирует образова-
лишь одна фотолизированная молекула ро- ние комплекса GTP с трансду-
допсина катализирует обмен GDP на GTP цином; этот комплекс в свою
на нескольких сотнях молекул трансдуцина, очередь активирует фосфодиэ-
что в свою очередь активирует сотни моле- стеразу циклического GMP.
кул фосфодиэстеразы. Следовательно, если [Fung В. К.-К., Stryer L., Ргос.
число оборотов фосфодиэстеразы соста- Nat. Acad, Sci., 77, 2503 (1980).]
вляет примерно 103 с-1, то на свету в тече-
ние секунды гидролизуется уже более 105
молекул cGMP в расчете на одну молекулу
фотолизированного родопсина. Система 37.18. Цветовое зрение опосредуется
возвращается в исходное темновое состоя- фоторецепторами трех типов
ние благодаря встроенной в нее GTP-азной В 1802 г. Томас Юнг (Thomas Young) выска-
активности. Присоединенный к трансдуцину зал предположение, что цветовое восприя-
GTP подвергается медленному гидролизу тие опосредовано тремя основными рецеп-
с образованием GDP-трансдуцина, неспо- торами. Как показали спектрофотометриче-
собного активировать фосфодиэстеразу. Та- ские исследования интактной сетчатки, про-
ким образом, весь этот цикл протекает за веденные более 150 лет назад, в глазу
счет свободной энергии гидролиза GTP. существует три типа клеток-колбочек,
Здесь мы видим пример того, как для усиле- а именно клетки, поглощающие синий, зе-
ния сигнала используется ~Р. Описанный леный и красный свет. Для получения спек-
каскад реакций, регулирующих содержание тра поглощения этих трех фоторецепторных
cGMP (рис. 37.35), очень напоминает каскад пигментов колбочки освещали лучом света
реакций, опосредующих действие β-адре-
нергических гормонов, в частности адрена- 37. Возбудимые мембраны
лина (разд. 35.4). и сенсорные системы 347
честве переносчика кислорода в гемоглоби-
не, переносчика электронов в цитохроме с
и катализатора в пероксидазе.
Большинство форм дальтонизма (цвето-
вой слепоты) обусловлено сцепленной с по-
лом рецессивной мутацией. Около 1% му-
жчин не видят красного цвета, около
2% - зеленого. Как показали спектральные
исследования, проведенные на интактном
глазе, у этих людей либо совсем отсут-
ствуют фоторецепторные молекулы, вос-
принимающие красный или зеленый цвет,
либо имеется измененный пигмент со сдви-
нутым спектром поглощения. Таким обра-
зом, дальтонизм обусловлен отсутствием
или дефектом одного из типов опсина
в колбочках.
Рис. 37.35. Предполагаемый каскад реак- 37.19. 11-цис-ретиналь - хромофор всех
ций, регулирующих содержа- известных органов зрения
ние cGMP в сетчатке глаза. Со- Только у трех типов животных - моллю-
кращения: Рд - родопсин, сков, членистоногих и позвоночных - глаза
Рд* - фотолизированный ро- способны отображать образ предмета. Ана-
допсин, Т - трансдуцин, томически глаза этих трех типов устроены
ФДЭн - неактивная фосфодиэ- совершенно по-разному и, по-видимому,
стераза, ФДЭ - активная фос- в ходе эволюции возникли независимо. Од-
фодиэстераза. нако во всех трех случаях хромофором в фо-
торецепторных молекулах служит 11-цис-
ретиналь. Это поразительный пример кон-
диаметром I мкм (рис. 37.36). Кроме того, вергентной эволюции. Что же такого особен-
во многие колбочки вводили микроэлек- ного в 11-цис-ретинале? Во-первых, это
троды. Спектры действия, основанные на соединение обладает интенсивной полосой
гиперполяризации плазматических мем- поглощения, которая легко сдвигается в ви-
бран, разделяются на три группы с макси- димую область спектра. Во-вторых, под
мумами соответственно в синей, зеленой действием света 11-цис-ретиналь легко изо-
и красной областях видимого света. У золо- меризуется. Более того, в темноте скорость
той рыбки максимумы поглощения трех изомеризации очень низка. В-третьих, изо-
цветовых рецепторов приходятся на 455, 530 меризация вызывает большие изменения
и 625 нм, тогда как родопсин характери- в структуре. В итоге поглощенный свет пре-
зуется максимумом 500 нм. образуется в движение атомов такого масш-
Хромофором в колбочках всех трех типов таба, которое способно инициировать
служит 11-цис-ретиналъ. В отсутствие бел- генерирование нервного импульса. На-
ка протонированное шиффово основание конец, исходными предшественниками
имеет максимум поглощения при 380 нм.
Следовательно, различные группировки на
опсине оказывают значительное действие на
хромофорные свойства связанного 11-цис-
ретиналя. Зависимость спектральных
свойств этого хромофора от белкового
окружения - частное проявление общего
принципа, а именно взаимодействие с бел-
ком оказывает модулирующее влияние на
свойства простетической группы. Другой
пример тому - функционирование гема в ка-

Часть V. Рис. 37.36. Спектры поглощения трех цве-


348 Молекулярная физиология товых рецепторов.
Рис. 37.37. Вид клеток - палочек и колбо- хемотаксисом. В 60-х годах Джулиус Адлер
чек - фоторецепторного слоя (Julius Adler) начал изучать молекулярную
сетчатки в сканирующем элек- основу хемотаксиса бактерий. Выполненные
тронном микроскопе. (Печа- им, а также большим числом других ученых
тается с любезного разрешения биохимические, генетические и структурные
д-ра William Miller.) исследования раскрыли многие стороны
этого процесса. Хемотаксис начинается с об-
11-цис-ретиналя являются каротины (разд. наружения химических соединений специфи-
20.27), очень широко распространенные ческими хеморецепторами на поверхности
в живой природе. клетки. Информация от этих сенсоров пере-
дается в систему преобразования, где проис-
37.20. Хеморецепторы бактерий восприни- ходит анализ и интеграция большого числа
мают специфические молекулы стимулов. Далее сенсорная преобразующая
и передают сигналы на жгутики система посылает сигналы к моторам, при-
В конце XIX в. немецкий ботаник Виль- водящим в движение жгутики. В зависимо-
гельм Пфеффер (Wilhelm Pfeffer) продемон- сти от этих сигналов бактерия либо плавно
стрировал, что подвижные бактерии скапли- передвигается по прямой, либо резко меняет
ваются вокруг отверстия тонкого капилля- направление движения.
ра, содержащего какой-нибудь аттрактант, У Е. coli обнаружено около 20 различных
например сахар (рис. 37.38). В случае же, хеморецепторов. Каждый из этих белков ло-
когда капилляр содержит репеллент (обыч- кализован или в плазматической мембране,
но это вещество, повреждающее бактерии, или в периплазматическом пространстве.
или продукт их выделения), бактерии дви- Хеморецептор содержит узнающий и сигна-
жутся прочь от капилляра. Такое направлен-
ное движение бактерий в сторону одних ве- 37. Возбудимые мембраны
ществ и прочь от других называется и сенсорные системы 349
лизирующий компоненты. В хеморецепто-
рах, обеспечивающих положительный хемо-
таксис (привлечение), узнающий компонент
оказался связывающим белком, участвую-
щим в транспорте данного соединения
в клетку. Так, например, связывающий га-
лактозу белок (растворимый белок, локали-
зованный в периплазматическом простран-
стве) служит и узнающим компонентом при
положительном хемотаксисе на галактозу,
и частью насоса, осуществляющего ак-
тивный транспорт галактозы в клетку. Хе-
морецептор для глюкозы является также
компонентом фосфотрансферазной си-
стемы, связанной с мембраной и обеспечи-
вающей активное потребление этого сахара
(разд. 36.12). На поверхности Е. coli имеются
Рис. 37.38. Хемотаксис у бактерий. Бакте- хеморецепторы и для таких аттрактантов,
рии движутся к капилляру, со- как серин, цистеин, аланин, глицин. Хотя
держащему атрактант, напри- транспорт и хемотаксис тесно связаны ме-
мер глюкозу. жду собой, однако хемотаксис не зависит от
процессов транспорта. Так, некоторые му-
танты, неспособные транспортировать
определенные сахара или аминокислоты, со-
храняют способность направленно двигать-
ся к ним. Имеются также различные хеморе-
цепторы, связанные с отрицательным хемо-
таксисом. Жирные кислоты, спирты, гидро-
фобные аминокислоты, индол, Н+ (рН <
< 6,5), ОН- (рН > 7,5) и сульфиды отталки-
вают бактерии путем взаимодействия со
специфическими хемосенсорами.
37.21. В основании бактериального жгутика
находится вращающий его реверсивный
«мотор»
Бактерии плывут благодаря вращению жгу-
тиков, отходящих от поверхности клетки.
Эти тонкие спиральные нити состоят из
субъединиц массой 53 кДа, называемых
флагеллином. У бактерии Е. coli имеется
около 6 жгутиков длиной 10 мкм и диаме-
тром 150 А. Жгутики бактерий по сравне-
нию со жгутиками и ресничками эукариот
(разд. 34.18) имеют значительно меньшие
размеры и проще устроены. Бактериальный
жгутик сам по себе не может совершать ак-
тивных волнообразных движений, так как
Рис. 37.39. Электронная микрофотогра- в нем нет сократительного аппарата. Его
фия S. typhimurium. Хорошо вращает «мотор», расположенный в участке
видно, что жгутики собраны соединения жгутика с клеточной оболочкой.
в пучок. (Печатается с любезно- Выделение жгутиков, сохраняющих прикре-
го разрешения д-ра Daniel пленную к ним базальную структуру, позво-
Koshland.) лило изучить эти образования; оказалось,
что они состоят из нити, крючка и стерж-
Часть V. ня. У E.coli на стержень насажены 4 коль-
350 Молекулярная физиология ца. Наружное кольцо прикреплено к наруж-
ной мембране, а внутреннее - к плазматиче-
ской мембране клеточной оболочки. Базаль-
ное тельце (рис. 37.40) заякоривает жгутик
к клеточной оболочке и приводит его в дви-
жение. Этот «мотор» работает за счет про-
тонодвижущей силы, возникающей на плаз-
матической мембране, а не за счет энергии
гидролиза АТР. Действительно, угловая ско-
рость вращения прямо пропорциональна
протонодвижущей силе. Загадочное свой-
ство «мотора» состоит в том, что он может
вращаться как по часовой стрелке, так
и против нее.
Обычно отдельная бактерия Е. coli спо-
койно плывет по прямой примерно одну се-
кунду. За это время она проходит расстоя-
ние около 30 мкм, что примерно в 15 раз
превышает ее собственную длину. Затем
бактерия как бы кувыркается и резко меняет
направление движения (рис. 37.41). Угол по-
ворота в среднем обычно составляет 60°. От Рис. 37.40. Базальное тельце жгутика у Е.
чего зависит, движется ли бактерия плавно coli. (Adler J., The sensing of
или кувыркаясь? Оказалось, что при враще- chemicals by bacteria, 1976.)
нии жгутиков против часовой стрелки их
спиральные нити организуются в стройный
пучок, который и обеспечивает плавное
передвижение клетки. Если же жгутики вра-
щаются по часовой стрелке, то весь пучок
рассыпается, каждая нить тянет в свою сто-
рону и бактерия начинает кувыркаться.
37.22. Бактерии различают временной
градиент, а не одномоментный
пространственный градиент концентраций
Регуляция частоты кувыркания занимает
центральное место в хемотаксисе. Когда
бактерия движется в направлении увеличе-
ния концентрации аттрактанта, кувыркание
становится реже. Наоборот, при движении
от аттрактанта бактерия кувыркается ча-
ще. Репелленты оказывают противопо-
ложный эффект на частоту кувыркания
бактерий. В результате при движении
в сторону аттрактанта или прочь от репел-
лента бактерия плывет прямолинейно в те-
чение большего промежутка времени, чем
при движении в противоположном направ- Рис. 37.41. Проекция пути E. coli, получен-
лении. Кувыркание способствует выбору ная в электронном микроскопе
правильного направления. путем автоматическою слеже-
Сравнивает ли бактерия концентрации ния за перемещением бактерии
аттрактанта на двух концах своей клетки, в трех измерениях. Точки отде-
или же она сравнивает концентрации ат- лены друг от друга промежут-
трактанта в два отдельных момента вре- ком 80 мс. [Berg H.C., Nature,
мени? Другими словами, является ли ее 254, 390 (1975).]
сенсорный механизм пространственным
или временным? Дэниел Кошланд и Ро- 37. Возбудимые мембраны
берт Макнаб (Daniel Koshland, Robert и сенсорные системы 351
Рис. 37.42. Кувыркание бактерии обусло- нием концентрации аттрактанта, является
влено резким изменением на временным. После определенного лаг-пе-
180° направления вращения риода частота кувырканий возвращается
«мотора»; в результате пучок к исходному уровню. По существу, при по-
жгутиков оказывается разме- стоянном наличии аттрактанта бактерия
танным в разные стороны. (По теряет чувствительность к нему. Благодаря
рисунку, любезно предоста- такой десенсибилизации, называемой адап-
вленному д-ром Daniel Kosh- тацией, бактерии способны воспринимать
land.) градиенты в широком диапазоне концен-
траций аттрактанта. Как указывалось ра-
нее, аналогичным свойством обладает ре-
Macnab) нашли ответ на этот важный акция палочек сетчатки на свет (рис. 37.30).
вопрос, поставив очень простой Генетические исследования хемотаксиса
и остроумный опыт. Суспензию бактерий бактерий показали, что информация по
в среде, лишенной аттрактанта, быстро крайней мере от 12 хеморецепторов пере-
смешивали с раствором, содержащим ат- дается через 3 белка-продукта генов tsr,
трактант, и подсчитывали частоту кувыр- tar и trg (рис. 37.43). Например, сигналы от
каний бактерий. Поразительным образом рецепторов рибозы и галактозы поступают
уже через секунду после смешивания эта на белок trg. Указанные три белка подвер-
частота снижалась. Бактерии проплывали гаются обратимому метилированию, и по-
относительно большие расстояния по пря- тому их называют метил-акцепторные хе-
мой, хотя в быстро перемешанном раство- мотаксические белки (МХБ). Несколько
ре пространственный градиент концентра- глутаматных боковых цепей в каждом из
ции отсутствовал. Следовательно, бакте- этих белков подвергается метилированию
рии воспринимают изменение концентра- под действием метилтрансферазы, исполь-
ции во времени, т.е. обладают временным зующей S-аденозилметионин в качестве ак-
сенсорным механизмом. Иными словами, тивированного донора метильных групп
бактерия определяет градиент аттрактанта (рис. 37.44). Эти ковалентные модификации
в пространстве не путем сопоставления его могут быть обращены специфической эсте-
концентрации на переднем и заднем кон- разой. Уровень метилирования МХБ воз-
цах своей клетки, а путем сопоставления растает при воздействии аттрактантом
отдельных восприятий концентрации во и снижается при воздействии репеллентом.
времени по мере движения. По существу, По-видимому, адаптация опосредована сте-
бактериальный хемотраксис - это частично пенью метилирования этих белков.
ориентированное случайное движение. Це- Информация от указанных трех метил-
ленаправленность возникает в результате акцепторных белков попадает далее на
отбора случайных направлений движения. продукты генов che. Каким образом эти
молекулы определяют направление враще-
37.23. При бактериальном хемотаксисе ния жгутиков, остается неизвестным. Одна-
передача информации обеспечивается ко теперь уже совершенно ясно, что у бак-
метилированными белками терий имеется примитивная сенсорная си-
Реакция бактерии на тот или иной гра- стема, образованная продуктами примерно
диент концентрации аттрактанта не 30 генов, в которой обрабатывается и ин-
является строго определенной. Торможе- тегрируется информация относительно пи-
ние кувыркания, обусловленное повыше- тательных веществ и ядов в окружающей
бактерию среде. В сущности, основной во-
Часть V. прос для бактерии: «кувыркаться или не
352 Молекулярная физиология кувыркаться»?
Рис. 37.43. Путь передачи информации Заключение
при хемотаксисе бактерий. Потенциалы действия в мембранах аксо-
В нижней части схемы пока- нов нервных клеток опосредованы кратко-
заны выявленные типы мутан- временным изменением проницаемости
тов. МХБ - акцептирующий для Na + и К + . И Na+-, и К + -каналы регу-
метильную группу хемотакси- лируются трансмембранной разностью по-
ческий белок. [Springer R. S., тенциалов. Тетродотоксин и сакситоксин
Coy M.F., Adler J., Nature, 280, - специфические блокаторы Na+-каналов.
280 (1979).] Передача нервных импульсов через
синапсы в большинстве случаев опосредо-
вана химическими медиаторами. Ацетилхо-

Рнс. 37.44. Обратимое метилирование ме-


тил-акцепторных хемотаксиче- 37. Возбудимые мембраны
ских белков. и сенсорные системы 353
лин, который служит нейромедиатором во 11-цис-ретинальной группировки в по-
многих синапсах и двигательных концевых лностью-транс-ретиналь. Конечный этап
пластинках, синтезируется из ацетил-СоА зрительного возбуждения - гиперполяриза-
и холина. Ацетилхолин накапливается ция плазматической мембраны наружного
в синаптических пузырьках, которые при сегмента, обусловленная снижением прони-
+
поступлении нервного импульса сливаются цаемости для Na . Поглощение одного
с пресинаптической мембраной; высвобо- фотона адаптированной к темноте палоч-
ждающийся при этом ацетилхолин диф- кой блокирует поток более миллиона ио-
2+
фундирует через синаптическую щель и со- нов натрия. Медиаторы (вероятно, Са
единяется со специфическими белковыми или циклический GMP) передают сигнал
рецепторами на постсинаптической мем- от фотолизированного родопсина на плаз-
бране. Вызванное этим увеличение прони- матическую мембрану. Цветовое зрение
цаемости для Na+ и К+ приводит к депо- опосредовано фоторецепторами трех ти-
ляризации постсинаптической мембраны. пов, каждый из которых содержит 11-цис-
Рецептор ацетилхолина имеет высокое ретиналь. По существу, 11-цис-ретиналь
сродство к α-бунгаротоксину и другим является хромофором во всех известных
нейротоксинам; указанное свойство облег- зрительных органах, что служит удиви-
чило выделение и очистку этого интеграль- тельным примером конвергентной эволю-
ного мембранного белка. После гидролиза ции.
ацетилхолина под действием ацетилхолин- Подвижные бактерии способны к напра-
эстеразы происходит реполяризация пост- вленному движению в сторону аттрактанта
синаптической мембраны. Ингибиторами (например, глюкозы) или от репеллента
ацетилхолинэстеразы служат органические (например, жирных кислот). Сенсоры для
фосфаты, в частности ДИФФ, который мо- хемотаксиса локализованы в периплазма-
жет вызвать смерть вследствие паралича тическом пространстве или на плазматиче-
дыхания. К числу нейромедиаторов отно- ской мембране. Бактериальные жгутики
сятся также катехоламины (адреналин, нор- вращаются с помощью «моторов», исполь-
адреналин и дофамин) и γ-аминобутират зующих энергию протонного градиента на
(ГАМК). плазматической мембране. Бактерии спо-
Возбуждение палочек сетчаткой глаза койно плывут в течение примерно секунды,
может быть вызвано одним фотоном. затем кувыркаются вследствие перемены
В наружном сегменте палочки имеется направления вращения жгутиков от движе-
около тысячи уложенных пачкой дисков, ния против часовой стрелки к движению
которые представляют собой замкнутые по часовой стрелке. Когда бактерия дви-
двуслойные мембраны, обильно нагру- жется к аттрактанту или от репеллента, ее
женные молекулами трансмембранного кувыркания становятся реже. Бактерии
белка родопсина. Родопсин - фоторецеп- определяют временной, а не простран-
торный белок; его хромофором является ственный градиент концентрации. В бакте-
11-цис-ретиналь, который образуется из риальной клетке информация от хемосен-
полностью-транс-ретинола (витамина А). соров передается на три метил-акцеп-
11-цис-ретиналъ присоединяется к специфи- торных хемотаксических белка (МХБ)
ческому остатку лизина в опсине, образуя и далее на жгутики. Обратимое метилиро-
шиффово основание. Первичный акт вание МХБ регулирует чувствительность
зрительного возбуждения - изомеризация детекторной системы.

РЕКОМЕНДУЕМАЯ Rushton W.A.H., 1975. Visual pig- Книги


ЛИТЕРАТУРА ments and color blindness, Sci. Amer., Kuffler S.W., Nicholls J.G., 1976.
232(3), 64-74. From Neuron to Brain, Sinauer.
С чего начать Adler J., 1976. The sensing of che- [Имеется перевод: Куффлер С., Ни-
Lester H.А., 1977. The response to micals by bacteria, Sci. Amer., 234(4), коле Дж. От нейрона к мозгу.- М.:
acetylcholine, Sci. Amer, 236 (2), 40-47. Мир, 1979.] (Часть II этой замеча-
106-118. Berg H., 1975. How bacteria swim, Sci. тельной книги содержит прекрасное
Keynes R.D., 1979. Ion channels in the Amer., 233(2), 36-44. описание механизмов передачи сиг-
nerve-cell membrane, Sci. Amer., налов по нейронам.)
240(3), 126-135. Katz В., 1966. Nerve, Muscle, and
Synapse, McGraw-Hill. [Имеется
Часть V. перевод: Катц Б. Нерв, мышца
354 Молекулярная физиология и синапс.- М.: Мир, 1968.] (Велико-
лепное краткое изложение общих Fulpius B.W., Miskin R., Reich E., Fung B.K.-K., Stryer L., 1980.
представлений.) 1980. Antibodies from myasthenic Photolyzed rhodopsin catalyzes the
Cone R.A., Dowling J.E. (eds.), 1979. patients that compete with cholinergic exchange of GTP for bound GDP in
Membrane Transduction Mechanisms, agents for binding to nicotinic re- retinal rod outer segments, Proc. Nat.
Raven Press. (Сжатые и ясные описа- ceptors, Proc. Nat. Acad. Sci., 77, Acad. Sci., 77, 2500-2504.
ния различных возбудимых мем- 4326-4330.
бранных систем.) Hess G.P., Lipkowitz S., Struve G.E., Хемотаксис
Aidley D.J., 1977. The Physiology of 1978. Acetylcholine-receptor mediated Koshland D.E., Jr., 1979. A model
Excitable Cells (2nd ed.), Liverpool ion flux in electroplax membrane regulatory system: bacterial
University Press. microsacs (vesicles): change in me- chemotaxis, Physiol. Rev., 59, 811-862.
chanism produced by asymmetrical Macnab R., Koshland D.E., Jr., 1972.
Проведение по аксону нерва distribution of sodium and potassium The gradient-sensing mchanism in
Hille В., 1978. Ionic channels in ions, Proc. Nat. Acad. Sci., 75, bacterial chemotaxis, Proc. Nat. Acad.
excitable membranes: current pro- 1703-1707. Sci., 69, 2509-2512. (Эти опыты пока-
blems and biophysical approaches, Anglister L., Silman L., 1978. Molecular зали, что бактерии определяют вре-
Biophys. J., 22, 283-294. structure of elongated forms of electric менной, а не пространственный гра-
Barchi R.L., Cohen S.A., Murphy L.E., eel acetylcholinesterase, J. Mol. Biol диент.)
1980. Purification from rat sarcolemma 125, 293-311. Springer M.S., Goy M.F., Adler J.,
of the saxitoxin-binding component of 1979. Protein methylation in behavi-
the excitable membrane sodium Зрение oural control mechanisms and in
channel, Proc. Nat. Acad. Sci., 77, Miller W.H., (ed.), 1981. Molecular signal transduction, Nature, 280,
1306-1310. Mechanisms of Photoreceptor Trans- 279-284.
Morell P., Norton W.T., 1980. Myelin. duction, Academic Press. Silverman M.R., Simon M.I., 1974.
Sci. Amer., 242(5), 88-118. Hagins W.A., 1979. Excitation in Flagellar rotation and the mechanism
Ritchie J.M., Rogart R.B., 1977. Den- vertebrate photo receptors. In: Schmitt of bacterial motility, Nature, 249,
sity of sodium channels in mammalian F.O. and Worden F.G. (eds.), The 73-74.
myelinated nerve fibers and nature of Neurosciences: Fourth Study Program, Manson M.D., Tedesco P., Berg C.,
the axonal membrane under the pp. 183-191, MIT Press. Harold F.M., van der Drift C., 1977.
myelin sheath, Proc. Nat. Acad. Sci., Hubbell W.L., Bownds M.D., 1979.Vi- A protomotive force drives bacterial
74, 211-215. sual transduction in vertebrate flagella, Proc. Nat. Acad. Sci., 74,
photoreceptors, Ann. Rev. Neurosci., 2, 3060-3064.
17-34. Manson M.D., Tedesco P.M.,
Wald G., 1968. The molecular basis of Berg H.C., 1980. Energetics of flagellar
Синаптическая передача visual excitation, Nature, 219, 800-807. rotation in bacteria, J. Mol. Biol., 138,
Axelrod J., 1974. Neurotransmitters, (Нобелевская лекция; содержит ин- 541-561.
Sci. Amer. 230(6), 59-71. тересное описание того, как был от- Khan S., Macnab R.M., 1980. Proton
Heidmann Т., Changeux J.-P., 1978. крыт первичный акт зрительного chemical potential, proton electrical
Structural and functional properties of возбуждения.) potential and bacterial motility, J.
the acetylcholine receptor protein in its Young R.W., 1970. Visual cells, Sci. Mol. Biol, 138, 599-614.
purified and membrane-bound states, Amer., 223(4), 80-91. Stock J.B., Koshland D.E., Jr., 1978.
Ann. Rev. Biochem., 47, 317-357. Dawling J.E., 1966. Night blindness, A protein methylesterase involved in
Raftery M.A., Hunkapiller M.W., Stra- Sci. Amer., 215(4), 78-84. bacterial sensing, Proc. Nat. Acad. Sci.,
der C.D., Hood L.E., 1980. MacNichol E.F., Jr., 1964. Three- 75, 3659-3663.
Acetylcholine receptor: complex of pigment color vision, Sci. Amer., Kondoh H., Ball С.В., Adler J., 1979.
homologous subunits, Science, 208, 211(6), 48-56. Identification of a methyl-accepting
1454-1457. Yoshikami S., George J.S., Hagins W.- chemotaxis protein for the ribose and
Klymkowsky M.W., Stroud R.M., 1979. A., 1980. Light-induced calcium fluxes galactose chemoreceptors of
Immunospecific identification and from outer segment layer of vertebrate Escherichia coli, Proc. Nat. Acad. Sci.,
three-dimensional structure of retinas, Nature, 286, 395-398. 76, 260-264,
a membrane-bound acetylcholine Pober J.S., Bitensky M.W., 1979. Berg H.C, Purcell E.M., 1977. Physics
receptor from Torpedo California, J. Light-regulated enzymes of vertebrate of chemoreception, Biophys. J., 20,
Mol. Biol, 128, 319-334. retinal rods, Advan. Cyclic Nucleotide 193-219.
Moore H.H., Hartig P.R., Raftery M. Res., 11, 265-301.
A., 1979, Correlation of polypeptide Liebman P.A., Pugh E.N., Jr., 1979.
composition with functional events in The control of phosphodiesterase in
acetylcholine receptor-enriched mem- rod disk membranes: kinetics, possible
branes from Torpedo California, Proc. mechanisms, and significance for
Nat Acad. Sci., 76, 6265-6269. vision, Vision Res., 19, 375-380.
ж) Движущей силой обеих реакций является
Ответы на вопросы гидролиз пирофосфата.
и задачи 2.
3.
5'-UAACGGUACGAU-3'.
2'-ОН группа в составе РНК действует в каче-
Глава 24 стве внутримолекулярного катализатора. При
щелочном гидролизе РНК образуется 2'3'-ци-
1. a) TTGATC; б) GTTCGA; в) ACGCGT; клический промежуточный продукт.
г) ATGGTA. 4. Кордицепин обрывает синтез РНК. В цепи
2. а) [Т] + [С] = 0,46. РНК, содержащей кордицепин, нет 3'-ОН-
б) [Т] = 0,30; [С] = 0,24; [А] + [G] = 0,46. группы.
3. 5,88•103 пар оснований. 5. a) pGCp, AGUp, ACp, Up, GUp и С.
4. Через 1,0 генерацию половина молекул будет б) pGp, CAGp, UACUGp и UC
15
N — 1 5 N , а другая половина 1 4 N— 1 4 N. Через в) pGp, САр, Gp, UAp, CUGp и UC.
2,0 поколения четверть всех молекул будет г) pGp, CAp, Gp, Up, Ap, CUp и С.
15
N — 1 5 N , остальные три четверти 1 4 N — 1 4 N . 6. UAGCCUGAAUp.
Гибридные молекулы 1 4 N — 1 5 N при консерва-
тивной репликации обнаруживаться не будут. Глава 26
5. FAD, CoA, NADP + .
1. Leu-Pro-Ser-Asp-Trp-Met-.
6. ДНК-лигаза релаксирует сверхспирализован-
2. Poly (Leu-Leu-Thr-Tyr).
ную ДНК, катализируя расщепление фосфодиэ-
3. a) Pro (CCC), Ser (UCC), Leu (CUC) и Phe
фирной связи в одной из цепей ДНК. Атакую-
(UUC). В другом случае последнее основание
щая группа - AMP; она присоединяется
каждого из этих кодонов может быть U.
к 5'-фосфорильной группе в месте расщепления.
б) Эти С —> U- мутации были вызваны азоти-
AMP необходим потому, что эта реакция пред-
стой кислотой.
ставляет собой обращение заключительной
4. а) Для этого понадобились бы две замены
стадии соединения различных кусков ДНК (см.
оснований.
рис. 24.32 в разд. 24.15).
б) Arg, Asn, Gln, Gln, Ile, Met или Thr.
7. 5'-GGCATAC-3'.
5. а) Нет, эта последовательность возникла в ре-
Глава 25 зультате делеции первого основания приведен-
1. а) ДНК-полимераза I представляет собой од- ной ниже последовательности и вставки друго-
ну-единственную полипептидную цепь, а РНК- го основания в конце.
полимераза имеет субъединичную структуру б)—AGUCCAUCACUUAAU—.
α2ββ'σ. 6. Они имеют следующие последовательности:
б) Предшественниками служат дезоксинуклео- Lys-стоп; -Met-Arg-; -Asn-Gln-.
зидтрифосфаты, а не рибонуклеозидтрифос-
фаты.
в) Направление синтеза для обоих ферментов Глава 27
5'—>3'. 1. а) Нет; б) нет; в) да.
г) ДНК-полимераза I обладает 5'—>3'- и 3'—> 2. В градиенте будет 4 полосы: легкая; тяжелая;
—>5'-экзонуклеазными активностями, а РНК- полоса, соответствующая гибриду легкой 30S-
полимераза - ни одной из них. и тяжелой 50S-субчастиц; полоса, соответ-
д) ДНК-полимераза I осуществляет полукон- ствующая гибриду тяжелой 30S- и легкой 50S-
сервативный синтез, а РНК-полимераза - кон- субчастиц.
сервативный.
3. Расходуется примерно 799 богатых энергией
е) ДНК-полимеразе I необходима затравка, фосфатных связей: 400 для активирования 200
а РНК-полимеразе нет. аминокислот, 1 для инициации и 398 для обра-
зования 199 пептидных связей.
4. б), в) и е) - механизм 1-го типа; а), г) и д) - меха-
356 Ответы на вопросы и задачи низм 2-го типа.
5. Простейшее предположение состоит в том, что синтеза белков trp-оперона, так как в нем нет
антикодон ССА триптофановой тРНК мутиро- trp-репрессора.
вал в UCA-кодон, комплементарный UGA. в) В этом мутанте арабинозный оперон не экс-
Однако изучение этой измененной тРНК при- прессируется, так как для активирования тран-
вело к неожиданному результату. Ее антикодон скрипции необходима Р2-форма araC-белка.
остался неизменным. Вместо этого произошло г) Этот мутант обладает литическим дей-
замещение А на G в положении 24. Таким ствием, но не лизогенизирующим, так как он
образом, остаток, расположенный на значи- не способен синтезировать λ-репрессор.
тельном расстоянии от антикодона в линейной д) Этот мутант обладает лизогенизирующим
последовательности, может влиять на точность действием, но не способен к литическому дей-
узнавания кодона. ствию, так как он не может синтезировать N-
6. Один из подходов состоит в том, чтобы синте- белок - позитивный регуляторный фактор тран-
зировать тРНК, к которой присоединен реак- скрипции.
ционноспособный аналог аминокислоты. На- 2. Одна из возможностей состоит в том, что в
пример, бромацетилфенилаланил-тРНК служит i S -мутанте образуется измененный lac-репрес-
реагентом для мечения по сродству Р-участка сор, который почти не имеет сродства к индук-
рибосом E.coli. См.статью: Oen H., Pellegrini тору, но проявляет нормальное сродство к опе-
М., Eilat D., Cantor С. R., Ргос. Nat. Acad. Sci., ратору. Такой lac-репрессор будет связываться
70, 2799 (1973). с оператором и блокировать транскрипцию да-
7. Последовательность GAGGU комплементарна же в присутствии индуктора.
последовательности пяти оснований на 3'-конце 3. У этого мутанта lac-оператор изменен таким
16S-pPHK и расположена на расстоянии не- образом, что он не может связывать репрессор.
скольких оснований в 5'-сторону от кодона Такая мутация обозначается OC (от англ.
AUG. Поэтому этот участок служит сигналом operator constitutive - конститутивный опера-
начала синтеза белка. Замещение G на А могло тор).
бы ослаблять взаимодействие этой мРНК 4. У этого мутанта, видимо, белок, связывающий
с 16S-pPHK и снижать таким образом эффек- циклический AMP (БАК), либо имеет изменен-
тивность этой последовательности в качестве ную структуру (дефектен), либо совсем отсут-
сигнала инициации. Действительно, эта мута- ствует.
ция приводит к 10-кратному снижению скоро- 5. Клетка E. coli, несущая профаг λ, содержит мо-
сти синтеза белка, кодируемого мРНК. См. лекулы λ-репрессора, которые также блоки-
статью, в которой подробнее обсуждаются руют транскрипцию предранних генов других
свойства этой интересной мутации: Dunn J. J., частиц фага λ.
Buzash-Pollert E., Studier F. W., Proc. Nat. Acad. 6. а) Трансляция транскрипта PRE происходит
Sci., 75, 2741 (1978). в 5-10 раз быстрее, чем трансляция транскрип-
8. В обоих случаях используются реакции гидро- та РRM, так как он содержит полноценный сиг-
лиза: 3'—>5'-экзонуклеазная активность ДНК- нал инициации синтеза белка (как это обсу-
полимеразы I и гидролиз ошибочного проме- ждается в разд. 27.14).
жуточного продукта аминоацил—AMP под б) Более эффективная трансляция транскрипта
действием аминоацил-тРНК—синтетазы. PRE приводит к быстрому образованию боль-
шого количества молекул λ-репрессора, необ-
Глава 28
ходимых для установления лизогенного состоя-
1. а) у i--мутанта нет lac-репрессора. Поэтому ния. Обсуждение этого процесса см. в статье:
такой мутант конститутивен в отношении син- Ptashe M., Backman К., Humagun Z., Jeffrey A.,
теза белков lac-оперона. Maurer R., Meyer В., Sauer R.T., Science, 194,
б) Этот мутант конститутивен в отношении 156 (1976).
ПРИЛОЖЕНИЯ Математические постоянные
п = 3,14159
е = 2,71828
lnх = 2,303 lgx

Соотношение единиц измерения

ПРИЛОЖЕНИЕ А Физические Единицы измерения


величины
Физические константы
Длина 1 см = 10-2м = 10мм = 104 мкм =
и перевод единиц
= 107нм
из одной системы = 108 А = 0,3937 дюйма

в другую
-3 3 6
Масса 1 г = 10 кг = 10 мг = 10 мкг
= 3,527•10-2 унций
Объем 1 см3 = 10-6 м3 = 103 мм3
Числовые значения физических констант
1 мл = 1 см3 = 10-3 л = 103 мкл
1 см3 = 6,1•10-2 дюйм3 = 3,53•10-5
Величина Символ Значение
1
фут3
Температура К = °С + 273,15
Атомная еди- а.е.м. 1,66•10-24 г
°С =5/9(°F-32)
ница массы (Да)
Энергия 1 Дж = 107 эрг = 0,239 кал = 1 Вт•с
(дальтон)
Давление 1 торр = 1 мм рт. ст. (0°C)
Число Авогад- N 6,022•1023 моль-1
= 1,333•102 Н/м2
ро
= 1,333•102 Па
Постоянная k 1,381•10-23 Дж•К-1 = 1,316•10-3 атм
Больцмана 3,298•10-24 кал•К-1
Электрон- эВ 1,602 • 10 - 1 9 Дж
вольт
3,828•10-20 кал Приставки для образования кратных и дольных еди-
ниц измерений
Число Фара- F 9,649•104 Кл•моль-1
дея 2,306•104 кал•В - 1 •экв - 1
Радиоактив- Ки 3,70•1010 расп•с-1 Приставка Обозначение Числен-
ность ный экви-
русскими латински- валент
Универсаль- R 8,314•Дж•моль-1•К-1 буквами ми или приставки
ная газовая 1,987 кал•моль -1 •К -1 гречески-
постоянная ми буква-
ми
Постоянная h 6,626•10-34 Дж•с
Планка 1,584•10-34 кал•с Кило к k 103
2
Скорость све- с
10
2,998•10 см•с -1
Гекто г h 10
та в вакууме Дека да da 101
Деци д d 10-1
Санти с с 10-2
Милли М m 10-3
1
Использованные сокращения: В - вольт; г - грамм; Микро мк μ 10-6
-9
Дж - джоуль; К - кельвин; кал - калория; Кл - кулон; Нано н n 10
с - секунда; см-сантиметр; экв - эквивалент. Пико п р 10-12
ПРИЛОЖЕНИЕ Б
Порядковые номера
и атомные массы
элементов

Название Знак Поряд- Название Знак Поряд-


ковый Атомная ковый Атомная
номер масса номер масса

Азот N 7 14,01 Кремний Si 14 28,09


Актиний Ас 89 227,03 Криптон Кг 36 83,80
Алюминий Al 13 26,98 Ксенон Хе 54 131,30
Америций Am 95 243,06 Курчатовий Kh 104 260
Аргон Аг 18 39,95 Кюрий Cm 96 245,07
Астат At 85 210,99 Лантан La 57 138,91
Барий Ва 56 137,34 Литий Li 3 6,94
Бериллий Be 4 9,01 Лоуренсий Lr 103 256
Берклий Bk 97 247,07 Лютеций Lu 71 174,97
Бор В 5 10,81 Магний Mg 12 24,31
Бром Вг 35 79,90 Марганец Mn 25 54,94
Ванадий V 23 50,94 Медь Cu 29 63,55
Висмут Bi 83 208,97 Менделевий Md 101 255,09
Водород Н 1 1,01 Молибден Mo 42 95,94
Вольфрам W 74 183,85 Мышьяк As 33 74,92
Гадолиний Gd 64 157,25 Натрий Na 11 22,99
Галлий Ga 31 69,72 Неодим Nd 60 144,24
Гафний Hf 72 178,49 Неон Ne 10 20,18
Гелий Не 2 4,00 Нептуний Np 93 237,05
Германий Ge 32 72,59 Никель Ni 28 58,71
Гольмий Но 67 164,93 Ниобий Nb 41 92,91
Диспрозий Dy 66 162,50 Нобелий No 102 255
Европий Eu 63 151,96 Олово Sn 50 118,69
Железо Fe 26 55,85 Осмий Os 76 190,20
Золото Au 79 196,97 Палладий Pd 46 106,40
Индий In 49 114,82 Платина Pt 78 195,09
Иод I 53 126,90 Плутоний Pu 94 242,06
Иридий Ir 77 192,22 Полоний Po 84 208,98
Иттербий Yb 70 173,04 Празеодим Pr 59 140,91
Иттрий Y 39 88,91 Прометий Pm 61 145
Кадмий Cd 48 112,40 Протактиний Pa 91 231,04
Калий К 19 39,10 Радий Ra 88 226,03
Калифорний Cf 98 249,07 Радон Rn 86 222,02
Кальций Ca 20 40,08 Рений Re 75 186,20
Кислород O 8 16,00
Кобальт Co 27 58,93 Приложения 359
Название Знак Поряд- Название Знак Поряд-
ковый Атомная ковый Атомная
номер масса номер масса

Родий Rh 45 102,91 Титан Ti 22 47,90


Ртуть Hg 80 200,59 Торий Th 90 232,04
Рубидий Rb 37 85,47 Туллий Tm 69 168,93
Рутений Ru 44 101,07 Углерод С 6 12,01
Самарий Sm 62 150,40 Уран U 92 238,03
Свинец Pb 82 207,20 Фермий Fm 100 257,08
Селен Se 34 78,96 Фосфор Р 15 30,97
Сера S 16 32,06 Франций Fr 87 223,02
Серебро Ag 47 107,87 Фтор F 9 18,99
Скандий Sc 21 44,96 Хлор Cl 17 35,45
Стронций Sr 38 87,62 Хром Cr 24 52,00
Сурьма Sb 51 121,75 Цезий Cs 55 132,91
Таллий Tl 81 204,37 Церий Ce 58 140,12
Тантал Та 73 180,95 Цинк Zn 30 65,37
Теллур Те 52 127,60 Цирконий Zr 40 91,22
Тербий Tb 65 158,93 Эйнштейний Es 99 254,09
Технеций Тс 43 98.91 Эрбий Er 68 167,26
ПРИЛОЖЕНИЕ В ПРИЛОЖЕНИЕ Г
Значение рК' для Стандартные длины
ряда кислот связей

Кислота рК' Кислота pК' Связь Структура Длина, А


(при (при
25°С) 25°С)
С—Н R 2 CH 2 1,07
Аммония ион 9,25
Ароматическая 1,08
Аскорбиновая, 1,10
RCH 3
pK1' 4,10
pК 2 ' 11,79
Ацетоуксусная 3,58 С—С Углеводородная 1,54
Бензойная 4,20 Пиридиния ион 5,25 Ароматическая 1,40
Вода 14,0 Пирофосфорная, С=С Этилен 1,33
рК1' 0,85 С=С Ацетилен 1,20
С—N RNH 2 1,47
Глицин, рК1' 2,35 рК2' 1,49
рК 2 ' 9,78 рК3' 5,77
Имидазолия O=C—N 1,34
ион 6,95 рК4' 8,22 С—O Спирт 1,43
Эфир 1,36
Какодиловая 6,19 Триметиламмо-
C=O Альдегид 1,22
ния ион 9,79
Амид 1,24
Лимонная, Трис(гидроксиме- С—S R2S 1,82
pK1' 3,14 тил)-аминометан 8,08
pK2' 4,77
рК3' 6,39 Угольная, pK 1 ' 6,35 N—Н Амид 0,99
Малеиновая, O—Н Спирт 0,97
pK1' 1,83 pK2' 10,33 O—О O2 1,21
pK2' 6,07 Уксусная 4,76
n-Масляная 4,81 Фенол 9,89 Р—О Эфир 1,56
Молочная 3,86 Фосфорная, pK1' 2,12 S—Н Тиол 1,33
S—S Дисульфид 2,05
Муравьиная 3,75 pK2' 7,21
рК3' 12,67
Этиламмония ион 10,81
Яблочная, pK 1 ' 3,40
pK2' 5,11
Янтарная, pK 1 ' 4,21
pK2' 5,64
ПРИЛОЖЕНИЕ Д
Стандартные
сокращения,
принятые в биохимии

АКТГ (АСТН) адренокортикотропный гормон cDNA (кДHK) комплементарная ДНК


АПБ (АСР) ацилпереносящий белок DNase (ДНКаза) дезоксирибонуклеаза
АТРаза аденозинтрифосфатаза DNP (ДНФ) динитрофенол
ДИФФ (DIPF) диизопропилфторфосфат DPN + см. NAD +
ДНК (DNA) дезоксирибонуклеиновая кислота DPNH см. NADH
кДНК комплементарная ДНК FAD флавинадениндинуклеотид (окис-
ДНКаза (DNase) дезоксирибонуклеаза ленная форма)
ДНФ (DNP) динитрофенол FADH 2 флавинадениндинуклеотид (вос-
РНК (RNA) рибонуклеиновая кислота становленная форма)
мРНК (mRNA) информационная (матричная) fMet формилметионин
РНК FMN флавинмононуклеотид (окислен-
рРНК (rRNA) рибосомная РНК ная форма)
тРНК (tRNA) транспортная РНК FMNH 2 флавинмононуклеотид (восста-
РНКаза (RNase) рибонуклеаза новленная форма)
А аденин G гуанин
АСР (АПБ) ацил переносящий белок GDP гуанозиндифосфат
АСТН (АКТГ) адренокортикотропный гормон Gln глутамин
ADP а денозиндифосфат Glu глутамат
Ala аланин Gly глицин
AMP аденозинмонофосфат GMP гуанозинмонофосфат
cAMP циклический AMP GTP гуанозинтрифосфат
Arg аргинин Hb гемоглобин
Asn аспарагин HbCO карбоксигемоглобин
Asp аспартат HbO2 оксигемоглобин
ATP аденозинтрифосфат His гистидин
ATPase аденозинтрифосфатаза Hyp гидроксипролин
С цитозин IgG иммуноглобин G
CDP цитидиндифосфат Ile изолейцин
CMP цитидинмонофосфат ITP инозинтрифосфат
CTP цитидинтрифосфат Leu лейцин
CoA кофермент А Lys лизин
CoQ кофермент Q (убихинон) Mb миоглобин
Cys цистеин MbO2 оксимиоглобин
d 2'-дезоксирибо Met метионин
DIPF (ДИФФ) диизопропилфторфосфат MetHb метгемоглобин
DNA (ДНК) дезоксирибонуклеиновая кислота NAD + никотинамидадениндинуклеотид
(окисленная форма)
NADH никотинамидадениндинуклеотид
(восстановленная форма)

362 Приложения
NADP + никотинамидадениндинуклео- RNase (РНКаза) рибонуклеаза
тидфосфат (окисленная Ser серин
форма) Т тимин
Thr треонин
NADPH никотинамидадениндинуклео- TPN + см. NADP +
тидфосфат (восстановленная TPNH см. NADPH
форма)
Phe фенилаланин Trp триптофан
Pi неорганический ортофосфат TTP тимидинтрифосфат
PPi неорганический пирофосфат Tyr тирозин
Pro пролин U урацил
RNA (РНК) рибонуклеиновая кислота UDP уридиндифосфат
mRNA (мРНК) информационная (матричная) UMP уридинмонофосфат
РНК UTP уридинтрифосфат
rRNA (pPHK) рибосомная РНК Val валин
tRNA (тРНК) транспортная РНК
Именной указатель Варбург О. (Warburg О.) II: 24, 96
Вейн Дж. (Vane J.) III: 298
Вейсс С. (Weiss S.) III: 52
Ануин Н. (Unwin N.) I: 222
Веннесланд Б. (Vennesland В.) II: 62
Анфинсен X. (Anfinsen С.) I: 38, 40; III: 240
Вестхеймер Ф. (Westheimer F.) II: 62
Арбер В. (Arber W.) III: 38, 240
Виноград Дж. (Vinograd J.) III: 20
Арнольд У. (Arnold W.) II: 185
Вуд В. (Wood W.) III: 173
Арнон Д. (Arnon D.) II: 188
Аткинсон Д. (Atkinson D.) II: 20
Аттер М. (Utter M.) II: 107 Габер Ф. (Haber F.) II: 230
Афзелиус Б. (Afzelius В.) III: 278 Гарден A. (Harden A.) II: 23
Гатано С. (Hatano S.) III: 272
Гауровиц Ф. (Haurowitz F.) I: 76
Балтимор Д. (Baltimore D.) III: 180
Гаффрон Г. (Gaffron H.) II: 185
Баркрофт Дж. (Barcroft J.) I: 73
Геллерт M. (Gellert M.) III: 33
Бенеш Р. и Рут (Benesch R., Ruth) I: 73
Гензеляйт К. (Henseleit К.) II: 164
Бензер С (Benzer S.) III: 77
Герарт Дж. (Gerhart J.) II: 264
Беннет К. (Bennett С.) III: 249
Гиббонс Я. (Gibbons J.) III: 278
Бенс-Джонс Г. (Bence-Jones Н.) III: 242
Гиббс Дж. (Gibbs J.W.) II: 7
Берг П. (Berg Р.) II: 141
Гилберт У. (Gilbert W.) III: 39, 115
Бергстром С. (Bergstrom S.) III: 297
Гирке Э. фон (von Gierke E.) II: 129
Бернал Дж. (Bernal J.) I: 63; III: 292
Голдстайн Дж. (Goldstein J.) II: 218
Бернет M. (Burnet M.) III: 240, 255, 257
Голл Дж. (Gall J.) III: 140
Бернстил M. (Birnstiel M.) III: 141
Грин Д. (Green D.) II: 143
Блобел M. (Blobel G.) III: 158
Грин M. (Green M.) III: 239
Блоу Д. (Blow D.) I: 154
Гринберг Дж. (Greenberg G.) II: 257
Блох К. (Bloch К.) II: 212
Гриффит Ф. (Griffith F.) III: 7
Бор К. (Bohr Ch.) I: 72
Гросс Э. (Gross E.) I: 30
Браун Д. (Brown D.) III: 141
Грюнберг-Манаго M. (Grunberg-Manago M.) III:
Браун M, (Brown M.) II: 218
70
Браунли Дж. (Brownlee G.) III: 158
Гулемин P. (Guillemin R.) III: 295
Браунштейн A. (Braunstein A.) II: 162
Гэррод A. (Garrod A.) II: 176
Браше Ж. (Brachet J.) III: 46
Бреннер С. (Brenner S.) III: 49, 68
Бриттен P. (Britten R.) III: 138 Дальтон Дж. (Dalton J.) I: 25
Брэгг Л. (Bragg L.) I: 64 Де-Ланж P. (De-Lange R.) III: 129
Бухнер Г (Buchner H.) II: 23 Де Лусия Паула (DeLucia Paula) III: 27
Бухнер Э. (Buchner E.) II: 23 Диккенс Ф. (Dickens F.) II: 96
Бьюкенен Дж. (Buchanan J.) II: 257 Диккерсон Р. (Dickerson R.) II: 88
Бэйлисс У. (Bayliss W.) III: 282 Динцис Г (Dintzis H.) III: 98
Доти П. (Doty P.) III: 50
Дрейер У. (DreyerW.) III: 249
Вагелос П. (Vagelos P.) II: 151
Дэвис Д. (Davies D.) III: 244
Валентайн P. (Valentine R.) III: 239
Ван-Нил К. (Van Niel C.) II: 186
Ерне H. (Jerne N.) III: 240, 255
Именной
364 указатель Жакоб Ф. (Jacob F.) III: 48, 49, 113, 114
Зимм Б. (Zimm В.) III: 18 Липман Ф. (Lipmann F.) II: 17; III: 109
Липском У. (Lipscomb W.) I: 145; II: 266
Ингенхауз Я. (Ingenhousz J.) II: 182 Листер Дж. (Lister J.) I: 167
Ингольд К. (Ingold С.) II: 69 Локк (Lock) III: 257
Ингрем В. (Ingram V.) I: 92 Любимова М.Н. III: 263
Йонг У. (Young W.) II: 23; III: 347

Майер Ю. (Mayer J.) II: 183


Мак-Карти M. (McCarty M.) III: 8, 10
Кабат Э. (Kabat E.) III: 243
Мак-Коннелл Г. (McConnell H. M.) I: 224
Кальвин М. (Calvin М.) II: 193
Мак-Леод К. (Mac Leod C.) III: 8. 10
Кан P. (Cahn R.) II: 69
Макнаб P. (Macnab R.) III: 351, 352
Капоши М. (Kaposi M.) III: 36
Марголиаш Э. (Margoliash E.) II: 90
Карновский М. (Karnovsky M.) III: 322
Мармур Дж. (Marmur J.) III: 50
Картье Ж. (Cartier J.) I: 186
Мартиус К. (Martius С) II: 66
Каспар Д. (Caspar D.) III: 168
Мейергоф О. (Meyerhof О.) II: 24
Касперсон Т. (Caspersson Т.) III: 46
Ментен М. (Menten M.) I: 1 1 1
Катц Б. (Katz В.) III: 331
Мерфи В. (Murphy W.) II: 170
Кватреказас П. (Cuatrecasas P.) III: 293
Меселсон М. (Meselson M.) III: 15, 49
Кейзер А. (Kaiser А.) III: 122
Миллер О. (Miller О.) III: 141
Кейлин Д. (Keilin D.) II: 76
Милстайн Ц. (Milstein С) III: 158, 241
Кельвин (Kelvin) II: 62
Мино F. (Minot G.) II: 170
Кендрью Дж. (Kendrew J.) I: 50
Митчелл П. (Mitchell P.) II: 79, 91; III: 314
Кеннеди Ю. (Kennedy E.) II: 141; III: 313
Михаэлис Л. (Michaelis L.) I: 109, 111
Келлер Дж. (Koller G.) III: 241
Моно Ж. (Monod J.) I: 118; III: 48, 49, 113, 114
Клуг A. (Klug A.) III: 91, 168
Мюллер П. (Mueller P.) I: 207
Кнооп Ф. (Knoop F.) II: 66, 141
Мюллер-Хилл Б. (Muller-Hill В.) III: 115
Коллман Дж. (Collman J.) I: 59
Мэксэм A. (Maxam A.) III: 39
Корана Г. (Khorana H.) III: 72, 74
Кори Г. (Cori G.) II: 24, 115, 129; III: 282
Кори К. (Cori С.) II: 24, 115, 128; III: 282 Натанс Д. (Nathans D.) III: 38
Кори P. (Corey R.) III: 33 Нахмансон Д. (Nachmansohn D.) III: 334
Корнберг А. (Kornberg A.) III: 21, 22 Нидергерке P. (Niedergerke R.) III: 261
Корнберг P. (Kornberg R.) I: 223; III: 129 Николсон Г. (Nicolson G.) I: 218
Кошланд Д. (Koshland D.) I: 121, 148; II: 38; Ниренберг M. (Nirenberg M.) III: 69, 70, 72, 75
III: 351 Нойберг К. (Neuberg C.) II: 24
Краут Дж. (Kraut J.) I: 160 Номура M. (Nomura M.) III: 98
Кребс Г. (Krebs H.) II: 18, 66, 164
Кребс Э. (Krebs E.) III: 287 Огстон A. (Ogston A.) II: 61
Крик Ф. (Crick F.) III: 11, 67, 68, 168 Оказаки P. (Okazaki R.) III: 31
Кэмпбелл А. (Campbell A.) III: 185 Осава Ф. (Osawa F.) III: 272
Кэрнс Дж. (Cairns J.) III: 27 Отто Дж. (Otto J.) I: 173
Кюне Ф. (Kuhne W.) II: 24 Очоа С. (Ochoa S.) II: 143; III: 70

Леви A. (Loewy A.) III: 272 Палад Г. (Palade G.) II: 72


Леви-Монтальчини Рита (Levi-Montalcini R.) III: Пардью M. (Pardue M.) III: 140
300 Парк Дж. (Park J.) III: 225
Ледер Ф. (Leder P.) III: 251 Парнас Я. (Parnus J.) II: 24
Ледерберг Дж. (Lederberg J.) III: 202, 224, 225 Пастер Л. (Pasteur L.) II: 23, 284
Лелуа Л. (Leloir L.) II: 120 Перутц M. (Perutz M.) I: 50, 63
Леман P. (Lehman R.) III: 26 Полинг Л. (Pauling L.) I: 33, 90, 101, 142; II: 240
Ленинджер A. (Lehninger A.) II: 141 Поляк Р. (Poljak R.) III: 244
Лёвенштейн В. (Loewenstein W.) III: 322 Портер P. (Porter R.) III: 237, 239
Ли Ч. (Li С.) III: 296 Прелог В. (Prelog V.) II: 69
Линд Дж. (Lind J.) I: 186
Линен Ф. (Lynen F.) II: 143, 174 Именной
Липкин Д. (Lipkin D.) III: 284 указатель 365
Пристли Дж. (Priestley J.) II: 181 Уотсон Дж. (Watson J.) III: 11, 32, 81, 168
Пташне М. (Ptashne M.) III: 122 Уэбстер Д. (Webster D.) II: 225-226
Пфеффер В. (Pfeffer W.) III: 349 Уэйкил С. (Wakil S.) II: 149

Филлипс Д. (Phillips D.) I: 133


Раус П. (Rous P.) III: 186
Фишер Э. (Fischer E.) I: 110; II: 123
Ревель Ж.-П. (Revel J.-P.) III: 322
Флеминг A. (Fleming A.) I: 132; III: 224
Рейхард П. (Reichard P.) II: 267
Флори X. (Florey H.) III: 224
Рич A. (Rich А.) III: 12, 91
Франклин Розалинда (Franklin Rosalind) III: 11
Роузман С. (Roseman S.) III: 314
Френкел-Конpaт X. (Fraenkel-Conrat H.) III: 169
Рудин Д. (Rudin D.) I: 107
Фуллер Б. (Fuller В.) III: 168
Рэкер Э. (Racker E.) И: 83, 96, 201

Хайяши О. (Hayaishi О.) II: 175


Сабатини Д. (Sabatini D.) III: 158
Хаксли Э. (Huxley A.) III: 261, 266, 327
Сазерленд Э. (Sutherland E.) III: 282
Холдейн Дж. (Haldane J.В.S.) I: 173
Сайденем Т. (Sydenham Т.) II: 274
Харрисон С. (Harrison S.) III: 176
Сатир П. (Satir P.) III: 278
Хендерсон P. (Henderson R.) I: 222
Сведберг Т. (Svedberg T.) III: 48
Хенсон Дж. (Hanson J.) III: 261
Сент-Дьёрдьи A. (Szent-Gyorgyi Albert) II: 66;
Хеппель Л. (Heppel L.) III: 284
III: 265
Херик Дж. (Herrick J.) I: 88
Сент-Дьёрдьи Э. (Szent-Gyorgyi Andrew) III: 264
Херриот P. (Herriott R.) III: 9
Сиденхем Т. (Sydenham T.) III: 295
Херши A. (Hershey A.) III: 9, 10
Сингер Дж. (Singer J.) I: 218
Хехт З. (Hecht S.) III: 340
Синсхеймер P. (Sinsheimer R.) III: 16
Хёрвиц Дж. (Hurwitz J.) III: 52
Скоу Й. (Skou J.) III: 306
Хилл P. (Hill R.) II: 187
Слэк Х. (Slack С.R.) II: 198
Ходжкин A. (Hodgkin A.) III: 327
Смит Г. (Smith H.) III: 38
Ходжкин Д. (Hodgkin D.) I: 63; II: 170; III: 292
Снелл Э. (Snell E.) II: 162
Холдейн Дж. (Haldane J. В. S.) I: 173
Соссюр Т. де (de Sassure Т.) II: 182
Холли Р. (Holley R.) III: 90
Спигелман С. (Spiegelman S.) III: 50, 183
Холлидей P. (Holliday R.) III: 201
Стайнер Д. (Steiner D.) III: 291
Хорекер Б. (Horecker В.) II: 96
Сталь Ф. (Stahl F.) III: 15
Худ Л. (Hood L.) III: 251
Старлинг Э. (Starling E.) III: 282
Хьюбер P. (Huber R.) I: 162
Стеккениус В. (Stoeckenius W.) II: 200, 201
Хэч M. (Hatch M.D.) II: 198
Стромингер Дж. (Strominger J.) III: 225
Строуд P. (Stroud R.) I: 162
Сэнгер Ф. (Sanger R.) I: 26, 29; III: 41, 290 Цвет М. (Tswett M.) I: 93
Цукеркандл Э. (Zuckerkandl E.) I: 101
Татум Э. (Tatum) III: 202
Тейлор Э. (Taylor E.) III: 265 ЧансБ. (Chance В.) II: 81
Темин Х. (Temin H.) III: 189, 190 Чаргафф Э. (Chargaff E.) III: 14
Тонегава С. (Tonegawa S.) III: 249, 251 Чейз Марта (Chase Martha) III: 9, 10
Торричелли Э. (Torricelli E.) I: 70 Чейн Э. (Chain E.) III: 224
Тэлмедж Д. (Talmage D.) III: 255
Шанже Ж.-П. (Changeux J.-P.) I: 118
Уайман Дж. (Wyman J.) I: 118 Шахман X. (Schachman H.) II: 264
Уилкинс M. (Wilkins M.) III: 11 Шемин Д. (Shemin D.) II: 248
Уилсон И. (Wilson I.) III: 336 Шестранд Ф. (Sjostrand F.) II: 72
Уильяме P. (Williams R.) III: 169
Уитеринг У. (Withering W.) III: 310
Уиткоп Б. (Witkop B.) I: 30 Эбаши С. (Ebashi S.) III: 269
Уолд Дж. (Wald G.) III: 343 Эдгар P. (Edgar R.) III: 173
Уолш Д. (Walsh D.) III: 287 Эдельман Дж. (Edelman G.) III: 238, 244
Эдман П. (Edman P.) I: 30
Именной Эдмундсон A. (Edmundson A.) III: 248
366 указатель Эйвери О. (Avery O.) III: 8, 10
Эймс Б. (Ames В.) III: 82 Ягендорф А. (Jagendorf А.) II: 191
Эмбден Г. (Embden G.) II: 24 Янофски Ч. (Janofsky С) III: 77, 118
Эмерсон P. (Emerson R.) II: 185, 187 Ярдецкий О. (Jardetzky О.) III: 309
Энгельгардт В. А, III: 263
Эфрусси Б. (Ephrussi В.) III: 137

Указатель латинских названий


Amantia phalloides III: 146, 147 -pol-мутанты III: 27, 28
Bacillus brevis III: 107 Haemophilus influenzae III: 38, 178
Bombix mori III: 144 Halobacterium halobium I: 221
Clostridium histolyticum I: 191 Micrococcus lysodeikticus I: 132
Corynebacterium diphteriae III: 155 Penicillum III: 224
Dichapetalum cymosum II: 63 Physarum polycephalum III: 64, 272
Drosophila melanogaster III: 80, 128, 143, 144 Rhizobium III: 230
- virilis III: 140 Rhizopus I: 166
Electrophorus III: 332 Salmonella III: 82-84
Escherichia coli III: 19, 22, 34, 51-55, 60, 116 - typhimurium III: 226, 227, 229
- ДНК III: 28-31 -- жгутики III: 350
- конъюгация III: 197 Streptomyces III: 61
- мРНК III: 47 Strongуlocentrotus purpuratus III: 144
- оболочка III: 226 Torpedo III: 332
- рибосомы III: 97 Vibrio cholerae III: 289
- тРНК III: 48 Xenopus III: 151
- хеморецепторы HI: 349 - laevis III: 143
- электрофорез белков I: 26
-- транспорте ионов III: 270-271, 304, 306-308,
Предметный указатель 311-312
Аденозинтрифосфатаза см. АТРаза
Адреналин II: 122-123, 248, 292; III: 282, 284,
Абеквоза III: 228 339
Авидин II: 114 Адреногенитальный синдром см. Вирилизм
Агглютинин I: 214 Адренодоксин II: 222
Адаптация при зрении III: 345 Адренокортикотропный гормон (АКТГ) I: 47;
-- хемотаксисе III: 352 II: 222
Адапторная молекула III: 67-68 β-Адренэргические рецепторы III: 286
Аденилат см. Аденозин-5'-монофосфат Азасерин II: 279
Аденилатдезаминаза II: 273 Азид II: 81
Аденилаткиназа II: 10, 264; III: 271 Азотистая кислота III: 81-82
Аденилаттрансфераза II: 247; III: 285-287 Азотистые основания. См. также Пиримидины,
Аденилатциклаза в жировой ткани II: 140 Пурины
- и обмен гликогена II: 123 -- номенклатура II: 255-257; III: 6, 24
- стимуляция холерным токсином III: 289 -- пары III: 11-15, 19-20
Аденилилтрансфераза II: 246-247 Азотистый баланс II: 233
Аденилирование II: 246-247, 283 Азотфиксация II: 230-232
Аденилосукцинат II: 260 Аконитаза II: 50, 63-64
Аденин II: 255-257; III: 6, 13, 14 Аконитат II: 50, 51
- таутомерные формы III: 81, 82 Акридины III: 82
Аденин-фосфорибозилтрансфераза II: 261 Аксонема III: 277-279
S-Аденозилгомоцистеин II: 238 Аксоны III: 300, 327
S-Аденозилметионин II: 204, 207, 237-239; III: АКТГ см. Адренокортикотропный гормон
60, 150, 171, 352 Активный транспорт III: 304-306
Аденозин II: 255-257 - центр I: 109-110
Аденозиндифосфат (ADP) II: 10, II, 256 -- карбоксипептидазы А I: 146
Аденозиндифосфат, рибозилирование III: 156, -- лизоцима I: 134, 140
289 -- рибонуклеазы S I: 17
Аденозин-3',5'-монофосфат (циклический AMP, -- химотрипсина I: 157-159
сАМР) III: 116-117 Актин III: 261, 263, 265-266, 269-276
- в жировых клетках II: 140 Актиномицин III: 61-64, 116
- и действие гормонов III: 282-289 Актомиозин III: 265
-- обмен гликогена II: 122-123, 125-128 Акцелерин I: 175
Аденозин-5'-монофосфат (AMP) II: 10, 256, 259- Алании I: 20; II: 167, 233-234
260 Аланин-аминотрансфераза II: 160
Аденозинтрифосфат (АТР) II: 10-13, 141, 255, Аланиновая тРНК III: 94-95
256, 280-281 Алкаптонурия II: 176
- в мышцах III: 270-271 Алкенильный эфир глицерола II: 208
-- ресничках III: 278, 279 Алкогольдегидрогеназа II: 36
- образование при гликолизе II: 31-33 Аллантоиказа II: 275
--- окислении жирных кислот II: 144-145 Аллантоин II: 273, 275
--- окислительном фосфорилировании II: 71, Аллантоиновая кислота (аллантоат) II: 273, 275
78-81, 83-84 Аллантоиназа II: 275
--- фотосинтезе II: 190-194, 200 Аллельное исключение III: 252
- при генетической рекомбинации III: 200 D-Аллоза II: 46
-- репликации ДНК III: 32-33 Аллоксан III: 295
Аллолактоза III: 112
Предметный Аллопуринол II: 276
368 указатель Аллостерические белки I: 69, 75, 77, 84
-взаимодействия I: 106, 118-122; II: 282-283 Аминосахара I: 193
- свойства гемоглобинов I: 69-87 Амитал II: 81
+
- ферменты I: 118-122; II: 34-35, 123-125, 264- Аммоний (NH4 ) II: 160-166, 230-232
268 Аммоникс I: 210
Аллостерический активатор II: 120 Аммонотелические организмы II: 164
Аллостерическое ингибирование I: 116, 120 Амниоцентез II: 212
- различие III: 242 Амплификация II: 128; III: 141, 145
Альдимины II: 162, 163 Амфипатические соединения 1: 204
Альдозы II: 24, 29, 46 Анаболизм II: 205
Альдолаза II: 30, 38-39 Анаболические пути II: 21
- при фотосинтезе II: 195-196 Аналоги оснований III: 24, 81, 83
Альдоль-гистидиновый комплекс I: 190 Анаплеротические реакции II: 64, 108
Альдольная конденсация I: 190 Ангстрем I: 34
Альдольное расщепление II: 27 Андерсена болезнь II: 130
D-Альтроза II: 46 Андрогены II: 221-224
α-Аманитин III: 146-147 Андростендион II: 223, 224
Аметоптерин II: 270; III: 189 Анемия I: 88-90; II: 103, 170, 172
Амидная связь I: 23 Анионный канал I: 213
Амилозы II: 131 Антибиотики III: 304, 316-320. См. также по
Амилопектин II: 131 названиям
Аминоакрилат II: 163 - как ингибиторы транскрипции III: 61-62
Аминоациладенилат III: 88 - устойчивость к ним III: 205-206
Аминоацил-АМР III: 89 Антибиотики-каналообразователи III: 317
Аминоацил-тРНК III: 87-89, 103 Антибиотики-переносчики III: 316, 318
- гибридная III: 93 Антигемофильный фактор I: 173
Аминоацил-тРНК-синтетаза III: 88-90, 100 Антиген (иммуноген) III: 234
Аминоацильный участок (А-участок) III: 102-104 Т-Антиген III: 151
γ-Аминобутират см. γ-Аминомасляная кислота Антиген-антитело, комплексы III: 238, 256
Аминобутират-глутамат-аминотрансфераза III: Антигенная детерминанта III: 234
340 Антиген-связывающие участки антител III: 236-
5-Аминоимидазолрибонуклеотид II: 259 237, 240, 245-246
Аминокислотные остатки I: 81-83 Антидот III: 336-337
-- в гемоглобине I: 65-66 Антикоагулянты I: 170, 176
- последовательности в адренокортикотропном Антикодон III: 68, 91-95
гормоне I: 47 Антикодоновая петля III: 91, 93
--- белках I: 26-27, 37-39, 63; III: 7 Антимицин А II: 80, 81
--- гемоглобине I: 63-65 Антипараллельный слой II: 37
--- гликофорине I: 216 Антипорт III: 312-313
--- иммуноглобулинах III: 240-244 Антисыворотка III: 236
--- инсулине I: 27 Антитела см. Иммуноглобулины
--- лизоциме I: 35 Антитромбин I: 175
--- миоглобине I: 56, 63 Антранилат II: 241, 242
--- рибонуклеазе I: 39 АПБ см. Ацилпереносящий белок
--- эпидермальном факторе роста III: 301 Апомиоглобин I: 62-63
-- гомологичные участки I: 63; III: 244 Апопротеин I: 48
Аминокислоты I; 19-23, 32; II: 160-179, 247-248; Арабиноза II: 46; III: 117
III: 68-69, 75, 87-89 Арабинозный оперон III: 117-119
- в гистонах III: 129 Арабино-изомераза III: 116, 117
- D-изомеры I: 20; III: 219 Арахидат II: 139
- N-концевые I: 28-30 Аргиназа II: 164
- незаменимые II: 230, 233-234, 239 Аргинин I: 21, 22; II: 169
- способность к образованию водородных свя- - в цикле мочевины II: 164—165
зей I: 123-124 Аргининосукциназа II: 165
- транспорт III: 312-313 Аргининосукцинат II: 164—165
- рК I: 45, 46 Аргининосукцинат-синтетаза II: 164
δ-Аминолевулинат II: 249 Арсенат II: 41
δ-Аминолевулинат-синтетаза II: 249 1-Арсено-3-фосфоглицерат II: 41
γ-Аминомасляная кислота (ГАМК) II: 274; III: Асимметрия биологических мембран I: 200, 214,
338-340 219
Аминопептидаза III: 105 - системы транспорта Na + и К+ I: 219
β-Аминопропионитрил I: 190
Аминоптерин II: 270 Предметный
2-Аминопурин III: 81 указатель 369
Аскорбиновая кислота (витамин С) I: 181, 186, AMP см. Аденозин-5'-монофосфат
187 АТ-пары III: 13, 20
Аспарагин I: 21, 22; II: 168, 234 АТР см. Аденозинтрифосфат
Аспартат I: 21, 22; II: 233-234 ATP-ADP-транслоказа II: 86
- в биосинтезе пиримидинов II: 262 АТРаза в митохондриях II: 84
-- цикле мочевины II: 164—165 -- мышцах III: 264-266
- трансаминирование II: 168-169 - и транспорт ионов III: 306-313
Аспартат-карбомоилтрансфераза II: 262
Аспартат-транскарбамоилаза (АТКаза) II: 264-
266 БАК см. Белковый активатор катаболизма
β-Аспартилфосфат III: 307 Бактерии, ДНК в них III: 19, 20, 100, 218-232
Аспирин (ацетилсалицилат) III: 298, 299 - конъюгация III: 197, 201-205
Атеросклероз II: 220 - пространственный градиент III: 351-352
Атрактилозид II: 86 - хеморецепторы III: 349-353
Аттенуация III: 59, 119-120 - экспрессия эукариотических генов III: 212-213
Аутоиммунное заболевание III: 338 Бактериородопсин I: 221-222; II: 200-201
Афинная метка I: 157-158; III: 243 Бактериофаги см. Фаги
- хроматография I: 25-26; III: 236 Бактериохлорофилл II: 189
Ацетальдегид II: 36 Бацитрацин III: 161
Ацетат I: 10; III: 334 Белки I: 18-47; III: 154-159. См. также по на-
N-Ацетилгалактозамин I: 214 званиям
N-Ацетилглюкозамин (NAG) I: 133, 137, 138, 214 - вирусов III: 179-180, 183
- в клеточной стенке бактерий III: 219, 221 - вспомогательные (морфопоэтические) III:
N-Ацетилглюкозамин-1-фосфат III: 221 173-174
Ацетилкоэнзим А см. Ацетил-СоА - дестабилизирующие спираль ДНК III: 33
Ацетиллипоамид II: 57 - ковалентная модификация I: 105-106; II: 283
N-Ацетилмурамовая кислота (NAM) I: 133 - кодируемые вирусом SV-40 III: 188
- в клеточной стенке бактерий III: 219-223 - конформация I: 32-34, 38, 40-42, 120
N-Ацетилнейраминат II: 209, 210 - мембран I: 208-218; III: 156-158, 326
Ацетил-трансацетилаза II: 151, 152 - митохондрий III: 159
Ацетилфосфат II: 12 - при талассемии III: 154
Ацетилхолин III: 330-334 - рекомбинации (recА, recВ, recС, recВС) III: 200
Ацетилхолиновый рецептор III: 332-338 - рибосом III: 158
Ацетилхолинэстераза I: 114, 157; III: 330, 334- - секреторные III: 156-158
336, 338 - синтез III: 76, 87-110. См. также Трансля-
Ацетильные группы II: 16 ция, Рибосомы
Ацетил-СоА II: 5, 16, 49, 287-288 -- в бактериях III: 100-102
- и жирные кислоты II: 143-144, 149 - содержащие негемовое железо II: 32, 75. См.
-- синтез ацетилхолина III: 330 также Железопротеины
- образование из лейцина II: 174 Белки соединительной ткани I: 179-198
--- пирувата II: 49 - фагов III: 124, 183
-- при диабете III: 294 - хлоропластов III: 159
Ацетил-СоА—карбоксилаза II: 149-151, 286 Белки-антидетерминаторы III: 59
Ацетоацетат II: 147-148, 174, 294 Белковый активатор катаболизма (БАК) III: 116,
- при диабете III: 294 117
Ацетоацетил-АПБ II: 152 Cro-белок III: 124
Ацетоацетил-СоА II: 147, 166 Fe-S-белок см. Железосеропротеины
Ацетон II: 147; III: 194 G-белок III: 286-287
Ациладенилат I: 141-142, 161 HPr-белок III: 315
Ацилирование I: 156, 159 Mo-Fe-белок II: 231
Ацилкарнитин II: 143 recА-белок III: .200
Ацил-коффермент А см. Ацил-СоА rep-белок (хеликаза) III: 33
Ацилпереносящий белок (АПБ) II: 151 ρ-белок (ρ-фактор) III: 58-60
N-Ацилсфингозин II: 208 Белые мышцы III: 271
Ацил-АМР II: 142 Бензилпенициллин III: 224, 226
Ацил-СоА I: 35-36; II: 142-145 Бензойная кислота II: 141
Ацил-СоА-дегидрогеназа II: 144 Бенс-Джонса белок III: 242
Ацил-СоА: карнитин-ацилтрансфераза II: 143 Бери-бери II: 60
Ацил-СоА-синтетаза II: 141 Бесклеточная система III: 70, 151, 155
Ацил-СоА-холестерол-ацилтрансфераза II: 220 Бетаин II: 238
Бехангат II: 139
Предметный Библиотека ДНК III: 211-212
370 указатель Бикарбонат см. Диоксид углерода
Биливердин II: 251 - К2 I: 170; II: 226
Билирубин II: 251-252 Витамины II: 17-18. См. также по названиям
Бимолекулярный слой (бислой) I: 205-208 Вода I: 10, 125-127
Биологические процессы, их скорость I: 12 Водород, стереоспецифический перенос II: 62-63
Биотин II: 107-108, 114, 149-150 Водородные связи I: 122-124
Биотинкарбоксилаза II: 150 -- необычные III: 92
Биполярные ионы (цвиттерионы) I: 19 Водоросли II: 193
1,3-Бисфосфоглицерат (1,3-БФГ) I: 15; II: 41-44 Воротный ток III: 330
2,3-Бисфосфоглицерат (2,3-БФГ) I: 73-75, 80-82; Времена биологических процессов I: 11-12
II: 41-44 Временной градиент III: 351-352
Бисфосфоглицератмутаза I: 115; II: 42 Вставочные последовательности (вставки, интро-
Болезнь накопления гликогена II: 131 ны, IS-элементы) III: 78-83, 150-151, 196,
Бонгкрековая кислота II: 86 202, 206-207
Бора эффект I: 72-73, 81-84 ВТМ см. Вирус табачной мозаики
Борсодержащие кислоты I: 178 Вторичная структура I: 37
Брожение II: 23 Вырожденность кода III: 69, 76
5-Бромдезоксиуридин III: 135 -- гипотеза качания III: 94—95
Бромистый циан I: 30, 32 Высокий потенциал переноса фосфатной группы
5-Бромурацил III: 81 II: 11
α-Бунгаротоксин III: 333 Высокоэнергетические связи II: 11-12
Бутирил-АПБ II: 152, 153
Буферная емкость раствора I: 46
БФГ см. Бифосфоглицерат Газовая гангрена I: 191
Галактиол II: 135
Галактоза I: 106; II: 46, 134-135; III: 112
Галактоземия II: 135
Варфарин I: 170, 171 β-Галактозидаза III: 112-113
Ведущая нить III: 31 Галактозидпермеаза III: 112
Векторы для клонирования ДНК III: 207, 210- Галактозилтрансфераза II: 132
211 Галактозо-1-фосфат II: 134
Вернике - Корсакова синдром II: 102 Галактозо-1-фосфат-уридилтрансфераза II: 134,
«Ветвящий» фермент II: 121 135
Вирилизм II: 224-225 Галактокиназа II: 134
Вирус бешенства III: 181 Галактолипиды II: 184
- везикулярного стоматита III: 180-181 Галобактерии II: 200-201
- кустистой карликовости томата III: 176 Галотан II: 111
- папилломы III: 188 Ганглиозиды I: 204; II: 208-211
- полиомиелита III: 179-182 Гаптен III: 234-236, 240
- полиомы III: 186-189 Гаптен-антитело, комплекс III: 236-237
- саркомы Рауса III: 179, 186 Гаптенная детерминанта III: 234
- табачной мозаики (ВТМ) III: 167-173 Гексадеканоат II: 139
--- мутации III: 77 Гекса-NAG III: 137-138
- ящура III: 179 Гексозомонофосфатный путь см. Пентозофос-
- Qβ III: 182, 183 фатный путь
- R17 III: 182, 183 Гексозы I: 25, 46, 47
- SV-40 III: 55, 186-189 Гексокиназа I: 18; II: 28, 29, 38, 43
-- генетическая карта III: 189 Геликаза III: 33
Вирусы, оболочка III: 167-168 Гель-фильтрация I: 25
- перекрывающиеся гены III: 78, 183 Гель-электрофорез см. Электрофорез в полиак-
- РНК-содержащие III: 178-179, 189-190 риламидном геле
- самосборка III: 167-194 Гем I: 48-50; II: 249, 250
Витамин А (полностью-транс-ретинол) II: 17, 18; - в миоглобине I: 56-60
III: 342 - связывание с СО2 I: 60-61
- B1 (тиамин) II: 60 Гем а II: 77
- В2 II: 17 Гем-гем, взаимодействие I: 72
- В6 (пиридоксин) II: 17, 124, 161 Гемоглобин I: 48-87
- В12 (кобаламин) II: 170-172, 238 - гены III: 154-155
- D II: 223-224 - мутации I: 98-100; III: 77. См. также Сер-
- D2 II: 18 повидноклеточная анемия, Талассемия
Витамин D3 II: 223-224 - плода I: 75; III: 154
- Е II: 18
- К I: 170; III: 248 Предметный
- K1 II: 17, 18; III: 248 указатель 371
Гемоглобин А, А2 I: 63 Гидроксикобаламин II: 171
- F I: 63 21-Гидроксилаза I: 1 8 1 ; II: 224-225
- М I: 99 Гидроксиламин I: 32; III: 82, 336
- S I: 90-98 Гидроксилизин I: 180, 182, 192
- α- и β-цепи I: 63-65, 75 3-Гидрокси-3-метилглутарил-СоА II: 147, 174, 213
Гем-оксигеназа II: 251 3-Гидрокси-3-метилглутарил-СоА - редуктаза II:
Геморрагия I: 170, 175 213, 217
Гемофилия I: 172-173 Гидроксиметилирование III: 173
Ген. См. также Гены 5-Гидроксиметилцитозин III: 173
- овальальбумина III: 79, 81 17α-Гидроксипрогестерон II: 224
- фиброина III: 144-145 4-Гидроксипролин I: 22, 180-181, 192
- cro III: 123, 124 5-Гидрокситриптамин II: 248
- i III: 113-114 Гидроксифенилпируват II: 175, 176, 240
- ilv III: 29 n-Гидроксифенилпируват-гидроксилаза II: 175
- J III: 251-252 Гидроксиэтиламинопирофосфат II: 56
- src III: 191-192 Гидролиз I: 104
- trp III: 30 Гидрофильные группы I: 204
Генетическая рекомбинация III: 196-216 Гидрофобные взаимодействия I: 127, 205-206
Генетический код III: 68-69, 75-77 - группы I: 204
Геномы, конструирование III: 196, 207-215 Гипераммонемия II: 166
- области гомологии III: 191, 200 Гипервариабельные участки III: 243, 246
Гены. См. также по названиям Гипертермия II: 1 1 1
- антител III: 248-250 Гиперхолестеролемия II: 219-220
- вирусов III: 120, 121 Гиперхромизм III: 19
- влияние стероидных гормонов III: 298-299 Гипогликемия III: 290
- гемоглобинов III: 154—155. См. также Мо- Гипоксантин II: 259, 273, 276; III: 24, 82
лекулярные болезни Гипоксантин-гуанин - фосфорибозилтрансфераза
- гистонов III: 143, 144 II: 261, 275-276
- клонирование III: 196, 207-209, 214 Гипохромизм III: 138
- коллинеарность III: 77-80 Гирке болезнь II: 129-130
- лимфоцитов III: 249-250 Гистамин I: 60; II: 248
- перекрывающиеся III: 77-79, 182-183 Гистидин I: 21, 22, 56; II: 242, 244
- перестройки III: 196-216 - превращение в глутамат II: 168-169
- разорванное строение III: 78-80, 145-146, 150, - участие в катализе I: 157-159
151 Гистидиновые кодоны III: 120
- рибосомных РНК III: 140-142 - опероны III: 122
- уникальные III: 144—145 Гистидинол II: 244
- фага Т4 III: 172-173 Гистидинолфосфат II: 244
- экспрессия III: 112-125 Гистоны III: 79, 127-130, 132-133, 136-137, 143
- эукариот III: 78, 211-213 Гладкий эндоплазматический ретикулум II: 282
Гепарансульфат I: 193 Гликоген II: 115-137
Гепарин I: 176, 195 Гликоген-синтаза II: 121, 126
Гептануклеотиды III: 140 Гликоген-фосфорилаза (фосфорилазы α и β) II:
Гептозы II: 25; III: 228 116, 117, 123-125
Геранилпирофосфат II: 214-216, 227 Гликозаминогликаны I: 193, 195; III: 163
Гетерогенная ядерная РНК (гяРНК) III: 148-149 Гликозидные связи I: 133; II: 117-118, 255
Гетерокарион I: 215-217 Гликозилирование III: 163
Гетеротропные эффекты I: 120 Гликолат II: 199
Гиалуроновая кислота I: 194, 195 Гликолиз (гликолитический путь) II: 23, 29-45,
Гибридизация (гибриды) ДНК и РНК III: 29, 283
30, 50-52 - наследственные нарушения II: 43-44
- in situ III: 140 N-Гликолилнейраминат II: 209
Гибридомы III: 240-241 Гликолипиды I: 203-205, 214, 216; III: 163
Гидразин I: 47; III: 40 Гликопептид-транспептидаза III: 223
Гидрид-ион II: 39-40 Гликопротеины I: 214-216; III: 159-163. См. так-
Гидроксиапатит (фосфат кальция) I: 189; III: 138 же Коллаген
3-Гидроксиацил-АПБ-дегидратаза II: 152 Гликофорин А I: 213-214
L-Гидроксиацил-СоА II: 144 Гликохолат II: 215
D-3-Гидроксибутират II: 147 Глиоксилат II: 199, 274
D-Глицеральдегид II: 25, 46
Глицеральдегид-3-фосфат II: 30-32, 97, 98
Предметный Глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа II: 31,
372 указатель
39-41, 195 Голодание II: 293; III: 288
Глицерол I: 201-203 Голофермент III: 54, 55
- как предшественник тейхоевой кислоты III: Гольджи аппарат III: 161-163
223 Гомогентизат II: 175
- образование из триацилглицеролов II: 140 Гомогентизатоксидаза II: 175
Глицерол-3-фосфат I: 201; II: 11, 12, 84-85 Гомополипептиды III: 74
- как предшественник фосфатидных кислот II: Гомотропные эффекты I: 120
205 Гомоцистеин II: 238-239
- образование из глицерола II: 140-141 Гомоцистеин-метилтрансфераза II: 238
Глицерол-фосфатацилтрансфераза II: 205 Гормональные регуляторы метаболизма II: 291
Глицерол-3-фосфат-дегидрогеназа II: 84—85 Гормон-рецепторный комплекс III: 299-300
Глицеролфосфатный челночный механизм II: 85 Гормоны III: 282-309. См. также по названиям
Глицилтирозин I: 146-148 - влияние на синтез гликогена I: 122-123
Глицил-тРНК III: 222 ---- лактозы II: 133
Глицин I: 20; II: 235, 257; III: 71, 72, 97 - и активность ферментов I: 106
- в коллагене I: 180, 184 -- циклический AMP III: 282-289
- превращения II: 167 Гош-конформация I: 219
- при синтезе порфирина II: 248 Грама метод окрашивания III: 218
Глицинамидрибонуклеотид II: 258 Грамицидин А III: 316, 320, 321
Глицин-синтаза II: 235 - S III: 107-109
β-Глобин III: 78, 79, 151, 154 Грам-отрицательные бактерии III: 218, 226-232
Глобиновые гены III: 78, 79, 154 Грам-положительные бактерии III: 218-226
Глутамат (глутаминовая кислота) I: 21, 22; II: Граны II: 180
167-169, 232-234 Грибной яд III: 146-147, 276
превращение в ГАМК I I I : 340 Гуанин I: 91; II: 255; III: 6, 13, 14
- распад II: 160-161 Гуанингидрохлорид I: 39
Глутаматаминотрансфераза II: 160 Гуаниннуклеозидсвязывающий белок см. G-бе-
Глутаматдегидрогеназа II: 160-161, 169, 232-233 лок
Глутамат-декарбоксилаза III: 339, 340 Гуанинтрифосфат III: 149
Глутамат-синтетаза II: 233 Гуанозин I: 255, 256; III: 289
Глутамин I: 21, 22; II: 169, 232-233 Гуанозинмонофосфат (GMP) II: 256-260
- в фиброине I: 169 Гуанозин-5'(β,γ-имидо)-трифосфат (Gpp[NH]р)
- как донор азота II; 245 III: 289
Глутаминаза II: 169 Гуанозинмонофосфат (GMP) II: 256-260
Глутамин-синтетаза II: 232-233, 245-247 Гуанозинтрифосфат (GTP) II: 52, 109; III: 102,
Глутатион II: 103-104, 268 103, 289, 347
Глутатионредуктаза II: 103, 105, 268 D-Гулоза II: 46
Глюкогенные аминокислоты II: 167 гяРНК см. Гетерогенная ядерная ДНК
Глюкагон II: 122-123, 291-293; III: 282, 284, GMP см. Гуанозинмонофосфат
286 GTP см. Гуанозинтрифосфат
Глюкоза I: 10; II: 24-27, 46, 105-106, 285; III:
112, 113
- в крови II: 292-293 Дальтон I: 25
- ингибирование синтеза циклического AMP III: ε-Дансиллизин III: 237
116 Дансилхлорид I: 29-30
- и образование АТР II: 86 Дауэкс-50 I: 28
- транспорт III: 312-313 Двигательные концевые пластинки III: 330
Глюкозилирование III: 173 Двойная спираль ДНК (двухцепочечная, двух-
Глюкозо-1,6-бисфосфат II: 119 спиральная ДНК) III: 11-21
Глюкозо-1-фосфат II: 12, 116-122, 285 Двойные связи I: 219-220
Глюкозо-6-фосфат II: 12, 28-30, 286 Двуокись углерода см. Диоксид углерода
-- в глюконеогенезе II: 107 Двухцепочечная ДНК см. Двойная спираль ДНК
-- обмене гликогена II: 118-120, 122 - РНК III: 47, 179, 192-193
-- пентозо-фосфатном пути II: 95-100 Деацилирование I: 155, 156, 159-161
Глюкозо-6-фосфатаза II: 119-120, 129, 130 «Деветвящий» фермент II: 118
Глюкозо-6-фосфат—дегидрогеназа II: 96, 103- Дегидратазы II: 163
105, 285 Дегидратация II: 27, 50
Глюкокортикоиды II: 221-222; III: 299 Дегидроаскорбиновая кислота I: 186
Глюконеогенез II: 105-110, 112, 287 Дегидрогеназы в пентозо-фосфатном цикле см.
- влияние инсулина III: 290 Глюкозо-6-фосфат-дегидрогеназа, 6-
α-D-Глюкопираноза II: 25
Глюкуронат II: 252; III: 7 Предметный
Глюкуронид билирубина II: 252 указатель 373
Фосфоглюконат-дегидрогеназа Деформилаза III: 105
- в цикле трикарбоновых кислот см. Изоцитрат- Дефосфокофермент А II: 272, 273
дегидрогеназа Диабет III: 294
- при гликолизе см. Глицеральдегидфосфатде- Диазосоединения III: 243
гидрогеназа Диализ I: 24, 25
-- окислении жирных кислот II: 145 Дибутирил-сАМР III: 286
-- синтезе аминокислот см. Глутаматдегидро- Дигидробиоптеринредуктаза II: 175
геназа Дигидроксиацетон (кетоза) II: 25, 47, 102
--- жирных кислот см. Малатдегидрогеназа Дигидроксиацетонфосфат II: 30-31, 140-141, 196
-- фосфорилировании окислительном см. 3,4-Дигидроксифенилаланин (ДОФА) III: 339
NADH-дегидрогеназа, Глицерол-3-фос- 3,4-Дигидроксифенилгликольалъдегид III: 340
фатдегидрогеназа Дигидроксифенилэтиламин (дофамин) III: 339
- янтарного полуальдегида III: 340 Дигидроксихолестерол II: 223
7-Дегидрохолестерол II: 225 Дигидролипоамид II: 57, 58
5-Дегидрохолинат II: 240 Дигидролипоиддегидрогеназа II: 57
5-Дегидрошикимовая кислота (5-дегидрошики- Дигидролипоилтрансацетилаза II: 56, 57
мат) II: 240 Дигидрооротаза II: 263
Дезамидо-NAD+ II: 271, 272 Дигидрооротат II: 263
Дезаминирование аминокислот II: 160-163 Дигидросфингозин II: 209
5'-Дезоксиаденозилкобаламин II: 171, 172 Дигидротимин II: 275
Дезоксиаденозин II: 255, 256 Дигидрофолят II: 269
3-Дезоксиарабиногептулозонат-7-фосфат II: 240 Дигидрофолят-редуктаза II: 269
Дезоксигемоглобин I: 75-78, 80-81, 95-96 Дигитоксигенин III: 311
Дезоксинуклеотидил-трансфераза (терминальная Диизопропилфторфосфат (ДИФФ) I: 115, 157,
трансфераза) III: 209 161; III: 335-337
Дезоксирибоза II: 255, 256 Дикумарол I: 170
Дезоксирибонуклеаза III: 173 6-Диметиладенин III: 60
Дезоксирибонуклеиновая кислота (ДНК) I: 15; Диметилаллилпирофосфат II: 214
III: 6-44, 128-147, 196-208. См. также Диметилксантин III: 286
Библиотека ДНК, Двойная спираль ДНК, Динеин III: 277-278
Одноцепочечная ДНК, Рекомбинация Динитрофенильное производное бычьего сыво-
ДНК, Репликация ДНК роточного альбумина (ДНФ-БСА) III: 235
-- клонирование III: 207-214 Динитрофенол (ДНФ) III: 235, 237
-- кольцевая III: 20-21, 29, 184 Диоксигеназа II: 175
-- липкие концы III: 209, 210 Диоксид углерода (двуокись углерода, СО2) в
- нетранскрибируемые и нетранслируемые уча- цикле трикарбоновых кислот II: 53
стки III: 141, 143 -- при глюконеогенезе II: 106-108
- связывание гормон-рецепторного комплекса --- при пентозофосфатном пути II: 95, 100
III: 299-300 --- синтезе жирных кислот II: 149
- эукариотическая III: 133-136, 138 ---- пуринов II: 257
Дезоксирибонуклеозиды II: 255 --- фотосинтезе II: 193-195, 197, 199
Дезоксирибонуклеотидтрифосфаты III: 21-24 -- связывание с кислородом I: 72, 73, 81
Дезоксирибонуклеотиды II: 266 -- транспорт в тропических растениях II: 198
Дезокситимидилат (dTMP) II: 268-269 Дипептиды I: 23, 37
Дезокситимидин II: 255, 256 Дисахарид-дипептидное звено III: 221-223
Дезоксиуридилат (dUMP) II: 268, 269 Дисахариды II: 132
Дезоксицитидин II: 255, 256 Дистальный гистидин I: 56
Декаметоний III: 337 Дисульфидные связи I: 23-24, 38-39; III: 105, 244
Декарбоксилирование II: 49, 51, 96, 109, 152 -- окисление I: 32, 38
Дексаметазон III: 299-300 Дифосфатидилглицерол I: 203
Декстран II: 131; III: 236-237 Дифосфопиридиннуклеотид см. Никотинамид-
α-Декстрин II: 131 адениндинуклеотид
α-Декстриназа II: 131 Дифракция рентгеновских лучей I: 52, 54
Делеции III: 80, 82, 83 Дифтерийный токсин III: 155-156
Денатурация I: 39 Диффузия I: 114, 217-224
Деполяризация III: 330 - облегченная II: 86
Дерматансульфат I: 195 Диэлектрическая постоянная I: 126
Дерматоспараксис I: 188 Ди-NAG I: 142
Десенсибилизация II: 343; III: 331 ДНК см. Дезоксирибонуклеиновая кислота
Десмозин I: 193, 194 ДНК-гираза III: 33
ДНК-зависимая РНК-полимераза III: 53
Предметный ДНК-лигаза III: 26-27, 35
374 указатель ДНК-полимераза РНК-зависимая (обратная
транскриптаза) III: 178, 190 Зимняя спячка II: 88, 91
ДНК-полимеразы I: 105; III: 21-28, 32-35 Зимогеновые гранулы I: 152, 153
- дефектные III: 81 Зимогены I: 105, 152, 160. См, также Профер-
- эукариотические III: 136 менты
ДНК-топоизомераза III: 27-28, 32, 33 Зингиберин II: 226
ДНФ-аминокислоты I: 29 Змеиные яды III: 333
Додекановая кислота (додеканоат) II: 139 Зрительные рецепторы см. Колбочки, Палочки
Додецилдиметиламиноксид (ДДАО) I: 210
Додецилсульфат натрия (ДСН) I: 209-211, 213
Додецилтриметиламмонийбромид I: 210 Иглобрюх III: 328, 329
Докозаноат II: 139 D-Идоза II: 46
Домены I: 38, 162 β-Изгиб I: 37
- антител III: 244-245, 248, 253 Изовалерил-СоА II: 174
Долихол III: 159 Изовалерил-СоА—дегидрогеназа II: 174
Долихолпирофосфат III: 161 Изозимы см. Изоферменты
Долихолфосфат III: 160-161, 221 Изолейцин I: 20; II: 170, 174, 243; III: 89
ДОФА III: 339 Изомеризация II: 28-30
ДОФА-декарбоксилаза III: 339 Изомерия цис-транс (цис-транс-конфигурация)
Дофамин III: 339 I: 219-220; III: 343-344
Дрожжи II: 23-24, 35 Изопентенилпирофосфат II: 212-214, 226
ДСН см. Додецилсульфат натрия Изопрен II: 212
Дупликации генов III: 248-249 Изопреновые единицы III: 211
Дыхание II: 71 Изопропилтиогалактозид III: 112, 113, 115
Дыхательный контроль II: 87-88 Изоферменты II: 112
- коэффициент II: 86 Изоциановая кислота I: 98
Изоцитраза II: 159
Изоцитрат II: 50-51
Еноил-АПБ-редуктаза II: 152 Изоцитратдегидрогеназа II: 51
Еноил-СоА II: 144, 146 Изоэлектрическая точка I: 68, 91
Еноил-СоА-гидратаза II: 144 Икосаэдрическая симметрия III: 168-169, 177
Енол I: 32 Имидазолацетолфосфат II: 244
3-Енолпируватшикимат-5-фосфат II: 240 Имидазолглицеролфосфат II: 244
Енолфосфаты II: 41 4-Имидазол-5-пропионат II: 168
Енолят-анион II: 39 Иминокислоты I: 20
ES-комплекс см. Фермент-субстратные комплек- Иммуноген см. Антиген
сы Иммуноглобулин A (IGA) III: 246, 248
- D (IgD) III: 246
Жгутики III: 277, 350, 351 - Е (IgE) III: 246, 248
Железо I: 49, 78-79 - G (IgG) III: 235-240, 243-244, 246, 247
- в белках см. Железопротеины, Железосеро- - M (IgM) III: 235, 236, 246
протеины Иммуноглобулиновые складки III: 244, 246
Железопорфирин I: 59-60 Иммуноглобулины III: 160, 234-258. См. также
Железопротеины II: 32, 75 Антиген-связывающие участки
Железо-серные комплексы II: 75 - классы II: 246, 248, 253-254
Железосеропротеины (Fe-S-белки) II: 52, 188, 230 - мРНК III: 151
Желчные кислоты II: 215 - трехмерная структура III: 244-245, 247
Жидкостно-мозаичная модель мембран I: 218- Иммунный ответ III: 235, 255
219 Иммунологическая память III: 256
Жир, накопление у перелетных птиц II: 295-296 Иммунофлуоресцентная микроскопия III: 272-
Жирные кислоты I: 220-221; II: 138-159, 286- 275
289, 291 Ингибирование (ферментативных реакций) I:
-- в крови II: 294 114-118
-- незаменимые II: 156; III: 297 - по принципу обратной связи I: 106; II: 243
Жировая ткань II: 100-101, 140, 289-290; III: 298 Индол-3-глицеролфосфат II: 247
Индукторы III: 112-114
Индуцированное соответствие III: 110, 111, 144,
Замена оснований III: 80, 83 148
Заменимые аминокислоты II: 233 Инициаторная РНК III: 100-103
Замораживание-скалывание I: 211 Инициаторный комплекс III: 102
Замораживание - травление I: 211, 212 Инициация синтеза белков III: 76, 101-102, 153
Зарин III: 335, 336
Зеленые серные бактерии II: 186 Предметный
Зимаза II: 24 указатель 375
-- ДНК III: 134 - транспорт III: 270-271, 311-312
-- РНК III: 55-56. См. также Промоторы Кальциферол II: 18
- факторы III: 102, 155, 209 Кальцификация I: 189
Инозин I: 74; III: 95 Канцерогены III: 82-84
Инозинат II: 259 Капсид III: 167, 173
Инозитол I: 202 N-Карбамоиласпартат II: 262
Инсектициды I: 157; III: 335 N-Карбамоилизобутират II: 275
Инсерционная инактивация III: 210 Карбамоиловые эфиры III: 334-335
Инструктивная теория III: 240 Карбомоил-производное гемоглобина I: 83
Инсулин I: 27; II: 291; III: 290-295 Карбамоилфосфат II: 165
- синтез у Е. coli III: 212, 214 - в синтезе пиримидинов II: 262
Инсулинома III: 213 -- цикле трикарбоновых кислот II: 164
Интегральные мембранные белки I: 210, 213; - свободная энергия гидролиза I: 12
III: 326 Карбамоилфосфатсинтаза II: 165, 263-264
Интеграция (в геном эукариотической клетки) Карбанион II: 101, 103
вирусов III: 192 Карбоангидраза I: 81, 104, 114
- фагов III; 120, 184-185 Карбоксибиотин II: 108
Интеркаляция III: 62, 64, 82 Карбоксибиотин-переносящий белок II: 150
Интерферон III: 192-193 γ-Карбоксиглутамат I: 22, 23, 170, 171
Интроны (прерывающие последовательности) Карбоксильная группа II: 108
III: 79-80, 145, 252 Карбоксипептидаза А I: 132
Информационные РНК (мРНК) III: 46-86, 148- Карбоксипротеиназы I: 166
154 1-(о-Карбоксифениламино)-1-дезоксирибулозо-5-
-- антител III: 252, 253 фосфат II: 242
-- синтетические III: 69-71 Карбоний (ион) I: 140, 141
-- трансляция III: 99-100 Карбонилцианид-n-трифторметоксифенилгидра-
Иодацетамид I: 115 зон II: 88
Ионная пара I: 122 Кардиотонические стероиды III: 309-311
Ионные связи I: 122. См. также Солевые связи Карнитин II: 142-143, 290-291
Ионный радиус III: 319, 320 β-Каротин II: 226-227
Ионообменная хроматография I: 25, 28 Каротиноиды II: 226
Ионофоры см. Антибиотики-переносчики Каскадный механизм в обмене гликогена II:
Ионы металлов III: 52. См. также Калий, Каль- 128
ций, Натрий -- при действии гормонов III: 288-289
IS-элементы см. Вставочные последовательно- --- свертывании крови I: 166-167
сти -- регуляторный II: 247
IgA, IgD, IgE, IgG, IgM см. Иммуноглобулин Катаболизм II: 205
A, D, E, G, M Катаболитная репрессия III: 116
Катаболические опероны III: 116-117
- пути II: 21
Калиевые каналы III: 327, 328
Каталаза II: 273
Калиевый потенциал III: 345
+ Катализ I: 104, 140
Калий (ион К ) и возбудимость мембран III:
Каталитическая субъединица II: 265-266
326-328, 331
Каталитические группы I: 109
- связывание с антибиотиками III: 318-320
Катехоламины II: 292; III: 338-339
Калликреин I: 175
Катехол-О-метилтрансфераза III: 339, 340
Кальвина цикл II: 196-199
Катионные каналы III: 331
Кальмедулин III: 287
Каучук II: 226
Кальсеквестрин III: 270
«Качания» гипотеза III: 94-95
Кальциевый насос III: 270
Квазиэквивалентность III: 176
Кальций (ион Са2+), влияние на киназу фос-
Кератансульфат I; 193, 194
форилазы II: 126
Кетимины II: 162, 163
--- межклеточные контакты III: 323, 324
Кетогенные аминокислоты II: 166-167
--- подвижность клеток III: 274
2-Кето-3-дезоксиоктонат III: 228
--- свертывание крови I: 171-172
Кетозо-альдозные изомеризации II: 96
- как медиатор для родопсина III: 345-346
Кетозы II: 25, 47, 294
- при зрении III: 332
Кетоновые тела II: 147-148, 194; III: 294
-- освобождении ацетилхолина III: 332
β-Кетотиолаза II: 144
- регуляция мышечного сокращения III: 269-
Килобазы III: 19
270
Килодальтон I: 25
Киназа фосфорилазы II: 123, 125-127
Предметный Киназы II: 28; III: 191-192, 287, 288
376 указатель Кинин I: 174
Кислород I: 69-72, 79-81 Конформационная гипотеза сопряжения II: 79
- при гидролизе коллагена I: 181 Конформационное равновесие I: 120
-- фотосинтезе II: 186-187, 190 Конфармационное равновесие I: 120
- транспорт I: 48 Конформация кресла I: 32-34, 137; II: 26
Кислота I: 45 - миоглобина I: 55, 57
Клатрин II: 219; III: 161 - полипептидных цепей I: 32-34, 37, 38, 40-42
«Кленового сиропа» болезнь II: 174-175 - связей С—С в мембранах I: 219-221
Клетки, зародышевые линии III: 250 Концевые пластинки III: 332
- метаболизм II: 281-282 Кооперативное связывание I: 119-121
- обкладки сосудистого пучка II: 198-200 - взаимодействие в гемоглобине I: 72, 79-80
- образование антител III: 250-252, 254, 255 --- коллагене I: 184-185
- печени II: 28, 280, 290 --- липидных бислоях I: 205-206
I-клеточная болезнь III: 163 Копропорфириноген II: 249
Клеточная подвижность III: 271-272, 276. См. Корепрессор III: 118
также Микротрубочки Кори болезнь II: 130
- стенка (оболочка) бактерий I: 132-133; III: - цикл II: 112
218-232 Корриновое кольцо (ядро) II: 170, 171
Клеточные мембраны I: 199-224; III: 304. См. Кортизол II: 223; III: 284
также Белки мембран, Постсинаптиче- Кортикостерон II: 223
ская мембрана Кортикотропин II: 222; III: 296, 297
-- асимметрия III: 163 Кор-фермент III: 55, 56
-- возбудимые III: 326-355 Кость I: 189
-- проницаемость для Na+ и К+ III: 326-329 Котранспорт III: 312
-- реконструкция II: 201 Кофакторы цикла трикарбоновых кислот II: 55
-- текучесть I: 219-221 Кофеин III: 286
-- эндоплазматического ретикулума II: 156 Кофермент А II: 16, 17, 272
Клеточный цикл III: 136 - Q II: 75-76, 81
Клональная селекция III: 255-257 «Красное падение» II: 187
Клонированная ДНК, библиотека III: 211-212 Красные мышцы III: 271
Клонированные гены III: 196, 207-209, 214 Крахмал II: 131-132
Клострипаин I: 32 Крахмальный гель I: 92
«Ключ-замок», модель ферментативного ката- Креатин III: 270
лиза I: 110 Креатинкиназа III: 270
Кобаламин II: 170-172 Креатинфосфат II: 12, 13
Кобальт II: 170-171 Кребса цикл см. Цикл трикарбоновых кислот
Кобратоксин III: 343 «Кривые Cot» III: 139
Ковалентная модификация I: 105-106, 283 Криоэнзимология I: 136
Кодоны III: 68, 75 Кристаллизация I: 50
- не кодирующие аминокислот III: 75 Кристмас-фактор I: 173-175
- синонимические III: 76 Кристы II: 72
- узнавание антикодона III: 94-95 Кротонил-АПБ II: 152, 153
Козимаза II: 24 Крысиные яды I: 170; II: 63
Колбочки III: 340, 347-348 Ксантин II: 273
Колицин III: 202 Ксантиноксидаза II: 273
Колициногенные факторы III: 202 Ксантиолат II: 290
Коллаген I: 19, 179-192 Ксантобиотические соединения II: 222
Коллагеназы I: 191-192 Ксенопус III: 141
Колхицин III: 277 D-Ксилоза II: 46
Компартменты I: 199, 222; II: 283-284 D-Ксилулоза II: 47
Комплемент I: 173; III: 238 Ксилулозо-5-фосфат II: 97-98, 196
Комплементарная ДНК (кДНК) III: 213 Ксилулозо-6-фосфат III: 117
Кональбумин III: 146 Кулона закон I: 122
Конвергентная эволюция III: 348 Кумулятивная регуляция по типу обратной свя-
Конденсирующий фермент II: 50 зи II: 245
Конканавалин А I: 26, 214 Кi I: 116-117
Конкатамеры III: 174-175 Км см. Константа Михаэлиса
Конкурентное ингибирование I: 115-118 CoQ см. Кофермент Q
Коннексоны III: 323
Константа диссоциации I: 86, 113
- Михаэлиса (Км) I: 111-114
Константные участки (С-области) III: 241-244,
249, 253-254 Предметный
Конститутивные мутанты III: 113 указатель 377
α-Лактальбумин II: 132 β-Липотропин III: 296
β-Лактамное кольцо III: 224, 225 Люмиродопсин III: 344
Лактат II: 36, 111-112 Lac см. Лактоза
Лактат-дегидрогеназа II: 36, 111-112 Lac-оператор см. Лактозный оператор
Лактоза I; 106; II: 132-133; III: 112-114 Lac-оперон см. Лактозный оперон
Лактозный аналог тетра-NAG I: 142 Lac-репрессор см. Лактозный репрессор
- оператор (lac-оператор) III: 115-117
- оперон (lас-оперон) III: 114-117
2+
- репрессор (lас-репрессор) III: 115-117 Магний (ион Mg ) II: 28, 29
Лактозо-синтаза I: 106; II: 132-133 Мак-Ардля болезнь II: 130
Лактоназа II: 96 Макрофаги II: 207; III: 271
Ламеллиподии III: 271 Макроэргические соединения см. Высокоэнерге-
Ланостерол II: 214 тическая связь, Высокоэнергетические фос-
Латеральная диффузия I: 218 фаты
Латиризм I: 190 Малат II: 52, 53, 155, 198
Лаурат II: 139 Малат-аспартатный шунт II: 85
Леггемоглобин II: 232 Малат-дегидрогеназа II: 53, 155
Легкие цепи (L-цепи) III: 238-244 Малат-синтетаза II: 159
Лед I: 126 4-Малеилацетоацетат II: 175
Лейкемия II: 270 Малонат I: 115, II: 67
Лейкины I: 214 Малонил-АПБ II: 151-152
Лейкоциты I: 49 Малонил-трансацилаза II: 151, 152
Лейцин I: 20; II: 173-174; III: 71 Малонил-СоА II: 151, 152
Лейцин-энкефалин III: 296 Мальтаза II: 132; III: 229
Лекарственная идиосинкразия III: 338 Малярия I: 97; II: 104
Летальный синтез II: 63 D-Манноза II: 46
Леша-Нихана синдром II: 276-277 Маннозо-6-фосфат III: 163
Лиазы II: 155 Марганец II: 188
Лигноцерат II: 139 Масла II: 226
Лидерная мРНК III: 119-120 Матрикс II: 71, 72
Лизилгидроксилаза I: 181 Матричная РНК (мРНК) см. Информационные
Лизилоксидаза I: 190 РНК
Лизин I: 21, 22 Мевалонат II: 212-214
Лизинонорлейцин I: 193 Медиаторы III: 345
Лизогенизация III: 120 Медь I: 192; II: 191
Лизогенизирующие фаги III: 202, 204 Межгенная супрессия III: 96
Лизогенный цикл III: 122 Межклеточное соединение III: 305
Лизосомы I: 166; II: 210-211, 219; III: 163 - узнавание I: 215
Лизофосфатидат II: 205 Межклеточные каналы III: 321, 322
Лизоцим I: 132-144; III: 173 Меланин II: 177
Ликопин II: 226, 227 Мембранные везикулы II: 201; III: 312
D-Ликсоза II: 46 - липиды I: 201-207
Лимонен II: 226 Мембранный потенциал II: 79-80; III: 304, 313,
Лимфоциты III: 249-250 327, 332
- В и Т III: 235, 256, 257 - транспорт I: 219; III: 304-325
Линкер III: 210 Мембраны. См. также Клеточные мембраны
Линолеат II: 139, 156 - митохондрий II: 72, 83-84, 86
Липазы I: 165; II: 140 - тилакоидов II: 180, 184
Липид А III: 226-227 β-Меркаптоэтанол I: 38-39
Липидные бислои I: 205-208, 218 β-Меркаптоэтиламин II: 16
Липидный переносчик III: 220-223 Меромиозин легкий (ЛММ) и тяжелый (ТММ)
Липиды I: 201, 215 III: 264, 266, 267
- мембран I: 200-207; III: 318 Метаболизм II: 6-25, 280, 284-286
«Липкие» концы III: 184 - адаптация к голоданию II: 293
Липоамид II: 56-59 Метаболическая активация II: 222
Липоевая кислота II: 57 - специализация органов II: 283
Липолиз II: 140; III: 297 Метаморфоз головастика I: 191
Липополисахариды III: 226-229 Метанольное отравление I: 118
Липопротеины II: 218-220, 290 Метародопсины III: 344
Липосомы I: 206-207 Метгемоглобин I: 49, 99
N5N10-Метенилтетрагидрофолят II: 236, 237
Предметный Метил-акцепторные белки III: 352, 353
378 указатель L-Метилвалин III: 63
Метилглутамат III: 353 Монооксигеназы II: 175, 222
β-Метилглутаконил-СоА II: 174 Моносахариды II: 24-27
7-Метилгуанилат III: 149, 150 Морской еж III: 143
5 10
N N -Метилентетрагидрофолят II: 236, 237, Морфин III: 296
268-269 Мочевая кислота II: 274-276
Метилирование при хемотаксисе III: 352 Мочевина
Met I: 39; II: 164-166, 273
- роль кобаламина II: 172 мРНКi III: 153
Метилированная ДНК III: 177-178 Муколипидоз III: 163
Метилированный нуклеотид («колпачок», «кеп») Мутагенез III: 82
III: 60, 149-151 Мутагены химические III: 81, 83
Метилкобаламин II: 238 Мутанты температурочувствительные III: 191-
β-Метилкротонил-СоА II: 174 192
β-Метилкротонил-СоА-карбоксилаза II: 174 - pol III: 27, 28
Метилмалонил II: 169-173 - rif-r III: 61
Метилмалонил-СоА II: 170 Мутации III: 80-84. См. также Делеции, Дуп-
2'-O-Метилрибоза III: 60 ликации, Транслокации
N5-Метилтетрагидрофолят II: 236-238 - и вырожденность кода III: 76
Метальные группы II: 16, 207, 238-239 -- образование антител III: 250, 254-255
Метионил-тРНК (Met-тРНК) III: 101 - нонсенс III: 82, 96
Метионин I: 21, 154; II: 169-179, 238; III: 75, - со сдвигом рамки считывания III: 69, 97
76, 100-101 - супрессия III: 96-97
Метионин-энкефалин III: 295, 296 - у бактерий III: 353
Метотрексат II: 270 Мышечное сокращение III: 260-281
Миастения III: 338 Мышечные клетки III: 141
Миелинизированные нервные волокна III: 329, Мышцы I: 18, 19; II: 289; III: 260-261, 304
330 Мюллера-Рудина способ получения мембран I:
Миелома III: 240-242 207
Микоплазма III: 19 Меt-тРНКf см. Метионил-тРНК
Микроворсинки III:. 275, 276, 313
Микросомы II: 156
Надмуравьиная кислота I: 32, 38
Микротрубочки III: 276-279
Надпочечники II: 225
Микрофиламенты III: 261, 272-274, 276
Налоксон III: 296
Минералокортикоиды II: 222, 224
Наперстянка III: 310-311
Минимальный фермент III: 55
Натриевые каналы III: 327-330, 345-346
Миоглобин I: 48-62, 69-72
Натрий (ион Na + ) III: 319-320, 327-328
- сравнение с гемоглобином I: 63-64, 69
Миозин III: 261-264, 266-273 - и транспорт сахаров III: 312-313
- транспорт см. Натриевые каналы, Натрий-
- в немышечных клетках III: 271-273
Миокиназа II: 10, 264, 293; III: 271. См. также калиевый насос
Натрий-калиевый насос III: 305-310, 327
Аденилаткиназа
Миофибриллы III: 260, 262 Негемовое железо II: 52, 75
Незаменимые аминокислоты II: 230, 233-234, 239
Миристат II: 139
Мирицин II: 226 - жирные кислоты II: 156
Нейромедиаторы III: 330, 338-340
Миссенс-супрессоры III: 97
Митохондриальная АТРаза II: 79 Нейротоксины III: 333, 335
Митохондрии II: 71-72 Неконкурентное ингибирование I: 116-117
- ДНК в них III: 21, 136-138 Немиелинизированные нервные волокна III: 329
Ненасыщенные жирные кислоты II: 146
- рибосомы в них III: 153
Михаэлиса константа I: 111-114 Неостигмин III: 334, 336
Михаэлиса-Ментен уравнение I: 112, 118 Непермиссивные клетки-хозяева III: 187
Мицелла I: 205 Неполярные взаимодействия I: 61-62
Нервно-мышечное соединение III: 330
Мобильные (подвижные) генетические элементы
III: 201-202, 205, 206. См. также Вста- Нервный импульс III: 326-327
Нециклическое фотофосфорилирование II: 192
вочные последовательности, Плазмиды
Модель из шаров и палочек I: 10-11 Ниацин II: 17, 270. См. также Никотиновая
Модифицирующая субъединица I: 106; II: 133 кислота
Никотинамидадениндинуклеотид (NAD+,
Мозг II: 288
NADH) II: 14, 36-38, 255, 285
Молекулярные болезни I: 88-103
Никотинамидадениндинуклеотидфосфат
- модели I: 10
(NADP+, NADH) II: 15, 16, 95-100, 281
Молекулярный шарнир III: 33, 176, 239, 268, 269
Молибден II: 231, 276
Моноаминооксидаза III: 339 Предметный
Моноклональные антитела III: 241 указатель 379
- в биосинтезе холестерола II: 214 Одноцепочечная ДНК III: 16, 19, 52, 138, 167,
--- дезоксирибонуклеотидов II: 266-268 200
-- гидроксилировании стероидов II: 222 Оказаки фрагменты III: 31
-- малат-дегидрогеназной реакции II: 155-156 Окаймленные пузырьки III: 161-162
- образование в цикле трикарбоновых кислот β-Окисление II: 143
II: 53 Окислительно-восстановительная пара II: 72-73
-- при окислении жирных кислот II: 143-144 Окислительно-восстановительный потенциал II:
--- гликолизе II: 32 73-74, 190
--- фотосинтезе II: 189, 191 Окислительное дезаминирование II: 160
- окисление II: 84-85 - фосфорилирование II: 14, 71, 78, 83, 87-88
- стереоспецифичность II: 62 Оксалоацетат II: 49-50, 52-54, 108-109, 168, 198
Никотиновая кислота II: 17, 270-272 Оксалосукцинат II: 61
Нингидрин I: 28 Оксианион I: 159, 160
Нитрогеназный комплекс II: 230-232 Оксигемоглобин I: 75-76, 86
2-Нитро-5-тиоцианат I: 32 Оксигеназы II: 195, 199, 222
n-Нитрофенилацетат I: 155, 156 Оксигенирование I: 56-60
n-Нитрофенилдиазоний III: 243 Оксид азота I: 224
n-Нитрофенол I: 155, 156 - углерода (СО) I: 60, 61, 86-87; II: 81
Нонактин III: 319, 320 β-Оксоацил-АПБ-редуктаза II: 152
Норадреналин II: 291, 292; III: 339, 340 Оксоацил-СоА II: 143, 144
5'—>3'-Нуклеаза III: 25-26, 35 α-Оксобутират II: 163, 239, 243
Нуклеиновые кислоты. См. также Дезоксирибо- α-Оксоглутарат I: 181; II: 51, 160, 161, 168-169
нуклеиновая кислота, Рибонуклеиновая α-Оксоглутаратдегидрогеназный комплекс II: 51,
кислота 59
-- конформация III: 11-15, 47 α-Оксоизокапроат II: 174
-- области гомологии III: 55 Оксокислоты II: 160, 162, 174, 235
Нуклеозиддифосфаткиназа II: 264 Октадекадиеновая кислота II: 138
Нуклеозиддифосфаты II: 132 Олеинат I: 201, 220; II: 139, 156
Нуклеозидмонофосфаткиназы II: 264 Олигоаденилат III: 192
Нуклеозидтрифосфаты II: 256 Олигомицин II: 84
Нуклеозид-фосфорилазы II: 273 Олигонуклеотид-синтетаза III: 192
Нуклеозиды II: 255-279 Олигосахариды III: 159-163
Нуклеосомное «ядро» (минимальная нуклеосо- Онкогенные вирусы III: 186-192
ма) III: 131-132 Ооциты ящериц III: 156, 157
Нуклеосомы III: 129-133, 136-137 trp-Оператор III: 118
Нуклеотидазы II: 273 Операторный ген III: 114
Нуклеотиддифосфаты III: 23 λ-Операторы III: 122-124
Нуклеотиды II: 255-279; III: 6, 11-15, 19, 24 trp-Оперон III: 118, 119, 121
Нуклеофильная атака I: 158 Опероны III: 114-120
NAD, NADH см. Никотинамидадениндинуклео- Опий и опиаты III: 295
тид Опсины III: 341, 348
NAD-связывающий участок дегидрогеназы II: Опухолеродные (онкогенные) вирусы III: 186-
37-38 192
NADH-дегидрогеназа II: 74 Органические фосфаты I: 156; III: 334-337
NADH-Q-редуктаза II: 74-75, 82 Органоспецифичность метаболизма II: 288
NADP + , NADH см. Никотинамидадениндину- Орнитин II: 164
клеотидфосфат Орнитин-карбамоилтрансфераза II: 164
NAG см. N-Ацетилглюкозамин Оротидилат II: 262, 263
NAM см. N-Ацетилмурамовая кислота Ортофосфат II: 12
NGF см. Фактор роста нервов Основания как акцепторы протонов I: 45
Остемаляция II: 226
Отжиг ДНК III: 20
«Отпечатки пальцев» I: 93

Обратимое ингибирование I: 115


Обратная связь I: 106; II: 243-245 Палиндром III: 38
- транскриптаза III: 178, 190 Палочки сетчатки II: 281; III: 217, 340-349
- транскрипция III: 178-179, 190 Пальмитат I: 201; II: 139, 145, 156, 159
Овальальбумин III: 151-153 Пальмитоил СоА II: 208
Одноуглеродные фрагменты II: 235-239 Памахин II: 103
Панкреатит I: 165
Предметный Панкреатический ингибитор I: 162-164
380 указатель
Пантотенат (пантотеновая кислота) II: 16, 17, - превращение в ацетил-СоА II: 49, 54
272-273 --- лактат II: 36
Папаин I: 166; II: 239 --- этанол 35-36
Паповавирусы III: 188 Пируватдегидрогеназный комплекс II: 54-59, 64-
Паратион III: 335, 336 65
Пастера эффект II: 284 Пируват-Рi-дикиназа II: 198
Пенициллин III: 218, 224-227 Пируват-карбоксилаза II: 107, 108
Пенициллиназа III: 225-226 Пищеварительные ферменты I: 152-178
Пеницилловая кислота III: 225 Плавление ДНК III: 19
Пентаглициновый мостик III: 219 - коллагена I: 185
Пентозофосфатный путь II: 95-114, 284-285 - мембран I: 220
Пепсин I: 152, 166 Плазмагены II: 208
Пепсиноген I: 152, 166 Плазматическая мембрана I: 199; III: 344-345.
Пепстатин I: 166 См. также Клеточные мембраны
Пептидазы I: 188-189 Плазматические клетки III: 235, 256
Пептидилтрансфераза III: 104 Плазмиды III: 201-206
Пептидильный участок III: 102 - для пенициллиназы III: 226
Пептидная единица I: 33-34 - как векторы III: 210-211
- связь I: 23, 29-30, 32, 104; III: 103-104, 223, 226 - колициногенные III: 210
Пептидные карты I: 92-93 - ColE1 III: 210, 211
- мостики III: 223 - pBR322 III: 210
Пептиды I: 27, 30. См. также Полипептиды - pSC101 III: 205
Пептозогликаны III: 219, 220, 223-224 Z-Пластинки III: 271
Первичная структура I: 37 Пластохинон II: 190-191
Первичные транскрипты III: 148, 149 Пластоцианин II: 191
СH-Переключение III: 253, 256 Пневмококки III: 7-10
Перенос заряда I: 158, 176 Подагра II: 274-276
- фосфатных групп II; 11-12, 72 Поджелудочная железа III: 290
- электронов II: 72, 74, 82, 222 Полиены II: 184, 227; III: 342
Перехваты Ранвъе III: 329 Полилизин III: 71
Переходное соединение I: 166 Полинуклеотидкиназа III: 64
Периплазматическое пространство III: 226 Полинуклеотид-фосфорилаза III: 70
Пермеаза III: 113, 114, 313 Полинуклеотиды синтетические III: 99
Пермиссивные клетки-хозяева III: 187 Полиоксиэтилен I; 210
Пернициозная анемия II: 170, 172 Полипептид гигантский III: 180, 181
Пероксисомы II: 199 Полипептидные цепи I: 23-24
D-Петля III: 200, 202 -- конформация I: 32-34, 38, 40-42
Печень II: 172, 290-291. См. также Клетки Полипептиды I: 23-32
печени Полипиррилметан II: 250
Пикорнавирусы III: 179 Полипролин I: 182, 183; III: 71
Пили III: 197 Полирибонуклеотиды III: 73
Пиперидин III: 40 Полирибосомы III: 100
Пираноза II: 26-27 Полисахарид III: 7-10
2-Пиридинальдоксимметиодид (ПАМ) III: 337 Полисома III: 100, 101
Пиридоксальфосфат I: 108, 109; II: 161-162 Политенные хромосомы III: 147, 148
- в фосфорилазе II: 124 Полиуридилат [poly(U)] III: 70
Пиридоксин II: 17, 161 Полифенилаланин III: 70
Пиримидиновые димеры III: 35-37 Полицистронный (полигенный) транскрипт III:
Пиримидины II: 255-256; III: 6, 7 115
- биосинтез II: 262-264, 276 Полицистроны III: 149
- спаривание с пуринами III: 11-15 Полуальдегид янтарной кислоты III: 340
Пирофосфат, гидролиз II: 121, 142, 273; III: 23, Полуацеталь II: 25
88 Полукеталь II: 25-26
-- свободная энергия I: 12 Полуконсервативная репликация III: 15-16, 133-
Пирофосфатная связь III: 149, 150 134
5-Пирофосфомевалонат II: 213, 214 Помпе болезнь II: 130
Пиррол I: 48 Поперечная диффузия I: 218, 224
Пирролидоновое кольцо I: 55, 183, 185 Поперечнополосатые мышцы III: 260-262
Δ-Пирролин-5-карбоксилат II: 169, 235 Поперечные мостики III: 261, 266
Пируват II: 27, 54-58, 106, 108, 286-287 - связи I: 190, 192-193
- в С 4 -пути II: 198
- образование и выход энергии II: 32-33, 163, Предметный
167-168 указатель 381
Порин III: 229-230, 232 Профосфолипаза А2 I: 165
Порфирины II: 248, 250-251 Прохиральная молекула II: 62
Порфирия II: 251 Процессинг РНК III: 60-61, 148-152, 252
Порфобилиноген II: 249, 250 Проэластаза I: 152
Последовательности ДНК повторяющиеся III: Псевдоуридин III: 61
72-75, 138-140. См. также Вставочные Псевдохолинэстераза III: 338
последовательности D-Псикоза II: 47
- Прибнова III: 55 Пурины II: 255; III: 6, 7, 14
- сигнальные III: 74-75, 157-159, 231, 252 - биосинтез II: 257-262
- poly(A) III: 149-150 - распад II: 273-274
Постсинаптическая мембрана III: 330, 331 - спаривание с пиримидинами III: 11-15
Потенциал переноса II: 11-12, 16, 72, 74 Пуромицин III: 102, 107
- фосфорилирования II: 20 Пурпурная мембрана II: 200-201
Потенциалы действия III: 326-328 Пустые циклы II: 110
Праймаза III: 31, 32 Пуфы III: 147-148
Превитамин D3 II: 225-226 Пятиуглеродные единицы III: 226
Прегненолон II: 222-223 рК I: 45, 46, 81-83
Предзатравочный комплекс III: 32 рН I: 45, 143
Прелюмиродопсин III: 344 PAS-полосы I: 211
Препроинсулин III: 290-292 PAS-реакция см. Периодат-иод-Шифф
Префенат II: 240-241
Прибнова последовательности III: 55
Провитамин D3 II: 225 Рабдовирусы III: 181
Прогестагены II: 221, 222 Равновесная седиментация III: 15, 16
Прогестерон II: 221, 223 Радиоактивные изотопы II: 61; III: 22
Проинсулин III: 290-292 Радиоиммунологический анализ III: 296
- синтез в Е. coli III: 214 Разобщители II: 87-88
Прокарбоксипептидаза I: 152 Рак, вирусная этиология III: 167, 186-189
Проколлаген I: 187-189 - кожи III: 35-36
Проконвертин I: 175 - химиотерапия II: 269
Пролилгидроксилаза I: 181 Рамка считывания, сдвиг III: 69, 82, 83, 97
Пролин I: 20, 21, 55 Рамноза III: 228
Пролипопротеин III: 230, 231 Растения, С4-путь II: 198-199
Промежуточные продукты цикла трикарбоновых Рацемазы III: 220
кислот II: 64, 65 Рахит II: 225-226
Промоторы III: 55-56, 118, 123 Реакционный центр II: 185
Проницаемость, коэффициент I: 208-209 Ревертанты III: 83
- липидных бислоев I: 206-208 Регуляторная субъединица II: 266
Про-опиокортин III: 296-297 Регуляторный ген III: 113-114
Пропионил-СоА II: 146-147, 169-170 Редуктаза см. Сукцинат-Q-редуктаза, NADH-Q-
Пропионил-СоА-карбоксилаза II: 169 редуктаза
Проростки пшеницы III: 151 Рекомбинация ДНК III: 196-216
Простагландин-синтазы III: 298, 299 - фага λ III: 185
Простагландин-циклооксигеназа III: 298 Релаксация ДНК III: 20, 21, 33
Простагландины III: 297-298 Ренатурация антитела III: 240, 241
Простетические группы I: 48; III: 105 - миоглобина I: 62-63
Протеазы I: 166; III: 174-175 - РНКазы III: 240
Протеиназы I: 32, 166 Рентгеноструктурный анализ I: 50-52
Протеинкиназы III: 155, 287-288 -- гемоглобина I: 63-64, 76, 83
Протеогликаны I: 193-194 -- ДНК III: 11
Протеолитические ферменты I: 104-105 -- миоглобина I: 50-58
Протонный градиент II: 79, 81-82, 91-92, 190-193; Реовирус III: 181-182
III: 313-314 Репарация ДНК III: 35-37
Протоны, ток (поток) И: 84, 91-92 Репликазы III: 183. См. также тРНК-репли-
Протопласты III: 224-225 каза
Протопорфирин I: 47; II: 249-250 Репликационная вилка III: 28-34, 134-137
Протромбин I: 170-172 Репликация ДНК III: 14-19, 28-44, 133-136
Профаги III: 120-121, 185 -- ошибки III: 24-26
Проферменты (зимогены) I: 105-106, 152-153, - РНК III: 180
160-161, 165 - фага Т4 III: 174-175
- ферментативная III: 41-42
Предметный Репрессор III: 113-119, 122-124. См. также Лак-
382 указатель
тозный репрессор, Триптофановый репрес- РНК-синтетаза III: 178
сор РНК-содержащие вирусы III: 178-179
Реснички III: 277-278 -- опухолеродные III: 189-190
Рестрикция III: 177, 208-209 РНК-транскрипты III: 148-152
- фермента III: 38-39, 176-178 Родопсин III: 340-348
Ретикулоциты III: 98-99, 155 Ротенон II: 80, 81
Ретинали в пурпурной мембране II: 200 рРНК см. Рибосомная РНК
- транс- и цис-изомеры III: 341-344, 348-349
Ретинол II: 17, 18
Ретинол-дегидрогеназа III: 343 Сакситоксин III: 328-330
Ретровирусы III: 179, 189-190 Самосборка вирусов III: 168-176
Рецепторные ямки II: 219 - липидных бислоев I: 205
Рецепторы антигенов III: 256-257, 293-294 - рибосом III: 98
- эстрадиола III: 299-300 Саркозин III: 63
Рибоза II: 255; III: 46 Сарколемма III: 260
Рибонуклеаза S I: 17 Саркомер III: 261
Рибонуклеазы I: 39-41, 123, 124; III: 64 Саркомы III: 186
- ренатурация III: 240 Саркоплазма III: 260
Рибонуклеиновая кислота (РНК) III: 46-48, 52- Саркоплазматический ретикулум I: 209; III: 271
61. См. также Гибридизация ДНК-РНК, -- и транспорт Са2+ III: 270, 311
Двухцепочечная РНК Сателлитная ДНК III: 139, 140
-- положительная (+РНК) и отрицательная Сахара II: 24-27, 132
(—РНК) III: 179-182 - абсолютная конфигурация II: 25, 46, 47
Рибонуклеозиддифосфаты III: 70 - номенклатура III: 159
Рибонуклеозидтрифосфаты III: 52, 73 - транспорт III: 312-316
Рибонуклеотид 5-аминоимидазола II: 259 Сахароза II: 132
- 5-аминоимидазол-4-карбоксамида II: 244, 259 Свертывание крови I: 152, 166-176
- 5-аминоимидазол-4-карбоксилата II: 259 -- каскад реакций I: 166-167
- 5-аминоимидазол-4-N-сукцинкарбоксиламида Свет, спектр поглощения I: 68. См. также
II: 259 Экстинкция
- никотиновой кислоты II: 270-271 --- миоглобина и гемоглобина I: 59
- 5-формиламидоимидазол-4-карбоксамида II: --- родопсина III: 342
259 --- хлорофиллов II: 184
- N'-5'-фосфорибозилформимино-5-аминоими- --- цветовых рецепторов III: 348
дазол-4-карбоксамида II: 244 Световые реакции (фотосинтеза) II: 185, 187
Рибонуклеотид-редуктаза II: 267-268 Связь С—С I: 219-220
Рибонуклеотиды II: 255; III: 34-35 Седиментация III: 48
Рибосомная РНК (рРНК) III: 47-48, 149 Седогептулозо-1,7-дифосфат II: 196
Рибосомы III: 46, 49-50, 72, 97-99, 101-103, 157- Седогептулозо-7-фосфат II: 97-98
158 Секвенатор I: 32
- митохондрий III: 153 Селекционная теория III: 240
- реконструирование III: 98, 99 Серин I: 21, 22, 156-157, 202; II: 163, 168, 235
- эукариотические (80S) III: 152-153 - связывание с сахарами I: 214, 216
Риботимидин III: 61 Сериндегидратаза II: 163
Рибофлавин II: 17 Сериновые протеазы I: 157, 163, 165-166
Рибофлавин-5'-фосфат II: 271 Серотонин II: 248
Рибофорины III: 157 Серповидноклеточная анемия I: 88-90, 94, 97-98
D-Рибулоза I: 47 Сефадекс I: 25
Рибулозо-1,5-бисфосфаткарбоксилаза II: 195-197, Сиаловые кислоты II: 209
203 Симметрия вирусов III: 168
Рибулозо-5-фосфат II: 96-100, 196, 197, 257 - во взаимодействии белков с нуклеиновыми
Рибулозо-5-фосфат-эпимераза III: 117 кислотами III: 62, 125
Рибулокиназа III: 117 --- репрессора с оператором III: 115-116
Рилизинг-факторы II: 172 - рестрикции III: 178
Риновирус III: 179 Симпорт III: 312-314
Рифампицин III: 61-62 Синапсы III: 330-331
РНК-зависимая ДНК-полимераза (обратная - электронная микрофотография III: 326
транскриптаза) III: 178, 190 Синаптическое тельце III: 340
- РНК-полимераза III: 178 Синаптосомы III: 331
РНК-затравка III: 31-32 Синтетазы II: 154; III: 87-90
РНК-матрица III: 46, 52
РНК-полимеразы III: 52-56, 146-147 Предметный
РНК-репликаза III: 52, 178, 179 указатель 383
Сквален II: 212, 214, 215, 217 Табун III: 335, 336
Скваленоксид II: 217 D-Тагатоза II: 47
Скелетные мышцы III: 260-262 Талассемия III: 154-155
β-Складчатый слой I: 34-37 D-Талоза II: 46
Скольжение филаментов III: 261-262, 267-269 Таурин II: 215
Скорость ферментативной реакции максималь- Таурохолат II: 215
ная (V max ) I: 112-113 Таутомеры III: 81
Слепота ночная («куриная») III: 343 Твин III: 333
Слизевик III: 272, 273 Тейхоевая кислота III: 223-224
Согласованная регуляция по типу обратной свя- Текучесть мембран I: 219-221
зи II: 245 Темновые реакции (фотосинтеза) II: 185, 193,
Соединительная ткань I: 179 195-196
Солевые мостики I: 122 Температура плавления (Т п л ) I: 185
- (ионные) связи I: 77, 122 - сжатия (T s ) I: 185
Соматическая рекомбинация III; 250, 252, 254- - тела I: 88
255 Температурный переход мембраны I: 219-220
Соматические гипермутации III: 250 Теофиллин III: 286
Соматостатин III: 213-214 Терминальная трансфераза III: 209
Соматотропин (гормон роста) III: 283 Терминация синтеза белка III: 104, 105
Сопрягающий фактор (F 1 ) II: 83-84 - транскрипции III: 55, 58-60, 74-76, 119, 154
Сопряжение, сопряженные реакции II: 9, 13, 79, Термодинамика II: 6
86-88, 92; III: 308-309 Термодинамическая стабильность I: 41
Сопряженная пара кислота-основание I: 45 Терпены II: 226
D-Сорбоза II: 47 Тестостерон II: 220, 223, 224; III: 299
Спаривание оснований или гомологичных цепей Тетрагидробиоптерин II: 175
ДНК III: 11-15, 19-20, 196, 198-200 Тетрагидроптероилглутамат см. Тетрагидрофо-
Спектрин I: 213 лят
α-Спирали I: 34-36, 55; III: 269. См. также Тетрагидрофолят II: 235-237, 257, 269
Двойная спираль ДНК Тетраглициновый мостик III: 221
- суперспирализованные I: 30, 36, 178, 183; III: Тетрадеканат II: 139
264 Тетраиодтиронин II: 248
Спиртовое брожение II: 36 Тетракозаноат II: 139
Сплайсинг III: 26, 61, 79, 81, 150-151, 249-253 Тетраоксипиримидин III: 295
Стеарат I: 220; II: 139 Тетрапептид III: 219
Стероидные гормоны II: 221-222; III: 298-300 Тетрапиррольное кольцо I: 48
-- врожденные нарушения II: 224 Тетрациклин III: 107
Стероиды кардиотонические III: 282, 309-310 Тетраэдрическое переходное состояние I: 159, 160
Стоп-кодоны III: 76 Тетродотоксин III: 328-330
Стрептомицин III: 105-107 Тетрозы II: 25, 46, 47
Структурные гены III: 114 Тея-Сакса болезнь II: 210-211
Стюарта фактор I: 175 Тиазолидиновое кольцо III: 224, 226
Субмитохондриальные частицы II: 83 Тиамин см. Витамин B1
Субстрат см. Фермент-субстратные комплексы Тиаминпирофосфат II: 55-56, 101-102
Субстратные циклы II: 110-111 Тилакоиды II: 180, 184, 190, 194
Субтилизин I: 105, 163-164 Тимидилатсинтетаза II: 271
Субъединица I: 38 Тимидин (Т) II: 255, 275; III: 6, 13, 14
Сукцинат II: 116; III: 340 - димеры III: 35, 37
Сукцинат-дегидрогеназа I: 115; II: 32 Тимидин-5'-фосфат (ТМР) (дезокситимидилат)
Сукцинат-Q-редуктаза II: 75, 82 II: 256, 257
Сукцинилхолин III: 337-338 Тиогалактозид-трансацетилаза III: 112
Сукцинил-СоА II: 31-32, 169, 248-250 Тиоловые протеиназы I: 166
Сукцинил-СоА—синтетаза II: 32 Тиоредоксин II: 267
Сульфаниламид II: 279 Тиоредоксин-редуктаза II: 268
Сульфгидрильный буфер II; 104 Тиоэфиры II: 40; III: 108
Сульфолипиды II: 184 Тироглобулин III: 160
Суперспирализация ДНК I: 183; III: 20-21 Тирозин I: 21, 22, 175, 176; II: 241; III: 152
Сфингозин I: 203; II: 208, 209 - как предшественник нейромедиаторов III: 339
Сфингомиелин I: 203, 204 Тирозингидроксилаза III: 339
Сшивки см. Поперечные связи Тирозин-О-сульфат I: 168
Сэнгера реактив I: 29 Тироксин II: 248
Титрование I: 46
Предметный Тканевой фактор I: 174
384 указатель Тозил-L-фенилаланинхлорметилкетон I: 157-158
α-Токоферол II: 18 Триозы II: 24, 46, 47
Толстые нити III: 261-264, 266-267 Триокиназа II: 133
-- реконструкция III: 266 Триоксикопростановая кислота (тригидроксико-
Топоизомеразы III: 21 простаноат) II: 215, 217
Торр I: 70 Трипсин I: 30, 105, 152, 161-165
Транзиции III: 80-81 Трипсиноген I: 165
Трансальдолаза II: 96-98, 102-103 Триптофан I: 21, 22; II: 241, 242; III: 71, 72,
Трансамидаза I: 169 75, 118, 121
Трансамидирование I: 169 Триптофанил-мРНК III: 119
Трансаминазы II: 160 Триптофановая мРНК (trp-мРНК) III: 118, 121
Трансаминирование II: 160-162 Триптофановый оперон III: 53, 59, 118-119, 121
Трансверсии III: 80-81 -- клонирование III: 212
Трансгликозилирование I: 144 - репрессор III: 118, 119
Транскарбоксила за II: 150 Триптофансинтаза I: 108, 109, 114; II: 241; III:
Транскетолаза II: 96-98, 101-102, 196 77, 78
транс-Конформация I: 219-220 Тритон X I: 210
Транскрипты см. РНК-транскрипты Трифосфатизомераза I: 114; II: 30
Транскрипция III: 46-86, 112 Трифосфопиридиннуклеотид (TNP) см. Никотин-
- выбор цепи III: 53-56, 58-62 амидадениндинуклеотидфосфат
- с РНК III: 180-181 Три-NAG см. Три-N-глюкозамин
Транслоказы II: 86; III: 104, 156 тРНК см. Транспортные РНК
Транслокация в белках III: 156-157 тРНКf см. Инициаторная РНК
- в мРНК III: 103-104 тРНКm III: 100
- группы III: 314-316 Тромбин I: 105, 168-170
- иммуноглобулиновых генов III: 249-250 Тромбопластин I: 175
Трансляция III: 46. См. также Белки, синтез Тромбоциты I: 166; III: 271
- лидерной мРНК III: 119-120 Тропические растения II: 198-200
- направление III: 99-100 Тропоколлаген I: 179, 182
Трансмембранные каналы III: 320-322 Тропомиозин III: 261, 269-270
Транспептидаза III: 225 Тропонин III: 261, 269-270
Транспептидирование III: 223, 225 Тропониновые комплексы III: 269, 270
Транспозиция (перенос) генов III: 119, 206 Т-трубочки (поперечные трубочки) III: 270, 271
Транспозоны III: 206 d-Тубокурарин III: 337, 338
Транспорт см. Мембранный транспорт, Сим- α-, β-Тубулин III: 276
порт, Транслокация группы Туникамицин III: 161
- пассивный III: 304 Тяжелые (Н) цепи III: 238-239, 241-243, 253
- СО2 у тропических растений II: 198 Тяжелый меромиозин III: 264, 266, 267
Транспортные антибиотики III: 316-320
- РНК (тРНК) III: 47-48, 61, 67-68, 90-95, 151-
152 Уабаин III: 311
-- мутантные III: 95-97 Убихинон II: 75
-- связывание с рибосомами III: 72 Углекислый газ см. Диоксид углерода
Транссукцинилаза II: 59 Углеродные атомы II: 166-167, 212
Трансфераза II: 118 Ультрафиолетовый свет III: 35
Трансферрин I: 18 Умеренные фаги III: 120-125
Трансформация ДНК III: 7-10 Уникальные гены III: 144-145
- клеток III: 186-187, 192 Уотсона-Крика модель III: 11-14
D-Треоза II: 46 Уравнение фотосинтеза II: 180-183, 186
Треонин I: 21, 22; II: 169 Урацил II: 255, 257
- дезаминирование II: 163 - димеры III: 35-36
- превращение в изолейцин I: 106; II: 243 Урацил-ДНК-гликозидаза III: 37
- связывание с сахарами I: 214, 216 Уреаза II: 275
Треониндегидратаза II: 163 Уреотелические организмы II: 164
Треониндезаминаза I: 106; II: 243 Уридилат (уридинмонофосфат, UMP) II: 256,
Третичная структура I: 32 257, 262-265
Три-N-ацетилглюкозамин I: 136-137 Уридилтрансфераза II: 247
Триацилглицерол-синтетазный комплекс II: 205- Уридин (U) II: 255-257
206 Уридинтрифосфат (UTP) II: 264, 265
Триацилглицеролы II: 138-140, 205 Уридинфосфат-N-ацетилглюкозамин (UDP-
Трикарбоновые кислоты см. Цикл трикарбоно- NAG) III: 220-223
вых кислот
1,3,7-Триметилксантин III: 286 Предметный
Тринуклеотиды III: 72 указатель 385
Уридинфосфат-N-ацетилмуаровая кислота Фермент-субстратные комплексы I: 102, 108-110,
(UDP-NAM) III: 220-223 148, 154-156
Уриказа II: 275 Ферменты I: 104-133; II: 283. См. также Ак-
Урикотелические организмы II: 164 тивный центр и по названиям
Уроканат II: 168 - аденилированные II: 246
Уропорфириноген-синтаза II: 251 - взаимодействие с субстратом I: 108-110, 122-
Уропорфириногены I и III II: 249-251 123, 148, 154-156. См. также Фермент-
Усиление сигнала при фоторецепции III: 345 субстратные комплексы
UDP-галактоза II: 134 - ковалентный комплекс с AMP II: 263; III: 26
UDР-галактозо-4-эпимераза II: 134 - множественность II: 245
UDP-глюкоза II: 120-121, 134, 206 - рестрикции III: 38, 208-209
UDP-глюкозо-пирофосфорилаза II: 120-121 Ферредоксин II: 188-189, 231
+
UDP-глюкуронат II: 252 Ферредоксин-NADP -редуктаза II: 189
UMP см. Уридилат (уридинмонофосфат) Ферригемоглобин I: 45
UTP см. Уридинтрифосфат Ферритин I: 18, 214
Феррицианид II: 187
Феррогемоглобин I: 49
Фаги III: 9 Феррохелатаза II: 250
- кольцевая ДНК III: 184
Ферроцианид II: 187
- лизогенные III: 184-185 Фертильность см. Фактор F
- трансдуцирующие III: 205 Фибрин II: 167-169
- умеренные III: 184 Фибриновый сгусток I: 167
- F2 III: 182 Фибриноген I: 167-168, 175
- G4 III: 78 Фибринопептиды I: 168
- Mu III: 202 Фибробласты III: 273
- Р22 III: 229 Фиброин шелка III: 144
- Т2 III: 9, 10, 19, 48-51 Физостигмин III: 334, 336
- Т4 III: 171-176
Филаменты мышц III: 261-268
- Т7 III: 20, 55 Фитоин II: 227
- λ III: 18-20, 55, 120-124, 183-185, 202
Фитольная боковая цепь II: 226
-- генетическая карта III: 123 Флавикадениндинуклеотид (FAD, FADH 2 ) II: 14-
— как вектор III: 210-212
15, 52-53, 73, 84-85, 143, 275
- φХ174 III: 16-24, 53, 183
Флавинмононуклеотид (FMN) II: 75, 271
Фаговая конверсия III: 229
Флагеллин III: 350
Факторы инициации III: 102, 155
Флуорескамин I: 28
- освобождения III: 104
Фолиевая кислота II: 270
- роста нервов (NGF) I: 19; III: 300-301
Формамид I: 10
- свертывания крови I: 167, 175; II: 172; III: 152
Формилглицинамидинрибонуклеотид II: 258, 259
- устойчивости III: 205 Формилметионил-тРНК (fMet-тРНК) III: 76, 87,
- F II: 83, 84; III: 201-206
100-105
- R III: 202, 205-206 Формилметионин (fMet) III: 76, 100
- RTF III: 205 10
N -формилтетрагидрофолят II: 236
Фаллоидин III: 276 Формил-L-триптофан I: 158, 159
Фарадея число II: 74 N-Формилиминоглутамат II: 169
Фарнезилпирофосфат II: 214 N5-Формиминотетрафолят II: 236
Фенилаланин I: 21; II: 175, 240, 241; III: 71
Фосфагены III: 271
- при фенилкетонурии II: 176-178
Фосфатаза II: 127
Фенилаланингидроксилаза II: 175, 177-178 Фосфатидальхолин II: 208
Фенилаланиновая тРНК III: 93 Фосфатидат (фосфотидная кислота) II: 205, 206
Фенилаланиновый оперон III: 122
Фосфатидилинозитол I: 203
Фенилизотиоцианат I: 30 Фосфатидилсерин I: 203; II: 206
Фенилкетонурия II: 177-178
Фосфатидилхолин I: 203, 204, 224; II: 207-209
Фенилпропионат II: 142
Фосфатидилэтаноламин I: 203; II: 207-208
Фенилтиогидантоин (ФТГ-аминокислоты) I: 30-
Фосфатидат I: 202
32
Фосфатные группы II: 11, 12, 72
Фенилуксусная кислота II: 142
Фосфаты высокоэнергетические II: 12
Феноксозановое кольцо III: 62, 64
Фосфоангидридные связи II: 10
Ферментативный катализ I: 104, 108-109, 136-
Фосфоаргинин III: 270, 271
144, 154-156
Фосфоацилглицеролы I: 201-203; II: 206-207
-- кинетика I: 114
3-Фосфогидроксипируват II: 235
Фосфогистидин III: 315
Предметный Фосфогликолат II: 199
386 указатель 2-Фосфоглицерат II: 32
3-Фосфоглицерат II: 31-32, 194-196, 235 Фруктозо-6-фосфат II: 28-29, 106, 195-197
Фосфоглицераткиназа II: 31-32 Фруктозо-1-фосфатный путь II: 133
Фосфоглицеромутаза II: 32, 119 α-D-Фруктофураноза II: 26
Фосфоглюкомутаза II: 118, 362 Фторацетат II: 63
6-Фосфоглюконатдегидрогеназа II: 96, 97 Фторацетил-СоА II: 63
6-Фосфоглюконо-δ-лактон II: 96 Фтордезоксиуридилат II: 269
Фосфодиэстеразы II: 127; III: 285, 346-347 5-Фтордезоксиуридин III: 189
- змеиного яда III: 64 Фтординитробензол I: 29
Фосфодиэфирная связь III: 6, 7, 23, 26-27 Фторурацил II: 269
Фосфоенолпируват I: 32; II: 106-107, 239, 240 Фторцитрат II: 63-64
- в С4-пути II: 198 Фумараза II: 53
- и активный транспорт III: 314-315 Фумарат (фумаровая кислота) II: 52-53, 165, 169,
- при гликолизе II: 32 175, 176
-- синтезе UDP-N-ацетилмурамовой кислоты 4-фумарилацетоацетат II: 175
III: 221 Фураноза II: 26
- свободная энергия гидролиза II: 12 Фурье разностный метод I: 135
Фосфоенопируват-карбоксикиназа II: 107 FAD, FADH 2 см. Флавинадениндинуклеотид
Фосфокреатин III: 270, 271 fMet см. Формилметионин
Фосфолипаза А2 I: 165 fMet-тРНК см. Формилметионил-тРНК
Фосфолипазы II: 208, 210 FMN см. Флавинмононуклеотид
Фосфолипиды I: 201-203
- влияние на свертывание крови I: 171-172
Хаворта проекционные формулы II: 26
5-Фосфомевалонат II: 214
Хагемана фактор I; 175
4'-Фосфопантетеин II: 272, 273
Хеликаза см. Геликаза
4'-Фосфопантотенат II: 272, 273
Хемиосмотическая гипотеза II: 79
4'-Фосфопантотенилцистеин II: 272
Хеморецепторы III: 349-350, 352
Фосфопентозоизомераза II: 96-98, 196
Хемотаксис у бактерий III: 349-353
З-Фосфо-5-пирофосфовалонат II: 213, 214
Хемотрофы II: 10
5'-Фосфорибозил-1-амин II: 258
Хендерсона-Хассельбалъха уравнение I: 45
N-5'-Фосфорибозилантранилат II: 241, 242
Хилла коэффициент I: 72
5-Фосфорибозил-1-пирофосфат (ФРПФ) II: 240,
- реакция II: 187
242, 258, 261
Хиломикроны II: 218
Фосфорибомутаза II: 273
Химерная ДНК III: 208
Фосфорибулозокиназа II: 196
Химическое сопряжение II: 79
Фосфорилаза II: 123-125, 130
Химотрипсин I: 153-159, 161-164
Фосфорилирование II: 283
Химотрипсиноген I: 152-154, 160
- и активный транспорт III: 307-308, 311, 314-
Хиральность (RS) II: 62, 69
316
Хитин I: 133; II: 131
-- регуляция активности ферментов II: 65, 123-
Хлорамфеникол III: 107
127
Хлоропласты II: 180, 181, 184
- субстратное II: 32
- ДНК в них III: 137-139
Фосфорил-ферментные комплексы III: 335
- рибосомы в них III: 153
Фосфорилхолин II: 207-208
Хлорофиллы II: 183-184
Фосфорильная группа II: 27
Холат натрия I: 210
Фосфорная кислота I: 202
Холекальциферол II: 223
Фосфоролиз II: 116
Холерный токсин III: 156, 289
Фосфосерин I: 22, 23; II: 235
Холестерол II: 212-227. См. также Гиперхо-
Фосфотрансферазная система III: 314-316
лестеролемия
Фосфофруктокиназа II: 30, 33-35, 284
- в клеточных мембранах II: 204, 221
Фотодыхание II: 199, 200
Холил-СоА II: 215
Фотореактивирующий фермент III: 35
Холин I: 202; II: 207-209; III: 331, 334
Фоторецепторы III: 340-349
Холлидэя модель III: 201
Фотосинтез II: 180-203
Хондроитинсульфат I: 193, 195
Фотосинтезирующие бактерии II: 186, 200
Хоризмат II: 239-241
Фотосинтетическая единица II: 184-185
Хориокарциномы II: 270
Фотосистемы I и II II: 187-193
Хроматин III: 128-133
Фототрофы II: 10
Хроматография аффинная I: 25
Фотофосфорилирование II: 188, 192, 200-201
- гель-фильтрация I: 25
- циклическое II: 191, 193
- ионообменная I: 25
Фрагменты иммуноглобулинов (Fab, Fc) III: 237-
239
Фруктоза II: 25-26, 47, 133 Предметный
Фруктозо-1,6-бисфосфат II: 28, 30, 106, 107, 196 указатель 387
- на бумаге I: 92-93 - Р 450 II: 222
Хромосомы (эукариотические) III: 127-165. См. Цитохромоксидаза II: 77
также Политенные хромосомы QН 2 -Цитохром с II: 82
- типа ламповых щеток III: 127 QН 2 -Цитохром-с-редуктазный комплекс II: 76,
Хромофор III: 341 77, 80-82
Хрящ I: 194 Цитрат II: 34-35, 50, 51, 60, 155
Хэча-Слэка путь (С4-путь) II: 198 Цитрат-лиаза II: 155
Цитрат-синтетаза II: 50
Цитрил-СоА II: 50
Цветовая слепота III: 348
Цитруллин II: 164, 165
Цветовое зрение III: 347-348
сАМР см. Аденозин-3',5'-монофосфат
Цвиттерионы I: 19
CDP-диацилглицерол см. Цитидиндифосфоди-
Целлюлаза II: 131
ацилглицерол
Целлюлоза II: 131
СТР см. Цитидинтрифосфат
Центромеры III: 140
χ-Цепи III: 242, 249, 251
λ-Цепи III: 242, 251 Четвертичная структура I: 64, 76-77, 81
Цепь переноса электронов II: 82, 222 Число оборотов (фермента) I: 113-114
Церамид II: 208-209
Цереброзиды I: 203, 204; II: 208
Шарнир в молекуле иммуноглобулинов III: 239
Цианид ( C N - ) II: 80, 81, 171
--- миозина III: 268
Цианкобаламин II: 171
Шелковичный червь III: 144
Цикл Кальвина II: 196-199
Шикимат II: 240
- мочевины II: 164-166
Шиффово основание I: 190, 194; II: 39, 102-103,
- трикарбоновых кислот II: 49-70, 284
161-162; III: 342, 343
--- связь с циклом мочевины II: 165
Циклический AMP см. Аденозин-3',5'-монофос-
фат Щавелевая кислота I: 118
- GMP (cGMP) III: 345-347 Щавелевоуксусная кислота см. Оксалоацетат
Циклическое фотофосфорилирование II: 191 Щавелевояблочная кислота см. Оксалосукцинат
Циклогексимид III: 107, 152, 153 Щелевые соединения III: 322-324
Циклопропановые жирные кислоты I: 223 Щелочная фосфатаза III: 64
Цинга I: 186-187 Щеточная каемка III: 275
Цинк I: 144-146
Цис-аконитат II: 50, 51 Эволюция белков I: 69, 84
Цис-вакценат II: 156 - дивергентная I: 163-164
Цис-конфигурация I: 220 - единичный период III: 129
Цистатионин II: 239 - иммуноглобулинов III: 248-250, 253
Цистатиониназа II: 239 - конвергентная III: 348
Цистатионин-синтетаза II: 239 - молекулярная I: 101
Цистеин I: 10, 21-24; II: 167, 168, 239; III: 71 Эдмана реакция (деградация по Эдману) I: 30-32
Цистеиновая кислота I: 32 Эзерин III: 334
Цистин I: 24 Эйкозаноат II: 139
Цистидин II: 255-257 Эйкозотетраеноат II: 139
Цитидиндифосфодиацилглицерол (CDP-диацил- Эйкозотриеноат III: 298
глицерол) II: 206-207 Экваториальные заместители II: 26, 27
Цитидинмонофосфат (цитидилат, СМР) II: 206, Экдизон III: 148
256, 257 3'—>5'-Экзонуклеаза III: 24-26
Цитидинтрифосфат (СТР) II: 206-207, 264-266 Экзонуклеазы III: 64
Цитозин II: 255, 257; III: 6, 13, 14 Экзоны III: 79, 145
- дезаминирование III: 36, 37 Экстинкции коэффициент I: 68
- спаривание с аденином III: 81, 82 Эластаза I: 152, 161
Цитозинарабинозид III: 189 Эластин I: 192-193
Цитохалазин В III: 276 Электрический орган III: 332
Цитохром-с-оксидазный комплекс II: 76-78, 80- - угорь III: 332
82 Электрогенный насос III: 307-308
Цитохром(ы) а II: 76-78, 81, 82 Электронная микроскопия II: 211, 221-222
- b II: 76-77, 81, 191 - плотность I: 52-53, 58
- с II: 76-78, 81, 82, 88-91, 191 Электроны, перенос и транспорт II: 14-16, 71-
- f II: 191 78, 81, 85, 87. См. также Цепь переноса
электронов
Предметный - смещение I: 144, 148-149
388 указатель Электростатические взаимодействия I: 122
Электрофорез I: 25, 26, 90-91 Энкефалины III: 297
- в крахмальном геле I: 92 Энтальпия II: 7
-- полиакриламидном геле с додецилсульфатом Энтеропептидаза I: 165
натрия I: 208-210, 213 Энтропия II: 6-7
Электрохимический потенциал III: 304 Эпидермальный фактор роста III: 300-301
Элерса-Данлоса синдром I: 188 Эпимеразы в обмене галактозы II: 134
Элонгация III: 103-104, 106 -- пентозофосфатном пути см. Фосфопентозо-
- ДНК III: 23, 24 изомеразы
- жирных кислот II: 149, 151-153, 156 Эпинефрин см. Адреналин
- РНК III: 52, 53 D-Эритроза II: 46
- факторы III: 103-104 Эритромицин III: 107, 153
Эмбдена-Мейергофа путь см. Гликолиз Эритропоэтическая порфирия II: 250
Эмбриональные гемоглобины I: 75 Эритрозо-4-фосфат II: 98, 196, 240
- клетки и образование антител III: 250-251, 253 Эритроциты I: 48, 49, 209, 211-214
Эндонуклеаза (эндонуклеазы) III: 63, 64, 192 - плода I: 75
- активатор II: 237 - тени III: 307
- расщепление чужеродных ДНК III: 176 D-Эритрулоза II: 47
- рестрикции III: 176-178, 196 Эстрадиол II: 224; III: 299
- УФ-специфичная III: 35 Эстрогены II: 222-224
Эндоплазматический ретикулум II: 282; III: 156- Эстрон И: 224; III: 299
161 Этанол I: 118. См. также Спиртовое брожение
Эндорфины III: 295-296 Этаноламин I: 202
Эндоцитоз II: 219 Этидий бромистый III: 39
Энергетические ресурсы организма II: 288-289 Этиленгликоль I: 117-118
Энергетический заряд II: 20, 35, 65 Этиленимин I: 47
Энергия (в биологических процессах) I: 12; III: Эукариоты III: 127
32-33 Эфирная связь I: 104, 155, 178
- активации I: 106-108
- извлечение II: 16-19 «Яблочный» фермент II: 155
- метаболические источники II: 288-289 Ядерная мембрана III: 127, 188
- перенос II: 185-186 Ядовитые грибы III: 146, 276
- преобразование II: 91-92 Ядро III: 136
- фотосинтеза II: 197 Ядрышко III: 141
Энзим (фермент) II: 24 Яды III: 335. См. также Грибной яд, Змеиный
яд
ОГЛАВЛЕНИЕ вательно в обоих направлениях 29
24.19. Одна цепь ДНК синтезируется преры-
висто 30
Часть IV. 24.20. Затравкой синтеза ДНК служит РНК 31
Информация 24.21. Энергия гидролиза АТР используется для
расплетания родительской ДНК в области реп-
Глава 24. ДНК: генетическая роль, структура и ликационной вилки под действием белка
репликация 6 гер 32
24.1. Ковалентная структура и номенклатура 24.22. ДНК-гираза вводит отрицательные супер-
ДНК 6 витки в родительскую ДНК, чтобы облегчить
24.2. Трансформация пневмококков с помощью ее расплетание 33
ДНК показала, что гены состоят из ДНК 7 24.23. Сложность аппарата репликации, по-види-
24.3. Гены некоторых вирусов состоят из мому, необходима для обеспечения очень вы-
РНК 10 сокой надежности 33
244. Двойная спираль ДНК Уотсона-Кри- 24.24. Повреждения ДНК постоянно репариру-
ка 11 ются 35
24.5. Комплементарные цепи служат матрицами 24.25. Рак кожи при золотистой ксеродерме
друг для друга при репликации ДНК 14 обусловлен нарушением нормальной репарации
24.6. Репликация ДНК полуконсервативна 15 ДНК 35
24.7. Некоторые вирусы содержат на определен- 24.26. ДНК содержит тимин вместо урацила,
ных стадиях жизненного цикла одноцепочеч- что делает возможной репарацию дезаминиро-
ную ДНК 16 ванного цитозина 36
24.8. Молекулы ДНК очень длинные 18 24.27. Рестриктирующие эндонуклеазы соверши-
24.9. Двойная спираль может быть обратимо ли переворот в анализе ДНК 37
расплавлена 19 24.28. Последовательность нуклеотидов в ДНК
24.10. Некоторые молекулы ДНК имеют коль- можно быстро определить с помощью специфи-
цевую форму 20 ческого химического расщепления 39
24.11. Кольцевые двухспиральные молекулы 24.29. Полная последовательность оснований
ДНК могут находиться в суперспирализован- ДНК фага φХ174 была определена с помощью
ном состоянии 20 метода ферментативной репликации 41
24.12. Открытие ДНК-полимеразы 21 Заключение 42
24.13. ДНК-полимераза получает инструкции от Вопросы и задачи 45
матрицы 24
24.14. ДНК-полимераза I исправляет ошибки
в ДНК 24 Глава 25. Информационная РНК и транскрип-
24.15. ДНК-лигаза соединяет фрагменты ция 46
ДНК 26 25.1. Структура РНК 46
24.16. Открытие ДНК-полимераз II и III 27 25.2. Клетки содержат три типа РНК: рибо-
24.17. Расплетание родительской ДНК и синтез сомную, транспортную и информационную 47
новой ДНК происходят в репликационной вил- 25.3. Формулирование концепции информацион-
ке 28 ной РНК 48
24.18. Репликация ДНК начинается в строго 25.4. Экспериментальные данные о существова-
определенном месте и продолжается последо- нии информационной РНК-посредника в син-
тезе белка 49
25.5. Опыты по гибридизации показали, что
390 Оглавление информационная РНК комплементарна кодиру-
ющей ее ДНК-матрице 50 26.8. Сигналы инициации и терминации синте-
25.6. Рибосомные РНК и транспортные РНК за белка 76
также синтезируются на ДНК-матрице 51 26.9. Генетический код универсален 76
25.7. Все клеточные РНК синтезирует РНК-по- 26.10. Последовательность оснований гена и по-
лимераза 52 следовательность аминокислот соответствующе-
25.8. РНК-полимераза получает инструкции от го полипептида коллинеарны 77
ДНК-матрицы 53 26.11. Некоторые последовательности вирусных
25.9. Обычно в данном участке генома транс- ДНК кодируют более одного белка 77
крибируется только одна цепь ДНК 53 26.12. Гены эукариот представляют собой мо-
25.10. РНК-полимераза Е. coli состоит из заику из транслируемых и нетранслируемых
субъединиц 54 последовательностей ДНК 78
25.11. Транскрипция инициируется на промотор- 26.13. Мутации возникают в результате изме-
ных участках матричной ДНК 55 нений последовательности оснований ДНК 80
25.12. σ-Субъединица обеспечивает узнавание 26.14. Некоторые химические мутагены весьма
промоторных участков РНК-полимеразой 55 специфичны 81
25.13. Цепи РНК начинаются с pppG или 26.15. Многие мутагенные канцерогены можно
рррА 56 выявить по их мутагенному действию на бак-
25.14. Цепи РНК синтезируются в направле- терии 82
нии 5'—>3' 57 Заключение 84
25.15. Матричная ДНК содержит стоп-сигналы Вопросы и задачи 85
для транскрипции 58
25.16. Белок р участвует в терминировании
транскрипции 58 Глава 27. Синтез белка 87
25.17. Многие молекулы РНК после транскрип- 27.1. Аминокислоты активируются и присоеди-
ции расщепляются и химически модифицируют- няются к транспортным РНК под действием
ся 60 специфических синтетаз 87
25.18. Антибиотики-ингибиторы транскрипции: 27.2. Надежность синтеза белка определяется
рифамицин и актиномицин 61 высокой специфичностью аминоацил-тРНК—
25.19. Разработаны совершенные методы опре- —синтетаз 89
деления последовательности нуклеотидов в 273. Молекулы транспортных РНК имеют об-
РНК 62 щий план строения 90
Заключение 63 27.4. Транспортная РНК имеет L-образную фор-
Вопросы и задачи 66 му 91
27.5. В узнавании кодона участвует антикодон,
а не активированная аминокислота 93
27.6. Молекула транспортной РНК может узна-
Глава 26. Генетический код и зависимость меж- вать более одного кодона благодаря «кача-
ду генами и белками 67 ниям» 94
26.1. Транспортная РНК - адапторная молекула 27.7. Мутантные молекулы транспортных РНК
в синтезе белка 67 могут подавлять другие мутации 95
26.2. Аминокислоты кодируются группами из 27.8. Рибосомы - органеллы, в которых происхо-
трех оснований, начиная со строго определен- дит синтез белка,- состоят из большой и ма-
ной точки 68 лой субчастиц 97
26.3. Расшифровка генетического кода: синтети- 27.9. Рибосомы можно реконструировать из сос-
ческие РНК могут служить информационными тавляющих их молекул белков и РНК 98
РНК 69 27.10. Белки синтезируются в направлении от
26.4. Состав кодонов многих аминокислот был аминоконца к карбоксильному концу 98
определен с помощью сополимеров в качестве 27.11. Информационная РНК транслируется в
матриц 71 направлении 5'—>3' 99
26.5. Тринуклеотиды способствуют связыванию 27.12. Одну молекулу мРНК одновременно
определенных молекул тРНК с рибосома- транслирует несколько рибосом 100
ми 72 27.13. Синтез белка в бактериях инициируется
26.6. Еще один инструмент расшифровки кода - формилметиониновой тРНК 100
сополимеры с определенной последователь- 27.14. Сигналом инициации служит кодон AUG
ностью 72
26.7. Основные свойства генетического ко-
да 75 Оглавление 391
(или GUG), которому предшествует несколько 28.13. λ-Репрессор регулирует собственный син-
оснований, способных спариваться с 16S- тез 123
рнк 101 Заключение 125
27.15. В результате образования инициирующе- Вопросы и задачи 126
го 70S-комплекса формилметиониновая тРНК
связывается с Р-участком 102
27.16. Фактор элонгации Tu доставляет амино-
ацил-тРНК в А-участок рибосомы 103 Глава 29. Эукариотические хромосомы и выра-
27.17. После образования пептидной связи про- жение генов у эукариот 127
исходит транслокация 103 29.1. Эукариотическая хромосома содержит одну
27.18. Синтез белка терминируется факторами молекулу двухспиральной ДНК 128
освобождения 104 29.2. Эукариотическая ДНК прочно связана с
27.19. Многие белки модифицируются после основными белками - гистонами 128
трансляции 105 29.3. Последовательности аминокислот в гисто-
27.20. Стрептомицин ингибирует инициацию и нах Н3 и Н4 почти одинаковы у всех жи-
вызывает неправильное считывание информа- вотных и растений 129
ционной РНК 105 29.4. Нуклеосомы - повторяющиеся субъедини-
27.21. Пуромицин вызывает преждевременную цы хроматина 129
терминацию цепи, так как имитирует амино- 29.5. Минимальная нуклеосома («ядро» нуклео-
ацилированную транспортную РНК 107 сомы) состоит из ДНК длиной 140 пар осно-
27.22. Некоторые короткие пептиды синтезиру- ваний, намотанной на октамер гистонов 131
ются без участия рибосом 107 29.6. Нуклеосома - первый уровень конденсации
Заключение 109 ДНК 133
Вопросы и задачи 111 29.7. Репликация эукариотической ДНК начина-
ется во многих местах и идет в двух направ-
лениях 133
Глава 28. Регуляция выражения гена в феноти- 29.8. Новые гистоны образуют новые нуклео-
пе 112 сомы на отстающей дочерней нити ДНК 136
28.1. β-Галактозидаза - индуцибельный фер- 29.9. Митохондрии и хлоропласты содержат соб-
мент 112 ственную ДНК 137
28.2. Открытие регуляторного гена 113 29.10. Эукариотическая ДНК содержит много
28.3. Оперон - единица координированной гене- повторяющихся последовательностей основа-
тической экспрессии 114 ний 138
28.4. lac-Репрессор - тетрамерный белок 115 29.11. Высокоповторяющаяся ДНК (сателлитная
28.5. Последовательность оснований в lac-опе- ДНК) локализована в центромерах 140
раторе симметрична 115 29.12. Гены, кодирующие рибосомные РНК, рас-
28.6. Циклический AMP стимулирует транскрип- положены один за другим тандемно и повто-
цию многих индуцибельных катаболических опе- ряются несколько сот раз 140
ронов 116 29.13. Гены гистонов собраны вместе и повто-
28.7. Различные формы одного и того же белка ряются тандемно много раз 143
активируют и ингибируют транскрипцию ара- 29.14. Многие белки, синтезирующиеся в боль-
бинозного оперона 117 ших количествах, кодируются уникальными ге-
28.8. Транскрипция триптофанового оперона ре- нами 144
гулируется и аттенюатором, и операто- 29.15. Большинство уникальных генов переме-
ром 118 жается повторяющимися последовательностя-
28.9. Аттенюация опосредуется трансляцией ли- ми 145
дерной мРНК 119 29.16. Почти все гены высших эукариот, коди-
28.10. Аттенюаторный участок гистидинового рующие белки, имеют разорванное строе-
оперона содержит семь гистидиновых кодонов ние 145
подряд 120 29.17. РНК в эукариотических клетках синтези-
28.11. Репрессоры и активаторы детерминируют руется тремя различными РНК-полимераза-
развитие умеренных фагов 120 ми 146
28.12. Два оператора фага лямбда содержат 29.18. Грибной яд α-аманитин - мощный ингиби-
ряд участков связывания репрессора 122 тор РНК-полимеразы II 146
29.19. Специфические гены могут активировать-
ся для транскрипции 147
392 Оглавление 29.20. Три вида рибосомных РНК образуются
в результате процессинга одного первичного ему образовывать икосаэдрический кап-
транскрипта 148 сид 176
29.21. Информационные РНК избирательно об- 30.9. Бактериальные рестрикционные эндонукле-
разуются из больших ядерных предшествен- азы расщепляют чужеродные молекулы
ников РНК (гетерогенной ядерной РНК, ДНК 176
гяРНК) 148 30.10. Стратегия репликации РНК-содержащих
29.22. На 5'-конце мРНК находятся «колпачки», вирусов 178
а на 3'-конце, как правило, роlу(А)-последова- 30.11. Белки вируса полиомиелита образуются
тельности 149 путем множественного расщепления гигантско-
29.23. Ферменты сплайсинга с высокой точ- го предшественника 179
ностью удаляют интроны из первичных транс- 30.12. С геномной РНК вируса везикулярного
криптов разорванных генов 150 стоматита транскрибируется пять моноцистрон-
29.24. В настоящее время известны последова- ных мРНК 180
тельности оснований многих информационных 30.13. Геном реовируса состоит из десяти раз-
РНК 151 личных молекул двухцепочечной РНК 181
29.25. Эукариотическая рибосома (80S) состоит 30.14. Мелкие РНК-содержащие фаги содержат
из малой (40S) и большой (60S) субчастиц 152 перекрывающиеся гены 182
29.26. Талассемия - генетически обусловленное 30.15. Дарвиновская эволюция фаговой РНК вне
нарушение синтеза гемоглобина 154 клетки 183
29.27. Трансляция регулируется каскадом про- 30.16. Лизогенные фаги могут включать свою
теинкиназ, инактивирующим один из факторов ДНК в состав ДНК клетки-хозяина 184
инициации 155 30.17. Ретровирусы и некоторые ДНК-содержа-
29.28. Дифтерийный токсин блокирует синтез щие вирусы могут вызывать рак у чувстви-
белка у эукариот, ингибируя транслока- тельных клеток-хозяев 186
цию 155 30.18. Вирусы SV-40 и полиомы могут вызы-
29.29. Рибосомы, связанные с эндоплазматиче- вать продуктивную инфекцию или трансфор-
ским ретикулумом, синтезируют секреторные и мацию клеток-хозяев 187
мембранные белки 156 30.19. Ретровирусы содержат обратную транс-
29.30. Сигнальные последовательности позволя- криптазу, которая синтезирует двухспиральную
ют секреторным белкам проходить через мем- ДНК, используя в качестве матрицы
брану эндоплазматического ретикулума 157 (+)РНК 189
29.31. Присоединение сахарных остатков «ядра» 30.20. Ретровирусная ДНК транскрибируется
к гликопротеинам происходит в эндоплазмати- только в том случае, если она интегрирована
ческом ретикулуме при участии донора доли- с геном клетки-хозяина 190
хола 159 30.21. Киназа, кодируемая геном src вируса сар-
29.32. Модификация и сортировка гликопротеи- комы птиц, участвует в трансформации 191
нов происходит в аппарате Гольджи 161 30.22. Двухцепочечная РНК подавляет синтез
Заключение 163 белка в клетках, обработанных интерферо-
ном 192
Заключение 193

Глава 30. Вирусы 167


30.1. Оболочка мелких вирусов состоит из мно- Глава 31. Перестройки генов: рекомбинация,
жества идентичных белковых субъединиц 167 транспозиция и клонирование 196
30.2. Самосборка вируса табачной мозаики 31.1. В основе генетической рекомбинации ле-
(втм) 168 жат разрыв и воссоединение цепей ДНК 196
30.3. При сборке вирусной частицы ВТМ бел- 31.2. При генетической рекомбинации происхо-
ковые диски присоединяются к петле РНК 169 дит спаривание гомологичных цепей ДНК с об-
30.4. Заражение фагом Т4 полностью перестраи- разованием двухцспочсчного промежуточного
вает синтез макромолекул в клетке 171 продукта 198
30.5. В упорядоченной сборке фага Т4 участ- 31.3. Белок recА катализирует AТР-зависимый
вуют вспомогательные белки и протеазы 173 обмен цепей ДНК при генетической рекомби-
30.6. В репликации фага Т4 участвует конка- нации 200
темерный промежуточный продукт 174 31.4. Бактерии содержат плазмиды и другие
30.7. ДНК фага Т4 вводится в предобразован-
ную головку 175
30.8. Гибкость белка оболочки ВККТ позволяет Оглавление 393
подвижные генетические элементы 200 стенок путем ингибирования реакции транспеп-
31.5. Фактор F позволяет бактериям передавать тидирования 225
гены реципиентам путем конъюгации 201 32.11. Некоторые бактерии резистентны к пени-
31.6. Плазмиды факторы R придают бактериям циллину, так как синтезируют разрушающий
устойчивость к антибиотикам 205 его фермент 225
31.7. IS-элементы могут присоединяться к не- 32.12. Грам-отрицательные бактерии окружены
родственным генам 206 наружной мембраной, богатой липополисахари-
31.8. В лаборатории можно сконструировать но- дами 226
вые геномы и клонировать их в клетках-хо- 32.13. Благодаря разнообразию О-боковых це-
зяевах 207 пей грам-отрицательные бактерии противостоят
31.9. Ферменты рестрикции и ДНК-лигаза - не- защитным силам организма-хозяина 228
обходимые инструменты для получения реком- 32.14. Порин образует в наружной мембране
бинантных молекул ДНК 208 каналы для небольших полярных молекул 229
31.10. Плазмиды и фаг лямбда - наиболее под- 32.15. Новообразованные белки наружной мемб-
ходящие векторы для клонирования ДНК в бак- раны содержат отщепляемую сигнальную по-
териях 210 следовательность 230
31.11. Из суммарной геномной ДНК, расщеплен- Заключение 231
ной рестриктирующими эндонуклеазами, можно
выделить с помощью клонирования определен- Глава 33. Иммуноглобулины 234
ные эукариотические гены 211 33.1. Основные определения 234
31.12. Эукариотические гены могут транскриби- 33.2. Синтез специфических антител в ответ на
роваться в бактериальных клетках 212 антиген 235
31.13. Химически синтезированный ген пептид- 33.3. Участки антител, связывающие антиген,
ного гормона соматостатина экспрессируется подобны активным центрам ферментов 236
в клетках Е. coli 213 33.4. Препараты антител с определенной специ-
31.14. Перспективы клонирования генов 214 фичностью обычно гетерогенны 237
Заключение 215 33.5. При ферментативном расщеплении имму-
ноглобулина G образуются активные фраг-
Часть V. менты 237
Молекулярная 33.6. Иммуноглобулин G состоит из L- и Н-
физиология цепей 238
33.7. Иммуноглобулин G - гибкая Y-образная
Глава 32. Оболочки бактериальных кле- молекула 239
ток 218 33.8. Антитела под действием отбора или инст-
32.1. Клеточная стенка - это огромная мешко- рукции образуются 240
видная макромолекула 219 33.9. Конец инструктивной теории 240
32.2. Стадии синтеза пептидогликана 220 33.10. Иммуноглобулины миеломы и гибридомы
32.3. Синтез UDP-углевод-пептидного зве- гомогенны 240
на 220 33.11. Каждая L- и Н-цепь состоит из вариа-
32.4. Перенос углевод-пептидного звена на ли- бельного и константного участков 241
пидный переносчик 220 33.12. Участок связывания антигена образован
32.5. Синтез дисахарид-пептидного звена, при- гипервариабельными фрагментами L- и Н-це-
крепленного к липидному переносчику 221 пей 243
32.6. Перенос дисахарид-пептидного звена на 33.13. Вариабельная и константная области вы-
растущую полисахаридную цепь 222 полняют разные функции 243
32.7. Поперечные мостики между полисахарид- 33.14. Молекулы антител уложены с образова-
ными цепями образуются в реакции транспеп- нием компактных доменов, имеющих гомологич-
тидирования 223 ные последовательности 244
32.8. У грам-положительных бактерий пептидо- 33.15. Рентгеноструктурный анализ связываю-
гликан покрыт тейхоевой кислотой 223 щих участков антител показал, как происходит
32.9. Пенициллин вызывает гибель растущих связывание некоторых гаптенов 245
бактерий, ингибируя синтез клеточных сте- 33.16. Разные классы иммуноглобулинов разли-
нок 224 чаются по биологической активности 246
32.10. Пенициллин блокирует синтез клеточных 33.17. Молекулы антител возникли в результа-
те дупликации и последующей дивергенции ге-
нов 248
394 Оглавление 33.18. Вариабельные и константные области ко-
2+
дируются разными, но соединившимися гена- 34.11. Потек ионов Са регулируется сарко-
ми 249 плазматическим ретикулумом 270
33.19. Как возникает разнообразие специфично- 34.12. Фосфокреатин - форма запасания
сти антител? 250 ~Р 270
33.20. Вариабельные участки L- и Н-цепей ко- 34.13. Актин и миозин служат сократительны-
дируются несколькими сотнями генов 250 ми элементами почти во всех эукариотических
33.21. Открытие генов J (соединяющих) - допол- клетках 271
нительного источника разнообразия анти- 34.14. Распределение микрофиламентов в клетке
тел 251 выявляется методом иммунофлуоресцентной
33.22. Соединение генов V и J в различных микроскопии 272
рамках также способствует разнообразию ан- 34.15. Прикрепленные к мембране нити актина
тител 252 опосредуют сокращение микроворсинок кишеч-
33.23. мРНК для L- и Н-цепей образуются пу- ника 274
тем сращивания (сплайсинга) первичных продук- 34.16. Цитохалазин и фаллоидин тормозят под-
тов транскрипции 252 вижность, сопряженную с процессами сборки
33.24. Разные классы антител образуются в ре- и дезагрегации нитей актина 276
зультате перескока генов VH 253 34.17. Микротрубочки участвуют в различных
33.25. Разнообразие антител обусловлено сома- видах клеточной подвижности и частично фор-
тической рекомбинацией многих генов клеток мируют цитоскелет 276
зародышевого пути и соматической мута- 34.18. Биение ресничек и движение жгутиков
цией 254 обусловлено скольжением микротрубочек, инду-
33.26. Клонально-селекционная теория образова- цированным динеином 277
ния антител 255 Заключение 279
33.27. На поверхности клеток, продуцирующих
антитела, имеются рецепторы антигенов 256
33.28. Биологическое значение клональной селек- Глава 35. Действие гормонов 282
ции 257 35.1. Открытие циклического AMP - посредника
Заключение 257 в действии многих гормонов 282
35.2. Циклический AMP синтезируется адени-
латциклазой и расщепляется фосфодиэстера-
Глава 34. Мышечное сокращение и подвижность зой 285
клеток 260 35.3. сАМР служит вторым посредником при
34.1. Мышца состоит из взаимодействующих действии многих гормонов 285
друг с другом толстых и тонких белковых 35.4. Сопряжение рецепторов гормонов с адени-
нитей 260 латциклазой осуществляется белком, связываю-
34.2. При мышечном сокращении происходит щим гуаниннуклеотиды 286
скольжение толстых и тонких нитей относитель- 35.5. Циклический AMP активирует протеинки-
но друг друга 261 назы 287
34.3. Миозин образует толстые нити; он гид- 35.6. Циклический АМР - эволюционно древний
ролизует АТР и связывает актин 262 сигнал голодания 288
34.4. Миозин можно расщепить на активные 35.7. Холерный токсин стимулирует аденилатки-
фрагменты 264 назу, ингибируя GТРазную активность G-бел-
34.5. Актин образует нити, которые соединяют- ка 289
ся с миозином 265 35.8. Инсулин стимулирует анаболические про-
34.6. Актин повышает АТР-азную активность цессы и ингибирует катаболические процес-
миозина 265 сы 290
34.7. Толстые и тонкие нити мышечного волок- 35.9. Препроинсулин и проинсулин - предшест-
на определенным образом ориентирова- венники активного гормона 290
ны 266 35.10. Трехмерная структура инсулина 292
34.8. Полярность толстых и тонких нитей в се- 35.11. Рецепторы инсулина локализованы в плаз-
редине саркомера меняется на противополож- матической мембране клеток-мишеней 293
ную 267 35.12. Недостаточность инсулина вызывает диа-
34.9. «Рабочим ходом» является поворот связан- бет 294
ной с актином S1-головки миозина 267 35.13. Эндорфины - пептиды мозга, действующие
34.10. Тропонин и тропомиозин опосредуют ре-
гуляторное действие ионов кальция на мышеч-
ное сокращение 269 Оглавление 395
+
подобно опиатам 295 прочнее, чем Na 319
35.14. При расщеплении проопиокортина обра- 36.17. Можно выявить поток ионов через еди-
зуется несколько пептидных гормонов 296 ничный канал в мембране 320
35.15. Простагландины - модуляторы действия 36.18. Через щелевые соединения ионы и не-
гормонов 297 большие молекулы перетекают из клетки в
35.16. Простагландины образуются из ненасы- клетку 322
щенных жирных кислот 298 Заключение 324
35.17. Стероидные гормоны активируют специ-
фические гены 298 Глава 37. Возбудимые мембраны и сенсорные
35.18. Белковые факторы роста типа ФРН и системы 326
ЭФР стимулируют пролиферацию клеток-ми- 37.1. Потенциалы действия опосредованы крат-
шеней 300 ковременными изменениями проницаемости для
Заключение 301 Na + и К + 326
37.2. Тетродотоксин и сакситоксин блокируют
натриевые каналы в мембранах аксонов нерв-
ных клеток 328
37.3. Ацетилхолин является нейромедиато-
Глава 36. Мембранный транспорт 304 ром 330
36.1. Различие между пассивным и активным 37.4. Ацетилхолин открывает в постсинаптиче-
транспортом 304 ской мембране каналы для катионов 331
36.2. Открытие системы активного транспорта 37.5. Ацетилхолин высвобождается кванта-
ионов натрия и калия 305 ми 331
36.3. И фермент, и насос ориентированы в мемб- 37.6. При добавлении ацетилхолина реконструи-
ране 307 рованные мембранные пузырьки становятся про-
36.4. АТР преходяще фосфорилирует натрий- ницаемыми для катионов 332
калиевый насос 307 37.7. Ацетилхолин быстро гидролизуется, и кон-
36.5. Транспорт ионов и гидролиз АТР тесно цевая пластинка реполяризуется 334
сопряжены 308 37.8. Ингибиторы ацетилхолинэстеразы исполь-
36.6. Натрий-калиевый насос - олигомерный зуются как лекарственные средства и как
трансмембранный белок 308 яды 334
36.7. Модель механизма действия натрий-калие- 37.9. Разработка антидота для лечения отрав-
вого насоса 309 лений органическими фосфатами 336
36.8. Кардиотонические стероиды - специфиче- 37.10. Ингибиторы ацетилхолинового рецепто-
ские ингибиторы (Na+ + К+)-АТРазы и (Na+ + ра 337
+ К+)-насоса 309 37.11. К числу нейромедиаторов относятся так-
36.9. Транспорт кальция осуществляется другой же катехоламины и γ-аминомасляная кислота
АТРазой 311 (ГАМК) 338
36.10. Поток Na + обеспечивает энергией актив- 37.12. Для возбуждения палочки сетчатки глаза
ный транспорт сахаров и аминокислот в жи- достаточно одного фотона 340
вотных клетках 312 37.13. Родопсин - фоторецепторный белок пало-
36.11. Поток протонов служит движущей силой чек 340
во многих процессах транспорта у бакте- 37.14 Свет вызывает изомеризацию 11-цис-pe-
рий 313 тиналя 343
36.12. Активный транспорт ряда сахаров сопря- 37.15. Свет вызывает гиперполяризацию плаз-
жен с их фосфорилированием 314 матической мембраны наружного сегмента па-
36.13. Транспортные антибиотики повышают лочек 344
ионную проницаемость мембран 316 37.16. Медиаторы передают сигнал от фото-
36.14. Транспортные антибиотики функциониру- лизированного родопсина на плазматическую
ют либо как подвижные переносчики, либо как мембрану 345
каналообразователи 317 37.17. Свет снижает содержание циклического
36.15. Антибиотики-переносчики имеют форму GMP путем активации фосфодизстеразы 346
скорлупы ореха и связывают ионы в своей 37.18. Цветовое зрение опосредуется фоторецеп-
центральной полости 318 торами трех типов 347
36.16. Валиномицин связывает К+ в 1000 раз 37.19. 11-цис-ретиналь - хромофор всех извест-
ных органов зрения 348
37.20. Хеморецепторы бактерий воспринимают
396 Оглавление специфические молекулы и передают сигналы
на жгутики 349 Приложения 358
37.21. В основании бактериального жгутика на- Приложение А. Физические константы и пере-
ходится вращающий его реверсивный «мо- вод единиц из одной системы в другую 358
тор» 350 Приложение Б. Порядковые номера и атомные
37.22. Бактерии различают временной градиент, массы элементов 359
а не одномоментный пространственный градиент Приложение В. Значение рК' для ряда кис-
концентраций 351 лот 360
37.23. При бактериальном хемотаксисе переда- Приложение Г. Стандартные длины свя-
ча информации обеспечивается метилированны- зей 360
ми белками 352 Приложение Д. Стандартные сокращения, при-
Заключение 353 нятые в биохимии 361
Ответы на вопросы и задачи 356 Предметный указатель 362
УВАЖАЕМЫЙ ЧИТАТЕЛЬ!

Ваши замечания о содержании книги, ее оформ-


лении, качестве перевода и другие просим при-
сылать по адресу:
129820, Москва, И-110, ГСП
1-й Рижский пер., д. 2,
издательство «Мир».

Люберт Страйер Сдано в набор 24.01.84.


Подписано к печати 6.08.85.
БИОХИМИЯ, ТОМ 3 Формат 70 х 100/16.
Бумага офсетная № 1.
Гарнитура тайме. Печать офсетная.
Ст. научн. редактор Л. Г. Тер-Саркисян Объем 12,5 бум. л. Усл. печ. л. 32,5.
Мл. научн. редактор О. А. Горгун Усл.кр.-отт. 130,54. УЧ.-ИЗД.Л. 37,22.
Художник И. Б. Кравцов Изд. № 4/2707. Тираж 17100 экз. Зак. 97.
Художественный редактор Л. М. Кузнецова Цена 3 р. 70 к.
Технический редактор 3. И. Резник
Корректор М. А. Смирнов ИЗДАТЕЛЬСТВО «МИР»
Москва, 1-й Рижский пер., 2.
ИБ № 3853
Можайский полиграфкомбинат Союзполиграф-
прома при Государственном комитете СССР
по делам издательств, полиграфии и книжной
торговли.
143200, г. Можайск, ул. Мира, 93.
Замеченные опечатки

Страница Колонка Строка Напечатано Следует читать

Том I
76 (подпись 5 сн. α2β1-контактов α 1 β 2 -контактов
к рис. 4.11)
173 Левая 3 сн. Халдейн Холдейн
196 (подпись к 1-3 сн. North-Holland, North-Holland,
рис. 9.27) 1975, р. 105. За- 1975, р. 105
каз 667. стр. 33-
38 Голдобина С.

Том II
72 Левая 13 сн. Съёстранд Шестранд
88 Правая 17 сн. Дикерсон Диккерсон
96 Левая 8-я св. Дикенс Диккенс
200 » 8 сн. Стекениус Стеккениус
201 » 17 св. » »
273 Правая 5 сн. Аллантоевую Аллантоиновую
Шлегель Г. ОБЩАЯ МИКРОБИОЛОГИЯ
Пер. 6-го нем. изд.- М.: Мир, 1987-
38л., ил.- В пер.: 3 р.

Книга представляет собой перевод


шестого издания популярного в ФРГ
учебника микробиологии, в котором
четко, ясно и компактно изложены сов-
ременные сведения об организации и
жизнедеятельности микроорганизмов.
Шестое издание значительно перерабо-
тано и дополнено по сравнению со
вторым, выпущенным в 1972 году изда-
тельством «Мир».
Для микробиологов - научных сот-
рудников и работников микробиологи-
ческой промышленности, преподавате-
лей и студентов биологических фа-
культетов.

Вам также может понравиться