UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE BAJA CALIFORNIA

COORDINACIÓN DE FORMACIÓN PROFESIONAL Y VINCULACIÓN UNIVERSITARIA

COORDINACIÓN DE FORMACION BÁSICA
PROGRAMA DE UNIDAD DE APRENDIZAJE POR COMPETENCIAS (GUIA)

I. DATOS DE IDENTIFICACIÓN

CENTRO DE INGENIERIA Y TECNOLOGIA CITEC UNIDAD 1. Unidad Académica

VALLE DE LAS PALMAS (s):

2. Programa (s) de estudio: (Técnico, BIOINGENIERIA 3. Vigencia del plan:

Licenciatura (s) _____

4. Nombre de la BIOLOGIA MOLECULAR 5. Clave ____________

Asignatura

6. HC: 3 HL__3__ HT_____ HPC_____ HCL_____ HE _3_ CR___9__

7. Ciclo Escolar: 8. Etapa de formación a la que pertenece:

_________________________________

9. Carácter de la Asignatura: Obligatoria ____________ Optativa _____X______

10. Requisitos para cursar la asignatura: Biología Celular

 Formuló:

____________________________________
_________________________________
M.C. Luis Jesús Villarreal Gómez Q.F.B. José
Román Chávez Méndez
Profesor de Tiempo Completo
Profesor de Asignatura

11 de Octubre de 2010

Vo. Bo.

_________________________________________________ ____________________________________________
Mtro. Rubén Roa Quiñones M. C. Patricia Avitia Carlos
Jefe del Centro de Tecnología e Ingeniería Subdirectora Académica
 II. PROPÓSITO GENERAL DEL CURSO
La biología molecular es una materia de la etapa disciplinaria, que le otorgara al estudiante las bases cognoscitivas y
experimentales, para su desarrollo profesional dentro del área de la Bioingeniería. Es indispensable que los
estudiantes de bioingeniería comprendan las bases fundamentales de la vida, que les permita interpretar y emplear
la información obtenida en diversos procesos biotecnológicos que tengan aplicación en la medicina, industria y
medio-ambiental.

III. COMPETENCIA(S) DEL CURSO

Relacionar los conceptos temáticos referentes al dogma central de la Biología Molecular y replicación con los
fundamentos experimentales que comprenden la manipulación genética, diagnostico molecular, síntesis proteica,
etc., con respeto a la naturaleza y una actitud creativa e innovadora.

IV. EVIDENCIA(S) DE DESEMPEÑO

1.- Reporte de prácticas de laboratorio de acuerdo a formato y habilidades experimental:

El reporte debe constar de las siguientes partes:

Introducción: El propósito de la introducción es dar antecedentes sobre el tema principal de estudio. Para ello se
pueden plantear las siguientes preguntas para su auxilio. ¿Por qué es importante estudiar este tema?, ¿Qué se
conoce hasta la actualidad?, va iniciando de una idea general y va concentrando la idea.
Objetivos: Los objetivos se refieren a lo que se pretende obtener en el estudio, te puedes auxiliar preguntándote
¿Qué?, ¿Cómo? y ¿Con que?.

Metodología: Se debe anotar el material genético y reactivos utilizados, así como describir detalladamente los pasos
seguidos, de tal forma que si otra persona lee el trabajo lo pueda reproducir en el laboratorio.

Resultados: Se debe incluir tablas, graficas y/o esquemas, las cuales deberán estar numeradas y hacer referencia de
ellas dentro del texto. Además se debe describir los resultados que se obtuvieron.

Discusión y conclusiones: Se debe obtener propias conclusiones a partir de la comparación de los resultados con los
de otros autores, explicar los errores, aciertos, pregúntarse ¿qué tan confiables son los resultados? Si los resultados
no fueron los esperados explicar ¿cuál fue la razón?, ¿el trabajo, alcanzó el objetivo planteado?, evalúar la hipótesis
de trabajo.

Bibliografía: Las referencias deben citarse adecuadamente, ejemplos:

Sneeler, P. y Bianchi, D. 1993. Biología celular. Limusa. México. Pp.473-487 (libro)

Tolbert, N. E. y Essner, E. 1981. Metabolic Pathway Peroxisomas and Glioxisomes. Ann. Rev. Biochem. 50:133-157.
(revista)

2.- Resúmenes de lecturas recomendadas

3.- Proyecto de investigación en equipos – investigación relacionada a la innovación y desarrollo en biología molecular de acuerdo a
formato y presentación en plenaria por equipos, video grabado de presentación y publicación de esta en blog de la materia.

4.- Portafolio final con todos los trabajos archivados, presentados por escrito y publicados en blog de la materia

5.- Ensayo final sobre la importancia de la biología molecular en bioingeniería.

6.- Presentación oral colectiva

 V. DESARROLLO POR UNIDADES
Competencia

Enlistar los conceptos básicos de la biología molecular, así como la estructura y función de los ácidos nucleícos en los
diferentes procesos moleculares de los sistemas biológicos, a través de la discusión colectiva y extrapolación de
conocimientos previos con los obtenidos, para su aplicación y comprensión en las diferentes técnicas moleculares de
laboratorio, conservando una actitud de trabajo colaborativo y procuración de entendimiento de los efectos que la
manipulación de organismos tiene sobre el medio natural del ambiente.

Contenido Duración
12 hrs
EL NÚCLEO: CROMOSOMAS, GENES Y CÓDIGO GENÉTICO.

1. Los genes son ADN

1.1. El ADN es el material genético de todos los organismos vivos
1.2. Polinucleotidos
1.3. El ADN es una doble hélice
1.4. La replicación del ADN es semiconservativa
1.5. Hibridacion de los acidos nucleicos
1.6. Mutaciones

2. Los genes codifican proteinas

2.1. Codigo genético
2.2. Mutacion genética y funcion proteica
2.3. Alelos
2.4. Codones
2.5. Procesos involucrados en la expresion genica
2.6. isomeria funcional de proteinas y ADN

3. El gen interrumpido
3.1. Exones e Intrones
3.2. Endonucleasas de restricción y mapeo genetico
3.3. Distribucion de tamaños en los genes
3.4. Secuancias de ADN codifican a mas de una proteina
V. DESARROLLO POR UNIDADES

Competencia

Explicar los mecanismos moleculares que gobiernan el dogma central de la biología distinguiendo y localizando los
procesos cronológicos teóricos aplicables para la comprensión de las técnicas de manipulación de organismos en el
laboratorio y su aplicación dentro del área de la bioingeniería molecular.

Contenido
Duración
DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGIA MOLECULAR 12 hrs

4. ARN mensajero
4.1. ARN splicing y procesado

5. Síntesis de Proteína
5.1. Iniciación, elongación y terminación

6. Utilización del código genético

6.1. Reconocimiento de codones y anticodones
6.2. ARN de transferencia

7. Localización proteica
7.1. Translocacion de proteínas
7.2. Chaperonas
7.3. Peptidos señales

8. Transcripción
8.1. ARN polimerasas
8.2. Promotores y terminadores

9. Operon
9.1. Regulacion positiva y negativa
9.2. Control de genes estructurales
9.3. El operon lac
 9.4 Mutaciones cis y trans, el efecto sobre el operados y el regulador.
9.5 Regulacion de la traduccion

10. ARN regulador

10.1 Estructuras secundarias que controlan la atenuacion
10.2 La atenuacion es controlada por la traduccion
10.3 ARN de interferencia
 V. DESARROLLO POR UNIDADES
Competencia

Enunciar los procesos de replicación, recombinación y reparación genética, a través de la deducción y discriminación del proceso y las
moléculas participantes, con el propósito de aplicar los mecanismos celulares para heredar la información genética entre generaciones, con
disciplina hacia la integración de los contenidos.

Contenido Duración

REPLICACION, REPARACION Y RECOMBINACION DEL ADN 12 hrs

11. Mecanismos de replicación del ADN

11.1. Los orígenes de replicación son asimétricos
11.2. Tipos de replicación del ADN
11.3. Maquina de replicación
11.4. Control genético de la replicación

12. Reparación del ADN

12.1. Mutaciones
12.2. Clasificación de las mutaciones
12.3. Detección de las mutaciones
12.4. Mecanismos de reparación del ADN

13. Recombinación genética

13.1. Recombinación homologa
13.2. Recombinación especifica de sitio
13.3. Transposones
13.4. Mecanismos virales
 V. DESARROLLO POR UNIDADES

Competencia

Combinar las bases teóricas con los elementos experimentales de uso bioindustrial, por medio de
la investigación y experimentación referente a manipulación genética, con compromiso bioético hacia la
sociedad y al ambiente.

Contenido Duración

12 hr
PRODUCCION DE PLASMIDOS PARA USO BIOINDUSTRIAL

14. Tecnología del ADN recombinante

14.1. Reacción en cadena de la polimerasa
14.2. Plásmidos
14.3. Clonación
14.4. Enzimas de restricción
14.5. Vectores

15. Aplicaciones de la ingeniería genética

15.1. Análisis del genoma
15.2. Terapia génica
15.3. Mejoramiento genético
15.4. Biotecnología

16. Introducción a la Bioinformatica

16.1. Bases de datos
16.2. BLAST
16.3. ClustalX y Bioedit
16.4. Construcción de arboles filogenéticos
 VI. ESTRUCTURA DE LAS PRÁCTICAS

No. de Competencia(s) Descripción Material Duración

Práctic de
a Apoyo

1 Insulina, Identificar y comprender las relaciones entre Concurso de modelos atomicos en donde el Plastilina, 2
modelo compocicion quimica, estructura geometrica alumno descriva las relaciones compocicion esferas de
molecular tridimencional y funcion de compuestos quimica-estructura tridimencional-funcion unicel en
de una biologicamente activos, a traves del analisis de biologica, ante el grupo. Se pueden tomar como diferentes
proteina de el dogma central de la biologia: replicacion- base proteinas de bajo peso molecular o tamanos, palillos
5.8 kD transcripcion-traduccion y el control enzimatico secciones de estas que se encuentren ancladas de dientes,
de dichos procesos. al sistema de membranas o formando pegamento, etc.
complejos enzimaticos (metabolicos)

2.- Normas Comprender la importancia que tiene la Introducir al alumno al analisis y comprension Equipo de 2
de aplicación de normas de trabajo en un de las normas oficilales internacionales y laboratorio,
Biosegurida laboratorio de biologia molecular en torno a la nacionales sobre el trabajo de laboratorio en NOM’s, Ley
d bioseguridad y calidad profecional de las biologia molecular. Que pueda interpretar la nacional de
tecnicas desempenadas. importancia que dichas normas tienen en la organismos
bioseguridad y que relacione las funciones de geneticamente
manipulacion de muestras con el equipo modificados.
utilizado. Niveles de
bioseguridad.

3.-
Preparacio Desarrollar la capacidad tecnica y cognoscitiva Esterilizacion de materiales y reactivos para Autoclave,
n de para la preparacion de diluciones y practicas de electroforesis, pcr, etc. materiales de 2
material y esterilizacion de materiales que se utilizan en el Preparacion de buffers y gel de electroforesis. laboratorio,
reactivos laboratorio de biologia molecular agua destilada

4.-
Aislamiento Practicar una tecnica de extraccion molecular El aislamiento del ADN es el principio de Sal de mesa, 2
de ADN rudimentaria al aislar ADN de una muestra de muchos métodos usados en la bioingenieria, bicarbonato de
genomico. celulas y analizar las bases moleculares sobre como la transformación, secuenciación, mapeo sodio, champu,
las que se fundamenta la extraccion para físico, mutagénesis sitio dirigidas, etc. El pina y papaya,
 buscar la transpolacion de los conocimientos al
diseno experimental de nuevas herramientas de
extraccion de materiales biologicos.
5.- Aplicar el conocimiento de las propiedades
Estimacion fisicas de la energia luminosa al efecto que esta
de la tiene sobre las particularidades quimicas de
concentraci sustancias biologicas para el diseno de un
on de ADN metodo de estimacion de la concentracion y
por pureza de material genetico proveniente de una
espectrofot muestra real de un tejido animal o vegetal
ometria (muestra practica 2)
6.-
Electrofore Relacionar las propiedades electro-quimicas de
sis en gel las proteinas y los acidos nucleicos para el
de agarosa diseno de un metodo de separacion selectiva
dependiente de la carga electrica y el tamano
de las moleculas, para permitir el
descubrimiento y aplicación de las bases
fundamentales del diagnostico molecular.
7.-
Amplificaci Aplicar una tecnica basica de biologia molecular
on de ADN, en la amplificacion de material genetico extraido
(Reaccion de microorganismos y celulas diversas. Con el
en cadena fin de aprender a manipular muestras biologicas
de la para valorar la importacia de su adecuada
polimerasa, manipilacion en el area de diagnostico e
pcr) investigacion molecular.
aislamiento de los ácidos nucleicos implica la palillos, tubo
destrucción de la célula por choque osmótico; para centrifuga y
homogeneización, digestión enzimática o centrifuga y/o kit
tratamiento mecánico suave. La separacion del de axtraccion
material genetico se basa en las diferenciias en
densidad que este presenta cuando se pone en
contacto con alcohol, en contacto con este el
adn se desenrrolla y presipita.
El ADN absorve luz uv por la presencia de las Tubos de
bases nitrogenadas que le conponen. La ensaye, muestra 2
absorcion de luz es proporcional a su de ADN,
concentracion. espectrofotomet
La medicion se realiza a un maximo de onda de ro
260nm para el ADN y las proteinas obsorben a
280nm devido a los residuos de triptofano
presentes en ellas. Una relacion A260/A280 entre
1.65-1.9 indican una muestra de ADN pura.
La electroforesis es un procedimiento rutinario Agarosa,
en el analisis molecular de proteinas y acidos camara de 2
nucleicos. El procedimiento nos permite electroforesis,
visualizar y semi cuantificar las sustancias TAE 1X,
antes mencionadas. El principio basico del Bromuro de
metodo consiste en un analisis de migracion de etidio,
las moleculas a trabes de un gel de naturaleza marcadores de
porosa, en el cual, por accion de la aplicación peso molecular,
de un campo electrico, las moleculas son dye.
separaddas de acuerdo a su tamano.
El pcr es una tecnica basica de biologia molecular Muestra de
que realiza una reaccion en cadena catalizada por la ADN, kit de 2
ADN polimerasa y es utilizada para amplificar reactivos para
regiones de adn de cualquier tipo. La tecnica se pcr,
fundamenta en la propiedad fisico-quimica de las adn termociclador.
polimerasas que replican hebras de adn empleando
ciclos de temperaturas establecidos.
8.- Enzimas Costruir y aplicar una tecnica experimental de
de deteccion cuantitativa y cualitativa de material
restriccion genetico al unificar los conceptos desarrollados
en las prácticas anteriores y utilizarlos para
resolver un problema de presencia comun en
los laboratorios de biologia molecular.
9.- Diseñar y demostrar la eficiencia de la
Transferen utilizacion de una tecnica de deteccion
cia de ADN altamente selectiva de material genetico que
a soporte permita relacionar los conceptos teoricos con
solido, las herramientas experimentales dentro del
Southern campo de la biologia molecular.
Blot
BIOINFOR Efectuar un analisis de la base de datos
MATICA moleculares mas grande del mundo que
10.- permita la manipulacion de datos reales para
GeneBank utilizarlos como plantilla en una analisis
bioinformatico molecular.
Las enzimas de restriccion son endonucleasas Kit de enzimas
que pueden reconocer y cortar secuencias de restriccion,
caracteristicas de nucleotidos en el ADN. El material de 2
mecanismo de corte se da por la ruptura de dos electroforesis.
enlaces fosfodiester en la doble hebra dando
lugar a dos cadenas cortas de ADN, las cuales
pueden ser identificadad en contenido
nucleotidico por secuenciacion, ligadas a
proteinas vectoras y clonadas en una celula
procariota o identificadas por su tamano en un
gel de agarosa.
El southern Blot es un metodo que permite Material de
detectar la precencia de una secuencia de ADN electroforesis,
2
en una mezcla compleja de material genetico. kit de enzimas
Primero emplea la separacion electroforetica de restriccion,
para despues separar transfiriendo a una sonda de
membrana solida y detectar usando una sonda hibridacion
de hivridacion marcada, que revelara la marcadas,
presencia de un fragmento mdeterminado de membrana de
ADN. nylon y
membrana
reveladora.
El Genebank es una base de datos de
secuancias geneticas de diversos organismos. Computarora e
Esta cuenta con mas de 1 millon de secuencias internet
2
acumuladas. Asi como un arsenal de
herramientas bioinformaticas importantes para
el estudio de la biologia molecular
11.- Diseñar oligonucleotidos para evaluar un Un oligonucleotido es una secuencia pequena, Computadora e
Deteccion metodo de deteccion genetica manejando el 15-25 bases, de ADN que sirve como iniciador internet.
de software necesario en el proceso. de la pcr en la amplificacion selectiva de ADN. Software:
2
secuencias autoprime,
blanco y primer 3,
diseño de
oligonucleo
tidos

12.- Efectuar la manipulacion de datos moleculares
BLASTn utilizando varias bases de datos mundialmente
reconicidas para resolver, identificar y
cuantificar las relaciones evolutivas entre
organismos diversos molecularmente
equidistantes.
El Basic Local Alignment Tool (BLAST) es una Computadora e 2
erramienta que encuentra regiones de similitud internet.
entre secuencias geneticas comparadas. El Software:
programa compara secuancias geneticas o BLASTn, DDBJ,
proteicas y calcula las similitudes significativas Biozon.
estadisticamente. El analisis es usado
ampliamente para identificar relaciones
evolutivas y similitudes geneticas entre
organismos.

13.-
Creacion Construir arboles filo genetiicos que permitan Un arbol filogenetico es una representacion Computadora e
de arboles manejar las herramientas de analisis de grafica de las relaciones evolutivas entre varias internet. 2
filogenetico evolucion de especies y relacionar el uso de especies o organismos de una misma especie Genebank.
s. modelos matematicos con la resolucion de con ascendencia comun.
problemas biologicos moleculares comunes.

14.- Diseñar un poster con los resultados obtenidos Presentacion en poster (modelo de congreso) Material de
Presentacio del analisis bioinformatico que permita de los resultados obtenidos en el analisis diseno y
n de interpretar y razonar los conceptos bioinformatico de las relaciones evolutivas entre produccion de
reporte en experimentales y teoricos obtenidos durante la organismos diversos. poster. Area de 2
poster materia. Para buscar la participacion activa en exposición al
la divulgacion e investigacion. público
academico.
 VII. METODOLOGÍA DE TRABAJO
El curso se divide en dos secciones: la clase teórica y el laboratorio. El desarrollo de dichas actividades permite el
aprendizaje integral de la biología molecular. Estrategias empleadas por cada actividad:

I. Clases teóricas actualizadas con énfasis en reforzamiento conductual positivo y con uso extensivo de material
audiovisual:
Exposición de conocimientos actualizados de la biología molecular y el uso de la técnica de reforzamiento
conductual positivo en los alumnos, con el fin de promover la confianza, creatividad y participación. Uso constante
de animaciones computacionales y material audiovisual que permita desarrollar ideas claras de los procesos
genéticos en el espacio tridimensional. Exposición de aplicaciones de la biología molecular en el área de bioingeniería
en cada tema, se promoverá la elaboración de notas de clase, trabajos de investigación y desarrollo de temas
selectos.

II. Laboratorio:
Exposición de las técnicas básicas de la biología molecular y realización de prácticas que permitan que los alumnos
desarrollen las habilidades motrices y cognoscitivas requeridas. Se desarrollaran las siguientes prácticas de
laboratorio:

1.- Insulina, modelo molecular de una proteína de 5.8 KD

2.- Preparación de material y reactivos
3.-Extracción y cuantificación de ADN de diferentes organismos
4.-Electroforesis en gel de agarosa
5.- Amplificación de ADN
6.-Enzimas de restricción
7.- Transferencia de ADN a soporte solido, Sourthen Blot
8.- GeneBank
9.- BLAST
10.- Diseño de cebadores
 VIII. CRITERIOS DE EVALUACIÓN

Calificación:

Exposiciones orales 20%

Entrega de tareas individuales 20%
Laboratorio 20%
Exámenes parciales 30%
Participación 10 %

Acreditación:

Obtener una calificación mínima de 60 en el promedio de los exámenes parciales, de lo contrario presentar un examen ordinario y obtener una calificación mínima de 60.

Evaluación:

Se realizará un examen parcial por unidad. Se realizará al menos una tarea por unidad. Se entregará un trabajo de investigación bibliográfica.
Se evaluará quincenalmente la participación en clase.

IX. BIBLIOGRAFÍA
Básica Complementaria
 Karp, G. (1998). Biología Celular y Molecular. México: McGraw-Hill.
Alberts, B. (2008). Molecular biology of the cell. New York: Garland
Science. Freifelder, D. (1998). Essentials Molecular Biology. Estados Unidos:
Jones and Bartlett Publishers.
Allison, L. A. (2007). Fundamental molecular biology. Oxford:
Blackwell.

Karp, G. (2007). Cell and molecular biology: Concepts and

experiments. Chichester: John Wiley.

Wilson, J., & Hunt, T. (2008). Molecular biology of the cell: The
problems book. New York [u.a.]: Garland.