Пиримидиновый димер

Материал из Википедии — свободной энциклопедии

Перейти к навигацииПерейти к поиску

DNA Lesion-Thymine Dimer

Пиримидиновый димер — дефект ДНК, возникающий в результате образования

ковалентной связи между двумя соседними пиримидиновыми основаниями (тимином или
цитозином) под действием ультрафиолетовых лучей[1][2]. Ультрафиолетовые лучи
вызывают разрыв двойной связи и образование в этом месте ковалентной связи между
двумя нуклеотидами[3]. Образование димера приводит к нарушению транскрипции ДНК на
данном участке и возникновению мутаций. Образование димеров является главной
причиной возникновения меланомы у человека.

Содержание

1 Типы димеров

2 Мутагенез

3 Репарация ДНК

4 Примечания

5 Ссылки

Типы димеров

Photodimers

Слева: 6,4-фотопродукт. Справа: циклобутановый димер

В результате реакции возникает либо циклобутановый димер, либо пиримидин-(6,4)-

пиримидиновые фотопродукты. Основу циклобутанового димера составляет
четырёхуглеродное кольцо, возникающее на месте разрыва двух двойных связей соседних
пиримидиновых оснований[4][5][6]. 6,4-фотопродукты, составляют в среднем треть от
количества циклобутановых димеров, однако более мутагенны[7].

Репарацию циклобутановых димеров осуществляет ДНК-фотолиаза[8].

Мутагенез
Пиримидиновые димеры часто вызывают мутации при репликации, репарации или
транскрипции ДНК как у прокариотов, так и у эукариотов. Как тиминовые, так и цитозиновые
димеры, и димеры тимин — цитозин могут вызывать мутации. Цитозиновые димеры чаще
приводят к мутациям, чем тиминовые димеры, а горячие пятна ультрафиолетового
мутагенеза чаще всего совпадают с димерами тимин — цитозин, но ими могут быть и
цитозиновые димеры[9]. Механизмы образования мутаций, вызванных пиримидиновыми
димерами, были разработаны в рамках полимеразной и полимеразно-таутомерной моделей
ультрафиолетового мутагенеза. В полимеразной модели предполагается, что единственной
причиной мутагенеза являются случайные ошибки ДНК-полимераз, ферментов,
встраивающих основания напротив матричных оснований[10]. Полимеразно-таутомерная
модель ультрафиолетового мутагенеза основана на том факте, что при образовании
димеров может изменяться таутомерное состояние входящих в них оснований[11].
Показано, что некоторые из редких таутомерных состояний могут приводить к мишенным
мутациям замены оснований в процессах репликации или репарации[12]. Существуют
модели, основанные на дезаминировании цитозина. Димеры, включающие цитозин,
склонны к деаминированию, включая замену цитозина на тимин[13].

Репарация ДНК

Меланома — одна из злокачественных опухолей кожи

Пиримидиновые димеры вызывают локальные конформационные нарушения в структуре

ДНК, позволяющие ферментам репарации распознавать дефект[14]. У большинства
организмов (исключая плацентарных млекопитающих, к которым относится человек) они
могут восстанавливаться за счёт фотореактивации[15]. Фотореактивация — это процесс, в
котором фермент ДНК-фотолиаза напрямую восстанавливает димер за счёт фотохимической
реакции. Дефекты ДНК обнаруживаются этим ферментом, после чего в результате
поглощения кванта света с длиной волны более 300 нм ковалентная связь между
основаниями разрывается, восстанавливая цепочку ДНК до первоначального состояния[16].

Наиболее универсальный процесс восстановления повреждений ДНК связан с вырезанием

дефектных и близстоящих нуклеотидов и восстановлением комплементарной цепочки[16].

Пигментная ксеродерма — генетическое заболевание человека, вызванное сбоем процесса

репарации фотодимеров и характеризующаяся обесцвечиванием кожи и появлением
опухолей при ультрафиолетовом облучении. Нерепарированные димеры способны также
привести к меланоме[17].