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BIOQUIMICA

Es una ciencia derivada producto del avance de la química y de la biología, que se


encarga del estudio de las moléculas, reacciones y procesos que caracterizan a la
materia viva.
• Molécula: la partícula más pequeña de una sustancia, que mantiene las
propiedades químicas específicas de esa sustancia.
• Reacción: proceso en el que una o más sustancias se transforman en otras
sustancias diferentes.
• la reacción en materia inerte es aislada, es decir independiente una de otra.
• La reacción en materia viva es encadenada, es decir una reacción provoca
otra lo que indica que son complementarias. Debido a esto la materia viva
siempre esta transformándose rápidamente, debido a su dinamismo.

 PROPÓSITO

Comprender los procesos que se desarrollan en la materia a nivel molecular.

 OBJETIVO

En si, es el metabolismo que se define como el conjunto de reacciones químicas que


se llevan a cabo dentro de la célula de los organismos vivos.

 CAMPO DE ACCIÓN

Toda la materia viva que existe en el universo.


HISTORIA DE LA BIOQUIMICA
La bioquímica tuvo sus primeros orígenes en las especulaciones acerca del papel del
aire en la utilización de los alimentos y sobre la naturaleza de las fermentaciones.
Leonardo Da Vinci (1452-1519) fue uno de los primeros en comparar el proceso de
nutrición animal con la combustión de una bujía, línea de pensamiento que más tarde
fue desarrollada por Van Helmont (1648). Sin embargo la verdadera historia de la
bioquímica no comenzó hasta finales del siglo XVIII, en que la ciencia química
comenzó a adquirir forma.
• 1771-1774: Priestley descubre el oxígeno y demuestra que lo consumen los
animales y lo producen las plantas.
• 1773: Rouvelle aísla la urea a partir de la orina.
• 1779-1796: Ingenuos demuestra que la luz es indispensable para la producción
de oxígeno por las plantas verdes. También observa que las plantas consumen
dióxido de carbono.
• 1780-1789: Lavoisier demuestra que los animales requieren oxigeno, reconoce
que la respiración es una oxidación, mide por primera vez el consumo de oxígeno
de un ser humano y reconoce que la fermentación alcohólica es,
fundamentalmente, un proceso químico.
• 1783: Spallanzani deduce que la digestión proteica del estómago es un proceso
más químico que mecánico.
• 1804: Dalton enuncia la teoría atómica.
• 1804: De Saussure hace el primer balance de la estequiometría de los
intercambios gaseosos de la fotosíntesis.
• 1810: Gay-Lussac deduce la ecuación de la fermentación alcohólica.
• 1828: Wöhler sisntetiza la primera sustancia orgánica partiendo de sustancias
inorgánicas: la urea a partir del cianato de plomo y del amoniaco.
• 1830-1840: Liebig desarrolla técnicas de análisis cuantitativo aplicadas a
sistemas biológicos.
• 1833: Payen y Persoz postulan la importancia capital de las enzimas en biología.
• 1837: Berzelius postula la naturaleza catalítica de la fermentación.
• 1838: Schleiden y Schwan enuncian la teoría celular.
• 1838: Mulder realiza los primeros estudios sistemáticos de las proteínas.
• 1850-1855: Bernard aisla glucógeno del hígado, mostrando que se convertía en
la glucosa sanguínea, y descubre también el proceso de la gluconeogénesis.
• 1854-1864: Patear demuestra que la fermentación es provocada por
microorganismos, destruyendo así la hipótesis de la generación espontánea.
• 1859: Darwin publica el origen de las especies.
• 1869: Miescher descubre el DNA.
• 1893: Ostwald demuestra que las enzimas son catalizadores.
• 1903: Neuberg utiliza por primera vez la denominación de bioquímica.
• 1905: Knoop deduce la ß – oxidación de los ácidos grasos.
• 1912: Neuberg propone una ruta metabólica química para la fermentación.
• 1912: Warburg postula la existencia de una enzima respiratorio activador del
oxigeno, descubriendo su inhibición por el cianuro, demostrando la
indispensabilidad del hierro en la respiración.
• 1927: Muller y Stadler demuestran la mutación artificial de los genes por los rayos
X.
• 1935: Stanley cristaliza, por primera vez, un virus, el del mosaico del tabaco.
• 1935: Davson y Danielli postulan un modelo para la estructura de las membranas
celulares.
• 1937: Krebs postula el ciclo del ácido cítrico.
• 1939-1941: Lipmann postula el papel central del ATP en el ciclo de la
transferencia energética.
• 1948: Calvin y Benson descubren que el ácido fosfoglicérico es uno de los
primeros productos intermediarios de la fijación fotosintética del dioxido de
carbono.
• 1951: Lenhinger demuestra que el transporte electrónico desde el NADH al
oxígeno es la fuente de energía inmediata para la fosforilación oxidativa.
• 1952-1954: Zamecnik y sus colegas descubren que las partículas de
ribonucleoproteínas, más tarde denominadas ribosomas, son los sitios de síntesis
proteica.
• 1950-1965: Durante este período se elucionan las etapas principales de la
sisntesis y degradacion de aminoácidos, purinas, dirimidas, ácidos grasos,
glúcidos complejos y lípidos, y compuestos terpenoides, alo que contribuyen
multiples investigadores.
• 1961-1965: Los laboratorios de Nirenberg, Khorana y Ochoa identifican los
vocablos del código genético de los aminoácidos.
DESARROLLO DE LA BIOQUIMICA
 Se ha logrado comprender la función de las biomoleculas:

o Proteínas.
 Fue la primer biomolecula en aparecer en la tierra antes de la vida,
se les llamó coacervados.
 Tienen función estructural. Forman a los seres vivos a excepción
de los vegetales que son formados por carbohidratos en mayor
cantidad (celulosa).
 Nosotros obtenemos los carbohidratos de los vegetales y a partir de
ellos generamos las demás biomoleculas (lípidos, proteínas, y
ácidos nucleicos), a través del metabolismo.
 Somos dependientes de los vegetales puesto que estos son los
únicos que pueden producir su propio alimento a través de la
fotosíntesis.
 Tienen función de transporte. La hemoglobina es la accionante del
metabolismo en las células ya que esta es la que ayuda al oxigeno a
llegar a todas las partes del cuerpo. No se pueden llevar a cabo las
reacciones bioquímicas si no existiera el oxigeno.
 Las células liberan el CO2.

o Carbohidratos. Proporcionan energía directa a las células de los animales


para que se lleven a cabo las reacciones necesarias para su supervivencia
y por lo tanto del individuo.
 En los vegetales tienen función estructural mayoritariamente aunque
también les proporcionan energía. El que los vegetales los usen
principalmente para función estructural y no para producción de
energía se debe a que las plantas son más dependientes de la
energía del sol para producir su energía. Algunas plantas no pueden
sintetizar todas las proteínas.

o Lípidos.

 Función energética y estructural.

o Ácidos nucleicos.

 Función de replicación y reproducción:


• Replicación. Se da la mitosis. Cuando hay reposición de
células con estructura idéntica a la original. Podemos decir
que se da una recombinación genética.
• Reproducción. Se da la meiosis. Un ser da lugar a otro ser
de estructura diferente (se combinan dos células y dan lugar
a otra) mediante la unión sexual.
 Se han delineado las rutas metabólicas de las biomoleculas.
o En la materia viva, los procesos se dan de manera organizada.
o En la materia inerte los procesos se dan de manera desorganizada.
o Cada biomolecula sigue su propia ruta (proceso) metabólica sin cruzarse
entre ellas.
o Cada uno de los procesos característicos de las biomoleculas son las
llamadas rutas metabólicas.

 Se han aislado los principales organelos celulares.


o La célula es la unidad básica de todos los seres vivos.
o Ser vivo → órganos → tejido → células → organelos → biomoleculas →
→elementos o átomos.
o La materia viva inicia en la célula.

 Se conoce la composición química de la célula.

o La célula esta formada por sustancias químicas, por lo que se puede definir
como un conjunto de moléculas en interacción.
o Para que una célula se considere como tal, debe de haber interacción
entre sus moléculas, es decir que se afecten unas a otras.

 Se conoce la función de las enzimas.

o Las células están compuestas por sustancias químicas orgánicas.


Naturalmente las sustancias químicas orgánicas reaccionan muy
lentamente es por ello que necesitan la presencia de catalizadores que les
ayuden a acelerar esas reacciones, estos catalizadores son las llamadas
proteínas.
o Las sustancias químicas inorgánicas reaccionan rápidamente.
o Toda reacción química necesita catalizadores, pero solo las orgánicas son
catalizadas por enzimas.
o Las enzimas controlan la velocidad de las reacciones de sustancias
orgánicas.
o Las enzimas son proteínas.

 Se conoce la estructura y función del DNA.

o DNA responsable de la información genética.

 Se conoce la estructura y función del genoma humano.


o Al conjunto de genes se le conoce como genoma humano.
o Se conoce el número exacto de genes en el ser humano.
o Un ejemplo de la aplicación sobre el conocimiento de estructura genomica
esta demostrado en la recombinación genética que hace posible la
producción de alimentos transgénicos.
RETOS DE LA BIOQUIMICA

• No se conoce el mecanismo de diferenciación celular


o Es un enigma el como de una célula se puedan crear una gran variedad de
células que lleguen a conformar los distintos tejidos.
o No se sabe que pasa con las células para que “de repente” cambien su
forma.

• No se conoce (molecularmente) el momento en el que empieza la vida.


o En que momento se forma un ser vivo.

• No se conocen las funciones cerebrales (memoria, sueños, pensamiento).


o No se sabe que sucede en las moléculas para que podamos soñar, pensar.
BIOQUIMICA: CIENCIA EXPERIMENTAL
Se dice que la bioquímica es una ciencia experimental debido a que la obtención de
conocimientos se lleva a cabo a través del método experimental. Cuando se hacen
investigaciones biológicas lo que se usa es el método experimental, si no se usa este
método no se puede considerar investigación biológica. Para realizar una
investigación experimental los bioquímicos han basado sus descubrimientos
haciendo uso de tres pasos: aislamiento de moléculas, determinación de su
estructura, y determinación de su función. Para poder saber la función de una
molécula, primero hay que conocer su estructura. Aun cuando se habla del método
experimental, es necesario recordar que todos los métodos dependen del método
científico. El paso de aislamiento de moléculas se encuentra dentro de un proceso
llamado fraccionamiento celular:

♣ FRACCIONAMIENTO CELULAR:

• Aislamiento de moléculas: se siguen tres pasos:


o Extracción con solventes: los solventes se usan para disolver
las moléculas que se quieren estudiar. Consiste en exponer al
tejido en solventes orgánicos (cloroformo, benceno, CCl4, etanol).
Para ello se utilizan solventes que no sean muy agresivos o bien
se pueden utilizar diluidos, todo esto se lleva a cabo a 4ºC para
garantizar que el solvente se traiga solo a la molécula que vamos
a estudiar.
o Homogeneización: consiste en colocar el solvente con la
molécula extraída en un tubo de ensaye para posteriormente
depositarlo en un agitador magnético. La homogeneización se
lleva a cabo usando movimientos suaves. Esto se hace para evitar
que se precipiten todos los componentes.
o Centrifugación: se lleva a cabo tres veces, en donde el
sobrenadante de una centrifugación se centrifuga en la siguiente.
De tal manera que se obtienen tres fracciones celulares: una
fracción nuclear, fracción mitocondrial, y fracción microsómica.

♣ ESTRUCTURA DE LA MOLECULAS:

♦ para la determinación de la estructura molecular se utilizan los siguientes


métodos:
o Espectroscopia ultravioleta o infrarroja.
o Espectrometría de masa.
o Cristalografía de rayos X.

♣ DETERMINACIÓN DE LA FUNCIÓN:

♦ Se usan pruebas en los órganos, tejidos y células de animales.


CARBOHIDRATOS
Son sustancias orgánicas constituidas por C, H, O, y N, que ocupan importantes
funciones estructurales y metabólicas tanto en la célula animal como en la vegetal.
Proporcionan energía directa para la realización de sus funciones, principalmente en
los animales; mientras que en los vegetales son los principales constituyentes de su
estructura.
Químicamente son derivados de los polialcoholes ya que resultan de la oxidación de
estos, de tal manera que para que una estructura sea considerada como
carbohidrato debe poseer un grupo carboxilo y varios grupos oxidrilos o hidroxilos.

Estructura ciclica de la glucosa, mayor representante de los carbohidratos


Estructura lineal de la glucosa, mayor representante de los carbohidratos

CLASIFICACIÓN DE CARBOHIDRATOS

 MONOSACARIDOS: Son los carbohidratos más simples, aquellos que no se


pueden descomponer o hidrolizar. Si se descompusieran se obtendrían sustancias
que no son en sí carbohidratos. Como ejemplos de monosacáridos encontramos
los siguientes: glucosa, fructosa, ribosa, galactosa, y manosa.

Los monosacáridos se clasifican por dos criterios:

o No. De átomos de carbono.

 Triosas: tienen tres átomos de carbono.


 Tetrosas: cuatro átomos de carbono.
 Pentosas: cinco átomos de carbono.
 Hexosas: seis átomos de carbono.
 Heptosas: siete átomos de carbono.

- Las más abundantes en la naturaleza son las triosas y las tetrosas.


- Las más importantes biológicamente son las pentosas porque
pertenecen a la ribosa que es un componente esencial de los ácidos
nucleicos, y las hexosas porque pertenecen a la glucosa la cual da
energía tanto a la célula animal como vegetal.

o De acuerdo a la posición del grupo carboxilo.

 Aldosas. Cuando el grupo carboxilo se encuentra en un carbono


o extremo Terminal. Las moléculas tiene dos extremos.
 Cetosas. Cuando el grupo carboxilo se encuentra en un carbono
intermedio.
ESTRUCTURA DE LOS MONOSACARIDOS
La glucosa es el monosacárido original puesto que a partir de su síntesis se origina
los demás.

♦ La primera estructura que se le asignó a la glucosa fue la estructura lineal o


también conocida como estructura de Fisher. Esta estructura le fue asignada
debido a que no se contaba con el equipo necesario para poder observar otra
estructura.

♦ Después de estudios por parte de los bioquímicos se determinó que la estructura


real de la glucosa es la estructura cíclica o también llamada estructura de
Hawarth.
♦ Los estudios continuaron y finalmente se llegó a la conclusión y determinación de
la estructura de silla. Fue descubierta utilizando técnicas de cristalografía de
rayos X. aun cuando esta es la forma real, casi no se utiliza por que es mucho
más compleja que las anteriores.

ISOMERIA DE LOS MONOSACARIDOS


ISOMEROS: Son compuestos que tienen la misma formula pero diferente arreglo
espacial (forma de acomodar).
El hecho de que un compuesto presente isomeros se debe a la presencia de
carbonos asimétricos en su estructura.
Un carbono asimétrico es aquel que esta unido a cuatro grupos distintos, esta
capacidad de unión se debe a que el carbono presenta cuatro ligaduras.
Los posibles isomeros que pueda formar un compuesto esta dado por la formula ;
donde “n” es el numero átomos de carbonos asimétricos.
La glucosa tiene 4 carbonos asimétricos, así que la glucosa puede tener 16 posibles
isomeros.
ACTIVIDAD OPTICA: Se dice que una sustancia posee actividad óptica cuando tiene
la capacidad de desviar la luz polarizada en un plano. Los carbonos asimétricos son
los que dan la actividad óptica.

o Si la luz polarizada se da en el sentido de las manecillas del reloj se


dice que la sustancia es dextrorotatoria o dextrógira y se representa con
un signo así: (+).

o Si la desviación ocurre en sentido contrario a las manecillas del reloj se


dice que la sustancia es levorotatoria o levógira y se representa así: (-).

EJEMPLOS DE ISOMERIA DE LA GLUCOSA

♣ ISOMERIA D Y L: Este tipo de isomería esta dado por la orientación de los


grupos H y OH alrededor del átomo de carbono adyacente al átomo de carbono
con el alcohol primario Terminal. Si el OH de dicho átomo se encuentra a la
derecha, corresponde a la serie D; pero, si el OH se encuentra a la izquierda
corresponde a la serie L.
♣ ∝ Y ß ANOMEROS: Este tipo de isomería esta dado por la variación de la
orientación de los grupos H y OH alrededor del átomo de carbono No. 1. si el OH
esta orientado hacia abajo, el monosacárido corresponde a la serie alfa (∝); y si
esta orientado hacia arriba, corresponde a la serie beta (ß).

♣ EPIMERÍA DE LOS MONOSACARIDOS: Este tipo de isomería esta dada


por la orientación de los grupos H y OH alrededor de los átomos de carbono 2 y 4
de un monosacárido. Si la variación se da en el carbono 2 el isomero resultante es
la manosa; si la variación se presenta en el carbono 4 es la galactosa.
♣ ALDOSA – CETOSA: Este tipo de isomería esta dado por la ubicación del
grupo carbonilo en la estructura del monosacárido. Si el grupo carbonilo se
encuentra en el carbono Terminal entonces tenemos una aldosa (glucosa); si el
grupo carbonilo se encuentra en un carbono intermedio entonces se trata de una
cetosa (fructosa).

ALDOSAS CETOSAS

 DISACARIDOS: Son carbohidratos constituidos por dos moléculas de


monosacáridos unidos mediante un enlace tipo éter denominado glucosídico, el
cual se forma esntre un grupo OH de un monosacárido con el grupo OH de otro
monosacárido, dando lugar ala formación del disacárido correspondiente y una
molécula de agua. Puede ser descompuesto por hidrólisis para separarse en
monosacáridos. Como ejemplo de disacáridos tenemos: sacarosa (glucosa +
fructosa), maltosa (glucosa + glucosa), y lactosa (glucosa + galactosa).
Todos los carbohidratos tienen glucosa, siendo esta esencial para la materia viva.

ISOMERIA DE LOS DISACARIDOS


 MALTOSA. Esta constituida por dos glucosas unidas por medio de un enlace
glucosídico ∝ - 1 - 4

 SACAROSA. Disacárido constituido por una molécula de glucosa y una de


fructosa unidos por enlace glucosídico ∝ - 1 – 2; donde el átomo No. 2 va a ser
aportado por la fructosa.
 LACTOSA. Disacárido constituido por una molécula de glucosa y una de
galactosa, unidas por un enlace glucosídico ß – 1 – 4.

 POLISACARIDOS. Son los carbohidratos más complejos, constituidos por más


de tres unidades de monosacáridos. Como ejemplo de estos, tenemos: almidón,
celulosa, quitina, glucógeno, etc.
Los humanos comemos almidón y celulosa de las plantas, solo que la celulosa no
la podemos descomponer en glucosa, los únicos capaces de realizar esta función
son los animales rumiantes como las vacas.
Las plantas sintetizan almidón, los animales no.
Las células animales sintetizan glucogeno a partir del almidón que consumimos en
exceso.
Las células vegetales no sintetizan glucogeno.

ℵ ALMIDON.
Constituye la fuente más importanete de carbohidratos de los alimentos y se
encuentra en los cereales, legumbres y otros vegetales. Su estructura contiene
dos componentes: amilosa que es una estructura helicoidal no ramificada de
glucosas unidas por enlace glucosídico ∝ - 1 – 4 y amilopectina que es una
estructura muy ramificada con glucosas unidas por enlace glucosídico ∝ - 1 – 4 en
las cadenas y ∝ - 1 – 2 en los puntos de ramificación.

O O

O O

O O

O
O

O
O

O
O

AMILOSA
AMILOPECTINA

NOTA: El que las semillas sean ricas en almidón se debe a que estas tienen por
dentro una plantita, la cual necesita de nutrientes para seguir con vida, y en este
caso estos nutrientes se los da el almidón, es por ello que la planta produce almidón.

ℵ GLUCÓGENO.
Es el polisacárido que se almacena en los tejidos animales. Es una estructura
mucho más ramificada que la amilopectina, la glucosas están unidas mediante un
enlace glucosídico ∝ - 1 – 4 sobre las cadenas y ∝ - 1 – 6 sobre los puntos de
ramificación.
Conocidos coloquialmente con el nombre de grasas. A veces cuando la glucosa
está en exceso y la célula ya no la puede recibir se desvía al glucógeno, y si este
tampoco la puede reci9bir entonces se van a formar a los lípidos.
Son reservas de energía ya que no se usan por la célula directamente sino que
son almacenados.
Contienen vitaminas que ninguna otra biomolecula se la va a dar.
En sí, son sustancias reconocidas como grasas; su principal función es ser fuente
de energía de reserva para las células.

Son un grupo de compuestos heterogéneos (químicamente no se parecen uno con


otro) relacionados con los ácidos grasos que tienen la propiedad común de ser
insolubles en agua pero solubles en solventes orgánicos no polares (éter,
cloroformo, benceno, etc.)

Son reconocidos fácilmente por propiedades físicas que por químicas. La mayoría
tienen ácidos grasos; sin embargo los hay que no los contienen, tales como: el
colesterol, esteroides, etc.

Químicamente, son esteres de ácidos grasos y alcoholes. Esta es la diferencia


entre los lípidos y los carbohidratos (son éteres).

Son importantes constituyentes de los alimentos ya que proporcionan energía


directa y potencial al sistema celular. Además de que son las únicas sustancias
que proporcionan vitaminas liposolubles y ácidos grasos esenciales al sistema
celular.

ℵ FUNCIONES IMPORTANTES

 Actúan como aislantes eléctricos en el sistema nervioso y el cerebro los


lípidos forran a los nervios para que cuando la corriente eléctrica producida
por el cerebro no se disemine o se pierda en el espacio.
 Actúan como aislantes térmicos. El cuerpo humano trabaja o debe mantener
cierta temperatura (36ºC) para que las células trabajen eficientemente y los
lípidos que forran nuestro cuerpo tienen ésta función (que los órganos
mantengan la temperatura ideal).
 Son constituyentes importantes de las membranas celulares. La célula tiene
tantas membranas como organelos celulares, esto es, cada organelo tiene
una membrana. Todas las membranas celulares están constituidas por lípidos
y carbohidratos; formadas de la misma manera (lípidos-carbohidratos-lípidos).

• CLASIFICACIÓN DE LÍPIDOS
Químicamente los lípidos son esteres; intervienen Ac. Grasos + alcohol.

CH3 - CH2 -COOH + CH3 - CH2 - OH H2O + CH3 - CH2 - COO - CH2 - CH3
No hay una sola clasificación ya que son compuestos heterogéneos.

Harper clasifica a los lípidos en tres tipos: simples, complejos, y precursores y


derivados de los lípidos.
Los lípidos simples y complejos, ambos, contienen ácidos grasos, mientras que en
los precursores y derivados no se sabe si contienen ácidos grasos.

© LIPIDOS SIMPLES: Son esteres grasos más diversos alcoholes.

o GRASAS: Son esteres de ácidos grasos con glicerol. Pueden ser


sólidas (mantecas) y líquidas (aceites).

CH2 - OH CH2 - OOC - R

CH - OH + 3 R - COOH CH - OOC - R
(Ác. Grasos)
CH2 - OH CH2 - OOC -R

(Glicerol) (Triglicéridos)

La mayoría de las grasas que se encuentran en la naturaleza son


triglicéridos (por eso son tan conocidos). Según el número de ác.
Grasos pueden llamarse: monogliceridos, digliceridos y triglicéridos.

o CERAS: Esteres de ácidos grasos con alcoholes monohídricos de


alto peso molecular. Para que un alcohol monohídrico tenga alto peso
molecular, su molécula debe tener más de 20 átomos de carbono. El
glicerol no puede formar ceras puesto que es un polialcohol. La cera
más conocida es la utilizada en los panales de abejas (producidas por
las propias abejas).

 LIPIDOS COMPLEJOS: Esteres de ácidos grasos que contienen grupos


adicionales al alcohol y al ácido graso.
Ácido graso + alcohol + otra especie química distinta del alcohol

o FOSFOLÍPIDOS: Junto con los glucolípidos son los lípidos complejos de


mayor importancia biológica.
o GLUCOLÍPIDOS: Junto con los fosfolípidos son los más abundantes en la
naturaleza y por lo tanto los de mayor importancia biológica.
 PRECURSORES Y DERIVADOS: En este grupo se estudia a los ácidos grasos,
glicerol, esteroides, vitaminas liposolubles, terpenos (aceites esenciales, pigmentos
vegetales, vitaminas; canela, clavo, etc.).

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