2 Fundamentos
Tabela periódica
A. Elementos biologicamente importantes 䊎
Existem, na natureza, 81 elementos estáveis.
Desses, quinze estão presentes em todos os
seres vivos, enquanto de oito a dez foram
identificados apenas em determinados orga-
nismos. O quadro A mostra a primeira metade
da tabela periódica, na qual aparecem todos
os elementos biologicamente importantes. Ao
lado de informações químicas e físicas são
fornecidos dados sobre a distribuição dos ele-
mentos na natureza viva e sua freqüência no
organismo humano. As regras subjacentes do
sistema periódico dos elementos são discuti-
das em livros-texto de química.
Mais de 99% de todos os organismos ani-
mais são constituídos por apenas quatro ele-
mentos: hidrogênio (H), oxigênio (O), carbo-
no (C) e nitrogênio (N). O hidrogênio e o oxi-
gênio são os componentes da água, responsá-
vel por 60 a 70% da massa celular (p. 196).
Junto com o carbono e o nitrogênio, o hidro-
gênio e o oxigênio são os constituintes princi-
pais das ligações orgânicas, a partir das quais
ocorrem as reações dos organismos vivos.
Muitas biomoléculas contêm também enxofre
(S) ou fósforo (P). Os chamados macroele-
mentos são essenciais a todos os organismos.
Um segundo grupo de elementos biologi-
camente importantes, que compõem apenas
cerca de 0,5% da massa corporal, existe nos
organismos quase que exclusivamente como
íons inorgânicos. Tal grupo inclui os metais
alcalinos sódio (Na) e potássio (K), assim co-
mo os metais alcalino-terrosos magnésio
(Mg) e cálcio (Ca). Também o halogênio clo-
ro (Cl) encontra-se ionizado nas células. To-
dos os outros elementos, os quais são impor-
tantes para a vida, estão presentes em tão pe-
quenas quantidades que são chamados de ele-
mentos-traço. Esses elementos são principal-
mente do grupo dos metais: ferro (Fe), zinco
(Zn), cobre (Cu), cobalto (Co) ou manganês
(Mn). Alguns poucos não-metais, como iodo
(I) ou selênio (Se), podem também ser classi-
ficados como elementos-traço essenciais.
B. Configurações eletrônicas: exemplos 䊊
As propriedades químicas dos átomos e os ti-
pos de ligações que podem se formar entre
eles são determinados por suas camadas de
elétrons. As representações simplificadas das
configurações eletrônicas dos elementos são
mostradas na figura A. A figura B explica os
símbolos e as abreviações utilizadas. As re-
presentações mais detalhadas são encontradas
em livros-texto de química.
As possíveis posições dos elétrons nos
átomos são chamadas de orbitais. Eles são
representados por um número, o chamado
número quântico principal, e uma letra (p.
ex., s, p ou d). Os orbitais são preenchidos
um a um, conforme o número de elétrons au-
menta, embora cada orbital possa conter ape-
nas dois elétrons, os quais devem possuir mo-
vimentos diferentes chamados de “Spins”. A
figura A mostra a distribuição de elétrons nos
diversos orbitais para cada um dos elemen-
tos. Por exemplo, os seis elétrons do carbono
(B1) ocupam os orbitais 1s, 2s e dois orbitais
2p. O orbital 1s totalmente preenchido repre-
senta a configuração do gás nobre hélio (He).
Esta zona da camada de elétrons do carbono
é abreviada na figura A como “He”. Na colu-
na da direita é apresentado o número de elé-
trons em cada orbital. As camadas de elétrons
do cloro (B2) são como a do neônio acrescida
de sete elétrons nos orbitais 3s e 3p. No ferro,
um metal de transição do primeiro grupo, o
orbital 4s já se encontra ocupado, embora o
orbital 3d ainda não esteja (B3). Muitas rea-
ções dos metais de transição envolvem os or-
bitais d, por exemplo, nas reações de óxido-
redução ou na formação complexa com ba-
ses.
A configuração eletrônica é especialmen-
te estável quando a camada mais externa está
ocupada por oito elétrons (regra do octeto).
Essa regra se aplica, por exemplo, aos gases
nobres, mas também a íons como Cl-(3s23p6)
ou Na+ (2s22p6). Apenas para o hidrogênio e o
hélio são suficientes dois elétrons para com-
pletar o orbital 1s mais externo.
 Química 3

A. Elementos biologicamente importantes

Grupos
1 2 13 14 15 16 17 18

1.01 4,00
1 Metais alca- Grupo Grupo do 2 1s
1
H linoterrosos do boro nitrogênio Halogênios He
1 63 2
6,94 He 9,01 He 10,81 He 12,01 He 14,01 He 16,00 He 19,00 He 20,18 He
2
?Li
3
1

4
2
Be
5
2
1
6 9,5
?B
2
2
7 1,4
2
3 C
2
4
8 25,5 9
2
5 N
10
2
6 O F Ne
2s
2p

22,99 Ne 24,31 Ne 26,98 Ne 28,09 Ne 30,97 Ne 32,07 Ne 35,45 Ne 39,95 Ne

Período

3
Na 1 2
Mg
11 0,03 12 0,01 13
2
1
14
?2
Al
2
2
3 Si 2
4
2
P
5
15 0,22 16 0,05 17 0,03 18
2
6 S Cl Ar 3s
3p

39,10 Ar 40,08 Ar 69,72 Ar 72,61 Ar 74,92 Ar 78,96 Ar 79,90 Ar 83,80 Ar

4
K
19
1

0,06
Ca
20 0,31
2
Ga
31
10
2
1
Ge
32
10
2
2
?
As
33
10
2
3
Se
34
10
2
4
?
Br
35
10
2
5
Kr
36
10
2
6
3d
4s
4p
126,9 Kr
5 Metais Grupo do Grupo do 10 Gases 4d
alcalinos carbono oxigênio I
2 nobres 5s
53 5 5p

Grupos
3 4 5 6 7 8 9 10 11 12

44,96 Ar 47,88 Ar 50,94 Ar 52,00 Ar 54,94 Ar 55,85 Ar 58,93 Ar 58,69 Ar 63,55 Ar 65,39 Ar
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 3d
4 Sc 2 Ti 2 V 2 Cr 2 Mn 2 Fe 2 Co 2 Ni 2 Cu 2 Zn 2 4s
21 22 23 24 25 26 27 28 29 30
95,94 Kr
5 4 4d
Mo 2 5s
42

Macroelemento Elementos-
Massa atômica Configuração traço
30,97 Ne Essencial para...
relativa eletrônica Metal
2 todos/a maioria
Símbolo químico P 3
% no corpo
dos organismos Semi-metal
Número de ordem 15 0,22 para alguns Não-metal
humano
possivelmente ? Gás nobre

B. Configurações eletrônicas

s p s p s p d

3 3
2 Hélio Neônio Argônio 2
(He, gás nobre) (Ne, gás nobre) (Ar, gás nobre)
1 1s2 1s2 2s2 2s6 1s2 2s2 2s6 3s2 3s6 1

4 1. Carbono 4
[He] 2s2 2p2
3 3
[Ar]
2 [Ne] 2
2. Cloro (Cl) 3. Ferro (Fe)
1 [He]
[Ne] 3s2 3p5 [Ar] 4s2 3d6 1
4 Fundamentos
Ligações químicas
A. Hibridização de orbital e ligação química 䊊
As ligações covalentes estáveis entre átomos
de não-metais ocorrem como resultado da
combinação dos orbitais (p. 2) de ambos os
átomos, formando o orbital molecular, o qual
é preenchido por um elétron de cada átomo.
Assim, os quatro elétrons de ligação do car-
bono ocupam os orbitais atômicos 2s e 2p
(1a). O orbital 2s é esférico, enquanto os três
orbitais 2p têm a forma distribuída ao longo
dos eixos x, y e z. Espera-se também que um
átomo de C forme pelo menos dois diferentes
tipos de orbitais moleculares. Geralmente is-
so não ocorre, devido a um efeito chamado de
hibridização de orbital. Através da combina-
ção do orbital s e dos três orbitais p do átomo
de carbono formam-se quatro orbitais atômi-
cos híbridos sp3 equivalentes e de estrutura te-
traédrica (hibridização sp3). Sobrepondo cada
um destes com o orbital 1s de quatro átomos
de H forma-se a molécula de metano (CH4)
(1b). Por essa razão, o carbono pode formar
quatro ligações. A molécula de metano (CH4)
possui quatro ligações simples ou σ (sigma).
De forma semelhante, formam-se ligações
simples entre outros átomos. Os íons fosfato e
o cátion amônio têm, também, estrutura te-
traédrica semelhante (1c).
Um segundo tipo de orbital híbrido do
carbono é formado pelo orbital 2s e apenas
dois dos três orbitais 2p (2a). Por isso, esse
processo denomina-se hibridização sp2. O re-
sultado dessa hibridização são três orbitais
híbridos sp2 equivalentes dispostos sobre um
plano, formando entre si um ângulo de 120°.
O orbital 2p restante posiciona-se perpendi-
cularmente a esse plano. Ao contrário de áto-
mos com hibridização sp3, formam-se dois ti-
pos diferentes de ligação quando se combi-
nam para formar orbitais moleculares (2b).
Os três orbitais sp2 formam ligações σ, já
descritas. Além disso, os elétrons de ambos
os orbitais 2px combinam-se em um orbital-p
oblongo adicional, que se posiciona acima e
abaixo do plano de ligação. Tais ligações são
chamadas de ligações duplas. São formadas
por uma ligação s e uma ligação p e ocorrem
apenas porque ambos os átomos participan-
tes estão hibridizados na forma sp2. As liga-
ções duplas, ao contrário das ligações sim-
ples, não giram livremente, pois uma rotação
distorceria o orbital molecular. Isso se deve
ao fato de os átomos estarem no mesmo pla-
no (2c) e, por isso, existem isômeros cis e
trans (p. 8). Nas biomoléculas, são freqüen-
tes ligações C=C e C=O. As ligações C=N, p.
ex., encontram-se nas aldiminas (bases de
Schiff, p. 178).
B. Ressonância 䊎
Muitas moléculas com muitas ligações duplas
têm capacidade de reação menor do que a es-
perada. A razão disso está no fato de a ligação
dupla nessas estruturas não estar claramente
localizada. Seus orbitais π não se estendem
apenas entre os dois átomos ligados, mas
constituem um orbital p comum ampliado. As
estruturas com essa propriedade são chama-
das de ressonantes, pois as condições dessa li-
gação não podem ser representadas de forma
padrão. Ou se representam estruturas limítro-
fes, com configurações idealizadas, nas quais
os elétrons p de determinados átomos são or-
denados (ver p. 32 e 66), ou se utilizam, como
na figura B, de linhas tracejadas para indicar a
extensão do orbital (detalhes são discutidos
em livros de química).
Neste livro serão utilizadas freqüentemen-
te linhas pontilhadas para representar a locali-
zação alterada dos orbitais π. Ao sistema de
ressonância pertencem, por exemplo, o grupo
carboxilato como no radical formiato, hidro-
carbonetos com ligações duplas como o do
1,3-butadieno e os compostos cíclicos chama-
dos de aromáticos. O composto aromático
mais conhecido é o benzeno (antigamente co-
nhecido como benzol), que possui seis elé-
trons π com localização alterada em seu anel.
As estruturas ressonantes com dez ou mais
elétrons π absorvem luz no espectro visível e
são, por isso, coloridas. Pertencem a este gru-
po, por exemplo, o carotenóide alifático (p.
132) ou o grupo heme, no qual dezoito elé-
trons π ocupam um orbital molecular estendi-
do (p. 106).
 Química 5

A. Hibridização de orbital e ligação química

S Pz Py Px S Pz Py Px

Hibridi- 4 orbitais Hibridi- 3 orbitais

zação atômicos sp3 zação atômicos sp2
sp3 equivalentes sp2 equivalentes
(tetraédrico) (trigonal)
1a 2a

Orbitais sp3 4 orbitais 5 orbitais moleculares

Orbital 1s do do átomo moleculares σ de ligação
átomo de de carbono σ de ligação
hidrogênio
orbital
molecular
π de ligação

C + 4H CH4
1b 2b

Metano Fosfato hidrogenado Íon amônio Alqueno Ligação Aldimina

carbonil
H O H R H R R
H C H O P OH H N H C C C O C N
H O H H R' R' H R'
1c 2c

B. Ressonância
Formiato 1,3 Butadieno Benzeno

Orbital
molecular
π

H
O H H
H C H
Represen- H C C
H C C C
tação da C C H
fórmula O C C
H H H C H
H
6 Fundamentos
Estrutura molecular
O comportamento físico e químico de uma
molécula é determinado pela sua constitui-
ção (a forma e o número de átomos e suas li-
gações). A estrutura da fórmula determina
propriedades junto com a reatividade quími-
ca, o tamanho, a forma da molécula e, até um
determinado grau, sua conformação (o arran-
jo espacial dos átomos na molécula). Nesta
página são apresentadas informações que
servirão de base para tais considerações.
Além disso, descreve-se a L-diidroxifenilala-
nina (L-dopa, p. 352) como exemplo das re-
presentações moleculares que serão utiliza-
das neste livro.
A. Representação das moléculas 䊎
Nas fórmulas estruturais (A1) bidimensio-
nais, os átomos são representados por letras e
os pares de elétrons por traços. Um traço en-
tre dois símbolos de átomos simboliza dois
elétrons de ligação (ver p. 4), todos os outros
traços representam pares de elétrons livres,
como, por exemplo, átomos C e N. Os átomos
livres em geral (e também neste livro) não são
explicitamente representados. Para destacar
elétrons deslocados são utilizadas linhas tra-
cejadas, círculos ou arcos.
O modelo de esferas (A2) é utilizado para a
representação da forma e do tamanho das mo-
léculas. Os átomos são representados por esfe-
ras coloridas (ver código de cores na parte in-
terna da capa) e as ligações (também mais de
uma ligação), como cilindro cinza. Quando se
quer melhor visualização da representação do
tamanho da ligação e ângulos, os átomos são
representados em tamanho diminuído.
Para a representação da forma e do tama-
nho da molécula o modelo de Van der Waals
(A3) é útil; nele, o raio de cada átomo é repre-
sentado por uma esfera ou calota. Sua exten-
são efetiva é representada pelo chamado raio
de Van der Waals. Este ocorre devido à me-
lhor distância entre dois átomos não-ligados.
B. Tamanho e ângulos da ligação 䊊
Atualmente, o raio atômico e a distância são
-12
expressos em picômetros (1pm = 10 m). A
unidade Ångstrom (Å = 100 p) não é mais uti-
lizada. A distância entre átomos ligados por
ligações simples representa, de forma aproxi-
mada, a soma dos raios de covalência desses
átomos (ver lado interno da capa). As ligações
duplas são geralmente de 10 a 20% mais cur-
tas. Para avaliação dos espaçamentos entre os
átomos de uma molécula são utilizados raios
de covalência. Os átomos com hibridização
3
sp formam, entre as ligações simples, ângu-
los de aproximadamente 110°, e aqueles com
2
hibridização sp , ângulos de 120°.
C. Polarização da ligação 䊊
Os átomos diferem em sua eletronegativida-
de, isto é, na sua tendência em receber elé-
trons. Essa propriedade depende da posição
do elemento na tabela periódica (p. 2). Os va-
lores em C2 situam-se em uma escala de 2 a 4.
Quanto maior o valor tanto maior a eletrone-
gatividade do átomo. Quando dois átomos
com eletronegatividades muito diferentes se
ligam, os elétrons de ligação são fortemente
atraídos pelo átomo mais eletronegativo e es-
ta ligação é dita polar. Os átomos participan-
tes possuem, então, cargas parciais negativas
ou positivas. Em C1, está representada a su-
perfície de Van der Waals com suas diferentes
cargas (vermelho=negativo, azul=positivo).
Entre os elementos bioquimicamente impor-
tantes, o oxigênio é o mais eletronegativo. As
ligações duplas entre C=O são mais forte-
mente polarizadas.
D. Pontes de hidrogênio 䊎
As pontes de hidrogênio, uma forma especial
de ligação não-covalente, têm papel de desta-
que na Bioquímica. Em tais pontes, os átomos
de hidrogênio de grupos OH-, NH– ou SH–
(chamados de doadores de pontes de hidrogê-
nio) interagem com os elétrons livres dos áto-
mos aceptores (p. ex., O, N, S). A energia de
-1
ligação de cada ponte de H (10-40 kj . mol )
é bem menor que a energia das ligações cova-
-1
lentes (> 400 kj. mol ). Todavia, como as
pontes de hidrogênio podem ser muito nume-
rosas nas proteínas e no DNA, elas desempe-
nham um papel importante na estabilização
dessas moléculas (p. 68, 84). O significado
das pontes de H para as propriedades da água
será discutido na página 26.
 Química 7

A. Representações moleculares B. Tamanho e ângulos de ligação

Centro
quiral H O H

110
O H H 140 pm

p
111 pm
12

m
4
pm
154 pm 110° 137 pm
C C C O 120°

95
120° 110° 110° 108°

pm
149 pm
120°
O H H 120° 120°
110° 100 pm
H N H H H 110° 110°

1. Fórmulas estruturais C. Polarização da ligação

2. Modelo de esferas

Positivo Neutro Negativo

1. Carga parcial L-dopa

0,9 2,1 2,5 3,0 3,5 4,0

Na H C N O F

1 2 3 4
Eletronegatividade crescente

3. Modelo de Van der Waals 2. Eletronegatividade

D. Pontes de hidrogênio
Ácido Base
Ácido Base Doador Aceptor
dissociado protonada

A H B A H B A H B

Ponto de partida Pontes de hidrogênio Reação completa

1. Princípio

H 290 pm
27
0– 280 pm
28 H N C O N H O CH3
O 0p
m
N
H H HC
H H C O H N C C C C
O O R1 CH HC R2 N C N H N CH
R
H H N H O C N C 290 pm
C N
H O R
Água Proteínas DNA
2. Exemplos
8 Fundamentos

Isomeria léico. Ambas as formas são possíveis, embora

a conformação 1, pela distância entre os gru-
Os isômeros são moléculas com a mesma
pos COOH, seja mais favorável e, por isso, a
composição (isto é, a mesma fórmula molecu-
mais freqüente. As macromoléculas, como as
lar), mas com propriedades químicas e físicas
proteínas e o ácido nucléicos, têm conforma-
diferentes. Isômeros que se diferenciam atra-
ções definidas, que são estabilizadas através
vés da combinação dos átomos na molécula
de ação recíproca na molécula (p. 74).
são chamados isômeros constitucionais (co-
mo o citrato e isocitrato, D). Outras formas de
isômeros referem-se ao arranjo das ligações C. Isômero óptico 䊎
dos radicais (A, B) ou à existência de centro Uma outra forma de isomeria ocorre quando a
quiral na molécula (C). molécula tem um centro quiral ou é ela toda
um quiral. As quiralidade (do grego cheir,
A. Isômeros cis e trans-䊎 mão) refere-se a estruturas que se comportam
como refletidas em um espelho (“antípodas
As ligações duplas não giram livremente (p.
óticos”). A razão mais freqüente de um com-
4). Se os átomos ligados tiverem diferentes
portamento quiral é a existência de um átomo
radicais, há duas possibilidades de orientação.
de C-assimétrico, isto é, um átomo com quatro
Assim, no ácido fumárico, um intermediário
radicais ou substituintes diferentes. Assim, há
do ciclo do citrato (p. 136), os grupos carbo-
duas formas (enantiômeros) com configura-
xil estão em lados diferentes da ligação dupla
ções diferentes. Geralmente denomina-se os
(posição trans). No isômero ácido maléico,
enantiômeros de uma molécula como formas
que não ocorre no metabolismo, os grupos
L e D. Uma ordenação inequívoca permite o
carboxil encontram-se no mesmo lado da li-
chamado sistema R/S (ver livro-texto de Quí-
gação (posição cis). Os isômeros cis-trans
mica).
(isômeros geométricos) diferenciam-se em
Os enantiômeros têm propriedades quími-
suas propriedades químicas e físicas, por
cas muito semelhantes, mas desviam o plano
exemplo, ponto de fusão (PF) e valor de pKa.
de luz polarizada em direções opostas (ativi-
Sua transformação não é possível através de
dade óptica, p. 36, 58). Isso é válido também
reações químicas.
para os enantiômeros do ácido lático. O L-áci-
No metabolismo de lipídeos, a isomeria
do lático encontra-se nos músculos e no san-
cis-trans é especialmente importante. As liga-
gue de animais; a forma D é produzida por
ções em ácidos graxos naturais (p. 48) ocor-
microorganismos e encontra-se, por exemplo,
rem, em geral, na posição cis. Por outro lado,
em produtos derivados de leite (p. 148). Para
os intermediários insaturados da β-oxidação
a representação de centros quirais se utiliza a
estão na forma trans. Isto dificulta a degrada-
projeção de Fisher (p. 58).
ção de ácidos graxos insaturados (p. 166). Na
visão, a isomerização cis-trans do retinal de-
sempenha o papel central (p. 358). D. Reação da aconitase 䊊
As enzimas funcionam em geral de forma es-
B. Confôrmeros* 䊎 tereoespecífica. Nos substratos quirais, elas
atuam em apenas um dos enantiômeros, e os
As estruturas moleculares que se diferenciam
produtos da reação são geralmente uniformes.
pela livre rotação da ligação são chamadas de
A aconitato-hidratase (aconitase) catalisa a
confôrmeros. Pequenas moléculas em solu-
transformação de citrato no isômero isocitra-
ção podem assumir diferentes conformações.
to (p. 136). Embora o citrato não seja quiral, a
Nos confôrmeros do ácido de Bernstein repre-
aconitase liga-se apenas em uma das quatro
sentados, os átomos estão ordenados de forma
formas isoméricas de isocitratos (isocitrato
semelhante ao ácido fumárico e ao ácido ma-
2R,3S-isocitrato). O produto intermediário da
reação, o ácido tricarboxílico aconitato, entra
*
N de T. Em alemão “Konformere”; não existindo na reação apenas na forma cis. A forma trans
esse termo em português, optou-se por utilizar a do aconitato encontra-se na composição de
palavra confôrmeros com significado de “isôme- algumas plantas.
ros conformacionais”.
 Química 9

A. Isômeros cis e trans B. Confôrmeros

Ácido fumárico Ácido

Fp. 287 °C Bernstein
pKa 3,0, 4,5 Conformação 1

sem giro giro livre

Ácido maléico Ácido de

Fp. 130 °C Bernstein
pKa 1,9, 6,5 conformação 2

C. Isômeros ópticos

Projeção
de Fischer
COO OOC

C C
CH3 3HC
HO OH
H COO OOC H
L(S) HO C H H C HO D(R)
CH3 CH3

L-ácido láctico D-ácido lático

Fp. 53 °C 53 °C Fp.
Valor pka 3,7 3,7 valor pKa
Giro + 2,5˚ -2,5˚ Giro
específico Nos músculos, Nos produtos específico
sangue lácticos

D. Reação da aconitase

COO H2O H2O COO

OOC H
H C H C H 2C OH
1 1
OOC C OH C OOC
OOC CH2 COO 3C H
H2C COO H2C COO

Citrato (pró-quiral) cis-Aconitato (produto intermediário) (2R,3S)-Isocitrato

O trans-aconitato aparece nas plantas 1 Aconitase 4.2.1.3

10 Fundamentos
Biomoléculas I
A. Classes de compostos importantes 䊉
A maioria das biomoléculas corresponde a
compostos formados (derivados) de ligações
de não-metais de oxigênio (O), nitrogênio
(N), enxofre (S) e fósforo (P). Os compostos
bioquímicos importantes de oxigênio, nitro-
gênio e enxofre são derivados de compostos
simples ligados ao hidrogênio (hidretos como
H2O, NH3 e H2S). Nos sistemas biológicos, o
fósforo participa geralmente na forma de de-
rivados de ácido fosfórico (H3PO4).
Substituindo nos hidretos de não-metal
um ou mais átomos de hidrogênio por um
grupo R, isto é, um radical alquila, obtém-se
um composto do tipo R-XHn-1, ou R-XHn-2-
R’, e assim por diante. Assim é formada a
água (H2O), o álcool (R-OH) e o éter (R-O-
R’). Do amoníaco (NH3) obtêm-se aminas
primárias (R-NH2), aminas secundárias (R-
NH-R) e aminas terciárias (R-N-R’R”), en-
quanto do sulfeto (H2S) forma-se o tiol (R-
SH) e o tioéter (R-S-R’). Os grupos polares
como –OH ou –NH2 encontram-se como ca-
deias laterais em muitos compostos orgâni-
cos. Esses grupos são chamados de grupos
funcionais devido a sua maior capacidade de
reagir que as estruturas de carbono-hidrogê-
nio nas quais estão ligados.
Através da oxidação dessas ligações for-
mam-se novos grupos funcionais. Assim,
através da oxidação de tióis obtém-se um dis-
sulfeto (R-S-S-R’). A dupla oxidação de um
álcool primário (R-CH2-OH) forma primeiro
um aldeído (R-C(O)-H) e, a seguir, um ácido
carbônico (R-C(O)-OH). Através da oxidação
de um álcool secundário forma-se uma ceto-
na (R-C(O)-R). Uma característica desse
composto é o grupo carbonil (C=O).
A adição de uma amina ao grupo carbonil
de um aldeído forma, após a eliminação de
água, uma aldimina (não-representada, p.
178). As aldiminas são produtos intermediá-
rios do metabolismo de aminoácidos (p. 178)
e servem como elementos de ligação de aldeí-
dos com o grupo amino nas proteínas. Através
da adição de um álcool no grupo carbonil de
um aldeído forma-se um semi-acetal (R-O-
C(H)OH-R’). Ao grupo de semi-acetais per-
tencem, por exemplo, as formas cíclicas dos
açúcares (p. 36). Através da oxidação, forma-
se éster de ácido carboxílico.
Em Biologia, são especialmente impor-
tantes os ácidos carboxílicos e seus derivados,
que podem ser obtidos pela substituição do
grupo –OH por outros grupos. De fato, esses
derivados são formados pela substituição nu-
cleofílica de compostos intermediários ativa-
dos com liberação de água (p. 14). A partir de
ácidos carboxílicos e álcoois formam-se éste-
res de ácidos carboxílicos (R-O-CO-R’). A es-
te grupo pertencem as gorduras (p. 48). De
forma análoga, obtém-se de um ácido carbo-
xílico e um tiol um tioéster (R-S-CO-R’). Os
tioésteres têm um papel importante no meta-
bolismo dos ácidos carboxílicos. O mais co-
nhecido composto desse tipo é a acetil-coen-
zima A (p. 12).
Os ácidos carboxílicos e as aminas primá-
rias reagem para formar as amidas de ácidos
carboxílicos (R-NH-CO-R’). Os aminoáci-
dos, componentes dos peptídeos e das proteí-
nas, ligam-se através de ligações amida-áci-
do, que são também chamadas de ligações
peptídicas (p. 66).
O ácido fosfórico (H3PO4) é um ácido tri-
básico (tri-protonado), isto é, possui três gru-
pos hidroxilas que podem doar íons H+. Sob
condições fisiológicas, pelo menos um desses
três grupos está dissociado. Os outros dois
podem reagir com álcoois, Dessa maneira,
formam-se monoésteres (R-O-P(O)O-OH) e
diésteres (R-O-P(O)O-O-R’) de ácidos fosfó-
ricos. O monoéster de ácido fosfórico encon-
tra-se, p. ex., no metabolismo dos carboidra-
tos, enquanto os grupos de diésteres de ácido
fosfórico encontram-se em fosfolipídeos (p.
50) e ácidos nucléicos (p. 82).
As ligações entre ácidos são chamadas de
anidridos de ácidos. Para a formação de ani-
dridos de ácido é necessária muita energia.
Por isso, as ligações de anidridos de ácido
fosfórico têm papel de destaque na conserva-
ção e liberação de energia na célula (p. 122).
Os anidridos mistos de ácidos carboxílicos e
de fósforo também são metabólitos ricos em
energia e importantes para o metabolismo.
 Química 11

A. Classes de compostos importantes

Oxigênio O Grupo carbonil Nitrogênio N

Água H H O Grupo amino

O R H H H
H C
R R' N N
O
Álcool
secundário Oxidação
Cetona H H
R C R' Amina Amônia
primária
H H
Álcool O Oxidação R R' R R'
primário N
N
R C R'
O H R''
H
Aldeído Amina Amina
R R'
Éter
O C secundária terciária
H R'

H O
O R C
R Oxidação
O O C R' N R'
R
O P O H
Semi-acetal H
H Amida de ácido carboxílico
O Grupo carboxil O
Éster de
ácido fosfórico H C
O R' O
O Ácido carboxílico
R C
S R'
R C
O R' Tioéster
Éster de ácido carbônico

Fósforo P O O Enxofre S
R
O P O C R' H H
S
O Ácido sulfídrico

O Anidrido misto R H
H S
O P O
H Tiol Grupo
O sulfidrila
O O
Fosfato diidrogenado
R
O P O P O R R'
H S S
O O
Dissulfeto
Anidrido de ácido fosfórico
Ligação rica em energia
12 Fundamentos
Biomoléculas II
Muitas biomoléculas são módulos constituí-
dos por pequenas unidades, nas quais elas po-
dem ser decompostas. Na maioria das vezes, a
síntese dessas moléculas ocorre através de
condensação, com a retirada de uma molécu-
la de água. Por outro lado, sua degradação
ocorre de forma hidrolítica, isto é, com a en-
trada de uma molécula de água. Na página se-
guinte, apresentamos esse princípio modular,
utilizando como exemplo uma coenzima im-
portante.
A. Acetil-CoA 䊎
A coenzima (ver também p. 106) é um nucleo-
tídeo complexo (p. 80), e sua função consiste
em ativar resíduos alifáticos de ácidos carbo-
xílicos (resíduos acil-). Através da ligação do
grupo carboxil do ácido carboxílico com o
grupo tiol da coenzima, forma-se uma ligação
tioéster (-S-CO-R, ver p. 10), na qual o resí-
duo acil possui alto potencial químico. Ele po-
de, assim, ser transferido para outras molécu-
las através de reações exoergônicas. Este me-
canismo de transferência tem papel importan-
te principalmente no metabolismo dos lipí-
deos (ver p. 162 e ss.), mas também em duas
reações do ciclo do citrato (ver p. 136).
Como comentado na p. 16, o potencial de
transferência de grupos é quantificado como
alteração da energia livre (ΔG) pela hidrólise
da ligação em questão. Esta é uma afirmação
arbitrária, há, porém, evidências importantes
do potencial químico a partir do qual o referi-
do grupo é formado. No caso da acetil-CoA
considera-se também a reação
Acetil CoA + H2O → Acetato + CoA
Sob condições padrão e em pH 7,0, a alte-
0'
ração do potencial químico (ΔG , ver p. 18)
-1
dessa reação é de – 32 kJ . mol e é, dessa for-
ma, semelhante ao ΔG da hidrólise do ATP
0'
(ver p. 18). Além das ligações tioéster ricas
em energia, a acetil-CoA possui outras sete li-
gações hidrolisáveis com diferentes graus de
estabilidade. Essas ligações e os fragmentos
que se formam pela sua hidrólise são comen-
tados na sua ordem.
(1) O grupo tiol reativo da coenzima A en-
contra-se em uma região da molécula que é
derivada de cisteamina. A cisteamina é uma
amina biogênica (ver p. 62), que é formada
pela descarboxilação do aminoácido cisteína.
(2) O grupo amina da cisteamina liga-se
através de uma ligação amida-ácido (-CO-
NH-) com o grupo carboxílico de uma outra
amina biogênica. A β-alanina forma-se pela
descarboxilação do aminoácido aspartato, po-
rém pode também ser formada pela decompo-
sição de bases pirimídicas (ver p. 186).
(3) Uma outra ligação amida-ácido (-CO-
NH-) faz a ligação com o componente seguin-
te, o pantoinato. Essa ligação possui um cen-
tro quiral e pode, assim, apresentar-se na for-
ma de dois enantiômeros (ver p. 8). A coenzi-
ma A natural é encontrada em apenas uma das
formas, o (R)-pantoinato. O metabolismo hu-
mano não pode sintetizar o pantoinato, e de-
ve, por isso, receber um composto formado
pela ligação de β-alanina e pantoinato, o pan-
totenato (“ácido pantotênico”) na forma de
vitamina na alimentação (ver p. 366).
(4) O grupo hidroxil do C-4 do pantotena-
to liga-se através de uma ligação éster a um
resíduo de fosfato.
A parte da molécula apresentada até aqui
representa uma unidade funcional. É sinteti-
zada nas células sob a forma de pantotenato.
Na forma de 4’-fosfopantoteína, essa molécu-
la aparece ligada à enzima ácido-graxo-sinta-
se (ver p. 168). Na coenzima A ela se encon-
tra, por outro lado, ligada à 3’,5’-adenosina-
difosfato.
(5) A ligação entre os dois resíduos de fos-
fato não é uma ligação éster, mas uma ligação
anidrido fosfórica, como aparece também em
outros fosfatos de nucleosídeos. Por outro la-
do, em (6) e (7) tem-se novamente ligações
éster.
(8) A base adenina liga-se ao C-1da ribose
através de uma ligação N-glicosídica (ver p.
36). Junto a C-2 e C-4, o C-1 da ribose forma
também um centro quiral. Nos nucleotídeos
encontra-se, em regra, a β-configuração.
 Química 13

A. Acetil-CoA

CH3
Acetato
C O
Ligação
tioéster S

CH2
Cisteamina
CH2

Ligação H N
ácido-
amida C O

CH2
β-alanina
CH2

Ligação H N
ácido-
amida C O

H C OH
Pantoinato
H 3C C CH3 Modelo de Van der Waals

CH2
Ligação
éster ácido O
fosfórico
O P O
Fosfato Ligação
anidrida ácido O NH2
fosfórico
O P O
N
Fosfato Ligação N
O HC
éster ácido
fosfórico
CH2 N N Adenina

Ribose O
H H Ligação
H H N-glicosídica
Ligação
éster ácido O OH
fosfórico
O P O

Fosfato O Ligação rica em energia

Centro quiral
14 Fundamentos
Reações químicas
As reações químicas são processos pelos quais
elétrons ou grupos de moléculas são armaze-
nados, trocados entre moléculas ou deslocados
dentro de uma molécula. Apresentamos aqui
os tipos de reações mais importantes através
de exemplos simples. Os elétrons recolocados
são representados por setas vermelhas.
A. Reações de óxido-redução 䊎
Nas reações de óxido-redução (ver p. 32), os
elétrons são transferidos de uma molécula
(agente redutor) a outra (agente oxidante). Ao
mesmo tempo, são freqüentemente transferi-
dos um ou dois prótons; contudo, o critério
decisivo para que ocorra uma reação de óxi-
do-redução é a transferência do elétron. O
agente redutor torna-se oxidado durante a rea-
ção e o agente oxidante, reduzido.
A Figura A mostra a oxidação de um álcool a
aldeído (1), bem como a redução de um aldeí-
do a álcool (2). Um íon hidreto (dois elétrons
e um próton, ver p. 32) é, assim, na reação 1,
transferido para o agente oxidante A. O pró-
ton excedente é ligado a uma base com ação
catalítica B. Na redução do aldeído (2), A-H
serve como agente redutor e o ácido H-B co-
mo catalisador.
B. Reações ácido-base 䊎
Ao contrário das reações de óxido-redução,
nas reações ácido-base (ver p. 30) ocorre ape-
nas a transferência de prótons. Na dissocia-
ção de um ácido (1), a água atua como acep-
tor de prótons (isto é, como base). Por outro
lado, a água assume a função de ácido na pro-
tonação de um ânion carboxilato (2).
C. Adição/eliminação 䊎
A reação na qual átomos ou moléculas for-
mam mais de uma ligação, é chamada de adi-
ção. O contrário da adição, ou seja, a reação
que provoca a perda de radicais ou átomos ou
a separação de moléculas com a formação de
uma ligação dupla, é chamada de eliminação.
Na adição de água a um alqueno (1a), um pró-
ton é, primeiramente, transferido para o al-
queno. O produto intermediário, o cátion car-
bênio, é instável e recebe primeiramente água
(não mostrado), antes da eliminação de um
próton para a formação de álcool (1b). A eli-
minação de água do álcool (2, desidratação) é
da mesma forma catalisada por um ácido e
processa os mesmos produtos intermediários
como a reação de adição.
D. Substituição nucleofílica 䊎
Uma reação na qual um grupo (ver p. 10) é
trocado por outro, é chamada de substituição.
De acordo com o processo, pode-se diferen-
ciar entre reações de substituição nucleofíli-
cas ou electrofílicas (consultar livro de Quí-
mica). As reações nucleofílicas iniciam com a
adição de uma molécula a outra, seguida da
eliminação de um grupo inicial.
Como exemplo para o chamado mecanismo
SN2 é apresentada a hidrólise de um éster a ál-
cool e ácido (1), bem como a esterificação de
um ácido de carbono com um álcool (2). Am-
bas as reações são facilitadas pela distinta po-
laridade da ligação dupla C=C. Na hidrólise
de éster aqui representada, um próton é retira-
do de uma molécula de água pelo efeito cata-
-
lítico da base B. O íon OH , fortemente nu-
cleofílico, reage com o C-carbonil do éster,
positivamente carregado, e originando uma
3
condição hibridizada sp transitória e instável.
A água é eliminada (2b) e o éster é novamen-
te formado, ou ocorre a eliminação de álcool
ROH (1b), e forma-se um ácido livre. Na rea-
ção de esterificação (2), ocorrem as mesmas
etapas em seqüência inversa.
Outras informações
Na redistribuição (isomerização, não-de-
monstrada), grupos são deslocados dentro da
mesma molécula. Exemplos bioquímicos são
a isomerização de fosfatos de açúcares (p.
36) e de metilmalonil-CoA a succinil-CoA
(ver p. 166).
 Química 15

A. Reações de óxido-redução B. Reações ácido-base

H H B H
R C O O
O H H
H R C
A 1
1 O
H O
H H
A B H B A R C
H H H O O
1 H H H O
R C O O H 1
R C
2 R C
H O
2
A B H B H O
Álcool Aldeído O H O H O
A Ácido
H R C
H 2 2 O H O
R C O H
H Ânion
O R C
H B
A O

C. Adição/eliminação
O H
BH B H B BH
H R H H H H
1a 1b
C C R C C R' R C C R'
2a 2b
R' H H O H
BH B H B H
BH
Alqueno Íon carbênio O H Álcool

D. Substituições nucleofílicas

1a B 1b O H
R H
R C O
O C O H
R' O
R' O H B

H
R' O Álcool
O H B BH BH B
R O H H O H
1a 1b
O C R C O R C
R' O 2b 2a O
R' O
Éster O H B BH Estado BH B R' O Ácido
H intermediário H carboxílico
Álcool
2b H B 2a O H
R C
O H
O
R C O R' O
R' O H B