Добрый день, уважаемые члены жюри и участники турнира!

Меня зовут Василовская Виолетта,

я представитель школы номер 3 и я выступаю в роли докладчика по решению задачи номер 1
«Dimicandum»

Что ж начнем с целей доклада :

1. Выяснить, что же такое вирусы и какова их биологическая роль
2. Исследовать происхождение вирусов
3. Предложить протокол проверки вирусной инфекции на конкретном примере

Итак, на сегодняшний день существует огромное изобилие разнообразных неклеточных форм

жизни , которые являются абсолютными клеточными паразитами т.е. вирусы. В нашем
представлении вирусы причиняют в основном лишь вред, но оказалось это далеко не так, их
биологическая роль достаточно недооценена. Без существования вирусов не могло бы
произойти эволюции иммунной системы, не регулировалась бы численность заболевших
хозяев, не осуществлялся бы горизонтальный перенос генов(передача генетической
информации между особами одного вида).

Но все же не стоит забывать об их смертельной опасности .Эпидемии, вызванные вспышками

возбудителей привели к огромным последствиям. Так только от вспышки возбудителя
лихорадки эбола в 1976 году РНК-геномного вируса рода Filovirus погибло более 90%
заболевших или же вспышки инфекции H5N1 более известный как птичий грипп унесший
более 25 тысяч жизней людей в 2009 году. Это лишь единичные примеры в истории
человечества.
В последние года появилась острая потребность исследовать возбудителей инфекционных
заболеваний. Было проведено множество исследований по происхождению небезизвестных
штаммов гриппа, вируса, провоцирующий Ближневосто́чный респирато́рный синдро́м
(летальность 35% в 2012-2019)

И к каким же результатам привели эти исследования?

Ученые продемонстрировали, что вирус, провоцирующий Ближневосто́чный респирато́рный
синдро́м (англ. Middle East respiratory syndrome, MERS)  — воспалительное заболевание
органов дыхания, вызываемое вирусом рода Betacoronavirus подсемейства Coronavirinae[1])
)«перепрыгивал» со своего основного хозяина — одногорбого верблюда — на человека не один
раз, так что каждая вспышка заболевания была связана с отдельным переходом
и спровоцирована независимыми мутациями вируса. Следовательно, огромную роль в
распространении могут играть переносчики и промежуточные хозяева( насекомые(клещи)
животные(одногобый верблюд))

Итак, перейдем непосредственно к происхождению возбудителей вирусов

Этот вопрос вызывает много споров среди вирусологов. На фоне этого были сформированы 3
гипотезы происхождения возбудителей вирусных инфекций:
4. Прогрессивная гипотеза или гипотеза «бегства» утверждает, что вирусы возникли из
генетических элементов, которые приобрели способность перемещаться между клетками
5. Регрессивная гипотеза утверждает, что вирусы являются остатками клеточных организмов
6. Гипотеза «вирус-первый» гласит, что вирусы эволюционировали одновременно с их
нынешними хозяевами.
Попробуем рассмотреть происхождение конкретного возбудителя вируса Covid - 19 .В 2013
году у летучих мышей — подковоносов был обнаружен коронавирус, способный использовать
для попадания в клетки не только их собственные мембранные белки, (рецепторы ACE2), но и
мембранные белки цивет(циветы стали промежуточным звеном, через которое Тяжёлый острый
респираторный синдром (атипичная пневмония) передался от летучих мышей людям.) и людей.
Чтобы спрогнозировать угрозу, исходящую от потенциального патогена, требуется понимать,
как именно он может измениться и каких изменений ему достаточно для того, чтобы стать
опасным.

Именно для того, чтобы понять, насколько опасны циркулирующие в популяции летучих
мышей вирусы, в 2015 году при участии лаборатории в Ухане был изготовлен вирус-химера
SARS-CoV с промежуточной «пересадкой» в цивете, Вирус SARS-CoV тоже пришел к нам
от летучих мышей, но с промежуточной «пересадкой» в цивете(род хищных млекопитающих из
семейства виверровых. Обитают в субтропических и тропических странах Африки и Азии.)

Если секвенировать геном вируса-химеры, то можно увидеть блоки, из которых он был

построен, — они будут похожи на участки исходных вирусов.

Вызвавший сегодняшнюю пандемию штамм не подходит под предложенный вариант.Во-

первых, геном SARS-CoV-2 не обладает такой блочной структурой: отличия от других
известных штаммов рассыпаны по всему геному. Это один из признаков естественной
эволюции.
Во-вторых, никаких вставок, похожих на другие патогенные вирусы, в этом геноме тоже
не найдены.
Поэтому оснований считать, что современный SARS-CoV-2 — это версия синтетического
вируса 2015 года, нет.

Хотелось бы еще остановится на том, а возможно ли доказать искусственное или синтетическое

происхождение патогенного агента?

Основная идентификация вируса у человека происходит с помощью пцр (Полимера́зная

цепна́я реа́кция (ПЦР) — метод молекулярной биологии, позволяющий добиться значительного
увеличения малых концентраций определённых фрагментов нуклеиновой кислоты (ДНК) в
биологическом материале), с помощью которой можно определить возбудителя. Считаем, что
вектор(переносчик) синтетического происхождения обязательно оставляет свои материальные
следы в геноме вируса, способствуя стабильной экспрессии.(процесс, в ходе которого
наследственная информация от гена (последовательности нуклеотидов ДНК) преобразуется в
функциональный продукт — РНК или белок. ), но данного процесса при проверки вируса
Covid-19 не было обнаружено.

Таким образом, можно предложить следующий протокол проверки происхождения

возбудителя:

1 этап: исследовать симптоматику болезни.Ученые могут по симптомам болезни

приблизительно знать, какой вирус её вызывает. Поэтому, когда мы знаем, что болезнь
вызывается коронавирусом, у неё будет определённое течение (это можно пронаблюдать на
примере вирусов того же семейства, протекающих в последние 10 лет).

2 этап: исследование путей распространения вирусов.Ключевая особенность вирусов

заключается в том, что они не могут распространятся в природе самостоятельно и помогают им
в этом живые организмы. Поэтому важно изучить эпицентр возникновения вируса, и понять
какие другие биологические системы могли бы помочь ему распространится: насекомые, люди
и т.д. Также, стоит не забывать про способы попадания вируса внутрь организма: воздушно-
капельный, через покровы тела и т.д.

3 этап: исследование самого вируса в случае, если его природа вызывает сомнения.(я думаю,
что в случае с коронавирусом это вирогения, когда геном вируса соединяется с генетическим
аппаратом клетки и во время деления клетки может не проявляться сразу же, а передаваться
дочерними клетками). Исследование кодирующих и некодирующих участков генома вируса.

4 этап: исследовать генокод вируса. Если последовательность генов в регулирующей

области неестественна для данного типа вирусов, это может говорить о его искусственном
происхождении. В нашем случае в возбудителях  коронавируса из группы SARS в S-белке
произошли изменения в участках, необходимых для импорта и экспорта в ядро клетки.
Сигнальные последовательности, по которым ферменты узнают, где должен находиться белок,
и переносят его туда, стали заметнее в этой группе штаммов.В анализ попал 3001 геном, 944 из
которых принадлежат семи патогенным для человека штаммам. Все они были выравнены
между собой, а затем при помощи SVM в данных искали ключевые участки ДНК, по которым
можно было бы предсказать опасность вируса для человека. Всего нашлось 11 участков, 6 из
которых пришлось на гены S-белка и белка нуклеокапсида (N-белок), — основы для упаковки
РНК вируса.Это значит, что, по-видимому, правильная локализация этого белка играет важную
роль в развитии патогенности.

Итак, переходим к выводам

1. Без вирусов наша жизнь была бы невозможна. Именно они способствовали эволюции
иммунной системы, регуляции численности заболевших хозяев, осуществлению
горизонтального переноса генов
2. Точное происхождение вирусов до сих пор точно неизвестно, но есть основания
предполагать, что вирусы эволюционируют путем естественного отбора или же под влиянием
переносчиков, промежуточных хозяев.
3. Предложенная проверка коронавирусной инфекции предпологает четырехэтапную проверку
возбудителя SARS-CoV и детальное изучение симптомов, путей распространения и генома
данного штамма вируса.

Спасибо за внимание! Оказалось, что в геноме SARS-CoV-2 встречается необычно много

мутаций, которые приводят к замене гуанина (Г), из которых состоят цепочки РНК и ДНК, на молекулы
урацила (У). В общей сложности к этой категории относятся почти две сотни (15%) обнаруженных
мутаций. Это почти в десять раз больше, чем доля таких мутаций у предка SARS-CoV-2 до заражения
человека. .обьяснение 4го этапа