О Н +
С + Н N
О– Н
– +
СОО Н3N
Ионная связь
Связи, стабилизирующие
белковую молекулу
SН НS
Окисление Восстановление
S S
Дисульфидная связь
Водородные связи
•В образовании водородной
связи принимают участие
атомы Н, ОН-, NH- и SH-гpупп
- доноры водородной связи,
которые взаимодействуют со
свободной парой электронов
атомов-акцепторов
(например, О, N или S).
• Складываются из дисперсионных
сил притяжения атомов и сил
взаимного отталкивания их
электронных оболочек.
• Возникают на малом расстоянии
м/ду молекулами и имеют в основе
кулоновские силы
электростатического притяжения
(смещение электронных орбит б.) Диполи могут воздействовать на
относительно ядра, что ведет к неполярные молекулы, превращая
образованию диполя) их в индуцированные (наведенные)
диполи
• а). При сближении полярных
молекул они ориентируются таким в) В любой молекуле возникают
образом, чтобы положительная флуктуации (колебание)
электрической плотности, в
сторона одного диполя была
результате чего появляются
ориентирована к отрицательной мгновенные диполи, которые в
стороне другого диполя свою очередь индуцируют мгновен-
ные диполи у соседних молекул
Ионные связи
• Ионные, или электростатические,
взаимодействия представляют
собой взаимодействия
заряженных групп.
• При этом, как известно,
одноименно заряженные группы
отталкиваются, а разноименно
заряженные притягиваются.
• К ним относятся, в частности,
взаимодействия ионогенных
групп, образующих солевые связи.
• Если разница
электроотрицательности велика
(2,0 и выше), то обр-ся ионная
связь, а меньше 1,0 –
ковалентная.
• Фермент—кофермент
• Фермент—субстрат
• Антиген—антитело
• Олигопептиды (ди-, три-, тетра-)– до 20 АК
• Полипептиды – от 20 до 50 АК
• Белки – более 50 АК М.м – свыше 6000.
• Каждому белку свойственна своя
геометрическая форма или конформация.
• 4 уровня организации белков
• Аминокислотная последовательность
определяет пространственную структуру
белка, а структура эта уже определяет его
функцию
Уровни структурной организации белка
•В поджелудочной железе
в качестве запасной
формы содержится
гексамер инсулина (из 6
мономеров),
стабилизированный
ионами Zn2+.
•В образовании двух
комплексов с катионом
Zn2+ принимают участие
остатки гистидина в
положении B-10 всех
шести субъединиц.
Функция инсулина.
• Инсулин - важнейший регулятор промежуточного
обмена веществ.
Стабилизируют α-спираль:
Ala, Val, Leu, Phe, Trp, Met, His, Gln
Дестабилизируют α-спираль:
Gly, Glu, Asp, Ile, Lys, Arg, Tyr, Asn, Ser, Cys
Водородные
связи
СО - - -NH
Вторичная структура белка - β-складчатая структура
0,272 нм
Вторичная структура белка - β-складчатая структура
Параллельная структура
Вид сбоку
Антипараллельная структура
Вид сбоку
Формирование складчатой структуры
•β- структура формируется между
линейными областями одной
полипептидной цепи.
•Полипептидные цепи могут
формировать параллельные (N- и C-
концы пептидных цепей совпадают и
водородные связи у них слабее чем в
антипар-х) или антипараллельные (N- и
C- концы цепей лежат в
противоположных направлениях) β-
структуры.
По наличию α-
спиралей и β–
структур
глобулярные белки
делятся на 4 группы:
1. Белки, в которых
имеются только α–
спирали ,н-р
миоглобин,
гемоглобин.
2. Белки – и α-спирали
и β-структуры.
3. Белки – только β-структуру,
в иммуноглобулинах,
ферментах.
4. Белки – незначительное
кол-во регулярных
вторичных структур,
•В Α-цепи имеются
два коротких
участка, а в В-цепи
— один длинный
участок,
построенные в виде
α-спирали.
α/β
• Поддержанию третичной структуры белка способствуют
гидрофобные связи, которые образуются внутри
молекулы. В образовании этих связей принимают участие
неполярные радикалы аминокислот.
б а - электростатическое
взаимодействие;
б - водородная связь;
в г в - гидрофобные взаимодействия
д неполярных групп;
в г - диполь-дипольные
взаимодействия;
д - дисульфидная (ковалентная)
связь.
Четвертичная структура белка
Четвертичная структура характерна для белков, состоящих
из нескольких полипептидных цепей.
Она возникает в результате ассоциации нескольких субъединиц в
компактную глобулу. Это взаимное расположение субъединиц
белка в пространстве.
•Олигомерная молекула
гемоглобина (красные диски –
группы гема).
α-Цепи светлые; β-цепи темные;
группы гема красные.
• Белки с четвертичной структурой называются
олигомерными, а составляющие их индивидуальные
полипептидные цепи — субъединицами
протомерами или мономерами.
• Такие соединения стабилизируются водородными
связями и электростатическими взаимодействиями
между АК-остатками, расположенными на
поверхности протомеров.
• Преимущества белков с четвертичной
структурой:
• 1) экономия генетического материала;
• 2) уменьшение числа ошибок при синтезе белка;
• 3) качественное разнообразие белков — появление у
белков новых функций.
Образование четвертичной структуры
глобулярного белка
Folding белков.
Белки синтезируются в рибосомах в виде длинной
полипептидной нити, но затем быстро
сворачиваются в свою естественную («нативную»)
пространственную структуру.
Этот процесс называется фолдинг белка
Стадии образования нативной конформации
белка ( Folding белков )
• Вначале очень быстро (за
миллисекунды) формируются
элементы вторичной структуры,
служащие как бы “затравками”