Цели

После локального иссечения раннего рака прямой кишки состояние

лимфатических узлов неизвестно. Для определения наиболее подходящего
последующего лечения необходим альтернативный способ точной оценки
риска рецидива. Используемые в настоящее время меры являются
неоптимальными. Мы оценили три показателя содержания опухолевой стромы,
чтобы определить их прогностическую ценность после локального иссечения в
описанной группе пациентов с раком прямой кишки без предшествующей
лучевой терапии.
Методы и результаты
Всего было включено 143 пациента. Гематоксилиновые и эозиновые (ГиЭ)
срезы сканировались для
І. глубинной нейронной сети (ГНС, алгоритм машинного обучения)
сегментации опухоли на отделы, включая десмопластическую строму и
воспаленную строму;
ІІ. цифровой оценки стромальной фракции опухоли (СФО) и оптического
анализа плоидности ДНК.
Секвенирование 3′ мРНК проводилось для получения данных экспрессии генов,
на основании которых рассчитывались стромальные и иммунные баллы с
использованием метода ESTIMATE. Полные результаты были получены для
139 образцов и сравнивались с выживаемостью без болезни. Все три метода
оказались прогностическими. Наиболее сильным прогностическим показателем
было определяемое ГНС соотношение десмопластической и воспаленной
стромы >5,41 (P < 0,0001). Соотношение стромального и иммунного балла
ESTIMATE <1,19 также предсказывало выживаемость без болезни (P =
0,00051), как и стромальная фракция >36,5% (P = 0,037).
Выводы
Определяемое ГНС соотношение десмопластического и воспаленного
соотношения является новым и убедительным предиктором рецидива
заболевания при локально распространенном раннем раке прямой кишки. Он
может быть оценен на одном срезе ГиЭ, поэтому может быть применен в
повседневной клинической практике для улучшения прогностической
информации, доступной пациентам и врачам для принятия решения о
дальнейшем лечении.
A total of 143 patients were included. Haematoxylin and eosin (H&E) sections were
scanned for
(i) deep neural network (DNN, a machine-learning algorithm) tumour segmentation
into compartments including desmoplastic stroma and inflamed stroma;
(ii) digital assessment of tumour stromal fraction (TSR) and optical DNA ploidy
analysis.
3′ mRNA sequencing was performed to obtain gene expression data from which
stromal and immune scores were calculated using the ESTIMATE method. Full
results were available for 139 samples and compared with disease-free survival. All
three methods were prognostic. Most strongly predictive was a DNN-determined
ratio of desmoplastic to inflamed stroma >5.41 (P < 0.0001). A ratio of ESTIMATE
stromal to immune score <1.19 was also predictive of disease-free survival (P = 
0.00051), as was stromal fraction >36.5% (P = 0.037).