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Introdução a Bioquímica

A bioquímica estuda as estruturas moleculares, os mecanismos e os processos


químicos responsáveis pela vida. Para realizar as suas funções, os seres vivos
dependem da capacidade de obter,transformar,armazenar e utilizar energia.Sem
energia ocorre a perda da vitalidade e a morte celular.
Os organismos vivos são estruturalmente complexos diversificados. Todos fazem
uso das mesmas espécies de moléculas e extraem a energia do meio ambiente para as
suas funções. Apesar da grande diversidade dos processos bioquímicos que envolvem a
integração funcional de milhões de moléculas para manter e perpetuar a vida, a ordem
biológica é conservada por vários processos: (1) síntese de biomoléculas, (2) transporte
de íons e moléculas através das membranas biológicas, (3) produção de energia e
movimento e (4) remoção de produtos metabólicos de excreção e substâncias tóxicas. A
quase totalidade das reações químicas que ocorre nos seres vivos são catalisadas por
enzimas – proteínas com funções catalíticas.Os seres vivos são formados por uma
grande variedade de moléculas,tais como:carboidratos,lipídeos,proteínas,ácidos
nucléicos e compostos relacionados.

Água: o meio da vida

A água compõe a maior parte da massa corporal do ser humano. É o solvente


biológico ideal. A capacidade solvente inclui íons, açucares e muitos aminoácidos.
Reagentes e produtos de reações metabólicas, nutrientes,assim como produtos de
excreção,dependem da água para o transporte no interior das células e entre as células.
A força e a especificidade das interações fracas são grandemente dependentes do meio
onde ocorrem, sendo que a maioria das interações biológicas tem lugar na água. Duas
propriedades da água são especialmente importante para a existência dos seres vivos:

• A água é uma molécula polar. A molécula de água é não-linear com distribuição


da carga de forma assimétrica.

• A água é altamente coesiva. As moléculas de água interagem entre si por meio


de pontes de hidrogênio. A natureza altamente coesiva da água afeta as
interações entre as moléculas em solução aquosa.

Estrutura da água

A água é uma molécula dipolar formada por dois átomos de hidrogênio ligados a
um átomo de oxigênio.Cada átomo de hidrogênio possui uma carga elétrica parcial
positiva e o átomo de oxigênio,carga elétrica parcial negativa.Ao se aproximarem as
moléculas de água interagem,pois a carga elétrica parcial positiva do hidrogênio de uma
molécula atrai a carga elétrica parcial negativa do oxigênio de outra molécula de água
adjacente resultando em uma atração eletrostática denominada ponte de hidrogênio.
Interações não-covalentes

As interações não-covalentes são geralmente eletrostáticas; elas ocorrem entre o


núcleo positivo de um átomo e a nuvem eletrônica de outro átomo adjacente. No
entanto, coletivamente elas influenciam de modo significativo as propriedades químicas
e físicas da água e as estruturas, propriedades e funções das biomoléculas pelo efeito
cumulativo de muitas interações. Nos organismos vivos as interações não-covalentes
mais importantes são: pontes de hidrogênio, interações iônicas, interações hidrofóbicas
e interações de van der Waals.

Propriedades solventes da água.

A natureza polar e a capacidade de formar pontes de hidrogênio, torna a água uma


molécula com grande poder de interação. A água dissolve biomoléculas com grupos
ionizáveis e muitas com grupos funcionais polares, porém não-carregadas, por formar
pontes de hidrogênio com os solutos. As biomoléculas ou grupamentos não-polares são
insolúveis em água,pois as interações entre as moléculas de água são mais fortes que as
interações da água com compostos não-polares.As interações hidrofóbicas são as
principais forças propulsoras no enovelamento de macromoléculas.

Moléculas anfifílicas

Um grande número de biomoléculas denominadas anfifílicas contêm tanto grupos


polares como grupos não-polares. Essa propriedade afeta significativamente o meio
aquoso. Quando misturados com a água, as moléculas anfifílicas se agregam formando
estruturas estáveis chamadas micelas. Nas micelas, as regiões carregadas denominadas
cabeças polares, são orientadas para a água com a qual interage. A cauda
hidrocarboneto não-polar tende a evitar o contato com a água e orienta-se para o interior
hidrofóbico. A tendência das biomoléculas anfipáticas é espontaneamente se rearranjar
em água e é uma característica importante de numerosos componentes celulares.

Pressão osmótica

Osmose é o processo espontâneo no qual as moléculas solventes atravessam uma


membrana semipermeável de uma solução de menor concentração de soluto para uma
solução de maior concentração de soluto. A pressão osmótica é a pressão necessária
para interromper o fluxo líquido de água por meio da membrana. A pressão osmótica
cria alguns problemas críticos para organismos vivos. As células tendo grande
concentração de soluto pode perder ou ganhar água.Se as células estão em solução
isotônica ela nem ganha e nem perde água.Nas soluções hipertônicas aquelas com maior
concentração de soluto,as células murcham a medida que a água flui para a solução.

• Ionização da água
Pequena proporção de moléculas de água se dissocia para formar íons
hidrogênio (H+) e hidroxila (OH-).

H²O H+ + OH-

Para cada mal de H+, um mal de OH – é produzido. Devido a elevada


reatividade do íon hidrogênio e o momento dipolar da molécula de água o H+ não
existe como tal em solução aquosa, mas reage sem uma seqüência da molécula de
H²O formando o íon hidrogênio (H³O+). O grau de ionização quantitativamente pela
constante de dissociação “K”:

K = [H+] [OH-]

[H²O]

O valor de K para água é 1,8x10-16 á 25ºC. A concentração de água não


dissociada pode ser considerada como uma constante (1000g /18g / mal = 55,5N, ou
seja, o numero de gramas de água em 100ml dividido pela molécula-grama de água,
portanto a quantidade de água ionizada é insuficiente em relação a não ionizada.

A constante do produto iônico de água é descrito por “KW”.

KW = [H+] [ON-] =

KW = (10-7) (10-7) =

KW = 10-14

Então, [H+] [OH-] em uma solução a uma temperatura de 25ºC é sempre 1,0 x
10-17, já em água pura [H+] = [OH-] com valor de 1,0 x 10-7 N. O equilíbrio está
sempre presente entre H²O, H+ e OH- em soluções diluídas, com a adição de
qualquer substancia as alterações, ocorrem convictamente mas concentrações de H+
ou H-, para manutenção de equilíbrio, conhecendo a de um deles, facilmente é
colocado a teor do outro.

• Escala de pH
Para haver o uso de exponenciais emprega-se a escala de PH, expressa a
concentração real de íons de hidrogênio de uma solução. O PH de uma solução é
definido como o logaritmo negativo fase 10 da concentração de íons hidrogênio:

PH = - log [H+]

Quando o PH < 7 são ácidos, enquanto aquelas com PH > 7 são básicas.

O PH vária na razão inversa da concentração de H+, esse modo o aumento de


H+ reduz o PH, quando a diminuição, o eleva.

• Ácidos e bases
A concentração H+ afeta a maioria dos processos nos sistemas biológica. As
definições mais eficientes de ácidos e bases são as propostas por Brosted e Loury,
são as mais eficientes no estudo das reações dos seres vivos.

Ácidos – são substanciais que podem doar prótons.

Bases – são substanciais que podem aceitar prótons.

A força de um ácido ou base refere-se à eficiência com que o ácido doa prótons
ou a base aceita prótons. Com respeito à força, existem duas classes de ácidos e
bases: fortes e fracos, ácidos e bases fortes são aqueles que se dissociam
parcialmente em soluções aquosas diluídas.

A tendência de um ácido fraco não-dissociado (HA) para perder um próton e


formar a sua base conjugada (A-) é dada pela equação.

HA H+ + A-

Esta reação não ocorre até o final, mas atinge um ponto de equilíbrio entre o e 100%
da reação, nesse equilíbrio a velocidade líquida é zero, pois as velocidades absolutas em
ambas as direções são exatamente iguais, é descrita pela equação:

K= [H+] [A-]

[HA]
K é a constante de equilíbrio da reação reversível, com para cada temperatura,
para os ácidos é usada a designação Ka. Os ácidos fortes tem valor de Ka elevado,
pois apresentam maior numero de prótons liberados por mal de ácido em solução.

• Pares ácido – base conjugadas


Quando um ácido fraco, como o ácido acético, é dissolvido em água, obtém-se
uma dissociação parcial, estabelecendo um equilíbrio entre o ácido, o acetato o íon
hidrogênio (próton):

O ácido acético é um ácido conjugado (doador de prótons) a forma ionizada do


ácido acético, o íon acetato (CH3 COO-) é denominada base conjugada (aceptora de
prótons) ou “sal”. Em reações desse tipo, depois de todos os equilíbrios ácidos –
base, o ácido fraco (CH3COOH) e a base formada na sua dissociação (CH3COO-)
constituem um par ácido – base conjugado.

O valor de Ka para o ácido acético é 1,74x10-5.

As constante da dissociação são mais facilmente expressas em termos de PKa,


que é definida como:

PKa= -log Ka

Relação de PKa e Ka é inverso; o menor valor de Ka fornece o maior PKa.

• A Equação de Henderson – Hasselbalch


Através da equação Henderson – Hasselbach é possível calcular o PH de uma
solução contendo uma mistura de ácido fraco com sua base conjugada.

Para a dissociação do ácido fraco (HA = H+ + A-) a equação pode ser derivada
tomando-se o logaritmo negativo dos dois lados da equação Ka:

Ka = [H+] [A-]

[HÁ]

Ou escrita de forma genética.

PH = PKa + log10 [base conjugada]

[ácido conjugado]
Esta equação apresenta um modo conveniente para o estudo do PH de uma
solução, o PKa do ácido fraco e as quantidades relativas de ácidos conjugado a base
conjugada presentes.

Nos casos onde a concentração molar de ácido conjugado é igual a da base


conjugada ([HÁ] = [A-]), a relação [A-] / [HA] é igual a 1. como o log de 1 é zero o
PH da solução é igual ao valor do PKa do ácido fraco.

Tampões e tamponamento

A regulação do pH nos líquidos biológicos é atividade essencial dos organismos


vivos. Pois se sabe que mesmo pequenas mudanças de pH afetam as funções das
biomoléculas. Para o controle da concentração de hidrogênios existem as soluções
tampões que são formadas por ácidos fracos e suas bases conjugadas.

Quando elas são adicionadas em uma solução o pH não altera tão drasticamente
porque parte dos prótons adicionados combinam com a base conjugada para amenizar o
aumento dos hidrogênios ionizáveis.

Existem dois fatores para a resistência na mudança do pH: a concentração molar do


acido fraco e sua base conjugada e a relação das suas concentrações.

A) Ácidos fracos com mais de um grupo ionizável

No caso de existir mais de um grupo ionizável em um ácido fraco as ionizações


ocorrem em etapas com a liberação de um por vez

B) Tampões fisiológicos

Os três tampões mais importantes no corpo são:

1- Tampão bicarbonato

Um caso especial e muito importante para os mamíferos. Atua estabilizando


o pH sangüíneo.

2- Tampão fosfato

É fundamental para o tamponamento dos líquidos intracelulares

3- Tampão de proteínas
Existem em grade quantidade no nosso organismo, são tampões poderosos.
(Ex. : hemoglobina; albumina)

BIOMOLÉCULAS

Milhares de moléculas orgânicos e inorgânicas compõem o nosso


organismo.

A grande maioria dos constituintes moleculares dos sistemas vivos contem


carbonos ligados covalentemente a outros carbonos e a átomos de
hidrogênio, oxigênio e nitrogênio.

A) Carbono

Uma das mais importantes propriedades do carbono é sua capacidade


para formar ligações covalentes com outros átomos de carbono e com
outros átomos de hidrogênio, oxigênio, nitrogênio e enxofre para formar
cadeias ou anéis das macromoléculas.

B) Estrutura tridimensional

Os componentes de carbono cujas composições são idênticas, mas as


relações espaciais entre os átomos são diferentes, são denominados
esteroisômeros.

Carbonos assimétricos são centro quirais indicando que os


esteroisomeros podem ocorrer em formas orientadas para a direita ou
esquerda.

Os centros quirais são de grande importância , pois muitas


moléculas são seletivas quanto a quiralidade.

C. Macromoléculas

As macromoléculas são construídas pela união química de precursores relativamente


simples para formar polímeros de unidades repetidas. As ligações especificas para cada
tipo de macromolécula, são formadas por reações de condensação com perda de água,
em processos que requerem o fornecimento de energia.

4. Ácidos Nucléicos (DNA e RNA)


São polímeros formados por nucleotídeos. Armazena, transmitem e transcrevem a
informação da genética. São componentes das organelas celulares. Como exemplo, os
carboidratos poliméricos são constituídos por monossacarídeos unidos por ligações
glicosídicas para formar oligossacarídeos ou polissacarídeos. Os oligossacarídeos são
descritos como dissacarídeos, trissacarídeos ou tetrassacarídeos e assim por diante de
acordo com o número de unidades monoméricas. A forma precisa de uma estrutura
polimérica é observada conforme as ligações covalentes e ligações não-covalentes,
sendo as ligações não-covalentes fundamentais as seguintes: pontes de hidrogênio,
interações eletrostáticas e forças de van der Waals. As mesmas não podem ocorrer entre
átomos ou grupos funcionais na mesma cadeia ou entre cadeias adjacentes. As classes
de macromoléculas biológicas não são mutuamente exclusivas e podem interagir para
produzir moléculas hibridas ou conjugadas. Por exemplo, as proteínas e os carboidratos
formam proteoglicanos ou glicoproteinas

Glicolipídeos, lipoproteínas e nucleoproteínas que são moléculas hibridas também estão


presentes nos organismos vivos.

1.1Células: a unidade básica da vida

As células são as unidades estruturais e funcionais de todos os organismos vivos,


classificadas de acordo com seu tamanho e complexidade em procarióticas e
eucarióticas. Nas células procarióticas o material genético não esta delimitado em um
envelope nuclear, sua estrutura é protegida por parede celular, são unicelulares,
enquanto as eucarióticas contêm o material genético organizado em cromossomos
dentro de um envelope nuclear, são complexos e podem ser unicelulares ou
multicelulares, possuem varias organelas limitadas por membranas no seu citoplasma.

Cada organela apresenta especificadas funções, como mostrar a tabela a seguir:

ORGANELA FUNÇÃO
Núcleo Sitio da síntese da maior parte do DNA e
RNA
Mitocôndria Biossíntese e metabolismo energético
Reticulo endoplasmático Membrana citoplasmática continua com as
membranas nuclear e plasmática
Complexo de Golgi Ligam açucares e outros componentes
celulares
Lisossomos Hidrolise de material estranho na célula,
parte do sistema digestivo, lise de células
mortas.
Peroxissomos Enzimas envolvidas no metabolismo do
peróxido de hidrogênio
Ribossomos Ocorre a síntese protéica
Membrana plasmática Separa as organelas contidas no
citoplasma de terem contato com o meio
extracelular e regula a troca com o meio.

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