M N D E Z N N E Z , 13

( ju n to a C a lle A lfo n so )

9 7 6 .2 3 .8 2 .7 2

ACCESO A LA UNIVERSIDAD MAYORES DE 25 AOS

Biologa

Tema 5: NUCLETICOS Y CIDOS NUCLEICOS

TEMA 5. NUCLETIDOS Y CIDOS NUCLEICOS

1. COMPOSICIN QUMICA 1.1. Conceptos generales
Los cidos nucleicos son sustancias con carcter qumico de cidos y que se encontraron por primera vez en el ncleo de las clulas eucariotas. Son compuestos qumicos formados por carbono (C), hidrgeno (H), oxgeno (O), nitrgeno (N) y fsforo (P). El fsforo no es ocasional, sino que se encuentra en una cantidad constante (10% en peso). Son polmeros de elevado peso molecular. Sus constituyentes son: - el cido ortofosfrico (H3PO4). - una pentosa (ribosa o desoxirribosa). - las bases nitrogenadas. Segn sea la pentosa (ribosa o desoxirribosa) se distinguen dos tipos: el cido ribonucleico (ARN) y el cido desoxirribonucleico (ADN). Las bases nitrogenadas pueden ser de dos tipos: bases pricas (derivadas pirimidnicas pirimidina). adenina pirimidnicas citosina y y Las la son el de la purina) (derivadas pricas guanina. tres: cido (ADN) mientras que el halla en el cido la timina, son y de dos: bases la la Las la

uracilo. La timina slo

se encuentra en el desoxirribonucleico uracilo slo se ribonucleico (ARN).

La unin entre una pentosa y una base nitrogenada da lugar a lo que se denomina un nuclesido. La unin de un nuclesido con una molcula de cido ortofosfrico da lugar a un nucletido. El enlace entre cientos o miles o millones de stos constituye un cido nucleico.

1.2. Los nuclesidos

Los nuclesidos se nombran aadiendo la terminacin -osina al nombre de la base prica, y la terminacin -idina para el caso de las bases pirimidnicas. Por ello los nombres de

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los nuclesidos son: adenosina y guanosina, por un lado, y timidina, uradina y citidina, por otro. Si la pentosa es la desoxirribosa, se antepone el prefijo desoxi-; por ejemplo desoxicitidina.

1.3. Los nucletidos

Los nucletidos tienen un fuerte carcter cido debido al grupo fosfato que se ioniza. Los nucletidos se nombran anteponiendo la palabra cido al nombre de la base y aadiendo la terminacin -lico: cido adenlico, cido citidlico, etc. Con ms frecuencia se suelen emplear solamente las siglas de la frmula desarrollada. Ejemplos: 1) cido adenlico = adenosn monofosfato = AMP 2) cido citidlico = citosn = monofosfato = CMP 3) cido desoxitimidlico = desoxitimidn monofosfato = dTMP

1.4.Funcin biolgica del ATP y del NAD+

Los nucletidos, aparte de formar los cidos nucleicos tienen un papel biolgico fundamental. Vamos a estudiar dos de ellos: el Adenosn-trifosfato (ATP) y el nicotinaminadenn dinucletido NAD+ EL ATP La energa contenida en los glcidos de reserva como el almidn o el glucgeno o en los lpidos, es energa de reserva para los organismos; la energa de la glucosa las que es energa es accesible, pero no puede ser utilizada directamente de energa por clulas; necesario una molcula transportadora intercambie directamente con las clulas; esta molcula es el ATP. Es un nucletido formado por ribosa, adenina y tres grupos fosfatos; la unin del primer grupo fosfato es a travs del carbono 5 de la ribosa y los otros dos se unen al primero con prdida de una molcula de agua, produciendo enlaces altamente energticos, de 7,3 kilocaloras por mol y enlace. Si el ATP pierde un grupo fosfato pasa a adenosn-difosfato, ADP y se liberan 7,3 kcal/mol; el ADP puede perder el otro grupo fosfato y pasar a adenosn-monofosfato AMP cediendo otras 7,3 kcal/mol. Y al revs, la energa obtenida por la clula por oxidacin de la glucosa es almacenada en molculas de ATP, mediante la conversin de AMP a ADP y de ste a ATP. El nucletido ATP es pues la molcula de almacenamiento inmediato y de intercambio de energa directo con las clulas. La clula utiliza en menor medida otros nucletidos con la misma finalidad: el GTP (guanidn-trifosfato), el UTP (uridn-trifosfato) y el CTP (citidntrifosfato).

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EL NAD+ En ciertas reacciones exergnicas (exotrmicas) la energa es liberada mediante electrones de alta energa. Estos electrones energticos, que provienen muchas veces de tomos de hidrgeno, pueden ser captados, junto con el hidrgeno por nucletidos transportadores, que luego podrn donarlos a otras molculas para producir
+

reacciones

endergnicas

(endoenergticas). El nicotinaminademn dinucletido (NAD ) capta la energa en el enlace que se establece entre su molcula y el tomo de hidrgeno formando el NADH. Cuando este enlace se rompe se libera la energa; el NAD+ es pues un transportador de poder reductor. Otros transportadores de energa que veremos son el nicotinaminademn dinucletido fosfato (NADP+), el flavinadenn dinucletido (FAD) y el flavn mononucletido (FMN).

1.5. Los cidos nucleicos

Los cidos nucleicos son polinucletidos. Los nucletidos se unen entre s a travs del radical fosfato situado en el carbono quinto (C5) de un nucletido y del radical hidroxilo (OH) del tercer carbono (C3) del otro nucletido. La unin se realiza pues, mediante un enlace de esterificacin, con prdida de una molcula de agua.

2. EL CIDO DESOXIRRIBONUCLEICO 2.1. Concepto general

El ADN, como veremos en otro tema, contiene la informacin gentica que determina la morfologa, el desarrollo y la fisiologa de cada individuo, en todos los individuos, salvo en alguno virus, cuya informacin gentica est contenida en ARN.

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Est constituido por 5,6 109 (5.600 millones) de nucletidos. En las clulas eucariotas el ADN se encuentra asociado a las protenas histonas, mientras que en las procariotas no (ADN desnudo). Podemos distinguir en el ADN varios niveles estructurales: la estructura primaria o de una sola hebra, la estructura secundaria o de la "doble hlice", la estructura terciaria o del "collar de perlas" y la estructura cuaternaria o "fibra de 300 ".

2.2. Estructura primaria

Es la secuencia de nucletidos de una sola cadena o hebra. Si se considera el elevado nmero de nucletidos existentes en una hebra de ADN y las innumerables combinaciones posibles, se puede comprender cmo a travs de la secuencia de bases nitrogenadas es posible estructurar una determinada informacin (el llamado mensaje biolgico). El porcentaje de guanina, citosina, adenina y timina es el mismo para todos los individuos de la misma especie.

2.3. Estructura secundaria

Fue postulada en 1953 por Watson y Crick, basndose en los estudios de difraccin por rayos X por Franklin y Williams, y en la equivalencia de bases de Chargaff (el nmero de bases de adenina es igual al nmero de bases de timina, y el de guanina igual al de citosina A=T, C=G; el nmero de bases pricas es igual al nmero de bases pirimidnicas) Es la disposicin en el espacio de dos hebras o cadenas de polinucletidos en doble hlice con las bases nitrogenadas enfrentadas y unidas mediante puentes de hidrgeno. Los puentes de hidrgeno se establecen entre A y T y, por otro lado, entre C y G. Entre A y su base complementaria T deben establecerse dos puentes de hidrgeno, y entre C y su base complementaria G, tres puentes de hidrgeno. El ADN estara formado por dos cadenas o hebras de polinucletidos, complementarias y enrolladas una sobre la otra en forma de doble hlice dextrgira (girando a derechas) Las dos hebras son antiparalelas, van en sentidos contrarios: una en el sentido 3-5 y otra en el 5-3; los grupos fosfatos se colocan hacia fuera de la doble

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hlice, mientras que las bases nitrogenadas estn dirigidas hacia el interior, en planos paralelos entre s y perpendiculares al eje de la hlice.

2.4. Estructura empaquetamiento cromosmica

terciaria: de la

la

cromatina.

Niveles y

de fibra

cromatina:

nucleosoma

Es la disposicin que adopta la fibra de ADN de doble hlice al asociarse con las protenas. En las bacterias, clulas procariotas, que contienen una nica molcula de ADN bicatenario (de doble hlice) no asociado a protenas (ADN desnudo), la doble hlice se pliega sobre s misma como una superhlice y luego esta superhlice adopta forma circular. La misma forma adopta el ADN en las mitocondrias y en los plastos de las clulas eucariotas En las clulas eucariotas el ADN se une a protenas de dos tipos: histonas y protenas cromosmicas no-histonas. Las primeras, como veremos a continuacin, tienen funcin estructural en la formacin de la cromatina y consecuentemente de los cromosomas. Las nohistonas son un grupo muy numeroso y en su mayora son enzimas que participan en los procesos de replicacin o duplicacin del ADN. La estructura terciaria del ADN asociada a histonas se conoce como fibra nucleosmica , se da en clulas somticas en reposo, es decir, que no estn en divisin. Los nucleosomas son unas partculas de unos 100 de dimetro, con dos partes: El ncleo o partcula nuclear est constituido a su vez por un octmero (ocho molculas) formado por dos molculas de cada una de las histonas H2A, H2B, H3 y H4, y por una longitud de ADN que se disponen a su alrededor dando 1,75 vueltas. En todas las especies estudiadas tienen la misma estructura. El ADN espaciador o linker es la longitud de ADN que hay entre dos nucleosomas consecutivos. A la salida de una nucleosoma, los dos extremos del ADN espaciador coinciden en el mismo lugar y all se asocian a una molcula de histona H1. La

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agrupacin nucleosoma-H1 se denomina cromatosoma. La unin de los cromatosomas forma la estructura llamada collar de perlas, que, compactada, da lugar a la fibra nucleosmica LA ESTRUCTURA CRISTALINA La estructura cristalina aparece en las clulas reproductoras, como los espermatozoides. Estos poseen un ncleo que ocupa casi toda la clula, ya que su citoplasma se halla reducido prcticamente al largo flagelo, a una veintena de mitocondrias y a una reserva de materiales energticos (el acrosoma) que posibilitan el continuo movimiento del flagelo. El ncleo del espermatozoide slo posee la mitad de ADN que las clulas somticas. Debido a la mayor fuerza de atraccin entre el ADN y las protaminas, el grado de empaquetamiento del ADN es mucho ms elevado que en el "collar de perlas".

2.5. Estructura cuaternaria

Es la disposicin que adopta el ADN con estructura terciaria, es decir, a la fibra nucleosmica al replegarse sobre s mismo. Corresponde a la forma denominada "fibra de 300 ", o dominio de bucles que se observa con el microscopio electrnico en el ncleo y en los cromosomas.

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Para explicar la estructura interna de la fibra de 300 se conocen hoy dos hiptesis. Hiptesis del solenoide Un arrollamiento sobre s mismo del "collar de perlas"; un acortamiento de cinco veces la longitud del "collar de perlas". La formacin del solenoide parece que est relacionada con la sntesis de un polmero de histonas H1, que constituye el eje central del solenoide. Para la formacin de este polmero es imprescindible la presencia de cationes divalentes (Ca+2, Mg+2). Finalmente el arrollamiento sobre s mismo del solenoide, produce la fibra de 700 , que, condensada produce las cromtidas que formarn los cromosomas, visibles al microscopio ptico en la fase mittica.

Hiptesis de la superperla Considera que el "collar de perlas", al arrollarse sobre s mismo, invierte unos seis nucleosomas por vuelta y que unas tres de estas vueltas se condensan formando una superperla, que constara de una veintena de nucleosomas.

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2.6.Tipos de ADN
El ADN puede ser de una sola hebra o de dos hebras. El ADN de una sola hebra o monocatenario es muy raro. Se ha encontrado en forma circular en algunos virus y en forma lineal en otros virus bacterifagos. El ADN bicatenario puede ser circular, como sucede en las bacterias, en las mitocondrias y cloroplastos y en algunos virus, y tambin puede ser lineal, como sucede en los mayora de los virus, y en el ncleo de las clulas eucariotas. En estas se encuentra asociado a histonas. En las mitocondrias de las clulas eucariotas suele haber de cuatro a seis molculas de ADN. A menudo, dos de esas molculas circulares se enlazan. El ADN mitocondrial slo supone el 1% del ADN total celular. En el ncleo de las clulas eucariotas, el ADN se encuentra asociado a protenas, lo que dificulta su extraccin y el clculo de su peso molecular. En el caso del hombre, al desaparecer el ncleo durante la divisin celular, aparecen cuarenta y seis cromosomas de diferentes tamaos; los ms grandes miden 10 m de longitud y contiene una molcula de ADN de unos 8 cm de longitud. La longitud total del ADN de una clula humana se estima en 2,36 metros.

3. EL CIDO RIBONUCLEICO
Recordamos la composicin que vimos en el punto 1: El ARN es un polirribonucletido formado por nucletidos de adenina, guanina, citosina y uracilo (en vez de la timina del ADN). La pentosa es la ribosa. El ARN es casi siempre monocatenario (excepto en los retrovirus), aunque a veces la misma hebra se puede espiralizar sobre s misma, apareciendo la tpica estructura secundaria en doble hlice. ARN bicatenario (con estructura en doble hlice) en los reovirus y ARN monocatenario, como el ARN ribosmico (ARNr), el ARN mensajero (ARNm), el ARN soluble o de transferencia (ARNs o ARNt) y el ARN nucleolar (ARNn). El ARN se encuentra en todos los virus fitopatgenos y en las clulas procariotas y eucariotas. En stas normalmente hay de cinco a diez veces ms ARN que ADN. El 70% se encuentra en forma de ARNr en los ribosomas, el 15% como ARNt disuelto en el citoplasma, el 5% en las mitocondrias (ARNr y ARNt) y el 10% restante en el ncleo (ARNm y ARNn). Los ARN se sintetizan de segmentos de ADN mediante la complementaridad de las bases. Las copias as realizadas se llaman transcritos primarios, que posteriormente sufren un proceso de maduracin, como vemos en cada tipo de ARN

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3.1.

ARN mensajero
la informacin gentica desde el

Transportan

ncleo a los ribosomas para que se sinteticen las protenas. Se forma en el ncleo, como copia de un fragmento de ADN; el transcrito primario tiene en un extremo, el 5, una metilguanosina con un grupo trifosfato y en el 3 unos 200 nucletidos de Adenina. Adems tienen zonas con informacin gentica (exones) de otros que no tienen informacin (intrones). Los extremos y los intrones son eliminados en el proceso de maduracin. Un mismo transcrito puede producir varios ARNm; despus de la maduracin sale del ncleo y se dirige a los ribosomas, a los que aporta la informacin gentica. Veremos su papel biolgico con detalle en el tema de la Traduccin. Slo tiene estructura primaria. Su forma es filamentosa. Entre su sntesis y su degradacin no transcurren ms que unos cuantos minutos. Se sintetiza con facilidad. Constituye un 10% del ARN total. Se halla asociado a histonas. Si se encuentra en el ncleo, se denomina informmero, y si est en el citoplasma, informosoma.

3.2. ARN

soluble

(o

ARN

de

transferencia)
Molculas pequeas (70-80 aminocidos). Un solo filamento. Tiene forma de hoja de trbol. Su funcin es reconocer los aminocidos y unirse a ellos y aportarlos a los ribosomas; en uno de los extremos del trebol tiene los grupos de reconocimiento y unin al aminocido; en el extremo opuesto se encuentra el anticodn (formado por bases complementarias de las del codn del ARNm); obviamente, existe, al menos, un ARNt para cada aminocido. En el tema de la Traduccin se desarrolla con ms detalle su funcin biolgica. Representa del 5 al 15% del ARN total. Hay unos 50 tipos de ARNs.

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3.3.

ARN ribosmico

Es un solo filamento con estructura primaria, secundaria y posiblemente terciaria, ya que se encuentra asociado a unas protenas bsicas parecidas a las histonas. Existen varios tipos que se sintetizan en el nucleolo a partir de un nico transcrito que posteriormente se fragmenta. Salen del ncleo y unidos a protenas forman las dos partes de los ribosomas, donde se sintetizan las protenas segn el cdigo aportado por el ARNm y con los aminocidos aportados por el ARNt. Ver el tema de la Traduccin para ampliar su funcin biolgica. Se encuentra en los ribosomas, el 70% del ARN total celular. Su peso molecular oscila entre 500.000 y 1.700.000.

3.4.

ARN nucleolar

No hay sntesis de ARNr si no hay nuclolos en el ncleo. En el nuclolo aparece un ARN que luego se disocia en dos, que estn asociados a protenas del tipo ribosmico. Estas partculas pasan al citoplasma, donde se agrupan formando los ribosomas. Otros ARNn son necesarios para la formacin y maduracin del ARNm, y otros que participan en los procesos de replicacin del ADN.

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