Biotecnologa para una Acuicultura Sustentable

Rodger Miranda Stevenson, MS

Produccin Mundial y Nacional

Base: FAO

Produccin Mundial y Nacional

Proyeccin Propia

Salmon Chile

Haciendo Historia
1850 1920: 1921 1973: 1974 1985: 1985 2007: 2008: Introduccin de especies exticas. Introduccin de Salmn Coho (Oncorhynchus kisutch). Desarrollo de una Salmonicultura insipiente. Expansin de la Salmonicultura. Cambio de Paradigma.

En Chile el inters por la importacin de ovas se inici en 1885 trayendo ovas de salmones y truchas con fines deportivos, no es hasta 1905 que el estado chileno comenz a manifestar inters por este tema y durante ese ao lleg al pas una pequea cantidad de ovas de Salmn del Atlntico (Salmo salar) y Trucha (Salmo gairdnieri irideus; hoy Oncorhynchus mykis) compradas en Hamburgo, Alemania, pero debido al avanzado estado de desarrollo que traan fueron desembarcadas en Buenos Aires, Argentina, transportadas por tren a Mendoza y luego a lomo de mula a travs de la cordillera hasta la piscicultura de los Andes (Construida en 1904). Las importaciones continuaron entre 1905 y 1910, para realizar siembras en diferentes ros en nuestro pas desde la V hasta X Regin.

Porque Desarrollar la Acuicultura

Produccin de Alimento Generacin de Empleo

Acuicultura
Evita sobre explotacin de Recursos Acuticos Genera Investigacin y Desarrollo

Mayor eficiencia productiva

Porque Desarrollar la Acuicultura - Problemtica

Contaminacin.

Acuicultura
Especies Autctonas

Efectos sobre el Paisaje. Utilizacin de espacios que podran servir para otras actividades. Mezcla accidental con especies silvestres.

Problemas
Contaminacin. Efectos sobre el Paisaje.

Especies Introducidas

Utilizacin de espacios que podran servir para otras actividades.

Escapes Accidentales con efecto sobre el Ecosistema. Introduccin de nuevas enfermedades.

Biotecnologa

Gentica

OMICs Salud y Nutricin

Medioambiente

Salud y Nutricin
Cambios histricos en las dietas para salmonideos

Fuente: Biomar Chile

Salud y Nutricin
Evolucin dietas de Salmones
AO Protena /Lpido Harina Pescado Otras Harinas Animales Harina Soya Trigo y subproductos Gluten maz, lupino Aceite de Pescado Aceite vegetales 1989 prensado 50/18 75% 0% 0% 10% 0% 10% 0% 1995 extruido 46/26 60% 0% 0% 15% 0% 20% 0% 2000 extruido 43/27 50% 5% 5% 15% 0% 22% 0% 2002 extruido 38/33 40% 5 15% 5 15% 10% 10% 20% 8% 2004 extruido 36/35 25-35% 5 15% 5 15% 10% 15% 15% 15% 2010 extruido 34/37 15-20% 5 15% 5 15% 10% 15-20% 15% 15%

4.2 Kg. de peces producen 1 Kg. de harina de pescado Antiguo Dieta Harina de Pescado 46 / 26 60% Hoy 38 / 33 20%

FCb
Total Harina de pescado

1.30
0.78 3.28 Kg. de peces

1.30
0.26 1.09 Kg. de peces

10

Salud y Nutricin

Harina de Pescado Soya Otras Harinas Animales 100 kg Alimento Protena, Carbohidrato y Aceites

Aceites

Maz

Uso eficiente de Protenas

Kontali, 2008

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Salud y Nutricin

Conocimiento

Nutrigenmica

La nutrigenmica es una rama de la genmica que quiere proporcionar un conocimiento molecular sobre los componentes de la dieta que contribuyen a la salud, mediante la modificacin de la expresin y/o las estructuras, segn la constitucin gentica individual.

Relacin genes - nutrientes Alimentos Biotecnolgicos Dietas Funcionales Dietas Extruidas Diseo por Req. de Aminocidos Relacin ED/PD

Informacin

Dietas extruidas Diseo por Req. Energa Dietas Peletizadas Diseo por proximal

Ayer

Hoy

Maana

12

Salud y Nutricin

Nutrigentica hace referencia al anlisis de variaciones genticas entre individuos y su respuesta a nutrientes especficos. 13

Salud y Nutricin

Las tcnicas moleculares para diagnostico de enfermedades han demostrado ser mas efectivas, mas sensibles y mas rpidas que las tcnicas tradicionales. nico problema de las tcnicas moleculares es que detectan presencia cadenas de ADN o ARN pero esto no indica actividad viral o bacteriana.

14

Salud y Nutricin
Mejores tcnicas de anlisis

15

Salud y Nutricin
Diferencia entre tcnica

16

Salud y Nutricin
Patgenos Posibles de identificar con rt-PCR (Taqman)
Alphavirus

- rganos Internos de peces - Otras especies - Ovas (importante en importacin) - Agua

Determinacin del serotipo de IPNV por medio del secuenciamiento gentico Rhabdovirus (VHS-IHN)

Serotipo WB

Serotipo Sp

Serotipo Ab

Otros Serotipos (C1,C2,C3, He, Ja y Te)

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Salud y Nutricin
Base de datos para ISAv

Determinacin de especie por secuenciamiento del Gen Ribosomal 16S en bacterias

18

Medioambiente

Herramientas basadas en DNA y RNA para detectar, monitorear y trazar organismos acuticos. Sistemas de deteccin bioqumica y biosensores. Herramientas biotecnolgicas para controlar y eliminar contaminacin acutica. Sistemas de Produccin de Individuos para repoblacin.

19

Medioambiente

20

Medioambiente
Contaminacin

Medioambiente

Bio-Indicador Pez Transgenico

Expresin Gnica

21

Gentica
Cosecha de especies en cultivo en Chile - 2008

871 mil toneladas Proyectos de Diversificacin Acucola

Merluza (Merluccius gayi gayi) Mero (Dissostichus eleginoides) Dorado (Seriola lalandi) Corvina (Cilus gilberti) Bacalao (Gadus morhua)

Fuente SERNAPESCA

22

Gentica - Genmica
Aumento de productividad
Herramientas Biotecnolgicas

Reduccin de ciclos productivos Individuos mas robustos

Acuicultura

Programas Genticos

Individuos estriles Individuos trazables Resultados mas predecibles Seleccin de individuos mas tolerantes a las dietas vegetales

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Gentica - Genmica
Mayor Productividad implica mayor eficiencia en la utilizacin de los recursos y en este sentido los programas genticos han demostrado ser una excelente oportunidad.
3 generaciones de mejora.

Anlisis de Productividad por cepa realizado para grupos cerrados 2007 y 2008 por SGS. Base 400 MM de Smolts.

Fuente SGS-AquaticHealth 24

Gentica - Genmica
Reduccin del tiempo a cosecha entre 20 y 30 das en 4 generaciones

Salmon Coho Reduccin de tiempo a cosecha en el mar

25

Gentica - Genmica
Peso Cosecha Lnea Impar
6000 5500 5000 4500 4000 3500 3000 2500 2000
1997 1999 2001 2003 2005 2007

Resultado de la Ganancia Gentica en el programa de Salmn Coho

Peso Cosecha Lnea Par
6000 5500 5000 4500 4000 3500 3000 2500 2000
1998 2000 2002 Clase Ao Fenotipo Genotipo 2004 2006

Peso Cosecha

Clase Ao Fenotipo Genotipo

YC
PB 1997 1999 2001 2003 2005 2007

Cosecha
--1999 2001 2003 2005 2007 2009

EBV
-44,81 2,09 34,88 546,74 924,49 1.476,36 2.169,12

F
0,0% 0,0% 0,2% 0,4% 1,9% 4,0% 5,1%

GG
--47 33 512 378 552 693

%
----2,4% 14,3% 13,2% 13,3% 19,5%

YC
PB 1998 2000 2002 2004 2006 2008

Peso Cosecha

Cosecha
--2000 2002 2004 2006 2008 2010

EBV
-0,0004 3,52 209,64 678,16 1321,19 1605,18

F
0,0% 0,0% 0,5% 1,4% 4,5% 5,7%

GG
--3,52 206,12 468,52 643,03 283,98

%
----6,3% 12,5% 15,2% 5,8%

Ganancia Gentica Media por Generacin

12,6%

Ganancia Gentica Media por Generacin

10,0%

26

27 Mortalidad 100% 10% 20% 40% 50% 60% 70% 80% 90%

Gentica - Genmica

30%

0%

Desafio de Familias de Salmn del Atlantico contra SRS

Familias

46121 46126 46134 46181 46033 46086 46122 46223 46061 46138 46079 46049 46083 46185 46245 46087 46129 46078 46115 46130 46154 46180 46204 46231 46241 46216 46226 46035 46060 46248 46017 46008 46170 46197 46034 46107 46045 46147 46022 46188 46089 46090

Cual es la Diferencia Gentica?

Gentica - Genmica

Millones

12

Sobrevivientes (20 a 30%)

10

Desafo contra ISAv con inyeccin intraperitoneal, el grafico muestra hasta el da 22 la cantidad de virus promedio en rganos de los peces muertos por el virus (rt-PCR) y al da 31 se evalu la carga viral en rganos de los sobrevivientes.

Cantidad de Virus

8
6 4 2 0
12 13 14 15 17 18 20 21 22 31 Dias Pos Tratamiento

28

Gentica - Genmica
Caractersticas de Importancia para mejora en Programas Genticos Mejor crecimiento, reduccin del tiempo a cosecha

Resistencia a Enfermedades Baja Maduracin Mayor Tolerancia a comer Vegetales Calidad (pigmentacin, contenido de grasa)
Tolerancia a mayores temperaturas

Objetivos a mejorar

Seleccin de Caractersticas

Costo, Factibilidad, Eficiencia de Seleccin

80 20
29

Gentica - Genmica

Impacto de la mejora de algunas caractersticas de importancia productiva

Caractersticas 1% de mayor crecimiento (sgr) 1% menos mortalidad 5% mejor retencin de pigmento

Efecto en costo - 6 /kg - 2 /kg - 1 /kg

30

Gentica - Genmica

Ganancia gentica por generacin medida en programas genticos

Especie Salmn Coho Salmn Atlntico
Truchas Tilapia Salmn Atlntico Trucha C-S Maduracin Resistencia a Enfermedades Crecimiento

Caractersticas

GG (%) 6-10 % 6-15%

7-13 % 7-10 % -22 % 32% ?

Gentica Cuantitativa

31

Gentica - Genmica

Generacin G0 G1 G2 G3 G4 40 Aos

Peso de Cosecha 4.230

Tiempo en Mar 17,7

Mortalidad (%) 19,2%

Crecimiento (sgr) 0,71%

FCRb 1,40

G5 G6 G7
G8 G9 G10
4.230 12,2 11,2% 1,06% 1,30

Modelacin de un 10% de mejor crecimiento por generacin

32

Gentica - Genmica
El Genoma y la Genmica en relacin al dogma central de la Gentica

ADN

Genoma

Genmica

ARN

Transcriptoma

Transcrptmica

Protena

Proteoma

Protemica

Fenotipo

Performance

33

Gentica - Genmica
Impacto del Secuenciamiento Gentico
ALOZIMAS RFLP Microsatlites SNPs

400 Marcadores

2.000 Marcadores

5.000 Marcadores

10 cM

0,5 cM

0,2 cM

34

Saturacin del mapa gentico humano, Adaptado de S. Primrose & R. Twyman.2004. Genomics, Aplications in Human Biology. Cristian Araneda

Gentica - Genmica La ventaja del nuevo conocimiento Secuencia del Genoma: Pollo
En Diciembre 2004 se publico el ensamble del genoma del pollo (Nature). Primer animal de produccin agrcola en donde se logra esta meta.

> 1.000 millones de pares de bases Ms del 90% de los 20.000 30.000 genes han sido identificados.

Se han identificado 2.8 millones de SNPs Se han desarrollado chips de ADN que contienen 20.000 SNPs

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Gentica - Genmica
Using in breeding program: Implementing by Hendrix Genetics (Hybro)
DNA-Chip
DNA extraction Candidates screening

Better efficiency to identify high Genetic Value breeders

BLUP: Best Linear Unbiased Prediction GMAS: Gene Markers Assisted Selection

Advanced Statistic-genetic software

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Gentica - Genmica Biotecnologa Disponible

Stock Reproductor
CONTROL DE LA FERTILIDAD - Poliploidias - Triploidia CONTROL DEL CRECIMIENTO

CONTROL MADURACION
-Induccin Ambiental Fotoperiodo - Induccin Hormonal GnRHa

Gametos Fecundacin Artificial Incubacin Ovas con Ojo

Eclosin (alevin con Saco) Alevines Smolts

CRIOPRESERVACION

-Temperatura - Fotoperiodo
SELECCION ASISTIDA

CONTROL DE LA PROPORCION DE SEXOS -Neomachos

Reproductores

- Marcadores Moleculares (sexaje)

Engorda

-Stock Monosexo

Cosecha
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Gentica - Genmica Biotecnologa Disponible

Otras herramientas que existen y que en el futuro podran considerarse son:

- Transgenia - Clonacin

Hoy en da hay que conocerlas, estudiarlas y saber cual podra ser su real impacto.

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Gentica - Genmica
Diversificacin Acucola Desarrollo de estrategias Europeas

Proyectos de Diversificacin Acucola

Merluza (Merluccius gayi gayi) Mero (Dissostichus eleginoides) Dorado (Seriola lalandi) Corvina (Cilus gilberti) Bacalao (Gadus morhua)

1. Genetic impacts of escapees and restocking and introduction of non-native strains, 2. Genetic impacts of culture practices, 3. Triploids (both fish and shellfish), tetraploid mother oyster strains, 4. Growth enhancement in fish by gene transfer, Recombinant DNA vaccines, 5. Genetic impact evaluation, monitoring tools and modelling, 6. Predictive tools: modeling and assessment of risk. The results will be disseminated to scientists, industry, NGOs, policy makers and the press.

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Gentica - Genmica
Diversificacin Acucola

Proyectos de Diversificacin Acucola

Merluza (Merluccius gayi gayi) Mero (Dissostichus eleginoides) Dorado (Seriola lalandi) Corvina (Cilus gilberti) Bacalao (Gadus morhua)

En Chile estos proyectos estn considerando desde el inicio tener estudios que permitan cuantificar el impacto de su desarrollo.

1. 2. 3. 4.

Estructura de Poblaciones. Produccin de triploides estriles. Evaluacin ambiental del impacto gentico. Diseo programa gentico.

40

AQUAINNOVO S.A.

41

AquaInnovo S.A.
Compaa Chilena. Proyecto a 5 aos (Comenzando en 2007) US$ 10 Millones (50% Innova de CORFO y 50% E. Aquachile) La propiedad de la compaa es 83% AquaChile, 15% Universidad de Chile y 2% otro.

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Principales Objetivos
Producir una infraestructura permanente para la innovacin, investigacin y desarrollo en genmica, gentica y biotecnologa para la industria acucola

(Laboratorio y Estacin Experimental)

Desarrollar planes para innovar en herramientas de biologa molecular y biotecnologa para programas de mejoramiento gentico. Producir recurso humano calificado para investigacin y transferencia tecnolgica. Desarrollar tcnicas para hacer seleccin por resistencia a enfermedades. Desarrollar un software para dar soporte a programas de mejoramiento gentico (administracin y anlisis de la base de datos).

Buscar marcadores genticos asociados a caracteres de importancia

productiva.

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Nuestro Equipo en Chile

Mathematic Modeling Center

Rodger Miranda, MS Gerente General Roberto Neira, Ph.D. Gerente de Investigacin y Desarrollo Maria Eugenia Cabrejos, Ph.D. Sub Gerente de Laboratorio de Biologa Molecular Jean Paul Lhorente, MS Jefe del Centro Experimental Ph. D. Student Michael Filp, Ing Pesq. Gerente de Operaciones y Servicios Alexis Martinez, Bioqumico, MSc Jefe Laboratorio de Diagnostico Karina Rebolledo, Ing.Civ.Ind. Jefe de Proyecto William Currie, Ing. Agr. Asesor de Gestin de Proyectos Hctor Barahora, Ing. Informtica Diseador de Software

Alejando Maass Ph.D. Bioinformatica Roberto Neira. Ph. D. Director Tcnico Cristian Araneda. Ph. D. Investigador (Gentica Molecular) Vernica Cambiazo. Ph. D. Investigador INTA (Microarrays) Rodrigo Pulgar Estudiante Ph.D. Melinka Mansilla Estudiante Ph.D. Patricia Hanna Bioq. Investigador Dinka Mandakovic Ing. Biol. Mol. Investigador Stephen Gunther Estudiante Ph.D. Investigador Mara Jos Menendez Medico Veterinario Asistente Investigacin
Celular Genomic Center

Miguel Allende Ph.D. Genomica Comparada EXTERNAL ADVISORS Patricia Iturra Universidad de Chile Pedro Smith Universidad de Chile Mauricio Gonzlez Universidad de Chile Mario George Nascimento Universidad Catlica S.C.

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Red Internacional de Investigacin

Canada Simon Jones Fisheries and Ocean Genmica resistencia enfermedades USA Ronald Hardy University of Idaho Nutrigenomics Escocia Beatriz Villanueva Scotish Agriculture College Control de consanguinidad Espaa Miguel Angel Toro, Miguel Perez-Enciso QTL Anlisis

Canada William Davison, Ben Koop Simon Fraser University University of Victoria Microarrays, cGRASP Malasia Raul Ponzoni GIFT (Gentica de tilapias)

Canada Matthew Rise Memorial University Microarrays, P. salmonis

USA Dr Juan Medrano Universidad de California-Davis Proyecto trazabilidad (SNP) Costa Rica Aquacorporacin Internacional Mejora Gentica de tilapias 45

Brasil Dr. Alexandre Silva Hilsdorf Ncleo Integrado de Biotecnologa UMC

Israel Gideon Hulata, Yitzhak Simon The Volcani Center Gentica de tilapias

Universidad Nacional de Costa Rica

AQUAINNOVO S.A.
Construyamos Juntos la Acuicultura del Futuro

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