Transformaes Bioqumicas Lista de aminocidos e protenas

1)

A frmula abaixo aparece em muitos textos como representativa de

aminocidos. Ela de fato representativa de aminocido em valores de pH muito baixo, fisiolgico ou muito alto?

2) Os peptdios Lys-Asp-Glu e Leu-Ala-Phe foram adicionadas a uma mistura de gua e leo com posterior agitao. Prever a distribuio dos peptdios entre as duas fases. 3) Verificar a veracidade das seguintes afirmaes: a) Em valores extremos de pH, uma protena apresenta menor nmero de grupos com carga eltrica do que em pH 7. b) Uma protena que apresenta menor solubilidade em pH 9 rica em aminocidos bsicos. c) Quanto maior a porcentagem de aminocidos hidrofbicos presentes em uma protena, tanto maior ser a concentrao de sal necessria para precipita -la. d) As pontes de H da estrutura F-pregueada de uma protena so estabelecidas entre os grupos R dos aminocidos. 4) Escrever a frmula de um aminocido, dar exemplos de aminocidos que apresentam: a) um grupo amino e dois grupos carboxlicos b) um grupo carboxlico e dois grupos amina

5)

Analisando as cadeias laterais, classificar os aminocidos em polares e

apolares. Entre os polares, citar aqueles que em pH 7, apresentam o grupo R com carga negativa (aminocidos cidos), carga positiva (aminocidos bsicos) e carga nula (polares sem carga) 6) Definir protenas globulares e fibrosas. Citar exemplos - Protenas Fibrosas - Na sua maioria, as protenas fibrosas so insolveis nos solventes aquosos e possuem pesos moleculares muito elevados. So formadas geralmente por longas molculas mais ou menos retilneas e paralelas ao eixo da fibra. A esta categoria pertencem as protenas de estrutura, como colgeno do tecido conjuntivo, as queratinas dos cabelos, as esclerotinas do tegumento dos artrpodes, a conchiolina das conchas dos moluscos, ou ainda a fribrina do soro sanguneo ou a miosina dos msculos. Algumas protenas fibrosas, porm, possuem uma estrutura diferente, como as tubulinas, que so formadas por mltiplas subunidades globulares dispostas helicoidalmente. - Protenas Globulares - De estrutura espacial mais complexa, so mais ou menos esfricas. So geralmente solveis nos solventes aquosos e os seus pesos moleculares situam-se entre 10.000 e vrios milhes. Nesta categoria situam-se as protenas ativas como os enzimas, transportadores como a hemoglobina, etc. As protenas globulares possuem cadeias polipeptdicas enoveladas firmemente em estruturas tridimensionais compactas com forma esfrica ou elipside. Possui alta solubilidade em gua. Exercem funes como: enzimas, transportadores e moduladores fisiolgicos e genticos.

7) Definir ponto isoeltrico de uma protena (pI) e indicar como pode ser determinado. 8) Citar 4 exemplos de protenas com funo no-enzimtica.

9)

r d s

pr

d scr v r

pH

p r

r s br

sr

r d s pr

Agentes fsicos e qumicos podem acarretar no que chamamos de desnaturao. Esta consiste no rompimento das ligaes peptdicas e/ou perda das estruturas secundrias e tercirias, podendo ser reversveis ou no, j que provoca um re-arranjo da protena. Esta, desnaturada, apresenta-se insolvel em gua e se precipita em solues. A desnaturao ocorre com a deformao tridimensional da protena sem a quebra das ligaes peptdicas. A estrutura nativa das protenas fundamental para o bom funcionamento das suas funes e essas alteraes ocasionam a perda parcial de suas funes biolgicas. Como os -aminocidos possuem grupos ionizveis na molcula, a forma inica predominante dessas molculas em soluo depende do pH. A titulao dos aminocidos ilustra o efeito do pH sobre sua estrutura. A titulao tambm til para determinar a reatividade das cadeias laterais dos aminocidos.

As cadeias laterais R diferenciam um aminocido de outro. O significado funcional da cadeia lateral enfatizado nas protenas onde o grupo carbox lico e o grupo amino

formam ligaes pept dicas e, portanto, no exercem suas propriedades cidobsicas. Quando o grupo R neutro, a sua composio tem pequeno efeito sobre as propriedades de dissociao dos grupos carbox licos e grupos aminos do carbono . Os aminocidos com cadeias laterais ionizveis apresentam trs grupos cidobsicos. Na Tabela 2.1 esto relacionados os valores de pK e pI dos grupos amino, carbox alm de grupos ionizveis das cadeias laterais dos lico aminocidos