GENOMA

Dogma central da biologia molecular:

A informao flui dos cidos nucleicos para as protenas

As proteinas e os cidos nucleicos so formados por um nmero limitado de diferentes sub-unidades

cido desoxi-ribonucleico (DNA)

- Contem a informao (gentica) para construir o organismo em causa - Pode ser duplicado de forma exacta (continuidade gentica das espcies) - Gene - a sequncia de DNA necessria para produo de uma molcula de RNA . Genes estruturais (mRNA) . Genes de transferncia (tRNA) . Genes ribossmicos (rRNA)

cidos Nucleicos so Polmeros Lineares de Nucletidos

Nucletido: Aucar Pentose = molcula de 5 carbonos Base Nitrogenada = 5 tipos Radical Fosfato

Estrutura da Pentose

Bases nitrogenadas dos cidos nucleicos

A, G e C no RNA e DNA T s no DNA U s no RNA

Purinas
tm um par de aneis fundidos

Pirimidinas
Os tomos de carbono das pentoses so numerados tm s um anel

Estrutura qumica de um nucletido

Nucletido - contm fosfato

Nucletidos (monmeros) do DNA

Estrutura bsica

Nucletidos: monofosfatados difosfatados trifosfatados

-O

BASE NITROGENADA
P O
OO O

P O
O-

P O
O-

Adenina Timina Guanina Citosina

Nuclesido - sem fosfato

CH2 H H OH

O H H H

Denominao dos nucletidos e nuclesidos

(base)1

Ligaes Fosfo-diester
O (base)2 O _ (aucar)

(aucar) - OH

HO

P O

(base)1 (aucar) O

O P _ O O

(base)2 (aucar)

+ H2O

Formas alternativas de representar as cadeias de cidos nucleicos

A dupla hlix de DNA

5 CAG 3

O estado nativo do DNA o de uma dupla hlix de duas cadeias antiparalelas com complementaridade da sequncia de nucletidos

Componentes do DNA
Cada par de bases possui: uma base prica e uma pirimdica C-G tm trs ligaes de hidrognio A-T tm duas pontes de hidrognio G-C possui maior estabilidade

DNA right-handed e DNA left-handed

Duas possveis formas de DNA O DNA natural right-handed

DNA

DNA pode ser desnaturado e reconstituido

Muitas molculas de DNA so circulares

As cadeias de DNA tm de ser separadas durante a replicao e transcrio

Os DNAs das bactrias, de muitos virus e das mitocndrias so circulares

RNA tem uma estrutura similar ao DNA (5->3 ligao fosfodiester) contem uracilo em vez da timina O aucar a ribose em vez da desoxi-ribose Possui um grupo hidroxilo adicional na posio 2 tornando a molcula quimicamente mais lbil

RNA uma cadeia fosfodiester e pode formar muitas estruturas tri-dimensionais diferentes

O RNA pode ter uma ou duas cadeias, podendo ser linear ou circular

RNA pode ter actividade cataltica

1. self-cleaving ribozima

cido ribonucleico (RNA)

RNAs mensageiros (mRNAs) so modelos
Transportam informaes para incorporar e ordenar os amino-cidos nas protenas So traduzidos em protenas

RNAs de transferncia (tRNAs) interpretam os mRNAs durante a translao

2. ribonucleoproteinas: complexo de RNA e proteinas exemplo - Ribossoma

RNAs ribosmicos (rRNAs) so parte dos ribosomas

Uma clula eucaritica sintetisa cerca de 10.000 protenas, de um total de aproximadamente 60.000 genes. A maioria so protenas para uso prprio, necessrias para manter os diferentes tipos de clulas. Algumas protenas so especficas de certos tipos de clulas.

Tamanho do Genoma
E.Coli (bactria) Yeast (fungo simples) Menor cromossoma humano Genoma humano 4.6 x 106 bases 15 x 106 bases 50 x 106 bases 3 x 109 bases

Tamanho do Genoma

Genes
A cadeia de DNA inclui: Regies de codificao (genes) E. coli tem ~4,000 genes Yeast tem ~6,000 genes C. Elegans tem ~13,000 genes Humanos tm ~32,000 genes Regies de Controlo Adjacentes aos genes Condicionam a trancrio gentica Junk DNA (funo desconhecida)

Transcrio e ps-transcrio

Regulao da expresso gentica

Controlo:

Controlo da Transcrio

1. Transcrio 2. Processamento de RNA 3. Translao 4. Actividade da protena

Metilao do DNA Protenas de ligao ao DNA

Metilao
Adio de grupos metil a algumas bases de Citosina, efectuada pela DNA Metilase. Tipos de protenas de ligao ao DNA
DNA e RNA polimerases Enzimas de reparao Protenas estruturais Factores de transcrio

DNA

eucromatina heterocromatina

Nucleossomas
Ncleo histnico

Estrutura nucleossmica
DNA Inter-nucleossmico

H4

H3

H2b

H2a

DNA Nucleossmico 2 voltas completas 146 pares de bases

Nucleossoma

DNA Descompactado (Eucromatina)

DNA Compactado (Heterocromatina)

DNA nucleossmico

DNA inter-nucleossmico Filamento de DNA

(2 voltas completas 146 pares de bases)

Nucleossoma Ncleo histnico

(2xH2a + 2xH3 + 2xH4 + 2xH2b)

Compactao do DNA Nucleossomas

Compactao mxima do DNA

Protenas de regulao gentica

Protenas de regulao gentica

p53 uma protena nuclear que actua como supressor tumoral. Liga-se a sequncias que reconhece de DNA e controla a transcrio de genes reguladores do crescimento tecidual.

Os genes possuem, a montante do local de iniciao, sequncias reguladoras de DNA O promotor o local onde a RNA polimerase se liga para iniciar a transcrio. As Protenas reguladoras ligam-se s sequncias reguladoras de DNA, impedindo ou facilitando a ligao da RNA polimerase

Regulao da expresso gentica

3 RNA polimerases so usadas para a transcrio nas clulas eucariticas Para iniciar a transcrio so necessrios factores de transcrio As sequncias reguladoras de DNA influenciam a transcrio

RNA Polimerases
RNA polimerase I transcreve a maioria dos genes de rRNA RNA polimerase II transcreve todos os genes que originam mRNA RNA polimerase III transcreve alguns genes de tRNA e a cadeia 5S de rRNA.

TTGACA

TATAAT DNA 0 Incio RNA (r, t, m)

5 ATGCCGTTAGACCGTTAGCGGACCTGAC 3 3 TACGGCAATCTGGCAATCGCCTGGACTG 5 Sntese de RNA

-35

-10

RNA polimerase: - Liga-se ao promotor - Sintetisa RNA de 5 para 3

5 AUGCCGUUAGACCGUUAGCGGACCUGAC 3

Segmento de gene

3 5

5 3

5 ATCCCGTTACGGATTTAGGC 3

Forquilha

Segmento de RNA transcrito

3 5

3 5

Topoisomerase

? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
Helicase

3 5

Transcrio de mRNA

DNA

Topoisomerase

Helicase

5 3

Topoisomerase

Helicase Topoisomerase

3 5

RNA Polimerase II Pr-mRNA

5 3

Topoisomerase

RNA Helicase Topoisomerase Polimerase II

3 5

Pr-mRNA
5 3

cap
5

Topoisomerase

RNA Helicase Topoisomerase Polimerase II

3 5

10

Maturao do mRNA
Capping Poli-adenilao Splicing

mRNA splicing

Capping e poli-adenilao do mRNA

5 P-P-P-N 3

Exo

Intro

Exo

Intro

Exo

Intro

5 P-P-N

Pi GTP

5 G-P-P-P-N

PPi S-Adenosilmetionina

S-Adenosilhomosisteina cap nATP nPPi cap

Exo Intro Exo Intro Exo Intro

(A)n

Splicing do mRNA

Splicing do mRNA

cap

Exo

Intro

Exo

Intro

Exo

Intro

Exo

(A)n

Intres

cap

AUG

NNN

UAG

(A)n

Codo de Iniciao

Codo de Terminao

11

Tamanho de alguns genes humanos

Gene -Globina Insulina Proteina kinase C Albumina Catalase LDL receptor Factor VIII Tiroglobulina Distrona 1.5 1.7 11 25 34 45 186 300 >2000 mRNA 0.6 0.4 1.4 2.1 1.6 5.5 9 8.7 17 n Intron 2 2 7 14 12 17 25 36 >50

3 5

Transcrio de tRNA

DNA

Topoisomerase

Helicase

Splicing tRNA

3 5

Pr-tRNA

5 3

Topoisomerase

Helicase Topoisomerase

3 5 A C C

Anti-codo

Exon 1

Intron

Exon 2

RNA Polimerase III Pr-tRNA

5 3

tRNA

Intron 5 3 5 Exon 1 Exon 2

Topoisomerase

RNA Polimerase III

Helicase Topoisomerase

Exon 1

Exon 2

Pr-tRNA
5 3

Intron 3 5

Topoisomerase

RNA Polimerase III

Helicase Topoisomerase

tRNA

Transcrio de rRNA
DNA Nucleolar
5 3 Topoisomerase RNA Polimerase I Pr-rRNA Helicase 3 5 5 3 Topoisomerase RNA Polimerase III Pr-rRNA Helicase Topoisomerase RNA Polimerase I 3 5 Helicase

DNA Extra-Nucleolar
3 5

5 Helicase Topoisomerase RNA Polimerase III 3 5

5 Topoisomerase 3

5 Topoisomerase 3

Pr-rRNA

5 Topoisomerase 3

Helicase Topoisomerase RNA Polimerase I

3 5

Segmento 2

Segmento 1

45S

12

Maturao do rRNA
45S 5 18S

Segmento 1
5,8S 28S 3

Segmento 2
5 5S 3

Protenas Ribonucleoprotena 80S 5 18S 5,8S 28S 3 5 5S

Protenas

Protenas 20S 5 18S 3 5 32S 5,8S 28S

Protenas

Protenas 3

Protenas 60S 5S 28S 5,8S

Protenas

40S 18S Pequena Sub-unidade ribossmica

Grande Sub-unidade ribossmica

Unidades de replicao
Filamento de DNA
DNA Polimerase 3 5 DNA Polimerase DNA Polimerase DNA Polimerase

DNA Polimerase

DNA Polimerase

DNA Polimerase

DNA Polimerase

DNA Polimerase 5 3

13

14