Genética Cuantitativa, Poligenes y QTLs

Dr. Cristian Araneda T.

craraned@uchile.cl
Departamento de Producción Animal
Facultad de Ciencias Agronómicas
Universidad de Chile

CARACTER CUANTITATIVO (Descripción General)

1
 CARACTER CUANTITATIVO (Descripción General)

1. UN INDIVIDUO ES CARACTERIZADO POR UNA MEDICIÓN

CUANTITATIVA PARA UN CARÁCTER DADO
2. LOS VALORES INDIVIDUALES ASIGNADOS CONFORMAN UNA SERIE
CONTÍNUA (No hay clases fenotípicas)
3. LA EXPRESIÓN DEL CARÁCTER MEDIDO ESTÁ INFLUENCIADO POR
MUCHOS LOCI, CADA UNO SE COMPORTA EN FORMA MENDELIANA,
CON UN PEQUEÑO EFECTO EN EL FENOTIPO
4. LA EXPRESIÓN DE CADA LOCI (Y GENOTIPO) ESTÁ INFLUENCIADO
POR EL AMBIENTE, AFECTANDO EL VALOR FENOTÍPICO EN MAYOR
O MENOR GRADO
5. EL ESTUDIO DE LA HERENCIA CUENTITATIVA REQUIERE DE
COMPARACIONES ENTRE GRUPOS DE INDIVIDUOS. UN
CRUZAMIENTO EN PARTICULAR NO PROPORCIONA INFORMACIÓN
ÚTIL

Modelo Genético Infinitesimal para Caracteres Cuantitativos

B1
B17
b2
b10 B18
b3 b7
B11 B14
b4 B8 b19
B5 B12 b15

B6 b9 B16 b20
b13

2
 1 Locus 2 Loci 3 Loci 6 Loci

aa AA aa bb AA BB aa bb cc AABBCC aa. . . . ff AA. . . . FF

Aa Aa Bb Aa Bb Cc Aa. . . . .. .Ff

F1

1/2 6/16 20 / 64

15/64 15/64
F2 4/16 4/16

1/4 1/4 6/64 6/64

1/16 1/16
1/64 1/64

Carácter No Heredable Carácter Heredable

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 Experimento de W. Johanssen con semillas de
porotos princesa (1909) VT = VG + VE
VG = Variación Genética
VE = Variación Ambiental

VG = VT - VE

40,5 mg 93,7 mg VG = 40,96 - 8,76 = 32,2

σ2F1 = 8,76 32,2

H = = 0,79
σ2F1 VE 40,96

62,3 mg
HEREDABILIDAD
VG
H= VT
σ2F2 = 40,96

σ2F2 VT = VG + VE PROPORCIÓN DE LA VARIACIÓN

OBSERVABLE ATRIBUÍBLE A
DIFERENCIAS GENÉTICAS
67,0 mg

• SON TODOS LOS ATRIBUTOS BIOLÓGICOS HEREDABLES ?

• ES EL CI UN ATRIBUTO HEREDABLE ?

CI

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 Componentes Genético y Ambiental de algunas Patologías Humanas

Estudios en gemelos idénticos muestran que ciertas patologías como la Psoriasis

tienen un fuerte Componente Genético y muy poco Componente Ambiental
(estilo de vida). Otras patologías como la Esclerosis Múltiple tienen poca
Influencia Genética y mucha Ambiental.

MEDIDAS DEL VALOR DE UN INDIVIDUO

1. VALOR FENOTÍPICO (P) VP

- Se refiere al fenotipo medido en un individuo en un momento
dado.
P = G + E
P = A + D + I + E
2. VALOR GENOTÍPICO (G) VG
- Se refiere a la habilidad genética total de un individuo en
relación a su población.
G = A + D + I
3. VALOR DE CRÍA (Valor Genético Aditivo) (A) VA
-   Se refiere al valor de un individuo como reproductor en
relación a su población
Si se dispone del fenotipo del individuo:

A = 2 (µprogenie - µPoblación)

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 HEREDABILIDAD

Sentido Amplio (H):

• Con VP = VG + VE
Corresponde al porcentaje o proporción de la variación
fenotípica de un rasgo que es producto de DIFERENCIAS
GENÉTICAS entre los progenitores (Varianza Genética).
H = VG / VP

Sentido Estricto (h2):

• Con VP = VA + VD + VI + VE
Corresponde al porcentaje o proporción de la variación
fenotípica de un rasgo que es producto de DIFERENCIAS
GENÉTICAS ADITIVAS entre los progenitores (Varianza
Genética Aditiva).
h2 = VA / VP

ESTIMACION DE HEREDABILIDAD EN HUMANOS

ESTUDIOS GEMELOS (MONO Y DICIGOTICOS)

Vm = Varianza Monocigóticos = VE
Vf = Varianza Diocigóticos o Fraternos = ½ VG + VE

Vf – Vm = ½ VG  H = VG / (VG + VE)

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 HEREDABILIDAD (h2)
Proporción o porcentaje de la VARIACION FENOTIPICA de un
rasgo que es producto de DIFERENCIAS GENÉTICAS
TRANSMISIBLES.

h2 = Varianza Genética Aditiva / Varianza Fenotípica

VALORES PROMEDIOS DE HEREDABILIDADES

Bovinos: Gallinas:
Peso Corporal Adulto 0.40 Peso de huevos 0.50
Producción de leche 0.30 Producción de huevos 0.10
Fertilidad 0.05 Sobrevida primera semana 0.01
Cerdos: Ovejas:
Espesor grasa dorsal 0.70 Peso de vellón de lana 0.50
Ganancia de peso 0.40 Finura de la lana 0.55
Tamaño de camada 0.05 Tamaño de camada 0.15

HEREDABILIDAD DE ALGUNAS PATOLOGÍAS EN EL HOMBRE

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 TIPO DE HERENCIA DE LAS PATOLOGÍAS EN EL HOMBRE

DERMATOGLIFOS (RTC = Recuento Total de Crestas)

0,48 ≤ h2 ≤ 0,49

µ♀ = 127
µ♂ = 144

a) Arco
b) Presilla
c) Verticilo trirradio

trirradio trirradio

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 RESPUESTA A LA SELECCIÓN (R)

Diferencial de Selección:

Seleccionados DS = X selecionados - X población

como reproductores Superioridad de los individuos seleccionados

R = DS x h2  h2 = R / DS

Ejemplo: Peso Corporal Adulto Bovinos

DS
Promedio Población
h2 = 0,40
Promedio Población = 500 Kg
Promedio Seleccionados = 550 Kg
R = (550-500) Kg x 0,40 = 20 Kg
Progenie Los hijos de estos seleccionados
R pesarán en promedio 520 Kg

APRENDIZAJES DE EXPERIMENTOS DE SELECCIÓN DE LARGO

PLAZO

Efecto de la Selección Natural

¿Agotamiento de la Varianza Genética?

Drosophila
melanogaster,
Longitud tórax

Ratones, peso a las 6 semanas

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 SELECCIÓN
DIVERGENTE
Susceptibilidad a caries
dentales en ratas.
(Respuesta Asimetrica)

RESPUESTA A LA SELECCIÓN A LARGO PLAZO

Límite a la selección, leche

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 RESPUESTA A LA SELECCIÓN A LARGO PLAZO

Límite a la selección, maíz

Evolución de la Producción Mundial de Cereales

Aumento Estimado de la Población

Mundial

La producción Global en el periodo 1950 - 1991 La producción Per Capita una disminución con
muestra un incremento lineal con una pendiente una pendiente de - 1,4 % año-1 en el 1985-1991.
de +1,5% año-1.

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 Modelo Genético para Caracteres Cuantitativos con Genes de
Efecto Mayor Y QTLs

B11 es Un Gen de Efecto Mayor

QTL1

B11

QTL2

GENES DE EFECTO MAYOR:

Tienen un fuerte efecto sobre la variabilidad fenotípica de un
rasgo cuantitativo, los individuos que portan ALELOS DE EFECTO
MAYOR muestran diferencias respecto al valor promedio de
entre 2 a 3 σ.

Estos genes en general se encuentran en baja frecuencia debido a

efectos pleiotrópicos adversos, menor viabilidad o fertilidad en
homocigotos.

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GENES DE EFECTO MAYOR:
Obese
Ratones Obese (Ob Leptina)
High Growth (hg)

Obese codifica para una proteína (146 áá)

secretada por los adipositos que controla la
homeostasis del peso corporal, regula el
Obese
apetito.

High Growth produce un 30-50% aumento

en ganancia de peso en los homocigotos, sin
producir obesidad. Aumenta la masa
muscular por hiperplasia con hipertrofia
moderada.
High Growth

GENES DE EFECTO MAYOR:

Bovinos Hypertrophy muscular (mh) Myostatin

Double muscle
Produce un aumento anormal del tejido muscular causado por el
agrandamiento de las células (hipertrofia). En los bovinos aumenta la masa
muscular en un 20% en cortes de mayor precio.

Belgian Blue nockout miostatina

Piedemontese
ratón

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GENES DE EFECTO MAYOR:

Ovinos Fecundity gene (FecB),

Ovejas Booroola Merino
Incrementa el tamaño de la camada en 3 o más crias. El efecto de
esta mutación es aditiva para la tasa de ovulación (numero de
ovocitos liberados en cada ciclo ovulatorio) y parcialmente
dominante para el tamaño de la camada. En promedio, cada copia
del gen mutante incrementa el tamaño de la camada en un cordero
extra.

Booroola Merino

ASOCIACION DE MARCADORES Y RESISTANCIA:

Enfermedad de Marek en Gallinas

Neoplasia causada por la infección de un virus DNA, tipo
herpes. La Resistencia/Susceptibilidad a Marek esta
asociada con alelos específicos del grupo sanguíneo B.

Línea Susceptibilidad Alelo B21 Alelo B19

Resistente 7% 100% 0%
Susceptible 94% 0% 97%

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 LOCUS GENÉTICO CUANTITATIVO (QTL):
Son Regiones Cromosómicas, a veces muy amplias, donde
hay loci que están afectando en mayor porcentaje un rasgo
cuantitativo (10 a un 20%).

Normalmente no se conocen directamente los genes, sino

que sólo la posición en los cromosomas de posibles loci.

La Identificación de QTLs requiere tener un Mapa Genético

saturado con marcadores moleculares que permitan asociar
el efecto del QTL con alelos en loci específicos.
Inicialmente se utilizaron marcadores RFLP, actualmente se
usan Microsatélites y mas recientemente SNPs
(Polimorfismos de Nucleótidos Simples).

COBERTURA DEL GENOMA

Densidad en que los marcadores moleculares están distribuidos en un
mapa genético de recombinación. Es decir, la distancia promedio en
centi Morgan (cM) que separa dos marcadores.

400 2000 5000

Marcadores Marcadores Marcadores
10 cM 0,5 cM 0,2 cM
ALOZIMAS RFLP Microsatelites SNP
Saturación del mapa genético humano, Adaptado de S. Primrose & R. Twyman.2004. Genomics, Aplications in Human Biology.

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 MARCADORES MICROSATÉLITES o SSR
• Son secuencias repetidas en támden en la que el
motivo repetido fluctúa entre 1 y 4 nucleótidos.

• Para el PCR se utilizan partidores específicos que

son complementarios a las secuencias que
flanquean el microsatélite, normalmente son
especie específicos.

• El polimorfismo detectado se debe a diferencias

en el número de repeticiones.

• Los marcadores son de tipo CODOMINANTE y la

técnica es de LOCUS UNICO.

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 Microsatélites (SSR o STR)

Métodos de Visualización de Microsatélites

Genotipos microsatélites obtenidos por medio de un Análisis de

fragmentos en secuenciador automático

Genotipos microsatélites visualizados

en un gel de poliacrilamida y teñidos
con plata

Genotipos microsatélites visualizados en un gel de agarosa y teñidos con

Bromuro de Etidio.

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 SNP = Polimorfísmos de Nucleótidos Únicos
Los SNP corresponden a sitios en una secuencia de DNA en el cual
existen dos bases nucleotídicas alternativas (alelos) en una
frecuencia mayor al 1%.
Individuo 1: ATGCCTCAGTCATGATAGGCC
Individuo 2: ATGCCTCAGTCGTGATAGGCC
Individuo 3: ATGCCTCAGTCGTGATAGGCC
Individuo 4: ATGCCTCAGTCATGATAGGCC

El polimorfismo detectado se debe a la diferencia de sólo UNA base en una secuencia de ADN.

Mapeo de QTL’s

F1

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 Mapeo de QTL’s

F1 X F1

F2

Loci Microsatélites Asociados con Fecha Desove

Sakamoto et al. 1999. Aquaculture 173:33-43

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 Marker-Assisted Selection (MAS)
Selección Asistida por Marcadores

Marcadores
Desarrollo de Marcadores Genéticos
Moleculares
QTL fecha de desove

Desarrollo de Mapas Genéticos

QTL color músculo

Mapeo de QTLs por medio

de Marcadores QTL color piel

Incorporación de Marcadores (Genotipos Individuos)

en los programas de mejoramiento Genético
Adaptado de A. Norris, 2001.

Efecto de la Selección Asistida por Marcadores

(un QTL) sobre la Respuesta a la Selección

5,5

20
Efecto Combinado de la Selección Asistida por Marcadores
Utilizando Varios QTLs sobre la Respuesta a la Selección

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