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Principios generales sobre regulacin metablica. Principios de bioenergtica. Energa libre. Procesos irreversibles. Reacciones acopladas. Papel central del ATP en el metabolismo energtico. Hidrlisis de ATP. Otros compuestos ricos en energa. Transferencia de grupos fosfato. Reacciones de oxido-reduccin biolgica. Coenzimas transportadoras de electrones. Vitaminas.
INTRODUCIN AL METABOLISMO
QUE ES EL METABOLISMO? El conjunto de todas las transformaciones qumicas que se producen en una clula u organismo Cientos de reacciones organizadas en rutas metablicas QU ES UNA RUTA METABLICA? Una serie de reacciones catalizadas enzimticamente. En una ruta, un precursor se convierte en un producto a travs de una serie de intermediarios: los metabolitos Las rutas metablicas pueden ser convergentes, divergentes o cclicas
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GLUCOSA-6-P
Fosfoglucoisomerasa
FRUCTOSA-6-P
Fosfofructoquinasa
FRUCTOSA-1,6-BP
Aldolasa
DHAP
TPI
GLICERALDEHIDO-3P
NADH
1,3-BPG
GAPDH
ATP
3-PG
PGK
PGM
2-PG
Enolasa
PEP
ATP
(2) PIRUVATO
TEMA 15
Piruvatoquinasa
FUNCIONES DEL METABOLISMO -Obtener energa qumica (ATP) degradando nutrientes ricos en energa (o a partir de la energa solar) -Convertir molculas nutrientes en molculas celulares (fabricar los componentes celulares) -Polimerizar precursores monomricos a protenas, cidos nucleicos, polisacridos, etc. -Sintetizar y degradar biomolculas requeridas en funciones celulares especializadas (hormonas, neurotransmisores, etc.) CARACTERSTICAS DEL METABOLISMO -Las reacciones bioqumicas son muchas, pero las reacciones importantes son relativamente pocas -Las rutas metablicas centrales son pocas y son similares en todas las formas vivas -Las molculas importantes del metabolismo no son mas de 100 -Todas las rutas se regulan de forma similar.
TEMA 15
RUTAS METABLICAS
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"Biochemistry" Garrett, R.H. and Grisham, C.M. Saunders College Publishing. 2005
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Energa solar
TEMA 15
CATABOLISMO Degradativo, oxidativo Genera energa, produce ATP. Los productos finales e intermedios son materias primas del anabolismo Genera desechos que se excretan al entorno LISIS
Catabolismo ADP+Pi NAD+ NADP+
Modificado del Lehninger Principios de Bioqumica", 4 ed. Nelson, D.L. y Cox, M.M. Omega. 2006.
Glicerol
Acidos Grasos
Urea
Piruvato
AcetilCoA
CATABOLISMO
ANABOLISMO
CO2 O2 H2O
e-
ATP
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Sirve para: Que la velocidad de la va est adaptada a las necesidades de la clula Que las vas de sntesis y degradacin no est activas a la vez. Las rutas catablicas y anablicas no son inversas las unas de las otras. Ambas rutas tienen a menudo localizacin diferente en las clulas.
Se d a tres niveles: 1. Por los enzimas alostricos, capaces de cambiar la actividad cataltica en respuesta a moduladores estimuladores o inhibidores. 2. Mediante regulacin hormonal.. 3. Por regulacin de la concentracin de un enzima en la clula (regulacin gentica)
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NCLEO
Replicacin del DNA Sntesis tRNA y mRNA NUCLEOLO sntesis rRNA
RETCULO ENDOPLSMICO
Sntesis de lpidos, transporte intracelular
RIBOSOMAS
Sntesis de protenas
GOLGI
Maduracin de glucoprotenas y otros componentes de las membranas
MITOCONDRIAS
Oxidacin del piruvato Ciclo Krebs Fosforilacin oxidativa Oxidacin de cidos grasos Catabolismo de aminocidos
CITOSOL
Glucolisis, parte de gluconeognesis; pentosas fosfato; sntesis de cidos grasos, sntesis de nucletidos
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TEMA 15
SISTEMAS MULTIENZIMTICOS
Enzimas individuales. Los intermediarios fluyen de un enzima a otro. Ej: glucolisis Complejos multienzimticos Enzimas fsicamente asociados. A menudo los intermediarios estn unidos covalentemente a los complejos. Ej PirDH
Enzimas asociados a grandes estructuras, membranas o ribosomas. Ej: cadena electrnica mitocondrial
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"Biochemistry" Garrett, R.H. and Grisham, C.M. Saunders College Publishing. 2005
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REACCIONES BIOQUMICAS
Muchas reacciones qumicas requieren condiciones no compatibles con los organismos vivos: solventes no acuosos alta temperatura y presin presencia de cidos o bases fuertes
Las reacciones bioqumicas tienen lugar bajo condiciones especiales: soluciones acuosas condiciones suaves: presin y temperatura prcticamente constantes pH fisiolgico catalizadas enzimticamente
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1. Oxidacin-reduccin
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BIOENERGTICA
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ENERGA
NUTRIENTES DEL ENTORNO.....quimiosintticos LUZ SOLAR ...................................fotosintticos Transformaciones qumicas en el interior de las clulas
TRANSDUCCIONES DE ENERGA
TRABAJO BIOLGICO: Biosntesis (anabolismo) Trabajo mecnico (contraccin muscular) Gradientes osmticos (transporte contra gradiente) Trabajo elctrico (transmisin del impulso nervioso) etc.
PRODUCTOS FINALES DEL METABOLISMO (molculas simples CO2, H2O) CALOR
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AUMENTO DE ENTROPA
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Bioenergtica: Rama de la bioqumica que estudia la transferencia y utilizacin de energa en los sistemas biolgicos. Comprende el estudio cuantitativo de los cambios de energa de las reacciones bioqumicas. Aplica los principios bsicos de la termodinmica a los sistemas biolgicos. Sistema: se denomina sistema termodinmico a aquella parte del universo que se est observando. El entorno es el resto del universo. El sistema y su entorno constituyen el universo. Las clulas vivas y los organismos son sistemas abiertos que intercambian materia y energa con el entorno
ENTORNO
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SISTEMA
UNIVERSO
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Estado de un sistema: forma de comportarse el sistema en un instante dado. Cuando se produce una variacin en el estado de un sistema, se dice que este ha sufrido una transformacin, un proceso en el que existe un estado inicial y un estado final. El incremento () es la diferencia entre el valor de una variable en el estado inicial y en el estado final. Ej.: Transformacin de un gas Estado inicial V1, P1 Cambios: V =V2-V1 P =P2-P1 Estado final V2, P2
Funciones de estado: aquellas funciones termodinmicas cuyo valor depende slo del estado del sistema. Si en un sistema se produce una transformacin, la variacin de las funciones de estado depende nicamente del estado inicial y del estado final, y no del camino por el que se realiza la transformacin. Volmen V, Presin P, Entalpa H, Energa libre G, etc.
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TEMA 15
Procesos exergnicos
Procesos endergnicos
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G Es una funcin de estado: depende del estado inicial y final, no del camino seguido o mecanismo
A
Glucosa
G
= - 2840 kJ/mol
C
metabolismo
combustin
CO2 + H2O
D
G no proporciona informacin sobre la velocidad de la reaccin, slo si se dar o no espontneamente G se expresa en J/mol (o cal/mol)
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C+ D
[C]eq [D]eq [A]eq [B]eq G= variacin de E libre en condiciones estandar (pH=7, 25C, 1atm de presin, conc. inicial de R y P 1 M)
G= - RT LnKeq
G y Keq son constantes y caractersticas de cada reaccin G es una forma alternativa de expresar la constante de equilibrio G (-) G (+)
R R
P P
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RELACIN ENTRE G y G
G= variacin de energa libre en condiciones estandar. Es una CONSTANTE, tiene un valor fijo para cada reaccin G = variacin de energa libre real . Es variable, depende de las concentraciones de reactivos y productos y de la temperatura
G = G+ RT Ln
[P] [R]
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G1
G2
G3
GTOTAL
= G1 +G2 +G3
Las reacciones exergnicas se acoplan a reacciones endergnicas: la energa liberada por las exergnicas se usa para dar lugar a las endergnicas, que no se produciran espontneamente
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- En las clulas las condiciones no son las estandar (sobre todo por las distintas concentraciones de reactivos y productos) [P] Greal = G0 + RT ln
[R]
- G0 son aditivas. Las reacciones exergnicas se acoplan a reacciones endergnicas: la energa liberada por las exergnicas se usa para dar lugar a las endergnicas, que no se produciran espontneamente.
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TEMA 15
Lehninger Principios de Bioqumica", 4 ed. Nelson, D.L. y Cox, M.M. Omega. 2006.
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ATP
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ATP: nexo entre procesos biolgicos dadores de energa y procesos biolgicos consumidores de energa
NUTRIENTES PRODUCTORES DE ENERGA
catabolismo
TRABAJO BIOLGICO
ADP + Pi
ATP
anabolismo
MACROMOLCULAS COMPLEJAS
PRECURSORES SENCILLOS
La hidrlisis del ATP proporciona energa libre para impulsar reacciones endergnicas, energticamente desfavorables
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- Enlaces fosfoanhidro
adenina
ATP
ribosa H2O
Hidrlisis con disminucin de la repulsin de cargas
ATPasa
OH
Pi
(Estabilizacin por resonancia)
ADP
(Ionizacin)
TEMA 15
LA HIDRLISIS DEL ATP PROPORCIONA ENERGIA LIBRE PARA IMPULSAR REACCIONES ENDERGNICAS
ATP + H2O
G 0 = - 64,6 kJ/mol
Los otros nuclesidos trifosfato: GTP, UTP y CTP y los deoxinuclesidos trifosfato: dATP, dGTP, dTTP, dCTP son energticamente equivalentes al ATP Se producen transfosforilaciones entre nucletidos: ATP + NDP
TEMA 15
ADP + NTP
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-Compuestos de alta energa = altos potenciales de transferencia de fosforilo (tendencia a ceder el P ) - ATP = valor intermedio
-Compuestos de alta energa.....transfieren su grupo fosfato al ADP para formar ATP -- ATP.......transfiere su grupo fosfato a compuestos de baja energa y los activa
TEMA 15
G0 de hidrlisis (kJ/mol)
Ej:
PK
HK
Formacin de ATP: - Fosforilacin a nivel de sustrato (1): transferencia de grupo fosfato desde un compuesto de alta energa al ATP - Fosforilacin oxidativa (2): transferencia de electrones al O2 acoplado a la biosntesis de ATP en la membrana mitocondrial Consumo de ATP:
ATP
ATP
Intermedios -P
ATP
Fosfocreatina
ATP
ATP
ATP
UTP UDP-glucosa
Modificado de: Basic Medical Biochemistry. A Clinical Approach. Marks, D.B, Marks, A.D and Smith, C.M. Williams and Wilkins.1996. TEMA 15 32
TEMA 15
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Reacciones de transferencia electrnica, son reacciones de oxidacin reduccin: -prdida de e- por una especie qumica reducida (que se oxida) -ganancia de e- por una especie qumica oxidada (que se reduce)
3 etapas del catabolismo: 1. La fuente de e- son compuestos reducidos (ej: glucosa, ac.grasos) 2. Reacciones de oxidacin: los e- pasan de distintos intermediarios metablicos a transportadores electrnicos con liberacin de energa 3. Transporte de e- al O2 (aceptor final) acoplado a sntesis de ATP (fosforilacin oxidativa)
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Monosacridos Glicerol Acidos Grasos
Urea
Piruvato
AcetilCoA
CATABOLISMO
ANABOLISMO
CO2 O2 H2O
e3
ATP
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TEMA 15
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N de epertenecientes aC
Ms reducido
Ms oxidado
Modificado del Lehninger Principios de Bioqumica", 4 ed. Nelson, D.L. y Cox, M.M. Omega. 2006. TEMA 15 37
NAD+ y NADP+. Cofactores mviles, se trasladan de un enzima a otro FAD y FMN: grupo prosttico de las flavoprotenas, a las que estn fuertemente unidas.
2. Otros cofactores: algunos solubles, otros protenas de membrana quinonas liposolubles, protenas ferrosulfuradas, citocromos Equivalentes de reducin (e-) del catabolismo
NAD+ FAD
NADH FADH2
NADP+
NADPH
TEMA 15
Sntesis de ATP
Reacciones anablicas
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NAD+ y NADP+
nicotinamida
+ H+
NADH reducido
NAD+ oxidado
NAD+ + 2H+ + 2 e-
NADH + H+
Ej.
NAD+ + R C R OH
NADH + H+ + R C R O
Ms de 200 enzimas utilizan NAD o NADP como coenzimas. Se denominan oxidoreductasas o deshidrogenasas.
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FAD y FMN
FAD y FMN
FAD + 2H+ + 2 e-
FADH2
H H FAD + R C C R H H
H FADH2 + R C C R H
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VITAMINAS Y COENZIMAS
COENZIMA TPP
ENZIMA
Piruvato deshidrogenasa -ceto -glutarato DH -cetocido DH Deshidrogenasas (flavoprotenas) Deshidrogenasas Pir-DH, -KG-DH, acil CoA sintetasas... Aminotransferasas (Glucgeno fosforilasa) Carboxilasas metab. aminocidos oxidacin propionato
B5, Pantotenato CoA B6, Piridoxina B8, Biotina B9, Folato Piridoxal fosfato Biotina Tetrahidrofolato
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A los mdicos les gusta prescribir vitaminas, y millones de personas las toman, pero se necesita una buena cultura bioqumica para entender porqu se necesitan y cmo las utiliza el organismo.
Fritz Lipman (1899-1986), Descubridor del CoA
The Nobel Prize in Physiology or Medicine 1953
"for his discovery of the citric acid cycle" "for his discovery of coenzyme A and its importance for intermediary metabolism"
http://nobelprize.org/
TEMA 15
FIN de la BIOENERGTICA
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