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Asociacin predispone o causa Resistente al medio ambiente transporte Precipitacion del ADN

Infeccin coronavirales de camlidos del Nuevo Mundo fue identificado por primera vez en 1998 en llamas y alpacas con diarrea severa. A fin de comprender esta infeccin, una de las cepas de coronavirus fue secuenciado y analizado.Tiene un genoma de 31.076 nt incluyendo la cola poli en el extremo 3 '. Este virus designado como ACoV-00-1381 (ACoV) codifica los 10 marcos de lectura abierta (ORF) caracterstica del grupo 2 de la especie bovina coronavirus (BCoV). El anlisis filogentico demostr que el genoma ACoV se agrupa estrechamente (identidad> 99,5%) con dos cepas BCoV, ENT y LUN, y tambin estuvo estrechamente relacionado con otras cepas BCoV (Mebus, Quebec, DB2), una corona virus humano (cepa 043) (> 96%), porcino y virus de la encefalomielitis hemaglutinante (> 93% de identidad). Un total de 145 mutaciones puntuales y una delecin de nucletidos se encuentran en relacin con la ENT BCoV. La mayora de los ORFs fueron altamente conservadas, sin embargo, la prediccin de protena de anclaje (S) tiene 9 y 12 aminocidos diferencias de BCoV LUN y ENT, respectivamente, y muestra un mayor nmero relativo de los cambios de las otras protenas. El anlisis filogentico sugiere que ACoV acciones de un mismo ancestro como ENT BCoV y LUN. Un tiempo real de la transcriptasa inversa-reaccin en cadena de la polimerasa (RT-PCR) para la deteccin de la especie bovina coronavirus (BCoV) de ARN en las muestras clnicas se describe. El ensayo se basa en la tecnologa TaqMan, que consta de dos cebadores y una sonda marcada con el reportero tinte de 6 carboxifluorescena que se une selectivamente al gen de la protena transmembrana de BCoV. El BCoV en tiempo real RT-PCR fue capaz de detectar la prueba BCoV y BCoV-como los virus (coronavirus respiratorio canino coronavirus y bufalina), mientras que otros patgenos virales comunes del ganado no fueron reconocidos por el conjunto de oligonucletidos establecidos, lo que demuestra que la prueba es especfica para bovino como CoVs. El lmite de deteccin del ensayo fue de 20 BCoV copias de ARN (1-registro ms alto con respecto a los tradicionales a base de gel RT-PCR) y la reproducibilidad fue satisfactoria, lo que permite una medida sensible y exacta de la carga viral de ARN en las muestras clnicas. Doscientos veinte muestras clnicas (92 recto, 82 y 46 hisopos nasales oculares) fueron sometidos a base de gel y en tiempo real RT-PCR. Por la amplificacin convencional, de 43 aos rectal, nasal 54 y 34 muestras dieron positivo ocular, mientras que el ensayo TaqMan fue capaz de detectar el cido nucleico en 49 BCoV rectal, nasal 60 y 37 hisopos oculares. La rapidez y el alto rendimiento del ensayo TaqMan BCoV hace que este mtodo una herramienta poderosa para el diagnstico sensible y especfica de la infeccin BCoV en el ganado.

Este proyecto evala la asociacin epidemiolgica entre un nuevo coronavirus y el sndrome respiratorio agudo (ARS) en alpacas. En 2007 una enfermedad respiratoria se observ a partir de la costa este avanzaba hacia el oeste y los rumores de brotes asociados de la ARS a la asistencia a determinados espectculos y eventos. Como parte de un intenso seguimiento de las alpacas varios signos clnicos de la ARS que se presentaron a la Salud Animal de California y el Laboratorio de Seguridad Alimentaria, un coronavirus se aisl de tejido pulmonar de una alpaca sometido a la necropsia. Aunque este trabajo es

preliminar y el coronavirus se ha recuperado slo se ha aislado de un caso nico hasta la fecha, la investigacin adicional de diagnstico y seguimiento epidemiolgico son de vital importancia para nuestra comprensin y ayuda en la capacidad de diagnstico de enfermedades respiratorias en alpacas en el futuro. La comparacin de la secuencia del genoma del virus aislado de los pulmones con la de los coronavirus que causa la enfermedad diarreica en alpacas es de especial inters debido a los ensayos de eficacia de vacunas contra la propuesta de coronavirus bovino para su uso en alpacas. La informacin que apoyara un estudio de reto a cumplir Koch postulado para el establecimiento de una prueba de causalidad entre el coronavirus del sndrome respiratorio y sera un resultado fundamental de la labor actual.
En informes anteriores de COVs en alpacas se han centrado enla identificacin y caracterizacin del serogrupo 2 CoV, asociados con la diarrea. Con base en los resultados preliminares de la secuenciacinCoV aislado de los tejidos pulmonares de los casos de necropsia CAHFS y el uso de un breve fragmento de PCRdirigidas a la 1a poliprotena, el nuevo virus se pueden agruparen el serogrupo 1 y es, por tanto, diferente de los virus aisladosde las heces de alpaca como se inform anteriormente. Secuenciacin del genoma completo est actualmente en cursopara proporcionar una comparacin completa entre los dosvirus. Hasta la fecha, datos de la secuencia obtenida del genpico, el gen de la nucleoprotena, y el gen de la membrana desubrayar las observaciones que el aislado pertenece CoV en el serogrupo 1 (datos no mostrados)
-28 cras fueron 31 das de edad, 11 tenan de 32 a 62 das de edad, y 6 fueron de 63 a 210 das de edad. Patgenos potenciales fueron aisladas de heces de 32 de las 45 cras. Un total de 39 agentes patgenos potenciales se han obtenido, incluyendo coronavirus (n = 19 cras, 42%), Giardia spp (8, 18%), Eimeria spp (6, 13%), Cryptosporidium spp (4, 9%), el rotavirus ( 1, 2%), y el nematodo huevos (1;. 2%) Salmonella spp no estaban aislados. La mayora de cras que los agentes patgenos potenciales fueron aislados fueron identificados durante los brotes de diarrea participacin de otros camlidos, aunque slo coronavirus fue aislado de cras identificadas en brotes que afectan a los camlidos adultos.Coronavirus se detect durante todo el ao, mientras que los protozoos fueron aislados con ms frecuencia durante el otoo y el invierno.

coronavirus coronavirus ha sido implicado en la diarrea posterior a la feria brotes en alpacas, tanto jvenes y adultos. Se sabe que causandiarrea y enfermedades respiratorias en el ganado. Los animales infectados pueden excretar el virus durante largos periodos de tiempo de exposicin de sus compaeras y de forma intermitente puede arrojar cuando se someten aperodos de estrs. Hay varias vacunas disponibles coronavirus bovino. Pfizer Calf-Guard es una vacuna viva modificada. Puede ser dado a cras por va oral antes de consumir el calostro omujeres embarazadas. Productos dados de Pfizer Scourguard 4Kc y Novartis Scour Bos 4. estos se puede dar a cras y adultos.
Las cras presentan un cuadro diarreico de 3 a 8 das que cursa con deshidratacin, prdida de peso y en ocasiones sobreviene la muerte, aunque algunas cras se recuperan (Alva y Caldern, 1987). La infeccin natural con rotavirus en alpacas se conoce desde hace dcadas (Rivera et al., 1987), aunque se desconoce la frecuencia de la infeccin y su asociacin con la diarrea. Se ha descrito elevada seroprevalencia frente a rotavirus en guanacos en la Patagonia argentina (Parreo et al., 2001; Mercado et al., 2004).

Su utilidad se halla en la posibilidad de aumentar la sensibilidad de la reaccin, pero adems puede emplearse como mtodo de tipificacin, por ejemplo, la primer PCR se realiza con cebadores para un agente etiolgico determinado. Para subtipificar, en tubos de reaccin separados se realiza la nested PCR con cebadores especficos para cada suntipo. Por lo general se toma un pequeo volumen de la primera reaccin de PCR (1-2ul) y se coloca en el tubo de reaccin de la

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