El mdico como investigador

Julio Garca Rubio

20 de octubre de 2011
Laboratorio del CNIC (Madrid)

Objetivos

- Descubrir qu es la investigacin - Conocer lugares donde documentarse cientcamente - Comprender conceptos basados en trabajos previos - Despertar el inters temprano por la investigacin

Contenidos

1. Investigacin
- Denicin - Tipos

2. Publicaciones
- Dnde busco informacin? - Formas de publicacin - Concepto de factor de impacto

3. Proyectos nalizados y en marcha

- Relacin entre las antenas de telefona mvil y el cncer - Leptina: aproximacin experimental - Cultivos de queratinocitos. Determinacin de la longitud telomrica. - Glicmica: expresin diferencial de proteoglicanos en tumor renal de clula clara

Investigacin
(Del latn investigatio)

Accin y efecto de investigar

Real Academia Espaola

Investigar
(Del latn investigare)

1. Hacer diligencias para descubrir algo. 2. Realizar actividades intelectuales y experimentales de modo sistemtico con el propsito de aumentar los conocimientos sobre una determinada materia. 3. Aclarar la conducta de ciertas personas sospechosas de actuar ilegalmente.

Real Academia Espaola

Tipos de investigacin

Bsica
- De pipeta - Enfocada a la bioqumica y biologa molecular - Universidad e institutos de investigacin

Aplicada
- Investigacin al servicio de la sociedad - Ensayos clnicos - Ms cercana al mdico

Tipos de investigacin

Bsica

Traslacional

Aplicada

Tipos de investigacin

Traslacional
Transferir el conocimiento de la investigacin bsica a la clnica

El mdico tiene un perl idneo

Contenidos

1. Investigacin
- Denicin - Tipos

2. Publicaciones
- Dnde busco informacin? - Formas de publicacin - Concepto de factor de impacto

3. Proyectos nalizados y en marcha

- Relacin entre las antenas de telefona mvil y el cncer - Leptina: aproximacin experimental - Cultivos de queratinocitos. Determinacin de la longitud telomrica. - Glicmica: expresin diferencial de proteoglicanos en tumor renal de clula clara

Dnde busco informacin?

- Conexin remota
- Acceso con IP de la Universidad

https://acceso.uniovi.es

- Identicacin con el UO y el PIN

Dnde busco informacin?

- Conexin remota
- Acceso con IP de la Universidad

https://acceso.uniovi.es

Dnde busco informacin?

- Conexin remota
- Acceso con IP de la Universidad

https://acceso.uniovi.es

www.accesowok.fecyt.es

Dnde busco informacin?

WEB OF KNOWLEDGE

Dnde busco informacin?

- Conexin remota
- Acceso con IP de la Universidad

https://acceso.uniovi.es

www.pubmed.gov

Dnde busco informacin?

- Conexin remota
- Acceso con IP de la Universidad

https://acceso.uniovi.es

WEB OF KNOWLEDGE

Publicar en investigacin

- Preprint - Artculo en revista (paper) - Congreso - Libro - Artculo de divulgacin - Internet

Publicar en investigacin

- Preprint
- Generar discusin - Rapidez - Aumentar impacto futuro

- Artculo en revista (paper)

- Cientcas vs. profesionales - Revisin por pares WEB OF KNOWLEDGE

Publicar en investigacin

- Revisin por pares

Peer review - Original e indito - Normas de la revista - Evaluacin interna (consejo de redaccin) - Evaluacin externa (revisores)
Publicar sin modicaciones Publicar con pequeas correcciones Publicar con revisiones profundas No publicar

Publicar en investigacin

- Preprint
- Generar discusin - Rapidez - Aumentar impacto futuro

- Artculo en revista (paper)

- Cientcas vs. profesionales - Revisin por pares WEB OF KNOWLEDGE

- Congreso
- Pster - Comunicacin - Ponencia

Publicar en investigacin

- Libro
- Publicacin no peridica de al menos 49 pginas - Conocimiento consolidado

- Artculo de divulgacin
- Pblico general

- Internet
- Wikis - Blogs - Fiabilidad?

www.revespcardiol.org

Publicar en investigacin

Factor de impacto
- Estimador anual de repercusin de una revista - La inuencia de un trabajo se mide en citas
Cmo calcularlo, por ejemplo, para el ao 2010?

Necesitamos saber:
- Nmero de artculos publicados por la revista en 2008 y 2009. - Nmero de citas recibidas durante el ao 2010 en cualquier revista de los artculos publicados en 2008 y 2009.

Publicar en investigacin

Factor de impacto
- Estimador anual de repercusin de una revista - La inuencia de un trabajo se mide en citas
Cmo calcularlo, por ejemplo, para el ao 2010?
La revista A public en 2008 un total de 650 artculos, y en el ao 2009 un total de 700 artculos. Por tanto, en los dos aos ha publicado 1350 artculos. Revisando los artculos publicados en cualquier revista a lo largo de 2010, vemos que los 1350 artculos anteriores han sido citados un total de 4050 veces. El ndice de impacto de la revista A en 2010 es de 4050 / 1350 = 3.00

Publicar en investigacin

Factor de impacto

Nmero de citas recibidas por artculo publicado en los dos aos anteriores.

Publicar en investigacin

Factor de impacto
- Estimador anual de repercusin de una revista - Atencin a los sesgos!
- Investigacin bsica vs. investigacin clnica - Ingls vs. resto de idiomas

Podemos conocer el factor de impacto de una revista?

WEB OF KNOWLEDGE Journal Citation Reports

Contenidos

1. Investigacin
- Denicin - Tipos

2. Publicaciones
- Dnde busco informacin? - Formas de publicacin - Concepto de factor de impacto

3. Proyectos nalizados y en marcha

- Relacin entre las antenas de telefona mvil y el cncer - Leptina: aproximacin experimental - Cultivos de queratinocitos. Determinacin de la longitud telomrica. - Glicmica: expresin diferencial de proteoglicanos en tumor renal de clula clara

3. Proyectos nalizados y en marcha

2005

2007

2011

2011-2012

- Relacin entre las antenas de telefona mvil y el cncer - Leptina: aproximacin experimental - Cultivos de queratinocitos. Determinacin de la longitud telomrica. - Glicmica: expresin diferencial de proteoglicanos en tumor renal de clula clara

3. Proyectos nalizados y en marcha

2005

2007

2011

2011-2012

- Relacin entre las antenas de telefona mvil y el cncer - Leptina: aproximacin experimental - Cultivos de queratinocitos. Determinacin de la longitud telomrica. - Glicmica: expresin diferencial de proteoglicanos en tumor renal de clula clara

Relacin entre las antenas de telefona mvil y el cncer

2004-2005 Salta la alarma en una comunidad de vecinos de Gijn que registra trece casos de cncer en lo que va de ao.

Los vecinos se rebelan contra las antenas de telefona mvil instaladas en su edicio

Relacin entre las antenas de telefona mvil y el cncer

Existe relacin?

Cuestin conictiva

Relacin entre las antenas de telefona mvil y el cncer

Metodologa
- Conocer la localizacin de los repetidores

77 en total

Relacin entre las antenas de telefona mvil y el cncer

Metodologa
- Conocer los casos de cncer ocurridos en Gijn en los ltimos cinco aos

Ao
2000 2001 2002 2003 2004

Tumores
384 377 363 360 407 1.891

Relacin entre las antenas de telefona mvil y el cncer

Metodologa
- Fusionar el mapa de antenas con la distribucin anual de neoplasias

Ao

Tumores
384 377 363 360 407

2000 2001 2002 2003 2004

Mapeo de repetidores (por ao)

El Llano, repetidores y casos

Relacin entre las antenas de telefona mvil y el cncer

40

30

20

10 2000

2001

2002

2003

0 2004

Casos

Relacin entre las antenas de telefona mvil y el cncer

20

15

10

2000

2001

2002

0 2003 2004

Prximos Alejados

Relacin entre las antenas de telefona mvil y el cncer

20

15

10

5 2000

2001

2002

2003

0 2004

Casos

Relacin entre las antenas de telefona mvil y el cncer

20

15

10

5 2000

2001

2002

2003

0 2004

Casos
C/ Ramn y Cajal

Relacin entre las antenas de telefona mvil y el cncer

Discusin
- Mayor variabilidad en zonas prximas a repetidores - Mayor incidencia en las reas hacia las que apuntan las pantallas Efecto cono - Mayor incidencia en zonas con varias antenas prximas

Les invitamos a que vuelvan a observar los planos del trabajo

Relacin entre las antenas de telefona mvil y el cncer

Repercusin

4 Premio
rea de Ciencias (Nivel I) Paradjicamente, uno de los patrocinadores era Vodafone

- Difusin en prensa - Los vecinos consiguieron la supresin de las antenas de la muerte

Relacin entre las antenas de telefona mvil y el cncer

Autores
Luca Allende Arancha Fernndez Ana Riera Covadonga Loredo Ana Mara Prez Leticia Martn Patricia Gutirrez Paula Chave Amanda lvarez Carmen lvarez Patricia Gndara Julio Garca

Coordinador
Jos Ramn Surez

Colaboradora
Mnica Gonzlez

Agradecimientos

3. Proyectos nalizados y en marcha

2005

2007

2011

2011-2012

- Relacin entre las antenas de telefona mvil y el cncer - Leptina: aproximacin experimental - Cultivos de queratinocitos. Determinacin de la longitud telomrica. - Glicmica: expresin diferencial de proteoglicanos en tumor renal de clula clara

Leptina: aproximacin experimental

- Pptido anorexignico
Leptos: delgado

- Sntesis ubicua

Tejido adiposo, msculo, placenta, ovario, hgado, estmago, hipsis

- Acciones
- Reeja la cantidad de grasa acumulada - Modula respuesta de linfocitos T - Interviene en la sntesis de surfactante - Potencia la angiognesis - Efecto natriurtico - HTA en obesos?

Leptina: aproximacin experimental

La leptina provoca saciedad

Qu ocurrira si no se sintetizase leptina?

Hiperfagia descontrolada Obesidad

Factor de riesgo cardiovascular

Leptina: aproximacin experimental

Ratones knock-out
Mutacin en el codn 105 del gen de la leptina. Eliminacin del gen recesivo lep / ob. La obesidad se maniesta a las 4 semanas.

Existen diferencias entre estos ratones y los controles?

Leptina: aproximacin experimental

Determinacin de la glucemia
Ratn ob/ob Control

261
mg/dl

138
mg/dl

Leptina: aproximacin experimental

44.000 genes
Cuntos se han expresado de forma diferencial?

Ms de 3.000
Cuntos tienen un p valor inferior a 0,00192?

150 genes

Leptina: aproximacin experimental

Genes expresados diferencialmente

Leptina Apolipoprotena A-IV Prostaglandina sintetasa D2 cerebral Carrier de aniones 1a1 Sulfotransferasa 2A preferente de DHEA IGFBP1 Receptor de leptina Monoacilglicerol O-aciltransferasa 1 Receptor de ADH Citocromo P450 Lipoproten lipasa Receptor de Prostaglandinas F

Sobreexpresin de genes del metabolismo de lpidos en ratones ob/ob.

Leptina: aproximacin experimental

Protemica
Diferencias signicativas en el subproteoma de tejido muscular

- Protena NDRG2: Relacin con diabetes - Translocasa 1 ATP/ADP - Canales aninicos dependientes de voltaje

Sin diferencias: Miosina, creatn quinasa, actina, albmina...

Leptina: aproximacin experimental

Citometra

Ratones WT

Ratones OB

Se aprecia una tasa de divisin ms elevada en los ratones knock-out

Leptina: aproximacin experimental

Estudio de radicales libres

Ratones WT

Ratones OB

Se aprecia mayor estrs oxidativo en ratones knock-out.

Leptina: aproximacin experimental

Candela Nieves Beatriz Palezuela Eli Prez Eduardo Rodrguez Francisco Romn Noelia Sirgo Maria Jos Teruel Julio Garca

Programa Acrcate 2007

3. Proyectos nalizados y en marcha

2005

2007

2011

2011-2012

- Relacin entre las antenas de telefona mvil y el cncer - Leptina: aproximacin experimental - Cultivos de queratinocitos. Determinacin de la longitud telomrica. - Glicmica: expresin diferencial de proteoglicanos en tumor renal de clula clara

Telmeros

Cromosoma
Centrmero

Telmeros

Telmero

Regiones terminales de los cromosomas

Telos: n, nalidad

Telmeros

Cromosoma
Centrmero

Telmeros

Telmero

Regiones terminales de los cromosomas

Repeticiones 5 - TTAGGG - 3

Telos: n, nalidad

Telmeros

End-replication problem
La replicacin es el proceso de copia del DNA previo a la divisin celular para garantizar que las dos clulas hijas reciben la misma informacin que la clula madre. La DNA polimerasa slo puede copiar en sentido 5 > 3. Una hebra va del tirn sin problemas: hebra dominante

Telmeros

End-replication problem
La replicacin es el proceso de copia del DNA previo a la divisin celular para garantizar que las dos clulas hijas reciben la misma informacin que la clula madre. La DNA polimerasa slo puede copiar en sentido 5 > 3. La otra hebra debe replicarse por segmentos: hebra retrasada

Telmeros

End-replication problem
La replicacin es el proceso de copia del DNA previo a la divisin celular para garantizar que las dos clulas hijas reciben la misma informacin que la clula madre. La DNA polimerasa slo puede copiar en sentido 5 > 3. Estos fragmentos se denominan fragmentos de Okazaki

Telmeros

End-replication problem
Hebra lder

Hebra retrasada

- Cebador o primer
RNA molde para el comienzo de la replicacin DNA ligasa lo sustituye por DNA

Telmeros

End-replication problem

Para sustituir el RNA del ltimo cebador, la DNA ligasa necesita un lugar de sustentacin (DNA previo)

Telmeros

End-replication problem

En cada divisin celular se produce un acortamiento del DNA a expensas de los telmeros. Ocurre porque nuestras molculas de DNA son lineales y no circulares.

CADA DIVISIN = CROMOSOMAS MS CORTOS

Telmeros Por tanto, los telmeros se relacionan con el envejecimiento.

- Una clula con telmeros cortos signica que se ha dividido muchas veces.

Largo

Corto

Telmeros

Sin embargo, hay clulas que se dividen y no acortan los telmeros

- Clulas tumorales, clulas embrionarias

Telomerasa

Telmeros

Jefe de grupo

Ignacio Flores

Stem cells in organ generation, regeneration & aging

Mara Blasco

Directora del CNIO

Centro Nacional de Investigaciones Oncolgicas

Telomapping
Hibridacin in situ uorescente para telmeros en microscopa confocal
Corto Medio Largo

DOI: 10.1101/gad.451008

Flores I et al., 2007

Telomapping
Hibridacin in situ uorescente para telmeros en microscopa confocal
Corto Medio Largo

Zonas con clulas que tienen telmeros largos

Nichos de clulas madre?

DOI: 10.1101/gad.451008

Flores I et al., 2007

Telmeros

Jefe de grupo

Ignacio Flores

Stem cells in organ generation, regeneration & aging

Programa CICERONE
Sexta convocatoria

Junio - julio 2011

Cultivos de queratinocitos

Objetivo
Comprobar si las clulas epiteliales diferenciadas tienen telmeros ms cortos que las ms primitivas.

Material y mtodos
- Trabajo de animalario - Cultivos celulares - Mtodo de diferenciacin: cloruro clcico - Visualizacin en el microscopio - Telomapping

Cultivos de queratinocitos

Resultados

- Preliminares, pendiente de telomapping

3. Proyectos nalizados y en marcha

2005

2007

2011

2011-2012

- Relacin entre las antenas de telefona mvil y el cncer - Leptina: aproximacin experimental - Cultivos de queratinocitos. Determinacin de la longitud telomrica. - Glicmica: expresin diferencial de proteoglicanos en tumor renal de clula clara

Glicmica Proteoglicano: protena + azcares

Azcar
Glicosaminoglicanos

Protena

(condroitn, heparn, dermatn, queratn sulfato)

- Biglicano - Decorina

- Versicano - Lumicano

- Perlecano - Neurocano

- Sindecano - Agrecano

Glicmica Sntesis de glicosaminoglicanos

CDIGO MOLECULAR LINKER
O-SERINA

REMODELACIN DEL HS MODIFICACIN POLIMERIZACIN

PROTENA

HEPARN SULFATO Punto de divergencia

CONDROITN SULFATO
PROTENA

O-SERINA

Glicmica

Objetivo
Describir a nivel transcriptmico e histolgico las alteraciones que sufren los proteoglicanos en tumor de clula clara renal viendo diferencias con tejido sano.

Muestras procedentes del banco de tumores del HUCA

Glicmica

Transcriptoma
- Hay regiones de DNA que no tienen funcin aparente - Interesa conocer qu genes se estn expresando

Solucin?

- Estudiar el mRNA
- Sintetizar cDNA (RT-PCR)

Glicmica

- Proyecto en marcha
- Laboratorio 3-15 Facultad de Medicina y Ciencias de la Salud.

- Direccin del proyecto

- Prof. Luis Quirs - Dr. Ivn Fernndez

Departamento de Biologa Funcional

3. Proyectos nalizados y en marcha

2005

2007

2011

2011-2012

- Relacin entre las antenas de telefona mvil y el cncer - Leptina: aproximacin experimental - Cultivos de queratinocitos. Determinacin de la longitud telomrica. - Glicmica: expresin diferencial de proteoglicanos en tumor renal de clula clara

Objetivos

- Descubrir qu es la investigacin - Conocer lugares donde documentarse cientcamente - Comprender conceptos basados en trabajos previos - Despertar el inters temprano por la investigacin

Salidas profesionales del titulado en medicina

- Actividad asistencial
- Formacin Sanitaria Especializada: Sistema MIR - Ejercicio privado

> 95%

- Actividad docente e investigadora

- Obtencin del ttulo de Doctor / PhD - Universidad

- Actividad empresarial - industrial

- Farmacuticas - Medicina laboral

- Gestin sanitaria - Oposiciones

- Instituciones penitenciarias

- Medicina militar - Cooperacin

Investigacin durante la carrera

- Iniciacin a la investigacin biomdica
- 6 crditos - No se oferta en 2011/2012

- Profesores
- Pregunta si ests interesado! - Congresos de estudiantes de medicina

- Beca de colaboracin departamental

- Sexto

- IFMSA

- Intercambios de investigacin

- Otros programas
- CICERONE (CNIC), 2 ciclo

Es cuestin de tiempo que un investigador espaol obtenga de nuevo un premio Nobel

Samuel Ting

Premio Nobel de Fsica, 1976

Muchas gracias!

jcgrubio@me.com