Instituto Tecnolgico Superior De Lerdo

ENSAYO FORMATOS DE ARCHIVOS DE SECUENCIAS

Nombre: Francisco Eduardo Rodrguez Campos Numero de control: 10231045 Grupo: B Fecha: 9 de febrero de 2012

Introduccin
En nuestro ensayo encontraremos la descripcin de como se catalogan los archivos ya sea en ASCCII o en binario as como tambin se dan a conocer ejemplos de archivos que pertenecen a cada una de las categoras ya mencionadas. Adems de que daremos a conocer como son algunos de los formatos de archivos de secuencia ms conocidos y la descripcin de cada uno de ellos segn sea el caso, todo esto con la finalidad de conocer mas sobre el tema y tener una idea de como es que son empleados cada uno de estos formatos de archivos de secuencia.

Formatos De Archivos De Secuencia

Como inicio del tema de formato de archivos de secuencias tenemos que los archivos se pueden catalogar de en dos tipos distintos de archivos los ASCCII y los binarios, uno de los tipos de archivos son los archivos tipo ASCCII (american standard code for information interchange) y su acrnimo en espaol significa cdigo estndar americano para intercambio de informacin este cdigo de caracteres asigna un valor numrico a cada carcter esto se emplea en archivos de texto plano como pueden ser archivos de texto o archivos con extensin HTML por mencionar algunos. El cdigo ASCCII se caracteriza por se legible o por que puede ser comprensible con facilidad a diferencia de los archivos de tipo binario que son por el contrario a los archivos ASCCII, este tipo de archivos como mencione anterior mente es difcil de comprender a simple vista, algunos de los archivos que son binarios son archivos de video o archivos de imgenes entre otros. Los distintos formatos que existen ayudan a saber que tipo de archivo es y para que sirven, los formatos que existen de archivos de secuencia son muy variados pero algunos formatos que son utilizados son por ejemplo: PHYLIP, GenBank, EMBL, FASTA, PIR entre otros. PHYLIP: El formato de secuencia de archivos PHYLIP fue creado a travs del lenguaje C y es utilizado como formato de entrada de diversos programas este formato es empleado principalmente en qumica para diversas aplicaciones dentro de esta ciencia.

GenBank: Lo que lo identifica a este formato de archivos de secuencia es que un formato de base de datos que proporciona informacin cientfica sobre lo que refiere las secuencias del ADN con la finalidad de tener acceso a informacin cientfica actualizada sobre secuencias del ADN. EMBL: Este formato tiene la caracterstica de que se generan reportes de la base de datos sobre la secuencia de nucletidos, este formato es compatible con programas GCG. FASTA: Este formato es uno de los ms empleados y es usado para alineacin de secuencias de ADN. PIR: El formato PIR es un formato que se genera e las bases de datos PIR.

Conclusin
Como conclusin tenemos que los formatos de archivos de secuencias pueden ser de gran utilidad para la comunidad cientfica debido a que facilitan el estudio a diversas ciencias, adems que hacen ms fcil el estudio de diferentes temas como es el del estudio del ADN.

BIBLIOGRAFIA
Tipos de archivos y archivos de secuencia () [en lnea].Disponible en http://www.cecalc.ula.ve Miguel vagan guzmn () [en lnea].Tipos de archivos y archivos de secuencias. Disponible en: http://www.educarchile.com Mara Jess Lamarca Lapuente (19 de noviembre del 2011) [en lnea].Tipos de archivos. Disponible en: http://www.hipertexto.info

PHYLIP (1 de enero del 2012) [en lnea].Disponible en http://evolution.genetics.washington.edu

Que es el GenBank (3 de mayo del 2011) [en lnea].Disponible en http://www.ncbi.nlm.nih.gov