15/09/2011

Introduo Modelagem Molecular

Prof. Alex Fabiano C. Campos, Dr

Introduo
Mtodos tericos e tcnicas computacionais para modelar ou imitar o comportamento de molculas e sistemas atmicos. Empregados na qumica, fsica, computacional e cincia dos materiais. biologia, farmcia

Permite estudar sistemas moleculares de pequenos porte grandes molculas biolgicas e materiais. So necessrios computadores para realizar clculos de sistemas de qualquer tamanho.

Prof. Alex Fabiano C. Campos, Dr

15/09/2011

Introduo
Modelagem Molecular

Mtodos Clssicos

Mtodos Qunticos

Mecnica Molecular

Mtodos baseados na funo de onda

Teoria do Funcional de Densidade (DFT)

Campos de Fora

Dinmica Molecular

Mtodos Semiempricos

Clculo ab initio
Prof. Alex Fabiano C. Campos, Dr

Introduo

Teoria de Campos: Quntica e Relativstica

Mecnica Quntica (temporal)

H = i t
H = E H = E
Aproximao

Mecnica Quntica

Mtodos Semi-Empricos

Mtodos Clssicos (empricos)

Mecnica de Newton

Prof. Alex Fabiano C. Campos, Dr

15/09/2011

Introduo
Os limites atuais

Qualidade na Energia

Nmero de tomos

Mecnica Quntica (ab-initio)

103 tomos

Tempo de CPU

Mtodos Semi-empricos

105 tomos

Mtodos Clssicos (Eqs.de Newton)

5x1011 tomos

Onde esto os Problemas?

H = E

Prof. Alex Fabiano C. Campos, Dr

Mecnica Molecular
Mecnica Molecular refere-se ao Newtoniana para modelar sistemas. uso da Mecnica

Trata a molcula como um conjunto de esferas ligadas por molas

Vantagens:
Investiga grandes sistemas que so impossveis por MQ; Fcil de entender; Total flexibilidade para definir os clculos.

Desvantagens:
Pode ser difcil definir os potenciais de interao; Acurcia baixa; Nenhuma informao sobre as propriedades eletrnicas.
Prof. Alex Fabiano C. Campos, Dr

15/09/2011

Mecnica Molecular
Campo de Fora se refere forma funcional e conjunto de parmetros usados para descrever o potencial de energia de um sistema de partculas (tipicamente tomos). Funes de campo de Fora e conjunto de parmetros so derivados de trabalhos experimentais e clculos de mecnica quntica.

O campo de fora usado para minimizar a energia da ligao da molcula.

Prof. Alex Fabiano C. Campos, Dr

Mecnica Molecular
A energia total formada pela soma de diversos componentes:

Parmetros dependem do tomo e tipo de ligao;

Prof. Alex Fabiano C. Campos, Dr

15/09/2011

Mecnica Molecular

Prof. Alex Fabiano C. Campos, Dr

Mecnica Molecular

Prof. Alex Fabiano C. Campos, Dr

15/09/2011

Mecnica Molecular
A anlise conformacional realizada pela rotao de ligaes , com mudana paralela dos ngulos torcionais e didricos e por clculos correspondentes da energia estrica decorrente da sobreposio espacial de tomos no ligados e barreiras torcionais de rotao.

Quase nunca uma molcula desenhada inicialmente estar em sua configurao de menor energia.

Prof. Alex Fabiano C. Campos, Dr

Mecnica Molecular

Mnimo local

Mnimo absoluto
Prof. Alex Fabiano C. Campos, Dr

15/09/2011

Mecnica Molecular
O que podemos calcular com a Mecnica Molecular principalmente ?

Energia conformacional

Calor de formao

Prof. Alex Fabiano C. Campos, Dr

Qumica Quntica
Ramo especializado tanto da Qumica como da Fsica que, usando as ferramentas da Mecnica Quntica. Visa explicar e prever o comportamento de sistemas fsicoqumicos microscpicos, tais como tomos, molculas, ons e redes cristalinas. Ab initio - clculo de primeiros princpios. Nenhum dado emprico usado. Mtodos semiempricos - emprega fundamentalmente duas aproximaes importantes: interaes entre os eltrons da camada de valncia apenas; ncleos estacionrios.

Prof. Alex Fabiano C. Campos, Dr

15/09/2011

Qumica Quntica
O que podemos calcular com a Qumica Quntica principalmente ?

Energia dos orbitais de fronteira Propriedades termodinmicas Cargas eltricas dos tomos Momento dipolar Energia de solvatao
Prof. Alex Fabiano C. Campos, Dr